View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13876_low_9 (Length: 615)

Name: NF13876_low_9
Description: NF13876
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13876_low_9
NF13876_low_9
[»] chr5 (332 HSPs)
chr5 (19-615)||(13522634-13523231)
chr5 (19-615)||(20168178-20168775)
chr5 (19-615)||(35543240-35543836)
chr5 (19-615)||(36095764-36096360)
chr5 (19-615)||(36097221-36097817)
chr5 (132-615)||(13533474-13533958)
chr5 (19-607)||(40032869-40033466)
chr5 (19-608)||(1914855-1915452)
chr5 (102-615)||(20417015-20417529)
chr5 (102-615)||(106232-106745)
chr5 (102-615)||(32753580-32754092)
chr5 (102-615)||(20624878-20625391)
chr5 (104-615)||(40228184-40228701)
chr5 (104-608)||(20215218-20215728)
chr5 (122-615)||(19478115-19478606)
chr5 (122-615)||(21702779-21703275)
chr5 (213-615)||(13404753-13405158)
chr5 (122-615)||(19464085-19464576)
chr5 (122-615)||(21705626-21706122)
chr5 (122-615)||(37406762-37407253)
chr5 (122-615)||(17446350-17446842)
chr5 (19-542)||(23487961-23488483)
chr5 (122-615)||(34782970-34783460)
chr5 (187-615)||(17457032-17457458)
chr5 (122-615)||(20797809-20798301)
chr5 (188-615)||(34062734-34063160)
chr5 (51-615)||(7031708-7032275)
chr5 (122-615)||(34772025-34772515)
chr5 (122-615)||(22559550-22560042)
chr5 (122-615)||(43043326-43043818)
chr5 (122-615)||(30069559-30070053)
chr5 (122-615)||(5290231-5290723)
chr5 (122-615)||(10754607-10755097)
chr5 (122-615)||(27622422-27622914)
chr5 (122-615)||(8521955-8522446)
chr5 (122-615)||(24983075-24983567)
chr5 (122-615)||(17607174-17607664)
chr5 (122-615)||(27603073-27603565)
chr5 (122-615)||(31348648-31349138)
chr5 (122-615)||(31359262-31359752)
chr5 (122-615)||(36084575-36085066)
chr5 (122-615)||(24925794-24926286)
chr5 (188-615)||(34052073-34052499)
chr5 (122-615)||(23406560-23407051)
chr5 (122-615)||(24808026-24808517)
chr5 (122-615)||(36228853-36229344)
chr5 (122-615)||(1121557-1122050)
chr5 (122-615)||(17617788-17618279)
chr5 (122-615)||(31418775-31419268)
chr5 (127-615)||(1108804-1109292)
chr5 (122-564)||(5300802-5301242)
chr5 (122-615)||(9377117-9377609)
chr5 (122-615)||(24816541-24817033)
chr5 (122-615)||(24827129-24827621)
chr5 (122-615)||(36687809-36688299)
chr5 (122-615)||(36698375-36698865)
chr5 (122-615)||(31844072-31844566)
chr5 (122-615)||(15693687-15694178)
chr5 (104-608)||(23477900-23478404)
chr5 (122-615)||(24567203-24567694)
chr5 (122-615)||(31448666-31449159)
chr5 (122-615)||(23306958-23307450)
chr5 (122-615)||(39352601-39353093)
chr5 (122-615)||(20551929-20552420)
chr5 (122-615)||(14446656-14447147)
chr5 (122-615)||(14457268-14457759)
chr5 (122-615)||(15740080-15740573)
chr5 (122-615)||(15769240-15769733)
chr5 (122-615)||(22146634-22147128)
chr5 (122-615)||(22157217-22157711)
chr5 (122-615)||(42395094-42395589)
chr5 (122-615)||(9346656-9347147)
chr5 (122-615)||(14040710-14041202)
chr5 (122-615)||(14557672-14558164)
chr5 (122-615)||(14568309-14568801)
chr5 (122-615)||(23296390-23296882)
chr5 (104-568)||(25112020-25112489)
chr5 (104-568)||(25171111-25171580)
chr5 (122-615)||(27460274-27460766)
chr5 (122-615)||(27470673-27471165)
chr5 (122-615)||(40390470-40390962)
chr5 (122-615)||(17719031-17719522)
chr5 (122-615)||(17729683-17730174)
chr5 (122-615)||(6130902-6131396)
chr5 (122-615)||(9336069-9336560)
chr5 (122-615)||(14030157-14030649)
chr5 (122-615)||(16003546-16004038)
chr5 (122-615)||(39490605-39491097)
chr5 (122-615)||(39501795-39502287)
chr5 (122-615)||(40401132-40401624)
chr5 (122-615)||(23707556-23708047)
chr5 (122-568)||(31833642-31834088)
chr5 (122-615)||(35215618-35216111)
chr5 (122-615)||(35226202-35226695)
chr5 (122-526)||(39364685-39365086)
chr5 (122-615)||(30227151-30227644)
chr5 (122-615)||(30237678-30238171)
chr5 (122-615)||(36582212-36582705)
chr5 (122-615)||(36592767-36593260)
chr5 (122-615)||(42042898-42043389)
chr5 (122-615)||(42053473-42053964)
chr5 (122-615)||(22676229-22676722)
chr5 (122-615)||(22686120-22686613)
chr5 (122-615)||(23362223-23362716)
chr5 (122-615)||(15992984-15993476)
chr5 (122-615)||(27041867-27042359)
chr5 (122-568)||(27052491-27052935)
chr5 (122-615)||(27203906-27204397)
chr5 (122-615)||(40513644-40514137)
chr5 (122-615)||(6975921-6976414)
chr5 (122-615)||(6986411-6986904)
chr5 (122-615)||(33951455-33951948)
chr5 (122-615)||(37728907-37729399)
chr5 (122-615)||(37740223-37740715)
chr5 (122-528)||(20562526-20562930)
chr5 (104-337)||(32160274-32160513)
chr5 (49-216)||(13403700-13403870)
chr5 (122-544)||(23696969-23697389)
chr5 (106-304)||(11208417-11208619)
chr5 (461-615)||(21414191-21414345)
chr5 (19-160)||(40228067-40228210)
chr5 (19-130)||(13533391-13533502)
chr5 (19-162)||(20417499-20417638)
chr5 (19-162)||(32753471-32753610)
chr5 (122-413)||(43621549-43621837)
chr5 (19-160)||(20215702-20215844)
chr5 (19-162)||(106715-106855)
chr5 (20-160)||(23477786-23477926)
chr5 (19-162)||(21420287-21420427)
chr5 (462-615)||(43621853-43622006)
chr5 (100-234)||(22586466-22586600)
chr5 (122-234)||(643184-643297)
chr5 (19-162)||(20625361-20625502)
chr5 (99-234)||(20968730-20968866)
chr5 (122-234)||(21199484-21199597)
chr5 (362-608)||(11208087-11208334)
chr5 (122-273)||(2156717-2156870)
chr5 (122-234)||(9399099-9399212)
chr5 (122-234)||(20550434-20550547)
chr5 (122-234)||(21072720-21072833)
chr5 (122-234)||(23880606-23880719)
chr5 (122-234)||(28464821-28464936)
chr5 (362-608)||(32160554-32160801)
chr5 (122-234)||(23413457-23413571)
chr5 (444-608)||(89524-89689)
chr5 (122-234)||(12353279-12353391)
chr5 (104-236)||(20567330-20567462)
chr5 (122-234)||(34637996-34638109)
chr5 (134-234)||(3245925-3246028)
chr5 (122-234)||(19536781-19536895)
chr5 (122-234)||(26765043-26765157)
chr5 (122-234)||(30116320-30116435)
chr5 (51-162)||(9336550-9336663)
chr5 (51-162)||(9347137-9347250)
chr5 (51-162)||(15992881-15992994)
chr5 (51-162)||(16003443-16003556)
chr5 (51-162)||(23362706-23362819)
chr5 (51-162)||(27602970-27603083)
chr5 (51-162)||(36582109-36582222)
chr5 (51-162)||(36592664-36592777)
chr5 (51-162)||(39353083-39353196)
chr5 (51-162)||(39365076-39365189)
chr5 (51-162)||(40390952-40391065)
chr5 (51-162)||(40401614-40401727)
chr5 (100-234)||(24019140-24019274)
chr5 (133-226)||(25097318-25097412)
chr5 (133-226)||(25155288-25155382)
chr5 (122-231)||(89907-90019)
chr5 (150-234)||(6498806-6498891)
chr5 (122-234)||(16607053-16607166)
chr5 (51-162)||(17446248-17446360)
chr5 (150-234)||(21100186-21100271)
chr5 (62-160)||(25112463-25112562)
chr5 (62-160)||(25171554-25171653)
chr5 (51-162)||(34052556-34052668)
chr5 (51-162)||(34063217-34063329)
chr5 (51-162)||(37407243-37407355)
chr5 (122-234)||(4886562-4886676)
chr5 (134-234)||(10848323-10848426)
chr5 (122-234)||(13546008-13546122)
chr5 (122-234)||(21659750-21659865)
chr5 (135-226)||(23589269-23589360)
chr5 (122-234)||(26783893-26784008)
chr5 (122-234)||(33932807-33932921)
chr5 (122-234)||(35932490-35932605)
chr5 (51-162)||(6131386-6131499)
chr5 (51-162)||(6976404-6976519)
chr5 (51-162)||(6986894-6987009)
chr5 (51-162)||(20798291-20798404)
chr5 (446-608)||(21072342-21072505)
chr5 (51-162)||(22147118-22147230)
chr5 (51-162)||(22157701-22157813)
chr5 (51-162)||(22676712-22676827)
chr5 (51-162)||(22686603-22686718)
chr5 (51-162)||(23296872-23296987)
chr5 (51-162)||(23307440-23307555)
chr5 (51-162)||(23708037-23708152)
chr5 (51-162)||(27622319-27622432)
chr5 (51-162)||(30227046-30227161)
chr5 (51-162)||(30237573-30237688)
chr5 (51-162)||(31419258-31419371)
chr5 (133-234)||(31589458-31589561)
chr5 (51-162)||(33951350-33951465)
chr5 (51-162)||(39490500-39490615)
chr5 (51-162)||(39501690-39501805)
chr5 (51-162)||(40513539-40513654)
chr5 (51-162)||(42043379-42043494)
chr5 (51-162)||(42053954-42054069)
chr5 (122-234)||(7746177-7746291)
chr5 (122-273)||(14086982-14087138)
chr5 (51-147)||(17456864-17456962)
chr5 (51-162)||(5290127-5290241)
chr5 (51-162)||(5300698-5300812)
chr5 (122-231)||(6512916-6513028)
chr5 (103-234)||(26120310-26120441)
chr5 (122-234)||(28139146-28139260)
chr5 (122-234)||(35986716-35986831)
chr5 (99-234)||(39799359-39799494)
chr5 (51-162)||(22560032-22560145)
chr5 (400-525)||(23372718-23372845)
chr5 (51-162)||(23407041-23407154)
chr5 (51-162)||(23697379-23697494)
chr5 (51-162)||(27204387-27204500)
chr5 (51-162)||(31834078-31834195)
chr5 (51-162)||(31844556-31844673)
chr5 (51-162)||(34772505-34772618)
chr5 (51-162)||(34783450-34783563)
chr5 (51-162)||(36229334-36229447)
chr5 (51-162)||(37728803-37728917)
chr5 (51-162)||(37740119-37740233)
chr5 (51-162)||(42395579-42395692)
chr5 (51-162)||(43043223-43043336)
chr5 (463-608)||(9398836-9398982)
chr5 (52-162)||(14557568-14557682)
chr5 (52-162)||(14568205-14568319)
chr5 (100-234)||(34637094-34637226)
chr5 (149-234)||(9088535-9088622)
chr5 (149-234)||(15516536-15516623)
chr5 (164-273)||(25930598-25930710)
chr5 (133-234)||(26056009-26056109)
chr5 (51-162)||(30069455-30069569)
chr5 (149-234)||(31117445-31117532)
chr5 (122-234)||(23392088-23392203)
chr5 (134-234)||(31146118-31146221)
chr5 (51-162)||(1121454-1121567)
chr5 (51-162)||(9377013-9377127)
chr5 (51-162)||(10755087-10755200)
chr5 (51-162)||(14030639-14030753)
chr5 (51-162)||(14041192-14041306)
chr5 (51-162)||(14446552-14446666)
chr5 (51-162)||(14457164-14457278)
chr5 (51-162)||(15693583-15693697)
chr5 (51-162)||(15740563-15740677)
chr5 (51-162)||(15769723-15769837)
chr5 (51-162)||(17607654-17607768)
chr5 (51-162)||(17618269-17618383)
chr5 (51-162)||(17719512-17719626)
chr5 (51-162)||(17730164-17730278)
chr5 (51-162)||(24567684-24567798)
chr5 (51-162)||(24816437-24816551)
chr5 (51-162)||(24827025-24827139)
chr5 (51-162)||(27041763-27041877)
chr5 (51-162)||(27052387-27052501)
chr5 (51-162)||(27460756-27460870)
chr5 (51-162)||(27471155-27471269)
chr5 (51-162)||(31349128-31349242)
chr5 (51-162)||(31359742-31359856)
chr5 (51-162)||(31449149-31449262)
chr5 (51-162)||(35216101-35216215)
chr5 (51-162)||(35226685-35226799)
chr5 (19-161)||(11208594-11208736)
chr5 (103-229)||(12078386-12078514)
chr5 (444-608)||(33022538-33022699)
chr5 (51-162)||(8522436-8522550)
chr5 (122-234)||(13736618-13736733)
chr5 (166-234)||(22000539-22000608)
chr5 (19-160)||(32160158-32160300)
chr5 (51-147)||(1108696-1108795)
chr5 (126-234)||(17814508-17814619)
chr5 (122-234)||(30742521-30742635)
chr5 (51-162)||(43621445-43621559)
chr5 (51-162)||(21702676-21702789)
chr5 (51-162)||(23392996-23393109)
chr5 (51-162)||(24808507-24808621)
chr5 (486-608)||(26784266-26784389)
chr5 (51-162)||(36085056-36085169)
chr5 (51-162)||(36688289-36688403)
chr5 (51-162)||(36698855-36698969)
chr5 (444-608)||(21910426-21910591)
chr5 (444-608)||(23880937-23881102)
chr5 (122-231)||(31487775-31487886)
chr5 (134-234)||(11993441-11993543)
chr5 (51-162)||(20552410-20552524)
chr5 (51-162)||(20562920-20563034)
chr5 (445-608)||(29138508-29138672)
chr5 (134-234)||(29138889-29138991)
chr5 (122-234)||(33022204-33022319)
chr5 (122-225)||(23392903-23393006)
chr5 (195-234)||(25740725-25740764)
chr5 (486-608)||(28139519-28139642)
chr5 (486-608)||(41566536-41566659)
chr5 (51-162)||(24925689-24925804)
chr5 (51-162)||(24982970-24983085)
chr5 (101-162)||(19464566-19464626)
chr5 (101-162)||(19478596-19478656)
chr5 (546-615)||(23392830-23392898)
chr5 (122-234)||(42243220-42243335)
chr5 (104-160)||(12078357-12078413)
chr5 (445-608)||(26759021-26759184)
chr5 (537-608)||(35986334-35986406)
chr5 (486-608)||(4886934-4887057)
chr5 (86-162)||(21705559-21705636)
chr5 (486-567)||(13545655-13545737)
chr5 (444-608)||(21660081-21660247)
chr5 (546-615)||(20562454-20562522)
chr5 (444-533)||(25740993-25741082)
chr5 (102-130)||(6976376-6976404)
chr5 (102-130)||(6986866-6986894)
chr5 (537-608)||(10848736-10848808)
chr5 (102-130)||(22676684-22676712)
chr5 (102-130)||(22686575-22686603)
chr5 (102-130)||(23296844-23296872)
chr5 (102-130)||(23307412-23307440)
chr5 (102-130)||(23708009-23708037)
chr5 (102-130)||(30227161-30227189)
chr5 (102-130)||(30237688-30237716)
chr5 (102-130)||(33951465-33951493)
chr5 (102-130)||(39490615-39490643)
chr5 (102-130)||(39501805-39501833)
chr5 (102-130)||(40513654-40513682)
chr5 (102-130)||(42043351-42043379)
chr5 (102-130)||(42053926-42053954)
[»] chr1 (262 HSPs)
chr1 (19-615)||(46180916-46181512)
chr1 (26-615)||(20883919-20884508)
chr1 (104-615)||(23926591-23927103)
chr1 (19-615)||(28473673-28474272)
chr1 (102-615)||(22610011-22610524)
chr1 (19-608)||(44200455-44201049)
chr1 (19-615)||(20251216-20251819)
chr1 (195-615)||(20798689-20799109)
chr1 (102-615)||(14388163-14388677)
chr1 (102-615)||(5929234-5929748)
chr1 (122-615)||(41132652-41133148)
chr1 (102-615)||(675103-675616)
chr1 (102-615)||(18311009-18311522)
chr1 (19-380)||(45070900-45071262)
chr1 (67-615)||(52350721-52351271)
chr1 (102-615)||(20195730-20196241)
chr1 (103-615)||(19037533-19038052)
chr1 (122-446)||(20867059-20867383)
chr1 (122-615)||(11195104-11195597)
chr1 (104-615)||(28379522-28380040)
chr1 (122-608)||(22018877-22019374)
chr1 (51-615)||(9050525-9051090)
chr1 (51-615)||(23580363-23580928)
chr1 (104-608)||(22655004-22655515)
chr1 (103-608)||(22642421-22642933)
chr1 (122-615)||(47194940-47195431)
chr1 (104-608)||(26548299-26548810)
chr1 (122-615)||(18381941-18382433)
chr1 (104-608)||(17370569-17371080)
chr1 (132-615)||(20441354-20441835)
chr1 (122-615)||(17956917-17957409)
chr1 (122-615)||(7689496-7689988)
chr1 (104-608)||(19170376-19170879)
chr1 (405-611)||(45070694-45070900)
chr1 (188-615)||(39586714-39587139)
chr1 (122-615)||(4250602-4251093)
chr1 (122-615)||(39194131-39194622)
chr1 (122-615)||(35012606-35013092)
chr1 (122-615)||(19187516-19188008)
chr1 (122-615)||(154326-154817)
chr1 (122-615)||(4166937-4167429)
chr1 (122-615)||(4177593-4178085)
chr1 (122-615)||(19178637-19179129)
chr1 (122-615)||(38094754-38095247)
chr1 (122-615)||(38105379-38105872)
chr1 (122-615)||(51629224-51629716)
chr1 (122-615)||(51656485-51656977)
chr1 (122-615)||(148251-148742)
chr1 (188-615)||(5973502-5973933)
chr1 (122-615)||(5832896-5833389)
chr1 (122-615)||(5843498-5843991)
chr1 (122-615)||(10997821-10998313)
chr1 (84-568)||(21543547-21544027)
chr1 (122-615)||(47607967-47608460)
chr1 (122-615)||(47618575-47619068)
chr1 (122-615)||(12898020-12898510)
chr1 (122-615)||(3171300-3171793)
chr1 (122-615)||(3181902-3182395)
chr1 (122-615)||(7506980-7507472)
chr1 (122-615)||(7517577-7518069)
chr1 (122-615)||(12623818-12624310)
chr1 (122-615)||(35648727-35649220)
chr1 (122-615)||(21877444-21877937)
chr1 (122-615)||(12614353-12614845)
chr1 (122-615)||(12730225-12730717)
chr1 (122-615)||(12740818-12741310)
chr1 (122-615)||(21863339-21863831)
chr1 (122-615)||(33084240-33084732)
chr1 (122-615)||(36236467-36236958)
chr1 (122-615)||(36247014-36247505)
chr1 (122-615)||(5639747-5640239)
chr1 (122-615)||(5650304-5650796)
chr1 (122-615)||(35404428-35404921)
chr1 (122-615)||(2538214-2538705)
chr1 (122-615)||(35638075-35638567)
chr1 (164-568)||(24028768-24029177)
chr1 (204-615)||(21894963-21895372)
chr1 (19-162)||(22610494-22610637)
chr1 (19-307)||(7745438-7745718)
chr1 (19-160)||(5929122-5929262)
chr1 (104-337)||(34255831-34256069)
chr1 (19-162)||(674994-675133)
chr1 (259-615)||(35401201-35401559)
chr1 (19-162)||(41133138-41133277)
chr1 (19-160)||(23926474-23926617)
chr1 (19-162)||(14388647-14388788)
chr1 (19-160)||(28379405-28379548)
chr1 (102-256)||(12944867-12945020)
chr1 (19-162)||(18311492-18311633)
chr1 (19-160)||(19170853-19170995)
chr1 (122-234)||(10756968-10757081)
chr1 (19-160)||(22018743-22018885)
chr1 (19-160)||(26548784-26548926)
chr1 (122-234)||(17025386-17025499)
chr1 (19-162)||(20196211-20196351)
chr1 (128-234)||(18130434-18130542)
chr1 (122-234)||(26702552-26702665)
chr1 (103-234)||(26280474-26280606)
chr1 (62-160)||(22642318-22642418)
chr1 (19-162)||(12944757-12944897)
chr1 (122-234)||(14263854-14263969)
chr1 (463-608)||(10757313-10757459)
chr1 (122-234)||(12624977-12625090)
chr1 (122-234)||(7309360-7309475)
chr1 (19-162)||(11195587-11195728)
chr1 (147-234)||(17018149-17018237)
chr1 (122-234)||(23024334-23024449)
chr1 (122-234)||(25448980-25449095)
chr1 (122-234)||(30892635-30892750)
chr1 (21-160)||(17370455-17370595)
chr1 (136-234)||(18517583-18517682)
chr1 (100-234)||(27858262-27858397)
chr1 (128-234)||(2819733-2819838)
chr1 (122-234)||(48703745-48703859)
chr1 (122-235)||(7677522-7677635)
chr1 (122-234)||(21121488-21121603)
chr1 (134-234)||(21135584-21135687)
chr1 (122-234)||(42284182-42284297)
chr1 (51-162)||(4177490-4177603)
chr1 (51-162)||(5640229-5640342)
chr1 (51-162)||(5650786-5650899)
chr1 (51-162)||(10998303-10998416)
chr1 (51-162)||(12614835-12614948)
chr1 (51-162)||(12624300-12624413)
chr1 (51-162)||(12730122-12730235)
chr1 (51-162)||(12740715-12740828)
chr1 (51-162)||(12898500-12898613)
chr1 (51-162)||(19178534-19178647)
chr1 (51-162)||(19187413-19187526)
chr1 (51-162)||(21863236-21863349)
chr1 (51-162)||(21877341-21877454)
chr1 (51-162)||(35638557-35638670)
chr1 (122-234)||(2268072-2268186)
chr1 (124-234)||(2834230-2834343)
chr1 (149-234)||(14293107-14293193)
chr1 (100-234)||(26703099-26703233)
chr1 (100-234)||(31358851-31358983)
chr1 (122-234)||(36133744-36133858)
chr1 (51-162)||(33084136-33084250)
chr1 (122-234)||(10250528-10250642)
chr1 (103-234)||(16233552-16233684)
chr1 (122-234)||(16235732-16235846)
chr1 (122-234)||(22202157-22202272)
chr1 (122-234)||(35039707-35039822)
chr1 (122-234)||(44824185-44824299)
chr1 (122-234)||(46088530-46088645)
chr1 (51-162)||(7506875-7506990)
chr1 (51-162)||(7517472-7517587)
chr1 (100-231)||(8698380-8698510)
chr1 (101-160)||(19037501-19037560)
chr1 (124-233)||(23053918-23054026)
chr1 (51-162)||(35012503-35012616)
chr1 (51-162)||(35404911-35405026)
chr1 (51-162)||(35649210-35649325)
chr1 (51-162)||(36236948-36237063)
chr1 (51-162)||(36247495-36247610)
chr1 (51-162)||(38094649-38094764)
chr1 (51-162)||(38105274-38105389)
chr1 (132-234)||(21684477-21684579)
chr1 (51-147)||(39586546-39586644)
chr1 (51-162)||(7689978-7690094)
chr1 (51-162)||(18382423-18382535)
chr1 (122-234)||(18614461-18614573)
chr1 (122-234)||(20908954-20909066)
chr1 (122-231)||(21984137-21984249)
chr1 (122-234)||(22153400-22153513)
chr1 (133-234)||(23036930-23037034)
chr1 (149-234)||(33256773-33256861)
chr1 (149-234)||(33276945-33277033)
chr1 (122-234)||(12283966-12284081)
chr1 (122-234)||(21205296-21205411)
chr1 (122-234)||(21215100-21215215)
chr1 (122-234)||(21702355-21702470)
chr1 (122-234)||(22427761-22427875)
chr1 (122-234)||(29215337-29215451)
chr1 (51-162)||(2538110-2538224)
chr1 (51-162)||(3171196-3171310)
chr1 (51-162)||(3181798-3181912)
chr1 (51-162)||(51629706-51629821)
chr1 (51-162)||(51656967-51657082)
chr1 (133-234)||(18897017-18897118)
chr1 (124-229)||(20110377-20110482)
chr1 (149-230)||(21028365-21028447)
chr1 (149-234)||(21192288-21192374)
chr1 (124-234)||(32786363-32786475)
chr1 (62-161)||(34256043-34256142)
chr1 (122-234)||(37640550-37640666)
chr1 (51-162)||(148732-148846)
chr1 (149-234)||(30571765-30571853)
chr1 (122-234)||(1577407-1577522)
chr1 (51-147)||(20441849-20441948)
chr1 (444-567)||(22464892-22465016)
chr1 (134-234)||(48570654-48570756)
chr1 (51-162)||(5832792-5832906)
chr1 (51-162)||(5843394-5843508)
chr1 (51-162)||(5973333-5973446)
chr1 (103-229)||(9346298-9346425)
chr1 (122-233)||(19215155-19215268)
chr1 (164-234)||(19717108-19717179)
chr1 (51-144)||(47194778-47194873)
chr1 (463-608)||(32785979-32786125)
chr1 (51-162)||(154807-154921)
chr1 (444-608)||(1900218-1900383)
chr1 (468-608)||(7745132-7745273)
chr1 (122-234)||(2266640-2266753)
chr1 (122-234)||(2327859-2327975)
chr1 (104-160)||(22642392-22642448)
chr1 (86-162)||(4166870-4166947)
chr1 (122-221)||(22600625-22600726)
chr1 (51-162)||(47608450-47608564)
chr1 (51-162)||(47619058-47619172)
chr1 (17-59)||(19037417-19037459)
chr1 (100-162)||(19965768-19965829)
chr1 (463-608)||(22600224-22600370)
chr1 (19-61)||(23059006-23059048)
chr1 (467-608)||(25448608-25448750)
chr1 (51-162)||(17956813-17956927)
chr1 (444-567)||(23036612-23036736)
chr1 (122-234)||(38282106-38282220)
chr1 (53-162)||(39194612-39194725)
chr1 (51-162)||(4251083-4251200)
chr1 (556-615)||(23064935-23064994)
chr1 (444-608)||(1577740-1577905)
chr1 (122-228)||(1899887-1899995)
chr1 (463-608)||(22153749-22153895)
chr1 (487-608)||(33256393-33256515)
chr1 (487-608)||(33276565-33276687)
chr1 (51-160)||(7677419-7677530)
chr1 (444-517)||(12624690-12624763)
chr1 (444-608)||(22201778-22201943)
chr1 (106-159)||(22639779-22639832)
chr1 (198-234)||(22639898-22639934)
chr1 (122-162)||(35895705-35895745)
chr1 (444-603)||(38282440-38282600)
chr1 (444-516)||(48704077-48704149)
chr1 (548-615)||(12946818-12946885)
chr1 (195-234)||(18515612-18515651)
chr1 (486-608)||(21702729-21702852)
chr1 (122-226)||(22465241-22465347)
chr1 (195-234)||(25398988-25399027)
chr1 (195-234)||(28492824-28492863)
chr1 (122-160)||(22654992-22655030)
chr1 (446-567)||(35401683-35401805)
chr1 (463-608)||(42284520-42284666)
chr1 (463-567)||(7309712-7309817)
chr1 (486-555)||(17400891-17400960)
chr1 (444-608)||(22427399-22427564)
chr1 (537-605)||(34255561-34255630)
chr1 (464-608)||(35040059-35040204)
chr1 (445-608)||(2327482-2327646)
chr1 (102-130)||(2538224-2538252)
chr1 (102-130)||(7506990-7507018)
chr1 (102-130)||(7517587-7517615)
chr1 (51-98)||(16710408-16710456)
chr1 (537-608)||(19215578-19215650)
chr1 (444-608)||(21028667-21028831)
chr1 (445-608)||(36134064-36134228)
chr1 (102-130)||(36236920-36236948)
chr1 (102-130)||(36247467-36247495)
chr1 (102-130)||(41133110-41133138)
chr1 (537-608)||(46088955-46089027)
chr1 (102-162)||(47194891-47194950)
[»] chr4 (240 HSPs)
chr4 (19-615)||(23508781-23509377)
chr4 (19-615)||(16819373-16819970)
chr4 (102-611)||(18774680-18775191)
chr4 (51-615)||(8997277-8997830)
chr4 (19-615)||(14778463-14779064)
chr4 (102-615)||(55651071-55651584)
chr4 (19-615)||(14710799-14711400)
chr4 (122-615)||(18007080-18007577)
chr4 (102-615)||(49001978-49002492)
chr4 (102-615)||(11535593-11536105)
chr4 (67-615)||(17993814-17994364)
chr4 (103-564)||(19241771-19242235)
chr4 (102-615)||(10300283-10300794)
chr4 (19-608)||(36210136-36210731)
chr4 (102-615)||(11514783-11515295)
chr4 (102-615)||(31266797-31267303)
chr4 (51-615)||(47152079-47152642)
chr4 (164-615)||(24713241-24713690)
chr4 (122-615)||(5873139-5873629)
chr4 (122-615)||(10695409-10695899)
chr4 (131-615)||(4987051-4987533)
chr4 (122-615)||(3370483-3370975)
chr4 (187-615)||(19581074-19581500)
chr4 (122-614)||(16317099-16317589)
chr4 (122-615)||(3390223-3390715)
chr4 (122-615)||(10909176-10909668)
chr4 (122-615)||(14836103-14836593)
chr4 (122-615)||(18752490-18752980)
chr4 (122-615)||(27814944-27815436)
chr4 (122-615)||(18077905-18078397)
chr4 (122-615)||(16304875-16305366)
chr4 (122-615)||(5022505-5022995)
chr4 (122-615)||(18763100-18763590)
chr4 (104-608)||(33377933-33378444)
chr4 (122-615)||(25656904-25657395)
chr4 (122-615)||(36018105-36018597)
chr4 (122-615)||(36028658-36029150)
chr4 (122-615)||(40470587-40471078)
chr4 (122-615)||(40454348-40454840)
chr4 (122-615)||(48370900-48371392)
chr4 (122-615)||(15561078-15561570)
chr4 (122-615)||(24028084-24028576)
chr4 (122-615)||(450345-450837)
chr4 (122-615)||(55745251-55745743)
chr4 (122-615)||(55755862-55756354)
chr4 (122-615)||(24640017-24640509)
chr4 (122-615)||(16255634-16256130)
chr4 (122-615)||(16266227-16266723)
chr4 (122-613)||(17917821-17918311)
chr4 (122-613)||(17928469-17928959)
chr4 (122-615)||(10751167-10751659)
chr4 (122-615)||(10964936-10965428)
chr4 (122-615)||(49517904-49518396)
chr4 (122-615)||(14843652-14844144)
chr4 (122-615)||(30937071-30937563)
chr4 (122-615)||(4948106-4948596)
chr4 (122-615)||(18130238-18130731)
chr4 (122-615)||(10740593-10741085)
chr4 (122-615)||(10954362-10954854)
chr4 (122-614)||(22006780-22007271)
chr4 (122-615)||(460926-461418)
chr4 (122-615)||(27656369-27656862)
chr4 (122-615)||(27666942-27667435)
chr4 (122-615)||(19944326-19944818)
chr4 (122-615)||(19954961-19955453)
chr4 (122-614)||(21996182-21996673)
chr4 (122-615)||(30926493-30926985)
chr4 (122-615)||(52703557-52704049)
chr4 (400-615)||(15207413-15207627)
chr4 (104-306)||(1671908-1672114)
chr4 (19-160)||(19241657-19241798)
chr4 (19-160)||(18007569-18007710)
chr4 (19-160)||(18775163-18775304)
chr4 (19-162)||(49002462-49002601)
chr4 (19-162)||(55650962-55651101)
chr4 (122-338)||(29041934-29042147)
chr4 (19-162)||(11514673-11514813)
chr4 (122-338)||(15207664-15207879)
chr4 (19-162)||(31267273-31267414)
chr4 (19-126)||(18775514-18775621)
chr4 (19-162)||(11535483-11535623)
chr4 (103-234)||(19889443-19889575)
chr4 (19-162)||(10300173-10300313)
chr4 (122-234)||(3105879-3105993)
chr4 (196-306)||(1674476-1674589)
chr4 (133-234)||(55379859-55379961)
chr4 (122-234)||(23750062-23750175)
chr4 (124-272)||(17057534-17057683)
chr4 (104-234)||(16939548-16939681)
chr4 (122-234)||(15014845-15014958)
chr4 (107-234)||(2651338-2651466)
chr4 (122-217)||(18775815-18775911)
chr4 (122-234)||(40860207-40860322)
chr4 (122-234)||(14605364-14605478)
chr4 (133-234)||(17788498-17788600)
chr4 (122-234)||(56034109-56034223)
chr4 (122-234)||(41115216-41115329)
chr4 (127-234)||(13890374-13890482)
chr4 (122-234)||(14154455-14154569)
chr4 (122-234)||(17399134-17399249)
chr4 (122-234)||(19912338-19912453)
chr4 (51-162)||(450242-450355)
chr4 (51-162)||(4948003-4948116)
chr4 (51-162)||(15561560-15561673)
chr4 (51-162)||(18752970-18753083)
chr4 (51-162)||(18763580-18763693)
chr4 (51-162)||(19944808-19944921)
chr4 (51-162)||(19955443-19955556)
chr4 (51-162)||(21996079-21996192)
chr4 (51-162)||(22006677-22006790)
chr4 (51-162)||(30926975-30927088)
chr4 (51-162)||(30937553-30937666)
chr4 (51-162)||(52703454-52703567)
chr4 (133-234)||(11915251-11915353)
chr4 (122-234)||(12811635-12811749)
chr4 (133-234)||(14902906-14903008)
chr4 (122-228)||(23123057-23123166)
chr4 (51-162)||(5873037-5873149)
chr4 (51-162)||(17917717-17917831)
chr4 (51-162)||(17928365-17928479)
chr4 (122-234)||(20571458-20571571)
chr4 (62-160)||(33377860-33377959)
chr4 (444-608)||(55380158-55380323)
chr4 (122-234)||(6641221-6641336)
chr4 (106-234)||(7222033-7222160)
chr4 (122-234)||(9751999-9752114)
chr4 (122-234)||(10072470-10072584)
chr4 (122-234)||(17701215-17701330)
chr4 (122-234)||(22190382-22190497)
chr4 (122-234)||(29120902-29121016)
chr4 (122-234)||(37986070-37986185)
chr4 (126-234)||(54679468-54679579)
chr4 (51-162)||(460823-460936)
chr4 (51-162)||(14844134-14844247)
chr4 (51-162)||(16255532-16255644)
chr4 (51-162)||(16266125-16266237)
chr4 (51-162)||(16304772-16304885)
chr4 (51-162)||(16316996-16317109)
chr4 (51-162)||(18078387-18078502)
chr4 (51-162)||(18130721-18130836)
chr4 (51-162)||(27656264-27656379)
chr4 (51-162)||(27666837-27666952)
chr4 (51-162)||(27815426-27815539)
chr4 (133-234)||(37436000-37436103)
chr4 (51-162)||(40454830-40454943)
chr4 (51-162)||(40471068-40471181)
chr4 (51-162)||(48370797-48370910)
chr4 (124-234)||(8105177-8105289)
chr4 (133-234)||(13693360-13693459)
chr4 (122-234)||(14904816-14904930)
chr4 (150-227)||(15135296-15135374)
chr4 (122-235)||(3500111-3500227)
chr4 (122-234)||(10661625-10661738)
chr4 (51-162)||(10695307-10695419)
chr4 (122-234)||(10875770-10875883)
chr4 (51-162)||(15207869-15207981)
chr4 (51-162)||(19580906-19581018)
chr4 (51-162)||(24028566-24028682)
chr4 (122-234)||(12600295-12600410)
chr4 (122-234)||(16853041-16853155)
chr4 (122-234)||(39420195-39420310)
chr4 (132-239)||(39532170-39532277)
chr4 (122-233)||(4986790-4986901)
chr4 (51-162)||(10909073-10909186)
chr4 (51-162)||(24639913-24640027)
chr4 (50-147)||(24713092-24713191)
chr4 (51-162)||(25008561-25008674)
chr4 (51-162)||(25656801-25656914)
chr4 (51-162)||(29042137-29042251)
chr4 (51-162)||(55745733-55745847)
chr4 (51-162)||(55756344-55756458)
chr4 (100-234)||(18473548-18473682)
chr4 (51-162)||(3370379-3370493)
chr4 (51-162)||(3390119-3390233)
chr4 (122-234)||(11900729-11900842)
chr4 (444-608)||(23750390-23750555)
chr4 (122-234)||(3395127-3395241)
chr4 (51-159)||(5022402-5022512)
chr4 (122-234)||(6517023-6517137)
chr4 (122-234)||(13576576-13576690)
chr4 (122-234)||(20976994-20977109)
chr4 (122-234)||(22675982-22676097)
chr4 (122-234)||(25651555-25651669)
chr4 (122-234)||(29681005-29681120)
chr4 (122-234)||(45832922-45833036)
chr4 (122-234)||(55731383-55731497)
chr4 (51-162)||(4986891-4987004)
chr4 (51-162)||(10741075-10741189)
chr4 (51-162)||(10954844-10954958)
chr4 (122-234)||(21350659-21350773)
chr4 (51-162)||(36018001-36018115)
chr4 (51-162)||(36028554-36028668)
chr4 (51-162)||(49517800-49517914)
chr4 (149-234)||(17539965-17540051)
chr4 (444-608)||(10072803-10072968)
chr4 (463-567)||(12600645-12600750)
chr4 (486-608)||(3395500-3395623)
chr4 (51-159)||(10751652-10751763)
chr4 (51-159)||(10965421-10965532)
chr4 (122-234)||(15475603-15475718)
chr4 (122-234)||(16631978-16632093)
chr4 (150-234)||(19884267-19884353)
chr4 (150-234)||(38513442-38513529)
chr4 (444-608)||(14604985-14605147)
chr4 (51-162)||(14836583-14836696)
chr4 (103-227)||(18773577-18773702)
chr4 (486-608)||(19884612-19884735)
chr4 (136-234)||(17526841-17526938)
chr4 (100-234)||(18394060-18394193)
chr4 (173-234)||(36470418-36470480)
chr4 (122-234)||(8685901-8686014)
chr4 (444-608)||(37985690-37985855)
chr4 (133-234)||(56533520-56533625)
chr4 (445-608)||(17398752-17398916)
chr4 (122-234)||(19665903-19666018)
chr4 (51-142)||(19143504-19143598)
chr4 (122-234)||(27189101-27189218)
chr4 (488-608)||(6517397-6517518)
chr4 (106-226)||(9266801-9266920)
chr4 (132-273)||(10328797-10328939)
chr4 (444-608)||(10692719-10692884)
chr4 (444-608)||(10906485-10906650)
chr4 (195-273)||(16324933-16325013)
chr4 (122-231)||(19621522-19621634)
chr4 (463-567)||(22675640-22675745)
chr4 (445-608)||(3105497-3105661)
chr4 (104-160)||(24619175-24619231)
chr4 (133-175)||(16325019-16325061)
chr4 (463-517)||(41114939-41114993)
chr4 (444-533)||(3483598-3483687)
chr4 (444-517)||(37435705-37435778)
chr4 (19-103)||(10290264-10290344)
chr4 (445-608)||(12811253-12811417)
chr4 (444-552)||(17247111-17247219)
chr4 (102-134)||(17928479-17928511)
chr4 (102-130)||(18130693-18130721)
chr4 (537-608)||(20977418-20977490)
chr4 (102-130)||(24640027-24640055)
chr4 (102-130)||(27656379-27656407)
chr4 (102-130)||(27666952-27666980)
[»] chr7 (286 HSPs)
chr7 (19-615)||(24882494-24883090)
chr7 (102-615)||(29589705-29590219)
chr7 (122-615)||(3476414-3476907)
chr7 (102-615)||(26209622-26210135)
chr7 (122-615)||(15216050-15216543)
chr7 (102-615)||(13682033-13682547)
chr7 (102-615)||(18440909-18441422)
chr7 (102-615)||(18418828-18419341)
chr7 (100-615)||(8999007-8999528)
chr7 (102-615)||(12734240-12734751)
chr7 (102-500)||(48381901-48382301)
chr7 (104-615)||(11087117-11087634)
chr7 (102-566)||(38403331-38403797)
chr7 (127-615)||(40054828-40055314)
chr7 (102-457)||(8933277-8933631)
chr7 (104-608)||(13174685-13175195)
chr7 (122-615)||(30049254-30049745)
chr7 (122-615)||(15888403-15888894)
chr7 (51-615)||(44280155-44280722)
chr7 (122-615)||(31116585-31117076)
chr7 (122-611)||(14745747-14746235)
chr7 (122-615)||(1367364-1367855)
chr7 (51-615)||(540744-541311)
chr7 (122-615)||(9432998-9433490)
chr7 (51-615)||(4211669-4212237)
chr7 (122-615)||(5685253-5685745)
chr7 (122-615)||(9443594-9444086)
chr7 (122-615)||(20989387-20989879)
chr7 (122-615)||(21770017-21770508)
chr7 (122-615)||(588947-589438)
chr7 (122-615)||(3165469-3165960)
chr7 (122-615)||(21003082-21003574)
chr7 (122-615)||(9159465-9159955)
chr7 (122-615)||(6867299-6867791)
chr7 (122-615)||(24930677-24931169)
chr7 (122-615)||(48710565-48711057)
chr7 (122-615)||(9085018-9085509)
chr7 (122-615)||(9094732-9095223)
chr7 (122-615)||(9169920-9170410)
chr7 (122-615)||(6877931-6878423)
chr7 (122-615)||(11004919-11005411)
chr7 (122-615)||(26653399-26653891)
chr7 (122-615)||(1987274-1987767)
chr7 (122-615)||(1997895-1998388)
chr7 (122-615)||(4222342-4222836)
chr7 (122-615)||(20490741-20491232)
chr7 (122-615)||(40042183-40042674)
chr7 (122-615)||(40052732-40053223)
chr7 (122-615)||(42865561-42866054)
chr7 (122-615)||(42876187-42876680)
chr7 (122-615)||(2705686-2706178)
chr7 (122-615)||(8627683-8628175)
chr7 (122-615)||(24734487-24734979)
chr7 (122-615)||(24744434-24744926)
chr7 (122-615)||(26294103-26294595)
chr7 (122-615)||(26390170-26390662)
chr7 (122-615)||(26400812-26401304)
chr7 (122-615)||(26699728-26700220)
chr7 (51-465)||(38593937-38594351)
chr7 (122-615)||(8002138-8002631)
chr7 (122-615)||(8012783-8013276)
chr7 (122-615)||(17950192-17950684)
chr7 (122-615)||(17960798-17961290)
chr7 (122-615)||(37343934-37344426)
chr7 (122-615)||(467655-468147)
chr7 (122-615)||(2716290-2716782)
chr7 (122-615)||(8617120-8617612)
chr7 (122-615)||(22088857-22089349)
chr7 (122-615)||(22099472-22099964)
chr7 (122-615)||(454873-455365)
chr7 (104-517)||(4412178-4412598)
chr7 (122-615)||(11095788-11096281)
chr7 (104-344)||(4432925-4433171)
chr7 (122-615)||(166629-167108)
chr7 (122-615)||(177221-177700)
chr7 (265-615)||(9170863-9171211)
chr7 (19-162)||(29589592-29589735)
chr7 (19-160)||(8999498-8999641)
chr7 (122-304)||(602306-602491)
chr7 (19-162)||(8933168-8933307)
chr7 (19-162)||(13681924-13682063)
chr7 (19-162)||(3476897-3477036)
chr7 (19-154)||(12734729-12734860)
chr7 (19-162)||(26210105-26210244)
chr7 (19-162)||(15215920-15216060)
chr7 (445-615)||(19985887-19986058)
chr7 (19-160)||(11087608-11087750)
chr7 (19-162)||(18418718-18418858)
chr7 (19-162)||(18440799-18440939)
chr7 (19-160)||(13175169-13175311)
chr7 (19-162)||(48381790-48381931)
chr7 (500-615)||(8933631-8933746)
chr7 (19-162)||(38403767-38403908)
chr7 (133-234)||(13473002-13473104)
chr7 (122-234)||(11792449-11792562)
chr7 (122-229)||(7488414-7488522)
chr7 (133-234)||(13034342-13034444)
chr7 (122-234)||(5034926-5035039)
chr7 (122-234)||(13027406-13027519)
chr7 (19-162)||(17064085-17064225)
chr7 (122-234)||(13172858-13172970)
chr7 (122-234)||(12174844-12174959)
chr7 (122-234)||(13302399-13302514)
chr7 (122-234)||(13731178-13731293)
chr7 (122-234)||(15088087-15088202)
chr7 (122-234)||(16557094-16557209)
chr7 (122-234)||(16608453-16608568)
chr7 (51-162)||(22099369-22099482)
chr7 (501-615)||(38593809-38593923)
chr7 (133-273)||(18362031-18362172)
chr7 (19-159)||(4412573-4412714)
chr7 (134-234)||(8182480-8182583)
chr7 (122-234)||(16310410-16310525)
chr7 (126-234)||(16315043-16315154)
chr7 (134-234)||(24795219-24795322)
chr7 (122-234)||(28622863-28622978)
chr7 (122-234)||(48063316-48063431)
chr7 (51-162)||(166526-166639)
chr7 (51-162)||(177118-177231)
chr7 (51-162)||(9084915-9085028)
chr7 (51-162)||(9094629-9094742)
chr7 (51-162)||(9432895-9433008)
chr7 (51-162)||(9443491-9443604)
chr7 (51-162)||(22088754-22088867)
chr7 (51-162)||(26653881-26653994)
chr7 (51-162)||(26700210-26700323)
chr7 (51-162)||(37343831-37343944)
chr7 (51-162)||(48711047-48711160)
chr7 (122-234)||(4494115-4494229)
chr7 (132-234)||(13261118-13261223)
chr7 (103-234)||(16308218-16308350)
chr7 (122-231)||(16317063-16317173)
chr7 (122-234)||(29935849-29935962)
chr7 (149-234)||(39285068-39285154)
chr7 (122-234)||(14424993-14425109)
chr7 (122-231)||(16112392-16112504)
chr7 (101-234)||(16472211-16472342)
chr7 (51-162)||(24931159-24931273)
chr7 (51-162)||(26294585-26294699)
chr7 (122-234)||(331189-331304)
chr7 (122-234)||(2914114-2914229)
chr7 (122-234)||(10883675-10883790)
chr7 (134-234)||(14187240-14187343)
chr7 (122-229)||(16411544-16411651)
chr7 (122-234)||(27871255-27871370)
chr7 (122-234)||(32265224-32265339)
chr7 (51-147)||(40055323-40055422)
chr7 (51-162)||(468137-468250)
chr7 (51-162)||(588844-588957)
chr7 (133-234)||(2499587-2499690)
chr7 (51-162)||(2706168-2706283)
chr7 (51-162)||(5685150-5685263)
chr7 (51-162)||(6867781-6867894)
chr7 (51-162)||(6878413-6878526)
chr7 (51-162)||(17950674-17950789)
chr7 (51-162)||(17961280-17961395)
chr7 (164-234)||(21691913-21691984)
chr7 (51-162)||(24734382-24734497)
chr7 (51-162)||(24744329-24744444)
chr7 (51-162)||(40042664-40042779)
chr7 (51-162)||(40053213-40053328)
chr7 (104-234)||(2501517-2501646)
chr7 (133-234)||(19237540-19237642)
chr7 (149-234)||(41842929-41843015)
chr7 (149-234)||(1292595-1292683)
chr7 (51-162)||(8617016-8617130)
chr7 (455-567)||(21695282-21695395)
chr7 (122-234)||(11318944-11319059)
chr7 (122-229)||(12367246-12367354)
chr7 (122-234)||(15704993-15705107)
chr7 (122-234)||(21381933-21382048)
chr7 (122-234)||(48806384-48806499)
chr7 (51-162)||(1367261-1367374)
chr7 (51-162)||(1987170-1987284)
chr7 (51-162)||(1997791-1997905)
chr7 (51-162)||(2716772-2716887)
chr7 (51-162)||(3165366-3165479)
chr7 (51-162)||(4222238-4222352)
chr7 (51-162)||(8002621-8002735)
chr7 (51-162)||(8013266-8013380)
chr7 (51-162)||(11004815-11004929)
chr7 (122-234)||(13683136-13683250)
chr7 (51-162)||(15888884-15888997)
chr7 (51-162)||(20490638-20490751)
chr7 (51-162)||(20989284-20989397)
chr7 (51-162)||(21003564-21003677)
chr7 (51-162)||(21770498-21770611)
chr7 (51-162)||(26390652-26390767)
chr7 (51-162)||(26401294-26401409)
chr7 (51-162)||(30049151-30049264)
chr7 (51-162)||(31117066-31117179)
chr7 (51-162)||(42865457-42865571)
chr7 (51-162)||(42876083-42876197)
chr7 (122-215)||(13902136-13902230)
chr7 (463-608)||(21692176-21692322)
chr7 (100-234)||(22579719-22579855)
chr7 (133-234)||(25687345-25687446)
chr7 (62-156)||(4433149-4433244)
chr7 (122-234)||(9098738-9098851)
chr7 (122-234)||(9099544-9099657)
chr7 (444-608)||(13260738-13260903)
chr7 (149-234)||(19711517-19711605)
chr7 (125-234)||(33692206-33692317)
chr7 (122-234)||(9710309-9710423)
chr7 (106-234)||(25806919-25807046)
chr7 (51-162)||(9159362-9159475)
chr7 (51-162)||(9169817-9169930)
chr7 (122-229)||(13263322-13263426)
chr7 (123-234)||(15467456-15467569)
chr7 (486-608)||(16112007-16112130)
chr7 (51-162)||(8627578-8627693)
chr7 (444-608)||(331515-331680)
chr7 (122-225)||(21283887-21283992)
chr7 (149-234)||(23280465-23280552)
chr7 (444-608)||(30944446-30944611)
chr7 (150-230)||(44466631-44466712)
chr7 (122-214)||(5001349-5001444)
chr7 (122-234)||(13645929-13646044)
chr7 (126-230)||(13879713-13879820)
chr7 (134-234)||(14426098-14426200)
chr7 (51-162)||(14746225-14746339)
chr7 (122-234)||(19328518-19328632)
chr7 (134-234)||(19339753-19339856)
chr7 (444-567)||(28622520-28622644)
chr7 (122-234)||(33421288-33421401)
chr7 (463-608)||(23280081-23280228)
chr7 (486-608)||(29935481-29935604)
chr7 (100-234)||(16105470-16105604)
chr7 (463-608)||(30025794-30025940)
chr7 (122-216)||(33604445-33604541)
chr7 (101-162)||(455355-455415)
chr7 (444-608)||(11792777-11792942)
chr7 (444-608)||(13138018-13138183)
chr7 (444-608)||(13302681-13302845)
chr7 (444-608)||(41842396-41842561)
chr7 (103-231)||(9802700-9802829)
chr7 (122-234)||(13138401-13138516)
chr7 (445-608)||(13879975-13880139)
chr7 (122-234)||(30945864-30945978)
chr7 (109-234)||(1878763-1878886)
chr7 (195-234)||(4821098-4821137)
chr7 (195-234)||(11015575-11015614)
chr7 (195-273)||(12222899-12222977)
chr7 (490-608)||(48237025-48237144)
chr7 (444-608)||(2913731-2913896)
chr7 (100-210)||(23125465-23125573)
chr7 (444-608)||(44466933-44467099)
chr7 (122-193)||(48237387-48237460)
chr7 (467-552)||(2266502-2266587)
chr7 (444-608)||(4821344-4821509)
chr7 (546-615)||(6044285-6044354)
chr7 (103-271)||(9762208-9762376)
chr7 (463-567)||(10883337-10883442)
chr7 (444-608)||(13018628-13018793)
chr7 (444-517)||(13034057-13034130)
chr7 (444-608)||(30945479-30945644)
chr7 (464-608)||(33691835-33691980)
chr7 (149-234)||(35953190-35953277)
chr7 (444-567)||(4494447-4494571)
chr7 (446-568)||(602636-602759)
chr7 (195-234)||(2266020-2266059)
chr7 (461-567)||(13683482-13683589)
chr7 (463-518)||(19237255-19237310)
chr7 (19-80)||(602174-602235)
chr7 (486-567)||(16545847-16545929)
chr7 (486-567)||(16619733-16619815)
chr7 (102-196)||(17064021-17064115)
chr7 (100-162)||(23125435-23125497)
chr7 (463-557)||(39284739-39284833)
chr7 (185-226)||(9065110-9065151)
chr7 (122-163)||(19141888-19141929)
chr7 (122-163)||(20741287-20741328)
chr7 (444-517)||(28408909-28408982)
chr7 (102-130)||(3476869-3476897)
chr7 (102-130)||(8002593-8002621)
chr7 (102-130)||(8013238-8013266)
chr7 (104-160)||(9802671-9802727)
chr7 (107-159)||(11095744-11095795)
chr7 (100-156)||(11572808-11572864)
chr7 (487-606)||(15467829-15467949)
chr7 (51-98)||(25212471-25212519)
chr7 (102-130)||(26653853-26653881)
chr7 (102-130)||(26700182-26700210)
chr7 (126-234)||(30025448-30025558)
chr7 (102-130)||(40042636-40042664)
chr7 (102-130)||(40053185-40053213)
[»] chr6 (263 HSPs)
chr6 (39-615)||(19289385-19289962)
chr6 (19-615)||(31931018-31931614)
chr6 (19-615)||(18554865-18555461)
chr6 (19-615)||(12953135-12953731)
chr6 (19-615)||(11205540-11206137)
chr6 (103-611)||(11235177-11235686)
chr6 (102-615)||(17741707-17742221)
chr6 (19-615)||(17063794-17064386)
chr6 (19-615)||(17047154-17047746)
chr6 (132-615)||(9933676-9934159)
chr6 (122-615)||(25518386-25518881)
chr6 (102-615)||(18826243-18826754)
chr6 (105-615)||(7586261-7586776)
chr6 (102-615)||(18834639-18835149)
chr6 (102-615)||(27166448-27166958)
chr6 (102-615)||(29765216-29765726)
chr6 (102-615)||(25686754-25687266)
chr6 (122-615)||(4292425-4292917)
chr6 (132-615)||(25735563-25736044)
chr6 (102-615)||(22308468-22308981)
chr6 (102-611)||(31572095-31572601)
chr6 (105-615)||(21127760-21128272)
chr6 (102-615)||(17745787-17746300)
chr6 (366-615)||(18498562-18498811)
chr6 (104-615)||(17608410-17608927)
chr6 (122-615)||(26043912-26044404)
chr6 (122-615)||(18925767-18926260)
chr6 (209-615)||(25679024-25679428)
chr6 (122-608)||(20635268-20635758)
chr6 (122-615)||(25787401-25787892)
chr6 (122-615)||(25985782-25986273)
chr6 (127-615)||(12827397-12827884)
chr6 (104-520)||(19452719-19453142)
chr6 (132-615)||(5844796-5845275)
chr6 (122-615)||(16123542-16124032)
chr6 (122-615)||(7375763-7376254)
chr6 (122-615)||(9123136-9123628)
chr6 (122-615)||(32301047-32301539)
chr6 (122-615)||(32311736-32312228)
chr6 (122-615)||(28251570-28252058)
chr6 (122-615)||(28356717-28357205)
chr6 (122-615)||(27505642-27506135)
chr6 (122-615)||(7751240-7751731)
chr6 (122-615)||(9112499-9112991)
chr6 (122-615)||(20029909-20030400)
chr6 (132-615)||(11147254-11147736)
chr6 (122-615)||(27372532-27373025)
chr6 (122-615)||(27462882-27463375)
chr6 (122-615)||(3661083-3661574)
chr6 (104-609)||(22386333-22386842)
chr6 (122-615)||(12716838-12717332)
chr6 (122-615)||(12727487-12727981)
chr6 (122-615)||(3671747-3672238)
chr6 (122-615)||(20062660-20063151)
chr6 (122-615)||(4630571-4631065)
chr6 (122-615)||(26025159-26025651)
chr6 (122-615)||(26035733-26036225)
chr6 (122-615)||(27341394-27341886)
chr6 (122-615)||(27402134-27402626)
chr6 (122-615)||(27412793-27413285)
chr6 (122-615)||(31982630-31983122)
chr6 (122-615)||(33199028-33199520)
chr6 (122-615)||(16930151-16930642)
chr6 (122-615)||(29384452-29384943)
chr6 (122-615)||(12854721-12855213)
chr6 (122-615)||(12865247-12865739)
chr6 (122-615)||(16959322-16959813)
chr6 (122-615)||(27474547-27475037)
chr6 (195-615)||(31542902-31543319)
chr6 (122-615)||(26864486-26864980)
chr6 (122-615)||(26875110-26875604)
chr6 (122-615)||(32961933-32962430)
chr6 (122-615)||(32972552-32973049)
chr6 (122-615)||(34807164-34807656)
chr6 (122-615)||(34817796-34818288)
chr6 (122-615)||(27384134-27384624)
chr6 (122-615)||(27504045-27504536)
chr6 (122-615)||(17982505-17982997)
chr6 (122-615)||(17984714-17985206)
chr6 (51-465)||(12353180-12353596)
chr6 (103-303)||(14070492-14070694)
chr6 (259-615)||(8653497-8653851)
chr6 (400-615)||(17042596-17042813)
chr6 (103-303)||(14051811-14052013)
chr6 (400-615)||(13913025-13913240)
chr6 (19-160)||(11235063-11235204)
chr6 (19-160)||(21127644-21127785)
chr6 (19-160)||(7586751-7586892)
chr6 (19-162)||(25687236-25687379)
chr6 (19-162)||(25518254-25518396)
chr6 (31-160)||(19453116-19453247)
chr6 (459-615)||(25675196-25675352)
chr6 (30-162)||(17742191-17742319)
chr6 (19-162)||(31571985-31572125)
chr6 (122-234)||(7763198-7763311)
chr6 (19-162)||(17746270-17746410)
chr6 (19-162)||(18835119-18835259)
chr6 (19-162)||(22308357-22308498)
chr6 (19-162)||(29765106-29765246)
chr6 (150-295)||(32757126-32757271)
chr6 (103-234)||(18172720-18172849)
chr6 (103-234)||(18226952-18227081)
chr6 (50-162)||(27166928-27167042)
chr6 (19-160)||(17608901-17609042)
chr6 (19-162)||(18826724-18826864)
chr6 (122-234)||(21034534-21034647)
chr6 (192-533)||(26022881-26023221)
chr6 (19-154)||(5844656-5844788)
chr6 (122-234)||(15301758-15301873)
chr6 (122-234)||(19085702-19085817)
chr6 (103-234)||(32335363-32335494)
chr6 (120-234)||(26941979-26942094)
chr6 (133-234)||(19625366-19625468)
chr6 (122-231)||(25930021-25930131)
chr6 (122-234)||(19470211-19470324)
chr6 (103-229)||(17446151-17446277)
chr6 (122-234)||(15395178-15395292)
chr6 (128-234)||(25595728-25595833)
chr6 (19-80)||(21119222-21119283)
chr6 (103-184)||(23006547-23006628)
chr6 (103-184)||(23781738-23781819)
chr6 (122-234)||(12715913-12716028)
chr6 (122-234)||(15478274-15478385)
chr6 (122-234)||(19623523-19623638)
chr6 (103-234)||(24729014-24729146)
chr6 (23-130)||(9934131-9934235)
chr6 (100-235)||(18027210-18027344)
chr6 (100-234)||(26185242-26185377)
chr6 (51-162)||(27372429-27372542)
chr6 (19-162)||(27384004-27384144)
chr6 (51-162)||(27462779-27462892)
chr6 (19-162)||(27474388-27474528)
chr6 (19-162)||(27503886-27504026)
chr6 (51-162)||(27505539-27505652)
chr6 (51-162)||(32962420-32962533)
chr6 (51-162)||(32973039-32973152)
chr6 (136-229)||(23296283-23296377)
chr6 (122-234)||(29597617-29597731)
chr6 (61-162)||(7751721-7751824)
chr6 (122-234)||(7811558-7811670)
chr6 (19-160)||(20635134-20635276)
chr6 (122-231)||(33352723-33352835)
chr6 (122-234)||(9717385-9717499)
chr6 (445-608)||(19623854-19624018)
chr6 (136-231)||(20113192-20113288)
chr6 (122-234)||(20731197-20731311)
chr6 (51-162)||(3660980-3661093)
chr6 (51-162)||(3671644-3671757)
chr6 (51-162)||(9112981-9113094)
chr6 (51-162)||(9123618-9123731)
chr6 (122-216)||(12347635-12347730)
chr6 (51-162)||(12717322-12717437)
chr6 (51-162)||(12727971-12728086)
chr6 (51-162)||(12854618-12854731)
chr6 (51-162)||(12865144-12865257)
chr6 (107-234)||(14923703-14923830)
chr6 (51-162)||(17982987-17983102)
chr6 (51-162)||(17985196-17985311)
chr6 (486-608)||(19086074-19086197)
chr6 (123-234)||(19482295-19482409)
chr6 (122-234)||(24719232-24719342)
chr6 (51-162)||(25985677-25985792)
chr6 (51-162)||(26043809-26043922)
chr6 (51-162)||(34818278-34818393)
chr6 (122-231)||(14100933-14101043)
chr6 (122-231)||(17927335-17927445)
chr6 (100-234)||(22076898-22077034)
chr6 (51-162)||(18926250-18926362)
chr6 (19-160)||(22386217-22386359)
chr6 (122-234)||(25592165-25592277)
chr6 (51-162)||(33198924-33199038)
chr6 (51-162)||(34807646-34807762)
chr6 (150-234)||(10631673-10631760)
chr6 (122-234)||(13601710-13601825)
chr6 (128-273)||(15551541-15551687)
chr6 (122-234)||(18435083-18435197)
chr6 (122-234)||(19066510-19066625)
chr6 (123-234)||(23230735-23230846)
chr6 (122-234)||(24116371-24116486)
chr6 (519-615)||(25722963-25723059)
chr6 (51-162)||(32756997-32757108)
chr6 (51-162)||(20030390-20030503)
chr6 (51-162)||(29384348-29384462)
chr6 (533-615)||(6158316-6158398)
chr6 (19-161)||(14070666-14070808)
chr6 (122-231)||(16914969-16915079)
chr6 (132-234)||(32543817-32543921)
chr6 (444-608)||(23284438-23284603)
chr6 (51-162)||(25787299-25787411)
chr6 (61-162)||(28252048-28252151)
chr6 (61-162)||(28357195-28357298)
chr6 (134-234)||(12422817-12422919)
chr6 (51-147)||(12827289-12827388)
chr6 (133-193)||(15986908-15986968)
chr6 (122-234)||(19952064-19952178)
chr6 (126-234)||(21234705-21234815)
chr6 (122-234)||(22801682-22801796)
chr6 (122-234)||(26589141-26589256)
chr6 (51-162)||(4630467-4630581)
chr6 (446-568)||(14051531-14051654)
chr6 (446-568)||(14070212-14070335)
chr6 (51-162)||(16124022-16124135)
chr6 (164-234)||(16265643-16265713)
chr6 (122-234)||(16463143-16463258)
chr6 (51-162)||(16930047-16930161)
chr6 (51-162)||(16959218-16959332)
chr6 (122-193)||(17303807-17303878)
chr6 (149-234)||(19688349-19688436)
chr6 (51-162)||(20063141-20063254)
chr6 (51-162)||(26025055-26025169)
chr6 (51-162)||(26035629-26035743)
chr6 (51-162)||(26864382-26864496)
chr6 (51-162)||(26875006-26875120)
chr6 (51-162)||(27341290-27341404)
chr6 (51-162)||(27402030-27402144)
chr6 (51-162)||(27412689-27412803)
chr6 (51-162)||(31983112-31983226)
chr6 (51-162)||(32301529-32301643)
chr6 (51-162)||(32312218-32312332)
chr6 (444-608)||(9717717-9717882)
chr6 (444-608)||(32544139-32544304)
chr6 (51-143)||(10404043-10404138)
chr6 (122-234)||(21624632-21624746)
chr6 (122-234)||(15532118-15532233)
chr6 (463-608)||(15987126-15987272)
chr6 (103-193)||(17867179-17867269)
chr6 (103-193)||(17876962-17877052)
chr6 (444-605)||(20112813-20112975)
chr6 (463-608)||(14100550-14100694)
chr6 (444-608)||(15302074-15302239)
chr6 (122-234)||(15954239-15954353)
chr6 (150-234)||(17317016-17317103)
chr6 (51-139)||(25583509-25583600)
chr6 (122-234)||(25593612-25593727)
chr6 (195-234)||(10705025-10705064)
chr6 (195-234)||(21617862-21617901)
chr6 (486-608)||(24116744-24116867)
chr6 (128-273)||(24470850-24470993)
chr6 (486-608)||(29917933-29918056)
chr6 (128-233)||(31127801-31127899)
chr6 (195-273)||(31720073-31720151)
chr6 (463-608)||(16265260-16265406)
chr6 (122-233)||(16876447-16876560)
chr6 (444-608)||(21234998-21235164)
chr6 (19-69)||(25678979-25679028)
chr6 (197-234)||(24398393-24398430)
chr6 (51-162)||(7376244-7376358)
chr6 (100-274)||(14757867-14758039)
chr6 (122-193)||(14883515-14883586)
chr6 (486-608)||(15954619-15954742)
chr6 (463-608)||(20730814-20730960)
chr6 (122-216)||(29917565-29917661)
chr6 (444-517)||(19470545-19470618)
chr6 (524-608)||(22076517-22076602)
chr6 (362-438)||(32335621-32335697)
chr6 (102-130)||(17982959-17982987)
chr6 (102-130)||(17985168-17985196)
chr6 (103-229)||(19875360-19875487)
chr6 (362-437)||(23296516-23296591)
chr6 (102-130)||(25518396-25518424)
chr6 (122-162)||(27474518-27474557)
chr6 (122-162)||(27504016-27504055)
chr6 (102-130)||(29384462-29384490)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (19-615)||(28829-29427)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (19-615)||(831-1428)
scaffold0752 (33-615)||(1460-2043)
[»] chr2 (246 HSPs)
chr2 (19-615)||(19313029-19313627)
chr2 (19-615)||(19498003-19498600)
chr2 (68-615)||(19300022-19300571)
chr2 (122-615)||(19356043-19356536)
chr2 (102-615)||(967515-968028)
chr2 (122-615)||(20646619-20647116)
chr2 (102-615)||(24274729-24275242)
chr2 (102-615)||(22774062-22774575)
chr2 (187-615)||(17969221-17969650)
chr2 (102-615)||(22763358-22763871)
chr2 (19-568)||(22754907-22755460)
chr2 (122-615)||(36784817-36785303)
chr2 (132-615)||(28064924-28065405)
chr2 (132-615)||(27978395-27978876)
chr2 (122-615)||(38586100-38586591)
chr2 (122-615)||(18768919-18769409)
chr2 (122-615)||(26866795-26867287)
chr2 (187-615)||(26879450-26879876)
chr2 (122-615)||(24415035-24415525)
chr2 (104-608)||(1083537-1084047)
chr2 (104-608)||(23392735-23393245)
chr2 (122-615)||(29243946-29244438)
chr2 (122-615)||(29254525-29255017)
chr2 (122-544)||(24427670-24428090)
chr2 (188-615)||(28721329-28721754)
chr2 (122-615)||(10277295-10277787)
chr2 (122-615)||(18392649-18393141)
chr2 (122-615)||(28731917-28732406)
chr2 (19-310)||(38033152-38033442)
chr2 (122-615)||(4220205-4220699)
chr2 (122-615)||(1099207-1099699)
chr2 (122-615)||(10266718-10267210)
chr2 (122-615)||(21172479-21172970)
chr2 (122-615)||(32217598-32218090)
chr2 (122-615)||(34790229-34790721)
chr2 (122-615)||(39170107-39170599)
chr2 (122-615)||(43354747-43355238)
chr2 (122-615)||(11395184-11395676)
chr2 (122-615)||(11405500-11405992)
chr2 (122-615)||(34477653-34478144)
chr2 (122-615)||(7005819-7006311)
chr2 (122-615)||(11388821-11389313)
chr2 (122-615)||(17857449-17857941)
chr2 (122-615)||(34804372-34804864)
chr2 (122-615)||(43345132-43345623)
chr2 (189-615)||(2561279-2561705)
chr2 (122-615)||(4209613-4210107)
chr2 (51-615)||(21650544-21651113)
chr2 (122-615)||(24338416-24338908)
chr2 (122-615)||(36251856-36252348)
chr2 (122-615)||(40222056-40222549)
chr2 (122-615)||(24327746-24328238)
chr2 (122-615)||(35263315-35263808)
chr2 (122-615)||(35273940-35274433)
chr2 (122-615)||(22914876-22915368)
chr2 (122-615)||(27221105-27221598)
chr2 (122-615)||(40250917-40251410)
chr2 (122-615)||(9897586-9898078)
chr2 (122-615)||(9908174-9908666)
chr2 (122-615)||(16768667-16769159)
chr2 (122-615)||(43082378-43082863)
chr2 (122-615)||(43092987-43093472)
chr2 (122-615)||(22960344-22960836)
chr2 (122-615)||(30488835-30489328)
chr2 (122-615)||(35252706-35253199)
chr2 (104-434)||(24801792-24802125)
chr2 (122-615)||(9762782-9763272)
chr2 (122-615)||(9773318-9773808)
chr2 (19-171)||(19302909-19303061)
chr2 (104-305)||(24814887-24815092)
chr2 (19-160)||(19355910-19356051)
chr2 (102-320)||(1041853-1042070)
chr2 (19-160)||(20647108-20647249)
chr2 (19-162)||(17970764-17970903)
chr2 (23-162)||(24274624-24274759)
chr2 (159-345)||(1088943-1089135)
chr2 (102-271)||(17970626-17970794)
chr2 (21-162)||(22773951-22774092)
chr2 (122-338)||(4099538-4099751)
chr2 (19-162)||(22763245-22763388)
chr2 (19-162)||(967998-968138)
chr2 (473-615)||(22779811-22779953)
chr2 (19-155)||(1041743-1041876)
chr2 (99-234)||(21911311-21911447)
chr2 (427-615)||(4099810-4100000)
chr2 (133-234)||(24376656-24376758)
chr2 (19-98)||(38040522-38040601)
chr2 (133-234)||(21537699-21537801)
chr2 (122-234)||(18431386-18431499)
chr2 (122-234)||(18702280-18702393)
chr2 (405-568)||(24814690-24814855)
chr2 (122-229)||(24843743-24843851)
chr2 (19-162)||(36785293-36785434)
chr2 (122-229)||(22383020-22383129)
chr2 (19-160)||(23393219-23393360)
chr2 (122-234)||(28141049-28141163)
chr2 (122-234)||(24851111-24851224)
chr2 (122-234)||(25188938-25189051)
chr2 (122-234)||(22786103-22786218)
chr2 (122-234)||(19539955-19540069)
chr2 (103-234)||(21845678-21845810)
chr2 (150-234)||(22455436-22455521)
chr2 (62-160)||(24802099-24802198)
chr2 (122-234)||(26619548-26619661)
chr2 (19-147)||(27978890-27979015)
chr2 (19-147)||(28065419-28065544)
chr2 (122-234)||(10010198-10010313)
chr2 (122-234)||(20152449-20152563)
chr2 (122-234)||(24575573-24575688)
chr2 (51-162)||(1099689-1099802)
chr2 (51-162)||(4099435-4099548)
chr2 (51-162)||(4209510-4209623)
chr2 (51-162)||(7006301-7006414)
chr2 (51-162)||(9773798-9773911)
chr2 (51-162)||(11389303-11389416)
chr2 (122-274)||(14581095-14581252)
chr2 (51-162)||(22915358-22915471)
chr2 (51-162)||(22960826-22960939)
chr2 (51-162)||(24328228-24328341)
chr2 (51-162)||(24338898-24339011)
chr2 (100-231)||(25918232-25918363)
chr2 (51-162)||(40250814-40250927)
chr2 (133-234)||(39038089-39038191)
chr2 (123-234)||(24778912-24779027)
chr2 (62-160)||(24815066-24815165)
chr2 (154-234)||(26366886-26366967)
chr2 (51-162)||(34477549-34477663)
chr2 (122-234)||(22317129-22317243)
chr2 (122-234)||(22776685-22776800)
chr2 (122-234)||(22782063-22782178)
chr2 (122-234)||(28551367-28551482)
chr2 (122-234)||(38780933-38781048)
chr2 (122-234)||(40782014-40782129)
chr2 (122-234)||(44839970-44840085)
chr2 (122-234)||(45087430-45087545)
chr2 (51-162)||(4220102-4220215)
chr2 (51-162)||(9763262-9763375)
chr2 (51-162)||(16768564-16768677)
chr2 (51-162)||(17857931-17858044)
chr2 (51-162)||(18393131-18393246)
chr2 (51-162)||(29243843-29243956)
chr2 (51-162)||(29254422-29254535)
chr2 (51-162)||(32217493-32217608)
chr2 (51-162)||(34790711-34790824)
chr2 (51-162)||(34804854-34804967)
chr2 (51-162)||(36252338-36252451)
chr2 (51-162)||(38586581-38586696)
chr2 (51-162)||(40221953-40222066)
chr2 (51-162)||(43082275-43082388)
chr2 (100-234)||(14794307-14794440)
chr2 (128-234)||(19320848-19320953)
chr2 (51-162)||(9898068-9898184)
chr2 (51-162)||(9908656-9908772)
chr2 (51-162)||(18769399-18769511)
chr2 (122-234)||(19114623-19114736)
chr2 (444-608)||(22188169-22188334)
chr2 (444-608)||(24376969-24377134)
chr2 (51-162)||(26866693-26866805)
chr2 (150-234)||(41122164-41122249)
chr2 (122-234)||(22257739-22257854)
chr2 (122-234)||(30557769-30557883)
chr2 (122-234)||(40331646-40331761)
chr2 (51-162)||(2561109-2561222)
chr2 (51-162)||(11395666-11395781)
chr2 (51-162)||(11405982-11406097)
chr2 (51-162)||(24415515-24415628)
chr2 (51-162)||(24428080-24428193)
chr2 (51-162)||(27221001-27221115)
chr2 (51-162)||(28732396-28732509)
chr2 (124-231)||(33073766-33073875)
chr2 (51-162)||(35252602-35252716)
chr2 (51-162)||(35263211-35263325)
chr2 (51-162)||(35273836-35273950)
chr2 (51-162)||(43092884-43092997)
chr2 (149-234)||(22271698-22271784)
chr2 (51-147)||(26879282-26879380)
chr2 (149-230)||(13964431-13964515)
chr2 (133-234)||(15671058-15671157)
chr2 (122-234)||(23184750-23184863)
chr2 (122-234)||(23596013-23596126)
chr2 (122-234)||(6392172-6392286)
chr2 (150-234)||(6574576-6574662)
chr2 (444-567)||(20152134-20152258)
chr2 (122-234)||(20569197-20569312)
chr2 (122-234)||(28712147-28712262)
chr2 (51-162)||(10266614-10266728)
chr2 (51-162)||(10277191-10277305)
chr2 (463-605)||(22258088-22258231)
chr2 (51-162)||(28721810-28721923)
chr2 (51-162)||(30489318-30489431)
chr2 (164-234)||(31801336-31801406)
chr2 (51-162)||(39170589-39170703)
chr2 (51-162)||(43345028-43345142)
chr2 (51-162)||(43354643-43354757)
chr2 (149-231)||(44880734-44880817)
chr2 (444-605)||(10009820-10009982)
chr2 (133-231)||(23234555-23234656)
chr2 (19-160)||(1083421-1083563)
chr2 (149-229)||(10898976-10899056)
chr2 (122-235)||(31328410-31328525)
chr2 (122-235)||(31335131-31335246)
chr2 (444-552)||(6574249-6574357)
chr2 (122-234)||(22188551-22188666)
chr2 (100-234)||(22525275-22525409)
chr2 (445-608)||(31800954-31801118)
chr2 (19-62)||(22615293-22615336)
chr2 (132-234)||(17963715-17963819)
chr2 (51-162)||(21172960-21173075)
chr2 (463-608)||(40782364-40782510)
chr2 (122-231)||(1587484-1587595)
chr2 (101-234)||(22682914-22683046)
chr2 (444-608)||(23234875-23235040)
chr2 (125-230)||(25037713-25037820)
chr2 (444-608)||(28711765-28711930)
chr2 (444-608)||(21537315-21537482)
chr2 (444-552)||(22317461-22317569)
chr2 (444-567)||(23184412-23184536)
chr2 (444-567)||(23595675-23595799)
chr2 (547-615)||(28374527-28374595)
chr2 (445-608)||(28550985-28551149)
chr2 (134-234)||(34322384-34322486)
chr2 (444-567)||(38781266-38781390)
chr2 (147-229)||(14866831-14866913)
chr2 (490-608)||(19540330-19540449)
chr2 (463-554)||(22272020-22272111)
chr2 (195-234)||(22802083-22802122)
chr2 (164-234)||(25828713-25828784)
chr2 (128-234)||(27939534-27939638)
chr2 (463-608)||(13964045-13964191)
chr2 (463-608)||(39037709-39037855)
chr2 (198-234)||(24157432-24157468)
chr2 (122-209)||(16494884-16494974)
chr2 (164-234)||(35744426-35744496)
chr2 (122-207)||(20567698-20567783)
chr2 (549-615)||(24425564-24425629)
chr2 (492-608)||(30666905-30667022)
chr2 (122-231)||(28701664-28701776)
chr2 (445-517)||(22455149-22455221)
chr2 (537-608)||(25037326-25037398)
chr2 (537-608)||(25041433-25041505)
chr2 (486-608)||(30621126-30621249)
chr2 (486-608)||(30623747-30623870)
chr2 (537-608)||(33074187-33074259)
chr2 (195-231)||(33240296-33240332)
chr2 (195-231)||(33248217-33248253)
chr2 (126-162)||(35666494-35666530)
[»] chr8 (233 HSPs)
chr8 (21-615)||(22211416-22212012)
chr8 (102-615)||(22135886-22136398)
chr8 (102-615)||(22167051-22167563)
chr8 (19-615)||(23271232-23271832)
chr8 (102-615)||(3843262-3843775)
chr8 (152-615)||(7018409-7018872)
chr8 (19-615)||(8031460-8032072)
chr8 (19-438)||(19460624-19461046)
chr8 (19-438)||(19558302-19558724)
chr8 (102-615)||(20259645-20260158)
chr8 (102-615)||(21046275-21046788)
chr8 (19-608)||(29379012-29379609)
chr8 (195-615)||(23370386-23370801)
chr8 (133-608)||(17519178-17519660)
chr8 (187-615)||(18158082-18158507)
chr8 (187-615)||(18153563-18153987)
chr8 (122-615)||(18769165-18769657)
chr8 (104-608)||(40002748-40003260)
chr8 (122-615)||(16746761-16747253)
chr8 (188-615)||(30314724-30315149)
chr8 (51-615)||(20195643-20196210)
chr8 (122-615)||(19224695-19225186)
chr8 (122-615)||(40213198-40213688)
chr8 (122-615)||(23469488-23469980)
chr8 (122-615)||(3220393-3220885)
chr8 (122-608)||(28903006-28903490)
chr8 (122-615)||(6318544-6319035)
chr8 (122-615)||(19418113-19418604)
chr8 (122-615)||(20161257-20161750)
chr8 (122-615)||(44480852-44481344)
chr8 (122-615)||(44491468-44491960)
chr8 (122-615)||(241585-242076)
chr8 (122-615)||(252170-252661)
chr8 (122-615)||(848995-849486)
chr8 (122-615)||(19128509-19129001)
chr8 (122-615)||(19139041-19139533)
chr8 (122-615)||(9340905-9341397)
chr8 (122-615)||(9368049-9368541)
chr8 (122-615)||(19428688-19429181)
chr8 (122-615)||(210181-210672)
chr8 (122-615)||(723804-724295)
chr8 (104-568)||(21540474-21540943)
chr8 (122-615)||(32088297-32088788)
chr8 (122-615)||(36077698-36078189)
chr8 (122-615)||(36088284-36088775)
chr8 (122-615)||(3348654-3349146)
chr8 (122-615)||(3359251-3359743)
chr8 (122-615)||(15791326-15791818)
chr8 (122-568)||(794940-795383)
chr8 (122-615)||(9856499-9856996)
chr8 (122-615)||(32077724-32078215)
chr8 (122-615)||(6150829-6151323)
chr8 (122-615)||(6160784-6161278)
chr8 (122-615)||(29076492-29076983)
chr8 (122-615)||(15780737-15781229)
chr8 (122-615)||(31214773-31215268)
chr8 (122-615)||(29086743-29087234)
chr8 (122-615)||(18449131-18449623)
chr8 (122-615)||(26120670-26121163)
chr8 (122-615)||(13688594-13689087)
chr8 (122-615)||(36292682-36293172)
chr8 (122-615)||(36303285-36303775)
chr8 (122-615)||(26110992-26111485)
chr8 (122-568)||(43248086-43248531)
chr8 (104-568)||(45568061-45568547)
chr8 (19-162)||(22136368-22136511)
chr8 (19-162)||(22167533-22167676)
chr8 (19-162)||(7018926-7019069)
chr8 (104-304)||(21287924-21288128)
chr8 (104-304)||(21298534-21298738)
chr8 (19-162)||(3843153-3843292)
chr8 (423-615)||(30325280-30325473)
chr8 (19-162)||(23363759-23363902)
chr8 (418-615)||(23457332-23457530)
chr8 (19-155)||(20260135-20260267)
chr8 (19-155)||(21046765-21046897)
chr8 (467-615)||(19461053-19461201)
chr8 (467-615)||(19558731-19558879)
chr8 (19-162)||(17519660-17519804)
chr8 (467-615)||(1750197-1750346)
chr8 (122-234)||(18321659-18321772)
chr8 (122-234)||(15934132-15934245)
chr8 (19-160)||(40002631-40002774)
chr8 (124-234)||(19956838-19956949)
chr8 (122-234)||(19942772-19942884)
chr8 (19-160)||(28902873-28903014)
chr8 (122-234)||(25163607-25163721)
chr8 (122-234)||(14989952-14990067)
chr8 (122-234)||(18152148-18152263)
chr8 (122-273)||(18679350-18679505)
chr8 (122-273)||(18718539-18718694)
chr8 (122-234)||(22662651-22662766)
chr8 (122-234)||(40845888-40846003)
chr8 (122-234)||(45538938-45539053)
chr8 (122-231)||(26832612-26832722)
chr8 (452-615)||(6576547-6576712)
chr8 (122-234)||(14990563-14990678)
chr8 (51-162)||(3220290-3220403)
chr8 (51-162)||(9856986-9857099)
chr8 (51-162)||(19128406-19128519)
chr8 (124-234)||(19707047-19707158)
chr8 (51-162)||(26110889-26111002)
chr8 (51-162)||(32078205-32078318)
chr8 (51-162)||(32088778-32088891)
chr8 (122-227)||(22707867-22707973)
chr8 (149-234)||(43644460-43644546)
chr8 (122-231)||(6407261-6407372)
chr8 (122-234)||(17928590-17928703)
chr8 (122-234)||(18772229-18772342)
chr8 (122-234)||(13431121-13431236)
chr8 (122-229)||(18557569-18557676)
chr8 (122-234)||(20382894-20383009)
chr8 (122-234)||(21932417-21932531)
chr8 (122-234)||(29692848-29692963)
chr8 (122-234)||(33560716-33560831)
chr8 (122-234)||(39693069-39693184)
chr8 (51-159)||(43247983-43248093)
chr8 (134-234)||(43639328-43639431)
chr8 (51-162)||(210662-210777)
chr8 (51-162)||(241480-241595)
chr8 (51-162)||(252065-252180)
chr8 (51-162)||(724285-724400)
chr8 (51-162)||(794835-794950)
chr8 (51-162)||(849476-849591)
chr8 (51-162)||(6150727-6150839)
chr8 (51-162)||(6160682-6160794)
chr8 (51-162)||(6319025-6319138)
chr8 (51-162)||(13689077-13689192)
chr8 (51-162)||(13697188-13697303)
chr8 (51-162)||(18449028-18449141)
chr8 (51-162)||(31214670-31214783)
chr8 (133-234)||(1210243-1210344)
chr8 (51-162)||(15791808-15791922)
chr8 (19-72)||(15969489-15969542)
chr8 (51-162)||(18153395-18153507)
chr8 (51-162)||(18157914-18158026)
chr8 (122-234)||(25850494-25850607)
chr8 (51-162)||(26120564-26120680)
chr8 (122-234)||(9320105-9320219)
chr8 (445-608)||(15425273-15425437)
chr8 (122-234)||(16206833-16206947)
chr8 (122-234)||(20256011-20256126)
chr8 (134-234)||(22673375-22673478)
chr8 (122-234)||(43773654-43773769)
chr8 (122-234)||(45292369-45292484)
chr8 (51-162)||(16746658-16746771)
chr8 (104-229)||(17879155-17879278)
chr8 (51-162)||(19138938-19139051)
chr8 (51-162)||(20161740-20161853)
chr8 (51-162)||(23469970-23470083)
chr8 (51-162)||(36077594-36077708)
chr8 (51-162)||(36088180-36088294)
chr8 (51-162)||(36292577-36292692)
chr8 (51-162)||(36303180-36303295)
chr8 (51-162)||(40213678-40213791)
chr8 (122-234)||(2810344-2810458)
chr8 (109-234)||(24678898-24679024)
chr8 (51-162)||(15781219-15781333)
chr8 (122-235)||(17442319-17442435)
chr8 (444-608)||(21932749-21932914)
chr8 (150-234)||(22462138-22462223)
chr8 (445-608)||(15336208-15336372)
chr8 (122-234)||(15336589-15336703)
chr8 (122-234)||(15425654-15425768)
chr8 (445-608)||(15516577-15516741)
chr8 (122-234)||(15516958-15517072)
chr8 (122-234)||(17796956-17797070)
chr8 (122-234)||(30421934-30422048)
chr8 (51-162)||(3349136-3349250)
chr8 (51-162)||(3359733-3359847)
chr8 (51-162)||(9340801-9340915)
chr8 (51-162)||(9367945-9368059)
chr8 (51-162)||(29076388-29076502)
chr8 (51-162)||(29086639-29086753)
chr8 (51-162)||(30315210-30315323)
chr8 (51-162)||(44480748-44480862)
chr8 (51-162)||(44491364-44491478)
chr8 (128-230)||(12541188-12541289)
chr8 (165-234)||(16188563-16188633)
chr8 (132-234)||(19505938-19506040)
chr8 (122-234)||(23264126-23264242)
chr8 (100-273)||(24634837-24635007)
chr8 (100-234)||(33052393-33052526)
chr8 (463-567)||(18121267-18121372)
chr8 (122-231)||(18121612-18121723)
chr8 (444-608)||(18321279-18321444)
chr8 (62-160)||(21287851-21287950)
chr8 (66-160)||(21540405-21540500)
chr8 (444-564)||(30421593-30421714)
chr8 (62-160)||(45568521-45568620)
chr8 (51-162)||(19418009-19418123)
chr8 (51-162)||(19428584-19428698)
chr8 (51-162)||(19224592-19224705)
chr8 (444-608)||(23185346-23185512)
chr8 (463-608)||(16188869-16189015)
chr8 (463-608)||(25163955-25164101)
chr8 (101-234)||(27739403-27739532)
chr8 (164-234)||(36104777-36104846)
chr8 (149-234)||(1744715-1744802)
chr8 (444-608)||(12757883-12758048)
chr8 (170-234)||(17701326-17701391)
chr8 (19-160)||(21298388-21298530)
chr8 (195-234)||(12193524-12193563)
chr8 (195-234)||(12437952-12437991)
chr8 (51-162)||(18769647-18769760)
chr8 (444-566)||(19943101-19943224)
chr8 (122-230)||(24645866-24645977)
chr8 (444-608)||(39693401-39693566)
chr8 (195-273)||(17526192-17526272)
chr8 (444-517)||(17701606-17701679)
chr8 (444-608)||(20382514-20382679)
chr8 (492-608)||(24646252-24646369)
chr8 (444-608)||(43644762-43644927)
chr8 (102-162)||(7018896-7018956)
chr8 (486-605)||(14989574-14989694)
chr8 (445-608)||(16207173-16207337)
chr8 (446-510)||(21288270-21288334)
chr8 (446-510)||(21298880-21298944)
chr8 (444-567)||(33082732-33082856)
chr8 (100-234)||(17687499-17687631)
chr8 (195-234)||(19155854-19155893)
chr8 (195-234)||(24498610-24498649)
chr8 (486-608)||(45538559-45538682)
chr8 (444-608)||(29693181-29693346)
chr8 (100-156)||(1210353-1210409)
chr8 (124-193)||(12758279-12758350)
chr8 (537-608)||(13430748-13430820)
chr8 (102-130)||(13689049-13689077)
chr8 (445-517)||(19707373-19707445)
chr8 (104-160)||(21298504-21298560)
chr8 (537-608)||(21300981-21301053)
chr8 (102-130)||(29076502-29076530)
chr8 (102-130)||(29086753-29086781)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (19-615)||(344-941)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (19-533)||(9907-10420)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (19-615)||(272-869)
scaffold0090 (19-615)||(4652-5249)
[»] scaffold0007 (5 HSPs)
scaffold0007 (88-615)||(59325-59851)
scaffold0007 (122-234)||(63913-64027)
scaffold0007 (122-234)||(46239-46353)
scaffold0007 (444-552)||(142971-143079)
scaffold0007 (164-234)||(142683-142753)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (19-526)||(38120-38626)
[»] chr3 (399 HSPs)
chr3 (132-615)||(21735868-21736351)
chr3 (19-615)||(27172481-27173073)
chr3 (102-615)||(2246094-2246608)
chr3 (102-615)||(15662699-15663212)
chr3 (122-615)||(15651064-15651557)
chr3 (19-608)||(10528786-10529384)
chr3 (91-615)||(14580858-14581379)
chr3 (102-615)||(13199236-13199752)
chr3 (104-615)||(31113980-31114494)
chr3 (102-615)||(1053438-1053950)
chr3 (102-615)||(1063867-1064379)
chr3 (102-615)||(29933552-29934066)
chr3 (102-615)||(29982706-29983220)
chr3 (102-568)||(29906221-29906687)
chr3 (102-568)||(29947386-29947852)
chr3 (102-568)||(29996540-29997006)
chr3 (102-615)||(16076658-16077170)
chr3 (102-615)||(16671156-16671667)
chr3 (122-615)||(8740121-8740611)
chr3 (103-615)||(51989137-51989654)
chr3 (51-615)||(28168757-28169322)
chr3 (132-615)||(9006502-9006984)
chr3 (102-615)||(27883112-27883624)
chr3 (102-615)||(17281427-17281940)
chr3 (102-615)||(8995950-8996462)
chr3 (19-608)||(13147705-13148304)
chr3 (104-615)||(41045271-41045788)
chr3 (19-425)||(17017442-17017854)
chr3 (104-604)||(22150774-22151280)
chr3 (122-615)||(38314443-38314940)
chr3 (122-615)||(9380650-9381143)
chr3 (122-615)||(9391196-9391689)
chr3 (122-615)||(11216715-11217210)
chr3 (122-615)||(11163579-11164070)
chr3 (122-615)||(6500997-6501488)
chr3 (122-615)||(1784064-1784556)
chr3 (122-615)||(9993887-9994378)
chr3 (122-615)||(48336991-48337482)
chr3 (122-615)||(4404022-4404513)
chr3 (122-615)||(6490343-6490834)
chr3 (122-615)||(12237608-12238098)
chr3 (122-615)||(23635459-23635951)
chr3 (104-568)||(49989789-49990259)
chr3 (122-615)||(1794476-1794969)
chr3 (51-615)||(8784917-8785485)
chr3 (122-615)||(13261667-13262158)
chr3 (122-615)||(12249434-12249924)
chr3 (122-615)||(9981879-9982370)
chr3 (122-615)||(39672876-39673368)
chr3 (122-615)||(4743488-4743979)
chr3 (122-615)||(4174750-4175242)
chr3 (122-615)||(9535359-9535849)
chr3 (122-615)||(41683428-41683920)
chr3 (122-615)||(41693997-41694489)
chr3 (122-615)||(933377-933868)
chr3 (91-574)||(18006010-18006496)
chr3 (122-615)||(29461207-29461698)
chr3 (122-615)||(29472059-29472550)
chr3 (122-615)||(504161-504653)
chr3 (122-615)||(526527-527019)
chr3 (122-615)||(24706548-24707040)
chr3 (122-615)||(5865687-5866181)
chr3 (122-615)||(5876286-5876780)
chr3 (122-615)||(37759419-37759912)
chr3 (122-615)||(5628011-5628503)
chr3 (122-615)||(7794601-7795092)
chr3 (122-615)||(7804512-7805003)
chr3 (122-615)||(20720863-20721355)
chr3 (122-615)||(35187127-35187619)
chr3 (122-615)||(37885328-37885820)
chr3 (122-615)||(5510446-5510937)
chr3 (122-615)||(5520624-5521115)
chr3 (122-615)||(10098818-10099309)
chr3 (122-615)||(13372663-13373151)
chr3 (122-615)||(13383257-13383745)
chr3 (104-425)||(17006722-17007048)
chr3 (104-608)||(12752741-12753253)
chr3 (122-615)||(20683774-20684264)
chr3 (122-615)||(5537015-5537506)
chr3 (122-615)||(8774407-8774900)
chr3 (122-613)||(10626937-10627427)
chr3 (122-615)||(5579627-5580119)
chr3 (122-615)||(13121412-13121904)
chr3 (122-615)||(13557324-13557816)
chr3 (122-615)||(14465341-14465833)
chr3 (122-615)||(23757048-23757540)
chr3 (122-615)||(23767644-23768136)
chr3 (122-615)||(24383512-24384004)
chr3 (122-615)||(24659650-24660142)
chr3 (122-615)||(37866195-37866687)
chr3 (122-615)||(4754075-4754564)
chr3 (122-615)||(13393851-13394339)
chr3 (122-615)||(20673189-20673679)
chr3 (122-613)||(10655259-10655749)
chr3 (122-615)||(19778135-19778627)
chr3 (122-615)||(19788772-19789264)
chr3 (122-615)||(28314225-28314718)
chr3 (122-615)||(18483794-18484287)
chr3 (127-615)||(19887348-19887834)
chr3 (122-615)||(38194474-38194967)
chr3 (122-615)||(38205010-38205503)
chr3 (122-615)||(5547599-5548090)
chr3 (104-608)||(15832936-15833442)
chr3 (122-615)||(6220695-6221187)
chr3 (122-615)||(24670230-24670722)
chr3 (122-615)||(14475971-14476465)
chr3 (122-608)||(51340557-51341049)
chr3 (122-615)||(11272376-11272869)
chr3 (19-337)||(45861983-45862306)
chr3 (122-615)||(12286972-12287465)
chr3 (100-574)||(17961071-17961551)
chr3 (122-615)||(23647499-23647990)
chr3 (122-615)||(28324841-28325332)
chr3 (242-615)||(4456784-4457156)
chr3 (122-544)||(16385825-16386243)
chr3 (122-615)||(12296794-12297287)
chr3 (122-615)||(13131654-13132147)
chr3 (189-615)||(17909996-17910420)
chr3 (122-615)||(6180521-6181013)
chr3 (122-615)||(39371803-39372296)
chr3 (122-615)||(39382440-39382933)
chr3 (19-416)||(37412048-37412450)
chr3 (400-615)||(18851686-18851901)
chr3 (104-305)||(11909467-11909672)
chr3 (31-162)||(2245993-2246124)
chr3 (103-280)||(15848729-15848910)
chr3 (442-615)||(16666121-16666294)
chr3 (19-160)||(51989627-51989768)
chr3 (19-162)||(13199722-13199864)
chr3 (104-338)||(13953791-13954022)
chr3 (19-160)||(31114468-31114609)
chr3 (19-160)||(41045154-41045297)
chr3 (19-162)||(15663212-15663355)
chr3 (19-162)||(15651577-15651720)
chr3 (19-130)||(21735785-21735896)
chr3 (19-161)||(17006606-17006749)
chr3 (19-162)||(17281910-17282050)
chr3 (19-160)||(22150658-22150800)
chr3 (19-162)||(29934036-29934176)
chr3 (19-162)||(29983190-29983330)
chr3 (122-338)||(14321962-14322177)
chr3 (19-162)||(1053327-1053468)
chr3 (19-162)||(1063756-1063897)
chr3 (19-162)||(16076547-16076688)
chr3 (19-162)||(29906657-29906797)
chr3 (19-162)||(29947822-29947962)
chr3 (19-162)||(29996976-29997116)
chr3 (444-615)||(16391608-16391780)
chr3 (122-234)||(16032139-16032252)
chr3 (361-608)||(15850799-15851048)
chr3 (50-162)||(16671637-16671751)
chr3 (19-160)||(14580753-14580897)
chr3 (19-155)||(27883002-27883135)
chr3 (122-234)||(52919978-52920091)
chr3 (122-234)||(12963586-12963701)
chr3 (501-615)||(15216334-15216448)
chr3 (122-273)||(17239383-17239539)
chr3 (122-234)||(17697161-17697274)
chr3 (362-568)||(45861733-45861941)
chr3 (122-273)||(8874580-8874735)
chr3 (503-615)||(12567264-12567376)
chr3 (124-234)||(12967854-12967965)
chr3 (19-155)||(8996439-8996572)
chr3 (122-271)||(11206411-11206559)
chr3 (19-160)||(15832820-15832962)
chr3 (122-234)||(2025629-2025744)
chr3 (122-234)||(21606157-21606272)
chr3 (100-234)||(13698891-13699026)
chr3 (122-273)||(40799439-40799594)
chr3 (122-234)||(49554003-49554117)
chr3 (134-273)||(50299787-50299931)
chr3 (19-155)||(9006991-9007124)
chr3 (122-234)||(14007109-14007221)
chr3 (122-234)||(29951939-29952052)
chr3 (122-234)||(30001093-30001206)
chr3 (19-160)||(49989673-49989815)
chr3 (122-234)||(6090271-6090386)
chr3 (103-234)||(8729489-8729621)
chr3 (103-234)||(9081376-9081508)
chr3 (122-234)||(13947879-13947994)
chr3 (122-234)||(30054683-30054798)
chr3 (51-162)||(4175232-4175345)
chr3 (51-162)||(5537496-5537609)
chr3 (51-162)||(5548080-5548193)
chr3 (51-162)||(6181003-6181116)
chr3 (51-162)||(6221177-6221290)
chr3 (51-162)||(13121309-13121422)
chr3 (51-162)||(13131551-13131664)
chr3 (51-162)||(13557221-13557334)
chr3 (51-162)||(14475868-14475981)
chr3 (51-162)||(19778032-19778145)
chr3 (51-162)||(19788669-19788782)
chr3 (51-162)||(23756945-23757058)
chr3 (51-162)||(23767541-23767654)
chr3 (51-162)||(37866092-37866205)
chr3 (51-162)||(37885225-37885338)
chr3 (51-162)||(39673358-39673471)
chr3 (124-234)||(41494543-41494654)
chr3 (122-234)||(2784606-2784722)
chr3 (50-162)||(8740601-8740714)
chr3 (519-608)||(17021975-17022065)
chr3 (122-273)||(22140306-22140461)
chr3 (122-235)||(4433509-4433622)
chr3 (122-234)||(12396611-12396724)
chr3 (122-234)||(14072242-14072354)
chr3 (122-234)||(14077822-14077934)
chr3 (122-234)||(15961132-15961245)
chr3 (51-162)||(23647395-23647509)
chr3 (122-234)||(26418178-26418291)
chr3 (133-230)||(31302899-31302999)
chr3 (122-234)||(11223105-11223220)
chr3 (122-234)||(13823607-13823722)
chr3 (62-159)||(15848597-15848695)
chr3 (122-234)||(15902738-15902853)
chr3 (19-145)||(18857426-18857548)
chr3 (122-234)||(20645696-20645811)
chr3 (134-234)||(21640420-21640523)
chr3 (122-234)||(28581647-28581761)
chr3 (122-234)||(38178147-38178261)
chr3 (122-234)||(40850518-40850633)
chr3 (122-234)||(46796870-46796984)
chr3 (122-234)||(47405925-47406040)
chr3 (51-160)||(4403920-4404030)
chr3 (51-160)||(4433407-4433517)
chr3 (51-162)||(5580109-5580224)
chr3 (51-162)||(5628493-5628608)
chr3 (51-162)||(6490824-6490937)
chr3 (51-162)||(6501478-6501591)
chr3 (51-162)||(9994368-9994481)
chr3 (51-162)||(10627417-10627530)
chr3 (51-162)||(11272859-11272974)
chr3 (51-162)||(12249914-12250027)
chr3 (51-162)||(12297277-12297392)
chr3 (51-162)||(13262148-13262261)
chr3 (189-256)||(14258416-14258482)
chr3 (122-234)||(16879560-16879673)
chr3 (51-162)||(20684254-20684366)
chr3 (51-162)||(23635356-23635469)
chr3 (133-234)||(7833129-7833231)
chr3 (103-234)||(16881813-16881945)
chr3 (122-234)||(22804523-22804639)
chr3 (122-273)||(49643222-49643378)
chr3 (126-234)||(6174884-6174993)
chr3 (51-162)||(11163477-11163589)
chr3 (122-234)||(19198381-19198493)
chr3 (122-234)||(20724632-20724745)
chr3 (51-162)||(24707030-24707144)
chr3 (444-608)||(47405542-47405707)
chr3 (122-234)||(1728518-1728633)
chr3 (122-234)||(5213120-5213234)
chr3 (122-234)||(9700540-9700655)
chr3 (122-229)||(10851354-10851461)
chr3 (122-234)||(14393505-14393620)
chr3 (134-234)||(14954983-14955085)
chr3 (122-234)||(20627936-20628050)
chr3 (134-234)||(21638746-21638849)
chr3 (122-233)||(23538666-23538778)
chr3 (122-234)||(52283273-52283387)
chr3 (122-234)||(53057232-53057347)
chr3 (51-162)||(1794959-1795072)
chr3 (51-162)||(5510342-5510456)
chr3 (51-162)||(5520520-5520634)
chr3 (51-162)||(5866171-5866286)
chr3 (51-162)||(5876770-5876885)
chr3 (51-162)||(8774303-8774417)
chr3 (51-162)||(9391679-9391792)
chr3 (51-162)||(9982360-9982473)
chr3 (51-162)||(10098714-10098828)
chr3 (51-162)||(10655739-10655852)
chr3 (51-162)||(11217200-11217313)
chr3 (51-162)||(12238088-12238201)
chr3 (51-162)||(12287455-12287570)
chr3 (51-162)||(13373141-13373256)
chr3 (51-162)||(13394329-13394444)
chr3 (520-615)||(14321676-14321771)
chr3 (51-162)||(20720758-20720873)
chr3 (51-162)||(24383994-24384109)
chr3 (51-162)||(28314708-28314822)
chr3 (51-162)||(28325322-28325436)
chr3 (51-162)||(29472540-29472653)
chr3 (51-162)||(37759316-37759429)
chr3 (51-162)||(38194370-38194484)
chr3 (51-162)||(38204906-38205020)
chr3 (51-162)||(39382336-39382450)
chr3 (51-162)||(48336888-48337001)
chr3 (363-565)||(11909188-11909393)
chr3 (103-234)||(13410549-13410681)
chr3 (51-147)||(14258555-14258653)
chr3 (132-230)||(16305651-16305749)
chr3 (100-234)||(27849710-27849843)
chr3 (122-273)||(46350307-46350463)
chr3 (124-234)||(47207248-47207360)
chr3 (444-608)||(49642883-49643048)
chr3 (122-213)||(12726758-12726851)
chr3 (19-160)||(13953675-13953817)
chr3 (166-234)||(18143248-18143316)
chr3 (51-162)||(20673669-20673782)
chr3 (134-223)||(49669003-49669095)
chr3 (19-160)||(51340393-51340535)
chr3 (51-162)||(933273-933387)
chr3 (122-230)||(2560729-2560839)
chr3 (122-234)||(3238234-3238348)
chr3 (51-162)||(17910480-17910594)
chr3 (51-147)||(19887843-19887942)
chr3 (134-234)||(22463595-22463698)
chr3 (134-234)||(22465053-22465156)
chr3 (122-186)||(22770411-22770475)
chr3 (122-234)||(24776035-24776149)
chr3 (51-162)||(504643-504757)
chr3 (51-162)||(527009-527123)
chr3 (51-162)||(1784546-1784659)
chr3 (51-162)||(4743384-4743498)
chr3 (51-162)||(4753971-4754085)
chr3 (51-162)||(9381133-9381246)
chr3 (51-162)||(11206549-11206662)
chr3 (51-162)||(16385721-16385835)
chr3 (51-162)||(18483690-18483804)
chr3 (51-162)||(24659546-24659660)
chr3 (51-162)||(24670126-24670240)
chr3 (51-162)||(29461688-29461801)
chr3 (124-231)||(33582775-33582884)
chr3 (51-162)||(35187023-35187137)
chr3 (51-162)||(39371699-39371813)
chr3 (51-162)||(41683324-41683438)
chr3 (51-162)||(41693893-41694007)
chr3 (103-273)||(4243581-4243754)
chr3 (122-234)||(12389373-12389487)
chr3 (132-234)||(12410298-12410399)
chr3 (100-234)||(13931482-13931615)
chr3 (122-273)||(17667946-17668102)
chr3 (136-273)||(19249873-19250013)
chr3 (444-608)||(2561061-2561226)
chr3 (122-234)||(6252964-6253077)
chr3 (19-144)||(12753243-12753369)
chr3 (51-162)||(14322167-14322279)
chr3 (444-608)||(20646027-20646192)
chr3 (51-162)||(38314341-38314453)
chr3 (51-162)||(7795082-7795196)
chr3 (51-162)||(7804993-7805107)
chr3 (122-234)||(13781087-13781202)
chr3 (99-234)||(21317040-21317176)
chr3 (134-234)||(29854962-29855065)
chr3 (104-160)||(51340509-51340565)
chr3 (100-234)||(11078212-11078346)
chr3 (51-162)||(13383735-13383850)
chr3 (486-608)||(14393125-14393248)
chr3 (164-234)||(22128631-22128701)
chr3 (490-608)||(49666526-49666645)
chr3 (51-141)||(13601880-13601973)
chr3 (479-615)||(16476382-16476520)
chr3 (463-608)||(37467225-37467371)
chr3 (62-160)||(11909646-11909745)
chr3 (103-160)||(15848699-15848756)
chr3 (444-608)||(22804144-22804309)
chr3 (444-608)||(29951559-29951724)
chr3 (444-608)||(30000713-30000878)
chr3 (444-608)||(31303259-31303424)
chr3 (164-231)||(18122119-18122186)
chr3 (444-532)||(49553687-49553775)
chr3 (100-155)||(13292159-13292214)
chr3 (180-234)||(16659120-16659175)
chr3 (486-608)||(24775655-24775778)
chr3 (195-234)||(25398759-25398798)
chr3 (486-608)||(40799789-40799912)
chr3 (122-193)||(2783020-2783093)
chr3 (51-160)||(15194516-15194628)
chr3 (463-532)||(16812105-16812174)
chr3 (444-517)||(18142957-18143030)
chr3 (195-231)||(1463906-1463942)
chr3 (493-608)||(2784987-2785102)
chr3 (51-162)||(9535255-9535369)
chr3 (537-608)||(13780705-13780777)
chr3 (102-162)||(15663182-15663242)
chr3 (104-160)||(15848670-15848726)
chr3 (164-231)||(19889447-19889515)
chr3 (444-552)||(28581979-28582087)
chr3 (444-567)||(38177805-38177929)
chr3 (445-532)||(20627629-20627716)
chr3 (463-517)||(18121827-18121881)
chr3 (463-517)||(20724980-20725034)
chr3 (487-608)||(21605775-21605897)
chr3 (463-567)||(3238586-3238691)
chr3 (104-141)||(8710418-8710455)
chr3 (104-141)||(9062305-9062342)
chr3 (122-163)||(10928584-10928625)
chr3 (122-207)||(14968904-14968991)
chr3 (444-608)||(16658739-16658904)
chr3 (132-161)||(18005989-18006018)
chr3 (463-516)||(23538379-23538432)
chr3 (51-103)||(33650847-33650900)
chr3 (537-608)||(1728136-1728208)
chr3 (102-130)||(5510456-5510484)
chr3 (102-130)||(5520634-5520662)
chr3 (102-130)||(5580081-5580109)
chr3 (102-130)||(5628465-5628493)
chr3 (102-130)||(12287427-12287455)
chr3 (102-130)||(12297249-12297277)
chr3 (122-162)||(12756019-12756059)
chr3 (122-162)||(14427555-14427595)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (102-615)||(29183-29698)
scaffold0163 (19-162)||(29071-29213)
[»] scaffold0154 (2 HSPs)
scaffold0154 (102-615)||(35248-35760)
scaffold0154 (19-162)||(35136-35278)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (19-568)||(1117-1670)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (19-615)||(60666-61267)
scaffold0005 (122-234)||(211900-212014)
scaffold0005 (444-608)||(212231-212393)
[»] scaffold0739 (2 HSPs)
scaffold0739 (102-615)||(1704-2217)
scaffold0739 (19-162)||(1595-1734)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (102-615)||(5006-5518)
scaffold0042 (19-162)||(4897-5036)
[»] scaffold0017 (7 HSPs)
scaffold0017 (122-615)||(40378-40876)
scaffold0017 (104-615)||(58924-59440)
scaffold0017 (132-615)||(175062-175547)
scaffold0017 (19-160)||(59414-59555)
scaffold0017 (19-160)||(40868-41011)
scaffold0017 (19-130)||(174981-175090)
scaffold0017 (164-224)||(10113-10174)
[»] scaffold0084 (7 HSPs)
scaffold0084 (102-615)||(56815-57328)
scaffold0084 (104-337)||(731-970)
scaffold0084 (19-162)||(57298-57439)
scaffold0084 (362-568)||(483-690)
scaffold0084 (122-234)||(48876-48991)
scaffold0084 (19-160)||(944-1086)
scaffold0084 (486-608)||(32401-32524)
[»] scaffold0407 (3 HSPs)
scaffold0407 (122-615)||(12149-12642)
scaffold0407 (497-615)||(15980-16098)
scaffold0407 (19-162)||(12632-12773)
[»] scaffold0012 (6 HSPs)
scaffold0012 (102-614)||(127357-127868)
scaffold0012 (195-615)||(140608-141028)
scaffold0012 (139-615)||(7683-8164)
scaffold0012 (102-295)||(16315-16508)
scaffold0012 (19-162)||(127243-127387)
scaffold0012 (19-162)||(16202-16345)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (261-615)||(58170-58524)
scaffold0073 (19-216)||(57962-58159)
[»] scaffold0497 (2 HSPs)
scaffold0497 (102-615)||(10321-10833)
scaffold0497 (19-162)||(10803-10943)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (102-612)||(15438-15949)
scaffold0410 (19-162)||(15328-15468)
[»] scaffold2071 (1 HSPs)
scaffold2071 (19-318)||(801-1100)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (122-608)||(61279-61771)
scaffold0010 (19-160)||(61143-61287)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (122-615)||(40232-40725)
scaffold0142 (19-162)||(40102-40242)
[»] scaffold0002 (7 HSPs)
scaffold0002 (104-608)||(475322-475834)
scaffold0002 (104-608)||(481842-482354)
scaffold0002 (164-608)||(156698-157149)
scaffold0002 (441-615)||(117147-117321)
scaffold0002 (19-160)||(475808-475950)
scaffold0002 (19-160)||(482328-482470)
scaffold0002 (100-210)||(111894-112004)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (122-615)||(36768-37259)
scaffold0072 (51-162)||(37249-37362)
[»] scaffold0655 (2 HSPs)
scaffold0655 (122-608)||(4664-5156)
scaffold0655 (19-160)||(4529-4672)
[»] scaffold0068 (4 HSPs)
scaffold0068 (122-615)||(10635-11131)
scaffold0068 (122-615)||(7788-8284)
scaffold0068 (51-162)||(11121-11234)
scaffold0068 (86-162)||(8274-8351)
[»] scaffold0047 (5 HSPs)
scaffold0047 (122-615)||(32937-33427)
scaffold0047 (122-615)||(40486-40978)
scaffold0047 (51-162)||(40968-41081)
scaffold0047 (122-234)||(8179-8292)
scaffold0047 (51-162)||(33417-33530)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (122-615)||(6919-7409)
scaffold0322 (51-162)||(7399-7512)
[»] scaffold1263 (2 HSPs)
scaffold1263 (104-608)||(1200-1711)
scaffold1263 (19-160)||(1685-1827)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (230-483)||(16349-16601)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (313-615)||(12858-13161)
[»] scaffold1321 (2 HSPs)
scaffold1321 (104-608)||(1007-1518)
scaffold1321 (19-160)||(1492-1634)
[»] scaffold0570 (3 HSPs)
scaffold0570 (133-608)||(1744-2227)
scaffold0570 (19-162)||(6-146)
scaffold0570 (19-162)||(2227-2371)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (122-615)||(14314-14807)
scaffold0028 (189-615)||(54157-54581)
scaffold0028 (133-234)||(80952-81054)
scaffold0028 (51-162)||(14211-14324)
scaffold0028 (51-162)||(54638-54751)
scaffold0028 (150-233)||(6056-6141)
[»] scaffold0133 (4 HSPs)
scaffold0133 (122-612)||(42557-43045)
scaffold0133 (122-615)||(30863-31355)
scaffold0133 (51-162)||(30758-30873)
scaffold0133 (101-162)||(43035-43095)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (122-611)||(2256-2743)
scaffold0391 (51-162)||(2733-2847)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (122-568)||(6828-7283)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (104-608)||(20449-20956)
scaffold0177 (62-160)||(20930-21029)
[»] scaffold0422 (3 HSPs)
scaffold0422 (104-568)||(11289-11760)
scaffold0422 (21-160)||(11146-11285)
scaffold0422 (104-160)||(11259-11315)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (104-567)||(38197-38667)
scaffold0132 (62-159)||(38642-38740)
[»] scaffold0908 (2 HSPs)
scaffold0908 (104-568)||(4008-4481)
scaffold0908 (62-156)||(4459-4554)
[»] scaffold0105 (5 HSPs)
scaffold0105 (122-615)||(7692-8185)
scaffold0105 (122-615)||(36990-37483)
scaffold0105 (51-162)||(7587-7702)
scaffold0105 (51-162)||(37473-37588)
scaffold0105 (457-615)||(47624-47785)
[»] scaffold0280 (3 HSPs)
scaffold0280 (329-608)||(17878-18160)
scaffold0280 (122-234)||(3183-3297)
scaffold0280 (445-608)||(2802-2966)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (122-615)||(6875-7367)
scaffold0027 (51-162)||(7357-7470)
[»] scaffold0185 (3 HSPs)
scaffold0185 (103-333)||(32519-32750)
scaffold0185 (23-160)||(32407-32546)
scaffold0185 (551-608)||(9278-9335)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (265-615)||(13641-13989)
[»] scaffold0207 (5 HSPs)
scaffold0207 (104-510)||(10250-10659)
scaffold0207 (104-502)||(20151-20552)
scaffold0207 (19-158)||(19975-20115)
scaffold0207 (106-160)||(20123-20177)
scaffold0207 (124-160)||(10240-10276)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (62-305)||(2191-2439)
scaffold0220 (363-565)||(1912-2117)
[»] scaffold0386 (2 HSPs)
scaffold0386 (122-615)||(12088-12579)
scaffold0386 (51-162)||(11985-12098)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (19-155)||(5323-5459)
[»] scaffold0018 (4 HSPs)
scaffold0018 (103-305)||(6831-7037)
scaffold0018 (405-568)||(6634-6799)
scaffold0018 (62-160)||(7040-7139)
scaffold0018 (104-160)||(7010-7066)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (362-615)||(52136-52393)
[»] scaffold0664 (2 HSPs)
scaffold0664 (122-345)||(909-1129)
scaffold0664 (400-564)||(1198-1363)
[»] scaffold0771 (3 HSPs)
scaffold0771 (134-338)||(5901-6110)
scaffold0771 (122-234)||(19-134)
scaffold0771 (19-130)||(5815-5927)
[»] scaffold0050 (3 HSPs)
scaffold0050 (103-239)||(35174-35311)
scaffold0050 (19-159)||(35030-35170)
scaffold0050 (104-160)||(35145-35201)
[»] scaffold0747 (3 HSPs)
scaffold0747 (122-304)||(2421-2601)
scaffold0747 (419-615)||(2824-3021)
scaffold0747 (51-162)||(2318-2431)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (445-615)||(6252-6423)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (455-615)||(1-162)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (19-160)||(13941-14084)
[»] scaffold0297 (3 HSPs)
scaffold0297 (104-239)||(9497-9635)
scaffold0297 (248-568)||(16632-16954)
scaffold0297 (62-160)||(9424-9523)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (188-338)||(2652-2799)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (99-234)||(4464-4599)
scaffold0040 (149-234)||(1962-2048)
scaffold0040 (102-162)||(8260-8320)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (122-234)||(9502-9615)
scaffold0324 (444-608)||(9830-9995)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (122-234)||(21429-21542)
scaffold0116 (122-234)||(2427-2542)
scaffold0116 (463-608)||(21043-21189)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (122-234)||(29339-29452)
scaffold0035 (122-234)||(99660-99775)
scaffold0035 (122-273)||(19880-20035)
scaffold0035 (463-564)||(19588-19690)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (122-234)||(74127-74240)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (104-193)||(165125-165214)
scaffold0011 (122-234)||(65859-65974)
scaffold0011 (122-234)||(144904-145019)
scaffold0011 (103-229)||(59086-59212)
scaffold0011 (19-144)||(165204-165330)
scaffold0011 (527-608)||(165018-165100)
scaffold0011 (133-234)||(251160-251260)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (122-234)||(107-221)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (122-234)||(1203-1317)
scaffold0210 (444-608)||(1534-1699)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (149-234)||(268353-268439)
scaffold0009 (122-234)||(83936-84050)
scaffold0009 (444-566)||(84269-84392)
[»] scaffold0099 (3 HSPs)
scaffold0099 (400-533)||(19247-19383)
scaffold0099 (189-523)||(17067-17414)
scaffold0099 (188-306)||(19020-19140)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (122-230)||(158655-158764)
scaffold0022 (122-234)||(36943-37058)
scaffold0022 (122-234)||(135003-135118)
scaffold0022 (444-517)||(37276-37349)
scaffold0022 (444-517)||(135336-135409)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (122-234)||(144451-144564)
scaffold0020 (463-517)||(144799-144853)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (122-234)||(13115-13230)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (122-234)||(7369-7484)
scaffold0334 (486-562)||(7740-7817)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (122-273)||(14661-14816)
[»] scaffold0004 (6 HSPs)
scaffold0004 (122-234)||(210942-211057)
scaffold0004 (122-234)||(244734-244846)
scaffold0004 (122-234)||(219784-219897)
scaffold0004 (122-234)||(87950-88063)
scaffold0004 (122-234)||(377999-378114)
scaffold0004 (444-609)||(377630-377796)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (101-234)||(3797-3931)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (122-234)||(6144-6259)
scaffold0359 (486-608)||(5762-5885)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (122-234)||(88054-88169)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (150-234)||(7496-7583)
scaffold0026 (122-234)||(59560-59675)
scaffold0026 (444-608)||(7800-7965)
scaffold0026 (444-608)||(59890-60055)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (133-234)||(103126-103229)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (124-234)||(5727-5840)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (122-231)||(729-839)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (124-234)||(5737-5850)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (122-234)||(864-976)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (122-214)||(2204-2297)
scaffold0622 (99-234)||(3849-3985)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (19-80)||(1884-1945)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (122-234)||(22558-22670)
scaffold0273 (136-234)||(5189-5288)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (122-230)||(2776-2885)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (122-234)||(32239-32352)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (122-234)||(11740-11855)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (123-234)||(19621-19733)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (122-234)||(18219-18334)
scaffold0249 (537-608)||(17837-17909)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (122-234)||(16170-16285)
scaffold0247 (122-234)||(25830-25945)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (122-229)||(256-363)
scaffold0003 (150-231)||(90513-90596)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (122-234)||(22584-22698)
scaffold0217 (122-234)||(18574-18687)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (127-234)||(1331-1439)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (128-234)||(7645-7749)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (122-234)||(435-547)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (122-234)||(2246-2359)
scaffold0598 (463-517)||(1958-2012)
[»] scaffold0161 (4 HSPs)
scaffold0161 (122-234)||(10561-10674)
scaffold0161 (122-234)||(15225-15338)
scaffold0161 (444-608)||(10180-10345)
scaffold0161 (444-608)||(14844-15009)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (122-234)||(37187-37299)
scaffold0120 (122-234)||(41706-41818)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (122-226)||(76759-76864)
[»] scaffold1026 (1 HSPs)
scaffold1026 (103-232)||(2609-2739)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (122-234)||(7366-7480)
scaffold0251 (444-608)||(7579-7742)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (122-234)||(393-508)
scaffold0205 (165-234)||(248-318)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (122-229)||(18741-18848)
scaffold0201 (524-615)||(7362-7453)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (122-234)||(8699-8813)
scaffold0176 (487-608)||(9072-9194)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (532-615)||(8096-8179)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (122-231)||(27887-27994)
[»] scaffold0567 (2 HSPs)
scaffold0567 (122-230)||(9449-9561)
scaffold0567 (444-517)||(9780-9853)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (122-234)||(2440-2554)
scaffold0530 (444-565)||(2107-2229)
[»] scaffold0774 (1 HSPs)
scaffold0774 (562-615)||(6397-6450)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (122-213)||(9508-9601)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (149-234)||(5778-5866)
scaffold0069 (537-608)||(5397-5469)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (122-234)||(78809-78923)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (122-234)||(265-380)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (133-216)||(9494-9577)
[»] scaffold1657 (1 HSPs)
scaffold1657 (133-234)||(1396-1498)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (164-234)||(2893-2963)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (122-232)||(19078-19191)
[»] scaffold0211 (3 HSPs)
scaffold0211 (104-162)||(1-59)
scaffold0211 (499-608)||(15694-15804)
scaffold0211 (19-160)||(33-175)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (122-234)||(13588-13701)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (134-234)||(1109-1211)
[»] scaffold0859 (2 HSPs)
scaffold0859 (122-234)||(2524-2638)
scaffold0859 (486-567)||(2900-2980)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (138-234)||(31296-31395)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (164-235)||(44342-44414)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (164-234)||(5594-5664)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (134-231)||(1277-1377)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (122-234)||(16582-16695)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (149-234)||(26121-26209)
scaffold0056 (122-234)||(35258-35374)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (122-234)||(7194-7308)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (195-234)||(7611-7650)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (100-232)||(4920-5048)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (486-608)||(12125-12248)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (463-565)||(26090-26193)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (554-615)||(1694-1755)
[»] scaffold0683 (1 HSPs)
scaffold0683 (195-232)||(9-46)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (445-608)||(14523-14687)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (51-103)||(23399-23452)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 526; Significance: 0; HSPs: 332)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 13522634 - 13523231
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13522634 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 13522733  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
13522734 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcag 13522833  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
13522834 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactccagacttgagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatt 13522933  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13522934 tggcagagtttaggcgcttttaacttgtgatattgtctatgcagatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 13523033  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
13523034 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaagatcaacttcaaattcattcc 13523133  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13523134 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 13523231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20168775 - 20168178
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20168775 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 20168676  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
20168675 gcgagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactctgaacacttgatatacaatcag 20168576  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
20168575 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatt 20168476  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
20168475 tggcagagttttggagcttttaacttgtgataatgtctctactgatcttcaagtcttcatttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctta 20168376  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20168375 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 20168276  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
20168275 tatcttgagggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtacttt 20168178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 35543836 - 35543240
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
35543836 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcatgcag 35543737  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
35543736 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctgatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 35543637  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaattt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
35543636 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactatagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaattt 35543537  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
35543536 ggcagatttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatcttta 35543437  T
419 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
35543436 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccacaagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcat 35543337  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
35543336 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatattgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtcgaggtagtggttgtacacttgtacttt 35543240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36096360 - 36095764
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36096360 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 36096261  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
36096260 gcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcag 36096161  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
36096160 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgattttgagaaacaaatt 36096061  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
36096060 tggcagagtttggacgctttaaccttgtagtaatgtctctgctgatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctta 36095961  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
36095960 agcacgtctaaagattcgttgag-acctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcc 36095862  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
36095861 tatcttgaaggaacaattttgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36095764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36097817 - 36097221
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36097817 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 36097718  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
36097717 gcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcag 36097618  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
36097617 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgattttgagaaacaaatt 36097518  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
36097517 tggcagagtttggacgctttaaccttgtagtaatgtctctgctgatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctta 36097418  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
36097417 agcacgtctaaagattcgttgag-acctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcc 36097319  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
36097318 tatcttgaaggaacaattttgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36097221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 132 - 615
Target Start/End: Original strand, 13533474 - 13533958
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
13533474 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaataacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcaatagtgttcacaat 13533573  T
231 acaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
13533574 acaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagtttgg 13533673  T
331 gcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaag 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
13533674 gcgcttttaacttgtgataatgtctctgcagatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgcgatcttaagcacgtctaaag 13533773  T
431 agtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaa 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13533774 agtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaa 13533873  T
531 caattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13533874 caattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 13533958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 40033466 - 40032869
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
40033466 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 40033367  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatc 215  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
40033366 aggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatt 40033267  T
216 aatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttg--agaa 310  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||   |||    
40033266 agtggtgttcacaatacaatgcaaatgaatgactctctagacttaagaatttctaagatttatcaaatgaacacagaaattcaaagtgcttttgtatgaa 40033167  T
311 ttaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttga 410  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||    
40033166 acaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtattgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagatgtgtgtaaagagacgttga 40033067  T
411 gatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaa 509  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||    
40033066 gatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaa 40032967  T
510 ttcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacact 607  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
40032966 tccattcctatcttgaaggaacatttctgcaagcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacact 40032869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 19 - 608
Target Start/End: Original strand, 1914855 - 1915452
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||      
1914855 ccttgcactttcaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcgagcacta 1914954  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatc 215  Q
    | || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
1914955 aagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatc 1915054  T
216 aatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactct--agacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttga--gaa 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||   |||    
1915055 agtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgcttttgtatgaa 1915154  T
311 ttaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttga 410  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||    
1915155 acaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtattgtctctgctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-atagagacgttga 1915253  T
411 gatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaa 509  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||    
1915254 gatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaa 1915353  T
510 ttcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
1915354 tccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagttgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 1915452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20417529 - 20417015
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
20417529 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgactttgaac 20417431  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
20417430 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgagaatttctaatatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 20417332  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||    
20417331 ctatttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttttaacttgtgttgatatctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtagtgagta 20417232  T
399 gagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
20417231 gagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttagatgtagtcctatgaagga 20417132  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
20417131 tcaacttcaaattcattcctctcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 20417032  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
20417031 ttgtacacttgtacttt 20417015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 106745 - 106232
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||    
106745 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaaagt-gtttgactttgaac 106647  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
106646 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 106548  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||| |||||| |     
106547 ctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttcaacttgtgttaatgtctcttaccaatcttcaagtctccactcctttatatagaggtgtgaa- 106449  T
400 agagacgttgagatctta-agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
106448 agagacgttgagattttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagga 106349  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  || | |  ||| || |||||| ||||||    
106348 tcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctacaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagagtagtggaggtagtgg 106249  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
106248 ttgtacacttgtacttt 106232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 32753580 - 32754092
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||    
32753580 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgattttgaac 32753678  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32753679 acttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 32753777  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
     |||  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||  || ||||| ||||||||||| | |||||||| |||| |||     
32753778 ttttatagaatcaaatttggcagagttttggcacttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatctt-aagtcttcactcctttatatagaggtgagtaa 32753876  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
32753877 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatctaccattaatctttttcctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 32753976  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
32753977 taacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 32754076  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
32754077 tgtacacttgtacttt 32754092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20625391 - 20624878
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| ||||||||||||   | || |||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||    
20625391 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcatgcatgcgagaggcttctattcaaacaaaaatacacagaaaat-gtttgactttgaac 20625293  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
20625292 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactatagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 20625194  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |     
20625193 ctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaa- 20625095  T
400 agagacgttgagatctta-agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
20625094 agagacgttgagattttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaa 20624995  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
20624994 tcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaacatttctgcaggcatagctgttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtggtggaggtagtgg 20624895  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
20624894 ttgtacacttgtacttt 20624878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 104 - 615
Target Start/End: Original strand, 40228184 - 40228701
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
40228184 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 40228283  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
40228284 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatataatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagt 40228383  T
300 gcttt-tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    ||||| || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||    
40228384 gctttgtgtgaaacaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgttgtcttgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgta 40228483  T
399 gagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagg 497  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| |  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
40228484 gagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatggtcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagg 40228583  T
498 atcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtg 597  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||| ||||| |||||    
40228584 atcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcatggaggtagtg 40228683  T
598 gttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||    
40228684 gttgtacacttgtacttt 40228701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 20215728 - 20215218
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
20215728 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttttattcaaacagaattatacagaaaattgtttgagtttgaacac 20215629  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
20215628 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctatacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagt 20215529  T
300 gcttt-tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |    
20215528 gctttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtcttgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-a 20215430  T
399 gagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagg 497  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||   | ||||| |   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
20215429 gagagacgttgagatctttaagcacgtcaatagagtctttgagaaaccttgattaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagg 20215330  T
498 atcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagt 596  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||    
20215329 atcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagt 20215230  T
597 ggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||    
20215229 ggttgtacactt 20215218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 19478606 - 19478115
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19478606 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 19478507  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
19478506 gttcacaatacaatacgataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttatagaatcaaatt-gac 19478409  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||    
19478408 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgatttgc 19478311  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||    
19478310 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 19478211  T
521 cttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
19478210 cttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggacgtagtggttgtacacttgtacttt 19478115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 21702779 - 21703275
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
21702779 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 21702878  T
222 gttcacaatacaatgcaata----aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||    
21702879 gttcacaatacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt 21702978  T
318 tggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct 415  Q
     | |||||||| ||| ||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | |||||||||||||       
21702979 -gacagagttttggcactttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagagga 21703074  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
21703075 ttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 21703174  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
21703175 cccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 21703274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 213 - 615
Target Start/End: Original strand, 13404753 - 13405158
Alignment:
213 atcaatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactct--agacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttga-g 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  | |    
13404753 atcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttgtatg 13404852  T
309 aattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgtt 408  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||    
13404853 aaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtattgtctctacagatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-agagagacgtt 13404951  T
409 gagatctta-agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttca 507  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||    
13404952 gagatcttttagcacgtc-aaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtccaatgaaggatcaagttca 13405050  T
508 aattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacact 607  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |    
13405051 aatccattcctttcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacaat 13405150  T
608 tgtacttt 615  Q
    ||||||||    
13405151 tgtacttt 13405158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 19464576 - 19464085
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19464576 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 19464477  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |      
19464476 gttcacaatacaatacgataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gat 19464379  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||    
19464378 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgatttgc 19464281  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||    
19464280 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 19464181  T
521 cttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
19464180 cttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggacgtagtggttgtacacttgtacttt 19464085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 21705626 - 21706122
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
21705626 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 21705725  T
222 gttcacaatacaatgcaata----aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||| |||||    
21705726 gttcacaatacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtataatcaaatt 21705825  T
318 tggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct 415  Q
     | |||||||| ||| ||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | |||||||||||||       
21705826 -gacagagttttggcactttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagagga 21705921  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
21705922 ttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 21706021  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
21706022 cccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 21706121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 37407253 - 37406762
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
37407253 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgaccttgaacacttgatatataatcagtgg 37407155  T
221 tgttcacaa-tacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |    
37407154 tgttcacaaatataatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-g 37407057  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||||        
37407056 acagagttttggcgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcccttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgaat 37406960  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||     
37406959 aacacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattaattct 37406860  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |   || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
37406859 catcttgaaggaacaattctgcaggcataactgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacacttgtacttt 37406762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 17446350 - 17446842
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaat-tacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| ||  ||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
17446350 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacactagatatacaatcagtgg 17446449  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaa-gaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |    
17446450 tgttcacaatacaatacaataaa-gactctagactttgtgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-g 17446547  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct 415  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| | |   |||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||      
17446548 acagagttttggcgctttttaacttgt----atctctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatga 17446642  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
17446643 atagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 17446742  T
516 cctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17446743 cccaacttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 17446842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 542
Target Start/End: Original strand, 23487961 - 23488483
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || |||||||||||||    
23487961 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacgcagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgc 23488058  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatc 215  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
23488059 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatc 23488158  T
216 aatggtgttcacaatacaatgc-aataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgct--tttgagaatt 312  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||  | || |||      
23488159 agtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactct---ct--agaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttatatgtgaaac 23488253  T
313 aaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgaga 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |  |||   |   |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| | |||  ||||||||    
23488254 aaattttgcagagtttgggcgcttttaacttgctgtcttgttctttttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaagtgtg-aaagattcgttgaga 23488352  T
413 tc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaatt 511  Q
    || ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||     
23488353 tctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttctgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcatgttcaaatc 23488452  T
512 cattcctatcttgaaggaacaattctgcagg 542  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
23488453 cattcctatcttgaaggaacatttctgcagg 23488483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 34783460 - 34782970
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
34783460 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 34783361  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || || | |    
34783360 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaactt-gac 34783264  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||     ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
34783263 agagttttggcgctttttaacttgtgt--atgtctctcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcag 34783167  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
34783166 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 34783067  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
34783066 atcttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 34782970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 187 - 615
Target Start/End: Original strand, 17457032 - 17457458
Alignment:
187 tgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaa-gaatttctaagatatatcaaatcagtg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
17457032 tgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaat-actctagactttgtgaatttctaagatatatcaaatcagtg 17457130  T
286 cagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttcc 381  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| | |   |||||||||||||||| |     
17457131 cagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgctttttaacttgt----atctctctatctacattcttcaagtcttcactcct 17457225  T
382 ttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttggg 481  Q
    |||||||| || ||| | ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
17457226 ttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgaatagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttggg 17457324  T
482 tgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcag 581  Q
    ||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||   ||| |  |||    
17457325 tgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtatacaaaaacag 17457424  T
582 ggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17457425 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 17457458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20798301 - 20797809
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| | |||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
20798301 agagacttctactgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 20798202  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
20798201 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 20798104  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   || ||| ||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
20798103 agagttttggcgcttttgaacttgtgt--atctctatatgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattag 20798007  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
20798006 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 20797907  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
20797906 atcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgcagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 20797809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 188 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 34063160 - 34062734
Alignment:
188 gtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
34063160 gtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacgataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaataagtgca 34063062  T
288 gaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgat---cttcaagtcttcacttcctt 383  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||| |  |   ||||||||||||||| | ||    
34063061 gaaattcagtgtgctttttagaatcaaatt-gacagagttttggcgctttttaacttgt-ata-tgactctatctttattcttcaagtcttcactccttt 34062965  T
384 atatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtg 483  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
34062964 atatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgaatagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtg 34062866  T
484 tagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcaggg 583  Q
    ||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| |    
34062865 tagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagag 34062766  T
584 tcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||    
34062765 tagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 34062734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 51 - 615
Target Start/End: Original strand, 7031708 - 7032275
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
7031708 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 7031807  T
148 agcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagac 247  Q
     |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||    
7031808 -gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagt-aaagac 7031905  T
248 tctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtg 346  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| ||    
7031906 tctagactt-tgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgacagagttttggcgcttttgaacttatg 7032003  T
347 ataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcct 445  Q
        | | |||  | ||||||||||||||||  | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||||    
7032004 tatctctatct-tcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcct 7032101  T
446 ttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggca 544  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||    
7032102 ttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggca 7032201  T
545 gagctgttatcttgtcttgtagcgaggac---acactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
      |||||| | |||||||||||||  |||   | |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
7032202 tggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 7032275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 34772515 - 34772025
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
34772515 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 34772416  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || || | |    
34772415 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaactt-gac 34772319  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||     ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |     
34772318 agagttttggcgctttttaacttgtgt--atgtctctcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcat 34772222  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
34772221 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 34772122  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
34772121 atcttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 34772025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 22560042 - 22559550
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
22560042 agagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 22559943  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
22559942 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 22559846  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
22559845 agagttttggcgcttttgaacttat----atatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc 22559751  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
22559750 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 22559651  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
22559650 ccatcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 22559551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 43043326 - 43043818
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
43043326 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaggaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 43043425  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
43043426 gttctcaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 43043523  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    ||||||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
43043524 agagttttggcgcttttgaacttgt----atgtctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatt 43043618  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
43043619 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 43043718  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
43043719 ccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 43043818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 30069559 - 30070053
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
30069559 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 30069658  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttct-aagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || ||||     
30069659 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttcttaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttga 30069755  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |    
30069756 cagagttttggcgctttttaacttgt-ata-tctctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataat 30069852  T
417 aagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
     |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
30069853 cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctatgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 30069952  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
30069953 cccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgttttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 30070052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 5290231 - 5290723
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
5290231 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 5290330  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | |||||| |    
5290331 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaa-tcaatttgac 5290427  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
5290428 agagttttggcgcttttgaacttgt----atatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 5290522  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||     
5290523 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcatta 5290622  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
5290623 ccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 5290722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 10755097 - 10754607
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
10755097 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 10754998  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
10754997 gttcttaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcataaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 10754901  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| || |||||| ||||||| ||| | ||| || |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
10754900 agagttttggagctttttaacttgt-ata-tctctatatctcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 10754804  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
10754803 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcatttaatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 10754704  T
519 atcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
10754703 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 10754607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27622422 - 27622914
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
27622422 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactttatatacaatcagtggt 27622521  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
27622522 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 27622618  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
27622619 agagttttggcgcttttgaacttgtg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc 27622713  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
27622714 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 27622813  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
27622814 ccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 27622913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 8522446 - 8521955
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
8522446 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 8522347  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
8522346 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 8522249  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
8522248 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 8522151  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
8522150 acgtctaaagagtcgtttgaaatcatttgatcattcactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 8522051  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
8522050 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 8521955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 24983075 - 24983567
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24983075 agagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 24983174  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  || | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
24983175 gttcacaatacaatacgttaga-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 24983272  T
322 agagtttgggcgctttt--aacttgtgata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||| || | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |    
24983273 agagttttggcgcttttttaacttgt-atatatctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgatta 24983369  T
419 gcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
24983370 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcc 24983469  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24983470 catcttgaaggcacaaattctgcaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24983567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17607664 - 17607174
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
17607664 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 17607565  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
17607564 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 17607468  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
17607467 agagttttggcgcttttgaacttgtg----tatctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcag 17607373  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
17607372 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 17607273  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17607272 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 17607174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27603073 - 27603565
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27603073 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 27603172  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
27603173 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 27603269  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||| |    |||||||||||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
27603270 agagttttggcgcttttgaacttgtg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcatttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 27603364  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
27603365 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 27603464  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
27603465 ccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtatacttgtactt 27603564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 31349138 - 31348648
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
31349138 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 31349039  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||| |    
31349038 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaa-ttgac 31348942  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | ||| || | ||||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
31348941 agagttttggcgcttttgaacttat-atatatctatcta---atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcag 31348847  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
31348846 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 31348747  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
31348746 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 31348648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 31359752 - 31359262
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
31359752 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 31359653  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||| |    
31359652 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaa-ttgac 31359556  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | ||| || | ||||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
31359555 agagttttggcgcttttgaacttat-atatatctatcta---atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcag 31359461  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
31359460 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 31359361  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
31359360 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 31359262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36085066 - 36084575
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
36085066 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 36084967  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
36084966 gttcacaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 36084869  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||    | | ||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
36084868 agagttttggcgatttttaacttgtgtatctctatctgca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagc 36084771  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||| |    
36084770 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattccca 36084671  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36084670 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcatgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36084575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 24925794 - 24926286
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24925794 agagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 24925893  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  || | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
24925894 gttcacaatacaatacgttaga-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 24925991  T
322 agagtttgggcgctttt--aacttgtgata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||| || | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||  |||||| | ||||||||||||||  | |    
24925992 agagttttggcgcttttttaacttgt-atatatctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaa-agagacgttgagatgatta 24926088  T
419 gcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
24926089 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcc 24926188  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24926189 catcttgaaggcacaaattctgcaggcataggtgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24926286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 188 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 34052499 - 34052073
Alignment:
188 gtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
34052499 gtttgacttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaatacgataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaataagtgca 34052401  T
288 gaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgat---cttcaagtcttcacttcctt 383  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||| |  |   ||||||||||||||| | ||    
34052400 gaaattcagtgtgctttttagaatcaaatt-gacagagttttggcgctttttaacttgt-ata-tgactctatctttattcttcaagtcttcactccttt 34052304  T
384 atatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtg 483  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
34052303 atatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgaatagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtg 34052205  T
484 tagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcaggg 583  Q
    ||||||| ||||| || | ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |   ||      
34052204 tagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccaacttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagac 34052105  T
584 tcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||    
34052104 tagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 34052073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23407051 - 23406560
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| ||| |  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
23407051 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttttgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 23406952  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
23406951 gttctcaatacaatacgataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagttcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 23406854  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
23406853 agagttttgacgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagc 23406756  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
23406755 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 23406656  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
23406655 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtattgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23406560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24808517 - 24808026
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24808517 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 24808418  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
24808417 gttcacaatgcaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 24808321  T
322 agagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||   || | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
24808320 agagttttggcgcttttaaacttatgtatatctgtctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 24808223  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
24808222 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 24808123  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24808122 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24808026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36229344 - 36228853
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
36229344 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 36229245  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
36229244 gttcacaatacaatacgttaaaa-actctagacttttgaatttccaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 36229147  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
36229146 agagttttgacgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagc 36229049  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||| |    
36229048 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattccca 36228949  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36228948 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtggcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36228853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 1121557 - 1122050
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
1121557 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 1121656  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || || | |    
1121657 gttcacaatacaatacaattaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaactt-gac 1121754  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-ataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||  | |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
1121755 agagttttggcgctttttaacttgtgtatatctctctctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatta 1121852  T
419 gcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
1121853 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 1121952  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |  ||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
1121953 cactttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 1122050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17618279 - 17617788
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
17618279 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 17618180  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
17618179 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 17618083  T
322 agagtttggg-cgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga-tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||    | |||||| | | |||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |    
17618082 agagttttggtcgcttttgaacttgtg----tatctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca 17617988  T
419 gcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
17617987 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcc 17617888  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17617887 catcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 17617788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 31419268 - 31418775
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
31419268 agagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 31419169  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |  |||| | |||||| |    
31419168 gttctcaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctctgtagaa-tcaatttgac 31419072  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||  | ||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
31419071 agagttttggcgcttttgaacttgt-atatctctatcttacaatcttcaagtcttcactcctctatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataattag 31418974  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
31418973 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 31418874  T
519 atcttgaagg-aacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggac-acactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||| | |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
31418873 atcttgaaggcataaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 31418775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 127 - 615
Target Start/End: Original strand, 1108804 - 1109292
Alignment:
127 cttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttca 226  Q
    |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
1108804 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttca 1108903  T
227 caatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagt 326  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || || | ||||||    
1108904 caatacaatacaattaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaactt-gacagagt 1109001  T
327 ttgggcgctttt-aacttgtg-ataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacg 423  Q
    || ||||||||| |||||||| |||  | |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||||||    
1109002 tttggcgctttttaacttgtgtatatctctctctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagcacg 1109099  T
424 tctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct 522  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |  |    
1109100 tctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactt 1109199  T
523 tgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
1109200 tgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 1109292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 564
Target Start/End: Original strand, 5300802 - 5301242
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
5300802 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 5300901  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | |||||| |    
5300902 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaa-tcaatttgac 5300998  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
5300999 agagttttggcgcttttgaacttgt----atatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 5301093  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
5301094 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 5301193  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgt 564  Q
    | |||||||| | |||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||    
5301194 ccatcttgaacgtacaacttctgctggcatggctgttgtcttgtcttgt 5301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 9377117 - 9377609
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
9377117 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 9377216  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
9377217 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 9377313  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | ||||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
9377314 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 9377411  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
9377412 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 9377511  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9377512 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9377609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 24816541 - 24817033
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24816541 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 24816640  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
24816641 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 24816737  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | ||||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
24816738 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 24816835  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
24816836 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 24816935  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24816936 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24817033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 24827129 - 24827621
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24827129 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 24827228  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
24827229 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 24827325  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | ||||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
24827326 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 24827423  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
24827424 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 24827523  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24827524 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24827621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36688299 - 36687809
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
36688299 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 36688200  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
36688199 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 36688103  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga-tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |  |    |||||| | | |||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
36688102 agagttttggcgcttttgaacttatttt----tctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 36688008  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
36688007 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 36687908  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36687907 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36687809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36698865 - 36698375
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
36698865 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 36698766  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
36698765 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 36698669  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga-tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |  |    |||||| | | |||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
36698668 agagttttggcgcttttgaacttatttt----tctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 36698574  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
36698573 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 36698474  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36698473 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36698375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 31844566 - 31844072
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
31844566 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 31844467  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
31844466 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 31844370  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-ata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || |||  |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
31844369 agagttttggcgcttttgaacttatgtatatctgtctcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatca 31844272  T
419 gcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
31844271 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcc 31844172  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
31844171 catcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 31844072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 15693687 - 15694178
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
15693687 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 15693786  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
15693787 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 15693883  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
15693884 agagttttggcgcttttaaacttatg--tatctctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 15693980  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
15693981 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttccc 15694080  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
15694081 atcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 15694178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Original strand, 23477900 - 23478404
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
23477900 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacactgaaaattgtttgagtttgaacac 23477999  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||| |   || |||||| ||||||    
23478000 ttgatatacaatcagtggtgttcagaatacaatgcaaatgaaagactct---ct--agaatttctaagatatatcaaatgaacacataaattctaagtgc 23478094  T
302 tttt--gagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    || |  | |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||   |   |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |     
23478095 ttataagtgaaacaaattttgcagagtttgggcgcttttaacttgttgtcttgttctttttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aa 23478193  T
400 agagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||    
23478194 agagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctaagaagga 23478293  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtg 597  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||  |||||    
23478294 tcacattcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctacaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtg 23478393  T
598 gttgtacactt 608  Q
    |||||||||||    
23478394 gttgtacactt 23478404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24567694 - 24567203
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24567694 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 24567595  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
24567594 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 24567498  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
24567497 agagttttggcgcttttaaacttatg--tatctctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 24567401  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
24567400 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttccc 24567301  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24567300 atcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24567203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 31449159 - 31448666
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
31449159 agagacttctaatgctcaagaacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatataatcagtggt 31449060  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || ||||      
31449059 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgag 31448963  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
31448962 agagttttggcgcttttgaacttgt-atatctctatcttacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattag 31448865  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
31448864 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 31448765  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggac-acactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||| | |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
31448764 atcttgaaggcacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 31448666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23307450 - 23306958
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
23307450 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 23307351  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
23307350 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 23307254  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
23307253 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagc 23307156  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
23307155 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 23307056  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
23307055 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23306958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 39353093 - 39352601
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
39353093 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 39352994  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
39352993 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 39352897  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||      | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
39352896 agagttttggcgcttttgaacttatgtatccctttcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 39352799  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
39352798 acgtctaaagagtcgtttgaaattctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 39352699  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
39352698 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 39352601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20552420 - 20551929
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
20552420 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 20552321  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
20552320 gttcacaataaaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 20552223  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
20552222 agagttttgacgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagc 20552125  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    | ||||||||||| ||| ||  || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
20552124 aagtctaaagagttgtttgaaatcatttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 20552025  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | | || || |||||| |||||||||||||||||||||||    
20552024 tcttgaaggcacaaaatctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaat-agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 20551929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 14446656 - 14447147
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
14446656 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 14446755  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
14446756 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 14446852  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
14446853 agagttttggcgcttttaaacttgtg----tatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 14446947  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
14446948 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 14447047  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
14447048 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14447147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 14457268 - 14457759
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
14457268 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 14457367  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
14457368 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 14457464  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
14457465 agagttttggcgcttttaaacttgtg----tatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 14457559  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
14457560 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 14457659  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
14457660 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14457759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 15740573 - 15740080
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
15740573 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 15740474  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
15740473 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 15740377  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
15740376 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttgaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 15740282  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
15740281 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattc 15740182  T
517 ctatcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    | |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
15740181 ccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 15740082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 15769733 - 15769240
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
15769733 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 15769634  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
15769633 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 15769537  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
15769536 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttgaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 15769442  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
15769441 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattc 15769342  T
517 ctatcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    | |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
15769341 ccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 15769242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 22147128 - 22146634
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
22147128 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 22147029  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
22147028 gttcacaatacaatgc-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 22146932  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
22146931 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 22146835  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
22146834 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 22146735  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
22146734 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 22146635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 22157711 - 22157217
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
22157711 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 22157612  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
22157611 gttcacaatacaatgc-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 22157515  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
22157514 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 22157418  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
22157417 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 22157318  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
22157317 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 22157218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 42395589 - 42395094
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
42395589 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 42395490  T
222 gttcacaatacaatgcaata----aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||    
42395489 gttcacaatacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt 42395390  T
318 tggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
     | |||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||  | ||||||||||||||  |    
42395389 -gacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtaaa-agagacgttgagataat 42395293  T
417 aagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
     |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
42395292 tagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 42395193  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
     | |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  || | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
42395192 tccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaca-gatagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 42395095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9347147 - 9346656
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
9347147 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 9347048  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
9347047 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 9346951  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
9346950 agagttttggcgcttttgaacttatgt--atttctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcag 9346854  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
9346853 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 9346754  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggac-acactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||| | |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9346753 atcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9346656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 14041202 - 14040710
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
14041202 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 14041103  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
14041102 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 14041006  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
14041005 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 14040908  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
14040907 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 14040808  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
14040807 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14040710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 14557672 - 14558164
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
14557672 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 14557771  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
14557772 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 14557868  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||| |  ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
14557869 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtct-caaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 14557966  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
14557967 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 14558066  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
14558067 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14558164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 14568309 - 14568801
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
14568309 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 14568408  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
14568409 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 14568505  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||| |  ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
14568506 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtct-caaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 14568603  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
14568604 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 14568703  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
14568704 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14568801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23296882 - 23296390
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
23296882 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 23296783  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
23296782 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 23296686  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
23296685 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 23296588  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |    
23296587 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcatttgaagaataaacttcaaattcattccca 23296488  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
23296487 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23296390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 25112489 - 25112020
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
25112489 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacac 25112390  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
25112389 ctgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacgtaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 25112290  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtg 396  Q
    |||||  || |||  ||| || ||||||||||||||| ||||   ||||  |   ||||||   |||||||||||||||||| | ||||| || | ||||    
25112289 gcttttatgtgaaacaaaattagcagagtttgggcgctttttggtttgttgtctcgtctct---gatcttcaagtcttcactcctttataaagagatgtg 25112193  T
397 tagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaa 495  Q
     | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
25112192 -aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaa 25112094  T
496 ggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
25112093 ggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcg 25112020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 25171580 - 25171111
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
25171580 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacac 25171481  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
25171480 ctgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacgtaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 25171381  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtg 396  Q
    |||||  || |||  ||| || ||||||||||||||| ||||   ||||  |   ||||||   |||||||||||||||||| | ||||| || | ||||    
25171380 gcttttatgtgaaacaaaattagcagagtttgggcgctttttggtttgttgtctcgtctct---gatcttcaagtcttcactcctttataaagagatgtg 25171284  T
397 tagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaa 495  Q
     | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
25171283 -aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaa 25171185  T
496 ggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
25171184 ggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcg 25171111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 27460766 - 27460274
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27460766 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 27460667  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
27460666 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 27460570  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
27460569 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 27460472  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
27460471 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 27460372  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
27460371 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27460274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 27471165 - 27470673
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27471165 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 27471066  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
27471065 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 27470969  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
27470968 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 27470871  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
27470870 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 27470771  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
27470770 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27470673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 40390962 - 40390470
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
40390962 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 40390863  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
40390862 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 40390766  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
40390765 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatct-tcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 40390668  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
40390667 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 40390568  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
40390567 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 40390470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17719522 - 17719031
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
17719522 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 17719423  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
17719422 gttcacagtacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 17719326  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
17719325 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctctata-aaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 17719230  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
17719229 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccca 17719130  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17719129 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 17719031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17730174 - 17729683
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
17730174 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 17730075  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
17730074 gttcacagtacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 17729978  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
17729977 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctctata-aaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 17729882  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
17729881 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccca 17729782  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17729781 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 17729683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6131396 - 6130902
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
6131396 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 6131297  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
6131296 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 6131200  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
6131199 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 6131103  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
6131102 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 6131003  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
6131002 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 6130903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9336560 - 9336069
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||  | |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
9336560 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagatacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 9336461  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
9336460 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 9336364  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
9336363 agagttttggcgcttttgaacttatgt--atttctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcag 9336267  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
9336266 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 9336167  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9336166 atcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9336069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 14030649 - 14030157
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
14030649 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttttaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 14030550  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
14030549 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 14030453  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
14030452 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 14030355  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
14030354 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 14030255  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
14030254 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14030157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 16003546 - 16004038
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
16003546 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 16003645  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
16003646 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 16003742  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
16003743 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 16003837  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
16003838 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 16003937  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
16003938 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 16004037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 39490605 - 39491097
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
39490605 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 39490704  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
39490705 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 39490801  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
39490802 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 39490896  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
39490897 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 39490996  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
39490997 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 39491096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 39501795 - 39502287
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
39501795 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 39501894  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
39501895 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 39501991  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
39501992 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 39502086  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
39502087 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 39502186  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
39502187 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 39502286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 40401624 - 40401132
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
40401624 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 40401525  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
40401524 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 40401428  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
40401427 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatct-tcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 40401330  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
40401329 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 40401230  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
40401229 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 40401132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23708047 - 23707556
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
23708047 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 23707948  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
23707947 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 23707851  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
23707850 agagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctct-tttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 23707753  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |    
23707752 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttccca 23707653  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
23707652 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23707556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 122 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 31834088 - 31833642
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
31834088 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 31833989  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
31833988 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 31833892  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-ata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| || |||  |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
31833891 agagttttgacgcttttgaacttatgtatatctgtctcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatca 31833794  T
419 gcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
31833793 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcc 31833694  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcg 568  Q
     |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
31833693 catcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcg 31833642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 35216111 - 35215618
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
35216111 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 35216012  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
35216011 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 35215915  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
35215914 agagttttggcgcttttgaacttatgtatatctct-tttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 35215817  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
35215816 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccca 35215717  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
35215716 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 35215618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 35226695 - 35226202
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
35226695 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 35226596  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
35226595 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 35226499  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
35226498 agagttttggcgcttttgaacttatgtatatctct-tttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 35226401  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
35226400 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccca 35226301  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
35226300 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 35226202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 39365086 - 39364685
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
39365086 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 39364987  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
39364986 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 39364890  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||      | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
39364889 agagttttggcgcttttgaacttatgtatccctttcta-caatcttcaagtcttcacttctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 39364792  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
39364791 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 39364692  T
520 tcttgaa 526  Q
    |||||||    
39364691 tcttgaa 39364685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 30227151 - 30227644
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
30227151 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 30227250  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
30227251 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 30227347  T
322 agagtttgggcgc---ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| |||||   ||||||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
30227348 agagttttggcgctttttttaacttatgtatttctctct-tttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatca 30227445  T
419 gcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||    
30227446 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcc 30227545  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
30227546 catcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 30227644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 30237678 - 30238171
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
30237678 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 30237777  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
30237778 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 30237874  T
322 agagtttgggcgc---ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| |||||   ||||||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
30237875 agagttttggcgctttttttaacttatgtatttctctct-tttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatca 30237972  T
419 gcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||    
30237973 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcc 30238072  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
30238073 catcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 30238171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 36582212 - 36582705
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattg--tttgacttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
36582212 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa-atacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtg 36582310  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |    
36582311 gtgttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaggttgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-g 36582407  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
     |||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
36582408 acagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatca 36582505  T
419 gcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
36582506 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcc 36582605  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36582606 catcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36582705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 36592767 - 36593260
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattg--tttgacttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
36592767 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa-atacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtg 36592865  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |    
