View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13869_high_26 (Length: 367)

Name: NF13869_high_26
Description: NF13869
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13869_high_26
NF13869_high_26
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (9-351)||(41053085-41053427)
chr2 (82-351)||(24602103-24602372)
chr2 (82-351)||(24611742-24612011)
chr2 (87-348)||(5351088-5351349)
chr2 (82-351)||(9659392-9659661)
chr2 (82-351)||(43944153-43944422)
chr2 (82-348)||(3795805-3796071)
chr2 (87-348)||(39797797-39798058)
chr2 (89-351)||(28342975-28343237)
chr2 (87-348)||(7266801-7267062)
chr2 (87-348)||(10620429-10620690)
chr2 (87-348)||(38949543-38949804)
chr2 (87-348)||(41563847-41564108)
chr2 (82-351)||(1097035-1097304)
chr2 (82-351)||(41181862-41182131)
chr2 (82-350)||(45479164-45479441)
chr2 (87-348)||(209440-209702)
chr2 (82-351)||(12905981-12906250)
chr2 (82-340)||(41004999-41005257)
chr2 (82-348)||(24753377-24753642)
chr2 (82-340)||(81602-81860)
chr2 (82-351)||(1150384-1150652)
chr2 (205-340)||(439285-439420)
chr2 (82-222)||(439103-439243)
chr2 (82-252)||(25613753-25613922)
chr2 (9-87)||(24607359-24607437)
chr2 (9-87)||(41008708-41008786)
chr2 (9-87)||(43950025-43950103)
chr2 (107-253)||(42808963-42809109)
chr2 (9-87)||(19187003-19187081)
chr2 (13-79)||(34910153-34910219)
chr2 (9-87)||(34921551-34921629)
chr2 (11-87)||(435559-435634)
chr2 (9-87)||(9651380-9651461)
chr2 (9-79)||(45475627-45475697)
chr2 (146-282)||(27732728-27732864)
chr2 (9-39)||(1149675-1149705)
chr2 (9-39)||(3803397-3803427)
chr2 (9-39)||(27276205-27276235)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (82-351)||(25140457-25140726)
chr6 (82-351)||(29286654-29286923)
chr6 (87-348)||(1608749-1609010)
chr6 (82-356)||(29667175-29667449)
chr6 (82-351)||(28362069-28362338)
chr6 (82-351)||(31150417-31150686)
chr6 (82-349)||(2051495-2051763)
chr6 (82-340)||(2259547-2259805)
chr6 (82-351)||(23959342-23959614)
chr6 (143-348)||(13383096-13383301)
chr6 (205-351)||(7537652-7537798)
chr6 (105-255)||(34231037-34231187)
chr6 (105-283)||(19133180-19133359)
chr6 (107-255)||(20448164-20448313)
chr6 (82-169)||(18609688-18609775)
chr6 (9-87)||(2052410-2052488)
chr6 (11-87)||(7361378-7361454)
chr6 (9-87)||(7363097-7363175)
chr6 (9-87)||(18606259-18606337)
chr6 (9-87)||(26702032-26702109)
chr6 (194-241)||(8356572-8356619)
chr6 (9-80)||(31146590-31146660)
chr6 (9-78)||(24218230-24218299)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (82-351)||(7797029-7797298)
chr5 (87-348)||(38856170-38856431)
chr5 (82-348)||(7017953-7018219)
chr5 (82-348)||(27863858-27864124)
chr5 (82-351)||(13564093-13564362)
chr5 (82-351)||(33994501-33994770)
chr5 (87-348)||(11029462-11029723)
chr5 (87-348)||(14280335-14280596)
chr5 (87-348)||(37815037-37815298)
chr5 (82-348)||(28882443-28882709)
chr5 (82-335)||(24050506-24050759)
chr5 (82-348)||(1039144-1039410)
chr5 (82-340)||(4196977-4197241)
chr5 (82-335)||(24053631-24053883)
chr5 (82-351)||(43179222-43179486)
chr5 (105-337)||(30352896-30353129)
chr5 (167-348)||(25890449-25890630)
chr5 (186-351)||(34122990-34123155)
chr5 (196-351)||(28387722-28387876)
chr5 (82-171)||(25891868-25891957)
chr5 (9-87)||(4203991-4204069)
chr5 (9-83)||(28387482-28387556)
chr5 (9-87)||(33993493-33993571)
chr5 (11-87)||(7800768-7800844)
chr5 (9-87)||(18538113-18538193)
chr5 (10-87)||(31098715-31098792)
chr5 (9-39)||(1035397-1035427)
chr5 (9-39)||(21999267-21999297)
chr5 (9-39)||(25896910-25896940)
chr5 (9-39)||(34123750-34123780)
chr5 (9-39)||(34944053-34944083)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (82-354)||(43376631-43376903)
chr8 (82-348)||(7343908-7344174)
chr8 (87-348)||(8419860-8420121)
chr8 (109-348)||(23924420-23924659)
chr8 (87-349)||(32376106-32376368)
chr8 (82-351)||(2124646-2124915)
chr8 (82-351)||(7171669-7171938)
chr8 (87-348)||(30301590-30301851)
chr8 (82-348)||(39912-40178)
chr8 (114-351)||(35962759-35962996)
chr8 (92-351)||(41744275-41744534)
chr8 (82-348)||(31959399-31959665)
chr8 (105-351)||(22660949-22661195)
chr8 (82-336)||(22587794-22588048)
chr8 (82-289)||(43679915-43680122)
chr8 (105-276)||(31281337-31281508)
chr8 (105-283)||(30972248-30972427)
chr8 (9-87)||(2146738-2146816)
chr8 (9-87)||(43369994-43370072)
chr8 (9-87)||(39752805-39752882)
chr8 (9-87)||(18205999-18206076)
chr8 (306-351)||(39751706-39751751)
chr8 (9-39)||(31958021-31958051)
chr8 (9-39)||(43689830-43689860)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (82-348)||(4001843-4002109)
chr3 (87-348)||(2743910-2744171)
chr3 (82-348)||(3952566-3952832)
chr3 (87-348)||(13743721-13743982)
chr3 (87-348)||(14402362-14402623)
chr3 (82-340)||(67346-67604)
chr3 (82-348)||(50957031-50957297)
chr3 (87-348)||(6744683-6744944)
chr3 (82-351)||(21952251-21952520)
chr3 (87-348)||(30943646-30943907)
chr3 (87-348)||(8156964-8157225)
chr3 (82-348)||(48246866-48247132)
chr3 (82-349)||(46989980-46990247)
chr3 (87-348)||(9427060-9427321)
chr3 (87-348)||(36813306-36813567)
chr3 (82-244)||(6501831-6501993)
chr3 (87-239)||(16448411-16448563)
chr3 (239-351)||(6489795-6489907)
chr3 (106-282)||(14013422-14013598)
chr3 (9-85)||(46993014-46993090)
chr3 (9-87)||(7837809-7837887)
chr3 (82-252)||(35443651-35443821)
chr3 (9-87)||(29929640-29929722)
chr3 (9-87)||(29978794-29978876)
chr3 (285-348)||(2857537-2857600)
chr3 (9-87)||(6505756-6505835)
chr3 (141-253)||(7314922-7315034)
chr3 (9-85)||(21955987-21956063)
chr3 (9-39)||(2745059-2745089)
chr3 (9-39)||(7842843-7842873)
chr3 (9-39)||(9582711-9582741)
chr3 (9-39)||(36817352-36817382)
chr3 (50-87)||(28610888-28610925)
chr3 (11-39)||(14398748-14398776)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (82-348)||(44469363-44469629)
chr1 (82-351)||(37018748-37019017)
chr1 (87-351)||(50113773-50114037)
chr1 (87-348)||(3944430-3944691)
chr1 (89-348)||(3993201-3993460)
chr1 (82-348)||(5081716-5081982)
chr1 (87-345)||(13633229-13633487)
chr1 (82-351)||(8459409-8459678)
chr1 (87-348)||(20353292-20353553)
chr1 (87-348)||(29352688-29352949)
chr1 (87-348)||(38772086-38772347)
chr1 (82-340)||(46978586-46978844)
chr1 (82-351)||(7966441-7966709)
chr1 (82-348)||(12643660-12643926)
chr1 (82-340)||(51666018-51666276)
chr1 (82-351)||(1655432-1655701)
chr1 (82-351)||(19495504-19495774)
chr1 (82-351)||(13177478-13177747)
chr1 (87-316)||(41456586-41456815)
chr1 (82-340)||(4517746-4518004)
chr1 (105-340)||(33168376-33168612)
chr1 (82-348)||(9711032-9711296)
chr1 (82-336)||(36072839-36073091)
chr1 (176-348)||(6558356-6558528)
chr1 (176-340)||(38690371-38690535)
chr1 (105-281)||(1180112-1180288)
chr1 (200-348)||(30909499-30909647)
chr1 (9-87)||(8459880-8459958)
chr1 (9-87)||(13174051-13174129)
chr1 (9-87)||(46973416-46973494)
chr1 (306-351)||(5141446-5141491)
chr1 (17-79)||(7980931-7980993)
chr1 (9-87)||(36076342-36076420)
chr1 (11-87)||(21944158-21944234)
chr1 (9-87)||(22345472-22345551)
chr1 (9-84)||(19498896-19498970)
chr1 (289-350)||(25039640-25039701)
chr1 (11-87)||(4516220-4516299)
chr1 (9-39)||(6561990-6562020)
chr1 (9-39)||(37015106-37015136)
chr1 (9-39)||(50117604-50117634)
chr1 (9-37)||(1654959-1654987)
chr1 (9-37)||(23914043-23914071)
[»] scaffold0219 (2 HSPs)
scaffold0219 (82-351)||(19286-19555)
scaffold0219 (9-87)||(15890-15968)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (82-351)||(10616-10885)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (87-348)||(19069655-19069916)
chr4 (82-340)||(11506446-11506704)
chr4 (82-348)||(49564297-49564563)
chr4 (87-348)||(3407596-3407857)
chr4 (82-340)||(38460888-38461146)
chr4 (82-351)||(37394555-37394824)
chr4 (82-351)||(4773957-4774225)
chr4 (82-336)||(18579099-18579354)
chr4 (100-327)||(24415646-24415872)
chr4 (82-351)||(10374491-10374742)
chr4 (155-351)||(44050505-44050700)
chr4 (214-349)||(10422892-10423027)
chr4 (105-281)||(6187189-6187365)
chr4 (105-255)||(30042802-30042952)
chr4 (9-87)||(44049312-44049390)
chr4 (9-79)||(21471116-21471186)
chr4 (9-84)||(4975979-4976055)
chr4 (11-87)||(17139820-17139896)
chr4 (9-87)||(4768866-4768944)
chr4 (9-87)||(11494757-11494837)
chr4 (105-253)||(31599037-31599185)
chr4 (9-87)||(38464550-38464628)
chr4 (9-39)||(19073483-19073513)
chr4 (9-39)||(41023599-41023629)
chr4 (9-87)||(51644280-51644358)
chr4 (197-241)||(21178341-21178385)
[»] scaffold0794 (1 HSPs)
scaffold0794 (82-340)||(1103-1361)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (87-348)||(4683-4944)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (87-348)||(15069707-15069968)
chr7 (87-348)||(43620135-43620396)
chr7 (87-348)||(604234-604495)
chr7 (87-348)||(30790363-30790624)
chr7 (87-348)||(42503195-42503456)
chr7 (87-348)||(45767217-45767478)
chr7 (82-340)||(12111686-12111944)
chr7 (82-351)||(19044758-19045027)
chr7 (82-351)||(20709609-20709878)
chr7 (82-349)||(47742341-47742608)
chr7 (82-336)||(10705724-10705978)
chr7 (82-340)||(47064646-47064904)
chr7 (105-351)||(34622950-34623196)
chr7 (142-351)||(29592954-29593163)
chr7 (178-348)||(18109241-18109411)
chr7 (9-87)||(47061141-47061219)
chr7 (9-85)||(47741951-47742027)
chr7 (9-39)||(10708110-10708140)
chr7 (9-39)||(29593184-29593214)
chr7 (9-39)||(36186008-36186038)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (82-348)||(15307-15573)
scaffold0116 (9-39)||(11487-11517)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (82-348)||(22869-23135)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (82-340)||(22101-22359)
scaffold0057 (9-87)||(23025-23102)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (9-87)||(7096-7174)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (9-87)||(11524-11602)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (12-87)||(962-1038)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (9-39)||(4230-4260)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (9-39)||(17180-17210)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41053427 - 41053085
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgtcaagtgagacgtgtccaaggt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41053427 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttggttttgtcaagtgagacgtgtccaaggt 41053328  T
Q  109 tgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41053327 tgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaggttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaactt 41053228  T
Q  209 aacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgcacat 308  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||    
T  41053227 aacatttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgttttgtcaaatgccatgcatagacctaggagaagatagagacgaatacgcat 41053128  T
Q  309 ggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41053127 tgaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 41053085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24602372 - 24602103
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24602372 ttttgtcaagtgagacatgttcgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 24602273  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  24602272 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttcctcaaatgccatgcatagacc 24602173  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24602172 taggagaagatagagacgaatacggatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 24602103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 24611742 - 24612011
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24611742 ttttgtcaagtgagacatgttcgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 24611841  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  24611842 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttcctcaaatgccatgcatagacc 24611941  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24611942 taggagaagatagagacgaatacggatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 24612011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 5351088 - 5351349
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5351088 tcaagtgagacatgtctaaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 5351187  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5351188 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 5351287  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5351288 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 5351349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 9659392 - 9659661
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  9659392 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaagaccttgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaatgttatgataacgccgacggac 9659491  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  9659492 tctcttgatgatttgaatgcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 9659591  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9659592 taggagaagatagagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatag 9659661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 43944422 - 43944153
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||    
T  43944422 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacagac 43944323  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43944322 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacattacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 43944223  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43944222 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggcttattcgcgatgatag 43944153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3796071 - 3795805
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3796071 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcatttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 3795972  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3795971 tctcttgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagtatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 3795872  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3795871 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgtgacga 3795805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 39797797 - 39798058
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39797797 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaaggtcgggttaggtactccacgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 39797896  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  39797897 tgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccttgcatagacctagga 39797996  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39797997 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 39798058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 89 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28343237 - 28342975
Alignment:
Q  89 aagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttg 188  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  28343237 aagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcatgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacaccgacgaactctcttg 28343138  T
Q  189 ataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgaga 288  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28343137 atgatttgaagacacaacttaacacttattttgaacatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcataggcctaggaga 28343038  T
Q  289 agatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28343037 agatagagacgaatacacatgtaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 28342975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 7266801 - 7267062
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  7266801 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgctgacggactctct 7266900  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7266901 tgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 7267000  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  7267001 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatacctttgcttattcgcgacga 7267062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10620690 - 10620429
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  10620690 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacagactctct 10620591  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10620590 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 10620491  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10620490 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 10620429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 38949543 - 38949804
