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Alignment Overview

Query: NF13946_low_31 (Length: 255)

Name: NF13946_low_31
Description: NF13946
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13946_low_31
NF13946_low_31
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (41-248)||(2449275-2449484)
chr4 (39-225)||(48807063-48807259)
chr4 (39-225)||(11566051-11566249)
chr4 (39-230)||(37856032-37856234)
chr4 (121-248)||(48806820-48806948)
chr4 (39-225)||(37295885-37296085)
chr4 (39-217)||(28234971-28235157)
chr4 (39-218)||(16472968-16473154)
chr4 (148-248)||(43176263-43176363)
chr4 (39-225)||(43175906-43176096)
chr4 (121-237)||(37856360-37856476)
chr4 (130-248)||(6092382-6092496)
chr4 (154-218)||(7088177-7088241)
chr4 (164-225)||(7088375-7088436)
chr4 (158-195)||(43493038-43493075)
chr4 (158-195)||(53536753-53536790)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (41-218)||(30192693-30192873)
chr5 (39-225)||(35282071-35282268)
chr5 (39-225)||(41622346-41622545)
chr5 (39-225)||(20743664-20743862)
chr5 (79-248)||(20743425-20743595)
chr5 (39-225)||(35671281-35671479)
chr5 (130-248)||(41622669-41622786)
chr5 (121-248)||(35671673-35671800)
chr5 (130-248)||(2170019-2170138)
chr5 (41-225)||(2170258-2170442)
chr5 (39-113)||(42912677-42912751)
chr5 (158-197)||(13581532-13581571)
chr5 (158-193)||(13589746-13589781)
chr5 (158-195)||(30966251-30966288)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (39-225)||(2271416-2271612)
chr2 (39-242)||(23265899-23266118)
chr2 (39-218)||(29407552-29407743)
chr2 (79-248)||(23260675-23260846)
chr2 (79-248)||(2271175-2271347)
chr2 (39-225)||(14002691-14002889)
chr2 (39-169)||(28138780-28138910)
chr2 (121-248)||(28139136-28139264)
chr2 (130-248)||(1729106-1729224)
chr2 (79-248)||(29407305-29407478)
chr2 (39-224)||(6232807-6233001)
chr2 (43-225)||(40156712-40156901)
chr2 (39-225)||(37321817-37322011)
chr2 (143-244)||(37294664-37294765)
chr2 (79-204)||(23265725-23265852)
chr2 (126-242)||(23260893-23261022)
chr2 (39-113)||(12252292-12252366)
chr2 (39-113)||(28419607-28419681)
chr2 (165-242)||(28138945-28139024)
chr2 (39-73)||(33222815-33222849)
chr2 (157-195)||(33661941-33661979)
chr2 (158-203)||(37893266-37893311)
chr2 (157-193)||(30271224-30271260)
chr2 (158-193)||(29601047-29601082)
chr2 (158-220)||(44553164-44553227)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (39-242)||(13644999-13645216)
chr7 (39-225)||(48001052-48001249)
chr7 (43-225)||(30846499-30846693)
chr7 (39-169)||(19072637-19072767)
chr7 (43-225)||(11886187-11886380)
chr7 (79-248)||(30846258-30846429)
chr7 (80-245)||(11886469-11886636)
chr7 (39-225)||(14102026-14102222)
chr7 (39-225)||(14412043-14412239)
chr7 (121-248)||(14101762-14101894)
chr7 (121-248)||(14411779-14411911)
chr7 (130-237)||(19073217-19073324)
chr7 (79-197)||(13644811-13644931)
chr7 (39-113)||(31512839-31512913)
chr7 (158-231)||(2526680-2526753)
chr7 (164-225)||(19073032-19073093)
chr7 (41-99)||(47750999-47751057)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (41-225)||(43520459-43520653)
chr8 (42-225)||(39208096-39208289)
chr8 (41-225)||(38133823-38134018)
chr8 (39-225)||(34892117-34892315)
chr8 (39-225)||(16939953-16940150)
chr8 (39-225)||(37656110-37656308)
chr8 (39-225)||(3085714-3085913)
chr8 (39-242)||(41471291-41471513)
chr8 (39-228)||(13782434-13782634)
chr8 (39-225)||(35206336-35206534)
chr8 (87-248)||(7121232-7121394)
chr8 (121-248)||(41471625-41471753)
chr8 (87-245)||(39512655-39512814)
chr8 (121-248)||(16939711-16939839)
chr8 (130-246)||(43520219-43520335)
chr8 (79-248)||(34892385-34892555)
chr8 (41-225)||(36595623-36595818)
chr8 (39-225)||(39512892-39513087)
chr8 (121-242)||(36595370-36595492)
chr8 (121-245)||(22960946-22961071)
chr8 (121-245)||(37656421-37656546)
chr8 (42-225)||(22961183-22961376)
chr8 (79-225)||(40741560-40741707)
chr8 (39-225)||(45410305-45410500)
chr8 (39-169)||(36345678-36345806)
chr8 (121-237)||(35206085-35206202)
chr8 (39-185)||(7121517-7121660)
chr8 (150-242)||(3086069-3086161)
chr8 (121-248)||(13782745-13782866)
chr8 (156-195)||(42731985-42732024)
chr8 (158-195)||(3641807-3641844)
chr8 (158-193)||(20861779-20861814)
chr8 (158-193)||(31745344-31745379)
chr8 (158-193)||(44885851-44885886)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (39-225)||(39999256-39999453)
chr3 (42-223)||(19842705-19842896)
chr3 (39-228)||(32592412-32592613)
chr3 (39-215)||(10659014-10659202)
chr3 (39-225)||(32743380-32743577)
chr3 (41-225)||(4274626-4274822)
chr3 (41-225)||(20484833-20485030)
chr3 (39-220)||(26494184-26494377)
chr3 (39-225)||(45075545-45075742)
chr3 (79-248)||(4274388-4274559)
chr3 (130-248)||(45075870-45075988)
chr3 (39-225)||(7941683-7941880)
chr3 (121-248)||(32592724-32592852)
chr3 (41-225)||(11269961-11270156)
chr3 (121-248)||(30294551-30294679)
chr3 (121-248)||(20485143-20485271)
chr3 (121-248)||(7941441-7941569)
chr3 (141-248)||(19843034-19843141)
chr3 (43-225)||(4331040-4331231)
chr3 (121-248)||(26493916-26494044)
chr3 (157-236)||(31889617-31889696)
chr3 (39-99)||(6143870-6143930)
chr3 (158-210)||(31890101-31890153)
chr3 (158-195)||(14043772-14043809)
chr3 (158-193)||(2062533-2062568)
chr3 (158-195)||(34722386-34722423)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (39-225)||(8900-9098)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (39-225)||(21700075-21700272)
chr1 (42-242)||(42290472-42290685)
chr1 (40-225)||(5329690-5329886)
chr1 (42-225)||(51461258-51461453)
chr1 (79-245)||(5329433-5329601)
chr1 (39-217)||(7943141-7943330)
chr1 (121-248)||(12627551-12627678)
chr1 (39-225)||(12627811-12628009)
chr1 (121-248)||(51461566-51461695)
chr1 (130-242)||(41909273-41909385)
chr1 (44-105)||(13760897-13760958)
chr1 (52-113)||(41909623-41909684)
chr1 (144-220)||(44387660-44387736)
chr1 (39-109)||(18609703-18609773)
chr1 (158-193)||(15695956-15695991)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (43-225)||(127695-127888)
scaffold0019 (148-248)||(128057-128157)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (39-225)||(26350429-26350622)
chr6 (39-225)||(11159103-11159305)
chr6 (39-225)||(32396328-32396516)
chr6 (79-225)||(11158885-11159033)
chr6 (39-163)||(35096837-35096963)
chr6 (121-225)||(17338240-17338345)
chr6 (39-225)||(17338456-17338651)
chr6 (39-99)||(117709-117769)
chr6 (39-99)||(15546204-15546264)
chr6 (158-220)||(22209472-22209535)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (39-113)||(54764-54838)
[»] scaffold1379 (1 HSPs)
scaffold1379 (158-195)||(308-345)
[»] scaffold0283 (1 HSPs)
scaffold0283 (158-193)||(1515-1550)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2449484 - 2449275
Alignment:
Q  41 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaaaaa-cgtt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||        ||||| |||||||| | ||    
T  2449484 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcagtagttaattgacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaaaaacaaaaaacatt 2449385  T
Q  139 acaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataa 238  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2449384 ataaatgatataataattatatttgtaattaatttcattaatgtctgtaattattcatagatttgactaacctattattattttataatattttagatat 2449285  T
Q  239 tattcatctc 248  Q
    ||||||||||    
T  2449284 tattcatctc 2449275  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48807259 - 48807063
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaacgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||       ||||||||||||||||||    
T  48807259 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgataattcaataaaaaaatgcaacaacaaaaacgtt 48807160  T
Q  139 acaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48807159 acaaatgatagaataattatatttttaattattaataattaatttcattgatgtctatcattattcataggtttgactaacctattattattttata 48807063  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 11566051 - 11566249
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn--tgcaacaacaaaaacg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||         |||||||| |||||||    
T  11566051 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatctgtagttaatgggcctaaaatgattattcaataaaaaaaaatgcaacaataaaaacg 11566150  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatatttgtaa----------ttaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11566151 ttacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 11566249  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 230
Target Start/End: Original strand, 37856032 - 37856234
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||        |||||||||||||||||    
T  37856032 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatccgtagttaatagacctaaaatgatgatttaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgt 37856131  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  37856132 tacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtatgtcattattcataggtttgactaacctattattgctttatatt 37856231  T
Q  228 att 230  Q
    |||    
T  37856232 att 37856234  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 48806948 - 48806820
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48806948 tgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattac 48806849  T
Q  220 tttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48806848 tttataatattttagatattattcatctc 48806820  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37296085 - 37295885
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtag---ttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  37296085 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagtaattaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaa 37295986  T
Q  135 cgttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttat 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  37295985 cgttagaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgaataatctattattactttat 37295886  T
Q  225 a 225  Q
    |    
T  37295885 a 37295885  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28235157 - 28234971
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||   ||||||||||||    
T  28235157 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatg---caacaaaaacgt 28235061  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattatt 217  Q
    | |||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28235060 ttcaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctatcattattcataggtttgactaacctattatt 28234971  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16473154 - 16472968
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaacgtt 138  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||   |||||||||||||    
T  16473154 gccataaataaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaatg---caacaaaaacgtt 16473058  T
Q  139 acaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattatta 218  Q
     | |||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16473057 tctaatgatagaataattatatttgtcattattagtaattaatttcattgatgtctatcattattcgtaggtttgactaacctattatta 16472968  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 248
Target Start/End: Original strand, 43176263 - 43176363
Alignment:
Q  148 agaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcatct 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43176263 agaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttataatattttagatattattcatct 43176362  T
Q  248 c 248  Q
    |    
T  43176363 c 43176363  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 43175906 - 43176096
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  43175906 gccataaataaagatatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaagtgatgattcaataaaagtaaatgcaacaacaaaaacg 43176005  T
Q  137 ttacaaatgatagaataatta--tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||| ||   ||   ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  43176006 ttacaaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatttctgtcattattcataagtttgactaacctattagtactttata 43176096  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Original strand, 37856360 - 37856476
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  37856360 tgcaacaacaaaaaacaatataaatgatagaataattatatttgtaattaattttattgatgtctgtcattattcatagatttga-taacctattattac 37856458  T
Q  220 tttataatattttagata 237  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37856459 tttataatattttagata 37856476  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Original strand, 6092382 - 6092496
Alignment:
Q  130 aaaaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatat 229  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6092382 aaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattga----cgtcattatttatagatttgactaacctattattactttataatat 6092477  T
Q  230 tttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  6092478 tttagatattattcatctc 6092496  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7088241 - 7088177
Alignment:
Q  154 attatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattatta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088241 attatatttgtaattaatttcattaatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattatta 7088177  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7088436 - 7088375
Alignment:
Q  164 taattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7088436 taattaatttcattaatgtctgtcattattcatagatttgactaacctattattactttata 7088375  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 195
Target Start/End: Original strand, 43493038 - 43493075
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43493038 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattattca 43493075  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 53536790 - 53536753
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53536790 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattattca 53536753  T

