View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1383_high_8 (Length: 408)

Name: NF1383_high_8
Description: NF1383
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1383_high_8
NF1383_high_8
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (29-362)||(50000827-50001161)
chr4 (29-362)||(53619458-53619791)
chr4 (153-361)||(3329869-3330077)
chr4 (51-362)||(55933386-55933695)
chr4 (29-362)||(31846975-31847292)
chr4 (110-362)||(23255585-23255828)
chr4 (29-312)||(56462009-56462291)
chr4 (183-362)||(39001269-39001448)
chr4 (29-358)||(26521365-26521693)
chr4 (29-361)||(30940641-30940966)
chr4 (86-361)||(600651-600926)
chr4 (187-362)||(4419136-4419310)
chr4 (31-362)||(132257-132590)
chr4 (29-240)||(12918274-12918485)
chr4 (88-350)||(34107655-34107919)
chr4 (29-323)||(25504206-25504498)
chr4 (83-362)||(48656866-48657148)
chr4 (29-361)||(53170386-53170712)
chr4 (34-362)||(46440795-46441124)
chr4 (146-350)||(7536590-7536794)
chr4 (89-353)||(50462908-50463169)
chr4 (135-342)||(6865828-6866033)
chr4 (32-101)||(3330083-3330152)
chr4 (142-243)||(50483211-50483312)
chr4 (129-326)||(54190858-54191050)
chr4 (219-359)||(50464388-50464528)
chr4 (42-297)||(38535501-38535739)
chr4 (203-353)||(16955341-16955491)
chr4 (85-270)||(45386019-45386204)
chr4 (129-263)||(43849350-43849484)
chr4 (300-361)||(40392727-40392788)
chr4 (29-196)||(12053451-12053616)
chr4 (108-196)||(16957580-16957668)
chr4 (194-362)||(42455674-42455842)
chr4 (265-362)||(23604962-23605059)
chr4 (257-350)||(50442609-50442702)
chr4 (152-243)||(53098412-53098503)
chr4 (126-294)||(28739845-28740014)
chr4 (126-216)||(24719952-24720043)
chr4 (30-185)||(48506928-48507083)
chr4 (186-322)||(49354125-49354265)
chr4 (86-160)||(1041386-1041460)
chr4 (279-361)||(47585160-47585242)
chr4 (286-362)||(12053339-12053415)
chr4 (249-353)||(23242781-23242885)
chr4 (29-77)||(54927613-54927661)
chr4 (32-305)||(46391220-46391490)
chr4 (132-206)||(45760839-45760913)
chr4 (240-341)||(8738098-8738199)
chr4 (134-247)||(34536939-34537052)
chr4 (300-360)||(54927354-54927414)
chr4 (300-362)||(12917921-12917983)
chr4 (223-353)||(23233211-23233339)
chr4 (312-362)||(41372253-41372303)
chr4 (179-285)||(49344191-49344297)
chr4 (287-360)||(9601084-9601156)
chr4 (170-238)||(747812-747880)
chr4 (287-359)||(16009242-16009313)
chr4 (120-196)||(41440075-41440151)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (31-362)||(17249209-17249540)
chr6 (29-362)||(33220613-33220946)
chr6 (29-361)||(34304369-34304701)
chr6 (29-362)||(357619-357951)
chr6 (29-322)||(959493-959785)
chr6 (29-319)||(4206498-4206788)
chr6 (44-269)||(45594-45819)
chr6 (33-349)||(34554183-34554498)
chr6 (81-350)||(29338033-29338302)
chr6 (124-319)||(4165919-4166114)
chr6 (43-362)||(28008903-28009222)
chr6 (85-321)||(13398140-13398376)
chr6 (29-310)||(24016261-24016541)
chr6 (29-262)||(34415408-34415641)
chr6 (29-215)||(28543394-28543580)
chr6 (111-359)||(28625806-28626054)
chr6 (109-293)||(3714858-3715042)
chr6 (81-189)||(34168913-34169021)
chr6 (276-362)||(7749353-7749439)
chr6 (29-177)||(12401388-12401536)
chr6 (219-330)||(32115622-32115733)
chr6 (249-362)||(3137369-3137482)
chr6 (257-362)||(34168793-34168897)
chr6 (150-321)||(26225602-26225773)
chr6 (40-270)||(22985885-22986115)
chr6 (40-270)||(23802279-23802509)
chr6 (29-147)||(32115776-32115894)
chr6 (257-362)||(28543269-28543374)
chr6 (322-361)||(45816-45855)
chr6 (115-229)||(6225077-6225191)
chr6 (300-361)||(749501-749562)
chr6 (317-361)||(2134994-2135038)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (29-359)||(34644441-34644771)
chr1 (29-359)||(2764354-2764684)
chr1 (29-359)||(28041029-28041359)
chr1 (86-361)||(22346768-22347042)
chr1 (163-362)||(47459555-47459753)
chr1 (116-361)||(21472876-21473121)
chr1 (29-345)||(4861891-4862208)
chr1 (29-344)||(45659549-45659863)
chr1 (29-274)||(29169696-29169940)
chr1 (108-361)||(31737304-31737556)
chr1 (29-345)||(20259699-20260015)
chr1 (142-361)||(24177526-24177745)
chr1 (29-359)||(50161319-50161656)
chr1 (28-217)||(19035464-19035653)
chr1 (103-341)||(2898595-2898836)
chr1 (139-297)||(38731546-38731704)
chr1 (81-234)||(16500034-16500187)
chr1 (29-206)||(25375735-25375912)
chr1 (214-362)||(48841169-48841317)
chr1 (29-284)||(37932120-37932374)
chr1 (102-319)||(50314599-50314815)
chr1 (249-361)||(868525-868635)
chr1 (144-361)||(7213116-7213341)
chr1 (276-362)||(5453967-5454053)
chr1 (85-199)||(36486921-36487035)
chr1 (36-262)||(42919832-42920057)
chr1 (127-296)||(18616153-18616322)
chr1 (257-362)||(30688429-30688534)
chr1 (109-205)||(37200012-37200107)
chr1 (286-361)||(1114027-1114102)
chr1 (264-353)||(4611070-4611159)
chr1 (255-349)||(21934262-21934357)
chr1 (287-361)||(19035352-19035426)
chr1 (300-361)||(28493504-28493565)
chr1 (110-273)||(35387643-35387802)
chr1 (120-256)||(15584853-15584988)
chr1 (142-268)||(35550090-35550216)
chr1 (102-182)||(23043929-23044009)
chr1 (286-346)||(45835345-45835404)
chr1 (111-193)||(7433264-7433346)
chr1 (307-353)||(44420593-44420639)
chr1 (230-359)||(6670208-6670337)
chr1 (258-362)||(6790793-6790898)
chr1 (135-168)||(19035425-19035458)
chr1 (111-176)||(37918072-37918137)
chr1 (286-350)||(7483769-7483832)
chr1 (249-321)||(40515997-40516068)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (29-343)||(39434558-39434872)
chr8 (50-362)||(38815166-38815478)
chr8 (29-343)||(3187861-3188174)
chr8 (29-361)||(24124901-24125233)
chr8 (29-274)||(35739889-35740133)
chr8 (29-262)||(500200-500432)
chr8 (29-342)||(25021716-25022029)
chr8 (38-345)||(4699760-4700064)
chr8 (109-338)||(6592472-6592700)
chr8 (157-353)||(37514102-37514298)
chr8 (84-353)||(4073415-4073685)
chr8 (35-237)||(8619811-8620013)
chr8 (185-353)||(22589395-22589562)
chr8 (135-345)||(28196082-28196291)
chr8 (109-341)||(6618178-6618409)
chr8 (170-359)||(43823864-43824053)
chr8 (29-209)||(10189568-10189748)
chr8 (192-361)||(18804486-18804654)
chr8 (36-165)||(37517163-37517292)
chr8 (188-310)||(3821148-3821270)
chr8 (231-360)||(42659101-42659230)
chr8 (116-190)||(8882371-8882445)
chr8 (109-206)||(42922109-42922206)
chr8 (164-343)||(3825527-3825705)
chr8 (108-267)||(8115779-8115937)
chr8 (126-280)||(39671170-39671325)
chr8 (164-262)||(3863289-3863387)
chr8 (126-320)||(10556292-10556485)
chr8 (109-321)||(8540359-8540574)
chr8 (287-361)||(18596759-18596833)
chr8 (219-320)||(9259384-9259485)
chr8 (305-362)||(44337212-44337268)
chr8 (29-158)||(11611150-11611275)
chr8 (264-343)||(8882235-8882314)
chr8 (249-338)||(24451018-24451105)
chr8 (258-338)||(6792165-6792245)
chr8 (120-227)||(166166-166273)
chr8 (111-230)||(36004126-36004245)
chr8 (120-309)||(121716-121903)
chr8 (109-167)||(22589336-22589394)
chr8 (286-344)||(24320227-24320285)
chr8 (276-361)||(500115-500200)
chr8 (305-361)||(15566152-15566208)
chr8 (161-212)||(27713949-27714000)
chr8 (161-270)||(27715312-27715421)
chr8 (286-362)||(24350881-24350957)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (29-362)||(28517189-28517522)
chr7 (29-362)||(5825145-5825476)
chr7 (36-361)||(21326747-21327072)
chr7 (29-353)||(4501140-4501463)
chr7 (29-351)||(32584483-32584806)
chr7 (29-361)||(19277164-19277498)
chr7 (29-361)||(45613744-45614076)
chr7 (123-362)||(40726476-40726715)
chr7 (29-320)||(43856788-43857079)
chr7 (35-320)||(27521385-27521670)
chr7 (29-361)||(982822-983154)
chr7 (29-361)||(22197860-22198191)
chr7 (29-361)||(22239630-22239961)
chr7 (36-341)||(24527482-24527787)
chr7 (85-361)||(25186894-25187165)
chr7 (154-321)||(48539094-48539261)
chr7 (108-362)||(10904990-10905243)
chr7 (109-338)||(30216040-30216268)
chr7 (29-198)||(3676675-3676845)
chr7 (237-362)||(45003007-45003132)
chr7 (86-245)||(9281091-9281249)
chr7 (86-245)||(9292062-9292220)
chr7 (29-206)||(38839352-38839532)
chr7 (51-231)||(2904368-2904548)
chr7 (117-297)||(42295174-42295354)
chr7 (109-322)||(23037457-23037669)
chr7 (296-362)||(38766196-38766262)
chr7 (29-237)||(47679122-47679330)
chr7 (190-344)||(41117833-41117988)
chr7 (28-155)||(33202367-33202493)
chr7 (311-362)||(38832174-38832225)
chr7 (106-334)||(34772682-34772907)
chr7 (149-255)||(10032193-10032299)
chr7 (255-361)||(27027758-27027864)
chr7 (150-295)||(23792951-23793096)
chr7 (259-361)||(45974731-45974833)
chr7 (132-238)||(47251787-47251892)
chr7 (204-321)||(5972293-5972410)
chr7 (157-294)||(6634993-6635130)
chr7 (120-195)||(7637505-7637579)
chr7 (106-177)||(26770454-26770525)
chr7 (85-167)||(1249653-1249735)
chr7 (34-207)||(34067769-34067941)
chr7 (219-292)||(44525927-44526000)
chr7 (252-320)||(5714954-5715022)
chr7 (311-362)||(36931887-36931937)
chr7 (29-101)||(9266175-9266246)
chr7 (157-321)||(36558898-36559061)
chr7 (249-345)||(43333952-43334048)
chr7 (286-361)||(32336285-32336355)
chr7 (241-280)||(38766263-38766302)
chr7 (324-362)||(2520918-2520956)
chr7 (300-353)||(29054730-29054783)
chr7 (305-353)||(12137230-12137278)
chr7 (120-164)||(24566960-24567004)
chr7 (286-334)||(34856765-34856813)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (29-362)||(35310320-35310653)
chr5 (29-362)||(27336567-27336898)
chr5 (29-362)||(13166812-13167145)
chr5 (29-362)||(33691957-33692287)
chr5 (81-346)||(37873592-37873857)
chr5 (150-362)||(430474-430686)
chr5 (29-361)||(32269699-32270030)
chr5 (108-356)||(25663013-25663261)
chr5 (36-361)||(15291935-15292259)
chr5 (129-361)||(42921571-42921802)
chr5 (42-335)||(14423586-14423870)
chr5 (29-362)||(34335209-34335542)
chr5 (31-244)||(43129524-43129737)
chr5 (226-353)||(2566194-2566321)
chr5 (31-227)||(35455963-35456159)
chr5 (55-205)||(3114091-3114241)
chr5 (107-361)||(26212563-26212817)
chr5 (29-238)||(43115360-43115568)
chr5 (31-155)||(433371-433495)
chr5 (159-327)||(22188687-22188855)
chr5 (134-274)||(38875598-38875738)
chr5 (49-342)||(8100446-8100737)
chr5 (179-362)||(23423923-23424106)
chr5 (109-199)||(32230489-32230579)
chr5 (116-176)||(8858974-8859034)
chr5 (29-95)||(38446305-38446371)
chr5 (305-362)||(2917539-2917596)
chr5 (249-353)||(23023476-23023580)
chr5 (287-353)||(11005759-11005825)
chr5 (247-353)||(15506735-15506841)
chr5 (119-269)||(7716146-7716294)
chr5 (120-273)||(13307317-13307470)
chr5 (189-322)||(26010276-26010408)
chr5 (130-203)||(26577403-26577476)
chr5 (152-227)||(14723269-14723344)
chr5 (134-209)||(16017199-16017274)
chr5 (108-198)||(9829335-9829423)
chr5 (125-254)||(16598886-16599015)
chr5 (324-358)||(27913506-27913540)
chr5 (250-319)||(22819761-22819830)
chr5 (135-214)||(7143728-7143805)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (108-362)||(26772630-26772884)
chr3 (37-361)||(44198640-44198964)
chr3 (29-361)||(53785582-53785914)
chr3 (29-362)||(39583131-39583464)
chr3 (119-359)||(38670873-38671112)
chr3 (29-320)||(7900772-7901063)
chr3 (29-361)||(52741413-52741746)
chr3 (128-361)||(32546668-32546901)
chr3 (29-362)||(46940672-46941008)
chr3 (29-361)||(13582383-13582714)
chr3 (95-342)||(37132967-37133214)
chr3 (120-353)||(26856755-26856988)
chr3 (31-321)||(38145969-38146259)
chr3 (139-322)||(52411903-52412086)
chr3 (85-322)||(38978757-38978994)
chr3 (108-321)||(3443293-3443506)
chr3 (29-328)||(5338552-5338852)
chr3 (29-343)||(7501913-7502226)
chr3 (29-361)||(49017840-49018168)
chr3 (81-326)||(4472970-4473214)
chr3 (34-273)||(51234577-51234803)
chr3 (107-320)||(25324943-25325158)
chr3 (211-361)||(44706-44859)
chr3 (222-361)||(4763888-4764026)
chr3 (112-327)||(37992240-37992454)
chr3 (111-317)||(54508367-54508574)
chr3 (252-353)||(4669788-4669889)
chr3 (155-361)||(21552537-21552746)
chr3 (36-198)||(35484601-35484763)
chr3 (179-308)||(42205993-42206123)
chr3 (276-353)||(26276496-26276573)
chr3 (111-320)||(43123059-43123268)
chr3 (300-362)||(8592013-8592075)
chr3 (249-321)||(465003-465075)
chr3 (240-359)||(3643028-3643145)
chr3 (186-322)||(7257616-7257751)
chr3 (116-234)||(3376729-3376848)
chr3 (29-124)||(35236316-35236411)
chr3 (111-223)||(13772460-13772572)
chr3 (118-168)||(45676778-45676828)
chr3 (29-67)||(54508286-54508324)
chr3 (253-330)||(26393812-26393889)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (29-362)||(28224872-28225205)
chr2 (29-361)||(4412968-4413300)
chr2 (29-327)||(27502269-27502566)
chr2 (29-361)||(41867810-41868141)
chr2 (36-353)||(9685324-9685641)
chr2 (29-297)||(44686353-44686624)
chr2 (29-361)||(17344511-17344843)
chr2 (29-361)||(18744856-18745188)
chr2 (29-361)||(19161685-19162017)
chr2 (29-321)||(3825639-3825932)
chr2 (29-353)||(23484840-23485163)
chr2 (29-341)||(5532314-5532624)
chr2 (241-362)||(27494183-27494304)
chr2 (126-270)||(34814818-34814961)
chr2 (179-361)||(13413224-13413406)
chr2 (102-232)||(2888518-2888648)
chr2 (98-320)||(16351812-16352037)
chr2 (29-344)||(7760748-7761062)
chr2 (29-274)||(20142642-20142872)
chr2 (117-322)||(13147087-13147295)
chr2 (121-326)||(33612542-33612744)
chr2 (122-332)||(32029081-32029291)
chr2 (120-277)||(3968402-3968559)
chr2 (144-350)||(2886632-2886839)
chr2 (135-359)||(11921218-11921436)
chr2 (289-361)||(3208406-3208478)
chr2 (179-342)||(8036534-8036699)
chr2 (86-297)||(44720259-44720471)
chr2 (103-238)||(29808071-29808205)
chr2 (29-255)||(10579681-10579907)
chr2 (300-362)||(30602361-30602423)
chr2 (300-362)||(41702144-41702206)
chr2 (266-353)||(15515286-15515373)
chr2 (100-177)||(1296023-1296100)
chr2 (288-361)||(42122690-42122763)
chr2 (286-362)||(2626006-2626082)
chr2 (305-361)||(20143123-20143179)
chr2 (316-362)||(10587144-10587190)
chr2 (120-176)||(9200423-9200479)
chr2 (157-269)||(19893517-19893629)
chr2 (320-359)||(38723985-38724024)
chr2 (120-198)||(5679314-5679392)
chr2 (115-232)||(34186050-34186166)
chr2 (229-321)||(3262244-3262336)
chr2 (291-359)||(32612326-32612394)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (29-289)||(6279-6538)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (43-361)||(33123-33440)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (65-361)||(102979-103274)
[»] scaffold1768 (1 HSPs)
scaffold1768 (29-361)||(86-418)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (108-362)||(49287-49537)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (52-230)||(10364-10546)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (109-341)||(7496-7727)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (31-196)||(47443-47608)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (36-262)||(18274-18499)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (286-361)||(6761-6836)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (281-361)||(5197-5277)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (136-209)||(8525-8598)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (93-177)||(16191-16275)
scaffold0119 (185-342)||(15998-16154)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (300-345)||(16827-16872)
[»] scaffold0514 (1 HSPs)
scaffold0514 (258-338)||(4378-4458)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (120-173)||(37391-37444)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Original strand, 50000827 - 50001161
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50000827 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagctgcgtcaagcaaa 50000926  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgctttta-tacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacctt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50000927 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttaatacaatttgcttttgacacttttggctttctagcatcagaggcagttgacctt 50001026  T
Q  228 ctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctag 327  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  50001027 ctacatatagtccaaagggttatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaatgttgtgtttacgaagattgattttgccatccaaaaagatctag 50001126  T
Q  328 cggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50001127 cggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 50001161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 53619791 - 53619458
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  53619791 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttagaggtgggggcttttacagtaggacaggcaaccctaaaagctgcgtcaagcaaa 53619692  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53619691 gtggccaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacacttttgacttcctagcatcagaggcagttgaccttc 53619592  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53619591 tacatagagtctaaagggttatgcataacaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgagaattggttttgccatccaaaaaggtctagc 53619492  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  53619491 ggcgcagcttgttgcctacttacctcctattcat 53619458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3330077 - 3329869
Alignment:
Q  153 tctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3330077 tctgacaatcaacatgcttttatactatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaagggttatgc 3329978  T
Q  253 atagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcc 352  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329977 atagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgctgtgtttacgatgattggttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcc 3329878  T
Q  353 tcctattca 361  Q
    |||||||||    
T  3329877 tcctattca 3329869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Original strand, 55933386 - 55933695
Alignment:
Q  51 ggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgt 150  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |    
T  55933386 ggggtttcaccccttgtgggtttaagggtcagggcttttacggtaggacagtcagccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagttt 55933485  T
Q  151 gttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattat 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55933486 gttctaacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcgacttcctagcatc--aggttgttgaccttctacatagagtccaaagggttat 55933583  T
Q  251 gcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttg 350  Q
     |||| |||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  55933584 acataacaatattatgtctcctaggtccgtgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagtctagcgacgcagtttgttgtccgcttg 55933683  T
Q  351 cctcctattcat 362  Q
    ||||||||||||    
T  55933684 cctcctattcat 55933695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31847292 - 31846975
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||| |||||||||||||    
T  31847292 acatgcatgtgtggacttgactagggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacagtaggacaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaa 31847193  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31847192 gtggtcaaacatgagaaaccatgttctgacagtcaacatgtttttttaccatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaagcggttgaccttc 31847093  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||||||||||||||| | |||                ||||||||| ||||| ||| |||||||  |||  |||  || |||||||||||||||||||||    
T  31847092 tacatagagtccaaacggtta----------------gtctcctaggtccatgaatgttgtgttagcgaggattcgttatgccatccaaaaaggtctagc 31847009  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31847008 ggcgcaggttgttgcccgcttgcctcctattcat 31846975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 110 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23255828 - 23255585
Alignment:
Q  110 aaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||         ||| |||||    
T  23255828 aaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaattaacatgcttttataccatttgtttttgac---------ttcttagca 23255738  T
Q  210 tcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttg 309  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  23255737 tcataggcagttgaccttctacatagagtccaaagggttatgcataacaatgttatgtctcctaagtccatgaatattgtgtttacgaggattgattttg 23255638  T
Q  310 ccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23255637 ccatccagaaaagtctagcggcgcagcttgttgtccgcttacctcctattcat 23255585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 312
Target Start/End: Original strand, 56462009 - 56462291
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||| | | |||||||||| | | |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  56462009 acatgcatgtgtggacttgactgaggtttcaccatttgttggattaggggtcgagacttttacggttgtatagaccaccctaaaagttgcgtcaaacaaa 56462108  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  56462109 gtgg-caaacatgataaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttagacacttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 56462207  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgcca 312  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  56462208 tacatagagttcaaaggatcatgcatgacaatgtcatgtctcctaagtccataaatgttgtgtttacgagaattggttttgcca 56462291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 183 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39001448 - 39001269
Alignment:
Q  183 gcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |    
T  39001448 gcttttgacacttttggcttcctaggatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcataacaatgttgtgtctcctaggtccatga 39001349  T
Q  283 attttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    || ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39001348 atgttgtgtttacgaggattggttttgtcatccaaaaaggtctagcggcgcagtttgttgcccgcttgcctcctattcat 39001269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26521693 - 26521365
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |  |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26521693 acatgcatgtatggacttgactggagtttcatcacttgtgggattaggggtcagaccttttatggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaa 26521594  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    ||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26521593 gtggctaaacatgaaaaaacgtgttatgacaatcaacatgcttttatatcatatgctttcaacacttttggtttcctagcaccagaggctgttgaccttc 26521494  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||| ||| |||||| | |||| ||||||||| |||| ||||||  ||||  || ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  26521493 tacatacagttcaaagggtcatgcgtagcaatgtcatgtatcctaggcccat-gatgttgtgtttacgaggattggttttgtcatccaaaaaggtttagc 26521395  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctat 358  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  26521394 ggcacagctttttgtccgcttgccttctat 26521365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 30940641 - 30940966
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | | | ||     |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  30940641 acatgcttgtgtagacttgactgaggtttcgccacttgtgggattaagtgtcaaaccttttaccataggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagtaaa 30940740  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||| |      |||    
T  30940741 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacca-ttgcttttgacactttcgatttcctagcacctgaggctg------ttc 30940833  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||| |||||| || | |||||| || || ||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940834 tacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatatatcctaggtctatgaatgttgtgttcatgaggattgattttgccatccaaaaaggtctagc 30940933  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30940934 gacgcagcttgttgcccgcttgccttctattca 30940966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 361
Target Start/End: Original strand, 600651 - 600926
Alignment:
Q  86 ttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgct 185  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  600651 ttttactgtaggacagacaaccctaaaagttatgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaaacgtgttctaacaattaacatgcttttataccatttgct 600750  T
Q  186 tttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaatt 285  Q
    |||| |||||| || |||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |||| | | ||| ||| | |||| ||||||||||| ||||| |||     
T  600751 tttgtcactttcggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgtataactatgtcatgtctcctaggtccattaatg 600850  T
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
     |||||||||||  |||  |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  600851 ctgtgtttacgatgattagttttgccatccaaaaatgtatagcgacgtagcttgttgtccgcttgccttctattca 600926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4419310 - 4419136
Alignment:
Q  187 ttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattt 286  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  4419310 ttgacactttcggcttcgtagcatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggttatgcataacaatgttatgtctcctaggtccatgaatgt 4419211  T
Q  287 tgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4419210 tgtgtttacgatgattggttttgccatccaaaaa-atctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 4419136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 132590 - 132257
Alignment:
Q  31 atgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggt--agaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||||||  || |||| || | ||||||| |||||||||||||    
T  132590 atgcatgtgtgaacttgactggggtttcaccacttgttggattaggggtcgggacttttacggtgtaggacaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaa 132491  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
     |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || ||||||  |||||||   |||||| |||    
T  132490 atggcaaaacatgagaaatcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgttttttacactttcggtttcctaatatcagagattgttgacattc 132391  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||| |||||  ||||| | | ||||| |||||| ||||||  ||| | ||| | | |||||||||| |  || ||||||  |||| |||||||| || |    
T  132390 tacacagagtttaaagggtcaagcataacaatgtcatgtcttttaggttcatgattgttgtgtttacaagaatcgattttatcatctaaaaaggtataac 132291  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  132290 ggtgcagcttgttccccgcttgccttctattcat 132257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 12918274 - 12918485
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| | | |  | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12918274 acatgcatgtgtgtagttgactggagtttcatcacttgtgggattaagattcggggcttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaa 12918373  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  12918374 gtggtcaaacataagaaatcgtgttctgacaatcaacacacttttatactatttacttttgacactttcgacttcctagcatcagagattgttgaccttc 12918473  T
Q  229 tacatagagtcc 240  Q
    || |||||||||    
T  12918474 tagatagagtcc 12918485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 88 - 350
Target Start/End: Original strand, 34107655 - 34107919
Alignment:
Q  88 ttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgt--tctgacaatcaacatgcttttatacaatttgct 185  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  34107655 ttaccgtataacagacaatcctaaaaattgcgtcaaacgaagtggccaaacatgagaaaacgtgtgttcagataatcaacatgtttttataccatttgtt 34107754  T
Q  186 tttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaatt 285  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  34107755 tttgacactttcgatttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaagtcatgcataacaatgttatgtctcctagatccatgaatg 34107854  T
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttg 350  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||    
T  34107855 ttgtgttcacgaggattggttttgtcatccaaaaaagtttaacggcacagcttgttgcccacttg 34107919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25504498 - 25504206
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||  || |||||||||||  |||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  25504498 acatgcatgtatagacttgactgaggtttcaccacttgtgggattaggcgtcaggccttttacggtatgacaggcaaccctaaa-gttgcatcaagcaaa 25504400  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| | |||||||||     
T  25504399 -tggtcaaacatgagaaaacgtgttctaacaatcgacatgtttttataccgtttgcttttgacatttttggtttcctagcactagagactgttgaccttt 25504301  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggt 323  Q
    || |||||||  ||| | | |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  25504300 taaatagagtttaaaaggtcatgcatagtaatgtcatgtctcataggtccatgaatattgtgtttatgaggattgcttttgccattcaaaaaggt 25504206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 362
Target Start/End: Original strand, 48656866 - 48657148
Alignment:
Q  83 ggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaattt 182  Q
    ||||||||| |||  ||||||| | ||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  48656866 ggcttttacagtatgacagacagccctaaaagtttcatcaagtaaaatggacaaacatgagaaagtgtgttatgtcaatcaaaatgtttttataccattt 48656965  T
Q  183 gcttttgacacttttggcttcctagc-atcagaggcagttga----ccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatc 277  Q
    | |||||||||||| | |||| |||| || |||||  |||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  48656966 gtttttgacactttcgacttcttagcgattagaggttgttgaccttccttctacatagagtccaaatgattatgcatagcaatgttatgtctcataggtc 48657065  T
Q  278 cataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
     || ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| || |  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48657066 tatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccgtccaaaaagatctagtggtg--gcttgttgcctgcttggctcctattcat 48657148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 53170712 - 53170386
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||  ||||||| |||  |||| || | |||||||| | || | | |||    
T  53170712 acatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccactcgtgggattaggtgtcggaccttttacagtatgacaggcagccctaaaagtcgtgttaggtaaa 53170613  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||    
T  53170612 gtagccaaacatgagaaagcgtgttctgacagtcaacatgcttg------atttgcttttgacactttcggtttgctagcaccagaggctgttgaccttc 53170519  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctaga-tccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctag 327  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  53170518 tacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctataggtcatgaatgttgtgttcacgaggattgattttgctatctaaaaaggtctag 53170419  T
Q  328 cggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    | | ||||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  53170418 cagtgcagc-tgttgtctgcttgccttctattca 53170386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 362
Target Start/End: Original strand, 46440795 - 46441124
Alignment:
Q  34 catgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggctttt-acggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtgg 132  Q
    |||||||||| |||| || | ||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| || |||| | | | |   ||||||||  |||||| ||||||||    
T  46440795 catgtgtggatttgattgagattttaccacttgtaggtttaggggtcggggctttttacagtaggataaatagtcctaaaagtaacgtcaaacaaagtgg 46440894  T
Q  133 tcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctaca 232  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  46440895 tcaaacataaaaaagtgtgttctaacaattaacacgtttttatatcatttgcttttgacactttcggcttcctagcatcagaagctgctgaccttctaca 46440994  T
Q  233 tagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcg 332  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  || | |||||||  |||||||||| |||| |||||| | ||||  ||    
T  46440995 tagagtccaaagggttgtgcatagcaatgctatgtctcataggttcatgaaaattatatttacgatgattgattttgtcatctaaaaagatttagcatcg 46441094  T
Q  333 cagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
     | ||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  46441095 taacttgtcgcccgcttgtctcttattcat 46441124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 350
Target Start/End: Original strand, 7536590 - 7536794
Alignment:
Q  146 agcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaagg 245  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |    
T  7536590 agcgtgttttgacaatcaacatgtttttatacaatttgtttttgacaatttcagtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaatg 7536689  T
Q  246 attatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgccc 345  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || ||||||| |  |||| |||||  |||||||||| |||||| | ||| |||||||| |    
T  7536690 atcgtgcatagcaattttatgtctcgtagatccatgaatgttatgtttacaatgattggttttgtgatccaaaaagatctagcagtgcaacttgttgctc 7536789  T
Q  346 gcttg 350  Q
    |||||    
T  7536790 gcttg 7536794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 353
