View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13869_high_10 (Length: 572)

Name: NF13869_high_10
Description: NF13869
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13869_high_10
NF13869_high_10
[»] chr3 (114 HSPs)
chr3 (359-539)||(38416726-38416906)
chr3 (360-539)||(47257794-47257973)
chr3 (360-539)||(7855116-7855295)
chr3 (360-539)||(46134357-46134536)
chr3 (360-539)||(51170035-51170214)
chr3 (360-539)||(27066980-27067159)
chr3 (360-535)||(29625833-29626008)
chr3 (360-539)||(40130961-40131140)
chr3 (360-539)||(49330038-49330217)
chr3 (360-539)||(47809598-47809778)
chr3 (360-548)||(48739226-48739414)
chr3 (360-539)||(22399098-22399276)
chr3 (360-539)||(24100284-24100462)
chr3 (360-539)||(28048394-28048573)
chr3 (360-539)||(35748313-35748492)
chr3 (360-539)||(40643801-40643980)
chr3 (360-539)||(41464353-41464532)
chr3 (368-541)||(48609732-48609905)
chr3 (359-539)||(40804512-40804692)
chr3 (360-524)||(53943604-53943768)
chr3 (360-539)||(32234400-32234578)
chr3 (360-539)||(40419836-40420015)
chr3 (360-539)||(42291843-42292022)
chr3 (360-539)||(43612049-43612228)
chr3 (361-539)||(41293321-41293498)
chr3 (354-539)||(18946898-18947083)
chr3 (360-549)||(51102370-51102559)
chr3 (351-539)||(51452753-51452940)
chr3 (360-539)||(2666001-2666180)
chr3 (360-539)||(37324542-37324721)
chr3 (360-539)||(39634574-39634752)
chr3 (360-539)||(41732529-41732708)
chr3 (360-539)||(44222830-44223009)
chr3 (360-539)||(44806685-44806864)
chr3 (364-539)||(52628959-52629133)
chr3 (360-539)||(55453246-55453425)
chr3 (360-528)||(37313400-37313568)
chr3 (360-539)||(7755309-7755487)
chr3 (360-539)||(20754395-20754574)
chr3 (364-539)||(43183917-43184092)
chr3 (360-539)||(52638843-52639022)
chr3 (360-537)||(35594122-35594299)
chr3 (360-516)||(24376574-24376730)
chr3 (383-539)||(46126011-46126166)
chr3 (360-539)||(47894822-47895001)
chr3 (360-535)||(52215077-52215252)
chr3 (360-526)||(36368940-36369105)
chr3 (360-518)||(43125832-43125990)
chr3 (360-539)||(43021715-43021895)
chr3 (360-515)||(39053395-39053550)
chr3 (360-539)||(53832486-53832665)
chr3 (360-508)||(53637842-53637990)
chr3 (360-539)||(41216456-41216635)
chr3 (363-524)||(46949379-46949538)
chr3 (360-532)||(51146224-51146396)
chr3 (360-539)||(5560027-5560213)
chr3 (360-541)||(54158998-54159169)
chr3 (360-541)||(48546840-48547010)
chr3 (360-538)||(49130579-49130746)
chr3 (360-505)||(37758930-37759075)
chr3 (360-539)||(55379986-55380154)
chr3 (360-532)||(25641647-25641808)
chr3 (360-532)||(42589831-42589992)
chr3 (360-536)||(54401188-54401353)
chr3 (360-539)||(25353555-25353723)
chr3 (360-539)||(53115448-53115616)
chr3 (419-539)||(52864550-52864669)
chr3 (360-524)||(34279738-34279891)
chr3 (360-532)||(54707229-54707390)
chr3 (426-539)||(33550469-33550582)
chr3 (360-539)||(38156634-38156802)
chr3 (360-539)||(47510942-47511110)
chr3 (360-539)||(51415970-51416138)
chr3 (360-539)||(30251503-30251671)
chr3 (360-539)||(55000180-55000348)
chr3 (360-524)||(39141141-39141296)
chr3 (359-539)||(31286795-31286964)
chr3 (359-527)||(40022074-40022231)
chr3 (359-539)||(51143817-51143986)
chr3 (360-527)||(41635814-41635970)
chr3 (360-539)||(43176740-43176908)
chr3 (360-539)||(45058884-45059052)
chr3 (360-458)||(21597220-21597318)
chr3 (360-458)||(41882063-41882161)
chr3 (408-490)||(47182049-47182131)
chr3 (360-539)||(24688115-24688283)
chr3 (360-539)||(42998791-42998958)
chr3 (360-470)||(2227995-2228105)
chr3 (360-516)||(17665549-17665694)
chr3 (360-532)||(37028724-37028885)
chr3 (361-458)||(50731986-50732083)
chr3 (361-458)||(50780773-50780870)
chr3 (352-466)||(177154-177268)
chr3 (360-532)||(51224047-51224207)
chr3 (361-470)||(8847718-8847827)
chr3 (360-458)||(28576184-28576282)
chr3 (360-458)||(48726070-48726168)
chr3 (454-539)||(30429229-30429314)
chr3 (360-531)||(40165653-40165812)
chr3 (360-435)||(52434140-52434216)
chr3 (360-435)||(48752086-48752161)
chr3 (368-470)||(47402810-47402911)
chr3 (466-532)||(48534016-48534082)
chr3 (360-445)||(44946014-44946099)
chr3 (392-470)||(41609100-41609178)
chr3 (394-539)||(52756069-52756207)
chr3 (466-539)||(44945937-44946010)
chr3 (490-539)||(50731916-50731965)
chr3 (490-539)||(50780891-50780940)
chr3 (360-411)||(37741436-37741487)
chr3 (489-539)||(40688431-40688481)
chr3 (499-532)||(37760345-37760378)
chr3 (482-539)||(48752226-48752283)
chr3 (360-400)||(51942546-51942586)
[»] chr4 (124 HSPs)
chr4 (361-539)||(44984763-44984941)
chr4 (360-539)||(34276548-34276727)
chr4 (361-539)||(21366611-21366789)
chr4 (360-539)||(6019929-6020108)
chr4 (360-539)||(9798466-9798645)
chr4 (360-539)||(23437593-23437772)
chr4 (360-539)||(31532137-31532316)
chr4 (362-539)||(31972338-31972515)
chr4 (360-532)||(237478-237650)
chr4 (360-532)||(41560329-41560501)
chr4 (360-539)||(32366662-32366841)
chr4 (360-539)||(42085208-42085387)
chr4 (360-539)||(42765844-42766022)
chr4 (360-539)||(53854432-53854610)
chr4 (360-549)||(39077546-39077735)
chr4 (360-541)||(41702459-41702640)
chr4 (359-539)||(22618516-22618694)
chr4 (360-539)||(2826684-2826862)
chr4 (360-539)||(18462015-18462194)
chr4 (360-539)||(19387690-19387869)
chr4 (360-539)||(27373077-27373255)
chr4 (360-539)||(50234001-50234180)
chr4 (360-539)||(51363008-51363186)
chr4 (360-539)||(53461818-53461997)
chr4 (360-539)||(54574942-54575121)
chr4 (360-539)||(55519828-55520007)
chr4 (360-541)||(397403-397584)
chr4 (360-541)||(50457810-50457991)
chr4 (360-539)||(146431-146610)
chr4 (360-539)||(3692212-3692391)
chr4 (360-539)||(26091260-26091439)
chr4 (360-539)||(29478361-29478540)
chr4 (360-539)||(29777259-29777438)
chr4 (360-539)||(31914199-31914377)
chr4 (360-539)||(43471697-43471876)
chr4 (360-539)||(45797480-45797659)
chr4 (360-539)||(47344657-47344836)
chr4 (360-531)||(55056269-55056440)
chr4 (360-538)||(6285308-6285486)
chr4 (360-539)||(41949383-41949564)
chr4 (360-539)||(49881061-49881244)
chr4 (360-539)||(47662104-47662283)
chr4 (360-539)||(54086411-54086588)
chr4 (360-539)||(55776046-55776224)
chr4 (360-539)||(55840224-55840402)
chr4 (359-539)||(42222291-42222471)
chr4 (360-532)||(54607963-54608135)
chr4 (360-539)||(407755-407932)
chr4 (360-539)||(3170627-3170806)
chr4 (360-539)||(23609088-23609267)
chr4 (360-539)||(42033176-42033355)
chr4 (359-529)||(50534631-50534801)
chr4 (360-537)||(35446507-35446683)
chr4 (360-539)||(2243459-2243638)
chr4 (360-523)||(22468788-22468951)
chr4 (360-539)||(31070076-31070254)
chr4 (360-539)||(56023000-56023179)
chr4 (361-535)||(33897501-33897675)
chr4 (360-539)||(38591669-38591844)
chr4 (360-539)||(48654815-48655000)
chr4 (360-524)||(39587796-39587960)
chr4 (360-539)||(48313558-48313735)
chr4 (360-532)||(1932764-1932936)
chr4 (360-539)||(14017378-14017555)
chr4 (359-539)||(53834056-53834236)
chr4 (360-539)||(41632009-41632187)
chr4 (361-539)||(48657826-48657998)
chr4 (360-532)||(54805623-54805799)
chr4 (360-537)||(50536628-50536805)
chr4 (360-524)||(54424983-54425147)
chr4 (360-539)||(9997933-9998101)
chr4 (360-524)||(48259528-48259691)
chr4 (359-541)||(51951682-51951863)
chr4 (402-539)||(52728309-52728445)
chr4 (415-539)||(36532832-36532956)
chr4 (360-532)||(54715036-54715197)
chr4 (360-527)||(20351856-20352012)
chr4 (360-539)||(43890929-43891097)
chr4 (360-547)||(45633773-45633949)
chr4 (360-541)||(54216314-54216484)
chr4 (360-532)||(54216745-54216906)
chr4 (360-539)||(15060291-15060459)
chr4 (360-539)||(47811907-47812075)
chr4 (444-539)||(35595772-35595867)
chr4 (360-532)||(33289704-33289865)
chr4 (414-532)||(42509351-42509469)
chr4 (360-539)||(34835178-34835346)
chr4 (360-539)||(38547603-38547771)
chr4 (360-518)||(5117461-5117608)
chr4 (360-466)||(1662323-1662429)
chr4 (360-532)||(37239099-37239260)
chr4 (360-537)||(27398607-27398773)
chr4 (360-537)||(46720026-46720195)
chr4 (360-466)||(14335165-14335271)
chr4 (360-466)||(27580120-27580226)
chr4 (360-532)||(52688350-52688511)
chr4 (360-539)||(34552320-34552488)
chr4 (407-497)||(52396774-52396865)
chr4 (363-539)||(573807-573972)
chr4 (360-532)||(22620594-22620755)
chr4 (360-532)||(31881323-31881484)
chr4 (360-518)||(4486604-4486751)
chr4 (439-539)||(35344868-35344967)
chr4 (363-539)||(46708743-46708908)
chr4 (360-539)||(6371251-6371419)
chr4 (360-518)||(27873571-27873718)
chr4 (359-541)||(33557942-33558113)
chr4 (360-524)||(52461367-52461517)
chr4 (360-451)||(3293102-3293193)
chr4 (468-539)||(33048990-33049061)
chr4 (387-539)||(27872607-27872748)
chr4 (360-539)||(49014099-49014267)
chr4 (360-443)||(42557583-42557666)
chr4 (360-451)||(11972208-11972299)
chr4 (360-458)||(43231504-43231601)
chr4 (464-539)||(48259706-48259780)
chr4 (396-527)||(51981493-51981613)
chr4 (360-465)||(49057933-49058038)
chr4 (473-539)||(3291807-3291873)
chr4 (437-527)||(42558271-42558353)
chr4 (360-410)||(17555617-17555667)
chr4 (370-465)||(18206583-18206682)
chr4 (489-539)||(1662263-1662313)
chr4 (457-527)||(49304602-49304671)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (360-539)||(13764-13943)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (360-539)||(32984079-32984258)
chr8 (360-539)||(10646124-10646303)
chr8 (360-539)||(43328708-43328887)
chr8 (360-539)||(24079903-24080082)
chr8 (360-539)||(41862221-41862400)
chr8 (360-539)||(6365987-6366166)
chr8 (360-539)||(40435155-40435334)
chr8 (360-537)||(31830959-31831136)
chr8 (360-539)||(5946048-5946227)
chr8 (360-539)||(9303576-9303755)
chr8 (360-539)||(33730643-33730822)
chr8 (360-539)||(37956422-37956601)
chr8 (360-538)||(44088446-44088624)
chr8 (359-532)||(17718731-17718904)
chr8 (362-539)||(25185902-25186079)
chr8 (360-524)||(2714550-2714714)
chr8 (360-539)||(9734256-9734433)
chr8 (360-539)||(33981665-33981844)
chr8 (360-539)||(37301327-37301506)
chr8 (360-539)||(41653896-41654075)
chr8 (360-539)||(9013685-9013863)
chr8 (364-539)||(32114254-32114429)
chr8 (360-539)||(37419941-37420120)
chr8 (360-535)||(45066598-45066773)
chr8 (360-539)||(45236567-45236746)
chr8 (360-526)||(13760663-13760829)
chr8 (360-518)||(29048426-29048584)
chr8 (360-539)||(13356122-13356301)
chr8 (360-539)||(41231947-41232126)
chr8 (360-527)||(2275914-2276080)
chr8 (360-539)||(35628778-35628957)
chr8 (360-539)||(25248040-25248213)
chr8 (360-539)||(22878392-22878571)
chr8 (360-539)||(41639915-41640094)
chr8 (415-539)||(12032986-12033110)
chr8 (360-524)||(45258511-45258675)
chr8 (360-529)||(42701301-42701471)
chr8 (408-532)||(3904126-3904249)
chr8 (425-539)||(41981534-41981648)
chr8 (360-539)||(4447297-4447465)
chr8 (360-539)||(10378310-10378478)
chr8 (360-527)||(41843254-41843410)
chr8 (428-539)||(31336163-31336274)
chr8 (360-532)||(31940316-31940476)
chr8 (360-539)||(3211207-3211374)
chr8 (360-532)||(9713690-9713848)
chr8 (359-539)||(117331-117500)
chr8 (360-524)||(38631653-38631806)
chr8 (360-466)||(39915887-39915993)
chr8 (360-532)||(40458781-40458942)
chr8 (360-539)||(2379141-2379309)
chr8 (364-524)||(32373744-32373892)
chr8 (360-539)||(3490401-3490569)
chr8 (361-532)||(4975416-4975576)
chr8 (360-539)||(33896845-33897012)
chr8 (383-461)||(41981457-41981535)
chr8 (360-468)||(31148953-31149060)
chr8 (360-451)||(27243218-27243309)
chr8 (360-451)||(27254793-27254884)
chr8 (371-532)||(40649840-40649990)
chr8 (360-523)||(26196335-26196486)
chr8 (360-532)||(9509409-9509570)
chr8 (360-524)||(33622483-33622635)
chr8 (466-532)||(41425438-41425503)
chr8 (365-428)||(164728-164791)
chr8 (476-539)||(39901674-39901737)
chr8 (383-420)||(2179045-2179082)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (360-539)||(5882507-5882686)
chr6 (360-539)||(22551063-22551242)
chr6 (360-539)||(24168092-24168271)
chr6 (360-541)||(2892189-2892370)
chr6 (360-537)||(14891383-14891560)
chr6 (360-539)||(2593854-2594033)
chr6 (360-539)||(26377206-26377385)
chr6 (360-539)||(34527864-34528043)
chr6 (360-547)||(7345106-7345293)
chr6 (360-539)||(7393588-7393767)
chr6 (360-539)||(8615241-8615420)
chr6 (362-539)||(18101497-18101674)
chr6 (359-535)||(30743454-30743630)
chr6 (360-539)||(599893-600072)
chr6 (360-539)||(959906-960085)
chr6 (372-539)||(11988976-11989143)
chr6 (360-535)||(16703367-16703542)
chr6 (360-539)||(19415535-19415714)
chr6 (360-539)||(28947088-28947267)
chr6 (359-539)||(5294803-5294983)
chr6 (359-539)||(5299355-5299535)
chr6 (360-528)||(1970712-1970880)
chr6 (360-539)||(10507910-10508089)
chr6 (372-539)||(22341790-22341959)
chr6 (360-539)||(19281057-19281236)
chr6 (360-539)||(33452574-33452753)
chr6 (360-539)||(24224072-24224252)
chr6 (360-488)||(30467656-30467784)
chr6 (392-539)||(23261931-23262078)
chr6 (360-539)||(7167583-7167751)
chr6 (360-539)||(28948847-28949015)
chr6 (360-532)||(13329382-13329543)
chr6 (360-539)||(15965434-15965602)
chr6 (360-539)||(1398554-1398722)
chr6 (360-549)||(3786750-3786928)
chr6 (360-441)||(929660-929741)
chr6 (360-539)||(3291009-3291177)
chr6 (360-532)||(4487528-4487689)
chr6 (138-248)||(27420271-27420377)
chr6 (360-539)||(375729-375894)
chr6 (365-455)||(1939579-1939669)
chr6 (466-539)||(18661830-18661903)
chr6 (1-114)||(27420382-27420493)
chr6 (482-539)||(34262342-34262399)
chr6 (466-523)||(24913114-24913171)
chr6 (370-466)||(13844847-13844943)
chr6 (293-356)||(27368259-27368327)
chr6 (293-356)||(27458606-27458674)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (360-539)||(24253383-24253562)
chr5 (360-539)||(35626039-35626218)
chr5 (360-532)||(43326388-43326560)
chr5 (360-539)||(7722050-7722229)
chr5 (360-539)||(15398484-15398663)
chr5 (360-541)||(6901800-6901981)
chr5 (360-539)||(739706-739885)
chr5 (360-539)||(12648798-12648977)
chr5 (360-539)||(43262185-43262364)
chr5 (370-539)||(31938908-31939077)
chr5 (360-532)||(18479677-18479849)
chr5 (360-532)||(40886037-40886208)
chr5 (360-539)||(3466683-3466862)
chr5 (360-539)||(5184973-5185152)
chr5 (360-539)||(27501057-27501236)
chr5 (360-539)||(39932580-39932759)
chr5 (360-539)||(27938898-27939078)
chr5 (360-539)||(2484294-2484473)
chr5 (360-539)||(15683792-15683971)
chr5 (360-539)||(25831522-25831700)
chr5 (360-539)||(27278475-27278658)
chr5 (360-539)||(890907-891085)
chr5 (396-539)||(29789297-29789440)
chr5 (361-539)||(13504744-13504922)
chr5 (367-539)||(38756489-38756662)
chr5 (370-539)||(40278860-40279029)
chr5 (360-539)||(28424797-28424974)
chr5 (360-539)||(5137716-5137895)
chr5 (360-540)||(40110235-40110414)
chr5 (402-539)||(34451293-34451430)
chr5 (360-539)||(33617586-33617754)
chr5 (360-503)||(40632500-40632634)
chr5 (360-522)||(4149695-4149847)
chr5 (360-539)||(763724-763903)
chr5 (360-539)||(19295731-19295899)
chr5 (360-539)||(31293991-31294170)
chr5 (360-539)||(9424594-9424762)
chr5 (360-532)||(38015523-38015684)
chr5 (360-536)||(42658667-42658832)
chr5 (360-539)||(2585463-2585631)
chr5 (360-539)||(5497274-5497442)
chr5 (360-539)||(27503380-27503548)
chr5 (360-532)||(9374511-9374672)
chr5 (360-470)||(12558090-12558199)
chr5 (360-539)||(23195250-23195418)
chr5 (364-539)||(33623941-33624105)
chr5 (360-529)||(18327185-18327343)
chr5 (360-532)||(1402514-1402675)
chr5 (360-532)||(6973064-6973225)
chr5 (367-539)||(27390605-27390766)
chr5 (360-539)||(13957671-13957839)
chr5 (360-524)||(36365462-36365615)
chr5 (360-466)||(36472348-36472454)
chr5 (360-539)||(14971979-14972147)
chr5 (360-539)||(24167786-24167954)
chr5 (360-539)||(38637912-38638080)
chr5 (385-532)||(36948499-36948633)
chr5 (360-539)||(40686900-40687067)
chr5 (386-532)||(3656577-3656712)
chr5 (360-447)||(42247865-42247952)
chr5 (370-467)||(5120036-5120132)
chr5 (360-518)||(6206885-6207032)
chr5 (393-524)||(38492647-38492767)
chr5 (359-426)||(9527124-9527191)
chr5 (362-444)||(9171111-9171193)
chr5 (385-539)||(612759-612900)
chr5 (381-450)||(3940411-3940480)
chr5 (390-458)||(20207088-20207156)
chr5 (363-419)||(28756082-28756138)
chr5 (478-539)||(3940338-3940399)
chr5 (370-426)||(15300977-15301033)
[»] chr2 (82 HSPs)
chr2 (360-539)||(17600836-17601015)
chr2 (360-539)||(45370990-45371169)
chr2 (360-539)||(746466-746645)
chr2 (360-539)||(2324891-2325070)
chr2 (360-539)||(34518367-34518546)
chr2 (361-539)||(23901780-23901958)
chr2 (360-539)||(4034592-4034771)
chr2 (360-539)||(6594460-6594639)
chr2 (360-539)||(38997101-38997280)
chr2 (360-532)||(6430473-6430645)
chr2 (360-539)||(11184972-11185151)
chr2 (360-539)||(13815220-13815399)
chr2 (360-539)||(14660446-14660625)
chr2 (360-539)||(26710345-26710524)
chr2 (360-539)||(27651036-27651215)
chr2 (360-539)||(40635218-40635397)
chr2 (360-538)||(10424595-10424773)
chr2 (360-539)||(1091953-1092132)
chr2 (360-539)||(10244584-10244763)
chr2 (360-539)||(27400403-27400582)
chr2 (360-539)||(37255339-37255513)
chr2 (354-539)||(2914140-2914325)
chr2 (363-539)||(11159625-11159800)
chr2 (360-532)||(33427656-33427828)
chr2 (360-539)||(5726129-5726308)
chr2 (360-539)||(14697539-14697718)
chr2 (360-539)||(32327361-32327540)
chr2 (374-539)||(32856438-32856603)
chr2 (360-539)||(37620869-37621051)
chr2 (360-539)||(4609626-4609805)
chr2 (360-539)||(7892690-7892869)
chr2 (360-539)||(27024415-27024594)
chr2 (360-539)||(40735464-40735643)
chr2 (360-539)||(32948446-32948624)
chr2 (360-515)||(8432942-8433097)
chr2 (360-515)||(32608380-32608535)
chr2 (360-539)||(40037143-40037321)
chr2 (360-539)||(9444683-9444872)
chr2 (360-541)||(15925080-15925261)
chr2 (359-539)||(12842102-12842277)
chr2 (411-538)||(25294886-25295013)
chr2 (360-539)||(39103047-39103215)
chr2 (360-484)||(42899915-42900039)
chr2 (408-526)||(1229675-1229793)
chr2 (437-539)||(447635-447737)
chr2 (360-539)||(145282-145450)
chr2 (360-539)||(21734902-21735070)
chr2 (359-539)||(35158052-35158221)
chr2 (361-507)||(41172459-41172605)
chr2 (360-532)||(43898980-43899140)
chr2 (360-539)||(4258490-4258657)
chr2 (360-531)||(44481828-44481988)
chr2 (359-539)||(27331297-27331470)
chr2 (360-532)||(35126780-35126941)
chr2 (360-539)||(28641294-28641462)
chr2 (360-539)||(29687041-29687209)
chr2 (370-539)||(13543626-13543784)
chr2 (360-524)||(12333513-12333665)
chr2 (360-532)||(19428435-19428597)
chr2 (360-539)||(39301199-39301367)
chr2 (360-541)||(28566698-28566868)
chr2 (439-521)||(12827142-12827223)
chr2 (360-532)||(27764872-27765032)
chr2 (360-539)||(34249265-34249433)
chr2 (431-503)||(28014856-28014928)
chr2 (360-435)||(12814614-12814689)
chr2 (360-451)||(40544155-40544246)
chr2 (392-532)||(3711665-3711794)
chr2 (360-524)||(12730061-12730214)
chr2 (360-450)||(2000417-2000507)
chr2 (360-539)||(2688731-2688899)
chr2 (359-451)||(3266295-3266387)
chr2 (360-456)||(30545821-30545917)
chr2 (360-539)||(43356099-43356264)
chr2 (360-524)||(8056626-8056779)
chr2 (392-466)||(38985342-38985415)
chr2 (486-529)||(42900781-42900824)
chr2 (483-539)||(3266399-3266455)
chr2 (360-400)||(28019962-28020002)
chr2 (360-398)||(1897130-1897168)
chr2 (360-426)||(10176559-10176625)
chr2 (442-491)||(17799296-17799345)
[»] chr1 (110 HSPs)
chr1 (361-532)||(4068692-4068863)
chr1 (360-539)||(31308002-31308181)
chr1 (360-539)||(45538154-45538333)
chr1 (360-539)||(3611137-3611316)
chr1 (360-539)||(25058689-25058868)
chr1 (360-539)||(25678261-25678440)
chr1 (360-539)||(44661971-44662150)
chr1 (354-539)||(21139414-21139599)
chr1 (360-532)||(17994960-17995132)
chr1 (361-541)||(43251713-43251893)
chr1 (360-539)||(26277178-26277357)
chr1 (360-539)||(38790199-38790378)
chr1 (360-539)||(47671587-47671766)
chr1 (360-539)||(5981171-5981350)
chr1 (360-539)||(26085400-26085578)
chr1 (360-532)||(24245034-24245206)
chr1 (360-532)||(41999816-41999988)
chr1 (360-539)||(3285403-3285581)
chr1 (360-539)||(6327550-6327728)
chr1 (360-539)||(23984756-23984935)
chr1 (360-539)||(31040710-31040889)
chr1 (360-539)||(33884089-33884268)
chr1 (360-539)||(33959984-33960163)
chr1 (360-537)||(26794305-26794482)
chr1 (360-539)||(23932511-23932690)
chr1 (360-539)||(33112820-33112998)
chr1 (360-539)||(37620194-37620373)
chr1 (360-539)||(38331861-38332040)
chr1 (360-539)||(39646569-39646748)
chr1 (360-539)||(46967043-46967222)
chr1 (360-539)||(47383734-47383913)
chr1 (360-535)||(49253981-49254156)
chr1 (360-539)||(50774218-50774397)
chr1 (360-538)||(28888582-28888760)
chr1 (360-539)||(35273597-35273776)
chr1 (360-539)||(36566331-36566510)
chr1 (361-528)||(42863867-42864034)
chr1 (360-537)||(23220939-23221110)
chr1 (360-513)||(31844377-31844530)
chr1 (360-532)||(5980069-5980241)
chr1 (360-539)||(24885502-24885681)
chr1 (360-539)||(26524891-26525070)
chr1 (360-539)||(46784424-46784603)
chr1 (360-539)||(51057072-51057251)
chr1 (360-539)||(35692665-35692845)
chr1 (360-528)||(46616550-46616718)
chr1 (360-539)||(47317316-47317495)
chr1 (360-497)||(25518815-25518952)
chr1 (360-539)||(36003131-36003313)
chr1 (360-539)||(47187106-47187285)
chr1 (360-539)||(49398990-49399169)
chr1 (360-539)||(42313363-42313546)
chr1 (360-539)||(48373505-48373675)
chr1 (394-539)||(2450529-2450674)
chr1 (360-539)||(27983605-27983768)
chr1 (360-524)||(51403034-51403188)
chr1 (360-539)||(33073212-33073380)
chr1 (360-539)||(10928068-10928236)
chr1 (402-539)||(51045598-51045735)
chr1 (361-518)||(45475866-45476014)
chr1 (413-539)||(4808699-4808825)
chr1 (360-547)||(2657304-2657480)
chr1 (360-539)||(41467634-41467802)
chr1 (361-478)||(31979998-31980115)
chr1 (360-478)||(2556909-2557027)
chr1 (360-539)||(2954856-2955024)
chr1 (360-539)||(4953053-4953221)
chr1 (360-539)||(5961269-5961437)
chr1 (360-539)||(6626026-6626194)
chr1 (360-539)||(26685857-26686025)
chr1 (360-532)||(26472188-26472349)
chr1 (362-539)||(30289912-30290078)
chr1 (360-539)||(33187341-33187503)
chr1 (360-466)||(27924722-27924828)
chr1 (360-532)||(29770671-29770832)
chr1 (360-531)||(38716257-38716417)
chr1 (360-539)||(42234841-42235008)
chr1 (362-539)||(1388476-1388642)
chr1 (448-539)||(13312533-13312624)
chr1 (410-539)||(4156438-4156574)
chr1 (360-450)||(24649802-24649892)
chr1 (360-532)||(34752323-34752484)
chr1 (409-539)||(47772174-47772304)
chr1 (360-527)||(4243504-4243660)
chr1 (360-539)||(39475785-39475952)
chr1 (371-539)||(48683332-48683489)
chr1 (360-524)||(51155606-51155759)
chr1 (360-539)||(10920201-10920369)
chr1 (359-539)||(7561530-7561713)
chr1 (360-451)||(44544125-44544216)
chr1 (361-539)||(41895166-41895333)
chr1 (360-539)||(52323939-52324108)
chr1 (360-451)||(46428332-46428423)
chr1 (360-455)||(13313249-13313346)
chr1 (361-451)||(32448650-32448740)
chr1 (360-466)||(52367884-52367990)
chr1 (360-515)||(13281588-13281732)
chr1 (360-458)||(39637901-39637996)
chr1 (360-418)||(4156188-4156246)
chr1 (361-524)||(35991616-35991768)
chr1 (401-518)||(24215805-24215911)
chr1 (370-451)||(44293534-44293615)
chr1 (360-411)||(10919313-10919364)
chr1 (406-524)||(38718183-38718297)
chr1 (422-539)||(31286506-31286612)
chr1 (485-538)||(32448754-32448807)
chr1 (504-539)||(31844818-31844853)
chr1 (480-522)||(39359502-39359544)
chr1 (360-393)||(23994849-23994882)
chr1 (451-515)||(9779919-9779982)
[»] chr7 (95 HSPs)
chr7 (360-539)||(25893919-25894098)
chr7 (360-539)||(33423277-33423456)
chr7 (360-539)||(33695823-33696002)
chr7 (361-539)||(45690099-45690277)
chr7 (360-539)||(46913111-46913292)
chr7 (360-539)||(27018118-27018297)
chr7 (360-539)||(33839717-33839896)
chr7 (360-539)||(37846018-37846197)
chr7 (360-539)||(40670565-40670744)
chr7 (361-535)||(15877553-15877727)
chr7 (359-539)||(23393053-23393233)
chr7 (360-539)||(17855430-17855609)
chr7 (360-539)||(22979649-22979828)
chr7 (360-539)||(33411262-33411441)
chr7 (360-539)||(35355890-35356069)
chr7 (360-539)||(47066979-47067158)
chr7 (360-539)||(49171364-49171543)
chr7 (360-532)||(31586850-31587022)
chr7 (360-539)||(20165816-20165995)
chr7 (360-539)||(35328071-35328250)
chr7 (360-539)||(47740333-47740512)
chr7 (359-529)||(41990870-41991040)
chr7 (360-539)||(2341663-2341843)
chr7 (360-539)||(19563449-19563628)
chr7 (383-539)||(36389381-36389537)
chr7 (360-527)||(10028490-10028657)
chr7 (360-539)||(26579719-26579898)
chr7 (360-539)||(45482660-45482839)
chr7 (360-539)||(48609679-48609858)
chr7 (359-539)||(31625705-31625884)
chr7 (360-539)||(35757022-35757201)
chr7 (360-539)||(33332791-33332969)
chr7 (383-532)||(5183834-5183983)
chr7 (360-517)||(33870247-33870404)
chr7 (360-539)||(5712170-5712349)
chr7 (360-532)||(43499487-43499659)
chr7 (360-539)||(45063359-45063536)
chr7 (360-539)||(31429477-31429656)
chr7 (360-532)||(10618300-10618465)
chr7 (382-539)||(29446862-29447018)
chr7 (360-539)||(35767483-35767655)
chr7 (360-507)||(33720070-33720217)
chr7 (404-539)||(28233938-28234073)
chr7 (410-539)||(30076529-30076658)
chr7 (360-539)||(35752036-35752204)
chr7 (360-535)||(48085860-48086024)
chr7 (360-532)||(46817430-46817591)
chr7 (360-527)||(43489220-43489376)
chr7 (376-517)||(44564356-44564497)
chr7 (360-539)||(46898018-46898186)
chr7 (360-539)||(2332021-2332189)
chr7 (360-539)||(24228543-24228711)
chr7 (360-539)||(33393330-33393498)
chr7 (363-539)||(7876330-7876495)
chr7 (360-536)||(26941537-26941702)
chr7 (360-532)||(36816854-36817015)
chr7 (360-524)||(41855061-41855214)
chr7 (425-539)||(41904272-41904386)
chr7 (360-539)||(24923026-24923194)
chr7 (360-539)||(37127939-37128107)
chr7 (360-539)||(44003372-44003540)
chr7 (422-527)||(44405412-44405517)
chr7 (360-451)||(47906838-47906929)
chr7 (360-466)||(16482847-16482953)
chr7 (359-539)||(47460774-47460943)
chr7 (360-539)||(7257383-7257551)
chr7 (360-539)||(45502818-45502986)
chr7 (360-541)||(15643946-15644116)
chr7 (360-524)||(498205-498358)
chr7 (360-539)||(21718119-21718286)
chr7 (360-527)||(29610637-29610793)
chr7 (360-532)||(25037517-25037678)
chr7 (360-507)||(32556640-32556776)
chr7 (364-527)||(46103127-46103278)
chr7 (359-532)||(26371050-26371212)
chr7 (360-459)||(29863017-29863116)
chr7 (360-450)||(29098753-29098843)
chr7 (360-546)||(35484638-35484814)
chr7 (370-470)||(38448508-38448608)
chr7 (360-539)||(39453484-39453645)
chr7 (359-451)||(39866666-39866758)
chr7 (360-451)||(33455098-33455189)
chr7 (360-451)||(39323618-39323709)
chr7 (360-532)||(44659846-44660006)
chr7 (360-527)||(45237547-45237703)
chr7 (360-426)||(35557732-35557798)
chr7 (360-459)||(7720574-7720673)
chr7 (406-467)||(26456157-26456218)
chr7 (360-466)||(21649442-21649549)
chr7 (360-423)||(30077043-30077106)
chr7 (402-539)||(37443604-37443730)
chr7 (473-539)||(39323712-39323777)
chr7 (360-421)||(35823292-35823353)
chr7 (483-536)||(39866762-39866815)
chr7 (469-537)||(29098847-29098915)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (361-539)||(1871-2049)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (360-539)||(39558-39737)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (361-539)||(11135-11312)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (360-539)||(278007-278188)
scaffold0007 (371-539)||(176666-176834)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (360-532)||(2441-2613)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (360-539)||(75246-75425)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (360-539)||(18856-19035)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (360-513)||(32562-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (359-539)||(4598-4772)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (360-539)||(3089-3259)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (360-539)||(20479-20647)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (360-539)||(7091-7260)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (360-539)||(14745-14913)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (360-466)||(103-209)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (360-466)||(4618-4725)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (360-466)||(3393-3500)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (138-248)||(66986-67092)
scaffold0003 (1-114)||(66870-66981)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (360-507)||(17907-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (370-465)||(19228-19327)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 114)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 38416906 - 38416726
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38416906 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 38416807  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38416806 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 38416726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 47257794 - 47257973
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47257794 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 47257893  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47257894 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47257973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 7855295 - 7855116
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7855295 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccac 7855196  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7855195 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 7855116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 46134357 - 46134536
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46134357 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46134456  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46134457 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtca 46134536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 51170214 - 51170035
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51170214 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 51170115  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  51170114 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtca 51170035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 27067159 - 27066980
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  27067159 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 27067060  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27067059 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtca 27066980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 29626008 - 29625833
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29626008 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 29625909  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 535  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29625908 ttaaaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaatt 29625833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 40131140 - 40130961
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40131140 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccac 40131041  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40131040 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 40130961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 49330038 - 49330217
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49330038 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49330137  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49330138 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtca 49330217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 47809778 - 47809598
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47809778 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47809679  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47809678 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47809598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 48739414 - 48739226
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48739414 ttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccac 48739315  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaat 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  48739314 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctataaat 48739226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 22399098 - 22399276
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22399098 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccac 22399197  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22399198 tt-aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 22399276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 24100284 - 24100462
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24100284 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccac 24100382  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24100383 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 24100462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 28048573 - 28048394
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28048573 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 28048474  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28048473 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 28048394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 35748492 - 35748313
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35748492 ttttttttagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35748393  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35748392 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtca 35748313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 40643801 - 40643980
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  40643801 ttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcat 40643900  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40643901 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 40643980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 41464353 - 41464532
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41464353 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 41464452  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  41464453 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtca 41464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 368 - 541
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609905
Alignment:
Q  368 agattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaat 467  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  468 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcatc 48609905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 40804692 - 40804512
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40804692 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggatacca 40804593  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40804592 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 40804512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 53943768 - 53943604
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53943768 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 53943669  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53943668 ttaaaaatatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 53943604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 32234578 - 32234400
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32234578 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 32234479  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  32234478 tt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtca 32234400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 40419836 - 40420015
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40419836 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 40419935  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40419936 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtca 40420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 42291843 - 42292022
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42291843 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 42291942  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42291943 ttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 42292022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 43612228 - 43612049
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  43612228 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccac 43612129  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43612128 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 43612049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 41293498 - 41293321