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Target: chr5 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 30192693 - 30192873
Alignment:
Q  41 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn--tgcaacaacaaaaa-cgt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| | |    
T  30192693 cataaatgaaaaaatatgagagatgaataatatcagcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaataaaaaaaaatgcaacaacaaaaaacat 30192792  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattatta 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30192793 tataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattatta 30192873  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35282268 - 35282071
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  35282268 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtaattaatggacataaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgt 35282169  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35282168 tagaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtttgtcattattcataggtttcactaacctattattactttata 35282071  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 41622346 - 41622545
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat---nnnnnnntgcaacaacaaaaac 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||||||||||    
T  41622346 gccataaatgaagaaatgtgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaaatgcaacaacaaaaac 41622445  T
Q  136 gttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41622446 gttacaaatgatataataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattatttataggtttcactaacctattattactttata 41622545  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20743862 - 20743664
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaat-ggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  20743862 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatgggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaatgcaacaacaaaaac 20743763  T
Q  136 gttacaaatgatagaataattatatttg----------taattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20743762 gttacaaatgatagaataattatatttgtaattattattaattaatttcattgatgtct-tcattattcataggtttgactgacctattattactttata 20743664  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20743595 - 20743425
Alignment:
Q  79 atcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcatt 177  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||       |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20743595 atcggtaattaatgtacctaaaatggtgattcaataaaaaaatgcaacaacaaaaaacattttaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcatt 20743496  T
Q  178 gatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20743495 gatgtctgtcattattaataggtttgactaacctattattactttataatattttagatactattcatctc 20743425  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 35671281 - 35671479
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaa-tatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaaaaacg 136  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||     
T  35671281 gccataaatgaaaaaaatatgagagatgaataatatctgcaattgatagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaact 35671380  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35671381 ttacaaatgataaaataattatattgataactattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 35671479  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Original strand, 41622669 - 41622786
Alignment:
Q  130 aaaaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatat 229  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41622669 aaaaacattataaatgatagaataat-atatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttataatat 41622767  T
Q  230 tttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  41622768 tttagatattattcatctc 41622786  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Original strand, 35671673 - 35671800
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaa-aacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35671673 tgcaacaacaaataacattataaatgatagaataattatatttgta-taaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattac 35671771  T
Q  220 tttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35671772 tttataatattttagatattattcatctc 35671800  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2170138 - 2170019
Alignment:
Q  130 aaaaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaa-ttaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataata 228  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2170138 aaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaaattaatttcattgatgtttgtcattattcataggtttgactaacttattattactttataata 2170039  T
Q  229 ttttagataatattcatctc 248  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  2170038 ttttagatattattcatctc 2170019  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2170442 - 2170258
Alignment:
Q  41 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacgtt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||    
T  2170442 cataaatgaaaaaatatgagagatgaataatatctgtaatcggtagttaatgaacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaatgcaacaacaaaaacgtt 2170343  T
Q  139 acaaatgatagaataattatatttgtaattaat-ttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||   | |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2170342 acaaacgatagaataattatatttgtaattattagtaattaat---tttatttattcataggtttgactaacctattattactttata 2170258  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 42912751 - 42912677
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat 113  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  42912751 gccataaatgaaaaaatatgatagatgaataatatctgcaatcagtaattaatggacctaaaatgatgattcaat 42912677  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13581571 - 13581532
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13581571 tatttgtaattaatttcattgatatctatcattattcata 13581532  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 193
Target Start/End: Original strand, 13589746 - 13589781
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13589746 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattatt 13589781  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 195
Target Start/End: Original strand, 30966251 - 30966288
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattca 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30966251 tatttataattaatttcattgatgtctatcattattca 30966288  T

