View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13955_low_22 (Length: 447)

Name: NF13955_low_22
Description: NF13955
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13955_low_22
NF13955_low_22
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (10-440)||(19886483-19886913)
chr2 (10-258)||(17396669-17396916)
chr2 (178-440)||(11231161-11231426)
chr2 (178-440)||(22513008-22513273)
chr2 (178-440)||(28775630-28775895)
chr2 (178-440)||(24685604-24685869)
chr2 (10-258)||(19794720-19794967)
chr2 (15-258)||(462743-462985)
chr2 (10-258)||(8891242-8891489)
chr2 (10-258)||(20627329-20627576)
chr2 (10-258)||(36982457-36982704)
chr2 (10-242)||(43642989-43643220)
chr2 (10-258)||(7507860-7508107)
chr2 (10-243)||(24341420-24341652)
chr2 (178-389)||(8944014-8944226)
chr2 (178-389)||(12728560-12728772)
chr2 (316-440)||(24826522-24826646)
chr2 (178-389)||(16935761-16935973)
chr2 (178-389)||(17006421-17006633)
chr2 (178-389)||(34824643-34824855)
chr2 (178-352)||(3798516-3798691)
chr2 (178-347)||(23777963-23778133)
chr2 (10-258)||(25265406-25265653)
chr2 (178-389)||(42177845-42178057)
chr2 (178-389)||(12635744-12635956)
chr2 (178-347)||(12641560-12641730)
chr2 (244-389)||(23774370-23774516)
chr2 (244-347)||(5888548-5888652)
chr2 (127-258)||(19689417-19689548)
chr2 (127-258)||(23820187-23820318)
chr2 (127-258)||(14906456-14906587)
chr2 (213-301)||(21142098-21142187)
chr2 (127-258)||(20015127-20015258)
chr2 (316-389)||(25213372-25213446)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (10-440)||(12374-12804)
chr5 (10-440)||(21073417-21073847)
chr5 (10-440)||(18777814-18778244)
chr5 (10-440)||(22366302-22366733)
chr5 (10-440)||(19499899-19500328)
chr5 (10-440)||(25426628-25427058)
chr5 (10-440)||(43443220-43443647)
chr5 (10-440)||(4199807-4200237)
chr5 (10-414)||(27009841-27010244)
chr5 (62-440)||(29188107-29188483)
chr5 (10-242)||(23506965-23507196)
chr5 (178-440)||(10777793-10778058)
chr5 (178-440)||(21932204-21932469)
chr5 (178-440)||(21938374-21938639)
chr5 (178-440)||(35582204-35582469)
chr5 (178-440)||(36989593-36989858)
chr5 (211-440)||(22882907-22883139)
chr5 (178-414)||(7425492-7425729)
chr5 (10-243)||(27182578-27182810)
chr5 (178-390)||(11211940-11212153)
chr5 (10-258)||(22053849-22054096)
chr5 (10-258)||(18531083-18531330)
chr5 (178-440)||(17471411-17471676)
chr5 (178-389)||(35790974-35791186)
chr5 (21-258)||(34939289-34939524)
chr5 (178-389)||(23514729-23514941)
chr5 (178-389)||(1219396-1219608)
chr5 (244-389)||(23328791-23328937)
chr5 (244-389)||(24616395-24616541)
chr5 (244-389)||(24712771-24712917)
chr5 (244-389)||(24745789-24745935)
chr5 (316-440)||(11343008-11343134)
chr5 (127-258)||(20623085-20623216)
chr5 (127-258)||(21233544-21233675)
chr5 (316-440)||(16105967-16106093)
chr5 (128-258)||(25900422-25900552)
chr5 (127-258)||(16536313-16536444)
chr5 (127-258)||(37052860-37052991)
chr5 (14-54)||(29190482-29190522)
chr5 (178-258)||(32950862-32950942)
chr5 (10-51)||(17471803-17471844)
chr5 (174-258)||(26559815-26559900)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (10-440)||(27653805-27654235)
chr6 (10-414)||(25175563-25175968)
chr6 (10-336)||(16825678-16826006)
chr6 (14-440)||(14625952-14626377)
chr6 (14-347)||(1650022-1650352)
chr6 (178-440)||(16376196-16376461)
chr6 (178-440)||(16383520-16383785)
chr6 (178-440)||(10488867-10489132)
chr6 (211-440)||(22251389-22251621)
chr6 (178-440)||(22225561-22225826)
chr6 (178-414)||(16232060-16232297)
chr6 (240-440)||(19299467-19299670)
chr6 (178-429)||(16555973-16556227)
chr6 (178-429)||(16632529-16632783)
chr6 (21-258)||(23153458-23153694)
chr6 (178-414)||(18086674-18086911)
chr6 (244-414)||(29869627-29869798)
chr6 (21-258)||(1657764-1657999)
chr6 (10-258)||(35009455-35009702)
chr6 (178-389)||(1556173-1556385)
chr6 (178-389)||(19610186-19610398)
chr6 (21-258)||(15862484-15862718)
chr6 (178-389)||(23977937-23978149)
chr6 (78-343)||(29665941-29666208)
chr6 (331-440)||(16814820-16814930)
chr6 (178-347)||(13620712-13620882)
chr6 (189-258)||(27751603-27751672)
chr6 (316-389)||(4991396-4991470)
chr6 (174-258)||(19854317-19854402)
chr6 (10-159)||(27740838-27740985)
chr6 (174-234)||(29605612-29605672)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (10-440)||(36093-36523)
scaffold0023 (223-436)||(169736-169951)
scaffold0023 (10-258)||(48598-48845)
scaffold0023 (178-389)||(153883-154095)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (10-440)||(30120722-30121153)
chr8 (10-440)||(21851786-21852217)
chr8 (10-440)||(21844393-21844824)
chr8 (10-411)||(16674245-16674644)
chr8 (14-440)||(24548986-24549410)
chr8 (14-440)||(6774082-6774505)
chr8 (10-200)||(222753-222943)
chr8 (10-200)||(736376-736566)
chr8 (10-200)||(860271-860461)
chr8 (10-258)||(43373484-43373731)
chr8 (178-440)||(271183-271448)
chr8 (178-440)||(644472-644737)
chr8 (178-440)||(830207-830472)
chr8 (9-258)||(16193732-16193980)
chr8 (237-440)||(15318982-15319188)
chr8 (237-440)||(15499351-15499557)
chr8 (178-440)||(22088617-22088882)
chr8 (21-258)||(24928807-24929043)
chr8 (178-389)||(22006134-22006346)
chr8 (10-258)||(16404991-16405235)
chr8 (178-389)||(13720804-13721016)
chr8 (21-258)||(17345581-17345816)
chr8 (178-389)||(16195399-16195611)
chr8 (178-389)||(13662141-13662353)
chr8 (178-352)||(16872964-16873139)
chr8 (10-258)||(22907230-22907476)
chr8 (138-200)||(691908-691970)
chr8 (127-258)||(5238203-5238334)
chr8 (127-258)||(24661264-24661395)
chr8 (127-258)||(43685662-43685793)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (10-440)||(13910846-13911277)
chr7 (10-440)||(10989410-10989841)
chr7 (10-440)||(2437457-2437889)
chr7 (10-414)||(13572676-13573079)
chr7 (10-440)||(16478785-16479213)
chr7 (10-347)||(18253761-18254098)
chr7 (178-440)||(7822896-7823161)
chr7 (178-440)||(7830207-7830472)
chr7 (178-440)||(27176601-27176866)
chr7 (16-240)||(25292372-25292595)
chr7 (178-440)||(27101460-27101725)
chr7 (178-440)||(27108808-27109073)
chr7 (178-440)||(38783552-38783817)
chr7 (10-258)||(47481047-47481294)
chr7 (10-258)||(13037030-13037277)
chr7 (15-258)||(11580755-11580997)
chr7 (12-258)||(16211768-16212013)
chr7 (178-414)||(18979872-18980109)
chr7 (10-243)||(36052667-36052896)
chr7 (178-414)||(15927736-15927973)
chr7 (10-258)||(3059966-3060213)
chr7 (178-440)||(15950613-15950879)
chr7 (178-389)||(13758538-13758750)
chr7 (178-389)||(15759990-15760202)
chr7 (10-258)||(13321014-13321263)
chr7 (10-258)||(7293017-7293263)
chr7 (178-352)||(14250811-14250986)
chr7 (265-347)||(15862174-15862257)
chr7 (244-347)||(16418731-16418835)
chr7 (176-347)||(48622584-48622756)
chr7 (244-347)||(10000288-10000392)
chr7 (127-258)||(11516343-11516474)
chr7 (127-258)||(15441580-15441711)
chr7 (127-258)||(30262145-30262276)
chr7 (316-390)||(15516719-15516793)
chr7 (153-237)||(296003-296087)
chr7 (174-258)||(28722272-28722357)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (10-440)||(10644219-10644648)
chr4 (10-389)||(47357654-47358030)
chr4 (18-234)||(13048261-13048477)
chr4 (10-243)||(13246430-13246662)
chr4 (10-242)||(54118276-54118507)
chr4 (10-258)||(15675105-15675352)
chr4 (178-414)||(15287096-15287333)
chr4 (178-440)||(18169138-18169403)
chr4 (178-414)||(15294205-15294442)
chr4 (10-243)||(31115629-31115861)
chr4 (244-414)||(22351915-22352086)
chr4 (178-352)||(17145570-17145745)
chr4 (178-389)||(7131941-7132153)
chr4 (213-347)||(18248421-18248556)
chr4 (178-347)||(19020654-19020824)
chr4 (110-243)||(121989-122121)
chr4 (78-243)||(10104281-10104445)
chr4 (178-389)||(20000891-20001103)
chr4 (10-258)||(26680201-26680447)
chr4 (244-389)||(26339253-26339399)
chr4 (236-338)||(8378377-8378480)
chr4 (178-309)||(22738437-22738568)
chr4 (10-107)||(111395-111492)
chr4 (127-258)||(10488678-10488809)
chr4 (127-258)||(16327942-16328073)
chr4 (316-414)||(14952085-14952183)
chr4 (78-243)||(40885585-40885749)
chr4 (273-347)||(9795490-9795564)
chr4 (315-389)||(14996444-14996518)
chr4 (10-54)||(10104450-10104494)
chr4 (211-258)||(33240900-33240947)
chr4 (314-347)||(8378491-8378524)
chr4 (174-258)||(18238157-18238242)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (10-440)||(42997-43427)
scaffold0076 (178-440)||(39271-39536)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (10-440)||(31497-31928)
scaffold0008 (10-243)||(128200-128431)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (10-414)||(55316219-55316622)
chr3 (10-414)||(41270075-41270478)
chr3 (10-390)||(16821139-16821517)
chr3 (10-347)||(15936553-15936890)
chr3 (14-347)||(15614838-15615168)
chr3 (13-347)||(15938395-15938729)
chr3 (10-389)||(14842446-14842824)
chr3 (10-258)||(13975738-13975985)
chr3 (10-258)||(45860805-45861052)
chr3 (9-258)||(51158034-51158282)
chr3 (10-258)||(15859040-15859287)
chr3 (178-440)||(49232604-49232869)
chr3 (10-258)||(13954906-13955153)
chr3 (178-440)||(1467562-1467827)
chr3 (10-258)||(12030163-12030410)
chr3 (178-440)||(12264614-12264880)
chr3 (10-258)||(2049810-2050057)
chr3 (211-440)||(12812042-12812274)
chr3 (21-258)||(13838905-13839141)
chr3 (178-440)||(22275377-22275642)
chr3 (178-389)||(15468216-15468428)
chr3 (178-389)||(25058907-25059119)
chr3 (178-389)||(18911161-18911373)
chr3 (10-240)||(17912516-17912744)
chr3 (211-389)||(18896920-18897099)
chr3 (178-347)||(12902008-12902178)
chr3 (178-389)||(5228481-5228692)
chr3 (127-347)||(54651573-54651795)
chr3 (10-258)||(16744131-16744377)
chr3 (127-258)||(2449254-2449385)
chr3 (178-347)||(44229153-44229323)
chr3 (10-123)||(47984650-47984763)
chr3 (10-123)||(47993937-47994050)
chr3 (10-123)||(48003224-48003337)
chr3 (10-123)||(48012510-48012623)
chr3 (315-389)||(8268609-8268683)
chr3 (315-389)||(8275709-8275783)
chr3 (10-51)||(15468555-15468596)
chr3 (174-258)||(41661727-41661812)
chr3 (178-258)||(11986182-11986262)
chr3 (10-51)||(22275209-22275250)
chr3 (174-258)||(31412333-31412418)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (10-414)||(5072237-5072640)
chr1 (10-309)||(18601071-18601370)
chr1 (10-386)||(22227809-22228185)
chr1 (10-386)||(22232506-22232882)
chr1 (14-347)||(2116258-2116589)
chr1 (76-347)||(45051489-45051757)
chr1 (10-258)||(20931345-20931592)
chr1 (178-440)||(18059581-18059846)
chr1 (178-440)||(17148735-17149001)
chr1 (10-258)||(20913037-20913277)
chr1 (178-440)||(17004806-17005071)
chr1 (178-440)||(38054914-38055179)
chr1 (10-243)||(20893657-20893889)
chr1 (240-440)||(19962322-19962525)
chr1 (10-258)||(41394222-41394469)
chr1 (10-242)||(20445679-20445910)
chr1 (10-234)||(20531444-20531667)
chr1 (10-240)||(37844484-37844714)
chr1 (178-352)||(46523557-46523731)
chr1 (244-389)||(22035681-22035827)
chr1 (244-389)||(7640810-7640956)
chr1 (127-240)||(51452608-51452721)
chr1 (316-390)||(15861284-15861358)
chr1 (14-54)||(45051446-45051486)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (10-414)||(64372-64780)
scaffold0026 (10-347)||(107747-108084)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (10-440)||(20936-21367)
scaffold0139 (10-440)||(13882-14312)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (10-389)||(35-411)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (116-414)||(1153-1450)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (10-389)||(5088-5466)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (14-347)||(9266-9596)
scaffold0215 (14-347)||(16164-16494)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (10-389)||(3722-4102)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (106-418)||(13171-13480)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (14-389)||(2966-3341)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (34-258)||(5552-5776)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (12-258)||(3598-3843)
scaffold0266 (10-258)||(1124-1371)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (10-258)||(12115-12360)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (10-258)||(6080-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (10-258)||(972-1218)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (10-258)||(48187-48434)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (236-405)||(29388-29558)
scaffold0213 (379-440)||(29565-29627)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (10-242)||(8878-9109)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (178-440)||(31477-31742)
scaffold0107 (178-299)||(39814-39935)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (10-243)||(148721-148953)
scaffold0025 (10-258)||(8849-9096)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (10-258)||(19206-19453)
scaffold0195 (10-258)||(21290-21537)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (10-258)||(36929-37176)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (10-242)||(123196-123427)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (10-243)||(5092-5324)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (21-258)||(247458-247694)
scaffold0012 (178-347)||(34076-34246)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (10-258)||(26431-26678)
scaffold0162 (127-258)||(8196-8327)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (21-243)||(171916-172137)
scaffold0001 (21-243)||(177619-177840)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (14-258)||(41733-41976)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (244-414)||(6831-7002)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (10-258)||(550-797)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (16-243)||(272031-272257)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (236-389)||(10624-10778)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (10-258)||(34476-34724)
scaffold0075 (274-347)||(34374-34450)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (178-389)||(1451-1663)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (213-440)||(7278-7509)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (178-440)||(2560-2826)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (178-389)||(1390-1602)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (10-258)||(41648-41895)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (246-414)||(23600-23769)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (10-116)||(9-115)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (10-258)||(13506-13753)
scaffold0132 (274-347)||(13779-13855)
scaffold0132 (316-348)||(42677-42709)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (10-116)||(48514-48620)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (178-347)||(45198-45369)
scaffold0066 (78-347)||(54484-54755)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (316-440)||(130880-131006)
scaffold0028 (128-258)||(89470-89600)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (128-258)||(51198-51328)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (178-347)||(10257-10427)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (10-258)||(37082-37328)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (176-347)||(54040-54212)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (244-347)||(7443-7547)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (176-309)||(3579-3712)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (10-107)||(9382-9479)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (244-347)||(12045-12149)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (181-258)||(3360-3437)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (127-258)||(22656-22787)
scaffold0141 (127-258)||(26911-27042)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (127-258)||(1598-1729)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (323-414)||(154282-154373)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (273-347)||(13268-13342)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (316-440)||(17115-17241)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (111-258)||(56115-56262)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (176-258)||(8174-8257)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (174-258)||(14198-14283)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (174-258)||(108171-108256)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (178-258)||(4-84)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886483
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886713 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 19886614  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886613 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagtttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 19886514  T
Q  410 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886513 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 19886483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396669
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17396916 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 17396817  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  17396816 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 17396717  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     || |||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  17396716 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt 17396669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11231426 - 11231161
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  11231426 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 11231327  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  11231326 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 11231227  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11231226 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 11231161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22513273 - 22513008
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  22513273 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 22513174  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  22513173 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 22513074  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22513073 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 22513008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28775895 - 28775630
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  28775895 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 28775796  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  28775795 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 28775696  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28775695 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 28775630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24685869 - 24685604
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  24685869 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 24685770  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  24685769 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 24685670  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  24685669 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacacttttgttcttctct 24685604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794720
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19794867 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 19794769  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  19794768 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 19794720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Original strand, 462743 - 462985
Alignment:
Q  15 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  115 acaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  462843 acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
Q  215 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||    
T  462942 aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaattt 462985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891489
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8891342 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta 8891440  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||    
T  8891441 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaattt 8891489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627329
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | |||||||    
T  20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20627476 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20627378  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  20627377 tcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 20627329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982457