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41293498 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccact 41293399  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41293398 t-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtca 41293321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 354 - 539
Target Start/End: Original strand, 18946898 - 18947083
Alignment:
Q  354 atataattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgga 453  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18946898 atatgattttttctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatgga 18946997  T
Q  454 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18946998 taccagttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtca 18947083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 360 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 51102559 - 51102370
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  51102559 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 51102460  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaata 549  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  51102459 ttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcaccgataaata 51102370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 351 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 51452940 - 51452753
Alignment:
Q  351 taaatataattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 450  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  51452940 taaataaagttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttat 51452841  T
Q  451 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51452840 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtca 51452753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 2666001 - 2666180
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2666001 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2666100  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  2666101 ttaaaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtca 2666180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 37324542 - 37324721
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37324542 ttttttctaaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 37324641  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37324642 ttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 37324721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 39634752 - 39634574
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39634752 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccac 39634654  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39634653 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtca 39634574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 41732529 - 41732708
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41732529 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccac 41732628  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||    
T  41732629 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtca 41732708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 44222830 - 44223009
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  44222830 ttttttctaaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccac 44222929  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44222930 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 44223009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 44806685 - 44806864
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44806685 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccac 44806784  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  44806785 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtca 44806864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 364 - 539
Target Start/End: Original strand, 52628959 - 52629133
Alignment:
Q  364 ttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaa 463  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52628959 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 52629058  T
Q  464 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52629059 aaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 52629133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 55453425 - 55453246
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55453425 ttttttctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 55453326  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  55453325 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 55453246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 528
Target Start/End: Original strand, 37313400 - 37313568
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  37313400 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 37313499  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtac 528  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313500 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtac 37313568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 7755487 - 7755309
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  7755487 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccac 7755388  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7755387 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtca 7755309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 20754574 - 20754395
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||    
T  20754574 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcac 20754475  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  20754474 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtca 20754395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 364 - 539
Target Start/End: Original strand, 43183917 - 43184092
Alignment:
Q  364 ttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaa 463  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43183917 ttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaa 43184016  T
Q  464 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43184017 aaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 52638843 - 52639022
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52638843 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccac 52638942  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  52638943 ttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtca 52639022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 360 - 537
Target Start/End: Original strand, 35594122 - 35594299
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  35594122 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcac 35594221  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 537  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35594222 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35594299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 360 - 516
Target Start/End: Original strand, 24376574 - 24376730
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24376574 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 24376673  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattc 516  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24376674 ttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 383 - 539
Target Start/End: Original strand, 46126011 - 46126166
Alignment:
Q  383 aatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 482  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46126011 aatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggcta 46126110  T
Q  483 atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  46126111 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 46126166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 47895001 - 47894822
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47895001 ttttttttagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47894902  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47894901 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 535
Target Start/End: Original strand, 52215077 - 52215252
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  52215077 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 52215176  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || |||||    
T  52215177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgggtgccttaatt 52215252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 526
Target Start/End: Original strand, 36368940 - 36369105
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36368940 ttttttctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 36369039  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggt 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36369040 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgggt 36369105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 518
Target Start/End: Original strand, 43125832 - 43125990
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43125832 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 43125931  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43125932 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 43125990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 43021715 - 43021895
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggga-tcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  43021715 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaatacca 43021814  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  43021815 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtca 43021895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 360 - 515
Target Start/End: Original strand, 39053395 - 39053550
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39053395 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccac 39053494  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccatt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  39053495 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatt 39053550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 53832665 - 53832486
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||     
T  53832665 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaa 53832566  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  53832565 ttaaaaaggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagttgtca 53832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 360 - 508
Target Start/End: Original strand, 53637842 - 53637990
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  53637842 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccac 53637941  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacc 508  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  53637942 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 41216456 - 41216635
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  41216456 ttttttctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccac 41216555  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  41216556 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtca 41216635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 363 - 524
Target Start/End: Original strand, 46949379 - 46949538
Alignment:
Q  363 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 462  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46949379 tttctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccactta 46949477  T
Q  463 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46949478 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccatgg 46949538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 51146396 - 51146224
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||  | ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51146396 ttttttctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 51146297  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51146296 ttaaaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtacccta 51146224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 5560213 - 5560027
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaat-----gagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggat 454  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5560213 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggat 5560114  T
Q  455 accacttaaaaatgtgcttatgtggc--taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5560113 accacttaaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 5560027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 360 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 54159169 - 54158998
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  54159169 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccac 54159070  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54159069 ttaaaaatgtgctta---------tgtgtattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcatc 54158998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 360 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 48547010 - 48546840
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48547010 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaa-atagttcatggataccac 48546913  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
    ||||||||||||||         |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  48546912 ttaaaaatgtgctt---------atgtgtattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcatc 48546840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 360 - 538
Target Start/End: Original strand, 49130579 - 49130746
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||        
T  49130579 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatgaata---- 49130674  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 538  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  49130675 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 49130746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 505
Target Start/End: Original strand, 37758930 - 37759075
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||    
T  37758930 ttttttctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccac 37759029  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 505  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37759030 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 55379986 - 55380154
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  55379986 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 55380085  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  55380086 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 55380154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 25641647 - 25641808
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||              
T  25641647 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 25641736  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  25641737 -taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 25641808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 42589831 - 42589992
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  42589831 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 42589922  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  42589923 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 42589992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 536
Target Start/End: Original strand, 54401188 - 54401353
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  54401188 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 54401279  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattg 536  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  54401280 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattg 54401353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 25353555 - 25353723
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25353555 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 25353654  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25353655 ctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 25353723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 53115448 - 53115616
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53115448 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 53115547  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  53115548 ttaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtca 53115616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 419 - 539
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864669
Alignment:
Q  419 agcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 518  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgag-taaattacccaccattctt 52864648  T
Q  519 ccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  52864649 ccatgggtaccctagttgtca 52864669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 34279891 - 34279738
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  34279891 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 34279800  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  34279799 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 34279738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 54707390 - 54707229
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  54707390 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 54707299  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  54707298 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 54707229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 426 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550469
Alignment:
Q  426 tgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatggg 525  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  526 taccctaattgtca 539  Q
    ||||||| ||||||    
T  33550482 taccctagttgtca 33550469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 38156802 - 38156634
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  38156802 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 38156711  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38156710 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 38156634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 47511110 - 47510942
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  47511110 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 47511019  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  47511018 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtca 47510942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 51415970 - 51416138
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||         
T  51415970 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat----- 51416064  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  51416065 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtca 51416138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 30251671 - 30251503
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30251671 ttttttctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 30251572  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30251571 ctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 30251503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 55000348 - 55000180
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||        
T  55000348 ttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata---- 55000253  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  55000252 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 55000180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 39141296 - 39141141
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||         
T  39141296 ttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 39141202  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  39141201 ----atatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcatgg 39141141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 31286964 - 31286795
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  31286964 attttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 31286872  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  31286871 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtca 31286795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 359 - 527
Target Start/End: Original strand, 40022074 - 40022231
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  40022074 attttttctaaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 40022166  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  40022167 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggta 40022231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Original strand, 51143817 - 51143986
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  51143817 attttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggatacca 51143916  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  51143917 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtca 51143986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 360 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 41635970 - 41635814
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  41635970 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 41635879  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41635878 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggta 41635814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 43176908 - 43176740
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  43176908 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccac 43176809  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||            |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43176808 ctaaaaaggtg-----------gatgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtca 43176740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 45058884 - 45059052
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  45058884 ttttttttaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 45058975  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||    
T  45058976 ---aatatgtgcttatgttgctaatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagttgtca 45059052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 21597318 - 21597220
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21597318 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 21597220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 41882161 - 41882063
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41882161 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 408 - 490
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182131
Alignment:
Q  408 caatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 47182131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 24688115 - 24688283
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||            
T  24688115 ttttttctaaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-------- 24688206  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24688207 ---aatatgtgtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 24688283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 42998958 - 42998791
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42998958 ttttttctagattacctttgaaaa-tggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 42998860  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  42998859 ctaaaaaggtg-----------aatgcttattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtca 42998791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2228105 - 2227995
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| |||    
T  2228105 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcac 2228006  T
Q  460 ttaaaaatgtg 470  Q
    || ||||||||    
T  2228005 ttcaaaatgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 17665694 - 17665549
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  17665694 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 17665603  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattc 516  Q
       || || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17665602 ---aatatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 17665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 37028724 - 37028885
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||            
T  37028724 ttttttttaaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatg-------- 37028815  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  37028816 ---aatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 37028885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 50732083 - 50731986
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  50732083 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50731986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 458
Target Start/End: Original strand, 50780773 - 50780870
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  50780773 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50780870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 352 - 466
Target Start/End: Original strand, 177154 - 177268
Alignment:
Q  352 aaatataattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  177154 aaatataattttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatg 177253  T
Q  452 gataccacttaaaaa 466  Q
    ||||| || ||||||    
T  177254 gatacaacctaaaaa 177268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 51224207 - 51224047
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  51224207 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 51224117  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  51224116 ---aatatgtgcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagccta 51224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8847827 - 8847718
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  8847827 tttttttaaattacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccact 8847728  T
Q  461 taaaaatgtg 470  Q
    ||||||||||    
T  8847727 taaaaatgtg 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 360 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 28576282 - 28576184
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28576282 ttttttctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 360 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 48726168 - 48726070
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||    
T  48726168 ttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacca 48726070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 454 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429229
Alignment:
Q  454 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtca 30429229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 360 - 531
Target Start/End: Original strand, 40165653 - 40165812
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  40165653 ttttttctaaattatctttgaaaaataatgg-taatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 40165751  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccct 531  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40165752 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccct 40165812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 360 - 435
Target Start/End: Original strand, 52434140 - 52434216
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataa-tttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  52434140 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 360 - 435
Target Start/End: Original strand, 48752086 - 48752161
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  48752086 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402810
Alignment:
Q  368 agattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaat 467  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T
Q  468 gtg 470  Q
    |||    
T  47402812 gtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 48534082 - 48534016
Alignment:
Q  466 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  48534082 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 48534016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 360 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 44946099 - 44946014
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatag 445  Q
    |||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  44946099 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag 44946014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 392 - 470
Target Start/End: Original strand, 41609100 - 41609178
Alignment:
Q  392 taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 470  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  | || ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41609100 taatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg 41609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 52756207 - 52756069
Alignment:
Q  394 atttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat----gtgta 489  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||    |||||    
T  52756207 atttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaattaatgtgta 52756119  T
Q  490 ttggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  52756118 ttggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 52756069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 44946010 - 44945937
Alignment:
Q  466 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  44946010 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtca 44945937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 490 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 50731965 - 50731916
Alignment:
Q  490 ttggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50731965 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 50731916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 490 - 539
Target Start/End: Original strand, 50780891 - 50780940
Alignment:
Q  490 ttggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50780891 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 50780940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 411
Target Start/End: Original strand, 37741436 - 37741487
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaat 411  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37741436 ttttttttagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 539
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688481
Alignment:
Q  489 attggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtca 40688481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 532
Target Start/End: Original strand, 37760345 - 37760378
Alignment:
Q  499 ataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37760345 ataaattacccaccattcttccataggtacccta 37760378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 539
Target Start/End: Original strand, 48752226 - 48752283
Alignment:
Q  482 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || |||| ||||||    
T  48752226 aatgtttattggttgggataaattacccacaatttttccatagatatcctagttgtca 48752283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 360 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51942586 - 51942546
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacc 400  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  51942586 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacc 51942546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 124)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Original strand, 44984763 - 44984941
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44984763 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 44984862  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44984863 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 44984941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 34276548 - 34276727
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34276548 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 34276647  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34276648 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 34276727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21366789 - 21366611
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21366789 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 21366690  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21366689 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 21366611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 6019929 - 6020108
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6019929 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6020028  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6020029 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 6020108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 9798466 - 9798645
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9798466 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 9798565  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9798566 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 9798645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 23437593 - 23437772
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23437593 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23437692  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23437693 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 23437772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 31532316 - 31532137
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31532316 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31532217  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31532216 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 31532137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 362 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 31972515 - 31972338
Alignment:
Q  362 ttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31972515 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactt 31972416  T
Q  462 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31972415 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtca 31972338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 237478 - 237650
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  237478 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacac 237577  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  237578 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 237650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 41560329 - 41560501
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41560329 ttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 41560428  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41560429 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 41560501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 32366841 - 32366662
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32366841 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 32366742  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32366741 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 32366662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 42085208 - 42085387
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42085208 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 42085307  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42085308 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtca 42085387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 42766022 - 42765844
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42766022 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccac 42765924  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42765923 ttaaaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtca 42765844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 53854610 - 53854432
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53854610 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 53854511  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  53854510 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 53854432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 360 - 549