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  38949543 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 38949642  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38949643 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 38949742  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38949743 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgcctttgcttattcgcgacga 38949804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 41563847 - 41564108
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  41563847 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaagattatgataacgccgacggactctct 41563946  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41563947 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 41564046  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41564047 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 41564108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1097304 - 1097035
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  1097304 ttttgtcaagtgaaatatgtccgaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactctgcttttaaaaagacaattaaggttatcataacgccgacggac 1097205  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  1097204 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcattttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 1097105  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  1097104 taggagaagatagagacgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgcttgggcttatttgcgacgatag 1097035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41182131 - 41181862
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||  |||||    
T  41182131 ttttgtcaagtgaaaaatgtccgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataactccggcggac 41182032  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  41182031 tctcttgatgatttgaagacacaacttaacacttattttgtgcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatacacc 41181932  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41181931 taggagaagatagagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggcttatacgcgacgatag 41181862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 350
Target Start/End: Original strand, 45479164 - 45479441
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45479164 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacagttaaggttatgataacgccgacggac 45479263  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatc----------aatatacacgtcacttctgtggtcaaatgcca 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  45479264 tctcttgatgatttgaaggcacaaattaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacattaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgcc- 45479362  T
Q  272 tgcatagacctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgata 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45479363 tgcatagacctaggagaagatagagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgata 45479441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 209702 - 209440
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  209702 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 209603  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaactta-acacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacg 285  Q
    ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  209602 tgacaatttgaaagcacaactcacacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagg 209503  T
Q  286 agaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    |||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  209502 agaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 209440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12906250 - 12905981
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| || ||||||    
T  12906250 ttttgtcaagtgaaacatgttcggggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagataattaaggttatgataacaccgacggac 12906151  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  12906150 tctcttgatgatttgaacgcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcatttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 12906051  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||| ||| | || | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12906050 taggagaagataaagatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 12905981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41005257 - 41004999
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||    
T  41005257 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacagac 41005158  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  41005157 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacatgtcacttgtttggtcaaatgcaatgcacagacc 41005058  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  41005057 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacgacaagctacatgccctggcttatt 41004999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Original strand, 24753377 - 24753642
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||    
T  24753377 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactctgcgtttaaaaagacagttaaggttatgataacgtcgatggac 24753476  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24753477 tctcttgataatttga-ggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacccgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 24753575  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || |  |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24753576 taggagaagatagagatgaatacgtatggaaaacggcaagctatatgcttttgcttattcgcgacga 24753642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Original strand, 81602 - 81860
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| | || |||    
T  81602 ttttctcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaatttgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaaaacaattaaggttatgataacgtcgacagac 81701  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  81702 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacatttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgctatgcatagacc 81801  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  81802 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatcccttgacttatt 81860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 1150384 - 1150652
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  1150384 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaaggacgtgttaggtactccgtgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgtcgacggac 1150483  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1150484 tctcttgacgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtg-aaatcaatatacatgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 1150582  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || |||||||||||||   || | ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||||    
T  1150583 taggagaagatagagataaatacgcatggaaaacggcaaactatacgccttggtttatttgtgacgatag 1150652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 439285 - 439420
Alignment:
Q  205 acttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgc 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  439285 acttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaattccttgcatagacctaggagaagatagagatgaatac 439384  T
Q  305 acatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  439385 gcatggaaaacggcaagctatatgccctggcttatt 439420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Original strand, 439103 - 439243
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||    
T  439103 ttttgtcaagtgaaacatgtatgaggttgcaaaaattgaaggccgtgctaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacagac 439202  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttga 222  Q
    | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  439203 tatcttgatgatttgaaggcaatacttaacacttattttga 439243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25613922 - 25613753
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||| |||| | || ||||| |||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| ||||  || |  |||    
T  25613922 ttttgtgaagttaaacatgtccgaggttgtacaaattgaaggccgtgtc-ggtactctgcttttaaaaagacaattaaggttatcataaaaccgatcgac 25613824  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtca 252  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25613823 actattgatgatttgaaggcacaacttaacaaatattttgagtatcttggtgaaaaccaatatacacgtca 25613753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24607437 - 24607359
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24607437 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 24607359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 41008786 - 41008708
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41008786 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattaagcattttaatctgttcattttttggttttgt 41008708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 43950103 - 43950025
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43950103 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 43950025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 253
Target Start/End: Original strand, 42808963 - 42809109
Alignment:
Q  107 gttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaac 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||| |||| || || ||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  42808963 gttgcacaaattgaaggtcgtgttcgatactctgctttcaaaaagacaattaaggttatgctaactccgacagacactattgatgatttcaaggcacaac 42809062  T
Q  207 ttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcac 253  Q
    |||| |  ||||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||    
T  42809063 ttaataaatattttgagtatttcagtgaaaatcaatatacacatcac 42809109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 19187081 - 19187003
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19187081 agcataggaggtatcaacacacatttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatcggtttattttttggttttgt 19187003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Original strand, 34910153 - 34910219
Alignment:
Q  13 taggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcatttttt 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34910153 taggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattaagcattttaatccgtttatttttt 34910219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 34921629 - 34921551
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||       ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34921629 agcataggaggtatcaacaaactttcgacgtaaaaaaacagatattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 34921551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 435559 - 435634
Alignment:
Q  11 cataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  435559 cataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaa-agggattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 435634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 9651380 - 9651461
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnn---caggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9651380 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaaaaacaggtatcgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 9651461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 45475627 - 45475697
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcatttttt 79  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45475627 agcataggaggtaccaacacacttttgacgaaagaaaacaggtattgagcattttaatccgttcatttttt 45475697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 282
Target Start/End: Original strand, 27732728 - 27732864
Alignment:
Q  146 aaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatata 245  Q
    ||||||||  |||| ||| ||||||| || || ||| || ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||| ||||    
T  27732728 aaaaagacaattaaggttttgataactccgaccgacactattgatgagttgaaggcacaacttaacaaatattttgactatgttggtgaaaatcattata 27732827  T
Q  246 cacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacct 282  Q
    || ||||| | | || ||| ||||| ||| |||||||    
T  27732828 catgtcacgtatttgttcagatgccttgcttagacct 27732864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Original strand, 1149675 - 1149705
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149675 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 1149705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 3803427 - 3803397
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3803427 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 3803397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 27276235 - 27276205
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27276235 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 27276205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 25140457 - 25140726
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  25140457 ttttgtcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaaggccgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacagac 25140556  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25140557 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 25140656  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25140657 taggagaagatagagacgaatacacatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatag 25140726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29286923 - 29286654
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29286923 ttttgtaaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcatgttagatactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 29286824  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29286823 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatattggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 29286724  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29286723 taggagaagatagagacgaatacacatagaaaacggcaaactatatgccttggcttattcgcgacgatag 29286654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1609010 - 1608749
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1609010 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 1608911  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1608910 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 1608811  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1608810 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 1608749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 356
Target Start/End: Original strand, 29667175 - 29667449
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||| || || |||    
T  29667175 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccacttttaaaaagacaattaaggttatgagaacaccgacagac 29667274  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  29667275 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 29667374  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagtgatg 356  Q
    || | ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29667375 taggggaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgatg 29667449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 28362069 - 28362338
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  28362069 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaatagaagggcgtgttaggtactccgcgttaaaaaagacggttaaggttatgatcacgccgacggac 28362168  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28362169 tctcttgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 28362268  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | ||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28362269 taggagaagatagagatgaataagcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttatttgcgatgatag 28362338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 31150417 - 31150686
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  31150417 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttggacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaacgacggttaaggttatgataacgtcgacggac 31150516  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31150517 tctcttcacgatttgaaggcacaacttaacaattattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 31150616  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | || | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31150617 taggagaagatagagatgaatacgcttggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 31150686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 82 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2051763 - 2051495