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Target: chr2 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2271612 - 2271416
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaacgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  2271612 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaatgcaacaacaaaaacgtt 2271513  T
Q  139 acaaatgatagaataattatatttg----------taattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2271512 acaaatgatagaataattatatttgtaattattattaattaatttcattgaagtctgtcattattcataggtttgactgacctattattactttata 2271416  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23266118 - 23265899
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat---nnnnnnntgcaacaacaaaaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||    
T  23266118 gccataaatgaagaaatataagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaataaaaaaaaaatgcaacaacaaaaac 23266019  T
Q  136 gttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattatttta-- 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||      
T  23266018 gttacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctttcattattcataggtttgactagcctattattactttata 23265919  T
Q  224 -taatattttagataatatt 242  Q
     |||||||||||||| ||||    
T  23265918 ctaatattttagatattatt 23265899  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29407743 - 29407552
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||||||||||    
T  29407743 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaatcaaaaaaaaggcaacaacaaaaacg 29407644  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattatta 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29407643 ttacaaatgaaagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcatagatttgactaacctattatta 29407552  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23260846 - 23260675
Alignment:
Q  79 atcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaa-aaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 176  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23260846 atcggtaattaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaagaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 23260747  T
Q  177 tgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcatctc 248  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23260746 cgatgtctgtcgttattcataggtttgactaacctattattactttataatattttagatattattcatctc 23260675  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2271347 - 2271175
Alignment:
Q  79 atcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn--tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttca 175  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2271347 atcggtaattaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaatgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttca 2271248  T
Q  176 ttgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2271247 ttgatgtctgtcattattaataagtttgactaacctattattactttataatattttagatattattcatctc 2271175  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 14002691 - 14002889
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  14002691 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaataggtagttaatgaacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaatgcaacaacaaaaacg 14002790  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  14002791 ttataaatgatagaataattatatttgtaatcattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcatagatttgaataatctattattactttata 14002889  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 169
Target Start/End: Original strand, 28138780 - 28138910
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaacgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||    
T  28138780 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaattggtagttaatggacctaaaatgatgatttaataaaaaaatgcaacaacaaaaacgtt 28138879  T
Q  139 acaaatgatagaataattatatttgtaatta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28138880 acaaatgatagaataattatatttgtaatta 28138910  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Original strand, 28139136 - 28139264
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||||| | ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28139136 tgcaacaacaaaaaacattatatataatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattac 28139235  T
Q  220 tttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28139236 tttataatattttagatattattcatctc 28139264  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1729224 - 1729106
Alignment:
Q  130 aaaaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatat 229  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  1729224 aaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgattaatctattattactttataatat 1729125  T
Q  230 tttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  1729124 tttagatattattcatctc 1729106  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29407478 - 29407305
Alignment:
Q  79 atcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn---tgcaacaacaaaaacg-ttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttc 174  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||          ||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29407478 atcggtaattaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaaatgcaacaacaaaaaatattataaatgatagaataattatatttctaattaattta 29407379  T
Q  175 attgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29407378 attgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttataatattttagatattattcatctc 29407305  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 224
Target Start/End: Original strand, 6232807 - 6233001
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         ||    ||||||||||    
T  6232807 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaagaaaaatg---taacaaaaacg 6232903  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttat 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||          ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6232904 tttcaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttaattgatgtatgtcattattcataggtttgactaacctattattactttat 6233001  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Original strand, 40156712 - 40156901
Alignment:
Q  43 taaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaacgttacaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||        ||   ||||||||||||| |||    
T  40156712 taaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatgaacctgaaatgatgattcaaaaaaaaaatg---caacaaaaacgtttcaa 40156808  T
Q  143 atgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40156809 atgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctatcattattgataggtttgactaacctattattactttata 40156901  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37322011 - 37321817
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||   ||||||||| ||    
T  37322011 gccataaatgaaaaaatatgagtgatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatg---caacaaaaatgt 37321915  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  37321914 ttcaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttaactaatctattattactttata 37321817  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37294765 - 37294664
Alignment:
Q  143 atgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatatt 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37294765 atgagagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtatgtcattattcataggtttgattaacctattattactttataatattttagatattatt 37294666  T
Q  243 ca 244  Q
    ||    
T  37294665 ca 37294664  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23265852 - 23265725
Alignment:
Q  79 atcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaa-aaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 176  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265852 atcggtaattaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaagaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 23265753  T
Q  177 tgatgtctgtcattattcataggtttga 204  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23265752 cgatgtctgtcgttattcataggtttga 23265725  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23261022 - 23260893
Alignment:
Q  126 caacaaaaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaatta----------atttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23261022 caacaaaaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctttcattattcataggtttgactagcctatta 23260923  T
Q  216 ttatttta---taatattttagataatatt 242  Q
    ||| ||||   |||||||||||||| ||||    
T  23260922 ttactttatactaatattttagatattatt 23260893  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 12252366 - 12252292
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12252366 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctacaatcggtagttaattgacctaaaatgatgattcaat 12252292  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Original strand, 28419607 - 28419681
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat 113  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28419607 gccataaatgaaaaaatatgatagatgaataatatctgcaatcggtaattaatggacctaaaatgatgattcaat 28419681  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 242
Target Start/End: Original strand, 28138945 - 28139024
Alignment:
Q  165 aattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattatttta---taatattttagataatatt 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| ||||    
T  28138945 aattaatttcattgatgtttgtcattattcataggtttgactaacc-attattactttatactaatattttagatattatt 28139024  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 73
Target Start/End: Original strand, 33222815 - 33222849
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33222815 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatat 33222849  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 33661941 - 33661979
Alignment:
Q  157 atatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattca 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33661941 atatttgtaattaatttcattgatgtctatcattattca 33661979  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37893311 - 37893266
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  37893311 tatttgtaattaatttcattgatatctatcattattcatatgtttg 37893266  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 193
Target Start/End: Original strand, 30271224 - 30271260
Alignment:
Q  157 atatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattatt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30271224 atatttgtaattaatttcattgatgtctatcattatt 30271260  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29601082 - 29601047
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29601082 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattatt 29601047  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 220
Target Start/End: Original strand, 44553164 - 44553227
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgact-aacctattattatt 220  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44553164 tatttatatttaattttatttatgtatatcattattcataggtttgactaaacctattattatt 44553227  T