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  36982604 caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta 36982506  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  36982505 tcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 36982457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642989
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||| ||||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43643120 taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43643022  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcaca 242  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43643021 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca 43642989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507860
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
T  7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa- 7508009  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7508008 ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7507909 atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaattt 7507860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341420
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  24341552 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta 24341454  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24341453 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 24341420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 8944014 - 8944226
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  8944014 aacatgtaatttcacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 8944113  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  8944114 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 8944213  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||| ||||||||    
T  8944214 aatttagctccta 8944226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 12728560 - 12728772
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  12728560 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 12728659  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  12728660 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 12728759  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||| ||||||||    
T  12728760 aatttagctccta 12728772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 316 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24826646 - 24826522
Alignment:
Q  316 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt 415  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826646 atgattatgatgatgactaacccctttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt 24826547  T
Q  416 cccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  24826546 cccttcaaccctcttgctcttctct 24826522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 16935761 - 16935973
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  16935761 aacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaa 16935860  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  ||  ||||    
T  16935861 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttc 16935960  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  16935961 aattcagctccta 16935973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 17006421 - 17006633
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  17006421 aacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaa 17006520  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  ||  ||||    
T  17006521 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttc 17006620  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  17006621 aattcagctccta 17006633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 34824643 - 34824855
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  34824643 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 34824742  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  34824743 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 34824842  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||| ||||||||    
T  34824843 aatttagctccta 34824855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3798691 - 3798516
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||||||| ||| |||||||||||||||  |   |||||||||||||    
T  3798691 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaa 3798592  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3798591 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttaccttagaag 3798516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 178 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23778133 - 23777963
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||| | ||||  |||| |  | ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  23778133 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 23778034  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23778033 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccctttacctt 23777963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265406
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25265553 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 25265455  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  25265454 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaattt 25265406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 42178057 - 42177845
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||| ||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  42178057 aacatgtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 42177958  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||  || |||||    
T  42177957 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttc 42177858  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||| ||||    
T  42177857 aattcagccccta 42177845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12635956 - 12635744
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  12635956 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 12635857  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  12635856 cctattttcatacaacatgaggaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 12635757  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||| ||||||||    
T  12635756 aatttagctccta 12635744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 178 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12641730 - 12641560
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||| | ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||||||| ||| |||||||||||||||  |   |||||||||||||    
T  12641730 aacatgtaatttcagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaa 12641631  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12641630 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 12641560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 389
Target Start/End: Original strand, 23774370 - 23774516
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa-ttacacatgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23774370 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataataactaaccccctt 23774469  T
Q  343 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  23774470 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23774516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5888652 - 5888548
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | |||||||||| | ||| |||||||||    
T  5888652 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaaccccctt 5888553  T
Q  343 acctt 347  Q
    |||||    
T  5888552 acctt 5888548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689417
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  19689448 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 19689417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820318
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  23820287 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 23820318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906456
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  14906487 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 14906456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 301
Target Start/End: Original strand, 21142098 - 21142187
Alignment:
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 301  Q
    |||||||||||| |  || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21142098 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 21142187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015258
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
T  20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  20015227 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 20015258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 389
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213446
Alignment:
Q  316 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgatta-tccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 25213446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12804
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12574 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaa 12673  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12674 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 12773  T
Q  410 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 12804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073417
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073647 acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 21073548  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073547 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 21073448  T
Q  410 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073447 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 21073417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18777814
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778044 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 18777945  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18777944 ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttaattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctc 18777845  T
Q  410 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18777844 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 18777814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366302
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366533 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22366434  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcct 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22366433 ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcaactcctaggtcaccccacttgattgct 22366334  T
Q  409 aaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22366333 aaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 22366302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500328
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500099 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 19500198  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  19500199 ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta-gtcacccacttgattcctc 19500297  T
Q  410 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19500298 aagcttcccttcaactctcttgttcttctct 19500328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25427058
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426828 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 25426927  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatc-cttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcct 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  25426928 ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctccta-gttacccacttgattctt 25427026  T
Q  409 aaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25427027 taagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 25427058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443220
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||    
T  43443447 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaatccattttcatataacatgagaatatgc--aa 43443350  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43443349 ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcct- 43443251  T
Q  410 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43443250 aagcttcccttcaaccctcatgctcttctct 43443220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4199807
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4200037 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaaa 4199938  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199937 ttacacatgattatgataatccctaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 4199838  T
Q  410 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4199837 aagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 4199807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 414
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010244
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27009841 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 27009940  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  27009941 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca 27010040  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27010041 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 27010140  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27010141 at-tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattccta 27010239  T
Q  410 aagct 414  Q
    |||||    
T  27010240 aagct 27010244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 62 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188107
Alignment:
Q  62 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttat 161  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
Q  162 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgac 261  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |    
T  29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc 29188285  T
Q  262 atgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatc 361  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29188284 atgaattgttcatcgacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt--acatgattataataatcactaacccccttacctttgaagttgattatc 29188187  T
Q  362 cttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
      ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29188186 tctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 29188107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507196
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23507065 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 23507163  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcaca 242  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23507164 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca 23507196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10778058 - 10777793
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  10778058 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 10777959  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa-ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  10777958 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaccccccttacctttgaagatgattatccttaacccttgcttc 10777859  T
Q  377 aattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagctt-cccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10777858 aattcagctcctaggtcaccccacttgattcctcaagcttccccttcaactctcttgttcttctct 10777793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21932469 - 21932204
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  21932469 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 21932370  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  21932369 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 21932270  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21932269 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 21932204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21938639 - 21938374
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  21938639 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 21938540  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  21938539 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 21938440  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21938439 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 21938374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 35582204 - 35582469
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  35582204 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 35582303  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  35582304 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 35582403  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35582404 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 35582469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36989858 - 36989593
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  36989858 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 36989759  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  36989758 cccattttcatacaacatgagaaattgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 36989659  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36989658 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 36989593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 211 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22883139 - 22882907
Alignment:
Q  211 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 309  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22883139 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 22883040  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 408  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |     
T  22883039 ttgtacatgattatgataataactaacccccttatctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgatttcc 22882940  T
Q  409 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22882939 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 22882907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 178 - 414
Target Start/End: Original strand, 7425492 - 7425729
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  7425492 aacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaa 7425591  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  7425592 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 7425691  T
Q  377 aattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7425692 aattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 7425729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182578
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  27182710 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta 27182612  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27182611 tcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacag 27182578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11212153 - 11211940
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  11212153 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 11212054  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  || |||||    
T  11212053 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttc 11211954  T
Q  377 aattcagctcctag 390  Q
    ||||||||||||||    
T  11211953 aattcagctcctag 11211940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053849
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22053996 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 22053898  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  22053897 tcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 22053849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531083
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18531230 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 18531083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17471676 - 17471411
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  17471676 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaa 17471577  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa-ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||  || |||||    
T  17471576 cccattttcatacaacatgagaaaatacaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaactcaaactcttgcttc 17471477  T
Q  377 aattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc--ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||||    
T  17471476 aattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaaatc-cttgttcttctct 17471411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 35791186 - 35790974
