View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13854_low_8 (Length: 432)

Name: NF13854_low_8
Description: NF13854
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13854_low_8
NF13854_low_8
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (20-417)||(15428459-15428856)
chr5 (24-416)||(15083798-15084188)
chr5 (31-412)||(15332036-15332417)
chr5 (20-398)||(15336476-15336851)
chr5 (20-404)||(16414841-16415225)
chr5 (20-398)||(15347849-15348227)
chr5 (20-417)||(15358118-15358515)
chr5 (34-412)||(16397530-16397908)
chr5 (184-412)||(15452306-15452534)
chr5 (34-269)||(16404128-16404363)
chr5 (369-412)||(16404459-16404502)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (20-412)||(8187949-8188341)
chr3 (109-156)||(38939072-38939119)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 15428856 - 15428459
Alignment:
Q  20 ttctcttcaagctaaaatcttctgaaacacaaacccaaattctcggctcaaagtgtttgaccaccctctcgtgattgaagataagttgggcaagtgttgt 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15428856 ttctcttcaaactaaaatcttctgaaacacaaacccaaattctcggctcaaagtgtttgaccaccctctcgtgattgaagataagttgggcaagtgttgt 15428757  T
Q  120 ttttccaaatccgcctagaccaacaattggatagacacacaaatcctcaagaccagaagcttcgccaaccaaaaaatctacaattttattcatatcttta 219  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15428756 ttttccaagtccacctataccaacaattggataaacacacaaatcctcaagaccagaagcttcaccaaccaaaaaatctacaattttatccatatcttta 15428657  T
Q  220 tctcttccatagacttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgccaatcagggactccgcttctcttctctctgactatctcggtcaaatgaaatt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15428656 tctcttccatagacttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgccaattagggactccgcttctcttctctctgactatctcggtcaaatgaaatt 15428557  T
Q  320 tgattctttctgcagctatttcatctaacctctctcgtatgttcttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcaacttgctttggatgaagagaa 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15428556 tgattctttctgcagctatttcatctaacctctctcgtatgttcttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcaacttgctttggatgaagagaa 15428459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 24 - 416
Target Start/End: Original strand, 15083798 - 15084188
Alignment:
Q  24 cttcaagctaaaatcttctgaaacacaaacccaaattctcggctcaaagtgtttgaccaccctctcgtgattgaagataagttgggcaagtgttgttttt 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15083798 cttcaaactaaaatcttctgaaacacacacccacattctggactca--gtgttggaccaccctttcatgattgaagataagttgggcaagtgttgttttc 15083895  T
Q  124 ccaaatccgcctagaccaacaattggatagacacacaaatcctcaagaccagaagcttcgccaaccaaaaaatctacaattttattcatatctttatctc 223  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  15083896 ccaagtccgcctagacccacaattggacagacacacaaatcctcaagaccagaagcttccctaaccaaaaaatctacaattttatccttatcttcatctc 15083995  T
Q  224 ttccatagacttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgccaatcagggactccgcttctcttctctctgactatctcggtcaaatgaaatttgat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  15083996 ttccatagacttgaggttgagaaatgattgaggtggtttggcaccagtcaaggactccgcttctcttttctctgactatctcagtcaaatgaaacttggt 15084095  T
Q  324 tctttctgcagctatttcatctaacctctctcgtatgttcttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcaacttgctttggatgaagaga 416  Q
      ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15084096 cttttcttcagctatttcatccaacctctctcgtatgctcttcattttcttagcaattttgtaacgaaaagcaacttgttttggatgaagaga 15084188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 412
Target Start/End: Original strand, 15332036 - 15332417
Alignment:
Q  31 ctaaaatcttctgaaacacaaacccaaattctcggctcaaagtgtttgaccaccctctcgtgattgaagataagttgggcaagtgttgtttttccaaatc 130  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15332036 ctaaaatcatctgaaacacacacccacattctcagatcaaagtgtttgacaacactttcatgattgaatataagttgggcaagtgttgtttttccaagtc 15332135  T
Q  131 cgcctagaccaacaattggatagacacacaaatcctcaagaccagaagcttcgccaaccaaaaaatctacaattttattcatatctttatctcttccata 230  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||  ||  |||||||| |||||| ||||||| | ||||   |||||||||  |    