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Target: chr7 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13645216 - 13644999
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  13645216 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaagcaacaacaaaaacgt 13645117  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata-- 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  13645116 tacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttatact 13645017  T
Q  226 -atattttagataatatt 242  Q
     |||||||||||| ||||    
T  13645016 tatattttagatattatt 13644999  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48001249 - 48001052
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||    
T  48001249 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaataaaaacgt 48001150  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  48001149 tacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctttcattattcatagatttgactaacctattcttactttata 48001052  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30846693 - 30846499
Alignment:
Q  43 taaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacgttac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||| | |||||||||    
T  30846693 taaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaataaatgcaacaaaagaaacgttac 30846594  T
Q  141 aaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30846593 aaatgatagaatagttatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 30846499  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 169
Target Start/End: Original strand, 19072637 - 19072767
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaacgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  19072637 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaatgcaacaacaaaaacgtt 19072736  T
Q  139 acaaatgatagaataattatatttgtaatta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072737 acaaatgatagaataattatatttgtaatta 19072767  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Original strand, 11886187 - 11886380
Alignment:
Q  43 taaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn--tgcaacaacaaaaacgttac 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  11886187 taaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatctgtagttaatg-acctaaaatggtgattcaataaaaaaaaatgcaacaacaaaaacgttac 11886285  T
Q  141 aaatgatagaataattatatttgtaa----------ttaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11886286 aaatgatagaacaattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 11886380  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30846429 - 30846258
Alignment:
Q  79 atcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaaaaacg-ttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 176  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||        ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30846429 atcggtaattaatggacctaaaatggtgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaaatattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 30846330  T
Q  177 tgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30846329 tgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattaatttataatattatagatattattcatctc 30846258  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Original strand, 11886469 - 11886636
Alignment:
Q  80 tcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcatt 177  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||        |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11886469 tcggtaattaatggacctaaaatggtgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcatt 11886568  T
Q  178 gatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  11886569 gatgtctgtcattattcatagatttgactaacctattattactttatgatattttagatattattcat 11886636  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14102222 - 14102026
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||        |||||||||||||||||    
T  14102222 gccataaatgaagaaatatgagaaatgaataatatttgcaatcggtagttaatggacctaaaatgataattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgt 14102123  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14102122 tacaattgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctctcattatt-ataggtttgactaacatattattactttata 14102026  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14412239 - 14412043
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||        |||||||||||||||||    
T  14412239 gccataaatgaagaaatatgagaaatgaataatatttgcaatcggtagttaatggacctaaaatgataattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgt 14412140  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14412139 tacaattgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctctcattatt-ataggtttgactaacatattattactttata 14412043  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14101894 - 14101762
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcatag----gtttgactaacctatta 215  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  14101894 tgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtatgtttgactaacctatta 14101795  T
Q  216 ttattttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14101794 ttactttataatattttagatattattcatctc 14101762  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14411911 - 14411779
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcatag----gtttgactaacctatta 215  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  14411911 tgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtatgtttgactaacctatta 14411812  T
Q  216 ttattttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14411811 ttactttataatattttagatattattcatctc 14411779  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 237
Target Start/End: Original strand, 19073217 - 19073324
Alignment:
Q  130 aaaaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatat 229  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19073217 aaaaacattataaatgatagaataattatatttataattaatttcattgatgtgtgtcattattaataggtttgactaacctattattactttataatat 19073316  T
Q  230 tttagata 237  Q
    ||||||||    
T  19073317 tttagata 19073324  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13644931 - 13644811
Alignment:
Q  79 atcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 176  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||        |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13644931 atcggtaattaatggacctaaaatggtgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaaacattatatatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 13644832  T
Q  177 tgatgtctgtcattattcata 197  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13644831 tgatgtctgtcattattcata 13644811  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31512913 - 31512839
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat 113  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31512913 gccataaatgaaaaaatatgatagatgaataatatctgcaatcggtaattaatggacctaaaatgatgattcaat 31512839  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Original strand, 2526680 - 2526753
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattt 231  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2526680 tatttataattaatttcattaatgtctatcattattcataggtttcactaacctattattactttataatattt 2526753  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Original strand, 19073032 - 19073093
Alignment:
Q  164 taattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19073032 taattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactgacctattattactttata 19073093  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 47751057 - 47750999
Alignment:
Q  41 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||    
T  47751057 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctacattcggtaattaatggacctaa 47750999  T