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||    
T  2051763 ttttgtcaagtaaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggtcatgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacaccgacggac 2051664  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcac-ttctgtggtcaaatgccatgcatagac 280  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  2051663 tatcttgatgatttgaaggcacaacttaaaacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcactttatttggtcaaatgtcatgcatagac 2051564  T
Q  281 ctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgat 349  Q
    ||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2051563 ctaggagaagatatagacgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgtcttggcttattcgcgacgat 2051495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2259805 - 2259547
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||| || |||    
T  2259805 ttttgtgaagtgaaacatgtctgaggttgcaaaaattgaaggtagtgttaggtactccgcttttaaaaatacaattaaggctatgataacgccgaccgac 2259706  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||    
T  2259705 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgttttgtcaaatgtcatgcatagacc 2259606  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||||||| | || | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2259605 taggagaagatagagatgaatacgcatagaaaacgacaagctatatgcattggcttatt 2259547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23959614 - 23959342
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||  ||    
T  23959614 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaatatcgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgtcgaccaac 23959515  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatg---catag 278  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||   |||||    
T  23959514 tctcttgatgatttgaatgcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacatcacttgtttggtccaatgtcatgcatcatag 23959415  T
Q  279 acctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    ||||| |||||| |||||| | || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23959414 acctaggagaagctagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcacgacgatag 23959342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13383301 - 13383096
Alignment:
Q  143 tttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13383301 tttaaaaagacggttaaagttatgataacgccgacggactctcttcacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaat 13383202  T
Q  243 atacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcg 342  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  13383201 atacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacctaggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacgtcaagttatatgcctttgcttattcg 13383102  T
Q  343 cgacga 348  Q
    ||||||    
T  13383101 cgacga 13383096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 205 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7537798 - 7537652
Alignment:
Q  205 acttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgc 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  7537798 acttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacatgtcacttgtttggtcaaattccatgcatagacctaggagaagatagagacgaatac 7537699  T
Q  305 acatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
     ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7537698 gcatggaaaacagcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatag 7537652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34231187 - 34231037
Alignment:
Q  105 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcaca 204  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  34231187 aggttgcaaaaattgaagatcctgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgaccgactctcttgatgatttgaaggcaca 34231088  T
Q  205 acttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcactt 255  Q
    | ||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34231087 aattaacacttgttttgagcatattggtgaaactcaatatacacgtcactt 34231037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19133359 - 19133180
Alignment:
Q  105 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaa-gacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  || | |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| ||    
T  19133359 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttcggtactccgcttttaaaaaagacaattgaggttatgataacgccgactgacactcttgatgatttgaaggtac 19133260  T
Q  204 aacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagaccta 283  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| ||||| ||||| ||||||    
T  19133259 aacttaacacatattttgagtatcttggtgaaaatcagtatacacgtcacttatttgctcagatgccttgcatggaccta 19133180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 255
Target Start/End: Original strand, 20448164 - 20448313
Alignment:
Q  107 gttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgctttt-aaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaa 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||||   |||| ||||||||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20448164 gttgcaaaaattgaaggccgtgttcggtactccattttttaaaaagataattaaggttatgataacaccgactgacactcttgatgatttgaaggcacaa 20448263  T
Q  206 cttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcactt 255  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20448264 cttaacacatattttgagtatctttgtgaaaatcaatatacacgtcactt 20448313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 169
Target Start/End: Original strand, 18609688 - 18609775
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgata 169  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18609688 ttttgtcaagtgaaacatgtccaaggatgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaagttatgata 18609775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2052488 - 2052410
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2052488 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtcaaaaaacaggtattgagcattttagtccgttcattttttggttttgt 2052410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 7361378 - 7361454
Alignment:
Q  11 cataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7361378 cataggaggtatcaacacacttttgacataaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 7361454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7363175 - 7363097
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7363175 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaataggtattgagcattttaatccgtttattttttggttttgt 7363097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 18606259 - 18606337
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18606259 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaagtattgagcattttaatacgttcattttttggttttgt 18606337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 26702032 - 26702109
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26702032 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt-aaaaaacaggtattgagcattttaatctgttcattttttggctttgt 26702109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 241
Target Start/End: Original strand, 8356572 - 8356619
Alignment:
Q  194 ttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaa 241  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8356572 ttgaaggcacaacttaacagatattttgttcatcttggtgaaaatcaa 8356619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 31146590 - 31146660
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttg 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||        || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31146590 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaa-agatattgagcattttaatccgttcattttttg 31146660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 24218230 - 24218299
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||       || ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  24218230 agcataggaggtatcaacacacttctgacgtaaaaaaacatgtattgagcattttaatcagttgattttt 24218299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7797298 - 7797029
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  7797298 ttttgtcaagtgagaaatgtccgaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactctgcttttaaaaagacggttaatgttatgataacgtcgacggac 7797199  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7797198 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 7797099  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    ||  |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7797098 tagaagaagatagagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgctttggcttattcgcgacgatag 7797029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38856431 - 38856170
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  38856431 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaaggtcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 38856332  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  38856331 tgaaaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccttgcatagacctagga 38856232  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38856231 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 38856170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7018219 - 7017953
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7018219 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 7018120  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  7018119 tctcttgaaaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 7018020  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||| ||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7018019 taggagtagatagagatgaatacacatggaaaatggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 7017953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27864124 - 27863858
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27864124 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactctgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 27864025  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27864024 tctcttgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 27863925  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27863924 taggagaagatagagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 27863858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13564362 - 13564093
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  13564362 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacagac 13564263  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13564262 tctcttgacaattttaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 13564163  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13564162 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttatttgcgatgatag 13564093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 33994501 - 33994770
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||||    
T  33994501 ttttgtcaagtgaaacatgtctgaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactctgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgatggac 33994600  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33994601 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaattaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 33994700  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | || | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33994701 taggagaagatagagatgaatacgcatggacaacggcaaactatatgccttggcttattcgcgacgatag 33994770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11029723 - 11029462
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  11029723 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaaggtcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgtcgacggactctct 11029624  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  11029623 tgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccttgcataaacctagga 11029524  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11029523 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 11029462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 14280335 - 14280596
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14280335 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 14280434  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14280435 tgacaattcgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 14280534  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14280535 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 14280596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37815298 - 37815037
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37815298 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggtgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 37815199  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37815198 tgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 37815099  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37815098 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcacgacga 37815037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28882709 - 28882443
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28882709 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcataaattgaagggcgagttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 28882610  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28882609 tctcttgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatgttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 28882510  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  28882509 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcatttgcttatttgcgacga 28882443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24050759 - 24050506
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  24050759 ttttgtcacgtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactctgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacggac 24050660  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  24050659 tctcttgatgatttgaaggtacaatttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatatacc 24050560  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggc 335  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24050559 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggc 24050506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Original strand, 1039144 - 1039410
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  1039144 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggtgcgttagatactccgcgtttaaaaagacggttaaagttatgataacgccgacagac 1039243  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1039244 tctcttgacgatttgaaggcacgatttaacacttattttgagcatcttggtaaaaattaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 1039343  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1039344 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 1039410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4197241 - 4196977
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  4197241 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgtaaaaattgaaagccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaagttatgaaaacgccgacggac 4197142  T
Q  182 tctcttgataatttgaa------ggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgca 275  Q
    ||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4197141 tctcttgatgatttgaacttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaaaatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgca 4197042  T
Q  276 tagacctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4197041 tagacctaggagaagatagagatgaatatgcatggaaaacgacaagctacatgccttggcttatt 4196977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24053883 - 24053631
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  24053883 ttttgtcacgtgaaacatgtccgagattgcaaaaattgaagaccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacggac 24053784  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | |||    
T  24053783 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttgctgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcaaatacc 24053684  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggc 335  Q
    || ||| ||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24053683 taggag-agatagagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggc 24053631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 43179222 - 43179486
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| | || |||    