T  15332136 cgcctagtcccacaattggataaaccgacaaatcctcaaaaccagaagcaccgttaaccaaaatatctaccattttatccctatcaccatctcttccgaa 15332235  T
Q  231 gacttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgccaatcagggactccgcttctcttctctctgactatctcggtcaaatgaaatttgattctttct 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||   |||||||||| | || || ||  |||||||||| ||  | ||||||    
T  15332236 gacttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgccagtcaatgactccatctctcttctctttaaccatttcaatcaaatgaaacttactcctttct 15332335  T
Q  331 gcagctatttcatctaacctctctcgtatgttcttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcaacttgctttggatgaa 412  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15332336 tcagctatttcatttaatctctctcgtatgcttttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcaacatgctttggatgaa 15332417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 398
Target Start/End: Original strand, 15336476 - 15336851
Alignment:
Q  20 ttctcttcaagctaaaatcttctgaaacacaaacccaaattctcggctcaaagtgtttgaccaccctctcgtgattgaagataagttgggcaagtgttgt 119  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||    
T  15336476 ttcttttcaaactgaaatcttctgaaacacatacccaaattcttagatcaaactggttgactacactctcatgattgaagataagttgggtcaatgttgt 15336575  T
Q  120 ttttccaaatccgcctagaccaacaattggatagacacacaaatcctcaagaccagaagcttcgccaaccaaaaaatctacaattttattcatatcttta 219  Q
    |||||||| ||| || | ||| ||||||||||| ||| | |||||||||| || |  |   |  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  15336576 ttttccaattccaccaacaccgacaattggataaacagataaatcctcaaaactacca---ttactaaccaaaaactctacaattttattcttatcttca 15336672  T
Q  220 tctcttccatagacttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgccaatcagggactccgcttctcttctctctgactatctcggtcaaatgaaatt 319  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  15336673 tctcttccataaacttgacgttgattaatgattgaagtggtttgccgccagtcaaggactccgcttctcttctctctgactatctcaatcaaatgaaact 15336772  T
Q  320 tgattctttctgcagctatttcatctaacctctctcgtatgttcttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcaac 398  Q
    || |||||||| | ||||| ||||| || ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15336773 tgcttctttcttctgctatctcatccaatctctcccttatgctcttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcaac 15336851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 404
Target Start/End: Original strand, 16414841 - 16415225
Alignment:
Q  20 ttctcttcaagctaaaatcttctgaaacacaaacccaaattctcggctcaaagtgtttgaccaccctctcgtgattgaagataagttgggcaagtgttgt 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| |||    
T  16414841 ttctcttcaaactaaaatcttctgaaacacatacccaaattcttagctcaaagtggttgactaccctttcatgattaaagatcagttggacaagtgctgt 16414940  T
Q  120 ttttccaaatccgcctagaccaacaattggatagacacacaaatcctcaagaccagaagcttcgccaaccaaaaaatctacaattttattcatatcttta 219  Q
    ||| || || || |||||||| ||||||||||||||    |||||  | | | ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | |||| |    
T  16414941 tttacccaaaccacctagacctacaattggatagactggtaaatctactaaaacagaagcatcaccaaccaaaaattccacaattttattcttctcttca 16415040  T
Q  220 tctcttccatagacttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgccaatcagggactccgcttctcttctctctgactatctcggtcaaatgaaatt 319  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||      
T  16415041 tctcttccatagattcgtggttgagtaatgattgaggtggtttggcgccagtcaaggactccacttctcttctctttgactatctcagtcaaatgaaaca 16415140  T
Q  320 tgattctttctgcagctatttcatctaacctctctcgtatgttcttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcaacttgctt 404  Q
    |  | |||||| | ||||||||||  || || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16415141 tactcctttcttcggctatttcattcaatctgtcccttatcttcttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcgacatgctt 16415225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 398
Target Start/End: Original strand, 15347849 - 15348227
Alignment:
Q  20 ttctcttcaagctaaaatcttctgaaacacaaacccaaattctcggctcaaagtgtttgaccaccctctcgtgattgaagataagttgggcaagtgttgt 119  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||  ||||| ||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||    