Target Start/End: Original strand, 50462908 - 50463169
Alignment:
Q  89 tacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgctttt 188  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  50462908 tacggtaggacagacagccttaaaagttgcgtcaagcaagatgaccaaacatgagaaagtgtcttccgacaatcaacatgctttcataccatttgctttt 50463007  T
Q  189 gacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttg 288  Q
    ||||||||||  |||||  || ||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||   ||||||| |||||  |||||||| |  |  || |   |||    
T  50463008 gacacttttgatttccttacaccagagactgttgaccttctacgtagagtttaaagggccatgcataacaatgccatgtctcccaagtatatga---ttg 50463104  T
Q  289 tgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  50463105 tgtttacgaggatttgttttgccatccaaaaagacctagcggcgcagcttgctgtccgcttgcct 50463169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 342
Target Start/End: Original strand, 6865828 - 6866033
Alignment:
Q  135 aaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacata 234  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||| |  ||| ||||| ||||||    
T  6865828 aaacacgagaaaacgtgttctgactatcaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttgagcttcatagcactagatgttgttaaccttttacata 6865927  T
Q  235 gagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgca 334  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || || ||||  | ||||||||| || | ||||||||||||||| | ||    
T  6865928 gagttcaaagggtaatgcatagcaatgtcatgtctcctagat-catgaatgttctg-ttacatagattgattttacctttcaaaaaggtctagcgacaca 6866025  T
Q  335 gcttgttg 342  Q
     |||||||    
T  6866026 acttgttg 6866033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3330152 - 3330083
Alignment:
Q  32 tgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3330152 tgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacggtaggacag 3330083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 243
Target Start/End: Original strand, 50483211 - 50483312
Alignment:
Q  142 agaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtcca 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  50483211 agaaagcgtcttctgacaatcaacatgattttataccatttgctttcgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttca 50483310  T
Q  242 aa 243  Q
    ||    
T  50483311 aa 50483312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 326
Target Start/End: Original strand, 54190858 - 54191050
Alignment:
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||| ||||||     |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  54190858 gtggtcaaacatgagaaaacatattctgacaatttacatgtttttat-----ttgcttttgacacttttgactttctagtatcagaggttgttgaccttc 54190952  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtcta 326  Q
     ||||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||| ||| ||  ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||    
T  54190953 cacatagagttcaaagggccatgcataacaatgtcatgactcttaagtccataaatattgtatttacaaagattggttttgctatccaaaaagttcta 54191050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 219 - 359
Target Start/End: Original strand, 50464388 - 50464528
Alignment:
Q  219 gttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaa 318  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||| |||||| |||||||| | ||  || ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  50464388 gttgaccttctacgtagagtttaaagggtcatgcataacaatgtcatgtctcccaaatatatgaatgttgtgtttacgaggatttattttgccatccaaa 50464487  T
Q  319 aaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  50464488 aagacctagcggcgcagcttgttgtccgcttgccttctatt 50464528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 38535501 - 38535739
Alignment:
Q  42 gacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatg 141  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |  | ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||     
T  38535501 gacttgactagggtttcactacttgtgggatttgaggttggggcttttaatgtagaacagacagctctaaaagttgtgtctaacaaagtggtcaaatata 38535600  T
Q  142 agaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtcca 241  Q
    |||||||                 ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||| ||    
T  38535601 agaaagc-----------------atgctcttataccatttgcatttgacacttttgacttcctagcaccagaggttgttcaccctctacatagagttca 38535683  T
Q  242 aaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacga 297  Q
    |||  | |||||||||||||| ||||||  ||| |||||  || ||||||||||||    
T  38535684 aagagtcatgcatagcaatgtcatgtcttataggtccatggatgttgtgtttacga 38535739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16955491 - 16955341
Alignment:
Q  203 cctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatatt 302  Q
    ||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||  |||    
T  16955491 cctagcaccagaggttgctgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggcccatgaatgttgtgtttacgaggatt 16955392  T
Q  303 gattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    ||||| |||||| |||||| ||   || ||||| |||||| ||||||||||    
T  16955391 gatttggccatcaaaaaagatccgacgacgcagtttgttgtccgcttgcct 16955341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 270
Target Start/End: Original strand, 45386019 - 45386204
Alignment:
Q  85 cttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgc 184  Q
    ||||| |||||| |||  |||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||| |    
T  45386019 cttttgcggtaggacatgcaaccctaaaagctaagtcaaggaaagtggtcaaacataagaaagcgtgttctgacaatcaatttctttttataccatttac 45386118  T
Q  185 ttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctc 270  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||  |||||   || ||||||||| || | | |||||| | ||||||| ||||||| ||||||    
T  45386119 atttgaaacttttggctttctagcacaagaggtcattaaccttctacctaaaattcaaagggtcatgcataacaatgttgtgtctc 45386204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 263
Target Start/End: Original strand, 43849350 - 43849484
Alignment:
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| | || |||  || || ||||    
T  43849350 gtggccaaacacgagaaagcgtgttcagataaccaacatgcttttatactatttgtgtttgacacttttggcttcctagaaccaaaggttgtggatcttc 43849449  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgtt 263  Q
    |||| ||||| |||| | | ||||||| |||||||    
T  43849450 tacaaagagttcaaatggtcatgcataacaatgtt 43849484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 361
Target Start/End: Original strand, 40392727 - 40392788
Alignment:
Q  300 attgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40392727 attggttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgtccgcttgccttctattca 40392788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12053616 - 12053451
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| | || || |  ||||| |   ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  12053616 acatgcatgtgtggacattattggggtttcaccattagttggattgggggtcga--cttttacagtaggacaaacagctctaaaagctgcgtcaaacaaa 12053519  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttt 196  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  12053518 gttgtcaaacatgagaaatcgtgttctaacaatcaaaacgtttttatatcatttgctttcgactcttt 12053451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16957668 - 16957580
Alignment:
Q  108 ctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttt 196  Q
    |||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16957668 ctaaaagttgcgtagagcaaaatgaccaaacatgagaaagtgtgctctgataatcaacatgcttatataccatttgcttttgacacttt 16957580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 362
Target Start/End: Original strand, 42455674 - 42455842
Alignment:
Q  194 ttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgttt 293  Q
    ||||||||||||||    |||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||| |||| | |||| ||||| ||| |||| |||    
T  42455674 ttttggcttcctagtgctagaggttgttaaccttctacatagagttcaaatgatcatggataacaatgtcatgttttctaggtccatgaatgttgttttt 42455773  T
Q  294 acgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||  ||||| |||| ||| ||||||||| |||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42455774 acgagaattgactttgtcattcaaaaaggtttagcagcacaacttgttgctcgcttgccttctattcat 42455842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23605059 - 23604962
Alignment:
Q  265 tgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||   ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||    
T  23605059 tgtctcctagatccatgaatattgtgttgttgaggattgattttgtcatccaaaaaggtctagcggcgcaacttgttgtccggttgtcttctattcat 23604962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 350
Target Start/End: Original strand, 50442609 - 50442702
Alignment:
Q  257 caatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttg 350  Q
    |||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  50442609 caatgttatgtctcctaggttcatggatgttgtgtttaagaggattggttttgccatccaaaaagggttagtggcgcagcttgttgcccgcttg 50442702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 53098503 - 53098412
Alignment:
Q  152 ttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaa 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||  ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  53098503 ttctgacaatcaacatgtttttgaaccgtttccttttgacatttttggtttcctagcatcagaggttgttaaccttctacatagagttcaaa 53098412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28740014 - 28739845
Alignment:
Q  126 aaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgc-ttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgac 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| | ||||||  |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||||| || || | |  ||||||    
T  28740014 aaagtggccaaacacgagaaattgtgttgtgacagttaacatgtgttttataccatttatgtttgacactttcgacttcctaacaccacaagttgttgac 28739915  T
Q  225 cttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgttta 294  Q
    ||| |||||||||| ||| |    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28739914 cttttacatagagttcaacgtgcaatgcataacaatgttatgtctcctaggtccataaatgttgtgttta 28739845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24720043 - 24719952
Alignment:
Q  126 aaagtggtcaaacatgagaaag-cgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagagg 216  Q
    ||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  24720043 aaagtggtcaaacatgataaaaacgcgttctgacaatcaacatgtttttatatcatttgtgtttgacacttttgtcttcctaacaacagagg 24719952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Original strand, 48506928 - 48507083
Alignment:
Q  30 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaag 129  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||| || ||||| | ||||  ||  | |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||     
T  48506928 catgcatgcgtggacttgaccggagtttcatcatttgtgagataagctgtcagagcttttacggtaaaacagacaaccctaaaaactgcgtcaagcaaaa 48507027  T
Q  130 tggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgct 185  Q
    | ||||||||  | |||   | || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  48507028 ttgtcaaacaaaaaaaaaaatattatgacaatcaacatacttctataccatttgct 48507083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 322
Target Start/End: Original strand, 49354125 - 49354265
Alignment:
Q  186 tttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaatt 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||| |||||| |  ||| | | || ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  49354125 tttgacatttttggcttcctagcactagaggtaactgaccttctgcatagaatttaaatggtcattcatagcaatgtaatgtctcctaaatccatgaatt 49354224  T
Q  286 ----ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaagg 322  Q
        ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  49354225 aatgttgtgtttacgatgattgattttgtcgtccaaaaagg 49354265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1041460 - 1041386
Alignment:
Q  86 ttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaa 160  Q
    ||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1041460 ttttatggtaggacaagcaactctaaaagttgtgtcaaacatagtggtcaaacataagaaagtgtgttctgacaa 1041386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 361
Target Start/End: Original strand, 47585160 - 47585242
Alignment:
Q  279 ataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || |||||| | | |||||| |||||||    
T  47585160 ataaattttgtgtttacgaagattggttttgtcatctaaaaaggtttagcggcgtagtttgttgtctgtttgccttctattca 47585242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 286 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12053415 - 12053339
Alignment:
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  12053415 ttgtgtttacgagaattggttttgccatcgaaaaaggccgagcgacgcagcttgttgtctgcttgccttctattcat 12053339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 249 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23242885 - 23242781
Alignment:
Q  249 atgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgct 348  Q
    ||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||| |||| || ||| |||  ||||    
T  23242885 atgcataacaatgtcatttctcttaggtccataaatattgtgtttacgatgattgattttgttatccaaaaagctctaacggcacaacttattgttcgct 23242786  T
Q  349 tgcct 353  Q
    |||||    
T  23242785 tgcct 23242781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 54927661 - 54927613
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggg 77  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  54927661 acatgcatgtgtggacttgattggggtttccccacttgtgggtttaggg 54927613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 305
Target Start/End: Original strand, 46391220 - 46391490
Alignment:
Q  32 tgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaaca-gacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagt 130  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || | || ||| ||  |||||||||||| | | |   || ||||||| | |||| | |||||     
T  46391220 tgcatgtgtgaatttgattggggtttcaccacttgtaggattagaggtcggatcttttacggtaggatatgttgac-ctaaaagctacgtcgaacaaagc 46391318  T
Q  131 ggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttcta 230  Q
    ||| ||||| |||||| | |||||| |||  ||||||| |||||||| ||| |||| | ||| ||| |  |||||| ||  |||||  ||||||||||||    
T  46391319 ggttaaacacgagaaaacatgttctcacagccaacatgtttttataccatt-gcttgtaacattttcgatttcctatcagtagaggttgttgaccttcta 46391417  T
Q  231 catagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgat 305  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||  | |||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||    
T  46391418 cataaagttcaaaagatcatgc--aacaatgtcatgtctcctaaatccatgaatgttgtatttacgaagattgat 46391490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Original strand, 45760839 - 45760913
Alignment:
Q  132 gtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttccta 206  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||   ||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  45760839 gtcaaagatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatatttttatatcttttgcatttgacatttttgacttccta 45760913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8738199 - 8738098
Alignment:
Q  240 caaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttg 339  Q
    |||||| | |||||||  ||||| ||||||| ||| | ||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||    
T  8738199 caaaggctcatgcataaaaatgtcatgtctcttaggttcatgaatgttgtgtatacaaagattgattttgtcatccaaaaaagtttagcggcgcagtttg 8738100  T
Q  340 tt 341  Q
    ||    
T  8738099 tt 8738098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 247
Target Start/End: Original strand, 34536939 - 34537052
Alignment:
Q  134 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacat 233  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||  ||||| |||  |||||| |||| || |||| ||||||||     
T  34536939 caaacatgaaaaaacgtgttatgacaatcaacatatttttatactatttgtgtttgacgattttgactttatagcataagagacacttgatcttctacaa 34537038  T
Q  234 agagtccaaaggat 247  Q
    | ||| ||||||||    
T  34537039 atagttcaaaggat 34537052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 54927414 - 54927354
Alignment:
Q  300 attgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattc 360  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  54927414 attgattttgccatctagaaagggttagcggcgcagcttgttgcacgcttgtcttctattc 54927354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12917983 - 12917921
Alignment:
Q  300 attgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  12917983 attgattttgtcatccaaaaaggtctaacggcacaacttattgtctgcttgcctcttattcat 12917921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 353
Target Start/End: Original strand, 23233211 - 23233339
Alignment:
Q  223 accttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaagg 322  Q
    ||||||||| |||||| ||| || | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| ||| |||| |||| ||  |||||||| || |||||||||||    
T  23233211 accttctacgtagagttcaaggg-tcatgcataataatgtcatgtttcctagattcatgaatgttgtctttatgaggattgatttggctatccaaaaagg 23233309  T
Q  323 tctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
      |||| || |||||||||| ||||||||||    
T  23233310 cttagcagcacagcttgttg-ccgcttgcct 23233339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Original strand, 41372253 - 41372303
Alignment:
Q  312 atccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  41372253 atccacaaaggtctagcagcgcaacttgttgtctgcttgcctcctattcat 41372303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 285
Target Start/End: Original strand, 49344191 - 49344297
Alignment:
Q  179 atttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatcc 278  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| | || ||| | ||||||| ||||||| |||  ||||| | |  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  49344191 atttgcatttgacacttttgttttcctaggaccaaaggtaattgacctcctacatatagtttaaagggtcactcatagaaatgtaatgtctcctagatcc 49344290  T
Q  279 ataaatt 285  Q
    || ||||    
T  49344291 atgaatt 49344297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9601156 - 9601084
Alignment:
Q  287 tgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattc 360  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  9601156 tgtgtttacgaggattgattttgtcatccaaaaagct-taacggcgcaacttgttgtccgcttgtcttctattc 9601084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 238
Target Start/End: Original strand, 747812 - 747880
Alignment:
Q  170 ttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagt 238  Q
    |||||||| |||||||||||| | || ||| ||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  747812 ttttataccatttgcttttgatatttctggtttcttaatatcagaggttgttgaccttctacatagagt 747880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16009313 - 16009242
Alignment:
Q  287 tgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    |||||||| ||  |||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16009313 tgtgtttaagatgattggttttgcgataaaaaaaggt-tagcggcgcagcttgttgcctgcttgccttctatt 16009242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 196
Target Start/End: Original strand, 41440075 - 41440151
Alignment:
Q  120 tcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttt 196  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||| || |||||||| |||| | |||||||||||    
T  41440075 tcaaacaaagtagtcaaacataagaaaatgtgttctaacattcaacgtgtttttatactatttacatttgacacttt 41440151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 31 - 362
Target Start/End: Original strand, 17249209 - 17249540
Alignment:
Q  31 atgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17249209 atgcatgtgtggacttgactggggtttcaccatttgtgggtttcggagtgggcgcttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagt 17249308  T
Q  131 ggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttcta 230  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17249309 ggccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttcta 17249408  T
Q  231 catagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcgg 330  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17249409 catagagtccaaaggattatgtatagcaatgttatgtctcctaagttcatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaaaggtctagcgg 17249508  T
Q  331 cgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17249509 cgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 17249540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Original strand, 33220613 - 33220946
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  33220613 acatgcatgtgtgaatttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagctgcatcaagcaaa 33220712  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  33220713 gtggccaaacatgagaaagcgtgtgttgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcatccgaggttgttgaccttc 33220812  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33220813 tacatatagtccaaagggttatgcatagcaatgttgtgtcttctaggtccatgaatgttgcgtttacgataattggttttgccatcctaaaaggtctagc 33220912  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33220913 ggcgcagcttgttggccgcttgcctcctattcat 33220946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34304701 - 34304369
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||  | | ||||||| |||||||||||||    
T  34304701 acatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtgggtttaggagtcggggcttttacggttggacagctagccctaaaagctgcgtcaagcaaa 34304602  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
     |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  34304601 ataaccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttgggcttcctagcatcagatgatgttgaccttc 34304502  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| ||| || || ||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34304501 tacatagagtccaaagagttatgcatagcaatatcatgtctcataggtctatgaatgttgtatttacgaggattgattttgcaatccaaaaaggtatagc 34304402  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  34304401 ggcacaaattgttgcccgtctgcctcctattca 34304369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Original strand, 357619 - 357951
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| || | ||||||| | |||||||||||    
T  357619 acatgcatgtgtggacttgactggagtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttttacggtaggacaggcagccctaaaagcttcgtcaagcaaa 357718  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||| |||||||| | |||||| ||| |||||  | ||||||||    
T  357719 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctaacattagaggttgatgaccttc 357817  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  357818 tacatagagtccaaatgattaagcatagcaatgttatctctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattaattttgccatctaaaaatgtatagc 357917  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||  ||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  357918 ggcatagcttgttgtcggtttgtctcctattcat 357951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 959785 - 959493
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| | ||| || ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  959785 acatgcatgtgtggacttgattgaagtttcaccacttatgggattaggtgtcgggccttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgtgtcaagcaaa 959686  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    ||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  959685 gtggctaaccatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtctttataccatttgtttttgacattttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 959586  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaagg 322  Q
    ||| || ||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  959585 tacgta-agttcaaaaggtcatgcatagcaatgttgtgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattgattttgtcatctaaaaagg 959493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Original strand, 4206498 - 4206788
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |  |  |||||||||||| |||  || |  ||||||| ||||||||||||    
T  4206498 acatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggcatcagaccttttacggtaggacatgcagccttaaaagtggcgtcaagcaaa 4206597  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  4206598 gtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggttgttgaccttc 4206697  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaa 319  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||  |||||| ||||| ||||| || || ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  4206698 tacatagagttcaaaaggtcatgcatgacaatgtcatgtcacctaggtcaatgaatatagtgtttacgaggattggttttgccatccaaaa 4206788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 269
Target Start/End: Original strand, 45594 - 45819
Alignment:
Q  44 cttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgag 143  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||  ||||||| |||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  45594 cttgacaggtgtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaggcagctctaaaagctgcatcaagcaaagtgatcaaacatgag 45693  T
Q  144 aaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaa 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45694 aaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttattccatttgtttttgacactttcggtttcttagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaa 45793  T
Q  244 ggattatgcatagcaatgttatgtct 269  Q
     | | |||||||||||||||||||||    
T  45794 aggtcatgcatagcaatgttatgtct 45819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 349
Target Start/End: Original strand, 34554183 - 34554498
Alignment:
Q  33 gcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtgg 132  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| | |||| |  |||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  |     
T  34554183 gcatatgtggatttgattggggtttcaccaattgtgggattagggatcagggcttttaaagtaggtcagacaacactaaaagttgcgtcaagcaaaacga 34554282  T
Q  133 tcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctaca 232  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||    
T  34554283 ccaaacatgagaaagcgtgttctgataatcaagatgtttttataccatttacttttgacacattcggcttcctagcaccagatgctattgactttctaca 34554382  T
Q  233 tagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcg 332  Q
    ||||||  ||| | | ||| |||||||| | ||||||| || |  ||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||| |||     
T  34554383 tagagtttaaaaggtcatgtatagcaatatcatgtctcgta-agtcatgaattttgtgtttacgaggattgattttgtcatccaaaaaggcctagtggca 34554481  T
Q  333 cagcttgttgcccgctt 349  Q
    |||||| |||| |||||    
T  34554482 cagcttattgctcgctt 34554498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 350
Target Start/End: Original strand, 29338033 - 29338302
Alignment:
Q  81 ggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaat 180  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||   |||||| || |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  29338033 ggggcttttacggtaggacaaacaatcataaaagatgtgtcaagcaaagctgccaaacatgagaaaacgtgttctaacaatcaacatgctcttataccat 29338132  T
Q  181 ttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccat 280  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||   ||||||||||||||||  || |||||| | ||||| | |||||| ||| ||||||| |||||    
T  29338133 ttgcttttgacacttctgacttcctagcaccagagatcgttgaccttctacatatggttcaaagggtcatgcacatcaatgtcatgactcctaggtccat 29338232  T
Q  281 aaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttg 350  Q
     ||| |||||||||| |  ||||||||| | |||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  29338233 gaatgttgtgtttacaaggattgatttttctatccaaaatggcctagcagtgcagcttgttgcccacttg 29338302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 319
Target Start/End: Original strand, 4165919 - 4166114
Alignment:
Q  124 gcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttga 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||||    
T  4165919 gcaaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggttgttga 4166018  T
Q  224 ccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaa 319  Q
    |||||||||||||||  ||| | | ||||||  |||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  4166019 ccttctacatagagtttaaaaggtcatgcatgacaatgtcatgtcacctaggtcaataaatatagtgtttacgaggattggttttgccatccaaaa 4166114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 362
Target Start/End: Original strand, 28008903 - 28009222
Alignment:
Q  43 acttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  28008903 acttgactggagtttcaccactcgtgggattaggggtcggggcttttacggtaggacatgcaaccctaaaagctacgtcaagcaaagcggtcaaacatga 28009002  T
Q  143 gaaagcgtgttctgacaatc---aacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtc 239  Q
    |||||| |||||| ||||||   || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||   || || || | |  |||||||||||  ||| |||     
T  28009003 gaaagcttgttctaacaatcaagaatatggttttataccatttgcttttgacacttttggct---taacaccaaaagttgttgaccttctgtatatagtt 28009099  T
Q  240 caaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttg 339  Q
    |||||| | || || | |||||| ||| ||||||| ||||| ||  |||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||     
T  28009100 caaagggtcatacacaacaatgtcatgactcctaggtccatgaacgttgtctttaccagaattgattttgcaatccaaaaaggcctaacgacgcagctta 28009199  T
Q  340 ttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||    
T  28009200 ttgtccgtttgccttctattcat 28009222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 13398140 - 13398376
Alignment:
Q  85 cttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgc 184  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||| |||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |    
T  13398140 cttttacggtagaatagacaattctacaagttgtatcaagtaaaacggtcaaatatgaaaaagcatgttccgacaatcaacatatttttatactatttac 13398239  T
Q  185 ttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaat 284  Q
    |||||| | ||||| ||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| | | || |||||| |||||||    
T  13398240 ttttgatatttttgacttcctaacatcagaagttgttgacattctacatagagttcaaaagatgatgcataacaatgtcacgacttctagatgcataaat 13398339  T
Q  285 tttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaag 321  Q
     ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  13398340 gttgtgtttacgatggttgattttgtcatccaaaaag 13398376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24016541 - 24016261
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||  || ||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||    
T  24016541 acatgcatgtgtgaatttgaccggagtttccccacttgtgggattaggagtcggggctttttgggaaga-cagacaaccgtaaaagttgcatcaagtaaa 24016443  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
     | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||| |||| |  |||||  ||     
T  24016442 atagtcaaacatgagaaagcttgttctcacaatcaacatgtttttataccatttgctattgatagttttggtttcctagcaccagatgttgttgattttt 24016343  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgc 310  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| |  ||||| ||||||||||  | ||||||| || |||||||||  |||| ||||||    
T  24016342 tacatagagttcaaagggtcatgcacaagaatgtcatgtctcctaagtacataaatattatgtttacgataattggttttgc 24016261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34415641 - 34415408
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  || |||||||||||| | || || |  || ||| |||||||||||||    
T  34415641 acatacatttgtgaacttgattggggtttcaccacacgttggattaggggtcaggacttttacggtaggataggcatccttacaagctgcgtcaagcaaa 34415542  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
     |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || |||||| || || | |||||||||||||    
T  34415541 atggcgaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgcttttatgccatttgtttttgacactttaggtttcctaacaccaaatgcagttgaccttc 34415442  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgt 262  Q
    || ||||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  34415441 tatatagagttcaaatggtcatgcatagcaatgt 34415408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28543580 - 28543394
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | || |||  || |||||||||||  |||| || |  ||||||| ||||||||||||    
T  28543580 acatgcatgtgtggatttgactgaggtttcaccacttgtgggattagaggtcaggacttttacggtaagacaggcagccttaaaagtcgcgtcaagcaaa 28543481  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagag 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  28543480 gtggccaaacatgagaaatcgtgttttgaaaatcactatgctcttatactatttgattttgacactttcagcttcctagcattagag 28543394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28626054 - 28625806