T  43179222 ttttgtgaagtgaaacatgtccgagattgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtattccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgtcaaccgac 43179321  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||||||||||    
T  43179322 tctcttgatgatttgaaggcacaactta-----tattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttatttgctcaaatgtcttgcatagacc 43179416  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | |  | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43179417 taggagaagatagagatgaacacgcatggaaaacggtaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 43179486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 105 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30353129 - 30352896
Alignment:
Q  105 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaa-gacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcac 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  30353129 aggttgcaaaaattgaaggtcatgttaggtactccgcttttaaaaaagacaattaaggttatgataacgccgaccgactttcttgatgatttgaaggcac 30353030  T
Q  204 aacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatg 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||     
T  30353029 aacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacatgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacctaggagaagatagagatgaata 30352930  T
Q  304 cacatggaaaacgccaagctatatgccttggctt 337  Q
      |||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  30352929 tgcatgaaaaacggcaagttatatgccttggctt 30352896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25890630 - 25890449
Alignment:
Q  167 ataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaa 266  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25890630 ataacgctgacggactctcttgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaa 25890531  T
Q  267 tgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| | || | | ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25890530 tgccatgcatagccctaggagaagatagagatgaatacgcgtggaaaacagcaagcgatatgcctttgcttattcgcgacga 25890449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 186 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34123155 - 34122990
Alignment:
Q  186 ttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacg 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  34123155 ttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctggg 34123056  T
Q  286 agaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    |||||||||||| | || | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34123055 agaagatagagatgaatacgcatggaaaacggtaagttatatgccttggcttattcgcgacgatag 34122990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 196 - 351
Target Start/End: Original strand, 28387722 - 28387876
Alignment:
Q  196 gaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagataga 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28387722 gaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacatgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctaggagaagataaa 28387821  T
Q  296 gacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || | || ||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||||    
T  28387822 gatgaatacacatggaaaacgacaagttatatgcctttg-ttattcacgacgatag 28387876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25891957 - 25891868
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataac 171  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25891957 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataac 25891868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4204069 - 4203991
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4204069 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 4203991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 28387482 - 28387556
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggtt 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28387482 agcataggaggtatcaacacacttttgacataaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttggtt 28387556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 33993493 - 33993571
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33993493 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgtacattttttggtcttgt 33993571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7800844 - 7800768
Alignment:
Q  11 cataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7800844 cataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaaccctttcattttttggttttgt 7800768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18538193 - 18538113
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt--nnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18538193 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaaaacaggtattgagcattttaatccattcattttttggctttgt 18538113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 31098792 - 31098715
Alignment:
Q  10 gcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  31098792 gcatagaaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacatgtattgagcattttaatctgttaattttttgattttgt 31098715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Original strand, 1035397 - 1035427
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035397 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 1035427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Original strand, 21999267 - 21999297
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21999267 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 21999297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 25896940 - 25896910
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25896940 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 25896910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 34123780 - 34123750
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34123780 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 34123750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Original strand, 34944053 - 34944083
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34944053 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 34944083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 82 - 354
Target Start/End: Original strand, 43376631 - 43376903
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||    
T  43376631 ttttgtcaagtgagacatgttcgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaggttatgataacgctgacgaac 43376730  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43376731 tttcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgttacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 43376830  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagtga 354  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  43376831 taggagaagatagagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggtttattcgcgacgatagtga 43376903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Original strand, 7343908 - 7344174
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7343908 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 7344007  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7344008 tctcttgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 7344107  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7344108 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 7344174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8420121 - 8419860
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8420121 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 8420022  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8420021 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 8419922  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8419921 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 8419860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 109 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23924659 - 23924420
Alignment:
Q  109 tgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaactt 208  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23924659 tgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctcttgacaatttgaagacacaactt 23924560  T
Q  209 aacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgcacat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | |||    
T  23924559 aacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctaggagaagatagagatgaatacgcat 23924460  T
Q  309 ggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23924459 ggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 23924420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 87 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 32376368 - 32376106
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  32376368 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 32376269  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32376268 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 32376169  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgat 349  Q
    ||||||||||| | || | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32376168 gaagatagagatgaatacgcatgggaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgat 32376106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2124915 - 2124646
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||||    
T  2124915 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtacttcgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgatggac 2124816  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  2124815 tctcttgatgatttgaaggcacaacttgacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatatacggcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 2124716  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2124715 taggagaagatagagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacaatag 2124646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 7171669 - 7171938
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||    
T  7171669 ttttgtgaagtgaaacatgtctgaggttgcaaaaattgaaggtcatgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgaccgac 7171768  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7171769 tctcttgatgatttgaagacacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 7171868  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    ||   ||||||||||| | || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7171869 tagaggaagatagagatgaatacgcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 7171938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30301851 - 30301590
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  30301851 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaagtttacgataacgccgacggactctct 30301752  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30301751 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 30301652  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30301651 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 30301590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40178 - 39912
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40178 ttttttcaagtgagacatgtccgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 40079  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||     
T  40078 tctcttgacgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagtatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagact 39979  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  39978 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgtctttgcttattcgcaacga 39912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 114 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 35962996 - 35962759
Alignment:
Q  114 aaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaacttaacac 213  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  35962996 aaattgaagggcgtgttaggtgctccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctcttgacgatttgaaagcacaacttaacac 35962897  T
Q  214 ttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgcacatggaaa 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | || | ||||||||    
T  35962896 ttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacctaggagaatatagagatgaatacgcatggaaa 35962797  T
Q  314 acgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35962796 acgacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 35962759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 92 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41744534 - 41744275
Alignment:
Q  92 tgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgata 191  Q
    |||||| ||||  |||||| | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||      
T  41744534 tgagacatgtctgaggttgtacaaattgaagggcgtgttaggtactctgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgcagacggactctcttgacg 41744435  T
Q  192 atttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaaga 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41744434 atttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctaggagaaga 41744335  T
Q  292 tagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    |||||| | || | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41744334 tagagatgaatacgcatggaaaacgacaagttatatgccttggcttattcatgacgatag 41744275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Original strand, 31959399 - 31959665
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  31959399 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacaccgacagac 31959498  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||     
T  31959499 tctcttgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcttcttggtgaaaatcaatatacatgtcacttgtttggtcaaatcccatgcataaacg 31959598  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31959599 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 31959665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 351
Target Start/End: Original strand, 22660949 - 22661195
Alignment:
Q  105 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcaca 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |    
T  22660949 aggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgaccgactctcttgatgatttgaaggcata 22661048  T
Q  205 acttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgc 304  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||      
T  22661049 acttaacacatattttgagcatcttggtgaaaattaatatacacgtcacttatttggtcagatgccatgcatagacctaggagaagatagagatgaatat 22661148  T
Q  305 acatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22661149 gcatggaaaacggcaagccatatgccttggcttattcacgacgatag 22661195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 336
Target Start/End: Original strand, 22587794 - 22588048
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| | ||||    
T  22587794 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgaaaacgccgaaggac 22587893  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  22587894 tctcttgatgatttgaagacacaacttaacacttattttgagcatcttggtaaaaatcaatatactcgtcacttgtttggtcaaatgccatacatagacc 22587993  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggct 336  Q
    || ||||| || |||| | || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22587994 taggagaaaatggagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtcttggct 22588048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43680122 - 43679915
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||    
T  43680122 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttagacactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacagac 43680023  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  43680022 tctcttggtgatttgaaggcacaacttaacacttattttgaacatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 43679923  T
Q  282 tacgagaa 289  Q
    || |||||    
T  43679922 taggagaa 43679915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31281508 - 31281337
Alignment:
Q  105 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  31281508 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttcggtactccgcttttaaaaagataattaaggttatgataacgccgaccgacactcttgatgatttgatggcaca 31281409  T
Q  205 acttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcat 276  Q
    |  |||||| || | |||  || |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| |||||    
T  31281408 atgtaacacatactctgagtattttggtgaaaatcaatatacacgtcacttatttgctcagatgccttgcat 31281337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 283
Target Start/End: Original strand, 30972248 - 30972427
Alignment:
Q  105 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcaca 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  30972248 aggttgcaaaaattgaaagtcgtgtttgatactccgcttttaaaaagataattaaggttatgataaccccaaccgacactcttgataatttaaaggcgca 30972347  T
Q  205 acttaacacttat-tttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagaccta 283  Q
    ||||| ||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| | ||||| ||||||    
T  30972348 acttagcacatatctttgagtatcttagtgaaaatcaatatgcacgtcacttatttgctcaaatgacttgcatggaccta 30972427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2146816 - 2146738
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2146816 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtcaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 2146738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 43369994 - 43370072
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43369994 agcataggaggtatcaacacacttttgacctaaaaaaacaggtattgaacattttaatccgttcattttttggttttgt 43370072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 39752882 - 39752805
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39752882 agcataggaggtatcaacacacttttgacataaaaaa-caggtattgagcattttaatccattcattttttggttttgt 39752805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 18205999 - 18206076
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||       ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18205999 agcataggaggtattaacacacttttgacgtaaaaaa-cagatattgagcattttaatccattcattttttggttttgt 18206076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 39751751 - 39751706
Alignment:
Q  306 catggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39751751 catggaaaacggcaaactatatgtcttggcttattcgcgacgatag 39751706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Original strand, 31958021 - 31958051
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958021 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 31958051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 43689860 - 43689830
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43689860 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 43689830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Original strand, 4001843 - 4002109
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4001843 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaaggacgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 4001942  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  4001943 tctcttgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 4002042  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4002043 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 4002109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2744171 - 2743910
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  2744171 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 2744072  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2744071 tgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 2743972  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2743971 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 2743910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Original strand, 3952566 - 3952832
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3952566 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 3952665  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3952666 tctcttgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 3952765  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3952766 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 3952832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13743982 - 13743721
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13743982 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 13743883  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13743882 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 13743783  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13743782 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 13743721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 14402362 - 14402623
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14402362 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 14402461  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14402462 tgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacctagga 14402561  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14402562 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 14402623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 67604 - 67346
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  67604 ttttgtcaagtgaaacatgtctgaggttgcaaaaattgaagggcgtgttaggtactctgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 67505  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  67504 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 67405  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||||||| | || | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  67404 taggagaagatagagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgtcttggcttatt 67346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Original strand, 50957031 - 50957297
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50957031 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggtgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 50957130  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  50957131 tctcttgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttatttggtcaaatgccatgcatagacc 50957230  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||  |||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50957231 tagaagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacga 50957297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 6744683 - 6744944
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6744683 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 6744782  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6744783 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 6744882  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6744883 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacga 6744944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21952520 - 21952251
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  21952520 ttttgtcaagtgagacatgtctgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacaccaacggac 21952421  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21952420 tctcatgacaatttaaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaataaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 21952321  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||| | | || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21952320 taggagaagatagatatgaatacgcatggaaaacggcaagctatgtgccttggcttattcgcgatgatag 21952251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30943907 - 30943646
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30943907 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagatggttaaggttatgataacgccgacggactctct 30943808  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30943807 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 30943708  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30943707 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 30943646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8157225 - 8156964
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  8157225 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacgaactctct 8157126  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  8157125 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgctatgcatagacctagga 8157026  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8157025 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 8156964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 48247132 - 48246866
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  48247132 ttttttcaagtgagacatgtttgaggttgcacaaattgaagggtgtgttagatactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacagac 48247033  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  48247032 tctcttgacgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgctatgcatagacc 48246933  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48246932 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgctttggcttattcgcgacga 48246866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 46990247 - 46989980
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| |||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  46990247 ttttttcaagtgagacatgtttgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactctgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataactccgacagac 46990148  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |    
T  46990147 tctcttgacgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagatc 46990048  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgat 349  Q
    ||  |||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46990047 tagcagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgat 46989980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9427321 - 9427060
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||    
T  9427321 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacatcgacagactctct 9427222  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9427221 tgacaatttgaatgcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcagtatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 9427122  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9427121 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaaactatatgcctttgcttattcgcgacga 9427060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36813567 - 36813306
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||  |||||||    
T  36813567 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacttcgacttactctct 36813468  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  36813467 tgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacctagga 36813368  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || |   ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36813367 gaagatagagatgaatacgtgtggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacga 36813306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6501993 - 6501831
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  6501993 ttttgtcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcatgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaacgttatgataacgccgacagac 6501894  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatat 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6501893 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatat 6501831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 16448411 - 16448563
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||    
T  16448411 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacatcgacagactctct 16448510  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatc 239  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16448511 tgacaatttgaatgcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatc 16448563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 239 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6489907 - 6489795
Alignment:
Q  239 caatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggctta 338  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6489907 caatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctaggagaagatagagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggctta 6489808  T
Q  339 ttcgcgacgatag 351  Q
    |||| ||||||||    
T  6489807 ttcgtgacgatag 6489795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 282
Target Start/End: Original strand, 14013422 - 14013598
Alignment:
Q  106 ggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaa 205  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||   ||||  ||||||||||  | || ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14013422 ggttgcacaaattgaaggttgtgtttgatactctgcttttaaaaagataattaagattatgataacttcgaccgacactattgatgatttgaaggcacaa 14013521  T
Q  206 cttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacct 282  Q
    |||||||  ||||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||| | | || ||||||| | ||||| |||||    
T  14013522 cttaacaaatattttgagtatcttgatgaaaattagtatacacgtcacatatttgctcaaatgtcttgcatggacct 14013598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 46993090 - 46993014
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggtttt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46993090 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttggtttt 46993014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 7837809 - 7837887
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7837809 agcataggaggtatcaacacacttttgaagtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttagttttgt 7837887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 35443821 - 35443651
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||| |||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||  | ||||   |||| ||||||||  |||| |||||| |||| || || |||    
T  35443821 ttttgtaaagttaaacatgtctaaggttgcacaaattgaaggtcgtgtctgatactttactttcaaaaagacaattaaggttatgctaactccgaccgac 35443722  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtca 252  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  35443721 actattgatgagttgaagacacaacttaacaaatattttgagtatcttggtgaaaattattatacatgtca 35443651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 29929640 - 29929722
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnn----caggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29929640 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaaaaatcaggtattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 29929722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 29978794 - 29978876
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnn----caggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29978794 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaaaaatcaggtattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 29978876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 348
Target Start/End: Original strand, 2857537 - 2857600
Alignment:
Q  285 gagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2857537 gagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 2857600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 6505835 - 6505756
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnnca-ggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||        | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6505835 agcataggaggtatcaacacacatttgacgtaaaaaaaaaaggtattgagcattttaatccgttcattttttgattttgt 6505756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7315034 - 7314922
Alignment:
Q  141 cttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatca 240  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||| ||||  | || ||| || ||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||    
T  7315034 ctttcaaaaagacaattaaggttatgctaacttcgaccgacactattgatgagttgaagacacaacttaacaaatattttgagtatcttggtgaaaatca 7314935  T
Q  241 atatacacgtcac 253  Q
     |||||| |||||    
T  7314934 ttatacatgtcac 7314922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21956063 - 21955987
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggtttt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| | |||||| | || || |||||||||||||    
T  21956063 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgaacatttttacccatttattttttggtttt 21955987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 2745089 - 2745059
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2745089 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 2745059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 7842873 - 7842843
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7842873 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 7842843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Original strand, 9582711 - 9582741
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582711 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 9582741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 36817382 - 36817352