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  35791186 aacatgtaatttcactcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 35791087  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  35791086 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 35790987  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  35790986 aattcagctccta 35790974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939524
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact 34939387  T
Q  121 taggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  34939388 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 34939486  T
Q  221 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34939487 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 34939524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 23514729 - 23514941
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  23514729 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 23514828  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  23514829 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 23514928  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  23514929 aattcagctccta 23514941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1219608 - 1219396
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||| ||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  1219608 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 1219509  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  1219508 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 1219409  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||| ||||||||    
T  1219408 aatttagctccta 1219396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 389
Target Start/End: Original strand, 23328791 - 23328937
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23328791 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 23328890  T
Q  343 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  23328891 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23328937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 389
Target Start/End: Original strand, 24616395 - 24616541
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24616395 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 24616494  T
Q  343 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  24616495 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24616541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 389
Target Start/End: Original strand, 24712771 - 24712917
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24712771 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 24712870  T
Q  343 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  24712871 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24712917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 389
Target Start/End: Original strand, 24745789 - 24745935
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24745789 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 24745888  T
Q  343 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  24745889 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24745935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 316 - 440
Target Start/End: Original strand, 11343008 - 11343134
Alignment:
Q  316 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc- 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  11343008 atgattatgataaaaactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaacctctgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctcaagct 11343107  T
Q  414 ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11343108 ttcccttcaacactcttgttcttctct 11343134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623216
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  20623185 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 20623216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233544
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  21233575 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 21233544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 440
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106093
Alignment:
Q  316 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc- 413  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||     
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 16106066  T
Q  414 ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16106067 ttcccttcaacactcttgttcttctct 16106093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900422
Alignment:
Q  128 aattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    |||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
Q  228 aaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    ||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  25900452 aaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 25900422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536444
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  16536413 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 16536444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37052991
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  37052960 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 37052991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 54  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29190522 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa 29190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 258
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950942
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt 32950942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471803
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 51  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17471844 catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat 17471803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26559900 - 26559815
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| |||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26559900 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaagagcacgaattt 26559815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653805
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654035 acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 27653936  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653935 ttacacatgattatgataatcactaaccccctcacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 27653836  T
Q  410 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27653835 aagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 27653805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 414
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175968
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25175763 acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa 25175862  T
Q  309 attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatc-cttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcc 407  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25175863 attatacatgattatggtaatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctccta-gtcacccacttgattcc 25175961  T
Q  408 taaagct 414  Q
     ||||||    
T  25175962 gaaagct 25175968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825678
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826006 catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 16825907  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac 207  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16825906 taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac 16825807  T
Q  208 taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825806 taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaa 16825707  T
Q  308 aattacacatgattatgataataactaac 336  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16825706 aattacacatgattatgataatcactaac 16825678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14625952
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    |||||||||| | || ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  14626277 aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaaatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||| | ||| | | ||  |||| ||||||  ||||||  || ||| |     
T  14626178 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcaca-attcaaacaacatttgagaatttgtaaagtg 14626080  T
Q  312 acacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaa 411  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14626079 a-agatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctcaa 14625981  T
Q  412 gcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14625980 gcttcccttcaaccctcttgttcttctct 14625952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650022
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
     | ||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  1650252 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 1650154  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattac 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1650153 caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt-- 1650056  T
Q  314 acatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1650055 acatgattatgataaagactaacccccttacctt 1650022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16376461 - 16376196
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  16376461 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 16376362  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  16376361 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 16376262  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16376261 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 16376196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16383785 - 16383520
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  16383785 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 16383686  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  16383685 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 16383586  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16383585 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 16383520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 10488867 - 10489132
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  10488867 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 10488966  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  10488967 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 10489066  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10489067 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 10489132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 211 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22251621 - 22251389
Alignment:
Q  211 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 309  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22251621 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 22251522  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 408  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22251521 ttgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcct 22251422  T
Q  409 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
     |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22251421 caagctttccattcaacactcttgttcttctct 22251389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22225826 - 22225561
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  22225826 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 22225727  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||    
T  22225726 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 22225627  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22225626 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccattcaacactcttgttcttctct 22225561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 178 - 414
Target Start/End: Original strand, 16232060 - 16232297
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  16232060 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 16232159  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  16232160 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 16232259  T
Q  377 aattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16232260 aattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 16232297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 240 - 440
Target Start/End: Original strand, 19299467 - 19299670
Alignment:
Q  240 acagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaaccc 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19299467 acagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccc 19299566  T
Q  339 ccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19299567 ccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaacactcttgttctt 19299666  T
Q  437 ctct 440  Q
    ||||    
T  19299667 ctct 19299670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 178 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16556227 - 16555973
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  16556227 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 16556128  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  16556127 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 16556028  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctct 429  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||    
T  16556027 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactct 16555973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 178 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16632783 - 16632529
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  16632783 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 16632684  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  16632683 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 16632584  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctct 429  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||    
T  16632583 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactct 16632529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153694
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  121 taggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23153558 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23153656  T
Q  221 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  23153657 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 23153694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 178 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18086911 - 18086674
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  18086911 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 18086812  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  18086811 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatactaataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 18086712  T
Q  377 aattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18086711 aattcagctcctaagtcacccacttgatttctaaagct 18086674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29869798 - 29869627
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29869798 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaattttaaattgattatgataataactaaccccctt 29869699  T
Q  343 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    ||||| ||||  ||| | ||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29869698 accttagaagaagatcaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 29869627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657764
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 1657901  T
Q  121 taggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  1657900 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1657802  T
Q  221 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1657801 tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaattt 1657764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009455
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35009602 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 35009504  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  35009503 tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaattt 35009455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 1556173 - 1556385
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  1556173 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 1556272  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |   ||  || |||||    
T  1556273 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttc 1556372  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  1556373 aattcagctccta 1556385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 19610186 - 19610398
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||| ||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  19610186 aacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaa 19610285  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  19610286 cccattttcatacaacatcagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 19610385  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  19610386 aattcagctccta 19610398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862718
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 15862581  T
Q  121 taggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15862582 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15862680  T
Q  221 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15862681 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 15862718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 23977937 - 23978149
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||||||| ||| |||||||||||||||  |   |||||||||||||    
T  23977937 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaa 23978036  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  23978037 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacgcccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 23978136  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||| ||||||||    
T  23978137 aatttagctccta 23978149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 343
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666208
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
Q  177 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 275  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| | ||||    
T  29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatc 29666138  T
Q  276 aacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaa-aattacacatgattatgataataactaaccccctta 343  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  29666139 accccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccactta 29666208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16814930 - 16814820
Alignment:
Q  331 actaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctct 429  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16814930 actaaccctcttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattgctaaagcttcccttcaaacctct 16814831  T
Q  430 tgttcttctct 440  Q
    || ||||||||    
T  16814830 tgctcttctct 16814820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13620882 - 13620712
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||| ||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  13620882 aacatgcaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 13620783  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  13620782 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt 13620712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 258
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751672
Alignment:
Q  189 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaattt 27751672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 389
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991470
Alignment:
Q  316 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgatta-tccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 4991470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Original strand, 19854317 - 19854402
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19854317 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt 19854402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 159
Target Start/End: Original strand, 27740838 - 27740985
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| |  | || |||| |||| |   |  |||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  27740838 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 27740937  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataactt 159  Q