Alignment:
Q  111 aaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgctttt-atacaatttgcttttgacacttttggcttcctagca 209  Q
    |||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| |||| |||||||    |||||||||    
T  28626054 aaagctgcgtcaagtaaggtggctaaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacattttttttataccatttgttttttacactttcaatttcctagca 28625955  T
Q  210 tcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttg 309  Q
     ||||||  ||||| |||||||||| ||| |||| | | ||||||| || ||| || |||| ||| || || ||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  28625954 ccagaggttgttgagcttctacataaagttcaaaaggtcatgcataaca-tgtcatatctcataggtctatgaatgttgtgtttacggagattgattttg 28625856  T
Q  310 ccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  28625855 ccattcaaaaagatctagcggcgcagcttattacccgtttgccttctatt 28625806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3715042 - 3714858
Alignment:
Q  109 taaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagc 208  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||  || || |||||||||||||| |||| ||||    
T  3715042 taaaagttgtgtcaaacaaaatggttaaacatgagaaaacgtgttctcacaattaacatgtttttatatcatctgtttttgacacttttgacttcttagc 3714943  T
Q  209 atcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgttt 293  Q
    | || || |  |||| ||||||||||||||  |||| || ||||| | |||||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  3714942 accaaagactcttgatcttctacatagagtttaaagaatcatgcacaacaatgtcatgtctcataaatccatgaatgttgtgttt 3714858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34169021 - 34168913
Alignment:
Q  81 ggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaat 180  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| ||    
T  34169021 ggggcttttaccgtaggacatgcaaccctaaaatttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcatgtttggacaagcaacatgcttttataccat 34168922  T
Q  181 ttgcttttg 189  Q
    |||||||||    
T  34168921 ttgcttttg 34168913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7749439 - 7749353
Alignment:
Q  276 tccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7749439 tccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatcctaaaaggtctagcggtgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 7749353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12401536 - 12401388
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | | || |  ||||||||| ||||| |||  || | |||||||||||||||| ||||    
T  12401536 acatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttatgggattatggttcagggcttttatggtaggacaagcagcactaaaagttgcgtcaaacaaa 12401437  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatac 177  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  12401436 gtggccaaacataagatagcgtgttttgctaatcaacatgcttatatac 12401388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32115733 - 32115622
Alignment:
Q  219 gttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaa 318  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||    
T  32115733 gttgaccttctacaaagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgctatctaaa 32115634  T
Q  319 aaggtctagcgg 330  Q
    ||||||||||||    
T  32115633 aaggtctagcgg 32115622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 362
Target Start/End: Original strand, 3137369 - 3137482
Alignment:
Q  249 atgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgct 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||| |    
T  3137369 atgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaaaggcttagcagtgcaacttgttgcccgtt 3137468  T
Q  349 tgcctcctattcat 362  Q
    ||||| | ||||||    
T  3137469 tgccttccattcat 3137482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34168897 - 34168793
Alignment:
Q  257 caatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcct 356  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  34168897 caatgtcatgactcctagatccatgaatgttgtgtt-acgaggattggttttgctatccaaaaaggcctagcggcgcaacttgtcgcccgcttgccttct 34168799  T
Q  357 attcat 362  Q
    ||||||    
T  34168798 attcat 34168793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 321
Target Start/End: Original strand, 26225602 - 26225773
Alignment:
Q  150 tgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggatta 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||   ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |  |||| ||||| ||||||||| |||||| | |    
T  26225602 tgttctgacaatcaacatgcttttttaccagttatgtttgacatttttggctttctagcactagatgttgttggccttcaacatagagttcaaaggctca 26225701  T
Q  250 tgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaag 321  Q
    |||| || ||  |||||||| |||| || ||  |||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  26225702 tgcagagaaacattatgtcttctaggtcgatggattttgtgtttatgaggattggttttgtcatccaaaaag 26225773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22986115 - 22985885
Alignment:
Q  40 tggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaaca 139  Q
    ||||||| | |||| |||||||| || |||| | |||| |  ||||||| | ||| | ||| ||| |||| ||||| || ||||||| | ||||||||      
T  22986115 tggacttaattgggatttcaccagttttgggattagggatcagggctttaatggtgggacaaacagctctcaaagtcgcatcaagcagattggtcaaatg 22986016  T
Q  140 tgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtc 239  Q
    ||||||| | |||| || |||||||| | ||||||||| | |||  ||||||| |||||||| |||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  22986015 tgagaaaacatgttatggcaatcaacgtacttttatactacttgtgtttgacatttttggctacctaacatcataggttgtttaccttctatatagagtc 22985916  T
Q  240 caaaggattatgcatagcaatgttatgtctc 270  Q
    |||| | | || |||||| ||||||| ||||    
T  22985915 caaaaggtcatacatagccatgttatatctc 22985885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Original strand, 23802279 - 23802509
Alignment:
Q  40 tggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaaca 139  Q
    ||||||| | |||| |||||||| || |||| | |||| |  ||||||| | ||| | ||| ||| |||| ||||| || ||||||| | ||||||||      
T  23802279 tggacttaattgggatttcaccagttttgggattagggatcagggctttaatggtgggacaaacagctctcaaagtcgcatcaagcagattggtcaaatg 23802378  T
Q  140 tgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtc 239  Q
    ||||||| | |||| || |||||||| | ||||||||| | |||  ||||||| |||||||| |||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23802379 tgagaaaacatgttatggcaatcaacgtacttttatactacttgtgtttgacatttttggctacctaacatcataggttgtttaccttctatatagagtc 23802478  T
Q  240 caaaggattatgcatagcaatgttatgtctc 270  Q
    |||| | | || |||||| ||||||| ||||    
T  23802479 caaaaggtcatacatagccatgttatatctc 23802509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32115894 - 32115776
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||| || |||  ||||||| ||| |||  || |  ||||||||||||||| ||||    
T  32115894 acatgcatgtgtagacttgaccggggtttcatcacttatgggattaggtgtcgggcattttacgttaggacatgcagccttaaaagttgcgtcaaacaaa 32115795  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaag 147  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  32115794 gtggccaaacatgagaaag 32115776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28543374 - 28543269
Alignment:
Q  257 caatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcct 356  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||    
T  28543374 caatgttatgtttcctaggtccataaatattatgtttaagaggattggttttgccatctgaaaagatctagcggcgcaactaattgtccgcttgccttct 28543275  T
Q  357 attcat 362  Q
    ||||||    
T  28543274 attcat 28543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 361
Target Start/End: Original strand, 45816 - 45855
Alignment:
Q  322 gtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45816 gtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 45855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6225191 - 6225077
Alignment:
Q  115 ttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcaga 214  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||   |||||  ||||||||||||| ||| ||| || ||||    
T  6225191 ttgcgtcaaataaagtggtcaaacatgagaaattttgttgtgacaatcaacatgcttatatgtcatttgtgtttgacacttttgcctttctatcaccaga 6225092  T
Q  215 ggcagttgaccttct 229  Q
     ||  ||||||||||    
T  6225091 tgctcttgaccttct 6225077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 361
Target Start/End: Original strand, 749501 - 749562
Alignment:
Q  300 attgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  749501 attgattttgccatccaaaaacgtctgacgacacagcttgttgtccgcttgccttctattca 749562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 361
Target Start/End: Original strand, 2134994 - 2135038
Alignment:
Q  317 aaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  2134994 aaaaagtctagcggcgcagcttgttacctgcttgccttctattca 2135038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34644771 - 34644441
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  34644771 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacaagcaaccctaaaagttgcgtcaaacaaa 34644672  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34644671 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaacctacatgcttttataccatttgtttttgacactttcggcttcctagcatcagaggttgttgaccttc 34644572  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34644571 tacatagagtccaaagggttatgcatatcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagtctagc 34644472  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34644471 ggcgcagtttgttgcccgcttacctcctatt 34644441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2764684 - 2764354
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| | || ||   |||||||||| ||||  ||||    
T  2764684 acatgcatgtgtgaacttgattgaggtttcaccacttgtgggtttaggggttggtgcttttatggtaggataggcagtcctaaaagttgtgtcagacaaa 2764585  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2764584 gtggtcaaacatgagaaaacgtgttccgacaatcaacatgcttttatgccattttcttttgacactttcagcttcctagcatcagaggttgttgaccttc 2764485  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2764484 tacataaagtccaaagggttatgcaaatcaatgttatgtctcttaggtccataaatgttgtgtttacgatgattgattttaccatccaaaaaggtttagc 2764385  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    ||||||||||||| |||| || |||| ||||    
T  2764384 ggcgcagcttgttacccgtttccctcgtatt 2764354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 359
Target Start/End: Original strand, 28041029 - 28041359
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || ||  ||||||| |||| | || || ||||||||   ||||||| ||||    
T  28041029 acatgcttgtgtagacttgactggggtttcactacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggataggcagctctaaaatccgcgtcaaacaaa 28041128  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28041129 gtggccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacaggtttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggcggttgaccttc 28041228  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||  |||  ||||| ||| ||||| | | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28041229 tacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtcctctaagtccatgaatgttgtgctcatgaggattgatttttccatccaaaaaggtctagc 28041328  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  28041329 ggcggagcttgttgtccgcttgtcttctatt 28041359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22347042 - 22346768
Alignment:
Q  86 ttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgct 185  Q
    |||||| |||| ||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  22347042 ttttaccgtaggacaaacaac-ctaaaagttatgtcaagcaaagtggccaaatatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcgtttataccttttgct 22346944  T
Q  186 tttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaatt 285  Q
    ||||||||||| || ||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||||||||| |  || |||     
T  22346943 tttgacactttcggtttcctagtagcagaggttgttgaccttctacacagagttcaaaaggtcatgcatagaaatgtcatgtctcctaggtttatgaatg 22346844  T
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22346843 ttgtgttcacgaggattagttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgtccgcttgccttctattca 22346768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 47459753 - 47459555
Alignment:
Q  163 aacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgt 262  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47459753 aacatgtttttataccatttgcttttgatacttttggcttcctagtatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggaatatgcatagcaatgt 47459654  T
Q  263 tatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||||||||  || |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  47459653 tatgtctcctaagtctataaatgttgtgtttacgagaattgatttagccattcaaaaaggtctagc-gcgcagcttgttgtctgcttggctcctattcat 47459555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21473121 - 21472876
Alignment:
Q  116 tgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagag 215  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  21473121 tgcgtcaagtaaaatggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacacttgcagtttcctagcaccagag 21473022  T
Q  216 gcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatcc 315  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||| | ||  | || |||||||||||    
T  21473021 gctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgcgttcaggaggactggttttgccatcc 21472922  T
Q  316 aaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||    
T  21472921 aaaaaggtctagcggcgcaacttattgcccgcttgcattctattca 21472876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 4861891 - 4862208
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||||   | | |||| ||||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||    
T  4861891 acatgcatgtgtggatttgactggtgtttcaccacttgttggattaggggtcttgacatttatggtaggacagacagccttaaaagttgcgtcaagtaaa 4861990  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || || | |  ||||||||||    
T  4861991 atggtcaaacatgagaaagcgtcttctgacaagcaacatacttttatacaatttgcttttgacactttcgatttcctaacaccaaaagttgttgaccttc 4862090  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattga-ttttgccatccaaaaaggtctag 327  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||| |||||| | ||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||  |  |||| ||||    
T  4862091 tacatagagttcaaagggtcatgcataacaatgtcacgtcccttagatccatgaatgttgtgattacgaggattgatttttgccatatatgaaggcctag 4862190  T
Q  328 cggcgcagcttgttgccc 345  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4862191 cggcgcagcttgttgccc 4862208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 45659549 - 45659863
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactct-aaaagttgcgtcaagcaa 127  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | ||| ||||||| |||| |||  || | || ||||| ||||||||| ||    
T  45659549 acatgcatgcgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtatcgggccttttaccgtaggacatgcagcccttaaaagctgcgtcaagtaa 45659648  T
Q  128 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacctt 227  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||||| |||||||||    
T  45659649 ggtggccaaacacgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcgatttcctatcaccagaggctgttgacctt 45659748  T
Q  228 ctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctag 327  Q
    ||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||  |  | ||||| || ||||||||||||||    
T  45659749 ct--atagagttcaaaagatcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtcaataaatgtcgtgtttacgaggaccggttttgtcacccaaaaaggtctag 45659846  T
Q  328 cggcgcagcttgttgcc 344  Q
    | |||||  ||||||||    
T  45659847 ctgcgcaaattgttgcc 45659863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 274
Target Start/End: Original strand, 29169696 - 29169940
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||| ||||||| |||| ||||||| | || ||||||| |||||| ||     
T  29169696 acatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccactt-tgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggacagacagcccttaaagttgtgtcaagtaag 29169794  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||||||    
T  29169795 gtggccaaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttaaccttc 29169894  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctag 274  Q
    |||||||||| |||| | | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  29169895 tacatagagttcaaaaggtcatgcacagcaatgtcatgtctcctag 29169940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 361
Target Start/End: Original strand, 31737304 - 31737556
Alignment:
Q  108 ctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctag 207  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  || ||||    
T  31737304 ctaaaagcggcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacatattctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcgattttctag 31737403  T
Q  208 catcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattt 307  Q
    ||| ||||||  ||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||    
T  31737404 cattagaggctattgacattctacatagagttcaaaaggtcatgcatatcaatgttatgtttcctagatccatgaa-ttagtgtttacgaggattgattt 31737502  T
Q  308 tgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  31737503 tgccatccaaaaaggcttggcggcgcagcttgttgtctgtttgccttctattca 31737556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 20259699 - 20260015
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||| | ||| ||  |  ||||||| | | |||||  | | ||||||| | |||||||||||    
T  20259699 acatgcatgtgtagacatgactagggttttaccgcttgtgggattaggtgtcagaccttttaccggaaaacaggtagccctaaaagctacgtcaagcaaa 20259798  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| || ||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  20259799 gtggttaaaaatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttattgttgacactttcggtttcttagcaccagaggttgttgaccttc 20259898  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||||| ||  |  |||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20259899 tacatagagttcaaaaggtcatgcatagtaatgtcatgtctcataagttaataaatgttgtgtttatatggattggttttgccatccaaaaaggtctagc 20259998  T
Q  329 ggcgcagcttgttgccc 345  Q
    ||||||| |||||||||    
T  20259999 ggcgcagtttgttgccc 20260015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 361
Target Start/End: Original strand, 24177526 - 24177745
Alignment:
Q  142 agaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtcca 241  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  24177526 agaaagtgtgtaccgacaatcaacatatttttataccatttgtttttgacagtttcggtttcctagcatcagaggctgtttaccttctacatagagttca 24177625  T
Q  242 aaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgtt 341  Q
    ||   | |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24177626 aaaagtcatgcatagcaatgtcatatctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgaggattggttttgccaaccaaaaaggtctagcggtgcagcttgtt 24177725  T
Q  342 gcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  24177726 gcccgcttgtcttctattca 24177745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 359
Target Start/End: Original strand, 50161319 - 50161656
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||| || |   |||||||||| ||||  | |||||  | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50161319 acatgcatgtgtggacttaaccgatatttcaccactcgtggaattaggggctgagacttttacggtaggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagcaaa 50161418  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgctttt---gacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacc 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||    | |||||||||| ||||||| || |||  | ||||     
T  50161419 gtggacaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgcttttatatcatttttttttttatatacttttggctccctagcaccaaaggttgatgaca 50161518  T
Q  226 ttctacatagagtccaaaggattatgcatagca----atgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaag 321  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    |||||| | | | ||| ||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||| ||| |||| |    
T  50161519 ttctacatagagttcaaaggatcatgcagagcaatgcatgttacgacacataggtccatgaatgttgtgtttaagaggattgaatttgctatctaaaacg 50161618  T
Q  322 gtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    |  ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  50161619 gcttagcggcacagcttgttgcccttttgccttctatt 50161656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19035653 - 19035464
Alignment:
Q  28 cacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaa 127  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| || ||  ||||||| ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||||    
T  19035653 cacatgcttgtgtagacttgactgggatttcaccagttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagggcaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaa 19035554  T
Q  128 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggc 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  19035553 agtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttacttttgacacttacggtttcctagcaccagaggc 19035464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2898836 - 2898595
Alignment:
Q  103 caactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaag----cgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttg 198  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  2898836 caaccctaaaagatgcatcaagcaaagtggccaaacatgagaaagtgagcgtgttctgacaatcaata-gtttttataccatttgcttttgatactttcg 2898738  T
Q  199 gcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctccta-gatccataaattttgtgtttacga 297  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| | ||||||| || ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  2898737 gtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaagatcatgcataacaatatcatgtctcatacgat-catgaatgttgtgtttaaga 2898639  T
Q  298 atattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgtt 341  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  2898638 ggattgattttgccatccaaaaaggcttagcggcgtagcttgtt 2898595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 139 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38731704 - 38731546
Alignment:
Q  139 atgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  38731704 atgagaaagcgtgttctgacaatcaacatacttttatacaatttgcttttgaaacttttggcttcttagcaccagaggttgttaaccttctacatagagt 38731605  T
Q  239 ccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacga 297  Q
     |||||| | ||||| |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  38731604 tcaaagggtcatgcacaataatgtcatgactcctaggtccatgaatattgtgtttacga 38731546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16500187 - 16500034
Alignment:
Q  81 ggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaat 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||| || ||||| | |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||    
T  16500187 ggggcttttacggtaggacagacaatcctaaaagttgcgtcacgtaaagtggccaaatataagaaaacatgttctaacaattaacatgcctttatactat 16500088  T
Q  181 ttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacata 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16500087 ttgcttttgacacttttgacttcctagcattagaggctgttgaccttctacata 16500034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 25375735 - 25375912
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||| | ||||| |||||  ||||||||| ||| || || | ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25375735 acatgcaagcgtggatttgaccagggtttcactactcgtcggattaggggtcagagcttttacggtaggacagacaactccaaaagttgcgtcaagcaaa 25375834  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttccta 206  Q
    |||  ||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25375835 gtgaccaaacatgacaaaacatgttcttaccatcaacatgtttttataccatttgctattgacacttttggcttccta 25375912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 48841169 - 48841317
Alignment:
Q  214 aggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||  ||||||||||| ||    
T  48841169 aggcagttgaccttctacatagagtctaaagagttatgcataataatgttatgtctcctaaatctatgaatattatgtttacgaggattgattttgcaat 48841268  T
Q  314 ccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  48841269 ccaaaaaagtctagcagcgcaacttgttgtccgcttacctcatattcat 48841317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Original strand, 37932120 - 37932374
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||    ||||||||| |||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  37932120 acatgcatgcgtggacttgattgaggtttcaccacttgtgggattaggggccaaggcttttacagtaagacagacagccctaaaagttgtgtcaagcaaa 37932219  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
     |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  |||   |||| ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| |||    
T  37932220 atggtcaaatacgagaaag-gtgttctgacaatcaacgtgtttttacattattatttttttacactttcggcttcctagcaccagaggatgttgacattc 37932318  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaat 284  Q
    || || ||||  |||   |  ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  37932319 tatattgagtttaaacattcgtgcatagtaatgtcatgtctcataggtccataaat 37932374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 319
Target Start/End: Original strand, 50314599 - 50314815
Alignment:
Q  102 acaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggct 201  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   |    
T  50314599 acaactctaagagctgcataaagcaaagtggtcaaacatgacaaaacttgttctcacaatcaacatgcttttataccatttacttttgacattttttatt 50314698  T
Q  202 tcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatat 301  Q
    ||||| ||  ||| |  |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |  | |||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| | ||     
T  50314699 tcctaacacaagatgttgttgactttctacatagagttcaaagggttatacgcaacaatgtcatgactcctag-tccatgaataatgtgtttaccattac 50314797  T
Q  302 tgattttgccatccaaaa 319  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  50314798 tgattttgctatccaaaa 50314815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Original strand, 868525 - 868635
Alignment:
Q  249 atgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgct 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  ||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868525 atgcatagcaatgtcatgtctcctaagtccatgaatt--gtgttcacaaggattggttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgct 868622  T
Q  349 tgcctcctattca 361  Q
    ||||| |||||||    
T  868623 tgccttctattca 868635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7213341 - 7213116
Alignment:
Q  144 aaagcgtgttctgacaatcaacatgctttt-atacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaa 242  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| |||| |||  ||||  |||||||||||| || |||||||||| |||| | ||||| ||||| |||| ||| |||    
T  7213341 aaagcatgttctgataattaacatgttttttatatcatttatttttgacactttcggtttcctagcattagagactgttgagcttctgcataaagttcaa 7213242  T
Q  243 aggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaat-------attgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcag 335  Q
    |   | |||||||  ||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  7213241 aatgtcatgcataataatgtcatgtcttctaggtccatgaatgttgtgttcacgaatcacgatgattggttttaccatccaaaaaggtctagcggcgcaa 7213142  T
Q  336 cttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  7213141 cttgttgcccgcttgccttctattca 7213116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5454053 - 5453967
Alignment:
Q  276 tccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||| ||| |||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454053 tccatgaatgttgtgtttacaaggattggttttgtcatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 5453967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36487035 - 36486921
Alignment:
Q  85 cttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgc 184  Q
    |||||| |||| || ||||| || ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  36487035 cttttatggtaaaatagacatctttaaaaattgcatcaagtaaagtggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaatatctttttatataatttgc 36486936  T
Q  185 ttttgacacttttgg 199  Q
    |||||||||||||||    
T  36486935 ttttgacacttttgg 36486921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 42920057 - 42919832
Alignment:
Q  36 tgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtca 135  Q
    ||||||| ||||| || | |||||| ||| ||||| | | |||| || ||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||    
T  42920057 tgtgtgggcttgattgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcatcaaacaaagcggcca 42919958  T
Q  136 aacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatag 235  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||||||||||  |||| ||||  ||||   ||| |||||||||||||    
T  42919957 aacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgcttttgacacttttgatttccaagcagtagagattgttaaccttctacatag 42919859  T
Q  236 agtccaaaggattatgcatagcaatgt 262  Q
    |||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  42919858 agtttaaagggtcatgcagagcaatgt 42919832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Original strand, 18616153 - 18616322
Alignment:
Q  127 aagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgc-ttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacc 225  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| | ||| |||||| | ||||| ||||||     
T  18616153 aagtgatccaacatgagaaaacgtgttc-gataatcaacatgtgttttataccatttgtttttaacactttcgactttctagcacccgaggctgttgaca 18616251  T
Q  226 ttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacg 296  Q
    ||||||||| | | |||||| | |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  18616252 ttctacatataattcaaagggtcatgcatagcaatattatgtatcttaggtccataaatattgtatttacg 18616322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30688534 - 30688429
Alignment:
Q  257 caatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcct 356  Q
    |||||| ||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30688534 caatgtcatgactcctgggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgttatccaaaaaggcctagcggcgcagcttgttgcccgcttgccatct 30688435  T
Q  357 attcat 362  Q
    ||||||    
T  30688434 attcat 30688429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37200107 - 37200012
Alignment:
Q  109 taaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcct 205  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37200107 taaaagttacgtcaagtaaagtggtcaaacataagaaagcatgtgctaacaatcaatatgtttttataccatttg-tttttacacttttggcttcct 37200012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 286 - 361
Target Start/End: Original strand, 1114027 - 1114102
Alignment:
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  1114027 ttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaaaggtctaacggcacagcttgttgcccgcttggcttctattca 1114102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4611159 - 4611070
Alignment:
Q  264 atgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  4611159 atgtctcctaggtccatgaatattgtgttcacgatgattgattttgtcatccaaaaaggtctaacagcacagcttgttgtccgcttgcct 4611070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21934357 - 21934262
Alignment:
Q  255 agcaatgttatgtctcctagatccataaat-tttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgctt 349  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  21934357 agcaatgttttgtctcctagttccatgaatgtttgtatttaagaggattggttttgccatccaaaaagggttagcggcgcagcttgttgcctgctt 21934262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19035426 - 19035352
Alignment:
Q  287 tgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  19035426 tgtgttcacgaggattggttttgtcatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgtccgattgccttctattca 19035352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 361
Target Start/End: Original strand, 28493504 - 28493565
Alignment:
Q  300 attgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || |||||||    
T  28493504 attgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagtttgttgtccgtttgtcttctattca 28493565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 273
Target Start/End: Original strand, 35387643 - 35387802
Alignment:
Q  110 aaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagca 209  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||   |||| |||||||||||||  |||||    
T  35387643 aaaatttgcatcaagcaaagtggccaaacatgaaaaagtgtgttctgacgatcaacaagcttttatac-tttctttttttacacttttggctttttagca 35387741  T
Q  210 tcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctccta 273  Q