Target Start/End: Original strand, 39077546 - 39077735
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39077546 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 39077645  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaata 549  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  39077646 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacctataaata 39077735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 360 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 41702640 - 41702459
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41702640 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 41702541  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41702540 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcatc 41702459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 22618694 - 22618516
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22618694 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatacca 22618596  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22618595 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttagg-taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 22618516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 2826862 - 2826684
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2826862 ttttttctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2826763  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2826762 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 2826684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 18462194 - 18462015
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18462194 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 18462095  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18462094 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 18462015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19387869 - 19387690
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19387869 ttttttctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccac 19387770  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19387769 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 19387690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 27373077 - 27373255
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27373077 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 27373176  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27373177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctaattgtca 27373255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 50234001 - 50234180
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50234001 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccac 50234100  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  50234101 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtca 50234180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 51363008 - 51363186
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51363008 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 51363107  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  51363108 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 51363186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 53461997 - 53461818
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53461997 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 53461898  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  53461897 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 53461818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 54575121 - 54574942
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54575121 ttttttctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccac 54575022  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54575021 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54574942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 55519828 - 55520007
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55519828 ttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccac 55519927  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  55519928 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 55520007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 360 - 541
Target Start/End: Original strand, 397403 - 397584
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  397403 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 397502  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  397503 ttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcatc 397584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 360 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 50457991 - 50457810
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50457991 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 50457892  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50457891 ttaaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcatc 50457810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 146610 - 146431
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  146610 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 146511  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  146510 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtca 146431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 3692391 - 3692212
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  3692391 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccac 3692292  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3692291 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 3692212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 26091439 - 26091260
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26091439 ttttttctaaattatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26091340  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26091339 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 26091260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 29478361 - 29478540
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29478361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 29478460  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29478461 ttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 29478540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 29777438 - 29777259
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  29777438 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccac 29777339  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29777338 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 29777259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 31914199 - 31914377
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31914199 ttttttttagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31914298  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31914299 ttaaaaatgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 31914377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 43471876 - 43471697
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43471876 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccac 43471777  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43471776 ttaaaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 43471697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 45797480 - 45797659
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45797480 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 45797579  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45797580 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtca 45797659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 47344657 - 47344836
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47344657 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47344756  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47344757 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47344836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 55056440 - 55056269
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  55056440 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaac 55056341  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccct 531  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55056340 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccct 55056269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 538
Target Start/End: Original strand, 6285308 - 6285486
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6285308 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6285407  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 538  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6285408 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 6285486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 41949383 - 41949564
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41949383 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 41949482  T
Q  460 ttaaaaatgtgct--tatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  41949483 ttaaaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtca 41949564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 49881244 - 49881061
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  49881244 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 49881145  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt----gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  49881144 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtca 49881061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 47662283 - 47662104
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  47662283 ttttttctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccac 47662184  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  47662183 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 47662104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 54086411 - 54086588
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  54086411 ttttttctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccgc 54086508  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54086509 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54086588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 55776046 - 55776224
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55776046 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccac 55776144  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||    
T  55776145 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtca 55776224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 55840224 - 55840402
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55840224 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccac 55840322  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||    
T  55840323 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtca 55840402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Original strand, 42222291 - 42222471
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  42222291 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgatacca 42222390  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  42222391 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtca 42222471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 54607963 - 54608135
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  54607963 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 54608062  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  54608063 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggatacccta 54608135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 407755 - 407932
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  407755 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cac 407853  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  407854 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 407932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 3170627 - 3170806
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  3170627 ttttttctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 3170726  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  3170727 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtca 3170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 23609088 - 23609267
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23609088 ttttttctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccac 23609187  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23609188 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtca 23609267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 42033176 - 42033355
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42033176 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 42033275  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42033276 ttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 42033355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 359 - 529
Target Start/End: Original strand, 50534631 - 50534801
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50534631 attttttttagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 50534730  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacc 529  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50534731 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacc 50534801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 360 - 537
Target Start/End: Original strand, 35446507 - 35446683
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  35446507 ttttttctagattaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcac 35446605  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 537  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35446606 ttaaaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35446683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 2243459 - 2243638
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2243459 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccac 2243558  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2243559 ttaaaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 2243638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 22468951 - 22468788
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22468951 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccac 22468852  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatg 523  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  22468851 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 31070254 - 31070076
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  31070254 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcatg-ataccac 31070156  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31070155 ttaaaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 31070076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 56023179 - 56023000
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  56023179 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccac 56023080  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  56023079 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtca 56023000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 361 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 33897675 - 33897501
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33897675 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33897576  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 535  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33897575 taaaaatatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtaccctaatt 33897501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 38591669 - 38591844
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  38591669 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccat 38591768  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38591769 t----aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 38591844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 48654815 - 48655000
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  48654815 ttttttttagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccac 48654914  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggcta------atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48654915 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtca 48655000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 39587960 - 39587796
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39587960 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 39587861  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39587860 ttaaaaatgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccatgg 39587796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 48313558 - 48313735
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48313558 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccac 48313656  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    || ||||| ||||||||| |||||| | |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48313657 tt-aaaatatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 48313735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 1932764 - 1932936
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1932764 ttttttctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccac 1932863  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||    
T  1932864 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtacccta 1932936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 14017555 - 14017378
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14017555 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 14017456  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14017455 tt--aagtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtca 14017378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 53834236 - 53834056
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53834236 attttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggatacca 53834137  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  53834136 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 53834056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 41632187 - 41632009
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  41632187 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatatcgc 41632089  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  41632088 ttaaaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtca 41632009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Original strand, 48657826 - 48657998
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |      || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48657826 tttttttagattacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 48657919  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48657920 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48657998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 54805799 - 54805623
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54805799 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccac 54805700  T
Q  460 ttaaaaatgtg----cttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  54805699 ttaaaaatgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtacccta 54805623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 360 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 50536805 - 50536628
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  50536805 ttttttttagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccac 50536706  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 537  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  50536705 ttaaaaatatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Original strand, 54424983 - 54425147
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  54424983 ttttatctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 54425082  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  54425083 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccatgg 54425147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 9998101 - 9997933
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  9998101 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatg-------- 9998010  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9998009 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 9997933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 48259691 - 48259528
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  48259691 ttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccac 48259592  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  48259591 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 48259528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 541
Target Start/End: Original strand, 51951682 - 51951863
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||    
T  51951682 attttttctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatca 51951781  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51951782 gttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgtg-taaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcatc 51951863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 402 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 52728445 - 52728309
Alignment:
Q  402 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggata 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||    
T  52728445 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgaggta 52728346  T
Q  502 aattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52728345 aattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 52728309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 415 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532832
Alignment:
Q  415 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccat 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccat 36532857  T
Q  515 tcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||    
T  36532856 tcttccatgggtatcctagttgtca 36532832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 54715036 - 54715197
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||            
T  54715036 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatg-------- 54715127  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54715128 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 54715197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 20352012 - 20351856
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||            
T  20352012 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 20351921  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20351920 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggta 20351856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 43890929 - 43891097
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||            
T  43890929 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatg-------- 43891020  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  43891021 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtca 43891097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 45633949 - 45633773
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  45633949 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 45633858  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaa 547  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||    
T  45633857 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccgataaa 45633773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 360 - 541
Target Start/End: Original strand, 54216314 - 54216484
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  54216314 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 54216405  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
       || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  54216406 ---aatatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtcatc 54216484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 54216906 - 54216745
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||            
T  54216906 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-------- 54216815  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  54216814 ---aatatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggatacccta 54216745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 15060459 - 15060291
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  15060459 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 15060368  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15060367 ---aatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 15060291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 47811907 - 47812075
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| |||        
T  47811907 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaata---- 47812002  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  47812003 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtca 47812075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 444 - 539
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595867
Alignment:
Q  444 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 35595867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 33289704 - 33289865
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||       
T  33289704 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac--- 33289800  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  33289801 --------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 33289865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 414 - 532
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509469
Alignment:
Q  414 aaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccacca 513  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  514 ttcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  42509451 ttcttccatgagtacccta 42509469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 34835178 - 34835346
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||     
T  34835178 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccat 34835277  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34835278 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 34835346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 38547771 - 38547603
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38547771 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 38547672  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  38547671 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtca 38547603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 5117608 - 5117461
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  5117608 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 5117517  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 518  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5117516 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 5117461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1662429 - 1662323
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1662429 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 1662330  T
Q  460 ttaaaaa 466  Q
     ||||||    
T  1662329 ctaaaaa 1662323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 37239260 - 37239099
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  37239260 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 37239169  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  37239168 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagccta 37239099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 360 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 27398773 - 27398607
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27398773 ttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27398674  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 537  Q
    ||||||||||            ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  27398673 ttaaaaatgt-----------aaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcattggtaccctagttgt 27398607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 360 - 537
Target Start/End: Original strand, 46720026 - 46720195
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  46720026 ttttttctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggataccac 46720125  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 537  Q
     |||||| |||  |||       |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  46720126 ctaaaaaggtg-atat-------atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 46720195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14335271 - 14335165
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  14335271 ttttttctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccac 14335172  T
Q  460 ttaaaaa 466  Q
     ||||||    
T  14335171 ctaaaaa 14335165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Original strand, 27580120 - 27580226
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27580120 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27580219  T
Q  460 ttaaaaa 466  Q
     ||||||    
T  27580220 ctaaaaa 27580226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 52688350 - 52688511
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||            
T  52688350 ttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg-------- 52688441  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  52688442 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 52688511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 34552320 - 34552488
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||            
T  34552320 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatg-------- 34552411  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  34552412 ---aatatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 34552488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 497
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  407 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa-gatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 363 - 539
Target Start/End: Original strand, 573807 - 573972
Alignment:
Q  363 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 462  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  573807 tttctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 573906  T
Q  463 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||    
T  573907 aaaaagtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtca 573972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 22620594 - 22620755
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  22620594 ttttttctaaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 22620685  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  22620686 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagccta 22620755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 31881484 - 31881323
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  31881484 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 31881393  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||| |||||||| ||||    
T  31881392 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagccta 31881323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 360 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 4486751 - 4486604
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||            
T  4486751 ttttttctaaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-------- 4486660  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 518  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4486659 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 4486604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 439 - 539
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344967
Alignment:
Q  439 aagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 538  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgg-taaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtc 35344966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 363 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 46708908 - 46708743
Alignment:
Q  363 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 462  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||               
T  46708908 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 46708820  T
Q  463 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| | || |||| ||||||    
T  46708819 aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtca 46708743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 6371419 - 6371251
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || | || ||||||    
T  6371419 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttaccac 6371320  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  6371319 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtca 6371251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 360 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27873718 - 27873571
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||            
T  27873718 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatg-------- 27873627  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 518  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27873626 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 27873571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 359 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 33558113 - 33557942
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||           
T  33558113 attttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg------- 33558021  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
        || ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  33558020 ----aatatgtatttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgaatagcctaattgtcatc 33557942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Original strand, 52461367 - 52461517
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||        
T  52461367 ttttttctaaattacctttgaa---tggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata---- 52461459  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  52461460 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 52461517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 360 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 3293193 - 3293102
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  3293193 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 468 - 539
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049061
Alignment:
Q  468 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 33049061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 387 - 539
Target Start/End: Original strand, 27872607 - 27872748
Alignment:
Q  387 gtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 486  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           |||||    
T  27872607 gtggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgt 27872695  T
Q  487 gtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  27872696 ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtca 27872748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 49014099 - 49014267
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  49014099 ttttttttaaatcacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 49014190  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  49014191 ---aatatgtacttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtca 49014267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 360 - 443