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36817382 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 36817352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 28610925 - 28610888
Alignment:
Q  50 gtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28610925 gtattgagcattttaatccgttcattttttggctttgt 28610888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 39
Target Start/End: Original strand, 14398748 - 14398776
Alignment:
Q  11 cataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14398748 cataggaggtatcaacacacttttgacgt 14398776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Original strand, 44469363 - 44469629
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44469363 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 44469462  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44469463 tctcttgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 44469562  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44469563 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 44469629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 37018748 - 37019017
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37018748 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggcactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 37018847  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  37018848 tctcttgacgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacatcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 37018947  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37018948 taggagaagatagagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 37019017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 87 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 50114037 - 50113773
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  50114037 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacagactctct 50113938  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50113937 tgacgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 50113838  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50113837 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 50113773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3944691 - 3944430
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3944691 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 3944592  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3944591 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 3944492  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3944491 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 3944430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 89 - 348
Target Start/End: Original strand, 3993201 - 3993460
Alignment:
Q  89 aagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttg 188  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3993201 aagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctcttg 3993300  T
Q  189 ataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgaga 288  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3993301 acaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctaggaga 3993400  T
Q  289 agatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3993401 agatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 3993460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Original strand, 5081716 - 5081982
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||    
T  5081716 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagatggttaaggttatgataacgctgacggac 5081815  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5081816 tctcttgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 5081915  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  5081916 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacgacaaggtatatgcctttgcttattcgcgacga 5081982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 87 - 345
Target Start/End: Original strand, 13633229 - 13633487
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  13633229 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaaggtcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgctgacggactctct 13633328  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  13633329 tgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccttgcatagacctagga 13633428  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcga 345  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13633429 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcga 13633487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8459678 - 8459409
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| || |||    
T  8459678 ttttgtcaagtgaaacatgtccgtggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaagcttatgataacgccgacagac 8459579  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  8459578 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaaccaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatacatagacc 8459479  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8459478 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatag 8459409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 20353292 - 20353553
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  20353292 tcaagtgagacatgtctaaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgctgacggactctct 20353391  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20353392 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 20353491  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||| ||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20353492 gaagataaagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 20353553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29352949 - 29352688
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29352949 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 29352850  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  29352849 tgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcattgacctagga 29352750  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
     |||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29352749 aaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 29352688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38772347 - 38772086
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  38772347 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 38772248  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38772247 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 38772148  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38772147 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttatccgcgacga 38772086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Original strand, 46978586 - 46978844
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| |||  |    
T  46978586 ttttgtcaagtgaaacatgttcgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataatgccgacgtgc 46978685  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  46978686 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgaacatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 46978785  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46978786 taggagaagatagagatgaatacacatggaaaacgacaagctatatgccttggcttatt 46978844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7966709 - 7966441
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||  ||||||    
T  7966709 ttttgtcaagtgaaacatgtctgaggttgcaaaaattgaagtccgtgttaggtactccgcttttaaaaagttaattaaggttatgataacgctgacggac 7966610  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7966609 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 7966510  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7966509 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctt-gcttattcgcgacgatag 7966441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12643926 - 12643660
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  12643926 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgtacaaattgaaaggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgatggac 12643827  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  12643826 tctcttgacgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatccacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 12643727  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12643726 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 12643660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Original strand, 51666018 - 51666276
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| || |||    
T  51666018 ttttgtcaagtgaaacatgtatgaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatcataacgccaacagac 51666117  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  51666118 tcttttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 51666217  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  51666218 taggagaagatagagatgaatacacatggaacacgacaagctatatgccttggcttatt 51666276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 1655432 - 1655701
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||    
T  1655432 ttttgtcaagtgaaacatgtacgaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggtcatgataacgccgactgac 1655531  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| || || ||||||| ||||    
T  1655532 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacatgtcgcttgtttggtaaagtgtcatgcatggacc 1655631  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1655632 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatag 1655701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19495774 - 19495504
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||    
T  19495774 ttttgtgaagtgaaacatgtctgaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgaccgac 19495675  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||    
T  19495674 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatattcc 19495575  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatg-gaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    |||||||||||||||| | || |  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19495574 tacgagaagatagagatgaatacgtatgaaaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgagacgatag 19495504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 13177478 - 13177747
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||    
T  13177478 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaagtgaaggccgtgttaggtacttcgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacaccgacggac 13177577  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  13177578 tctcttgaagatttgaaggcacaacttaacacttagtttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccattcatagacc 13177677  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||| ||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  13177678 taggagaaaatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatggcttggcttaatcgcaacgatag 13177747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 87 - 316
Target Start/End: Original strand, 41456586 - 41456815
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41456586 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 41456685  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  41456686 tgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacctagga 41456785  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacg 316  Q
    ||||||||||| | || | |||||||||||    
T  41456786 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacg 41456815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Original strand, 4517746 - 4518004
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  4517746 ttttgtcaagtgaaacatgttcaaggttgcaaaaattgaagaccgtgttagatactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacgaac 4517845  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  4517846 tctcttgatgatttgcaaacacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 4517945  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||| ||| | || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  4517946 taggagaagataaagatgaatacgcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttatt 4518004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 105 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33168612 - 33168376
Alignment:
Q  105 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcaca 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  33168612 aggttgcaaaaattgaaagccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacagttaaggttatgataacgccgaccgactctcttgatgatttgaagacaca 33168513  T
Q  205 a-cttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatg 303  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||     
T  33168512 aacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacttaggagaagatagagatgaata 33168413  T
Q  304 cacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  33168412 cgcatggaaaacaacaagctatatgccttgacttatt 33168376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9711296 - 9711032
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  9711296 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactttgcgtttacaaagacggttaaggttatgataacgccg--ggac 9711199  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  9711198 tctcttgacgatttgaaggcacaacttaacaattattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgacatgcatagacc 9711099  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9711098 taggagaagatagagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 9711032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36073091 - 36072839
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||     
T  36073091 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaatgccgttttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacagat 36072992  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36072991 tctcttgatgaattgaaggcacaacttaacact--ttttgatcatcttggtaaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 36072894  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggct 336  Q
    || |||||||||| || | || | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36072893 taagagaagatagcgatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttggct 36072839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 176 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6558528 - 6558356
Alignment:
Q  176 acggactctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgca 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  6558528 acggactctcttgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccttgca 6558429  T
Q  276 tagacctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||| ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6558428 tatacctaggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 6558356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 176 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38690535 - 38690371
Alignment:
Q  176 acggactctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38690535 acggactctcttgatgatttgaaatcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgca 38690436  T
Q  276 tagacctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38690435 tagacctaggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttatt 38690371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1180288 - 1180112
Alignment:
Q  105 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcaca 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||    
T  1180288 aggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgctgaccgactctcttgatgatttgaaggcaca 1180189  T
Q  205 acttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||| ||||    
T  1180188 agttaacacttattttgagcatattggtgaaactcaatatacacgtcacttatttgctcagatgccttgcattgacc 1180112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 348
Target Start/End: Original strand, 30909499 - 30909647
Alignment:
Q  200 gcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  30909499 gcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctaggagaagatagagatg 30909598  T
Q  300 gatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
     || | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30909599 aatacgcatggaaaacagcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 30909647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 8459958 - 8459880