      | |    ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||||||||    
T  35387742 ctaca---tgttgatcttctacatagagttcaaagggacatgcatatcaatgtcatgtctccta 35387802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15584988 - 15584853
Alignment:
Q  120 tcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcag 219  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||  |||| |      
T  15584988 tcaagcaaagtgatcaaacattggaaaacgtattctgacaatcaacatgtttctataccatttgcgtttgaca-tttttgattcctagcactagagcctc 15584890  T
Q  220 ttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatag 256  Q
    |  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  15584889 tgaatcttctacaaagagttcaaaggatcatgcatag 15584853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 268
Target Start/End: Original strand, 35550090 - 35550216
Alignment:
Q  142 agaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtcca 241  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  || ||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||  | |||  |||| ||||||| | |||||  |    
T  35550090 agaaagtgttttctgacaatcaacataattctatattatttacgtttgacactcttggcttcctagcactataggttgttggccttctaaaaagagttta 35550189  T
Q  242 aaggattatgcatagcaatgttatgtc 268  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  35550190 aaggatcatgtataacaatgttatgtc 35550216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23044009 - 23043929
Alignment:
Q  102 acaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaattt 182  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |  || || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23044009 acaaccctcaaagctgcatcaagcaaagtggccaaatatgagaaaacaagtactcacaatcaacatgcttttataccattt 23043929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 346
Target Start/End: Original strand, 45835345 - 45835404
Alignment:
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccg 346  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||    
T  45835345 ttgtgtttacgaggattgattttgccatccaaaaa-gtctagctgcgcagtttattgcccg 45835404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7433346 - 7433264
Alignment:
Q  111 aaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacac 193  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||  | ||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||    
T  7433346 aaagtcgcgtcaagcaaagtgatcaaatatgagaaaatgtgttcataaaatcaacgtatttttataccatttgcatttgacac 7433264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 44420639 - 44420593
Alignment:
Q  307 ttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44420639 ttgccatccaaaaaggcttagcggcgcagtttgttgctcgcttgcct 44420593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 359
Target Start/End: Original strand, 6670208 - 6670337
Alignment:
Q  230 acatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcg 329  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||  |||||| || |||||||||| ||| ||| || | |||||||  ||| |||||||||||||||||  | |||      
T  6670208 acatagagttcaaagagtcatgcattacaatgtcatatctcctagattcatgaatgttatatttacgataattaattttgccatccaaaaaaatatagta 6670307  T
Q  330 gcgcagcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  6670308 gcgcaccttgttgtccacttgccttctatt 6670337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 362
Target Start/End: Original strand, 6790793 - 6790898
Alignment:
Q  258 aatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgatttt-gccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcct 356  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| ||| || |||||||||  || |||||| | |||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  6790793 aatgttgtgtcttctaggtccatgaatgttatgtttacgataatagatttttgtcatccaaaaagacctagcggcacagtttgttacccgcctgccttct 6790892  T
Q  357 attcat 362  Q
    ||||||    
T  6790893 attcat 6790898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19035458 - 19035425
Alignment:
Q  135 aaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatg 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19035458 aaacatgagaaagcatgttctgacaatcaacatg 19035425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 176
Target Start/End: Original strand, 37918072 - 37918137
Alignment:
Q  111 aaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttata 176  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37918072 aaagtcgcgtcaagcaaagttattaaacattaaaaaggatgttctgacaatcaacatgtttttata 37918137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7483832 - 7483769
Alignment:
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttg 350  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  7483832 ttgtgtttacgaagattagttttgccatctaaaaaggcttagcggcgcagc-tgttgctcgcttg 7483769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Original strand, 40515997 - 40516068
Alignment:
Q  249 atgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaag 321  Q
    |||||| ||||| | ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  40515997 atgcatggcaatataatgtctc-tagattcatgaatgttgtgtttacgattattgattttgcaatccgaaaag 40516068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39434872 - 39434558
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  39434872 acatgcatgtgtgtacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtggaggcttttacagtaggacaggaagctctaaaagttgcgtcaagcaaa 39434773  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39434772 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacacttttgacttcctagcatcagaggcatttgatcttc 39434673  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39434672 tacatagagtccaaagggttatgcatatcaatgtaatgtctcttagatccatgaatgttgtgtttacgaggattgattttgccatccaaaaaggtctagc 39434573  T
Q  329 ggcgcagcttgttgc 343  Q
    |||||||||||||||    
T  39434572 ggcgcagcttgttgc 39434558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 50 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38815478 - 38815166
Alignment:
Q  50 tggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcg 149  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| | |||||||   || ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  38815478 tggggtatcaccacttgtgggattaggggtcggggcttttatggtaggacagacagccctaaaagccacgccaaacaaagtggccaaacatgagaaagcg 38815379  T
Q  150 tgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggatta 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  38815378 tgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttccgcttcctagcaccagagggtgttgaccttctacatagagttcaaagggtca 38815279  T
Q  250 tgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgctt 349  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  38815278 tgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggtttttccatccaaaaaggcttagcggcgcagcttgttgcccgctt 38815179  T
Q  350 gcctcctattcat 362  Q
    |||| ||||||||    
T  38815178 gccttctattcat 38815166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3188174 - 3187861
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaac-tctaaaagttgcgtcaagcaa 127  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||  | | |||||||||||| ||||||||    
T  3188174 acatgcatgtgtggccttgtgtggggtttcaccacttgtgggtttaggg-tcggggcttttacggtaggacaggaagcctctaaaagttgcatcaagcaa 3188076  T
Q  128 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacctt 227  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  3188075 agtggcaaaacatgaggaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgaaactttcggcttcctagcatcagaggttgttaacctt 3187976  T
Q  228 ctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctag 327  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||     
T  3187975 ctacatagagt-caaagggttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagaattggttttgccatccaaaaaggtctaa 3187877  T
Q  328 cggcgcagcttgttgc 343  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  3187876 cggtgcagcttattgc 3187861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24125233 - 24124901
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | || | | |||||||||| | |||  || | ||||||| ||| |||||||||    
T  24125233 acatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattatgcgtcgtgccttttacggtgggacaagcagccctaaaagctgcatcaagcaaa 24125134  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  24125133 atggccaaacatgagaaagcgtgctctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacaattttgatttcctagcaccagaggttgttggccttc 24125034  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||| ||| |||| | | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |  |||  |||||||||||  ||| |  | ||    
T  24125033 tacataaagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcataggtccatgaatgttgtgtttacaaggattagttttgccatccgtaaaagcttggc 24124934  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  24124933 ggcgcagcttttttgccgcttgccttctattca 24124901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 274
Target Start/End: Original strand, 35739889 - 35740133
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtggg-ttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  35739889 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccactagtgggattaagg--tcgggccttttacggtaggacagacatccctaaaagttgtgttaagcaa 35739986  T
Q  128 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacctt 227  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||   |||||||||    
T  35739987 agtggccaaacatgagaaagcgggttctgacaatcaacatgtttttatacaattagcttttgacactttcagtttcctagcaccagagattgttgacctt 35740086  T
Q  228 ctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctag 274  Q
    ||||||||||| ||||   | ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  35740087 ctacatagagttcaaaaagtcatgcataacaatgtcatgtcccctag 35740133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 500432 - 500200
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||    
T  500432 acatgcatgtgtagacttgagtgaggtttcaccacttgtgggattaggtgtcgggccttttacggtaggaccgacagccctaaaagttgcgtcaagcaaa 500333  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || ||||||| || |||||  |||| |||||    
T  500332 gtggccaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttacttttgacattttcggtttcctagtatgagagg-tgttggccttc 500234  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgt 262  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||| ||||||    
T  500233 tacatagagttcaaaaggtcatgcatatcaatgt 500200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 342
Target Start/End: Original strand, 25021716 - 25022029
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |  | |||||| |||  ||| ||| | |||||||||| ||||||||||    
T  25021716 acatgcatgtgtggacttgaccggagtttcaccacttgtgggattaggggtcgatgtttttacagtatgacatacagccctaaaagttgtgtcaagcaaa 25021815  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||    
T  25021816 gtggtgaaatatgagaaagtgtgttctcacaatcaacatgtttttataccattttcttttgacatttttggcttcctagcaccagaggttgttgaccatc 25021915  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
     ||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| || |||||||| ||||  ||| |||||||||| |  |||||||||  ||||||||||  ||||||    
T  25021916 cacacaaagttcaaagggtcatgcacaacaatgtcatatctcctaggtccaggaatgttgtgtttacaatgattgattttatcatccaaaaaattctagc 25022015  T
Q  329 ggcgcagcttgttg 342  Q
    | || |||||||||    
T  25022016 gacgtagcttgttg 25022029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4700064 - 4699760
Alignment:
Q  38 tgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaa 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || | | |||||||||  | | | ||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4700064 tgtggatttgactggggtttcaccacttgtgggtttaaggatcgcggcttttacaatcggatagacaaccctcaaagttgtgtcaagcaaagtggccaaa 4699965  T
Q  138 catgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagag 237  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  4699964 catgataa-gcgtgttctcacaattaacatgtttttacaccatttg-tgttaacacttttggcttcatagcaccagaggctgttgaccttctatataaag 4699867  T
Q  238 tccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagct 337  Q
    | |||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  4699866 ttcaaagg-tcatgaatagcaatattatgtcacctaggtccatgaatgttgtgtttacaaggattagttttgccatccaaaaaggcttagtggcgcagct 4699768  T
Q  338 tgttgccc 345  Q
    ||||||||    
T  4699767 tgttgccc 4699760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6592700 - 6592472
Alignment:
Q  109 taaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagc 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  6592700 taaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagc 6592601  T
Q  209 atcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgatttt 308  Q
      ||||||  ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||  ||||| ||||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  6592600 tccagaggttgttgaccttctgcatagagttcaaaaggtcatgcata-taatgtcatgtctcataggttcatgaatgttgtgtttacgagtattggtttt 6592502  T
Q  309 gccatccaaaaaggtctagcggcgcagctt 338  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6592501 gtcatccagaaaggtctagcggcacagctt 6592472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 157 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37514298 - 37514102
Alignment:
Q  157 acaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatag 256  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||     
T  37514298 acaatcaacatgcgtttatactatttgcttttgacactttcaatttcctagcgccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatat 37514199  T
Q  257 caatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||| || ||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37514198 caatgttacgtctcttaggtccatgaatgttgtattcacgaggattgatcttgccacccaaaaaggtctaacggcgcagcttgttgcccgcttgcct 37514102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 84 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4073685 - 4073415
Alignment:
Q  84 gcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttg 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4073685 gcttttacggtggaacagacaaccctaaaagttgcatcaaacaaagtggtcaaacaagagaaaacgtgttttaccaatcaacatgattttatacaatttg 4073586  T
Q  184 cttttgacacttttggc-ttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataa 282  Q
    | ||||||||||||| | ||  ||| | ||||||  |||||||||||||| |||   ||| |  | |||||||||||||| |||| ||| |||||| | |    
T  4073585 catttgacacttttgccatttttagtaccagaggttgttgaccttctacagagaaatcaatgagtcatgcatagcaatgtcatgtttccaagatccgtga 4073486  T
Q  283 attttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    || ||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |  ||||| | || |||||| |||||||||||    
T  4073485 atgttgtgtttacgagaattgattttatcatccaaaaaagcttagcgacacaacttgtttcccgcttgcct 4073415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8620013 - 8619811
Alignment:
Q  35 atgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtc 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || | | | | |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8620013 atgtgtgaacttgactggggtttcaccacttgtgggattagagatcgtgacttttacgatagaacagacagccctaaaagttgcgtcaagtaaaatggtc 8619914  T
Q  135 aaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacata 234  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| || ||||||  |||||| ||| |||||    
T  8619913 aaacatgaaaaagcgtattttgacaatcaacgtgcttttataccatttgtttttaacatttttggctttctaacaccagaggttgttgactttcgacata 8619814  T
Q  235 gag 237  Q
    |||    
T  8619813 gag 8619811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 185 - 353
Target Start/End: Original strand, 22589395 - 22589562
Alignment:
Q  185 ttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaat 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||| ||| || || |||    
T  22589395 ttttgacactttcggtttcctagcaccagaggctgttgacttt-tacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcataggtctatgaat 22589493  T
Q  285 tttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
     ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22589494 gttgtgttcacgaggattggttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 22589562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 135 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28196291 - 28196082
Alignment:
Q  135 aaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacata 234  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||  ||||||| ||||| ||    
T  28196291 aaacatgagaaagtgtgttatgataataaacatgtttttataccatttgtttttgacacttttgtcttcctagcaccataggttgttgaccatctacgta 28196192  T
Q  235 gagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgca 334  Q
    |||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  28196191 gagttcaaaggatcatgcacaacaatgtcatgtctcctagatccacggatgttgtgtttacgggaattgattttgtcatccaaaaa-gcctaacggcgca 28196093  T
Q  335 gcttgttgccc 345  Q
     ||||||||||    
T  28196092 acttgttgccc 28196082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6618409 - 6618178
Alignment:
Q  109 taaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagc 208  Q
    |||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  6618409 taaaagttgcgtcaaatagagtagttaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagc 6618310  T
Q  209 atcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgatttt 308  Q
      |||||   ||||||||| | ||||| || |||| | | |||||||  ||||| ||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  6618309 tccagagattgttgaccttttgcatagcgttcaaaaggtcatgcata-taatgtcatgtctcataggtccatgaatgttatgtttacgagtattggtttt 6618211  T
Q  309 gccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgtt 341  Q
    | ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  6618210 gtcatccaaaaagatctaacggcacagcttgtt 6618178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43824053 - 43823864
Alignment:
Q  170 ttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtct 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||  ||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||    
T  43824053 ttttataccatttgcttttgacacttttggcttccttgcattagaggctattgacctttcacatagagttcaaatggtcatgcatagcaatgtcatgtct 43823954  T
Q  270 cctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||   ||||  |||| |||| ||||||| ||||  ||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  43823953 ccgagatccattaatgttgtgtttacggcaattgggtttgtcatctaaaaaggcctagttgcgcaactttttgccctcttgccttctatt 43823864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10189748 - 10189568
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | | ||||||   |||||||| ||||| ||| |||   |||||||||||| |||  |||    
T  10189748 acatgtatgtgtggacttgattgggatttcaccgcttgtgagattaggggttaaggcttttatggtaggacatacattcctaaaagttgcgccaattaaa 10189649  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagca 209  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  10189648 gtagtcaaacaagagaaagcatgttctgacaatcaacatgtttttatatcatttgcatttgacatttttggcttcctagca 10189568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18804654 - 18804486
Alignment:
Q  192 acttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgt 291  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | | ||||||| |||||| ||| ||||||| | || |   ||| |||    
T  18804654 acttttgatttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatagatttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgactcctaggttcagagtgttt-tgt 18804556  T
Q  292 ttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18804555 ttacgaggattggttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcctgcttgccttctattca 18804486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37517292 - 37517163
Alignment:
Q  36 tgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtca 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||| || ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  37517292 tgtgtagacttgactggggtttcgccacttgttggattaggcgtaggaccttttaccgtaggacagacagctctaaaagctgcatcaagcaaagtggcca 37517193  T
Q  136 aacatgagaaagcgtgttctgacaatcaac 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37517192 aacatgagaaagggtgttccgacaatcaac 37517163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3821270 - 3821148
Alignment:
Q  188 tgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaatttt 287  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||    
T  3821270 tgacacttttggcatcctagaaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtaatgcatagcaatgtcatgtctcctaggttcataaatgtt 3821171  T
Q  288 gtgtttacgaatattgattttgc 310  Q
     |||||||||  |||||| ||||    
T  3821170 atgtttacgaggattgatattgc 3821148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42659230 - 42659101
Alignment:
Q  231 catagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcgg 330  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | ||| ||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  42659230 catagagtctaaagggttatgcatagcaatattatgtcttctaggttcatgaatgttgtgtttacgaggattaattttgtcatccaaaaaggtctaacgg 42659131  T
Q  331 cgcagcttgttgcccgcttgcctcctattc 360  Q
       | ||||||| |||||||||||||||||    
T  42659130 tataacttgttgtccgcttgcctcctattc 42659101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8882445 - 8882371
Alignment:
Q  116 tgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttga 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||    
T  8882445 tgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatatgcttttaaaccatttgtttttga 8882371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 206
Target Start/End: Original strand, 42922109 - 42922206
Alignment:
Q  109 taaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttccta 206  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42922109 taaaagttgcgtcaaacaaaatggtcaaatttgagaaaacgtgttttgacaatcaaaatgcttttaaatcatttgcctttgacacttttggcttccta 42922206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3825705 - 3825527
Alignment:
Q  164 acatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgtt 263  Q
    |||||||||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||| | || |||  |||||||||||||| ||| | |||||  | ||||||||||| ||     
T  3825705 acatgcttttattccatttgcatgtgacacctttggcttcctagaaccataggttgttgaccttctacacagaattcaaagagtaatgcatagcaacgtc 3825606  T
Q  264 atgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgc 343  Q
    |||| || ||||||||| ||| ||||||||||||  ||| || |||||||  |||||   ||||||||||| ||||||||    
T  3825605 atgtttcatagatccatgaatattgtgtttacgatgattaatattgccat-taaaaaaacctagcggcgcaacttgttgc 3825527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8115937 - 8115779
Alignment:
Q  108 ctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctag 207  Q
    |||||||||  ||||| || ||||||||||| | ||||| | |||||| | |||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||     
T  8115937 ctaaaagttatgtcaatcagagtggtcaaacgtaagaaatcttgttctaataatcaatatacttttataccatttgcatttgacacttttggtttttta- 8115839  T
Q  208 catcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgt 267  Q
     || |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  8115838 aatgagaggttgttgaccttctacataaagttcaaaggatcatgcattgcaatgtcatgt 8115779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Original strand, 39671170 - 39671325
Alignment:
Q  126 aaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaattt-gcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgac 224  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||   |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| ||    
T  39671170 aaagtggccaaaccagagaaagcgtgttttgacaattaacatgtttttatacaatttatttttttacattttcggcttcctagcaccagaggttgttaac 39671269  T
Q  225 cttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccat 280  Q
    ||| ||| ||||||  ||||| | ||| |||  ||||| |||||||||||||||||    
T  39671270 cttttacgtagagttaaaagggtcatgaataaaaatgtcatgtctcctagatccat 39671325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3863387 - 3863289
Alignment:
Q  164 acatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgt 262  Q
    |||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  3863387 acatgcttttattccatttgcatgtgacacttttggcttcctaggaccagaggttattgaccttctacatagagttcaaagggtagtgcatagcaatgt 3863289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 320
Target Start/End: Original strand, 10556292 - 10556485
Alignment:
Q  126 aaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacc 225  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||| || |||  |||||||||| || ||||||||||  |||| |||||||      
T  10556292 aaagtggtcaaacatgagaaaacatattctgaaaatcaacatgtttttatataaattgtatttgacacttatgacttcctagcactagagacagttgata 10556391  T
Q  226 ttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaa 320  Q
    |||| |||||||| ||| |  | ||||| | ||||||  || ||| ||| | ||| ||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||||||    
T  10556392 ttctgcatagagttcaatgagtcatgcaaaacaatgtcgtggctcatag-ttcatgaatgttgtgtctacaaaaattgattttgctatccaaaaa 10556485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 321
Target Start/End: Original strand, 8540359 - 8540574
Alignment:
Q  109 taaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagc 208  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||   || ||| |||||||||||   ||| ||| |    
T  8540359 taaaagttgcgtcaaacaaaatagtcaaacattagaaaatgtgttctaacaatcgacatgtttttatgtcatctgcatttgacactttcaactttctaac 8540458  T
Q  209 atcagaggcagttgaccttctacatag---agtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgat 305  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||    ||| |||||| | |||| || |||||| |||| | |||  | ||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  8540459 atcagaggttgttgactttctacataataaagttcaaagggtcatgcttaacaatgtcatgttttctattttcataaatgttgtgtttacgatgattgat 8540558  T
Q  306 tttgccatccaaaaag 321  Q
    |||  |||||||||||    
T  8540559 tttatcatccaaaaag 8540574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 361
Target Start/End: Original strand, 18596759 - 18596833
Alignment:
Q  287 tgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  18596759 tgtgttcacgaggattggttttgccatccgaaaaggtctagcggcgcagcttgttgtcagcttgccttctattca 18596833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 320
Target Start/End: Original strand, 9259384 - 9259485
Alignment:
Q  219 gttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || | |||||  ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9259384 gttgaccttctacatagagttcacagactcatgcatagcaatgtcatatatcctaagtccatgaatgttgtatttacgaagattgattttgtcatccaaa 9259483  T
Q  319 aa 320  Q
    ||    
T  9259484 aa 9259485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44337268 - 44337212
Alignment:
Q  305 ttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44337268 ttttgccatccaaaaaggtccagcggc-cagcttgttgctcgcttgcctcctattcat 44337212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Original strand, 11611150 - 11611275
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |    || ||||||||||| ||  | ||||| | |||||||||| |||||  |||    
T  11611150 acatgcatgtgtggacttcacaggggtttcaccactcgtgggatta----tgagggcttttacgataagatagacatccctaaaagttgtgtcaaataaa 11611245  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgac 158  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  11611246 gtggccaaatatgagaaagcatgttctgac 11611275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8882314 - 8882235
Alignment:
Q  264 atgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgc 343  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  8882314 atgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattaattttgccatcaaaaaatgtttaacggcgcagcttgttgc 8882235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24451105 - 24451018
Alignment:
Q  249 atgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagctt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  24451105 atgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgatgattg-ttttgccatcc-aaaatatctagcggcgcagctt 24451018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6792245 - 6792165
Alignment:
Q  258 aatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagctt 338  Q
    ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  6792245 aatgtcatgtctcataagtccataaatgttgtgtttacgaatattggttttgtcatcaagaaagatctagcggcacagctt 6792165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 166273 - 166166
Alignment:
Q  120 tcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcag 219  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||| |||| |||| | ||||| | |||||||||||||||| || || | |    
T  166273 tcaaacaaagtgtccaatcatgagaaagcgtgttctgacaacaaacatattttcatactatttacgtttgaaatttttggcttcctagcaccatagaccg 166174  T
Q  220 ttgacctt 227  Q
    ||||||||    
T  166173 ttgacctt 166166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36004245 - 36004126
Alignment:
Q  111 aaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcat 210  Q
    ||||||| || ||| |||||||  ||| |||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||| ||     
T  36004245 aaagttgggtaaagtaaagtggctaaatatgacaaagtgcgttatgacaatcaacatgtttttataccatttacatttgacatttttgacttcctatcac 36004146  T
Q  211 cagaggcagttgaccttcta 230  Q
    ||||||  ||||||| ||||    
T  36004145 cagaggttgttgaccatcta 36004126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 309
Target Start/End: Original strand, 121716 - 121903
Alignment:
Q  120 tcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcag 219  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| |||  ||||||  ||| ||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||   |    
T  121716 tcaagtaaagttgtcaaatatgataaaatgtgttcgcacagtcaacatgcttatatt--atttgcttttgaaacttttaacttcctagcctcagagattg 121813  T
Q  220 ttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttg 309  Q
    ||||| ||||||| | |||  ||| ||| ||||||| |||||| |||||  |||  |||||  || ||||||||||||  ||||||||||    
T  121814 ttgacattctacacaaagtttaaaagatcatgcatatcaatgtcatgtcatctaagtccatggatgttgtgtttacgaggattgattttg 121903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 167
Target Start/End: Original strand, 22589336 - 22589394
Alignment:
Q  109 taaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22589336 taaaagctgcgtcaagcaaaatggctgaacatgagaaagcgtgttctgacaaccaacat 22589394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24320285 - 24320227
Alignment:
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcc 344  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24320285 ttgtgtttacgaggattgattttgatatccaaaaaggtctagcagtgcagcttgttgcc 24320227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 500200 - 500115
Alignment:
Q  276 tccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  |  |||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  500200 tccatgaatgttgtgtttacgaggattgattttaccattcaaaaaggcttgacggcacagcttattgcccgcttgccttctattca 500115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15566208 - 15566152
Alignment:
Q  305 ttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||    
T  15566208 ttttgccatccaaaaaagtctagcggcatagtttgttgcccgcttgcattctattca 15566152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 27713949 - 27714000
Alignment:
Q  161 tcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatca 212  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27713949 tcaacatgcttttataccatttacgtttgatatttttggcttcctagcatca 27714000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27715421 - 27715312
Alignment:
Q  161 tcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaat 260  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||| ||||||||| |||| | |  |||||||||||| | ||||| ||||||   || |||  ||||    
T  27715421 tcaacatgcttttataccatttacgtttgatatttttagcttcctagtatcataagttgttgaccttctaaaaagagttcaaagggcaatacatcacaat 27715322  T
Q  261 gttatgtctc 270  Q
    ||||||||||    
T  27715321 gttatgtctc 27715312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 362
Target Start/End: Original strand, 24350881 - 24350957
Alignment:
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  24350881 ttgtgtttacgaggattggttttgccctccaaaaaagcctagtggcccagcctgttgcccgcttatcttctattcat 24350957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Original strand, 28517189 - 28517522