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Target: chr8 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43520653 - 43520459
Alignment:
Q  41 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaacgttac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     
T  43520653 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaatgcaacaacaaaaacgttaa 43520554  T
Q  141 aaatgatagaataattatatttg----------taattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43520553 aaatgatagaataattatatttgtaattattattaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactgacctattattactttata 43520459  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39208289 - 39208096
Alignment:
Q  42 ataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaacgttaca 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  39208289 ataaatgaagaaatataagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaataaaaaaatgcaacaacaaaaacgttaca 39208190  T
Q  142 aatgatagaataattatatttgtaatt----------aatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||          ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39208189 aatgatagaataattaaatttataattattagcaatcaatttcattgatgtctgtcattattcatatgtttgactaacctattattactttata 39208096  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38134018 - 38133823
Alignment:
Q  41 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgtta 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  38134018 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatgaacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgtta 38133919  T
Q  140 caaatgatagaataattatatttgtaat----------taatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38133918 caaatgatagaataattatatttgtaattattagtaactaatttcattgatgtctgtcattattcatatgtttgactaacctattattactttata 38133823  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 34892117 - 34892315
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  34892117 gccataaatgaagaaatataagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaatgcaacaacaaaaacg 34892216  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||| |||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34892217 ttacaaataatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgaccaacctattattactttata 34892315  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16940150 - 16939953
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||    
T  16940150 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctacaatcgatagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaatgt 16940051  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16940050 tacaaatgataaaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 16939953  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 37656110 - 37656308
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatga-ttcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||    
T  37656110 gccataaatgaagaaatatgaaagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgatttcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacg 37656209  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37656210 ttacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtaattattcataggtttgattaacctattattactttata 37656308  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 3085714 - 3085913
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat---nnnnnnntgcaacaacaaaaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||          |||||||||||||||    
T  3085714 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacttaaaatgatgatttaatacaaaaaaaatgcaacaacaaaaac 3085813  T
Q  136 gttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3085814 gttataaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtttgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 3085913  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 242
Target Start/End: Original strand, 41471291 - 41471513
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  41471291 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatagacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgt 41471390  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatatttgtaatta---------------atttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattatttt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41471391 tacaaacgatagaataattatatttgtaattattattaattcatttcatttcattgatgtttgtcattattcataggtttgactaacctattattacttt 41471490  T
Q  223 a---taatattttagataatatt 242  Q
    |   |||||||||||||| ||||    
T  41471491 atactaatattttagatattatt 41471513  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 228
Target Start/End: Original strand, 13782434 - 13782634
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  13782434 gccataaataaagaaatatgatagatgaataatatctgcaatcagtggttaatagatctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgt 13782533  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatatttgtaa----------ttaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataat 227  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13782534 tacaaacgatataataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttataat 13782633  T
Q  228 a 228  Q
    |    
T  13782634 a 13782634  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35206534 - 35206336
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  35206534 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatccatagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaatgcaacaacaaaaacg 35206435  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35206434 ttacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaattttattgatgtctgtcattatttataagtttgactaacctattattactttata 35206336  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7121394 - 7121232
Alignment:
Q  87 ttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctg 185  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||       |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7121394 ttaatggacctaaaatggtgatttaataaaaaaatgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtatg 7121295  T
Q  186 tcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7121294 tcattattcataggtttgactaacctattattactttataatattttagataatatccatctc 7121232  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Original strand, 41471625 - 41471753
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41471625 tgcaacaacaaaaaacattatatatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattac 41471724  T
Q  220 tttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41471725 tttataatattttagatattattcatctc 41471753  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39512814 - 39512655
Alignment:
Q  87 ttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctg 185  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||       |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39512814 ttaatggacctaaaatggtgattcaataaaaaaatgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctg 39512715  T
Q  186 tcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcat 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  39512714 tcatgattcataggtttgactaacctattattactttataatattttaaatattattcat 39512655  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16939839 - 16939711
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaacg-ttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16939839 tgcaacaacaaaaaatattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcagtgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattac 16939740  T
Q  220 tttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16939739 tttataatattttagatattattcatctc 16939711  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43520335 - 43520219
Alignment:
Q  130 aaaaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatat 229  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43520335 aaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattaataggtttgactaacctattattactttataatat 43520236  T
Q  230 tttagataatattcatc 246  Q
    |||||||| ||||||||    
T  43520235 tttagatattattcatc 43520219  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Original strand, 34892385 - 34892555
Alignment:
Q  79 atcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaacg-ttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcatt 177  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||       ||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  34892385 atcggtaattaatggacctaaaatggtgattcaataaaaaaatgcaacaacaaaaaatattataaatgatagaatagttatatttgtaattaattttatt 34892484  T
Q  178 gatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34892485 gatgtatgtcattattcataggtttgactaacttattattactttataatattttagatattattcatctc 34892555  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36595818 - 36595623
Alignment:
Q  41 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||         || |||||||||||||||    
T  36595818 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcgttagttaatggacctaaaatgatgagtcaataaaaaaaaatgtaacaacaaaaacgtt 36595719  T
Q  139 acaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36595718 acaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtatgtca-tattcatatgtttgactaacctattattactttata 36595623  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39513087 - 39512892
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnnt--gcaacaacaaaaacg 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          || ||||||||||||    
T  39513087 gccataaatgaagaaacatgagaga---ataatatatgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaaagccacaacaaaaacg 39512991  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatatttgtaatta----------atttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39512990 ttacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 39512892  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36595492 - 36595370
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36595492 tgcaacaacaaaaaacattataaacgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctctcattattcataggtttgactaacctattattac 36595393  T
Q  220 tttataatattttagataatatt 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  36595392 tttataatattttagatattatt 36595370  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22961071 - 22960946
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22961071 tgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattgtatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattac 22960972  T
Q  220 tttataatattttagataatattcat 245  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||    
T  22960971 ttattaatattttagatattattcat 22960946  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 245
Target Start/End: Original strand, 37656421 - 37656546
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaacg-ttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  37656421 tgcaacaacaaaaaaaattataaatgatagaataattatatttttaattaatttcattgatgtctgtcattatttataggtttgactaacctattattac 37656520  T
Q  220 tttataatattttagataatattcat 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  37656521 tttataatattttagatattattcat 37656546  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22961376 - 22961183
Alignment:
Q  42 ataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgttac 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||        |||||||||| ||| |||||    
T  22961376 ataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaat-ggtagttaatggacctaaaatgatgatgcaataaaaaaaatgcaacaacagaaatgttac 22961278  T
Q  141 aaatgatagaataattatatttg----------taattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||          |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  22961277 aaatgatagaataaatatatttgtaattattaataattaatttcattgatgtccgtcattattcatagatttgactaacttattattactttata 22961183  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40741707 - 40741560
Alignment:
Q  79 atcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcatt 177  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||       |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40741707 atcggtaattaattgacctaaaatggtgattcaataaaaaaatgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcatt 40741608  T
Q  178 gatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40741607 gatgtctgtcattattcataggtttgactaccctattattactttata 40741560  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 45410305 - 45410500
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         ||   |||||||||||    
T  45410305 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatttgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaatg---caacaaaaacg 45410401  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  45410402 tttcaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctatcattattcatagatttgactaacccatttttactttata 45410500  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 36345806 - 36345678
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||   ||||||||||||    
T  36345806 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatg---caacaaaaacgt 36345710  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatatttgtaatta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36345709 tacaaatgatagaataattatatttgtaatta 36345678  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35206202 - 35206085
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  35206202 tgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattgtattagtaattaattttattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctataattac 35206103  T
Q  220 tttataatattttagata 237  Q
    |||||||||||| |||||    
T  35206102 tttataatatttcagata 35206085  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7121660 - 7121517
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  7121660 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgt 7121561  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctg 185  Q
    |||||||  | |  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7121560 tacaaatatttg--taat--tattagtaattaatttcattgatgtctg 7121517  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 242
Target Start/End: Original strand, 3086069 - 3086161
Alignment:
Q  150 aataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatatt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3086069 aataattatatttgtaattaattttattgatgtctgtcattattcatatgtttgactgacctattattactttataatattttagatattatt 3086161  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Original strand, 13782745 - 13782866
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||      
T  13782745 tgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctatcattat-------gttgactaacctattattgc 13782837  T
Q  220 tttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13782838 tttataatattttagatattattcatctc 13782866  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 195
Target Start/End: Original strand, 42731985 - 42732024
Alignment:
Q  156 tatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42731985 tatatttgtaattaatttcattgatgtctatcattattca 42732024  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 195
Target Start/End: Original strand, 3641807 - 3641844
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3641807 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattattca 3641844  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20861814 - 20861779
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20861814 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattatt 20861779  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 193
Target Start/End: Original strand, 31745344 - 31745379
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31745344 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattatt 31745379  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 193
Target Start/End: Original strand, 44885851 - 44885886
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44885851 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattatt 44885886  T

