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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13899_high_73 (Length: 227)

Name: NF13899_high_73
Description: NF13899
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13899_high_73
NF13899_high_73
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (8-227)||(36435354-36435572)
chr5 (6-227)||(36445257-36445472)
chr5 (6-227)||(36467726-36467941)
chr5 (23-81)||(36411013-36411067)
chr5 (159-218)||(36411144-36411203)
chr5 (54-137)||(36475637-36475716)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 227
Target Start/End: Original strand, 36435354 - 36435572
Alignment:
Q  8 ataacgcattcatcatttttt-ggaaaagcttaattatcatcgttacaaatacatagtctgatgcaaatttatacatatgatttccaccgatgaaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||    
T  36435354 ataacgcattcatcatttttttggaaaagcttaataatcatcgttacaaatacatagtctgatgcaaatttatacat--gatttctcccgaagaaatatc 36435451  T
Q  107 tatctatactatatagtggcaagatagataaatacaccattatatcaacacacaacattatttttattcatgaaatatattactgagagagaatgcatga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||     
T  36435452 tatctatactatatagtggcaagatagataaatacaccattatatcaacacacaacattatttttattcatgaaatatattactgagaaagagtacatgg 36435551  T
Q  207 tgcatgaagatagatatcatt 227  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36435552 tgcatgaagatagatatcatt 36435572  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 227
Target Start/End: Original strand, 36445257 - 36445472
Alignment:
Q  6 agataacgcattcatcattttttggaaaagcttaattatcatcgttacaaatacatagtctgatgcaaatttatacatatgatttccaccgatgaaatat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||    
T  36445257 agataacacattcatcattttttggaaaagctta----tcatcattacaaatacatagtctgatgcaaatttatacat--gatttctcccgaagaaatat 36445350  T
Q  106 ctatctatactatatagtggcaagatagataaatacaccattatatcaacacacaacattatttttattcatgaaatatattactgagagagaatgcatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36445351 ctatctatactatatagtggcaagatagataaatacaccattatatcaacacacaacattatttttattcatgaaatatattactgagaaagagtgcatg 36445450  T
Q  206 atgcatgaagatagatatcatt 227  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  36445451 gtgcatgaagatagatatcatt 36445472  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 227
Target Start/End: Original strand, 36467726 - 36467941
Alignment:
Q  6 agataacgcattcatcattttttggaaaagcttaattatcatcgttacaaatacatagtctgatgcaaatttatacatatgatttccaccgatgaaatat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||    
T  36467726 agataacacattcatcattttttggaaaagctta----tcatcattacaaatacatagtctgatgcaaatttatacat--gatttctcccgaagaaatat 36467819  T
Q  106 ctatctatactatatagtggcaagatagataaatacaccattatatcaacacacaacattatttttattcatgaaatatattactgagagagaatgcatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36467820 ctatctatactatatagtggcaagatagataaatacaccattatatcaacacacaacattatttttattcatgaaatatattactgagaaagagtgcatg 36467919  T
Q  206 atgcatgaagatagatatcatt 227  Q
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T  36467920 gtgcatgaagatagatatcatt 36467941  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 81
Target Start/End: Original strand, 36411013 - 36411067
Alignment:
Q  23 ttttttggaaaagcttaattatcatcgttacaaatacatagtctgatgcaaatttatac 81  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36411013 ttttttggaaaagctta----tcatcgttacaaatacatagtcttatgcaaatttatac 36411067  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 218
Target Start/End: Original strand, 36411144 - 36411203
Alignment:
Q  159 caacattatttttattcatgaaatatattactgagagagaatgcatgatgcatgaagata 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||| ||||    
T  36411144 caacattatttttattcatgaaatatattactaagaaagagtgtatggtgcatgatgata 36411203  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 137
Target Start/End: Original strand, 36475637 - 36475716
Alignment:
Q  54 aaatacatagtctgatgcaaatttatacatatgatttccaccgatgaaatatctatctatactatatagtggcaagatagataa 137  Q
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T  36475637 aaatacatagattgttgcaaatttatac--atgatttccactaatgaaatatctatat-tac-atatagtgacaagatagataa 36475716  T

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