36592866 gtgttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaggttgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-g 36592962  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
     |||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
36592963 acagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatca 36593060  T
419 gcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
36593061 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcc 36593160  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36593161 catcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36593260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 42043389 - 42042898
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
42043389 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatcgaacacttgatatacaatcagtggt 42043290  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
42043289 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 42043193  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
42043192 agagttttggcgctttttaacttatgtatttttctct-tttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 42043095  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |    
42043094 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttccca 42042995  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
42042994 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 42042898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 42053964 - 42053473
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
42053964 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatcgaacacttgatatacaatcagtggt 42053865  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
42053864 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 42053768  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
42053767 agagttttggcgctttttaacttatgtatttttctct-tttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 42053670  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |    
42053669 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttccca 42053570  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
42053569 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 42053473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 22676722 - 22676229
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
22676722 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtgg 22676623  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |     
22676622 tgttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-ga 22676526  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |    
22676525 cagagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttgaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataat 22676431  T
417 aagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
22676430 cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcatt 22676331  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    || |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
22676330 cccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 22676231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 22686613 - 22686120
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
22686613 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtgg 22686514  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |     
22686513 tgttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-ga 22686417  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |    
22686416 cagagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttgaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataat 22686322  T
417 aagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
22686321 cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcatt 22686222  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    || |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
22686221 cccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 22686122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23362716 - 23362223
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || || | ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
23362716 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatatagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 23362617  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
23362616 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 23362520  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
23362519 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 23362425  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcc-tatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||    
23362424 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttgaagaataagcttcaaattcatt 23362325  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    || |||||||  |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
23362324 cccatcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 23362225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 15992984 - 15993476
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
15992984 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 15993083  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
15993084 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 15993180  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |  ||| | ||||||||||||||  |     
15993181 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagagccgtg-aaagagacgttgagataatc 15993275  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
15993276 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 15993375  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  |||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
15993376 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagattagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 15993475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27041867 - 27042359
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27041867 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 27041966  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
27041967 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 27042063  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
27042064 agagttttcgcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 27042161  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
27042162 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 27042261  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||| | |||||||||||||||||||||||    
27042262 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggtggtagtggttgtacacttgtacttt 27042359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 568
Target Start/End: Original strand, 27052491 - 27052935
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27052491 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 27052590  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
27052591 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 27052687  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
27052688 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 27052785  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
27052786 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 27052885  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
27052886 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcg 27052935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 27204397 - 27203906
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27204397 agagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 27204298  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
27204297 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 27204201  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | | |    
27204200 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcaac 27204104  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
27204103 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 27204004  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
27204003 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27203906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 40513644 - 40514137
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
40513644 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 40513743  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
40513744 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 40513840  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||     ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
40513841 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 40513937  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
40513938 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 40514037  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
40514038 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 40514137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6976414 - 6975921
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
6976414 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaagatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtgg 6976315  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |     
6976314 tgttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-ga 6976218  T
321 cagagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
6976217 cagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctatctaaa-atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 6976120  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
6976119 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 6976020  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
6976019 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6975921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6986904 - 6986411
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
6986904 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaagatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtgg 6986805  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |     
6986804 tgttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-ga 6986708  T
321 cagagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
6986707 cagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctatctaaa-atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 6986610  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
6986609 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 6986510  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
6986509 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6986411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 33951455 - 33951948
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
33951455 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 33951554  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
33951555 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 33951651  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
33951652 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 33951748  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
33951749 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 33951848  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||| ||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
33951849 atcttgagttgtacaaattctgcgggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 33951948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 37728907 - 37729399
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
37728907 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 37729006  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
37729007 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 37729103  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || || | ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||   | ||    
37729104 agagttttggcgcttttgaacttatg-tact-tctctatgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgaga-gatcag 37729199  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
37729200 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 37729299  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||    
37729300 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 37729399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 37740223 - 37740715
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
37740223 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 37740322  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
37740323 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 37740419  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || || | ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||   | ||    
37740420 agagttttggcgcttttgaacttatg-tact-tctctatgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgaga-gatcag 37740515  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
37740516 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 37740615  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||    
37740616 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 37740715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 20562930 - 20562526
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
20562930 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 20562831  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
20562830 gttcacaatacaatac-gttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 20562733  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
20562732 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagatgattagc 20562635  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    | ||||||||||| | ||||  || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
20562634 aagtctaaagagttgtttgaaatcatttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 20562535  T
520 tcttgaagg 528  Q
    |||||||||    
20562534 tcttgaagg 20562526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 104 - 337
Target Start/End: Original strand, 32160274 - 32160513
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
32160274 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 32160373  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
32160374 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacagtgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 32160473  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttt 337  Q
    |||||  || |||  |||||| ||||||||||||||||||    
32160474 gcttttatgtgaaacaaatttagcagagtttgggcgcttt 32160513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 13403700 - 13403870
Alignment:
49 aaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
13403700 aaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacga 13403799  T
147 aagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatca 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
13403800 aagcaagagacttctaatcaaacagaattacacaaaaaattgtttgagtttgaacacttgatatactatca 13403870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 23697389 - 23696969
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
23697389 agagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 23697290  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
23697289 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 23697193  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||| ||  | |||    
23697192 agagttttggcgcttttgaacttatgtatttctctct-tttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgaaataatcagc 23697095  T
421 acgtctaaagagtcgttgag-ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaa-cttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| | || ||  || |||||||||| ||||     
23697094 acgtctaaagagtcgttttgaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtggagtccttttaaagaaaaaccttcaaattccttccc 23696995  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||    
23696994 atcttgagtgaacaatcctgcaggca 23696969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11208619 - 11208417
Alignment:
106 ctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacactt 204  Q
    ||||||||| || || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
11208619 ctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaatagaattgtacagaaaattgtttgagtttgaacactt 11208520  T
205 gatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||    
11208519 gatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgc 11208420  T
302 ttt 304  Q
    |||    
11208419 ttt 11208417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 461 - 615
Target Start/End: Original strand, 21414191 - 21414345
Alignment:
461 taatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtc 560  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
21414191 taatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtc 21414290  T
561 ttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
21414291 ttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 21414345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 40228067 - 40228210
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
40228067 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 40228166  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
40228167 aggcaagagactccctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 40228210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 13533391 - 13533502
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
13533391 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgaaacttcccaaatgctcaagcacgcag 13533490  T
119 gcgagagacttc 130  Q
    ||||||||||||    
13533491 gcgagagacttc 13533502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20417638 - 20417499
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
20417638 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcat 20417543  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20417542 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 20417499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 32753471 - 32753610
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
32753471 ccttgcacttccaaggagatttccactaaaaa----tcacacagattacagatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 32753566  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
32753567 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 32753610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 122 - 413
Target Start/End: Original strand, 43621549 - 43621837
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
43621549 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 43621648  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
43621649 gttcacaatacaatac-gttaaagactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 43621746  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagat 413  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    | | |||| | ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||    
43621747 agagttttggcgctttttaacttgtgtatttctatcta-caatcttcaagtcttcaatcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagat 43621837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20215844 - 20215702
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
20215844 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacac 20215746  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
20215745 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 20215702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 106855 - 106715
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
106855 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaattctcaagcacgca 106760  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
106759 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 106715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Original strand, 23477786 - 23477926
Alignment:
20 cttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||||    
23477786 cttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgca 23477883  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
23477884 ggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 23477926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 21420287 - 21420427
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    ||||| || ||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
21420287 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatctcaaagattacaaatgctcaattctctcttagtatgagacttctcaaatggtcaagcacgca 21420382  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
21420383 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 21420427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 462 - 615
Target Start/End: Original strand, 43621853 - 43622006
Alignment:
462 aatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtc 560  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
43621853 aatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtc 43621952  T
561 ttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
43621953 ttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 43622006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22586600 - 22586466
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||  |||||    
22586600 caaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaaccaagagacttctaaacaaacacaattacacataaaaatgtttgggttgaa 22586501  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22586500 cacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22586466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 643297 - 643184
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
643297 agagacttctcatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagcttgaacatttgatatacaatcagtgg 643198  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
643197 tgttcacaatacaa 643184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20625502 - 20625361
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    ||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
20625502 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatctcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 20625407  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20625406 aggcaagaggcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 20625361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 234
Target Start/End: Original strand, 20968730 - 20968866
Alignment:
99 ccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttg 197  Q
    |||||| |||||||||  | || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||  |||    
20968730 ccaaatactcaagcacaaaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaaaaaaattacacataaaaatgtttgagattg 20968829  T
198 aacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
20968830 aacacttgatatacaatcaatggtgttcacaacacaa 20968866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21199597 - 21199484
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttg-acttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
21199597 agagacttcttatgctcaagcacaattgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtgg 21199498  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| |||||||    
21199497 tgttcataatacaa 21199484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 362 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 11208334 - 11208087
Alignment:
362 atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccag 460  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||  |   | |||||||  |||||     
11208334 atcttcacgtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagtcgttgagaactttaagcacgtcaatagagtcgttctgaagccttgatcaatcaccaa 11208236  T
461 taatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgt 559  Q
    | || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
11208235 tgattttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaagttcaaatccattcttattttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgt 11208136  T
560 cttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||| |||||||    
11208135 cttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacactt 11208087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2156870 - 2156717
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
2156870 agagacttcatatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacaaaattacaaataaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 2156771  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
2156770 tgttcacaatacaaatc-atataagactcttaagactctagaatttctaagatat 2156717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9399212 - 9399099
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||    
9399212 agagacttcatatgctcaagcacaactgcaaaagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacactttatatacaatcagtgg 9399113  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
9399112 tgttcacaatacaa 9399099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 20550434 - 20550547
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| || |||    
20550434 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaagcagtgg 20550533  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
20550534 tgttcacaatacaa 20550547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21072833 - 21072720
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
21072833 agagacttttaatgctcaagcacaactgcaagagacttatattcaaacaaaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaataagtgg 21072734  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
21072733 tgttcacaatacaa 21072720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 23880606 - 23880719
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  || ||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
23880606 agagacttctgatactcaagcacaactgcaagagacttctattcgaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 23880705  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
23880706 tgttcacaatacaa 23880719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28464936 - 28464821
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
28464936 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 28464837  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
28464836 ggtgttcacaatacaa 28464821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 362 - 608
Target Start/End: Original strand, 32160554 - 32160801
Alignment:
362 atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccag 460  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | |||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||  |     |||||||  |||||     
32160554 atctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagtcgttgcgatctttaagcacgtcaatagagtcgttctgaaaacttgatcaatcaccaa 32160652  T
461 taatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgt 559  Q
    | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||| || |||| |    
32160653 tgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctaagggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttat 32160752  T
560 cttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||| ||||||||    
32160753 cttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 32160801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23413571 - 23413457
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||    
23413571 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcaaattcaaacagaattacacaaaaaattgtttgaggatgaacacttgatatacaatcactg 23413472  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
23413471 gtgttcacaatacaa 23413457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 89689 - 89524
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |  |||||||    
89689 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacattgatgcaggc 89590  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
89589 agagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 89524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12353391 - 12353279
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
12353391 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaa-tgtttgagattgaacacttgatatacaattagtgg 12353293  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
12353292 tgttcacaatacaa 12353279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 236
Target Start/End: Original strand, 20567330 - 20567462
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||||||  ||||||||    
20567330 tgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaaccaagagacttctaatcaaacagaataataaagaaaa-tgtttgaggttgaacac 20567428  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatg 236  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
20567429 ttgatatacattcagtggtgttcacaatacaatg 20567462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 34637996 - 34638109
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  ||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||    
34637996 agagacttcatatgcttaaccacaaatgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttttttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 34638095  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
34638096 tgttcacaatacaa 34638109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3246028 - 3245925
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
3246028 tgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 3245929  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
3245928 acaa 3245925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19536895 - 19536781
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |    
19536895 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaaca-tttatatacaatcagt 19536797  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
19536796 ggtgttcacaatacaa 19536781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 26765043 - 26765157
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
26765043 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctcaaatcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcaat 26765141  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
26765142 ggtgttcacaatacaa 26765157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30116435 - 30116320
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
30116435 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 30116336  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||| ||||||||||||    
30116335 ggtattcacaatacaa 30116320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9336663 - 9336550
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9336663 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9336565  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9336564 agcaagagacttcta 9336550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9347250 - 9347137
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9347250 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9347152  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9347151 agcaagagacttcta 9347137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 15992881 - 15992994
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
15992881 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 15992979  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
15992980 agcaagagacttcta 15992994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 16003443 - 16003556
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
16003443 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 16003541  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
16003542 agcaagagacttcta 16003556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23362819 - 23362706
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
23362819 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 23362721  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
23362720 agcaagagacttcta 23362706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27602970 - 27603083
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
27602970 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 27603068  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
27603069 agcaagagacttcta 27603083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 36582109 - 36582222
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
36582109 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 36582207  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
36582208 agcaagagacttcta 36582222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 36592664 - 36592777
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
36592664 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 36592762  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
36592763 agcaagagacttcta 36592777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39353196 - 39353083
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
39353196 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 39353098  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
39353097 agcaagagacttcta 39353083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39365189 - 39365076
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
39365189 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 39365091  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
39365090 agcaagagacttcta 39365076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40391065 - 40390952
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
40391065 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 40390967  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
40390966 agcaagagacttcta 40390952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40401727 - 40401614
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
40401727 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 40401629  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
40401628 agcaagagacttcta 40401614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 24019140 - 24019274
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||  |||||    
24019140 caaatactcaagcatgcaagcaagagattttttatgctcaagcacaaaagcaagagatttctaaacaaacacaattacacaaaaaaatgtttgggttgaa 24019239  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||    
24019240 catttgatatacaataagtggtgttcacaatacaa 24019274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25097412 - 25097318
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttca 226  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
25097412 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcgaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttca 25097318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25155382 - 25155288
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttca 226  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
25155382 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcgaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttca 25155288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 90019 - 89907
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |    
90019 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttaaggttgaacacttgatatacaattagt 89920  T
219 ggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||    
89919 ggtgttcacaata 89907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Original strand, 6498806 - 6498891
Alignment:
150 caagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
6498806 caagagacttccattcaaacagaattacaaagaatattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 6498891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 16607053 - 16607166
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||    
16607053 agagacttcctatgctcaagcacaattgcaagatacttctattcaaacagaactacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagggg 16607152  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
16607153 tgttcacaatacaa 16607166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 17446248 - 17446360
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
17446248 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 17446346  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
17446347 gcaagagtcttcta 17446360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21100271 - 21100186
Alignment:
150 caagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
21100271 caagagacttatattcaaacagaattacaaagaaaattgtttaagattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21100186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25112562 - 25112463
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
25112562 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 25112464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25171653 - 25171554
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
25171653 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 25171555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34052668 - 34052556
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
34052668 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 34052570  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
34052569 gcaagagtcttcta 34052556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34063329 - 34063217
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
34063329 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 34063231  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
34063230 gcaagagtcttcta 34063217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37407355 - 37407243
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
37407355 ataatcacaaagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 37407257  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
37407256 gcaagagtcttcta 37407243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 4886562 - 4886676
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
4886562 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctcaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 4886660  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
4886661 ggtgttcacaatacaa 4886676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 10848323 - 10848426
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
10848323 tgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 10848422  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
10848423 acaa 10848426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13546122 - 13546008
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| |    
13546122 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctcaattcaaacagaattaca-agaaaaatgttagaggttgaacacttgatatacaatcagt 13546024  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
13546023 ggtgttcacaatacaa 13546008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 21659750 - 21659865
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt--caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    ||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
21659750 agagacttccattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaatccaaacagaattacaatgaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagt 21659849  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
21659850 ggtgttcacaatacaa 21659865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Original strand, 23589269 - 23589360
Alignment:
135 gctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttca 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||    
23589269 gctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacaaagaaaa-tgtttgaggttgaacacttgatatacaataagtggtgttca 23589360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 26783893 - 26784008
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||||| ||| || |  |||||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
26783893 agagacttctaatgcttaagtacaactgcaagagacttctgaattgaaacagaattacaaagaaaatagtttgaggttgaacacttgatatacaatcaat 26783992  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
26783993 ggtgttcacaatacaa 26784008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 33932807 - 33932921
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| || |||||| || |||||||||||||||||||| |    
33932807 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaatat-gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 33932905  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
33932906 ggtgttcacaatacaa 33932921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35932605 - 35932490
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
35932605 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattataaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 35932506  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
35932505 ggtgttcacaatacaa 35932490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6131499 - 6131386
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
6131499 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 6131401  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
6131400 agcaagagacttcta 6131386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6976519 - 6976404
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
6976519 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 6976420  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
6976419 -aagcaagagacttcta 6976404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6987009 - 6986894
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
6987009 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 6986910  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
6986909 -aagcaagagacttcta 6986894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20798404 - 20798291
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
20798404 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 20798306  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
20798305 agcaagagacttcta 20798291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 446 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 21072505 - 21072342
Alignment:
446 ttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcag 545  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||   |   |||||||||||| || |||||||    
21072505 ttgatcaatcaccagtgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcatttgaagtatgaaggaacaatgctacaggcag 21072406  T
546 agctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||| | ||||||||||||   ||||||  | | || || ||||||||||||||||||||    
21072405 agctgttattattgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacactt 21072342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22147230 - 22147118
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
22147230 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 22147133  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
22147132 agcaagagacttcta 22147118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22157813 - 22157701
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
22157813 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 22157716  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
22157715 agcaagagacttcta 22157701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22676827 - 22676712
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
22676827 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 22676728  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
22676727 -aagcaagagacttcta 22676712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22686718 - 22686603
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
22686718 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 22686619  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
22686618 -aagcaagagacttcta 22686603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23296987 - 23296872
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
23296987 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 23296888  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
23296887 -aagcaagagacttcta 23296872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23307555 - 23307440
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
23307555 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 23307456  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
23307455 -aagcaagagacttcta 23307440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23708152 - 23708037
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
23708152 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 23708053  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
23708052 -aagcaagagacttcta 23708037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27622319 - 27622432
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
27622319 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcataaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 27622417  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
27622418 agcaagagacttcta 27622432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 30227046 - 30227161
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
30227046 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 30227145  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
30227146 -aagcaagagacttcta 30227161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 30237573 - 30237688
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
30237573 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 30237672  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
30237673 -aagcaagagacttcta 30237688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31419371 - 31419258
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
31419371 ataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 31419273  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
31419272 agcaagagacttcta 31419258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31589561 - 31589458
Alignment:
133 atgctcaagcactaaa-gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
31589561 atgctcaagcattaaaagcaagagacttatagacaaacacaattacacagaaaaatgtttgaggttgaaaacttgatatacaatcagtgatgttcacaat 31589462  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
31589461 acaa 31589458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #203
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 33951350 - 33951465
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
33951350 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 33951449  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
33951450 -aagcaagagacttcta 33951465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #204
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 39490500 - 39490615
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
39490500 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 39490599  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
39490600 -aagcaagagacttcta 39490615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #205
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 39501690 - 39501805
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
39501690 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 39501789  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
39501790 -aagcaagagacttcta 39501805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #206
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 40513539 - 40513654
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
40513539 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 40513638  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
40513639 -aagcaagagacttcta 40513654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #207
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 42043494 - 42043379
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
42043494 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 42043395  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
42043394 -aagcaagagacttcta 42043379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #208
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 42054069 - 42053954
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
42054069 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 42053970  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
42053969 -aagcaagagacttcta 42053954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #209
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7746291 - 7746177
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
7746291 agagacttataatgctcaagcacaactgcaagagacttataattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 7746192  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
     ||||||||||||||    
7746191 atgttcacaatacaa 7746177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #210
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14087138 - 14086982
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||| |    
14087138 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagacacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattatttgaggttgaatacttgatacacaatcagt 14087039  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    ||||||||||||||||  ||   |||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
14087038 ggtgttcacaatacaaatcagataaagactcttaagactctagaatttctaagatat 14086982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #211
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Original strand, 17456864 - 17456962
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
17456864 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 17456962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #212
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 5290127 - 5290241
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
5290127 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 5290225  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
5290226 aagcaagagacttcta 5290241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #213
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 5300698 - 5300812
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
5300698 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 5300796  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
5300797 aagcaagagacttcta 5300812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #214
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6513028 - 6512916
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   ||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
6513028 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaatagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 6512929  T
219 ggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||    
6512928 ggtgttcacaata 6512916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #215
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26120441 - 26120310
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||    
26120441 atgctcaagcacacaaacaagagacttcctatgcttaagcataaaatcaagagacttctaaacaaacacaattacaaagaaaa-tgtttgaggttgaaca 26120343  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
     ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
26120342 attgatattcaatcattggtgttcacaatacaa 26120310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #216
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 28139146 - 28139260
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
28139146 agagacttctattactcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 28139244  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
28139245 ggtgttcacaatacaa 28139260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #217
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35986831 - 35986716
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |  ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
35986831 agagacttctattgctcaagcataactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 35986732  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
35986731 ggtgttcacaatacaa 35986716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #218
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39799494 - 39799359
Alignment:
99 ccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttg 197  Q
    |||||| ||||||||| ||  | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  || || ||||||||| |||| | |||||  |||    
39799494 ccaaatactcaagcacacaaacaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttttagataa-caaaattacacaaaaaaatatttgaggttg 39799396  T
198 aacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
39799395 aacacttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaa 39799359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #219
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22560145 - 22560032
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
22560145 ataatcataaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 22560047  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
22560046 agcaagagacttcta 22560032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #220
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 23372845 - 23372718
Alignment:
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctat-gaagg 497  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||  || |||| |||||||||| |||||||| | ||||     
23372845 agagacgttgagataatcagcccgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgttcctttgcctgatttgggggtagtccttttgaaga 23372746  T
498 atcaacttcaaattcattcctatcttga 525  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||    
23372745 ataaacttcaaattcattcccatcttga 23372718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #221
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23407154 - 23407041
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
23407154 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 23407056  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
23407055 agcaagagtcttcta 23407041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #222
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23697494 - 23697379
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaa----atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||    ||||||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||    
23697494 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 23697395  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
23697394 -aagcaagagacttcta 23697379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #223
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27204500 - 27204387
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||| |||| |    
27204500 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacact-a 27204402  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
27204401 agcaagagacttcta 27204387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #224
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31834195 - 31834078
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa------tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagca 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||      ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||    
31834195 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 31834096  T
144 ctaaagcaagagacttcta 162  Q
    || ||||||||||||||||    
31834095 ct-aagcaagagacttcta 31834078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #225
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31844673 - 31844556
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa------tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagca 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||      ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||    
31844673 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 31844574  T
144 ctaaagcaagagacttcta 162  Q
    || ||||||||||||||||    
31844573 ct-aagcaagagacttcta 31844556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #226
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34772618 - 34772505
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
34772618 ataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 34772520  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
34772519 agcaagagacttcta 34772505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #227
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34783563 - 34783450
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
34783563 ataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 34783465  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
34783464 agcaagagacttcta 34783450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #228
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36229447 - 36229334
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
36229447 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 36229349  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
36229348 agcaagagtcttcta 36229334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #229
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 37728803 - 37728917
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
37728803 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 37728901  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
37728902 -aagcaagagacttcta 37728917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #230
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 37740119 - 37740233
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
37740119 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 37740217  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
37740218 -aagcaagagacttcta 37740233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #231
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 42395692 - 42395579
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
42395692 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 42395594  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
42395593 agcaagagtcttcta 42395579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #232
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 43043223 - 43043336
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| | |    
43043223 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaat-a 43043321  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
43043322 agcaagagacttcta 43043336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #233
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 9398982 - 9398836
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   ||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
9398982 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctgagggaacaatgttgcaggcagagctgttattcttgtct 9398883  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   ||||||  | | || ||||||||||||||| |||||||    
9398882 tgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacactt 9398836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #234
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 162
Target Start/End: Original strand, 14557568 - 14557682
Alignment:
52 taatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
14557568 taatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 14557666  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
14557667 aagcaagagacttcta 14557682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #235
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 162
Target Start/End: Original strand, 14568205 - 14568319
Alignment:
52 taatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
14568205 taatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 14568303  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
14568304 aagcaagagacttcta 14568319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #236
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 34637094 - 34637226
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||| ||  | ||||| |||  |||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||  ||||||  |||||    
34637094 caaatactcaagcacacaaacaagagatttcatatgctcaaacacaaaagcaagagacttctgaacaaaca-aattacaaagaaatatgtttgg-ttgaa 34637191  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
34637192 cacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 34637226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #237
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 9088535 - 9088622
Alignment:
149 gcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
9088535 gcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 9088622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #238
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 15516536 - 15516623
Alignment:
149 gcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
15516536 gcaagagacttctcaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 15516623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #239
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25930710 - 25930598
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaaga 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  ||   |||||||||  |||||  |||    
25930710 tcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacagttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaaatcagataaagactctaaagactctaga 25930611  T
261 atttctaagatat 273  Q
    |||||||||||||    
25930610 atttctaagatat 25930598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #240
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26056109 - 26056009
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatac 232  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
26056109 atgctaaaggacaaaagcaagagacttctaaacaaaca-aattacacagaaataactttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatac 26056011  T
233 aa 234  Q
    ||    
26056010 aa 26056009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #241
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 30069455 - 30069569
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   |||||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||     
30069455 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 30069553  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
30069554 aagcaagagacttcta 30069569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #242
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 31117445 - 31117532
Alignment:
149 gcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
31117445 gcaagagacttctgaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 31117532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #243
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23392203 - 23392088
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
23392203 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 23392104  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||| |||||    
23392103 ggtgttcacagtacaa 23392088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #244
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31146221 - 31146118
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||  | ||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
31146221 tgctcaagcacaactgcaagagatttcttaattcaaatagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 31146122  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
31146121 acaa 31146118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #245
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 1121454 - 1121567
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
1121454 ataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 1121552  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
1121553 agcaagagtcttcta 1121567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #246
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 9377013 - 9377127
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
9377013 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 9377111  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
9377112 -aagcaagagacttcta 9377127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #247
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10755200 - 10755087
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||  |||||| |||| || || |||| ||||||||||||||| ||| |    
10755200 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagaact-a 10755102  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
10755101 agcaagagacttcta 10755087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #248
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14030753 - 14030639
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
14030753 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 14030655  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
14030654 -aagcaagagacttcta 14030639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #249
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14041306 - 14041192
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
14041306 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 14041208  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
14041207 -aagcaagagacttcta 14041192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #250
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 14446552 - 14446666
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
14446552 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 14446650  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
14446651 -aagcaagagacttcta 14446666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #251
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 14457164 - 14457278
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
14457164 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 14457262  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
14457263 -aagcaagagacttcta 14457278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #252
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 15693583 - 15693697
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
15693583 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 15693681  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
15693682 -aagcaagagacttcta 15693697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #253
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15740677 - 15740563
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
15740677 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 15740579  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
15740578 -aagcaagagacttcta 15740563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #254
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15769837 - 15769723
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
15769837 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 15769739  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
15769738 -aagcaagagacttcta 15769723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #255
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17607768 - 17607654
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
17607768 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17607670  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
17607669 -aagcaagagacttcta 17607654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #256
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17618383 - 17618269
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
17618383 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17618285  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
17618284 -aagcaagagacttcta 17618269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #257
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17719626 - 17719512
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
17719626 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17719528  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
17719527 -aagcaagagacttcta 17719512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #258
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17730278 - 17730164
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
17730278 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17730180  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
17730179 -aagcaagagacttcta 17730164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #259
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24567798 - 24567684
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
24567798 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24567700  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
24567699 -aagcaagagacttcta 24567684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #260
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 24816437 - 24816551
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
24816437 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24816535  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
24816536 -aagcaagagacttcta 24816551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #261
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 24827025 - 24827139
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
24827025 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24827123  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
24827124 -aagcaagagacttcta 24827139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #262
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27041763 - 27041877
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
27041763 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27041861  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
27041862 -aagcaagagacttcta 27041877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #263
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27052387 - 27052501
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
27052387 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27052485  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
27052486 -aagcaagagacttcta 27052501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #264
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27460870 - 27460756
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
27460870 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27460772  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
27460771 -aagcaagagacttcta 27460756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #265
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27471269 - 27471155
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
27471269 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27471171  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
27471170 -aagcaagagacttcta 27471155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #266
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31349242 - 31349128
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
31349242 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 31349144  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
31349143 -aagcaagagacttcta 31349128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #267
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31359856 - 31359742
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
31359856 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 31359758  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
31359757 -aagcaagagacttcta 31359742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #268
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31449262 - 31449149
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
31449262 ataatcacaaggattacaactgatcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaaccacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 31449164  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
31449163 agcaagagacttcta 31449149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #269
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35216215 - 35216101
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
35216215 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35216117  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
35216116 -aagcaagagacttcta 35216101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #270
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35226799 - 35226685
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
35226799 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35226701  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
35226700 -aagcaagagacttcta 35226685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #271
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11208736 - 11208594
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||||     
11208736 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagta-taatcacaactgattacaactgctcaatactacaactagtatgagactt-caaaatgctcaagcaca 11208639  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 161  Q
    || || ||| ||||||  | |||||||||  |||||||||||||||    
11208638 ca-gcaagatacttcctttactcaagcacacaagcaagagacttct 11208594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #272
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 229
Target Start/End: Original strand, 12078386 - 12078514
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgct--caagcactaaagcaagagacttctagtcaaacaga-attacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    |||||||||||| || || |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||  |||||| | |||| | |||| ||||||||| |||||    
12078386 atgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgcttgcaagcacaaaagcaagagacttttaa-caaacaaagattataaagaatattgtttgaattgaa 12078484  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaa 229  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||    
12078485 cacttgatatacaatcagaggagttcacaa 12078514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #273
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 33022538 - 33022699
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||  | |||||||    
33022538 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctttgcaggc 33022637  T
544 agagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||   | ||||||||||||||   |||| |  ||  || |||||| ||||||||||||||||    
33022638 agagc---tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 33022699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #274
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8522550 - 8522436
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |     
8522550 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca-tt 8522452  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
8522451 aagcaagagtcttcta 8522436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #275
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13736733 - 13736618
Alignment:
122 agagacttccaat-gctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||     
13736733 agagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaatagaattaca-agaaaaatgtttgaggctgaacacttgatatacaatcag 13736635  T
218 tggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||    
13736634 tggtgttcacaatacaa 13736618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #276
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22000608 - 22000539
Alignment:
166 aaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
22000608 aaacagaattaaacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatttacaatgagtggtgttcacaatacaa 22000539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #277
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 32160158 - 32160300
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || | |||||||||     
32160158 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattactcaagcaca 32160255  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
32160256 caggcaagagatttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttc 32160300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #278
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Original strand, 1108696 - 1108795
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
1108696 ataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 1108795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #279
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Original strand, 17814508 - 17814619
Alignment:
126 acttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   |||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||    
17814508 acttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaccagaattacaaagaaaaatgtttaaggttgaacacttgatatacaataagtggtg 17814607  T
223 ttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||    
17814608 ttcacaatacaa 17814619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #280
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 30742521 - 30742635
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| | |  | ||||||||||||||| |||| || |||||| || |||||||||||||||||||| |    
30742521 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacatttgaattcaaacagaattacaaagaatat-gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 30742619  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    | ||||||||||||||    
30742620 gatgttcacaatacaa 30742635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #281
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 43621445 - 43621559
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
43621445 ataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 43621543  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
43621544 aagcaagagtcttcta 43621559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #282
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 21702676 - 21702789
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||| ||||  |||||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
21702676 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 21702774  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
21702775 agcaagagtcttcta 21702789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #283
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23393109 - 23392996
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||| ||||  ||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||| |    
23393109 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtttgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaaagtcttccaatgctcaagcact-a 23393011  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
23393010 agcaagagtcttcta 23392996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #284
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24808621 - 24808507
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
24808621 ataatcaca-agattacaactgctcaatacttttaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24808523  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
24808522 -aagcaagagacttcta 24808507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #285
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 26784266 - 26784389
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | || ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||  | | ||    
26784266 gtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagcatgtaggaacatttttgcaggcagagttgttattcttgtcttgtagcagacacacaaactgagt 26784365  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
26784366 agtggaggtagtggttgtacactt 26784389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #286
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36085169 - 36085056
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
36085169 ataatcgcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 36085071  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
36085070 agcaagagtcttcta 36085056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #287
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36688403 - 36688289
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
36688403 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36688305  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
36688304 -aagcaagagacttcta 36688289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #288
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36698969 - 36698855
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
36698969 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36698871  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
36698870 -aagcaagagacttcta 36698855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #289
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 21910426 - 21910591
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | || |||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  || ||||    
21910426 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgtaggc 21910525  T
544 agagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
21910526 agaactgttatctttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 21910591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #290
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 23880937 - 23881102
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |   ||| ||||||||  |||||||    
23880937 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgccttatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcaaagtatgagggaacaatgttgcaggc 23881036  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||  |   || |||||||||||||||||||||||    
23881037 agagttgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacactt 23881102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #291
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Original strand, 31487775 - 31487886
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
31487775 agagacttctaattctcaagcacaactacaagagacttctaaattcaaatagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatataaaatcagt 31487873  T
219 ggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||    
31487874 ggtgttcacaata 31487886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #292
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 11993441 - 11993543
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
11993441 tgctcaagcacaactgcaagagacttctcaattcaaacagaattaca-ataaaaatgtttgaggttgaacactttatatacaattagtggtgttcacaat 11993539  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
11993540 acaa 11993543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #293
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20552524 - 20552410
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| |||     
20552524 ataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtact- 20552426  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
20552425 aagcaagagtcttcta 20552410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #294
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20563034 - 20562920
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| |||     
20563034 ataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagtact- 20562936  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
20562935 aagcaagagtcttcta 20562920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #295
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 29138672 - 29138508
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||   |||| |||| |  ||||||||    
29138672 tttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattgttgcaggca 29138573  T
545 gagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||| |||| | |||||||||||||   ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
29138572 gagttgtttttcttgtcttgtagcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 29138508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #296
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29138991 - 29138889
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| ||   ||||| ||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
29138991 tgctcaagcacaactgcaagagacttataaattcaaatagaattaca-agaaaaatatttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 29138893  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
29138892 acaa 29138889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #297
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 33022204 - 33022319
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |  || |||||||| |  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||   |    
33022204 agagacttctaatgatcaagcacaaccgcgagagactttttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaattggt 33022303  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||| ||||||||||||    
33022304 ggtattcacaatacaa 33022319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #298
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23393006 - 23392903
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
23393006 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacgcttgatatacaatcagtggt 23392907  T
222 gttc 225  Q
    ||||    
23392906 gttc 23392903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #299
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Original strand, 25740725 - 25740764
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
25740725 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 25740764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #300
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 28139519 - 28139642
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||   |||| ||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||| ||    
28139519 gtcctatgaatgatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacaatgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagt 28139618  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||||||||||||||||||||    
28139619 agtggagatagtggttgtacactt 28139642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #301
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 41566659 - 41566536
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||   | || ||||||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||  | | ||    
41566659 gtcctacgaatgatcaatttcaaattcattccatgcatgtaggaacattgtttcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagt 41566560  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||||||||||||||||||||    
41566559 agtggagatagtggttgtacactt 41566536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #302
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 24925689 - 24925804
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
24925689 ataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24925788  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||| ||||||    
24925789 -aagcaagagtcttcta 24925804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #303
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 24982970 - 24983085
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
24982970 ataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagcatgagacttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24983069  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||| ||||||    
24983070 -aagcaagagtcttcta 24983085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #304
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19464626 - 19464566
Alignment:
101 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
19464626 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 19464566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #305
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19478656 - 19478596
Alignment:
101 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
19478656 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 19478596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #306
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 546 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23392898 - 23392830
Alignment:
546 agctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
23392898 agctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23392830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #307
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 42243220 - 42243335
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacact-tgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||| || |||||| || ||||||  ||||||| |||||     
42243220 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttttgaattcaaacagaattacaaagaatat-gtttgagtttgaacacactgatatataatcag 42243318  T
218 tggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||    
42243319 tggtgttcacaatacaa 42243335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #308
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 12078357 - 12078413
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
12078357 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 12078413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #309
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Original strand, 26759021 - 26759184
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||| ||||| ||| | | |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | |  ||||||||    
26759021 tttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcctattatgaaggaatattgttgcaggca 26759120  T
545 gagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||| || ||||||||||||||   |||| | | || || |||||| ||||||||||||||||    
26759121 gagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaat-agagtagtggaggtagtggttgtacactt 26759184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #310
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 35986406 - 35986334
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||    
35986406 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 35986334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #311
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 4886934 - 4887057
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| ||    
4886934 gtcctaagaaggatcaatttcaaatgtattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagt 4887033  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
4887034 agtggaggtagtggttgtacactt 4887057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #312
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 162
Target Start/End: Original strand, 21705559 - 21705636
Alignment:
86 agtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
21705559 agtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 21705636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #313
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 486 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 13545737 - 13545655
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||| |||    ||||||||||| || |||||||||||||||||    
13545737 gtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccatagtgaagggacatcattgcaggcagagttgtttatcttgtcttgtagc 13545655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #314
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 21660081 - 21660247
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaat-tctgcagg 542  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |   || |  |||| | | ||||||    
21660081 ctttgatgattcaccattgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgcataaacattgtttgcagg 21660180  T
543 cagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||   |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||    
21660181 cagagttgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 21660247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #315
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 546 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20562522 - 20562454
Alignment:
546 agctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
20562522 agctgttgtcttgtcttgtagcatggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 20562454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #316
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 533
Target Start/End: Original strand, 25740993 - 25741082
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa 533  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||  |||||||||||    
25740993 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattctcatagtgaaggaacaa 25741082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #317
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6976404 - 6976376
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
6976404 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 6976376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #318
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6986894 - 6986866
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
6986894 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 6986866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #319
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Original strand, 10848736 - 10848808
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
10848736 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 10848808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #320
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22676712 - 22676684
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
22676712 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 22676684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #321
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22686603 - 22686575
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
22686603 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 22686575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #322
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23296872 - 23296844
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
23296872 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 23296844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #323
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23307440 - 23307412
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
23307440 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 23307412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #324
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23708037 - 23708009
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
23708037 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 23708009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #325
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 30227161 - 30227189
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
30227161 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 30227189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #326
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 30237688 - 30237716
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
30237688 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 30237716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #327
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 33951465 - 33951493
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
33951465 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 33951493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #328
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 39490615 - 39490643
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
39490615 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 39490643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #329
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 39501805 - 39501833
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
39501805 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 39501833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #330
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 40513654 - 40513682
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
40513654 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 40513682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #331
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42043379 - 42043351
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
42043379 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 42043351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #332
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42053954 - 42053926
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
42053954 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 42053926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 513; Significance: 0; HSPs: 262)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 46181512 - 46180916
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
46181512 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcat 46181413  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
46181412 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 46181313  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
46181312 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaattt 46181213  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
46181212 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgttgatgtctctcttgatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtaagtagagagacgttgagatcttta 46181113  T
419 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46181112 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 46181013  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
46181012 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaagacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 46180916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20884508 - 20883919
Alignment:
26 cttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagag 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20884508 cttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagag 20884409  T
126 acttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttc 225  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
20884408 aattccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 20884309  T
226 acaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
20884308 acaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttggcagag 20884209  T
326 tttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtc 425  Q
    ||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
20884208 ttttggcgcttttaacttgtgttgatttctctaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagacttttagcacgtc 20884109  T
426 taaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga 525  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20884108 caaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatctgttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga 20884009  T
526 aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
20884008 aggaagaattctgctggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagctaatggttgtacacttgtacttt 20883919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 615
Target Start/End: Original strand, 23926591 - 23927103
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacac 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
23926591 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 23926690  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgct 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23926691 ttgatatacaatcagtggtgttcacagtacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgct 23926790  T
303 tttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagaga 402  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||| |  |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||    
23926791 tttgagaatcaaatttagcagagttttgacgcttttaacttgtgttgatatctctatcagtcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagaga 23926890  T
403 gacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaa 502  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
23926891 gacgttgagatttttagcacgtccaaagagtcgttgagttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcac 23926990  T
503 cttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgt 602  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
23926991 gttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgtaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacatactcagggtcgtggaggtagtggttgt 23927090  T
603 acacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||    
23927091 acacttgtacttt 23927103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 28473673 - 28474272
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
28473673 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcag 28473772  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
28473773 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcag 28473872  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaat 316  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||  || |    
28473873 tggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaacgtgcttttgagaaacaatt 28473972  T
317 ttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-t 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||| || |||||||||||||||||| | || || || |||||||||| |||| |||||| | |    
28473973 ttggcagagtttgggcgcttttaacttgtagcattgtctccactgatcttcaagtcttcactcctttttagagaggtgtgtagaaagacattgagacctt 28474072  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
28474073 taagcacgtctaaagagtcgttgagaacctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccatt 28474172  T
516 cctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
28474173 cctatcttaaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgcagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtacttt 28474272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 22610524 - 22610011
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | ||  |||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22610524 aatgctcaagcactaaagcaggagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 22610425  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22610424 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 22610326  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    
22610325 tttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaga 22610226  T
401 gagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
22610225 gagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccatcagtaatcttttgcctgatttgagtgtagtcctataaaggatc 22610126  T
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
22610125 aaattcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatattgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggtt 22610026  T
601 gtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||    
22610025 gtacacttgtacttt 22610011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 608
Target Start/End: Original strand, 44200455 - 44201049
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagca----c 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    |    
44200455 ccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcatgcgc 44200554  T
115 gcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaa 213  Q
    ||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
44200555 gcacgcaagagacttcatatgctcaagcactaaagcaagagatttctaatcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaa 44200654  T
214 tcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatta 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |    
44200655 tcagtggtgttcacaatacaatgcaaggaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttatgtgaaaca 44200754  T
314 aatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagat 413  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
44200755 attttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtaatgtctctactgatcttcaagtcttcattcctttatatagtggtgtgtagagagacgttgagat 44200854  T
414 cttaagcacgtctaaagagtcgttgag-ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattc 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||   |||| | |||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |    
44200855 cttaagcacgtctaaagagtcgttgagaaacctttgatca-ataccaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctatgaaagatcaagttcaaatcc 44200953  T
513 attcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
44200954 attcctatcttgaaggaacatttctgcaggcaaagttgttatcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 44201049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 20251216 - 20251819
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
20251216 ccttgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaaaatgctcaagcacgc 20251315  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatc 215  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
20251316 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatc 20251415  T
216 aatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactc--tagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt-tgagaat 311  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||| || |||     
20251416 agtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctatagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagttctttgtgtgaaa 20251515  T
312 taaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgag 411  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
20251516 caaatttggtagagtttgggcgcttttaacttgttgtattgtctctgctgatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgag 20251615  T
412 atc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaat 510  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||    
20251616 atctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaaccttgatca-ataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaat 20251714  T
511 tcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgt 610  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||     
20251715 ccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgttttgtagcatagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacccttgc 20251814  T
611 acttt 615  Q
    |||||    
20251815 acttt 20251819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 195 - 615
Target Start/End: Original strand, 20798689 - 20799109
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattc 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20798689 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattc 20798787  T
295 aaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggt 393  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||    
20798788 aaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 20798887  T
394 gtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatg 493  Q
    | |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
20798888 gagtagagagacgttgagaattatagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctata 20798987  T
494 aaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagat 593  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
20798988 gaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttattttgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggt 20799087  T
594 agtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||    
20799088 agtggttgtacacttgtacttt 20799109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 14388677 - 14388163
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct-agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaa 199  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
14388677 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttcttaatcaaacagaattacacaaaaaat-gtttgactttgaa 14388579  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14388578 cacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 14388480  T
300 gcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    ||||||   ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
14388479 gctttttgtaatcaagtttggcagagttttagcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagta 14388380  T
399 gagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
14388379 gagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaagga 14388280  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
14388279 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaacagagtagtggaggtagtgg 14388180  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
14388179 ttgtacacttgtacttt 14388163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 5929234 - 5929748
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
5929234 aatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacaaaaaattgtttgagtttgaac 5929333  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||    
5929334 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcacagt 5929433  T
300 gcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||    
5929434 gcttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtaatgtctctagtgatcttcaagtcttcattcctttatataggggtgtgtag 5929533  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
5929534 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagaaaccttgatca-ataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggat 5929632  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||    
5929633 caagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctggtgtcttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggt 5929732  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
5929733 tgtacacttgtacttt 5929748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 41133148 - 41132652
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaa-ttacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
41133148 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacataaattacacagaaaattgtttgactttgaactcttgatatacaatcagtg 41133049  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
41133048 gtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttg 41132950  T
320 gcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
41132949 gcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagattttaa 41132850  T
419 -gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41132849 agcatgtctaaagagtcattgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 41132750  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||    
41132749 cattttgaaggaacagttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtacttt 41132652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 675103 - 675616
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
675103 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaacgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacataaaat-gtttgactttgaac 675201  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
675202 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaattagtgcagaaattcaaagtg 675300  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||    
675301 ctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactgctttatatagaggtgagtag 675400  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
675401 aaagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 675500  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
675501 caacttcaaattcattcccattttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggt 675600  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
675601 tgtacacttgtacttt 675616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18311522 - 18311009
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
18311522 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacataattacacagaaaat-gtttgactttgaac 18311424  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18311423 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataag-gactctaaacttaagaatttttaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 18311325  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
18311324 ctttgtagaatcaaatttggcagagttttggtgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtag 18311225  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
18311224 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagtttctttgatcattcaccagtaatcttttgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggat 18311125  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
18311124 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggtagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaacagagtagtggaggtagtggt 18311025  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
18311024 tgtacacttgtacttt 18311009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 45071262 - 45070900
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45071262 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactacgtagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 45071163  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttg-aacacttgatatacaatcaa 217  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
45071162 gctagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttttaacacttgatatacaatcag 45071063  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
45071062 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaggaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatt 45070963  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttc 380  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
45070962 tggcagagttttggcgcttttaacttgtgataatgtctctactgatcttcaagtcttcacttc 45070900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 67 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 52351271 - 52350721
Alignment:
67 caactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtca 166  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
52351271 caactgctcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatca 52351172  T
167 aacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaattt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
52351171 aacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaattt 52351072  T
265 ctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc-ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgat 363  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||    
52351071 ctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgaattgtctctaataat 52350972  T
364 cttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagta 462  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | |||||||   |||| |     
52350971 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgttgagagacgttgagttctttaagcacgtc-aaagagtcattgagaaaccttgatca-ataccaatg 52350874  T
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtctt 562  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
52350873 atcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaagggacatttctgcaggcagagctattatcttgtctt 52350774  T
563 gtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  ||||||  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
52350773 gtagcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtacttt 52350721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20196241 - 20195730
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaat-tacacagaaaattgtttgacttgaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| ||  |||| ||||||| |||||| ||||||    
20196241 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaaatacagagaaaat-gtttgaattgaac 20196143  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
20196142 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtg 20196044  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |     
20196043 ctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgtgaa- 20195945  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
20195944 agagacgttgagatttta-gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggat 20195846  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||| |||||||    
20195845 caacttcaaattcattcccatcttgatggaacaattctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggt 20195746  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
20195745 tgtacacttgtacttt 20195730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 103 - 615
Target Start/End: Original strand, 19037533 - 19038052
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
19037533 atgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaaca 19037632  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactctagacttaa--gaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaag 298  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
19037633 cttgatatactataagtggtgttcacaataaaatgcaattgaaagactctagaaaaaaaagaatttctaagatatatcaaatcaacaaagaaattcaaag 19037732  T
299 tgctttt-gagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgt 397  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||    
19037733 tgctttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttatattgtctctactgatctgcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgt 19037832  T
398 agagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaag 496  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||    
19037833 agagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctataaag 19037932  T
497 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatag 595  Q
     ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| |||    
19037933 aatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgcagacacaatcagagtcgtggaggtag 19038032  T
596 tggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||    
19038033 tggttgtacacttgtacttt 19038052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 122 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867059
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtagt 20867284  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
20867283 gttcacaatacaatgcagtaaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggc 20867184  T
322 agagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagca 421  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||    
20867183 agagttttggcacttttaacttgtggtgatttctctaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagca 20867084  T
422 cgtctaaagagtcgttgagttcctt 446  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
20867083 cgtccaaagagtcgttgagttcctt 20867059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 11195597 - 11195104
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| ||||||||||||   | ||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
11195597 agagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgactttgaacacttgatatactatcagtgg 11195499  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
11195498 tgttatcaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttatgagaagtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaatttgg 11195400  T
321 cagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||    
11195399 cagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttaccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatttttag 11195301  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
11195300 cacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttgagtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattccc 11195201  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| || ||||||||||||||||||||    
11195200 atcttgaaggaacatttctgcaggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtaatggttgtacacttgtacttt 11195104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 104 - 615
Target Start/End: Original strand, 28379522 - 28380040
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
28379522 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacaaaaaattgtttgagtttgaacac 28379621  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactct--agacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||     || |||||||||||    
28379622 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaatgactctctagacttaagaatttctaagatttatcagatagacacataaattcaaagt 28379721  T
300 gcttttga--gaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgt 397  Q
    |||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||    
28379722 gcttttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaatttgttgtattgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagatgtgtgt 28379821  T
398 agagagacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaag 496  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
28379822 agagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaag 28379921  T
497 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagt 596  Q
    |||||  |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||| || |    
28379922 gatcacgttcaaatcaattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaattagagtcgtggaggtact 28380021  T
597 ggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||    
28380022 ggttgtacacttgtacttt 28380040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 122 - 608
Target Start/End: Original strand, 22018877 - 22019374
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
22018877 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtgg 22018976  T
221 tgttcaca----atacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt--tgagaat 311  Q
    ||||||||    ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||||||  || |||     
22018977 tgttcacaatatatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgatcacaaaaattcaaagtgcttttgtgtgaaa 22019076  T
312 taaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgag 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||    
22019077 caaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttatcttgtctctgctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-agagagtcgttgag 22019175  T
412 atc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaat 510  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||    
22019176 atctttaagcacgtcaatagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaat 22019275  T
511 tcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
22019276 ccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggaagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 22019374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 51 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9051090 - 9050525
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |    
9051090 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcacgca 9050991  T
148 agcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcac-aatacaatgcaataaaaga 246  Q
     ||||||| |||||| ||||||| || |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  | ||    
9050990 ggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagagaaatatttttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaaatacaatgtaat-tatga 9050892  T
247 ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgc-ttttaacttgt 345  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||    
9050891 ctctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaa-ttgacagagttttggcgctttttaacttgt 9050793  T
346 gata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcc 444  Q
     |||  | | |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
9050792 -atatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaagtgtg-aaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgttgaattcc 9050696  T
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
9050695 tttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaaatagcttcaaattcattaccatcttgaaggaacatttctgcaggca 9050596  T
545 gagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
      |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9050595 tggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9050525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 51 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23580928 - 23580363
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||| |||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
23580928 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 23580829  T
148 agcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagac 247  Q
     |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
23580828 -gcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaat-aaagac 23580731  T
248 tctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtg 346  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | |||||| |||||||| ||||||||| |||||||     
23580730 tctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaa-tcaatttgacagagttttggcgcttttgaacttgt- 23580634  T
347 ataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagtt 442  Q
       || ||||||   |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  |    
23580633 ---atatctctatctcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaat 23580538  T
443 cctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcag 541  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
23580537 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgcag 23580438  T
542 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
23580437 gcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23580363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Original strand, 22655004 - 22655515
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
22655004 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 22655103  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||    
22655104 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatctcaaataaacacagaaattcaaagt 22655203  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctac----cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggt 393  Q
    |||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |      ||||||||||||||||| | |||||||| |||    
22655204 gcttttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgt-----tgtctcttcttttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 22655298  T
394 gtgtagagagacgttgagatc--ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtccta 491  Q
    ||| | |||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||    
22655299 gtg-aaagagtcgttgagatcttttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcagtcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtccta 22655397  T
492 tgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtgga 590  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||    
22655398 agaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagaactgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtgga 22655497  T
591 gatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||||||||||||||    
22655498 ggtagtggttgtacactt 22655515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 103 - 608
Target Start/End: Original strand, 22642421 - 22642933
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
22642421 atgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaaca 22642520  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaag 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
22642521 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaag 22642620  T
299 tgcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctac----cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtgg 392  Q
    ||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |     |||||||||||||||||| | |||||||  ||    
22642621 tgcttttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgt-----tgtctcttctttttgatcttcaagtcttcactcctttatataaagg 22642715  T
393 tgtgtagagagacgttgagatc--ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcct 490  Q
    |||| | ||||  |||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| || |||||| ||| |||||    
22642716 tgtg-aaagagtggttgagatcttttaagaacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgccttatttggatgttgtcct 22642814  T
491 atgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtgg 589  Q
    | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||  ||| |||||||    
22642815 aagaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagaactgtttatcttgtcttgtaccgtagacacaagcagagtcgtgg 22642914  T
590 agatagtggttgtacactt 608  Q
    || ||||||||||||||||    
22642915 aggtagtggttgtacactt 22642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 47194940 - 47195431
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
47194940 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 47195039  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
47195040 gttcacaatacaatacgataaa-gactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 47195137  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| | |   |||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
47195138 agagttttggcgctttttaacttgt----atatctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgatt 47195232  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
47195233 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatccttcgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcc 47195332  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||||||||| |||||||||||   ||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
47195333 catcttgaaggaacatttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 47195431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26548810 - 26548299
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
26548810 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgattttgaacac 26548711  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||    
26548710 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacactgaaattcaaagt 26548611  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgt 397  Q
    |||||  || |||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||     
26548610 gcttttctgtgaaacaaatttgacagagtttggacgcttttaacttgttgtctcttctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg- 26548512  T
398 agagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaag 496  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| |   | || || |  ||||| | |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
26548511 agagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtccttgtgaaaccttaattaaacaccaatgatcttttgcctgatttggatgctgtcctatgaag 26548412  T
497 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatag 595  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||| |  ||| ||||||||| |||    
26548411 gatcacgttcaaatccattcctatcttgaaagaacatttatgcagacagagctgtttatcctgtcttgtagcgtagacagaggcagtgtcgtggaggtag 26548312  T
596 tggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||    
26548311 tggttgtacactt 26548299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18382433 - 18381941
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaat-tacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| ||  ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
18382433 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaacatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtgg 18382334  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaa-gaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |    
18382333 tgttcacaatacaatacaataaa-gactttagactttgtgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-g 18382236  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgat---cttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct 415  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| | ||   ||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||      
18382235 acagagttttggcgctttttaacttgt----atatctctatctatattcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatga 18382141  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
18382140 ttaacacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 18382041  T
516 cctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
18382040 cccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18381941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Original strand, 17370569 - 17371080
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
17370569 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaatagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 17370668  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaagactc--tagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
17370669 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctatagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 17370768  T
300 gc--ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgt 397  Q
    ||  || || |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |   || |||   |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||     
17370769 gcatttatgtgaaacaaattttgcagagtttgggcgctttttacttgttgtctcgtgtctcttgatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtg- 17370867  T
398 agagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaag 496  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
17370868 aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaag 17370967  T
497 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagct-gttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatag 595  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||    
17370968 gatcacgttcaaatccattcctatcatgaaggaacatttctgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtag 17371067  T
596 tggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||    
17371068 tggttgtacactt 17371080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 132 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20441835 - 20441354
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
20441835 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaaaata 20441736  T
232 caatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttggg 331  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||    
20441735 caatacgataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttgg 20441638  T
332 cgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaag 430  Q
     |||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||    
20441637 tgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgataagcacgtctaaag 20441540  T
431 agtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaa 530  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |    
20441539 agtcgttgaattcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 20441440  T
531 c-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
20441439 caaattctgtaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 20441354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 17956917 - 17957409
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
17956917 agagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgatcttgaatacttgatatacaatcagtgg 17957015  T
221 tgttcacaa-tacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |    
17957016 tgttcacaaatacaatgtaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-g 17957113  T
320 gcagagtttgggcgctttt--aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc 414  Q
     ||| |||| |||||||||  |||||||    |||||||||   || ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| ||     
17957114 acagggttttggcgcttttttaacttgt----atgtctctatctccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgaaatg 17957208  T
415 ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcat 514  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||    
17957209 attagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcttccaccagtaattctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcat 17957308  T
515 tcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||| |  |||| |  ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
17957309 tcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggttgttttcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactt 17957408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 7689988 - 7689496
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
7689988 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 7689889  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
7689888 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 7689791  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| ||  |  | ||||||||||||||  | |||    
7689790 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcatagaaagagacgttgagataattagc 7689692  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||  |    
7689691 acgtctaaagagccgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcaca 7689592  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
7689591 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 7689496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 19170879 - 19170376
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||    
19170879 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacaaaaaattgtttgagttttaacac 19170780  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||     
19170779 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactct---ct--agaatttctaagatatatcaaatgaatacagaaattctaagtgt 19170685  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagag 401  Q
    || || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| | |||| | ||    
19170684 ttatgtgaaacaaatttggcaaagtttgggcgcttttaacttgttgtcttgtctcttattatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtg-aaag 19170586  T
402 agacgttgagatc-ttaagcacgtctaa-agagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    ||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||| |   | |||||||  ||||| | ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||    
19170585 agacgttgagatcttttagcacttcaaatagagtagttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggat 19170486  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||  ||||||    
19170485 cacgttcaaatccattcctatcttgaacgaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtgg 19170386  T
599 ttgtacactt 608  Q
    ||||||||||    
19170385 ttgtacactt 19170376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 405 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 45070900 - 45070694
Alignment:
405 cgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaact 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
45070900 cgttgagatcttaagcacgtctaaagaatcgttgagttcctttgatcattcaccactaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaact 45070801  T
505 tcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtac 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
45070800 tcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtac 45070701  T
605 acttgta 611  Q
    | |||||    
45070700 atttgta 45070694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 188 - 615
Target Start/End: Original strand, 39586714 - 39587139
Alignment:
188 gtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgca 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
39586714 gtttgatttgaacacttgatatactatcagtggtgttcacaatacaatacgataca-gactctagacttttgaatttctaagatatatcaaattagtgca 39586812  T
288 gaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttata 386  Q
    ||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||   |||||||||||||||| | |||||    
39586813 gaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacat-tcttcaagtcttcactcctttata 39586910  T
387 tagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtag 486  Q
    ||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
39586911 tagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgagtgtag 39587009  T
487 tcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtc 585  Q
    |||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||| ||     
39587010 tcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagta 39587109  T
586 gtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
39587110 gtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 39587139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 4251093 - 4250602
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
4251093 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 4250994  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
4250993 gttcataatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 4250896  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||| ||||||||  | |||    
4250895 agagttttggcgctttttaacttctgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagatgttgagataattagc 4250798  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
4250797 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 4250698  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4250697 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4250602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 39194622 - 39194131
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
39194622 agagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 39194523  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  || | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
39194522 gttcacaatacaatacgttaga-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 39194425  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| || | ||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
39194424 agagttttggcgctttttaacttgt-atatatctatcttca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattag 39194328  T
420 cacgtctaaagagtcgttgagt-tcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||     
39194327 cacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattccc 39194228  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
39194227 atcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 39194131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 35012606 - 35013092
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
35012606 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 35012705  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||||||||||||      || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
35012706 gttcacaatacaat------aaggactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 35012797  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| || |||| ||| | ||| ||    ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
35012798 agagttttggcgcttttgaaattgt-ata-tctctatattttatctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 35012894  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
35012895 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 35012994  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
35012995 atcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 35013092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 19187516 - 19188008
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
19187516 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 19187615  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
19187616 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 19187712  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    | || ||    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
19187713 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctcact-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 19187810  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||| |    
19187811 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagtaagcttcaaattcattccca 19187910  T
520 tcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19187911 tcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19188008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 154817 - 154326
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
154817 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 154718  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || || | |    
154717 gttcacaatacaatacaattaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaactt-gac 154620  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
154619 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctctctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 154522  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
154521 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 154422  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
      ||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
154421 ctttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttatacacttgtacttt 154326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 4166937 - 4167429
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
4166937 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 4167036  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
4167037 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 4167133  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
4167134 agagttttggtgcttttgaacttatgtatctctctct-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 4167231  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
4167232 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 4167331  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  ||| || | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4167332 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4167429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 4177593 - 4178085
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
4177593 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 4177692  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
4177693 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 4177789  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
4177790 agagttttggtgcttttgaacttatgtatctctctct-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 4177887  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
4177888 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 4177987  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4177988 tcttgaacgtacaaattttgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4178085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 19178637 - 19179129
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
19178637 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 19178736  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
19178737 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 19178833  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||    | || ||    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
19178834 agagttttgacgctttttaacttgtgtatctctcactttt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagc 19178931  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||| |    
19178932 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagtaagcttcaaattcattccca 19179031  T
520 tcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19179032 tcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19179129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 38094754 - 38095247
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
38094754 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 38094853  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
38094854 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 38094950  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || | |||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
38094951 agagttttggcgcttttaaacttatg--tatttttctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 38095047  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
38095048 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattccc 38095147  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
38095148 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 38095247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 38105379 - 38105872
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
38105379 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 38105478  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
38105479 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 38105575  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || | |||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
38105576 agagttttggcgcttttaaacttatg--tatttttctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 38105672  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
38105673 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattccc 38105772  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
38105773 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 38105872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 51629716 - 51629224
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
51629716 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 51629617  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
51629616 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 51629520  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
51629519 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 51629425  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
51629424 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 51629325  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
51629324 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 51629225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 51656977 - 51656485
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
51656977 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 51656878  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
51656877 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 51656781  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
51656780 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 51656686  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
51656685 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 51656586  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
51656585 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 51656486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 148742 - 148251
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
148742 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 148643  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || || | |    
148642 gttcacaatacaatacaattaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaactt-gac 148545  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
148544 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctctctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 148447  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
148446 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 148347  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
      ||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||    
148346 ctttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtgattgtacacttgtacttt 148251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 188 - 615
Target Start/End: Original strand, 5973502 - 5973933
Alignment:
188 gtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
5973502 gtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgca 5973600  T
288 gaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttata 386  Q
    ||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    | | ||| |  ||||||||||||||||| | |||||    
5973601 gaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctgca-atcttcaagtcttcactcctttata 5973698  T
387 tagtggtgtgtagagagacgttgagatc-tta-----agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttg 479  Q
    ||| || ||| | ||||||||||||||  |||     |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
5973699 tagaggcgtgaa-agagacgttgagataattataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttg 5973797  T
480 ggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacact 578  Q
    ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |      
5973798 ggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaa 5973896  T
579 cagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
5973897 cagagtagtggaggcagtggttgtacacttgtacttt 5973933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 5832896 - 5833389
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
5832896 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 5832995  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
5832996 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 5833092  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
5833093 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 5833189  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
5833190 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 5833289  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
5833290 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 5833389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 5843498 - 5843991
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
5843498 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 5843597  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
5843598 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 5843694  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
5843695 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 5843791  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
5843792 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 5843891  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
5843892 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 5843991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 10998313 - 10997821
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
10998313 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 10998214  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
10998213 gttcacaatacaatgc-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 10998117  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
10998116 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatct-gcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 10998019  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
10998018 acttctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 10997919  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
10997918 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 10997821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 84 - 568
Target Start/End: Original strand, 21543547 - 21544027
Alignment:
84 ctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaa 183  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
21543547 ctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaa 21543645  T
184 aattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatc 281  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||       |||||||||||||||||||||||||     
21543646 aattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagact------ataagaatttctaagatatatcaaatg 21543739  T
282 agtgcagaaattcaaagtgc-ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctac----cgatcttcaagtcttca 376  Q
    |   ||||||||  |||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||     ||||||| |     ||||||||||||||||    
21543740 aacacagaaattttaagtgctttttgtaaaacaaatttggcagagtttgggagctttttacttgt-----tgtctctcctctttgatcttcaagtcttca 21543834  T
377 cttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctga 475  Q
     | | |||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||    
21543835 ttcctttatatagtgatgtg-aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctga 21543933  T
476 tttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
21543934 tttggatgttgtcctataaagaatcatgttcaaatccattcctaacttgaaggaacatttctacaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcg 21544027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 47608460 - 47607967
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
47608460 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 47608361  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
47608360 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 47608264  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
47608263 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 47608167  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
47608166 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 47608067  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
47608066 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 47607967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 47619068 - 47618575
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
47619068 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 47618969  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
47618968 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 47618872  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
47618871 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 47618775  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
47618774 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 47618675  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
47618674 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 47618575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12898510 - 12898020
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
12898510 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 12898411  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
12898410 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 12898314  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | | ||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
12898313 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgttta---atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 12898218  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
12898217 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 12898118  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12898117 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12898020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 3171300 - 3171793
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
3171300 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 3171399  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
3171400 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 3171496  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |   ||  || |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
3171497 agagttttggcgcttttgaacttgcgtatattcctat-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 3171594  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
3171595 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 3171694  T
520 tcttga-aggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
3171695 tcttgagttgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 3171793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 3181902 - 3182395
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
3181902 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 3182001  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
3182002 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 3182098  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |   ||  || |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
3182099 agagttttggcgcttttgaacttgcgtatattcctat-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 3182196  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
3182197 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 3182296  T
520 tcttga-aggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
3182297 tcttgagttgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 3182395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 7506980 - 7507472
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
7506980 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 7507079  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
7507080 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 7507176  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
7507177 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 7507271  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
7507272 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 7507371  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
7507372 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 7507471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 7517577 - 7518069
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
7517577 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 7517676  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
7517677 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 7517773  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
7517774 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 7517868  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
7517869 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 7517968  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
7517969 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 7518068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12624310 - 12623818
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
12624310 agagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 12624211  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
12624210 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 12624114  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
12624113 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatct-gcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 12624016  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
12624015 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 12623916  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12623915 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12623818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 35649220 - 35648727
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
35649220 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 35649121  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
35649120 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 35649024  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
35649023 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 35648927  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
35648926 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 35648827  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
35648826 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 35648727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 21877444 - 21877937
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaa-cagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| || || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
21877444 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtgg 21877543  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| |||     
21877544 tgttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttga 21877640  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
21877641 cagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 21877738  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
21877739 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 21877838  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
21877839 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 21877937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12614845 - 12614353
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
12614845 agagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 12614746  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
12614745 gttcacaatacaatacagaaaaa-actctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 12614649  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
12614648 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctgca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 12614551  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
12614550 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 12614451  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12614450 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12614353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 12730225 - 12730717
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
12730225 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 12730324  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
12730325 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 12730421  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | || ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
12730422 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctcact-ttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 12730519  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
12730520 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 12730619  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12730620 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12730717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 12740818 - 12741310
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
12740818 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 12740917  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
12740918 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 12741014  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | || ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
12741015 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctcact-ttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 12741112  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
12741113 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 12741212  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12741213 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12741310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 21863339 - 21863831
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
21863339 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 21863438  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
21863439 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 21863535  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
21863536 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 21863633  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |    
21863634 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaataagcttcaaattcattccca 21863733  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||   |||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
21863734 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaaacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 21863831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 33084240 - 33084732
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
33084240 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 33084339  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
33084340 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 33084436  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||    | | ||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
33084437 agagttttggcacttttgaacttatgtatctctatct-caaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 33084534  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
33084535 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 33084634  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||   ||||  |   || || |||||| |||||||||||||||||||||||    
33084635 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcatagacagaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 33084732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36236958 - 36236467
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
36236958 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 36236859  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
36236858 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 36236762  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
36236761 agagttttggcgctttttaacttctgtatttctctct-tttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 36236664  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||| |    
36236663 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaatttcaaattccttccca 36236564  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36236563 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36236467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36247505 - 36247014
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
36247505 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 36247406  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
36247405 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 36247309  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
36247308 agagttttggcgctttttaacttctgtatttctctct-tttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 36247211  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||| |    
36247210 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaatttcaaattccttccca 36247111  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36247110 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36247014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 5640239 - 5639747
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
5640239 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 5640140  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||| ||| ||| |    
5640139 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgttttgtagaatcaaa-ttgac 5640043  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtc-tctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || || | |  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
5640042 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctcttttttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 5639946  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||     
5639945 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatacgcttcaaattcattccc 5639846  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| | || |||||||||||||  | |||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
5639845 atcttgaacgtacaaattctgcaggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 5639747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 5650796 - 5650304
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
5650796 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 5650697  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
5650696 gttcacaatacaatacagt-aaagaccctagactt-tgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 5650600  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtc-tctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || || | |  | |||||||||||||||||   |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
5650599 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctcttttttcaatcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 5650503  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||     
5650502 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatacgcttcaaattcattccc 5650403  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| | || |||||||||||||  | |||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
5650402 atcttgaacgtacaaattctgcaggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 5650304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 35404921 - 35404428
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
35404921 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 35404822  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||| | | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || || ||| ||| |    
35404821 gttcacaatacagtac-agaaaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagtatcaaa-ttgac 35404725  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||     
35404724 agagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctgt-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagt 35404627  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
35404626 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 35404527  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
35404526 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 35404428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 2538214 - 2538705
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
2538214 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 2538313  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||| ||| ||| |    
2538314 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctatgtagaatcaaa-ttgac 2538410  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
2538411 agagttttggcgcttttaaacttatg--tatctctatattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 2538507  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||     
2538508 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaataagcttcaaattcattccc 2538607  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | ||||  |||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
2538608 atcttgagtgtacaaaactgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 2538705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 35638567 - 35638075
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattg--tttgacttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |   |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
35638567 agagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat---cagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtg 35638471  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |    
35638470 gtgttcacaatacaatacag-aaaagactctagactttt-aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-g 35638374  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
     | |||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
35638373 accgagttttggcgcttttgaacttatgt--atatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 35638277  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
35638276 agcaggtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 35638177  T
517 ctatcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    | |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
35638176 ccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 35638077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 164 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 24029177 - 24028768
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactctagacttaagaa 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
24029177 tcaaacagaattacacagaaaatggtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcagtttaaagactctagacttaagaa 24029078  T
262 tttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctcta 358  Q
    ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||||| |||| | ||||  |  |||||||     
24029077 tttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgcttttatgtgaaacaattttagcagagtttgggcgctttttcaattgttgt-ctgtctctt 24028979  T
359 ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccac 457  Q
      | |||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  |||    
24028978 gagttcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcac 24028880  T
458 cagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagct-gttatct 556  Q
    || | |||||||| | ||||||| ||| || |||| ||||||||  |||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  || |||    
24028879 caatgatcttttgccagatttggatgttgttctataaaggatcacgttcaaatctattcataacttgaaggaacatttctgcaggcagagctatttttct 24028780  T
557 tgtcttgtagcg 568  Q
    ||||||||||||    
24028779 tgtcttgtagcg 24028768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 204 - 615
Target Start/End: Original strand, 21894963 - 21895372
Alignment:
204 tgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctt 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
21894963 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaagaaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt 21895061  T
304 ttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagag 401  Q
    |  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||| |    || |||||     ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||    
21895062 tgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgcttttgaacttat----atatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-ag 21895155  T
402 agacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
21895156 agacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaata 21895255  T
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||    
21895256 agcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtgg 21895355  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
21895356 ttgtacacttgtacttt 21895372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22610637 - 22610494
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
22610637 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactttctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 22610538  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
22610537 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaggagacttcta 22610494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7745718 - 7745438
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||    ||||||||||| |    
7745718 ccttgcacttccaaggagagtttcactaa-aaataatcacacagattacaattgctcaatactacaacaagtatgagacttcctt--tgctcaagcacac 7745622  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatc 215  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
7745621 ag-caagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagtcttcctatcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatc 7745523  T
216 aatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttga 307  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
7745522 aggggtgttcacaatacaatgcaat-gaaga------acttaagaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattctaagtgcttttga 7745438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 5929122 - 5929262
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5929122 ccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagatta-aactgctcaatactacctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 5929220  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5929221 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 5929262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 34256069 - 34255831
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
34256069 tgctcaagcacacag-caagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttcttatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagattgaacac 34255971  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaag---actctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
34255970 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagttgaaggactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 34255871  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttt 337  Q
    |||||  || ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||    
34255870 gctttgatgtgaaataatttttgcagagttttggcgcttt 34255831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 674994 - 675133
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
674994 ccttgcacttccaaggagatttccac----aaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 675089  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
675090 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 675133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 259 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 35401559 - 35401201
Alignment:
259 gaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctct 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || || ||||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| |    
35401559 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagtatcaaatt-gacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctgt 35401461  T
358 accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatcca 456  Q
        ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
35401460 ttt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagtacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatcca 35401363  T
457 ccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttat 554  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| |    
35401362 ccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgt 35401263  T
555 cttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
35401262 tttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 35401201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41133277 - 41133138
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
41133277 ccttgtacttccaaggagatttccactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 41133182  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
41133181 gcgagggacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttcta 41133138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 23926474 - 23926617
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
23926474 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctcaattgctcaaggacgc 23926573  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
23926574 aggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 23926617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14388788 - 14388647
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
14388788 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 14388693  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
14388692 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 14388647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 28379405 - 28379548
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
28379405 ccttgcacttccaaggagattttcactaagtaataatcacacagattacaactgttcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacac 28379504  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
28379505 aaacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 28379548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 256
Target Start/End: Original strand, 12944867 - 12945020
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||    
12944867 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaaca 12944966  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagactt 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
12944967 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaat-aaagactctagactt 12945020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18311633 - 18311492
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
18311633 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcacacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 18311538  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
18311537 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 18311492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19170995 - 19170853
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | || |||||||||||||    
19170995 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagactt-caaattgctcaagcacgc 19170897  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
19170896 aggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 19170853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 10756968 - 10757081
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
10756968 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 10757067  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
10757068 tgttcacaatacaa 10757081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 22018743 - 22018885
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22018743 ccttgcacttccaaggatattttcactaagtt-taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 22018841  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
22018842 aggcaagacacttcctttgctcaagcactaaagaaagagacttc 22018885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26548926 - 26548784
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
26548926 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcactcttattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 26548828  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
26548827 agtcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 26548784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17025499 - 17025386
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
17025499 agagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaacagaattacaaggaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatgg 17025400  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
17025399 tgttcacaatacaa 17025386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20196351 - 20196211
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
20196351 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 20196257  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20196256 aggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 20196211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18130542 - 18130434
Alignment:
128 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga--cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttc 225  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||    
18130542 ttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaaatgtttgaggtttgaacacttgatatacaattagtggtgttc 18130443  T
226 acaatacaa 234  Q
    |||||||||    
18130442 acaatacaa 18130434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26702665 - 26702552
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
26702665 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatgg 26702566  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||    
26702565 tgttcacagtacaa 26702552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26280606 - 26280474
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||    
26280606 atgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaacaaaattacacagaaaaatgtttgaggttgaaca 26280507  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
26280506 cttgatatacaatcagaggtgttcacgatacaa 26280474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Original strand, 22642318 - 22642418
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
22642318 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactcaagcaagagactt 22642417  T
160 c 160  Q
    |    
22642418 c 22642418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 12944757 - 12944897
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
12944757 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatactcaagcacgc 12944851  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
12944852 aggcaagagacttacaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 12944897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14263969 - 14263854
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |    
14263969 agagacttctattgctcaagcacaaaagcaagagacttctcaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagactgaacacttgatatacaatcagt 14263870  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
14263869 ggtgttcacaatacaa 14263854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Original strand, 10757313 - 10757459
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtct 561  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
10757313 atcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacaatgctgcaggcagagctgttattcttgtct 10757412  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   ||||||  | | || ||| |||||||||||||||||||    
10757413 tgtagcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactt 10757459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12625090 - 12624977
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||    
12625090 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaagtagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttaatatacaatcagtgg 12624991  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
12624990 tgttcacaatacaa 12624977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 7309360 - 7309475
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |    
7309360 agagacttctaatgttcaagcacaaatgcaagagacttctaaattcaaacagaattacacagaaaattgtctgaggttgaacacttgatatacaatcagt 7309459  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||| |||||    
7309460 ggtgttcacattacaa 7309475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11195728 - 11195587
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |    || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |    
11195728 ccttgcacttccaaggagattttcatt----aaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacac 11195633  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
11195632 aggcaagagtcttccaatgatcaagcactaaagcaagagtcttcta 11195587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 234
Target Start/End: Original strand, 17018149 - 17018237
Alignment:
147 aagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
17018149 aagcaagagacttctattcaaatagaattacaaagaaaattgtttgatgttgaacatttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 17018237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 23024334 - 23024449
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
23024334 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 23024433  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
23024434 ggtgttcacaatacaa 23024449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25449095 - 25448980
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
25449095 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagatttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 25448996  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
25448995 ggtgttcacaatacaa 25448980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 30892635 - 30892750
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
30892635 agagacttctaatgctcaagcacaattgcaagagacttctaaattcaaatagaattacacagaagattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 30892734  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
30892735 ggtgttcacaatacaa 30892750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Original strand, 17370455 - 17370595
Alignment:
21 ttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||||    