T  15347849 ttctcttcaaactgaaatcttctgaaacgcatacccaaattcttagctcaaagtagttgactaccttctcatgattgaacacaatttgggcaagtgttgt 15347948  T
Q  120 ttttccaaatccgcctagaccaacaattggatagacacacaaatcctcaagaccagaagcttcgccaaccaaaaaatctacaattttattcatatcttta 219  Q
    ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||  | |||||||||| || |||||| ||  |||||||||| |||||||||||| || |||||| |    
T  15347949 tttcccaagtccacctaaaccgacaattggataaactgataaatcctcaaaactagaagcatcatcaaccaaaaagtctacaattttactcttatcttca 15348048  T
Q  220 tctcttccatagacttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgccaatcagggactccgcttctcttctctctgactatctcggtcaaatgaaatt 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| | | |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15348049 tctcttccataaacttgaggttgagtaataattgaggtggtttgtcgccagtcaaggacttcacatctcctttctctgactatctcagtcaaatgaaact 15348148  T
Q  320 tgattctttctgcagctatttcatctaacctctctcgtatgttcttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcaac 398  Q
    |  | |||||| |||||||| |||| || ||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348149 tactcctttcttcagctattccatccaatctctcccttatcctcttaattttcttagcaattttgtaacggaaagcaac 15348227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 417
Target Start/End: Original strand, 15358118 - 15358515
Alignment:
Q  20 ttctcttcaagctaaaatcttctgaaacacaaacccaaattctcggctcaaagtgtttgaccaccctctcgtgattgaagataagttgggcaagtgttgt 119  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||    
T  15358118 ttctcttcaaactgaaatcttctgaaacacatacccaaattcttagctcaaagtgtttgactaccttctcatgattgaacacaacttgggcaagtgttgt 15358217  T
Q  120 ttttccaaatccgcctagaccaacaattggatagacacacaaatcctcaagaccagaagcttcgccaaccaaaaaatctacaattttattcatatcttta 219  Q
    ||| |||| ||| || ||||| || | |||||||||  | |||||||||  |  | | || ||  |||||||||| |||||||||| || | |||||| |    
T  15358218 tttcccaagtccaccaagacctactactggatagactgataaatcctcacaagtatacgcatcatcaaccaaaaagtctacaatttgatccttatcttca 15358317  T
Q  220 tctcttccatagacttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgccaatcagggactccgcttctcttctctctgactatctcggtcaaatgaaatt 319  Q
    | ||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  15358318 tttcttccaaaaacttgaggttgagtgatatttgaggtggtttgtcgccagtcaagaaccccgcttcttctctctctcactatctcagtcaaatgaaact 15358417  T
Q  320 tgattctttctgcagctatttcatctaacctctctcgtatgttcttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcaacttgctttggatgaagagaa 417  Q
    |  | |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  15358418 tactcctttcttcagctatttcatccaatctctctcttattcttttcattttcttagcaagtttgtaacggaaagcaacatgcttaggatgaaaagaa 15358515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 412
Target Start/End: Original strand, 16397530 - 16397908
Alignment:
Q  34 aaatcttctgaaacacaaacccaaattctcggctcaaagtgtttgaccaccctctcgtgattgaagataagttgggcaagtgttgtttttccaaatccgc 133  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |   ||||||||| ||||| | | | || ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || | ||| |    
T  16397530 aaatcttctgaaacgcacacccaaatttttaactcaaagtggttgactatcttgtcatgattgaagacgagttgagcaagtgttgttttacctagtccac 16397629  T
Q  134 ctagaccaacaattggatagacacacaaatcctcaagaccagaagcttcgccaaccaaaaaatctacaattttattcatatctttatctcttccatagac 233  Q
    |||| |||||||||||||||||  | || |||||  |  | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||    
T  16397630 ctagcccaacaattggatagacggataagtcctcttgttcggaagcatcaccaaccaaaaagtctacaattttatccttatcttcgtttcttccatagac 16397729  T
Q  234 ttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgccaatcagggactccgcttctcttctctctgactatctcggtcaaatgaaatttgattc-tttctgc 332  Q
    |  |||||||| || ||||||||| ||||| ||||| || |||||| | |  ||  ||||||| || ||||| || |||||||| || |||| |||||||    
T  16397730 taaaggttgagtaacgattgaggtggtttgtcgccagtctgggactactccacttctctctctaacgatctcagttaaatgaaactt-attcttttctgc 16397828  T
Q  333 agctatttcatctaacctctctcgtatgttcttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcaacttgctttggatgaa 412  Q
    ||| || ||||||||||   ||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16397829 agcaatgtcatctaaccagactcctatcctcttcattttcttagcaagtttgtaacggaaagcaatatgctttggatgaa 16397908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15452534 - 15452306