Target Start/End: Original strand, 42557583 - 42557666
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagat 443  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  42557583 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 11972299 - 11972208
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  11972299 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 360 - 458
Target Start/End: Original strand, 43231504 - 43231601
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43231504 ttttttctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 464 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259706
Alignment:
Q  464 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 48259706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 396 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 51981613 - 51981493
Alignment:
Q  396 ttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 495  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51981613 ttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtgggattaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 51981525  T
Q  496 gggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
    ||| |||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  51981524 ggggtaaattactcatcattctttcattggta 51981493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 360 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 49058038 - 49057933
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| || | | || ||||||||| |||||||     
T  49058038 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccat 49057939  T
Q  460 ttaaaa 465  Q
    ||||||    
T  49057938 ttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291807
Alignment:
Q  473 tatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtca 3291807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 527
Target Start/End: Original strand, 42558271 - 42558353
Alignment:
Q  437 tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42558271 tcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt--------ggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggta 42558353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 360 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 17555667 - 17555617
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaa 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17555667 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 370 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206583
Alignment:
Q  370 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaag----atagttcatggataccacttaaaa 465  Q
    ||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 18206583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 1662313 - 1662263
Alignment:
Q  489 attggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1662313 attggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtca 1662263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 457 - 527
Target Start/End: Original strand, 49304602 - 49304671
Alignment:
Q  457 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  49304602 cacttaaaaatgtatttatgtggctgatgtttattggtt-gaataaattacccaccaattttctatgggta 49304671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13943 - 13764
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13943 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 13844  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13843 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 13764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 32984258 - 32984079
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32984258 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 32984159  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32984158 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 32984079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 10646124 - 10646303
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10646124 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10646223  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10646224 ttaaaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 10646303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 43328708 - 43328887
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43328708 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43328807  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328808 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 43328887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 24080082 - 24079903
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24080082 ttttttgtagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24079983  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24079982 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 24079903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 41862221 - 41862400
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41862221 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 41862320  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41862321 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtca 41862400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 6365987 - 6366166
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6365987 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccac 6366086  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  6366087 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtca 6366166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 40435334 - 40435155
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40435334 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccac 40435235  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40435234 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 40435155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 360 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 31831136 - 31830959
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31831136 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31831037  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31831036 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 5946048 - 5946227
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5946048 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 5946147  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  5946148 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtca 5946227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 9303755 - 9303576
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9303755 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 9303656  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9303655 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 9303576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33730822 - 33730643
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33730822 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33730723  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33730722 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 33730643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 37956422 - 37956601
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37956422 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 37956521  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  37956522 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtca 37956601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 360 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 44088624 - 44088446
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44088624 ttttttctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 44088525  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 538  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44088524 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctaattgtc 44088446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 359 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 17718904 - 17718731
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17718904 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggatacca 17718805  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718804 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 17718731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 362 - 539
Target Start/End: Original strand, 25185902 - 25186079
Alignment:
Q  362 ttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactt 461  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25185902 ttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccactt 25186001  T
Q  462 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25186002 aaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctaatcgtca 25186079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Original strand, 2714550 - 2714714
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2714550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 2714649  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2714650 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg 2714714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 9734256 - 9734433
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  9734256 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cac 9734354  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9734355 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 9734433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33981844 - 33981665
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33981844 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33981745  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33981744 ttaaaaatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 33981665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 37301506 - 37301327
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  37301506 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccac 37301407  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37301406 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 37301327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 41653896 - 41654075
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  41653896 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccac 41653995  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41653996 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 41654075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 9013685 - 9013863
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9013685 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 9013784  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9013785 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagg-taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 9013863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 364 - 539
Target Start/End: Original strand, 32114254 - 32114429
Alignment:
Q  364 ttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaa 463  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32114254 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaa 32114353  T
Q  464 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32114354 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 37419941 - 37420120
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  37419941 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactac 37420040  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37420041 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 37420120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 45066773 - 45066598
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45066773 ttttttatagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 45066674  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45066673 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccatgggtaccctaatt 45066598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 45236746 - 45236567
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45236746 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 45236647  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  45236646 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtca 45236567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 360 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 13760829 - 13760663
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13760829 ttttttcaagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccat 13760730  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggt 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13760729 ttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggt 13760663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 360 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 29048584 - 29048426
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29048584 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccac 29048485  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29048484 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13356301 - 13356122
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13356301 ttttttttagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 13356202  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13356201 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtca 13356122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 41231947 - 41232126
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41231947 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 41232046  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  41232047 ttaaaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtca 41232126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 527
Target Start/End: Original strand, 2275914 - 2276080
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2275914 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2276013  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2276014 tt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggta 2276080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 35628778 - 35628957
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  35628778 ttttttttagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccac 35628877  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  35628878 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtca 35628957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 25248040 - 25248213
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25248040 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25248133  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25248134 tttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtca 25248213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 22878392 - 22878571
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22878392 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccac 22878491  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22878492 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtca 22878571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 41639915 - 41640094
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  41639915 ttttttttagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgc 41640014  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  41640015 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtca 41640094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 415 - 539
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033110
Alignment:
Q  415 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccat 514  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  515 tcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtca 12033110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Original strand, 45258511 - 45258675
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  45258511 ttttttttagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccat 45258610  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45258611 ttaaaaatgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 45258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 360 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 42701471 - 42701301
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42701471 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccac 42701372  T
Q  460 tta---aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacc 529  Q
    |||   ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42701371 ttaaaaaaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggtacc 42701301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 408 - 532
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904249
Alignment:
Q  408 caatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattac 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  508 ccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtacccta 3904249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 425 - 539
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981648
Alignment:
Q  425 ttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  525 gtaccctaattgtca 539  Q
     ||||||| ||||||    
T  41981634 ataccctagttgtca 41981648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4447465 - 4447297
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||            
T  4447465 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-------- 4447374  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4447373 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 4447297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 10378310 - 10378478
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||            
T  10378310 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-------- 10378401  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10378402 ---aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 10378478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 527
Target Start/End: Original strand, 41843254 - 41843410
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||            
T  41843254 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatg-------- 41843345  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41843346 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 41843410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 428 - 539
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336274
Alignment:
Q  428 ttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  528 ccctaattgtca 539  Q
    ||||| ||||||    
T  31336263 ccctagttgtca 31336274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 31940316 - 31940476
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  31940316 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 31940407  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  31940408 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgggtagccta 31940476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 3211207 - 3211374
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||            
T  3211207 ttttttctaaattacctttgaaaa-tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg-------- 3211297  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3211298 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtca 3211374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 9713690 - 9713848
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  9713690 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacc---caaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 9713778  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  9713779 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 9713848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 117500 - 117331
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  117500 attttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 117408  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  117407 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtca 117331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Original strand, 38631653 - 38631806
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||            
T  38631653 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg-------- 38631744  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
       || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38631745 ---aatatatgcttatgtggttaatatgtattggttgggataaattatccaccattcttcaatgg 38631806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 39915993 - 39915887
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39915993 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 39915894  T
Q  460 ttaaaaa 466  Q
    |||||||    
T  39915893 ttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 40458942 - 40458781
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  40458942 ttttttctcaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 40458851  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  40458850 ---aatatgtgtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagccta 40458781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 2379141 - 2379309
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||            
T  2379141 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg-------- 2379232  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  2379233 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtca 2379309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 364 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 32373892 - 32373744
Alignment:
Q  364 ttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaa 463  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||           |    
T  32373892 ttctaaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------a 32373804  T
Q  464 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32373803 atatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatgg 32373744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 3490569 - 3490401
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  3490569 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttaccac 3490470  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  3490469 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtca 3490401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 4975576 - 4975416
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||             
T  4975576 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 4975486  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
      || |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4975485 --aatatgtgcttatatggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagccta 4975416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33897012 - 33896845
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  33897012 ttttttctagattacctttgaaaa-tggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccac 33896914  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     ||||||  ||           ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  33896913 ctaaaaagatg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtca 33896845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 383 - 461
Target Start/End: Original strand, 41981457 - 41981535
Alignment:
Q  383 aatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactt 461  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41981457 aatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 360 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31149060 - 31148953
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||    
T  31149060 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccac 31148962  T
Q  460 ttaaaaatg 468  Q
    |||||||||    
T  31148961 ttaaaaatg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 360 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27243309 - 27243218
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  27243309 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 360 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27254884 - 27254793
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  27254884 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 371 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649840
Alignment:
Q  371 ttacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 470  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||           ||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaata-----------tgtg 40649902  T
Q  471 cttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  40649901 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagccta 40649840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 360 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 26196486 - 26196335
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  26196486 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccac 26196388  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatg 523  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26196387 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatg 26196335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 9509570 - 9509409
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||            
T  9509570 ttttttctaaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg-------- 9509479  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  9509478 ---aatatgtgtttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 9509409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 33622635 - 33622483
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||| ||||||||||            
T  33622635 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttatggg-tcaaaatagttcatg-------- 33622545  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
       || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  33622544 ---aatatgtggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcatgg 33622483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 41425503 - 41425438
Alignment:
Q  466 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||  ||||||| ||||    
T  41425503 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattatccataattcttttatgggtagccta 41425438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 428
Target Start/End: Original strand, 164728 - 164791
Alignment:
Q  365 tctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgt 428  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  164728 tctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttgt 164791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 539
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901737
Alignment:
Q  476 gtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtca 39901737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 2179082 - 2179045
Alignment:
Q  383 aatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgag 420  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2179082 aatggtggataacttagctaccaaccaatgaaaatgag 2179045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 5882507 - 5882686
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5882507 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 5882606  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5882607 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 5882686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 22551242 - 22551063
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22551242 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 22551143  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22551142 ctaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 22551063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 24168092 - 24168271
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24168092 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24168191  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24168192 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 24168271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 360 - 541
Target Start/End: Original strand, 2892189 - 2892370
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2892189 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2892288  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2892289 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtcatc 2892370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 360 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 14891560 - 14891383
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14891560 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 14891461  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14891460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 2594033 - 2593854
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2594033 ttttttctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2593934  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2593933 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtca 2593854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 26377385 - 26377206
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26377385 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26377286  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26377285 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 26377206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 34528043 - 34527864
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34528043 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccac 34527944  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34527943 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 34527864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 7345293 - 7345106
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7345293 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 7345194  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaa 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  7345193 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtctaccttagttgtcatcgataaa 7345106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 7393767 - 7393588
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7393767 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 7393668  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7393667 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtca 7393588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 8615241 - 8615420
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8615241 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 8615340  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8615341 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtca 8615420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 362 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 18101674 - 18101497
Alignment:
Q  362 ttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactt 461  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18101674 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactt 18101575  T
Q  462 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18101574 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtca 18101497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 359 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 30743630 - 30743454
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30743630 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggatacca 30743531  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30743530 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaatt 30743454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 599893 - 600072
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  599893 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 599992  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  599993 ttaaaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 600072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 960085 - 959906
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  960085 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccac 959986  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  959985 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 959906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 372 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988976
Alignment:
Q  372 tacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgc 471  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  472 ttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 11988976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 535
Target Start/End: Original strand, 16703367 - 16703542
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16703367 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 16703466  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 535  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  16703467 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatcctaatt 16703542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19415714 - 19415535
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19415714 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccac 19415615  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19415614 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 19415535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 28947088 - 28947267
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  28947088 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccac 28947187  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28947188 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 28947267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 5294983 - 5294803
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294983 attttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 5294884  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5294883 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtca 5294803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 5299535 - 5299355
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299535 attttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 5299436  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5299435 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtca 5299355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 528
Target Start/End: Original strand, 1970712 - 1970880
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  1970712 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 1970811  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtac 528  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1970812 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtac 1970880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 10508089 - 10507910
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10508089 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10507990  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  10507989 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtca 10507910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 372 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341790
Alignment:
Q  372 tacctttgaaaaatggtggataatttacctacca--accaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 469  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  470 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtca 22341790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19281236 - 19281057
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  19281236 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 19281137  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  19281136 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtca 19281057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33452753 - 33452574