17370455 ttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgca 17370552  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
17370553 ggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 17370595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18517682 - 18517583
Alignment:
136 ctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgttt-gacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
18517682 ctcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaacaaaattacatagaaaaatgtttagggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 18517583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 27858262 - 27858397
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttga 198  Q
    ||||| ||||||||| ||  | ||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||    
27858262 caaatactcaagcacacaaacaagagattttctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaaattacacaaaaaaatgtttgaggttga 27858361  T
199 acacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
27858362 acacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaa 27858397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2819838 - 2819733
Alignment:
128 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcac 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
2819838 ttccaatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaaca-aattacaaagaaatatgtttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 2819740  T
228 aatacaa 234  Q
    | |||||    
2819739 agtacaa 2819733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 48703745 - 48703859
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
48703745 agagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatg 48703844  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| ||||||    
48703845 gtgttcacgatacaa 48703859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Original strand, 7677522 - 7677635
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
7677522 agagtcttccaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 7677621  T
222 gttcacaatacaat 235  Q
    ||||||||||||||    
7677622 gttcacaatacaat 7677635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21121603 - 21121488
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
21121603 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacggaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 21121504  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
21121503 ggtgttcacaatacaa 21121488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21135687 - 21135584
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
21135687 tgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacgatcaatggtgttcacaat 21135588  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
21135587 acaa 21135584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 42284182 - 42284297
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
42284182 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaat 42284281  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
42284282 ggtgttcacaatacaa 42284297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 4177490 - 4177603
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
4177490 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 4177588  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
4177589 agcaagagacttcta 4177603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5640342 - 5640229
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
5640342 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 5640244  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
5640243 agcaagagacttcta 5640229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5650899 - 5650786
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaa--atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||  |||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
5650899 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 5650801  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
5650800 agcaagagacttcta 5650786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10998416 - 10998303
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
10998416 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 10998318  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
10998317 agcaagagacttcta 10998303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12614948 - 12614835
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
12614948 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 12614850  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
12614849 agcaagagacttcta 12614835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12624413 - 12624300
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
12624413 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 12624315  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
12624314 agcaagagacttcta 12624300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 12730122 - 12730235
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
12730122 ataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 12730220  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
12730221 agcaagagacttcta 12730235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 12740715 - 12740828
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
12740715 ataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 12740813  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
12740814 agcaagagacttcta 12740828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12898613 - 12898500
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
12898613 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 12898515  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
12898514 agcaagagacttcta 12898500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 19178534 - 19178647
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
19178534 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 19178632  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
19178633 agcaagagacttcta 19178647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 19187413 - 19187526
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
19187413 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 19187511  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
19187512 agcaagagacttcta 19187526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 21863236 - 21863349
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
21863236 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 21863334  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
21863335 agcaagagacttcta 21863349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 21877341 - 21877454
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
21877341 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 21877439  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
21877440 agcaagagacttcta 21877454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35638670 - 35638557
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
35638670 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 35638572  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
35638571 agcaagagacttcta 35638557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 2268072 - 2268186
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||| | ||    
2268072 agagacttctaatgctcaagcacaacttcaagagacttctaattcaaacagaattacacataaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtg 2268171  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
2268172 gtgttcacaatacaa 2268186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Original strand, 2834230 - 2834343
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
2834230 agacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacacaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 2834329  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
2834330 tgttcacaatacaa 2834343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14293193 - 14293107
Alignment:
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
14293193 gcaaaagacttctattcaaacagaattacaaagaatattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14293107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 26703099 - 26703233
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||| | || || ||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||| | |||  ||||||  |||||    
26703099 caaatactcaagcgcacatgcaagagattttctatgctcaagcacaaaagcaagagacttataaacaaacaaaattacatataaagatgtttggtttgaa 26703198  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
26703199 cacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 26703233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 31358851 - 31358983
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||   |||||  |||||    
31358851 caaattctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcgcaaaagcaagagacttctaaacaaaca-aattacaaagaaataagtttgg-ttgaa 31358948  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
31358949 cacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 31358983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 36133744 - 36133858
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||    
36133744 agagacttctaatgctcaagcacaactacaagagacttctaattcaaacagaattacatagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacattcagtg 36133843  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
36133844 gtgttcacaatacaa 36133858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 33084136 - 33084250
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
33084136 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 33084234  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
33084235 aagcaagagacttcta 33084250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 10250528 - 10250642
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
10250528 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 10250626  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
10250627 ggtgttcacaatacaa 10250642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16233684 - 16233552
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||  |||||||    
16233684 atgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagaaacttctaaacaaacacaattacatagaaatatgtttgaggttgaaca 16233585  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
16233584 cttgacatactatcagtggtgttcacaatacaa 16233552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16235846 - 16235732
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |    
16235846 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaattagt 16235748  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
16235747 ggtgttcacaatacaa 16235732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22202272 - 22202157
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||  |||   | ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
22202272 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacaactatatttaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 22202173  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
22202172 ggtgttcacaatacaa 22202157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 35039707 - 35039822
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
35039707 agagacttataatgttcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 35039806  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
35039807 ggtgttcacaatacaa 35039822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44824299 - 44824185
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
44824299 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 44824201  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
44824200 ggtgttcacaatacaa 44824185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 46088530 - 46088645
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
46088530 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 46088629  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
46088630 ggtgttcataatacaa 46088645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 7506875 - 7506990
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
7506875 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 7506974  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
7506975 -aagcaagagacttcta 7506990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 7517472 - 7517587
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
7517472 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 7517571  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
7517572 -aagcaagagacttcta 7517587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Original strand, 8698380 - 8698510
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| |||||||||  | || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    ||||   |||||    
8698380 caaatactcaagcacaaaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaaca-aattacaaagaattaagtttcgtttgaa 8698478  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
8698479 cacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 8698510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 160
Target Start/End: Original strand, 19037501 - 19037560
Alignment:
101 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
19037501 aaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19037560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 23053918 - 23054026
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||    
23053918 agacttcctatgctcaagcacaattgcaagagacttctattcaaacagaattaaaaagaaa--tgtttgaggttgaacgcttgatatacaatcagtggtg 23054015  T
223 ttcacaataca 233  Q
    |||||||||||    
23054016 ttcacaataca 23054026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 35012503 - 35012616
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
35012503 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 35012601  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
35012602 agcaagagacttcta 35012616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35405026 - 35404911
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
35405026 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35404927  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
35404926 -aagcaagagacttcta 35404911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35649325 - 35649210
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
35649325 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35649226  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
35649225 -aagcaagagacttcta 35649210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36237063 - 36236948
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
36237063 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36236964  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
36236963 -aagcaagagacttcta 36236948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36247610 - 36247495
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
36247610 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36247511  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
36247510 -aagcaagagacttcta 36247495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 38094649 - 38094764
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
38094649 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 38094748  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
38094749 -aagcaagagacttcta 38094764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 38105274 - 38105389
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
38105274 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 38105373  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
38105374 -aagcaagagacttcta 38105389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21684579 - 21684477
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||   ||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
21684579 aatgctcaagcacaaaagaaagagatttctaaataaacaaaattacacagaaagatgtttgctttgaacacttgatatacaatcactgatgttcacaata 21684480  T
232 caa 234  Q
    |||    
21684479 caa 21684477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Original strand, 39586546 - 39586644
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
39586546 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 39586644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7690094 - 7689978
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttccca-----aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcac 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||     ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
7690094 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 7689995  T
145 taaagcaagagacttcta 162  Q
    | ||||||||||||||||    
7689994 t-aagcaagagacttcta 7689978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18382535 - 18382423
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||    
18382535 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 18382437  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
18382436 gcaagagtcttcta 18382423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 18614461 - 18614573
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttg-acttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||     
18614461 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaggagacttctattcaagcagaattacaaagaaaa-tgtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtga 18614559  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| |||||||    
18614560 tgttcataatacaa 18614573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 20908954 - 20909066
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||     
20908954 agagacttcctctgctcaagcacaactgcaagagacttatattcaaacagaattacaaagaaaa-cgtttgaggttgaacactttatatacaatcaatga 20909052  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
20909053 tgttcacaatacaa 20909066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Original strand, 21984137 - 21984249
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |    
21984137 agagacttctattgctcaagcacaattgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaattagt 21984236  T
219 ggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||    
21984237 ggtgttcacaata 21984249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 22153400 - 22153513
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | |    
22153400 agagacttctaatgcttaagcacaactgcaagagacttttattcaaacagaattacaacgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagttg 22153499  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    | ||||||||||||    
22153500 tattcacaatacaa 22153513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23037034 - 23036930
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaa 229  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
23037034 atgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttaaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 23036935  T
230 tacaa 234  Q
    |||||    
23036934 tacaa 23036930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33256861 - 33256773
Alignment:
149 gcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
33256861 gcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 33256773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33277033 - 33276945
Alignment:
149 gcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
33277033 gcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 33276945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 12283966 - 12284081
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
12283966 agagacttctaatgctcaagcacaactgcatgagacttccaaattcaaacagatttacaaagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 12284065  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||| ||||||||||||    
12284066 ggtattcacaatacaa 12284081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21205411 - 21205296
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| |    
21205411 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacccttgatatacaatcagt 21205312  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
21205311 ggtgttcacaatacaa 21205296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21215215 - 21215100
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| || |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
21215215 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacaaaaatacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 21215116  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
21215115 ggtgttcacaatacaa 21215100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 21702355 - 21702470
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | |||||||| || |  |||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |    
21702355 agagacttctattgctcaagaacaactgcaagaaacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatgtacaatcagt 21702454  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
21702455 ggtgttcacaatacaa 21702470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22427875 - 22427761
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
22427875 agagacttctattgctcaatcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 22427777  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
22427776 ggtgttcacaatacaa 22427761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 29215337 - 29215451
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
29215337 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 29215435  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    | | ||||||||||||    
29215436 gatattcacaatacaa 29215451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 2538110 - 2538224
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
2538110 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 2538208  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
2538209 -aagcaagagacttcta 2538224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 3171196 - 3171310
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
3171196 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 3171294  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
3171295 -aagcaagagacttcta 3171310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 3181798 - 3181912
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
3181798 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 3181896  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
3181897 -aagcaagagacttcta 3181912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 51629821 - 51629706
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
51629821 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 51629722  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
51629721 -aagcaagagacttcta 51629706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 51657082 - 51656967
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
51657082 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 51656983  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
51656982 -aagcaagagacttcta 51656967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18897118 - 18897017
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| |||| || ||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
18897118 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaa-caaaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 18897020  T
232 caa 234  Q
    |||    
18897019 caa 18897017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20110482 - 20110377
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    |||||||| |||||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||    
20110482 agacttcctatgctcaagcaactctgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaa-tgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtggtg 20110384  T
223 ttcacaa 229  Q
    |||||||    
20110383 ttcacaa 20110377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 230
Target Start/End: Original strand, 21028365 - 21028447
Alignment:
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
21028365 gcaagatacttctattcaaacagaattacaaagaatatagtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 21028447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21192374 - 21192288
Alignment:
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
21192374 gcaagagacttctattcaaacagaattacaaaataaattgtttgaggttgaacacatgatacacaatcattggtgttcacaatacaa 21192288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32786475 - 32786363
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||  | || |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
32786475 agacttctaatgctcgagcacaactgcaagagacttcttaattctaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatgg 32786377  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||| ||||||||    
32786376 tgttcgcaatacaa 32786363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34256142 - 34256043
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
34256142 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac-acagcaagagactt 34256045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 37640550 - 37640666
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct---agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||    | |||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||     
37640550 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcctaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcag 37640649  T
218 tggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||    
37640650 tggtgttcacaatacaa 37640666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 148846 - 148732
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
148846 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 148748  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
148747 aagcaagagtcttcta 148732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 30571765 - 30571853
Alignment:
149 gcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
30571765 gcaagagacttctcaattcaaacagaattacaaagaagattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaa 30571853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 1577407 - 1577522
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||| |   |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
1577407 agagacttctaatgctcacgcacaactgcaagagacttccaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 1577506  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
1577507 ggtgttcaaaatacaa 1577522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20441948 - 20441849
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
20441948 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 20441849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 444 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 22465016 - 22464892
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||  | |||||||    
22465016 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggc 22464917  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
22464916 agagctgtttttcttgtcttgtagc 22464892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48570756 - 48570654
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
48570756 tgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacataattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 48570658  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
48570657 acaa 48570654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 5832792 - 5832906
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
5832792 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 5832890  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
5832891 -aagcaagagacttcta 5832906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 5843394 - 5843508
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
5843394 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 5843492  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
5843493 -aagcaagagacttcta 5843508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 5973333 - 5973446
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||| |||||||||||||| |    
5973333 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcact-a 5973431  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
5973432 agcaagagtcttcta 5973446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 229
Target Start/End: Original strand, 9346298 - 9346425
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    |||||||||||  || || |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||| ||| | |||| |||||||  ||||||     
9346298 atgctcaagcatacacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaacacaatcacataaaaaaatgtttgaggttgaacg 9346397  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaa 229  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||    
9346398 cttgatatacaataagtggtgttcacaa 9346425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 233
Target Start/End: Original strand, 19215155 - 19215268
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| || |||||| || |||||||||||||||||||| |    
19215155 agagacttctattgctcaagcacaattgcaagagacttctcaattcaaacagaattacaaagaatat-gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 19215253  T
219 ggtgttcacaataca 233  Q
    | |||||||||||||    
19215254 gatgttcacaataca 19215268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 19717108 - 19717179
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
19717108 tcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatgcaatcagtggtgttcacaatacaa 19717179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 144
Target Start/End: Original strand, 47194778 - 47194873
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcac 144  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||    
47194778 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcac 47194873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 32786125 - 32785979
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||  | |||| ||||||||| || ||||||||    
32786125 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaagcagagctgtttttcttgtct 32786026  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | |||||  |||| |  ||  || |||||||||||||||||||||||    
32786025 tttagcggagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacactt 32785979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 154921 - 154807
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||     
154921 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 154823  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
154822 aagcaagagtcttcta 154807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 1900218 - 1900383
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||  |||||||| | |  |||||||    
1900218 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccatccccattgtgaaggaatattgttgcaggc 1900317  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
1900318 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1900383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 7745273 - 7745132
Alignment:
468 ttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtag 566  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |  ||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||    
7745273 ttgtctgatttggttgttttcctatgaaggatcaagttcaaatccattcttgttctgagggaacatttctgcaggcaaagctgtttttcttgtcatgtag 7745174  T
567 cgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||| | ||    ||| || |||||| ||||||||||||||||    
7745173 cgaaggcaatagcagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7745132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 2266640 - 2266753
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
2266640 agagacttctgatgttcaagcacaactgcgagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgagcttgaacacttgatatacaatcagt 2266738  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
     |||||||||||||||    
2266739 -gtgttcacaatacaa 2266753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2327975 - 2327859
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag----tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 216  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||| |||||||||     ||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
2327975 agagacttctgatgctcaagcacaactgcaaaagacttctaaaaattcaaacagaattacaaagaatat-gtttgaggttgaacacttgatatacaatca 2327877  T
217 atggtgttcacaatacaa 234  Q
     |||||||||||||||||    
2327876 gtggtgttcacaatacaa 2327859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 22642392 - 22642448
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22642392 tgctcaagcactcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22642448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 162
Target Start/End: Original strand, 4166870 - 4166947
Alignment:
86 agtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
4166870 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 4166947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22600726 - 22600625
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
22600726 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattac-tagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 22600628  T
219 ggt 221  Q
    |||    
22600627 ggt 22600625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 47608564 - 47608450
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |    
47608564 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaat 47608466  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
47608465 -aagcaagagacttcta 47608450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 47619172 - 47619058
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |    
47619172 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaat 47619074  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
47619073 -aagcaagagacttcta 47619058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 19037417 - 19037459
Alignment:
17 caccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca 59  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
19037417 caccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca 19037459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19965829 - 19965768
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
19965829 caaatgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaggagacttcta 19965768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #214
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22600370 - 22600224
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | |||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    ||||||||||| |||| | |||||||    
22600370 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagagttgtttttcttgtct 22600271  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
22600270 tgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 22600224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #215
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 23059006 - 23059048
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacaca 61  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
23059006 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacaca 23059048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #216
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 467 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 25448750 - 25448608
Alignment:
467 tttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgta 565  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||||||||||    
25448750 tttgcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgta 25448651  T
566 gcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
25448650 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25448608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #217
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 17956813 - 17956927
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaa-gcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||| || || |||| |||||||||||||| ||||     
17956813 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacact- 17956911  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
17956912 aagcaagagtcttcta 17956927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #218
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 23036736 - 23036612
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||  ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||    
23036736 ctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcattgcaggc 23036637  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
23036636 agagctgtttttcttgtcttgtagc 23036612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #219
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 38282106 - 38282220
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||||||||| || |  | |||||| ||||  | ||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||| |    
38282106 agagacttctaatgctcaagtacaattgtaagagatttcttaattcaaacagaattact-agaaaaatgtctgaggttgaacacttgatatacaatcagt 38282204  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
38282205 ggtgttcacaatacaa 38282220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #220
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39194725 - 39194612
Alignment:
53 aatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
39194725 aatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 39194627  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
39194626 agcaagagtcttcta 39194612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #221
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4251200 - 4251083
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa------tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagca 143  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||  |||      ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||    
4251200 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 4251101  T
144 ctaaagcaagagacttcta 162  Q
    || ||||||||| ||||||    
4251100 ct-aagcaagagtcttcta 4251083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #222
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 615
Target Start/End: Original strand, 23064935 - 23064994
Alignment:
556 ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
23064935 ttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23064994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #223
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 1577740 - 1577905
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcagg 542  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || | || ||||||| |  ||||||    
1577740 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaagaatcaatttcaaatccattcc-atgtatgtaggaacattgttgcagg 1577838  T
543 cagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
1577839 cagagctggtatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 1577905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #224
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Original strand, 1899887 - 1899995
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| || |||  |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |    
1899887 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacataactact-agaaaaatgtttgaggttgaacatttgatatacaatcagt 1899985  T
219 ggtgttcaca 228  Q
    ||||||||||    
1899986 ggtgttcaca 1899995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #225
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Original strand, 22153749 - 22153895
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||| || |||| | |||| |||| | |||||||    
22153749 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattcctattgtgatggaacatttttgcatgtagagttgtttttcttgtct 22153848  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
22153849 tgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22153895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #226
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 33256515 - 33256393
Alignment:
487 tcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtc 585  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || | | |   || ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||  | | ||     
33256515 tcctatgaaggatcaatttcaaatccaattccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagta 33256416  T
586 gtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||||||||    
33256415 gtggagatagtggttgtacactt 33256393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #227
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 33276687 - 33276565
Alignment:
487 tcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtc 585  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || | | |   || ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||  | | ||     
33276687 tcctatgaaggatcaatttcaaatccaattccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagta 33276588  T
586 gtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||||||||    
33276587 gtggagatagtggttgtacactt 33276565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #228
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 160
Target Start/End: Original strand, 7677419 - 7677530
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||| || || ||||  |||||||||||||||||| |    
7677419 ataatcacaaagattacgaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagttttccaatgctcaagcact-a 7677517  T
148 agcaagagacttc 160  Q
    |||||||| ||||    
7677518 agcaagagtcttc 7677530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #229
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12624763 - 12624690
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
12624763 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc 12624690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #230
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22201943 - 22201778
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||  |||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||| ||    
22201943 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaagc 22201844  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||| || ||| |||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
22201843 agagttgctatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 22201778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #231
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Original strand, 22639779 - 22639832
Alignment:
106 ctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    ||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
22639779 ctcaagcacacaagcaagagacttcaaatgctcaagcacaaaagcaagagactt 22639832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #232
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 234
Target Start/End: Original strand, 22639898 - 22639934
Alignment:
198 aacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22639898 aacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22639934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #233
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Original strand, 35895705 - 35895745
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
35895705 agagacttccaatgctcaagcacacaagcaagagacttcta 35895745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #234
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 603
Target Start/End: Original strand, 38282440 - 38282600
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | | |||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||| |  |||| ||    
38282440 ctttgatcaatcaccaatgaccttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgttgcaagc 38282539  T
544 agagct-gttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgta 603  Q
    ||||||  || |||| |||||||||   |||| |  ||| || ||||||||||||||||||    
38282540 agagctatttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta 38282600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #235
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 516
Target Start/End: Original strand, 48704077 - 48704149
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
48704077 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattc 48704149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #236
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 615
Target Start/End: Original strand, 12946818 - 12946885
Alignment:
548 ctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12946818 ctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12946885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #237
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Original strand, 18515612 - 18515651
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
18515612 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaacacaa 18515651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #238
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 21702729 - 21702852
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   |||| |   ||||| |||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| ||    
21702729 gtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagt 21702828  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||||||||||||||||||||    
21702829 agtggagatagtggttgtacactt 21702852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #239
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22465347 - 22465241
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct-agt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||| |||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
22465347 agagacttctattgctcaagcacaactgcaaaagacttctgagttcacacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 22465249  T
219 ggtgttca 226  Q
    | ||||||    
22465248 gatgttca 22465241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #240
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Original strand, 25398988 - 25399027
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
25398988 ttgaacacttgatatacaattaatggtgtttacaatacaa 25399027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #241
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28492863 - 28492824
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
28492863 ttgaacacttgatatacaatcagcggtgttcacaatacaa 28492824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #242
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 160
Target Start/End: Original strand, 22654992 - 22655030
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
22654992 agagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 22655030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #243
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 567
Target Start/End: Original strand, 35401683 - 35401805
Alignment:
446 ttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcag 545  Q
    |||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||  ||||||||||    || ||||||    
35401683 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatatattcccattgtgaaggaacatcgttgtaggcag 35401782  T
546 agctg-ttatcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
35401783 agctgtttttcttgtcttgtagc 35401805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #244
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Original strand, 42284520 - 42284666
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||   |||| |   ||||  |||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
42284520 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtct 42284619  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   |||| |||||   | |||||| ||||||||||||||||    
42284620 tgtagcagagacaaactcataatagtggaggtagtggttgtacactt 42284666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #245
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 567
Target Start/End: Original strand, 7309712 - 7309817
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtct 561  Q
    |||||| | ||||| ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| |  |||| ||||| ||| || ||||||||    
7309712 atctttcgcctgatatggttgttgtcctatgaatgatcaatttcaaattcattccaattgggaaggaacattgttgcacgcagaactgtttttcttgtct 7309811  T
562 tgtagc 567  Q
    ||||||    
7309812 tgtagc 7309817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #246
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 555
Target Start/End: Original strand, 17400891 - 17400960
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc 555  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
17400891 gtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgttatc 17400960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #247
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22427564 - 22427399
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||  |||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||    |||||||    
22427564 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatcgttgcaggc 22427465  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||  || |||||| ||||||||||||||||    
22427464 aaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 22427399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #248
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 34255630 - 34255561
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtaca 605  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||| || |||||  |||||||||||||    
34255630 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtaca 34255561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #249
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 608
Target Start/End: Original strand, 35040059 - 35040204
Alignment:
464 tcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagc-tgttatcttgtctt 562  Q
    ||||||||||||| | | | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||     |||||||||||| | || |||||||||    
35040059 tcttttgtctgatatagttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacgtcgttgcaggcagagctttttttcttgtctt 35040158  T
563 gtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
35040159 gtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35040204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #250
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 2327646 - 2327482
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||| ||| | | |||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||| |||    
2327646 tttgatcaatcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcctaagaaggattaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaagca 2327547  T
545 gagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
2327546 gagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaccagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2327482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #251
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 2538224 - 2538252
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
2538224 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 2538252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #252
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 7506990 - 7507018
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
7506990 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 7507018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #253
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 7517587 - 7517615
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
7517587 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 7517615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #254
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 98
Target Start/End: Original strand, 16710408 - 16710456
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
16710408 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttc 16710456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #255
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Original strand, 19215578 - 19215650
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| |  ||| || ||| |||||||||||||||||||    
19215578 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 19215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #256
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 21028667 - 21028831
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | |||||||||||||| || ||||||| |||||  |   |||||||||| |  |||||||    
21028667 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggattaatttcaaatccattcaaagtatgaaggaacattgttgcaggc 21028766  T
544 agagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | || |||  ||||||| ||||||   ||||||  | | || ||||||||||||| |||||||||    
21028767 atagttgtattcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacactt 21028831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #257
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Original strand, 36134064 - 36134228
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||  ||||| ||| | | |||||||||| |||||| || |||| ||||||  |  ||||||||||    ||||||||    
36134064 tttgatcaatcaccaattatctttttcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaattttaaatccattccacttatgaaggaacatcgttgcaggca 36134163  T
545 gagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
36134164 gagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36134228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #258
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 36236948 - 36236920
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
36236948 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 36236920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #259
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 36247495 - 36247467
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
36247495 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 36247467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #260
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 41133138 - 41133110
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
41133138 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 41133110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #261
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Original strand, 46088955 - 46089027
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
46088955 tgcaggcagagctgttatccttgtctagtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 46089027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #262
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 162
Target Start/End: Original strand, 47194891 - 47194950
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
47194891 aatgatcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 47194950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 509; Significance: 0; HSPs: 240)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 509; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 23508781 - 23509377
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
23508781 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 23508880  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
23508881 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 23508980  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
23508981 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaattt 23509080  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| || |    
23509081 ggcagagtttttgcgcttttaacttgtgttgatgtctcttccgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattttta 23509180  T
419 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
23509181 gcacgtccaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcct 23509280  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
23509281 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23509377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 16819970 - 16819373
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16819970 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactaactagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 16819871  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
16819870 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcag 16819771  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
16819770 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaggaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatt 16819671  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt- 416  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||     
16819670 tggcaaagttttggcgcttttaacttgtgatgatgtctctgcagatcttcaagtcttcact-ccttttatagaggtgtgtagagagacgttgagaccttt 16819572  T
417 aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16819571 aaacacgtccaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 16819472  T
517 ctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
16819471 ctatcttgtgggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcaaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 16819373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 18775191 - 18774680
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
18775191 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaac 18775092  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18775091 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaattaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 18774992  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
18774991 cttttgagaaacaaatttggcagagtttggacgcttttaacttgttgtaatgtctcttactaatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtag 18774892  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
18774891 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 18774792  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
18774791 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattatgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacacttagggtcgtggagatagtggt 18774692  T
600 tgtacacttgta 611  Q
    |||||| |||||    
18774691 tgtacaattgta 18774680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 8997830 - 8997277
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagc 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
8997830 ataatcacacagattacaattgctcaatactatctagtacgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag--------- 8997740  T
151 aagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct 250  Q
       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
8997739 ---agacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgtcttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct 8997643  T
251 agacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataa 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |    
8997642 agacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttgtgagaatcaaatttggcagagttttgacgcttttaacttgtgttga 8997543  T
351 t-gtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttga 449  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
8997542 ttgtctctaccaatcttcaagtcttcacttctttatatagatgtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtccaaagagtcgttgagttcctttga 8997443  T
450 tcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagct 549  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
8997442 tcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcctgtcttgaaggaacacttctgcaggcagaact 8997343  T
550 gttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
8997342 gttatcttgtcttgtagcgaggacatactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 8997277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 14779064 - 14778463
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
14779064 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 14778965  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatc 215  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
14778964 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatactatc 14778865  T
216 aatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttga-gaatta 313  Q
    | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||  | |||  |    
14778864 agtggtgttcacaaaacaatgcaattgaaagactctagtcttaagaatttctaagatttatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgcatgaaaca 14778765  T
314 aatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgaga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||    
14778764 aatttggcagagtttgggcgctttttaacttgtcgtattgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-agagagacgttgaga 14778666  T
413 tctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaatt 511  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||     
14778665 tctttaagcacgtc-aaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatc 14778567  T
512 cattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgta 611  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
14778566 cattcctttcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgta 14778467  T
612 cttt 615  Q
    ||||    
14778466 cttt 14778463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 55651071 - 55651584
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
55651071 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgaaggcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgacattgaac 55651169  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55651170 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 55651268  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||   | ||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||    
55651269 ctttaaagaaacaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtcacttgtcaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtag 55651368  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
55651369 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgactgatttgggtgtagtcctatgaaggat 55651468  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
55651469 caaattcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 55651568  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
55651569 tgtacacttgtacttt 55651584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 14711400 - 14710799
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
14711400 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 14711301  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatc 215  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
14711300 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatactatc 14711201  T
216 aatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt-tgagaatta 313  Q
    | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||| |  |||  |    
14711200 agtggtgttcacaaaacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatttatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgtatgaaaca 14711101  T
314 aatttggcagagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgaga 412  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||    
14711100 aatttggcagagtttaggcgctttttaacttgtcgtattgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtg-agagagacgttgaga 14711002  T
413 tc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaatt 511  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||     
14711001 tctttaagcacgtc-aaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatc 14710903  T
512 cattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgta 611  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
14710902 cattcctttcttgaaggaacatttctataggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgta 14710803  T
612 cttt 615  Q
    ||||    
14710802 cttt 14710799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18007577 - 18007080
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
18007577 agagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtgg 18007478  T
221 tgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttt-gagaattaaattt 318  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| | |||  ||||||    
18007477 tgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgttttttgtgaaacaaattt 18007378  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt-a 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
18007377 ggcagagtttgggcgcttttaatttgttgtcttgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttta 18007278  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
18007277 agcacgtctaaagagtcgttgagaacctttgatcatccaccagtaatcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcc 18007178  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
18007177 tatcttgaaggaacatttttgcaggcagagctgttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18007080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 49002492 - 49001978
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
49002492 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgactttgaac 49002394  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagactt-aagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49002393 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagactttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 49002295  T
300 gcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||| ||| | |||||||| | || |||    
49002294 gctttatagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtctttactcctttatatagagatgagta 49002195  T
399 gagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
49002194 gagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaagga 49002095  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
49002094 ttaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 49001995  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
49001994 ttgtacacttgtacttt 49001978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 11535593 - 11536105
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||    
11535593 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgactttgaac 11535691  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
11535692 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 11535790  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |     
11535791 ctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa- 11535889  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
11535890 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 11535989  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
11535990 caacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 11536089  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
11536090 tgtacacttgtacttt 11536105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 67 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17994364 - 17993814
Alignment:
67 caactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtca 166  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
17994364 caactgctcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatca 17994265  T
167 aacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaattt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
17994264 aacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaattt 17994165  T
265 ctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc-ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgat 363  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||    
17994164 ctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgaattgtctctaataat 17994065  T
364 cttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagta 462  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | |||||||   |||| |     
17994064 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgttgagagacgttgagttctttaagcacgtc-aaagagtcattgagaaaccttgatca-ataccaatg 17993967  T
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtctt 562  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
17993966 atcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaagggacatttctgcaggcagagctattatcttgtctt 17993867  T
563 gtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  ||||||  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
17993866 gtagcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtacttt 17993814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 103 - 564
Target Start/End: Original strand, 19241771 - 19242235
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
19241771 atgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaaca 19241870  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
19241871 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtg 19241970  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
19241971 cttttgagaaacaattttggcagagtttggacgcttttaacttgttgtaatgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtaga 19242070  T
401 gagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | |||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||    
19242071 gagacgttgagacctttaagcacgtctaaagagtcgttgagaacctttgatcatttaccaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctatgaatgat 19242170  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgt 564  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
19242171 caagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgt 19242235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 10300283 - 10300794
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||    
10300283 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaaca 10300382  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
10300383 cttgatatacaatcagtggtgttcaaaattcaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgc 10300481  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagag 401  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||    
10300482 tttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctctcccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-ag 10300580  T
402 agacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatca 501  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
10300581 agacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatca 10300680  T
502 acttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttg 601  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || | |  ||| || |||||| |||||||||    
10300681 acttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagataaaaacagagtagtggaggtagtggttg 10300780  T
602 tacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||    
10300781 tacacttgtacttt 10300794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 19 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 36210731 - 36210136
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
36210731 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacacagattacaactgctcaagactacacctagtatgagaattcacaaatgctcaagcacgc 36210633  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatc 215  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
36210632 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttaatatacaatc 36210533  T
216 aatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt-tgagaat 311  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || |||     
36210532 agtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttcaaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgtgtgaa- 36210434  T
312 taaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgag 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
36210433 aaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtcttgtctctactgatctttaagttttcactcctttatatagaggtgtg-agagagacgttgag 36210335  T
412 atc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaat 510  Q
    ||| ||||||| ||| | ||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||    
36210334 atctttaagcatgtcaatagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaat 36210235  T
511 tcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
36210234 ccattcctatcttgaaggaacatttatgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 36210136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 11514783 - 11515295
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||    
11514783 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacatagaaaat-gtttgactttgaac 11514881  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
11514882 acttgatatacaatcggtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 11514980  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||| | ||||||||||| | |||||||| |||||| |     
11514981 ctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcattaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa- 11515079  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
11515080 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 11515179  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
11515180 caacttcaaattcattctcatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 11515279  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| ||||||    
11515280 tgtacacttttacttt 11515295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 31267303 - 31266797
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||    
31267303 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgactttgaac 31267205  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
31267204 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtccagaaattcaaagtg 31267106  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc-taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||||||||||||       ||||| |||||| |     
31267105 ctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcac-------tatagaggtgtg-aa 31267014  T
400 agagacgttgaga-tcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |    
31267013 agagacgttgagattttttagcacgtctaaagagtcgttgagtttctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaa 31266914  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    ||| || |||||| ||||||    
31266913 tcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtgg 31266814  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
31266813 ttgtacacttgtacttt 31266797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 51 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 47152642 - 47152079
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||     
47152642 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa- 47152544  T
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaat-tgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagac 247  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |  ||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
47152543 gcaagagtcttctaatcaaacaaagatacagggaaaatatgtttgacttgaacacatgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaa-gac 47152445  T
248 tctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtg 346  Q
    |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||     
47152444 tctaaacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgctttttaacttgt- 47152347  T
347 ataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttc 443  Q
       ||||||||| |     |||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
47152346 ---atgtctctatctgcattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgttgagttc 47152251  T
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
47152250 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggc 47152151  T
544 agagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |  | |||| |||||||||||||||  || | |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
47152150 atggttgttgtcttgtcttgtagcgtagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 47152079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 164 - 615
Target Start/End: Original strand, 24713241 - 24713690
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaat 262  Q
    ||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||    
24713241 tcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatataatgcaataaa-gactctagacttgtgaat 24713338  T
263 ttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtct--ctacc 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | || |||  ||||     
24713339 ttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttgacagagttttggcgcttttaacttgtgttgatctctatctaca 24713438  T
361 gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccag 460  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24713439 -atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatctaccag 24713536  T
461 taatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtc 560  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
24713537 taatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtc 24713636  T
561 ttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24713637 ttgtagcg-tgacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24713690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 5873139 - 5873629
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
5873139 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 5873238  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | |    
5873239 gttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-gac 5873336  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    || |||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | | ||||||||||||  | ||    
5873337 agggttttggcgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaa-agacgttgagatgattag 5873433  T
420 cacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
5873434 cacgtctaaagagtcgttgagttccttggatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaatttcattccca 5873533  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
5873534 tcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 5873629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 10695409 - 10695899
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
10695409 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 10695508  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | |    
10695509 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-gac 10695606  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    ||||||||| | |   ||||||| |||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
10695607 agagttttggcgctttttaacttgt----atgtctctatctacattcttcaaatcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgatt 10695701  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
10695702 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 10695801  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  || | |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
10695802 catctcgaaggaacaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagggtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 10695899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 131 - 615
Target Start/End: Original strand, 4987051 - 4987533
Alignment:
131 caatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
4987051 caatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 4987150  T
231 acaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgg 330  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||| |    
4987151 acattacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttg 4987248  T
331 gcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaa 428  Q
    |||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | |||||||||||||   | |||||||||||    
4987249 gcgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagaggattagcacgtctaa 4987345  T
429 agagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaagg 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
4987346 agagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 4987445  T
529 aac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4987446 cacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4987533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 3370483 - 3370975
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
3370483 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgattatgaacacttgatatacaatcagtgg 3370582  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |     
3370583 tgttctcaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaatt-ga 3370680  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | |||||||||||||   |    
3370681 cagagttttggcgtttttgaacttgt----atatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagaggat 3370775  T
417 aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||    
3370776 tagcacgtctaaagagtcgttgagtttctttgatcacccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattc 3370875  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
3370876 ccatcttgaaggcacaaattttgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 3370975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 187 - 615
Target Start/End: Original strand, 19581074 - 19581500
Alignment:
187 tgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaa-gaatttctaagatatatcaaatcagtg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
19581074 tgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaa-gactctagactttgtgaatttctaagatataccaaatcagtg 19581172  T
286 cagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttcct 382  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| || ||   || |||||| |     |||||||||||||||| | |    
19581173 cagaaattcaatgtgctttttagaatcaaatt-gatagagttttggcgcttttaaatt-tgt--atttctctatcttcattcttcaagtcttcactcctt 19581268  T
383 tatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggt 482  Q
    ||||||| || ||| | ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
19581269 tatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgaatagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgtctgatttgggt 19581367  T
483 gtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagg 582  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||     
19581368 gtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacaga 19581467  T
583 gtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19581468 gtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19581500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 122 - 614
Target Start/End: Original strand, 16317099 - 16317589
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
16317099 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 16317198  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | ||| | |    
16317199 gttcacaatagaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcatatt-gac 16317296  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   || | |||||   |||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
16317297 agagttttggcgctttttaacttgtgtatatctatctacat-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagc 16317394  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||    
16317395 acgtctaaagagtcgttgatttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 16317494  T
521 cttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
16317495 cttgaaggaacatttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 16317589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 3390223 - 3390715
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
3390223 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgatgatgaacacttgatatacaatcagtgg 3390322  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |     
3390323 tgttctcaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaatt-ga 3390420  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | |||||||||||||   |    
3390421 cagagttttggcgtttttgaacttgt----atatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagaggat 3390515  T
417 aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||    
3390516 tagcacgtctaaagagtcgttgagtttctttgatcacccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattc 3390615  T
517 ctatcttgaagg-aacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||||| |  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
3390616 ccatcttgaaggcataaattctgcatgcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 3390715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 10909176 - 10909668
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
10909176 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 10909275  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
10909276 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 10909373  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
10909374 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 10909471  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
10909472 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 10909571  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
10909572 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 10909668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 14836593 - 14836103
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||  ||||||| || |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
14836593 agagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 14836494  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| || ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
14836493 gttcacaatacaatacaataaa-gactataaacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 14836396  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
14836395 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagc 14836298  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||| ||    
14836297 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagctttaaattcattcccat 14836198  T
521 cttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
14836197 cttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14836103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18752980 - 18752490
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
18752980 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 18752881  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
18752880 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 18752784  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||     | ||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
18752783 agagttttggcgcttttgaacttgtatgtttctctct-cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagc 18752686  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
18752685 acgtctaaagagtcgtttgaaatccattgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 18752586  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
18752585 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgccttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18752490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 27815436 - 27814944
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27815436 agagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 27815337  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
27815336 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 27815240  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || ||||||   |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
27815239 agagttttggcgcttttgaacttgt----atatctctatgtcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc 27815145  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
27815144 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 27815045  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
27815044 ccatcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacataaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 27814945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18078397 - 18077905
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
18078397 agagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacgcttgatatacaatcagtggt 18078298  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
18078297 gttcacaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 18078200  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
18078199 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 18078102  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
18078101 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 18078002  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||    
18078001 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagaggagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18077905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 16304875 - 16305366
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||| | || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
16304875 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaataaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 16304974  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
16304975 gttcacaatagaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 16305072  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   || | |||||   |||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
16305073 agagttttggcgctttttaacttgtgtatatctatctacat-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagc 16305170  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||  ||    
16305171 acgtctaaagagtcgttgatttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcat 16305270  T
521 cttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||| |||||||||||  | || || ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
16305271 cttgaaggaacatttctgcaggcatggttgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttatacttt 16305366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 5022505 - 5022995
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
5022505 agagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 5022604  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
5022605 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaattagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 5022701  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| || | ||||   |||||||||||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
5022702 agagttttggcgcttttgaacttgt-atatatctatctatt-atcttcaagtcttcactcatttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 5022798  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | || ||||||||||||     
5022799 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctccaaattcattccc 5022898  T
519 atcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
5022899 atcttaaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 5022995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18763590 - 18763100
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
18763590 agagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 18763491  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
18763490 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 18763394  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||     | ||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
18763393 agagttttggcgcttttgaacttgtatgtttctctct-cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagc 18763296  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
18763295 acgtctaaagagtcgtttgaaatccattgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 18763196  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
18763195 tcttgaaggcacaaattctgcaggcataactgttgccttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18763100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Original strand, 33377933 - 33378444
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
33377933 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaatagaattacgcagaaaattgtttgagtttgaacac 33378032  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaata-caatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaag 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||    
33378033 ttgatatacaatcagtggtgttcacaataccaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaag 33378132  T
299 tgcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtg 396  Q
    ||||||  || |||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  |   || || || |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||    
33378133 tgcttttatgtgaaacaaaattggcagagtttgagcgctttttacttgttgtctcgtatc-actgatctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 33378231  T
397 tagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaa 495  Q
     | |||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||| |   |||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
33378232 -aaagagtcgttgagatctttaagcacatcaatagagtcgttgtgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaa 33378330  T
496 ggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagata 594  Q
    | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||    
33378331 gaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggtagaactgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggta 33378430  T
595 gtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||||    
33378431 gtggttgtacactt 33378444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 25656904 - 25657395
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
25656904 agagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagcggt 25657003  T
222 gttcacaatacaatg-caataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    |||| ||||| ||   ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |     
25657004 gttctcaataaaaaaacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-ga 25657100  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
25657101 cagagttttggcgctttttaacttatgtatatctctctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcag 25657198  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
25657199 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 25657298  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
25657299 atcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 25657395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 36018105 - 36018597
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
36018105 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 36018204  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
36018205 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 36018301  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | ||||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
36018302 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 36018399  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
36018400 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 36018499  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36018500 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36018597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 36028658 - 36029150
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
36028658 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 36028757  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
36028758 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 36028854  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | ||||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
36028855 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 36028952  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
36028953 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 36029052  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36029053 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36029150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 40471078 - 40470587
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
40471078 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 40470979  T
222 gttcacaatacaatg-caataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    |||| ||||| ||   ||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |     
40470978 gttctcaataaaaaaacaataaa-gtctctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-ga 40470882  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    | | ||| || ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
40470881 cagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatct-ccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcag 40470784  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
40470783 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 40470684  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
40470683 atcttgaaggcacaaaatctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 40470587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 40454840 - 40454348
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
40454840 agagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 40454741  T
222 gttcacaatacaatg--caataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    |||| ||||| ||    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |    
40454740 gttctcaataaaaaaaacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-g 40454644  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||    | | ||| || ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
40454643 acagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatct-ccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatca 40454546  T
419 gcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
40454545 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 40454446  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
40454445 catcttgaaggcacaaaatctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 40454348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 48370900 - 48371392
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
48370900 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 48370999  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | |||||| |    
48371000 gttcacaatacaatacaat-aaagactctggactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaa-tcaatttgac 48371096  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | || || ||| |   | ||||||||||||||||  | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
48371097 agagttttggcgcttttgaacttat-at-atttctatcttcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 48371193  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
48371194 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 48371293  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
48371294 atcttgaaggtacaaattatgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 48371392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 15561570 - 15561078
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
15561570 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 15561471  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
15561470 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 15561374  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
15561373 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 15561276  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
15561275 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 15561176  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
15561175 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 15561078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24028576 - 24028084
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24028576 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 24028477  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
24028476 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 24028380  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
24028379 agagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 24028282  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
24028281 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgataatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 24028182  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  | |||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24028181 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24028084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 450345 - 450837
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
450345 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 450444  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||| |    
450445 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 450541  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
450542 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctctctatttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 450638  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
450639 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 450738  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
450739 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 450837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 55745743 - 55745251
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
55745743 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 55745644  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | |||||| |    
55745643 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaa-tcaatttgac 55745547  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||  |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
55745546 agagttttggcgcttttaaacttatg--tatttctctgtcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 55745450  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
55745449 cacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattccc 55745350  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
55745349 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 55745251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 55756354 - 55755862
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
55756354 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacaaagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 55756255  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | |||||| |    
55756254 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaa-tcaatttgac 55756158  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||  |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
55756157 agagttttggcgcttttaaacttatg--tatttctctgtcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 55756061  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
55756060 cacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattccc 55755961  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
55755960 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 55755862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 24640017 - 24640509
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24640017 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 24640116  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || || ||| ||| |    
24640117 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagtatcaaa-ttgac 24640213  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
24640214 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatgtctctgtaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 24640310  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
24640311 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 24640410  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24640411 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24640509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 16255634 - 16256130
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaa-ttacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
16255634 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaattacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtgg 16255733  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| |||     
16255734 tgttcacaatacaatgc-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttga 16255830  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || || | ||||||    | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |    
16255831 cagagttttggcgcttttgaacttatg-tattttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataat 16255928  T
417 aagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
     ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
16255929 cagcacgtttaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcatt 16256028  T
516 cctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    || |||||||  | |||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
16256029 cccatcttgagtgtacaagttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 16256128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 16266227 - 16266723
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaa-ttacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
16266227 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaattacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtgg 16266326  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| |||     
16266327 tgttcacaatacaatg-tagaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttga 16266423  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || || | ||||||    | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |    
16266424 cagagttttggcgcttttgaacttatg-tattttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataat 16266521  T
417 aagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
     |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
16266522 cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcatt 16266621  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    || |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
16266622 cccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 16266721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 613
Target Start/End: Original strand, 17917821 - 17918311
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
17917821 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 17917920  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
17917921 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 17918017  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
17918018 agagttttggcgcttttgaacttgtgtatctttatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 17918115  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
17918116 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 17918215  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
17918216 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 17918311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 613
Target Start/End: Original strand, 17928469 - 17928959
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
17928469 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 17928568  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
17928569 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 17928665  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
17928666 agagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 17928763  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
17928764 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 17928863  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
17928864 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 17928959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 10751659 - 10751167
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
10751659 agagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 10751560  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
10751559 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 10751463  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
10751462 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 10751365  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
10751364 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 10751265  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
10751264 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 10751167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 10965428 - 10964936
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
10965428 agagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 10965329  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
10965328 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 10965232  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
10965231 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 10965134  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
10965133 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 10965034  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
10965033 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 10964936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 49517904 - 49518396
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
49517904 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 49518003  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
49518004 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 49518100  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
49518101 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 49518198  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
49518199 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 49518298  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
49518299 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 49518396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 14844144 - 14843652
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
14844144 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 14844045  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
14844044 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 14843948  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    |||||||||||||||||   |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
14843947 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatatctctatttaatcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 14843851  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
14843850 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 14843751  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
14843750 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14843652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 30937563 - 30937071
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||  ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
30937563 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacggagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 30937464  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
30937463 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 30937367  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
30937366 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctctctatttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 30937270  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
30937269 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 30937170  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
30937169 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 30937071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 4948106 - 4948596
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
4948106 agagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 4948205  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
4948206 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 4948302  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| || | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
4948303 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctgtatc-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 4948398  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||| || | ||||||||||||||| |    
4948399 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtggtcatttgaagaataagcttcaaattcattccca 4948498  T
520 tcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | ||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4948499 tcttgagtgtacatattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4948596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18130731 - 18130238
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaa-cagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
18130731 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtgg 18130632  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |     
18130631 tgttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-ga 18130535  T
321 cagagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||    | ||||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
18130534 cagagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctctaaa-atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 18130437  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
18130436 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 18130337  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
18130336 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18130238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 10741085 - 10740593
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
10741085 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 10740986  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
10740985 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 10740889  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
     |||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
10740888 cgagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 10740791  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
10740790 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 10740691  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
10740690 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 10740593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 10954854 - 10954362
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
10954854 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 10954755  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
10954754 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 10954658  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
     |||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
10954657 cgagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 10954560  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
10954559 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 10954460  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
10954459 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 10954362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 614
Target Start/End: Original strand, 22006780 - 22007271
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
22006780 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 22006879  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||| |    
22006880 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttataagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaa-ttgac 22006976  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | || ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
22006977 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctcact-ttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 22007074  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
22007075 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 22007174  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
22007175 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 22007271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 460926 - 461418
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
460926 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagaattctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 461025  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||| ||| ||| |    
461026 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtataatcaaa-ttgac 461122  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
461123 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctctctatttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 461219  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
461220 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 461319  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
461320 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 461418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27656369 - 27656862
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27656369 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 27656468  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
27656469 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 27656565  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
27656566 agagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctgt-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggggtg-aaagagacgttgagataatcagc 27656663  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
27656664 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 27656763  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
27656764 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27656862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27666942 - 27667435
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27666942 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 27667041  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
27667042 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 27667138  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
27667139 agagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctgt-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggggtg-aaagagacgttgagataatcagc 27667236  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
27667237 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 27667336  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
27667337 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27667435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 19944818 - 19944326
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
19944818 agagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 19944719  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
19944718 gttcacaaaacaatacagt-aaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 19944622  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
19944621 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctct-gcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 19944524  T
421 acgtctaaagagtc-gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
19944523 acgtctaaagagtcatttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 19944424  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||||| | ||||||| |||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19944423 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttatagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19944326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 19955453 - 19954961
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
19955453 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 19955354  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
19955353 gttcacaaaacaatacagt-aaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 19955257  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
19955256 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctct-gcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 19955159  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||  |    
19955158 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctggtttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctca 19955059  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |   || || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19955058 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaaaagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19954961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 614
Target Start/End: Original strand, 21996182 - 21996673
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
21996182 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 21996281  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||| |    
21996282 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttataagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaa-ttgac 21996378  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | || ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
21996379 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctcact-ttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 21996476  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
21996477 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 21996576  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||    
21996577 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactt 21996673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 30926985 - 30926493
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
30926985 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 30926886  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
30926885 gttcacaatacaa-gacagaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 30926789  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    |||||||||||||||||   |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
30926788 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctctctatttaatcttcaagtcttcactcatttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 30926692  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||     
30926691 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctttaaattcattccc 30926592  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
30926591 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 30926493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 52703557 - 52704049
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  | ||||| || |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
52703557 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatgaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttaaacacttgatatacaatcagtggt 52703656  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||| ||||| | |    
52703657 gttcacaatacaatacagtaca-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtataatcaaatt-gac 52703753  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
52703754 agagttttggcgcttttgaacttatgtatttctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 52703851  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
52703852 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 52703951  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
52703952 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 52704049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 400 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 15207627 - 15207413
Alignment:
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
15207627 agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 15207528  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||    
15207527 tagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcataactgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggt 15207429  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
15207428 tgtacacttgtacttt 15207413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 104 - 306
Target Start/End: Original strand, 1671908 - 1672114
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
1671908 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 1672007  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||    
1672008 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaatacagaaattctaagt 1672107  T
300 gcttttg 306  Q
     ||||||    
1672108 acttttg 1672114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 19241657 - 19241798
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
19241657 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcag 19241756  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
19241757 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19241798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18007710 - 18007569
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
18007710 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgcttaatactacctagtatgagacttccaaattgctcaagcacgcag 18007611  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
18007610 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaatcaagagacttc 18007569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18775304 - 18775163
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
18775304 ccttgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactgcctagtgggagacttctcaaatgctcaagcacgcag 18775205  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
18775204 gcgagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 18775163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 49002601 - 49002462
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
49002601 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatcacacagattacagatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcat 49002506  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
49002505 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 49002462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 55650962 - 55651101
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
55650962 ccttgcacttccaaggagatttccactaaaaa----tcacacagattacagatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 55651057  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
55651058 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 55651101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 122 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29042147 - 29041934
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
29042147 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 29042048  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
29042047 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 29041951  T
322 agagtttgggcgctttt 338  Q
    ||||||| |||||||||    
29041950 agagttttggcgctttt 29041934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 11514673 - 11514813
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
11514673 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgca 11514768  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
11514769 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 11514813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15207879 - 15207664
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaat-tacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| ||  ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
15207879 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtgg 15207780  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| |||     
15207779 tgttcacaatacaatgcaat-aaagactctagactagtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttga 15207682  T
321 cagagtttgggcgctttt 338  Q
    |||||||| |||||||||    
15207681 cagagttttggcgctttt 15207664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31267414 - 31267273
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| || ||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
31267414 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatctcaaagattacaaatgctcaatattctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 31267319  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
31267318 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 31267273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18775621 - 18775514
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
18775621 ccttgcacttccaacgagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactgcctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 18775522  T
119 gcgagaga 126  Q
    || |||||    
18775521 gcaagaga 18775514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 11535483 - 11535623
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
11535483 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 11535577  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
11535578 aggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 11535623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19889575 - 19889443
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga--cttgaac 200  Q
    ||||||||||||  || | |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||    
19889575 atgctcaagcacaaagacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaa-tgtttgaggtttgaac 19889477  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
19889476 acttgacatacaatcagtggtgttcacaatacaa 19889443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 10300173 - 10300313
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
10300173 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 10300267  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
10300268 aggctagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 10300313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3105993 - 3105879
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
3105993 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaaatgaacacttgatatacaatcagtg 3105894  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
3105893 gtgttcacaatacaa 3105879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 306
Target Start/End: Original strand, 1674476 - 1674589
Alignment:
196 tgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaat 292  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
1674476 tgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaatacagaaat 1674575  T
293 tcaaagtgcttttg 306  Q
    || |||| ||||||    
1674576 tctaagtacttttg 1674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 55379859 - 55379961
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
55379859 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacacggaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 55379958  T
232 caa 234  Q
    |||    
55379959 caa 55379961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 23750062 - 23750175
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
23750062 agagacttcttatgctcaagcacgactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 23750161  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    || |||||||||||    
23750162 tgatcacaatacaa 23750175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17057683 - 17057534
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
17057683 agacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttttattcaaacagaattacaaagaaaa-tgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtg 17057585  T
223 ttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagata 272  Q
    ||||||||||||  | | | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
17057584 ttcacaatacaaatc-agataagactcttaagactttagaatttctaagata 17057534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Original strand, 16939548 - 16939681
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaac 200  Q
    |||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||    
16939548 tgctcaagcacaaatgcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaac 16939647  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
16939648 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 16939681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15014958 - 15014845
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||    
15014958 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattgaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttaaacacttgatatacaatcagtgg 15014859  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
15014858 tgttcacaatacaa 15014845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 234
Target Start/End: Original strand, 2651338 - 2651466
Alignment:
107 tcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttg 205  Q
    |||||||| || || ||||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
2651338 tcaagcacacaagcaagagattttctatgctcgagcacaaaaggaagagacttctagacaaacaaaattacacagaaaaatgtttgaggttgaacacttg 2651437  T
206 atatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||    
2651438 atatactatcattggtgttcacaatacaa 2651466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18775911 - 18775815
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
18775911 agagacttccaatactcaagcactcgggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaagattgtttgactttgaacacttgatatacaatcaa 18775815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 40860207 - 40860322
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
40860207 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaatcagaattacaaagaaaaatgtttgacgttgaacacttgatatacaatcagt 40860306  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
40860307 ggtgttcacaatacaa 40860322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14605478 - 14605364
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
14605478 agagacttcaaatgctcaagcacaactacaagagacttctaattcaaacagaatgacacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 14605379  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
14605378 gtgttcacaatacaa 14605364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17788600 - 17788498
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
17788600 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 17788501  T
232 caa 234  Q
    |||    
17788500 caa 17788498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 56034109 - 56034223
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
56034109 agagacttcaaatgctcaagcacaattgcaagagacttctaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 56034208  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    || ||||||||||||    
56034209 gtattcacaatacaa 56034223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41115329 - 41115216
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||    
41115329 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatgtacaatcagtgg 41115230  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
41115229 tgttcacaatacaa 41115216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 234
Target Start/End: Original strand, 13890374 - 13890482
Alignment:
127 cttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttc 225  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
13890374 cttcctatgctcaagcacaaaagcaagagtcttctaaacaaacacaattacacagaaatatgtttgaggtggaacacttgatatacaatcagtggtgttc 13890473  T
226 acaatacaa 234  Q
    |||||||||    
13890474 acaatacaa 13890482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14154569 - 14154455
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |    
14154569 agagacttctaatgctcaagcacaaatgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaggaaaat-gtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 14154471  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
14154470 ggtgttcacaatacaa 14154455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17399249 - 17399134
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |   ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
17399249 agagacttctattgctcaagcacaactacaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 17399150  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
17399149 ggtgttcacaatacaa 17399134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19912453 - 19912338
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   |||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
19912453 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaactacaacgaaaattgtttgaggttgaacacttgatatgcaatcaat 19912354  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
19912353 ggtgttcacaatacaa 19912338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 450242 - 450355
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
450242 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 450340  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
450341 agcaagagacttcta 450355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 4948003 - 4948116
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
4948003 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 4948101  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
4948102 agcaagagacttcta 4948116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15561673 - 15561560
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
15561673 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 15561575  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
15561574 agcaagagacttcta 15561560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18753083 - 18752970
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
18753083 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 18752985  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
18752984 agcaagagacttcta 18752970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18763693 - 18763580
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
18763693 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 18763595  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
18763594 agcaagagacttcta 18763580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19944921 - 19944808
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
19944921 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 19944823  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
19944822 agcaagagacttcta 19944808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19955556 - 19955443
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
19955556 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 19955458  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
19955457 agcaagagacttcta 19955443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 21996079 - 21996192
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
21996079 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 21996177  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
21996178 agcaagagacttcta 21996192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 22006677 - 22006790
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
22006677 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 22006775  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
22006776 agcaagagacttcta 22006790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30927088 - 30926975
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
30927088 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 30926990  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
30926989 agcaagagacttcta 30926975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30937666 - 30937553
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
30937666 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 30937568  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
30937567 agcaagagacttcta 30937553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 52703454 - 52703567
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
52703454 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 52703552  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
52703553 agcaagagacttcta 52703567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 11915251 - 11915353
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
11915251 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaaccagtggtggtcacaata 11915350  T
232 caa 234  Q
    |||    
11915351 caa 11915353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12811749 - 12811635
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
12811749 agagacttctaatgctcaagcacaattgcaagagacttctaattcaaatagaattacaacgaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtg 12811650  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
12811649 gtgttcacaatacaa 12811635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14903008 - 14902906
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
14903008 atgcttaagcacaaaagcaagagacttctagacaaacacaattatacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacattcggtggtgttcacaata 14902909  T
232 caa 234  Q
    |||    
14902908 caa 14902906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Original strand, 23123057 - 23123166
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |    
23123057 agagacttctaatgctcaagcacaatggcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 23123156  T
219 ggtgttcaca 228  Q
    ||||||||||    
23123157 ggtgttcaca 23123166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 5873037 - 5873149
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
5873037 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 5873135  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
5873136 gcaagagtcttcta 5873149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 17917717 - 17917831
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
17917717 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 17917815  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
17917816 aagcaagagacttcta 17917831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 17928365 - 17928479
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
17928365 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 17928463  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
17928464 aagcaagagacttcta 17928479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20571571 - 20571458
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| || |||    
20571571 agagacttcctatgttcaaacacaaaagcaagagacttctaaacaaacacaattacacagaaaaatgttagaggttgaacacttgatatacaaccagtgg 20571472  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||    
20571471 tgttcacagtacaa 20571458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Original strand, 33377860 - 33377959
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
33377860 gattacaacttctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 33377958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 55380158 - 55380323
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |  |||||||    
55380158 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacattgttgcaggc 55380257  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||| | ||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
55380258 agagctgttattattgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 55380323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 6641221 - 6641336
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |    
6641221 agagacttcctatgctcaagcacaattgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatatttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 6641320  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||| ||||||||    
6641321 ggtgttctcaatacaa 6641336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 7222033 - 7222160
Alignment:
106 ctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttg 205  Q
    ||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||   |||| | |||||||||||    
7222033 ctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagatttctaaacaaaca-aattacacagaaataagttttatttgaacacttg 7222131  T
206 atatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||    
7222132 atatgcaatcactggtgttcataatacaa 7222160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9752114 - 9751999
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
9752114 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagt 9752015  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
9752014 ggtgttcacaatacaa 9751999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 10072470 - 10072584
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
10072470 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 10072568  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    | ||||||||||||||    
10072569 gatgttcacaatacaa 10072584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17701330 - 17701215
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
17701330 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 17701231  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
17701230 ggtgttcacaatacaa 17701215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 22190382 - 22190497
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
22190382 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 22190481  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||| ||||    
22190482 ggtgttcacaaaacaa 22190497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 29120902 - 29121016
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
29120902 agagacttctaatgctcaagcacgactgcaagagacttctaaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 29121000  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||| |||||    
29121001 ggtgttcacagtacaa 29121016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37986185 - 37986070
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||||   ||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
37986185 agagacttctaatgctcaagtacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaaaaaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 37986086  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
37986085 ggtgttcacaatacaa 37986070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Original strand, 54679468 - 54679579
Alignment:
126 acttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
54679468 acttctaatgctcaagcacaattgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatggttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtg 54679567  T
223 ttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||    
54679568 ttcacaatacaa 54679579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 460823 - 460936
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
460823 ataatcacaaagattactactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 460921  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
460922 agcaagagacttcta 460936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14844247 - 14844134
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
14844247 ataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 14844149  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
14844148 agcaagagacttcta 14844134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 16255532 - 16255644
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
16255532 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 16255629  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
16255630 agcaagagacttcta 16255644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 16266125 - 16266237
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
16266125 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 16266222  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
16266223 agcaagagacttcta 16266237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 16304772 - 16304885
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
16304772 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 16304870  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
16304871 agcaagagtcttcta 16304885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 16316996 - 16317109
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
16316996 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 16317094  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
16317095 agcaagagtcttcta 16317109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18078502 - 18078387
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
18078502 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagaggcttccaatgctcaagcact 18078403  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
18078402 -aagcaagagacttcta 18078387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18130836 - 18130721
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
18130836 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 18130737  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
18130736 -aagcaagagacttcta 18130721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27656264 - 27656379
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
27656264 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 27656363  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
27656364 -aagcaagagacttcta 27656379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27666837 - 27666952
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
27666837 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 27666936  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
27666937 -aagcaagagacttcta 27666952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27815539 - 27815426
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
27815539 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 27815441  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
27815440 agcaagagacttcta 27815426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37436103 - 37436000
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctag-tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
37436103 atgctcaagcacaactgcaagagacttctaactcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacgat 37436004  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
37436003 acaa 37436000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40454943 - 40454830
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
40454943 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 40454845  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
40454844 agcaagagacttcta 40454830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40471181 - 40471068
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
40471181 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 40471083  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
40471082 agcaagagacttcta 40471068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 48370797 - 48370910
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
48370797 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 48370895  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
48370896 agcaagagacttcta 48370910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Original strand, 8105177 - 8105289
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
8105177 agacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 8105275  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
8105276 tgttcacaatacaa 8105289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 13693360 - 13693459
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatac 232  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
13693360 atgctcaagcacaaaagctagagacttctaaacaaaca--attacacagaaagatgtttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcgcaatac 13693457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14904930 - 14904816
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||    
14904930 agagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagatacttctaattcaaacagaattacacaaaaaaatgtttgaggttgaacatttgatatacaatcagtg 14904831  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||| |||||||||    
14904830 gtgtttacaatacaa 14904816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Original strand, 15135296 - 15135374
Alignment:
150 caagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcac 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
15135296 caagagacttctattcaaacagaattataaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 15135374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3500227 - 3500111
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
3500227 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 3500128  T
219 ggtgttcacaatacaat 235  Q
    |||||| ||||||||||    
3500127 ggtgtttacaatacaat 3500111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10661738 - 10661625
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  ||||| |||||| |  ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| || |||    
10661738 agagacttcatatgcttaagcacaactgcaagtgacttctacttaaacagaattacaaagaaaattgtttgatgttgaacacttgagatacaaccagtgg 10661639  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
10661638 tgttcacaatacaa 10661625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 10695307 - 10695419
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||    
10695307 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 10695405  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
10695406 gcaagagtcttcta 10695419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10875883 - 10875770
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  ||||| |||||| |  ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| || |||    
10875883 agagacttcatatgcttaagcacaactgcaagtgacttctacttaaacagaattacaaagaaaattgtttgatgttgaacacttgagatacaaccagtgg 10875784  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
10875783 tgttcacaatacaa 10875770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15207981 - 15207869
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
15207981 ataatcactaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 15207883  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
15207882 gcaagagtcttcta 15207869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 19580906 - 19581018
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||    
19580906 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggaaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 19581004  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
19581005 gcaagagtcttcta 19581018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24028682 - 24028566
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttccc-----aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcac 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |     |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
24028682 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 24028583  T
145 taaagcaagagacttcta 162  Q
    | ||||||||||||||||    
24028582 t-aagcaagagacttcta 24028566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 12600295 - 12600410
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |   |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | |    
12600295 agagacttctaatgttcaagcacaactacaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacactttatatacaattagt 12600394  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
12600395 ggtgttcacaatacaa 12600410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 16853041 - 16853155
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||    |||||||||| |||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
16853041 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctcacttcaaacagaagtacaaagaatat-gtttgaggttgaacacttgatatacaatcaat 16853139  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
16853140 ggtgttcacaatacaa 16853155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39420310 - 39420195
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  | |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
39420310 agagacttctattgctcaagcacaactgtaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 39420211  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| |||||||||    
39420210 ggtgttaacaatacaa 39420195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39532277 - 39532170
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
39532277 aatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaagatacagagaaaat-gtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 39532179  T
231 acaatgcaa 239  Q
    |||||||||    
39532178 acaatgcaa 39532170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4986901 - 4986790
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
4986901 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 4986802  T
222 gttcacaataca 233  Q
    ||||||||||||    
4986801 gttcacaataca 4986790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 10909073 - 10909186
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
10909073 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 10909171  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
10909172 agcaagagtcttcta 10909186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 24639913 - 24640027
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
24639913 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24640011  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
24640012 -aagcaagagacttcta 24640027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Original strand, 24713092 - 24713191
Alignment:
50 aataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
24713092 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttttcaaaatgctcaagcacgcaggaaagagtcttccaatgctcaagcactaa 24713191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 25008561 - 25008674
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
25008561 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 25008659  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
25008660 agcaagagtcttcta 25008674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 25656801 - 25656914
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
25656801 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 25656899  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
25656900 agcaagagacttcta 25656914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29042251 - 29042137
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
29042251 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 29042153  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
29042152 -aagcaagagacttcta 29042137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 55745847 - 55745733
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
55745847 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 55745749  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
55745748 -aagcaagagacttcta 55745733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 55756458 - 55756344
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
55756458 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 55756360  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
55756359 -aagcaagagacttcta 55756344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 18473548 - 18473682
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||| ||| || || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |   |||| | ||||||| |||||  || |||  |||||    
18473548 caaatactcaaccacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttatgaacaaataaaattacatagaaagatggttggtttgaa 18473647  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
18473648 cacttgatatacaatcagtggtgttcacactacaa 18473682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 3370379 - 3370493
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
3370379 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 3370477  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
     |||||||| ||||||    
3370478 tagcaagagtcttcta 3370493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 3390119 - 3390233
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
3390119 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 3390217  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
     |||||||| ||||||    
3390218 tagcaagagtcttcta 3390233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 11900729 - 11900842
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |  | |||||||||||| | ||| |||||| || ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||    
11900729 agagacttcctttgctcaagcacaactgtaagagacttctatttaaatagaattgcaaagaaatttttttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 11900828  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
11900829 tgttcacaatacaa 11900842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 23750390 - 23750555
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||  |||| ||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||||| |   |||||||||| |  |||||||    
23750390 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttaaaattcattccaagtatgaaggaacattgttgcaggc 23750489  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||||  | | || ||||||||| |||||||||||||    
23750490 agagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacactt 23750555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 3395127 - 3395241
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||   ||||| ||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |    
3395127 agagacttcaaatgctcaagcataactgcaagagacttctaaattcaaatagaattaaaaagaaaat-gtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 3395225  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
3395226 ggtgttcacaatacaa 3395241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 159
Target Start/End: Original strand, 5022402 - 5022512
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
5022402 ataattacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 5022500  T
148 agcaagagactt 159  Q
    ||||||||||||    
5022501 agcaagagactt 5022512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 6517023 - 6517137
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |  |||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
6517023 agagacttctattgctcaagcataactgcaaaagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 6517121  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
6517122 ggtgttcacaatacaa 6517137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13576690 - 13576576
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||| |    
13576690 agagacttctaattctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaagttgaacacttgagatacgatcagt 13576592  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
13576591 ggtgttcacaatacaa 13576576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 20976994 - 20977109
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||| ||||  | |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |    
20976994 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagaattcttaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaattagt 20977093  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
20977094 ggtgttcacaatacaa 20977109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22676097 - 22675982
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||  | |||||||||||||||   |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |    
22676097 agagacttctaatgctcaatcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaagaaaaaatgtttgaggttgaacatttgatatacaatcagt 22675998  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
22675997 ggtgttcacaatacaa 22675982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25651669 - 25651555
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | |||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
25651669 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattcca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 25651571  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||| |||||    
25651570 ggtgttcacagtacaa 25651555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29681120 - 29681005
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||    | |||||||||| |   ||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |    
29681120 agagacttctaatgctcaagcacatctgtaagagacttccaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttaaggttgaacacttgatatacaatcagt 29681021  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
29681020 ggtgttcacaatacaa 29681005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 45832922 - 45833036
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |    
45832922 agagacttctaatgctcaagcacaactacaagagacttcttaattcaaacagaattact-agaaaaatgtttgaggctgaacacttgatatacaatcagt 45833020  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
45833021 ggtgttcacaatacaa 45833036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 55731383 - 55731497
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||| || |||||| || |||||||||||||||||| | |    
55731383 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacataattacaaagaatat-gtttgagtttgaacacttgatatacaattagt 55731481  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
55731482 ggtgttcacaatacaa 55731497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4987004 - 4986891
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
4987004 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 4986906  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
4986905 agcaagagtcttcta 4986891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10741189 - 10741075
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
10741189 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10741091  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
10741090 -aagcaagagacttcta 10741075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10954958 - 10954844
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
10954958 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10954860  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
10954859 -aagcaagagacttcta 10954844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21350773 - 21350659
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac--ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||  || || ||||||| ||||||||| |||  |||||||   |||||||||||||||||||||| ||    
21350773 agagacttcttatgctcaagcacaaaaacaataggtttttaatcaaacaaaattacacaaaaagatgtttgaggtttgaacacttgatatacaatcagtg 21350674  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
21350673 gtgttcacaatacaa 21350659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 36018001 - 36018115
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
36018001 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36018099  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
36018100 -aagcaagagacttcta 36018115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 36028554 - 36028668
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
36028554 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36028652  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
36028653 -aagcaagagacttcta 36028668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 49517800 - 49517914
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
49517800 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 49517898  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
49517899 -aagcaagagacttcta 49517914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 17539965 - 17540051
Alignment:
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
17539965 gcaagagacttctattcaaacaaaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatataatcagtgatgttcacaatacaa 17540051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 10072803 - 10072968
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||  | ||||||     
10072803 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggt 10072902  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    || |||| || ||||||||| ||||   |||| |  ||  || |||||||||||||||||||||||    
10072903 agggctgtttttcttgtcttatagcagagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacactt 10072968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 567
Target Start/End: Original strand, 12600645 - 12600750
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | || ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
12600645 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagcatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtct 12600744  T
562 tgtagc 567  Q
    ||||||    
12600745 tgtagc 12600750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 3395500 - 3395623
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcaggg 583  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | || ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||  | | |    
3395500 gtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc-atgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgag 3395598  T
584 tcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
3395599 tagtggagatagtggttgtacactt 3395623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10751763 - 10751652
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
10751763 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10751665  T
146 aaagcaagagactt 159  Q
     |||||||||||||    
10751664 -aagcaagagactt 10751652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10965532 - 10965421
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
10965532 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10965434  T
146 aaagcaagagactt 159  Q
     |||||||||||||    
10965433 -aagcaagagactt 10965421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15475718 - 15475603
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||| |    
15475718 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaatgaaaaatgtttgagattaaacacttgatatacaatcagt 15475619  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
15475618 ggtgttcataatacaa 15475603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 16631978 - 16632093
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |   ||||||||||| |   |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |    
16631978 agagacttctaatgcccaagcacaacttcaagagacttccaaattcaaacagaattacaacgaaaaatgtttgacgttgaacacttgatatacaataagt 16632077  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| ||||||    
16632078 ggtgttcacgatacaa 16632093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Original strand, 19884267 - 19884353
Alignment:
150 caagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
19884267 caagagacttcttaagtcaaacaaaattaca-agaaaaatgtttgcggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 19884353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Original strand, 38513442 - 38513529
Alignment:
150 caagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
38513442 caagagacttctaaattcaaacataattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 38513529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 14605147 - 14604985
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||  ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||    
14605147 ctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaaca---ttgcaggc 14605051  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
14605050 agagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14604985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14836696 - 14836583
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | || |||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
14836696 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 14836598  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
14836597 agcaagagtcttcta 14836583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Original strand, 18773577 - 18773702
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga--cttgaac 200  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||   || ||     
18773577 atgctcaagcacacacacaagagacttcctatgctcaagcac-aaatcaatagacttctaattaaacataattacatagaaaattgtttgaggtttaaaa 18773675  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcac 227  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||    
18773676 acttgaaatacaattagtggtgttcac 18773702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 19884612 - 19884735
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||   |||| |  |||  |    
19884612 gtcctatgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagatt 19884711  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||||||||||||||||||||    
19884712 agtggagatagtggttgtacactt 19884735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17526938 - 17526841
Alignment:
136 ctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||    |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
17526938 ctcaagcacaaaagcaaaagacttctaaacaaaca-aattacaaagaattcagtttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcataatacaa 17526841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 18394060 - 18394193
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||| || || | ||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||| ||||||  | |||   |||||  |||||    
18394060 caaatactcaagcacacaagcaacagatttcttatgctcaagcacaaaaacaagagacttcaaaacaaaca-aattacgaaaaaataagtttggtttgaa 18394158  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
18394159 cacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 18394193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 234
Target Start/End: Original strand, 36470418 - 36470480
Alignment:
173 attacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
36470418 attacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 36470480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8686014 - 8685901
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| || ||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||   |||||||  |||||||||  ||||||||||| |||    
8686014 agagacttcctatactcaagcacaactgcaagtgacttctattcaaacagaatgacaaataactatgtttgaggttgaacactgtatatacaatcagtgg 8685915  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
8685914 tgttcacaatacaa 8685901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 37985855 - 37985690
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||    
37985855 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 37985756  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
37985755 agagttgttatccttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 37985690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 56533625 - 56533520
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctag----tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcac 227  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||     ||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
56533625 atgctcaagcacaactgcaagagacttctaaaaattcaaacagaattacaaagaatat-gtttgaggttgaacacttgatatacaattagtggtgttcac 56533527  T
228 aatacaa 234  Q
    |||||||    
56533526 aatacaa 56533520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 17398916 - 17398752
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   ||||  |||| |  ||||||||    
17398916 tttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccaatgtgaataaacattgttgcaggca 17398817  T
545 gagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
17398816 gagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacactt 17398752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 19665903 - 19666018
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   ||||||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |    
19665903 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacaaatttacaaagaaaaatgtttgaggttgaacatttgatatacaatcagt 19666002  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||| || |||||||||    
19666003 ggtatttacaatacaa 19666018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19143598 - 19143504
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagc 142  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||    
19143598 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 19143504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27189218 - 27189101
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaatt--acacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 216  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| || |  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
27189218 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacaaaaattaacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaattt 27189119  T
217 atggtgttcacaatacaa 234  Q
     |||||||||||||||||    
27189118 gtggtgttcacaatacaa 27189101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 488 - 608
Target Start/End: Original strand, 6517397 - 6517518
Alignment:
488 cctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcg 586  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||| ||   ||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |    
6517397 cctaagaaggatcaatttcaaatgtattcccattgggaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtag 6517496  T
587 tggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||||||||||||    
6517497 tggagatagtggttgtacactt 6517518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 226
Target Start/End: Original strand, 9266801 - 9266920
Alignment:
106 ctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacaga-attacacagaaaattgtttgacttgaacactt 204  Q
    ||||||||| || || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| | |||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
9266801 ctcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagactttta-taaaacaaagattacaaagaatattgtttg-gttgaacactt 9266898  T
205 gatatacaatcaatggtgttca 226  Q
     ||||| |||||  ||||||||    
9266899 aatataaaatcagaggtgttca 9266920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10328939 - 10328797
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacaga-attacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttc--aca 228  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||| | |||||| | |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||  | |    
10328939 aatgctaaagcacacaagcaagagaattct-gacaaacaaagattacaaagaaaattgtttggcttaaacacttgatatacaatgagaggtgttcctaaa 10328841  T
229 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatat 273  Q
    ||||||  | | |  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
10328840 atacaacac-acatcagactctagacttgagaatttctaagatat 10328797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 10692719 - 10692884
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | |||||||||| |||||| |||||||   |||| ||  |||||||||| |  |||||||    
10692719 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgggttcccattgtgaaggaacattgttgcaggc 10692818  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
10692819 atagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10692884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 10906485 - 10906650
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | |||||||||| |||||| |||||||   |||| ||  |||||||||| |  |||||||    
10906485 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgggttcccattgtgaaggaacattgttgcaggc 10906584  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
10906585 atagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10906650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16325013 - 16324933
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||  | |||||||  |||||  ||||||||||||||||    
16325013 ttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaaatcaaatacagactcttaagactctagaatttctaagatat 16324933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19621634 - 19621522
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| ||   ||||| | ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| | |    
19621634 agagacttctaatactcaagcacaactgcaagagacttttaaattcaaatataattacacataaaattatttgaggttgaacacttgatatacaataagt 19621535  T
219 ggtgttcacaata 231  Q
    |||||| ||||||    
19621534 ggtgtttacaata 19621522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 22675745 - 22675640
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagct-gttatcttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||| |  || ||||||||||  || ||||||||    
22675745 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgtaggcagagctatttttcttgtct 22675646  T
562 tgtagc 567  Q
    ||||||    
22675645 tgtagc 22675640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 3105661 - 3105497
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||   |||| |   ||||  |||| |  ||||||||    
3105661 tttgatcaatcaccaatgatcctttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatatgaataaacattgttgcaggca 3105562  T
545 gagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||   |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
3105561 gagctgttatccttgccttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 3105497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 24619175 - 24619231
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
24619175 tgctcaagcacacaagcaagagactttaaatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 24619231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16325061 - 16325019
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaatt 175  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
16325061 atgctcaagcacaaaagcaatagacttctaatcaaacagaatt 16325019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 41114993 - 41114939
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
41114993 atcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc 41114939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 533
Target Start/End: Original strand, 3483598 - 3483687
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa 533  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||  |||||||||||    
3483598 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgtgaaggaacaa 3483687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 37435778 - 37435705
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
37435778 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc 37435705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Original strand, 10290264 - 10290344
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaa 103  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    
10290264 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 10290344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 12811417 - 12811253
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||  | | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||    || ||||||| |  |||||||     
12811417 tttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatgtttattgtcctttgaatgatcaatttcaaatccattccttgtatgtaggaacattgttgcaggct 12811318  T
545 gagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
12811317 gagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 12811253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #234
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 552
Target Start/End: Original strand, 17247111 - 17247219
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||| ||||  | ||| |||    
17247111 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctttgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagtaacatctttgctggc 17247210  T
544 agagctgtt 552  Q
    |||||||||    
17247211 agagctgtt 17247219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #235
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 134
Target Start/End: Original strand, 17928479 - 17928511
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
17928479 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaat 17928511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #236
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18130721 - 18130693
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
18130721 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 18130693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #237
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Original strand, 20977418 - 20977490
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| |  ||| || ||| |||||||||||||||||||    
20977418 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 20977490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #238
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 24640027 - 24640055
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
24640027 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 24640055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #239
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 27656379 - 27656407
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
27656379 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 27656407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #240
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 27666952 - 27666980
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
27666952 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 27666980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 505; Significance: 0; HSPs: 286)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24883090 - 24882494
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24883090 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 24882991  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
24882990 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagc 24882891  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaattt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
24882890 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaattagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaattt 24882791  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
24882790 ggcagagtttgggtgcttttaacttgtgttgatgtctcttatgatcttcaagtcttcactcctttatatagtggttagtagagagacgttgagatcttta 24882691  T
419 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24882690 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 24882591  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
24882590 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgttgaggtagtggttgtacacttgtacttt 24882494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 29589705 - 29590219
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
29589705 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaac 29589804  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29589805 acttgatatacaataagtggtgttcacattacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 29589903  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
29589904 ctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatatctcttacaaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtag 29590003  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
29590004 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcatatgaaggat 29590103  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || ||| || |||||||    
29590104 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggt 29590203  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
29590204 tgtacacttgtacttt 29590219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 3476907 - 3476414
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
3476907 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagcggt 3476808  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
3476807 gttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggc 3476709  T
322 agagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc-taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||    
3476708 agagttttagcgcttttaacttgtgttgatgtctcttttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaaagagacgttgagatttttagc 3476609  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
3476608 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccattaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctat 3476509  T
521 cttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
3476508 cttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 3476414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 26210135 - 26209622
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | |  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
26210135 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggggagagactactattcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgactttgaac 26210037  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26210036 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttataagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 26209938  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||| |||| ||| | |||||||| |||| ||||    
26209937 ctttatagaatcaaatttgacagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctctttccaatcttcaaatctttactcctttatatagaggtgagtag 26209838  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
26209837 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 26209738  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |   || || |||||| |||||||    
26209737 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggt 26209638  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
26209637 tgtacacttgtacttt 26209622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 15216050 - 15216543
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
15216050 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctattcaaacaaaattatacagaaaat-gtttgactttgaacacttgatatacaatcagtgg 15216148  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
15216149 tgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttgg 15216247  T
321 cagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | || | |||   | ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||    
15216248 cagagttttggcgcttttaacttgtgttgatttgtcttttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttag 15216347  T
420 cacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
15216348 cacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatctattgcctgatttgggtgtagtcctatgacagatcaacttcaaattcattccta 15216447  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
15216448 tcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttttacttt 15216543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 13682033 - 13682547
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa-c 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || |    
13682033 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacaccgaaaat-gtttgactttaaac 13682131  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13682132 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttatgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 13682230  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataat--gtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||    