Alignment:
Q  184 ccaaccaaaaaatctacaattttattcatatctttatctcttccatagacttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgccaatcagggactccgc 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| | |||| |  ||||||||||  |||  || ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |    
T  15452534 ccaatcaaaaagtctacaattttatccttatcctcgtctcttccatgaactaaagtttgattaatgattgaggtggtttggcgccattctaggactccac 15452435  T
Q  284 ttctcttctctctgactatctcggtcaaatgaaatttgattctttctgcagctatttcatctaacctctctcgtatgttcttcattttcttagcaatttt 383  Q
     |||  ||||||| || ||||| ||||||||||||    |  ||||   ||| |||| |||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||| |||    
T  15452434 ctcttctctctctaaccatctccgtcaaatgaaatccactcttttcgaaagcgatttgatctaacctctctcttatcctcctcatttttttagcaagttt 15452335  T
Q  384 gtaacggaaagcaacttgctttggatgaa 412  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15452334 gtaacgaaaagcaacatgcttgggatgaa 15452306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 269
Target Start/End: Original strand, 16404128 - 16404363
Alignment:
Q  34 aaatcttctgaaacacaaacccaaattctcggctcaaagtgtttgaccaccctctcgtgattgaagataagttgggcaagtgttgtttttccaaatccgc 133  Q
    |||||||| ||||||   |||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || | ||| |    
T  16404128 aaatcttcagaaacaatcacccaaattcttaattcaaagtggttgactaccctctcgttattaaagacgagttgggcaagtgttgttttacccagtcccc 16404227  T
Q  134 ctagaccaacaattggatagacacacaaatcctcaagaccagaagcttcgccaaccaaaaaatctacaattttattcatatctttatctcttccatagac 233  Q
    |||| || || |||||||||||| | || ||||| |   || | || || ||||||||||| || || ||||||| | | ||||| ||||||||||||||    
T  16404228 ctaggcctactattggatagacagataagtcctccaattcatatgcatcaccaaccaaaaagtccacgattttatccttttctttttctcttccatagac 16404327  T
Q  234 ttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgcca 269  Q
    |   |||||||  |  |||||||| |||||||||||    
T  16404328 taacggttgaggtaatattgaggtggtttggcgcca 16404363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 412
Target Start/End: Original strand, 16404459 - 16404502
Alignment:
Q  369 tttcttagcaattttgtaacggaaagcaacttgctttggatgaa 412  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16404459 tttcttagcaagtttgtaacgaaaagcaacatgctttggatgaa 16404502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 412
Target Start/End: Original strand, 8187949 - 8188341
Alignment:
Q  20 ttctcttcaagctaaaatcttctgaaacacaaacccaaattctcggctcaaagtgtttgaccaccctctcgtgattgaagataagttgggcaagtgttgt 119  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| | ||| | | |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  8187949 ttctcttcaaactgaaatcttcagaaacacatacccaaattcttagctcaaagtggtcgactatcttctcatgattgaagatgagttgggtcagtgttgt 8188048  T
Q  120 ttttccaaatccgcctagaccaacaattggatagacacacaaatcctcaagaccagaagcttcgccaaccaaaaaatctacaattttattcatatcttta 219  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||  | || ||||||||| || ||||| | ||| |||| |||||||| | |||||| |    
T  8188049 ttttccaagtccacctagaccaactattggatagacagataaattttgaaaaccagaagcatcaccaacaagaaagtctataattttatccctatcttca 8188148  T
Q  220 tctcttccatagacttgaggttgagaaatgattgaggttgtttggcgccaatcagggactccgcttctcttctctctgactatctcggtcaaatgaaatt 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  8188149 tctcttccataaacttgaggttgagaaatgattgacgtggtttggcgccagtcaaatactccacttctcttctctctcactatctcagtcaaatgaaact 8188248  T
Q  320 tgattctttctgcagctatttcatctaacctctctcgtatgttcttcattttcttagcaattttgtaacggaaagcaacttgctttggatgaa 412  Q
    |  |||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8188249 tagttctttcttcagcaatttcatccaacctctttcgtatcttcttcattttcttagcaatattgtaacggaaagcaacatgcttaggatgaa 8188341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38939119 - 38939072
Alignment:
Q  109 gcaagtgttgtttttccaaatccgcctagaccaacaattggatagaca 156  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  38939119 gcaagtgttgtttttccatatccacctagaccaacaatggaatagaca 38939072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University