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33452753 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccac 33452654  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33452653 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtca 33452574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 24224252 - 24224072
Alignment:
Q  360 ttttttctagatt-acctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24224252 ttttttctagatttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacca 24224153  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  24224152 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtca 24224072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 360 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 30467784 - 30467656
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30467784 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 30467685  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgt 488  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30467684 ttaaacatgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 392 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 23262078 - 23261931
Alignment:
Q  392 taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt 491  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  23262078 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtatt 23261979  T
Q  492 ggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  23261978 ggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtca 23261931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 7167583 - 7167751
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7167583 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccac 7167682  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7167683 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 7167751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 28949015 - 28948847
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||            
T  28949015 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-------- 28948924  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28948923 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 28948847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 13329382 - 13329543
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||              
T  13329382 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---------- 13329471  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  13329472 -taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 13329543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 15965434 - 15965602
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||            
T  15965434 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatg-------- 15965525  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15965526 ---aatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 15965602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 1398554 - 1398722
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||            
T  1398554 ttttttctaaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatg-------- 1398645  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  1398646 ---aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtca 1398722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 360 - 549
Target Start/End: Original strand, 3786750 - 3786928
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||| |||| ||||||||||            
T  3786750 ttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatg-------- 3786841  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaata 549  Q
       || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||| || | |||||||    
T  3786842 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccaataaata 3786928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 441
Target Start/End: Original strand, 929660 - 929741
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaag 441  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  929660 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 3291009 - 3291177
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||              
T  3291009 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---------- 3291098  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  3291099 -taaatatgtgcttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtca 3291177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 4487528 - 4487689
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || ||| ||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  4487528 ttttttttaaatttcctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 4487619  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4487620 ---aatatgtactcatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 4487689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27420377 - 27420271
Alignment:
Q  138 gaaaaggaattcctgaaaatgattagtttgtatgttgttgaaatttacatgtttggatggatattaaagctaaatcaagacaatttaggattgatttctc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  27420377 gaaaaggaattcctgaaaatgatttgtttgtatgtggttcaaatttacatgttt----ggatataaaagcttaatcaagacaatctgggattcatttctc 27420282  T
Q  238 tttccattcct 248  Q
    |||||||||||    
T  27420281 tttccattcct 27420271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 375894 - 375729
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||      
T  375894 ttttttttagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacc-- 375797  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     ||||||  ||           ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  375796 -taaaaagatg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccttaattgtca 375729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 365 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1939669 - 1939579
Alignment:
Q  365 tctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggata 455  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  1939669 tctaaattatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 466 - 539
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661903
Alignment:
Q  466 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 18661903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27420493 - 27420382
Alignment:
Q  1 attctgaaacctttttatgtttggatgttatatattctggcccacttgaaagtttgttatgtatctgagtttaccaattgaacattctatagacaaaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| ||||| ||||| ||||  |||||    
T  27420493 attctgaaacctttttatgtttggat-ttatatattatggccgattggaaggtttgttatatatctga-atgaccatttgaaaattctttagaagaaaat 27420396  T
Q  101 atgagttccacttc 114  Q
    |||||||| |||||    
T  27420395 atgagttcaacttc 27420382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 539
Target Start/End: Original strand, 34262342 - 34262399
Alignment:
Q  482 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34262342 aatgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 34262399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913114
Alignment:
Q  466 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatg 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatg 24913114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 466
Target Start/End: Original strand, 13844847 - 13844943
Alignment:
Q  370 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||| |||||| ||| |||  |||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  13844847 attacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcataaataccacctaaaaa 13844943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27368327 - 27368259
Alignment:
Q  293 acgaggttttaggtgaggttaatgctt-----tggcatgatacacaatcattttgtcgagtaataaata 356  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27368327 acgaggtttacggtgaggttaatgcttagttttggcatgatacacaatcattttgtcgagtaatcaata 27368259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27458674 - 27458606
Alignment:
Q  293 acgaggttttaggtgaggttaatgctt-----tggcatgatacacaatcattttgtcgagtaataaata 356  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27458674 acgaggtttacggtgaggttaatgcttagttttggcatgatacacaatcattttgtcgagtaatcaata 27458606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 24253383 - 24253562
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24253383 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24253482  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24253483 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 24253562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 35626039 - 35626218
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35626039 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 35626138  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35626139 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtca 35626218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 43326560 - 43326388
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43326560 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43326461  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43326460 ttaaaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 43326388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 7722050 - 7722229
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7722050 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 7722149  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7722150 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 7722229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 15398663 - 15398484
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15398663 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15398564  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15398563 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtca 15398484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 360 - 541
Target Start/End: Original strand, 6901800 - 6901981
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6901800 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 6901899  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6901900 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcatc 6901981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 739885 - 739706
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  739885 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 739786  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  739785 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 739706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 12648798 - 12648977
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12648798 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 12648897  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12648898 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 12648977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 43262364 - 43262185
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43262364 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43262265  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43262264 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 43262185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 370 - 539
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939077
Alignment:
Q  370 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 469  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  470 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 31939077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 18479849 - 18479677
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18479849 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 18479750  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18479749 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggatacccta 18479677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 40886208 - 40886037
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40886208 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 40886109  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40886108 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 40886037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 3466862 - 3466683
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3466862 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 3466763  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  3466762 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtca 3466683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 5184973 - 5185152
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5184973 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 5185072  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5185073 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtca 5185152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 27501236 - 27501057
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27501236 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27501137  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27501136 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 27501057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 39932580 - 39932759
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39932580 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 39932679  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39932680 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtca 39932759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 27938898 - 27939078
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27938898 ttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27938997  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatggg-taccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27938998 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtca 27939078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 2484473 - 2484294
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  2484473 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactac 2484374  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2484373 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 2484294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 15683792 - 15683971
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15683792 ttttttctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15683891  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  15683892 ttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtca 15683971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 25831522 - 25831700
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  25831522 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaa 25831620  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  25831621 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtca 25831700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 27278658 - 27278475
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatag----ttcatggata 455  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  27278658 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggata 27278559  T
Q  456 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27278558 ccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 27278475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 890907 - 891085
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  890907 ttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccac 891006  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  891007 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtca 891085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 396 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789297
Alignment:
Q  396 ttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 495  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  496 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 29789297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13504922 - 13504744
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13504922 tttttctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 13504823  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13504822 taaaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtca 13504744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 367 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756489
Alignment:
Q  367 tagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  467 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt-ccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtca 38756489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 40279029 - 40278860
Alignment:
Q  370 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 469  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40279029 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgt 40278930  T
Q  470 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  40278929 gcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtca 40278860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 28424974 - 28424797
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28424974 ttttttctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 28424877  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  28424876 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtca 28424797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 5137716 - 5137895
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5137716 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 5137815  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  5137816 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccattaataccctagttgtca 5137895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 360 - 540
Target Start/End: Original strand, 40110235 - 40110414
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40110235 ttttttctatattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatagataccac 40110333  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcat 540  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40110334 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatgagtatcctaattgtcat 40110414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 402 - 539
Target Start/End: Original strand, 34451293 - 34451430
Alignment:
Q  402 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggata 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  34451293 accaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggta 34451392  T
Q  502 aattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34451393 aattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 34451430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 33617586 - 33617754
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||            
T  33617586 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-------- 33617677  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33617678 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtca 33617754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 360 - 503
Target Start/End: Original strand, 40632500 - 40632634
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  40632500 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc-- 40632597  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaa 503  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40632598 -------ggtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 360 - 522
Target Start/End: Original strand, 4149695 - 4149847
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||||    
T  4149695 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggg---------gtt-atggataccac 4149784  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4149785 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 763724 - 763903
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||    
T  763724 ttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcac 763823  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||| ||| ||||||    
T  763824 ttaaaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtca 763903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 19295731 - 19295899
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||         
T  19295731 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtat----- 19295825  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  19295826 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 19295899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 31294170 - 31293991
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||  | |||| |||| |||||||    
T  31294170 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccac 31294071  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||| |||  | |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31294070 ttaaaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtca 31293991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 9424762 - 9424594
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  9424762 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 9424671  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  9424670 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 9424594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 38015684 - 38015523
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  38015684 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 38015593  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  38015592 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 38015523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 42658832 - 42658667
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  42658832 ttttttcaaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 42658741  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattg 536  Q
       || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  42658740 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattg 42658667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 2585463 - 2585631
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  2585463 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccat 2585562  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     ||||||  ||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2585563 ctaaaaagttg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtca 2585631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 5497274 - 5497442
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| |||        
T  5497274 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata---- 5497369  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  5497370 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 5497442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 27503380 - 27503548
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  27503380 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 27503471  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  27503472 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtca 27503548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 9374672 - 9374511
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||            
T  9374672 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-------- 9374581  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  9374580 ---aatatgtgtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 9374511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 12558199 - 12558090
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  12558199 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccac 12558101  T
Q  460 ttaaaaatgtg 470  Q
    |||||||||||    
T  12558100 ttaaaaatgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 23195418 - 23195250
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  23195418 ttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 23195327  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23195326 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtca 23195250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 364 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33624105 - 33623941
Alignment:
Q  364 ttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaa 463  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| |             
T  33624105 ttctaaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggt--------- 33624015  T
Q  464 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  33624014 --atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtca 33623941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 360 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 18327343 - 18327185
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  18327343 ttttttctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 18327244  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacc 529  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18327243 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacc 18327185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 1402675 - 1402514
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1402675 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 1402576  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
      ||||| |||           ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1402575 ccaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 1402514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 6973064 - 6973225
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  6973064 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 6973155  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  6973156 ---aatatgtgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 6973225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 367 - 539
Target Start/End: Original strand, 27390605 - 27390766
Alignment:
Q  367 tagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27390605 tagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27390704  T
Q  467 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||           |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27390705 ggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 27390766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 13957671 - 13957839
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  13957671 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 13957762  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13957763 ---aatatgcgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 13957839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 36365615 - 36365462
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  36365615 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 36365524  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  36365523 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatgg 36365462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 36472454 - 36472348
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  36472454 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 36472355  T
Q  460 ttaaaaa 466  Q
    || ||||    
T  36472354 tttaaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 14971979 - 14972147
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||            
T  14971979 ttttttttaaattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-------- 14972070  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14972071 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 14972147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 24167954 - 24167786
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | ||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24167954 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 24167855  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24167854 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtca 24167786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 38638080 - 38637912
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  38638080 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaa 38637981  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38637980 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtca 38637912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 36948633 - 36948499
Alignment:
Q  385 tggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 484  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  36948633 tggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggata-----------tgtgcttatgtggctaat 36948546  T
Q  485 gtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36948545 gtgtattggtaggg-taaattacccaccattcttgcatgagtacccta 36948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 40686900 - 40687067
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||     
T  40686900 ttttttctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccat 40686999  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40687000 ctaaaaa-gtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtca 40687067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 386 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656577
Alignment:
Q  386 ggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 485  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatg 3656624  T
Q  486 tgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  3656623 tgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 3656577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 360 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 42247952 - 42247865
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtt 447  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  42247952 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 42247865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 467
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120132
Alignment:
Q  370 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaat 467  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaat 5120132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 518
Target Start/End: Original strand, 6206885 - 6207032
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || ||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||| |||| |||||||||| |||        
T  6206885 ttttttttaaattacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatgaata---- 6206980  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 518  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6206981 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 393 - 524
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492767
Alignment:
Q  393 aatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattg 492  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           |||||||||||| |||||||||||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  493 gttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  38492736 gttggggtaaattacccatcattctttcatgg 38492767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 359 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9527191 - 9527124
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaattt 426  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9527191 attttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9171193 - 9171111
Alignment:
Q  362 ttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagata 444  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  9171193 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 9171111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612759
Alignment:
Q  385 tggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 484  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||             ||||||||||||||||    
T  612900 tggtgggtaatttaaccaccaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgata-------------tgcttatgtggctaat 612815  T
Q  485 gtgtattggttggga-taaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  612814 gtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtca 612759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 3940480 - 3940411
Alignment:
Q  381 aaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 450  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||    
T  3940480 aaaatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 20207156 - 20207088
Alignment:
Q  390 gataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  20207156 gataatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggatacca 20207088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 419
Target Start/End: Original strand, 28756082 - 28756138
Alignment:
Q  363 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatga 419  Q
    ||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28756082 tttctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 3940399 - 3940338
Alignment:
Q  478 ggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| | |||| || ||||||    
T  3940399 ggctaatgtgtattggttcgaataaattactcatcattcttccatagataccttagttgtca 3940338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 370 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300977
Alignment:
Q  370 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaattt 426  Q
    |||||||||||| |||| | | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaattt 15300977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 82)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 17600836 - 17601015
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17600836 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 17600935  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17600936 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 17601015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 45370990 - 45371169
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45370990 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccac 45371089  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45371090 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 45371169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 746466 - 746645
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  746466 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 746565  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  746566 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 746645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 2325070 - 2324891
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2325070 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2324971  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  2324970 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtca 2324891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 34518367 - 34518546
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518367 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 34518466  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  34518467 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtca 34518546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Original strand, 23901780 - 23901958
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23901780 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 23901879  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23901880 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 23901958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 4034592 - 4034771
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4034592 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 4034691  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4034692 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 4034771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 6594639 - 6594460