13682231 ctttatagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatctgtctctaccaatcttcaagtcttcactcctttaaatagtggtgagta 13682330  T
399 gagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
13682331 gagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatattttgcctgatttgggtgtagtcttgtgaagga 13682430  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
13682431 ttaacttcaaattcattcccattttgaaggaacatttctgcaggaatagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 13682530  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
13682531 ttgtacacttgtacttt 13682547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 18440909 - 18441422
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||    
18440909 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaaagt-gtttgactttgaac 18441007  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
18441008 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 18441106  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||  || ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |     
18441107 ctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatttctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaa- 18441205  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
18441206 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaa 18441305  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
18441306 tcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 18441405  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
18441406 ttgtacacttgtacttt 18441422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 18418828 - 18419341
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||    
18418828 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaaagt-gtttgactttgaac 18418926  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
18418927 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 18419025  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||  || ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |     
18419026 ctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatttctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaa- 18419124  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
18419125 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaa 18419224  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
18419225 tcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggaagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 18419324  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
18419325 ttgtacacttgtacttt 18419341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 100 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 8999528 - 8999007
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttga 198  Q
    |||||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
8999528 caaatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttga 8999429  T
199 acacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
8999428 acacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaa 8999329  T
298 gtgcttt---tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtg 394  Q
    |||||||   |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
8999328 gtgctttttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtagtattgtctcccatgatcttcaagtcttcacttctttatatagaggtg 8999229  T
395 tgtagagagacgttgagatc-ttaagcacgt-ctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctat 492  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
8999228 tgtagagagacgttgagatctttaagcacatccaaaagagttgttgagaaaccttgatca-ataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctat 8999130  T
493 gaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaga 592  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||     
8999129 gaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatattgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggagg 8999030  T
593 tagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||    
8999029 tagtggttgtacacttgtacttt 8999007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12734751 - 12734240
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||  |||| || ||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||    
12734751 aatgctcaagcactaaagcaagattcttctaaggctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaagttacacagaaaat-gtttgactttgaac 12734653  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
12734652 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaataagtgcagaaattcaaagtg 12734554  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||    
12734553 ctttatagaatcaaatttggcagagtgttggcgcttttaacttgt--tgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtaagtag 12734456  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
12734455 aaagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatctcttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggat 12734356  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  |||| |  ||| ||  ||||| |||||||    
12734355 caacttcaaatttattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagttgttgtcttgtcttatagcgtagacaaaaacagagtaatggaggtagtggt 12734256  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
12734255 tgtacacttgtacttt 12734240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 102 - 500
Target Start/End: Original strand, 48381901 - 48382301
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
48381901 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacagaattacacagaaaat-gtttgactttgaac 48381999  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
48382000 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 48382098  T
301 cttttgagaattaaattt--ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgt 397  Q
    ||||  ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
48382099 ctttgtagaatcaaatttttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagt 48382198  T
398 agagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagg 497  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
48382199 agagagacgttgagatttttagcatgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaagg 48382298  T
498 atc 500  Q
    |||    
48382299 atc 48382301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 104 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 11087634 - 11087117
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
11087634 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacccagaaaattgtttgagtttgaacac 11087535  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactc--tagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
11087534 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatgcaatgcaattgaaagactctatagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagt 11087435  T
300 gcttt-tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    ||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||   |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
11087434 gctttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgatgtcttgtctcttttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgta 11087335  T
399 gagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagg 497  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
11087334 gagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagg 11087235  T
498 atcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtg 597  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||| ||| ||||| |||||    
11087234 atcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaacatttatgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagtgtagacacaagcagagtcatggaggtagtg 11087135  T
598 gttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||    
11087134 gttgtacacttgtacttt 11087117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 102 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 38403797 - 38403331
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| |  |||| | ||||| |||||| || ||||    
38403797 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaagatacagaaaaaat-gtttgattttgaac 38403699  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
38403698 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 38403600  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtg 396  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||       ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||    
38403599 ctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgctttttaacttgtgttgatatctctttttttaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtg 38403500  T
397 tagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaag 496  Q
     | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
38403499 aa-agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaag 38403401  T
497 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtag 566  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
38403400 aatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtag 38403331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 127 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 40055314 - 40054828
Alignment:
127 cttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttc 225  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
40055314 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacacagaaaaa-gtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggtgttc 40055216  T
226 acaa-tacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcaga 324  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||    
40055215 acaaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctatgtagaatcaaatt-gacaga 40055118  T
325 gtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcac 422  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||||    
40055117 gttttggcgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcccttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagcac 40055021  T
423 gtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||    
40055020 gtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcctatct 40054921  T
523 tgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
40054920 tgaaggaacatttatgcaggcatggttgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 40054828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 102 - 457
Target Start/End: Original strand, 8933277 - 8933631
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
8933277 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgactttgaac 8933375  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
8933376 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 8933474  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
8933475 ctttttagaatcaaatt-ggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatatctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtag 8933573  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccac 457  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8933574 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccac 8933631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13175195 - 13174685
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
13175195 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaattaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 13175096  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   || ||||||||| |    
13175095 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaacaatttctaagatatatcaaatgaacacaaaaattcaaaat 13174996  T
300 gcttt-tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||| |||||| |    
13174995 gctttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttattttcttgtctctactgatcttcaagtcttctctcctttatatagaggtgtg-a 13174897  T
399 gagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagg 497  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| |||||||||  || ||||||||||||    
13174896 gagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaagg 13174797  T
498 atcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagt 596  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |  || ||| |||| ||||||||| ||||    
13174796 atcacgttcaaatccattcctatcttgaagtaacatttctgcatgcaaagctgtttttcttgtcttgtagtgtagagacaatcagagtcgtggaggtagt 13174697  T
597 ggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||    
13174696 ggttgtacactt 13174685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 30049254 - 30049745
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
30049254 agagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 30049353  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
30049354 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 30049451  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  | ||| | ||||||||||||||  | |||    
30049452 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaagcgtgaa-agagacgttgagatgattagc 30049549  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||    
30049550 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 30049649  T
521 cttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
30049650 cttgaatgaacatttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 30049745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 15888894 - 15888403
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
15888894 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaattagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 15888795  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
15888794 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 15888697  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
15888696 agagttttggcgctttttaacttgtgtgtctctatctact-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 15888599  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
15888598 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 15888499  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
15888498 tcttgaaggcacaaattctgcaggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 15888403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 51 - 615
Target Start/End: Original strand, 44280155 - 44280722
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||| |||||||||||||  |    
44280155 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgca 44280254  T
148 agcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagac 247  Q
     ||||||| |||||| ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||    
44280255 ggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaat-taagac 44280353  T
248 tctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgc-ttttaacttgtg 346  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
44280354 tctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgacagagttttggcgctttttaacttgtg 44280452  T
347 ataatgtctct---accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagtt 442  Q
       ||||||||     | |||||||| |||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  |    
44280453 --tatgtctctctcttcaatcttcaattcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaat 44280549  T
443 cctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcag 541  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||    
44280550 cctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgcag 44280649  T
542 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
44280650 acatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 44280722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 31117076 - 31116585
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
31117076 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 31116977  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
31116976 gttctcaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 31116879  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||    | |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
31116878 agagttttggcgctttttaactagtgtatctctctctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagc 31116781  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||    
31116780 acgtctaaagagtcgttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 31116681  T
521 cttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
31116680 cttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 31116585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 122 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 14746235 - 14745747
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
14746235 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagttttacttgaacacttgatatacaatcagtggt 14746136  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
14746135 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 14746038  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
14746037 agagttttggcgcttttgaacttgt-atatctctgtctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcag 14745941  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||||||     
14745940 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 14745841  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgta 611  Q
    ||||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
14745840 atcttgagggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttgta 14745747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 1367364 - 1367855
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
1367364 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 1367463  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
1367464 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 1367561  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
1367562 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 1367659  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
1367660 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 1367759  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
1367760 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 1367855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 51 - 615
Target Start/End: Original strand, 540744 - 541311
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  |    
540744 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgca 540843  T
148 agcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaatt--gtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaag 245  Q
     |||||||||||||  ||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
540844 ggcaagagacttctgatcaaaca-aaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaat-aaag 540941  T
246 actctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttg 344  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||| || ||| |||||||| ||||||||| |||||     
540942 actctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtag-attcaaattgacagagttttggcgcttttgaactta 541039  T
345 tgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagttc 443  Q
    ||    | | |||  | ||||||||||||||||  | |||||||| || ||  | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||    
541040 tgtatctctatct-gcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggcgt-aaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 541137  T
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgcagg 542  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||    
541138 ctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgcagg 541237  T
543 cagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
541238 catggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 541311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 9432998 - 9433490
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
9432998 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatattcaatcagtggt 9433097  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
9433098 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 9433194  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
9433195 agagttttggcgcttttgaacttgtg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc 9433289  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
9433290 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 9433389  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
9433390 ccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 9433489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 51 - 615
Target Start/End: Original strand, 4211669 - 4212237
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
4211669 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 4211767  T
146 aaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaag 245  Q
    || |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
4211768 aa-gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgc-agaaaag 4211865  T
246 actctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttg 344  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||     
4211866 actctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgacagagttttggcgcttttgaactta 4211963  T
345 tgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcg-ttgag 440  Q
    ||   || ||||||      ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||     
4211964 tg--tatttctctatatgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaa 4212060  T
441 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgc 539  Q
     ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| | |||||||  | || ||||||||    
4212061 atcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcatttccatcttgagtgtacaaattctgc 4212160  T
540 aggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4212161 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4212237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 5685253 - 5685745
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
5685253 agagacttctaatgcacaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 5685352  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
5685353 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 5685449  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| || |||||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
5685450 agagttttggtgcttttgaacttgt----atatctctatctcatatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc 5685544  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
5685545 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 5685644  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
5685645 ccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 5685744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 9443594 - 9444086
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
9443594 agagacttctaatgctcaagcacgcaggaaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatattcaatcagtggt 9443693  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
9443694 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 9443790  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||  |||||| | ||||||||||||||  |     
9443791 agagttttggcgcttttgaacttgtg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaa-agagacgttgagataatc 9443885  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
9443886 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 9443985  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
9443986 ccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 9444085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 20989387 - 20989879
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
20989387 agagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtgat 20989486  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
20989487 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 20989583  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||| ||  | ||||||||||||||||  | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
20989584 agagttttggcgcttttgaacttgt-ata-tctctatattcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 20989680  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||     
20989681 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgcagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 20989780  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
20989781 atcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 20989879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 21770508 - 21770017
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
21770508 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 21770409  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
21770408 gttcacaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 21770311  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  |    
21770310 agagttttggcgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtctttactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgatttg 21770214  T
420 cacgtctaaagagtcgttgagt-tcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
21770213 cacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 21770114  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
21770113 atcttgaaggcacaaattctgcaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 21770017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 588947 - 589438
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || ||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
588947 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaattatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 589046  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
589047 gttcacaatacaatacgttaaa-gactctaaacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 589144  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
589145 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 589242  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
589243 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcaatcaccagtgatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 589342  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
589343 tcttgaaggcacaaattctgcaggcctagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 589438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 3165469 - 3165960
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
3165469 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 3165568  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
3165569 gttcacaatacaatacaattaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 3165666  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
3165667 agagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctctctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 3165764  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
3165765 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 3165864  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
      ||||||| || |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
3165865 ctttgaaggcacaaattctgcagacatacctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 3165960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 21003574 - 21003082
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
21003574 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtgat 21003475  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | |||||| |    
21003474 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaa-tcaatttgac 21003378  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || || ||| ||  | ||||||||||||||||  | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
21003377 agagttttggcgcttttgaacttgt-at-atctctatattcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcag 21003281  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
21003280 cacgtctaaagattcgtttgaaatccattgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 21003181  T
519 atcttgaagg-aacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
21003180 atcttgaaggtagaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 21003082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 9159465 - 9159955
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
9159465 agaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgataaacaatcagtggt 9159564  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
9159565 gttcacaatataatacgttaaa-gactctagacttttaaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 9159662  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||  | ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
9159663 agagttttggcgctttttaacttgt-ata-tctctctttcaatcttcaagtcgtcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagc 9159759  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || | ||| ||||||||||| |    
9159760 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagctttaaattcattccca 9159859  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9159860 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaga-acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9159955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6867791 - 6867299
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
6867791 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 6867692  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
6867691 gttcacaatacaatacagtaca-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 6867595  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
6867594 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 6867497  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
6867496 acgtctaaagagtcgtttgaaattctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 6867397  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
6867396 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6867299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24931169 - 24930677
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24931169 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 24931070  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
24931069 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 24930973  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
24930972 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 24930875  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
24930874 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 24930775  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24930774 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24930677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 48711057 - 48710565
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
48711057 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 48710958  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
48710957 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 48710861  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
48710860 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 48710763  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
48710762 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 48710663  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
48710662 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 48710565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 9085018 - 9085509
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
9085018 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 9085117  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
9085118 gttcacaatgcaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 9085214  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
9085215 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctctgtt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 9085312  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
9085313 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 9085412  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9085413 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9085509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 9094732 - 9095223
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
9094732 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 9094831  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
9094832 gttcacaatgcaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 9094928  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
9094929 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctctgtt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 9095026  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
9095027 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 9095126  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9095127 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9095223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 9169920 - 9170410
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
9169920 agaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgataaacaatcagtggt 9170019  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
9170020 gttcacaatataatacgttaaa-gactctagacttttaaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 9170117  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||  | ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
9170118 agagttttggcgctttttaacttgt-ata-tctctctttcaatcttcaagtcgtcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagc 9170214  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    | ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| || | ||| ||||||||||| |    
9170215 angtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcntttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttnaaattcattccca 9170314  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9170315 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtnttgtcttgtagcgtagacaga-acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9170410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6878423 - 6877931
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
6878423 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 6878324  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
6878323 gttcacaatacaatacagt-acagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 6878227  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
6878226 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 6878129  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
6878128 acgtctaaagagtcgtttgaaattctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 6878029  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
6878028 acttgaatgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6877931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 11004919 - 11005411
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
11004919 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 11005018  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
11005019 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 11005115  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
11005116 agagttttggcgcttttgaacttgtgtatatctctgt-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 11005213  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
11005214 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 11005313  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
11005314 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 11005411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 26653891 - 26653399
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
26653891 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 26653792  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
26653791 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 26653695  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |    || |||||| |    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
26653694 agagttttggcgcttttaaacttat----atatctctatcttttatcttcaagtcttcacttctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 26653600  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
26653599 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 26653500  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
26653499 ccatcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 26653400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 1987274 - 1987767
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
1987274 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 1987373  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
1987374 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 1987470  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |   ||  || |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
1987471 agagttttggcgcttttgaacttgcgtatattcctat-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 1987568  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
1987569 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 1987668  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
1987669 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 1987767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 1997895 - 1998388
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
1997895 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 1997994  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
1997995 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 1998091  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |   ||  || |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
1998092 agagttttggcgcttttgaacttgcgtatattcctat-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 1998189  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
1998190 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 1998289  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
1998290 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 1998388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 4222342 - 4222836
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
4222342 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 4222441  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
4222442 gttcacaatacaatgc-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 4222538  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||      ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
4222539 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctctatatgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 4222635  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
4222636 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 4222735  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
4222736 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 4222835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 20490741 - 20491232
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    |||||||| |||||||||||||||||||| |||     
20490741 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgactcgaacacttgatatacaatcagtggg 20490840  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
20490841 gttcacaatacaatacaattaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 20490938  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctc--tac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||  | | | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
20490939 agagttttggcgctttttaacttgt----atgtctcactgcacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatt 20491033  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
20491034 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 20491133  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
      |||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||    
20491134 tcatcttgaaggcacaaattttgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtgattgtacacttgtacttt 20491232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 40042674 - 40042183
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
40042674 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 40042575  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
40042574 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 40042478  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
40042477 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 40042381  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
40042380 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttccc 40042281  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
40042280 atcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 40042183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 40053223 - 40052732
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
40053223 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 40053124  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
40053123 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 40053027  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
40053026 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 40052930  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
40052929 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttccc 40052830  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
40052829 atcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 40052732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 42865561 - 42866054
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
42865561 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 42865660  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
42865661 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 42865757  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |   ||  || |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
42865758 agagttttggcgcttttgaacttgcgtatattcctat-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 42865855  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
42865856 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 42865955  T
520 tcttga-aggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
42865956 tcttgagttgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 42866054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 42876187 - 42876680
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
42876187 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 42876286  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
42876287 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 42876383  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |   ||  || |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
42876384 agagttttggcgcttttgaacttgcgtatattcctat-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 42876481  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
42876482 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 42876581  T
520 tcttga-aggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
42876582 tcttgagttgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 42876680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 2706178 - 2705686
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
2706178 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 2706079  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||| |    
2706078 gttcacaatacaaaacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 2705982  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
2705981 agagttttggcgcttttgaacttatgtacctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 2705884  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
2705883 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 2705784  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  | |||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
2705783 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 2705686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 8627683 - 8628175
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
8627683 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 8627782  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
8627783 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 8627879  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
8627880 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatct-tcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 8627977  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
8627978 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 8628077  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
8628078 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 8628175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 24734487 - 24734979
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24734487 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 24734586  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
24734587 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 24734683  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
24734684 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctct-taaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 24734781  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
24734782 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 24734881  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
24734882 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtacttt 24734979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 24744434 - 24744926
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24744434 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 24744533  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
24744534 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 24744630  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
24744631 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctct-taaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 24744728  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
24744729 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 24744828  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
24744829 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtacttt 24744926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 26294595 - 26294103
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
26294595 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 26294496  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
26294495 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 26294399  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
26294398 agagttttggcacttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 26294301  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
26294300 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatacaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 26294201  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
26294200 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 26294103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 26390662 - 26390170
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
26390662 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 26390563  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
26390562 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 26390466  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
26390465 agagttttggcgcttttaaacttatg----tatctctatctgaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 26390371  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
26390370 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgaattgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 26390271  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
26390270 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 26390171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 26401304 - 26400812
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
26401304 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 26401205  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
26401204 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 26401108  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
26401107 agagttttggcgcttttaaacttatg----tatctctatctgaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 26401013  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
26401012 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgaattgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 26400913  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
26400912 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 26400813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 26700220 - 26699728
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
26700220 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 26700121  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
26700120 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 26700024  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
26700023 agagttttggcgcttttaaacttat----atatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 26699929  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
26699928 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 26699829  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
26699828 ccatcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 26699729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 51 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 38594351 - 38593937
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |     
38594351 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 38594252  T
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagac 247  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
38594251 gcaagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaaaaaagtttgataatgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatgcaataaa-gac 38594153  T
248 tctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgc-ttttaacttgtg 346  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||     
38594152 tctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtacagaaattcaatgtgctttttggaatcaaa-ttgacagagtttttgcgctttttaacttgt- 38594055  T
347 ataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttc 443  Q
       || |||| |    | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
38594054 ---atatctcaatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagttgttgagttc 38593959  T
444 ctttgatcatccaccagtaatc 465  Q
    ||||||||||||||||||||||    
38593958 ctttgatcatccaccagtaatc 38593937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 8002631 - 8002138
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
8002631 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 8002532  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
8002531 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 8002435  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
8002434 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 8002338  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
8002337 cacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattccc 8002238  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
8002237 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 8002138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 8013276 - 8012783
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
8013276 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 8013177  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
8013176 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 8013080  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
8013079 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 8012983  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
8012982 cacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattccc 8012883  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
8012882 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 8012783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17950684 - 17950192
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
17950684 agagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 17950585  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
17950584 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 17950488  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | |||||||||| |||  | |||    
17950487 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgtct-gcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgcgataatcagc 17950390  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
17950389 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 17950290  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17950289 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 17950192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17961290 - 17960798
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
17961290 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 17961191  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
17961190 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 17961094  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
17961093 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgtct-gcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 17960996  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
17960995 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 17960896  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||   ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17960895 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcatagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 17960798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 37343934 - 37344426
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
37343934 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 37344033  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
37344034 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 37344130  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||  | |||||||  || ||| | ||||||||||||||  | |||    
37344131 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctct-tttatcttcaagtcttcacacctttatataagggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 37344228  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||| |    
37344229 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcttttgaagaataagcttcaaattcattccca 37344328  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
37344329 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 37344426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 468147 - 467655
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
468147 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 468048  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
468047 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 467951  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||    | ||||||      ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
467950 agagttttggtgcttttgaacttatg----tatctctatttttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 467856  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
467855 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 467756  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
467755 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 2716782 - 2716290
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
2716782 agagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 2716683  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||  | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
2716682 gttcacaatacaaaac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 2716586  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
2716585 agagttttggcgcttttgaacttatgtacctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 2716488  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||  |    
2716487 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctca 2716388  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
2716387 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 2716290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 8617120 - 8617612
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
8617120 agagacttctaatgctcaatcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtagt 8617219  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
8617220 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 8617316  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
8617317 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatct-gcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 8617414  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
8617415 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 8617514  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
8617515 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 8617612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 22088857 - 22089349
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
22088857 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 22088956  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
22088957 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 22089053  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
22089054 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-taatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 22089151  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
22089152 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 22089251  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||   ||||  | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
22089252 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatgactgtcgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 22089349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 22099472 - 22099964
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
22099472 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 22099571  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
22099572 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 22099668  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
22099669 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-taatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 22099766  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
22099767 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 22099866  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  | |||  | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
22099867 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggttgtcgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 22099964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 455365 - 454873
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
455365 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaaaagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 455266  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
455265 gttcacaatacaatacaa-aaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 455169  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||    | ||||||      ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||| ||||  |     
455168 agagttttggtgcttttgaacttatg----tatctctatttttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttaagataatc 455074  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
455073 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 454974  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
454973 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 454874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 104 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 4412598 - 4412178
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
4412598 tgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattaaacagaaaattgtttgagtttgaacac 4412499  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
4412498 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatacaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 4412399  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtg 396  Q
    ||| |  || |||  || ||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |    
4412398 gctgtgatgtgaaacaatttttgcagagtttggacgcttttaaattgt-atattgtctctcattgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgag 4412300  T
397 tagagagacgttgagatc-ttaagcacgtc-taaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatga 494  Q
     | |||| |||||||||| |||||||||||  | |||||||||  |     |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
4412299 -aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcagagagagtcgttctgaaatcttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatttggttgttgtcctatga 4412201  T
495 aggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||    
4412200 aggatcaatttcgaattcgttcc 4412178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 11095788 - 11096281
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||  |||||||||||||  | || |||||||| || ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
11095788 agagacttataatgctcaagcacgcaggcgagagacttgtaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 11095887  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
11095888 gttcacaatacaatacag-aaaagactctggacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaaattgac 11095985  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | || ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
11095986 agagttttggcgcttttgaacttatgtatttctcact-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 11096083  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
11096084 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 11096183  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
11096184 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 11096281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 104 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4433171 - 4432925
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
4433171 tgctcaagcactaaagcaagagaatttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 4433072  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatg-caataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
4433071 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgccattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaattaaaacagaaattcaaagt 4432972  T
300 gcttttga--gaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttg 344  Q
    ||||||||  ||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
4432971 gcttttgagtgacacaaatttgacagagtttgggcgctattaacttg 4432925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 166629 - 167108
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
166629 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 166728  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||             ||||||  ||||| ||||| | |    
166729 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaattcagtg-------------tgctttgtagaatcaaatt-gac 166812  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
166813 agagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 166910  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
166911 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 167010  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
167011 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 167108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 177221 - 177700
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
177221 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 177320  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||             ||||||  ||||| ||||| | |    
177321 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaattcagtg-------------tgctttgtagaatcaaatt-gac 177404  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
177405 agagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 177502  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
177503 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 177602  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
177603 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 177700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 265 - 615
Target Start/End: Original strand, 9170863 - 9171211
Alignment:
265 ctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgat 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||  | ||    
9170863 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgctttttaacttgt-ata-tctctctttcaat 9170959  T
364 cttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagta 462  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||    
9170960 cttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagcatgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagta 9171058  T
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtct 561  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
9171059 atcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtct 9171158  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9171159 tgtagcgtagacaga-acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9171211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 29589592 - 29589735
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
29589592 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatcacaaatgctcaatactatctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 29589691  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
29589692 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 29589735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8999641 - 8999498
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
8999641 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 8999542  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
8999541 aggcaagaaacttcaaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 8999498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 122 - 304
Target Start/End: Original strand, 602306 - 602491
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
602306 agagacttcagatgctcaagcactaaagcaagagacttctaattcaaacagaattacatagaaaattgtttgaatttgaacacttgatatacaatcagtg 602405  T
220 gtgttcacaatacaatgc-aataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||    
602406 gtgttcacaatacaatgcaaataacagactcttgactttagaatttctaagatttatcaaatgtgtacagaaattctaagtgcttt 602491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 8933168 - 8933307
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
8933168 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 8933263  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
8933264 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 8933307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 13681924 - 13682063
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
13681924 ccttgcacttcgaaggagatttccactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 13682019  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13682020 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 13682063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3477036 - 3476897
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
3477036 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 3476941  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
3476940 gcgagagacttccaatgcttaagcactaaagcaagagtcttcta 3476897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12734860 - 12734729
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
12734860 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 12734765  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaaga 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12734764 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaaga 12734729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26210244 - 26210105
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
26210244 ccttgcacttccaaggagattcccactaa----taatcacacagattacagatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 26210149  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
26210148 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 26210105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 15215920 - 15216060
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
15215920 ccttgcacttccaaggagattttaactaa---ataatcacacagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 15216016  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
15216017 gcgagagacttccaatgctaaagcactaaagcaagagtcttcta 15216060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 445 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 19986058 - 19985887
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggc 543  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
19986058 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggc 19985959  T
544 agagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | || |||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19985958 atagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19985887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11087750 - 11087608
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
11087750 ccttgcacttccaaggcgatttccgctaagtt-taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 11087652  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
11087651 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 11087608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 18418718 - 18418858
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18418718 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgca 18418813  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
18418814 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 18418858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 18440799 - 18440939
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18440799 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgca 18440894  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
18440895 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 18440939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13175311 - 13175169
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
13175311 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacacagattacaactgctcagtactacacctagtctgagacttcacaaatgctcaagcacgc 13175213  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
13175212 aggctatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 13175169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 48381790 - 48381931
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
48381790 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 48381885  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
48381886 aggcgagggacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 48381931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 500 - 615
Target Start/End: Original strand, 8933631 - 8933746
Alignment:
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
8933631 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 8933730  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
8933731 tgtacacttgtacttt 8933746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 38403908 - 38403767
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| | |||||||||||    
38403908 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatactcaagcacgc 38403813  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
38403812 aggcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 38403767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13473104 - 13473002
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13473104 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagcctgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 13473005  T
232 caa 234  Q
    |||    
13473004 caa 13473002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 11792449 - 11792562
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
11792449 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaatagaattacacaaaaaattgtttgaggttgaacacttggtatacaatcaatgg 11792548  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
11792549 tgttcacaatacaa 11792562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7488522 - 7488414
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
7488522 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 7488423  T
221 tgttcacaa 229  Q
    |||||||||    
7488422 tgttcacaa 7488414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13034444 - 13034342
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
13034444 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 13034345  T
232 caa 234  Q
    |||    
13034344 caa 13034342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 5034926 - 5035039
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
5034926 agagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagatacttctagacaaacaaaattatacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaataagtgg 5035025  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
5035026 tgttcacaatacaa 5035039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13027519 - 13027406
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
13027519 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 13027420  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| |||||||    
13027419 tgttcataatacaa 13027406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17064225 - 17064085
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
17064225 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 17064131  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17064130 aagcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 17064085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13172970 - 13172858
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttg-acttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| |||    
13172970 agagacttcctatactcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaa-tgtttgtggttgaacacttgatatacaatcagtgg 13172872  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| |||||||    
13172871 tgttcaaaatacaa 13172858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12174959 - 12174844
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
12174959 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacataattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 12174860  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
12174859 ggtgttcacaatacaa 12174844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 13302399 - 13302514
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
13302399 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 13302498  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
13302499 ggtgttcacaatacaa 13302514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13731293 - 13731178
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
13731293 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaat 13731194  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
13731193 ggtgttcacaatacaa 13731178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 15088087 - 15088202
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
15088087 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 15088186  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
15088187 ggtgttcacaatacaa 15088202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16557209 - 16557094
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
16557209 agagacttcgaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 16557110  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
16557109 ggtgttcacaatacaa 16557094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 16608453 - 16608568
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
16608453 agagacttcgaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 16608552  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
16608553 ggtgttcacaatacaa 16608568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 22099369 - 22099482
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |    
22099369 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacgcatgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 22099467  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
22099468 agcaagagacttcta 22099482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 501 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 38593923 - 38593809
Alignment:
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||| |  ||| || ||| || ||||||||    
38593923 aacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatgactgttatcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggtt 38593824  T
601 gtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||    
38593823 gtacacttgtacttt 38593809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18362172 - 18362031
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatac 232  Q
    |||||||| ||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18362172 atgctcaaccacaaaatctagaggcttctaaacaaacaaaattacacagaaagatgtttgatttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatac 18362073  T
233 aatgca-ataaaagactctagacttaagaatttctaagatat 273  Q
    ||  || |||||| |||  |||||  ||||||||||||||||    
18362072 aaatcagataaaacacttaagactctagaatttctaagatat 18362031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4412714 - 4412573
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || |||||||||||     
4412714 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcaca 4412617  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
4412616 caggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 4412573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 8182480 - 8182583
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
8182480 tgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 8182579  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
8182580 acaa 8182583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16310525 - 16310410
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttga--acacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||     
16310525 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacacaaaaaattgtttgaggttgaacacacttgatatacaatcaaa 16310426  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
     ||||| |||||||||    
16310425 tgtgtttacaatacaa 16310410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16315154 - 16315043
Alignment:
126 acttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
16315154 acttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacacaaaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtg 16315055  T
223 ttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||    
16315054 ttcacaatacaa 16315043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24795322 - 24795219
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
24795322 tgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 24795223  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
24795222 acaa 24795219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28622978 - 28622863
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
28622978 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagacacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 28622879  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
28622878 ggtgttcacaatacaa 28622863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48063431 - 48063316
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
48063431 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 48063332  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
48063331 ggtgttcacaatacaa 48063316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 166526 - 166639
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
166526 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 166624  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
166625 agcaagagacttcta 166639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 177118 - 177231
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
177118 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 177216  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
177217 agcaagagacttcta 177231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 9084915 - 9085028
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9084915 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9085013  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9085014 agcaagagacttcta 9085028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 9094629 - 9094742
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9094629 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9094727  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9094728 agcaagagacttcta 9094742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 9432895 - 9433008
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttccca--aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9432895 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9432993  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9432994 agcaagagacttcta 9433008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 9443491 - 9443604
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttccca--aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9443491 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9443589  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9443590 agcaagagacttcta 9443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 22088754 - 22088867
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||| |    
22088754 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcatgcatgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 22088852  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
22088853 agcaagagacttcta 22088867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26653994 - 26653881
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
26653994 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 26653896  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
26653895 agcaagagacttcta 26653881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26700323 - 26700210
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
26700323 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 26700225  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
26700224 agcaagagacttcta 26700210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 37343831 - 37343944
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
37343831 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 37343929  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
37343930 agcaagagacttcta 37343944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 48711160 - 48711047
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
48711160 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 48711062  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
48711061 agcaagagacttcta 48711047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 4494115 - 4494229
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaa-gagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||    
4494115 agagacttcttatgctcaagcacaattgcaaagagacttctaatcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacagtcagtg 4494214  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
4494215 gtgttcacaatacaa 4494229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13261223 - 13261118
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac--ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcaca 228  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
13261223 aatgctcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacaaaattacacagaaaattgtttgcgggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 13261124  T
229 atacaa 234  Q
    ||||||    
13261123 atacaa 13261118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16308350 - 16308218
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga--cttgaac 200  Q
    |||||||||||| || |  |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||    
16308350 atgctcaagcacacacgtaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagtaagagacttctaatcaaacagaattacacataaaa-tgtttgaggtttgaac 16308252  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
16308251 actatatatacaatcagtggtgttcacgatacaa 16308218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16317173 - 16317063
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
16317173 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagactactattcgaacataattacatagaaaattgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtgg 16317074  T
221 tgttcacaata 231  Q
    |||| ||||||    
16317073 tgtttacaata 16317063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29935962 - 29935849
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
29935962 agagacttttaatgctcaagcataactgcaagagacttctaattcaaacagaattac-cagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 29935864  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
29935863 gtgttcacaatacaa 29935849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39285154 - 39285068
Alignment:
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
39285154 gcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacatttgatatacaatcagtggtgtccacaatacaa 39285068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 14424993 - 14425109
Alignment:
122 agagacttccaat-gctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||     
14424993 agagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcag 14425092  T
218 tggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||    
14425093 tggtgttcacaatacaa 14425109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16112504 - 16112392
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
16112504 agagacttctactgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 16112405  T
219 ggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||    
16112404 ggtgttcacaata 16112392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 234
Target Start/End: Original strand, 16472211 - 16472342
Alignment:
101 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaac 200  Q
    |||| ||||||||| || || ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||   |||||  ||||||    
16472211 aaatactcaagcacacaagcaagagatttcccatgctcaaccacaaaagcaagagacttataa-caaaca-aattacacagaaataagtttggtttgaac 16472308  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
16472309 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 16472342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24931273 - 24931159
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
24931273 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact- 24931175  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
24931174 aagcaagagacttcta 24931159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26294699 - 26294585
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
26294699 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 26294601  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
26294600 aagcaagagacttcta 26294585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 331189 - 331304
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||      
331189 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagc 331288  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
331289 ggtgttcataatacaa 331304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2914229 - 2914114
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |    
2914229 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaattagt 2914130  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
2914129 ggtgttcacaatacaa 2914114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10883790 - 10883675
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   ||||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
10883790 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacagaattataaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 10883691  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
10883690 ggtgttcacaatacaa 10883675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 14187240 - 14187343
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
14187240 tgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattgcatagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 14187339  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
14187340 acaa 14187343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 16411544 - 16411651
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
16411544 agagacttactatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattaaaaagaaaa-tgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 16411642  T
221 tgttcacaa 229  Q
    |||||||||    
16411643 tgttcacaa 16411651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 27871255 - 27871370
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
27871255 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttttaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 27871354  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
27871355 ggtgttcacaatacaa 27871370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32265339 - 32265224
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |    
32265339 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacccttgatatacaatcagt 32265240  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
32265239 ggtgttcacaatacaa 32265224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40055422 - 40055323
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
40055422 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 40055323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 468250 - 468137
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
468250 ataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 468152  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
468151 agcaagagacttcta 468137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 588844 - 588957
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||| |    
588844 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgttcaagcact-a 588942  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
588943 agcaagagacttcta 588957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 2499587 - 2499690
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
2499587 atgctcaagcacaactacaagagacttctaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 2499686  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
2499687 acaa 2499690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2706283 - 2706168
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
2706283 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 2706184  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
2706183 -aagcaagagacttcta 2706168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 5685150 - 5685263
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
5685150 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagatttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 5685248  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
5685249 agcaagagacttcta 5685263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6867894 - 6867781
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
6867894 ataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 6867796  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
6867795 agcaagagacttcta 6867781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6878526 - 6878413
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
6878526 ataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 6878428  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
6878427 agcaagagacttcta 6878413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17950789 - 17950674
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
17950789 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17950690  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
17950689 -aagcaagagacttcta 17950674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17961395 - 17961280
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
17961395 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17961296  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
17961295 -aagcaagagacttcta 17961280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 21691913 - 21691984
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
21691913 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgaaatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21691984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 24734382 - 24734497
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
24734382 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 24734481  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
24734482 -aagcaagagacttcta 24734497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 24744329 - 24744444
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
24744329 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 24744428  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
24744429 -aagcaagagacttcta 24744444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40042779 - 40042664
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
40042779 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 40042680  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
40042679 -aagcaagagacttcta 40042664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40053328 - 40053213
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
40053328 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 40053229  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
40053228 -aagcaagagacttcta 40053213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2501646 - 2501517
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacact 203  Q
    ||||||||||| || || ||||| || | |||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||||  ||||||| |||| |  |||||| |||||||||    
2501646 tgctcaagcacacaagcaagagattttctatgctcaaacacaaaatcaagagacttctaaacaaacgaaattacaaagaataa-gtttgagttgaacact 2501548  T
204 tgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
2501547 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 2501517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19237642 - 19237540
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
19237642 atgctcaagcacataagcaagagacttctattcaaactaaattataaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 19237543  T
232 caa 234  Q
    |||    
19237542 caa 19237540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41843015 - 41842929
Alignment:
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
41843015 gcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgatcaaaatacaa 41842929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 1292595 - 1292683
Alignment:
149 gcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
1292595 gcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaa 1292683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 8617016 - 8617130
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   | ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
8617016 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 8617114  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
8617115 aagcaagagacttcta 8617130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 455 - 567
Target Start/End: Original strand, 21695282 - 21695395
Alignment:
455 caccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta- 553  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   ||||||||||||  |||||||||||||||||     
21695282 caccaataatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacaatgttgcaggcagagctgttat 21695381  T
554 tcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||||||||||||    
21695382 tcttgtcttgtagc 21695395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 11318944 - 11319059
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |   ||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
11318944 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagactttcaaattcaaacagatttacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 11319043  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
11319044 ggtgttcacaatacaa 11319059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12367354 - 12367246
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| |||    
12367354 agagacttctaatgctcaagcacaactctaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaattattgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 12367255  T
221 tgttcacaa 229  Q
    |||||||||    
12367254 tgttcacaa 12367246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15705107 - 15704993
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
15705107 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctcaattcaaatagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 15705009  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
15705008 ggtgttcacaatacaa 15704993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21382048 - 21381933
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  || ||||||||||  | |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
21382048 agagacttctattgctcaagcacaactgcgagagacttcttaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagt 21381949  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
21381948 ggtgttcacaatacaa 21381933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48806499 - 48806384
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| || |    
48806499 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgatgttgaacacttgatatacaagcagt 48806400  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
48806399 ggtgttcacaatacaa 48806384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 1367261 - 1367374
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
1367261 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 1367359  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
1367360 agcaagagtcttcta 1367374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 1987170 - 1987284
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
1987170 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 1987268  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
1987269 -aagcaagagacttcta 1987284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 1997791 - 1997905
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
1997791 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 1997889  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
1997890 -aagcaagagacttcta 1997905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2716887 - 2716772
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaa----atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||    |||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||||    
2716887 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatggtcaagcact 2716788  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
2716787 -aagcaagagacttcta 2716772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 3165366 - 3165479
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
3165366 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 3165464  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
3165465 agcaagagtcttcta 3165479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 4222238 - 4222352
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
4222238 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 4222336  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
4222337 -aagcaagagacttcta 4222352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8002735 - 8002621
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaa----atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
8002735 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 8002637  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
8002636 -aagcaagagacttcta 8002621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8013380 - 8013266
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaa----atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
8013380 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 8013282  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
8013281 -aagcaagagacttcta 8013266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 11004815 - 11004929
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
11004815 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 11004913  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
11004914 -aagcaagagacttcta 11004929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 13683136 - 13683250
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||    
13683136 agagacttctaatactcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttaacacttgatatacaatcagtg 13683235  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||| |||||||    
13683236 gtgttcaaaatacaa 13683250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15888997 - 15888884
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
15888997 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 15888899  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
15888898 agcaagagtcttcta 15888884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 20490638 - 20490751
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
20490638 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 20490736  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
20490737 agcaagagtcttcta 20490751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 20989284 - 20989397
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
20989284 ataatcacaaagattacagatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 20989382  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
20989383 agcaagagacttcta 20989397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21003677 - 21003564
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
21003677 ataataacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 21003579  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
21003578 agcaagagacttcta 21003564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21770611 - 21770498
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
21770611 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 21770513  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
21770512 agcaagagtcttcta 21770498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26390767 - 26390652
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
26390767 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 26390668  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
26390667 -aagcaagagacttcta 26390652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26401409 - 26401294
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
26401409 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 26401310  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
26401309 -aagcaagagacttcta 26401294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 30049151 - 30049264
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
30049151 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 30049249  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
30049250 agcaagagtcttcta 30049264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31117179 - 31117066
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| | |    
31117179 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaat-a 31117081  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
31117080 agcaagagacttcta 31117066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 42865457 - 42865571
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
42865457 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 42865555  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
42865556 -aagcaagagacttcta 42865571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 42876083 - 42876197
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
42876083 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 42876181  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
42876182 -aagcaagagacttcta 42876197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13902230 - 13902136
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
13902230 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacataattataaagaaaattgtttgaggttgaactcttgatatacaatc 13902136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Original strand, 21692176 - 21692322
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||    
21692176 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacaatgttgcaggcagagatgttatacttgtct 21692275  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||||    
21692276 tgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 21692322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22579855 - 22579719
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-tt 196  Q
    |||||||||||||||    || ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||  ||||||||| |||||| |||||||  ||    
22579855 caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcta-tgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaagaagaattacaaagaaaaatgtttgaggtt 22579757  T
197 gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22579756 gaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22579719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25687446 - 25687345
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
25687446 atgctcaagcacaactgcaagagacttttattcaaacataattacaaagaaaat-gtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcccaata 25687348  T
232 caa 234  Q
    |||    
25687347 caa 25687345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4433244 - 4433149
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaga 156  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
4433244 gattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 4433149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9098851 - 9098738
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
9098851 agagactttctatactcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaatagaattgcaaataaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtgg 9098752  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    | ||||||||||||    
9098751 tattcacaatacaa 9098738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9099657 - 9099544
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
9099657 agagactttctatactcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaatagaattgcaaataaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtgg 9099558  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    | ||||||||||||    
9099557 tattcacaatacaa 9099544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13260903 - 13260738
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||  ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||| |  |||||||    
13260903 ctttgatcattcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggc 13260804  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||   ||| ||||||||||||||   ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
13260803 agaggcattattcttgtcttgtagcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacactt 13260738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19711605 - 19711517
Alignment:
149 gcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
19711605 gcaagagacttctaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 19711517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33692317 - 33692206
Alignment:
125 gacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||||| || |||||||||| |   ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
33692317 gacttctaacgctcaagcacaactacaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggt 33692219  T
222 gttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||    
33692218 gttcacaatacaa 33692206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9710423 - 9710309
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||| |    
9710423 agagacttctaattctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaagttgaacacttgagatacgatcagt 9710325  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
9710324 ggtgttcacaatacaa 9710309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 25806919 - 25807046
Alignment:
106 ctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttg 205  Q
    ||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||| | |||||   |||||  |||||||||||    
25806919 ctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaaca-aattataaagaaataagtttggtttgaacacttg 25807017  T
206 atatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||    
25807018 atatacaatcagtgatgttcataatacaa 25807046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 9159362 - 9159475
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9159362 ataatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9159460  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
9159461 agcaagaggcttcta 9159475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 9169817 - 9169930
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9169817 ataatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9169915  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
9169916 agcaagaggcttcta 9169930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 13263322 - 13263426
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||  |||    
13263322 agagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta-tcaaacag-attacaaagaata-agtttgagatgaacacttgatatacaatcagaggt 13263418  T
222 gttcacaa 229  Q
    ||| ||||    
13263419 gtttacaa 13263426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 15467456 - 15467569
Alignment:
123 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||| || ||| ||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
15467456 gagacatctaatactcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacaaaattaca-agaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtg 15467554  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
15467555 gtgttcacaatacaa 15467569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 16112130 - 16112007
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| ||    
16112130 gtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattatgaaggaacatcgttgcaggcagagctgttttccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagt 16112031  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||||||||||||||||||||    
16112030 agtggagatagtggttgtacactt 16112007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 8627578 - 8627693
Alignment:
51 ataatcacacagattaca-actgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||  || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
8627578 ataatcacaaagattacatactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 8627677  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
8627678 -aagcaagagacttcta 8627693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 331515 - 331680
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | || ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||  ||||||||||    |||||||    
331515 ctttgatcaatcaccaatgatattttgcctgatttggttgatgtcctatgaaggatcaatttgaaaaccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggc 331614  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||||    
331615 agagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacactt 331680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21283992 - 21283887
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttg-acttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| | ||    
21283992 agagacttcaaatgctagagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacatagaaaaatgtttgcagttgaacacttgatatacaattagtg 21283893  T
220 gtgttc 225  Q
    ||||||    
21283892 gtgttc 21283887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23280552 - 23280465
Alignment:
149 gcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
23280552 gcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgattgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 23280465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 30944611 - 30944446
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| ||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||  ||| |||||| |  |||||||    
30944611 ctttgatcaatcaccagtgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgagggaacattgttgcaggc 30944512  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
30944511 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30944446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 230
Target Start/End: Original strand, 44466631 - 44466712
Alignment:
150 caagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
44466631 caagagacttctgataaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 44466712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5001444 - 5001349
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaat 214  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||    
5001444 agagacttctaatactcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacagttaatatacaat 5001349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 13645929 - 13646044
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |  |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |    
13645929 agagacttttaatactcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaataagt 13646028  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||| ||||||||||||    
13646029 ggttttcacaatacaa 13646044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #219
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 230
Target Start/End: Original strand, 13879713 - 13879820
Alignment:
126 acttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    ||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
13879713 acttctaattctcaagcacaactgcaagagacttctaaaatcaaacagaattataaagaaaaatatttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtg 13879812  T
223 ttcacaat 230  Q
    ||||||||    
13879813 ttcacaat 13879820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #220
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 14426098 - 14426200
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
14426098 tgctcaagcacaactgcaagagacttttgaattcaaacaaaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 14426196  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
14426197 acaa 14426200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #221
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14746339 - 14746225
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaa-gcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||| || || |||| |||||||||||||| ||||     
14746339 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacact- 14746241  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
14746240 aagcaagagacttcta 14746225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #222
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19328632 - 19328518
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||| |    
19328632 agagacttctagtgctcaagcacaactgcaagtgacttctaaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggtttaacacttgatatataatcagt 19328534  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
19328533 ggtgttcacaatacaa 19328518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #223
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19339856 - 19339753
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
19339856 tgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacataattacaatgaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcataat 19339757  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
19339756 acaa 19339753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #224
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 28622644 - 28622520
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||    
28622644 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggc 28622545  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
28622544 agagctgtttttcttgtcttgtagc 28622520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #225
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 33421288 - 33421401
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| |    
33421288 agagacttctattgctcaagcacaattgcaagagacttctcaattcaaacagaattata-agaaaaatgtttgaggttgaacactt-atatacaatcagt 33421385  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
33421386 ggtgttcacaatacaa 33421401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #226
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23280228 - 23280081
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||  | |||||||| ||||| || ||||||||    
23280228 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggcatagctgtttttcttgtct 23280129  T
562 tgtagc-gaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||| |||   | |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
23280128 tgtagcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 23280081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #227
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 29935604 - 29935481
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||| |   |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||  |   ||    
29935604 gtcctatgaaggattaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagt 29935505  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||||||||||||||||||||    
29935504 agtggagatagtggttgtacactt 29935481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #228
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16105604 - 16105470
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| |||||| || || || ||||| || | |||||||||||  ||||  ||| |||||||  |||| | ||||||||| |||  ||||||  |||||    
16105604 caaatactcaagtacacaagcaagagattttctatgctcaagcaaaaaagttagatacttctaaacaaataaaattacacaaaaagatgtttggtttgaa 16105505  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
16105504 cacttgatatacaatgagtggtgttcacaatacaa 16105470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #229
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Original strand, 30025794 - 30025940
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | ||||| | ||||||||||| ||||||| |||||  ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
30025794 atcttttgcctgatatggttatagtcatctgaaggatcaatttcaaatccattctaattgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtct 30025893  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   ||||||  | | || || |||||| |||||||||||||    
30025894 tgtagcagagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacactt 30025940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #230
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 33604445 - 33604541
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 216  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
33604445 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgatgttgaacacttgatatacaatca 33604541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #231
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 455415 - 455355
Alignment:
101 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
455415 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 455355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #232
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 11792777 - 11792942
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||  |   |||||||||| |  |||||||    
11792777 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcatatccattcaaagtatgaaggaacattgttgcaggc 11792876  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | |||||||| ||||||||||||||   ||||||  |   || |||||||||||||||||||||||    
11792877 aaagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacactt 11792942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #233
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13138183 - 13138018
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | |||||||| |||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||    
13138183 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgtaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 13138084  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   |||| |  | | ||  ||||||||||||||||||||||    
13138083 agagctgttatccttgtcttgtagcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacactt 13138018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #234
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 13302681 - 13302845
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||    
13302681 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc-agtatgtaggaacattgttgcaggc 13302779  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||||||| |||||||||||||   ||||||  | | || |||| ||||||||||||||||||    
13302780 aaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactt 13302845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #235
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 41842561 - 41842396
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | |  |||||||||||||||| ||||||| |||||| |   | |||||||| |  |||||||    
41842561 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattatcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtataaaggaacattgttgcaggc 41842462  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||||  | | || ||| || ||||||||||||||||    
41842461 agagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacactt 41842396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #236
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 231
Target Start/End: Original strand, 9802700 - 9802829
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaac-agaattacacagaaa--attgtttgacttgaa 199  Q
    |||||||||||| || || |||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| ||  ||||| |||||||||  ||||  ||||||| | |||||    
9802700 atgctcaagcacacaagcaagagacttcacatgctcaagcacacaagcaagacacttataa-caaactagaattacaaggaaataattgttt-agttgaa 9802797  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
9802798 cacttgatatacaataagtggtgttcacaata 9802829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #237
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13138516 - 13138401
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||| |   ||||||| ||| |||  ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| |    
13138516 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaggcttccaaattcaaacaaaatcacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacatgatatacaatcagt 13138417  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
13138416 ggtgttcacaatacaa 13138401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #238
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Original strand, 13879975 - 13880139
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||  ||||| ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||     
13879975 tttgatcaatcaccaataatctttttcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcg 13880074  T
545 gagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||    | || |||||||||||||||||||||||    
13880075 gagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacactt 13880139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #239
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30945978 - 30945864
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||| |||||||| |  |||||||| |  ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
30945978 agagacttctattgctcaagcacaactgcaaaagacttctcgattcaaacagtaacaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 30945880  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
30945879 ggtgttcacaatacaa 30945864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #240
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1878886 - 1878763
Alignment:
109 aagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc-tagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgat 207  Q
    |||||| || || ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||| |  ||| |  |||||||||||||    
1878886 aagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaacagacttcctaaacaaaca-aattacaaagaataaggttgg--ttgaacacttgat 1878790  T
208 atacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    
1878789 atacaatcagtggtgttcacagtacaa 1878763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #241
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Original strand, 4821098 - 4821137
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
4821098 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 4821137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #242
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Original strand, 11015575 - 11015614
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
11015575 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 11015614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #243
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12222977 - 12222899
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct-agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
12222977 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttaacaatacaaaacaat-ttagactctaagacttaagaattactaagatat 12222899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #244
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 490 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 48237144 - 48237025
Alignment:
490 tatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtg 588  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||  || |||    
48237144 tatgaagggtcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtg 48237045  T
589 gagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||| ||||||||||||||||    
48237044 gaggtagtggttgtacactt 48237025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #245
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 2913896 - 2913731
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcagg 542  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || | || |||| || |  ||||||    
2913896 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattcc-atgtatgtaggatcattgttgcagg 2913798  T
543 cagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
2913797 cagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 2913731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #246
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 210
Target Start/End: Original strand, 23125465 - 23125573
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  ||||||  |||||    
23125465 caaatactcaagcacacaagcaagagatttctaatgctcaagcccaaaagtaagagacttctaaacaaaca-aattacaaagaaatatgtttg-gttgaa 23125562  T
200 cacttgatata 210  Q
    |||||||||||    
23125563 cacttgatata 23125573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #247
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 44466933 - 44467099
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcagg 542  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | ||||||||||    ||||||    
44466933 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaatttgtgaaggaacatcgttgcagg 44467032  T
543 cagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    || ||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
44467033 catagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 44467099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #248
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48237460 - 48237387
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttga 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
48237460 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttga 48237387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #249
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 467 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 2266587 - 2266502
Alignment:
467 tttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtt 552  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||| |  ||||||||||||||||    
2266587 tttgtctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcctattaagaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 2266502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #250
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 4821344 - 4821509
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | || ||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||   |||| ||  |||||||||| |  || ||||    
4821344 ctttgatcaatcaccaatgatattttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccattgtgaaggaacattgttgtaggc 4821443  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
4821444 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4821509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #251
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 546 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6044354 - 6044285
Alignment:
546 agctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
6044354 agctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6044285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #252
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 271
Target Start/End: Original strand, 9762208 - 9762376
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaaca-gaattacacagaaa--attgtttgacttgaa 199  Q
    ||||||||| || || || |||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| ||  |||||| ||||||||  ||||  ||||||| | |||||    
9762208 atgctcaagtacacaagcaagagacttcacatgctcaagcacacaagcaagaaacttataa-caaacaagaattacaaggaaataattgttt-agttgaa 9762305  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaata--aaagactctagacttaagaatttctaagat 271  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   ||||    |||||||| |||||||||||||||||||    
9762306 cacttgatatacaataagtggtgttcacaatagaa---aatatgtcagactctatacttaagaatttctaagat 9762376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #253
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 10883442 - 10883337
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||    
10883442 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagatctgttattcttgtct 10883343  T
562 tgtagc 567  Q
    ||||||    
10883342 tgtagc 10883337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #254
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13018793 - 13018628
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||| | |  ||||| |    
13018793 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaaaattgttgcagtc 13018694  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
      |||||||| ||||||| ||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
13018693 gtagctgttattcttgtcctgtagcacagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 13018628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #255
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 13034130 - 13034057
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
13034130 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc 13034057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #256
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 30945644 - 30945479
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| |  |||||||    
30945644 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattctgagggaacattgttgcaggc 30945545  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||  || |||||| ||||||||||||||||    
30945544 atagctgtttttcttgtcttgtagctgagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 30945479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #257
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 464 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 33691980 - 33691835
Alignment:
464 tcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtctt 562  Q
    ||||||| ||||| ||| | | |||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||| || |||||||||    
33691980 tcttttgcctgatatggttattgtcccatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtctt 33691881  T
563 gtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||   |||| |  ||| || |||||| |||||||| |||||||    
33691880 gtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacactt 33691835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #258
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35953277 - 35953190
Alignment:
149 gcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
35953277 gcaagagacttctgaattcaaacagaattaca-agaaaaatatttgaggttgaacacttgatattcaatcagtgatgttcacaatacaa 35953190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #259
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 567
Target Start/End: Original strand, 4494447 - 4494571
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||  ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||| |    |||||||    
4494447 ctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaaaatcgttgcaggc 4494546  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
4494547 agagctgtttttcttgtcttgtagc 4494571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #260
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 568
Target Start/End: Original strand, 602636 - 602759
Alignment:
446 ttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcag 545  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||  | ||||||| |||||  |  |||| |||||| ||||||||||||    
602636 ttgatcaagcaccaatgatcctttgcctgatttggatatagtcctatgaagaattgatttcaaatccattctgaatttgagggaacatttctgcaggcag 602735  T
546 agctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||| || ||||||| |||||||    
602736 agctgtttttcttgtcctgtagcg 602759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #261
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2266059 - 2266020
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
2266059 ttgaacatttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 2266020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #262
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 567
Target Start/End: Original strand, 13683482 - 13683589
Alignment:
461 taatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgt 559  Q
    |||||||||| ||||| |||   | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||||||| |  ||||||||||| |||| | |||||    
13683482 taatcttttgcctgatatggtcattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcctagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttttccttgt 13683581  T
560 cttgtagc 567  Q
    ||||||||    
13683582 cttgtagc 13683589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #263
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19237310 - 19237255
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
19237310 atcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcct 19237255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #264
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 602174 - 602235
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacaca-gattacaactgctcaatac 80  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
602174 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagta-taatcacacaagattacaactgctcaatac 602235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #265
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 486 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 16545929 - 16545847
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagct-gttatcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||  || ||||||||||||||    
16545929 gtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagc 16545847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #266
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 486 - 567
Target Start/End: Original strand, 16619733 - 16619815
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagct-gttatcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||  || ||||||||||||||    
16619733 gtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagc 16619815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #267
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17064115 - 17064021
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt 196  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||||||    
17064115 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgactt 17064021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #268
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 162
Target Start/End: Original strand, 23125435 - 23125497
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||| |||||    
23125435 caaatgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcta 23125497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #269
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 39284833 - 39284739
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatctt 557  Q
    |||||||| ||||| ||| | | || |||||||||||||| ||||||| | |||| |   ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
39284833 atcttttgcctgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatccgttccaagtatgaaggaacaatgttgcaggcatagctgttatctt 39284739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #270
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Original strand, 9065110 - 9065151
Alignment:
185 attgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttca 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
9065110 attgtttgaattgaacacttgatatacaatcagtgatgttca 9065151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #271
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 163
Target Start/End: Original strand, 19141888 - 19141929
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
19141888 agagacttccaatgctcaagcacacaagcaaaagacttctag 19141929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #272
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 163
Target Start/End: Original strand, 20741287 - 20741328
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
20741287 agagacttccaatgctcaagcacacaagcaaaagacttctag 20741328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #273
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 517
Target Start/End: Original strand, 28408909 - 28408982
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
28408909 ctttgatcaatcaccaataatcttttgtctgatatggttattgtcctctaaaggatcaatttcaaatccattcc 28408982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #274
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3476897 - 3476869
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
3476897 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 3476869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #275
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8002621 - 8002593
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
8002621 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 8002593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #276
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8013266 - 8013238
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
8013266 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 8013238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #277
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 9802671 - 9802727
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
9802671 tgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 9802727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #278
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Original strand, 11095744 - 11095795
Alignment:
107 tcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
11095744 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 11095795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #279
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11572864 - 11572808
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaga 156  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||    
11572864 caaatgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagaga 11572808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #280
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 487 - 606
Target Start/End: Original strand, 15467829 - 15467949
Alignment:
487 tcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtc 585  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||| || |||||||||||    |||||| | ||||| || ||||||||||||||   |||| | |||| ||     
15467829 tcctatgaaggctcaatttcaaatccattcccattttgaaggaacatcgttgcaggtaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaattcagagta 15467928  T
586 gtggagatagtggttgtacac 606  Q
    |||||| || |||||||||||    
15467929 gtggaggtaatggttgtacac 15467949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #281
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25212519 - 25212471
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
25212519 ataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttc 25212471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #282
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26653881 - 26653853
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
26653881 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 26653853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #283
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26700210 - 26700182
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
26700210 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 26700182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #284
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Original strand, 30025448 - 30025558
Alignment:
126 acttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    ||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||  | ||||| | ||||||| ||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||    
30025448 acttctaatgctcaaacacaactgcaagagacttcttaattcaaaaaaaattacaaagaaaat-gtttgatgttgaacagttgatatacaattagtggtg 30025546  T
223 ttcacaatacaa 234  Q
    |||| |||||||    
30025547 ttcagaatacaa 30025558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #285
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 40042664 - 40042636
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
40042664 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 40042636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #286
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 40053213 - 40053185
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
40053213 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 40053185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 502; Significance: 0; HSPs: 263)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 19289962 - 19289385
Alignment:
39 ttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19289962 ttccactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctc 19289863  T
139 aagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttg-aacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
19289862 aagcactaaaggaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttttaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgc 19289763  T
238 aataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttt 337  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
19289762 aataaaagactctggacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcagagtttggacgcttt 19289663  T
338 taacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt 437  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19289662 taacttgtgataacgtctctactgatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt 19289563  T
438 gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattct 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19289562 gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttggatgtagtcctatgaaggatcgacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattct 19289463  T
538 gcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
19289462 gcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19289385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 31931018 - 31931614
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31931018 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 31931117  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
31931118 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 31931217  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
31931218 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaattt 31931317  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
31931318 ggcagagttttggcgcttttaacttgtgttcatgtctctttagatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtaagtagagagacgttgagatcttta 31931417  T
419 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31931418 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatattttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 31931517  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
31931518 aacttgaaggaacaattctgcaggcagagttgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 31931614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 18554865 - 18555461
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18554865 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 18554964  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
18554965 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 18555064  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
18555065 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaattt 18555164  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| || |    
18555165 ggtagagtttgggcgcttttaacttgtgttgatgtctctgtcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattttta 18555264  T
419 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
18555265 gcacatctaaagagtcgttgagttccttagatcatccacgagtaaacttttgcctgatttgggtgtagtcctacgaaggatcaacttcaaattcattcct 18555364  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
18555365 atcttgagggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18555461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12953731 - 12953135
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
12953731 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaattgctcaatactatctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 12953632  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
12953631 gctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaggcttctaatcaaacagaattacacaaaaatttgtttgaattgaacacttgatatacaatcagt 12953532  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaattt 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
12953531 ggtgttcacaatacaatgcaat-aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaattt 12953433  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| || |    
12953432 ggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctctaccaatcatcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattttta 12953333  T
419 gcacgtc-taaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12953332 gcacgtcttaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 12953233  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
12953232 tatcttgaaggaacaattctacaggcagagctgttatcttgtattgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12953135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 11205540 - 11206137
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
11205540 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcag 11205639  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||     
11205640 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgtgtttgaacacttgatatacaatcag 11205739  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||    
11205740 tggtgttcacaatacaatgcaatcaaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcaatacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatt 11205839  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
11205840 tggcagagtttgggcgcttttaatttgttgtagtgtctctaccaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgtggagagagacgttgagatctta 11205939  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | || |||||||  ||||| ||||||| ||||||    
11205940 agcacgtctaaagagtcgttgagaacctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatattgtactatgaaaaatcaagttcaaatccattcc 11206039  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
11206040 tatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtgttgtagcatagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 11206137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 103 - 611
Target Start/End: Original strand, 11235177 - 11235686
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
11235177 atgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaaca 11235276  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
11235277 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtacagaaattcaaagtgc 11235376  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagag 401  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||    
11235377 ttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaatttgttgtagtgtctctaccaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgtggagag 11235476  T
402 agacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatca 501  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||  ||||    
11235477 agacgttgagatcttaagcacatctaaagagtcgttgagaaccattgatcatccacctgtaatcttttgcctgatttggatattgtcctatgaaaaatca 11235576  T
502 acttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttg 601  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |   ||  | |||||| |||||||||    
11235577 agttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacaaaagtagaatagtggaggtagtggttg 11235676  T
602 tacacttgta 611  Q
    ||||||||||    
11235677 tacacttgta 11235686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17742221 - 17741707
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct-agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaa 199  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
17742221 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcttaatcaaacagaattacatagaaaat-gtttgactttgaa 17742123  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
17742122 cacttgatatacaatcagtggtgctcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 17742024  T
300 gcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
17742023 gctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagta 17741924  T
399 gagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
17741923 gagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatacaccagtaatcttatgcttgatttgggtgtagtcctatgaagga 17741824  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
17741823 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagatgttgtattgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 17741724  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
17741723 ttgtacacttgtacttt 17741707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 17063794 - 17064386
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaaga-aataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
17063794 ccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctcacagattacaattgttcaatactatcatgtatgagacttctcaaatgctcaaacacgca 17063893  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
17063894 ggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaacagaattaca-agaaaattgtttgacgttgaacacttgatatacaatca 17063992  T
217 atggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaat 316  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
17063993 gtggtgttctcaatacaatgcaataaaagactct---ct--agaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaatt 17064087  T
317 ttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttcctt-atatagtggtgtgtagagagacgttgagatc 414  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| | ||||||||||||||     
17064088 ttggcagagtttgtgcgctttttaacttgtgat---gtctctctcaatctccaagtcttcacttcctttatatagagatgtgaa-agagacgttgagatt 17064183  T
415 ttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattca 513  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
17064184 tttagcacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagtattaacttcaaattca 17064283  T
514 ttcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtac 612  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||  || |||||| |||| |||||||||||||||    
17064284 ttcccatcttgaaggaacaaattctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacatagtagtggaggtagttgttgtacacttgtac 17064383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 17047154 - 17047746
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
17047154 ccttgcacttccaaggagattttcactaaaaaataatcacacagattacaactgctcaatactatcaagtatgagacttctcaaatgctcaagcatgcag 17047253  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
17047254 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattatttgactttgaacacttgatatacaatcaa 17047353  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc-ttttgagaattaaat 316  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||  || |    
17047354 tggtgttctcaatacaatgtaataaaagactct---ct--agaatttctaagatatatcaaatcaaaacagaaattcaaagtgctttttcagaaacaatt 17047448  T
317 ttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttcc-ttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct 415  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||| |    
17047449 ttggcagagtttgtgcgcttttaacttgtgat-ctgtctctatttatcttcaagtcttcacttcctttatatag-agagagtagagagacgttgagattt 17047546  T
416 t-aagcacgtctaaagagtcgttgag-ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattca 513  Q
    |   |||   ||| ||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||||||    
17047547 tcttgca---ctatagagtcgttgagaaacctttgatctttcaccattaaacttttgcctgatttggatgtagtcctttaaagaattaacttaaaattca 17047643  T
514 ttcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcag-ggtcgtggagatagtggttgtacacttgtac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||||    
17047644 ttcctatcttgaaggaacaaatctgcaggcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagagttcgtggaggtcgtggttgtacatttgtac 17047743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 132 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9934159 - 9933676
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
9934159 aatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctaatcaaacagaattacacagaaaat-gtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 9934061  T
231 acaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgg 330  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||||||| |    
9934060 acaatgcaataaa-gactctagacttacgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttg 9933962  T
331 gcgcttttaacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaa 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
9933961 gcgcttttaacttgtgttaatgtctcttttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagatgttgagatttttagcacgtctaaa 9933862  T
430 gagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaagga 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
9933861 gagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgattttggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattccttcctatcttgaagga 9933762  T
530 acaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||| |  ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9933761 acatttctgcaggcagagttgttgtcttgtcttgtagcatagacagaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9933676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 25518386 - 25518881
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
25518386 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtgg 25518485  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
25518486 tgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttataagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaaacaaatttgg 25518584  T
321 cagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccg------atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc 414  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| | |      ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||     
25518585 cagagttttggcgcttttaacttgt-ata-tctctct-ctgtattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatt 25518680  T
415 ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcat 514  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
25518681 tttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgttgtgctatgaaggatcaacttcaaattcat 25518780  T
515 tcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
25518781 tcctgtcttgaaggaacatttctggaggcagagctgttgtcttgtcttgtaacgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 25518880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18826754 - 18826243
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| ||| |||||||||  | || | ||||||||  ||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||    
18826754 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatactcaagcacacaggcgacagacttcttttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgatttgaaca 18826656  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
18826655 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgc 18826557  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |    
18826556 tttgtagaattaaatttggcagagttttggcacttttaacttgtgttgatgtcttttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-a 18826458  T
401 gagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||    
18826457 gagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtaaagtcctttgaaggatc 18826358  T
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||||    
18826357 aacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 18826258  T
601 gtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||    
18826257 gtacacttgtacttt 18826243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 105 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 7586776 - 7586261
Alignment:
105 gctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacact 203  Q
    ||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||    
7586776 gctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagatttacacagaaaattgtttgagtttgaacgct 7586677  T
204 tgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgct 302  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
7586676 tgatatactatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgct 7586577  T
303 tt---tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||   |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
7586576 ttttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtattgtctctattgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtag 7586477  T
400 agagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
7586476 agagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaaccttgatca-ataccaatgatctgttgcctgatttggatgttgtcctatgaagga 7586378  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||    
7586377 tcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtgg 7586278  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
7586277 ttgtacacttgtacttt 7586261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18835149 - 18834639
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  |||| |||| |||||  ||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||    
18835149 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacagaagcgagaggcttcttttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgatttgaaca 18835051  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
18835050 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtg-agaaattcaaggtgc 18834953  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |    
18834952 tttgtagaatcaaatttggcagagttgtggcgcttttaacttgtgttgatgtcttttgccaatcttcaagtcttcacttctttatatagaggtgtgaa-a 18834854  T
401 gagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||    
18834853 gagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggaaaagtcctttgaaggatc 18834754  T
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||||    
18834753 aacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 18834654  T
601 gtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||    
18834653 gtacacttgtacttt 18834639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 27166958 - 27166448
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||    
27166958 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgaattgaaca 27166860  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
27166859 cttgatacacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgc 27166761  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| | |    
27166760 tttgtagaataaaatttgacagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttatcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaagtgtgaa-a 27166662  T
401 gagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
27166661 gagacgttgagatgtttagcacgtctaa-gagtcgttgagtttctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatc 27166563  T
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||| ||||||||    
27166562 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagccgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagtgtagtggaggtagtggtt 27166463  T
601 gtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||    
27166462 gtacacttgtacttt 27166448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 29765216 - 29765726
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||    
29765216 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaaaat-gtttgaattgaaca 29765314  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
29765315 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtac 29765413  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |    
29765414 tttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-a 29765512  T
401 gagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
29765513 gagacgttgagatttttagtacgtctaa-gagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatc 29765611  T
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||||    
29765612 aacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttgtcttgtctgatagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 29765711  T
601 gtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||    
29765712 gtacacttgtacttt 29765726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 25687266 - 25686754
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||||    
25687266 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcaaacaaaattacacataaaat-gtttgagattgaac 25687168  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
25687167 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatataatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtg 25687069  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc-taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |  | ||||||||||||  ||| | |||||||| |||| | ||    
25687068 ctttatagaatcaaatttgacagagtttaggcgcttttaacttgt-atgttgtctcttgtcaatcttcaagtctatactcctttatatagaggtgagcag 25686970  T
400 agagacgttgaga-tcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||    
25686969 agagacgttgagattccttagcacgtctaaagagtcgttgagttcc-ttgatcatccaccagtaatctttttcttgatttggatgttgtcctatgaagga 25686871  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || || ||| ||||||    
25686870 tcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtagaggtagtgg 25686771  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
25686770 ttgtacacttgtacttt 25686754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 4292425 - 4292917
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || ||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
4292425 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagcgaaatttttttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 4292524  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |    
4292525 gttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttgac 4292623  T
322 agagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||  || ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||| || |||    
4292624 agagttttggcgcttttgacttgtgttgatatctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatttttagc 4292722  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
4292723 acgtctaaagagtcgttaagttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctttgaaggatcagcttcaaattcattcccat 4292822  T
521 cttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4292823 cttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcctgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4292917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 132 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 25736044 - 25735563
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
25736044 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgagattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 25735946  T
231 acaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgg 330  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| | |||||||| |    
25735945 acaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtgctttatagaatcaaatt-gacagagtttag 25735848  T
331 gcgcttttaacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagat-cttaagcacgtctaa 428  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||   | ||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
25735847 gcgcttttaacttgt-atgtggtctcttgtcaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattctttggcacgtctaa 25735749  T
429 agagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaagg 528  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
25735748 agagtcgttgagttcctt-gatcatctaccagtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaagg 25735650  T
529 aacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
25735649 aacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtacttt 25735563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 22308468 - 22308981
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| ||||||||||||   | ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
22308468 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaaaat-gtttgactttgaac 22308566  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22308567 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatgcaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 22308665  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttta-acttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||  ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |    
22308666 ctttgtagaatcaaatttggcagagttttggtgctttttgacttgcgttaatgtctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa 22308765  T
399 gagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |    
22308766 -agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcatgatttgggtgtagtcctttgaggaa 22308864  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
22308865 tcaatttcaaattcattcccatcttgaaggaatatttctacaggtagagctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtagtggagttagtgg 22308964  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
22308965 ttgtacacttgtacttt 22308981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 102 - 611
Target Start/End: Original strand, 31572095 - 31572601
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||    
31572095 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgacttgaaca 31572193  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
31572194 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaa-gtgc 31572291  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||  || ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| | |    
31572292 tttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtattgatgtctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaa-a 31572390  T
401 gagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
31572391 gagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatc 31572490  T
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||  |  ||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||||    
31572491 aacttcaaattcattcccatcttgatagaacatttctgcaggcatggtcgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 31572590  T
601 gtacacttgta 611  Q
    |||||||||||    
31572591 gtacacttgta 31572601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 105 - 615
Target Start/End: Original strand, 21127760 - 21128272
Alignment:
105 gctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacact 203  Q
    ||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
21127760 gctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacact 21127859  T
204 tgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgct 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
21127860 tgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacatagaaattcaaagtgct 21127959  T
303 tttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagag 401  Q
    |  | |||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | ||    
21127960 tg-gtgaaacaaatttggcagagtttaggcgctttttaacttgttgtattgtctctactgatcttaaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-ag 21128057  T
402 agacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||    
21128058 agacgttgagatctttaagcacttcaatagagtcgttgcgaaaccttgatcaatcaccaattatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaagaatc 21128157  T
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
       ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||  ||||||||    
21128158 gcattcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagatgttatcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaagtagtggtt 21128257  T
601 gtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||    
21128258 gtacacttgtacttt 21128272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17746300 - 17745787
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||    
17746300 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgactttgaac 17746202  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaag-t 299  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |    
17746201 acttgatatataatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggat 17746103  T
300 gcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    |||||  ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |    
17746102 gctttgtagaatcaaatttgacagagttttggcacttttaacttgtgttaatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa 17746003  T
399 gagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||| |    
17746002 -agagacgttgagatgtttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgattattcaccagtaatgattttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaa 17745904  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| || |||    
17745903 tcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtaatgg 17745804  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| ||||||    
17745803 ttgtacacttctacttt 17745787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 366 - 615
Target Start/End: Original strand, 18498562 - 18498811
Alignment:
366 tcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatc 465  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
18498562 tcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtccaaagagtcattgagttcctttgatcatccaccagtaatc 18498661  T
466 ttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
18498662 ttttgtctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcttatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttattttgtcttgta 18498761  T
566 gcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
18498762 gcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18498811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 104 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17608927 - 17608410
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
17608927 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacac 17608828  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   || |||||| ||||    
17608827 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacataagaatttctaagatatatcaaatgaacacataaattctaagt 17608728  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtg 396  Q
    |||||  || |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||   |||||| ||||||||||| | || ||||| ||||||    
17608727 gcttttatgtgaaacaaattttgcagagtttgggcgcttttaacttgttgtcttgt-tctatttgatctttaagtcttcactcctttgtatagaggtgtg 17608629  T
397 tagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaa 495  Q
     | |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
17608628 -aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaa 17608530  T
496 ggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagata 594  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||  || |||||| ||    
17608529 ggatcacgttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaca-aaacaaagtagtggaggta 17608431  T
595 gtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||||    
17608430 gtggttgtacacttgtacttt 17608410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 26043912 - 26044404
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
26043912 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 26044011  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
26044012 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 26044108  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
26044109 agagttttggcgcttttgaacttgt-ata-tctctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc 26044205  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
26044206 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattc 26044305  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
26044306 ccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 26044404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18926260 - 18925767
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
18926260 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 18926161  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||| ||||| | |    
18926160 gttcacaatacaatacgataca-gactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtggaatcaaatt-gac 18926063  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| | |   |||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
18926062 agagttttggcgctttttaacttgt-ata-tatctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgatt 18925966  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
18925965 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 18925866  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||||||||| |||||||||||   ||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
18925865 catcttgaaggaacatttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18925767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 209 - 615
Target Start/End: Original strand, 25679024 - 25679428
Alignment:
209 tacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgag 308  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
25679024 tacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtgctttatag 25679122  T
309 aattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgt 407  Q
    ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||   | ||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
25679123 aatcaaatt-gacagagtttaggcgcttttaacttgt-atgtggtctcttgtcaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgt 25679220  T
408 tgagat-cttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttc 506  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
25679221 tgagattctttggcacgtctaaagagtcgttgagttcctt-gatcatctactagtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttc 25679319  T
507 aaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacac 606  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||     
25679320 aaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggaagagctgatgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacat 25679419  T
607 ttgtacttt 615  Q
    |||||||||    
25679420 ttgtacttt 25679428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 608
Target Start/End: Original strand, 20635268 - 20635758
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||    
20635268 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgaaatacaatcagtgg 20635367  T
221 tgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt--tgagaattaaa 315  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||  || |||  |||    
20635368 tgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaa 20635467  T
316 tttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct--accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagat 413  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||     |||||||     |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||| |||||||||    
20635468 attggcagagtttgggcgctttttacttgt-----tgtctcttatttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagtcgttgagat 20635561  T
414 c-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattc 512  Q
    | ||||||||||| | |||||| ||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |    
20635562 ctttaagcacgtcaatagagtctttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcc 20635661  T
513 attcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
20635662 attcctatcttgaaggaacattgctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20635758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 25787401 - 25787892
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
25787401 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 25787500  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
25787501 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 25787598  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
25787599 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 25787696  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
25787697 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 25787796  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
25787797 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 25787892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 25985782 - 25986273
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
25985782 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 25985881  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
25985882 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 25985978  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
25985979 agagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 25986076  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |    
25986077 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaatttattccca 25986176  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |   || || |||||| |||||||||||||||||||||||    
25986177 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 25986273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 127 - 615
Target Start/End: Original strand, 12827397 - 12827884
Alignment:
127 cttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttca 226  Q
    |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
12827397 cttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttca 12827496  T
227 caatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagt 326  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||    
12827497 caatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagt 12827594  T
327 ttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtc 425  Q
    || ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||||||||    
12827595 tttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtc 12827692  T
426 taaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttg 524  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
12827693 taaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 12827792  T
525 aaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12827793 aaggcgcaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12827884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 104 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 19453142 - 19452719
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
19453142 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaatcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgtgtttgaacac 19453043  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactct--agacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||    
19453042 ttgatatacaatcagtggtgttcataatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacaaaaattcaaagt 19452943  T
300 gcttttgag--aattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgt 397  Q
     |||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||| | |||||    
19452942 acttttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgttatgtctctgctgatcttcaagtcttcacccctttatatagagatgtgt 19452843  T
398 agagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaag 496  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
19452842 agagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagtgtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaag 19452743  T
497 gatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    |||||  ||||||| |||||||||    
19452742 gatcacgttcaaatccattcctat 19452719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 132 - 615
Target Start/End: Original strand, 5844796 - 5845275
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||||  ||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
5844796 aatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgaccttgaacacttgatatacaatcggtggtgttcacaat 5844894  T
231 acaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttg-agaattaaatttggcagagtttg 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||     
5844895 acaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctatgatgtatcaaatcagtgcagaaattca--gtgtttttgtagaatcaaatt-gacagagtttt 5844990  T
330 ggcgcttttaacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaa 428  Q
    ||||||||| | || |  ||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||    
5844991 ggcgctttttattttttttatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtctaa 5845088  T
429 agagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaagg 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |    
5845089 agagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgcagtcctttgaagaatcggcttcaaattcattcccatcttgaatg 5845188  T
529 aacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
5845189 aacattcctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 5845275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 16124032 - 16123542
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||     
16124032 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgaccttgaacacttgatgtacaatcagtga 16123933  T
221 tgttcacaa-tacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| |    
16123932 tgttcacaaatacaatgtaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcaaaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-g 16123835  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctac---cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct 415  Q
     |||||||| ||||||||| |||||      || ||||||    | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||      
16123834 acagagttttggcgctttttaactt------atatctctatgtacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatga 16123742  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
16123741 ttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatactttgactgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 16123642  T
516 cctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     | |||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
16123641 acaatcttgaaggaacatttatgaaggcatggatgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 16123542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 7376254 - 7375763
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
7376254 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 7376155  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
7376154 gttcacaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 7376057  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   || | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
7376056 agagttttggcgctttttaacttgtgtatatctttctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagc 7375959  T
421 acgtctaaagagtcgttgagt-tcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
7375958 acgtctaaagagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 7375859  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
7375858 tcttgaaggcacaaattctgctggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 7375763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9123628 - 9123136
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9123628 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 9123529  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
9123528 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 9123432  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
9123431 agagttttggcgcttttgaacttgt----atatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 9123337  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
9123336 agcacgtctaaagagtcttttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 9123237  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
9123236 ccatcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 9123137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 32301539 - 32301047
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
32301539 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 32301440  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
32301439 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 32301343  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga-tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
32301342 agagttttggcgcttttgaacttatgt--atgtctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 32301246  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
32301245 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 32301146  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
32301145 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 32301047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 32312228 - 32311736
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
32312228 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 32312129  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
32312128 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 32312032  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga-tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
32312031 agagttttggcgcttttgaacttatgt--atgtctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 32311935  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
32311934 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccc 32311835  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
32311834 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 32311736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 28252058 - 28251570
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| | ||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
28252058 agagacttctaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagacaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 28251960  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||| || |||| |    
28251959 gttctcaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 28251863  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
28251862 agagttttggcgcttttgaacttgt-atatctctgtctact-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcag 28251766  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||     
28251765 catgtctaaagagtcgtttgaattccttaaatcatc-accagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattccc 28251667  T
519 atcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
28251666 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 28251570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 28357205 - 28356717
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| | ||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
28357205 agagacttctaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagacaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 28357107  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||| || |||| |    
28357106 gttctcaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 28357010  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
28357009 agagttttggcgcttttgaacttgt-atatctctgtctact-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcag 28356913  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||     
28356912 catgtctaaagagtcgtttgaattccttaaatcatc-accagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattccc 28356814  T
519 atcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
28356813 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 28356717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27505642 - 27506135
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27505642 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 27505741  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
27505742 gttctcaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 27505838  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