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8459958 agcataagaggtatcaacacacttttgaggtaaaaaaagaggtattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 8459880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 13174051 - 13174129
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||       ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13174051 agcatatgaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacagatatttagcattttaatccgttcattttttggctttgt 13174129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 46973416 - 46973494
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  46973416 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaagtattgagcattttaattcgttcattttttggctttgt 46973494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 351
Target Start/End: Original strand, 5141446 - 5141491
Alignment:
Q  306 catggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5141446 catggaaaacggcaagctatatgcgttggcttattcgcgacgatag 5141491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 7980993 - 7980931
Alignment:
Q  17 aggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcatttttt 79  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7980993 aggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcatttttt 7980931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 36076420 - 36076342
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36076420 agcatagaagatatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattaaacattttaatccattcattttttgattttgt 36076342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 21944234 - 21944158
Alignment:
Q  11 cataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  21944234 cataggaggtatcaacacacttttaacgtaaataaacaggtattgagcattttaatcggtttattttttggatttgt 21944158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 22345472 - 22345551
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnn-caggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22345472 agcataggaggtatcaacacactttttacgtaaaaaaaacaggtattgagcattttaattcgttcattttttgattttgt 22345551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 19498970 - 19498896
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttt 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  19498970 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt-aaaaaacaggtattgagcattttaatcggtttatttttttgttt 19498896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 350
Target Start/End: Original strand, 25039640 - 25039701
Alignment:
Q  289 agatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgata 350  Q
    ||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25039640 agatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatacgccttggcttattcgcgtcgata 25039701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 4516220 - 4516299
Alignment:
Q  11 cataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnnca---ggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||        |   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4516220 cataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaaaaataggtattgagcattttaatccgttcattttttggctttgt 4516299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 6562020 - 6561990
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6562020 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 6561990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Original strand, 37015106 - 37015136
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37015106 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 37015136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 50117634 - 50117604
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50117634 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 50117604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 37
Target Start/End: Original strand, 1654959 - 1654987
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgac 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1654959 agcataggaggtatcaacacacttttgac 1654987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 37
Target Start/End: Original strand, 23914043 - 23914071
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgac 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23914043 agcataggaggtatcaacacacttttgac 23914071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 19286 - 19555
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||    
T  19286 ttttgtcaagtgaaacatgtctgaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacagac 19385  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  19386 tctcttgatgatttgaaggcacaatttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 19485  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
     | ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19486 aaggagaagatagagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgctttggcttattcgcgacgatag 19555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 15890 - 15968
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15890 agcataagaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgtgcattttaatccgttcattttttgattttgt 15968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 10616 - 10885
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10616 ttttgtcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtacttcgcgtttaaaaatacggttaaggttatgataacgccgacggac 10715  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10716 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 10815  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10816 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatag 10885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19069916 - 19069655
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19069916 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 19069817  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19069816 tgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 19069717  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19069716 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 19069655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Original strand, 11506446 - 11506704
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  11506446 ttttgtcaagtgaaacatgtccaaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacgaac 11506545  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  11506546 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 11506645  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11506646 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttgacttatt 11506704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 49564563 - 49564297
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49564563 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 49564464  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  49564463 tctcttgacaatttgaaagcacaatttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 49564364  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49564363 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 49564297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 3407596 - 3407857
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    |||||| |||| ||||  || ||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3407596 tcaagtaagacatgtctgagtttgcacaaattgaagagcgagttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 3407695  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3407696 tgacaatttgaagacacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 3407795  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3407796 gaagatagagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 3407857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38461146 - 38460888
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||    
T  38461146 ttttgtcaagtgaaacatgtatgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacagac 38461047  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||    
T  38461046 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttgatgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatatacc 38460947  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38460946 taggagaagatagagatgaatgcgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttatt 38460888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 37394555 - 37394824
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| |||||| |||| ||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37394555 ttttttcaagtaagacatgtctgaggtagcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggac 37394654  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  37394655 tctcttgacgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaaagccatgcatagacc 37394754  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37394755 taggagaagataaagatgaatacgcatggaaaacggcaagttgtatgccttggcttattcgcgacgatag 37394824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 4773957 - 4774225
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| || |||    
T  4773957 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataatgccgacagac 4774056  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||    
T  4774057 tctcttgatgatttgaatgcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttgg-caaatgtcgtgcatagacc 4774155  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4774156 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatggcttggcttatttgcgacgatag 4774225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18579354 - 18579099
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgctttt-aaaaagacggttaaagttatgataacgcccacgga 180  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| || ||    
T  18579354 ttttgtcaagtgaaacatgtctgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgctttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacaga 18579255  T
Q  181 ctctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagac 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  18579254 ctctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttatttttagcatcttgatgaaaatcaatatacacgtcacttgttttgtcaaatgtcatgcatagac 18579155  T
Q  281 ctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggct 336  Q
    ||| ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18579154 ctatgagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggct 18579099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24415872 - 24415646
Alignment:
Q  100 gtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaag 199  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||| ||||||||    
T  24415872 gtccgaggttgaaaaaattgaaggccgtgttagatactccacttttaaaaagacggttaaggttataataacgtcgaccgactctcttgatgatttgaag 24415773  T
Q  200 gcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24415772 gcacaacttaacacttattttcagcatctttgtg-aaatcaatatacatgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctaggagaagatagagatg 24415674  T
Q  300 gatgcacatggaaaacgccaagctatat 327  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||    
T  24415673 aatacacatggaaaacgacaagctatat 24415646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10374742 - 10374491
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||||    
T  10374742 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttagatactccacttttaaaaagaaaattaaggttatgataacgccgacggac 10374643  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10374642 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgaacatcttggtg------------------acttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 10374561  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10374560 taggagaagatagagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 10374491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 155 - 351
Target Start/End: Original strand, 44050505 - 44050700
Alignment:
Q  155 gttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcact 254  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44050505 gttaaggttatgataacgccgacggactctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgacaatcaatatacacgtcact 44050604  T
Q  255 tctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44050605 tgtttggtcaaatgccatgcatagacctaggagaagatagagacaaatacgcatggaaaacaacaagctatatg-tttggcttattcgcgacgatag 44050700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 349
Target Start/End: Original strand, 10422892 - 10423027
Alignment:
Q  214 ttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgcacatggaaa 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10422892 ttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatttcatgcatagacctaggagaagatagagacgaatacacatggaaa 10422991  T
Q  314 acgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgat 349  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10422992 acgacaagctatatgtcttggcttattcgcggcgat 10423027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6187365 - 6187189
Alignment:
Q  105 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcaca 204  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  6187365 aggttgcaaaaattaaagaccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgaccgactctcttgatgatttaaaggcaca 6187266  T
Q  205 acttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
      ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||| ||||| ||||| ||||    
T  6187265 cattaacgcttattttgagcatcttggtgaaactcaatatacacgtcccttatttgctcagatgccttgcattgacc 6187189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 255
Target Start/End: Original strand, 30042802 - 30042952
Alignment:
Q  105 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcaca 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||   |||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  30042802 aggttgcaaaaattgaaggccgtgttagatactcttcttttaaaaagagaattaaggttatgatgacgccgaccgactctcttgatgatttgaagacaca 30042901  T
Q  205 acttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcactt 255  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30042902 agttaacacttattttgagcatattggtgaaactcaatatacacgtcactt 30042952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 44049312 - 44049390
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44049312 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttgattttgt 44049390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 21471116 - 21471186
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcatttttt 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21471116 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcatttttt 21471186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Original strand, 4975979 - 4976055
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnn-caggtattaagcattttaatccgttcattttttggttt 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4975979 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttggttt 4976055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 17139820 - 17139896
Alignment:
Q  11 cataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  17139820 cataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatcggttcatttttagcttttgt 17139896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 4768866 - 4768944
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4768866 agcataggaggtatcaacacccttttgacgtaaaaaaacaggtatatagcattttaattcgttcatttttttgttttgt 4768944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 11494757 - 11494837
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnn--caggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||         |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11494757 agcataggaggtatccacacacttttgacgtaaaaaaaaacaggtattgaacattttaatccgttcattttttggttttgt 11494837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31599185 - 31599037
Alignment:
Q  105 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcaca 204  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||   |||| |||||| | || || |  ||| || ||| ||| |||||||||||    
T  31599185 aggttgcactaattgaaggtcgtgtctaatactctgtttttaaaaagataattaaggttatgttgactccgatcgacactattggtaagttgaaggcaca 31599086  T
Q  205 acttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcac 253  Q
    ||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31599085 acttaacaaatattttgagtatcttggtgaaaatcattatacatgtcac 31599037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 38464628 - 38464550
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||       |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38464628 agcataagaggtattagcacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaattcgttcattttttggctttgt 38464550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 19073513 - 19073483