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28517189 acatgtatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacagtaggacagacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaa 28517288  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28517289 gtggccaaacatgagaaagcgtgtttagacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacacttttgacttcctagcatcagagacagttgaccttc 28517388  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28517389 tacatagagtccaaagggttatgcataacaatgttatgtctcctaagtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaaaagtctagc 28517488  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    | | ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28517489 gacacagcttgttgcccgtctgcctcctattcat 28517522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5825476 - 5825145
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||  | | ||||||| ||| |||||||||    
T  5825476 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcgaggcttttacggcaggacaggaagccctaaaagctgcatcaagcaaa 5825377  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||  ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||||||    
T  5825376 gtg--caaacatgacaatgcgtgttatgacaatcaacatgtttttataccatttacttttgacactttcggcatcctagcaccagaggttgttgaccttc 5825279  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||  |    
T  5825278 tacatagagtcgaaagggttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtctatggatgttgtgtttacgaggattggttttgccatcgaaaaaggtcttac 5825179  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5825178 ggcgcagcttgttacctgcttgcctcctattcat 5825145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 361
Target Start/End: Original strand, 21326747 - 21327072
Alignment:
Q  36 tgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtca 135  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| | ||| || ||  ||||||| |||| ||| ||| | |||||||  |||||||||||||||| ||    
T  21326747 tgtgtagatttgattggagtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaaacagccctaaaagccgcgtcaagcaaagtggcca 21326846  T
Q  136 aacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatag 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  21326847 aacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcgatttcctagcaccagaggctgttgaccttttacatag 21326946  T
Q  236 agtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcag 335  Q
    ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21326947 agttcaaaaggtcatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgaggattgattttgccatccaaaaaggtctaacggcgcag 21327046  T
Q  336 cttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||    
T  21327047 cttgttgtctgcttgccttctattca 21327072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4501463 - 4501140
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4501463 acatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaaacaaa 4501364  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||  ||||||||||    
T  4501363 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatataatttgcttttgacac-tttggttttctagcaccagaggttgttgaccttc 4501265  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||   |||| |||| |||||||||||||    
T  4501264 tacatagagttcaaaagttcatgcatagcaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgaggattagctttgtcatctaaaaaggtctagc 4501165  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
     ||||| ||| ||| ||||||||||    
T  4501164 agcgcatcttattgtccgcttgcct 4501140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 32584806 - 32584483
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| |||| ||||||||||| |||  |||| |||||| |||| |||| ||||    
T  32584806 acatgcatgtgtggacttgactcgggtttcacctcttgtgggattaggggtcggggattttacggtaggacatgcaaccctaaaaattgcatcaaacaaa 32584707  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  32584706 gtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaagatgcttttacaccatttgcttttgacactttatgtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 32584607  T
Q  229 tacatagag-tccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctag 327  Q
    || |||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32584606 tagatagagttccaaaagatcatgcatatcaatgttatgtctcatagatcgatgaatgttgtgtttacaaagattgattttaccatccaaaaaggcctag 32584507  T
Q  328 cggcgcagcttgttgcccgcttgc 351  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||    
T  32584506 cagcgcaacttgtcgcccgcttgc 32584483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19277498 - 19277164
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  |  |  ||||| | |||| |||| ||   ||||||| |||||||||||||    
T  19277498 acatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtcggattaggtttcagaccttttgccgtaggacaggcagtcctaaaagctgcgtcaagcaaa 19277399  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  19277398 gtagccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 19277299  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtt--tacgaatattgattttgccatccaaaaaggtcta 326  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19277298 tacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacacgaaaattggttttgccatccaaaaaggtcta 19277199  T
Q  327 gcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  19277198 gcggcgcagcttattgcccgcctgccttctattca 19277164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 45613744 - 45614076
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| || ||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  45613744 acatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtaggattaggtgtcgggcctttttccgtaggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagtaag 45613843  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||  |||||    
T  45613844 gtgaccaaacacgggaaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgattttgacactttcggtttccaagcaccagaggctgttagccttc 45613943  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||| |||||| |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45613944 tacatagagttcaaaagttcatgcataacaatgtcaaatctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccgaaaaggtctagc 45614043  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45614044 ggcgcagcttgttgtccgcttgccttctattca 45614076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 123 - 362
Target Start/End: Original strand, 40726476 - 40726715
Alignment:
Q  123 agcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttg 222  Q
    |||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||    
T  40726476 agcaaagtggccaaacataataaaatgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgtttttgacactttcggcttcatagcatcagaggttgttg 40726575  T
Q  223 accttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaagg 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |    
T  40726576 accttctacatagagtccaaagggttatgcataacaatgctatgtctcctagatccatgaatgttgtgtttatgaggattgattttgccatccaaaaatg 40726675  T
Q  323 tctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40726676 tctaacatcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 40726715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43857079 - 43856788
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  43857079 acatacatgcgtggacttgacgggggtttcaccacttgtgggattaggggtcggggcttttacagtaggacagacaacattaaaagatgcgtcaatcaaa 43856980  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||  ||||||||||    
T  43856979 gtggctagacatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatgcgtttatacaatttgcttttgacatttttggtttcctaacaccagaggttgttgaccttc 43856880  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaa 320  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  43856879 tacatagagttcaaagggtcatgcacaacaatgtcatgactcctaggtccatgaatgttatgtttacgagaattgattttgctatccaaaaa 43856788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27521670 - 27521385
Alignment:
Q  35 atgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtc 134  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| | ||| || ||| |||||||||||| |||  || |  |||||||||||| || ||||||||||    
T  27521670 atgtgtagacttgactgagatttcaccatttgtgggattaggtgtcgggccttttacggtaggacatgcacccttaaaagttgcgttaaacaaagtggtc 27521571  T
Q  135 aaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacata 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27521570 aaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcatttatacaatttacttttgacacttttggtttcctagcatcagaggttgttgaccttctacata 27521471  T
Q  235 gagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaa 320  Q
    |||| |||| | | ||||||| |||||| ||||||||||  || || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  27521470 gagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaagtctatgaatgttgtgtttacgaggattgattttgccatcgaaaaa 27521385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 983154 - 982822
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||  ||||||  |||| |||| || |  |||||| |||||||||||||    
T  983154 acatgcttgtgtagacttgactagggtttaaccacttgtgggattaggtgtgggaccttttattgtaggacaggcagccataaaagctgcgtcaagcaaa 983055  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||||| ||||||  |||| |||||    
T  983054 gtggccaaacatgagaaatcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgatactttcggttttctagcaccagaggttgttggccttc 982955  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||| |||||| |||||| |||  ||||| ||| ||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  982954 tacatagagttcaaaaggtcatgcatatcaatgtcatgtcttctatgtccatgaatgttgtgttcacgaggattggtattgccatccaaaaaggtctagc 982855  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    | | |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  982854 gacacagcttgttgcctgtttgccttctattca 982822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22198191 - 22197860
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| | | ||| || ||| |||||| ||||| ||   || | |||||||  ||||||||||||    
T  22198191 acatgcatgtgtagatttgattggggtttcgccacttgtgcgattaggtgtcgggccttttatggtaggacgcgcagccctaaaagcggcgtcaagcaaa 22198092  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22198091 gtgaccaaacatgagaaagtgtgttccaacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgtcactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccttc 22197992  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  22197991 tacatagagttcaaaaggttatg-atagcaacgtcatgtctcctaggtcaatgaatgttgtgtttacgataattgattttgtcatccaaaaaggcttggc 22197893  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    || ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  22197892 ggtgcaacttgttgcccgcttgtcttctattca 22197860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 22239630 - 22239961
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| | | ||| || ||| |||||| ||||| ||   || | |||||||  ||||||||||||    
T  22239630 acatgcatgtgtagatttgattggggtttcgccacttgtgcgattaggtgtcgggccttttatggtaggacgcgcagccctaaaagcggcgtcaagcaaa 22239729  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22239730 gtgaccaaacatgagaaagtgtgttccaacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgtcactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccttc 22239829  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  22239830 tacatagagttcaaaaggttatg-atagcaacgtcatgtctcctaggtcaatgaatgttgtgtttacgataattgattttgtcatccaaaaaggcttggc 22239928  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    || ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  22239929 ggtgcaacttgttgcccgcttgtcttctattca 22239961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24527787 - 24527482
Alignment:
Q  36 tgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtca 135  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| || ||||||| | ||| || ||  ||||||| |||| |||| || | |||||||  | |||||| |||||||  |    
T  24527787 tgtgtagacttgactagggtctcatcatttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaggcagccctaaaagcagtgtcaagtaaagtgggaa 24527688  T
Q  136 aacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatag 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  24527687 aacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcacgagaggcggttgaccttctacatag 24527588  T
Q  236 agtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcag 335  Q
    ||| |||| | | |||||||||||||| || |||||| | ||||| ||| |||| || ||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24527587 agttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatttctccttggtccatgaatgttgtattcacgaggattggttttgtcatccaaaaagatctagcggcgcag 24527488  T
Q  336 cttgtt 341  Q
    ||||||    
T  24527487 cttgtt 24527482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 361
Target Start/End: Original strand, 25186894 - 25187165
Alignment:
Q  85 cttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgc 184  Q
    ||||||| |||| ||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| ||||||    
T  25186894 cttttaccgtaggacataaaaccctaaaagttgtgtcaagtaaagtggtctaacatgagaaagcgtgttccgataatcaacatgtttttctaccatttgc 25186993  T
Q  185 ttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaat 284  Q
    ||||||     | || |||| | ||  |||||  |||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  25186994 ttttga-----tcggtttccgaacactagaggttgttgaccttctatatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctagatccatgaat 25187088  T
Q  285 tttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
     |||||||  | |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25187089 gttgtgttcccaatgattgattttaccatctaaaaagatctagcggcgcagcttgttgcccgcttgccttctattca 25187165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 48539261 - 48539094
Alignment:
Q  154 ctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgca 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | | |||||    
T  48539261 ctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggttttctagcaccagaggctgttgatcgtctacatagagtccaaaaggtcatgca 48539162  T
Q  254 tagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaag 321  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  48539161 tagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaaag 48539094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10905243 - 10904990
Alignment:
Q  108 ctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctag 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  10905243 ctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaatatgagaaaaagtgttctgacactcaacatgcttt-ataccatttgcttttgacacttttggttgcctag 10905145  T
Q  208 catcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattt 307  Q
    || |||||   |||||||||||||||||||| |||||    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |  |||||| |    
T  10905144 caccagagtatgttgaccttctacatagagttcaaagagccatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgtcgtgtttacaaggattgatct 10905045  T
Q  308 tgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
      ||||||||||||  ||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  10905044 gaccatccaaaaagacctagtagcgcagcttgttaccctcttgcattctattcat 10904990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 338
Target Start/End: Original strand, 30216040 - 30216268
Alignment:
Q  109 taaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagc 208  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30216040 taaaagctgcgtcaagcaaaatggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagc 30216139  T
Q  209 atcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgatttt 308  Q
    |||||||   ||||| |||| ||||| ||| |||| | | |||||||||||||| || |||||||| || || ||| ||||||| ||||  || ||||||    
T  30216140 atcagagtttgttgatcttccacataaagttcaaatggtcatgcatagcaatgtcatatctcctaggtctatgaatgttgtgttcacgaggatcgatttt 30216239  T
Q  309 gccatccaaaaaggtctagcggcgcagctt 338  Q
    | ||| ||||||| || || ||||||||||    
T  30216240 gtcattcaaaaagatcgag-ggcgcagctt 30216268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3676845 - 3676675
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaa-ctctaaaagttgcgtcaagcaa 127  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  ||||||| |||| |||| | | | ||||||| ||||||||||||    
T  3676845 acatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggtccttttaccgtaggacaggccagccctaaaagctgcgtcaagcaa 3676746  T
Q  128 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttg 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3676745 agtggtcaaacatcagaaagcgtgttcttactatcaatatgcttttataccatttgcttttgacacttttg 3676675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 362
Target Start/End: Original strand, 45003007 - 45003132
Alignment:
Q  237 gtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagc 336  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45003007 gtccaaagagttatgcatagcaatgttatgtctcataggaccatgaatgttgtgtttacgaagattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagc 45003106  T
Q  337 ttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    || ||| |||||||||||||||||||    
T  45003107 ttattgtccgcttgcctcctattcat 45003132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 245
Target Start/End: Original strand, 9281091 - 9281249
Alignment:
Q  86 ttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgct 185  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  9281091 ttttacagtaggacagacaaccctaaaagctgcatcaagcaaactag-caaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgga 9281189  T
Q  186 tttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaagg 245  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9281190 tttgacattttttgcttcctagcaccagatgttgttgaccttctacatagagttcaaagg 9281249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 245
Target Start/End: Original strand, 9292062 - 9292220
Alignment:
Q  86 ttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgct 185  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  9292062 ttttacagtaggacagacaaccctaaaagctgcatcaagcaaactag-caaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgga 9292160  T
Q  186 tttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaagg 245  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9292161 tttgacattttttgcttcctagcaccagatgttgttgaccttctacatagagttcaaagg 9292220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38839532 - 38839352
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| |  ||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  38839532 acatgcatgtgtggacttgactgagatttcatca-ttgtgggatttggggtcgtgtcttttacggaagaacagacaactctaaaagttgcgtaaaataaa 38839434  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgc----ttttatacaatttgcttttgacacttttggcttccta 206  Q
     | ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38839433 atcgtcaaacatgagaaagcatgttatgtcaatcaacatgcatgtttttatataatttgcttttgacacttttgacttccta 38839352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2904548 - 2904368
Alignment:
Q  51 ggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgt 150  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||  | ||| |||||||||| | |||||   ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  2904548 ggggtttcaccacttgtgaggttaggggatgaggcatttacggtaggatagacagtcctaaaagttacgtcaagcaaaatagtcaaacatgagaaagcat 2904449  T
Q  151 gttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctac 231  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||  |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  2904448 gttccgacaatcaacatgattttatatcatttgtttgtgacatgtttggcttcctagcactagaggttgttgaccttctac 2904368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 297
Target Start/End: Original strand, 42295174 - 42295354
Alignment:
Q  117 gcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagagg 216  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||| || |||||| || ||| ||    
T  42295174 gcgtcaagcaaaatggccaaacataagaaagcttcttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttttatactttcggtttcctaacaccagggg 42295273  T
Q  217 cagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacga 297  Q
      ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  42295274 ttgttgaccttctacatagcgttcaaaatatcatgcataacattgtcatgtctcctaggtccatgaatcttgtgtttacga 42295354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23037669 - 23037457
Alignment:
Q  109 taaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctg-acaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctag 207  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||| | |||| |  | |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||   ||| ||     
T  23037669 taaaagttgcgtcaaacaaagtagttaaatatgagaaaacatgttttatataatcaacatgtttttatatcattt-cttttgacacttttaatttc-taa 23037572  T
Q  208 catcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattt 307  Q
    | |||||||  ||||||| ||||| ||| || |||||| |||||||||||||||| || |||| ||| || || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  23037571 cgtcagaggttgttgaccatctacgtagggttcaaagggttatgcatagcaatgtcatttctcttaggtctatgaattttgtgtttacgaggattgattt 23037472  T
Q  308 tgccatccaaaaagg 322  Q
    ||||||| |||||||    
T  23037471 tgccatctaaaaagg 23037457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38766262 - 38766196
Alignment:
Q  296 gaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38766262 gaatattggttttgccatccaaaaaggtctagctgcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 38766196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47679330 - 47679122
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggt-taaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaa 127  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| | |||||||||   || ||    | ||||||||||||||||| ||||    
T  47679330 acatacatgtctagacttgactagggtttcaccacttgtgggggttaggggtagcggcttttacaaaaggacgagtatctctaaaagttgcgtca-gcaa 47679232  T
Q  128 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacctt 227  Q
    ||||   ||| ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||||| |||  |||||||||    
T  47679231 agtgacaaaatatgagaaagtgtgttctcacaatcaatatacttttatactatttgcgtttgacattttcggtttcctagcatcacaggttgttgacctt 47679132  T
Q  228 ctacatagag 237  Q
    ||| ||||||    
T  47679131 ctaaatagag 47679122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 344
Target Start/End: Original strand, 41117833 - 41117988
Alignment:
Q  190 acacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgt 289  Q
    ||||||| || |||||| || |||| |  ||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  41117833 acactttcggtttcctaacaccagatgttgttaaccttctacatagagtttaaaagatcatgcatagcaatgtcatgtttcctaggtccatgaatgttgt 41117932  T
Q  290 gtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgca-gcttgttgcc 344  Q
    ||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  41117933 gttcacgatgattgattttgctatccaaaaaagtccagcggcgcaggcttgttgcc 41117988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 155
Target Start/End: Original strand, 33202367 - 33202493
Alignment:
Q  28 cacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| |||| | ||| | | ||  |||||||||| | | |    
T  33202367 cacatgcatgtgtggacttgact-gggtttcaccgcttgtgggattaggggttggggcttttacagtaggatagaaagccctggaagttgcgtccaacta 33202465  T
Q  128 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttct 155  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33202466 agtggccaaacatgagaacgcgtgttct 33202493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38832225 - 38832174
Alignment:
Q  311 catccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38832225 catccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 38832174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34772907 - 34772682
Alignment:
Q  106 ctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcct 205  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| | |||| ||||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||| |||||    ||| |    
T  34772907 ctctaaaagttg--tcaatcaaagtagccaaatatgagaaagtgtgttcggacaattaatatgtttttataccatttgcttttgaaactttcaatttctt 34772810  T
Q  206 agcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgat 305  Q
    || || |||||  |||||||||||||||| | | ||||   | ||||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| |    
T  34772809 ag-attagaggttgttgaccttctacataaacttcaaaaagtcatgcatatcaatgtcatgttttctaggtccatgaatattgtgtttacgataattggt 34772711  T
Q  306 tttgccatccaaaaaggtctagcggcgca 334  Q
    |||||||| |||||| || || |||||||    
T  34772710 tttgccattcaaaaaagtttaacggcgca 34772682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 255
Target Start/End: Original strand, 10032193 - 10032299
Alignment:
Q  149 gtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggatt 248  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| | |||  ||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  10032193 gtgttctgacaatcaatatgtttttatactatttgcttttgatattttcagcttcttagcattagatgttgttaaccttctacatagagttcaaaggatc 10032292  T
Q  249 atgcata 255  Q
    |||||||    
T  10032293 atgcata 10032299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 361
Target Start/End: Original strand, 27027758 - 27027864
Alignment:
Q  255 agcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctc 354  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||| |||||||     
T  27027758 agcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgaggattggttttgctatccaaaaagatctagcggtgtagcttgttacccacttgcctt 27027857  T
Q  355 ctattca 361  Q
    |||||||    
T  27027858 ctattca 27027864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23793096 - 23792951
Alignment:
Q  150 tgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggatta 249  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||  | ||   |||||||||||||  ||| ||||| || |||  |||||||||||| ||| ||| |||||||| |    
T  23793096 tgttttgacaatcaacatgcttctatatcaattatgtttgacacttttgttttcttagcaccacaggttgttgaccttctaaatacagttcaaaggatca 23792997  T
Q  250 tgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttac 295  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  23792996 tacatagtaatgtaatgtctcctaggtctataaatcttgtgtttac 23792951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 361
Target Start/End: Original strand, 45974731 - 45974833
Alignment:
Q  259 atgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctat 358  Q
    |||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  45974731 atgtcatgtctcctaggttcatgaatgttgtgtttacaaggataaattttgtcatccaaaaaggtctagtggcgcagcttgttgtccgcttgtcttctat 45974830  T
Q  359 tca 361  Q
    |||    
T  45974831 tca 45974833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Original strand, 47251787 - 47251892
Alignment:
Q  132 gtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctac 231  Q
    |||||| |||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| | |||||| || |||    
T  47251787 gtcaaatatgagaaaacatgttctcacaatcctcatgcttttata-aatttgtttttgacattttcgacttcctagcatcagagacggttgacattttac 47251885  T
Q  232 atagagt 238  Q
    |||||||    
T  47251886 atagagt 47251892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 321
Target Start/End: Original strand, 5972293 - 5972410
Alignment:
Q  204 ctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattg 303  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||   | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||  |||     
T  5972293 ctagtatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaatgtcatgcatagtaatgtcatttctcccagatctatgaatgttgtgtttacgaggatta 5972392  T
Q  304 attttgccatccaaaaag 321  Q
     |||||||||||||||||    
T  5972393 gttttgccatccaaaaag 5972410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 294
Target Start/End: Original strand, 6634993 - 6635130
Alignment:
Q  157 acaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatag 256  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||| |  ||  ||||||||||||  ||||||||||||| || | |  |||  ||  ||||||     
T  6634993 acaatcaacatatttttatatcatttgcttttgacagtttcgattttttagcatcagaggttgttgaccttctacgtaaaattaaaataatcttgcataa 6635092  T
Q  257 caatgttatgtctcctagatccataaattttgtgttta 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6635093 caatgtcatgtctcctagatccataaatgttgtgttta 6635130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 7637505 - 7637579
Alignment:
Q  120 tcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacactt 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7637505 tcaagcaaagtggtcaa-catgagaaagtgtgctctgacgatcaataagcttttataccatttgcgtttgacactt 7637579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26770525 - 26770454
Alignment:
Q  106 ctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatac 177  Q
    |||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26770525 ctctaaagattgcgtcaaataaagtggtaaaacatgagaaaacgtgttctgacaatctatatgcttttatac 26770454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1249735 - 1249653
Alignment:
Q  85 cttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacat 167  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  1249735 cttttacggtaggatagacagccctaaaacctgcgtcaaataaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttttgataatccacat 1249653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 34067769 - 34067941
Alignment:
Q  34 catgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggt 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |  |||    || ||||||| || | ||||||| | ||  |||| || |||||| |||||      
T  34067769 catgtgtggacttgaccggggttttcccacttgtgggattggggactaggacttttactgtgggacagacagccctcgaagtcgcttcaagccaagtgac 34067868  T
Q  134 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctag 207  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||| | |||||  |||||||||||||| |||||||    
T  34067869 caaacatgagaaagtgtgttttgacaatcaacat-tttctatgccatttgtatttgacacttttggtttcctag 34067941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44526000 - 44525927
Alignment:
Q  219 gttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtt 292  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  44526000 gttgaccttctacatggagttcaaaagaatatgcataacaatgtcatgtctcctatatccatgaatgttgtgtt 44525927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5715022 - 5714954
Alignment:
Q  252 catagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaa 320  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||    
T  5715022 cataacaatgttatgtctcctaggtccataaatgttgtgtttatgaagattggttttgtcatctaaaaa 5714954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 36931887 - 36931937
Alignment:
Q  311 catccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36931887 catccaaaaag-tctagcggcgcagcttgttatccgcttgcctcctattcat 36931937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Original strand, 9266175 - 9266246
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacag 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| |||| ||||    
T  9266175 acatgcatgtgtggatttgaccggg-tttcaccacttgtgggattaggggttagggcttttactgtaggacag 9266246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Original strand, 36558898 - 36559061
Alignment:
Q  157 acaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatag 256  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||||| || | |  |||||| |||| ||||||||  ||| | | |||||||     
T  36558898 acaatcaacatgtttttatataatttgcatttgacatttttggttttctagcaccaaaagtcgttgactttctccatagagt-taaatggtcatgcatat 36558996  T
Q  257 caatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaag 321  Q
     ||| | ||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||    
T  36558997 aaatatcatgtcttataggtccatgaatgttgtgtttacgatgaatgattttgctatctaaaaag 36559061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 345
Target Start/End: Original strand, 43333952 - 43334048
Alignment:
Q  249 atgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgccc 345  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| || ||| ||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||    
T  43333952 atgcatatcaatgacatgtctcctagatctatgaatgttgagtttatgatgattggttttgccattcaaaaagacttggcggcgcagcttgttgccc 43334048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 286 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32336355 - 32336285
Alignment:
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||     |||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  32336355 ttgtgttcacaaagattgattttgccatccaaaaaggt-----ggcgcaactttttgcccgcttgccttctattca 32336285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38766302 - 38766263
Alignment:
Q  241 aaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccat 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38766302 aaagggttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccat 38766263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 362