     |||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27740938 caacaacgacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataactt 27740985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 234
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605672
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||  ||||||||||| ||||||||    
T  29605612 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacata 29605672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36523
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  36293 acatcaattcatacatacaaacataacatcactacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaacatgagaatatgcaaaa 36392  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36393 ttacacatgattatgataatcattaacccccttacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 36492  T
Q  410 aagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36493 aagctttccttcaaccctcttgctcttctct 36523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 223 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 169951 - 169736
Alignment:
Q  223 catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgatta 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  169951 catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattatacatgatta 169852  T
Q  323 tgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagcttc-cctt 420  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  169851 tgataatcactaacccccttacttttgaagatgattatcactaacccttgcttcaattcagctcttatgtcaccccacttgattcctcaagcttcgcctt 169752  T
Q  421 caaccctcttgttctt 436  Q
    |||| |||||||||||    
T  169751 caactctcttgttctt 169736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48845
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48698 tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48796  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  48797 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 48845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 154095 - 153883
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    ||||||||| |||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  154095 aacatgtaacttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 153996  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |   ||  || |||||    
T  153995 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttc 153896  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  153895 aattcagctccta 153883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30121153
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaa 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||    
T  30120922 acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagattatacaaaa 30121021  T
Q  309 attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcct 408  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30121022 attacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagatgattatctctaacccttacttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcct 30121121  T
Q  409 aaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30121122 aaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 30121153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851786
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
T  21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 21851918  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
     |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21851917 at-tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagctccacttcagcttctaggtcacccacttgattcctc 21851819  T
Q  410 aagctt--cccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  21851818 aagcttccccctccaacactcttgttcttctct 21851786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844393
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21844824 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat 21844725  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  21844724 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 21844625  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21844624 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 21844525  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21844524 at-tacatgattgtgataataactaacccccttaccgttgaagttgattatccttaatcctagctccacttcagcttctaggtcacccacttgattcctc 21844426  T
Q  410 aagctt--cccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  21844425 aagcttccccctccaacactcttgttcttctct 21844393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674245
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  16674644 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 16674545  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16674544 taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 16674445  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16674444 acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 16674345  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  || ||  || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16674344 at-tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagatta-actcaactcttgcttcaattcagctcataagtcacccacttgattccta 16674247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 440
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549410
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  24549086 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 24549184  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24549185 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt-- 24549282  T
Q  314 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagc 413  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24549283 acatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagctcctaggtcacccacttgattcctcaagc 24549382  T
Q  414 tt-cccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    || |||| |||| |||||||||||||||    
T  24549383 ttcccctccaacactcttgttcttctct 24549410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774082
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  6774405 aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 6774307  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  6774306 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaatt-- 6774209  T
Q  314 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagc 413  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6774208 acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta-gtcacccacttgattcctcaagc 6774110  T
Q  414 tt-cccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    || |||| |||| |||||||||||||||    
T  6774109 ttcccctccaacactcttgttcttctct 6774082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373484
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  43373631 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta 43373533  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||    
T  43373532 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaattt 43373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 271448 - 271183
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  271448 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 271349  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  271348 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 271249  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  271248 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 271183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 644472 - 644737
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  644472 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 644571  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  644572 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 644671  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  644672 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 644737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 830207 - 830472
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  830207 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 830306  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  830307 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 830406  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  830407 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 830472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193732
Alignment:
Q  9 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||| || | | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16193880 ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt 16193782  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  16193781 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 16193732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15319188 - 15318982
Alignment:
Q  237 atcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15319188 atcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaa 15319089  T
Q  336 cccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgtt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| || |||||||| ||||||||    
T  15319088 cccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagcttttccttcaacactcttgtt 15318989  T
Q  434 cttctct 440  Q
    |||||||    
T  15318988 cttctct 15318982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15499557 - 15499351
Alignment:
Q  237 atcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15499557 atcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaa 15499458  T
Q  336 cccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgtt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| || |||||||| ||||||||    
T  15499457 cccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagcttttccttcaacactcttgtt 15499358  T
Q  434 cttctct 440  Q
    |||||||    
T  15499357 cttctct 15499351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22088882 - 22088617
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  22088882 aacatgtaatttcacctataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 22088783  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  22088782 cacattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgatgataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 22088683  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22088682 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 22088617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928807
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||||||   ||| ||||||    
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  121 taggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24928943 tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24928845  T
Q  221 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||    
T  24928844 tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaattt 24928807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 22006346 - 22006134
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  22006346 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 22006247  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |   ||  || |||||    
T  22006246 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaactcaaactcttgcttc 22006147  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  22006146 aattcagctccta 22006134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404991
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||| |    
T  16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||   |||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16405135 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16405040  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  16405039 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 16404991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 13721016 - 13720804
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  13721016 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 13720917  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  13720916 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 13720817  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  13720816 aattcagctccta 13720804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345816
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 17345679  T
Q  121 taggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17345680 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17345778  T
Q  221 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17345779 tgcatataaacataacatcacagttagagcacgaattt 17345816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 16195399 - 16195611
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||  |||||||||||||    
T  16195399 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatcaa 16195498  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||  || |||||    
T  16195499 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataattaacccccttaccttagaagatgattaacccaaactcttgcttc 16195598  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||| ||||||    
T  16195599 aattcaactccta 16195611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 13662353 - 13662141
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||  ||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||    
T  13662353 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgtttatcaa 13662254  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  13662253 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 13662154  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  13662153 aattcagctccta 13662141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16873139 - 16872964
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||||||| ||| |||||||||||||||  |   |||||||||||||    
T  16873139 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaa 16873040  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16873039 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaag 16872964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907230
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  22907376 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 22907279  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  22907278 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 22907230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
Q  138 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238334
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  5238303 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 5238334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661264
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  24661295 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 24661264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685793
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  43685762 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 43685793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13910846
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
Q  110 taacaacaactt-aggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13911077 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa 13910978  T
Q  309 attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcct 408  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910977 attacacatgattatgataatcaataacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcct 13910878  T
Q  409 aaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13910877 aaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 13910846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989841
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10989609 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaatatgcaaaa 10989708  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacc-cacttgattcct 408  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10989709 ttatacatgattatgataatcactaacccccatacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattaagctcctatgtcacctcacttgattcct 10989808  T
Q  409 aaagcttcccttc-aaccctcttgttcttctct 440  Q
     ||||| |||||| ||| |||||| ||||||||    
T  10989809 caagctccccttctaacactcttgatcttctct 10989841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437889
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  2437457 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat 2437556  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2437557 taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 2437656  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437657 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 2437756  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcct 408  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2437757 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcct 2437856  T
Q  409 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
     |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2437857 caagctttcccttcaacactcctgttcttctct 2437889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 10 - 414
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13573079
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13572676 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13572775  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  |    
T  13572776 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca 13572875  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13572876 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 13572975  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13572976 at-tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattccta 13573074  T
Q  410 aagct 414  Q
    |||||    
T  13573075 aagct 13573079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478785
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||| || ||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16479113 taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16479015  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479014 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 16478915  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
    ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16478914 tt--aaatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagctcctaggtcacccacttgattcctc 16478817  T
Q  410 aagctt-cccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  16478816 aagcttcccctccaacactcttgttcttctct 16478785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253761
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18253998 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18253900  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaa 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18253899 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 18253800  T
Q  309 attacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18253799 attgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 18253761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 7822896 - 7823161
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  7822896 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 7822995  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  7822996 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 7823095  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7823096 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 7823161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 7830207 - 7830472
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  7830207 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 7830306  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  7830307 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 7830406  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7830407 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 7830472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 27176601 - 27176866
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  27176601 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 27176700  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  27176701 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 27176800  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27176801 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 27176866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292372
Alignment:
Q  16 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
Q  116 caacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||    