27505839 agagttttggcgcttttgaacttgt----atatctctatcttctatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 27505933  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
27505934 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 27506033  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggac--acactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||  | |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
27506034 ccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 27506133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 7751731 - 7751240
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| | ||    |||||| |||||||||||||||||||||| || |    
7751731 agagacttctaatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtgat 7751632  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||| || |||| |    
7751631 gttctcaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 7751535  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
7751534 agagttttggcgcttttgaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 7751438  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||     
7751437 cacgtctaaagagtcgtttgaattcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaattcattccc 7751338  T
519 atcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
7751337 atcttgaaggcgcacattctgcaggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 7751240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9112991 - 9112499
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9112991 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 9112892  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | |||||| |    
9112891 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaa-tcaatttgac 9112795  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| |    |||||||||||||||||   |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
9112794 agagttttggcgcttttgaacttgt----atatctctatcttttatcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 9112700  T
418 agcacgtctaaagagtc-gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
9112699 agcacgtctaaagagtcttttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 9112600  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||||| || |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
9112599 ccatcttgaaggtacaaattttgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 9112500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20030400 - 20029909
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || |||   ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
20030400 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatactatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 20030301  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
20030300 gttcacaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 20030203  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||     | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||    
20030202 agagttttggcgctttttaacttgtacatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgatttgc 20030105  T
421 acgtctaaagagtcgttgagt-tcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
20030104 acgtctaaagagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 20030005  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
20030004 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 20029909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 132 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 11147736 - 11147254
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
11147736 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttcttatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 11147637  T
232 caatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttggg 331  Q
    |||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||    
11147636 caatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttgg 11147539  T
332 cgctttt-aacttgtg-ataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaa 429  Q
    ||||||| ||||| || || |  | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||    
11147538 cgctttttaacttatgtatcac-tatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagcacgtctaaa 11147442  T
430 gagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaagg 528  Q
    ||||| || ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
11147441 gagtcatttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 11147342  T
529 aac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |   || || |||||| |||||||||||||||||||||||    
11147341 cacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 11147254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27372532 - 27373025
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27372532 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 27372631  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
27372632 gttctcaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 27372728  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
27372729 agagttttggcgcttttgaacttgt----atatctctatcttctatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 27372823  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
27372824 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 27372923  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggac--acactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |  |||  | |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
27372924 ccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 27373023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27462882 - 27463375
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27462882 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 27462981  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
27462982 gttctcaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 27463078  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
27463079 agagttttggcgcttttgaacttgt----atatctctatcttctatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 27463173  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
27463174 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 27463273  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggac--acactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |  |||  | |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
27463274 ccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 27463373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 3661083 - 3661574
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
3661083 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 3661182  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
3661183 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 3661279  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
3661280 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctatattcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 3661376  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
3661377 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 3661476  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
3661477 atcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 3661574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 104 - 609
Target Start/End: Original strand, 22386333 - 22386842
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
22386333 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagtttgaacac 22386432  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
22386433 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 22386532  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc--taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgt 395  Q
    |||||  || |||  ||| || | ||||||||||||||||| |||     || ||||||      |||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
22386533 gcttttatgtgaaacaaaattagaagagtttgggcgctttttact-----tattgtctcatgtttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgt 22386627  T
396 gtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatga 494  Q
    | | |||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
22386628 g-aaagagtcgttgagatctttaagcatgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatga 22386726  T
495 aggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagat 593  Q
    |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |    
22386727 aggatcacgttaaaatccattaatatcttgaaggaacattactgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggt 22386826  T
594 agtggttgtacacttg 609  Q
    ||||||||||||||||    
22386827 agtggttgtacacttg 22386842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12717332 - 12716838
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
12717332 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 12717233  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
12717232 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 12717136  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | ||| |  ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
12717135 agagttttggcgcttttaaacttgtgtatctctatcttcaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 12717037  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
12717036 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccca 12716937  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12716936 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12716838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12727981 - 12727487
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
12727981 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 12727882  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
12727881 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 12727785  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | ||| |  ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
12727784 agagttttggcgcttttaaacttgtgtatctctatcttcaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 12727686  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
12727685 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccca 12727586  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12727585 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12727487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 3671747 - 3672238
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
3671747 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 3671846  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
3671847 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 3671943  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
3671944 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctatatttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 3672040  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
3672041 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 3672140  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
3672141 atcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 3672238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20063151 - 20062660
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||   ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
20063151 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatactatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 20063052  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |      
20063051 gttcacaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gat 20062954  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||| |||||||  |  |    
20062953 agagttttggcgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacattgagatgatttg 20062857  T
420 cacgtctaaagagtcgttgagt-tcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
20062856 cacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 20062757  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
20062756 atcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 20062660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 4630571 - 4631065
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
4630571 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 4630670  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||||| | |    
4630671 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaatt-gac 4630767  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    | ||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||    |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
4630768 aaagttttggcgcttttgaacttatgt--atgtctctgtatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc 4630864  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
4630865 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattc 4630964  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
4630965 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 4631064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 26025159 - 26025651
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
26025159 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 26025258  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
26025259 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 26025355  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
26025356 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 26025453  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
26025454 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 26025553  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
26025554 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 26025651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 26035733 - 26036225
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
26035733 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 26035832  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
26035833 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 26035929  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
26035930 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 26036027  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
26036028 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 26036127  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
26036128 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 26036225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27341394 - 27341886
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27341394 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 27341493  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
27341494 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 27341590  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
27341591 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 27341688  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
27341689 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccca 27341788  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
27341789 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27341886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27402134 - 27402626
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27402134 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 27402233  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
27402234 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 27402330  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
27402331 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 27402428  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
27402429 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccca 27402528  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
27402529 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27402626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27412793 - 27413285
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27412793 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 27412892  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
27412893 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 27412989  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
27412990 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 27413087  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
27413088 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccca 27413187  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
27413188 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27413285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 31983122 - 31982630
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
31983122 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 31983023  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
31983022 gttcacaatacaatacaa-aaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 31982926  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
31982925 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 31982828  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
31982827 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 31982728  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
31982727 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 31982630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 33199028 - 33199520
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
33199028 agagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 33199127  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
33199128 gttcacaaaacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 33199224  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||| || ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
33199225 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatct-ccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 33199322  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||    
33199323 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccta 33199422  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
33199423 tcttgaatgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 33199520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 16930151 - 16930642
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
16930151 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 16930250  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
16930251 gttcacaatgcaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 16930347  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || | | ||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
16930348 agagttttggcgcttttaaacttatgtatatctatata-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 16930445  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
16930446 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 16930545  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
16930546 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 16930642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 29384452 - 29384943
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
29384452 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 29384551  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
29384552 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 29384648  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
29384649 agagttttggcgcttttaaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 29384743  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
29384744 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 29384843  T
517 ctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
29384844 ccatcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 29384943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 12854721 - 12855213
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
12854721 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 12854820  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
12854821 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 12854917  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
12854918 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-taatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 12855015  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
12855016 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 12855115  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12855116 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12855213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 12865247 - 12865739
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
12865247 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 12865346  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
12865347 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 12865443  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
12865444 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-taatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 12865541  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
12865542 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 12865641  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12865642 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12865739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 16959322 - 16959813
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
16959322 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 16959421  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
16959422 gttcacaatgcaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 16959518  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || | | ||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
16959519 agagttttggcgcttttaaacttatgtatatctatata-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 16959616  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
16959617 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 16959716  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||    
16959717 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttgtacttt 16959813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27474547 - 27475037
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| | ||    |||||| |||||||||||||||||||||| || |    
27474547 agagacttctaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagtttgatttgaacacttgatatacaatcagtgat 27474645  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||| || |||| |    
27474646 gttctcaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 27474742  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
27474743 agagttttggcgcttttgaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagattatcag 27474839  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||  | | ||||||| |||||||     
27474840 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaaatcattccc 27474939  T
519 atcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| |||| |  ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
27474940 atcttgaaggcgcacattctgcaggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27475037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 195 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 31543319 - 31542902
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattc 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31543319 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattc 31543222  T
295 aaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggt 393  Q
    |  |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||| ||     
31543221 agtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgcttttgaacttatgc--atgtctctcttg-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggc 31543126  T
394 gtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctat 492  Q
    ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
31543125 gtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttt 31543027  T
493 gaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtgga 590  Q
    |||| || | ||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||    
31543026 gaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtgga 31542927  T
591 gatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
31542926 ggtagtggttgtacacttgtacttt 31542902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 26864486 - 26864980
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
26864486 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 26864585  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| | ||| ||| |    
26864586 gttcacaatacaatgc-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagactcaaa-ttgac 26864682  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-at-aatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||   | |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
26864683 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctatctcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatca 26864780  T
419 gcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
26864781 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcc 26864880  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  | || || ||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
26864881 catcttgagtgtacaaaatctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 26864980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 26875110 - 26875604
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
26875110 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 26875209  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| | ||| ||| |    
26875210 gttcacaatacaatgc-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagactcaaa-ttgac 26875306  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-at-aatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||   | |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
26875307 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctatctcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatca 26875404  T
419 gcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
26875405 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcc 26875504  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  | || || ||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
26875505 catcttgagtgtacaaaatctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 26875604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 32962430 - 32961933
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
32962430 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 32962331  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||| |    
32962330 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaa-ttgac 32962234  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-ata---atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| || |||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |    
32962233 agagttttgacgcttttgaacttctgtatatctatctcttttttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataat 32962135  T
417 aagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
     |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
32962134 cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcatt 32962035  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    || |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  || |  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
32962034 cccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagagagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 32961935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 32973049 - 32972552
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
32973049 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 32972950  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||| |    
32972949 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaa-ttgac 32972853  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-ata---atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| || |||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |    
32972852 agagttttgacgcttttgaacttctgtatatctatctcttttttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataat 32972754  T
417 aagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
     |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
32972753 cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcatt 32972654  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    || |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  || |  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
32972653 cccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagagagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 32972554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 34807656 - 34807164
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
34807656 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 34807557  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
34807556 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 34807460  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||   || ||| ||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
34807459 agagttttggcgtttttgaacttatg--tatctctatattcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 34807363  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
34807362 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 34807263  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  || |  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
34807262 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagatagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 34807164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 34818288 - 34817796
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
34818288 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 34818189  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
34818188 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 34818092  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||   || ||| ||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
34818091 agagttttggcgtttttgaacttatg--tatctctatattcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 34817995  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
34817994 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 34817895  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  || |  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
34817894 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagatagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 34817796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27384134 - 27384624
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| | ||    |||||| |||||||||||||||||||||| || |    
27384134 agagacttctaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagtttgatttgaacacttgatatacaatcagtgat 27384232  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||| || |||| |    
27384233 gttctcaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 27384329  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||| ||||||||  | ||    
27384330 agagttttggcgcttttgaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagatgttgagattatcag 27384426  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||  | | ||||||| |||||||     
27384427 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaaatcattccc 27384526  T
519 atcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| |||| |  ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
27384527 atcttgaaggcgcacattctgcaggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27384624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27504045 - 27504536
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| | ||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27504045 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagacaattgagtttgatttgaacacttgatatacaatcagtggt 27504144  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||| || |||| |    
27504145 gttctcaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 27504241  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
27504242 agagttttggcgcttttgaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagattatcag 27504338  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||  | | ||||||| |||||||     
27504339 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaaatcattccc 27504438  T
519 atcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| |||| |  ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
27504439 atcttgaaggcgcacattctgcaggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27504536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17982997 - 17982505
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
17982997 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 17982898  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
17982897 gttcacaatacaatac-agaaaagactctggactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 17982801  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | || ||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
17982800 agagttttggcgcttttgaacttatgtatttctcact-tttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 17982703  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
17982702 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctctgaagaataaacttcaaattcattccca 17982603  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17982602 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 17982505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17985206 - 17984714
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
17985206 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 17985107  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
17985106 gttcacaatacaatac-agaaaagactctggactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 17985010  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | || ||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
17985009 agagttttggcgcttttgaacttatgtatttctcact-tttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 17984912  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
17984911 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 17984812  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17984811 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 17984714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 465
Target Start/End: Original strand, 12353180 - 12353596
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||      
12353180 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgc 12353279  T
147 aagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaaga 246  Q
    | ||||||| |||||  ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
12353280 aggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaat-aaaga 12353378  T
247 ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgt 345  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| |||  ||||||| ||||||||| ||||| |    
12353379 ctctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgatagagttttggcgcttttgaacttat 12353477  T
346 gataatgtctct-ac--cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagt 441  Q
        |||||||| ||  | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||      
12353478 ----atgtctctcacttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaag-gagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 12353572  T
442 tcctttgatcatccaccagtaatc 465  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
12353573 tcctttgatcattcaccagtaatc 12353596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14070694 - 14070492
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    |||||||||||| || || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
14070694 atgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaaca 14070595  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    
14070594 cttgatatacaattagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgagtacagaaattcttagtg 14070495  T
301 ctt 303  Q
    |||    
14070494 ctt 14070492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 259 - 615
Target Start/End: Original strand, 8653497 - 8653851
Alignment:
259 gaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctct 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | || ||||| ||||||||| ||||| |       |||||    
8653497 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgcagaatcaaatt-gacatagttttggcgctttttaacttatatctccctctct 8653595  T
358 accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccac 457  Q
     |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8653596 tca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagttgattagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccac 8653693  T
458 cagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatctt 557  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||    
8653694 caataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccgttttgaaggaacatttctacaggcatagcttttgtctt 8653793  T
558 gtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
8653794 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 8653851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 400 - 615
Target Start/End: Original strand, 17042596 - 17042813
Alignment:
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |    
17042596 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagta 17042695  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtg 597  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||  || |||||| |||||    
17042696 ttaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaattctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtg 17042795  T
598 gttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||    
17042796 gttgtacacttgtacttt 17042813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14052013 - 14051811
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    |||||||||||| || || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
14052013 atgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaaca 14051914  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||    
14051913 cttgatatacaattagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgagtacataaattcttagtg 14051814  T
301 ctt 303  Q
    |||    
14051813 ctt 14051811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 400 - 615
Target Start/End: Original strand, 13913025 - 13913240
Alignment:
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
13913025 agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagttgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 13913124  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    ||  || |||||| |||||||    
13913125 tatcttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtggt 13913224  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
13913225 tgtacacttgtacttt 13913240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 11235063 - 11235204
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
11235063 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcag 11235162  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
11235163 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 11235204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 21127644 - 21127785
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
21127644 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcag 21127743  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
21127744 gcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttc 21127785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7586892 - 7586751
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
7586892 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacactgattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcag 7586793  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
7586792 gcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttc 7586751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25687379 - 25687236
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
25687379 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaatgctcaagcactca 25687281  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
25687280 ggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 25687236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 25518254 - 25518396
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
25518254 ccttgcacttccaaagagatttccactaa-aaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttctcaaatgctcaagtacgcag 25518352  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    || | |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
25518353 gcaaaagactttcaatgctcaagcactacagcaagagtcttcta 25518396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19453247 - 19453116
Alignment:
31 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagact 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
19453247 aaggagatttccactaagaaaaaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagatact 19453148  T
129 tccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||    
19453147 tcttttgctcaagcactaaagcaagagacttc 19453116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 459 - 615
Target Start/End: Original strand, 25675196 - 25675352
Alignment:
459 agtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttg 558  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
25675196 agtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttg 25675295  T
559 tcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
25675296 tcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtacttt 25675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17742319 - 17742191
Alignment:
30 taaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagactt 129  Q
    ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
17742319 taaggagatttccactaa----taatcgcacagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgggagactt 17742224  T
130 ccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17742223 ccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 17742191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 31571985 - 31572125
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
31571985 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 31572079  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
31572080 aggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 31572125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 7763198 - 7763311
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
7763198 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 7763297  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
7763298 tgttcacaatacaa 7763311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17746410 - 17746270
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
17746410 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 17746316  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17746315 aggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 17746270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18835259 - 18835119
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |    
18835259 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacac 18835165  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
18835164 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 18835119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 22308357 - 22308498
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatc-tagtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |    ||||||| || ||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
22308357 ccttgcacttcgaaggagattttcaat----aataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 22308452  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22308453 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 22308498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 29765106 - 29765246
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
29765106 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 29765200  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
29765201 aggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 29765246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 295
Target Start/End: Original strand, 32757126 - 32757271
Alignment:
150 caagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaa-tacaatgcaataaaagac 247  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||    
32757126 caagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggttttcacaaatataatgcaataaa-gac 32757223  T
248 tctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattca 295  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
32757224 tctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca 32757271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18172849 - 18172720
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaaca 201  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||    
18172849 atgctcaaccacaaaggcgagagacttcctatgctcaa---caaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaatatgtttgaggttgaaca 18172753  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
18172752 cttgatatacaatcaatggtgttcacaaaacaa 18172720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Original strand, 18226952 - 18227081
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||    
18226952 atgctcaaccacaaaggcgagagacttcctatgctcaa---caaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaatatgtttgaggttgaaca 18227048  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
18227049 cttgatatacaatcaatggtgttcacaaaacaa 18227081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27167042 - 27166928
Alignment:
50 aataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
27167042 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaa 27166943  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
27166942 agcaagagtcttcta 27166928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17609042 - 17608901
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccat--ctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||  || |||||||||||||    
17609042 ccttgcacttccaaggagattttcactaagtt-taatcacacagattacaactactcaataccacacctagtataagacttca-aattgctcaagcacgc 17608945  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
17608944 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 17608901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18826864 - 18826724
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |    
18826864 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaatgctcaagcacac 18826770  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
18826769 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 18826724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 21034534 - 21034647
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
21034534 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 21034633  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||| ||||||||    
21034634 tgttcgcaatacaa 21034647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 26023221 - 26022881
Alignment:
192 gacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaa 291  Q
    ||||||||||| ||||| || || |  ||||||| | ||||||| | ||||| |||||||| |||  || |||||||||| |||||||||||||||||||    
26023221 gacttgaacacctgataaaccattaggggtgttctccatacaataccataaa-gactctagcctttgga-tttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaa 26023124  T
292 ttcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatat 387  Q
    ||||  |||||||  ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |||| || |  || |||| | |   |||||||||||||||||| | |||||     
26023123 ttcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgaaagagttttggcgcttttgaactggtaa--atctctccatctttgatcttcaagtcttcactcctttataa 26023027  T
388 agtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtag 486  Q
    || |||||| | ||||||||||||||  | |||| || |||||||||||| ||  ||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
26023026 agaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcaagtttaaagagtcgtttgaaatcctttgattattcaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtag 26022928  T
487 tcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa 533  Q
    |||| |||||||| |  || ||||||||||| || ||||||| ||||    
26022927 tcctttgaaggattaggtttaaattcattcccattttgaaggcacaa 26022881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 5844656 - 5844788
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
5844656 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 5844750  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaaga 154  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
5844751 aggcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaaga 5844788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 15301758 - 15301873
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
15301758 agagaattctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaat 15301857  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
15301858 ggtgttcacaatacaa 15301873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 19085702 - 19085817
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
19085702 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 19085801  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
19085802 ggtgttcacaatacaa 19085817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Original strand, 32335363 - 32335494
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||    
32335363 atgctcaagcacaaacgcaatagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttataatcaaacagaattacaaagaaaa-tgtttgaggttgaaca 32335461  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
32335462 cttgatatacaattagtggtgttcacaatacaa 32335494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 234
Target Start/End: Original strand, 26941979 - 26942094
Alignment:
120 cgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
26941979 cgagagacttcatatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattataaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 26942078  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
26942079 ggtgttcacaatacaa 26942094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 19625366 - 19625468
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
19625366 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 19625465  T
232 caa 234  Q
    |||    
19625466 caa 19625468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Original strand, 25930021 - 25930131
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
25930021 agagacttcatatgctcaagcacaactacaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatgg 25930120  T
221 tgttcacaata 231  Q
     ||||||||||    
25930121 agttcacaata 25930131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 19470211 - 19470324
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
19470211 agagacttcctatgctcaagcaaaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtgg 19470310  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
19470311 tgttcacaatacaa 19470324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17446277 - 17446151
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||    
17446277 atgctcaagcacaaatgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttatattcaaacagaattacaaagaaaa-tgtttgaggttgaaca 17446179  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaa 229  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||    
17446178 cttgatatacaatcagtagtgttcacaa 17446151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15395292 - 15395178
Alignment:
122 agagacttccaa-tgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    |||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
15395292 agagacttccaaatactcaagcagacaagcaagagacttctagacatacaaaattacacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 15395193  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
15395192 gtgttcacaatacaa 15395178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 234
Target Start/End: Original strand, 25595728 - 25595833
Alignment:
128 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcac 227  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||    
25595728 ttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaa-caaaattacacagaaaaatgtttgatttgaacacttgatatacaagcagtgatgttcac 25595826  T
228 aatacaa 234  Q
    |||||||    
25595827 aatacaa 25595833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 21119222 - 21119283
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac 80  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21119222 ccttacacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac 21119283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23006628 - 23006547
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaa 184  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
23006628 atgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctaatcaaacataattacacagaaa 23006547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 23781738 - 23781819
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaa 184  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
23781738 atgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctaatcaaacataattacacagaaa 23781819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12716028 - 12715913
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
12716028 agagacttctaatgctcaagcacacctgcaagagacttctaaattcaaacagaattacatagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 12715929  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
12715928 ggtgttcacaatacaa 12715913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15478385 - 15478274
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||   |||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
15478385 agagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaaca-aattacaaagaaataagtttggtttgaacacttgctatacaatcaatggt 15478287  T
222 gttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||    
15478286 gttcacaatacaa 15478274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 19623523 - 19623638
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |    
19623523 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagtcttctaaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttaaacacttgatatacaatcagt 19623622  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
19623623 ggtgttcaaaatacaa 19623638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24729146 - 24729014
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    |||||||||| | || || |||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||    
24729146 atgctcaagcccacacgcaagagtcttcgtatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacacaattacacagaaatatgtttgaggttgaaca 24729047  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
24729046 cttgatgtacaatcaatgatgttcataatacaa 24729014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9934235 - 9934131
Alignment:
23 gcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcg 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
9934235 gcacttccaaggagatttccactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtacgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcg 9934140  T
122 agagacttc 130  Q
    |||| ||||    
9934139 agagtcttc 9934131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18027344 - 18027210
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||   |||||  |||||    
18027344 caaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaaca-aattacacagaaataagtttggtttgaa 18027246  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaat 235  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
18027245 cacttgatataaaatcagtggtgttcataatacaat 18027210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 26185242 - 26185377
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttga 198  Q
    |||||||||| |||| || || ||||| ||   |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |||| | ||||    
26185242 caaatgctcacgcacacaagcaagagattttttatgctcaaacacaaaagcaagagacttctaaacaaacataattacacataaaaatatttggcgttga 26185341  T
199 acacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26185342 acacttgatatacaatcaatggttttcacaatacaa 26185377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27372429 - 27372542
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
27372429 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 27372527  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
27372528 agcaagagacttcta 27372542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 27384004 - 27384144
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||     ||||||   ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||     
27384004 ccttgcacttccaaggagattttcacta-----taatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcaca 27384098  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
27384099 cacgcaagagacttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 27384144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27462779 - 27462892
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
27462779 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 27462877  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
27462878 agcaagagacttcta 27462892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 27474388 - 27474528
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||     ||||||   ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||     
27474388 ccttgcacttccaaggagattttcacta-----taatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcaca 27474482  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
27474483 cacgcaagagacttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 27474528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 27503886 - 27504026
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||     ||||||   ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||     
27503886 ccttgcacttccaaggagattttcacta-----taatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcaca 27503980  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
27503981 cacgcaagagacttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 27504026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27505539 - 27505652
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
27505539 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 27505637  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
27505638 agcaagagacttcta 27505652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32962533 - 32962420
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
32962533 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 32962435  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
32962434 agcaagagacttcta 32962420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32973152 - 32973039
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
32973152 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 32973054  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
32973053 agcaagagacttcta 32973039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Original strand, 23296283 - 23296377
Alignment:
136 ctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaa 229  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
23296283 ctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacagttgatatacaatcagtggtgttcacaa 23296377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 29597617 - 29597731
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
29597617 agagacttttaatgttcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 29597716  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
29597717 gtgttcacaatacaa 29597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7751824 - 7751721
Alignment:
61 agattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagac 157  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
7751824 agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcact-aagcaagagac 7751726  T
158 ttcta 162  Q
    |||||    
7751725 ttcta 7751721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 7811558 - 7811670
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
7811558 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagaaaattctattcaaacaga-ttacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 7811656  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    |||| |||||||||    
7811657 tgttaacaatacaa 7811670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 20635134 - 20635276
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||    
20635134 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aactgctcaagcacg 20635231  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||    
20635232 caggcaagagacttcatttgctcaagtactaaagcaagagacttc 20635276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33352835 - 33352723
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |    
33352835 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacactcgatatacaatcagt 33352736  T
219 ggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||    
33352735 ggtgttcacaata 33352723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 9717385 - 9717499
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
9717385 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 9717483  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
9717484 ggtgttcacaatacaa 9717499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Original strand, 19623854 - 19624018
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||| ||||||||| ||||||| |||||  |   |||||||||| | |||||||||    
19623854 tttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctataaaggatcaatttcaaatccattctaagtatgaaggaacattgctgcaggca 19623953  T
545 gagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
19623954 gagctgttattcttgtcttgtagcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 19624018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20113288 - 20113192
Alignment:
136 ctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
20113288 ctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaatattgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaata 20113192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20731311 - 20731197
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
20731311 agagacttctaatgctcaagcacaactgcgagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 20731213  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
20731212 ggtgttcacaatacaa 20731197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 3660980 - 3661093
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| ||    
3660980 ataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-aa 3661078  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
3661079 agcaagagacttcta 3661093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 3671644 - 3671757
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| ||    
3671644 ataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-aa 3671742  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
3671743 agcaagagacttcta 3671757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9113094 - 9112981
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9113094 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9112996  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9112995 agcaagagacttcta 9112981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9123731 - 9123618
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9123731 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9123633  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9123632 agcaagagacttcta 9123618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 12347635 - 12347730
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatca 216  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
12347635 agagacttcctatgctcaatcacaactacaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 12347730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12717437 - 12717322
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
12717437 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 12717338  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
12717337 -aagcaagagacttcta 12717322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12728086 - 12727971
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
12728086 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 12727987  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
12727986 -aagcaagagacttcta 12727971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 12854618 - 12854731
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
12854618 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 12854716  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
12854717 agcaagagacttcta 12854731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 12865144 - 12865257
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
12865144 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 12865242  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
12865243 agcaagagacttcta 12865257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14923830 - 14923703
Alignment:
107 tcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 206  Q
    |||||||| || || | ||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||  ||||||  | ||||||||||    
14923830 tcaagcacacaagcaatagatttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaaattacacataaagatgtttggttcgaacacttga 14923731  T
207 tatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
14923730 tatactatcagtggtgttcacaatacaa 14923703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17983102 - 17982987
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
17983102 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17983003  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
17983002 -aagcaagagacttcta 17982987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17985311 - 17985196
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
17985311 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17985212  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
17985211 -aagcaagagacttcta 17985196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 19086074 - 19086197
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||  | | ||    
19086074 gtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacattgatgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagt 19086173  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||||||||||||||||||||    
19086174 agtggagatagtggttgtacactt 19086197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 19482295 - 19482409
Alignment:
123 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    |||||||| | |||||||| || |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
19482295 gagacttctattgctcaagaacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 19482394  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
19482395 gtgttcacaatacaa 19482409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24719342 - 24719232
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||    
24719342 agagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta---aaacacaattacacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatgtacaatcagtgg 24719246  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| |||||||    
24719245 tgttcataatacaa 24719232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 25985677 - 25985792
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
25985677 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 25985776  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
25985777 -aagcaagagacttcta 25985792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 26043809 - 26043922
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
26043809 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaagctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 26043907  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
26043908 agcaagagacttcta 26043922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34818393 - 34818278
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
34818393 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 34818294  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
34818293 -aagcaagagacttcta 34818278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14101043 - 14100933
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||    
14101043 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattataaagaaaaatgtttgaggttggacacttgaaatacaatcagtgg 14100944  T
221 tgttcacaata 231  Q
    | |||||||||    
14100943 tattcacaata 14100933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Original strand, 17927335 - 17927445
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||    
17927335 agagacttcccatgctcaagcacaactgcaagagacttctatttaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggttgaatacttgataaacaatcagtgg 17927434  T
221 tgttcacaata 231  Q
    |||||||||||    
17927435 tgttcacaata 17927445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22077034 - 22076898
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-tt 196  Q
    |||||||||||||||    || ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||    
22077034 caaatgctcaagcacaactgcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagactttttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggtt 22076936  T
197 gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22076935 gaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22076898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18926362 - 18926250
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
18926362 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaattctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 18926264  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
18926263 gcaagagtcttcta 18926250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 22386217 - 22386359
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||  || |||||||| |||    
22386217 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatattacacctagtatgagacttca-aattgctcaagtacg 22386314  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
22386315 caggcatgagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 22386359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 25592165 - 25592277
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||     
25592165 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaa-tgtttaaggttgaacacttgatatgcaatcagtga 25592263  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||| ||||||    
25592264 tgttcactatacaa 25592277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 33198924 - 33199038
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
33198924 ataatcaccaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 33199022  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
33199023 aagcaagagacttcta 33199038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34807762 - 34807646
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttccc-----aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcac 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |     |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
34807762 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 34807663  T
145 taaagcaagagacttcta 162  Q
    | ||||||||||||||||    
34807662 t-aagcaagagacttcta 34807646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Original strand, 10631673 - 10631760
Alignment:
150 caagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
10631673 caagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 10631760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 13601710 - 13601825
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||||||||| || |   |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
13601710 agagacttctaatgctcaagtacaactccaagagacttctaaattcaaacataattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 13601809  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
13601810 ggtgttcacaatacaa 13601825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 273
Target Start/End: Original strand, 15551541 - 15551687
Alignment:
128 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcac 227  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||   |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||     
15551541 ttcctatgctcaagcaccaaagcaagagacttctaaacagaca-aattacaaagaaataagtttggtttgaacaattgatatacaatcagtggtgttcat 15551639  T
228 aatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    |||||||  |||  |||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
15551640 aatacaaatcaaataaagactcttaagactctagaatttctaagatat 15551687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 18435083 - 18435197
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |    
18435083 agagacttctaatgctcaagcacaactgtaagagacttctcaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttaaggttgaacacttgatatacaatcagt 18435181  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
18435182 ggtgttcacaatacaa 18435197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19066625 - 19066510
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||| |||| |||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
19066625 agagacttctattgctcaagcacaactgcaatagacctcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 19066526  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
19066525 ggtgttcacaatacaa 19066510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 23230735 - 23230846
Alignment:
123 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||  | |||||||||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
23230735 gagatttcctatgctcaaacacaaaagcaagagacttataaacgaacagaattagacaaaaaat-gtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatggt 23230833  T
222 gttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| ||||    
23230834 gttcacaaaacaa 23230846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 24116371 - 24116486
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |    
24116371 agagacttctaatgctcaagcacagctgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacacaaaaaattatttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 24116470  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| |||||||||    
24116471 ggtgtttacaatacaa 24116486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 519 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 25723059 - 25722963
Alignment:
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||    
25723059 atcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacatttgtacttt 25722963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 32756997 - 32757108
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
32756997 ataatcacaaagattacaaatgctcaatac--tctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 32757093  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
32757094 agcaagagtcttcta 32757108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20030503 - 20030390
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
20030503 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 20030405  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
20030404 agcaagagtcttcta 20030390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 29384348 - 29384462
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
29384348 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 29384446  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
29384447 -aagcaagagacttcta 29384462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 533 - 615
Target Start/End: Original strand, 6158316 - 6158398
Alignment:
533 attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
6158316 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6158398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14070808 - 14070666
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||  || | |||| ||||||||  ||||||||||||||     
14070808 ccttgcacttccaaggagagttccactaagta-taatcacaactgattacaactgctcaatacttcaacaagtacgagacttca-aaatgctcaagcaca 14070711  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 161  Q
    ||  | |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
14070710 caa-caagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttct 14070666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Original strand, 16914969 - 16915079
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | | |    
16914969 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacataatttcaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtcg 16915068  T
221 tgttcacaata 231  Q
    |||||||||||    
16915069 tgttcacaata 16915079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 234
Target Start/End: Original strand, 32543817 - 32543921
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcaca 228  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
32543817 aatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaatttttttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaca 32543915  T
229 atacaa 234  Q
    ||||||    
32543916 atacaa 32543921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #188
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 23284438 - 23284603
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||  | | |||||||||||||| || ||||||| |||||| |   |||||||||| |  |||||||    
23284438 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatgtttattgtcctatgaaggattaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggc 23284537  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | | || ||||||||| ||||| |||||||    
23284538 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagataatggttatacactt 23284603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #189
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 25787299 - 25787411
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||    
25787299 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgacacttctcaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 25787397  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
25787398 gcaagagtcttcta 25787411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #190
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28252151 - 28252048
Alignment:
61 agattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagac 157  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
28252151 agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcact-aagcaagagac 28252053  T
158 ttcta 162  Q
    |||||    
28252052 ttcta 28252048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #191
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28357298 - 28357195
Alignment:
61 agattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagac 157  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
28357298 agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcact-aagcaagagac 28357200  T
158 ttcta 162  Q
    |||||    
28357199 ttcta 28357195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #192
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 12422817 - 12422919
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12422817 tgctcaagcacaactgcaggagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 12422915  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
12422916 acaa 12422919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #193
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Original strand, 12827289 - 12827388
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
12827289 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 12827388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #194
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 193
Target Start/End: Original strand, 15986908 - 15986968
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga 193  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
15986908 atgctcaagcacaactgcaagagacttctactcaaacagaattacacagaaaattgtttga 15986968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #195
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19952178 - 19952064
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
19952178 agagacctctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattact-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatataaaatcagt 19952080  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
19952079 ggtgttcacaatacaa 19952064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #196
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Original strand, 21234705 - 21234815
Alignment:
126 acttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    ||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
21234705 acttctaatgctcaagcacaactgcgagagacttcttaattcaaatagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtg 21234803  T
223 ttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||    
21234804 ttcacaatacaa 21234815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #197
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 22801682 - 22801796
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttg-acttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||  |||||||||||||| |    
22801682 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattaca-agcaaaatgtttgcagttgaaccattgatatacaatcagt 22801780  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
22801781 ggtgttcacaatacaa 22801796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #198
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 26589141 - 26589256
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
26589141 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagaattctaaattcaaacaaaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 26589240  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
26589241 ggtgttcacaatacaa 26589256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #199
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 4630467 - 4630581
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
4630467 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 4630565  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
4630566 -aagcaagagacttcta 4630581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #200
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 14051654 - 14051531
Alignment:
446 ttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcag 545  Q
    |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||| |||||  |  |||||| |||| ||||||||||||    
14051654 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaacatttctgcaggcag 14051555  T
546 agctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
14051554 agctgtttttcttgtcttgtagcg 14051531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #201
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 14070335 - 14070212
Alignment:
446 ttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcag 545  Q
    |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || || ||||||| |||||  |  |||||| |||| ||||||||||||    
14070335 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatttggatgatgtcctatgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaacatttctgcaggcag 14070236  T
546 agctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
14070235 agctgtttttcttgtcttgtagcg 14070212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #202
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16124135 - 16124022
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||| |    
16124135 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctaaagcact-a 16124037  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
16124036 agcaagagtcttcta 16124022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #203
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16265713 - 16265643
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
16265713 tcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 16265643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #204
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16463258 - 16463143
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattac-acagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatca-at 218  Q
    |||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||  |||||||||||||||| |||||  |    
16463258 agagacttcctatactcaagcacaattgcaagagacttctattcaaacagaattacaaaaaaaaaatgtttgaggttgaacacttgatataaaatcagtt 16463159  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
16463158 ggtgttcacaatacaa 16463143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #205
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 16930047 - 16930161
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
16930047 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 16930145  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
16930146 -aagcaagagacttcta 16930161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #206
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 16959218 - 16959332
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
16959218 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 16959316  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
16959317 -aagcaagagacttcta 16959332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #207
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17303878 - 17303807
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga 193  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
17303878 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttga 17303807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #208
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 19688349 - 19688436
Alignment:
149 gcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
19688349 gcaagagacttctaattcaaacagaattacaaagaaaaatatttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaa 19688436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #209
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20063254 - 20063141
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||| |    
20063254 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtact-a 20063156  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
20063155 agcaagagtcttcta 20063141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #210
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 26025055 - 26025169
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
26025055 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 26025153  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
26025154 -aagcaagagacttcta 26025169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #211
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 26035629 - 26035743
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
26035629 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 26035727  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
26035728 -aagcaagagacttcta 26035743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #212
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 26864382 - 26864496
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
26864382 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 26864480  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
26864481 -aagcaagagacttcta 26864496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #213
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 26875006 - 26875120
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
26875006 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 26875104  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
26875105 -aagcaagagacttcta 26875120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #214
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27341290 - 27341404
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
27341290 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27341388  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
27341389 -aagcaagagacttcta 27341404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #215
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27402030 - 27402144
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
27402030 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27402128  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
27402129 -aagcaagagacttcta 27402144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #216
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27412689 - 27412803
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
27412689 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27412787  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
27412788 -aagcaagagacttcta 27412803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #217
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31983226 - 31983112
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
31983226 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 31983128  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
31983127 -aagcaagagacttcta 31983112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #218
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32301643 - 32301529
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
32301643 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 32301545  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
32301544 -aagcaagagacttcta 32301529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #219
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32312332 - 32312218
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
32312332 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 32312234  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
32312233 -aagcaagagacttcta 32312218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #220
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 9717717 - 9717882
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | |  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||| |  |||||||    
9717717 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattctcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgttgcaggc 9717816  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || |||||||||||| |   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
9717817 agagctgtttttcttgtcttgtatcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9717882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #221
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 32544139 - 32544304
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||  ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||    
32544139 ctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggc 32544238  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
32544239 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 32544304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #222
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10404138 - 10404043
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagca 143  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||    
10404138 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 10404043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #223
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 21624632 - 21624746
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||||||| | |    
21624632 agagacttctaatgctcaatcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggtcgaacacttgatatacaattagt 21624730  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||| |||||||||||    
21624731 ggtgctcacaatacaa 21624746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #224
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15532233 - 15532118
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct---agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||   | |||||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||     
15532233 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaatagacttctttaattcaaacagaactaca-agaaagatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcag 15532135  T
218 tggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||| |||||    
15532134 tggtgttcacattacaa 15532118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #225
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Original strand, 15987126 - 15987272
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 561  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||     
15987126 atcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgttatccttgtcc 15987225  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||    ||||||  | | ||  ||||||||||||||||||||||    
15987226 tgtagtagagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacactt 15987272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #226
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 193
Target Start/End: Original strand, 17867179 - 17867269
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga 193  Q
    |||||||| ||| || || |||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||    
17867179 atgctcaaccacacacgcaagagacttcatacgctcaagcacaaaaacaagagacttctaatcaaacagaattacacggaaatttttttga 17867269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #227
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 193
Target Start/End: Original strand, 17876962 - 17877052
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga 193  Q
    |||||||| ||| || || |||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||    
17876962 atgctcaaccacacacgcaagagacttcatacgctcaagcacaaaaacaagagacttctaatcaaacagaattacacggaaatttttttga 17877052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #228
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 20112975 - 20112813
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||  ||||| |   ||| ||||||||  ||||||     
20112975 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatctattccaagtatgagggaacaatgttgcaggg 20112876  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtaca 605  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||   ||||||  | | || ||||||||||||||||||||    
20112875 agagctgttattcttgtcttgtcgcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 20112813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #229
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 14100694 - 14100550
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtctt 562  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||| ||||    |||| |||||| |||| |||||||||    
14100694 atcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaagaaacatcgttgcatgcagagttgttttcttgtctt 14100595  T
563 gtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
14100594 gtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14100550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #230
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 15302074 - 15302239
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||||||||||| || |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||    
15302074 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctatgaaggatgaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 15302173  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||||||| |||||||||||||   |||||   | | || |||||||||||||||||||||||    
15302174 atagctgttatccttgtcttgtagcagagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 15302239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #231
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 15954239 - 15954353
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||  | ||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |    
15954239 agagacttctaatgctcaagcacaactacaagagacttctgaattcaaacataattata-agaaaaatgtttgaggttgaacatttgatatacaattagt 15954337  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
15954338 ggtgttcacaatacaa 15954353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #232
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17317103 - 17317016
Alignment:
150 caagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||  ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
17317103 caagagacttctaaattcaaacataattacaatgaaaaatggttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 17317016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #233
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 139
Target Start/End: Original strand, 25583509 - 25583600
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctca 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||    
25583509 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcatgagtcttccaatgctca 25583600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #234
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 25593612 - 25593727
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   | ||| ||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
25593612 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaatttaaatagaattataaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 25593711  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    | | ||||||||||||    
25593712 gatattcacaatacaa 25593727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #235
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10705064 - 10705025
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
10705064 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 10705025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #236
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Original strand, 21617862 - 21617901
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
21617862 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21617901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #237
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 24116744 - 24116867
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || | ||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||  | | ||    
24116744 gtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaagaacattgttgaaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagt 24116843  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||||||||||||||||||||    
24116844 agtggagatagtggttgtacactt 24116867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #238
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24470993 - 24470850
Alignment:
128 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct-agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttca 226  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||| |  |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
24470993 ttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttcttaaacaaaca-aattacaaagaataa-gtttga-ttgaacactagatatgcaatcattggtgttca 24470897  T
227 caatacaatgcaataaaagactct-agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    ||||||||  | |||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
24470896 caatacaacac-atatcagactctaagacttatgaatttctaagatat 24470850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #239
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 29917933 - 29918056
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||  |||| |||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||| ||    
29917933 gtcctatgaagaatcaatttcaaatgcattcccattgtgaatgaacatctttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagt 29918032  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
29918033 agtggaggtagtggttgtacactt 29918056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #240
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31127899 - 31127801
Alignment:
128 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcac 227  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||        |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
31127899 ttcctatgatcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaacaaaattacaa-------tgtttaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctc 31127807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #241
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31720151 - 31720073
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaa-tacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatat 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  || |  | |||||||||||||||||||||||||||||    
31720151 ttgaacacttgatatacaatcagaggtgttcacaaatacaaatcagttga-gactctagacttaagaatttctaagatat 31720073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #242
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 16265406 - 16265260
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagct-gttatcttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||  | |||||||||||||  || ||||||||    
16265406 atcttttgcctgatatggttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgcgaaggaacatctttgcaggcagagctatttttcttgtct 16265307  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   ||||||  ||| || |||||| ||||||||| ||||||    
16265306 tgtagcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacactt 16265260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #243
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 233
Target Start/End: Original strand, 16876447 - 16876560
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |   ||||||||||||  | ||||||||||||||| | || ||  |||   || ||||||||||||||||||| ||    
16876447 agagacttctattgctcaagcacaacttcaagagacttctcaattcaaacagaattacaaaaaatatgttttagtttaaacacttgatatacaatcagtg 16876546  T
220 gtgttcacaataca 233  Q
    ||||||||||||||    
16876547 gtgttcacaataca 16876560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #244
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 21234998 - 21235164
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||  |||| ||| | | |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||  |  ||||||    
21234998 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcttcgcaggc 21235097  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacaca-ctcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||| |  |||| || |||||| ||||||||||||||||    
21235098 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaatatcagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21235164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #245
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Original strand, 25678979 - 25679028
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
25678979 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacatattacaa 25679028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #246
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 234
Target Start/End: Original strand, 24398393 - 24398430
Alignment:
197 gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
24398393 gaacacttgatatacaatcaatgatgttcacaatacaa 24398430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #247
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7376358 - 7376244
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||  |||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||| |||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
7376358 ataatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 7376260  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
7376259 aagcaagagtcttcta 7376244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #248
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 14757867 - 14758039
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt-ctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttga 198  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||| |||| |  |||||  |||     
14757867 caaatactcaagcacacaagcaagagattttctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcctaaacaaaca-aattacaaagaata-agtttg-gttgt 14757963  T
199 acacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct-agacttaagaatttctaagatata 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||  ||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||    
14757964 acacttgatatacaatcaaaggtgttaaaaatacaaaacaattcaa-actctaagactaaagaatttataagatata 14758039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #249
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14883586 - 14883515
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga 193  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||| || || ||||||| |||||||||||||| |||||||    
14883586 agagatttcctatgctcaggcacaaaagcatgagagttgtaatcaaacacaattacacagaaaaatgtttga 14883515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #250
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 15954619 - 15954742
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||| || |||||||||||||    |||| |  ||| ||    
15954619 gtcctatgaaggattaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacaaaaacagagt 15954718  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
15954719 agtggaggtagtggttgtacactt 15954742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #251
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 20730960 - 20730814
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | |||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||  ||||||||||  | || ||||||||||| || ||||||||    
20730960 atcttttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcacattgtgaaggaacatctttgtaggcagagctgtttttcttgtct 20730861  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   |||| |  ||| |  |||||| ||||||||||||||||    
20730860 tgtagctgagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactt 20730814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #252
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 29917565 - 29917661
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |  |||| ||||||||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
29917565 agagacttctaatgctcaagcaaaactgcaaaagacttcttaattcaaacagaattacaaaaaaaat-gtttgaggttgaacacttgatatacaatca 29917661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #253
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 517
Target Start/End: Original strand, 19470545 - 19470618
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||| ||||||    
19470545 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggattaatttcaaatccattcc 19470618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #254
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 524 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22076602 - 22076517
Alignment:
524 gaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
22076602 gaagaaacaatgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 22076517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #255
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 438
Target Start/End: Original strand, 32335621 - 32335697
Alignment:
362 atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttg-agatcttaagcacgtctaaagagtcgttg 438  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |  ||||| || ||||||||||||    
32335621 atcttcaagtcttcactcacttatatagaggtgtg-agagagacgttgtagatttccagcacatcaaaagagtcgttg 32335697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #256
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17982987 - 17982959
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
17982987 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 17982959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #257
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17985196 - 17985168
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
17985196 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 17985168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #258
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 229
Target Start/End: Original strand, 19875360 - 19875487
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct-agtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaac 200  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||   |||  ||||||||| | | ||||| ||||||||| |||||| |||||||  || |||    
19875360 atgctcaagcacaaacgcaagagacttcctatgctcaagcttaaaataaagagacttttaattcaaaaagaattacaaagaaaa-tgtttgaggttaaac 19875458  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaa 229  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||    
19875459 aattgatatacaattagtggtgttcacaa 19875487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #259
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 362 - 437
Target Start/End: Original strand, 23296516 - 23296591
Alignment:
362 atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttga-gatcttaagcacgtctaaagagtcgtt 437  Q
    ||||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||    
23296516 atcttcaagtctttaatccattatatagtggtgtg-agagagacgttgatgattttcagcacatcaaaagagtcgtt 23296591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #260
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 25518396 - 25518424
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
25518396 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 25518424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #261
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Original strand, 27474518 - 27474557
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
27474518 agagacttctaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 27474557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #262
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Original strand, 27504016 - 27504055
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
27504016 agagacttctaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 27504055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #263
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 29384462 - 29384490
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
29384462 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 29384490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 475; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 29427 - 28829
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
29427 ccttgcacttccaatgagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcatgcat 29328  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
29327 gctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 29228  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaattt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
29227 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaattagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaattt 29128  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgaga-tctta 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||     
29127 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgttgatgtctctgctgatcttcgagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttt 29028  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29027 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 28928  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtgga-gatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
28927 aatcttaaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtagaggatagtggttgtacacttgtacttt 28829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 474; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 831 - 1428
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
831 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagaatgcccaaatgctcaagcacgcag 930  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
931 gcgagagacttcctatgttcaaggactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcag 1030  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
1031 tggtgttcacaatacaatgcaacaaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatt 1130  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
1131 tgacagagtttgggcgcttttaacttgtagtaatgtctcttataatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatttta 1230  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1231 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 1330  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
1331 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtacttt 1428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 615
Target Start/End: Original strand, 1460 - 2043
Alignment:
33 ggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcca 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
1460 ggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagaatgcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcct 1559  T
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
1560 atgatcaagaactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 1659  T
232 caatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttggg 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
1660 caatgcaacaaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttgacagagtttggg 1759  T
332 cgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaaga 431  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
1760 cgcttttaacttgtagtaatgtctcttataatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagattttaagcacgtctaaaga 1859  T
432 gtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1860 gtcgttgagttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac 1959  T
532 aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
1960 aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtacttt 2043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 471; Significance: 0; HSPs: 246)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 19313627 - 19313029
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19313627 ccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattataactgctcaatactaccgagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 19313528  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
19313527 gcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcag 19313428  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
19313427 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatt 19313328  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
19313327 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtagtaatgtctctactgatcttcaagtcttcactttcttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctta 19313228  T
418 agcacgtc-taaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
19313227 agcacgtcttaaagagtcgttgagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattt 19313128  T
517 ctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
19313127 ctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacactcagagttgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 19313029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 19498600 - 19498003
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19498600 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 19498501  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||     
19498500 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaagttgtttgagtttgaacacttgatatacaatcag 19498401  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
19498400 tggtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcacagtgcttttgagaatcaaatt 19498301  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||     
19498300 tggcagagtttgggcgtttttaacttgtgttgatgtctcttaaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattttt 19498201  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
19498200 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcatgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaagttcaaattcattcc 19498101  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19498100 tatcttaaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagagtagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19498003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 19300571 - 19300022
Alignment:
68 aactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaa 167  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19300571 aactgctcaatactacctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaa 19300472  T
168 acagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19300471 acagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttct 19300372  T
267 aagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatctt 366  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
19300371 aagatatatcaaatcaatgtagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcaaagtttgggcgcttttaacttgtagtaatgtctctactgatctt 19300272  T
367 caagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtc-taaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatc 465  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
19300271 caagtattcacttttttatatagaggtgtgtggagagacgttgagatcttaagcacgtcttaaagagtcgttgagtacctttgatcatccaccagtaatc 19300172  T
466 ttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 565  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
19300171 ttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggataaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtctggta 19300072  T
566 gcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||  ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19300071 gcgtagacacactcagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19300022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 19356043 - 19356536
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19356043 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 19356142  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaa-ttcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
19356143 gttcacaatacaatgcagtaaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttgg 19356242  T
321 cagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
19356243 tagagttttggcgcttttaacttgtgttgatttctcttt-gatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatctttagc 19356341  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
19356342 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccatcagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcctat 19356441  T
521 cttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
19356442 cttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtaacgaggagacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19356536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 968028 - 967515
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
968028 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgactttgaac 967930  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
967929 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcatatcagtgcagaaattcaaagtg 967831  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||    
967830 ctttatagaatcaaatttggcagagttttgacgcttttaacttgtgttgatgtctcttaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtag 967731  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
967730 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgacggat 967631  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
967630 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 967531  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
967530 tgtacacttgtacttt 967515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20647116 - 20646619
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
20647116 agagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtgg 20647017  T
221 tgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttt-gagaattaaattt 318  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| | |||  ||||||    
20647016 tgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgttttttgtgaaacaaattt 20646917  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt-a 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
20646916 ggcagagtttgggcgcttttaatttgttgtcttgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttta 20646817  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
20646816 agcacgtctaaagagtcgttgagaacctttgatcatccaccagtaatcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcc 20646717  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
20646716 tatcttgaaggaacatttttgcaggcagagctgttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 20646619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 24274729 - 24275242
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||    
24274729 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaattacacagaatat-gtttgactttgaac 24274827  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
24274828 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattaaaagtg 24274926  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
     |||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||    
24274927 ttttatagaatcaaatttggcagaattttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtag 24275026  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
24275027 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgacggat 24275126  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| |||||||    
24275127 caaattcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 24275226  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
24275227 tgtacacttgtacttt 24275242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 22774062 - 22774575
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||    
22774062 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaattaaacaaaattacacagaaaat-gtttgagattgaac 22774160  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
22774161 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtg 22774259  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||    
22774260 ctttatagaatcaaatttgacagagtttaggcgcttttaacttgt-atgttgtctcttatcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggttagtag 22774358  T
400 agagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
22774359 agagacgttgagatcctttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagga 22774458  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |   || || |||||| ||||||    
22774459 tcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtgg 22774558  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
22774559 ttgtacacttgtacttt 22774575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 187 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17969650 - 17969221
Alignment:
187 tgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtg 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
17969650 tgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtg 17969552  T
286 cagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttcctta 384  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | |||    
17969551 cagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactccttta 17969452  T
385 tatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgt 484  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
17969451 tatagaggtgagtaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgt 17969352  T
485 agtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |   || ||    
17969351 agtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagt 17969252  T
585 cgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||    
17969251 agtggatgtagtggttgtacacttgtacttt 17969221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 22763358 - 22763871
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||    
22763358 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttccaatcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgagattgaac 22763456  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
22763457 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtg 22763555  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc-taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| || | || |||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||    
22763556 ctttatagaatcaaatttgacagagtttaggcgcttttaacttgt-atgttgtctcttatcaattttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtag 22763654  T
400 agagacgttgagat-cttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||    
22763655 agagacgttgagatcctttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttggatgttctcctatgacgga 22763754  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
22763755 tcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggtagagctggtgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 22763854  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
22763855 ttgtacacttgtacttt 22763871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 568
Target Start/End: Original strand, 22754907 - 22755460
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
22754907 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaacttctcaacactacacctagtatgagacttcacagatgcttaagcacgc 22755006  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatc 215  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
22755007 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaatagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatataaaatc 22755106  T
216 aatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttt--gagaatt 312  Q
    |  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |  | ||       
22755107 agcggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgcttctaagtgacac 22755206  T
313 aaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgaga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||    |||||||| |||| ||| | |||||||| ||| || | |||||||||| ||    
22755207 aaatttggcagagtttgggcgctattaacttgttgttgtgtctct--gaatcttcaaatctttactcctttatatagaggt-tgaaaagagacgttggga 22755303  T
413 tc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaatt 511  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||     
22755304 cctttaagcacgtctaaagagtcgttgagaacc-ttgatcagtcaccaatgatcttttgtctgatttggatattgtcatatgaaggatcaagttcaaatc 22755402  T
512 cattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
22755403 cattcctatcttgaaggaacatttctgcagacagagctgttatacttgtcttgtagcg 22755460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36785303 - 36784817
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | || |||    
36785303 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgactttgaacacttgatatactaacagtgg 36785205  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
36785204 tgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaatttgg 36785106  T
321 cagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||    
36785105 cagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctctgaccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatttttag 36785007  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||     
36785006 cacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcatttgagggatcaacttcaaattcattccc 36784907  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36784906 atcttgaaggaacaattctgcaggc-------ttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36784817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 132 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 28065405 - 28064924
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||||  ||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
28065405 aatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 28065307  T
231 acaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgg 330  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | |||||||| |    
28065306 acaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttg 28065209  T
331 gcgcttttaacttgtgataatgtct--ctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaa 428  Q
     |||||||||||| || | || |||  ||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||    
28065208 acgcttttaacttatgttgatctctgtctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtctaa 28065111  T
429 agagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaagg 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
28065110 agagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaagg 28065011  T
529 aacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
28065010 aacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 28064924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 132 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 27978876 - 27978395
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||||  ||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
27978876 aatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 27978778  T
231 acaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgg 330  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | |||||||| |    
27978777 acaatgcaataaa-gactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttg 27978680  T
331 gcgcttttaacttgtgataatgtct--ctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaa 428  Q
     |||||||||||| || | || |||  ||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||    
27978679 acgcttttaacttatgttgatctctgtctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtctaa 27978582  T
429 agagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaagg 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
27978581 agagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaagg 27978482  T
529 aacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
27978481 aacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27978395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 38586591 - 38586100
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
38586591 agagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttatgttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtgg 38586493  T
221 tgttcacaa-tacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |    
38586492 tgttcacaaatataatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-g 38586395  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
38586394 acagagttttggcgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcccttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgatt 38586298  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
38586297 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 38586198  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
38586197 catcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttttagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 38586100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18769409 - 18768919
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
18769409 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 18769310  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
18769309 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 18769212  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
18769211 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagc 18769114  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||    
18769113 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 18769014  T
521 cttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
18769013 cttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18768919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 26866795 - 26867287
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaat-tacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| ||  ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
26866795 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtgg 26866894  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |     
26866895 tgttctcaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-ga 26866992  T
321 cagagtttgggcgctttt--aacttgtgata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| ||| || | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
26866993 cagagttttggcgcttttttaacttgt-atatatctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgatt 26867089  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
26867090 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccaacaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 26867189  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
26867190 catcttgaaggaacaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 26867287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 187 - 615
Target Start/End: Original strand, 26879450 - 26879876
Alignment:
187 tgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||    
26879450 tgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaataagtgc 26879548  T
287 agaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt--aacttgtgata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcacttcctt 383  Q
    |||||||||  |||||||   |||| ||||| | |||||||| | |||||||  ||||||| ||| || | |||||  ||||||||||||||||| | ||    
26879549 agaaattcagtgtgctttgttgaatcaaatt-gacagagttttgacgcttttttaacttgt-atatatctatctaca-atcttcaagtcttcactccttt 26879645  T
384 atatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtg 483  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
26879646 atatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagcaatcctttgtctgatttgggtg 26879744  T
484 tagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcaggg 583  Q
    ||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| |    
26879745 tagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagag 26879844  T
584 tcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||    
26879845 tagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 26879876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24415525 - 24415035
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || |||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24415525 agagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagagataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 24415426  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
24415425 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 24415328  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | | |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
24415327 agagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctatctaca-atcttcaagtcttcactccttcatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagc 24415230  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||  ||    
24415229 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcat 24415130  T
521 cttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24415129 cttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24415035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Original strand, 1083537 - 1084047
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
1083537 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacat 1083636  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
1083637 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaaatgagagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 1083736  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgt 397  Q
    |||||  || |||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |  ||| |||    ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||     
1083737 gcttttatgtgaaacaaatttagcagagttttggcgcttttaatttgttgtcttgtgtct-tttatcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtg- 1083834  T
398 agagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaag 496  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
1083835 aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaagccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaag 1083934  T
497 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatag 595  Q
    |||||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||    
1083935 gatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtag 1084034  T
596 tggttgtacactt 608  Q
    |||| ||||||||    
1084035 tggtcgtacactt 1084047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23393245 - 23392735
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
23393245 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 23393146  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
23393145 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 23393046  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgt 397  Q
    |||||  || |||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |   || |||   |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||     
23393045 gcttttatgtgaaacaaattttgcaaagtttgggcgcttttaacttgttgtctcgt-tcttttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg- 23392948  T
398 agagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaag 496  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |     |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
23392947 aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaataaagtcgttgtgaaatcttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaag 23392848  T
497 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatag 595  Q
    |||||  ||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||| || ||  ||||  |||    
23392847 gatcacgttcaaatccatttctattctgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcattgtcttgtagcagagacaaacttagagtaatggaagtag 23392748  T
596 tggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||    
23392747 tggttgtacactt 23392735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 29243946 - 29244438
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
29243946 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 29244045  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
29244046 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 29244142  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || | |||    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
29244143 agagttttggcgctttttaacttatgtatatctgtctttt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagc 29244240  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
29244241 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 29244340  T
520 tcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
29244341 tcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 29244438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 29254525 - 29255017
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
29254525 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 29254624  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
29254625 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 29254721  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || | |||    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
29254722 agagttttggcgctttttaacttatgtatatctgtctttt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagc 29254819  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
29254820 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 29254919  T
520 tcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
29254920 tcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 29255017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 24428090 - 24427670
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || |||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24428090 agagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagagataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 24427991  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
24427990 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 24427893  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||| ||||  | |||    
24427892 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttaagatgattagc 24427795  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||    
24427794 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgactgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 24427695  T
521 cttgaaggaac-aattctgcaggca 544  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
24427694 cttgaaggcacaaattctgcaggca 24427670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 188 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 28721754 - 28721329
Alignment:
188 gtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
28721754 gtttgacttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaatataatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgca 28721656  T
288 gaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttata 386  Q
     |||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||    
28721655 aaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttata 28721558  T
387 tagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgta 485  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
28721557 tagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgta 28721459  T
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| ||    
28721458 gtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagt 28721360  T
585 cgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||    
28721359 agtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 28721329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 10277295 - 10277787
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
10277295 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 10277394  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
10277395 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 10277491  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | ||||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
10277492 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 10277589  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
10277590 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 10277689  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
10277690 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 10277787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18393141 - 18392649
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
18393141 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 18393042  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
18393041 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 18392945  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
18392944 agagttttggcgcttttgaacttatgtatatttctct-caaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagatagtcagc 18392847  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
18392846 acgtctaaagagtcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattccca 18392747  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
18392746 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18392649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 28732406 - 28731917
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
28732406 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 28732307  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
28732306 gttcacaatataatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 28732209  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
28732208 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagc 28732111  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |    
28732110 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattccca 28732011  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||  ||||||||||||||    
28732010 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggt--tacacttgtacttt 28731917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38033442 - 38033152
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
38033442 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcaaaaaatgctcaagcacgca 38033343  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatca 216  Q
    ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
38033342 ggcaaaagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaatagaattaaacagaaaattgtttgagtttgaacacttgaaatacaatca 38033243  T
217 atggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaa 310  Q
     |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    || ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
38033242 gtggtgttcacaatataatgcaattgaaagactctag----aaaaatttctaaaatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgcttttgagaa 38033152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 4220205 - 4220699
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
4220205 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 4220304  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
4220305 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 4220401  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-at-aatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||   |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
4220402 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgtctcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatca 4220499  T
419 gcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
4220500 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcc 4220599  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4220600 catcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4220699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 1099699 - 1099207
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
1099699 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 1099600  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
1099599 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 1099503  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
1099502 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 1099405  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
1099404 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 1099305  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
1099304 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 1099207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 10266718 - 10267210
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
10266718 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 10266817  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
10266818 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 10266914  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    | ||||| ||||||||| ||||| ||    | ||||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
10266915 aaagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 10267012  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
10267013 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 10267112  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
10267113 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 10267210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 21172970 - 21172479
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| ||| |  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
21172970 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 21172871  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
21172870 gttcacaacacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 21172773  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
21172772 agagttttggcgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattag 21172676  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
21172675 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 21172576  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
21172575 atcttgaaggcacaaattctgcaagcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 21172479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 32217598 - 32218090
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
32217598 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 32217697  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
32217698 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 32217794  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
32217795 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 32217892  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
32217893 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 32217992  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
32217993 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 32218090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 34790721 - 34790229
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
34790721 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 34790622  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
34790621 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 34790525  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||   | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
34790524 agagttttggcgcttttgaacttatgaatctctttct-tcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 34790427  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
34790426 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 34790327  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
34790326 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 34790229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 39170599 - 39170107
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
39170599 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 39170500  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
39170499 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 39170403  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
39170402 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 39170305  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
39170304 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 39170205  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
39170204 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 39170107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 43354747 - 43355238
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
43354747 agagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 43354846  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
43354847 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 43354943  T
322 agagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
43354944 agagttttggcgcttttaaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 43355038  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
43355039 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 43355138  T
517 ctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
43355139 ccatcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 43355238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 11395676 - 11395184
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
11395676 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 11395577  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
11395576 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 11395480  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||   | ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
11395479 agagttttggcgcttttaaacttatg--tatctctctcttgaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcag 11395383  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
11395382 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 11395283  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
11395282 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 11395184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 11405992 - 11405500
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
11405992 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 11405893  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
11405892 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 11405796  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||   | ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
11405795 agagttttggcgcttttaaacttatg--tatctctctcttgaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcag 11405699  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
11405698 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 11405599  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
11405598 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 11405500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 34477653 - 34478144
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
34477653 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 34477752  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
34477753 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 34477849  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
34477850 agagttttggcgcttttgaacttatgt--atctctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcag 34477946  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
34477947 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 34478046  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
34478047 atcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 34478144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 7006311 - 7005819
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
7006311 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 7006212  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |      
7006211 gttcacaatacaatacagtaca-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gat 7006115  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
7006114 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc 7006020  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
7006019 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 7005920  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
7005919 ccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 7005820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 11389313 - 11388821
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
11389313 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 11389214  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
11389213 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 11389117  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
11389116 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctct-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 11389019  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
11389018 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 11388919  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
11388918 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 11388821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17857941 - 17857449
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| || |    
17857941 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtgat 17857842  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
17857841 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 17857745  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||| || ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
17857744 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgtct-ccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 17857647  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
17857646 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 17857547  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
17857546 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 17857449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 34804864 - 34804372
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
34804864 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 34804765  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
34804764 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 34804668  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||   | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | | |    
34804667 agagttttggcgcttttgaacttatgaatctctttct-tcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcacc 34804570  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
34804569 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 34804470  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
34804469 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 34804372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 43345132 - 43345623
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
43345132 agagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 43345231  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
43345232 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 43345328  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
43345329 agagttttggcgcttttaaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 43345423  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||     
43345424 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattt 43345523  T
517 ctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
43345524 ccatcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 43345623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 189 - 615
Target Start/End: Original strand, 2561279 - 2561705
Alignment:
189 tttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcag 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
2561279 tttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaattaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcag 2561377  T
289 aaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttcctta 384  Q
    |||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||| | ||||||| ||| ||||   ||||||||  | |   |||||||||||||||| | |||    
2561378 aaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttgacgctttttaacctgtgt--atgtctctctctacaatcttcaagtcttcactccttta 2561474  T
385 tatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtg 483  Q
    ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
2561475 tatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtg 2561573  T
484 tagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagg 582  Q
    ||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||     
2561574 tagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacaga 2561672  T
583 gtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
2561673 gtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 2561705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 4209613 - 4210107
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
4209613 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatataatcagtggt 4209712  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
4209713 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 4209809  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-at-aatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| || ||   |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
4209810 agagttttgacgcttttgaacttatgtatctctgtctcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatca 4209907  T
419 gcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
4209908 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcc 4210007  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4210008 catcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4210107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 51 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 21651113 - 21650544
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
21651113 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 21651015  T
146 aaagcaagagacttctagt---caaaca-gaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaata 241  Q
    || |||||||||||||| |   ||| || | |    | ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |    
21651014 aa-gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacag-a 21650917  T
242 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaa- 340  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||     
21650916 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgcttttaaa 21650819  T
341 cttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-g 438  Q
    ||||||   || ||| ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |    
21650818 cttgtgt--atctctatattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 21650722  T
439 agttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctg 538  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||    
21650721 aaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaattctg 21650622  T
539 caggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
21650621 caggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 21650544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24338908 - 24338416
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24338908 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 24338809  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
24338808 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 24338712  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
24338711 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 24338617  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
24338616 agcatgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccatcagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 24338517  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
24338516 ccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 24338417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36252348 - 36251856
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
36252348 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 36252249  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||| ||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
36252248 gttcacaacacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 36252152  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||    | |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
36252151 agagttttggcgctttttaacttatgtatctctctcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 36252054  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
36252053 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 36251954  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36251953 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36251856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 40222056 - 40222549
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgat-atacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
40222056 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgattatacaatcagtgg 40222155  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| |||     
40222156 tgttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttga 40222252  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
40222253 cagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 40222350  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
40222351 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 40222450  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
40222451 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 40222549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24328238 - 24327746
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24328238 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 24328139  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
24328138 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 24328042  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
24328041 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 24327947  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
24327946 agcatgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 24327847  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | || |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
24327846 ccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 24327747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 35263315 - 35263808
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
35263315 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 35263414  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
35263415 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 35263511  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
35263512 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 35263608  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
35263609 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 35263708  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
35263709 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 35263808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 35273940 - 35274433
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
35273940 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 35274039  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
35274040 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 35274136  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
35274137 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 35274233  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
35274234 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 35274333  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
35274334 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 35274433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 22915368 - 22914876
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
22915368 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 22915269  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
22915268 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 22915172  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||   || ||| ||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
22915171 agagttttggcgtttttgaacttatg--tatctctatatacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 22915075  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
22915074 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 22914975  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  ||| || | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
22914974 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 22914876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 27221105 - 27221598
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || || | ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
27221105 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatatagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 27221204  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
27221205 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 27221301  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
27221302 agagttttggcgcttttaaacttatgtatatctctgt-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 27221399  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
27221400 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 27221499  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
27221500 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 27221598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 40250917 - 40251410
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgat-atacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
40250917 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgattatacaatcagtgg 40251016  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| |||     
40251017 tgttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttga 40251113  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
40251114 cagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 40251211  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
40251212 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 40251311  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
40251312 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 40251410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9898078 - 9897586
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||    
9898078 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttaagttgaacacttcatatacaatcagtggt 9897979  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
9897978 gttcacaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 9897882  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
9897881 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatct-gcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 9897784  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
9897783 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 9897684  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9897683 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9897586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9908666 - 9908174
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
9908666 agagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttcatatacaatcagtggt 9908567  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
9908566 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 9908470  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
9908469 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatct-gcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 9908372  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
9908371 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 9908272  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9908271 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9908174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 16768667 - 16769159
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
16768667 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 16768766  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | |||||| |    
16768767 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaa-tcaatttgac 16768863  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||  || ||| | ||||||||||||||  |     
16768864 agagttttgacgcttttgaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatataaaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 16768958  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
16768959 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattattcaccagtaatactttgcctgatttgggtgtggtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 16769058  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
16769059 ccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatgactgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 16769158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 43082378 - 43082863
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
43082378 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 43082477  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
43082478 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgactttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 43082574  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||   || ||| ||    |||||||||||       | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
43082575 agagttttggcgctttttaacttatg--tatctctatattttatcttcaagtc-------ctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcag 43082664  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
43082665 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 43082764  T
519 atcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||    
43082765 atcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagactagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 43082863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 43092987 - 43093472
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
43092987 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 43093086  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
43093087 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 43093183  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||   || ||| ||    |||||||||||       | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
43093184 agagttttggcgctttttaacttatg--tatctctatattttatcttcaagtc-------ctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcag 43093273  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
43093274 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 43093373  T
519 atcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||  ||||  |  |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||    
43093374 atcttgaacgtacaacttctgcaggcatgactgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagactagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 43093472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 22960836 - 22960344
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
22960836 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 22960737  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
22960736 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 22960640  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||   || ||| ||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
22960639 agagttttggcgtttttgaacttatg--tatctctatatacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 22960543  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||      
22960542 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctc 22960443  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  ||| || | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
22960442 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 22960344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 30489328 - 30488835
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||  ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
30489328 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatactgagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 30489229  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
30489228 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 30489132  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
30489131 agagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctata-taatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 30489034  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |    
30489033 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcgttccca 30488934  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
30488933 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 30488835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 35252706 - 35253199
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
35252706 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagttgaatttgaacacttgatatacaatcagtggt 35252805  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||||| | |    
35252806 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagact-atgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaatt-gac 35252902  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
35252903 agagttttggcgcttttgaacttatgt--atatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcag 35252999  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
35253000 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 35253099  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
35253100 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 35253199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 104 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24802125 - 24801792
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
24802125 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacac 24802026  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
24802025 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatga-cacagaaattctaagt 24801927  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgt 397  Q
    |||||  || |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||     
24801926 gcttttatgtgaaacaaattt-gcagagttttggcgcttttaacttgttgtcttgt-tctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg- 24801830  T
398 agagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtc 434  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||    
24801829 aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtc 24801792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9763272 - 9762782
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
9763272 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 9763173  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||| ||| ||| |    
9763172 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtaaaatcaaa-ttgac 9763076  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| |    ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
9763075 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctctgttttaatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 9762980  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
9762979 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 9762880  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9762879 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9762782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9773808 - 9773318
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
9773808 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 9773709  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||| ||| ||| |    
9773708 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtaaaatcaaa-ttgac 9773612  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| |    ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
9773611 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctctgttttaatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 9773516  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
9773515 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 9773416  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9773415 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9773318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19303061 - 19302909
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
19303061 ccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcag 19302962  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacag 171  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19302961 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacag 19302909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24815092 - 24814887
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
24815092 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacac 24814993  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
24814992 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 24814893  T
300 gctttt 305  Q
    ||||||    
24814892 gctttt 24814887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 19355910 - 19356051
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
19355910 ccttgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcctaaatgctcaagcacgcag 19356009  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
19356010 gcaagagacttccaatgctcaggcactaaagcaagagacttc 19356051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 320
Target Start/End: Original strand, 1041853 - 1042070
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||  |||||||||||||  | || |||| |||||| |||||||  | |||||||||||  ||||||||| ||||    
1041853 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttataatgctcaagcacacaggcgagaggcttctaatcaaacaacaatacacagaaaaa-gtttgactttgaac 1041951  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
1041952 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 1042050  T
301 cttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||  ||||| ||||||||    
1042051 ctttgtagaatcaaatttgg 1042070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20647249 - 20647108
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
20647249 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgcttaatactacctagtatgagacttccaaattgctcaagcacgcag 20647150  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
20647149 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaatcaagagacttc 20647108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17970903 - 17970764
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
17970903 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactaactagtatgaaacttctcaaatgctcaagcacgcag 17970808  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17970807 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 17970764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 162
Target Start/End: Original strand, 24274624 - 24274759
Alignment:
23 gcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcga 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
24274624 gcacttccaaggagatttccactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactcactagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcga 24274719  T
123 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
24274720 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 24274759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 345
Target Start/End: Original strand, 1088943 - 1089135
Alignment:
159 tctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagac 254  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||    
1088943 tctattcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaaatgagagactctctagac 1089042  T
255 ttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||  || |||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
1089043 ttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaatttagcagagttttggcgcttttaatttgt 1089135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17970794 - 17970626
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
17970794 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgactttgaac 17970696  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagat 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
17970695 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaat-aaagactctagacttaagaatttctaagat 17970626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 22773951 - 22774092
Alignment:
21 ttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcagg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
22773951 ttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaatgctcaagcacacagg 22774049  T
120 cgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22774050 aaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 22774092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 122 - 338
Target Start/End: Original strand, 4099538 - 4099751
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
4099538 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatattcaatcagtggt 4099637  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
4099638 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 4099734  T
322 agagtttgggcgctttt 338  Q
    ||||||| |||||||||    
4099735 agagttttggcgctttt 4099751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 22763245 - 22763388
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
22763245 ccttgcacttccaaggagatttacactaagaaataatc-cacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaatgctcaagcacaca 22763343  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22763344 ggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 22763388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 968138 - 967998
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatc-tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||    |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
968138 ccttgcacttccaaggagatttgctct----aataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgca 968043  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
968042 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 967998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 473 - 615
Target Start/End: Original strand, 22779811 - 22779953
Alignment:
473 tgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgagga 572  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
22779811 tgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtaga 22779910  T
573 cacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    || |   || || |||||| |||||||||||||||||||||||    
22779911 caaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 22779953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 1041743 - 1041876
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||  | ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
1041743 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcttatagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgca 1041838  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1041839 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 1041876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21911447 - 21911311
Alignment:
99 ccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttg 197  Q
    |||||| ||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  |||    
21911447 ccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaaatgtttgaggttg 21911348  T
198 aacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
21911347 aacacttgatacccaatcagtggtgttcacaatacaa 21911311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 427 - 615
Target Start/End: Original strand, 4099810 - 4100000
Alignment:
427 aaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 526  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||     
4099810 aaagagacgttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgag 4099909  T
527 ggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4099910 tgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4100000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 24376656 - 24376758
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
24376656 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 24376755  T
232 caa 234  Q
    |||    
24376756 caa 24376758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 38040601 - 38040522
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttc 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
38040601 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttc 38040522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21537801 - 21537699
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
21537801 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaata 21537702  T
232 caa 234  Q
    |||    
21537701 caa 21537699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18431499 - 18431386
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
18431499 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaacagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 18431400  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
18431399 tgttcacaatacaa 18431386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 18702280 - 18702393
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
18702280 agagacttcctatgctcaagcataactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 18702379  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
18702380 tgttcacaatacaa 18702393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 405 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 24814855 - 24814690
Alignment:
405 cgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaac 503  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||      
24814855 cgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacg 24814756  T
504 ttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
24814755 ttcaaatccattcctattctgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcg 24814690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 24843743 - 24843851
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
24843743 agagacttcctatgctcaagcacaacggcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 24843842  T
221 tgttcacaa 229  Q
    |||||||||    
24843843 tgttcacaa 24843851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36785434 - 36785293
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||| | ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
36785434 ccttgcacttccaaggagattttcactaagaa----tcacaaaaattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 36785339  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
36785338 aggcaagagtcttccaatggtcaagcactaaagcaagagtcttcta 36785293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 22383020 - 22383129
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga--cttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||    
22383020 agagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacaaaaatttgtttgagggttgaacacttgatatactatcagtg 22383119  T
220 gtgttcacaa 229  Q
     |||||||||    
22383120 ttgttcacaa 22383129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23393360 - 23393219
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||    
23393360 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagt--taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacg 23393264  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
23393263 caggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 23393219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28141163 - 28141049
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||    
28141163 agagacttttaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacatttgatatacaatcagtg 28141064  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
28141063 gtgttcacaatacaa 28141049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24851224 - 24851111
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||    
24851224 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaggaaaattgtttgaggttgaacacttgatatatactcaatgg 24851125  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
24851124 tgttcacaatacaa 24851111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 25188938 - 25189051
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||    
25188938 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacactagatatacaatcagtgg 25189037  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| ||||    