Target Start/End: Original strand, 2520918 - 2520956
Alignment:
Q  324 ctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2520918 ctagcggcgcagcttgttgtccgcttgccttctattcat 2520956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 29054783 - 29054730
Alignment:
Q  300 attgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29054783 attggttttgccatccataaaggattagcggcgcagcttattgctcgcttgcct 29054730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 353
Target Start/End: Original strand, 12137230 - 12137278
Alignment:
Q  305 ttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    |||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12137230 ttttgccatcaagaaagggttagcggcgcaacttgttgcccgcttgcct 12137278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 164
Target Start/End: Original strand, 24566960 - 24567004
Alignment:
Q  120 tcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaa 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  24566960 tcaagtaaagtggtcaaacatgagaaagggtgtttagacaatcaa 24567004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34856813 - 34856765
Alignment:
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgca 334  Q
    ||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34856813 ttgtgtttactgagattgattttgtcatctaaaaaggtctagcggcgca 34856765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 35310653 - 35310320
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35310653 acatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacagacaaccctaaaagatgcgtcaagcaaa 35310554  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  35310553 gtggccaaacatgagaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatctgcttttgacactttcggcttcctggcatcagaggctgttaaccttc 35310454  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| || |    
T  35310453 tacatagagtccaaagggttttgcatatcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagaattggttttgccatccaaagaggtttaac 35310354  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35310353 gacgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 35310320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27336898 - 27336567
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27336898 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacaataggacagacagccctaaaagttgcgtcaagcaaa 27336799  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336798 gtggtcaaacatgagaaatcgtgttctgacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacacttgtggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 27336699  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||   ||| | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27336698 tacatagag--aaaatggttatgtatagcaatgttatgtctcctaagtccatgaatgttgtttttacaaggattgattttgccatcaaaaaaggtctagc 27336601  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    || |||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  27336600 ggtgcagtttattgtccgcttgtctcctattcat 27336567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Original strand, 13166812 - 13167145
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtta-aggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  13166812 acatgcatgtgtggacttgactggg-tttcaccacttgtggattttatgggttagggcttttacggtgggacagacaaccctaaaatctgcgtcaagcaa 13166910  T
Q  128 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacctt 227  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13166911 agtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcatcagagactgttgacctt 13167010  T
Q  228 ctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctag 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||  ||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  13167011 ctacatagagtccaaagggttatgcatagcaatggtatgtctcctaggtccatgaatgttgggtttacgatgattgattctgttatccaaaaagatctag 13167110  T
Q  328 cggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13167111 cggcgcagcttgttgcccacttgcctcctattcat 13167145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Original strand, 33691957 - 33692287
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||   ||||||| |||||||||||||    
T  33691957 acatgcatgtgtggacttgactgaggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacaggcaggcctaaaagctgcgtcaagcaaa 33692056  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  33692057 gtggccaaacatgacaaaacgtgttatgacaatcaacatgcttttgtaccatttgcttttgacactttcggcttcttagcatcagagactgttgaccttc 33692156  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||| || |||||||||   ||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  33692157 tacatagtgtccaaagg-gtatgcataacaatgttatgtctcataggttcatgaatgttctgtttacga--tttggtttttccatccaaaaagatctagc 33692253  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33692254 ggcgcagcttgttgcctgcttgcctcctattcat 33692287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 346
Target Start/End: Original strand, 37873592 - 37873857
Alignment:
Q  81 ggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaat 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  37873592 ggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccat 37873691  T
Q  181 ttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| || |||| || ||    
T  37873692 ttgcttttgacacttttggcttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcagaacaatgtcatgacttctaggtctat 37873791  T
Q  281 aaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccg 346  Q
     ||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||    
T  37873792 gaatgttgtgtttaagaggattgattttgctatcaaaaaaggcctagcggtgcaacttgttacccg 37873857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 430686 - 430474
Alignment:
Q  150 tgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggatta 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  430686 tgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttgtcttcatagcatcagaggcagttgaccttctacatagattccaaagggtta 430587  T
Q  250 tgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgctt 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||    
T  430586 tgcatagtaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattgattatgccatccaaaaaggtctatcggtgcagcttgtngtctgctt 430487  T
Q  350 gcctcctattcat 362  Q
    |||||||||||||    
T  430486 gcctcctattcat 430474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 32269699 - 32270030
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | ||| || ||| |||||| ||||| |||  |||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  32269699 acatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccacttctggaattaggtgtcgggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagctgcatcaaccaaa 32269798  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||  |||||  ||||||||||    
T  32269799 gtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgatttcctagcactagaggttgttgaccttc 32269898  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    | |||  ||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||    
T  32269899 tgcatgaagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattgatttcgccatccaaaaaagcatagc 32269998  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    || |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32269999 gg-gcagcttgttacccgcttgccttctattca 32270030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 356
Target Start/End: Original strand, 25663013 - 25663261
Alignment:
Q  108 ctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctag 207  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25663013 ctaaaagctgcatcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgataatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcagcttcctag 25663112  T
Q  208 catcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattt 307  Q
    ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||  ||||  ||    
T  25663113 catcagaagttgttgatcttctacatagagtccaaagggttatgcatatcaatgttatgtcccctaggtccatgaatgttgagtttacgaggattggctt 25663212  T
Q  308 tgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcct 356  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||    
T  25663213 tgtcatccaaaaaggtctaacgacgcagcttgttgctcgtttgcctcct 25663261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 361
Target Start/End: Original strand, 15291935 - 15292259
Alignment:
Q  36 tgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtca 135  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||| || | | | || ||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  15291935 tgtgtagacttgaatgaggtttcaccacttgttggattaagtgtcgggccttttgcggtatgacagacaaccctaaaagtggcgtcaaacaaagtggcca 15292034  T
Q  136 aacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatag 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| | || ||||||  |||||   |||| |||||||| |     
T  15292035 aacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttatacaatttgttttttacacttttagttttctagcactagaggttattgatcttctaca-aa 15292133  T
Q  236 agtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcag 335  Q
    ||| |||| | | |||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  15292134 agttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcacatctcctaggtccatgaatgttgtgtttatgaggattgattttgccatccaaaaaagcttggcggcgcag 15292233  T
Q  336 cttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||    
T  15292234 tttgttgcccacttgccttctattca 15292259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 42921802 - 42921571
Alignment:
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  42921802 gtggtcaaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttatgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttggccttc 42921703  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| || | | | ||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  42921702 tacatagagttcagaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaagtccat-aatattgtgtttacaaggattggttttgccatccaaaaagatctagc 42921604  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42921603 ggcgcagcttgtttcccacttgccttctattca 42921571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14423870 - 14423586
Alignment:
Q  42 gacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatg 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||  |||| || |||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||  | ||||||    
T  14423870 gacttgattggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggacctttaaccgtaggacaggcaaccctaaaaaatgcgtcaagcaaagtgaccgaacatg 14423771  T
Q  142 agaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtcca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       
T  14423770 agaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttt----ctcctagcatcagaggctgttgaccttctacatagagt--t 14423677  T
Q  242 aaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcag 335  Q
    |||| | || |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||| || |  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14423676 aagg-taattcataacaatgtcatgtctcttaggtccataaa--ttgtgttcacaaggattggttttgccatccaaaaagatctagcggtgcag 14423586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34335542 - 34335209
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||| || | | ||||    |||||||| |||| | ||||||| |||||||    ||||||||||    
T  34335542 acatgcatgtgtggaattcactggggttctatcacttgtaggattaagggtcaaagcttttactgtaggatagacaaccctaaaagccatgtcaagcaaa 34335443  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
      || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| ||  || ||||||| ||||||||||    
T  34335442 agggccaaacatgagaaagcgtgtcctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcgactttctgacaccagaggctgttgaccttc 34335343  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| ||| |||| |||| || |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| || | |||||   |||||    
T  34335342 tacatagagttcaacggatcatgcgtaacaatctcatgtctcctagacccataaatattgtgtttacgatgattgattttgtcacctaaaaacacctagc 34335243  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||| || |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  34335242 ggcacaacttgttacccgcttgcattctattcat 34335209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43129737 - 43129524
Alignment:
Q  31 atgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagt 130  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||  |||||||||| | |||  ||   ||||||| |||||||||||||||    
T  43129737 atgcatgtgtgaaattgactggggtttcaccacttgttggattaggggtcggaacttttacggttggacattcagtcctaaaagatgcgtcaagcaaagt 43129638  T
Q  131 ggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttcta 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| || |||||| || |||| |   |||||||||||    
T  43129637 ggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttctaccatttgcttttgacattttcggtttcctaacaccagatgtttttgaccttcta 43129538  T
Q  231 catagagtccaaag 244  Q
    || ||||| |||||    
T  43129537 cagagagttcaaag 43129524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 353
Target Start/End: Original strand, 2566194 - 2566321
Alignment:
Q  226 ttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtct 325  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2566194 ttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctagatccatcaatgttgtgtttacgaggattgattttgccatccaaaaaggtct 2566293  T
Q  326 agcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2566294 agcggcgcaacttgttgcccacttgcct 2566321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35456159 - 35455963
Alignment:
Q  31 atgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagt 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || || | ||||||  || ||||||||||||   ||  | | | |||||||| || ||| ||| |    
T  35456159 atgcatgtgtggacttgaccggggttttgccactcgtaggattaggggtccggccttttacggtagggtaggtagcccaaaaagttgtgttaagtaaaat 35456060  T
Q  131 ggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacctt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  35456059 ggtcaaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttataccttttgcttttgacaattttggcttcctagcaccagaggatgttgacctt 35455963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Original strand, 3114091 - 3114241
Alignment:
Q  55 tttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttc 154  Q
    ||||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3114091 tttcaccactcatgggattaggggtcggggcttttacggtaggacaggcagccctaaaagttgcatcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcatgttc 3114190  T
Q  155 tgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcct 205  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3114191 tgacagtcaacatgtttttataccatttgtttttgacacttttggtttcct 3114241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 361
Target Start/End: Original strand, 26212563 - 26212817
Alignment:
Q  107 tctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttccta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||  | ||| ||    
T  26212563 tctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtattctgacgatcaacatgcttttataccatttgttttttaccctttcagtttctta 26212662  T
Q  207 gcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgatt 306  Q
    ||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||   | ||| || ||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| || | ||  |||| ||    
T  26212663 gcaccagaggctattaaccttctacatagagttcaaaatgtcatgtatggcaatattatgtctcctaagtccatgaatgttgttttcatgaggattggtt 26212762  T
Q  307 ttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| | ||||   | |||||||||||| | |||||||    
T  26212763 ttgccttccgaaaagatctagtgacgcaatatattgcccgcttgctttctattca 26212817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Original strand, 43115360 - 43115568
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||  |||| | || ||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||  |||    
T  43115360 acatgcatgtatggatttgatcggggtttcaccactcatgggattagaggtcggggcttttacggtaggatagacagccctaaaagttgcgtaaat-aaa 43115458  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||| || || |||||   ||||||||||    
T  43115459 gcggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatgctttcatagcatttgcttttgacacttctgacttcgtaacaccagagattgttgaccttc 43115558  T
Q  229 tacatagagt 238  Q
    ||| ||||||    
T  43115559 tacgtagagt 43115568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 433495 - 433371
Alignment:
Q  31 atgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagt 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  433495 atgcatgtgtggacttgaccggggtttcaccacctgtgggtttaagggtaggggcttttacggtaggatagacaaccttaaaagctgtgtcaagcaaagt 433396  T
Q  131 ggtcaaacatgagaaagcgtgttct 155  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  433395 ggccaaacatgagaaagcgtgttct 433371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 327
Target Start/End: Original strand, 22188687 - 22188855
Alignment:
Q  159 aatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagca 258  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |  ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| ||    
T  22188687 aatcaacatgattttatactatttgtttttgacactttcgattttttagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataaca 22188786  T
Q  259 atgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctag 327  Q
    || | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22188787 atatcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgagaattggttttgtcatccaaaaaagtctag 22188855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38875738 - 38875598
Alignment:
Q  134 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacat 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |    
T  38875738 caaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttgtaccatttgtttttgacactttcagcttcctagcaccagaggctgctgaccttctacgt 38875639  T
Q  234 agagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctag 274  Q
    ||||| |||| | | ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  38875638 agagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcttgtctcctag 38875598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8100737 - 8100446
Alignment:
Q  49 ctggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagc 148  Q
    |||||||||||||||||||||| | | | || ||| |||| |  |||| |||  || | ||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  8100737 ctggggtttcaccacttgtgggattaagagtcgggactttaatagtaggacatgcatccctaaacgctgcatcaagtaaaatggtcaaacatgagaaaac 8100638  T
Q  149 gtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggatt 248  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||   ||||||  ||  |||||  ||||||||||||| ||||||  ||||  |     
T  8100637 gtgttgtgacaatttacatgcttttataccatttgtttgtgacactttcaacttccttccactagaggttgttgaccttctacgtagagtttaaagattc 8100538  T
Q  249 atgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttg 342  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| | | ||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  8100537 atgcatatcaatgtcatgtcttctaggt-cgtaaatgttgt-tttgcgatgattgattttgccatccaaaaaagcctagtggcgcagcttgttg 8100446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 362
Target Start/End: Original strand, 23423923 - 23424106
Alignment:
Q  179 atttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatcc 278  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| |||| |||||  ||     
T  23423923 atttgcttttgacactttcaacttcctaacatcaaatgttgttgaccttctacatagatttcaaaggatcattcattgcaatgtcatgtatcctacttct 23424022  T
Q  279 ataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    || ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| | | || |||||| ||||||||    
T  23424023 atcaatattgtgtttatgaagattgattttgtcatccaaaaatgtctatcggtgcagcttgattctcgtttgccttctattcat 23424106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 199
Target Start/End: Original strand, 32230489 - 32230579
Alignment:
Q  109 taaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttgg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||||||    
T  32230489 taaaagttgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaaatgtgttctgacaatcaacaagcttttataccatctgcgttcgacacttttgg 32230579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8859034 - 8858974
Alignment:
Q  116 tgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttata 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8859034 tgcgtcaagcaaagtagtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttata 8858974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 38446371 - 38446305
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggta 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  38446371 acatgcatgtgtggacttgactgaggtttcaccacttgtgggtttaggagttggggcttttacggta 38446305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 362
Target Start/End: Original strand, 2917539 - 2917596
Alignment:
Q  305 ttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2917539 ttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagtttgttgcctgcttgcctcctattcat 2917596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23023580 - 23023476
Alignment:
Q  249 atgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgct 348  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||| |    
T  23023580 atgcatatcaatgtcatgtctcctaggtcgatgaatgttgtgtttacgaagattgattttgtcatccaaaaaggcctaggggcgcatcttattgtccgtt 23023481  T
Q  349 tgcct 353  Q
    |||||    
T  23023480 tgcct 23023476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11005825 - 11005759
Alignment:
Q  287 tgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005825 tgtgtttactaggattggttttgccatccaaaaaggcttagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 11005759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 353
Target Start/End: Original strand, 15506735 - 15506841
Alignment:
Q  247 ttatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccg 346  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| | |  ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||    
T  15506735 ttatgtatagcaatgtcatgtctcctagacctacgaatgttgtgtttacgaggattgattttaccatcaaaaaaggcctaacggcgcaacttgttgctcg 15506834  T
Q  347 cttgcct 353  Q
     ||||||    
T  15506835 tttgcct 15506841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7716294 - 7716146
Alignment:
Q  119 gtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgc-ttttgacacttttggcttcctagcatcagaggc 217  Q
    |||||||||||||||||||||  |||   ||| || ||||| |||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||     
T  7716294 gtcaagcaaagtggtcaaacaaaaga---cgtattatgacattcaatatgtttctataccatttgcgttttgacacttttggttttctagcaccagaggt 7716198  T
Q  218 agttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtct 269  Q
     ||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  7716197 tgttggtcttttacataaagttcaaaggattatgcataacaatatcatgtct 7716146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13307470 - 13307317
Alignment:
Q  120 tcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcag 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| || |||| || ||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||| | |||||| || ||||   |    
T  13307470 tcaagtaaaatggtcaaacatgagaaagtgtattcttactatcaacatgtttttataccttttgcgttcgacacttttgacatcctagaattagagattg 13307371  T
Q  220 ttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctccta 273  Q
    ||||| || |||| ||||| |||  ||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  13307370 ttgacattttacaaagagttcaatagatcatgcgtaacaatgttatttctccta 13307317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 322
Target Start/End: Original strand, 26010276 - 26010408
Alignment:
Q  189 gacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttg 288  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||   |||||||||||| |||| || |||||||||||||||| | | || |||||| ||||||||||||| ||     
T  26010276 gacacttttggtttcctatcaccagaggttattgaccttctacgtagattc-aaaggattatgcatagaacttttgtgtctcttagatccataaatgtta 26010374  T
Q  289 tgtttacgaatattgattttgccatccaaaaagg 322  Q
    | ||| |||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  26010375 tattttcgagaattgattttgtcatacaaaaagg 26010408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 203
Target Start/End: Original strand, 26577403 - 26577476
Alignment:
Q  130 tggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttc 203  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  26577403 tggtcaaacataagaaagtgtgttccgactatcaacatgtttttatacaatttgtgtttcacacttttggcttc 26577476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 227
Target Start/End: Original strand, 14723269 - 14723344
Alignment:
Q  152 ttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacctt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||    
T  14723269 ttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgttttttacacttttggttttttagcatcagaggttgttgacctt 14723344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16017274 - 16017199
Alignment:
Q  134 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagca 209  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16017274 caaatatgagaaagtgtgttctaataatcaacatgatttaatactatttgcgtttgatacttttggcttcctagca 16017199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 198
Target Start/End: Original strand, 9829335 - 9829423
Alignment:
Q  108 ctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttg 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  9829335 ctaaaagttgcgt-aagcaaagtgg-ctaacatgataaaatgtgttttgacaatcaacatgcttttataccatttatatttgacacttttg 9829423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16599015 - 16598886
Alignment:
Q  125 caaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgac 224  Q
    ||||||||  ||| |||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| ||| ||||  | |||||||| | || || |||  ||||||    
T  16599015 caaagtggaaaaatatgaaaaggcgtgttctaacaatcaacatgtttttatactttttgttttcgacatatctggcttccaaacaccaaaggatgttgac 16598916  T
Q  225 cttctacatagagtccaaaggattatgcat 254  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||    
T  16598915 cttctacatagagttcaaagggttgtgcat 16598886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27913540 - 27913506
Alignment:
Q  324 ctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27913540 ctagcggcgcagcttgttgcccgcttgccttctat 27913506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 319
Target Start/End: Original strand, 22819761 - 22819830
Alignment:
Q  250 tgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaa 319  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| || ||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||    
T  22819761 tgcatagcaatgttatgtctgttaaatctatgaatgttgtgtttatgaagattgattttgtcattcaaaa 22819830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7143805 - 7143728
Alignment:
Q  135 aaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcaga 214  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||  |||||  | ||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  7143805 aaacatgagaaaacgtgttttaacaatcaacatgtttttatatgatttg--tgtgatacttttggcttactaacatcaga 7143728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26772884 - 26772630
Alignment:
Q  108 ctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctag 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772884 ctaaaagttgtgtcaagcaaagtggccaaacatcagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggcttcctag 26772785  T
Q  208 catcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  26772784 catcagaggcagttgaccttctatatagagtacaaaggattatgcataacaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattgattt 26772685  T
Q  308 tgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772684 tgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 26772630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 44198964 - 44198640
Alignment:
Q  37 gtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaa 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  ||||||| ||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44198964 gtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggtcaggcagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaa 44198865  T
Q  137 acatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacataga 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || || | ||||| ||||||||||||||||||    
T  44198864 acatgagaaagcgtgttctgagaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcttaacacccgaggctgttgaccttctacataga 44198765  T
Q  237 gtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagc 336  Q
    || || | | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||    
T  44198764 gttcagaaggttatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttgcgataattgattttgccatccaaaaaggttgagcgacacagc 44198665  T
Q  337 ttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||| |||||||||| |||||||    
T  44198664 ttgttgtccgcttgccttctattca 44198640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 53785914 - 53785582
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||| ||||||| |||| | || || | || ||||  |||||||| ||     
T  53785914 acatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccactagtgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggataggcagcccttaaagccgcgtcaagtaag 53785815  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  53785814 gtggccaaacacgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 53785715  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  53785714 tacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttatgtttacgaggattggttttgccatccaacaaggtccagc 53785615  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  53785614 ggcgtagcttgttgcccgcttgccttctattca 53785582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Original strand, 39583131 - 39583464
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| | | |||| ||| | |||| ||||| | || || | ||||||| |||||||||||||    
T  39583131 acatgcatgcgtggacttgacttaggttttaccacttgtgggattaagggtcgggccatttatggtaggataggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaa 39583230  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  39583231 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgttttcgacactttcggtttcctagcatcataggttgttgaccttc 39583330  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    | |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39583331 tgcatagagttcaaagggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggttcatgaatgtcgtgtttacgaggattgattttgccatccaaaaaggtctagc 39583430  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||| ||||||| | |||||| | ||||||||    
T  39583431 ggcgcaacttgttgtctgcttgctttctattcat 39583464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 119 - 359
Target Start/End: Original strand, 38670873 - 38671112
Alignment:
Q  119 gtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggca 218  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  38670873 gtcaagtaaagtg-tcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgtttttgacacttttggctttctagcatcagaggcg 38670971  T
Q  219 gttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaa 318  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  |||| |||||||||| |||    
T  38670972 gatgaccttctacatagagtctaaagagttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtgtacgaggattggttttgccatctaaa 38671071  T
Q  319 aaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38671072 aaagtctagcggcgcagcttgttgtccgcttacctcctatt 38671112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7901063 - 7900772
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| || || | | ||||||  |||||||||||||    
T  7901063 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggggttgggtcttttacggtaggacggatatccctaaaaactgcgtcaagcaaa 7900964  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
     | | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7900963 atagccgaacatgagaaagcgttttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcggcttcctagcatcagaggttgttgaccttc 7900864  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaa 320  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||| |  |||  |||| |||||||||||    