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6594639 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 6594540  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6594539 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 6594460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 38997101 - 38997280
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38997101 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 38997200  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38997201 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 38997280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 6430473 - 6430645
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6430473 ttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 6430572  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430573 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 6430645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 11184972 - 11185151
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11184972 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 11185071  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185072 ttaaaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 11185151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13815399 - 13815220
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13815399 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 13815300  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13815299 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtca 13815220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 14660446 - 14660625
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14660446 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 14660545  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14660546 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 14660625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 26710345 - 26710524
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26710345 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26710444  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26710445 ttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 26710524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 27651215 - 27651036
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27651215 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27651116  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27651115 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 27651036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 40635218 - 40635397
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40635218 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 40635317  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40635318 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 40635397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 538
Target Start/End: Original strand, 10424595 - 10424773
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10424595 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10424694  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10424695 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 1092132 - 1091953
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1092132 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 1092033  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1092032 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 1091953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 10244763 - 10244584
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10244763 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10244664  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10244663 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 10244584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 27400403 - 27400582
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27400403 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27400502  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27400503 ttaaaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 27400582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 37255513 - 37255339
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255513 ttttttctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 37255419  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37255418 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 37255339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 354 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 2914325 - 2914140
Alignment:
Q  354 atataattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgga 453  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2914325 atatgattttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatgga 2914226  T
Q  454 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  2914225 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtca 2914140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 363 - 539
Target Start/End: Original strand, 11159625 - 11159800
Alignment:
Q  363 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 462  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11159625 tttcttgattacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccactta 11159723  T
Q  463 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11159724 aaaatgtgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 11159800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 33427828 - 33427656
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33427828 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 33427729  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33427728 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtacccta 33427656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 5726129 - 5726308
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5726129 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccac 5726228  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5726229 ttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 5726308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 14697718 - 14697539
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14697718 ttttttttagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccac 14697619  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14697618 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 14697539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 32327361 - 32327540
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32327361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 32327460  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32327461 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtca 32327540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 374 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856438
Alignment:
Q  374 cctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 473  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  474 atgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 32856438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 37621051 - 37620869
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggat---caagatagttcatggatac 456  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  37621051 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggatac 37620952  T
Q  457 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37620951 cacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 37620869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 4609626 - 4609805
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4609626 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 4609725  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4609726 ttaaaaatgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtca 4609805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 7892869 - 7892690
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7892869 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccac 7892770  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  7892769 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtca 7892690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 27024415 - 27024594
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27024415 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 27024514  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27024515 ttaaaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtca 27024594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 40735464 - 40735643
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40735464 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 40735563  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40735564 ttaaaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtca 40735643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 32948446 - 32948624
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32948446 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccac 32948544  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  32948545 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtca 32948624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 360 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8433097 - 8432942
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8433097 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccac 8432998  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccatt 515  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8432997 tttaaaatatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 360 - 515
Target Start/End: Original strand, 32608380 - 32608535
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  32608380 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccac 32608479  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccatt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32608480 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 32608535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 40037143 - 40037321
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40037143 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 40037242  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40037243 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtca 40037321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 9444683 - 9444872
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttaccta-------ccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgg 452  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9444683 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatgg 9444782  T
Q  453 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccacc---attcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9444783 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtca 9444872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 360 - 541
Target Start/End: Original strand, 15925080 - 15925261
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15925080 ttttttctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 15925179  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||| || |||||    
T  15925180 ttaaaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagttatcatc 15925261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Original strand, 12842102 - 12842277
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  12842102 attttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggatacca 12842201  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     ||| ||||||||||||||||    
T  12842202 attaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat-----cataggtaccctaattgtca 12842277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295013
Alignment:
Q  411 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  511 ccattcttccatgggtaccctaattgtc 538  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtc 25295013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 39103047 - 39103215
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||        
T  39103047 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata---- 39103142  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39103143 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 39103215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 360 - 484
Target Start/End: Original strand, 42899915 - 42900039
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42899915 ttttttctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 42900014  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaat 484  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  42900015 ttaaaaatgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 408 - 526
Target Start/End: Original strand, 1229675 - 1229793
Alignment:
Q  408 caatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattac 507  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1229675 caatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattac 1229774  T
Q  508 ccaccattcttccatgggt 526  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1229775 ccaccattcttccatgggt 1229793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 437 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 447737 - 447635
Alignment:
Q  437 tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattg 536  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  447737 tcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctagttg 447638  T
Q  537 tca 539  Q
    |||    
T  447637 tca 447635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 145282 - 145450
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||       
T  145282 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac--- 145378  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  145379 --------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21735070 - 21734902
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||            
T  21735070 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatg-------- 21734979  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21734978 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 21734902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 35158221 - 35158052
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  35158221 attttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 35158129  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
        || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35158128 ----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 35158052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 507
Target Start/End: Original strand, 41172459 - 41172605
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||  | |||||||    
T  41172459 tttttttaaattacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccact 41172558  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattac 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41172559 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 43899140 - 43898980
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||            
T  43899140 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-------- 43899049  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  43899048 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgggtagccta 43898980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 4258490 - 4258657
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  4258490 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg-tcaagatagttcatg-------- 4258580  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||    
T  4258581 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtca 4258657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 531
Target Start/End: Original strand, 44481828 - 44481988
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44481828 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 44481927  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccct 531  Q
     |||||| |||           || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44481928 ctaaaaaggtg-----------aaagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccct 44481988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Original strand, 27331297 - 27331470
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |         
T  27331297 attttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaa----- 27331391  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
      || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27331392 --tatatatgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtca 27331470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 35126780 - 35126941
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35126780 ttttttctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 35126879  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  35126880 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatagatacccta 35126941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 28641462 - 28641294
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  28641462 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 28641371  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28641370 ---aatatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtca 28641294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 29687041 - 29687209
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  29687041 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 29687132  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  29687133 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 29687209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 370 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13543784 - 13543626
Alignment:
Q  370 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 469  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  13543784 attacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 13543696  T
Q  470 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13543695 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 13543626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 12333665 - 12333513
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||         
T  12333665 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat----- 12333571  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  12333570 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgg 12333513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 19428597 - 19428435
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacc-tttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||       
T  19428597 ttttttctaaattaccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatgaata--- 19428501  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  19428500 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 19428435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 39301367 - 39301199
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  39301367 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 39301276  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || |||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  39301275 ---aatatgtgcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtca 39301199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 360 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 28566868 - 28566698
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||            
T  28566868 ttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatg-------- 28566777  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  28566776 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccatc 28566698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 439 - 521
Target Start/End: Original strand, 12827142 - 12827223
Alignment:
Q  439 aagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttcca 521  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12827142 aagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttcca 12827223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 27765032 - 27764872
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||            
T  27765032 ttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-------- 27764941  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||| ||||    
T  27764940 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaaccatca-tctttcatgggtagccta 27764872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 34249265 - 34249433
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||            
T  34249265 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-------- 34249356  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  34249357 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 34249433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  431 gtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaa 503  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 360 - 435
Target Start/End: Original strand, 12814614 - 12814689
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 435  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814614 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 12814689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 360 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 40544246 - 40544155
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  40544246 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 392 - 532
Target Start/End: Original strand, 3711665 - 3711794
Alignment:
Q  392 taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt 491  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           |||||||||| ||||||||||||||    
T  3711665 taatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggctaatgtgtatt 3711753  T
Q  492 ggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  3711754 ggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 3711794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Original strand, 12730061 - 12730214
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||              
T  12730061 ttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 12730150  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  12730151 -taaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgg 12730214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 360 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2000507 - 2000417
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 450  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  2000507 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcat 2000417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 2688899 - 2688731
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |  ||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| |||        
T  2688899 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata---- 2688804  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  2688803 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtca 2688731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 359 - 451
Target Start/End: Original strand, 3266295 - 3266387
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  3266295 attttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 456
Target Start/End: Original strand, 30545821 - 30545917
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatac 456  Q
    |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30545821 ttttttttagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatac 30545917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 43356099 - 43356264
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  43356099 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 43356187  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||  |||||| ||||| || |||| ||||||    
T  43356188 ---aatatgtgcttatgtggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtca 43356264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Original strand, 8056626 - 8056779
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || ||||  | |||||||||||||            
T  8056626 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg-------- 8056717  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
       || ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||    
T  8056718 ---aatatgcgcttatgtagctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgg 8056779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 38985415 - 38985342
Alignment:
Q  392 taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 466  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38985415 taatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatatg-tcaagatagttcatggataccacctaaaaa 38985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 486 - 529
Target Start/End: Original strand, 42900781 - 42900824
Alignment:
Q  486 tgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacc 529  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42900781 tgtattggttgagataaattacccaccattcttccatgtgtacc 42900824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 483 - 539
Target Start/End: Original strand, 3266399 - 3266455
Alignment:
Q  483 atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3266399 atgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28020002 - 28019962
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacc 400  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28020002 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacc 28019962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 360 - 398
Target Start/End: Original strand, 1897130 - 1897168
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataattta 398  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1897130 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataattta 1897168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 360 - 426
Target Start/End: Original strand, 10176559 - 10176625
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaattt 426  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||   |||||  ||||||||||||||||||    
T  10176559 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 17799345 - 17799296
Alignment:
Q  442 atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt 491  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  17799345 atagttcatgaataccacttaaaaatatgaatatgtggctaatgtttatt 17799296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 110)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 361 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 4068863 - 4068692
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4068863 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 4068764  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4068763 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 4068692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 31308002 - 31308181
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31308002 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31308101  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31308102 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 31308181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 45538154 - 45538333
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45538154 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 45538253  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45538254 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 45538333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 3611137 - 3611316
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3611137 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 3611236  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3611237 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 3611316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 25058689 - 25058868
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25058689 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccac 25058788  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25058789 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 25058868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 25678440 - 25678261
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25678440 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25678341  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25678340 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtca 25678261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 44661971 - 44662150
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44661971 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 44662070  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44662071 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 44662150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 354 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21139599 - 21139414
Alignment:
Q  354 atataattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgga 453  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21139599 atatagttttttctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 21139500  T
Q  454 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21139499 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 21139414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 17995132 - 17994960
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17995132 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccac 17995033  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17995032 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 17994960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 361 - 541
Target Start/End: Original strand, 43251713 - 43251893
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43251713 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccact 43251812  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43251813 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcatc 43251893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 26277178 - 26277357
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26277178 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26277277  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26277278 ttaaaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 26277357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 38790378 - 38790199
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38790378 ttttttctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 38790279  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38790278 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 38790199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 47671587 - 47671766
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47671587 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccac 47671686  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47671687 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 47671766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 5981171 - 5981350
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5981171 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 5981270  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5981271 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 5981350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 26085578 - 26085400
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26085578 tttttactagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 26085480  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26085479 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 26085400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 24245206 - 24245034
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24245206 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24245107  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24245106 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtacccta 24245034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 41999816 - 41999988
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41999816 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccac 41999915  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41999916 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 41999988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 3285403 - 3285581
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3285403 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 3285502  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285503 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 3285581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 6327728 - 6327550
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6327728 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 6327629  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6327628 ttaaaaatgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtca 6327550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 23984756 - 23984935
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23984756 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23984855  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23984856 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 23984935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 31040710 - 31040889
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31040710 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31040809  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31040810 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtca 31040889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 33884089 - 33884268
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  33884089 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccat 33884188  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33884189 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtca 33884268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33960163 - 33959984
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  33960163 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccat 33960064  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33960063 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtca 33959984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 360 - 537
Target Start/End: Original strand, 26794305 - 26794482
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26794305 ttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 26794404  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 537  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26794405 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 23932690 - 23932511
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23932690 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccac 23932591  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23932590 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 23932511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33112998 - 33112820
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33112998 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33112899  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  33112898 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtca 33112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 37620373 - 37620194
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37620373 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 37620274  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37620273 ttaaaaatgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtca 37620194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 38332040 - 38331861