25189038 tgttcacaaaacaa 25189051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22786218 - 22786103
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
22786218 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 22786119  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
22786118 ggtgttcacaatacaa 22786103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 19539955 - 19540069
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
19539955 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcaaattcaaacagaattacacataaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 19540054  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||| |||||||    
19540055 gtgttcataatacaa 19540069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Original strand, 21845678 - 21845810
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga--cttgaac 200  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||   ||||||    
21845678 atgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaaaagacttctaaacaaacacaattacaca-aaaaatgtttgaggtttgaac 21845776  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
21845777 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 21845810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22455521 - 22455436
Alignment:
150 caagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
22455521 caagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtcttcacaatacaa 22455436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24802198 - 24802099
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
24802198 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aaatgctcatgcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 24802100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26619661 - 26619548
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||     
26619661 agagacttcatatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtga 26619562  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
26619561 tgttcacaatacaa 26619548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27979015 - 27978890
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
27979015 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 27978921  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||    
27978920 aggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 27978890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28065544 - 28065419
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
28065544 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 28065450  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||    
28065449 aggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 28065419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10010313 - 10010198
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |    
10010313 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagatttctaaattcaaacagaattacacagaaaaatatttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 10010214  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
10010213 ggtgttcacaatacaa 10010198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20152563 - 20152449
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
20152563 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgatgttgaacacttgatatacaatcagt 20152465  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
20152464 ggtgttcacaatacaa 20152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 24575573 - 24575688
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
24575573 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 24575672  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
24575673 ggtgttcacaatacaa 24575688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1099802 - 1099689
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
1099802 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 1099704  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
1099703 agcaagagacttcta 1099689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 4099435 - 4099548
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
4099435 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 4099533  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
4099534 agcaagagacttcta 4099548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 4209510 - 4209623
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
4209510 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 4209608  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
4209609 agcaagagacttcta 4209623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7006414 - 7006301
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
7006414 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 7006316  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
7006315 agcaagagacttcta 7006301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9773911 - 9773798
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9773911 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9773813  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9773812 agcaagagacttcta 9773798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11389416 - 11389303
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
11389416 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 11389318  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
11389317 agcaagagacttcta 11389303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 274
Target Start/End: Original strand, 14581095 - 14581252
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | |||||| | || || |||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
14581095 agagacttctattgctcatgtacaaatgcaaaagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 14581194  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatata 274  Q
    ||||||||||||||||  |||  | |||||||  |||||  |||||||||||||||||    
14581195 ggtgttcacaatacaaatcaaatacagactctaaagactctagaatttctaagatata 14581252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22915471 - 22915358
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
22915471 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 22915373  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
22915372 agcaagagacttcta 22915358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22960939 - 22960826
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
22960939 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 22960841  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
22960840 agcaagagacttcta 22960826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24328341 - 24328228
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
24328341 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 24328243  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
24328242 agcaagagacttcta 24328228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24339011 - 24338898
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
24339011 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 24338913  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
24338912 agcaagagacttcta 24338898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Original strand, 25918232 - 25918363
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||   ||||||  |||||    
25918232 caaatgctcaagcacacaagcaagagatctactatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaataaacaaaattacatagaaggatgtttggtttgaa 25918331  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
25918332 cacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 25918363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 40250814 - 40250927
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
40250814 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 40250912  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
40250913 agcaagagacttcta 40250927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39038191 - 39038089
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
39038191 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacataattacaaagaaaattgtttgaggttaaacacttgatatacaatcagtgatgttcacaata 39038092  T
232 caa 234  Q
    |||    
39038091 caa 39038089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 24778912 - 24779027
Alignment:
123 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag---tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |    
24778912 gagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaaattcaaacagaattacatagaaaattgtttgaggttgaacacatgatatacaatcagt 24779011  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||| |||||    
24779012 ggtgttcacagtacaa 24779027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24815165 - 24815066
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
24815165 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 24815067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26366967 - 26366886
Alignment:
154 agacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
26366967 agacttctattcaaacagaattataaagaaaattgtttgagattgaacacttgatatacaatcaatggcgttcacaatacaa 26366886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 34477549 - 34477663
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
34477549 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 34477647  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
34477648 aagcaagagacttcta 34477663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 22317129 - 22317243
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
22317129 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 22317227  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||| ||||||||||||    
22317228 ggttttcacaatacaa 22317243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22776800 - 22776685
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |    
22776800 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacatgatatacaatcagt 22776701  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| ||||||    
22776700 ggtgttcacgatacaa 22776685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22782178 - 22782063
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |    
22782178 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacatgatatacaatcagt 22782079  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| ||||||    
22782078 ggtgttcacgatacaa 22782063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28551482 - 28551367
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| |    
28551482 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagataattttttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 28551383  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
28551382 ggtgttcacaatacaa 28551367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 38780933 - 38781048
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| |    
38780933 agagacttctaatgctcaagcacaactacaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaaggtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 38781032  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
38781033 ggtgttcacaatacaa 38781048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 40782014 - 40782129
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |    
40782014 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttatgaattcaaacagaattacacaaaaaattatttgaggttgaacacttgatatacaatcact 40782113  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
     |||||||||||||||    
40782114 agtgttcacaatacaa 40782129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 44839970 - 44840085
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
44839970 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagaaacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 44840069  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
44840070 ggtgttcacaatacaa 44840085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45087545 - 45087430
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | |||| |||||| || |||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
45087545 agagacttctattgcttaagcacaaatgcaatagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 45087446  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
     |||||||||||||||    
45087445 agtgttcacaatacaa 45087430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 4220102 - 4220215
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
4220102 ataatcacaaagattacaactactcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 4220200  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
4220201 agcaagagacttcta 4220215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9763375 - 9763262
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9763375 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaaatatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9763277  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9763276 agcaagagacttcta 9763262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 16768564 - 16768677
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
16768564 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 16768662  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
16768663 agcaagagacttcta 16768677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17858044 - 17857931
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
17858044 ataatcacaaagattacaactgctcaatattttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 17857946  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
17857945 agcaagagacttcta 17857931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18393246 - 18393131
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
18393246 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 18393147  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
18393146 -aagcaagagacttcta 18393131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 29243843 - 29243956
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
29243843 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 29243941  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    || ||||||||||||    
29243942 agaaagagacttcta 29243956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 29254422 - 29254535
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
29254422 ataataacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 29254520  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
29254521 agcaagagacttcta 29254535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 32217493 - 32217608
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
32217493 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 32217592  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
32217593 -aagcaagagacttcta 32217608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34790824 - 34790711
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
34790824 ataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 34790726  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
34790725 agcaagagacttcta 34790711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34804967 - 34804854
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
34804967 ataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 34804869  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
34804868 agcaagagacttcta 34804854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36252451 - 36252338
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||| |    
36252451 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgtaagagtcttccaatgctcaagcact-a 36252353  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
36252352 agcaagagacttcta 36252338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 38586696 - 38586581
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
38586696 ataatcacaaagattacaagtgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcact 38586597  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||| ||||||    
38586596 -aagcaagagtcttcta 38586581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 40221953 - 40222066
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
40221953 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtataagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 40222051  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
40222052 agcaagagacttcta 40222066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 43082275 - 43082388
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
43082275 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 43082373  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
43082374 agcaagagacttcta 43082388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14794440 - 14794307
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||||||||||||| || |  ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||  |||||| ||||||||| |||   |||||  |||||    
14794440 caaatgctcaagcacacaagtaagagacttcaaatactcaagcacaaaagtaagatacttctaaacaaaca-aattacacacaaataagtttggtttgaa 14794342  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
14794341 aacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 14794307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19320953 - 19320848
Alignment:
128 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcac 227  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
19320953 ttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaata-aattatacagaaatatgtttggtttgaacacttgatatacaatcaatgatgttcat 19320855  T
228 aatacaa 234  Q
    |||||||    
19320854 aatacaa 19320848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9898184 - 9898068
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttccc-----aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcac 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |     |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
9898184 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 9898085  T
145 taaagcaagagacttcta 162  Q
    | ||||||||||||||||    
9898084 t-aagcaagagacttcta 9898068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9908772 - 9908656
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttccc-----aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcac 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |     |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
9908772 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 9908673  T
145 taaagcaagagacttcta 162  Q
    | ||||||||||||||||    
9908672 t-aagcaagagacttcta 9908656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18769511 - 18769399
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
18769511 ataatcacaaagattacaaatgctcaatgctctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 18769413  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
18769412 gcaagagtcttcta 18769399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 19114623 - 19114736
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||| | |||||  || ||||  |||||| |||||||||||||||||||    
19114623 agagacttcatatgctcaagcacaactgaaagagacttctattcaaacagaattataaagaaatatggttgaggttgaacgcttgatatacaatcaatgg 19114722  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
19114723 tgttcacaatacaa 19114736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22188334 - 22188169
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||    
22188334 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 22188235  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
22188234 agagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 22188169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 24376969 - 24377134
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||  ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||| |  |||||||    
24376969 ctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattattgcaggc 24377068  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
24377069 agagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 24377134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 26866693 - 26866805
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||    
26866693 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatcctcaagcact-aa 26866791  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
26866792 gcaagagtcttcta 26866805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41122249 - 41122164
Alignment:
150 caagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
41122249 caagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacgcttgatatacaatcagtggtgttcataatacaa 41122164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 22257739 - 22257854
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |    
22257739 agagacatctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaatgtcaaagaaaattgtttgaggtcgaacacttgatatacaatcagt 22257838  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
22257839 ggtgttcacaatacaa 22257854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30557883 - 30557769
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
30557883 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 30557785  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||| ||||||||||    
30557784 ggtgtccacaatacaa 30557769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 40331646 - 40331761
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |    
40331646 agagacttctattgctcaagcacaactgcgagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatatttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 40331745  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
40331746 ggtgttcacaatacaa 40331761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 2561109 - 2561222
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
2561109 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 2561207  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
2561208 agcaagagtcttcta 2561222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11395781 - 11395666
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
11395781 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 11395682  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
11395681 -aagcaagagacttcta 11395666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11406097 - 11405982
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
11406097 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 11405998  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
11405997 -aagcaagagacttcta 11405982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24415628 - 24415515
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
24415628 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 24415530  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
24415529 agcaagagtcttcta 24415515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24428193 - 24428080
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
24428193 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 24428095  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
24428094 agcaagagtcttcta 24428080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 27221001 - 27221115
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
27221001 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27221099  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
27221100 -aagcaagagacttcta 27221115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28732509 - 28732396
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
28732509 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 28732411  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
28732410 agcaagagtcttcta 28732396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 33073766 - 33073875
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||    
33073766 agacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggtttaacacttgatatacaatcaatgg 33073864  T
221 tgttcacaata 231  Q
    |||||||||||    
33073865 tgttcacaata 33073875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 35252602 - 35252716
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
35252602 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35252700  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
35252701 -aagcaagagacttcta 35252716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 35263211 - 35263325
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
35263211 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35263309  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
35263310 -aagcaagagacttcta 35263325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 35273836 - 35273950
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
35273836 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35273934  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
35273935 -aagcaagagacttcta 35273950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 43092884 - 43092997
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
43092884 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 43092982  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    || ||||||||||||    
43092983 agtaagagacttcta 43092997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 22271698 - 22271784
Alignment:
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22271698 gcaagagacttatattcaaacagaattacatataaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22271784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Original strand, 26879282 - 26879380
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
26879282 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 26879380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13964515 - 13964431
Alignment:
149 gcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
13964515 gcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 13964431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15671157 - 15671058
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatac 232  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||   |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
15671157 atgctcaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaaca-aattaca-agaaataagtttggattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatac 15671060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23184863 - 23184750
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  ||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||    
23184863 agagacttcttatgctcaaggacaactgcaagagacttctattcaaaaagaattcaaaagaaaattatttgaggttgaacacttgatatacaatcagcgg 23184764  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
23184763 tgttcacaatacaa 23184750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23596126 - 23596013
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  ||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||    
23596126 agagacttcttatgctcaaggacaactgcaagagacttctattcaaaaagaattcaaaagaaaattatttgaggttgaacacttgatatacaatcagcgg 23596027  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
23596026 tgttcacaatacaa 23596013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 6392172 - 6392286
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||| |    
6392172 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacactaaatatacaatcagt 6392270  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
6392271 ggtgttcacaatacaa 6392286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6574662 - 6574576
Alignment:
150 caagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
6574662 caagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaagtgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 6574576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 444 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 20152258 - 20152134
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||  | |||||||    
20152258 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggc 20152159  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
20152158 agagctgtttttcttgtcttgtagc 20152134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20569312 - 20569197
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |    
20569312 agagacttctaatgctcaggcacaactgcaagagacttccaaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggctgaacacttgatatacaatcagt 20569213  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
20569212 ggtgttcacaatacaa 20569197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28712262 - 28712147
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |    
28712262 agagacttctattgctcaagcacaattgcaagagactttttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacatttgatatacaatgagt 28712163  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
28712162 ggtgttcacaatacaa 28712147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #186
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 10266614 - 10266728
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
10266614 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10266712  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
10266713 -aagcaagagacttcta 10266728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #187
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 10277191 - 10277305
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
10277191 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10277289  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
10277290 -aagcaagagacttcta 10277305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #188
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 605
Target Start/End: Original strand, 22258088 - 22258231
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||   || ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
22258088 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaagaatcaatttcaaatccattcctagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtct 22258187  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtaca 605  Q
    ||||||   ||||||  | | || ||||||||||||||||||||    
22258188 tgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #189
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28721923 - 28721810
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
28721923 ataatcacaaagattgcaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 28721825  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
28721824 agcaagagtcttcta 28721810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #190
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30489431 - 30489318
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||  ||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
30489431 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcaaaagactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 30489333  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
30489332 agcaagagacttcta 30489318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #191
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31801406 - 31801336
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
31801406 tcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 31801336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #192
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39170703 - 39170589
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
39170703 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 39170605  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
39170604 -aagcaagagacttcta 39170589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #193
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 43345028 - 43345142
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
43345028 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 43345126  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
43345127 -aagcaagagacttcta 43345142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #194
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 43354643 - 43354757
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
43354643 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 43354741  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
43354742 -aagcaagagacttcta 43354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #195
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 231
Target Start/End: Original strand, 44880734 - 44880817
Alignment:
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
44880734 gcaagagacttctattcaaacataattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatgcaatcagtggtgttcacaata 44880817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #196
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 10009982 - 10009820
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||||| || ||| | | |||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||    
10009982 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 10009883  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtaca 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||||  | | || ||||||||||||||||||||    
10009882 agagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 10009820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #197
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Original strand, 23234555 - 23234656
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaa 229  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
23234555 atgctcaagcacaactgcaagagacttttaaattcaaacagaattacaaagaaaaaagtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 23234654  T
230 ta 231  Q
    ||    
23234655 ta 23234656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #198
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 1083421 - 1083563
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || |||||||||||     
1083421 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaacttattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcaca 1083518  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
1083519 caggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 1083563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #199
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10899056 - 10898976
Alignment:
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaa 229  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
10899056 gcaagagacttctattcaaacaaaattataaagaaaat-gtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaa 10898976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #200
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31328525 - 31328410
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | | ||||||||||||| |||  || |||||| || |||||||||||||||||||| |    
31328525 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctcaattaaaacagaattacaaagattat-gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 31328427  T
219 ggtgttcacaatacaat 235  Q
    |||||||||||||||||    
31328426 ggtgttcacaatacaat 31328410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #201
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31335246 - 31335131
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | | ||||||||||||| |||  || |||||| || |||||||||||||||||||| |    
31335246 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctcaattaaaacagaattacaaagattat-gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 31335148  T
219 ggtgttcacaatacaat 235  Q
    |||||||||||||||||    
31335147 ggtgttcacaatacaat 31335131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #202
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 6574357 - 6574249
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||  | |||||||    
6574357 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggc 6574258  T
544 agagctgtt 552  Q
    |||||||||    
6574257 agagctgtt 6574249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #203
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22188666 - 22188551
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |   ||||||| ||||| | || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
22188666 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttacaaattcaaacataattataaagcaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 22188567  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
22188566 ggtgttcacaatacaa 22188551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #204
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22525409 - 22525275
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaa-gcactaaagcaagagacttc-tagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttg 197  Q
    ||||| ||||||||| || || ||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||| |  |||||  |||    
22525409 caaatactcaagcacacaagcaagacatttcctatgctcaaagcacaaaagcaagagacttcataaacaaaca-aattacaaagaataa-gtttgggttg 22525312  T
198 aacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22525311 aacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22525275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #205
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 31801118 - 31800954
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | |||||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    ||||||||    
31801118 tttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggca 31801019  T
545 gagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
31801018 gagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 31800954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #206
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 22615293 - 22615336
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacag 62  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
22615293 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacag 22615336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #207
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17963819 - 17963715
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcaca 228  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
17963819 aatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacataattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacactt-atatacaatcagtggtgttcaca 17963721  T
229 atacaa 234  Q
    ||||||    
17963720 atacaa 17963715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #208
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21173075 - 21172960
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
21173075 ataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 21172976  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||| ||||||    
21172975 -aagcaagagtcttcta 21172960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #209
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Original strand, 40782364 - 40782510
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||    
40782364 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggtagagctgttatccttgtct 40782463  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   ||||||  |   ||  ||||||||||||||||||||||    
40782464 tgtagcagagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacactt 40782510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #210
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1587595 - 1587484
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| |  |||||||||||||  | | ||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||     
1587595 agagacttctattgctcaaacacaactgcaagagacttcttaatttaaatagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaag 1587497  T
219 ggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||    
1587496 ggtgttcacaata 1587484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #211
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 234
Target Start/End: Original strand, 22682914 - 22683046
Alignment:
101 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaac 200  Q
    |||| ||||||||| ||  | ||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| |||   |||||  || |||    
22682914 aaatactcaagcacacaaccaagagatttcctatgctcaaacacaaaagcaagagacttccaaacaaaca-aattacacataaataagtttggtttaaac 22683012  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
22683013 acttgatatacaataagtggtgttcagaatacaa 22683046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #212
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 23234875 - 23235040
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |   || ||||||| |  |||||||    
23234875 ctttgatcaatcaccaataatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattgccagtatgtaggaacattgttgcaggc 23234974  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     || ||||||| |||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
23234975 ggaactgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 23235040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #213
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25037820 - 25037713
Alignment:
125 gacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
25037820 gacttctaatggtcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacact-gatatacaatcagtggt 25037722  T
222 gttcacaat 230  Q
    |||||||||    
25037721 gttcacaat 25037713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #214
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 28711930 - 28711765
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||    
28711930 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcattgcaggc 28711831  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
28711830 agagctgtttttcttgtcttttagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28711765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #215
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 21537482 - 21537315
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |   ||| ||||||||  || |||     
21537482 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctgtgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgagggaacaatgttgtaggg 21537383  T
544 --agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
      ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
21537382 gaagagctgttattcttgtcttgtagcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 21537315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #216
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 552
Target Start/End: Original strand, 22317461 - 22317569
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||  ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||| |  |||||||    
22317461 ctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgttgcaggc 22317560  T
544 agagctgtt 552  Q
    |||||||||    
22317561 agagctgtt 22317569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #217
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 23184536 - 23184412
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||| |  |||||||    
23184536 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggc 23184437  T
544 agagctgtt-atcttgtcttgtagc 567  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||    
23184436 atagctgttaatcttgtcctgtagc 23184412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #218
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 23595799 - 23595675
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||| |  |||||||    
23595799 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggc 23595700  T
544 agagctgtt-atcttgtcttgtagc 567  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||    
23595699 atagctgttaatcttgtcctgtagc 23595675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #219
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 547 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 28374595 - 28374527
Alignment:
547 gctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
28374595 gctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 28374527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #220
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 28551149 - 28550985
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | ||| ||||||||||  || | | ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |   ||||| |||| |  ||||||||    
28551149 tttgatcaatcaccaatgatcctttgtctgatacggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatgcgttcccaatgtgaagaaacattgttgcaggca 28551050  T
545 gagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
28551049 gagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 28550985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #221
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34322486 - 34322384
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
34322486 tgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-acaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcggtgctgttcacaat 34322388  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
34322387 acaa 34322384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #222
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 567
Target Start/End: Original strand, 38781266 - 38781390
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||| |||    |||||||    
38781266 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatgattattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaagggacatcgttgcaggc 38781365  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
38781366 agagctgtttttcttgtcttgtagc 38781390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #223
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 229
Target Start/End: Original strand, 14866831 - 14866913
Alignment:
147 aagcaagagacttctagtcaaacaga-attacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaa 229  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
14866831 aagcaagagacttctaa-caaacaaagattacaaagaaaattgtttggattgaacacttgatatacaattagaggtgttcacaa 14866913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #224
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 490 - 608
Target Start/End: Original strand, 19540330 - 19540449
Alignment:
490 tatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtg 588  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |   ||| |||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||  | | || |||    
19540330 tatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgagggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgccttgtagcagagacacaaactgagtagtg 19540429  T
589 gagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||||||||||    
19540430 gagatagtggttgtacactt 19540449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #225
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 554
Target Start/End: Original strand, 22272020 - 22272111
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat 554  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||| |||||||||    
22272020 atcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtctggaggaacactggtgcaggcatagctgttat 22272111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #226
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Original strand, 22802083 - 22802122
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22802083 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22802122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #227
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 25828713 - 25828784
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
25828713 tcaaacagaattacacagaaagatgttggaggttgaacatttgctatacaatcagtggtgttcacaatacaa 25828784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #228
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 234
Target Start/End: Original strand, 27939534 - 27939638
Alignment:
128 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc-tagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttca 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||| |  |||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||||    
27939534 ttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctaaacaaaca-aattacaaagaataa-gtttgggt-gaacacttgatattcaatcagtggtgttca 27939630  T
227 caatacaa 234  Q
    ||||||||    
27939631 caatacaa 27939638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #229
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13964191 - 13964045
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||    
13964191 atcttttgcctgatatggttcttgtcctctaaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcggagctgttatccttgtct 13964092  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
13964091 tgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 13964045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #230
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 39037855 - 39037709
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 561  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||  |   ||||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||     
39037855 atcttttgtctgatatggttattgtcctatgaacgatcaatttcaaattcattctaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatagctgttatccttgtca 39037756  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||||    
39037755 tgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 39037709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #231
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 234
Target Start/End: Original strand, 24157432 - 24157468
Alignment:
198 aacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
24157432 aacatttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 24157468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #232
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 209
Target Start/End: Original strand, 16494884 - 16494974
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatat 209  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||    
16494884 agagacttctattgctcaagcacaactgcaacagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatat 16494974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #233
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35744496 - 35744426
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
35744496 tcaaagagaattaca-agaaaaatgtttgaggtcgaacactcgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 35744426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #234
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Original strand, 20567698 - 20567783
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgat 207  Q
    |||||||||  |||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
20567698 agagacttcttatgctcaagcacaactacaagagacttctattcaaacaaaattacaaagaaaa-tgtttgaggttgaacacttgat 20567783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #235
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 549 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24425629 - 24425564
Alignment:
549 tgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24425629 tgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24425564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #236
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 492 - 608
Target Start/End: Original strand, 30666905 - 30667022
Alignment:
492 tgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtgg 589  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| | || ||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||  | | || ||||    
30666905 tgaaggatcaatttcaaatccattc-tatgtatgtaggaacattgttgcaggcagcgctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgg 30667003  T
590 agatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||||    
30667004 agatagtggttgtacactt 30667022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #237
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28701776 - 28701664
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |   ||||||| ||||  | |||| |||||||| | |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| | |    
28701776 agagacttctattgctcaagcacaattacaagagaattcttaattcaatcagaattagaaagaaaaatgtttaaggttgaacacttgatatacaatgagt 28701677  T
219 ggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||    
28701676 ggtgttcacaata 28701664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #238
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 445 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22455221 - 22455149
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| ||||  ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
22455221 tttgatcaatcaccaataatcttttgcctgacatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc 22455149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #239
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 25037398 - 25037326
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
25037398 tgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 25037326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #240
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 25041505 - 25041433
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
25041505 tgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 25041433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #241
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 30621126 - 30621249
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcaggg 583  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | || ||||||| |  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  ||||||  | | |    
30621126 gtcctatgaaggatcaatttcaaatccatt-ctatgtatgtaggaacattgttgcaggcaacgctgttatcattgtgttgtagcggagacacaaactgag 30621224  T
584 tcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
30621225 tagtggagatagtggttttacactt 30621249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #242
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 30623747 - 30623870
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcaggg 583  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | || ||||||| |  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  ||||||  | | |    
30623747 gtcctatgaaggatcaatttcaaatccatt-ctatgtatgtaggaacattgttgcaggcaacgctgttatcattgtgttgtagcggagacacaaactgag 30623845  T
584 tcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
30623846 tagtggagatagtggttttacactt 30623870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #243
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Original strand, 33074187 - 33074259
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
33074187 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 33074259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #244
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 231
Target Start/End: Original strand, 33240296 - 33240332
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
33240296 ttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaata 33240332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #245
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 231
Target Start/End: Original strand, 33248217 - 33248253
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
33248217 ttgaacacttgatatacaattagtggtgttcacaata 33248253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #246
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35666530 - 35666494
Alignment:
126 acttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
35666530 acttccaatgctcaagcacagaagcaagagacttcta 35666494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 469; Significance: 0; HSPs: 233)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 22212012 - 22211416
Alignment:
21 ttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
22212012 ttgcactttcaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctctagtatgagacttcccaaatgctcaggcacgcaggc 22211913  T
121 gagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
22211912 gagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtg 22211813  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
22211812 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaattagtgcagaaattcagattgcttttgagaatcaaatttg 22211713  T
320 gcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||    
22211712 gcagagttttgatgcttttaacttgtgttgatgtctctgctgatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttag 22211613  T
420 cacgtct-aaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22211612 cacgtcttaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 22211513  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
22211512 atcttgaaggaacaattctgcaggcagggctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 22211416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 22136398 - 22135886
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||| ||||||||||||   | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22136398 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcaggcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 22136299  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
22136298 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgc 22136199  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagag 401  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
22136198 tttt-agaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctctaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagag 22136100  T
402 agacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatca 501  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22136099 acacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatca 22136000  T
502 acttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttg 601  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
22135999 acttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttg 22135900  T
602 tacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||    
22135899 tacacttgtacttt 22135886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 22167563 - 22167051
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22167563 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 22167464  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
22167463 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgc 22167364  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagag 401  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
22167363 tttt-agaatcaaatttggaagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctctaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagag 22167265  T
402 agacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatca 501  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22167264 agacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatca 22167165  T
502 acttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttg 601  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
22167164 acttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcaaagctgttatcttatcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttg 22167065  T
602 tacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||    
22167064 tacacttgtacttt 22167051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23271832 - 23271232
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
23271832 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcag 23271733  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||     
23271732 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaggattacacaaaaaattgtttgagtttgaacacttgacatacaatcag 23271633  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc-ttttgagaattaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||  ||||    
23271632 tggtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctagacttaaaaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgtgaaacaaat 23271533  T
317 ttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-t 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |    
23271532 ttgacagagtttgggcgcttttaacttgttgtaatgtctctactgatcttcaagttttcactcctttatatagaggtgggtagagagacgttaagatctt 23271433  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
23271432 taagcacgtctaaagagtcgttgagaacctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccatt 23271333  T
516 cctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
23271332 cctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaggcagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtactt 23271233  T
615 t 615  Q
    |    
23271232 t 23271232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 3843262 - 3843775
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
3843262 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgactttgaac 3843360  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3843361 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 3843459  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||    
3843460 ctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtag 3843559  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
3843560 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 3843659  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
3843660 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 3843759  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
3843760 tgtacacttgtacttt 3843775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 152 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 7018872 - 7018409
Alignment:
152 agagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct 250  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
7018872 agagacttctaatcaaacataattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaatgcaataaaa-actct 7018774  T
251 agacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataa 350  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
7018773 agacttaagaatttctaagatacatcaaatcagagcagaaattcaaattgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttga 7018674  T
351 tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgat 450  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
7018673 tgtctctaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgaatagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgat 7018574  T
451 catccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg 550  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
7018573 catccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcaaagctg 7018474  T
551 ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    || |||||||||||||||  ||||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
7018473 ttgtcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 7018409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 8031460 - 8032072
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
8031460 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 8031559  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagca-ctaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaat 214  Q
    ||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
8031560 agaaaagagacttcctttgctcaagcagctaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatactat 8031659  T
215 caatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg---------cttt 304  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||          |||    
8031660 cagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctaaacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgttttttttttttt 8031759  T
305 tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagaga 404  Q
    |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
8031760 tatgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtattgtctctgctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagaga 8031859  T
405 cgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaac 503  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||      
8031860 cgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacg 8031959  T
504 ttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgt 602  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||    
8031960 ttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaagcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgt 8032059  T
603 acacttgtacttt 615  Q
    ||| |||||||||    
8032060 acatttgtacttt 8032072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 19 - 438
Target Start/End: Original strand, 19460624 - 19461046
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
19460624 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcag 19460723  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||     
19460724 gcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatactatcag 19460823  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
19460824 tggtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaagtt 19460923  T
318 tggcagagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-t 415  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
19460924 tggcagagtttgggcactttttaacttgttgtaatgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctt 19461023  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||    
19461024 taagcacgtctaaagagtcgttg 19461046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 19 - 438
Target Start/End: Original strand, 19558302 - 19558724
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
19558302 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcag 19558401  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||     
19558402 gcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatactatcag 19558501  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
19558502 tggtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaagtt 19558601  T
318 tggcagagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-t 415  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
19558602 tggcagagtttgggcactttttaacttgttgtaatgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctt 19558701  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||    
19558702 taagcacgtctaaagagtcgttg 19558724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20260158 - 20259645
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||  ||||||||||||   | || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
20260158 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgactttgaac 20260060  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20260059 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 20259961  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||     
20259960 ctttataaaatcaaatttggtagagttttggcgcttttaacttgtgttaatatctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaa 20259861  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
20259860 agagacgttgagatttttagcacgtctaaaaagtcgttgatttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 20259761  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||| || |||||| |||||||    
20259760 caactttgaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacacaaacagagtagtggaggtagtggt 20259661  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
20259660 tgtacacttgtacttt 20259645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 21046788 - 21046275
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||  ||||||||||||   | || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
21046788 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgactttgaac 21046690  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21046689 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 21046591  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||     
21046590 ctttataaaatcaaatttggtagagttttggcgcttttaacttgtgttaatatctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaa 21046491  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
21046490 agagacgttgagatttttagcacgtctaaaaagtcgttgatttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 21046391  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||| || |||||| |||||||    
21046390 caactttgaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacacaaacagagtagtggaggtagtggt 21046291  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
21046290 tgtacacttgtacttt 21046275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 608
Target Start/End: Original strand, 29379012 - 29379609
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacac-agattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
29379012 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacaccagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacg 29379110  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaat 214  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
29379111 caggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattatttgagtttgaacacttgatatacaat 29379210  T
215 caatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt-tgagaa 310  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || |||    
29379211 cagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagattctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgtgtgaa 29379310  T
311 ttaa-atttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttg 409  Q
      || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||    
29379311 acaagatttgacagagtttgggcgcttttaacttattttcttgtctctactaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-agagagtcgttg 29379409  T
410 agatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaa 508  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||   | |||||||   |||| | |||| ||| |||||||    || |||||||||||||| |  |||||    
29379410 agatctttaagcacgtcaatagagtcgttgagaaaccttgatca-ataccaatgatctgttgcctgatttcaaagttgtcctatgaaggattatgttcaa 29379508  T
509 attcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacact 607  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
29379509 atccattcctatcctgaaggaacatttctgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacact 29379608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 195 - 615
Target Start/End: Original strand, 23370386 - 23370801
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattc 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
23370386 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattc 23370484  T
295 aaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggt 393  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || |||||   | |||||||||||||||||   |||||||| |||    
23370485 aaagtgctttatagaatcaaatttggcagagtttttgcgcttttaacttgtgttgatatctcttttcaatcttcaagtcttcactcatttatatagaggt 23370584  T
394 gtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatg 493  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
23370585 gagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatctttttcctgatttgggtgtagtcctacg 23370684  T
494 aaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagat 593  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||     |||| |  ||| || |||||| |    
23370685 aaggatcaactttgaattcattcctatcttaaaggaacatttctgtaggcagaggtgttgtcttgtcttgta-----gacaaaaacagagtagtggaggt 23370779  T
594 agtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||    
23370780 agtggttgtacacttgtacttt 23370801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 133 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 17519660 - 17519178
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
17519660 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 17519561  T
232 caatgcaata-aaagactct--agacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgag--aattaaatttggcagagt 326  Q
    |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||||||||    
17519560 caatgcaattcaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgattttgtgtgaaacaaatttggcagagt 17519461  T
327 ttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt-aagcacgtc 425  Q
    |||| ||||||||||||||  |  ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
17519460 ttggacgcttttaacttgttgtcttgtctctgctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-agagagtcgttgagatctttaagcacgtc 17519362  T
426 taaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga 525  Q
     | ||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
17519361 aatagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttga 17519262  T
526 aggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
17519261 aggaacatttctgcaggaagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 17519178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 187 - 615
Target Start/End: Original strand, 18158082 - 18158507
Alignment:
187 tgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
18158082 tgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgc 18158180  T
287 agaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttcctta 384  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||    
18158181 agaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactccttta 18158277  T
385 tatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgt 484  Q
    ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
18158278 tatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgt 18158376  T
485 agtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| ||    
18158377 agtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagagtggacaaaaacagagt 18158476  T
585 cgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||    
18158477 agtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18158507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 187 - 615
Target Start/End: Original strand, 18153563 - 18153987
Alignment:
187 tgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
18153563 tgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgc 18153661  T
287 agaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttcctta 384  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||    
18153662 agaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactccttta 18153758  T
385 tatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgt 484  Q
    ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
18153759 tatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagttgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgt 18153857  T
485 agtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| ||    
18153858 agtcctttgaagaattagcttcaaattcattcctatcttgaaggaacaatt-tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagt 18153956  T
585 cgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||    
18153957 agtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18153987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18769657 - 18769165
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaat-tacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
18769657 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtgg 18769558  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |     
18769557 tgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagactttttaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-ga 18769460  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | |||||||||||||   | |    
18769459 cagagttttggcactttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagaggatta 18769363  T
419 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
18769362 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 18769263  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
18769262 atcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttatcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18769165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Original strand, 40002748 - 40003260
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
40002748 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 40002847  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
40002848 ttgatatacaatcagtgatgttcacagtacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagt 40002947  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgc--ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgt 395  Q
    |||||  || |||  ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||  |   ||| | || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
40002948 gcttttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttttttactagttgtctggtcac-actgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgt 40003046  T
396 gtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatga 494  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
40003047 g-agagagtcgttgagatctttaagcacatcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatttggatgttgtcctaaga 40003145  T
495 aggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagat 593  Q
    || || |  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| |    
40003146 agaattacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacagtcagagtcgtggaggt 40003245  T
594 agtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||    
40003246 agtggttgtacactt 40003260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 16746761 - 16747253
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||  |||||  ||||||| || |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
16746761 agagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaagactcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 16746860  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
16746861 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 16746958  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtct--ctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   || |||  ||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
16746959 agagttttggcgctttttaacttgtgtatatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgatta 16747056  T
419 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |     
16747057 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttcc 16747156  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
16747157 atcttgaaggcacaaattctgcaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 16747253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 188 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 30315149 - 30314724
Alignment:
188 gtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
30315149 gtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgca 30315051  T
288 gaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttata 386  Q
    ||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||    
30315050 gaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttata 30314953  T
387 tagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgta 485  Q
    ||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
30314952 tagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgta 30314854  T
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| ||    
30314853 gtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgaggaca-aaacagagt 30314755  T
585 cgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||    
30314754 agtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 30314724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 51 - 615
Target Start/End: Original strand, 20195643 - 20196210
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||| |||||||||||||  |    
20195643 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgca 20195742  T
148 agcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagac 247  Q
     ||||||| |||||| ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||    
20195743 ggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaat-taagac 20195841  T
248 tctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgc-ttttaacttgtg 346  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
20195842 tctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgacagagttttggcgctttttaacttgtg 20195940  T
347 ataatgtctct---accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagtt 442  Q
       ||||||||     | |||||||| |||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  |    
20195941 --tatgtctctctcttcaatcttcaattcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaat 20196037  T
443 cctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcag 541  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||    
20196038 cctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgcag 20196137  T
542 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
20196138 acatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 20196210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 19224695 - 19225186
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19224695 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 19224794  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |    
19224795 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaatt-gac 19224892  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
19224893 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctact-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagc 19224990  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    |||||||||||||| || ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
19224991 acgtctaaagagtcatttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgttgtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 19225090  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19225091 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19225186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 40213688 - 40213198
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaat-tgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| ||| || ||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
40213688 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatattcaaacaaaaatacagagaaaatatgtttgacttgaacacttgatatgcaatcagtgg 40213589  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |     
40213588 tgttcacaa-ataatgtaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-ga 40213492  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| | |||| | ||||||||||||||  |    
40213491 cagagttttggcgctttttaacttgt----atatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaa-agagacgttgagatgat 40213397  T
417 aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
40213396 tagcaggtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 40213297  T
517 ctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||| |  |||| |  ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
40213296 ccatcttgaaggaacatttctgcaggcatgactgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtacttt 40213198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23469980 - 23469488
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
23469980 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 23469881  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
23469880 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 23469783  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
23469782 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagc 23469685  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
23469684 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtactcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 23469585  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||    
23469584 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagaggagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23469488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 3220393 - 3220885
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
3220393 agagacttctaatgctcaaacacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 3220492  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
3220493 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 3220589  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
3220590 agagttttggcgcttttgaacttat----atatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 3220684  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
3220685 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 3220784  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
3220785 ccatcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 3220884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 122 - 608
Target Start/End: Original strand, 28903006 - 28903490
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
28903006 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtgg 28903105  T
221 tgttcacaatacaatgc-aataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt--tgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||  |   || |||||| |||||||||  || |||  |||||    
28903106 tgttcacaatacaaggcaaatgaaagactc------taagaatttctaagatatatcaaacgaacacaaaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaatt 28903199  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-t 415  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||||| |    
28903200 ttgcagagtttgggcgcttttaacttgttgtcttgt-tcttcttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-agagagtcgttgagatctt 28903297  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    |||||||||| | ||||||| || |   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
28903298 taagcacgtcaatagagtcgctgtgaaaccttgatcaattaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccatt 28903397  T
516 cctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
28903398 cctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaca-aaacagagtagtggagctagtggttgtacactt 28903490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6319035 - 6318544
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
6319035 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 6318936  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
6318935 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 6318839  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
6318838 agagttttggcgcttttgaacttgt----atatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 6318744  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||| || | ||||||||||||||    
6318743 agaacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgagtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattc 6318644  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | ||||||| |  || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
6318643 ccatcttgaggacacaaattatgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6318544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 19418113 - 19418604
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19418113 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 19418212  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
19418213 gttcacaatacaatacgttaaa-gactgtagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 19418310  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    ||||||||| | |   |||||||||||||||| | |||||||| | |||| | ||||||||||||||  |     
19418311 agagttttggcgctttttaacttgt----atgtctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaa-agagacgttgagatgatt 19418405  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagt-tcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
19418406 agcacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 19418505  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19418506 ccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19418604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20161750 - 20161257
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
20161750 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 20161651  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
20161650 gttcacaatacaatacaattaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 20161553  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||  |    |||||||| |||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
20161552 agagttttggcgctttttaacttgtgt--atgtctctctcttcaatcttcaattcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatt 20161456  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
20161455 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 20161356  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |  ||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
20161355 ccactttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 20161257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 44480852 - 44481344
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
44480852 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 44480951  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
44480952 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 44481048  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||    |||    
44481049 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataaacagc 44481146  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
44481147 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccca 44481246  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
44481247 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 44481344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 44491468 - 44491960
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
44491468 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 44491567  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
44491568 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 44491664  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||    |||    
44491665 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataaacagc 44491762  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
44491763 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattccca 44491862  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
44491863 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 44491960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 241585 - 242076
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
241585 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattaaacacttgatatacaatcagtggt 241684  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
241685 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttta-aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 241781  T
322 agagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
241782 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 241879  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
241880 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 241979  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
241980 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 242076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 252170 - 252661
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
252170 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattaaacacttgatatacaatcagtggt 252269  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
252270 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 252366  T
322 agagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
252367 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 252464  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
252465 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 252564  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
252565 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 252661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 849486 - 848995
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
849486 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattaaacacttgatatacaatcagtggt 849387  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
849386 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 849290  T
322 agagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
849289 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 849192  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
849191 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 849092  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
849091 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 848995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 19128509 - 19129001
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
19128509 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 19128608  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
19128609 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 19128705  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtct-ctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||   ||||||  ||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |     
19128706 agagttttggcgctttttaacttatg--tatgtctattatttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcaa 19128802  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
19128803 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 19128902  T
519 atcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19128903 atcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19129001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 19139041 - 19139533
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
19139041 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 19139140  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
19139141 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 19139237  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||   |||||| | |   ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |     
19139238 agagttttggcgatttttaacttatgt--atgtctattatttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcaa 19139334  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
19139335 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 19139434  T
519 atcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19139435 atcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19139533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 9340905 - 9341397
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
9340905 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 9341004  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
9341005 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 9341101  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
9341102 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 9341199  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
9341200 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 9341299  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9341300 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9341397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 9368049 - 9368541
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
9368049 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 9368148  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
9368149 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 9368245  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
9368246 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 9368343  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
9368344 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 9368443  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9368444 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9368541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 19428688 - 19429181
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19428688 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 19428787  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||| |||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
19428788 gttcataatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 19428885  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    ||||||||| | |   |||||||||||||||| | |||||||| | |||| | ||||||||||||||  |     
19428886 agagttttggcgctttttaacttgt----atgtctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaa-agagacgttgagatgatt 19428980  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagt-tcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
19428981 agcacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 19429080  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
19429081 ccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 19429180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 210672 - 210181
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    | |||| || ||||||||||||||||||| ||||    
210672 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagattgaattaaacacttgatatacaatcagtggt 210573  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
210572 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 210476  T
322 agagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
210475 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 210378  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
210377 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 210278  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
210277 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 210181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 724295 - 723804
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    | |||| || ||||||||||||||||||| ||||    
724295 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagattgaattaaacacttgatatacaatcagtggt 724196  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
724195 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 724099  T
322 agagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
724098 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 724001  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
724000 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 723901  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
723900 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 723804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Original strand, 21540474 - 21540943
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
21540474 tgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaatac 21540573  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaagactc--tagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
21540574 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctttagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 21540673  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc--taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgt 395  Q
    |||||  || |||  ||| || ||||||||||||||||||    |||   |  ||||||  | | ||||||||||| |||||| | |||||| | | |||    
21540674 gcttttatgtgaaacaaaattagcagagtttgggcgcttt----ttggtttgttgtctcgtttctgatcttcaagttttcactcctttatattgagatgt 21540769  T
396 gtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatga 494  Q
    | | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
21540770 g-aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatga 21540868  T
495 aggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
21540869 aggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacatttatgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcg 21540943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 32088788 - 32088297
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
32088788 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 32088689  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
32088688 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 32088592  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
32088591 agagttttggcgcttttgaacttatgtatttctatctatt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 32088494  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
32088493 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 32088394  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
32088393 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 32088297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 36077698 - 36078189
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
36077698 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 36077797  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
36077798 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 36077894  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |    || |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
36077895 agagttttggcgcttttgaacttat----atatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 36077989  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
36077990 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 36078089  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36078090 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36078189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 36088284 - 36088775
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
36088284 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 36088383  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
36088384 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 36088480  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |    || |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
36088481 agagttttggcgcttttgaacttat----atatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 36088575  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
36088576 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 36088675  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36088676 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36088775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 3349146 - 3348654
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
3349146 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 3349047  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
3349046 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 3348950  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
3348949 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgtcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 3348852  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
3348851 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 3348752  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
3348751 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 3348654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 3359743 - 3359251
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
3359743 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 3359644  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
3359643 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 3359547  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
3359546 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgtcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 3359449  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
3359448 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 3359349  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
3359348 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 3359251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 15791818 - 15791326
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
15791818 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 15791719  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
15791718 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 15791622  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||   | | ||||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
15791621 agagttttggcgcttttgaacttatgaatctctatcta-taatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagatactcagc 15791524  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
15791523 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 15791424  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
15791423 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 15791326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 568
Target Start/End: Original strand, 794940 - 795383
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
794940 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattaaacacttgatatacaatcagtggt 795039  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
795040 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttta-aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 795136  T
322 agagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
795137 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctgtctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 795234  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
795235 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 795334  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
795335 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcg 795383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9856996 - 9856499
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
9856996 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 9856897  T
222 gttcacaatacaatgcaat----aaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |    
9856896 gttcacaatacaatacaatacagaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcggtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaa-t 9856799  T
318 tggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |    
9856798 tgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataat 9856701  T
417 aagcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
     |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
9856700 cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcatt 9856601  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    || |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || || ||| |||||||||||||||||||||    
9856600 cccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtact 9856501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 32078215 - 32077724
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
32078215 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 32078116  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
32078115 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 32078019  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
32078018 agagttttggcgcttttgaacttatgtatttctatcta-ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 32077921  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
32077920 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccatcagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 32077821  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
32077820 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 32077724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 6150829 - 6151323
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| || |    
6150829 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtgat 6150928  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
6150929 gttcacaatacaatgc-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgtc 6151025  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
6151026 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 6151122  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
6151123 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 6151222  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
6151223 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 6151322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 6160784 - 6161278
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
6160784 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 6160883  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
6160884 gttcacaatacaatgc-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 6160980  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
6160981 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 6161077  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
6161078 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 6161177  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  | |||| | |||| ||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
6161178 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggttgttgttttgttttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 6161277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 29076492 - 29076983
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
29076492 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 29076591  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
29076592 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 29076688  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
29076689 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 29076785  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
29076786 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttccc 29076885  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
29076886 atcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 29076983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 15781229 - 15780737
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
15781229 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 15781130  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
15781129 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 15781033  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    |||| || ||||||||| ||||| |||   | | ||||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
15781032 agagctttggcgcttttgaacttatgaatctctatcta-taatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagatactcagc 15780935  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
15780934 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 15780835  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
15780834 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 15780737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 31214773 - 31215268
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
31214773 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttaaacacttgatatacaatcagtggt 31214872  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| |||||||||  |||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
31214873 gttcgcaatacaatataataaa-gactctagactattgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 31214970  T
322 agagtttg---ggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    |||||||    ||||||||| ||||||||   || | ||||| | |||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||   |     
31214971 agagtttttttggcgcttttgaacttgtgtatatctttctacag-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagaggatt 31215068  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
31215069 agcacgtctaaagagttgtttgaaatcttttgatcatccaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 31215168  T
517 ctatcttgaagg-aacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||||| |  |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
31215169 ccatcttgaaggcataaattatgcaggcatagctgttgtcttgtcttatagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 31215268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 29086743 - 29087234
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
29086743 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 29086842  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
29086843 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 29086939  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
29086940 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 29087037  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |    
29087038 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttccca 29087137  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
29087138 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 29087234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 18449131 - 18449623
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
18449131 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 18449230  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
18449231 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 18449327  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
18449328 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctctatatacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagatagtcag 18449424  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
18449425 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 18449524  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    || ||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
18449525 attttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 18449623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 26120670 - 26121163
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
26120670 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 26120769  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
26120770 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 26120866  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
26120867 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataattagc 26120964  T
421 acgtc-taaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||||     
26120965 acgtcttaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaatttattccc 26121064  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
26121065 atcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 26121163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 13689087 - 13688594
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
13689087 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 13688988  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
13688987 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 13688891  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
13688890 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 13688794  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
13688793 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 13688694  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
13688693 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 13688594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 36292682 - 36293172
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| |||     |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
36292682 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 36292781  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
36292782 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 36292878  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |    || |||||     ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
36292879 agagttttggcgcttttgaacttat----atatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 36292973  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
36292974 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 36293073  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36293074 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36293172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 36303285 - 36303775
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| |||     |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
36303285 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 36303384  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
36303385 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 36303481  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |    || |||||     ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
36303482 agagttttggcgcttttgaacttat----atatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 36303576  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
36303577 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 36303676  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36303677 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36303775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 26110992 - 26111485
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
26110992 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 26111091  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
26111092 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaactcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 26111188  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
26111189 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataattagc 26111286  T
421 acgtc-taaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
26111287 acgtcttaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 26111386  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| | || |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| | |||||||||||||||||||||    
26111387 atcttgaacgtacaaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggttgtggttgtacacttgtacttt 26111485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 568
Target Start/End: Original strand, 43248086 - 43248531
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
43248086 agagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 43248185  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
43248186 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 43248282  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-ataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||    | ||| |  ||||||||| ||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
43248283 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctcttttct-caaatcttcaagccttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 43248380  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
43248381 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 43248480  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    |||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
43248481 atcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcg 43248531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 45568547 - 45568061
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
45568547 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 45568448  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
45568447 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 45568348  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaa--cttgtga-------taatg-----tctctac-cgatcttcaagtcttcacttcct 382  Q
    |||||  || |||  |||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||       |  ||     |||||||   ||||| ||||||||||| | |    
45568347 gcttttatgtgaaacaaatttagcagagtttgggcgctttaaattgttgtgagttgctctcttgtttgttctctactttatctttaagtcttcactcctt 45568248  T
383 tatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttggg 481  Q
    ||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |     |||||||  ||||| | |||||||| |||||||||     
45568247 tatatagaggtgtg-aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttctgaaaacttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggt 45568149  T
482 tgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
45568148 tgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttatagcg 45568061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22136511 - 22136368
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
22136511 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 22136412  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22136411 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 22136368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22167676 - 22167533
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
22167676 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 22167577  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22167576 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 22167533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7019069 - 7018926
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
7019069 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 7018970  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
7018969 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 7018926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 304
Target Start/End: Original strand, 21287924 - 21288128
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
21287924 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacac 21288023  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||| ||||    
21288024 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaaaatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 21288123  T
300 gcttt 304  Q
    |||||    
21288124 gcttt 21288128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 304
Target Start/End: Original strand, 21298534 - 21298738
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
21298534 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcgagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 21298633  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |   ||||||||| ||||    
21298634 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagaattaagaatttctaaaacatatcaaatgaacacagaaattctaagt 21298733  T
300 gcttt 304  Q
    |||||    
21298734 gcttt 21298738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 3843153 - 3843292
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
3843153 ccttgcacttccaaggagatttcca----gaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 3843248  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
3843249 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 3843292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 423 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 30325473 - 30325280
Alignment:
423 gtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatc 521  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||    
30325473 gtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatc 30325374  T
522 ttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
30325373 ttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgaggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 30325280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 23363759 - 23363902
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
23363759 ccttgcacttccaaggagatttccactaa-aaataatcacacagattacaaatgttcaatactctcttagtatgagacttctcaaatgctcaagcgcgca 23363857  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23363858 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 23363902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 418 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23457530 - 23457332
Alignment:
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
23457530 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtactcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 23457431  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
23457430 ccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23457332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20260267 - 20260135
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
20260267 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatcacacagattacaaatgctcagtactcactagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 20260172  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20260171 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 20260135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21046897 - 21046765
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
21046897 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatcacacagattacaaatgctcagtactcactagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 21046802  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21046801 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 21046765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 467 - 615
Target Start/End: Original strand, 19461053 - 19461201
Alignment:
467 tttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtag 566  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
19461053 tttgtctgattgggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatctattcctatattgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttatag 19461152  T
567 cgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
19461153 cgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtactcttgtacttt 19461201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 467 - 615
Target Start/End: Original strand, 19558731 - 19558879
Alignment:
467 tttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtag 566  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
19558731 tttgtctgattgggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatctattcctatattgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttatag 19558830  T
567 cgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
19558831 cgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtactcttgtacttt 19558879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17519804 - 17519660
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
17519804 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacacagattacaactgatcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 17519706  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||    
17519705 aggcaagagacttcctttgctaaagcactaaagcaaaagacttcta 17519660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 615
Target Start/End: Original strand, 1750197 - 1750346
Alignment:
467 tttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 565  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
1750197 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgttttgtcttgta 1750296  T
566 gcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
1750297 gcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 1750346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18321772 - 18321659
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
18321772 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacataattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 18321673  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
18321672 tgttcacaatacaa 18321659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15934245 - 15934132
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
15934245 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacaaaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatgg 15934146  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
15934145 tgttcacaatacaa 15934132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 40002631 - 40002774
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||    
40002631 ccttgcacttctaaggagagttccattaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaaattgctcaagcacg 40002729  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
40002730 caggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 40002774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19956949 - 19956838
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttg-acttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
19956949 agacttcctatgctcaagcacgcaagcaagagacttctattcaaacataattacaaagaaatttgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtg 19956850  T
223 ttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||    
19956849 ttcacaatacaa 19956838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 19942772 - 19942884
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
19942772 agagacttctaatggtcaagcacaactgcaagagacttataatcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggtgaacacttgatatacaatcagtggt 19942871  T
222 gttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||    
19942872 gttcacaatacaa 19942884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 28902873 - 28903014
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||   || |||||||||||||    
28902873 ccttgcacttccaaggagagttccactaagtt-taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagcatgagacttta-aattgctcaagcacgc 28902970  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
28902971 aggcaagagacttcctttactcaagcactaaagcaagagacttc 28903014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 25163607 - 25163721
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
25163607 agagatttctaatgctcaagcacaattgcaagagacttcaaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 25163706  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
25163707 gtgttcacaatacaa 25163721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14990067 - 14989952
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
14990067 agagacttctattgatcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 14989968  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
14989967 ggtgttcacaatacaa 14989952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18152263 - 18152148
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |    
18152263 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaatggtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 18152164  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
18152163 ggtgttcacaatacaa 18152148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Original strand, 18679350 - 18679505
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||    
18679350 agagacttctaatgctcaagcacaactgtaagagacttctaattcaaacagaattacacataaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatgagtg 18679449  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    |||||||||||||||| ||   | |||||||  |||||  ||||||||||||||||    
18679450 gtgttcacaatacaattcagatacagactcttaagactctagaatttctaagatat 18679505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Original strand, 18718539 - 18718694
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||    
18718539 agagacttctaatgctcaagcacaactgtaagagacttctaattcaaacagaattacacataaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatgagtg 18718638  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    |||||||||||||||| ||   | |||||||  |||||  ||||||||||||||||    
18718639 gtgttcacaatacaattcagatacagactcttaagactctagaatttctaagatat 18718694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 22662651 - 22662766
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | | ||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
22662651 agagacttctattactcaagcacaaatgcaagagacttttgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcaat 22662750  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
22662751 ggtgttcacaatacaa 22662766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40846003 - 40845888
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
40846003 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 40845904  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
40845903 ggtgttcacaatacaa 40845888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45539053 - 45538938
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
45539053 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 45538954  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
45538953 ggtgttcacaatacaa 45538938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Original strand, 26832612 - 26832722
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
26832612 agagacttcctatgctcaagcaaaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtgg 26832711  T
221 tgttcacaata 231  Q
    |||||||||||    
26832712 tgttcacaata 26832722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 452 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6576712 - 6576547
Alignment:
452 atccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctg 550  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||  ||||    
6576712 atccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctg 6576613  T
551 ttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    || | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
6576612 ttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6576547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14990678 - 14990563
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
14990678 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttatgaattcaaacaaaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 14990579  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
14990578 ggtgttcacaatacaa 14990563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 3220290 - 3220403
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
3220290 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 3220388  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
3220389 agcaagagacttcta 3220403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9857099 - 9856986
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9857099 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9857001  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9857000 agcaagagacttcta 9856986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 19128406 - 19128519
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
19128406 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 19128504  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
19128505 agcaagagacttcta 19128519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Original strand, 19707047 - 19707158
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    |||||||| |||||||||||     ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
19707047 agacttcctatgctcaagcatagctgcaggagacttttattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtg 19707146  T
223 ttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||    
19707147 ttcacaatacaa 19707158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 26110889 - 26111002
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
26110889 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 26110987  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
26110988 agcaagagacttcta 26111002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32078318 - 32078205
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
32078318 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 32078220  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
32078219 agcaagagacttcta 32078205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32088891 - 32088778
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
32088891 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 32088793  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
32088792 agcaagagacttcta 32088778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 227
Target Start/End: Original strand, 22707867 - 22707973
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
22707867 agagacttcatatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacataattataaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 22707966  T
221 tgttcac 227  Q
    |||||||    
22707967 tgttcac 22707973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 43644460 - 43644546
Alignment:
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
43644460 gcaagagacttctattcgagcagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 43644546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Original strand, 6407261 - 6407372
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
6407261 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttgattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaat 6407359  T
219 ggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||    
6407360 ggtgttcacaata 6407372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 17928590 - 17928703
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||| |||    
17928590 agagatttcctatgctcgagcacaaaaacaagagacttctagacaaacacaattacaaaaaaaaatgtctgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 17928689  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
17928690 tgttcacaatacaa 17928703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 18772229 - 18772342
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||    
18772229 agagacttcctatgctcaagcataactgcaagagacttttattcaaacagaattacaaagaaatttgtttcaggttgaacacttgatatacaatcagcgg 18772328  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
18772329 tgttcacaatacaa 18772342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13431236 - 13431121
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
13431236 agagacttctattgctcaagcacaactgcaatagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 13431137  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
13431136 ggtgttcacaatacaa 13431121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 18557569 - 18557676
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||| |||||||||||| | |||    
18557569 agagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaa-tgtttgaggtttaacagttgatatacaataagtgg 18557667  T
221 tgttcacaa 229  Q
    |||||||||    
18557668 tgttcacaa 18557676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20383009 - 20382894
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
20383009 agagatttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaacgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 20382910  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
20382909 ggtgttcacaatacaa 20382894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 21932417 - 21932531
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | | ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
21932417 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattgaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 21932515  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
21932516 ggtgttcacaatacaa 21932531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 29692848 - 29692963
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
29692848 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 29692947  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
29692948 ggtgttcacaatacaa 29692963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33560831 - 33560716
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
33560831 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagt 33560732  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    | ||||||||||||||    
33560731 gatgttcacaatacaa 33560716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 39693069 - 39693184
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |  | |||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
39693069 agagacttctaatgctcaagcgcaactgtaagagacttccaaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcatt 39693168  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
39693169 ggtgttcacaatacaa 39693184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 159
Target Start/End: Original strand, 43247983 - 43248093
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
43247983 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 43248081  T
148 agcaagagactt 159  Q
    ||||||||||||    
43248082 agcaagagactt 43248093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 43639328 - 43639431
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
43639328 tgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 43639427  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
43639428 acaa 43639431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 210777 - 210662
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
210777 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 210678  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
210677 -aagcaagagacttcta 210662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 241480 - 241595
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
241480 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 241579  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
241580 -aagcaagagacttcta 241595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 252065 - 252180
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
252065 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 252164  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
252165 -aagcaagagacttcta 252180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 724400 - 724285
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
724400 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 724301  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
724300 -aagcaagagacttcta 724285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 794835 - 794950
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
794835 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 794934  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
794935 -aagcaagagacttcta 794950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 849591 - 849476
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
849591 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 849492  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
849491 -aagcaagagacttcta 849476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 6150727 - 6150839
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
6150727 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 6150824  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
6150825 agcaagagacttcta 6150839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 6160682 - 6160794
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
6160682 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 6160779  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
6160780 agcaagagacttcta 6160794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6319138 - 6319025
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
6319138 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 6319040  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
6319039 agcaagagacttcta 6319025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13689192 - 13689077
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
13689192 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 13689093  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
13689092 -aagcaagagacttcta 13689077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13697303 - 13697188
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
13697303 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 13697204  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
13697203 -aagcaagagacttcta 13697188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 18449028 - 18449141
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
18449028 ataatcacaaagattacaactgcgcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 18449126  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
18449127 agcaagagacttcta 18449141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 31214670 - 31214783
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
31214670 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 31214768  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
31214769 agcaagagacttcta 31214783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1210344 - 1210243
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatac 232  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
1210344 atgctcaagcacagaagcaaaagacttctaaacaaacaaaattacacagaaagatgtttggtttggacacttgatatacaatcagtgatgttcacaatac 1210245  T
233 aa 234  Q
    ||    
1210244 aa 1210243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15791922 - 15791808
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
15791922 ataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact- 15791824  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
15791823 aagcaagagacttcta 15791808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15969542 - 15969489
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactg 72  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15969542 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactg 15969489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 18153395 - 18153507
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||    
18153395 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 18153493  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
18153494 gcaagagtcttcta 18153507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 18157914 - 18158026
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||    
18157914 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 18158012  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
18158013 gcaagagtcttcta 18158026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25850607 - 25850494
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
25850607 agagtcttcctatactcaagcacaaaagcaagagtcttctaaacaaacacaattacacaaaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaataagtgg 25850508  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
25850507 tgttcacaatacaa 25850494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 26120564 - 26120680
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcac 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||     ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
26120564 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 26120663  T
145 taaagcaagagacttcta 162  Q
    | ||||||||||||||||    
26120664 t-aagcaagagacttcta 26120680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 9320105 - 9320219
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
9320105 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 9320203  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    | || |||||||||||    
9320204 gatgctcacaatacaa 9320219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 15425437 - 15425273
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||| ||||| | ||| |||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||| |  ||||||||    
15425437 tttgatcattcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggca 15425338  T
545 gagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     ||||| || |||||||||||||| | |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
15425337 tagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15425273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 16206833 - 16206947
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
16206833 agagacttctaatgctcaagcaaaaatgcaagagacttcttaattcaaacagaattact-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 16206931  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||| ||||||||||||    
16206932 ggttttcacaatacaa 16206947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20256126 - 20256011
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||      
20256126 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaaataaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagc 20256027  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    | ||||||||||||||    
20256026 gatgttcacaatacaa 20256011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 22673375 - 22673478
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
22673375 tgctcaagcacaaatgcaagagacttttgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcaccggtgttcactat 22673474  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
22673475 acaa 22673478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 43773654 - 43773769
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||||||  | ||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
43773654 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaatagacttctcaattcaaacataattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 43773753  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
43773754 ggtgttcacaatacaa 43773769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 45292369 - 45292484
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||| |||| |||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
45292369 agagacttctattgctcaagcacaactgcaatagacctcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 45292468  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
45292469 ggtgttcacaatacaa 45292484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 16746658 - 16746771
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
16746658 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 16746756  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
16746757 agcaagagtcttcta 16746771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 17879155 - 17879278
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacaga-attacacagaaaattgtttgacttgaacac 202  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||  | ||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
17879155 tgctcaagcacacaagcaagagactttcaatgctcaagcacataagcaaga--cttcttatgaat-agagattacaaagaaaattgtttgagttgaacac 17879251  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaa 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
17879252 ttgatatacaatcagtggtgttcacaa 17879278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 19138938 - 19139051
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||| || || |||| |||||||||||||||| || |    
19138938 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgct-a 19139036  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
19139037 agcaagagacttcta 19139051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20161853 - 20161740
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
20161853 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 20161755  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
20161754 agcaagagtcttcta 20161740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23470083 - 23469970
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
23470083 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 23469985  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
23469984 agcaagagtcttcta 23469970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 36077594 - 36077708
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
36077594 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36077692  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
36077693 -aagcaagagacttcta 36077708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 36088180 - 36088294
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
36088180 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36088278  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
36088279 -aagcaagagacttcta 36088294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 36292577 - 36292692
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
36292577 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36292676  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
36292677 -aagcaagagacttcta 36292692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 36303180 - 36303295
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
36303180 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36303279  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
36303280 -aagcaagagacttcta 36303295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40213791 - 40213678
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |    
40213791 ataatcagaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcaggcaaaagtcttccaatgctcaagcact-a 40213693  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
40213692 agcaagagtcttcta 40213678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 2810344 - 2810458
Alignment:
122 agagacttccaa-tgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| || || ||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||| | ||    
2810344 agagacttcaaactgctcaagcacaactgcaagagagttataatcaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtg 2810443  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
2810444 gtgttcacaatacaa 2810458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24679024 - 24678898
Alignment:
109 aagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgat 207  Q
    |||||| || || |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||   ||||| |||||| || |||  ||||| |  |||||||||||||    
24679024 aagcacacacgcaagagtcttcctatgctcaagcaaaaaagcaagagacttctaaaaaaacacaattacccataaatatgtttaaggttgaacacttgat 24678925  T
208 atacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
24678924 atacaatcaatggtgatcacaatacaa 24678898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15781333 - 15781219
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
15781333 ataatcacaaagattgcaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact- 15781235  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
15781234 aagcaagagacttcta 15781219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17442435 - 17442319
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||||||  |||||| ||||| |  |||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| |    
17442435 agagacttcttatgctccagcacaactgcaagaaacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgatgttgaacacttgatacacaatcagt 17442336  T
219 ggtgttcacaatacaat 235  Q
    |||||||||||||||||    
17442335 ggtgttcacaatacaat 17442319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 21932749 - 21932914
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||    
21932749 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggc 21932848  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||| || | | || |||||| ||||||||||||||||    
21932849 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 21932914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22462223 - 22462138
Alignment:
150 caagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
22462223 caagagacttctatttaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaccatacaa 22462138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 15336372 - 15336208
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||| |  ||||||||    
15336372 tttgatcagtcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggca 15336273  T
545 gagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     ||||| || |||||||||||||| | |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
15336272 tagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15336208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15336703 - 15336589
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
15336703 agagacttctatttctcaagcacaactgcaagagacttctcaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 15336605  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
15336604 ggtgttcaaaatacaa 15336589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15425768 - 15425654
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
15425768 agagacttctatttctcaagcacaactgcaagagacttctcaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 15425670  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
15425669 ggtgttcaaaatacaa 15425654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 15516741 - 15516577
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||| |  ||||||||    
15516741 tttgatcagtcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggca 15516642  T
545 gagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     ||||| || |||||||||||||| | |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
15516641 tagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15516577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15517072 - 15516958
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
15517072 agagacttctatttctcaagcacaactgcaagagacttctcaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 15516974  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
15516973 ggtgttcaaaatacaa 15516958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 17796956 - 17797070
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||      
17796956 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacaaaattaca-agaaaaatatttgaggttgaacacttgatatacaatcagc 17797054  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
17797055 ggtgttcacaatacaa 17797070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30422048 - 30421934
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| |    
30422048 agagacttctaatgctcaagcacaactgcgagagacttctaaattcaaacaaaattacaaagaaaat-gtttgaggtcgaacacttgatatacaatcagt 30421950  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
30421949 ggtgttcacaatacaa 30421934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3349250 - 3349136
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
3349250 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 3349152  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
3349151 -aagcaagagacttcta 3349136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3359847 - 3359733
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
3359847 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 3359749  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
3359748 -aagcaagagacttcta 3359733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 9340801 - 9340915
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
9340801 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 9340899  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
9340900 -aagcaagagacttcta 9340915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 9367945 - 9368059
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
9367945 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 9368043  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
9368044 -aagcaagagacttcta 9368059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 29076388 - 29076502
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
29076388 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 29076486  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
29076487 -aagcaagagacttcta 29076502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 29086639 - 29086753
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
29086639 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 29086737  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
29086738 -aagcaagagacttcta 29086753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30315323 - 30315210
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| |    
30315323 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccgatgctcaagcact-a 30315225  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
30315224 agcaagagtcttcta 30315210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 44480748 - 44480862
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
44480748 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 44480846  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
44480847 -aagcaagagacttcta 44480862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 44491364 - 44491478
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
44491364 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 44491462  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
44491463 -aagcaagagacttcta 44491478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 230
Target Start/End: Original strand, 12541188 - 12541289
Alignment:
128 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcac 227  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| |||   |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
12541188 ttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttcaaaacaaaca-aattacacaaaaataagtttggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 12541286  T
228 aat 230  Q
    |||    
12541287 aat 12541289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 16188563 - 16188633
Alignment:
165 caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
16188563 caaacagaattacaaagaaaaatgtttgaagttgaacacttgatatacaatcactagtgttcacaatacaa 16188633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19506040 - 19505938
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  ||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
19506040 aatgctcaaacacacaagtaagagacttctaaacaaacaaaattacatagaaagatgtttggtttaaacatttgatatacaatcagtggtgttcacaata 19505941  T
232 caa 234  Q
    |||    
19505940 caa 19505938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23264242 - 23264126
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac--ttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |   ||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||    |||| |||||||||||||||||     
23264242 agagacttctaatgctcaagcacaactacaatagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgtgggttgagcacttgatatacaatcag 23264143  T
218 tggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||    
23264142 tggtgttcacaatacaa 23264126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 273
Target Start/End: Original strand, 24634837 - 24635007
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||   |||||| ||||||| |||| |  |||||  |||||    
24634837 caaattctcaagcacacaagtaagagacttcctatgctcaagcacaatagcaagatacttcttaacaaaca-aattacaaagaataa-gtttgg-ttgaa 24634933  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct-agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||    
24634934 cacttgatatacaattagtggtgttcacaatacaaaacaat-tcatactctaagacttaagaatttctaagatat 24635007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 33052393 - 33052526
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||| |||  |||||||||||  || ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||   |||||  |||||    
33052393 caaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcaaaaatgcaagagacttctaaacaaaca-aattatacagaaatcagtttggattgaa 33052491  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
33052492 catttgatgtacaatcagtggtgttcacaatacaa 33052526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 18121372 - 18121267
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||| || ||||||||    
18121372 atcttttgactgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtct 18121273  T
562 tgtagc 567  Q
    ||||||    
18121272 tgtagc 18121267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18121723 - 18121612
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
18121723 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacaaaattact-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 18121625  T
219 ggtgttcacaata 231  Q
    |||||||| ||||    
18121624 ggtgttcataata 18121612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 18321444 - 18321279
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| | | |||||||| |||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||  |  |||||||    
18321444 ctttgatcaatcaccaataatcttttgcctgatatggttcttgtcctatggaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaactttgttgcaggc 18321345  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||| |||||||||||||    ||||||  | | || ||||||||| |||||||||||||    
18321344 agagctgttattcttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacactt 18321279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Original strand, 21287851 - 21287950
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
21287851 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagtacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagactt 21287949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 160
Target Start/End: Original strand, 21540405 - 21540500
Alignment:
66 acaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
21540405 acaactgctcaatacgacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacatgcaagagacttc 21540500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 30421714 - 30421593
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||  | ||||||     
30421714 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctatgcagga 30421615  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgt 564  Q
    ||||||| || |||||||||||    
30421614 agagctgtttttcttgtcttgt 30421593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45568620 - 45568521
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
45568620 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaaaagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagactt 45568522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #191
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 19418009 - 19418123
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
19418009 ataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 19418107  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
19418108 aagcaagagtcttcta 19418123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #192
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 19428584 - 19428698
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
19428584 ataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 19428682  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
19428683 aagcaagagtcttcta 19428698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #193
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 19224592 - 19224705
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||| ||||  |||| |||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
19224592 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 19224690  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
19224691 agcaagagtcttcta 19224705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #194
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23185512 - 23185346
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||  | ||||||     
23185512 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcagga 23185413  T
544 agagctg--ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||  || ||||||||||||||   |||| |  ||| |  |||||| ||||||||||||||||    
23185412 agagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactt 23185346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #195
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Original strand, 16188869 - 16189015
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||   || ||||||    ||||||||||| ||||||| ||||||    
16188869 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattaagagggaacatagttgcaggcagagttgttatccttgtct 16188968  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
16188969 tgtagcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacactt 16189015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #196
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Original strand, 25163955 - 25164101
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||| |  |||||||| | |||||| ||||||||    
25163955 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcataactgttattcttgtct 25164054  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   ||||||    | || |||||||||||||||||||||||    
25164055 tgtagcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacactt 25164101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #197
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 234
Target Start/End: Original strand, 27739403 - 27739532
Alignment:
101 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaac 200  Q
    |||| ||||||||| || |  ||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| |  ||| |  ||||||    
27739403 aaatactcaagcacacaagtaagagatttcctatgctcaagcag-aaagcaagagacttctaaacaaaca-aattacaaagaataaggttag--ttgaac 27739498  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
27739499 acttgatatacaatcagtggtgatcacaatacaa 27739532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #198
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 36104777 - 36104846
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
36104777 tcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 36104846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #199
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 1744715 - 1744802
Alignment:
149 gcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||| || |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
1744715 gcaagagacttctcaattcaaacaaaattacaaagaatat-gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 1744802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #200
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 12758048 - 12757883
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||    
12758048 ctttgatcaatcaccaatgatcttttttctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattattgcaggc 12757949  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||||||| ||||||||||||    ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
12757948 ggagctgttatccttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 12757883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #201
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 234
Target Start/End: Original strand, 17701326 - 17701391
Alignment:
170 agaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
17701326 agaattacaaagaatattatttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 17701391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #202
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 21298388 - 21298530
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||  |||||     
21298388 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctacagcaca 21298485  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
     |||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
21298486 aaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttc 21298530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #203
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Original strand, 12193524 - 12193563
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
12193524 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 12193563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #204
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Original strand, 12437952 - 12437991
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
12437952 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 12437991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #205
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18769760 - 18769647
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| |||||| || || |||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||| |    
18769760 ataatcacaaagattaaaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacagacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 18769662  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
18769661 agcaagagtcttcta 18769647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #206
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 566
Target Start/End: Original strand, 19943101 - 19943224
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||  ||||||||||    |||||||    
19943101 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatctattccaattgtgaaggaacatcgttgcaggc 19943200  T
544 agagct-gttatcttgtcttgtag 566  Q
    |||||| ||| |||||||||||||    
19943201 agagctggttttcttgtcttgtag 19943224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #207
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Original strand, 24645866 - 24645977
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacaca-gaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||| || | | |||||||||| | | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
24645866 agagacttctaatgctcaagaacaactgcaagagacttataattctaacagaattagaaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 24645965  T
219 ggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||||    
24645966 ggtgttcacaat 24645977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #208
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 39693401 - 39693566
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcagg 542  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| | |||| || | || ||||||| |  ||||||    
39693401 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatcctttcc-atgtatgtaggaacattgttgcagg 39693499  T
543 cagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    || |||||||||| ||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
39693500 caaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 39693566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #209
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17526272 - 17526192
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||   | |||||||  |||||| ||||||||||||||||    
17526272 ttgaacacttgatatacaatcagtgatgttcacaatacaaatcagatacagactcttaagactttagaatttctaagatat 17526192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #210
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 517
Target Start/End: Original strand, 17701606 - 17701679
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
17701606 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc 17701679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #211
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 20382679 - 20382514
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| || |||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||    
20382679 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttaaaatccattcccaatatgtaggaacattcttgcaggc 20382580  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||   ||||||  | |  | |||||||||||||||||||||||    
20382579 agagctgttattcttctcttgttgcagagacacaaactgattagtggagatagtggttgtacactt 20382514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #212
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 492 - 608
Target Start/End: Original strand, 24646252 - 24646369
Alignment:
492 tgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtgga 590  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||  | | || |||||    
24646252 tgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcggagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 24646351  T
591 gatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||||||||    
24646352 gatagtggttgtacactt 24646369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #213
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 43644762 - 43644927
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||| |  | |||||    
43644762 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttacaggc 43644861  T
544 agagctgttatct-tgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | || |||||||| |||| ||||||   ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||||    
43644862 atagttgttatctctgtcctgtagcagagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacactt 43644927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #214
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7018956 - 7018896
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
7018956 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 7018896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #215
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 486 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 14989694 - 14989574
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||   |||| |||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||| ||    
14989694 gtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagt 14989595  T
585 cgtggagatagtggttgtaca 605  Q
     ||||||||||||||||||||    
14989594 agtggagatagtggttgtaca 14989574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #216
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Original strand, 16207173 - 16207337
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||| ||| | | |||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||  ||||||||||    |||||| |    
16207173 tttgatcaatcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatccattcacattgtgaaggaacatcgttgcaggaa 16207272  T
545 gagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
16207273 gagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 16207337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #217
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 510
Target Start/End: Original strand, 21288270 - 21288334
Alignment:
446 ttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaat 510  Q
    |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
21288270 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaat 21288334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #218
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 510
Target Start/End: Original strand, 21298880 - 21298944
Alignment:
446 ttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaat 510  Q
    |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
21298880 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaat 21298944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #219
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 567
Target Start/End: Original strand, 33082732 - 33082856
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   ||| ||||||    |||||||    
33082732 ctttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattccaagtctgagggaacaccgttgcaggc 33082831  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagc 567  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
33082832 agagatgttatccttgtcttgtagc 33082856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 17687499 - 17687631
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc-tagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttga 198  Q
    ||||| ||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||| |  |||||  ||||    
17687499 caaatactcaagcatacaagcaagagatttcctatgcccaagcacaaaagcaagagacttcctaaacaaaca-aattacaaagaataa-gtttgg-ttga 17687595  T
199 acacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
17687596 gaacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 17687631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #221
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Original strand, 19155854 - 19155893
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
19155854 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgctcacaatacaa 19155893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #222
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24498649 - 24498610
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
24498649 ttgaacacttgatatataatcagtggtgttcacaatacaa 24498610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #223
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 45538682 - 45538559
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    |||||| |||||||||| || |||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| ||    
45538682 gtcctaagaaggatcaattttaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagt 45538583  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
45538582 agtggaggtagtggttgtacactt 45538559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 29693181 - 29693346
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcagg 542  Q
    |||||||||  ||||| | || ||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||||| |  ||||||    
29693181 ctttgatcaatcaccaatgatattttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc-atgtatgaaggaacattgttgcagg 29693279  T
543 cagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    || || |||||| |||||| ||||||   ||||||  | | || ||||||||| |||||||||||||    
29693280 catagttgttatccttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacactt 29693346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1210409 - 1210353
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaga 156  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||    
1210409 caaatgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagaga 1210353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12758350 - 12758279
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttga 193  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
12758350 agacttctaatgctcaagcacaactgcaaaagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttga 12758279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13430820 - 13430748
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |  ||| || |||||  ||||||||||||||||    
13430820 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 13430748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13689077 - 13689049
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
13689077 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 13689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 445 - 517
Target Start/End: Original strand, 19707373 - 19707445
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||||| || ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
19707373 tttgatcaatcaccaatgatcttttgtcttatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc 19707445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 21298504 - 21298560
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
21298504 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttc 21298560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Original strand, 21300981 - 21301053
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||    
21300981 tgcaggcagagcagttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 21301053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 29076502 - 29076530
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
29076502 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 29076530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 29086753 - 29086781
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
29086753 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 29086781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 467; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 344 - 941
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
344 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 443  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
444 gcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcag 543  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
544 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaggaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatt 643  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt- 416  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||     
644 tggcaaagttttggcgcttttaacttgtgatgatgtctctgcagatcttcaagtcttcact-ccttttatagaggtgtgtagagagacgttgagaccttt 742  T
417 aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
743 aaacacgtccaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 842  T
517 ctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
843 ctatcttgtgggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcaaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 443; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 10420 - 9907
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10420 ccttgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 10321  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
10320 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 10221  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
10220 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaggaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaa-caaattt 10122  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
10121 ggcagagtttgggtacttttaacttgtgataatgtttctactgatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 10022  T
419 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10021 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttagatgcagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 9922  T
519 atcttgaaggaacaa 533  Q
    |||||||||||||||    
9921 atcttgaaggaacaa 9907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 272 - 869
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
272 ccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacacag 371  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
372 gcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaacataattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcag 471  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
472 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctaaacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatt 571  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
572 ttgcagagtttgggcgcttttaacttgtagtaatgtctctactgatcttcaagtcttcactttcttatatataggtgtgtagagagacgttgagatctta 671  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
672 agcacgtttaaagagtcgttgagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaaatcattcc 771  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
772 tatcttgaaggaacaattctacaggcagagctgctatcttgtcttgtagtgtagacacgctcagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 4652 - 5249
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
4652 ccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacacag 4751  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
4752 gcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaacataattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcag 4851  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
4852 tggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctaaacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatt 4951  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
4952 ttgcagagtttgggcgcttttaacttgtagtaatgtctctactgatcttcaagtcttcactttcttatatataggtgtgtagagagacgttgagatctta 5051  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
5052 agcacgtttaaagagtcgttgagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaaatcattcc 5151  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
5152 tatcttgaaggaacaattctacaggcagagctgctatcttgtcttgtagtgtagacacgctcagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 5249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 88 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 59851 - 59325
Alignment:
88 tatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaatt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
59851 tatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaaaaaagagacttctaatcaaacagaatgacacaaaaaatt 59752  T
188 gtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
59751 gtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgca 59652  T
288 gaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatat 387  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||    
59651 gaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttctgatcttcaagtcttcactcctttatat 59552  T
388 agtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagt 487  Q
    || |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
59551 agaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttaggtgtagt 59452  T
488 cctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgt 587  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
59451 cctatgaaggatgaacttcaaattcattcctatcttgaagg-acaattctgcaggcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagggtcgt 59353  T
588 ggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
59352 ggagataatggttgtacacttgtacttt 59325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 63913 - 64027
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||  || |||||| || |||||||||||||||||||| |    
63913 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagattat-gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 64011  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
64012 ggtgttcacaatacaa 64027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 46239 - 46353
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||  ||  ||||| || |||||||||||||||||||| |    
46239 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagattatc-tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 46337  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
46338 ggtgttcataatacaa 46353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 552
Target Start/End: Original strand, 142971 - 143079
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||    
142971 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggc 143070  T
544 agagctgtt 552  Q
    |||||||||    
143071 agagctgtt 143079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 142683 - 142753
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
142683 tcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaatacttgatatataatcagtggagttcacaatacaa 142753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 38626 - 38120
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
38626 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtataagacttcccaaatgctcaagcacgcag 38527  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
38526 gcgagagacttc-aatgctcaagcactaaagcaagagactttaaatcaaacagaattgcatagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 38428  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaattt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
38427 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaaaaatgtctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaattt 38328  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||| | | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |    
38327 ggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctctgctgatcttcaagtcatcattcctttatataaaggtgagtagagagacgttgagatcttta 38228  T
419 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38227 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 38128  T
519 atcttgaa 526  Q
    ||||||||    
38127 atcttgaa 38120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 399)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 132 - 615
Target Start/End: Original strand, 21735868 - 21736351
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
21735868 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaattacacaaaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcggtggtgttcacaata 21735967  T
232 caatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttggg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
21735968 caatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagtttggg 21736067  T
332 cgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaaga 431  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
21736068 cgcttttaacttgtgttgatatctctattgatcttcaagtcttcactcctttaaatagtggtgagtagagagacgttgagatctttagcacgtctaaagt 21736167  T
432 gtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
21736168 gtcgttgagttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtgggaac 21736267  T
532 aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