T  25292495 caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 25292397  T
Q  216 attcatgcatacaaacataacatca 240  Q
    |||||| |||||||||||| |||||    
T  25292396 attcatacatacaaacatatcatca 25292372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27101725 - 27101460
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  27101725 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 27101626  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  27101625 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 27101526  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27101525 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 27101460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27109073 - 27108808
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  27109073 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 27108974  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  27108973 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 27108874  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27108873 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 27108808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38783817 - 38783552
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  38783817 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 38783718  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  38783717 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 38783618  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38783617 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 38783552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481047
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  47481194 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 47481047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13037030
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||      
T  13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  13037177 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta 13037079  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  13037078 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 13037030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580755
Alignment:
Q  15 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 114  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  115 acaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  11580897 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 11580799  T
Q  215 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||    
T  11580798 aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaattt 11580755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 258
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212013
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 111  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  112 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 211  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |    
T  16211868 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc 16211966  T
Q  212 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  16211967 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 16212013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 178 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18980109 - 18979872
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  18980109 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 18980010  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  18980009 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 18979910  T
Q  377 aattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18979909 aattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 18979872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052896
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||   |||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  36052767 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta 36052862  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36052863 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacag 36052896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 178 - 414
Target Start/End: Original strand, 15927736 - 15927973
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||| |||||||    
T  15927736 aacatgtaatttcacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgatcatcaa 15927835  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  15927836 tccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 15927935  T
Q  377 aattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15927936 aattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 15927973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060213
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| || |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  3060066 taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||| ||||||||||| |||  |||||||   ||||||||||||    
T  3060165 tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaattt 3060213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15950879 - 15950613
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  15950879 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 15950780  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  15950779 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacccaaactcttgcttc 15950680  T
Q  377 aattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc--ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||  || |||||||  | |||||||||||||    
T  15950679 aattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctatttccttcaaaacccttgttcttctct 15950613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 13758538 - 13758750
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||||||| ||| |||||||||||||||  |   |||||||||||||    
T  13758538 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaa 13758637  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  13758638 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 13758737  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||| ||||||||    
T  13758738 aatttagctccta 13758750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 15760202 - 15759990
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||  |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  15760202 aacatgtaatttcacccacaaacatatcataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaa 15760103  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |   ||  || |||||    
T  15760102 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttc 15760003  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  15760002 aattcagctccta 15759990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321263
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
Q  110 taacaa-caacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatg-aacatgtaatttcaccaacaattatacaa 206  Q
     ||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13321114 caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 13321211  T
Q  207 ctaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13321212 ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 13321263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293263
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  7293117 caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 7293214  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
      || |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  7293215 ttattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 7293263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 178 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14250986 - 14250811
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  14250986 aacatgtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 14250887  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14250886 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaaatgaacatgattacgatgataactaacccccttaccttagaag 14250811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862257
Alignment:
Q  265 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862174 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt 15862257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 16418731 - 16418835
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | |||||||||| | ||| |||||||||    
T  16418731 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaaccccctt 16418830  T
Q  343 acctt 347  Q
    |||||    
T  16418831 acctt 16418835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48622756 - 48622584
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  48622756 tgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatc 48622657  T
Q  276 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa-ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  48622656 aacccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 48622584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10000392 - 10000288
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | |||||||||| |  || |||||||||    
T  10000392 caagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaagatgcaaaatttgaaattgattatgatgaagacaaaccccctt 10000293  T
Q  343 acctt 347  Q
    |||||    
T  10000292 acctt 10000288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516474
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  11516443 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 11516474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441580
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  15441611 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 15441580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262145
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  30262176 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 30262145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516719
Alignment:
Q  316 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctag 390  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||  || |||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 296003
Alignment:
Q  153 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataaca 296003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Original strand, 28722272 - 28722357
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| ||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  28722272 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaattt 28722357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644648
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 10644518  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  10644519 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttcacttcagctcctagatcacccacttgattcctc 10644616  T
Q  410 aagctt-cccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  10644617 aagcttcccctccaacactcttgttcttctct 10644648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47358030
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47357854 acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaggaaatgcaaaa 47357953  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  47357954 tt--acatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacc-caactcttgcttcaattcagctccta 47358030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048261
Alignment:
Q  18 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
Q  118 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
Q  218 tcatgcatacaaacata 234  Q
    |||||||||||||||||    
T  13048277 tcatgcatacaaacata 13048261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246662
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13246530 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13246628  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13246629 tcattaattcatgcatacaaacatatcatcacag 13246662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118276
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
T  54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  54118407 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 54118309  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcaca 242  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54118308 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca 54118276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675105
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15675252 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15675154  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  15675153 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 15675105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 178 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15287333 - 15287096
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||| ||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||     
T  15287333 aacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcat 15287234  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  15287233 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 15287134  T
Q  377 aattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15287133 aattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 15287096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 18169138 - 18169403
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  18169138 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 18169237  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||| || |||||    
T  18169238 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc-ttgaagaagattaaccctaattcttgcttc 18169336  T
Q  377 aattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc--ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||  ||| ||||||  | |||||||||||||    
T  18169337 aattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctct 18169403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 178 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15294442 - 15294205
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||| ||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||     
T  15294442 aacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcat 15294343  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  15294342 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 15294243  T
Q  377 aattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15294242 aattcagctcctaagtcacccacttcattcctaaagct 15294205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115861
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31115729 caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 31115827  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31115828 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 31115861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22352086 - 22351915
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22352086 caagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 22351987  T
Q  343 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22351986 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 22351915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17145745 - 17145570
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||| | |  || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17145745 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 17145646  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaag 352  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17145645 ctcattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaag 17145570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 7132153 - 7131941
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  7132153 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 7132054  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |  ||  || |||||    
T  7132053 cccattttcatataacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactcttgcttc 7131954  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  7131953 aattcagctccta 7131941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 213 - 347
Target Start/End: Original strand, 18248421 - 18248556
Alignment:
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaatt 311  Q
    |||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18248421 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt 18248520  T
Q  312 acacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248521 gtacaagattatgataataactaacccccttacctt 18248556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 178 - 347
Target Start/End: Original strand, 19020654 - 19020824
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19020654 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 19020753  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19020754 cccattttcatacaacatgacaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatggtaactaacccccttacctt 19020824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 110 - 243
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122121
Alignment:
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  122088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 122121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104281
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 177  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 10104281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 20000891 - 20001103
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||||||| ||| |||||||||||||||  |   |||||||||||||    
T  20000891 aacatgtaatttcacccagaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaa 20000990  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  20000991 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 20001090  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||| ||||||||    
T  20001091 aatttagctccta 20001103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680447
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  26680301 caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 26680398  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  26680399 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 26680447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 389
Target Start/End: Original strand, 26339253 - 26339399
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26339253 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 26339352  T
Q  343 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  26339353 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 26339399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 338
Target Start/End: Original strand, 8378377 - 8378480
Alignment:
Q  236 catcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaattacacatgattatgataataacta 334  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8378377 catcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataacta 8378476  T
Q  335 accc 338  Q
    ||||    
T  8378477 accc 8378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 309
Target Start/End: Original strand, 22738437 - 22738568
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||     
T  22738437 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagaacacgaatttaacatcaattgttcctcag 22738536  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738537 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22738568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111492
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 107  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 111492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488809
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  10488778 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 10488809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327942
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  16327973 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 16327942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 414
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952183
Alignment:
Q  316 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 14952183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885585
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||||||| | || |||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||| | |||| | |    
T  40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataat-ttcataacttgacatttatacatacttt 40885652  T
Q  177 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40885651 gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacag 40885585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 347