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Target: chr3 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39999453 - 39999256
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  39999453 gccataaatgaagaaatatgagagataaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaacaatgcaacaacaaaaacgt 39999354  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatatttg----------taattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39999353 tacaaatgatagaataattatatttgtaattatttttaattaatttcgttgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 39999256  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Original strand, 19842705 - 19842896
Alignment:
Q  42 ataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaacgttaca 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  19842705 ataaatgaagaaatatgagagatgaataaaatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaatgcaacaacaaaaacgttaca 19842804  T
Q  142 aatgatagaataattatatttg----------taattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattatttta 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19842805 aatgataaaataattatatttgtaattattattaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactgacctattattacttta 19842896  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 228
Target Start/End: Original strand, 32592412 - 32592613
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||     
T  32592412 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataacaaaaaatgcaacaacaaaaaca 32592511  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataa 226  Q
     |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  32592512 ctacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgaccaacctattattactttataa 32592611  T
Q  227 ta 228  Q
    ||    
T  32592612 ta 32592613  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Original strand, 10659014 - 10659202
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  10659014 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctacaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaataaaaaaaaatgcaacaacaaaaacg 10659113  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10659114 ttacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctatcattattcataggtttgactaacctatta 10659202  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 32743380 - 32743577
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  32743380 gccataaataaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgt 32743479  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32743480 tacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattaatgtctgtcatttttcataggtttgactaacctattattactttata 32743577  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4274822 - 4274626
Alignment:
Q  41 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||         |||||||||||| |||||    
T  4274822 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatgaacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaatgcaacaacaaatacgtt 4274723  T
Q  139 acaaatgatagaataattatatttgtaatta----------atttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4274722 acaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattgatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgaataacctattattactttata 4274626  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Original strand, 20484833 - 20485030
Alignment:
Q  41 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat---nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  20484833 cataaataaagaaatatgagagatgaataatatctgcaattggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaaaatgcaacaacaaaaacgt 20484932  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20484933 tacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaaccaattattactttata 20485030  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26494377 - 26494184
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||    
T  26494377 gccataaatgaagaaatatgagggatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaataaaaaaaaatacaacaacaaaaacg 26494278  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26494277 ttacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaattttattgatgtttgtcattattcataggtttgactaacctattagtatt 26494184  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 45075545 - 45075742
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||         || |||||||||||||    
T  45075545 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatgtgcaatcggtagttaatggacctaaaatgacgattctataaaaaaaaatg-aacaacaaaaacg 45075643  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatatttgta----------attaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45075644 ttacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtgattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 45075742  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4274559 - 4274388
Alignment:
Q  79 atcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 176  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||        |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4274559 atcggtaattaatggacctaaaatggtgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 4274460  T
Q  177 tgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4274459 tgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttataatattttagatcttattcatctc 4274388  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Original strand, 45075870 - 45075988
Alignment:
Q  130 aaaaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatat 229  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45075870 aaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggcttgactaacctattattattttataatat 45075969  T
Q  230 tttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  45075970 tttagatattattcatctc 45075988  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7941880 - 7941683
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||    
T  7941880 gccataaatgaaaaaatatgagagatgaataatatctccaatcggtagttaattgacctaaaatgacgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgt 7941781  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatatttgtaatta----------atttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7941780 tacaaatgatataataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctatcattactttata 7941683  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Original strand, 32592724 - 32592852
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaa-aaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32592724 tgcaacaacaataaacattataaatgatagaataattatatttataattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattac 32592823  T
Q  220 tttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32592824 tttataatattttagatattattcatctc 32592852  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11270156 - 11269961
Alignment:
Q  41 cataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgtta 139  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  11270156 cataaatgaagaaatatgatatatgaataatatctgcaatcggtaattaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgtta 11270057  T
Q  140 caaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
     ||| ||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11270056 gaaaggatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctttcattattcataggtttgactaacctattattactttata 11269961  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Original strand, 30294551 - 30294679
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  30294551 tgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataagtttgactaacccattattac 30294650  T
Q  220 tttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30294651 tttataatattttagatattattcatctc 30294679  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Original strand, 20485143 - 20485271
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20485143 tgcaacaacaaaaaacattataaatgatataataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtaattattcatagatttgactaacctattattac 20485242  T
Q  220 tttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20485243 tttataatattttagatattattcatctc 20485271  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7941569 - 7941441
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  7941569 tgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttataattaatttcattgatgtctgtcattatttataggtttgactaacttattattac 7941470  T
Q  220 tttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7941469 tttataatattttagatattatccatctc 7941441  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 248
Target Start/End: Original strand, 19843034 - 19843141
Alignment:
Q  141 aaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataata 240  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  19843034 aaataatagaataattatatttttaattaatttcattgatgtttgtcattattaataggtttgactaacctattattactttataatattttagatatta 19843133  T
Q  241 ttcatctc 248  Q
    ||||||||    
T  19843134 ttcatctc 19843141  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Original strand, 4331040 - 4331231
Alignment:
Q  43 taaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaa--caacaaaaacgttac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||          ||  |||||||||||||      
T  4331040 taaatgaagaaatatgagagatgaataatatccgcaatcggtagttaatggacctaaaaagatgattcaataaaaaaa---aaggcaacaaaaacgtttt 4331136  T
Q  141 aaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4331137 aaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtatatcattattcataggtttgactaacctattattactttata 4331231  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26494044 - 26493916
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  26494044 tgcaacaacaaaaaacattatatatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatatttgtgattattcattggtttgactaatctattattac 26493945  T
Q  220 tttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26493944 tttataatattttagatattattcatctc 26493916  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 236
Target Start/End: Original strand, 31889617 - 31889696
Alignment:
Q  157 atatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31889617 atatttgtaattaatttcattgatgtctatcattattcatcagtttgactaacctattattactttataatatttaagat 31889696  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 99
Target Start/End: Original strand, 6143870 - 6143930
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6143870 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaa 6143930  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31890153 - 31890101
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  31890153 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcatttttcgtaggtttgactaacc 31890101  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14043809 - 14043772
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14043809 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattattca 14043772  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 193
Target Start/End: Original strand, 2062533 - 2062568
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2062533 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattatt 2062568  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 195
Target Start/End: Original strand, 34722386 - 34722423
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34722386 tatttgtaattaatttcattgatgtctataattattca 34722423  T