T  7900863 tacatagagtttgaaggattatacatagcaatgttatgtttcctaggtccatcaatattttgtttacaatgattagttttaccatccaaaaa 7900772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 52741413 - 52741746
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaa-gttgcgtcaagcaa 127  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||  || ||  ||||||  |||| |||| || | |||||| | || ||||| |||    
T  52741413 acatgcttgtgtagacttgactgaggtttcaccacttgtgggattagatgtaggaccttttattgtaggacaggcagccctaaaaagctgagtcaaacaa 52741512  T
Q  128 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacctt 227  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  52741513 attgaccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggtttcctagcaccagaggttgttgacctt 52741612  T
Q  228 ctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctag 327  Q
    ||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||| || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  52741613 ctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctagatccatttatcttgtattcacgaagatttgttttgccatccaaaaaggtctag 52741712  T
Q  328 cggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    || |||| ||| ||||||||| |||| |||||||    
T  52741713 cgacgcaacttattgcccgctcgccttctattca 52741746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 128 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32546901 - 32546668
Alignment:
Q  128 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacctt 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| || |||| |||||||||    
T  32546901 agtggccaaacatgagaaagcgtgttcggacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccaaaggctgttgacctt 32546802  T
Q  228 ctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctag 327  Q
    ||||||||||| ||||   | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32546801 ctacatagagttcaaaaagtcatgcatagtaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgaggattggttttgccatccaaaaaggtctag 32546702  T
Q  328 cggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32546701 cggcgcagcttgttgcccgcttgccttctattca 32546668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Original strand, 46940672 - 46941008
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||| | |||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46940672 acatgtatgtgtgaacttgactgaggtttcattactcgtgggattaggggtcgaggattttatggtaggacagacaactctaaaagatgcgtcaagcaaa 46940771  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgac---c 225  Q
    |||| ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| || || |  |||||   |    
T  46940772 gtggccaaacattagaaaacatgttccgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacacttttgacgtcctagcaccatagactattgaccagc 46940871  T
Q  226 ttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtct 325  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   |||||| ||| ||| ||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||    
T  46940872 ttctacatagagttcaaaggatcatgcacgacaatgtcatgactcataggttcatgaatgttgtgtttacgaaaattgattttgttatccaaaaagacct 46940971  T
Q  326 agcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||| ||| ||||||||| | || ||| ||||||||    
T  46940972 agcggtgcaacttgttgcctgtttaccttctattcat 46941008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13582714 - 13582383
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| | ||| ||  || ||||||| |||| |||  || | ||||||| |||||||| ||||    
T  13582714 acatgcatgtgtagacttgaccgaggtttcaacacttgtgggattaggtgtcaggccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaatcaaa 13582615  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||      ||||||||||    
T  13582614 gtgatcaaacataagaaagtgtgttctgacaatcaacgtgtttttataccatttgttttt-acacttttgatttcctagcaccaacaattgttgaccttc 13582516  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||| ||||| |||| | | ||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13582515 tacagagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggaccatgaatgttgtgtttacgaagattgatttagccatccaaaaaggcctagc 13582416  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    | ||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  13582415 gacgctgtttattgcccgcttgccttctattca 13582383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Original strand, 37132967 - 37133214
Alignment:
Q  95 agaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacact 194  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  37132967 agaacagacagccctaaaagctacgtcaagcaaagtggttaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttttacact 37133066  T
Q  195 tttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgttta 294  Q
    || || ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | || | | |||||||||||||| ||||||||||  |  || ||| |||||||||    
T  37133067 ttcggtttcttagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttctaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaagttaatgaatgttgtgttta 37133166  T
Q  295 cgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttg 342  Q
      |  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37133167 taaggattggttttgcgatccaaaaaggtctagcggcgcagtttgttg 37133214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 120 - 353
Target Start/End: Original strand, 26856755 - 26856988
Alignment:
Q  120 tcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcag 219  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |  |||||||||  |||| | |    
T  26856755 tcaagtaaaatggtcaaatatgataaagcgtgttgtgacaatcaacatgcttttataccatctgcttttgacgctttcgatttcctagcactagagactg 26856854  T
Q  220 ttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaa 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |  || ||| ||||| || |||  |||| |||| ||||||||||    
T  26856855 ttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtttatgaatgttgtgcttgcgaggattggttttaccatccaaaa 26856954  T
Q  320 aggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26856955 aggcctagcggcgcagcttgttgctcgcttgcct 26856988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38146259 - 38145969
Alignment:
Q  31 atgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagt 130  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||| | ||||| |||  || | |||||||  || |||| ||||||    
T  38146259 atgcatgtgaggacttgcatggggtttcacgacttgtgggattaggggtcggagctttgagggtaggacatgcagccctaaaagcggcatcaatcaaagt 38146160  T
Q  131 ggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttcta 230  Q
    ||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| || |||||    
T  38146159 ggtcaaacgcgagacaacgtgttttgacaatcaacatgtttttataccatttacatttgacacttttgacttcctagcaccagaggttgtttacattcta 38146060  T
Q  231 catagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaag 321  Q
    | |||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  38146059 cttagagttcaaagggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaacgttgtgtttacgatgattgattttgtcatctaaaaag 38145969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 322
Target Start/End: Original strand, 52411903 - 52412086
Alignment:
Q  139 atgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagt 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  52411903 atgagagagcgtgttctgacaatcaacatgcttttattccatttgcttttgacactttcagctttctaacactagatgtcgttgaccttctacatagagt 52412002  T
Q  239 ccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaagg 322  Q
     |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  52412003 tcaaagggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagacccataaatattgtgtttacaatgattgattttgccatccaaaaagg 52412086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 322
Target Start/End: Original strand, 38978757 - 38978994
Alignment:
Q  85 cttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgc 184  Q
    |||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||| ||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||     
T  38978757 cttttacggtaggaaatacaaccctaaaagttgtgtcaagcaaattggttagacatgtgaaaacgtattttgacaatcaatatgtttttatactatttgt 38978856  T
Q  185 ttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaat 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||| |||||| ||||||| ||| |  || |||    
T  38978857 ttttgacacttttggtttcctagcacctgaggccgttgaccttctacatatagttcaaaaggtgatgcataacaatgtcatgtctcataggtttatcaat 38978956  T
Q  285 tttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaagg 322  Q
     ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  38978957 gttgtgtttacgaaaattagttttgccatccaaaaagg 38978994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 321
Target Start/End: Original strand, 3443293 - 3443506
Alignment:
Q  108 ctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctag 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  | |||||||    
T  3443293 ctaaaagttgcgtcaagcaaaatggccaaacatgaaaaagtgtattctaacaatcaacatgcttttataccattttctgttgacactttcagtttcctag 3443392  T
Q  208 catcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattt 307  Q
    ||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||  ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||  |||| |||    
T  3443393 cactagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcgtaggaatgtcttgtctcctaaatctatgaatgttgtgtttacgatgattggttt 3443492  T
Q  308 tgccatccaaaaag 321  Q
    ||||||||| ||||    
T  3443493 tgccatccacaaag 3443506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5338852 - 5338552
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggg-gcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||| |   | ||||||||||||| ||||| | | |||| ||||||||||| |||    
T  5338852 acatgcatctgtggacttgatttgggttacaccacttgtgggattagggatttagagcttttacggtaggacagaaagccctaagagttgcgtcaaacaa 5338753  T
Q  128 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttc---tgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgac 224  Q
    | | | |||||||||||||| | |||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||||    
T  5338752 aattgccaaacatgagaaagtgcgttgcgttgacagtcaacatgcttttatacaatttgcttttgacactttcggcttcctagcactagagattgttgac 5338653  T
Q  225 cttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtc 324  Q
     ||||||||||||| |||| | | |||| |||||||||  |||||| ||| ||    ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||    
T  5338652 attctacatagagttcaaaaggtcatgcgtagcaatgtcttgtctcataggtc---gaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaatggtc 5338556  T
Q  325 tagc 328  Q
    ||||    
T  5338555 tagc 5338552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Original strand, 7501913 - 7502226
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgc-gtcaagcaa 127  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||||| ||| |||  | ||  ||||||||   |||||| ||    
T  7501913 acatgcatgtgtagacttaaccagggtttcaccactcgtgggtctaggggtcggg-ctgttacgataggacaagctaccgtaaaagtttttgtcaagtaa 7502011  T
Q  128 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatg-cttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacct 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  7502012 agtggtcaaacatgagaaagcgtgttcgaacaatcaacatgttttttataccattttcttttgacatttttggtttcctagcaccagaggttgttgacct 7502111  T
Q  227 tctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtcta 326  Q
    |||||  |||||  ||||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||    
T  7502112 tctac--agagtttaaagggtcatgcacaacaatgtcatgactcatagatccatgaatattatgtttacgataattgattttgctatccaaaaagaccta 7502209  T
Q  327 gcggcgcagcttgttgc 343  Q
    | | | |||||||||||    
T  7502210 gtgactcagcttgttgc 7502226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 49018168 - 49017840
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  | ||| || | | |||||||||||| |||  |||| || |||||| ||| || ||||    
T  49018168 acatgcatgtgtaaacttgactggagtttcaccacttgtggaattaggtgtcgagccttttacggtaggacaagcaaccctgaaagttacgtaaaacaaa 49018069  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||||  ||||| ||||    
T  49018068 gtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgtttttataccattttttttttacactttcggtttcctagcacccgaggttgttgatcttc 49017969  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||| || ||| |||| | | |||||||  ||||| ||||    ||| || || ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||     ||    
T  49017968 tacgtaaagttcaaaaggtcatgcatataaatgtcatgt----taggtcaatgaatgttgtgtttatgaggattgattttgccatccaaaaagtatcggc 49017873  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  49017872 ggtgcagcttgttgtccgcttgccttctattca 49017840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4473214 - 4472970
Alignment:
Q  81 ggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaat 180  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||| ||    
T  4473214 ggggtttttacggtaggacagagagccttaaaaattgcgtcaagcaaagtgtcaaaacatgaaaaagcgtgttctaaccatcaatatgtttttatactat 4473115  T
Q  181 ttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccat 280  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||     || |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  4473114 ttgtttttgacactttcggcttcctagcaccaga-attcttaaccttctacataaagttcaaagaatcatgcatagcaatttcatgtctcctaggtctat 4473016  T
Q  281 aaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtcta 326  Q
     ||| ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4473015 gaatattgtgtttacgagaattggttttgtcatccaaaaaagtcta 4472970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 51234803 - 51234577
Alignment:
Q  34 catgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggt 133  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| ||| ||| ||||| ||||||  ||||||||              
T  51234803 catgtgtggacttgattaaggtttcaccacttgtgggtttaggggtcgagacttttacgataggacaaacaaccctaaaaactgcgtcaa---------- 51234714  T
Q  134 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacat 233  Q
       |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  51234713 ---acatgaaaaagcatgttatgacaaccaacatgcttttataccatttatttttgacactttcgactttctagcatcagaggttgttgaccttctacat 51234617  T
Q  234 agagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctccta 273  Q
    ||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  51234616 agagttcaaaaggttatgcataacaatgttatgtctccta 51234577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25325158 - 25324943
Alignment:
Q  107 tctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacat--gcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||| ||| || || ||||||||||  | |||||||| |||||||||  ||||||| |  ||||    
T  25325158 tctaaaagttgcgtcaagcaaagtgacaaaacattataaaacgtattttggcaatcaacatatgtttttataccatttgctttcaacactttcgatttcc 25325059  T
Q  205 tagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattga 304  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | || ||||| |||||| ||| ||||| ||||||  ||||     
T  25325058 tagcaccatagattgttgaccttctacatagagttcaaatgatcatgcatagcaatgtcaagtttcctaaatccatgaatattgtgcttacgatgattgc 25324959  T
Q  305 ttttgccatccaaaaa 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  25324958 ttttgccatccaaaaa 25324943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 211 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 44859 - 44706
Alignment:
Q  211 cagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgt---gtttacgaatattgattt 307  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||   ||| || |  |||  |||    
T  44859 cagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtttcctaggtccatgaatgttgttgtgttcacaaggatttgttt 44760  T
Q  308 tgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  44759 tgccatccaaaaaggtctagcggcgcagtttgttgcccgcttgccttctattca 44706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 361
Target Start/End: Original strand, 4763888 - 4764026
Alignment:
Q  222 gaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |||    |||||||||||||||    
T  4763888 gaccttctacatagagttcaaaaggttatgcatagcaatgtcatgtctcct-ggtccatgaatgttgtgtttacgaggattagaattgccatccaaaaag 4763986  T
Q  322 gtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |  | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4763987 gcttggtggcgcaacttgttgcccgcttgccttctattca 4764026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37992454 - 37992240
Alignment:
Q  112 aagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatc 211  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||   |||||||||| |||||      
T  37992454 aagttgtgtcaaacaaagtgaccaaacatgaggaagcatgttctgacaatcaacatgattttatatcatttacttttgatggttttggcttcatagcact 37992355  T
Q  212 agaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgcc 311  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||| | |||| | ||||| || ||||| ||| ||| ||  | ||| ||| |||||||| |||| |||| ||||  |    
T  37992354 agaggttgttgaccttctacaaagagttc-aagggtcatgcacagtaatgtcatgactcgtacgtgcatgaatgttgtgttttcgaagattggttttatc 37992256  T
Q  312 atccaaaaaggtctag 327  Q
    |||||||||| |||||    
T  37992255 atccaaaaagatctag 37992240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 317
Target Start/End: Original strand, 54508367 - 54508574
Alignment:
Q  111 aaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaag-cgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagca 209  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||||    
T  54508367 aaagttgcgtcaaacaaaatggctaaacatgagaaaaacttgttctgacaattaacatgtttttatatcatttgcttttgacatttttgattttctagca 54508466  T
Q  210 tcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttg 309  Q
     ||||||  ||||||||||| ||||  || |||||||| |||| || |||| | || ||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||| |||||    
T  54508467 ccagaggttgttgaccttctgcataaggtacaaaggatcatgcgtaacaatatcatatctgctaggtccatgaatgttgtgtttaagataattggttttg 54508566  T
Q  310 ccatccaa 317  Q
     |||||||    
T  54508567 tcatccaa 54508574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 353
Target Start/End: Original strand, 4669788 - 4669889
Alignment:
Q  252 catagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgc 351  Q
    |||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  4669788 cataacaatgtcatgtctccttggtccatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgttatccaaaaaggtttggcggcgcagcttgttgcccgcttgc 4669887  T
Q  352 ct 353  Q
    ||    
T  4669888 ct 4669889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21552746 - 21552537
Alignment:
Q  155 tgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcat 254  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||    
T  21552746 tgacaatcaacatgcttt-ataccatttatttttgacattttcagtttcctagcatcagagactgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcat 21552648  T
Q  255 a----gcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttg 350  Q
    |    | ||| | || |||||||| ||||| ||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||   |  ||||||| ||||||||||| ||     
T  21552647 agtacgtaatatcatatctcctaggtccatgaatgttgtgtttacaagaattggttttgacatccaaaaagacttgacggcgcaacttgttgcccgttta 21552548  T
Q  351 cctcctattca 361  Q
    ||| |||||||    
T  21552547 ccttctattca 21552537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 198
Target Start/End: Original strand, 35484601 - 35484763
Alignment:
Q  36 tgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtca 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||   | | || | | | |||||||||||| ||| |||||| |||||  |  |||||| ||||||||||    
T  35484601 tgtgtagacttgactggggtttcacaacttgtgaaattaaggattgagacttttacggtaggacaaacaactttaaaaactatgtcaagtaaagtggtca 35484700  T
Q  136 aacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttg 198  Q
    |||||||||||   |||||  |||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  35484701 aacatgagaaaatatgttccaacaatcaacatgtttttgtactatttgcatttgacacgtttg 35484763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42206123 - 42205993
Alignment:
Q  179 atttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagtt-gaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatc 277  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||  ||| | | |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  42206123 atttgcatttgacacttttgactttctagcatcaaaggtaatttgacattctacatagagtttaaatggtcatgcatagaaatgtaatgtatcctagatc 42206024  T
Q  278 cataaattttgtgtttacgaatattgatttt 308  Q
    ||||||  ||||||||||||  |||||||||    
T  42206023 cataaacgttgtgtttacgatgattgatttt 42205993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26276573 - 26276496
Alignment:
Q  276 tccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26276573 tccatgaatgttgtgtttatgaggattgattttgccatccaaaaagatctagcggtgtagcttgttgcccgcttgcct 26276496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43123268 - 43123059
Alignment:
Q  111 aaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcat 210  Q
    ||||| || ||||||||||||   |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||| |  ||||||||||||  || ||||||     
T  43123268 aaagtcgcatcaagcaaagtgtctaaacatgataaaggatgttctgacaatcaacatgttgttatactatttacgattgacacttttgattttctagcac 43123169  T
Q  211 cagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgc 310  Q
    || ||   |||||| ||||||| | ||| |||||| |  ||||||| ||| ||||||||  ||| || |||||| |||||||||  |  ||||||||| |    
T  43123168 catagtttgttgactttctacaaaaagttcaaagggtcgtgcatagaaatattatgtcttataggtcaataaatattgtgtttaaaacaattgatttttc 43123069  T
Q  311 catccaaaaa 320  Q
    |||| |||||    
T  43123068 catcaaaaaa 43123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8592075 - 8592013
Alignment:
Q  300 attgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  8592075 attgattttgccatccaaaaaggcccagcggcgcagcttgttacccacttgccttatattcat 8592013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Original strand, 465003 - 465075
Alignment:
Q  249 atgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaag 321  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  465003 atgcataacaatattatgtttcatagattcatgaatgttgtgtttacaaatattgattttgccattcaaaaag 465075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3643145 - 3643028
Alignment:
Q  240 caaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttg 339  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| |  ||| ||||| ||| ||||||||  ||  |||||||||| ||||| |||||| ||| || ||||||||     
T  3643145 caaaggatcatgcataacaatgtcatgttttttaggtccatgaatgttgtgttt--gatgattgattttgtcatccgaaaaggcctaacgacgcagctta 3643048  T
Q  340 ttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  3643047 ttgcccgcttgccttctatt 3643028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 322
Target Start/End: Original strand, 7257616 - 7257751
Alignment:
Q  186 tttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |  | | ||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||| | |||| | |||| ||||| |||     
T  7257616 tttgacacttttggcttcctagcatcagatgttg-cgtcattctacatatagttcaaagggctatccatagcaatatcatgtattctaggtccatgaatg 7257714  T
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaagg 322  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||    
T  7257715 ttgtgtttacgaagattagttttgtcattcaaaaagg 7257751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 234
Target Start/End: Original strand, 3376729 - 3376848
Alignment:
Q  116 tgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttt-tatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcaga 214  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | | |||| |||||||||||  ||| || || |||||||||||||  |||||| |||||||||  |||    
T  3376729 tgcgtcaagaaaaatggttaaacatgataaaacatattctcacaatcaacatattttatagaccatttgcttttgacttttttggtttcctagcactaga 3376828  T
Q  215 ggcagttgaccttctacata 234  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  3376829 ggttgttgaccttctacata 3376848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35236411 - 35236316
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaag 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||| | | | |||||| ||||| | ||  | |||||||||||||||||||    
T  35236411 acatgcatgtgtggacttgattgaggtttcaccacctgtgggattagggatcgagccttttatggtaggataggtagctctaaaagttgcgtcaag 35236316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13772572 - 13772460
Alignment:
Q  111 aaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcat 210  Q
    |||| ||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||||   |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||  |||  ||||||||||     
T  13772572 aaagctgcttcaagcaaagccatcaaacatgagaaaacgtgttccatcaatcaacacacttttataccatttgcgtttgacaacttttccttcctagcac 13772473  T
Q  211 cagaggcagttga 223  Q
    |||| || |||||    
T  13772472 cagaagccgttga 13772460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Original strand, 45676778 - 45676828
Alignment:
Q  118 cgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatg 168  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45676778 cgtcaagcaaagtgaccaagcataagaaaacgtgttctgacaatcaacatg 45676828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 67
Target Start/End: Original strand, 54508286 - 54508324
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgt 67  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  54508286 acatgcatgtgtgtacttgattggggtttcaccacttgt 54508324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 330
Target Start/End: Original strand, 26393812 - 26393889
Alignment:
Q  253 atagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcgg 330  Q
    |||||||| ||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  26393812 atagcaatattatgtctccttggtctatgaatgttgtgtttacgaggattgatatttccatccaacaaggtttagcgg 26393889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28225205 - 28224872
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  28225205 acatgcatgtgtggacttgaatggggtttcactacttgtgggcttaggagttagggcttttacggtaggacaaacaactttaaaagctgcgtcaagcaaa 28225106  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  28225105 gtgaccaaatatgagaaagcgtattctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcttcagaggttgttgaccttc 28225006  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28225005 tacatagagtccaaaggattatgcatgacaatattatgtctcctaggtcaatgaatgttgtgtttatgaagatttgttttgccatccaaaaaggtctagc 28224906  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28224905 ggcgcagcttattgcccgcttgtctcctattcat 28224872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 4412968 - 4413300
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  |  ||||||| |||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  4412968 acatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcagaccttttaccgtaggacaggcaaccctaaaagctgtgtcaagcaaa 4413067  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||   ||||||||||    
T  4413068 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagagattgttgaccttc 4413167  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    ||||||| || |||| | | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4413168 tacatagggttcaaaaggtcatgcatagcaaagtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcatgaggattgattttgccatccaaaaaggtctagc 4413267  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4413268 ggcgcagcttgttgcccacttgccttctattca 4413300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27502566 - 27502269
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27502566 acatgcatgtgtggacctgaatggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcagagcttttacgataggaca-ataaccctaaaagctgcgtcaagcaaa 27502468  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||| |  | ||||||||||    
T  27502467 gtggtcaaacatgagaaaacgtgttccgacaaacaacatgcttttatacaattgctttttgacactttcgacttcctagcatcatatactgttgaccttc 27502368  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctag 327  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27502367 tacatagaatccaaagggttatgcatagcaatatcatgtctcctagatctatgaatgttgtgtttacgaagattgattttgcaatccaaaaaggtctag 27502269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 41867810 - 41868141
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| | ||| || ||  ||||||  |||| |||| || |  |||||| |||||||||||||    
T  41867810 acatgcttgtgtagacttgactgagatttcacgacttgtgggattaggtgtcggaccttttatcgtaggacaggcagccttaaaagctgcgtcaagcaaa 41867909  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41867910 gtggtcaaacatgagaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggctgttgaccttc 41868009  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  41868010 tacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcccaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgcca-ccaaaaagatctagc 41868108  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  41868109 ggcgcaacttgttgcccgcttgctttctattca 41868141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 353
Target Start/End: Original strand, 9685324 - 9685641
Alignment:
Q  36 tgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtca 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |  ||||||| |||| | || || | ||||||   |||||||||||||||| ||    
T  9685324 tgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgtaggataggcagccctaaaatccgcgtcaagcaaagtggcca 9685423  T
Q  136 aacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatag 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||| || ||||||||| ||||    
T  9685424 aacatgaaaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttgattttctagcactagaggctgtggaccttctatatag 9685523  T
Q  236 agtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcag 335  Q
    ||| |||| | | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9685524 agttcaaaaggtcatggatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacaaagattgtttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcag 9685623  T
Q  336 cttgttgcccgcttgcct 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9685624 cttgttgcccgcttgcct 9685641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44686624 - 44686353
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||   ||||||| || |||||||||     
T  44686624 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacgataggacagacagtcctaaaagctg-gtcaagcaat 44686526  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaa----catgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgac 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||    
T  44686525 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatcaacatgcttttatattgttcgcttttgacactttcggcttcctagcatcagagtttgttgac 44686426  T
Q  225 cttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacga 297  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  44686425 cttctacatagattccaaagggttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccgtgaatgttgtgtttacga 44686353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17344843 - 17344511
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||  |  ||||||| |||| | || ||   || |||| ||||||||| ||     
T  17344843 acatgcatgtgtagacttgactggggtttcacaacttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgtaggaaagccagtccttaaagctgcgtcaagtaag 17344744  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  17344743 gtggccaaacacgagaaaacgtgttttcacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccataggctgttgaccttc 17344644  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  17344643 tacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattgatttttcgatccaaaaaggtctatc 17344544  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17344543 ggcgcagcttgttgccggcttgccttctattca 17344511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 18744856 - 18745188
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  || | ||||| |||  ||||  | | || ||||  ||||||||  |     
T  18744856 acatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcaggccatttaccgtaacacaggaagcccttaaagcagcgtcaagttag 18744955  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |  || |||||| || |||| |||| |||||    
T  18744956 gtggccaaacacgagaaagcgtgttctgacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacattttcgattttctagcaccataggctgttggccttc 18745055  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || | |||||| || || ||| |||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18745056 tacatagagttcaaaagatcatgcatagcaatgtcatatttcctaggtctatgaatgttgtgtttataaggattggttttgccatccaaaaaggtctagc 18745155  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||| |||| |||||| || |||||||    
T  18745156 ggcgcagcttattgctcgcttgtcttctattca 18745188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 19161685 - 19162017