21736268 aattctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 21736351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 27172481 - 27173073
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaaga-aataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
27172481 ccttgcacttccaaggagatttccactaaatcaataatcacacagattacaactgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgca 27172580  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 216  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
27172581 ggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaacagaattaca-agaaaattgtttgacgttgaacacttgatatacaatca 27172679  T
217 atggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaat 316  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
27172680 gtggtgttctcaatacaatgcaataaaagactct---ct--agaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaat 27172774  T
317 ttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttcc-ttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| |    
27172775 ttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgat-atgtctctaccaatcttcaagtcttcacttcctttatataggggagagtagagagacgttgagattt 27172873  T
416 t-aagcacgtctaaagagtcgttgag-ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattca 513  Q
    |   |||   ||| ||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
27172874 tcttgca---ctatagagtcgttgagaaacctttgatctttcaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattaacttcaaattca 27172970  T
514 ttcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcag-ggtcgtggagatagtggttgtacacttgtac 612  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||||    
27172971 ttcctatcttgaaagaacaaatctgcaggcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagagttcgtggaggtcgtggttgtacatttgtac 27173070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 2246094 - 2246608
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
2246094 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaac 2246193  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2246194 acttgatatacaattagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 2246292  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
2246293 ctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtag 2246392  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
2246393 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 2246492  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| |||| ||    
2246493 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttatgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtagt 2246592  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
2246593 tgtacacttgtacttt 2246608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 15663212 - 15662699
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
15663212 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaaatgtttgacttgaaca 15663113  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15663112 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataca-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 15663014  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |  || ||||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||    
15663013 tgtttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtcttttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggcgactaga 15662914  T
401 gagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
15662913 gagacgttgagatttttagcacgtctaaagggtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatc 15662814  T
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
15662813 aacttcaaattcattcctattttgaaggaaaaattctgtaggcagagctgttgtcttttcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggtt 15662714  T
601 gtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||    
15662713 gtacacttgtacttt 15662699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 15651557 - 15651064
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
15651557 agagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 15651458  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
15651457 gttcacaatacaatgcaataca-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctgtttagaatcaaatttggc 15651359  T
322 agagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |  || ||||||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||| ||||||| || |||    
15651358 agagttttggcacttttaacttgtgttgatgtcttttgccaatcttcaagtcttcactcctttatataatggcgagtagagagacattgagatttttagc 15651259  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15651258 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 15651159  T
521 cttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
15651158 tttgaaggaaaaattctgtaggcagagctgttgtcttttcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 15651064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 608
Target Start/End: Original strand, 10528786 - 10529384
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
10528786 ccttgaacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcataaatgctcaagcacgc 10528885  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatc 215  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
10528886 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatc 10528985  T
216 aatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactct--agacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgag--aa 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||  ||    
10528986 agtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaattaacacagaaattcaaagtgcttttgagtgaa 10529085  T
311 ttaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttga 410  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||||    
10529086 acaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtattgtctcttctgatcttcaagtcttcactcctttatacagagatgtgtagagagacgttga 10529185  T
411 gatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaa 509  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||    
10529186 gatctttaagcacgtcaaaagagtcattgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaa 10529285  T
510 ttcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
10529286 tccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 10529384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 91 - 615
Target Start/End: Original strand, 14580858 - 14581379
Alignment:
91 gagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaat-tgt 189  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
14580858 gagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaatatgt 14580957  T
190 ttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcag 288  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
14580958 ttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct---ct--agaatttctaagatatatcaaatcagtgaag 14581052  T
289 aaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttcctt-atat 387  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||   | ||||||||||||||||||||| ||||    
14581053 aaattcaaagtgcttttgagaaacaattttggcagagtttgtgcgcttttaacttgtgatg-tctctctcttgttcttcaagtcttcacttcctttatat 14581151  T
388 agtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagt 487  Q
     | |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
14581152 ggaggtgtgaa-agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgaagt 14581250  T
488 cctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcg 586  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    |||||| |    
14581251 cctttgaagaattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaaattctgcaggtagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagggtag 14581350  T
587 tggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
14581351 tggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14581379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 13199752 - 13199236
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||  ||||||||  | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
13199752 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcgtcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaac 13199653  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
13199652 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcggtgcagaaattcaaagtg 13199554  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc-taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | |  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||    
13199553 ctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcctgctaatcttcaagtcttcactcctttatacagtggtgagtag 13199454  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
13199453 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 13199354  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggac--acactcagggtcgtggagatagtg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||  | |  ||| || |||||| |||||    
13199353 caacttcaaattcattcctatcttgaaggatcatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcatagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtg 13199254  T
598 gttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||    
13199253 gttgtacacttgtacttt 13199236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 104 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 31114494 - 31113980
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
31114494 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 31114395  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
31114394 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaattaacacagaaattcaaagtgc 31114295  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagag 401  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||    
31114294 ttttgagaaacaattttggcagagtttgggcgcttttaacttgttataatgtctctcctgatcttcaagtcttcactcctttttatagaggtgtgtagag 31114195  T
402 agacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||    
31114194 aaacgttgagacctttaagcacgtctaaagagtcgttgagaacctttgatcattcaacattaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatc 31114095  T
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
    || ||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
31114094 aagttcaaaaccattcctaacttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgcagacacaagcagagtcgtggaggtagtggtt 31113995  T
601 gtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||    
31113994 gtacacttgtacttt 31113980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 1053438 - 1053950
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||  ||  ||||||||||| ||||||||| ||||    
1053438 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacgaaaagacacagaaaat-gtttgactttgaac 1053536  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
1053537 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 1053635  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |     
1053636 ctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcacttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa- 1053734  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||    
1053735 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaat 1053834  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||  || |||||| |||||||    
1053835 caacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctacaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggt 1053934  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
1053935 tgtacacttgtacttt 1053950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 1063867 - 1064379
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||  ||  ||||||||||| ||||||||| ||||    
1063867 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagaggcttctaatcaaacgaaaagacacagaaaat-gtttgactttgaac 1063965  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
1063966 acttgatatacaataagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 1064064  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |     
1064065 ctttgtagaatcaaatttggtagagttttggcgcttttaacttgtgtttatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa- 1064163  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
1064164 agagactttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 1064263  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
1064264 caacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggtagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 1064363  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
1064364 tgtacacttgtacttt 1064379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 29934066 - 29933552
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  || |  |||||||    
29934066 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttccaatcaaacaaaattacacagaaaatgtttgggattgaaca 29933967  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
29933966 cttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgc 29933868  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagag 401  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||    
29933867 ttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgcttttaacttgtgtttatatctctgtaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagag 29933768  T
402 agacgttgaga-tcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
29933767 agactttgagattctttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatc 29933668  T
501 -aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
29933667 gaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctattgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 29933568  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
29933567 tgtacacttgtacttt 29933552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 29983220 - 29982706
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  || |  |||||||    
29983220 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttccaatcaaacaaaattacacagaaaatgtttgggattgaaca 29983121  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
29983120 cttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgc 29983022  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagag 401  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||    
29983021 ttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgcttttaacttgtgtttatatctctgtaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagag 29982922  T
402 agacgttgaga-tcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
29982921 agactttgagattctttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatc 29982822  T
501 -aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
29982821 gaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctattgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 29982722  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
29982721 tgtacacttgtacttt 29982706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 102 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 29906687 - 29906221
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaac 200  Q
    ||||||||||| |  | || |||| |||| |||||||||||||  | ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||    
29906687 aatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattacacagaaaa-tgtttgagattgaac 29906589  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
29906588 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaat-aaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtg 29906490  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    
29906489 cttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgcttttaacttgtgttgatatctctataaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaga 29906390  T
401 gagacgttgaga-tcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||    
29906389 gagacgttgagattctttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggat 29906290  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
29906289 caagttcaaatccattcctatcttgaaggaaaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcg 29906221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 102 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 29947852 - 29947386
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaac 200  Q
    ||||||||||| |  | || |||| |||| |||||||||||||  | ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||    
29947852 aatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattacacagaaaa-tgtttgagattgaac 29947754  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
29947753 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaat-aaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtg 29947655  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    
29947654 cttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgcttttaacttgtgttgatatctctataaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaga 29947555  T
401 gagacgttgaga-tcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||    
29947554 gagacgttgagattctttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggat 29947455  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
29947454 caagttcaaatccattcctatcttgaaggaaaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcg 29947386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 102 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 29997006 - 29996540
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaac 200  Q
    ||||||||||| |  | || |||| |||| |||||||||||||  | ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||    
29997006 aatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattacacagaaaa-tgtttgagattgaac 29996908  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
29996907 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaat-aaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtg 29996809  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    
29996808 cttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgcttttaacttgtgttgatatctctataaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaga 29996709  T
401 gagacgttgaga-tcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||    
29996708 gagacgttgagattctttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggat 29996609  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
29996608 caagttcaaatccattcctatcttgaaggaaaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcg 29996540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 16076658 - 16077170
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||  ||||||    
16076658 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgatgttgaac 16076756  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
16076757 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 16076855  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | || |||||  || ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |     
16076856 ctttgtagaatcaaatttggcaaagttttggcgcttttaacttgtattgatatctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaa- 16076954  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
16076955 agagacgttgagattttgagcacgtctaaagagtcgttgagtttctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 16077054  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
16077055 caacttcaaattcattcccatcttgaaggaacattgctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 16077154  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
16077155 tgtacacttgtacttt 16077170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 16671667 - 16671156
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||  ||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||    
16671667 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacatgcgagaggcttcttttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgatttgaaca 16671569  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
16671568 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgc 16671470  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |    
16671469 tttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgtgaa-a 16671371  T
401 gagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||    
16671370 gagatgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagaatc 16671271  T
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||     |  || |||||| ||||||||    
16671270 aacttcaaattcattcacatcttgaaggaacaattctacaggcagagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaagagaaaagtagtggaggtagtggtt 16671171  T
601 gtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||    
16671170 gtacacttgtacttt 16671156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 8740611 - 8740121
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
8740611 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 8740512  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||    
8740511 gttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgggaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaa-gtgctttgtagaatcaaatttggc 8740414  T
322 agagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||  || |||||||||| |||||| | ||||||||  ||||| | |||||||||||||| || |||    
8740413 agagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtcacttgccaatcttcaagttttcactcctttatatagaagtgtgaa-agagacgttgagatttttagc 8740315  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
8740314 acgtctaa-gagtcgttgtgttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccat 8740216  T
521 cttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
8740215 cttgaaggagcaattctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 8740121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 103 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 51989654 - 51989137
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
51989654 atgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaaacaagagacttctaatcaaacagaattacacagtaaattgtttgagtttgaaca 51989555  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
51989554 cttgatatactatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtg 51989455  T
301 ctttt-gagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | | |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
51989454 ctttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtattgtctttgctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtag 51989355  T
400 agagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||| |    
51989354 agagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctataaagaa 51989255  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtg 597  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||  |||  |||||||| |||||    
51989254 tcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaaacagattcgtggaggtagtg 51989155  T
598 gttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||    
51989154 gttgtacacttgtacttt 51989137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 51 - 615
Target Start/End: Original strand, 28168757 - 28169322
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||  |    
28168757 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacaca 28168856  T
148 agcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaa-tacaatgcaataaaag 245  Q
     |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||     
28168857 ggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtagtgttcacaaatacaatgcaataaaa- 28168954  T
246 actctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttg 344  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| ||||||    
28168955 actctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-gacagggttttggcgctttttaacttg 28169053  T
345 tgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttc 443  Q
    | |||  | | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
28169054 t-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcccttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgttgagttc 28169150  T
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
28169151 ctttgatcatccaccagtaatcatttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggc 28169250  T
544 agagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | ||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
28169251 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 28169322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 132 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9006984 - 9006502
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
9006984 aatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgatgatgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaat 9006886  T
231 acaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgg 330  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| |    
9006885 acaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttg 9006787  T
331 gcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaa 429  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||  || ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||    
9006786 gcgcttttaacttgtattgatgtctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatttttagcacgtctaaa 9006688  T
430 gagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaagga 529  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
9006687 gattcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcgacttcaaattcattcccatcttgaagga 9006588  T
530 acaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9006587 acatttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9006502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 27883112 - 27883624
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| || | |||||||||||||  | || |||| |||||  ||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||    
27883112 aatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgaccttgaac 27883210  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
27883211 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtg 27883309  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtct--ctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | || |||  ||||  |||||||||||| |||| | |||||||| |||||| |    
27883310 ctttgtagaatcaaatttgacagagttttggcgcttttaacttgtgttgatctctatctaca-atcttcaagtctccactcctttatatagaggtgtgaa 27883408  T
399 gagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
27883409 -agagacgttgagatgtttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgagtgtagtcctttgaagaa 27883507  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
27883508 tcaatttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 27883607  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
27883608 ttgtacacttgtacttt 27883624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17281940 - 17281427
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||    
17281940 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacacagaaaat-gtttgactttgaac 17281842  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17281841 acttgatatactatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 17281743  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
     |||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||  || ||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| |     
17281742 ttttatagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgcctcttgccaatcttcaagtcttcattcctttatatagaagtgtgaa- 17281644  T
400 agagacgttgagatctta-agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |    
17281643 agagacgttgagattttttagcatgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgccagatttgggtgtagtcctttgaagaa 17281544  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
17281543 tcaacttcaaattcattttcattttgaaggaacatttctgcaggtatagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 17281444  T
599 ttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||    
17281443 ttgtacacttgtacttt 17281427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 8996462 - 8995950
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| || | |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||   |||||    
8996462 aatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgatgatgaac 8996364  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
8996363 acttgatatacaatcagtggttttctcaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtg 8996265  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||  || ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |     
8996264 ctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtattgatgtctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaa- 8996166  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
8996165 agagacgttgatatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 8996066  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
8996065 cgacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 8995966  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
8995965 tgtacacttgtacttt 8995950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 608
Target Start/End: Original strand, 13147705 - 13148304
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaact-gctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcac 114  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||  || |||||||||||    
13147705 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaacttgctcaatactacacctagtatgagacttcaaaattgctcaagcac 13147803  T
115 gcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaa 213  Q
    |||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
13147804 gcaggcaagagacttactttgatcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaa 13147903  T
214 tcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcag-aaattcaaagtgcttt--tga 307  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||  ||     
13147904 tcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaaattcaaagtgcttttgtgt 13148003  T
308 gaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgt 407  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| || | |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||    
13148004 gaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtcttgtcact-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-agagagtcgt 13148101  T
408 tgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttc 506  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||    
13148102 tgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttc 13148201  T
507 aaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtaca 605  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||  ||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||    
13148202 aaatccattcctatcttgaaggaacaattctgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtatcgtagacgcacgcatagtcgtggaggtagtggttgtaca 13148301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 104 - 615
Target Start/End: Original strand, 41045271 - 41045788
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
41045271 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaagttgtttgagtttgaacac 41045370  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactct--agacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
41045371 ttgatatactattggtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacatagaaattcaaagt 41045470  T
300 gcttttga-gaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    |||||  | |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
41045471 gctttgtatgaaacaaatttggcagagtttgagcgcttttaacttgttgtattgtctctattgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgta 41045570  T
399 gagagacgttgagatc-ttaagcacgtc-taaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaag 496  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||   | |||||||   |||| | || |||||  |||||||| ||| |||||||||||    
41045571 gagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaaagagttgttgagaaaccttgatca-ataccaattattttttgcatgatttggatgttgtcctatgaag 41045669  T
497 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagt 596  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||    
41045670 gatcaagttcaaatccattcctaacttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagt 41045769  T
597 ggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| |||||||||    
41045770 ggttgtacaattgtacttt 41045788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 425
Target Start/End: Original strand, 17017442 - 17017854
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
17017442 ccttgtacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 17017540  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatc 215  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||     
17017541 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaaatacacagaaaattatttaagtttgaacacttgatatacaatg 17017640  T
216 aatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt-tgagaat 311  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||     
17017641 agtggtgttcacaatacaatgaaattaaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgagcacagaaattcaaagtgctttgtgtgaaa 17017740  T
312 taaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgag 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||   |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
17017741 caaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtcttgtctcttatgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-agagagacgttgag 17017839  T
412 atc-ttaagcacgtc 425  Q
    ||| |||||||||||    
17017840 atctttaagcacgtc 17017854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 104 - 604
Target Start/End: Original strand, 22150774 - 22151280
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
22150774 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 22150873  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
22150874 ttgatatacaatcagtggtgttcacaaaacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagt 22150973  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgt 397  Q
    |||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    ||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||     
22150974 gcttttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtctcttctct-ctgatcttcaagttttcactcctttatatagaggtgtg- 22151071  T
398 agagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaag 496  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   |||||||||  || || | |||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||    
22151072 agagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaactttgatcaaacagcaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcttatgaag 22151171  T
497 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatag 595  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||  |||  |||||||| |||    
22151172 gatcacgttcaaatccattcctatcttgaaagaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagaatcgtggaggtag 22151271  T
596 tggttgtac 604  Q
    |||||||||    
22151272 tggttgtac 22151280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 38314443 - 38314940
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
38314443 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 38314542  T
222 gttcacaatacaatgcaata----aaagactctagacttaa-gaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaat 316  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
38314543 gttcacaatacaatacaatacaataaagactctagactttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaat 38314642  T
317 ttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct 415  Q
    | | |||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||   |||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||      
38314643 t-gacagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacat-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggagtgaa-agagacgttgagatga 38314739  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||    
38314740 ttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaaacagcttcaaattcatt 38314839  T
516 cctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||   ||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
38314840 cccatcttgaaggaacatttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 38314939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9381143 - 9380650
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9381143 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 9381044  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
9381043 gttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 9380946  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
9380945 agagttttggcgctttttaacttgt-ata-tatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgatt 9380849  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
9380848 agcatgtctaaagagtcgttgagatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 9380749  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
9380748 catcttgaaggaacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtacttt 9380650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9391689 - 9391196
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9391689 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 9391590  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
9391589 gttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 9391492  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
9391491 agagttttggcgctttttaacttgt-ata-tatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgatt 9391395  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
9391394 agcacgtctaaagagtcgttgagatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 9391295  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
9391294 catcttgaaggaacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtggtacatttgtacttt 9391196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 11217210 - 11216715
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
11217210 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 11217111  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
11217110 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 11217013  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-----atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct 415  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| |      ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||      
11217012 agagttttggcgctttttaacttgt-ata-tatctctatctcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatga 11216916  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
11216915 ttagcacgtctaaagagtcgttgagatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 11216816  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
11216815 cccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 11216716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 11163579 - 11164070
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
11163579 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 11163678  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| | |    
11163679 gttcacaatataataccataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaatt-gac 11163776  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||  |  | | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||   | |||    
11163777 agagttttggcactttttaacttgtatttctctatctaca-atcttcaagtcttcactcccttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagaggattagc 11163874  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||    
11163875 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 11163974  T
521 cttgaagg-aacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
11163975 cttgaaggcaaaaattctgtaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 11164070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6501488 - 6500997
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
6501488 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 6501389  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||| |  |||| |    
6501388 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagatattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgac 6501292  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatg-tctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |  ||| || | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
6501291 agagttttggcgcttttgaacttgt-atatttctctatatc-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 6501195  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
6501194 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 6501095  T
519 atcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
6501094 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6500997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 1784556 - 1784064
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  | ||||| || |||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
1784556 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgattaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttaaacacttgatatacaatcagtggt 1784457  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
1784456 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgcagaatcaaatt-gac 1784359  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||   |||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
1784358 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacat-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagc 1784261  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||    
1784260 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcccat 1784161  T
521 cttgaaggaacaattctgcaggcagagctgt-tatcttgtcttgtagcgaggacacact-cagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||| |   ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
1784160 cttgaaggaacatttctgcaggcatggctgtgtttcttgtcttgtagcgtggacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 1784064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9994378 - 9993887
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9994378 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 9994279  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
9994278 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 9994182  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||| ||| | ||| |     ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
9994181 agagttttggcacttttgaacttgt-atattttctatttttcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 9994084  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
9994083 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattccc 9993984  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9993983 atcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9993887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 48336991 - 48337482
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
48336991 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaattagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 48337090  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
48337091 gttcacaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 48337188  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||    
48337189 agagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgatttgc 48337286  T
421 acgtctaaagagtcgttgagt-tcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
48337287 acgtctaaagagtcgtttagaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 48337386  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
48337387 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 48337482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 4404022 - 4404513
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
4404022 agagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttcatatacaatcagtggt 4404121  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaa-gaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |     
4404122 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagactttgtgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-ga 4404219  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt 416  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||    || |||||| | |   |||||||||||||||| | |||||||  || ||| | ||||||||||||||       
4404220 catagttttggcgctttttaacttgt----atctctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatataggcgtgaa-agagacgttgagatgaa 4404314  T
417 aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
4404315 tagcacgtctaaagagttgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 4404414  T
517 ctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4404415 ccaacttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4404513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6490834 - 6490343
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
6490834 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaattagtggt 6490735  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||| |  |||| |    
6490734 gttctcaatacaatacaataaa-gactctggacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagatattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgac 6490638  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatg-tctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |  ||| || | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
6490637 agagttttggcgcttttgaacttgt-atatttctctatatc-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 6490541  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
6490540 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccc 6490441  T
519 atcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
6490440 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6490343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12238098 - 12237608
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
12238098 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 12237999  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
12237998 gttctcaatacaatacaataaa-gactatagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcattgtgctttgtagaatcaa-tttgac 12237902  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
12237901 agagttttggcgctttttaacttgt----atatctctatctgtcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 12237807  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
12237806 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 12237707  T
517 ctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12237706 ccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctattgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12237608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 23635459 - 23635951
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
23635459 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 23635558  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
23635559 gttctcaatacaatacgataaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 23635656  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
23635657 agagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 23635754  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
23635755 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 23635854  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
23635855 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23635951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Original strand, 49989789 - 49990259
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
49989789 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacac 49989888  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
49989889 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaataaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 49989988  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgc--ttttaacttgtgataatgtctc--taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggt 393  Q
    |||||  || |||  ||| || |||||||||||||||  |||| ||||||     ||||||    | |||||||||||||||||| | |||||||| |||    
49989989 gcttttatgtgaaacaaaattagcagagtttgggcgctttttttacttgt-----tgtctcatgtctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 49990083  T
394 gtgtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctat 492  Q
    ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   |||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
49990084 gtg-aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctat 49990182  T
493 gaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
49990183 gaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcg 49990259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 1794969 - 1794476
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || |||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
1794969 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttaaacacttgatatacaatcagtagt 1794870  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttcta-agatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |     
1794869 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttaaatttctatagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-ga 1794772  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||   |||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
1794771 cagagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctacat-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattag 1794674  T
420 cacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
1794673 cacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 1794574  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacact-cagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| |   ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
1794573 tcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 1794476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 51 - 615
Target Start/End: Original strand, 8784917 - 8785485
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||     
8784917 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacg 8785015  T
146 aaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaag 245  Q
     | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||    
8785016 caggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatac-agaaaag 8785114  T
246 actctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttg 344  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||    
8785115 actctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgacagagttttggcgcttttgaacttg 8785212  T
345 tgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcg-ttgagttc 443  Q
    ||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||    
8785213 tgtatatttctat-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 8785310  T
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga-aggaacaa-ttctgcag 541  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||||||||    
8785311 ctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgcag 8785410  T
542 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
8785411 gcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 8785485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 13262158 - 13261667
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
13262158 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgaccttaaacacttgatatacaatcagtgg 13262060  T
221 tgttcacaa-tacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |    
13262059 tgttcacaaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtacagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-g 13261962  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
     || ||||| | ||||||| ||||||| |||  | | |||||  |||  |||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
13261961 acaaagttttgacgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcaacaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgatt 13261865  T
418 agcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
13261864 aacacgtctaaagattcgttgagtccctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 13261765  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || ||| || |||||||||||||||||||||||    
13261764 catcttgaaggaacaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttgtacttt 13261667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12249924 - 12249434
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
12249924 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttataatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 12249825  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| || |||| |    
12249824 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaatttagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 12249728  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || ||||||      ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
12249727 agagttttggcgctttttaacttgt----atatctctatttgtcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 12249633  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
12249632 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 12249533  T
517 ctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12249532 ccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9982370 - 9981879
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9982370 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 9982271  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |||| |    
9982270 gttctcaatacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaa-tttgac 9982174  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||| ||| | ||| |     |||||||||||||||||   ||||||||  ||||| | ||||||||||||||  | ||    
9982173 agagttttggcacttttgaacttgt-atattttctatttttcatcttcaagtcttcactctattatatagaagtgtgaa-agagacgttgagataatcag 9982076  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
9982075 cacgtctaaagagtcatttgaaatcctttgatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattccc 9981976  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9981975 atcttgaaggcacaaattctgcaggcatagatgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9981879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 39673368 - 39672876
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
39673368 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 39673269  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
39673268 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 39673172  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
39673171 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 39673074  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
39673073 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 39672974  T
520 tcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
39672973 tcttgaacatacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 39672876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 4743488 - 4743979
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
4743488 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 4743587  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
4743588 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 4743684  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
4743685 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcta-ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 4743782  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
4743783 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 4743882  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4743883 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4743979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 4175242 - 4174750
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
4175242 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 4175143  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
4175142 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 4175046  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
4175045 agagttttggcgctttttaacttgtg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 4174951  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
4174950 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 4174851  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
4174850 ccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 4174751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 9535359 - 9535849
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| ||||||||||||   | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9535359 agagtcttctaatgctcaagcatgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 9535458  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
9535459 gttcacaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 9535556  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   || ||| |  | |  |||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
9535557 agagttttggcgctttttaacttgtgt--atctctatctccaatttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagc 9535653  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
9535654 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 9535753  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
9535754 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcatggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 9535849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 41683428 - 41683920
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
41683428 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 41683527  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
41683528 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 41683624  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
41683625 agagttttggcgcttttaaacttatgtatatctctcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 41683722  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
41683723 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 41683822  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
41683823 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 41683920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 41693997 - 41694489
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
41693997 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 41694096  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
41694097 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 41694193  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
41694194 agagttttggcgcttttaaacttatgtatatctctcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 41694291  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
41694292 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 41694391  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
41694392 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 41694489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 933377 - 933868
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
933377 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataggtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 933476  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||| | |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
933477 gttcacaatacattacgttaaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 933574  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
933575 agagttttggcgctttttaacttgt----atatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgatt 933669  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |  |||||||||||||    
933670 agcatgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgtctgatttggatgtagtcctttgaagaattagtttcaaattcattc 933769  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
933770 ccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 933868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 574
Target Start/End: Original strand, 18006010 - 18006496
Alignment:
91 gagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtt 190  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||| | |||    
18006010 gagacttctcagatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacacaaataca-agaaattggtt 18006108  T
191 tgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaaga--ctctagacttaag-aatttctaagatatatcaaatcagtgca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||| ||||||||||||| | ||||| |   |     
18006109 tgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaatgaaagaatctctaagcttaagaaatttctaagataga-caaataaacact 18006207  T
288 gaaattcaaagtgcttttgag-aattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttcc-tta 384  Q
    ||||||| ||| |||| || | |||  || ||| |||||||| |||||||| || || ||||   |||||| |   ||||||||| |||||||||| |||    
18006208 gaaattctaagagcttctgtgaaatgcaaattgacagagttttggcgctttcaaattttgat--ggtctcttcttaatcttcaagacttcacttccttta 18006305  T
385 tatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtg 483  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| ||||| | ||  |||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||    
18006306 tatagaggtgagtagaaagacgatgagagctttttgcacttcaatagagtcgttaagttcctttgatcatccaccagtgatctgttgcctgatttggatg 18006405  T
484 tagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca 574  Q
     |||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
18006406 cagtcctttgcataatcaacttcaaattcattgctatcttgaaggaacaaatctgcaggcagagctgttttcttgtcttgtagcgcggaca 18006496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 29461698 - 29461207
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
29461698 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 29461599  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
29461598 gttcacaatacaatacaattaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 29461501  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
29461500 agagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctctctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 29461403  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    || |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
29461402 acatctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 29461303  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
      ||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
29461302 ctttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 29461207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 29472550 - 29472059
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
29472550 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 29472451  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
29472450 gttcacaatacaatacaattaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 29472353  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
29472352 agagttttggcgctttttaacttgtgtatgtctctctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagc 29472255  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    || |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
29472254 acatctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 29472155  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
      ||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
29472154 ctttgaaggcacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 29472059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 504653 - 504161
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
504653 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 504554  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
504553 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 504457  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | ||||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
504456 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 504359  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
504358 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 504259  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
504258 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 504161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 527019 - 526527
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
527019 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 526920  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
526919 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 526823  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | ||||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
526822 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 526725  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
526724 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 526625  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
526624 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24707040 - 24706548
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
24707040 agagatttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacagtgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 24706941  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
24706940 gttcacaatataatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 24706843  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | ||| || ||||||||||||||||| | |||||||  || ||| | |||||||||||||   | |||    
24706842 agagttttggcgcttttgaacttgtgtatctctatct-ccaatcttcaagtcttcactcctttatataaaggcgtgaa-agagacgttgagagaattagc 24706745  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
24706744 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 24706645  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |   || || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24706644 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24706548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 5866181 - 5865687
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
5866181 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 5866082  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
5866081 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 5865985  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
5865984 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctctctatcttgaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 5865888  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
5865887 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 5865788  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
5865787 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 5865688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 5876780 - 5876286
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
5876780 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 5876681  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
5876680 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 5876584  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
5876583 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctctctatcttgaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 5876487  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
5876486 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 5876387  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
5876386 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 5876287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 37759419 - 37759912
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
37759419 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 37759518  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||| |    
37759519 gttcacaatacaatacagaaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 37759616  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
37759617 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatttctatatgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 37759713  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
37759714 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 37759813  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
37759814 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 37759912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 5628503 - 5628011
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
5628503 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 5628404  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
5628403 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-agaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 5628307  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||| |    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
5628306 agagttttggcgcttttaaacttgtg----tatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 5628212  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
5628211 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 5628112  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
5628111 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 5628012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 7795092 - 7794601
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
7795092 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 7794993  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |      
7794992 gttcacaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gat 7794895  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |       
7794894 agagttttggcgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgatttt 7794798  T
420 cacgtctaaagagtcgttgagt-tcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||     
7794797 cacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattccc 7794698  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
7794697 atcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 7794601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 7805003 - 7804512
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || || |  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
7805003 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatataatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 7804904  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
7804903 gttcacaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 7804806  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  |    
7804805 agagttttggcgctttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgatttg 7804709  T
420 cacgtctaaagagtcgttgagt-tcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||     
7804708 cacgtctaaagagtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattccc 7804609  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
7804608 atcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtattgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 7804512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 20720863 - 20721355
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
20720863 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 20720962  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | |||||| |    
20720963 gttcacaatacaat-atagaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaa-tcaatttgac 20721059  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
20721060 agagttttggcgcttttaaacttgtg----tatctctatcttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 20721154  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
20721155 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 20721254  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
20721255 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 20721354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 35187127 - 35187619
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
35187127 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 35187226  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
35187227 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 35187323  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
35187324 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 35187421  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
35187422 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 35187521  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
35187522 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 35187619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 37885328 - 37885820
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
37885328 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 37885427  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
37885428 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 37885524  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
37885525 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 37885619  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
37885620 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 37885719  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
37885720 ccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtactt 37885819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 5510446 - 5510937
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
5510446 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 5510545  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
5510546 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 5510642  T
322 agagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
5510643 agagttttggcgcttttaaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 5510737  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
5510738 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 5510837  T
517 ctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
5510838 ccatcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 5510937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 5520624 - 5521115
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
5520624 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 5520723  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
5520724 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 5520820  T
322 agagtttgggcgcttttaa-cttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
5520821 agagttttggcgcttttaaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 5520915  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
5520916 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 5521015  T
517 ctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
5521016 ccatcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 5521115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 10098818 - 10099309
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
10098818 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 10098917  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
10098918 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 10099014  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-at-aatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||  ||||||    | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
10099015 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctatgtct---gcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatca 10099110  T
419 gcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
10099111 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcc 10099210  T
518 tatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
10099211 catcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 10099309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 13373151 - 13372663
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
13373151 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 13373052  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
13373051 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 13372955  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
13372954 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctcttta---atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 13372861  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
13372860 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 13372761  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
13372760 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 13372663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 13383745 - 13383257
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
13383745 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 13383646  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
13383645 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 13383549  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
13383548 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctcttta---atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 13383455  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
13383454 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 13383355  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
13383354 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 13383257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 104 - 425
Target Start/End: Original strand, 17006722 - 17007048
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
17006722 tgctcaagcactaaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 17006821  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
17006822 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgaaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagt 17006921  T
300 gcttt-tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||   |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |    
17006922 gctttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtcttgtctcttatgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-a 17007020  T
399 gagagacgttgagatc-ttaagcacgtc 425  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
17007021 gagagacgttgagatctttaagcacgtc 17007048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 12753253 - 12752741
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
12753253 tgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 12753154  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaagactc--tagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
12753153 ttgatatacaatcattggtgttcacaatacaatgcaaatgatagactctttagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 12753054  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc-taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtg 396  Q
    |||||  || |||  |||||| ||||||||| |||||||| || ||||  |   || ||  |   ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
12753053 gcttttatgtgaaacaaatttagcagagttttggcgctttcaaattgttgtctcgtatcacatttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 12752954  T
397 tagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaa 495  Q
     | |||  | |||||||| ||||||||||| | | |||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
12752953 -aaagattcattgagatctttaagcacgtcaataaagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaa 12752855  T
496 ggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagata 594  Q
     |||||  ||||||  |||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||||||    
12752854 tgatcacgttcaaagccattcctattctgaaggaacatttttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagttgtggagata 12752755  T
595 gtggttgtacactt 608  Q
    ||||| ||||||||    
12752754 gtggtcgtacactt 12752741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20684264 - 20683774
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
20684264 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 20684165  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
20684164 gttcacaatacaatgc-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaactcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 20684068  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||  | |||    
20684067 agagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctata---atcttcaagtcttcacttctttatatagaggcgtg-aaagggacgttgagataatcagc 20683972  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
20683971 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 20683872  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
20683871 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 20683774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 5537506 - 5537015
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
5537506 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 5537407  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
5537406 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 5537310  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
5537309 agagttttggcgcttttgaacttatgt--atttctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcag 5537213  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
5537212 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 5537113  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
5537112 atcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 5537015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 8774407 - 8774900
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
8774407 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 8774506  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
8774507 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 8774603  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
8774604 agagttttggcgcttttgaacttgtgtatatttctat-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 8774701  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
8774702 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 8774801  T
520 tcttga-aggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
8774802 tcttgagttgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 8774900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 10627427 - 10626937
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattg--tttgacttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
10627427 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaa-atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtg 10627329  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||| || ||||    
10627328 gtgttctcaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaa-tttg 10627232  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
10627231 acagagttttggcgcttttgaacttgt-atatctctatctact-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 10627135  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||    
10627134 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataataatcttcaaattcattc 10627035  T
517 ctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    | ||||||||||  || | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
10627034 ccatcttgaaggcgcagaatctgcaggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 10626937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 5580119 - 5579627
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
5580119 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 5580020  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
5580019 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 5579923  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | |||||| |    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
5579922 agagttttggcgcttttaaacttgtg----tatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 5579828  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
5579827 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 5579728  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
5579727 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 5579628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 13121412 - 13121904
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
13121412 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 13121511  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
13121512 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 13121608  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
13121609 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 13121706  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    |||||||| |||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
13121707 acgtctaaggagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 13121806  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
13121807 tcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 13121904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 13557324 - 13557816
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
13557324 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 13557423  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
13557424 gttcacaatacaatacagt-acagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 13557520  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | ||| || ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
13557521 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatct-ccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 13557618  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||| |    
13557619 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaactcattccca 13557718  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || ||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
13557719 tcttgaacgtacaaattctgcatgcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttgtacttt 13557816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 14465341 - 14465833
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
14465341 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 14465440  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
14465441 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 14465537  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
14465538 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 14465635  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    |||||||| |||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
14465636 acgtctaaggagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 14465735  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
14465736 tcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14465833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 23757048 - 23757540
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
23757048 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 23757147  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
23757148 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 23757244  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
23757245 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatct-gcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 23757342  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
23757343 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 23757442  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
23757443 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23757540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 23767644 - 23768136
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
23767644 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 23767743  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
23767744 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 23767840  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
23767841 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatct-gcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 23767938  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
23767939 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 23768038  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
23768039 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23768136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24384004 - 24383512
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24384004 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 24383905  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
24383904 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 24383808  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
24383807 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctct-taaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 24383710  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
24383709 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 24383610  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24383609 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24383512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 24659650 - 24660142
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
24659650 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 24659749  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
24659750 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 24659846  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
24659847 agagttttggtgcttttaaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 24659944  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
24659945 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 24660044  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24660045 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24660142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 37866195 - 37866687
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
37866195 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 37866294  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
37866295 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 37866391  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
37866392 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 37866486  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
37866487 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcccgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 37866586  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||    
37866587 ccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagttgaggtagtggttgtacacttgtactt 37866686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 4754075 - 4754564
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
4754075 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 4754174  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
4754175 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 4754271  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | |||||||||||| |  | |||    
4754272 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctctctcta-ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgag-taatcagc 4754368  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |    
4754369 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaat-aacttcaaattcattccca 4754467  T
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4754468 tcttgagtgtacaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4754564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 13394339 - 13393851
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
13394339 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 13394240  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||| ||| |    
13394239 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtactttttagaatcaaa-ttgac 13394143  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
13394142 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatctcttta---atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 13394049  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
13394048 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 13393949  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
13393948 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 13393851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 20673679 - 20673189
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
20673679 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 20673580  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
20673579 gttcacaatacaatgc-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaactcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 20673483  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
20673482 agagttttggcgcttttgaacttatgtatatctctata---atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 20673387  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
20673386 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 20673287  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
20673286 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 20673189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 10655749 - 10655259
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattg--tttgacttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
10655749 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaa-atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtg 10655651  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||| || ||||    
10655650 gtgttctcaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaa-tttg 10655554  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
10655553 acagagttttggcgcttttgaacttgt-atatctctatctact-atcttcaagtcttcaatcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatc 10655457  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
10655456 agcacgtcgaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataatcttcaaattcattc 10655357  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    | ||||||||||  | || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
10655356 ccatcttgaaggcgcaaaatctgcaggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 10655259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 19778135 - 19778627
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19778135 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 19778234  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    ||||||||||||||  ||  | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
19778235 gttcacaatacaat-aaagtacagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 19778331  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
19778332 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 19778429  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
19778430 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaacagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 19778529  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19778530 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19778627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 19788772 - 19789264
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19788772 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 19788871  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
19788872 gttcacaatacaatacagt-acagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 19788968  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | | |    
19788969 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcaac 19789066  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
19789067 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaacagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 19789166  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
19789167 tcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 19789264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 28314718 - 28314225
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattg--tttgacttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
28314718 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa-atacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtg 28314620  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||||| |    
28314619 gtgttcacaatacaatacag-aaaagactctagact-atgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaatt-g 28314523  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
28314522 acagagttttggcgcttttgaacttgtgtatatctctgtttt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatca 28314425  T
419 gcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
28314424 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcc 28314325  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggac-acactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||| | |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
28314324 catcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 28314225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 18483794 - 18484287
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
18483794 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 18483893  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
18483894 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 18483990  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |    || |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
18483991 agagttttggcgcttttgaacttat----atatctctatctaaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 18484085  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
18484086 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 18484185  T
517 ctatcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtact 613  Q
    | |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
18484186 ccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 18484285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 19887834 - 19887348
Alignment:
127 cttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttca 226  Q
    |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
19887834 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttct 19887735  T
227 caatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagt 326  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||    
19887734 caatacaatacgataaa-gactctagactcttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcaggaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagt 19887637  T
327 ttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcac 422  Q
    || ||||||||| |||||||    || |||||| | |   ||||||||||||| ||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||||    
19887636 tttggcgctttttaacttgt----atatctctatctagaatcttcaagtcttcgctcatttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataattagcac 19887542  T
423 gtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatc 521  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| || | ||||||||||||||| |||    
19887541 gtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcgtttgcctgatttgggtgtactactttgaagaattagcttcaaattcattcccatc 19887442  T
522 ttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||    
19887441 ttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggagttagtggttgtacacttgtgcttt 19887348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 38194474 - 38194967
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
38194474 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 38194573  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
38194574 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 38194670  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
38194671 agagttttggcgcttttaaacttatgtatatctctgt-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 38194768  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
38194769 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 38194868  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
38194869 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 38194967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 38205010 - 38205503
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
38205010 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 38205109  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
38205110 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 38205206  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
38205207 agagttttggcgcttttaaacttatgtatatctctgt-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 38205304  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
38205305 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 38205404  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
38205405 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 38205503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 5548090 - 5547599
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
5548090 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 5547991  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
5547990 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 5547894  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    | ||||| ||||||||| ||||| ||   || ||| ||    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
5547893 aaagttttggcgcttttgaacttatgt--atttctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcag 5547797  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
5547796 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 5547697  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | ||||||||| |||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
5547696 atcttgagtgtacaattctgtaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 5547599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Original strand, 15832936 - 15833442
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
15832936 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 15833035  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||  ||| ||||    
15833036 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacaccgattttctaagt 15833135  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc--taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgt 395  Q
    |||||  || |||  ||| || | ||||||||||||||||| ||||||     ||||||      |||||||||||||||||| | |||||||| | |||    
15833136 gcttttatgtgaaacaaaattagtagagtttgggcgctttttacttgt-----tgtctcatgtttgatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgt 15833230  T
396 gtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatga 494  Q
    | | | || |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
15833231 g-aaatagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgacaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatga 15833329  T
495 aggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagat 593  Q
    |||||||  |||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |   || || |||||| |    
15833330 aggatcacgttcaaatcaattccta--ttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggt 15833427  T
594 agtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||    
15833428 agtggttgtacactt 15833442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6221187 - 6220695
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
6221187 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 6221088  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
6221087 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 6220991  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| || || ||    | ||||||      ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
6220990 agagttttggcgcttttgaatttatg----tatctctatgtataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 6220896  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
6220895 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 6220796  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
6220795 ccatcttgaacgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 6220696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 24670230 - 24670722
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
24670230 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatataatcagtggt 24670329  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |    
24670330 gttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaa-ttgac 24670426  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||    | | ||||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
24670427 agagttttggtgcttttaaacttatgtatctctatcta-aaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagc 24670524  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
24670525 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccca 24670624  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
24670625 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 24670722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 14475971 - 14476465
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
14475971 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 14476070  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
14476071 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 14476167  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct--taa 418  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | |||||||||||||| |  | |    
14476168 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagatataatca 14476265  T
419 gcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||| |||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
14476266 gcacgtctaaggagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcc 14476365  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  |||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
14476366 catcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagtgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14476465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 608
Target Start/End: Original strand, 51340557 - 51341049
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
51340557 agagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtgg 51340656  T
221 tgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt--tgagaattaaa 315  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   || |||||| |||||||||  || |||  |||    
51340657 tgttcacaatacaatgcaaatgagagactctctagactttagaatttctaagatatatcaaatgaacacaaaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaa 51340756  T
316 tttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc- 414  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |   || |||    ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | |||  ||||||||||     
51340757 tttagcagagttttggcgcttttaatttgttgtctcgtgtct-tttatcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagattcgttgagatct 51340854  T
415 ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcat 514  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||| |||    
51340855 ttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtactatgaaggatcacgttcaaatccat 51340954  T
515 tcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||| ||||||||    
51340955 tcctattctgaaggaacatttctgcgggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 51341049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 11272869 - 11272376
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
11272869 agagacttctaatgctcaagcactcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 11272770  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
11272769 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 11272673  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || | | |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
11272672 agagttttggcgcttttgaacttatgtatatctatgt-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggggtg-aaagagacgttgagataatcagc 11272575  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
11272574 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 11272475  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
11272474 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 11272376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 45862306 - 45861983
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || |||||||||||     
45862306 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactgcacctagtatgagacttca-aattgctcaagcaca 45862209  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaat 214  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
45862208 caagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattatacagaaaattgtttgagtttgaacacttaatatacaat 45862109  T
215 caatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt--tgagaat 311  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||  || |||     
45862108 cagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctatacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaa 45862009  T
312 taaatttggcagagtttgggcgcttt 337  Q
     |||||| ||||||||||||||||||    
45862008 caaatttagcagagtttgggcgcttt 45861983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12287465 - 12286972
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
12287465 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtgg 12287366  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |     
12287365 tgttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-ga 12287269  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
12287268 cagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctcttaa-atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 12287171  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
12287170 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 12287071  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12287070 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12286972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 100 - 574
Target Start/End: Original strand, 17961071 - 17961551
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcc--aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttg 197  Q
    |||||||||||||||  | || |||||||||   |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || || | ||||| | ||| ||||||    
17961071 caaatgctcaagcactaaagcaagagacttctcaaatgctcaagcacacaggcaagagacttctattcaaacaaaaatataaagaaattggttggacttg 17961170  T
198 aacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctaga--cttaagaa-tttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattc 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||| ||||||||||| | ||||| |   | |||||||    
17961171 aacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctctaagcttaagaaatttctaagataga-caaatgaacactgaaattc 17961269  T
295 aaagtgcttttgagaatta-aatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccga-tcttcaagtcttcacttcctt-atatagtg 391  Q
     ||| ||||||| ||| |  || ||| |||||||| |||||||| || || ||||   |||||| |  | |||||||| |||||||||||| |||||| |    
17961270 taagagcttttgtgaaatgcaaattgacagagttttggcgctttcaaattttgatg--gtctcttcttaatcttcaagacttcacttcctttatatagag 17961367  T
392 gtgtgtagagagacgttgagatcttaa-gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcct 490  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| || ||||||    
17961368 gtgagtagaaagacgttgagagctttttgcacttcaatagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtgatctgttgcctgatttggatgcagtcct 17961467  T
491 atgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca 574  Q
     || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
17961468 ttgcataatcaacttcaaattcattgctatcttgaaggaacaaatctgcaggcagagctgttttcttgtcttgtagcgcggaca 17961551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 23647499 - 23647990
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
23647499 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 23647598  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
23647599 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 23647695  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | | |||| | ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
23647696 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctatcta-caatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 23647792  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||| |    
23647793 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcatttgaagaataagcttcaaattcattccca 23647892  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
23647893 tcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23647990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 28325332 - 28324841
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaatt--gtttgacttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
28325332 agagacttctaatgctcaagcac--aggcaagagacttctaatcaaaca-aaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtg 28325236  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| |||    
28325235 gtgttcacaatacaatac-agaaaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttg 28325139  T
320 gcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
28325138 acagagttttggcgcttttgaacttgtgtatatctctgt-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatca 28325041  T
419 gcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
28325040 gcacgtttaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcc 28324941  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggac-acactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||| | |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
28324940 catcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 28324841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 242 - 615
Target Start/End: Original strand, 4456784 - 4457156
Alignment:
242 aaagactctagacttaa-gaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-a 339  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |    
4456784 aaagactctagactttgtgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-gacagagttttggcgcttttta 4456882  T
340 acttgtgataatgtctctaccga---tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgt 436  Q
    ||||||    || |||||| | |   |||||||||||||||| | |||||||  || ||| | |||||| |||||||    |||||||||||||||| ||    
4456883 acttgt----atctctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatataggcgtgaa-agagacattgagatgaatagcacgtctaaagagttgt 4456977  T
437 tgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattc 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
4456978 tgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaacatttc 4457077  T
537 tgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
4457078 tgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 4457156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 544
Target Start/End: Original strand, 16385825 - 16386243
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
16385825 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 16385924  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
16385925 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 16386021  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-ataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||    ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||||  | ||||||||||||||  | ||    
16386022 agagttttggcgcttttaaacttatgtatctcctctgta---atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgt-aaaagagacgttgagataatcag 16386117  T
420 cacgtctaaagagtcgt-tgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| || |  ||||||||||||||     
16386118 cacgtctaaagagtcgtatgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagattcaaattcattccc 16386217  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
16386218 atcttgaaggaacatttctgcaggca 16386243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12297287 - 12296794
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
12297287 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatacaatcagtgg 12297188  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |     
12297187 tgttcacaatacaatacag-aaaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-ga 12297091  T
321 cagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
12297090 cagagttttggcgcttttgaacttatgtatctctctcttaa-atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 12296993  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
12296992 cacgtctaaagaggcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 12296893  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12296892 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12296794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 13131654 - 13132147
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
13131654 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 13131753  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
13131754 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 13131850  T
322 agagtttgggcgctt-ttaacttgtgataatg-tctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||| | | ||  || |   | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
13131851 agagttttggcgcttctgacctaatgtttcggctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 13131948  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    ||||||||| |||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
13131949 cacgtctaaggagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 13132048  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
13132049 atcttgagtgaacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 13132147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 189 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17910420 - 17909996
Alignment:
189 tttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcag 288  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
17910420 tttgatttgaacacttgatatgcaatcagtggtgttcacactacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcag 17910322  T
289 aaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttata 386  Q
    |||||||  |||||||  ||||| ||||| |  ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||| | ||| ||||||||||||||||| | |||||    
17910321 aaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gatagagttttggcgctttttaacttgt-ata-tatctatcaccaatcttcaagtcttcactcctttata 17910225  T
387 tagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgta 485  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||     
17910224 tagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatccttttcctgatttgggtgtt 17910126  T
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaagg-aacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||| | | | || ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| ||    
17910125 gtccttttaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcataaattctgcaggcatagatgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagt 17910027  T
585 cgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||    
17910026 agtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 17909996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6181013 - 6180521
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
6181013 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtggt 6180914  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
6180913 gttcacaatacaatacagt-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 6180817  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| || || ||    | ||||||      ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |     
6180816 agagttttggcgcttttgaatttatg----tatctctatgtataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatc 6180722  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
6180721 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccaatgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 6180622  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | || |||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
6180621 ccatcttgaacgtacaaattatgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 6180522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 39371803 - 39372296
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
39371803 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 39371902  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
39371903 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 39371999  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| |||||||||  | || ||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
39372000 agagttttggcgcttttgtatttatgtatatctctgt-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 39372097  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
39372098 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 39372197  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
39372198 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 39372296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 39382440 - 39382933
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
39382440 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 39382539  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||| ||| |    
39382540 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagac-tatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaa-ttgac 39382636  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| |||||||||  | || ||   || ||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
39382637 agagttttggcgcttttgtatttatgtatatctctgt-tttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcagc 39382734  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
39382735 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccca 39382834  T
520 tcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
39382835 tcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 39382933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 416
Target Start/End: Original strand, 37412048 - 37412450
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || |||||||||||     
37412048 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcaca 37412145  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaat 214  Q
    || || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
37412146 caagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaaacaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaat 37412245  T
215 caatggtgttcacaatacaatgcaataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt--tgagaa 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| |||||  || |||    
37412246 cagcggtgttcacaatacaatgcagtgaaggactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagagctttgatgtgaa 37412345  T
311 ttaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc-taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttg 409  Q
      || ||   |||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||| | ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | | ||||||||    
37412346 acaatttcaacagagttttggcgcttttaaattgttgtaa-gtcacttaatgatcttcaggtcttcactcctttatatagtggtgtg-aaaaagacgttg 37412443  T
410 agatctt 416  Q
    |||||||    
37412444 agatctt 37412450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 400 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 18851901 - 18851686
Alignment:
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||    
18851901 agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttaaagaat 18851802  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||    
18851801 tagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattttgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 18851702  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    |||| |||||||||||    
18851701 tgtatacttgtacttt 18851686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11909672 - 11909467
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaacac 202  Q
    ||||||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
11909672 tgctcaagcccacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtgtgaacac 11909573  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
11909572 ttgatatacaatcagtggtgttcacaacacaatgcaattgaaagactctctaaacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 11909473  T
300 gctttt 305  Q
    ||||||    
11909472 gctttt 11909467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 2245993 - 2246124
Alignment:
31 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
2245993 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctcaagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 2246092  T
131 caatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
2246093 caatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 2246124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 280
Target Start/End: Original strand, 15848729 - 15848910
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
15848729 atgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaaca 15848828  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaat 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15848829 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaat 15848910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 442 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 16666294 - 16666121
Alignment:
442 tcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcag 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
16666294 tcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcacatcttgaaggaacaattctgcag 16666195  T
542 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
16666194 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 16666121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 51989768 - 51989627
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
51989768 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcatacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacacag 51989669  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
51989668 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 51989627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13199864 - 13199722
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
13199864 ccttgcacttccaaggagatttccactaa-aaataatcacacagattacaaatgcttaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 13199766  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13199765 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 13199722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 338
Target Start/End: Original strand, 13953791 - 13954022
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
13953791 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacac 13953890  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||      ||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||    
13953891 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactc------taataatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgc 13953984  T
302 -ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt 338  Q
     ||||| |||  |||   ||||||||||||||||||||    
13953985 tttttgtgaaacaaaaaaggcagagtttgggcgctttt 13954022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31114609 - 31114468
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
31114609 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcaataatgctcaagcacgcag 31114510  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
31114509 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 31114468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 41045154 - 41045297
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
41045154 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaagcacgc 41045253  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
41045254 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 41045297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15663355 - 15663212
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
15663355 ccttgcactttcaaggagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 15663256  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
15663255 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 15663212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15651720 - 15651577
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
15651720 ccttgcacttccaaggagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgtag 15651621  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
15651620 gcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttcta 15651577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 21735785 - 21735896
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21735785 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 21735884  T
119 gcgagagacttc 130  Q
    || |||||||||    
21735885 gcaagagacttc 21735896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 17006606 - 17006749
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
17006606 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 17006704  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 161  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
17006705 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttct 17006749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17282050 - 17281910
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
17282050 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgca 17281955  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17281954 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 17281910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 22150658 - 22150800
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22150658 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 22150756  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
22150757 aggaaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 22150800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29934176 - 29934036
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
29934176 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgca 29934081  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
29934080 ggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 29934036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29983330 - 29983190
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
29983330 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgca 29983235  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
29983234 ggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 29983190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 122 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14322177 - 14321962
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||  ||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
14322177 agagtcttctaatgctcaagcacgtaggctagaggcttctgttcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgaccttgaacacttgatatacaatcagtgg 14322079  T
221 tgttcacaa-tacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttg 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||    
14322078 tgttcacaaatacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagagcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaa-ttg 14321981  T
320 gcagagtttgggcgctttt 338  Q
     |||||||| |||||||||    
14321980 acagagttttggcgctttt 14321962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 1053327 - 1053468
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
1053327 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 1053422  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
1053423 aggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 1053468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 1063756 - 1063897
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
1063756 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 1063851  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
1063852 aggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 1063897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 16076547 - 16076688
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
16076547 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 16076642  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16076643 aggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 16076688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29906797 - 29906657
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
29906797 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgca 29906702  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
29906701 ggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttcta 29906657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29947962 - 29947822
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
29947962 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgca 29947867  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
29947866 ggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttcta 29947822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29997116 - 29996976
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
29997116 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgca 29997021  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
29997020 ggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttcta 29996976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 444 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 16391780 - 16391608
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcagg 542  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || | ||||| || | ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||    
16391780 ctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtactcatttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagggtacacattctgcagg 16391681  T
543 cagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    || ||||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
16391680 catagctgttgttttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtatacttgtacttt 16391608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 16032139 - 16032252
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
16032139 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 16032238  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
16032239 tgttcacaatacaa 16032252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 608
Target Start/End: Original strand, 15850799 - 15851048
Alignment:
361 gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccacca 459  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | |||| | |||| | |||||||||| || |||||| | |||||||||| |   | |||||||  |||||    
15850799 gatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaa-agagtcattgagatctttaaccacgtcaatagagtcgttgtgacaccttgatcaatcacca 15850897  T
460 gtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagct-gttatcttg 558  Q
     | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||    
15850898 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctggaggcagagctatttttcttg 15850997  T
559 tcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg-ttgtacactt 608  Q
    ||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||| ||||||||||    
15850998 tcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtttgtacactt 15851048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16671751 - 16671637
Alignment:
50 aataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttccc-aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
16671751 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctctaaatgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 16671652  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
16671651 agcaagagtcttcta 16671637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 14580753 - 14580897
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaaga-aataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
14580753 ccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctcacagattacaactgctcaatactttcaagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgca 14580852  T
118 ggcgagagact--tccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||| |||||||  || |||||||||||||  | ||||||||||||    
14580853 ggcaagagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 14580897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 27883002 - 27883135
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
27883002 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 27883096  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
27883097 aggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagag 27883135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 52919978 - 52920091
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
52919978 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 52920077  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
52920078 tgttcacaatacaa 52920091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12963701 - 12963586
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
12963701 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 12963602  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
12963601 ggtgttcacaatacaa 12963586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 501 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 15216448 - 15216334
Alignment:
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||||    
15216448 aacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 15216349  T
601 gtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||    
15216348 gtacacttgtacttt 15216334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17239539 - 17239383
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
17239539 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 17239440  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    || |||||||||||||  ||   | |||||||  |||||| ||||||||||||||||    
17239439 ggcgttcacaatacaaatcagatacagactcttaagactttagaatttctaagatat 17239383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 17697161 - 17697274
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||    
17697161 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaaaaaaattgtttgaggttgaacacttaatatacaatcagtgg 17697260  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
17697261 tgttcacaatacaa 17697274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 362 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 45861941 - 45861733
Alignment:
362 atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt-aagcacgtctaa-agagtcgttgagttcctttgatcatccacca 459  Q
    ||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||     |||||||  |||||    
45861941 atctttaagtcttgactcctttatatagaggtgtgaa-agagtcgttgagatctttaagcacgtcaaatagagtcgttcagaaatcttgatcaatcacca 45861843  T
460 gtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttg 558  Q
     | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || | |||    
45861842 atgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctgaaggaacatttctgcaggcagagctgttttttttg 45861743  T
559 tcttgtagcg 568  Q
    ||||||||||    
45861742 tcttgtagcg 45861733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8874735 - 8874580
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||    
8874735 agagacttctaatgcttaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagattgaacacttgatatacaataagtg 8874636  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    |||||||||||||||  |||  | |||||||  |||||  ||||||||||||||||    
8874635 gtgttcacaatacaaatcaaatacagactcttaagactctagaatttctaagatat 8874580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 503 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12567376 - 12567264
Alignment:
503 cttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgt 602  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || ||| || ||||||||||    
12567376 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgt 12567277  T
603 acacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||    
12567276 acacttgtacttt 12567264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Original strand, 12967854 - 12967965
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||    
12967854 agacttccaattctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttcatatacaatcagtggtg 12967953  T
223 ttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||    
12967954 ttcacaatacaa 12967965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8996572 - 8996439
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
8996572 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 8996478  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 155  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
8996477 aggcaagagttttccaatgctcaagcactaaagcaagag 8996439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11206559 - 11206411
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| ||| |||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
11206559 agagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 11206460  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagat 271  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
11206459 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagacttttgaatttctaagat 11206411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 15832820 - 15832962
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||    
15832820 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacg 15832917  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
15832918 caggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 15832962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 2025629 - 2025744
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
2025629 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctcaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 2025728  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
2025729 ggtgttcacaatacaa 2025744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21606272 - 21606157
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
21606272 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 21606173  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
21606172 ggtgttcacaatacaa 21606157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 13698891 - 13699026
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattg-tttgacttga 198  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || |  ||||    
13698891 caaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaacacaattacacagaaaaatgattggggttga 13698990  T
199 acacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
13698991 acacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13699026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Original strand, 40799439 - 40799594
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
40799439 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 40799537  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    ||||||||||||||||  ||  || |||||||  |||||  ||||||||||||||||    
40799538 ggtgttcacaatacaaatcagaaacagactcttaagactctagaatttctaagatat 40799594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 49554117 - 49554003
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||  |    
49554117 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatttacaatcagcg 49554018  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
49554017 gtgttcacaatacaa 49554003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 273
Target Start/End: Original strand, 50299787 - 50299931
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
50299787 tgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 50299886  T
231 acaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    | ||  |||  | |||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
50299887 ataaatcaaatatagactctaaagactttagaatttctaatatat 50299931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9007124 - 9006991
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
9007124 ccttgcacttccaaggagattt-cact----aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctgagtatgagacttctcaaaatgctcaagcatgc 9007030  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 155  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
9007029 aggcaagagtcttccaatgctcaagctctaaagcaagag 9006991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 14007109 - 14007221
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  |     
14007109 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaa-tgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagggc 14007207  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
14007208 tgttcacaatacaa 14007221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29952052 - 29951939
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
29952052 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaaaagacttctattcaaacaaaattagaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 29951953  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
29951952 tgttcacaatacaa 29951939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30001206 - 30001093
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
30001206 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaaaagacttctattcaaacaaaattagaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 30001107  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
30001106 tgttcacaatacaa 30001093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 49989673 - 49989815
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||    
49989673 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaattgctcaatactgcacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacg 49989770  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
49989771 caggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 49989815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 6090271 - 6090386
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
6090271 agagacttctaatgctcaagcacaactacaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttcatatacaatcaat 6090370  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
6090371 ggtgttcacaatacaa 6090386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8729621 - 8729489
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||    
8729621 atgctcaagcactgacgcaagagacttcttatgttcaagcacaaaagtaagagacttctaaacaaacacaattacacagaaatatgtttgaggttgaaca 8729522  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
8729521 cttgatatataatcagtggtgttcacaatacaa 8729489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9081508 - 9081376
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||    
9081508 atgctcaagcactgacgcaagagacttcttatgttcaagcacaaaagtaagagacttctaaacaaacacaattacacagaaatatgtttgaggttgaaca 9081409  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
9081408 cttgatatataatcagtggtgttcacaatacaa 9081376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 13947879 - 13947994
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |    
13947879 agagacttctaatgttcaagcacaactgcaagagacttataaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacagtcagt 13947978  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
13947979 ggtgttcacaatacaa 13947994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30054798 - 30054683
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
30054798 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacaaaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 30054699  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
30054698 ggtgttcacaatacaa 30054683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4175345 - 4175232
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
4175345 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 4175247  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
4175246 agcaagagacttcta 4175232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5537609 - 5537496
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
5537609 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 5537511  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
5537510 agcaagagacttcta 5537496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5548193 - 5548080
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
5548193 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 5548095  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
5548094 agcaagagacttcta 5548080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6181116 - 6181003
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
6181116 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 6181018  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
6181017 agcaagagacttcta 6181003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6221290 - 6221177
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
6221290 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 6221192  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
6221191 agcaagagacttcta 6221177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 13121309 - 13121422
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
13121309 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 13121407  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
13121408 agcaagagacttcta 13121422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 13131551 - 13131664
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
13131551 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 13131649  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
13131650 agcaagagacttcta 13131664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 13557221 - 13557334
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
13557221 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 13557319  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
13557320 agcaagagacttcta 13557334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 14475868 - 14475981
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
14475868 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 14475966  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
14475967 agcaagagacttcta 14475981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 19778032 - 19778145
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
19778032 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 19778130  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
19778131 agcaagagacttcta 19778145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 19788669 - 19788782
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
19788669 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 19788767  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
19788768 agcaagagacttcta 19788782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 23756945 - 23757058
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
23756945 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 23757043  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
23757044 agcaagagacttcta 23757058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 23767541 - 23767654
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
23767541 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 23767639  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
23767640 agcaagagacttcta 23767654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 37866092 - 37866205
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
37866092 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 37866190  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
37866191 agcaagagacttcta 37866205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 37885225 - 37885338
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
37885225 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 37885323  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
37885324 agcaagagacttcta 37885338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39673471 - 39673358
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
39673471 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 39673373  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
39673372 agcaagagacttcta 39673358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Original strand, 41494543 - 41494654
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtg 222  Q
    |||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
41494543 agacttcttatgctcaagcacaaatgcaagagacttctatttaaacataattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtg 41494642  T
223 ttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||    
41494643 ttcacaatacaa 41494654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 2784606 - 2784722
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac--ttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||     
2784606 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagtttgaacacttgatatacaatcag 2784705  T
218 tggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| |||||||    
2784706 tggtgttcataatacaa 2784722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8740714 - 8740601
Alignment:
50 aataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
8740714 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 8740616  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
8740615 agcaagagtcttcta 8740601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 519 - 608
Target Start/End: Original strand, 17021975 - 17022065
Alignment:
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtt-atcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
17021975 atcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 17022065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Original strand, 22140306 - 22140461
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| || |||||| || |||||||||||||||||||| |    
22140306 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaatat-gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 22140404  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    ||||||||||||||||  ||   | |||||||  ||||| |||||||||||||||||    
22140405 ggtgttcacaatacaaatcagatacagactctaaagactcaagaatttctaagatat 22140461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Original strand, 4433509 - 4433622
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
4433509 agagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttcatatacaatcagtggt 4433608  T
222 gttcacaatacaat 235  Q
    ||||||||||||||    
4433609 gttcacaatacaat 4433622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 12396611 - 12396724
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||| | |||    
12396611 agagacttcatatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattatttgaggttgagcacttgaaatacaataagtgg 12396710  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
12396711 tgttcacaatacaa 12396724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 14072242 - 14072354
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||| | |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| |||    
14072242 agagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttatattcaaacaaaaatacata-aaaaatgtttgaggttgaaaacttgatatacaatcagtgg 14072340  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
14072341 tgttcacaatacaa 14072354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14077934 - 14077822
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||  |  |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
14077934 agagacttcctatgctcaagcataactgcaaaagacttctactcaaacaaaattacaaagaaaat-gtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 14077836  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
14077835 tgttcacaatacaa 14077822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15961245 - 15961132
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||  |  |||||| |||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||    
15961245 agagacttcctatgctcaagcaaaactgcaagaaacttttattcaaacagaattacaaagaaaaatgttggaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 15961146  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
15961145 tgttcacaatacaa 15961132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 23647395 - 23647509
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
23647395 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 23647493  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
23647494 aagcaagagacttcta 23647509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26418291 - 26418178
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||  |||||||| | ||||||||||| |||    
26418291 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacaaaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacctaatatacaatcagtgg 26418192  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
26418191 tgttcacaatacaa 26418178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 230
Target Start/End: Original strand, 31302899 - 31302999
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaa 229  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31302899 atgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaa 31302998  T
230 t 230  Q
    |    
31302999 t 31302999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 11223105 - 11223220
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |    
11223105 agagacttctaatggtcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaataagt 11223204  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
11223205 ggtgttcacaatacaa 11223220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 13823607 - 13823722
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||   |    
13823607 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatatgt 13823706  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
13823707 ggtgttcacaatacaa 13823722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 15848597 - 15848695
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
15848597 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactt 15848695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 15902738 - 15902853
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
15902738 agagacttctaatgctcaagcacaattgcaagagacttccaaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 15902837  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
15902838 ggtgttcacaatacaa 15902853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18857548 - 18857426
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |    
18857548 ccttgcacttctaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacac 18857455  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||    
18857454 aggcaagagtcttccaatgctcaagcact 18857426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 20645696 - 20645811
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| | |    
20645696 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaattatttgaggttgaacacttgatatacaattagt 20645795  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
20645796 ggtgttcataatacaa 20645811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 21640420 - 21640523
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
21640420 tgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaatattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 21640519  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
21640520 acaa 21640523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 28581647 - 28581761
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
28581647 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacataattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 28581745  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
28581746 ggtgttcacaatacaa 28581761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38178261 - 38178147
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
38178261 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttacttcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 38178163  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
38178162 ggtgttcacaatacaa 38178147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 40850518 - 40850633
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | |||||||| || |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
40850518 agagacttctattgctcaagtacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 40850617  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
40850618 ggtgttcacaatacaa 40850633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46796984 - 46796870
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
46796984 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 46796886  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
46796885 ggtgttcacaatacaa 46796870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47406040 - 47405925
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |    
47406040 agagacttctaatgctcaagcacaactgcgagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatatttgagattgaacacttgatatacaatcagt 47405941  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
47405940 ggtgttcacaatacaa 47405925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 160
Target Start/End: Original strand, 4403920 - 4404030
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
4403920 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 4404018  T
149 gcaagagacttc 160  Q
    ||||||| ||||    
4404019 gcaagagtcttc 4404030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 160
Target Start/End: Original strand, 4433407 - 4433517
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
4433407 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 4433505  T
149 gcaagagacttc 160  Q
    ||||||| ||||    
4433506 gcaagagtcttc 4433517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5580224 - 5580109
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
5580224 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 5580125  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
5580124 -aagcaagagacttcta 5580109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5628608 - 5628493
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
5628608 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 5628509  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
5628508 -aagcaagagacttcta 5628493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6490937 - 6490824
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
6490937 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 6490839  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
6490838 agcaagagacttcta 6490824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6501591 - 6501478
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
6501591 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 6501493  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
6501492 agcaagagacttcta 6501478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9994481 - 9994368
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9994481 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9994383  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9994382 agcaagagacttcta 9994368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10627530 - 10627417
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
10627530 ataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 10627432  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
10627431 agcaagagacttcta 10627417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11272974 - 11272859
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
11272974 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 11272875  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
11272874 -aagcaagagacttcta 11272859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12250027 - 12249914
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
12250027 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 12249929  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
12249928 agcaagagacttcta 12249914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12297392 - 12297277
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
12297392 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 12297293  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
12297292 -aagcaagagacttcta 12297277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13262261 - 13262148
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
13262261 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 13262163  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
13262162 agcaagagtcttcta 13262148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14258482 - 14258416
Alignment:
189 tttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagactt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
14258482 tttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt 14258416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 16879560 - 16879673
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga--cttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| ||||| ||    
16879560 agagagttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacacaattacaca-aaaaatgtttgaggtttgaacacttgatataaaatcagtg 16879658  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
16879659 gtgttcacaatacaa 16879673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20684366 - 20684254
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
20684366 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 20684269  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
20684268 agcaagagacttcta 20684254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 23635356 - 23635469
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
23635356 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 23635454  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
23635455 agcaagagacttcta 23635469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7833231 - 7833129
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||| ||||||| || |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
7833231 atgcacaagcacaaatgcaagatacttctaaacaaacaaaattacacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaata 7833132  T
232 caa 234  Q
    |||    
7833131 caa 7833129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Original strand, 16881813 - 16881945
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac--ttgaac 200  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||   | ||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||    
16881813 atgctcaagcacaaacgcaagagacttcctatgttgaagcacaaaaacaagagacttctaaagagacacaattacacagaaaat-gtttgagatttgaac 16881911  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
16881912 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 16881945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22804639 - 22804523
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag---tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||    ||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||     
22804639 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaaattcaaacagaattactaagaaatttgtttgaggttgaacatttgatatacaatcag 22804540  T
218 tggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||    
22804539 tggtgttcacaatacaa 22804523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 49643378 - 49643222
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |    
49643378 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcggt 49643279  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    ||||||||||||||||  |||  | |||||||  |||||  ||||||||||||||||    
49643278 ggtgttcacaatacaaatcaaatacagactcttaagactctagaatttctaagatat 49643222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Original strand, 6174884 - 6174993
Alignment:
126 acttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgtt 224  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
6174884 acttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaatagaattacaaagaaagatgtttaaggttgaagacttgatatacaatcagtggtgtt 6174983  T
225 cacaatacaa 234  Q
    ||||||||||    
6174984 cacaatacaa 6174993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 11163477 - 11163589
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||    
11163477 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 11163575  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
11163576 gcaagagtcttcta 11163589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19198493 - 19198381
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||| |||    
19198493 agagaattcctatgctcaagcacaaaagcaatagacttatattcaaacagaattacaaagaaaa-tgtatgaggttgaacatttgatatacaatcagtgg 19198395  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    |||| |||||||||    
19198394 tgtttacaatacaa 19198381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 20724632 - 20724745
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||| | ||||||| ||||| |||    
20724632 agagacttcctatgctcaagcacacaagcaagatacttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacgcctgatatataatcagtgg 20724731  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| |||||||    
20724732 tgttcataatacaa 20724745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24707144 - 24707030
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
24707144 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 24707046  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||| |||||    
24707045 aagcaagagatttcta 24707030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 47405707 - 47405542
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||  | |||||||    
47405707 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctttgcaggc 47405608  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||  || |||||| ||||||||||||||||    
47405607 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 47405542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1728633 - 1728518
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |  ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
1728633 agagacttctattgctcaagcaaaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 1728534  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
1728533 ggtgttcacaatacaa 1728518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 5213120 - 5213234
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
5213120 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctcaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 5213218  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
     |||||||||||||||    
5213219 agtgttcacaatacaa 5213234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9700655 - 9700540
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |    
9700655 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacaaaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatttgt 9700556  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
9700555 ggtgttcacaatacaa 9700540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 10851354 - 10851461
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||    
10851354 agagacttcctatcctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaa-tgtttcaggttgaacacttgatatacaatcagcgg 10851452  T
221 tgttcacaa 229  Q
    |||||||||    
10851453 tgttcacaa 10851461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14393620 - 14393505
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |    
14393620 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacataattacacataaaatcgtttgaggttgaacacttgatatacaattagt 14393521  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
14393520 ggtgttcataatacaa 14393505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 14954983 - 14955085
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| || |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
14954983 tgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaatat-gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 14955081  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
14955082 acaa 14955085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20628050 - 20627936
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |    
20628050 agagaattctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaattagt 20627952  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
20627951 ggtgttcacaatacaa 20627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21638849 - 21638746
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||  | |||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
21638849 tgctcaaacacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattgcaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 21638750  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
21638749 acaa 21638746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23538778 - 23538666
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||||||| |  ||    
23538778 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaatagaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacctgatatacaataagcgg 23538679  T
221 tgttcacaataca 233  Q
    |||||||||||||    
23538678 tgttcacaataca 23538666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 52283273 - 52283387
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
52283273 agagacttcaaatgctcaagcacaactgcaaaagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 52283372  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
     |||||||||||||||    
52283373 -gtgttcacaatacaa 52283387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #259
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 53057347 - 53057232
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| |    
53057347 agagacttctaatgctcaggcacaattgcaagagacttcttaattcaaacataattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacagtcagt 53057248  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
53057247 ggtgttcacaatacaa 53057232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #260
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1795072 - 1794959
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
1795072 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 1794974  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
1794973 agcaagagtcttcta 1794959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #261
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 5510342 - 5510456
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
5510342 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 5510440  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
5510441 -aagcaagagacttcta 5510456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #262
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 5520520 - 5520634
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
5520520 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 5520618  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
5520619 -aagcaagagacttcta 5520634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #263
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5866286 - 5866171
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
5866286 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 5866187  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
5866186 -aagcaagagacttcta 5866171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #264
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5876885 - 5876770
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
5876885 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 5876786  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
5876785 -aagcaagagacttcta 5876770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #265
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 8774303 - 8774417
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
8774303 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 8774401  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
8774402 -aagcaagagacttcta 8774417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #266
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9391792 - 9391679
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| |    
9391792 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcccatgctcaagcact-a 9391694  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
9391693 agcaagagtcttcta 9391679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #267
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9982473 - 9982360
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9982473 ataatcataaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9982375  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
9982374 agcaagagacttcta 9982360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #268
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 10098714 - 10098828
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
10098714 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10098812  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
10098813 -aagcaagagacttcta 10098828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #269
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10655852 - 10655739
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
10655852 ataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 10655754  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
10655753 agcaagagacttcta 10655739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #270
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11217313 - 11217200
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
11217313 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcactcacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 11217215  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
11217214 agcaagagtcttcta 11217200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #271
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12238201 - 12238088
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||  |||||||| || || || |||| ||||||||||||||||||| |    
12238201 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagaacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 12238103  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
12238102 agcaagagacttcta 12238088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #272
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12287570 - 12287455
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
12287570 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 12287471  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     || |||||||||||||    
12287470 -aaccaagagacttcta 12287455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #273
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13373256 - 13373141
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
13373256 ataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 13373157  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
13373156 -aagcaagagacttcta 13373141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #274
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13394444 - 13394329
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
13394444 ataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 13394345  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
13394344 -aagcaagagacttcta 13394329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #275
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 520 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 14321771 - 14321676
Alignment:
520 tcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
14321771 tcttgaaggaacatttctgcaggaagagttgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14321676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #276
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 20720758 - 20720873
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
20720758 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 20720857  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
20720858 -aagcaagagacttcta 20720873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #277
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24384109 - 24383994
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
24384109 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24384010  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
24384009 -aagcaagagacttcta 24383994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #278
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28314822 - 28314708
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
28314822 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 28314724  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
28314723 -aagcaagagacttcta 28314708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #279
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28325436 - 28325322
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
28325436 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 28325338  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
28325337 -aagcaagagacttcta 28325322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #280
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29472653 - 29472540
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
29472653 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 29472555  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
29472554 agcaagagtcttcta 29472540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #281
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 37759316 - 37759429
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
37759316 ataatcacaaagattacaactcctcaatactttctaagtgtgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 37759414  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
37759415 agcaagagacttcta 37759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #282
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 38194370 - 38194484
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
38194370 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 38194468  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
38194469 -aagcaagagacttcta 38194484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #283
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 38204906 - 38205020
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
38204906 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 38205004  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
38205005 -aagcaagagacttcta 38205020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #284
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 39382336 - 39382450
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
39382336 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 39382434  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
39382435 -aagcaagagacttcta 39382450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #285
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 48336888 - 48337001
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
48336888 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 48336986  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
48336987 agcaagagtcttcta 48337001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #286
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 363 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 11909393 - 11909188
Alignment:
363 tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagt 461  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | |||| |||||||||||| |||||| || | |||||||||  |     |||||||  ||||| |    
11909393 tctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagtcgttgagatctttaagcacatcaatagagtcgttctgaaaacttgatcaatcaccaat 11909295  T
462 aatcttttgtctgatttgggt-gtagtcctatgaaggatcaac-ttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttg 558  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
11909294 gatcttttgcctaatttgggttgttgtcctatgaaggatcaaagttcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttg 11909195  T
559 tcttgta 565  Q
    |||||||    
11909194 tcttgta 11909188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #287
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13410681 - 13410549
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac--ttgaac 200  Q
    ||||||||||||  | || ||||  |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||   |||||| ||||||||| ||||| ||||||   ||||||    
13410681 atgctcaagcacaaacgcaagagttttcctatgctcaagcacaagagcaagaaacttctgaacaaacacaattacacaaaaaat-gtttgaggtttgaac 13410583  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
13410582 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 13410549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #288
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14258653 - 14258555
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
14258653 ataatcacaaagattacaaatgctgaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 14258555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #289
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16305749 - 16305651
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| || |||| |||||  ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
16305749 aatgctgaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaaactacagagaaagatgtttggtttgaacaattaatatacaatcaatggtgttcacaat 16305651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #290
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 27849710 - 27849843
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||   |||||  ||| |    
27849710 caaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgcttaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaaca-aattacacataaataagtttggtttgga 27849808  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
27849809 cacttgatatacaatcagtggtgttaacaatacaa 27849843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #291
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46350463 - 46350307
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| | |    
46350463 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaggagacttcttaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgatgttgaatacttgatatacaattagt 46350364  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    ||||||||||||||||  ||   | |||||||  |||||| ||||||||||||||||    
46350363 ggtgttcacaatacaaatcagatacagactcttaagactttagaatttctaagatat 46350307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #292
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Original strand, 47207248 - 47207360
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |||    
47207248 agacttctaatgctcaagcacaactgcgagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatatttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 47207346  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
47207347 tgttcacaatacaa 47207360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #293
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 49643048 - 49642883
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcagg 542  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || | || ||||||| |  ||||||    
49643048 ctttgatcaatcaccaataatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattcc-atgtatgtaggaacattgttgcagg 49642950  T
543 cagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   ||||||  | | || |||||||||||||||||||||||    
49642949 cagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 49642883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #294
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12726851 - 12726758
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaa 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||    
12726851 agagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaaatgtttgaggttgaacatttgatatacaa 12726758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #295
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 13953675 - 13953817
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || |||||||||||     
13953675 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcaca 13953772  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || || ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
13953773 caagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttc 13953817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #296
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18143316 - 18143248
Alignment:
166 aaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18143316 aaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 18143248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #297
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20673782 - 20673669
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
20673782 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 20673685  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||| ||||||||||||    
20673684 aagtaagagacttcta 20673669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #298
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 49669095 - 49669003
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttg-acttgaacacttgatatacaatcaatggtgt 223  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
49669095 tgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgt 49669003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #299
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 51340393 - 51340535
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||  || ||||||||||||    
51340393 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagatttca-aattgctcaagcacg 51340490  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
51340491 caggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggcaagagacttc 51340535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #300
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 933273 - 933387
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
933273 ataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 933371  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||    
933372 aagcaagagacttcta 933387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #301
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Original strand, 2560729 - 2560839
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
2560729 agagacttctattgctcaagcaaaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 2560827  T
219 ggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||||    
2560828 ggtgttcacaat 2560839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #302
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 3238234 - 3238348