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  38332040 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 38331941  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  38331940 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtca 38331861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 39646569 - 39646748
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39646569 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccac 39646668  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39646669 ttaaaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 39646748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 46967222 - 46967043
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46967222 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46967123  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46967122 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtca 46967043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 47383913 - 47383734
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47383913 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47383814  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  47383813 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtca 47383734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 49254156 - 49253981
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  49254156 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 49254057  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 535  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49254056 ttaaaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaatt 49253981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 50774218 - 50774397
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50774218 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 50774317  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  50774318 ttaaaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtca 50774397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 538
Target Start/End: Original strand, 28888582 - 28888760
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888582 ttttttctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 28888681  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 538  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28888682 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 35273597 - 35273776
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35273597 ttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35273696  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35273697 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtca 35273776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 36566331 - 36566510
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36566331 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 36566430  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36566431 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 36566510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 361 - 528
Target Start/End: Original strand, 42863867 - 42864034
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42863867 tttttctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactact 42863966  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42863967 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtac 42864034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 360 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 23221110 - 23220939
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23221110 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23221011  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23221010 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg------tatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 23220939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 360 - 513
Target Start/End: Original strand, 31844377 - 31844530
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31844377 ttttttctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccac 31844476  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccacca 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31844477 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 5980069 - 5980241
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5980069 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccac 5980168  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5980169 ttaaaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtacccta 5980241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 24885502 - 24885681
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24885502 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24885601  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  24885602 ttaaaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtca 24885681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 26525070 - 26524891
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26525070 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccac 26524971  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26524970 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtca 26524891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 46784424 - 46784603
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||    
T  46784424 ttttttctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccac 46784523  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46784524 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtca 46784603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 51057072 - 51057251
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  51057072 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccac 51057171  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51057172 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 51057251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 35692845 - 35692665
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataattta-cctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  35692845 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccg 35692746  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  35692745 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtca 35692665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 360 - 528
Target Start/End: Original strand, 46616550 - 46616718
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  46616550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 46616649  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtac 528  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46616650 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtac 46616718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 47317316 - 47317495
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47317316 ttttttttatattacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 47317415  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  47317416 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtca 47317495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 360 - 497
Target Start/End: Original strand, 25518815 - 25518952
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25518815 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25518914  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 497  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518915 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 36003131 - 36003313
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36003131 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccac 36003230  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttc---catgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||    
T  36003231 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtca 36003313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 47187106 - 47187285
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47187106 ttttttctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 47187205  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  47187206 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtca 47187285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 49399169 - 49398990
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  49399169 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccac 49399070  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  49399069 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtca 49398990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 42313546 - 42313363
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggata----atttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggata 455  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||  |||    
T  42313546 ttttttctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaata 42313447  T
Q  456 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42313446 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 42313363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 48373505 - 48373675
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48373505 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 48373604  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  48373605 ttaaaaatgtgctt---------atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtca 48373675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 394 - 539
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450674
Alignment:
Q  394 atttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg 493  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  494 ttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtca 2450674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 27983768 - 27983605
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||     
T  27983768 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg----------------gataccat 27983685  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27983684 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 27983605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 51403188 - 51403034
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51403188 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 51403089  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
    || |||||||||||         || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51403088 tt-aaaatgtgctt---------atatgtattggttgggataaattactcaccattcttccatgg 51403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 33073212 - 33073380
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||            
T  33073212 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-------- 33073303  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33073304 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 33073380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 10928068 - 10928236
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||            
T  10928068 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-------- 10928159  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  10928160 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtca 10928236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 402 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 51045735 - 51045598
Alignment:
Q  402 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggata 501  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  51045735 accaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggta 51045636  T
Q  502 aattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||    
T  51045635 aattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtca 51045598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 361 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 45476014 - 45475866
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||        |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45476014 tttttctagattacctttgaagaatggt--------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccact 45475923  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 518  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45475922 tacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccattctt 45475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 413 - 539
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808825
Alignment:
Q  413 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccacc 512  Q
    ||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  513 attcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtca 4808825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 547
Target Start/End: Original strand, 2657304 - 2657480
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  2657304 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 2657395  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaa 547  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||    
T  2657396 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccgataaa 2657480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 41467802 - 41467634
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  41467802 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 41467711  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  41467710 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 41467634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 31980115 - 31979998
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  31980115 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccact 31980016  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtg 478  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  31980015 taaaaatgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 2557027 - 2556909
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2557027 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 2556928  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtg 478  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  2556927 ttaaaaatgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 2954856 - 2955024
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2954856 ttttttctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccac 2954955  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||| |||           | ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2954956 ttaaaaaggtg-----------attgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 2955024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 4953053 - 4953221
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  4953053 ttttctctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 4953144  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  4953145 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtca 4953221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 5961437 - 5961269
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5961437 ttttttctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 5961338  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5961337 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtca 5961269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 6626194 - 6626026
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  6626194 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 6626103  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  6626102 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 6626026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 26685857 - 26686025
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  26685857 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccac 26685956  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26685957 ctaaaaaagtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 26686025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 26472349 - 26472188
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  26472349 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 26472258  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  26472257 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26472188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 362 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 30290078 - 30289912
Alignment:
Q  362 ttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||              
T  30290078 ttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatg---------- 30289989  T
Q  462 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  30289988 -aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtca 30289912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 33187341 - 33187503
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  33187341 ttttttctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccac 33187440  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||                 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33187441 ttaaa-----------------aatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 33187503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27924828 - 27924722
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27924828 ttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 27924729  T
Q  460 ttaaaaa 466  Q
     ||||||    
T  27924728 ctaaaaa 27924722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 29770671 - 29770832
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  29770671 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 29770762  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  29770763 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagccta 29770832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 360 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 38716417 - 38716257
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  38716417 ttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccac 38716318  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccct 531  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38716317 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccct 38716257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 42234841 - 42235008
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  42234841 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 42234932  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  42234933 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 42235008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 362 - 539
Target Start/End: Original strand, 1388476 - 1388642
Alignment:
Q  362 ttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactt 461  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  1388476 ttttctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacct 1388575  T
Q  462 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||| |||           ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1388576 aaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 1388642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 448 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312533
Alignment:
Q  448 catggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 13312533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 539
Target Start/End: Original strand, 4156438 - 4156574
Alignment:
Q  410 atgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaga-------tagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataa 502  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||       ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4156438 atgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 4156537  T
Q  503 attacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  4156538 attacccatcatttttccatgggtactctagttgtca 4156574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24649892 - 24649802
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24649892 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 34752484 - 34752323
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||            
T  34752484 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatg-------- 34752393  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  34752392 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaaccta 34752323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772174
Alignment:
Q  409 aatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacc 508  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  509 caccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47772204 caccattcttccatgggtaccttaattgtca 47772174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 4243660 - 4243504
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||            
T  4243660 ttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-------- 4243569  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||||    
T  4243568 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggta 4243504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 39475952 - 39475785
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39475952 ttttttctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg-tcaagatagtttatggataccac 39475854  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     ||||||||||           || || ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  39475853 ctaaaaatgtg-----------aacgtttattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtca 39475785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 371 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683332
Alignment:
Q  371 ttacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 470  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg 48683390  T
Q  471 cttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
               ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48683389 -----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 48683332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 51155759 - 51155606
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||            
T  51155759 ttttttctaaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg-------- 51155668  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
       || ||||| ||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  51155667 ---aatatgtgtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 51155606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 10920201 - 10920369
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||  |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10920201 ttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 10920300  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  10920301 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtca 10920369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 7561713 - 7561530
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa-gatagttcatggatacc 457  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |    | ||  |||      
T  7561713 attttttctaaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatagt 7561614  T
Q  458 acttaaaaatgtgctta--tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     | | || |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7561613 tcatgaatatgtgcttacgtggggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtca 7561530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 360 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 44544216 - 44544125
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  44544216 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 41895333 - 41895166
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||         
T  41895333 tttttctaaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaata----- 41895239  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  41895238 ------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 41895166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 52323939 - 52324108
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  52323939 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaataccac 52324038  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           |||||  |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  52324039 ctaaaaaggtg----------aaatgttcattgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtca 52324108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 360 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 46428423 - 46428332
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  46428423 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 360 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13313346 - 13313249
Alignment:
Q  360 ttttttctagatta--cctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggata 455  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13313346 ttttttctagattatacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 451
Target Start/End: Original strand, 32448650 - 32448740
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  32448650 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Original strand, 52367884 - 52367990
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  52367884 ttttttctggattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccac 52367983  T
Q  460 ttaaaaa 466  Q
     ||||||    
T  52367984 ctaaaaa 52367990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 360 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13281732 - 13281588
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||            
T  13281732 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-------- 13281641  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccatt 515  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  13281640 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcatt 13281588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 360 - 458
Target Start/End: Original strand, 39637901 - 39637996
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttc-atggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39637901 ttttttctagattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaa----taaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 360 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 4156246 - 4156188
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatg 418  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4156246 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 361 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 35991768 - 35991616
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||             
T  35991768 tttttttaaattacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 35991678  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
      || || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||    
T  35991677 --aatatatgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattagctatcattctttcatgg 35991616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 401 - 518
Target Start/End: Original strand, 24215805 - 24215911
Alignment:
Q  401 taccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggat 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || || || ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24215805 taccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatg-----------aatatatgtttatgtgactaatgtgtattggttggggt 24215893  T
Q  501 aaattacccaccattctt 518  Q
    |||||||||| |||||||    
T  24215894 aaattacccatcattctt 24215911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 44293615 - 44293534
Alignment:
Q  370 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    |||||||||||| ||| || | ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  44293615 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44293534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10919364 - 10919313
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaat 411  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10919364 ttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 38718297 - 38718183
Alignment:
Q  406 accaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggga-taaat 504  Q
    |||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||  |||     | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  38718297 accaataaaaatgaacaatttatttgtggcatcaagatagttcataaata-----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtatatcggttgggagtaaat 38718203  T
Q  505 tacccaccattcttccatgg 524  Q
    |||||| ||||||| |||||    
T  38718202 tacccatcattctttcatgg 38718183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 31286612 - 31286506
Alignment:
Q  422 aatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttcca 521  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |    
T  31286612 aatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttcta 31286524  T
Q  522 tgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  31286523 tgggtaccctagttgtca 31286506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 485 - 538
Target Start/End: Original strand, 32448754 - 32448807
Alignment:
Q  485 gtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 538  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  32448754 gtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 32448807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 504 - 539
Target Start/End: Original strand, 31844818 - 31844853
Alignment:
Q  504 ttacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31844818 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 31844853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 480 - 522
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359544
Alignment:
Q  480 ctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattattccat 39359544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 393
Target Start/End: Original strand, 23994849 - 23994882
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggata 393  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23994849 ttttttctagattacctttgaagaatggtggata 23994882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 451 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9779982 - 9779919
Alignment:
Q  451 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccatt 515  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  9779982 ggataccacttaaaaatgtgtttacgtggctaatatatatttgttggg-ttaattagccaccatt 9779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 95)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 25894098 - 25893919
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25894098 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25893999  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25893998 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 25893919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33423456 - 33423277
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33423456 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33423357  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33423356 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 33423277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33696002 - 33695823
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33696002 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33695903  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33695902 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 33695823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 45690277 - 45690099
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45690277 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 45690178  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45690177 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 45690099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 46913111 - 46913292
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46913111 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46913210  T
Q  460 ttaaaaa--tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46913211 ttaaaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 46913292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 27018118 - 27018297
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27018118 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccac 27018217  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27018218 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 27018297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33839896 - 33839717
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33839896 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33839797  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33839796 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtca 33839717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 37846197 - 37846018
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37846197 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccac 37846098  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37846097 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 37846018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 40670565 - 40670744
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40670565 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 40670664  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  40670665 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtca 40670744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 361 - 535
Target Start/End: Original strand, 15877553 - 15877727
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15877553 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 15877652  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 535  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877653 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 15877727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 23393233 - 23393053
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23393233 attttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 23393134  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23393133 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 23393053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 17855430 - 17855609
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  17855430 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactac 17855529  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17855530 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 17855609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 22979828 - 22979649
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22979828 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 22979729  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22979728 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 22979649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 33411262 - 33411441
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33411262 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33411361  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  33411362 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtca 33411441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 35355890 - 35356069
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35355890 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 35355989  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35355990 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 35356069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 47067158 - 47066979
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47067158 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47067059  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47067058 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 47066979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 49171543 - 49171364