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| | | ||  ||  || |||||| ||||| ||| ||| | ||||||  ||||||||| |||    
T  19161685 acatgcatgtgtagacttgaatagggtttcaccacttgtgagattagatgtcaggccttttatggtaggacatacatccctaaaatctgcgtcaagaaaa 19161784  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||  || ||  |||||| | | |||||     
T  19161785 gtgggcaaacatgaaaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcggttttgtaacactagaggctgcttaccttt 19161884  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||  ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||   |||     
T  19161885 tacatagagttcaaaaggtcatgcatatcaatgtcatgtctcctaggtcaatgaatagtgtgttttcgaggattgattttgtcatccaaaaagacgtagt 19161984  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  19161985 ggcgcagcttgctgtccgcttgctttctattca 19162017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3825932 - 3825639
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||  || |||||||||||  ||||| | | ||||||| |||||||||||||    
T  3825932 acatgcatgtgtggacttgattgaggtttcaccccttgtgggattaggggtcaggacttttacggtatgacagagagccctaaaagctgcgtcaagcaaa 3825833  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgtt-ctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacctt 227  Q
    |||||||||||||| ||||  | || ||||||||| ||||| ||||||   ||||||||  ||||||||    |||||||||||| |||  |||||||||    
T  3825832 gtggtcaaacatgaaaaagttttttcctgacaatctacatgtttttatttcatttgcttcagacactttcaatttcctagcatcaaaggttgttgacctt 3825733  T
Q  228 ctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaag 321  Q
    | |||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||    
T  3825732 caacatcgagttcaaagaatcatgcatagcaatgtcatgtcttctaggaccataaatgttgtgtttatgaagatcgattttgtcatccaaaaag 3825639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 23484840 - 23485163
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | | || ||| |||| ||||| | |||   | | ||||||| | |||||| ||||    
T  23484840 acatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcgggcctttaacggtgggacaactagccctaaaagctacgtcaaacaaa 23484939  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||| ||  |||| |      
T  23484940 gtggccaaatatgagaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacacttct-gtttcctagcaccagagaca-atgacttct 23485037  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatcc-aaaaaggtctag 327  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||| |||||||| || |||||||| |      
T  23485038 tacatagagttcaaaagatcatgcataacaatgctatgtctcctaggtccatgaacgttgtgtttacaaaaattggttttgccaaccaaaaaaggtttga 23485137  T
Q  328 cggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  23485138 cggcgcagcttgttgtcggcttgcct 23485163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5532624 - 5532314
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    ||||||||||||| |||| || || |||||||||||  | || | |||||| |||| ||||||||||| |||  || | ||||||| |||||||||||||    
T  5532624 acatgcatgtgtgaacttaaccggagtttcaccactcataggattaggggtcggggattttacggtaggacatgcagccctaaaagctgcgtcaagcaaa 5532525  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |||  ||||| ||||    
T  5532524 gtggtcaaacatgagaaaacgtgttgtgacaatcaacatgcttttatactatttacttttgacac-tttagcttcctagcaccataggttgttgagcttc 5532426  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| | |||||  ||| ||||||  | ||| || | ||||||||| |  |||||||||  ||||||||| || ||| |    
T  5532425 tacatagagttcaaagggtcatgcacaacaatgccatgactcctaagttcatgaa-tgtgtgtttacaaggattgattttctcatccaaaacggcctaac 5532327  T
Q  329 ggcgcagcttgtt 341  Q
    |||||| ||||||    
T  5532326 ggcgcaacttgtt 5532314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 241 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27494304 - 27494183
Alignment:
Q  241 aaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgt 340  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27494304 aaagggttatgtatagcaatgttatgtctcctaagtctatgaatattgtgtttacgaatattggttttgccatccaaaaaggtctaacggcgcagcttgt 27494205  T
Q  341 tgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27494204 tgcctgcttgcctcctattcat 27494183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 270
Target Start/End: Original strand, 34814818 - 34814961
Alignment:
Q  126 aaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgacc 225  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||| || ||||| | |||||||    
T  34814818 aaagtgatcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatatgcttttataccatttgctttcgacactttcgg-ttcctaacaccagagactgttgacc 34814916  T
Q  226 ttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctc 270  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||    
T  34814917 ttctacatagagttcaaatggtcatgcataacaatgttatgtctc 34814961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13413406 - 13413224
Alignment:
Q  179 atttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatcc 278  Q
    ||||| |||||||||||| || || | |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  13413406 atttgtttttgacactttcggttttcaagcagcagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtcc 13413307  T
Q  279 ataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    || ||| ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| || |||||||    
T  13413306 atgaatgttgtgtttatgagaattggttttgccatccaaaaaggcctaacggctcagcttgttgtccgcttgtcttctattca 13413224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2888648 - 2888518
Alignment:
Q  102 acaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggct 201  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  2888648 acaaccctaaaagttgcgtctagcaaagtggacaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttataccattcgtttatgacacttttggct 2888549  T
Q  202 tcctagcatcagaggcagttgaccttctaca 232  Q
    ||||| ||  |||||  ||||||||||||||    
T  2888548 tcctaacacaagaggttgttgaccttctaca 2888518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 320
Target Start/End: Original strand, 16351812 - 16352037
Alignment:
Q  98 acagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacact--- 194  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||||||| |       
T  16351812 acagacaatcctaaaagttgtgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaatgtgttctcacaatcaacataattttatattgtttgcttttgacattttg 16351911  T
Q  195 tttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgttta 294  Q
    |||||||   || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| | | ||||| | |||||| ||||||| ||| | ||| ||| || ||||||    
T  16351912 tttggctctttatcatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaatggtcatgcacaacaatgtcatgtctcttaggtacatgaatattatgttta 16352011  T
Q  295 cgaatattgattttgccatccaaaaa 320  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||    
T  16352012 cgatgattgtttttgccatctaaaaa 16352037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 7760748 - 7761062
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | | |      | |||||| ||| | |||  |||| || ||||| |||||||| |||    
T  7760748 acatacatgtgtgaacttgactagggtttcaccacttgtgggattatgaaccaagacttttatggtgggacaagcaaccctcaaagtcgcgtcaagtaaa 7760847  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||| |||  |||  ||| |||||| || ||||| ||||| || ||| || ||||||  ||||||||||    
T  7760848 gtggccaatcatgagaaaacgtgatctaacaatca-catattttcttacgatttgcattagacacctttggttttctatcaccagaggttgttgaccttc 7760946  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||  | ||  |||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  7760947 tacatagagttcaaaggatcatgcgtagcaatgtgatgtctcataagttcaagaatgatgtgcttacgaaaattgattttgacatccaaaaaggcttagc 7761046  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcc 344  Q
    |||||| ||| |||||    
T  7761047 ggcgcaacttattgcc 7761062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 274
Target Start/End: Original strand, 20142642 - 20142872
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| || |   ||||||| |||| |||| || ||||||||| | |||||||||||    
T  20142642 acatgcttgtgtagacttgattggggcttcaccacttgtgggattaggtgtcgtaccttttaccgtaggacaggcagctctaaaagcttcgtcaagcaaa 20142741  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||||||               |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||||     
T  20142742 gtggccaaacatga---------------caatcaacatgcttttataccattttcttttgacacttttggttttctagcatcaaaggttgttgacctta 20142826  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctag 274  Q
    |||||||||| |||| | | || |||| |||||| |||||||||||    
T  20142827 tacatagagttcaaaaggtcatacataacaatgtcatgtctcctag 20142872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 322
Target Start/End: Original strand, 13147087 - 13147295
Alignment:
Q  117 gcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacat---gcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcag 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| || |||    
T  13147087 gcgtcaagaaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcagcatatactttttataccatttgattttgacacttttggttttctaacaccag 13147186  T
Q  214 aggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccat 313  Q
    ||   ||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||| | ||||||  ||||| |||  | ||| ||| |||| |||||||| |||||||||| |||    
T  13147187 agattgttgaccttcttcatatagtacaaagggtcgtgcacaacaatgtcttgtcttctaagttcatgaatattgtatttacgaaaattgattttgtcat 13147286  T
Q  314 ccaaaaagg 322  Q
    | |||||||    
T  13147287 ctaaaaagg 13147295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 326
Target Start/End: Original strand, 33612542 - 33612744
Alignment:
Q  121 caagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagt 220  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||  ||    
T  33612542 caagcaaaatggt-aaacatgagaaaacgtgttttgacaatcaacatgattttatacaatttgtatttgacacttttggcttcctaacaccggaggttgt 33612640  T
Q  221 tgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaa 320  Q
    |||| ||||||  ||||| || ||| |    |||||||||||  |||| ||||| ||||| ||| |||||||| | |||||| ||||| | ||| |||||    
T  33612641 tgacattctac--agagttcagagggtcgctcatagcaatgtcttgtcccctaggtccatgaatgttgtgtttgcaaatattaattttacaatctaaaaa 33612738  T
Q  321 ggtcta 326  Q
    ||||||    
T  33612739 ggtcta 33612744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 332
Target Start/End: Original strand, 32029081 - 32029291
Alignment:
Q  122 aagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagtt 221  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||  |||||| | | |||||||| |||    
T  32029081 aagcaaattggttaaatatgagaatgtgtgttcagacaatcaacatgctttcatatcatttgtttttgacactttcagcttcccaacttcagaggctgtt 32029180  T
Q  222 gaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | || |||| |||||| ||||||  |||   ||| ||| | ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||    
T  32029181 gaccttctacatagagttcaaagagtcatccataacaatgtcatgtcttataggatcatgaatatcgtgtttacgaagattaattctgtcattcaaaaag 32029280  T
Q  322 gtctagcggcg 332  Q
    |  ||||||||    
T  32029281 gcatagcggcg 32029291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Original strand, 3968402 - 3968559
Alignment:
Q  120 tcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcag 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||| |||   |    
T  3968402 tcaagcaaagtggtcaaatatgagaaaacatgttttgacaatcaatatgcttttatacaatttgcgtttgacatttttgacttcatagtatctgagtttg 3968501  T
Q  220 ttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatc 277  Q
    || |||||||| | | ||| |||||||| | ||||| |||||||  ||| ||||||||    
T  3968502 ttaaccttctataaaaagttcaaaggatcacgcataacaatgttgagtcacctagatc 3968559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 350
Target Start/End: Original strand, 2886632 - 2886839
Alignment:
Q  144 aaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaa 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| | ||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  2886632 aaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttatatcatttgtttttgatattttcggtttccaagcatcagaggctgttgatcttttacatagagttcaaa 2886731  T
Q  244 ggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattga-ttttgccatccaaaaa-ggtctagcggcgcagcttgtt 341  Q
     ||  |||||||||||| | || |||| | | ||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||| |||||  | | ||||||||||    
T  2886732 agagcatgcatagcaatatcatatctcgt-ggtccataaatgttgtgtttatgaggattgatttttgtcatccaaaaagggtctgacagtgcagcttgtt 2886830  T
Q  342 gcccgcttg 350  Q
    ||| |||||    
T  2886831 gcctgcttg 2886839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 359
Target Start/End: Original strand, 11921218 - 11921436
Alignment:
Q  135 aaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacata 234  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||| | |||||    || || | |||| || | ||||||||||||||||    
T  11921218 aaacattagaaaacgtgttctgacaatcaacatatttttataccgtttgttttttatactttcaattttctggtatcatagactgttgaccttctacata 11921317  T
Q  235 gagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgca 334  Q
    |||| |||||| ||||      |||| |||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||| |  |||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11921318 gagttcaaagggttat------caattttatatcttctaggtccatgaatgttgtgtttactaggattagtttcgccatccaaaaagatctagcgtcgca 11921411  T
Q  335 gcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||    
T  11921412 gcttgttacccgcttccctcctatt 11921436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 289 - 361
Target Start/End: Original strand, 3208406 - 3208478
Alignment:
Q  289 tgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3208406 tgtttacgaggattggttttgccatccaaaaaggtttagcggcgcagcttgttgcccgcttgccttctattca 3208478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Original strand, 8036534 - 8036699
Alignment:
Q  179 atttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatag--caatgttatgtctcctagat 276  Q
    ||||| |||||| | |||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||   |||||| ||||||||||| |    
T  8036534 atttgtttttgatatttttggcttcgtaacatcagaggttgttgaccttttacatagagttcaaaggtttatgcatatatcaatgtcatgtctcctaggt 8036633  T
Q  277 ccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttg 342  Q
    || || || |||| ||||| |  |||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  8036634 ccgtagatattgtctttacaatgattgattttgtcattcaaaaaagcatagcggcgcagattgttg 8036699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44720471 - 44720259
Alignment:
Q  86 ttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgct 185  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||  |||||||| ||  ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||      
T  44720471 ttttacgttagaacatgcaacgctaaaagccgcgtcaagtaagatggccaaacatgaaaaaacgtgttatgacaatcaacatgtttttataccgtttgaa 44720372  T
Q  186 tttgaca-cttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaat 284  Q
    ||| |||  |||| |||||||| || ||||||  ||| || || |||||| ||| |||||||| ||||||| |||| || | |||| ||| |||||||||    
T  44720371 tttaacatttttttgcttcctaacaccagaggttgttcactttttacataaagttcaaaggatcatgcataacaatattttatctcataggtccataaat 44720272  T
Q  285 tttgtgtttacga 297  Q
      |||||||||||    
T  44720271 aatgtgtttacga 44720259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29808205 - 29808071
Alignment:
Q  103 caactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggctt 202  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||   ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | ||   ||    
T  29808205 caactttaaaagttgcctcaagtaaagtcaccaaacatgagacagcgtgttataacaatcaacatg-ttttataccatttgcttttcacattatttattt 29808107  T
Q  203 cctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagt 238  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||    
T  29808106 cctagcatcggaggttgttgaccttttacatagagt 29808071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Original strand, 10579681 - 10579907
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |  |   |  ||||||||||| ||  ||  ||| || ||||| | || |||||||    
T  10579681 acatgcatttgtggacttgactggggtttcaccacttgtatgattaaagaccgatgcttttacggtggactaggaaaccctcaaagtcgagtgaagcaaa 10579780  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    || | |||||| || | |  | ||||| || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||| | ||||||||||    
T  10579781 gtagccaaacaagatatatggagttctaaccatcaacatgcctttataccatttgcgtttgacacttttggcttcctgtcactagagaccgttgaccttc 10579880  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcata 255  Q
    ||||||||   |||||| |||||||||    
T  10579881 tacatagaactcaaagggttatgcata 10579907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30602423 - 30602361
Alignment:
Q  300 attgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30602423 attggttttgccatccaaaaaggcctagcagcgcagcttgttgcccgcatgccttctattcat 30602361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41702206 - 41702144
Alignment:
Q  300 attgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41702206 attggttttgccatccaaaaaggcctagtggcgcagcttgttgcccacttgccttctattcat 41702144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Original strand, 15515286 - 15515373
Alignment:
Q  266 gtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcct 353  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  15515286 gtctcctaggtccaccaatgttgtgttcacgaggattggttttgccatccaaaaaagtctagcggcgcagtttgttgcctgtttgcct 15515373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 177
Target Start/End: Original strand, 1296023 - 1296100
Alignment:
Q  100 agacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatac 177  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1296023 agacaacgctaaaagctgcgtcaaacaaaatggccaaacatgagaaaatatgttctgacaataaacatgtttttatac 1296100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 42122763 - 42122690
Alignment:
Q  288 gtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||    
T  42122763 gtgtttacgaggactggttttgccatccaaaaaagtctagcggcgcagcttattgttcgcttgccttctattca 42122690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 286 - 362
Target Start/End: Original strand, 2626006 - 2626082
Alignment:
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  | ||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2626006 ttgtgtttacgaagattaatttaactatctacaaaggtctaacggcgcagcttgttgtccgcttgccttctattcat 2626082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 305 - 361
Target Start/End: Original strand, 20143123 - 20143179
Alignment:
Q  305 ttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||| |||||||    
T  20143123 ttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcaacttgttgtctgtttgccttctattca 20143179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 362
Target Start/End: Original strand, 10587144 - 10587190
Alignment:
Q  316 aaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10587144 aaaaaggtctagcggcgtagcttgttgcccgtttgccttctattcat 10587190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9200479 - 9200423
Alignment:
Q  120 tcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttata 176  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  9200479 tcaagaaaagtggtcaaacacgagtaagcgtgttttgacaattaacatgattttata 9200423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 269
Target Start/End: Original strand, 19893517 - 19893629
Alignment:
Q  157 acaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatag 256  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| | ||| |||||  | | |||||||| | ||| || ||||| ||||||||  ||||||     
T  19893517 acaatcaacatgcttttatattatttgcgtttgtcactttttgtttcttagcactatatgcagttgatcatctgcaaagagttcaaaggatactgcatat 19893616  T
Q  257 caatgttatgtct 269  Q
    |||| ||||||||    
T  19893617 caatattatgtct 19893629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 320 - 359
Target Start/End: Original strand, 38723985 - 38724024
Alignment:
Q  320 aggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38723985 aggtctagcggtgcagcttgttgctcgcttgcctcctatt 38724024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5679392 - 5679314
Alignment:
Q  120 tcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttg 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  || ||||||||| |||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  5679392 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacatgttaagataatcaacatcctttcataccatttatgtttgacacttttg 5679314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 232
Target Start/End: Original strand, 34186050 - 34186166
Alignment:
Q  115 ttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcaga 214  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||| |  ||| | |||||||||||  |||||||  |||||| ||||| | ||||| ||||||| ||  |||    
T  34186050 ttgcttcaagcaaagtggtcaaatatgacaaaacacgttttcacaatcaacatatttttatatcatttgcatttgata-ttttgtcttcctaacacaaga 34186148  T
Q  215 ggcagttgaccttctaca 232  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  34186149 ggttgttgaccttctaca 34186166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 321
Target Start/End: Original strand, 3262244 - 3262336
Alignment:
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaag 321  Q
    |||||||||| |||||| |  |||| | || ||| ||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  3262244 tacatagagttcaaagggtcttgcacatcagtgtcatgactcataggtccataaatattatgtttacgagaattgattttgccatcaaaaaag 3262336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 359
Target Start/End: Original strand, 32612326 - 32612394
Alignment:
Q  291 tttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctatt 359  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32612326 tttacgaggattggttttgccatctgaaaaggtccggcgacgcagtttgttgcccgcttgccttctatt 32612394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6538 - 6279
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||  ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  6538 acatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggg-tcggaccttttaccgtaggacagacagccctaaaagttgcgtcaagtaaa 6440  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6439 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttctataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccagaggctgttgaccttc 6340  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgt 289  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  6339 tacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgt 6279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33440 - 33123
Alignment:
Q  43 acttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatga 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| | ||| || ||| |||||||||||| |||| |||| || ||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  33440 acttgattggggtttcaccacttatgggattaggtgtcgggccttttacggtaggacaggcaac-cttaaagtggcatcaagcaaagtggctaaacatga 33342  T
Q  143 gaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  33341 gaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttacttttgacattttcggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaa 33242  T
Q  243 aggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttg 342  Q
    | | | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  33241 aaggtcatgcatagcaattttatgtctcctaggtccatgaacgtcgtgtttacgaggattgattttgtcatccaaaaaggcttggcggtgcagcttgttg 33142  T
Q  343 cccgcttgcctcctattca 361  Q
    || |||||||| |||||||    
T  33141 cctgcttgccttctattca 33123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 103274 - 102979
Alignment:
Q  65 tgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaa 164  Q
    |||||| ||||| || ||| ||||||| |||| |||| || | || |||| ||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  103274 tgtgggataaggtgtcgggccttttaccgtaggacaggcagccctcaaagctgcgtcaagtaagatggccaaacacgagaaagcgtgt-ctgacaatcaa 103176  T
Q  165 catgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgtta 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | | ||||||| ||||||      
T  103175 catgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatcgagctcaaaaggtcatgcataacaatgtcg 103076  T
Q  265 tgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  103075 tgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaaaggtctagcggcgcaacttgttgcccgcttgccttctattca 102979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1768 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1768
Description:

Target: scaffold1768; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 86 - 418
Alignment:
Q  29 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaa 128  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | | | || ||| ||||||| |||| |||| || | ||||||  |||||||||||||    
T  86 acatgcatgtatagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcgggccttttactgtaggacaggcagccctaaaaactgcgtcaagcaaa 185  T
Q  129 gtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 228  Q
    |||| ||||||||||| || | ||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||| | || |||  ||||||||||    
T  186 gtggccaaacatgagacagtgggttatgaccatcaacatgcttttataccatttgtgtttgacacttttggttttctagtaccaaaggttgttgaccttc 285  T
Q  229 tacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagc 328  Q
    | |||| ||| ||||   | || ||||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  | |     
T  286 tgcataaagttcaaaaagtcatacatagcaatgtcatgtctcctagatcgatgaacgttgtgtttacgaggattagttttgccatccaaaaaggctttgt 385  T
Q  329 ggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||    
T  386 ggcgcatcttgttgccggctttccttctattca 418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 49537 - 49287
Alignment:
Q  108 ctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctag 207  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||     
T  49537 ctaaaagttgcatcaaacaaagtggtcaaatgtgagaaatcgtgttctgacaatcaacgtgcttttataccatttgcttttgacactttcgacttcttaa 49438  T
Q  208 catcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattt 307  Q
    || || ||   |||||   || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||  ||||| ||| | || |||||||  ||||||||    
T  49437 caccaaag---gttga-ggtcaacatagagttcaaaggatcatgcataacaatgtcatgtctcttatgtccatgaatgtagtatttacgagaattgattt 49342  T
Q  308 tgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattcat 362  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  49341 ttccatctaaaacggtctagcggcgcaacttgttgctagcttgccttctaatcat 49287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10546 - 10364
Alignment:
Q  52 gggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtg 151  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| || | |||  || | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||    
T  10546 gggtttcaccactcgtgggattaggggttggggcttttacagttggacaagcagccctaaaagttgcgtcaagtaaaatggccaaacatgataatgcgtg 10447  T
Q  152 ttctgacaatcaa----catgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttcta 230  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  10446 ttctgacaatcaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttgtggcttcctagcaccagaggttgttgaccttcta 10364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7727 - 7496
Alignment:
Q  109 taaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagc 208  Q
    |||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  7727 taaaagttgcgtcaaatagagtagttaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagc 7628  T
Q  209 atcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgatttt 308  Q
      |||||   ||||||||| | ||||| || |||| | | |||||||  ||||| ||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  7627 tccagagattgttgaccttttgcatagcgttcaaaaggtcatgcata-taatgtcatgtctcataggtccatgaatgttatgtttacgagtattggtttt 7529  T
Q  309 gccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgtt 341  Q
    | ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  7528 gtcatccaaaaagatctaacggcacagcttgtt 7496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 196
Target Start/End: Original strand, 47443 - 47608
Alignment:
Q  31 atgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagt 130  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | | | |||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  47443 atgcaagtgtggacttgattggggtttcaccacttgtgggattagggattgagacttttacggtaggacaaataaacctaaaagttgcgtcaagtaaaat 47542  T
Q  131 ggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttt 196  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||| | |||||  |||||||| |||||||||| |||||||    
T  47543 ggccaaacatgagaaaatgtgttctgacagttaacatatttttataccatttgcttttaacacttt 47608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 262
Target Start/End: Original strand, 18274 - 18499
Alignment:
Q  36 tgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtca 135  Q
    ||||||| ||||| || | |||||| ||| ||||| | | |||| || ||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||    
T  18274 tgtgtgggcttgattgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcatcaaacaaagcggcca 18373  T
Q  136 aacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatag 235  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||||||||||  |||| ||||  ||||   ||| |||||||||||||    
T  18374 aacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgcttttgacacttttgatttccaagcagtagagattgttaaccttctacatag 18472  T
Q  236 agtccaaaggattatgcatagcaatgt 262  Q
    |||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  18473 agtttaaagggtcatgcagagcaatgt 18499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 286 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6836 - 6761
Alignment:
Q  286 ttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6836 ttgtgtttacgagaattggttttgccatccaaaaaggtctagcgccgcagcttgttgcccgcttgccttctattca 6761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5277 - 5197
Alignment:
Q  281 aaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcctcctattca 361  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5277 aaatgttgtgttcacgaggattgactttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgcccgcttgcattctattca 5197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Original strand, 8525 - 8598
Alignment:
Q  136 aacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgcttttgacacttttggcttcctagca 209  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  8525 aacatgagaaaacatgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcgtttaacacttttggtttcctagca 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16275 - 16191
Alignment:
Q  93 gtagaacagacaactctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatac 177  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16275 gtaggacagacaacgctaaaagctgcgtcaaacaaaatggccaaacatgagaaaacatgttctgacaataaacatgtttttatac 16191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16154 - 15998
Alignment:
Q  185 ttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaat 284  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||   ||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| | |||| ||||   || || |||    
T  16154 tttttacacttttggtttcctagcacca-aggttattgactttctacatagagttcaaagggtcatgcatagtaatatcatgtttcctgtgtctatgaat 16056  T
Q  285 tttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttg 342  Q
    ||| |||||| ||  |||||||||   |||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  16055 tttttgtttatgagaattgattttataatccaaaaaggtctaaagatgcagcttgttg 15998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 345
Target Start/End: Original strand, 16827 - 16872
Alignment:
Q  300 attgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagcttgttgccc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16827 attgattttgccatccaaaaaggtctagcggtgcagcatgttgccc 16872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 338
Target Start/End: Original strand, 4378 - 4458
Alignment:
Q  258 aatgttatgtctcctagatccataaattttgtgtttacgaatattgattttgccatccaaaaaggtctagcggcgcagctt 338  Q
    ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  4378 aatgtcatgtctcataagtccataaatgttgtgtttacgaatattggttttgtcatcaagaaagatctagcggcacagctt 4458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37444 - 37391
Alignment:
Q  120 tcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgctttt 173  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  37444 tcaaacaaaatgatcaaacatgagaaagcatattctgacaatcaacatgttttt 37391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University