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Target: scaffold0217 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 8900 - 9098
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||         ||||| ||||||||||    
T  8900 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgatttaataaaaaaaaatgcaaaaacaaaaacg 8999  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9000 ttacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 9098  T

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Target: chr1 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 21700075 - 21700272
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  21700075 gccataaatgaaaaaatatgatagatgaataatatgtgcaatcggtaattaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgt 21700174  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatatttgtaa----------ttaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21700175 tagaaatgatataataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 21700272  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 242
Target Start/End: Original strand, 42290472 - 42290685
Alignment:
Q  42 ataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgttac 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  42290472 ataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgtaatcggtagttaatagacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaacgttac 42290571  T
Q  141 aaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattatttta---taat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||    
T  42290572 aaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgt-tgttattattcataagtttgactaacctattattactttatactaat 42290670  T
Q  228 attttagataatatt 242  Q
    |||||||||| ||||    
T  42290671 attttagatattatt 42290685  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5329886 - 5329690
Alignment:
Q  40 ccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn--tgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  5329886 ccataaataaagaaatatgggagatgaataatatgtgcaatcggtagttaatgg-tctaaaatgatgattcaagaaaacaaaatgcaacaacaaaaacgt 5329788  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatatttgtaatta----------atttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5329787 tacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacttattattactttata 5329690  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 225
Target Start/End: Original strand, 51461258 - 51461453
Alignment:
Q  42 ataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn--tgcaacaacaaaaacgtta 139  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  51461258 ataaatgaagaaatataagagataaataatatctgcaatcggtagttagatgacctaaaatgatgattcaataaaaaacaatgcaacaacaaaaacgtta 51461357  T
Q  140 caaatgatagaataattatatttgtaa----------ttaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  51461358 caaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctgtcgttattcataggtttgactaacctcttattactttata 51461453  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5329601 - 5329433
Alignment:
Q  79 atcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 176  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||        |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5329601 atcggtaattaatggacctaaaatgaagattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 5329502  T
Q  177 tgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcat 245  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5329501 tgatgtttgtcattattgataggtttgaataacctattattactttataatattttagatattattcat 5329433  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Original strand, 7943141 - 7943330
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        ||||||||||| |||||    
T  7943141 gccataaatgaaaaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacttaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaacaacgt 7943240  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||    
T  7943241 tacaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtatgtcattatttatatgtttggctaacatattatt 7943330  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12627678 - 12627551
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattatt 220  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |    
T  12627678 tgcaacaacaaaaatattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcatagatttgattaacctattattgct 12627579  T
Q  221 ttataatattttagataatattcatctc 248  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  12627578 ttataatatttcatatattattcatctc 12627551  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12628009 - 12627811
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat--nnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||         | ||||||||||||||    
T  12628009 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgtaatcggtagttaatggacctaaaataatgattcaataaaaaaaaatacaacaacaaaaacg 12627910  T
Q  137 ttacaaatgatagaataatta----------tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||||| ||||||||||||          |||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12627909 ttacaaataatagaataattatatctgtaattattagtaattaattaaattaatgtttgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 12627811  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Original strand, 51461566 - 51461695
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcatagg-tttgactaacctattatta 218  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  51461566 tgcaacaacaaaaaacattataaatgatagattaattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggttttcactaacctattatta 51461665  T
Q  219 ttttataatattttagataatattcatctc 248  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  51461666 ctttataatattttagatattatttatctc 51461695  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41909385 - 41909273
Alignment:
Q  130 aaaaacgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatat 229  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41909385 aaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaatgaatgtcattgatgtatgtcattattaatagatttgactaacctattattactttataatat 41909286  T
Q  230 tttagataatatt 242  Q
    |||||||| ||||    
T  41909285 tttagatattatt 41909273  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13760958 - 13760897
Alignment:
Q  44 aaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13760958 aaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgat 13760897  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 41909684 - 41909623
Alignment:
Q  52 aaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41909684 aaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaat 41909623  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 44387660 - 44387736
Alignment:
Q  144 tgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44387660 tgatagaataattatatttgtaattaattccatttatgtttgtcattattcacaagtttgactaacctattattatt 44387736  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18609773 - 18609703
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgatt 109  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18609773 gccataaatgaaaaaatatgatagatgaataatatccgcaatcggtaattaatggacctaatatgatgatt 18609703  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 193
Target Start/End: Original strand, 15695956 - 15695991
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15695956 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattatt 15695991  T