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49171543 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49171444  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  49171443 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 49171364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 31586850 - 31587022
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31586850 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 31586949  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31586950 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtacccta 31587022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 20165995 - 20165816
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20165995 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 20165896  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20165895 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 20165816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 35328250 - 35328071
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35328250 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35328151  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35328150 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 35328071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 47740512 - 47740333
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  47740512 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 47740413  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  47740412 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 47740333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 359 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 41991040 - 41990870
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41991040 attttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 41990941  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacc 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41990940 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggtacc 41990870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 2341843 - 2341663
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2341843 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaac 2341744  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat-gggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2341743 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtca 2341663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 19563449 - 19563628
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  19563449 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 19563548  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19563549 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtca 19563628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 383 - 539
Target Start/End: Original strand, 36389381 - 36389537
Alignment:
Q  383 aatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 482  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36389381 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 36389480  T
Q  483 atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36389481 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 36389537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 527
Target Start/End: Original strand, 10028490 - 10028657
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10028490 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 10028589  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10028590 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggta 10028657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 26579898 - 26579719
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26579898 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccac 26579799  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26579798 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 26579719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 45482660 - 45482839
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  45482660 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 45482759  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45482760 ttaaaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 45482839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 48609858 - 48609679
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  48609858 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccac 48609759  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48609758 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Original strand, 31625705 - 31625884
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31625705 attttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 31625804  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31625805 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 31625884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 35757201 - 35757022
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35757201 ttttttctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccac 35757103  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35757102 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 35757022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 33332791 - 33332969
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33332791 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccac 33332889  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33332890 ttaaaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 33332969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 383 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 5183983 - 5183834
Alignment:
Q  383 aatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 482  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5183983 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgcttatgtggcta 5183884  T
Q  483 atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5183883 atgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtacccta 5183834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 360 - 517
Target Start/End: Original strand, 33870247 - 33870404
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  33870247 ttttttctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccat 33870346  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattct 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33870347 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct 33870404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 5712170 - 5712349
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5712170 ttttttctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccac 5712269  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  5712270 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtca 5712349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 43499487 - 43499659
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43499487 ttttttttagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43499586  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43499587 ttaaaaatatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggatacccta 43499659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 45063536 - 45063359
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  45063536 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccac 45063437  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  45063436 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtca 45063359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 31429656 - 31429477
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31429656 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccac 31429557  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31429556 ttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtca 31429477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 10618300 - 10618465
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||    
T  10618300 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaataccac 10618392  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618393 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 10618465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 382 - 539
Target Start/End: Original strand, 29446862 - 29447018
Alignment:
Q  382 aaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 481  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  29446862 aaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgact 29446961  T
Q  482 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29446962 aatgtgtattggtt-ggagtaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 29447018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 35767483 - 35767655
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35767483 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggta-----cc--ccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35767575  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35767576 ttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 35767655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 360 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 33720217 - 33720070
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  33720217 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccac 33720118  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattac 507  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33720117 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 404 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233938
Alignment:
Q  404 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaa 503  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  504 ttacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28233973 ctacccacctttctttcatgggtaccctagttgtca 28233938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 410 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076529
Alignment:
Q  410 atgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccc 509  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  510 accattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtca 30076529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 35752204 - 35752036
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  35752204 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 35752113  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35752112 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 35752036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 535
Target Start/End: Original strand, 48085860 - 48086024
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  48085860 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 48085951  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 535  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  48085952 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaatt 48086024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 46817591 - 46817430
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  46817591 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 46817500  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  46817499 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagccta 46817430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 527
Target Start/End: Original strand, 43489220 - 43489376
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  43489220 ttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 43489311  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43489312 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 43489376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 376 - 517
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564497
Alignment:
Q  376 tttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 475  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  476 gtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattct 517  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 46898186 - 46898018
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||        
T  46898186 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata---- 46898091  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  46898090 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 46898018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 2332021 - 2332189
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  2332021 ttttttctaaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg-------- 2332112  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  2332113 ---aatatgtgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtca 2332189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 24228543 - 24228711
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  24228543 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 24228634  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24228635 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtca 24228711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 33393330 - 33393498
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33393330 ttttttctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 33393429  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     ||||||           || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33393430 ctaaaaa-----------ggttaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 33393498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 363 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 7876495 - 7876330
Alignment:
Q  363 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 462  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||               
T  7876495 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----------- 7876407  T
Q  463 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  7876406 aatatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtca 7876330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 26941702 - 26941537
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  26941702 ttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 26941611  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattg 536  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  26941610 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattg 26941537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 36817015 - 36816854
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  36817015 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 36816924  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  36816923 ---aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagccta 36816854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Original strand, 41855061 - 41855214
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||              
T  41855061 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca---------- 41855150  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41855151 -taaatatatgcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatgg 41855214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 425 - 539
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904386
Alignment:
Q  425 ttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  525 gtaccctaattgtca 539  Q
    ||| |||| ||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtca 41904386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 24923194 - 24923026
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||            
T  24923194 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-------- 24923103  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24923102 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtca 24923026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 37127939 - 37128107
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||              
T  37127939 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 37128028  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  37128029 -taaatatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 37128107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 44003540 - 44003372
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  44003540 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 44003441  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44003440 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 44003372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 422 - 527
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405517
Alignment:
Q  422 aatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttcca 521  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  522 tgggta 527  Q
    ||||||    
T  44405512 tgggta 44405517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 47906929 - 47906838
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  47906929 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 47906838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16482953 - 16482847
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  16482953 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggataccac 16482854  T
Q  460 ttaaaaa 466  Q
     ||||||    
T  16482853 ctaaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 47460943 - 47460774
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47460943 attttttttagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 47460844  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    | ||||||  ||           ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  47460843 cctaaaaagatg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtca 47460774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 7257383 - 7257551
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  7257383 ttttttctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccac 7257482  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  7257483 ctaaaaaggtg-----------aatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtca 7257551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 45502986 - 45502818
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||           |||||||     
T  45502986 ttttttctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaa-----------gataccat 45502898  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||    
T  45502897 ttaaaaatatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtca 45502818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 360 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 15644116 - 15643946
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15644116 ttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccac 15644017  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 541  Q
     |||||| |||           ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||    
T  15644016 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattgattggggtaaattacccaccattttttcatgggtacactagttgtcatc 15643946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 498358 - 498205
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  498358 ttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 498267  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 524  Q
       || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  498266 ---aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgg 498205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 21718119 - 21718286
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  21718119 ttttttctaaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 21718210  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| || |||||||| |||| ||||||    
T  21718211 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccattatt-tttcatgggtagcctagttgtca 21718286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 527
Target Start/End: Original strand, 29610637 - 29610793
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||            
T  29610637 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg-------- 29610728  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29610729 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggta 29610793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 25037678 - 25037517
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||            
T  25037678 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-------- 25037587  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  25037586 ---aatatgtgcttatgtggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 25037517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 360 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 32556776 - 32556640
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||||            
T  32556776 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg-------- 32556685  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattac 507  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32556684 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 364 - 527
Target Start/End: Original strand, 46103127 - 46103278
Alignment:
Q  364 ttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaa 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||           |    
T  46103127 ttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------a 46103214  T
Q  464 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  46103215 atatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggta 46103278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 359 - 532
Target Start/End: Original strand, 26371050 - 26371212
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||           
T  26371050 attttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg------- 26371142  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
        || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  26371143 ----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26371212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 360 - 459
Target Start/End: Original strand, 29863017 - 29863116
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29863017 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 360 - 450
Target Start/End: Original strand, 29098753 - 29098843
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 450  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  29098753 ttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 29098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 360 - 546
Target Start/End: Original strand, 35484638 - 35484814
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataa-tttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||           
T  35484638 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg------- 35484730  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataa 546  Q
        || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35484731 ----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattgtcatcaataa 35484814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448508
Alignment:
Q  370 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 469  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  470 g 470  Q
    |    
T  38448508 g 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 39453645 - 39453484
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||                
T  39453645 ttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt------------ 39453558  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
          ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  39453557 ------atgtgtttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 359 - 451
Target Start/End: Original strand, 39866666 - 39866758
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  39866666 attttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 451
Target Start/End: Original strand, 33455098 - 33455189
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  33455098 ttttttctaaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 33455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 451
Target Start/End: Original strand, 39323618 - 39323709
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  39323618 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39323709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Original strand, 44659846 - 44660006
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||            
T  44659846 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-------- 44659936  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
       || || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||    
T  44659937 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagccta 44660006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 360 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 45237703 - 45237547
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||            
T  45237703 ttttttctaaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatg-------- 45237612  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 527  Q
       || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||    
T  45237611 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggta 45237547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 360 - 426
Target Start/End: Original strand, 35557732 - 35557798
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaattt 426  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35557732 ttttttttagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 360 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 7720673 - 7720574
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||| |||||||| | | | || | |||||||||||||||||||||    
T  7720673 ttttttcttgattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggataccac 7720574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 406 - 467
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456218
Alignment:
Q  406 accaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaat 467  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaat 26456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21649549 - 21649442
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaa-tggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || || |  | ||||||||| ||||||||||    
T  21649549 ttttttttagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttattagtagatttaagatagtttatggatacca 21649450  T
Q  459 cttaaaaa 466  Q
    | ||||||    
T  21649449 cctaaaaa 21649442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 360 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 30077106 - 30077043
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaa 423  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30077106 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 37443730 - 37443604
Alignment:
Q  402 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggata 501  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||    
T  37443730 accaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggta 37443642  T
Q  502 aattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  37443641 aattacccaccatttttttatgggtaccctagttgtca 37443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 473 - 539
Target Start/End: Original strand, 39323712 - 39323777
Alignment:
Q  473 tatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  39323712 tatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtca 39323777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 421
Target Start/End: Original strand, 35823292 - 35823353
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagc 421  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  35823292 ttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 483 - 536
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866815
Alignment:
Q  483 atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattg 536  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggtagtctaattg 39866815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 469 - 537
Target Start/End: Original strand, 29098847 - 29098915
Alignment:
Q  469 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||||    
T  29098847 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgt 29098915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2049
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1871 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 1970  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1971 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 2049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 39737 - 39558
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39737 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 39638  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39637 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 39558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 11312 - 11135
Alignment:
Q  361 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 460  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11312 tttttctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 11214  T
Q  461 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11213 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 11135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 278007 - 278188
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc-- 457  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  278007 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacccc 278106  T
Q  458 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  278107 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 278188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 371 - 539
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176834
Alignment:
Q  371 ttacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 470  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  471 cttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtca 176834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 360 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 2613 - 2441
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2613 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 2514  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2513 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtacccta 2441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 75425 - 75246
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  75425 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccac 75326  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  75325 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtca 75246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19035 - 18856
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19035 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccac 18936  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18935 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtca 18856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 360 - 513
Target Start/End: Original strand, 32562 - 32715
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32562 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccat 32661  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccacca 513  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32662 ttaaaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4772 - 4598
Alignment:
Q  359 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||       |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4772 attttttctagattaactttgaataatggtgggtaac------accaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggatacca 4679  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4678 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 4598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 3089 - 3259
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3089 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcac 3179  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  3180 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatggataccttagttgtca 3259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 20647 - 20479
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  20647 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccac 20548  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20547 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 20479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 7091 - 7260
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaa-tgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||       
T  7091 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata--- 7187  T
Q  459 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
            |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7188 --------tgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 7260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 539
Target Start/End: Original strand, 14745 - 14913
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  14745 ttttgtctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccac 14844  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 539  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14845 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtca 14913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Original strand, 103 - 209
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  103 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaataccac 202  T
Q  460 ttaaaaa 466  Q
     ||||||    
T  203 ctaaaaa 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4725 - 4618
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4725 ttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacca 4626  T
Q  459 cttaaaaa 466  Q
     |||||||    
T  4625 tttaaaaa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Original strand, 3393 - 3500
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 458  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3393 ttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacca 3492  T
Q  459 cttaaaaa 466  Q
     |||||||    
T  3493 tttaaaaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 248
Target Start/End: Original strand, 66986 - 67092
Alignment:
Q  138 gaaaaggaattcctgaaaatgattagtttgtatgttgttgaaatttacatgtttggatggatattaaagctaaatcaagacaatttaggattgatttctc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  66986 gaaaaggaattcctgaaaatgatttgtttgtatgtggttcaaatttacatgtt----tggatataaaagcttaatcaagacaatctgggattcatttctc 67081  T
Q  238 tttccattcct 248  Q
    |||||||||||    
T  67082 tttccattcct 67092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 66870 - 66981
Alignment:
Q  1 attctgaaacctttttatgtttggatgttatatattctggcccacttgaaagtttgttatgtatctgagtttaccaattgaacattctatagacaaaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| ||||| ||||| ||||  |||||    
T  66870 attctgaaacctttttatgtttggat-ttatatattatggccgattggaaggtttgttatatatctga-atgaccatttgaaaattctttagaagaaaat 66967  T
Q  101 atgagttccacttc 114  Q
    |||||||| |||||    
T  66968 atgagttcaacttc 66981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 360 - 507
Target Start/End: Original strand, 17907 - 18043
Alignment:
Q  360 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||  |||| ||| || ||| ||||       
T  17907 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac--- 18003  T
Q  460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattac 507  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18004 --------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 370 - 465
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19327
Alignment:
Q  370 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaag----atagttcatggataccacttaaaa 465  Q
    ||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University