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| || |    
3238234 agagacttctattgctcaagcaaaactgcaagagacttctcaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaaacagt 3238332  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
3238333 ggtgttcacaatacaa 3238348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #303
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17910594 - 17910480
Alignment:
51 ataatcacacagattacaa-ctgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
17910594 ataatcacaaagattacaaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 17910496  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
17910495 aagcaagagtcttcta 17910480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #304
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19887942 - 19887843
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
19887942 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19887843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #305
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22463698 - 22463595
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
22463698 tgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 22463599  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
22463598 acaa 22463595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #306
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22465156 - 22465053
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
22465156 tgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 22465057  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
22465056 acaa 22465053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #307
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22770475 - 22770411
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaat 186  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
22770475 agagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcgaacagaattacaaagaaaat 22770411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #308
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24776149 - 24776035
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |  |||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
24776149 agagacttctattgctcaagcataactgcaaaagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 24776051  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
24776050 ggtgttcacaatacaa 24776035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #309
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 504757 - 504643
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
504757 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 504659  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
504658 -aagcaagagacttcta 504643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #310
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 527123 - 527009
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
527123 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 527025  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
527024 -aagcaagagacttcta 527009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #311
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1784659 - 1784546
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
1784659 ataatcacaaagattacaaatgctcgatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 1784561  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
1784560 agcaagagtcttcta 1784546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #312
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 4743384 - 4743498
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
4743384 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 4743482  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
4743483 -aagcaagagacttcta 4743498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #313
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 4753971 - 4754085
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
4753971 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 4754069  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
4754070 -aagcaagagacttcta 4754085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #314
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9381246 - 9381133
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
9381246 ataatcacaaagattacaaatgctcagtactatctaagtatgagacttcttaaaagtgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 9381148  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
9381147 agcaagagtcttcta 9381133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #315
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11206662 - 11206549
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||| |    
11206662 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacatacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 11206564  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
11206563 agcaagagtcttcta 11206549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #316
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 16385721 - 16385835
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
16385721 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 16385819  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
16385820 -aagcaagagacttcta 16385835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #317
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 18483690 - 18483804
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
18483690 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 18483788  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
18483789 -aagcaagagacttcta 18483804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #318
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 24659546 - 24659660
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
24659546 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24659644  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
24659645 -aagcaagagacttcta 24659660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #319
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 24670126 - 24670240
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
24670126 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24670224  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
24670225 -aagcaagagacttcta 24670240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #320
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29461801 - 29461688
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
29461801 ataataacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 29461703  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
29461702 agcaagagtcttcta 29461688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #321
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 33582775 - 33582884
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
33582775 agacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaataagtgg 33582873  T
221 tgttcacaata 231  Q
    |||||||||||    
33582874 tgttcacaata 33582884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #322
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 35187023 - 35187137
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
35187023 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35187121  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
35187122 -aagcaagagacttcta 35187137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #323
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 39371699 - 39371813
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||    
39371699 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcatacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 39371797  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
39371798 -aagcaagagacttcta 39371813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #324
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 41683324 - 41683438
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
41683324 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 41683422  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
41683423 -aagcaagagacttcta 41683438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #325
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 41693893 - 41694007
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
41693893 ataatcaca-agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 41693991  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
41693992 -aagcaagagacttcta 41694007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #326
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4243754 - 4243581
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||| |||||| || || |||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  | |||||  |||||||    
4243754 atgcttaagcacacacgcaagagtcttcctatgttcaaccacaaaagcaagagacttctaaacaaacacaattacacagaaatatctttgaggttgaaca 4243655  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    |||||||||||| ||| | |||| |||||| ||  |||  | |||||||  |||||  ||||||||||||||||    
4243654 cttgatatacaaacaacgatgtttacaataaaaatcaaatacagactcttaagactctagaatttctaagatat 4243581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #327
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12389487 - 12389373
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaa-aattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    |||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   || |||||  |||||||||||||||||||| | ||    
12389487 agagacttcctatgctcaagcacaactacaagagacttctattcaaacagaattacaaagaatttttttttgatgttgaacacttgatatacaataagtg 12389388  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||| ||||    
12389387 gtgttcacaaaacaa 12389373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #328
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12410399 - 12410298
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||   |||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
12410399 aatgctcaagcacacaagcaagagacttctaaacaaaca-aattacaaagaaataagtttggtttgaacaatttatatacaatcagtggtgttcacaata 12410301  T
232 caa 234  Q
    |||    
12410300 caa 12410298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #329
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 13931482 - 13931615
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||| || |  |||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||| ||||||| |||||   |||||  |||||    
13931482 caaatactcaagcacacaagaaagagatatcctatgctcaagcaaaaaagtaagagacttctaaacaaaca-aattacaaagaaataagtttggtttgaa 13931580  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
13931581 cacttgatatacaatcagtgttgttcacaatacaa 13931615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #330
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Original strand, 17667946 - 17668102
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||  | |    
17667946 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacagaattacaaggaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaaaaagt 17668045  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    | ||||||||||||||  ||   | |||||||  ||||| |||||||||||||||||    
17668046 gatgttcacaatacaaatcagatacagactcttaagactcaagaatttctaagatat 17668102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #331
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19250013 - 19249873
Alignment:
136 ctcaagcactaaagcaagagacttc-tagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaataca 233  Q
    ||||||||| | | ||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
19250013 ctcaagcacaacaacaagagatttcctattcaaacagaattacaaagaaa-ttgtttaaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 19249915  T
234 atgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    |  |||  | |||||||  |||||  ||||||||||||||||    
19249914 aatcaaatacagactcttaagactctagaatttctaagatat 19249873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #332
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 2561061 - 2561226
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    ||||||     
2561061 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggt 2561160  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
2561161 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2561226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #333
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 6252964 - 6253077
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |   |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||     
6252964 agagacttcgtatgctcaagcacaactacaagagacttatattcaaatagaattacaaagaaagatgtttgaggttgaacacttgatatataatcagtga 6253063  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
6253064 tgttcacaatacaa 6253077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #334
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12753369 - 12753243
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || |||||||||||     
12753369 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcaca 12753272  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcac 144  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||    
12753271 caggcaagagacttcctttgctcaagcac 12753243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #335
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14322279 - 14322167
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatctag-tatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||    
14322279 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaactatgagacttctcaaaatgctcaaccacacaggcaagagtcttctaatgctcaagcact-aa 14322181  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
14322180 gcaagagtcttcta 14322167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #336
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 20646027 - 20646192
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||    
20646027 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 20646126  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||   ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||||    
20646127 agaactgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 20646192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #337
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 38314341 - 38314453
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 148  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | |||| || |||||||||||||||| ||    
38314341 ataaccacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacagacaagagtctaccaatgctcaagcact-aa 38314439  T
149 gcaagagacttcta 162  Q
    ||||||| ||||||    
38314440 gcaagagtcttcta 38314453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #338
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7795196 - 7795082
Alignment:
51 ataatcacacagattaca-actgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
7795196 ataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 7795098  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
7795097 aagcaagagtcttcta 7795082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #339
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7805107 - 7804993
Alignment:
51 ataatcacacagattaca-actgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
7805107 ataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 7805009  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
7805008 aagcaagagtcttcta 7804993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #340
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13781202 - 13781087
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |   ||||||||||| |   ||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
13781202 agagacttctaatgttcaagcacaactacaagagacttccaaattcaaatagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 13781103  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    | ||||||||||||||    
13781102 gatgttcacaatacaa 13781087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #341
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 234
Target Start/End: Original strand, 21317040 - 21317176
Alignment:
99 ccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttg 197  Q
    |||||| || |||||| || || ||| | |||| ||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||  ||     
21317040 ccaaatactgaagcacacaagcaagatatttcctatgcttaagcacaaatgcaagagacttctaaacaaacacaattacatagaaaaatgtttgaggttc 21317139  T
198 aacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
21317140 aacatatgatatataatcagtggtgttcacaatacaa 21317176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #342
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 29854962 - 29855065
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
29854962 tgctcaagcacaattgcaagagacttcttaattaaaacagaattacaaagaaaaacgtttcaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 29855061  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
29855062 acaa 29855065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #343
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 51340509 - 51340565
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
51340509 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttc 51340565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #344
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 11078212 - 11078346
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaatt-gtttgacttga 198  Q
    ||||||||||||||| || || ||| | |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||| ||||| | | | |||  |||||  ||||    
11078212 caaatgctcaagcacacaagcaagatatttcctatgctcaagcataaaagcaagagacttataaacaaaca-aattaaaaaaataataagtttggtttga 11078310  T
199 acacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
11078311 aaacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 11078346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #345
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13383850 - 13383735
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||| |||    
13383850 ataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagtaagagtcttccaatgctcaagaact 13383751  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
13383750 -aagcaagagacttcta 13383735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #346
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 14393248 - 14393125
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||  |   ||    
14393248 gtcctatggaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgccgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagt 14393149  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||||||||||||||||||||    
14393148 agtggagatagtggttgtacactt 14393125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #347
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 22128631 - 22128701
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22128631 tcaaacataattaca-agaaaaatgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 22128701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #348
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 49666645 - 49666526
Alignment:
490 tatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtg 588  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| |   |||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| | |||| || |||    
49666645 tatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaatcagagtagtg 49666546  T
589 gagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||||||||||    
49666545 gagatagtggttgtacactt 49666526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #349
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 141
Target Start/End: Original strand, 13601880 - 13601973
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 141  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
13601880 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 13601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #350
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 479 - 615
Target Start/End: Original strand, 16476382 - 16476520
Alignment:
479 gggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggac-aca 576  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||  |||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||| | |    
16476382 gggtgtagtcctttgaaggataagcttcaaattcattcccatggtgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaga 16476481  T
577 ctcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
      ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
16476482 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 16476520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #351
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Original strand, 37467225 - 37467371
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||    
37467225 atcttttgcctgatatggttattgtcttatgaatgatcaatttcaaatccattcccagtatgcaggaacattgttgcgggcagagctgttatccttgtct 37467324  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
37467325 tgtagcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacactt 37467371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #352
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11909745 - 11909646
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||| |  |||||||||||||    
11909745 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagaaacttcctttgctcaagcccacaagcaagagactt 11909647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #353
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 160
Target Start/End: Original strand, 15848699 - 15848756
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
15848699 atgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 15848756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #354
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22804309 - 22804144
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   ||| |||||||   |||||||    
22804309 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgagggaacaaagttgcaggc 22804210  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||    | || ||||||||||||||| |||||||    
22804209 agagctgttattcttgtcctgtagcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacactt 22804144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #355
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 29951724 - 29951559
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||| |  |||||||    
29951724 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggc 29951625  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||   ||| ||  | | || |||||||||||||||||||||||    
29951624 atagctgttatccttgtccagtagcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactt 29951559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #356
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 30000878 - 30000713
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||| |  |||||||    
30000878 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggc 30000779  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||   ||| ||  | | || |||||||||||||||||||||||    
30000778 atagctgttatccttgtccagtagcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactt 30000713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #357
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 31303259 - 31303424
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | | ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||   || ||||||| |  |||||||    
31303259 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgccctctgaaggatcaatttcaaatccattgctagtatgtaggaacattgttgcaggc 31303358  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   ||||||  | | || ||||||||||| |||||||||||    
31303359 agagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacactt 31303424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #358
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18122186 - 18122119
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
18122186 tcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcgcaata 18122119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #359
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 49553775 - 49553687
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca 532  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
49553775 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaaca 49553687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #360
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13292214 - 13292159
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 155  Q
    |||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
13292214 caaatgctcaaggacacagccaagagacttccaatgctcaagcacaaaagcaagag 13292159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #361
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16659175 - 16659120
Alignment:
180 agaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
16659175 agaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgtttacaatacaa 16659120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #362
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 24775778 - 24775655
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| ||    
24775778 gtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgttttacttgtcttgtagcagagacaaaaacagagt 24775679  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||  ||||||||||||||||    
24775678 agtggatgtagtggttgtacactt 24775655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #363
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25398798 - 25398759
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
25398798 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 25398759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #364
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 40799789 - 40799912
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| || |||| |||||||||   |||| |  ||| ||    
40799789 gtcctatgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagt 40799888  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
40799889 agtggaggtagtggttgtacactt 40799912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #365
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 2783020 - 2783093
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttga 193  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
2783020 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttga 2783093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #366
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15194628 - 15194516
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||||     
15194628 ataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacacaagagtcttccaatgctcaagcact- 15194530  T
147 aagcaagagacttc 160  Q
    ||||||||| ||||    
15194529 aagcaagagtcttc 15194516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #367
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 532
Target Start/End: Original strand, 16812105 - 16812174
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca 532  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    
16812105 atcttttgcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaaca 16812174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #368
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 18143030 - 18142957
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
18143030 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcc 18142957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #369
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 231
Target Start/End: Original strand, 1463906 - 1463942
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
1463906 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 1463942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #370
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 493 - 608
Target Start/End: Original strand, 2784987 - 2785102
Alignment:
493 gaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggag 591  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||   ||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||   |||| | |||| || ||||||    
2784987 gaaggatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattcttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aatcagagtagtggag 2785085  T
592 atagtggttgtacactt 608  Q
     ||||||||||||||||    
2785086 gtagtggttgtacactt 2785102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #371
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 9535255 - 9535369
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||| ||     
9535255 ataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgct- 9535353  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
9535354 aagcaagagtcttcta 9535369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #372
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13780777 - 13780705
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
13780777 tgcaggcaaagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacactt 13780705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #373
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15663242 - 15663182
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
15663242 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 15663182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #374
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 15848670 - 15848726
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||||||||||  | || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
15848670 tgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 15848726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #375
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19889515 - 19889447
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || | |||||||||    
19889515 tcaaacagaattatactgaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtgattttcacaata 19889447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #376
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 552
Target Start/End: Original strand, 28581979 - 28582087
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||| | ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||    
28581979 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgctatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggc 28582078  T
544 agagctgtt 552  Q
    |||||||||    
28582079 agagctgtt 28582087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #377
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 38177929 - 38177805
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||||||||    |||||||    
38177929 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatcaattctcattgtgaaggaacatcgttgcaggc 38177830  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagc 567  Q
    |||| || || ||||||||||||||    
38177829 agagttgtttttcttgtcttgtagc 38177805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #378
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 20627716 - 20627629
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca 532  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    
20627716 tttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaaca 20627629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #379
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 18121881 - 18121827
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
18121881 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcc 18121827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #380
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 517
Target Start/End: Original strand, 20724980 - 20725034
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
20724980 atcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc 20725034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #381
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 487 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 21605897 - 21605775
Alignment:
487 tcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtc 585  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||| |   ||||| |||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||||   |||| |  ||| ||     
21605897 tcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaagaaacattgttggaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagta 21605798  T
586 gtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||||||||    
21605797 gtggagatagtggttgtacactt 21605775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #382
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 567
Target Start/End: Original strand, 3238586 - 3238691
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtct 561  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||   |||| ||   ||||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||    
3238586 atcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccattccgaaggaacattgttgcaggcagagatgtttttcttgtct 3238685  T
562 tgtagc 567  Q
    ||||||    
3238686 tgtagc 3238691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #383
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Original strand, 8710418 - 8710455
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
8710418 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 8710455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #384
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Original strand, 9062305 - 9062342
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
9062305 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 9062342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #385
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 163
Target Start/End: Original strand, 10928584 - 10928625
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
10928584 agagacttccaatgctcaagcacacaagcaagaaacttctag 10928625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #386
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Original strand, 14968904 - 14968991
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgat 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
14968904 agagacttctaatgctcaagcacaactacaagagacttctaaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgat 14968991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #387
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 16658904 - 16658739
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||  |||| ||| | | ||| |||||||||| || ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||    
16658904 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcatatgaaggattaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 16658805  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||||  |   || |||||| ||||||||||||||||    
16658804 agagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt 16658739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #388
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 161
Target Start/End: Original strand, 18005989 - 18006018
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttct 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
18005989 aatgctcaagcactaaagcaagagacttct 18006018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #389
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 23538432 - 23538379
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
23538432 atcttttctctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattc 23538379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #390
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 103
Target Start/End: Original strand, 33650847 - 33650900
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    
33650847 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 33650900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #391
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 1728208 - 1728136
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| |  ||| || ||| |||||||||||||||||||    
1728208 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 1728136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #392
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 5510456 - 5510484
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
5510456 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 5510484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #393
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Original strand, 5520634 - 5520662
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
5520634 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 5520662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #394
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 5580109 - 5580081
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
5580109 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 5580081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #395
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 5628493 - 5628465
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
5628493 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 5628465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #396
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12287455 - 12287427
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
12287455 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 12287427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #397
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12297277 - 12297249
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
12297277 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 12297249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #398
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12756059 - 12756019
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
12756059 agagacttccaatgcttaagcacacaagcaagagacttcta 12756019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #399
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14427595 - 14427555
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
14427595 agagacttgcaatgctcaagcacacaagcaagagacttcta 14427555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 29183 - 29698
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||| | ||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29183 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgcttaggcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 29282  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
29283 cttgatatacaatcaagtgtgttcacaatacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagcgcagaaattcagagtgc 29382  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagag 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||    
29383 ttttgagaatcaaatttggcagagttttggcacttttaacttgtattgatgtctctaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagag 29482  T
402 agacgttgaga-tcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtccta-tgaaggat 499  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
29483 agacgttgagattttttagcacgtccaaacagttgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctattgaaggat 29582  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
29583 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggt 29682  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
29683 tgtacacttgtacttt 29698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 29071 - 29213
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29071 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac-atctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 29169  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
29170 gagagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 29213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 35248 - 35760
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
35248 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaatagttagacttgaaca 35347  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35348 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 35446  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagag 401  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||  || ||    
35447 tttttagaatcaaatttggcagagttttagcgcttttaacttgtgttgatgtctctaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgactaaag 35546  T
402 agacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatca 501  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
35547 agacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggatta 35646  T
502 acttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttg 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||    
35647 acttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 35746  T
602 tacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||    
35747 tacacttgtacttt 35760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 35136 - 35278
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
35136 ccttgcacttccaaggagatttctactaa-aaataatcacacagattacaaatgttcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 35234  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
35235 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 35278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 1670 - 1117
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
1670 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcag 1571  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
1570 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcag 1471  T
218 tggtgttcacaatacaatgcaa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt-tgagaattaaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||  |||    
1470 tggtgttcacaatacaatgcaattgagagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttgtgtgaaacaaa 1371  T
316 tttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc- 414  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||     
1370 tttggcagagtttaggcacttttaacttgttgtactgtctctgctgatcttcaagtcttcactcctttttatagaggtgtgtagagagacgttgagatct 1271  T
415 ttaagcacgt-ctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattca 513  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
1270 ttaagcacgtccaaaagagtcgttgagaaaccttgatca-ataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatcca 1172  T
514 ttcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
1171 ttcctatcttgaaggaacatttctgcagacagagctgttatcttgtcttgtagcg 1117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 615
Target Start/End: Original strand, 60666 - 61267
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
60666 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 60765  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatc 215  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
60766 aggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatactatc 60865  T
216 aatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttga-gaatta 313  Q
    | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||  | |||  |    
60866 agtggtgttcacaaaacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatttatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgtatgaaaca 60965  T
314 aatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgaga 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||    
60966 aatttggcagagtttaggcgctttttaacttgtcgtattgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtg-agagagacgttgaga 61064  T
413 tctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaatt 511  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||     
61065 tctttaagcacgtc-aaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatc 61163  T
512 cattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgta 611  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
61164 cattcctttcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgta 61263  T
612 cttt 615  Q
    ||||    
61264 cttt 61267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 211900 - 212014
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||   ||    
211900 agagacttcaaatgctcaagcacaactacaagagacttctaattcaaacagaatgacacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatttgtg 211999  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
212000 gtgttcacaatacaa 212014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 212231 - 212393
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||  ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||    
212231 ctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaaca---ttgcaggc 212327  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||    
212328 agagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 212393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 1704 - 2217
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 201  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1704 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 1803  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
1804 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaat-aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatccgtgcagaaattcaaagtgc 1902  T
302 ttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatg-tctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtaga 400  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| | | |    ||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||| |    
1903 tttttagaatcaaatttggcagagttttagcgcttttaacttgtgttgatgtttttttttaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgagtaaa 2002  T
401 gagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatc 500  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||    
2003 gagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctaatttgggtgtagtcctgtgacggatc 2102  T
501 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggtt 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |   || || |||||| ||||||||    
2103 aacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaatagagtagtggaggtagtggtt 2202  T
601 gtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||    
2203 gtacacttgtacttt 2217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 1595 - 1734
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
1595 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactcactagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 1690  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
1691 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 1734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Original strand, 5006 - 5518
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||    
5006 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacacagaaaat-gtttgactttgaac 5104  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
5105 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 5203  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |     
5204 ctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa- 5302  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
5303 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 5402  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||| ||    
5403 caacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtagt 5502  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
5503 tgtacacttgtacttt 5518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 4897 - 5036
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
4897 ccttgcacttccaaggagatttccac----aaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcag 4992  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
4993 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 5036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 7)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 40876 - 40378
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||    
40876 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatactatcagtgg 40777  T
221 tgttcacaatacaatgcaata-aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgag--aattaaatt 317  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |   |||||    
40776 ttttcacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgcttttgagtgacacaaatt 40677  T
318 tggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt- 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||     
40676 tggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtcttgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggt-tgtagagagacgttgagaccttt 40578  T
417 aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
40577 aagcacgtctaaagagtcgttgagaacctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattc 40478  T
517 ctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
40477 ctatcttgaaggaacatttctgcaggcaaagctgttatacttgtcttgtagcgaagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtacttt 40378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 104 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 59440 - 58924
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
59440 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaacac 59341  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaata-aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc 301  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
59340 ttgatatacaatcagtgatgtttacaatacaatgcaattgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacaaaaattcaaagtgc 59241  T
302 ttttgag--aattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    |||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| ||| | |||    
59240 ttttgagtgacacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtcttatctctactgatcttaaagtcttcactcctttatatagaggttt-tag 59142  T
400 agagacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||    
59141 agagacgttgagacctttaagcacgtctaaagagtcgttgagaacctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcttatgaagga 59042  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtg 597  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |   |||||  |||  |||||||| |||||    
59041 tcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatacttgtctcgtagtgcaaacacaagcagattcgtggaggtagtg 58942  T
598 gttgtacacttgtacttt 615  Q
     ||||||| |||||||||    
58941 attgtacaattgtacttt 58924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 132 - 615
Target Start/End: Original strand, 175062 - 175547
Alignment:
132 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaat---caatggtgttcaca 228  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||    
175062 aatgctcaagcacgtaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaataatcagtgatgttcaca 175161  T
229 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagttt 328  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
175162 atacaatgcaataaa-gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagacattcaaggtgctttgtagaatcaaatttgacagagttt 175260  T
329 gggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtcta 427  Q
     ||||||||||||||||| | || |||||  || ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||    
175261 tggcgcttttaacttgtgttgatatctcttgccaatcttaaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatttttagcacgtcta 175359  T
428 aagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaag 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
175360 aagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcagcttcaaattcattcccatcttgaag 175459  T
528 gaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||| |||||||  || ||||||| ||||||| |||||||  |||| |   || || |||||| |||||||||||||||||||||||    
175460 gaacatttctgcaaacaaagctgttgtcttgtcctgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 175547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 59555 - 59414
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
59555 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcag 59456  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
59455 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 59414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41011 - 40868
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaata--ccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
41011 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatattacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgt 40912  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
40911 aggcaagagacttcctttgctcaagcaataaagcaagagacttc 40868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 174981 - 175090
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttc-ccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||     
174981 ccttgcacttccaaggagattttcactaaaaa----tcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgt 175076  T
117 aggcgagagacttc 130  Q
    |||| |||| ||||    
175077 aggcaagaggcttc 175090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 224
Target Start/End: Original strand, 10113 - 10174
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgtt 224  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
10113 tcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaatacttgatatacaatcaatggtgtt 10174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 7)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 57328 - 56815
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| ||||| |||||||  | || |||| |||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||    
57328 aatgctcaagcactaatgcaagagtcttctaatgcacaagcacgcaggcgagaggcttctattaaaacaaaaatacacagaaaat-gtttgactttgaac 57230  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
57229 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttgagtaattctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 57131  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | || |||||   | ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||    
57130 ctttttagaatcaaatttgacagagttttggcgcttttaacttgtgttgatatctcttttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtag 57031  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
57030 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 56931  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
56930 caacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 56831  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||    
56830 tgtacacttgtacttt 56815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 970 - 731
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
970 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaattaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 871  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    |||||||| ||||    
870 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagaatctctagacttaagaatttctaagatatatgaaatgaacatagaaattctaagt 771  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttt 337  Q
    |||||  || |||  |||||| ||||||||||||||||||    
770 gcttttatgtgaaacaaatttagcagagtttgggcgcttt 731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 57439 - 57298
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||    
57439 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgatacttctcaaaatgctcaagcacgc 57344  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
57343 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaatgcaagagtcttcta 57298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 362 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 690 - 483
Alignment:
362 atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccag 460  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |     |||||||  |||||     
690 atctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttctgaaaacttgatcaatcaccaa 592  T
461 taatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgt 559  Q
    | ||| |||| |||||||   ||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
591 tgatcgtttgcctgatttacttgttgtcctataaaggatcaagttcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgt 492  T
560 cttgtagcg 568  Q
    |||||||||    
491 cttgtagcg 483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 48876 - 48991
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| | |    
48876 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttaaacacttgatatacaataagt 48975  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
48976 ggtgttcacaatacaa 48991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1086 - 944
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || | |||||||||     
1086 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattactcaagcaca 989  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||| | ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
988 cagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttc 944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 32401 - 32524
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcaggg 583  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||| || | || ||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||  | | |    
32401 gtcctacgaaggatcaatttcaaatccattcc-atgtatgtaggaacatttttgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgag 32499  T
584 tcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
32500 tagtggagatagtggttgtacactt 32524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 12642 - 12149
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
12642 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgactttgaacacttgatattctatcagtgg 12544  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
12543 tgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctgagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaatttgg 12445  T
321 cagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| || || ||    
12444 cagagttttggcgcttttaacttgtgttaatgtctctggccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgaaatttttag 12346  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
12345 cacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattccc 12246  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12245 atcttgaaggaacaattctgcaggcggagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 497 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 16098 - 15980
Alignment:
497 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagt 596  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || ||| || ||||    
16098 gatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcggagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgtaggtagt 15999  T
597 ggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||    
15998 ggttgtacacttgtacttt 15980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12773 - 12632
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa-tgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
12773 ccttgcacttccaaggagattttcactaagaa----tcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgc 12678  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
12677 aggcaagagtcttccaatgctcaaggactaaagcaagagtcttcta 12632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 6)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 102 - 614
Target Start/End: Original strand, 127357 - 127868
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||| || ||||    
127357 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatcaaacaaaattacacataaaat-gtttgagtttgaac 127455  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
127456 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtg 127554  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataat-gtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||| || | || ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||    
127555 cttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgcttttaacttctgttgattgtctcttaa-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtag 127653  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
127654 agagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcgtttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggat 127753  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||  |||||||    
127754 caagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggt 127853  T
600 tgtacacttgtactt 614  Q
    |||||||||||||||    
127854 tgtacacttgtactt 127868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 195 - 615
Target Start/End: Original strand, 140608 - 141028
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattc 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
140608 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattc 140706  T
295 aaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataat-gtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggt 393  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||    ||||||||||||||||| | |||||||| |||    
140707 agagtgcttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgcttttaacttgtgatgattgtctcttaa-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggt 140805  T
394 gtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcc-tat 492  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
140806 gagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttt 140905  T
493 gaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaga 592  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || ||||||     
140906 gaaggatcaacttcaaactcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggagg 141005  T
593 tagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||    
141006 tagtggttgtacacttgtacttt 141028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 139 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 8164 - 7683
Alignment:
139 aagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
8164 aagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgc 8065  T
238 aa-taaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgag--aattaaatttggcagagtttgggcgc 334  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||| || ||    
8064 aagtgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacataaattcaaagtgcttttgagtgacacaaatttggcagagtttaggagc 7965  T
335 ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagt 433  Q
    |||||||||||  |  | |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
7964 ttttaacttgttgtcttatctctactaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagt 7866  T
434 cgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa 533  Q
    |||||||  |||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||     
7865 cgttgagaacctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagcatcaagttcaaattcattcatatcttgaatgaacat 7766  T
534 ttctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
7765 ttctgcaggcagagctgttatacttgtcttgtagcgcagacacactcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtacttt 7683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 295
Target Start/End: Original strand, 16315 - 16508
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct-agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaa 199  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
16315 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcttaatcaaacagaattacacagaaaat-gtttgactttgaa 16413  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattca 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16414 cacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaa-gactctcgacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattca 16508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 127243 - 127387
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
127243 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacac 127341  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
127342 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 127387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 16202 - 16345
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
16202 ccttgcacttccaaggagatttccactaa-agataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaatgctcaagcgcgca 16300  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16301 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 16345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 261 - 615
Target Start/End: Original strand, 58170 - 58524
Alignment:
261 atttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctacc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||       
58170 atttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgtttatgtctcttat 58269  T
361 gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccag 460  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
58270 gatcttcaagtcttcgctcctttatatagaggtgagtagagatacgttgagatctttagcacgactaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccag 58369  T
461 taatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtc 560  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
58370 taatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtc 58469  T
561 ttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
58470 ttgtagcgaggacacacttagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 58524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 57962 - 58159
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
57962 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattataactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcatgtag 58061  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
58062 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatca 58159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 102 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 10833 - 10321
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||    
10833 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaataaaaatacacagaaaat-gtttgacattgaac 10735  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
10734 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaataaatt-ctctagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 10636  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtag 399  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||   | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |     
10635 ctttgtagaatcaaatttggcagagttttggcgcttttaacttgtgttgatatctcttggcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa- 10537  T
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggat 499  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
10536 agagacgttgagatttttagcacatctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaat 10437  T
500 caacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggt 599  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||    
10436 caacttcaaattcattcccatcttaaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggt 10337  T
600 tgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||| |||||||||    
10336 tgtacatttgtacttt 10321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10943 - 10803
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
10943 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcagatgctcaagcacgca 10848  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
10847 ggtgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 10803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 102 - 612
Target Start/End: Original strand, 15438 - 15949
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaac 200  Q
    |||||||||||||  | || |||| |||| |||| ||||||||  | || |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
15438 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatggtcaagcacgcaggcgagaggcttctgatcaaacaaaattacacagaaaat-gtttgactttgaac 15536  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15537 acttgatatacaatcagtggtgttcacaatataatgcaacaaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 15635  T
301 ctttt-gagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccga-tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgta 398  Q
    ||||| |||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||    | |||||||||||| ||| | ||| |||| |||| |||    
15636 ctttttgagaaacaaatttagcagagttttgacgcttttaacttgtgttcatgtctctctttaatcttcaagtctttactcctttaaatagaggtgagta 15735  T
399 gagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
15736 gagagacgttgagatttttagaacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttgggtgtagtcctatgaagga 15835  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtgg 598  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||    
15836 tcaacttctaattcattcctttcttgaaggaacatttctgcaggcagagatgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 15935  T
599 ttgtacacttgtac 612  Q
    ||||||||||||||    
15936 ttgtacacttgtac 15949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 15328 - 15468
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
15328 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatcacacagattacagatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaatgctgaagcacgca 15423  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
15424 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 15468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1100 - 801
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1100 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 1001  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
1000 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 901  T
219 ggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaattt 318  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
900 ggttttcacaatacaatgcaataatatactttagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaattt 801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 122 - 608
Target Start/End: Original strand, 61279 - 61771
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
61279 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaattagtgg 61378  T
221 tgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt-tgagaattaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| || |||  ||||    
61379 tgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaagtcaaagtgctttgtgtgaaacaaat 61478  T
317 ttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-t 415  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
61479 ttggcagagtttgggtgcttttaacttgttgtcttgtctctactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-agagagacgttgagatctt 61577  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
61578 taagcacgtcaaaagagtcgttgagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccatt 61677  T
516 cctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
61678 cctatcttgaaggaacatttttgtaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 61771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 61143 - 61287
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
61143 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattataactgctcaatactacacctagtatgagacttcgcaaatgctcaagcacgc 61242  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcac-taaagcaagagacttc 160  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
61243 aggcaagagacttcctttgctcaagcacaaaaagcaagagacttc 61287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 40232 - 40725
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
40232 agagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaat-gtttgactttgaacacttgatatacaatcagtgg 40330  T
221 tgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttgg 320  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
40331 tgtttacaatacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaatatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttgg 40429  T
321 cagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc-taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgaga-tcttaa 418  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||    
40430 cagaattttggcgcttctaacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagatttttaa 40528  T
419 gcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
      |     ||| |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
40529 aaaaaaaaaaaaaaaaattgagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattccc 40628  T
519 atcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
40629 atcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 40725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 40102 - 40242
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
40102 ccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgca 40197  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
40198 ggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttcta 40242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 7)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 475834 - 475322
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
475834 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaaagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 475735  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||    
475734 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacataaattcaaagt 475635  T
300 gcttt-tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtct--ctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtg 396  Q
    ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |  |||||  |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
475634 gctttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttatcttgatgtcttgtctcactattgatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgtg 475535  T
397 tagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaa 495  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||   | |||||||   |||| | |||||||| |||||||||  || ||||||||||    
475534 -agagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttaagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaa 475436  T
496 ggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagata 594  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||    
475435 ggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggta 475336  T
595 gtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||||    
475335 gtggttgtacactt 475322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 482354 - 481842
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
482354 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaaagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 482255  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||    
482254 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacataaattcaaagt 482155  T
300 gcttt-tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtct--ctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtg 396  Q
    ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |  |||||  |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
482154 gctttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttatcttgatgtcttgtctcactattgatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgtg 482055  T
397 tagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaa 495  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||   | |||||||   |||| | |||||||| |||||||||  || ||||||||||    
482054 -agagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttaagaaaccttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaa 481956  T
496 ggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagata 594  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||    
481955 ggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggta 481856  T
595 gtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||||    
481855 gtggttgtacactt 481842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 164 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 157149 - 156698
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||    
157149 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaag 157050  T
260 aatttctaagatatatcaaatcagtgcag-aaattcaaagtgcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |    
157049 aatttctaagatatatcaaatgaacacagaaaattcaaagtgcttttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgttgtcttgtcac 156950  T
357 taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatcc 455  Q
    | | |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  |    
156949 t-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-agagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatc 156852  T
456 accagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttat 554  Q
    |||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
156851 accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacaattctgcaggtagagctgttttt 156752  T
555 cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
156751 cttgtcttgtatcgtagacgcacgcatagtcgtggaggtagtggttgtacactt 156698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 441 - 615
Target Start/End: Original strand, 117147 - 117321
Alignment:
441 ttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgca 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
117147 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattttgca 117246  T
541 ggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
117247 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagcggaggtagtggttgtacacttgtacttt 117321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 475950 - 475808
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
475950 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 475852  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
475851 agacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 475808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 482470 - 482328
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
482470 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgc 482372  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
482371 agacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 482328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 210
Target Start/End: Original strand, 111894 - 112004
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||  || || ||||| || | |||||||||| | ||||||| | |||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||  |||||    
111894 caaatactcaagcatacaagcaagagattttctatgctcaagcgcaaaagcaaaatacttctaaacaaacaaaattacacaaaaaaatgtttggtttgaa 111993  T
200 cacttgatata 210  Q
    |||||||||||    
111994 cacttgatata 112004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 37259 - 36768
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
37259 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 37160  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
37159 gttcacaatacaatacaataaa-gactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 37062  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
37061 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagc 36964  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||    
36963 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 36864  T
521 cttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
36863 cttgaaggaacatttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37362 - 37249
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
37362 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 37264  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
37263 agcaagagtcttcta 37249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 122 - 608
Target Start/End: Original strand, 4664 - 5156
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||    
4664 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattatttgagtttgaacacttgatatacaatcagtgg 4763  T
221 tgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt--tgagaattaaa 315  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||  || |||  |||    
4764 tgttcacaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagctatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgcttttgtgtgaaacaaa 4863  T
316 tttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc- 414  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||||||  |  |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||     
4864 tctggtagagtttgggcgtttttaacttgttgtcttgtcac-accgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-ggagagtcgttgagatct 4961  T
415 ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcat 514  Q
    || |||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| |  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||    
4962 ttcagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatggtcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcatgttcaaatccat 5061  T
515 tcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
5062 tcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacacgcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 5156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 4529 - 4672
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||    
4529 ccttgcacttccaaggagagttccactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaaattgctcaagcacg 4627  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
4628 caggcaagagacttcctttgctcaagcattaaagcaagagacttc 4672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 11131 - 10635
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
11131 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 11032  T
222 gttcacaatacaatgcaata----aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||    
11031 gttcacaatacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt 10932  T
318 tggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct 415  Q
     | |||||||| ||| ||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | |||||||||||||       
10931 -gacagagttttggcactttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagagga 10836  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
10835 ttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 10736  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
10735 cccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 8284 - 7788
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
8284 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 8185  T
222 gttcacaatacaatgcaata----aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatt 317  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||| |||||    
8184 gttcacaatacaatacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtataatcaaatt 8085  T
318 tggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataa-tgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatct 415  Q
     | |||||||| ||| ||||| ||||||| |||  | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | |||||||||||||       
8084 -gacagagttttggcactttttaacttgt-atatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagagga 7989  T
416 taagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatt 515  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
7988 ttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatt 7889  T
516 cctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
7888 cccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 7789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11234 - 11121
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||| ||||  |||||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
11234 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 11136  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
11135 agcaagagtcttcta 11121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8351 - 8274
Alignment:
86 agtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
8351 agtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 8274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 5)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 33427 - 32937
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||  ||||||| || |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
33427 agagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 33328  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| || ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
33327 gttcacaatacaatacaataaa-gactataaacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 33230  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
33229 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattagc 33132  T
421 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||    
33131 acgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccat 33032  T
521 cttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
33031 cttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 32937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 40978 - 40486
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
40978 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 40879  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
40878 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 40782  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||||    |||||||||||||||||   |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
40781 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatatctctatttaatcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatcag 40685  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
40684 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 40585  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
40584 atcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 40486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41081 - 40968
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
41081 ataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 40983  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
40982 agcaagagacttcta 40968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 8179 - 8292
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||    
8179 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagatacttctattcaaacagaattacaaaaaaaattgtatgaggttgaacacttaatatacaatcagtgg 8278  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||| ||||||||    
8279 tgttcccaatacaa 8292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33530 - 33417
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | || |||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
33530 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 33432  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
33431 agcaagagtcttcta 33417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 7409 - 6919
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
7409 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaattagtggt 7310  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | |    
7309 gttctcaatacaaaacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatt-gac 7213  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   || ||| |  | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||    
7212 agagttttggcgctttttaacttgtgt--atctctatctcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagataatcagc 7116  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||| |    
7115 acgtctaaagagtcgtttgaaaacctttgatcatccaccagtaatcctttgcctggtttgggtgtagtcctttaaagaattagcttcaaattcattccca 7016  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
7015 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7512 - 7399
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
7512 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 7414  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
7413 agcaagagacttcta 7399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 1711 - 1200
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
1711 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 1612  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||  |||    
1611 ttgatatacagtcagtggtgttcagaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatacatcaaatgaacatagaaattcttagt 1512  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgt 397  Q
    |||||  || |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   ||   ||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||     
1511 gcttttgtgtgaaacaaattttgcagagtttgggcgcttttaacttgttgtctcgttcttactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg- 1413  T
398 agagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaag 496  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
1412 aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaag 1313  T
497 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatag 595  Q
    |||||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |  |||| |  ||  || |||||| |||    
1312 gatcacattcaaatccattcctattatgaaggaacatttctgcaggcagaactgtttttcttgtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtag 1213  T
596 tggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||    
1212 tggttgtacactt 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1827 - 1685
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||  || ||||||||||||    
1827 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtacgagacttca-aattgctcaagcacg 1730  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
1729 caggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 1685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 230 - 483
Target Start/End: Original strand, 16349 - 16601
Alignment:
230 tacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttg 329  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||     
16349 tacaatgcaataaa-gactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtactttttagaatcaaatttggcagagtttt 16447  T
330 ggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaa 429  Q
    || |||||||||||||| | || ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||    
16448 ggtgcttttaacttgtgttgatatctctaccattcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcaaaa 16547  T
430 gagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtg 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
16548 gagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttgggtg 16601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 313 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 13161 - 12858
Alignment:
313 aaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgag 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| |    
13161 aaatttggcagagttttggcgcttttagcttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttggg 13062  T
412 atcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaatt 511  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
13061 atttttagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggttgtagtcctttgaagtatcaacttcaaatt 12962  T
512 cattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgta 611  Q
    ||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
12961 cattcctatcttgaaggaacattttttcatgcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgta 12862  T
612 cttt 615  Q
    ||||    
12861 cttt 12858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 1518 - 1007
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
1518 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 1419  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||  |||    
1418 ttgatatacagtcagtggtgttcagaatacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatacatcaaatgaacatagaaattcttagt 1319  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgt 397  Q
    |||||  || |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   ||   ||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||     
1318 gcttttgtgtgaaacaaattttgcagagtttgggcgcttttaacttgttgtctcgttcttactgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg- 1220  T
398 agagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaag 496  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
1219 aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaag 1120  T
497 gatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatag 595  Q
    |||||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |  |||| |  ||  || |||||| |||    
1119 gatcacattcaaatccattcctattatgaaggaacatttctgcaggcagaactgtttttcttgtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtag 1020  T
596 tggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||    
1019 tggttgtacactt 1007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1634 - 1492
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||  || ||||||||||||    
1634 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtacgagacttca-aattgctcaagcacg 1537  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
1536 caggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 1492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 133 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 2227 - 1744
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
2227 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaatagaattacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 2128  T
232 caatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt--tgagaattaaatttggcagagt 326  Q
    |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||| ||||  || |||  ||||||||||||||    
2127 caatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacaaaaattcaaagtacttttgtgtgaaacaaatttggcagagt 2028  T
327 ttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatc-ttaagcacgt 424  Q
    |||||||| |||||||||||  |  ||| |||    |||||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
2027 ttgggcgctttttaacttgttgtcttgtatctcttcatcttcaaatcttcactcctttatatagaggtgtg-agagagacgttgagatctttaagcacgt 1929  T
425 ctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttg 524  Q
    | | ||||||||||||   | |||||||   | || | |||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
1928 caatagagtcgttgagaaaccttgatcaaatatcaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttg 1829  T
525 aaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||||||| ||||    
1828 aaggaacatttttttaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtaaactt 1744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 146 - 6
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaatgctcaagcacgca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
146 ccttgcacttccaaggagatttccactaa----taatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgca 51  T
118 ggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
50 ggcaagagacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttcta 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2371 - 2227
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
2371 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtt-taatcacactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcatgc 2273  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    | || ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
2272 atgcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaggcttcta 2227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 14314 - 14807
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||  ||||||| || ||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
14314 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 14413  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || || | |    
14414 gttcacaatacaatacaattaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaactt-gac 14511  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg-atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||| || |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||    
14512 agagttttggcgcttttgaacttgt-ata-tctctatatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag 14608  T
420 cacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||     
14609 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattccc 14708  T
519 atcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
14709 atcttgaaggtacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 14807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 189 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 54581 - 54157
Alignment:
189 tttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcag 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
54581 tttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatacaattaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcag 54483  T
289 aaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctac-cgatcttcaagtcttcacttccttata 386  Q
    |||||||  |||||||  || || ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| ||| | || || | | ||||||||||||||||| | |||||    
54482 aaattcagtgtgctttgtagtatcaaatt-gacagagttttggcgctttttaacttgt-ata-tctcacttctcaatcttcaagtcttcactcctttata 54386  T
387 tagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgta 485  Q
    ||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
54385 tagaggcgtgaa-agagacgttgagataattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgta 54287  T
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |  ||| ||    
54286 gtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcatggaca-aaacagagt 54188  T
585 cgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||    
54187 agtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 54157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 80952 - 81054
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
80952 atgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaatcacaaagaaaattatttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaata 81051  T
232 caa 234  Q
    |||    
81052 caa 81054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 14211 - 14324
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
14211 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 14309  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
14310 agcaagagtcttcta 14324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 54751 - 54638
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
54751 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 54653  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||| ||||||    
54652 agcaagagtcttcta 54638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6141 - 6056
Alignment:
150 caagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaataca 233  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| || ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
6141 caagagacttctgaattcaaacaaaattaca-agaaaaatggttgaggttgaatacttgatatacaatcagtggtgttcacaataca 6056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 43045 - 42557
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||||  ||||||| || |||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
43045 agagtcttctaatgctcaagcacgcaggccagaggcttctgatcaaacaaaaataccaagaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 42946  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | |    
42945 gttcacaatacaatacgttaaa-gactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatt-gac 42848  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||||  | |||    
42847 agagtttcggcgctttttaacttgtgtatctctttctaca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaag-gagacgttgagatgattagc 42750  T
421 acgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||| |    
42749 acgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattccca 42650  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtac 612  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||| |||| |||||||||||||||    
42649 tcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgatgtcttgtcttgtagcgaggaca-aaacagagtagtggaggtagtcgttgtacacttgtac 42557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 30863 - 31355
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
30863 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 30962  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
30963 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 31059  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctacc---gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
31060 agagttttggcgcttttaaacttatg----tatctctatcttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatc 31154  T
418 agcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
31155 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattc 31254  T
517 ctatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
31255 ccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 31354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 30758 - 30873
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
30758 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 30857  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
30858 -aagcaagagacttcta 30873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 43095 - 43035
Alignment:
101 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
43095 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 43035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 2743 - 2256
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
2743 agagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 2644  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| |  | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
2643 gttcacaatacaatac-gttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 2546  T
322 agagtttgggcgc-ttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagc 420  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    | | |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  |  ||    
2545 agagttttggcgctttttaacttgtgtatctctatcta-caatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagatgatttgc 2448  T
421 acgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccta 519  Q
    ||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
2447 acgtctaaagagtcgtttgtaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgattttggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattccca 2348  T
520 tcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgta 611  Q
    ||||||||| || || |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
2347 tcttgaaggcacaaaatctgcaagcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgta 2256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2847 - 2733
Alignment:
51 ataatcacacagattacaac-tgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 146  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
2847 ataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 2749  T
147 aagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||| ||||||    
2748 aagcaagagtcttcta 2733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 568
Target Start/End: Original strand, 6828 - 7283
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| |||    
6828 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacataatatacaatcagtgg 6927  T
221 tgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt--tgagaattaaa 315  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||  || |||  |||    
6928 tgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgcttttatgtgaaacaaa 7027  T
316 tttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct--accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagat 413  Q
    ||| |||||||||||||||||||   ||    |  |||||||     |||||||||||||||||| | |||||||| | |||| | |||| |||||||||    
7028 ttttgcagagtttgggcgcttttttttttacttgttgtctctcatttgatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtg-aaagagtcgttgagat 7126  T
414 c-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattc 512  Q
    | ||||||||||| | |||||||||| |   | || ||||  ||||| | || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |    
7127 ctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttcatcaatcaccaatgatattttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcc 7226  T
513 attcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
7227 attcctatcttgaaggaacttttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcg 7283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 104 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 20956 - 20449
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||     
20956 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacaaaaaattgtttgagtttgaacaa 20857  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
     | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||  |||    
20856 ataatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctgagt 20757  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc-ta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgt 395  Q
    |||||  || |||  ||| || |||||||||||||||| || ||||||     |||||| ||   |||||||||||||||||| | |||||||| | |||    
20756 gcttttatgtgaaacaaaattagcagagtttgggcgctctttacttgt-----tgtctcgtatttgatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgt 20662  T
396 gtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatga 494  Q
    | | |||| |||||||||| |||||||||||   |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
20661 g-aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcagtagagtcgttgtgaaacattgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatga 20563  T
495 aggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagat 593  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |    
20562 aggatcacgttcaaatccattcctatcttgaagg-acatttctacaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggt 20464  T
594 agtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||    
20463 agtggttgtacactt 20449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21029 - 20930
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
21029 gattacaactactcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 20931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Original strand, 11289 - 11760
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
11289 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaatagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 11388  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
11389 ttgatatgcaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacataagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 11488  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtg 396  Q
    | |||  || |||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||  |  ||| ||||   |||||| ||||||||||| | || ||||| ||||||    
11489 gattttatgtgaaacaaattttgcagtgtttgagcgcttttaacttgttgtcttgt-tctatttgatctttaagtcttcactcctttgtatagaggtgtg 11587  T
397 tagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaa 495  Q
     | ||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||  |||||||||  || ||||||||||    
11588 -aaagagttgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttacctgatttggtagttgtcctatgaa 11686  T
496 ggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
11687 ggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggatcaattctgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcg 11760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Original strand, 11146 - 11285
Alignment:
21 ttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccat--ctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  || |||||||||||||||    
11146 ttgcacttccaaggagattttcactcagtt-taatcacacagattacaactgctcaataccacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcag 11243  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
11244 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaatagacttc 11285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 11259 - 11315
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||||||||||  | || | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
11259 tgctcaagcactaaagcaatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 11315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 104 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 38667 - 38197
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
38667 tgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacac 38568  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   || |||||| ||||    
38567 ttgatatacaattagtggtgttcactatacaatgcaaatgaaagactctctagccttaagaatttctaagatatatcaaaggaacacataaattctaagt 38468  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct-accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtg 396  Q
    |||||  ||  |   || ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
38467 gcttttatgtaacacaattttagcagagtttgggcgcttttaaattgt-atcttgtctctcattgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 38369  T
397 tagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaa 495  Q
     | |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||  |     |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
38368 -aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtctttttgaaatcttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaa 38270  T
496 ggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
38269 ggatcacgttcaaatccattcctattttgatggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagc 38197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38740 - 38642
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||  || | |||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
38740 gattacaactgctcaatactacacctagtatgacacttca-aatttctcaggcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagactt 38642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 4481 - 4008
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||    
4481 tgctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttaaacac 4382  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
4381 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagt 4282  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctct--accgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgt 395  Q
    |||||  || |||  |||||| |||||||||||| ||||||   ||    |  |||||||     |||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
4281 gcttttatgtgaaacaaattttgcagagtttgggtgcttttttttttacttgttgtctctcatttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgt 4182  T
396 gtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatga 494  Q
    | | |||| |||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |   | |||||||  || || | || ||||| ||||||||| ||| ||| |||||    
4181 g-aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaataaagtcgttgtgaaaccttgatcaatcagcaatgatattttgcctgatttggatgttgtcttatga 4083  T
495 aggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
4082 aggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacttttctgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtagcg 4008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4554 - 4459
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaga 156  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||| || || ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
4554 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagaga 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 5)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 7692 - 8185
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| | |||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
7692 agagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 7791  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
7792 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 7888  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
7889 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatatctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagatagtcag 7985  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
7986 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 8085  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
8086 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 8185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 37483 - 36990
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| | |||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
37483 agagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 37384  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
37383 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 37287  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta-ccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaag 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||    
37286 agagttttggcgcttttgaacttatg--tatatctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagatagtcag 37190  T
420 cacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcct 518  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
37189 cacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattccc 37090  T
519 atcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
37089 atcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 36990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 7587 - 7702
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
7587 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 7686  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
7687 -aagcaagagacttcta 7702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37588 - 37473
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa----tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
37588 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 37489  T
146 aaagcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||||    
37488 -aagcaagagacttcta 37473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 457 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 47785 - 47624
Alignment:
457 ccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga--aggaacaattctgcaggcagagctgttat 554  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||   | |  |||||||||||||  |||||| |    
47785 ccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgt 47686  T
555 cttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
47685 tttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 47624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 329 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 18160 - 17878
Alignment:
329 gggcgcttttaacttgtgataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt--aagcacgtct 426  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
18160 gggcgcttttaacttgtcgtattgtctctgctgatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgtagagagacgttgagatcttttaagcacgtct 18061  T
427 aaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 526  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
18060 ataaagtcgttgagaacctttgatcattcaccattgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaa 17961  T
527 ggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
17960 ggaacatttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 17878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3297 - 3183
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
3297 agagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacaaaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 3199  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
3198 ggtgttcacaatacaa 3183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 2966 - 2802
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||| ||||| ||| | | |||||| |||||||||| |||||||  || || ||   ||||||||| |  ||||||||    
2966 tttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgtatccccattgagaaggaacattattgcaggca 2867  T
545 gagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
2866 gagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 2802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 7367 - 6875
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  | |||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| || |    
7367 agagacttctaatgatcaagcacgcaggcaagaaacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatacaatcagtgat 7268  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||||| | |    
7267 gttcacaatacaatacagtaaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaatt-gac 7171  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctctaccg---atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctta 417  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||    | |||||| |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  |     
7170 agagttttggcgcttttgaacttatg----tatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc 7076  T
418 agcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
7075 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattc 6976  T
517 ctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactt 614  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||  |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
6975 ccatcttgaacgtacaacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactt 6876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7470 - 7357
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
7470 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactgtctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 7372  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
7371 agcaagagacttcta 7357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 103 - 333
Target Start/End: Original strand, 32519 - 32750
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
32519 atgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaaca 32618  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtg 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
32619 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacaaagaaattcaaagtg 32718  T
301 cttttgagaattaaatttggcagagtttgggcg 333  Q
    | || | |||  |||||||||||||||||||||    
32719 c-ttggtgaaacaaatttggcagagtttgggcg 32750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 160
Target Start/End: Original strand, 32407 - 32546
Alignment:
23 gcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggc 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
32407 gcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaatttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggc 32506  T
121 gagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
32507 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 32546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 551 - 608
Target Start/End: Original strand, 9278 - 9335
Alignment:
551 ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
9278 ttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 9335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 265 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 13989 - 13641
Alignment:
265 ctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgataatgtctcta---cc 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| | || ||| |||||||| ||||||||| |||||||    || ||||||   ||    
13989 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt-gtgaaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgt----atatctctatctcc 13895  T
361 gatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccag 460  Q
     ||| ||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13894 aatcctcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaa-agagacgttgagatgattaccacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccag 13796  T
461 taatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtc 560  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||    
13795 taatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggaataattatgcaggcatagctgttgtcttgtc 13696  T
561 ttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||| ||||| |  ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
13695 ttgtagcgtggacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 13641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 5)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Original strand, 10250 - 10659
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacac 202  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
10250 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattatttgagtttgaacac 10349  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgc-aataaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||| | ||    
10350 ttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaattcaaatgaaagactctcttgacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacataaattctatgt 10449  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc--taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgt 395  Q
    |||||  || |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||     ||||||  |   |||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
10450 gcttttatgtgaaacaaattttgcagagtttgggcgctttttacttgt-----tgtctcatttttgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgt 10544  T
396 gtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatga 494  Q
    | | |||| | |||||||| ||||||||||| | |||||||||| |     |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
10545 g-aaagagtcattgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaatcttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatga 10643  T
495 aggatcaacttcaaat 510  Q
    |||||||| |||||||    
10644 aggatcaatttcaaat 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 502
Target Start/End: Original strand, 20151 - 20552
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacac 202  Q
    ||||||||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
20151 tgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaactgaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 20250  T
203 ttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaat---aaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagt 299  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| | ||    
20251 ttgatatacaatttgtggtgttcacaatacaatgcaaatgaaaaactctcttgacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacatagaaattctatgt 20350  T
300 gcttt--tgagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgtgataatgtctc--taccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgt 395  Q
    |||||  || |||  |||||| ||| |  |||||||||||| ||||||     ||||||  |    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
20351 gcttttatgtgaaacaaattttgcataaattgggcgctttttacttgt-----tgtctcgttttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgt 20445  T
396 gtagagagacgttgagatc-ttaagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatga 494  Q
    | | |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
20446 g-aaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtctttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatga 20544  T
495 aggatcaa 502  Q
    ||||||||    
20545 aggatcaa 20552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 158
Target Start/End: Original strand, 19975 - 20115
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||    
19975 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacg 20072  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagact 158  Q
    || || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
20073 caagcaagagacttccttttctcaagcactaaagcaagagact 20115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 160
Target Start/End: Original strand, 20123 - 20177
Alignment:
106 ctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
20123 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcaatcaagcaagagacttc 20177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 160
Target Start/End: Original strand, 10240 - 10276
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
10240 agacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 10276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2439 - 2191
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
2439 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagactt 2341  T
160 ctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgact-tgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagact 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||    
2340 ctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtgtgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaacacaatgcaattgaaagactctctagact 2241  T
256 taagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||||    
2240 taagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgctttt 2191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 363 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 2117 - 1912
Alignment:
363 tcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagt 461  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | |||| |||||||||||| |||||| || | |||||||||  |     |||||||  ||||| |    
2117 tctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagtcgttgagatctttaagcacatcaatagagtcgttctgaaaacttgatcaatcaccaat 2019  T
462 aatcttttgtctgatttgggt-gtagtcctatgaaggatcaac-ttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttg 558  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
2018 gatcttttgcctaatttgggttgttgtcctatgaaggatcaaagttcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttg 1919  T
559 tcttgta 565  Q
    |||||||    
1918 tcttgta 1912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 122 - 615
Target Start/End: Original strand, 12088 - 12579
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
12088 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagtggt 12187  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggc 321  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| |    
12188 gttcacaatacaatac-agaaaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaa-ttgac 12284  T
322 agagtttgggcgctttt-aacttgtg-at-aatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaa 418  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||   ||| | ||   ||||||||||||||| | | |||||||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
12285 agagttttggcgcttttgaacttatgtatctctgttttta---atcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtg-aaagagacgttgagataatca 12379  T
419 gcacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
12380 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcc 12479  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggaca-cactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     |||||||  | || |||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |  ||||  |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
12480 catcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagagtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 12579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 11985 - 12098
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
11985 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 12083  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
    |||||||||||||||    
12084 agcaagagacttcta 12098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5459 - 5323
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
5459 ccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctctagtatgagacttcccaaattctcaagcacgcag 5360  T
119 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5359 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 5323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7037 - 6831
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
7037 atgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaaca 6938  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa-taaaaga--ctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaag 298  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||    
6937 cttgatatacaatcagtgttgttcacattacaatgcaattgaaagactctctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaag 6838  T
299 tgctttt 305  Q
    |||||||    
6837 tgctttt 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 405 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 6799 - 6634
Alignment:
405 cgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaac 503  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |   | |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||      
6799 cgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacg 6700  T
504 ttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
6699 ttcaaatccattcctattctgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcg 6634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7139 - 7040
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
7139 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 7041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7066 - 7010
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
7066 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 7010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 362 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 52393 - 52136
Alignment:
362 atcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccag 460  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || |||    
52393 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagatgattaacacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcatcag 52295  T
461 taatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtc 560  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
52294 taatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttatgcaggcagagctgttatcttgtc 52195  T
561 ttgtagcg-ag---gacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||| |||| ||   |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
52194 ttgcagcgtaggtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 52136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 122 - 345
Target Start/End: Original strand, 909 - 1129
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||   |||    
909 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaaaacttgatatacaatatgtgg 1008  T
221 tgttcacaatacaatgc-aataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgc-ttttgagaattaaattt 318  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||| ||||| |||  ||| ||    
1009 tgttcacaatacaatgcaaatgaaagactc------taagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgctttttgtgaaacaaaatt 1102  T
319 ggcagagtttgggcgcttttaacttgt 345  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
1103 ggcagagtttgggcgctttttacttgt 1129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 400 - 564
Target Start/End: Original strand, 1198 - 1363
Alignment:
400 agagacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||   | || ||||   |||| | |||||||| |||||||||  || |||||||||||||    
1198 agagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgagaaaccttaatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaagga 1297  T
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgt 564  Q
    |||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||    
1298 tcatgttcaa-tccattcctatcttgaaggaacatttctgcatgcagagctgtttttcttgtcttgt 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 338
Target Start/End: Original strand, 5901 - 6110
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatac 232  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
5901 tgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatac 6000  T
233 aatgcaa-taaaagactcta--gacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttt-gagaattaaatttggcagagttt 328  Q
    ||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||| | |||  |||   ||||||||||    
6001 aatgcaaatgaaagactctatagacttaagaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattctaagtgctttttgtgaaacaaaaaaggcagagttt 6100  T
329 gggcgctttt 338  Q
    ||||||||||    
6101 gggcgctttt 6110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 19 - 134
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |    
19 agagacttctaatgttcaagcacaactgcaagagacttataaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacagtcagt 118  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
119 ggtgttcacaatacaa 134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 5815 - 5927
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | || |||||||||||     
5815 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagactt-caaattgctcaagcaca 5912  T
116 caggcgagagacttc 130  Q
    || || |||||||||    
5913 caagcaagagacttc 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 239
Target Start/End: Original strand, 35174 - 35311
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
35174 atgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattgtttgagtttgaaca 35273  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
35274 cttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaatgcaa 35311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 35030 - 35170
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || |||||||||||||    
35030 ccttgcacttccaaggagattttcactaagtt-taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgc 35127  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
35128 aggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactt 35170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 35145 - 35201
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||||||||||  | || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
35145 tgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 35201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 91; Significance: 9e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 122 - 304
Target Start/End: Original strand, 2421 - 2601
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
2421 agagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggt 2520  T
222 gttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttt 304  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
2521 gttcacaatacaatacaat-aaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt 2601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 419 - 615
Target Start/End: Original strand, 2824 - 3021
Alignment:
419 gcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||||||    
2824 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcc 2923  T
518 tatcttgaaggaac-aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
     ||||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| || ||||||||||||||||||||    
2924 catcttgagggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtattggttgtacacttgtacttt 3021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 2318 - 2431
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 147  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||  || | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
2318 ataatcaccaagattacaaatgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 2416  T
148 agcaagagacttcta 162  Q
     ||||||||||||||    
2417 tgcaagagacttcta 2431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 445 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6423 - 6252
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-aattctgcaggc 543  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||||||    
6423 tttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatctttaaggcacaaattttgcaggc 6324  T
544 agagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
6323 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 455 - 615
Target Start/End: Original strand, 1 - 162
Alignment:
455 caccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggcagagctgtta 553  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||     
1 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaatttattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttg 100  T
554 tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
101 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 13941 - 14084
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaaga--aataatcacacagattacaactgctcaataccatctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
13941 ccttgcacttccaaggagatttccactaaaatcaataatcacacagattacagatgctcaatactctctagtatgagacttatcaaatgctcaagcacac 14040  T
117 aggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
14041 aggcaagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 14084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 239
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9635
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa--gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaac 200  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
9497 tgctcaagcacacagacaagagacttcctatgctcaagcactaaaaagcaagagacttctattcaaacagtattacacagaaaattgtttgagtttgaac 9596  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaa 239  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
9597 acttgatataccatcagtggtgttcacagtacaatgcaa 9635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 248 - 568
Target Start/End: Original strand, 16632 - 16954
Alignment:
248 tctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttt--gagaattaaatttggcagagtttgggcgcttttaacttgt 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |   || |||||| ||||||||||  | |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
16632 tctagacttaagaaattctaagatatatcaaatgaacacataaattctaagtgcttttatgtgaaacaaatttagcagagttttggcgcttttaacttgt 16731  T
346 gataatgtctctaccgatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatctt-aagcacgtctaaagagtcgttgagttcc 444  Q
      |   ||||| |   ||||||| || |||||| | |||||||| |||||| | |||  ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |   |    
16732 tgtctcgtctc-atttatcttcaggttttcactcctttatatagaggtgtgaa-agattcgttgaggtctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaac 16829  T
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggca 544  Q
     |||||||  ||||| | ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||    
16830 cttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacatttatgcaggca 16929  T
545 gagctg-ttatcttgtcttgtagcg 568  Q
    |||||| || |||||||||||||||    
16930 gagctgtttttcttgtcttgtagcg 16954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Original strand, 9424 - 9523
Alignment:
62 gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||  |  ||||||||||    
9424 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagactccctttgctcaagcacacagacaagagactt 9522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2799 - 2652
Alignment:
188 gtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
2799 gtttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttctcaatacaaaacaat-aaagactctcgactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgca 2702  T
288 gaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagagtttgggcgctttt 338  Q
    ||||||||  |||||||  |||| | |||||| |||||||| |||||||||    
2701 gaaattcagtgtgctttgtagaa-tcaatttgacagagttttggcgctttt 2652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4599 - 4464
Alignment:
99 ccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttg 197  Q
    |||||| ||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||  |||    
4599 ccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcaccaaagcaagagacttctaaacaaacacaattaca-agaaaaatgtttgaggttg 4501  T
198 aacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
4500 aacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 4464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2048 - 1962
Alignment:
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
2048 gcaagagacttctattcaaacagaattacaaaaaattttgtttgaggttgaacacttggtatacaatcagcggtgttcacaatacaa 1962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8320 - 8260
Alignment:
102 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
8320 aatgctcaagcacacaagcaagaggcttccaatgctcaagcatacaagaaagagacttcta 8260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 9502 - 9615
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
9502 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaattagtgg 9601  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
9602 tgttcacaatacaa 9615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 9830 - 9995
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |   |||| ||||| |  |||||||    
9830 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccatttcaagtatgaatgaacattgttgcaggc 9929  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | ||||||||| |||||||||||||   ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||||    
9930 atagctgttatccttgtcttgtagcagcgacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 9995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21542 - 21429
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
21542 agagacttctaatgctcaagcccaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagtgg 21443  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
21442 tgttcacaatacaa 21429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2542 - 2427
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa-cacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |    
2542 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttttgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagtgaaacacttgatatacaatcagt 2443  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
2442 ggtgttcacaatacaa 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 21189 - 21043
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| || |||| |||||| |   ||| |||||| |  |||||||| ||||||| | |||||||    
21189 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttgaaatccattccaagtgtgacggaacattgttgcaggcaaagctgtttttcttgtct 21090  T
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||   |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
21089 tgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 21043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 29339 - 29452
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
29339 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagaggcttatattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 29438  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
29439 tgttcacaatacaa 29452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 99775 - 99660
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
99775 agagacttctattgctcaagcacaaatgcaatagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcaat 99676  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
99675 ggtgttcacaatacaa 99660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20035 - 19880
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
20035 agagatttctaatgctcaagcacaactgcaaatgacttctaattcaaacagaattacacaaaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 19936  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    |||||||||||||||  |||  | |||||||  |||||  ||||||||||||||||    
19935 gtgttcacaatacaaatcaaatacagactcttaagactctagaatttctaagatat 19880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 19690 - 19588
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtct 561  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
19690 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaagaaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtct 19591  T
562 tgt 564  Q
    |||    
19590 tgt 19588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 74127 - 74240
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||    
74127 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttaaacacttgatatacaatcagtgg 74226  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    || |||||||||||    
74227 tgatcacaatacaa 74240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 165214 - 165125
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga 193  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
165214 tgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaattgtttga 165125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 65974 - 65859
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
65974 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 65875  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
65874 ggtgttcacaatacaa 65859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 145019 - 144904
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
145019 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 144920  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
144919 ggtgttcacaatacaa 144904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 229
Target Start/End: Original strand, 59086 - 59212
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaaca 201  Q
    ||||||||||||  | || ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||    
59086 atgctcaagcacaaatgcaagatacttcctatgctcaaccacaaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacaaagaaaa-tgtttgaggttgaaca 59184  T
202 cttgatatacaatcaatggtgttcacaa 229  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||    
59185 tttgacatacaatcagtggtgttcacaa 59212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 165330 - 165204
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacaca-gattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  || |||||||||||     
165330 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaaatgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcaca 165233  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcac 144  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||    
165232 caggcaagagacttcctttgctcaagcac 165204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 527 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 165100 - 165018
Alignment:
527 ggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| ||||||| ||||||||    
165100 ggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 165018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 251160 - 251260
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatac 232  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||| |||||||  ||||   || ||  || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
251160 atgctcaagcacaaaagcagaagacttctaaacaaaca-aattacaatgaaataagtctggtttcaacatttgatatacaatcagtggtgttcacaatac 251258  T
233 aa 234  Q
    ||    
251259 aa 251260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 221 - 107
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||    
221 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaaatgtttgaagttgaacaattgatatacaatcagtg 122  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
121 gtgttcacaatacaa 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 1203 - 1317
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
1203 agagacttcaaatgctcaagcacgactgcaagagacttctaattcaaacagaattacatagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 1302  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
1303 gtgttcacaatacaa 1317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 1534 - 1699
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||   || |||||| |  |||||||    
1534 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacattgttgcaggc 1633  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||   |||| |  ||  || |||||| ||||||||||||||||    
1634 agagctgtttttcttgtcttctagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 1699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 268353 - 268439
Alignment:
149 gcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
268353 gcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 268439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 83936 - 84050
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | || ||||||| || | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
83936 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcgaacagaactaaa-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 84034  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
84035 ggtgttcacaatacaa 84050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 566
Target Start/End: Original strand, 84269 - 84392
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||  ||||||||||    |||||||    
84269 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccaatccaattgtgaaggaacatcgttgcaggc 84368  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtag 566  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
84369 agagctgtttttcttgtcttgtag 84392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 533
Target Start/End: Original strand, 19247 - 19383
Alignment:
400 agagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaagga 498  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||    
19247 agagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttgagga 19346  T
499 --tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa 533  Q
      | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
19347 atttaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaa 19383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 17414 - 17067
Alignment:
189 tttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcac-aatacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttct-aagatatatcaaatc-agtg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  | | |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
17414 tttgacttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaaatacaatac-gttagagactctagacttttgaatttctaaagatgtatcaaatcaagtg 17316  T
286 -cagaaattcaaagtgcttttgagaattaaatttggcagag-tttgggcg---cttttaacttgtgata-atgtctctaccgatcttcaagtcttcactt 379  Q
     ||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||| ||||| ||||||||    ||||||||||| ||| || | |||| | |||||||||||||||||     
17315 tcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaaattgacagagttttgggcgtcttttttaacttgt-atatatctatcta-caatcttcaagtcttcactc 17218  T
380 ccttatatagtggtgtgtagagagacgttgaga-tcttaagcacgtctaaag-agtcgtt--gagttcctttgatcatccaccag-taatcttttgtctg 474  Q
    | |||||||  |||||| | ||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||    
17217 ctttatataaaggtgtg-aaagagacgttgagattgattagcacgtctaaagtagtcgtttgaaattcctttgatcattcaccagttaatcctttgcctg 17119  T
475 atttgggtgta-gtcctatgaaggatcaacttcaaa--ttcattcctatctt 523  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | || |||||||||  |||||||| |||||    
17118 atttgggtgtaggtcctttgaggaattaacttcaaaatttcattcccatctt 17067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 306
Target Start/End: Original strand, 19020 - 19140
Alignment:
188 gtttgacttgaacacttgata-tacaatcaatggtgttcacaatacaatgcaataaaagactctag-acttaagaatttctaagatatatcaaatcagtg 285  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  | | ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
19020 gtttgacttgaacacttgataatacaatcagtggtgttcacaatacaatac-gttagagactctagtacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtg 19118  T
286 -cagaaattcaaagtgcttttg 306  Q
     ||||||||||  |||||||||    
19119 acagaaattcagtgtgcttttg 19140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Original strand, 158655 - 158764
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||    
158655 agagacttcctatgctcaagcacacaagaaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaaaacttgatatacaatcagtgg 158754  T
221 tgttcacaat 230  Q
    ||||||||||    
158755 tgttcacaat 158764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 36943 - 37058
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaat-tgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||||| | |||||||||||||| | ||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
36943 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagggacttctaattcaaacagaattacaaaaaaaaaatgtttgaggttgaacacttgatataaaatcagt 37042  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
37043 ggtgttcaaaatacaa 37058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 135003 - 135118
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaat-tgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||||| | |||||||||||||| | ||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
135003 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagggacttctaattcaaacagaattacaaaaaaaaaatgtttgaggttgaacacttgatataaaatcagt 135102  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||||    
135103 ggtgttcaaaatacaa 135118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 517
Target Start/End: Original strand, 37276 - 37349
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
37276 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc 37349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 517
Target Start/End: Original strand, 135336 - 135409
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
135336 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc 135409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 144451 - 144564
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
144451 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcattgg 144550  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||| ||||||||||    
144551 tgtccacaatacaa 144564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 517
Target Start/End: Original strand, 144799 - 144853
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||||    
144799 atcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggattaatttcaaattcattcc 144853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 13115 - 13230
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
13115 agagacttctaatgttcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 13214  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
13215 ggtgttcacaatacaa 13230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 7369 - 7484
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
7369 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 7468  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
     ||||||||| |||||    
7469 agtgttcacagtacaa 7484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 486 - 562
Target Start/End: Original strand, 7740 - 7817
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtctt 562  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||    
7740 gtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtctt 7817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14816
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
14661 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaaacttcaaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 14760  T
220 gtgttcacaatacaatgcaataaaagactct--agacttaagaatttctaagatat 273  Q
    | |||||||||||||  ||   | |||||||  |||||| ||||||||||||||||    
14761 gcgttcacaatacaaatcagatacagactcttaagactttagaatttctaagatat 14816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 6)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 210942 - 211057
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
210942 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 211041  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
211042 ggtgttcacaatacaa 211057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 244846 - 244734
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||| |||||||||||||||| |||    
244846 agagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagagttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggttgaa-acttgatatacaatcagtgg 244748  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
244747 tgttcacaatacaa 244734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 219784 - 219897
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||    
219784 agagacttcttatgttcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtgtgaggttgaacacttgatatacaatcagcgg 219883  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
219884 tgttcacaatacaa 219897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 87950 - 88063
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || | |||||||  || ||||||||||||||||||| |||    
87950 agagacttcctatgctcaagcgcaactgcaagagacttctattcaaatagaattacagataacaatgtttgaggttaaacacttgatatacaatcagtgg 88049  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
88050 tgttcacaatacaa 88063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 378114 - 377999
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   ||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |    
378114 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttccaaattcaaatagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgacatacaatcagt 378015  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
378014 ggtgttcacaatacaa 377999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 377796 - 377630
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcagg 542  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | || |||| || |  ||||||    
377796 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc-atatatgtaggagcattcttgcagg 377698  T
543 cagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttg 609  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||    
377697 cagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttg 377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 234
Target Start/End: Original strand, 3797 - 3931
Alignment:
101 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacaca-gaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    |||| ||||||||| || || | ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| | ||||  |||||    
3797 aaatactcaagcacacaagcaaaagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacacaattacacaggaaaaatatttggattgaa 3896  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
3897 cacttgatatacagtcagtggtgttcacaatacaa 3931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6259 - 6144
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
6259 agagacttttaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 6160  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
6159 ggtgttcacaatacaa 6144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5885 - 5762
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 584  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||| |  ||||| | |||||||||| |||||||||||||   ||||||  | | ||    
5885 gtcctatgaacgatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacattgttgcagacggagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagt 5786  T
585 cgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
5785 agtggagatagtagttgtacactt 5762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 88169 - 88054
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
88169 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgacgttgaacacttgatatacaatcagt 88070  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| ||||||    
88069 ggtgttcacgatacaa 88054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Original strand, 7496 - 7583
Alignment:
150 caagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7496 caagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 7583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 59560 - 59675
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |    
59560 agagacttctaattctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacaattgatatacaatcagt 59659  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
59660 ggtgttcacaatacaa 59675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 7800 - 7965
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||  |||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||||||| |   ||||||    
7800 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcctagtatgtaggaacattgtagcaggc 7899  T
544 agagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   ||||||  |   || |||||||||||||||||||||||    
7900 agagctgttatctttgtcttgtagcagagacacaaacttcgtagtggagatagtggttgtacactt 7965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 59890 - 60055
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | ||| ||||||||||| | ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||    
59890 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcttatgaaggatcgatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 59989  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   ||||||  | | || |  ||||||||||||||||||||    
59990 agagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacactt 60055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 103126 - 103229
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
103126 atgctcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcaatggtgtatacaat 103225  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
103226 acaa 103229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Original strand, 5727 - 5840
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
5727 agacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttttgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtgg 5826  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
5827 tgttcacaatacaa 5840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 839 - 729
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |    
839 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagatacttctattcaaatagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtag 740  T
221 tgttcacaata 231  Q
    |||||||||||    
739 tgttcacaata 729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Original strand, 5737 - 5850
Alignment:
124 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
5737 agacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttttgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagtgg 5836  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
5837 tgttcacaatacaa 5850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 864 - 976
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | |    
864 agagacttcatatgctcaagcacacaagcaagagacttctatt-aaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtag 962  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    || |||||||||||    
963 tgctcacaatacaa 976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 214
Target Start/End: Original strand, 2204 - 2297
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaat 214  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
2204 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaggttgaacatttgatatacaat 2297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3985 - 3849
Alignment:
99 ccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttg 197  Q
    |||||| |||||||||  | || ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| | |||||||  |||    
3985 ccaaatactcaagcacataagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttataaacaaacacaattacacagaataatgtttgagattg 3886  T
198 aacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
3885 aacacttaatatacaatcagcggtgttcacaatacaa 3849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1945 - 1884
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac 80  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
1945 ccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatac 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 22558 - 22670
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||    
22558 agagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaaaagaattacaaagaaaa-tgtttaaggttgaacacttgatataccatcagtgg 22656  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    | || |||||||||    
22657 tatttacaatacaa 22670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Original strand, 5189 - 5288
Alignment:
136 ctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
5189 ctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacataattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgtgcacaatacaa 5288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Original strand, 2776 - 2885
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||    
2776 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaaggaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcggtgg 2875  T
221 tgttcacaat 230  Q
    ||||| ||||    
2876 tgttcgcaat 2885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32352 - 32239
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
32352 agagacttcatatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaacagaattacaatgaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 32253  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    | |||| |||||||    
32252 ttttcataatacaa 32239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 11740 - 11855
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| |    
11740 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgataaacaatcagt 11839  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
11840 ggtgttcacaatacaa 11855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 19621 - 19733
Alignment:
123 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||| || |    
19621 gagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaagaaacacaattacacagaaaaatatttgagattgaacatttgatatacaatcagtgat 19720  T
222 gttcacaatacaa 234  Q
    ||||| |||||||    
19721 gttcataatacaa 19733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18334 - 18219
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
18334 agagacttctattgctcaagcacaactgcaacagacttctcaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttgaacacttgatatataatcagt 18235  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
18234 ggtgttcacaatacaa 18219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 17909 - 17837
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
17909 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 17837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16285 - 16170
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |    
16285 agagacttctattgctcaagcacaacggcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttaaacacttgatatacaatcagt 16186  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||| |||||    
16185 ggtgttcacactacaa 16170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25945 - 25830
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |    
25945 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaagttaaacacttgatatacaatcagt 25846  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||| |||||    
25845 ggtgttcacactacaa 25830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 256 - 363
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
256 agagacttactatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattaaaaagaaaa-tgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 354  T
221 tgttcacaa 229  Q
    |||||||||    
355 tgttcacaa 363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 90596 - 90513
Alignment:
150 caagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
90596 caagagacttctaaattcaaacaaaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtagtgttcacaata 90513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22698 - 22584
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct-agt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
22698 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcttagttcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 22600  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
22599 ggtgttcacaatacaa 22584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 18574 - 18687
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||  | ||||||||||||| | ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |    
18574 agagacttctaatgctcaagcagaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattata-agaaattt-tttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 18671  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
18672 ggtgttcacaatacaa 18687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1439 - 1331
Alignment:
127 cttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac--ttgaacacttgatatacaatcaatggtgtt 224  Q
    ||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||    
1439 cttcctatgcttatgcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaaattacacagaaaat-gcttgaggtttgaacacttgatatacaatcagtggtgtt 1341  T
225 cacaatacaa 234  Q
    ||||||||||    
1340 cacaatacaa 1331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 234
Target Start/End: Original strand, 7645 - 7749
Alignment:
128 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcac 227  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
7645 ttcctatgctcaagcataaaagcaagagacttctaaacaaaca-aatcacacagaaataagtttga-ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcac 7742  T
228 aatacaa 234  Q
    |||||||    
7743 aatacaa 7749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 547 - 435
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||   | |    
547 agagacttcatatgctcaagcacacaagcaagagacttcta-ttaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatttgttg 449  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
448 tgttcacaatacaa 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2359 - 2246
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| ||||||||| || |  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |  |||||||||||||||||||||| |||    
2359 agagacttcctatgctcaagtacaactgcaatagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttttttaaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 2260  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||| |||||    
2259 tgttcacagtacaa 2246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 2012 - 1958
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
2012 atctgttgtctgatttggttatcgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10674 - 10561
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |   ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||    
10674 agagacttctgatgctcaagcacaactacaagagacttctaatcaaagataattacaaagaaaaatgtttgagtttgaacacttgatatacaaccattgg 10575  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
10574 tgttcacaatacaa 10561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15338 - 15225
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |   ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||    
15338 agagacttctgatgctcaagcacaactacaagagacttctaatcaaagataattacaaagaaaaatgtttgagtttgaacacttgatatacaaccattgg 15239  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
15238 tgttcacaatacaa 15225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 10345 - 10180
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||  |||||||| |    ||| |||    
10345 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatcaattccaattgtgaaggaatatcgttgctggc 10246  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || |||||||||||||    ||||||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||    
10245 agagctgtttttcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 10180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 15009 - 14844
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||  |||||||| |    ||| |||    
15009 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatcaattccaattgtgaaggaatatcgttgctggc 14910  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || |||||||||||||    ||||||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||    
14909 agagctgtttttcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 14844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37299 - 37187
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||  ||    
37299 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaatcgtttaaggttgaacactt-atatacaatcagagg 37201  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
37200 tgttcacaatacaa 37187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 41706 - 41818
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||  ||    
41706 agagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaatcgtttaaggttgaacactt-atatacaatcagagg 41804  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||    
41805 tgttcacaatacaa 41818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 226
Target Start/End: Original strand, 76759 - 76864
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgttt-gacttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||    
76759 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttcgggttgaacacttgatatacaatcagtgg 76858  T
221 tgttca 226  Q
     |||||    
76859 cgttca 76864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1026 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1026
Description:

Target: scaffold1026; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 232
Target Start/End: Original strand, 2609 - 2739
Alignment:
103 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga--cttgaac 200  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  ||| |||||||   ||||||    
2609 atgctcaagaacacacgcaagagacttcctgtgctcaagaacaaaagcaagagacttctactcaaatagaattacaaatcaaa-tgtttgaggtttgaac 2707  T
201 acttgatatacaatcaatggtgttcacaatac 232  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||    
2708 acttgatatacaatcagtgctgttcacaatac 2739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 7366 - 7480
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt-gaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |    
7366 agagacttataatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgaggtcgaacacttgatatacaatcagt 7464  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
7465 ggtgttcacaatacaa 7480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 7579 - 7742
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||| ||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    |||||||    
7579 ctttgatcaatcaccaatgatctattgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggc 7678  T
544 agagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||| |||  | || |||||| ||||||||||||||||    
7679 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaact--gagtagtggaggtagtggttgtacactt 7742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 393
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  |||||||| |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
508 agagacttgtaatgctcaagcacaactgcaagagaattctaaattcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 409  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
408 ggtgttcacaatacaa 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 248 - 318
Alignment:
165 caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
248 caaacagaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcaaaatacaa 318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 18741 - 18848
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||    
18741 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaatagaattacaaagaaaa-tgtttgaggttgaacacttgatataaaatcagtgg 18839  T
221 tgttcacaa 229  Q
    |||| ||||    
18840 tgtttacaa 18848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 524 - 615
Target Start/End: Original strand, 7362 - 7453
Alignment:
524 gaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
7362 gaaggaacatttatgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 7453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 8699 - 8813
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
8699 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttcataattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgagcttgaacacttgatatataatcagt 8797  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
8798 ggtgttcacaatacaa 8813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 608
Target Start/End: Original strand, 9072 - 9194
Alignment:
487 tcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtc 585  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  ||||||||   |||| ||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||   |||| |  ||  ||     
9072 tcctaagaaggatcaatttcaaatgtattcctattgagaagaaacaatgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacacagta 9171  T
586 gtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||||||||    
9172 gtggagatagtggttgtacactt 9194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 532 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 8179 - 8096
Alignment:
532 aattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
8179 aattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 8096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27994 - 27887
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac--ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||    
27994 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcta----aacagaattacacagaaaaatgtttgagggttgaacacttgatatacaatcagtg 27899  T
220 gtgttcacaata 231  Q
     | |||||||||    
27898 attttcacaata 27887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Original strand, 9449 - 9561
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct---agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||   | ||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||     
9449 agagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcttaaattcaaacataattacaaagaaaattgttttaggttgaacacttgatatacaatcac 9548  T
218 tggtgttcacaat 230  Q
    | |||||||||||    
9549 tagtgttcacaat 9561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 517
Target Start/End: Original strand, 9780 - 9853
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 517  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
9780 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc 9853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2554 - 2440
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatg 219  Q
    ||||||||| |||| ||||| || |  | |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||    
2554 agagacttctaatgttcaagtacaactgaaagagacttctaattcaaacagaattacaaagaaaaatatttgaggttgaacacttgatatacaatcagtg 2455  T
220 gtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||    
2454 gtgttcacaatacaa 2440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 2229 - 2107
Alignment:
444 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||  ||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  |||||||    
2229 ctttgatcaatcaccattgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattccaagtatgtaggaacattgttgcaggc 2130  T
544 agagctgtta-tcttgtcttgta 565  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
2129 agagctgttattcttgtcttgta 2107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0774
Description:

Target: scaffold0774; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 562 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 6450 - 6397
Alignment:
562 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
6450 tgtagcgaggacacactcaaggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 6397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Original strand, 9508 - 9601
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagt-caaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaa 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||    
9508 agagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaaatgtttgaggttgaacatttgatatacaa 9601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5866 - 5778
Alignment:
149 gcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
5866 gcaagagacttctaaattcaaacagaattataatgaaaattgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 5778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5469 - 5397
Alignment:
537 tgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||    
5469 tgcaggcagagctgttatccttttcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 5397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 78923 - 78809
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
78923 agagacttctattactcaagcacaactgcaagagacttctcaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttgatgttgaacacttgatatacaatcatt 78825  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||| |||||||||    
78824 ggtgtttacaatacaa 78809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 265 - 380
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
265 agagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttctaaattcaaacaaaattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 364  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||| |||||    
365 ggtgttcacagtacaa 380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9577 - 9494
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatca 216  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||    
9577 atgctcaatcacaaaagcaaaagacttctaaacaaacaaaattacacagaaaaatgtttggtttgaacacttgatatactatca 9494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1657 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1657
Description:

Target: scaffold1657; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 1396 - 1498
Alignment:
133 atgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaata 231  Q
    |||||||| |||  |||||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
1396 atgctcaaccacataagcaagaaaattctaatcaaacaaaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatctacaatcagtggtgttcacaata 1495  T
232 caa 234  Q
    |||    
1496 caa 1498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 2893 - 2963
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
2893 tcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 2963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19191 - 19078
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |   |||||||||||||||  | ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| |    
19191 agagacttctaatgctcaagcacaattgcaagagacttccaaattcaaacagaattacaatgcaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacagtcagt 19092  T
219 ggtgttcacaatac 232  Q
    ||||||||||||||    
19091 ggtgttcacaatac 19078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 59 - 1
Alignment:
104 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 162  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
59 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 499 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 15804 - 15694
Alignment:
499 tcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctg-ttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtg 597  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||| || ||||||||||||    
15804 tcaagttcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggagatagtg 15705  T
598 gttgtacactt 608  Q
    || ||||||||    
15704 gtcgtacactt 15694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 175 - 33
Alignment:
19 ccttgcacttctaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatac--catctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacg 115  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||| ||| |||||  || |||||||||||     
175 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtttgacacttca-aattgctcaagcaca 78  T
116 caggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 160  Q
    ||| | ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
77 cagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttc 33  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 13588 - 13701
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||| || || | |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
13588 agagacttcttatgctcaagtacacaagcaagagacttctattaaaacaaaaatataaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtgg 13687  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    || |||||||||||    
13688 tgctcacaatacaa 13701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1211 - 1109
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
1211 tgctcaagcacaactgcaagagacttttgaattcaaacataattaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 1113  T
231 acaa 234  Q
    ||||    
1112 acaa 1109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 2524 - 2638
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctag--tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||||||   ||||||||||  ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
2524 agagacttataatgctcaagcacaactgcaaaagacttctaaattcaaacagaaaaaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 2622  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||||||    
2623 ggtgttcacaatacaa 2638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 567
Target Start/End: Original strand, 2900 - 2980
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagc 567  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||||    
2900 gtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggagcatcgttgcaggcagagctgtt-ttttgtcttgtagc 2980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 31296 - 31395
Alignment:
138 caagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgttt--gac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||   || |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31296 caagcacaaaagcaagagacgtctaaacaaacacaattacacagatttttttttttgaggttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 31395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44414 - 44342
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaat 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
44414 tcaaacagaattacaaagaaatttatttgaggttgaacacttgataaacaatcagtggtgttcacaatacaat 44342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 5594 - 5664
Alignment:
164 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
5594 tcaaacagaattata-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 5664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1377 - 1277
Alignment:
134 tgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaat 230  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |  | ||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
1377 tgctcaagcacaactgcaagagactttttaattcaaacataattacaatgaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaat 1278  T
231 a 231  Q
    |    
1277 a 1277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16695 - 16582
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttga-cttgaacacttgatatacaatcaatgg 220  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || |||||  |||||||||| ||||||||||| |||    
16695 agaggcttcctatgctcaagctcaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaatatttttttttgaggttgaacactttatatacaatcagtgg 16596  T
221 tgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||| ||||    
16595 tgttcacaagacaa 16582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26209 - 26121
Alignment:
149 gcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
26209 gcaagagacttcttaattcaaacagaattacaaagacaaatgtttgaggttgaacacttgatagacaatcagtggtgttcacagtacaa 26121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35374 - 35258
Alignment:
122 agagacttccaat-gctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaa 217  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||     
35374 agagacttcaaattgctcaagcacaattgcaagagacttcttaattcaaacataattacaaagaattttttttgaggttgaacacttgatatacaatcag 35275  T
218 tggtgttcacaatacaa 234  Q
    ||||||||||| |||||    
35274 tggtgttcacagtacaa 35258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7308 - 7194
Alignment:
122 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct--agtcaaacagaattacacagaaaattgtttgac-ttgaacacttgatatacaatcaat 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |    
7308 agagacttctattgctcaagcacaacggcaagatacttctcaattcaaacagaattaca-agaaaaatgtttaaggttgaacacttgatatacaatcagt 7210  T
219 ggtgttcacaatacaa 234  Q
      ||||||||||||||    
7209 tttgttcacaatacaa 7194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7650 - 7611
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatacaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
7650 ttgaacacttgatatacaatcagtggtgttcacaatacaa 7611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 232
Target Start/End: Original strand, 4920 - 5048
Alignment:
100 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctagtcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||| || || ||| | |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||| ||||| | |||| |  |||||  |||||    
4920 caaatactcaagcacacaagcaagatatttcctatgctcaagcacaaa--caagagacttctaaacaaaca-aattagaaagaataa-gtttggtttgaa 5015  T
200 cacttgatatacaatcaatggtgttcacaatac 232  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||    
5016 aacttgatatacaatcagtggtgttcacaatac 5048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 12125 - 12248
Alignment:
486 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatc-ttgtcttgtagcgaggacacactcaggg 583  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || | || ||||||| |  || ||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||| || | |    
12125 gtcctctgaagaatcaatttcaaattcattcc-atgtatgtaggaacattggtgtaggcagagcagttatccttgtcttgtagcagagacacaatctgag 12223  T
584 tcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
12224 tagtggagatagtggttgtacactt 12248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 26193 - 26090
Alignment:
463 atcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtc 560  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||    
26193 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcc-atgtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccttgtc 26095  T
561 ttgta 565  Q
    |||||    
26094 ttgta 26090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 554 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 1755 - 1694
Alignment:
554 tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtacttt 615  Q
    |||||||||||||||  |||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
1755 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 1694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0683 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:

Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 232
Target Start/End: Original strand, 9 - 46
Alignment:
195 ttgaacacttgatatacaatcaatggtgttcacaatac 232  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
9 ttgaacacttgatatactatcagtggtgttcacaatac 46  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 608
Target Start/End: Original strand, 14523 - 14687
Alignment:
445 tttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatct-tgaaggaacaattctgcaggc 543  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | |  |||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || | || ||||||| |  |||||||    
14523 tttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattatcctctgaagtatcaatttcaaatccattcc-atgtatgtaggaacattgttgcaggc 14621  T
544 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 608  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||||    
14622 agagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 14687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 103
Target Start/End: Original strand, 23399 - 23452
Alignment:
51 ataatcacacagattacaactgctcaataccatct-agtatgagacttcccaaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    
23399 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 23452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University