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795564
Alignment:
Q  273 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa-ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9795490 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 9795564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 389
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996518
Alignment:
Q  315 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  14996444 catgattatgataataactaacccccttaccttaaaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 14996518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104450
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 54  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa 10104450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 258
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33240947
Alignment:
Q  211 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  33240900 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 33240947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 347
Target Start/End: Original strand, 8378491 - 8378524
Alignment:
Q  314 acatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378491 acatgattatgataataactaatccccttacctt 8378524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18238242 - 18238157
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat-tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || || |||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18238242 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 18238157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43427
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaa 308  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaagagcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa 43296  T
Q  309 attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcct 408  Q
    |||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43297 att--acatgtttgtgatagtaactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcacttcagctcctagatcacccacttgattcct 43394  T
Q  409 aaagctt-cccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
     |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  43395 caagcttcccctccaacactcttgttcttctct 43427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 39271 - 39536
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  39271 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 39370  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  39371 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 39470  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39471 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 39536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31497
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
Q  110 taacaacaactt-aggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31728 aacatcaattcatgcattcaaacataacatcaccacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa 31629  T
Q  309 attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcct 408  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31628 attacacatgattatgataatcactaacccccttacatttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcct 31529  T
Q  409 aaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31528 aaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128200
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctc-aat 128333  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||| ||  | |||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  128332 taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 128234  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  128233 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 128200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 414
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316622
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  55316219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 55316318  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55316319 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 55316418  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55316419 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 55316518  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55316519 at-tacatgattgtgataataactaacccctttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattccta 55316617  T
Q  410 aagct 414  Q
    |||||    
T  55316618 aagct 55316622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 10 - 414
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270478
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  41270075 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 41270174  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41270175 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta 41270274  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41270275 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtagatgcaaaa 41270374  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41270375 at-tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattccta 41270473  T
Q  410 aagct 414  Q
    |||||    
T  41270474 aagct 41270478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 390
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821517
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggatttgacataaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 16821438  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctag 390  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |   ||  || |||||||||||||||||||    
T  16821439 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctcctag 16821517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936553
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15936790 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15936692  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaa 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15936691 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 15936592  T
Q  309 attacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  15936591 attgaacatgattataatgataactaacccccatacctt 15936553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615168
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  15614938 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat 15615036  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattac 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15615037 caattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt-- 15615134  T
Q  314 acatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15615135 acatgattatgataaagactaacccccttacctt 15615168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938395
Alignment:
Q  13 catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  15938629 caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 15938531  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaatt 311  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| ||||   ||||||| ||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15938530 tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatt 15938431  T
Q  312 acacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
      |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15938430 gaacatgattataatgataactaacccccttacctt 15938395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842446
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  14842724 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta 14842626  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaa 307  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||  ||  |||| | ||| | | ||  |||||||||||  ||||||  |||||    
T  14842625 tcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaca-attcatacaacatttgagaatttgcaa 14842527  T
Q  308 aattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    | | | | |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||  || ||||||||||||||||||    
T  14842526 agtga-agatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccctaactcttgcttcaattcagctccta 14842446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975738
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13975985 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13975886  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13975885 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13975786  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     || |||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  13975785 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt 13975738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861052
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45860805 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 45860904  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  45860905 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 45861004  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     || |||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  45861005 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt 45861052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158034
Alignment:
Q  9 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  51158182 ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 51158084  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  51158083 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 51158034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15859040
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15859187 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15859089  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  15859088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 15859040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 49232604 - 49232869
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  49232604 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 49232703  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  49232704 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 49232803  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49232804 aattcagctcataggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 49232869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954906
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13955153 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13955054  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13955053 taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13954954  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     || |||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  13954953 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt 13954906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1467827 - 1467562
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  1467827 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 1467728  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  1467727 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 1467628  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1467627 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 1467562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030163
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  12030310 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 12030212  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  12030211 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 12030163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12264880 - 12264614
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  12264880 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 12264781  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  || | | |||||    
T  12264780 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcccaacctttgcttc 12264681  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc--acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12264680 aattcagctcctaggtcaccccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 12264614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050057
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2049910 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 2050008  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||| ||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||    
T  2050009 tcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaattt 2050057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 440
Target Start/End: Original strand, 12812042 - 12812274
Alignment:
Q  211 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 309  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12812042 catcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaatatgagaaaatgcaaaga 12812141  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 408  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  12812142 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttaaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 12812241  T
Q  409 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12812242 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 12812274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839141
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| ||||||    
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  121 taggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  13839005 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 13839103  T
Q  221 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  13839104 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 13839141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 22275377 - 22275642
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||  |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  22275377 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 22275476  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa-ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   | |||||    
T  22275477 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccttaacttttgcttc 22275576  T
Q  377 aattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc--ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||||    
T  22275577 aattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaaatc-cttgttcttctct 22275642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 15468428 - 15468216
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||    
T  15468428 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcctcaa 15468329  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa-ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| || |||||    
T  15468328 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttc 15468229  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  15468228 aattcagctccta 15468216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 25058907 - 25059119
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  25058907 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 25059006  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||  | |||||    
T  25059007 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtgcatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatttttgcttc 25059106  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  25059107 aattcagctccta 25059119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 18911161 - 18911373
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  18911161 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 18911260  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||    
T  18911261 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttc 18911360  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  18911361 aattcagctccta 18911373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912516
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| |    
T  17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| ||    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17912644 caactacaacata--tcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 17912547  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17912546 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 17912516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 211 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18897099 - 18896920
Alignment:
Q  211 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa- 309  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18897099 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaac 18897000  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  18896999 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttggaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 18896920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 178 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12902178 - 12902008
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  12902178 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattattcatcaa 12902079  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12902078 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 12902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Original strand, 5228481 - 5228692
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||    
T  5228481 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaat-gttcatcaa 5228579  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || | |||    
T  5228580 cccattttcataacacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttc 5228679  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  5228680 aattcagctccta 5228692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 347
Target Start/End: Original strand, 54651573 - 54651795
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatg-aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 224  Q
    ||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| | |||| | || |||||| ||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  54651573 aaattcaccaattgagtataat-ttcataacttaacatttatacatactttgcaacatgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgca 54651671  T
Q  225 tacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattat 323  Q
     |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||    
T  54651672 caagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattat 54651771  T
Q  324 gataataactaacccccttacctt 347  Q
    ||| |  || ||||||||||||||    
T  54651772 gatgaagacaaacccccttacctt 54651795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744131
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| | ||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  16744277 caactataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacactta 16744180  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
      ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  16744179 ttatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 16744131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449254
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  2449285 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 2449254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 347
Target Start/End: Original strand, 44229153 - 44229323
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||| | ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  44229153 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaa 44229252  T
Q  278 cccattttcatacaa-catgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    ||||||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  44229253 cccattttcatacaaccatgagaaatgaaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 44229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  47984750 caacaacaacttag 47984763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  47994037 caacaacaacttag 47994050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003337
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  48003324 caacaacaacttag 48003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  48012610 caacaacaacttag 48012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 8268683 - 8268609
Alignment:
Q  315 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  8268683 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8268609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 8275783 - 8275709
Alignment:
Q  315 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  8275783 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8275709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468555
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 51  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Original strand, 41661727 - 41661812
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || ||||| ||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41661727 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaattt 41661812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986182
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  11986262 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt 11986182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275250
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 51  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22275209 catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat 22275250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31412418 - 31412333
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| |||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  31412418 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 31412333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072237
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  5072640 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 5072541  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5072540 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 5072441  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5072440 acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacttgagtaaatgcaaaa 5072341  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 409  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5072340 at-tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatctttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattccta 5072242  T
Q  410 aagct 414  Q
    |||||    
T  5072241 aagct 5072237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601071
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  18601370 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 18601271  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18601270 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 18601171  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18601170 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 18601071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 386
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228185
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22227909 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22228007  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaa 308  Q
     |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22228008 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22228107  T
Q  309 attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctc 386  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  || |||||||||||||||    
T  22228108 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctc 22228185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 386
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232882
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22232606 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22232704  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaa 308  Q
     |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22232705 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22232804  T
Q  309 attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctc 386  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  || |||||||||||||||    
T  22232805 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctc 22232882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116589
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcaaattaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  2116358 caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 2116456  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  2116457 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaaaatgcaaaatt- 2116555  T
Q  313 cacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2116556 -acatgattatgataatcactaacccctttacctt 2116589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 76 - 347
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051757
Alignment:
Q  76 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 175  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc 45051687  T
Q  276 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45051688 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat--cacatgattatgataaagactaacccccttacctt 45051757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931592
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20931445 taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20931543  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  20931544 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 20931592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18059846 - 18059581
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  18059846 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 18059747  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||    
T  18059746 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattatacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 18059647  T
Q  377 aattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18059646 aattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 18059581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 17148735 - 17149001
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||||||| ||| |||||||||||||||  |   |||||||||||||    
T  17148735 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaa 17148834  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaa-cccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagctt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||    
T  17148835 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaccccccttacctttgaagttgattatccccaacccttgctt 17148934  T
Q  376 caattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17148935 caattcagctcctatgtcaccccacttgattcctcaagctttcccttcaaccctcttgttcttctct 17149001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913277
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||       |||    
T  20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aat 20913129  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20913130 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20913228  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  20913229 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 20913277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 17004806 - 17005071
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  17004806 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 17004905  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  17004906 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 17005005  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17005006 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 17005071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38055179 - 38054914
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || |||||||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  38055179 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 38055080  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  38055079 cccattttcatacaacatgagaagatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 38054980  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38054979 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 38054914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893657
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||      
T  20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  20893789 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta 20893691  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20893690 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 20893657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 240 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19962525 - 19962322
Alignment:
Q  240 acagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaaccc 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19962525 acagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccc 19962426  T
Q  339 ccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19962425 ccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaacactcttgttctt 19962326  T
Q  437 ctct 440  Q
    ||||    
T  19962325 ctct 19962322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394469
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||      
T  41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  41394322 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta 41394420  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  41394421 tcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 41394469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20445910
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
T  20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20445779 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20445877  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcaca 242  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20445878 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca 20445910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531667
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
T  20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20531544 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20531642  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacata 234  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  20531643 tcatcaattcatgcatacaaacata 20531667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844484
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37844614 taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 37844516  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacatca 240  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37844515 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 37844484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 352
Target Start/End: Original strand, 46523557 - 46523731
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||  |  |||||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  46523557 aacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 46523656  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46523657 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaag 46523731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 389
Target Start/End: Original strand, 22035681 - 22035827
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22035681 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 22035780  T
Q  343 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  22035781 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 22035827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 7640956 - 7640810
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7640956 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 7640857  T
Q  343 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  7640856 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 7640810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 240
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452721
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
Q  227 caaacataacatca 240  Q
    |||||||| |||||    
T  51452708 caaacatatcatca 51452721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861284
Alignment:
Q  316 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctag 390  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| || |||  || |||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15861284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 54
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051486
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 54  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45051446 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa 45051486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64372
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  64780 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 64681  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  64680 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 64581  T
Q  210 acatc-----aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg 304  Q
     ||||     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  64580 tcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatg 64481  T
Q  305 caaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgat 404  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  64480 caaaaat-tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgat 64382  T
Q  405 tcctaaagct 414  Q
    |||| |||||    
T  64381 tccttaagct 64372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108084
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  107847 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 107945  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaa 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  107946 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 108045  T
Q  309 attacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  108046 attgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 108084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 20936
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||    
T  21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  21267 taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 21169  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21168 tcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 21069  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcct 408  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  21068 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcct 20969  T
Q  409 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
     |||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20968 caagctttcccttcaaaactcttgttcttctct 20936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 13882
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||    
T  14312 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat 14213  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  14212 tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 14114  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113 tcatcaattcatgcatacagacataacatcacagcaagagcacgatttag-caagaattgtgcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 14015  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcct 408  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  14014 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcct 13915  T
Q  409 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
     |||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  13914 caagctttcccttcaaaactcttgttcttctct 13882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Original strand, 35 - 411
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35 catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 134  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  135 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 234  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  235 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgag-caatgcaaaa 333  T
Q  310 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |  ||  || ||||||||||||||||||    
T  334 tt--acatgattttgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactctcgcttcaattcagctccta 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 116 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1153
Alignment:
Q  116 caacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
Q  216 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||    
T  1350 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtaaatgcaaaaat-tac 1252  T
Q  316 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1251 atgattgtgataataactaacccccctacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtcaccaacttgattcctaaagct 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5088
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5367 taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaa 308  Q
     |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5268 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatacaacgtgagaaaatgcaaaa 5169  T
Q  309 attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||  || ||||||||||||||||||    
T  5168 attgtacatgattatgataataactaactcccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctccta 5088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9266
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  9496 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 9398  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  9397 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt-- 9300  T
Q  314 acatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9299 acatgattgtgataataactaacccccttacctt 9266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16164
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  16394 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 16296  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  16295 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt-- 16198  T
Q  314 acatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16197 acatgattgtgataataactaacccccttacctt 16164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Original strand, 3722 - 4102
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttg-catatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3822 taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 3920  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aa 307  Q
    | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3921 atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 4020  T
Q  308 aattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||  || ||||||||||||||||||    
T  4021 aattgtacatgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctccta 4102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13171
Alignment:
Q  106 aaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 205  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13480 aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 13382  T
Q  206 actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc 305  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13381 attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatga 13282  T
Q  306 aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgatt 405  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13281 aaaatt--acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagttcctaggtcacccacttgatt 13184  T
Q  406 cctaaagcttccc 418  Q
    ||| |||||||||    
T  13183 cctcaagcttccc 13171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 389
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3341
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| | ||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  3066 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3164  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatta 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3165 tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattg 3264  T
Q  313 cacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  3265 tacataattatgataataattaacccccttaccttagaagaagattaaccgaaactcttgcttcaattcagctccta 3341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 258
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5776
Alignment:
Q  34 acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattca 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  134 ccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
Q  234 aacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||    
T  5752 aacatcaaagttggagcacgaattt 5776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3598
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  112 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 211  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  3743 acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 3645  T