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19073513 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 19073483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Original strand, 41023599 - 41023629
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41023599 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 41023629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 51644358 - 51644280
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||| | |||| |||| ||||||||| |||||    
T  51644358 agcatatgaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcactataattcgtttattttttggctttgt 51644280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 21178341 - 21178385
Alignment:
Q  197 aaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaa 241  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  21178341 aaggcacaacttaacagatattttgtccatcttggtgaaaatcaa 21178385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0794 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:

Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Original strand, 1103 - 1361
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  1103 ttttgtcaagtgaaacatgtccaaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacgaac 1202  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  1203 tctcttgatgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 1302  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1303 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttgacttatt 1361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 4683 - 4944
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4683 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 4782  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4783 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 4882  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4883 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 4944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 15069707 - 15069968
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15069707 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcaggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 15069806  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15069807 tgacaatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 15069906  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15069907 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 15069968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43620396 - 43620135
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  43620396 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 43620297  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43620296 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 43620197  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43620196 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 43620135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 604495 - 604234
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  604495 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 604396  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  604395 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctttga 604296  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  604295 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 604234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 30790363 - 30790624
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30790363 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 30790462  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30790463 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 30790562  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30790563 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 30790624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 42503195 - 42503456
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  42503195 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 42503294  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42503295 tgacaatttgaagacacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacctagga 42503394  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42503395 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctacatgcctttgcttattcgcgacga 42503456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 45767217 - 45767478
Alignment:
Q  87 tcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctct 186  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45767217 tcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgggttaggtactccgcgtttaaaaagacggttaaggttatgataacgccgacggactctct 45767316  T
Q  187 tgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacga 286  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  45767317 tgacaatttgaaagcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacctagga 45767416  T
Q  287 gaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45767417 gaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 45767478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12111944 - 12111686
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||    
T  12111944 ttttgtcaagtgaaacatgttcgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccaacagac 12111845  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||    
T  12111844 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttgattaaatgccatgcatagacc 12111745  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12111744 taggagaagatagaaatgaatacacatggaaaacgacaagctatatgccttggtttatt 12111686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19045027 - 19044758
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||    
T  19045027 ttttgtcaagtgaaacatgttcgaggttgcaaaaattgaagttcgtgttaggtacttcacttttaaaaagacaattaaggttatgataacgctgacggac 19044928  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19044927 tctcttgatgatttgaagacacaacttaacacttattttgagcatcttggtggaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 19044828  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | ||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19044827 taggagaagatagagaagaatatgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatag 19044758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 351
Target Start/End: Original strand, 20709609 - 20709878
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||    
T  20709609 ttttgtcaagtgaaacatgttcgaggttgcaaaaattgaagttcgtgttaggtacttcacttttaaaaagacaattaaggttatgataacgctgacggac 20709708  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20709709 tctcttgatgatttgaagacacaacttaacacttattttgagcatcttggtggaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagacc 20709808  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
    || ||||||||||||| | ||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20709809 taggagaagatagagaagaatatgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatag 20709878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 349
Target Start/End: Original strand, 47742341 - 47742608
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||    
T  47742341 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccacatttaaaaagacgattaaggttatgataacgtcgacagac 47742440  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  47742441 tctcttgacgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatacatagacc 47742540  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgat 349  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47742541 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattcgcgacgat 47742608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10705978 - 10705724
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  10705978 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggccgttttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacggac 10705879  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  10705878 tctcttgaagatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacatgtcacttgtttggtcaaatgacatgcatagacc 10705779  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggct 336  Q
    || ||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10705778 taggagaagatacagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggct 10705724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Original strand, 47064646 - 47064904
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  47064646 ttttgtcaagtgaaacatgttcgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttataataatgccgacggac 47064745  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  47064746 tctcttgatgatttgaagacacaacttaacacttattttgagtatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacc 47064845  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  47064846 tatgagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggtttatt 47064904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34623196 - 34622950
Alignment:
Q  105 aggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcaca 204  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |    
T  34623196 aggttgcacaaattgaagggtgtgttaggtactccacgtttaaaaagacggttaaggttatgataatgccgacagactctcttgatgatttgaaggcaaa 34623097  T
Q  205 acttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgc 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| || |    
T  34623096 acttaacacttattttgaacatcttggtgaaaataaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgaataaacctaggagaagataaagacgaatac 34622997  T
Q  305 acatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 351  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622996 gcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatag 34622950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 142 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29593163 - 29592954
Alignment:
Q  142 ttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggactctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaa 241  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29593163 ttttaaaaacacggttaaggttatgataactccgacggactctcttgacgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaa 29593064  T
Q  242 tatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattc 341  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29593063 tatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcatgcatagacctaggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattc 29592964  T
Q  342 gcgacgatag 351  Q
    || |||||||    
T  29592963 gcaacgatag 29592954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 178 - 348
Target Start/End: Original strand, 18109241 - 18109411
Alignment:
Q  178 ggactctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcata 277  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18109241 ggactctcttgacaatttgaaggcacaacgtaacacttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcata 18109340  T
Q  278 gacctacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    |||||| ||||| ||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18109341 gacctaggagaatatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 18109411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 47061141 - 47061219
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47061141 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 47061219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 47741951 - 47742027
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggtttt 85  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47741951 agcataggaggtatcaagacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttggtttt 47742027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 10708140 - 10708110
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10708140 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 10708110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 29593214 - 29593184
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29593214 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 29593184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Original strand, 36186008 - 36186038
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36186008 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 36186038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Original strand, 15307 - 15573
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||    
T  15307 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcaaaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttaaaaagacgattaaggttatgataacgctgacggac 15406  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  15407 tctcttgacgatttgaaggcacaacttaacactgattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgccatgcatagaca 15506  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || |  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15507 taggagaagatagagatgaatacgtatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacga 15573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Original strand, 11487 - 11517
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11487 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 11517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23135 - 22869
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  23135 ttttttcaagtgagacatgtctgaggttgcacaaattgaagggcgtgttaggtactccgcgtttagaaagacggttaaggttatgataacgccgatggac 23036  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  23035 tctcttgacgatttgaaggcacaacttaacacttattttgagcatctgggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgacatgcatagacc 22936  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacga 348  Q
    || ||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22935 taggagaagatagagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttatttgcgacga 22869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22359 - 22101
Alignment:
Q  82 ttttgtcaagtgagacgtgtccaaggttgcaaaaattgaaggtcgtgttaggtactccgcttttaaaaagacggttaaagttatgataacgcccacggac 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || | |    
T  22359 ttttgtcaagtgaaacatgtccgaggttgcaaaaattgaaggccgtgttaggtactccgcttttaaaaagacaattaaggttatgataacgccgacagcc 22260  T
Q  182 tctcttgataatttgaaggcacaacttaacacttattttgatcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttctgtggtcaaatgccatgcatagacc 281  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||    
T  22259 tctcttgatgatttgaagacacaacttaatatttattttgagcatcttggtgaaaatcaatatacacgtcacttgtttggtcaaatgtcgtgcatagacc 22160  T
Q  282 tacgagaagatagagacggatgcacatggaaaacgccaagctatatgccttggcttatt 340  Q
    || ||||||||||| | | || | ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||    
T  22159 taggagaagatagaaatgaatacgcatggaaaatgacaagttatatgtcttggcttatt 22101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 23102 - 23025
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  23102 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaat-cgctcattttttggctttgt 23025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7174 - 7096
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7174 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaacaggtattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 7096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 11602 - 11524
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnncaggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |       |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11602 agcatacgaggtatcaacacacttttgacataaaaaaacaggtattgagcattttaatcggtttattttttggttttgt 11524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1038 - 962
Alignment:
Q  12 ataggaggtatcaacacacttttgacgtnnnnnnn-caggtattaagcattttaatccgttcattttttggttttgt 87  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1038 ataggtggtatcaacacacttttgacgtaaaaaaaacagggattgagcattttaatccgttcattttttggttttgt 962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 4260 - 4230
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4260 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 4230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 17210 - 17180
Alignment:
Q  9 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17210 agcataggaggtatcaacacacttttgacgt 17180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University