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Target: scaffold0019 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Original strand, 127695 - 127888
Alignment:
Q  43 taaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgttaca 141  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||    
T  127695 taaattaataaatttgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaatgttaca 127794  T
Q  142 aatgatagaataattatatttg----------taattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  127795 aatgatagaataattatatttgtaattattattaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactgaccaattattactttata 127888  T

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Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 248
Target Start/End: Original strand, 128057 - 128157
Alignment:
Q  148 agaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttataatattttagataatattcatct 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  128057 agaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctttcattattaataggtttgactaacctattattactttataatattttagatattattcatct 128156  T
Q  248 c 248  Q
    |    
T  128157 c 128157  T

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Target: chr6 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 26350429 - 26350622
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat-nnnnnnntgcaacaacaaaaacgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    |||||||||||    
T  26350429 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatct-caatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaataaaaaaaatg---taacaaaaacgt 26350524  T
Q  138 tacaaatgatagaataattatattt----------gtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  26350525 ttcaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatttcattgatgtctatcattattcataggtttgaataacctgttattactttata 26350622  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11159305 - 11159103
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatc-taaaatgatgattcaatnnnnnnn-----tgcaacaacaaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   || |||||||||||||||||            ||||||||||||    
T  11159305 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctactatcggtagttaataattcctaaaatgatgattcaataaaaaaaaaaaatgcaacaacaaa 11159206  T
Q  133 aacgttacaaatgatagaataattatatttg----------taattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattatttt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  11159205 aacgttacaaatgatagaataattatatttgaaattattagtaattaatttcattgatgtttgtcattattcatagatttgactaacctattattacttt 11159106  T
Q  223 ata 225  Q
    |||    
T  11159105 ata 11159103  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32396516 - 32396328
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaacaacaaaaacgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||       ||||||||   |||||||    
T  32396516 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatct-----cggtagttaatggacctaaaatgatgattcgataaaaaaatgcaacaa---aaacgtt 32396425  T
Q  139 acaaatgatagaataattatatttgtaatta----------atttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||          |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32396424 tcaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaattttattgatgtctatcattattcataggtttgactaacctattattactttata 32396328  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11159033 - 11158885
Alignment:
Q  79 atcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnn-tgcaacaacaaaaa-cgttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 176  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||        |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11159033 atcggtaattaatggacctaaaatggtgattcaataaaaaaaatgcaacaacaaaaaacattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcat 11158934  T
Q  177 tgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11158933 tgatgtatgtcattatttataggtttgactaacctattattactttata 11158885  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 163
Target Start/End: Original strand, 35096837 - 35096963
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattca--atnnnnnnntgcaacaacaaaaacg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |        |||||||| |||||||    
T  35096837 gccataaatgaagaaatatgagagaggaataatatctgcaatcggtagttaatggacctaaaatgatgattcaacaaaaaaaaatgcaacaaaaaaaacg 35096936  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatatttg 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  35096937 ttacaaatgatagaataattatatttg 35096963  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17338345 - 17338240
Alignment:
Q  121 tgcaacaacaaaaacg-ttacaaatgatagaataattatatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattat 219  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17338345 tgcaacaacaaaaaatattataaatgatagaataattatatttgtaattaatttcagtgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattac 17338246  T
Q  220 tttata 225  Q
    ||||||    
T  17338245 tttata 17338240  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17338651 - 17338456
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaatnnnnnnntgcaa--caacaaaaacg 136  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||          ||  ||||||||||     
T  17338651 gccataaatgtggaaatatgagagatgaataatatctgcaataggtagttaatggacctataatgatcattcaataaaaaaa---aatgcaacaaaaacc 17338555  T
Q  137 ttacaaatgatagaataattatatttgtaatta----------atttcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattattttata 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17338554 tttcaaatgatagaataattatatttgtaattattagtaattaatatcattgatgtctgtcattattcataggtttgactaacctattattactttata 17338456  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 117769 - 117709
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  117769 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctataatcggtagttaatggacctaa 117709  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15546264 - 15546204
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15546264 gccataaatgaagaaatatgagagatgaaaaatatctgcaatcggtcgttaatggacctaa 15546204  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22209535 - 22209472
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattcataggtttgact-aacctattattatt 220  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22209535 tatttataattaattttatttatgtttatcattattcattggtttgactaaacctattattatt 22209472  T

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Target: scaffold0092 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Original strand, 54764 - 54838
Alignment:
Q  39 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatctgcaatcggtagttaatggatctaaaatgatgattcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  54764 gccataaatgaagaaatatgagagatgaataatatatgcaatcggtagttaatagacctaaaatgatgattcaat 54838  T

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Target: scaffold1379 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1379
Description:

Target: scaffold1379; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 345 - 308
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattattca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  345 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattattca 308  T

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Target: scaffold0283 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0283
Description:

Target: scaffold0283; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1550 - 1515
Alignment:
Q  158 tatttgtaattaatttcattgatgtctgtcattatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1550 tatttgtaattaatttcattgatgtctatcattatt 1515  T

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