Q  212 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  3644 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 3598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1371
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1224 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1322  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
      |||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  1323 ttatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 1371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12360
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 12214  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
      |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  12215 --acaacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta 12311  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  12312 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaattt 12360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 6080
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t 6228  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6227 taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 6129  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  6128 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 972
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||| |    
T  1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaa-t 1120  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1119 taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1021  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  1020 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48434
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48287 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48385  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||    
T  48386 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaattt 48434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 236 - 405
Target Start/End: Original strand, 29388 - 29558
Alignment:
Q  236 catcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataacta 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  29388 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 29487  T
Q  335 acccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgatt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29488 acccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcacttcagctcctaggtcacccacttgatt 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 379 - 440
Target Start/End: Original strand, 29565 - 29627
Alignment:
Q  379 ttcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt-cccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  29565 ttcagctcctaggtcacccacttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctct 29627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9109
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  8978 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 9076  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcaca 242  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9077 tcatcgattcatgcatacaaacataacatcaca 9109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 31477 - 31742
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  31477 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaa 31576  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  31577 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 31676  T
Q  377 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31677 aattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 31742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Original strand, 39814 - 39935
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || |||  ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  39814 aacatgtaatttcacccacaaaaataccataatcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 39913  T
Q  278 cccattttcatacaacatgaga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39914 cccattttcatacaacatgaga 39935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 148721 - 148953
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  148821 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 148919  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  148920 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9096
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||| |    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8949 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 9047  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  9048 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaattt 9096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19453
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  19306 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 19404  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  19405 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 19453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21537
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  21390 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 21488  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  21489 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 21537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36929
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||      
T  37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  37076 caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta 36978  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  36977 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123196
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
T  123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  123327 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 123229  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcaca 242  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  123228 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca 123196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 5092
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  5224 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta 5126  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
     |||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  5125 tcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacag 5092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247458
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  121 taggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  247594 tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca 247496  T
Q  221 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||    
T  247495 tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaattt 247458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34246 - 34076
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  34246 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatttttcatcaa 34147  T
Q  278 cccattttcatacaac-atgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  34146 ccca-tttcatacaacaatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 34076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26431
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||    
T  26578 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta 26480  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  26479 tcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 26431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8196
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8227 caaacataacatcacagttagagcacgaattt 8196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172137
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  121 taggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  172016 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 172114  T
Q  221 tgcatacaaacataacatcacag 243  Q
    | |||||||||||| ||||||||    
T  172115 tccatacaaacatatcatcacag 172137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177840
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  121 taggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  177719 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 177817  T
Q  221 tgcatacaaacataacatcacag 243  Q
    | |||||||||||| ||||||||    
T  177818 tccatacaaacatatcatcacag 177840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Original strand, 41733 - 41976
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||    
T  41833 aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat 41931  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  41932 caattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 41976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 414
Target Start/End: Original strand, 6831 - 7002
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6831 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 6930  T
Q  343 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6931 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcgtaaagct 7002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 550
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| ||      
T  797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||  ||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  697 taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 599  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  598 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272257
Alignment:
Q  16 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  116 caacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  272131 caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca 272229  T
Q  216 attcatgcatacaaacataacatcacag 243  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  272230 attcattcatacaaacatatcattacag 272257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 10778 - 10624
Alignment:
Q  236 catcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataacta 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10778 catcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta 10679  T
Q  335 acccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||  || ||||||||||||||||||    
T  10678 acccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctccta 10624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34476
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34624 tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 34526  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34525 atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 34476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34450 - 34374
Alignment:
Q  274 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaa-aattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34450 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgataataactaaccctcttacctt 34374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1663 - 1451
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||| |||  ||  |||||||||||||    
T  1663 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagcaacaattgttcatcaa 1564  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  || ||| |||||    
T  1563 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaacccttgcttc 1464  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  1463 aattcagctccta 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 213 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7509 - 7278
Alignment:
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatta 312  Q
    |||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  7509 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatg 7410  T
Q  313 ca-catgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaa 410  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| || ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |    
T  7409 gaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctca 7310  T
Q  411 agc--ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||  ||| ||||||  | |||||||||||||    
T  7309 agctattctcttcaaaacccttgttcttctct 7278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Original strand, 2560 - 2826
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||| |||||||||||||||   ||  |||||||||||||    
T  2560 aacatgtaatttcacccacaaacataccataagcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagcaacaattgttcatcaa 2659  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa--ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagctt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||    
T  2660 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgctt 2759  T
Q  376 caattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc--ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||||    
T  2760 caattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaaatc-cttgttcttctct 2826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1602 - 1390
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||| ||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  1602 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 1503  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||  || |||||    
T  1502 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttc 1403  T
Q  377 aattcagctccta 389  Q
    |||||||||||||    
T  1402 aattcagctccta 1390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41895
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41748 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41847 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 41895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 246 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23769 - 23600
Alignment:
Q  246 agagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaacccccttac 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||     
T  23769 agagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataataactaacccccttaa 23670  T
Q  345 ctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    ||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23669 cttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagttcctaagtcacccacttgattcctaaagct 23600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat 16  T
Q  110 taacaac 116  Q
    |||||||    
T  15 taacaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 13506 - 13753
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  13506 catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 13605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13606 caacaacaacatagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13704  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  13705 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaattt 13753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 13779 - 13855
Alignment:
Q  274 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaa-aattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| || || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  13779 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaataaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 13855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42709
Alignment:
Q  316 atgattatgataataactaacccccttaccttt 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttaccttt 42709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat 48613  T
Q  110 taacaac 116  Q
    |||||||    
T  48614 taacaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 178 - 347
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45369
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||| |||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcatcaa 45297  T
Q  278 cccattttcatacaac-atgagaaaatgcaa-aattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  45298 cccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 45369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 347
Target Start/End: Original strand, 54484 - 54755
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 176  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| ||||  | ||||||||| ||  | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||| | |||| | |    
T  54484 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatacatacttt 54581  T
Q  177 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 275  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||  ||||||||| |||  |||| ||||||    
T  54582 gaaacatgcaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatc 54681  T
Q  276 aacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaa-aattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  54682 aacccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaaccaccttacctt 54755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 440
Target Start/End: Original strand, 130880 - 131006
Alignment:
Q  316 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc- 413  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattatgcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 130979  T
Q  414 ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  130980 ttcccttcaacactcttgttcttctct 131006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89470
Alignment:
Q  128 aattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
Q  228 aaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    ||| ||| ||||||||   ||||||||||||    
T  89500 aaatatatcatcacagttggagcacgaattt 89470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51198
Alignment:
Q  128 aattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  228 aaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    ||| ||| ||||||||   ||||||||||||    
T  51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaattt 51198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 178 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10427 - 10257
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  10427 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaa 10328  T
Q  278 cccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |  || ||||||||||||||    
T  10327 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgaagaagacaaacccccttacctt 10257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37082
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | |||||      
T  37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  37228 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 37131  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  37130 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 37082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 347
Target Start/End: Original strand, 54040 - 54212
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || | | |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  54040 tgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatc 54139  T
Q  276 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa-ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  54140 aacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 54212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 7443 - 7547
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | |||||||||| | ||| |||||||||    
T  7443 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaaccccctt 7542  T
Q  343 acctt 347  Q
    |||||    
T  7543 acctt 7547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 309
Target Start/End: Original strand, 3579 - 3712
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |  | |||||||||||| | |  || | |||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||    
T  3579 tgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacagtaagagcactaatttagcatcaattgttcatc 3678  T
Q  276 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 309  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3679 aacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaa 3712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9479
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12045
Alignment:
Q  244 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccct 341  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  12149 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgag-aaatgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct 12051  T
Q  342 tacctt 347  Q
    ||||||    
T  12050 tacctt 12045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 258
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3437
Alignment:
Q  181 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaattt 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22787
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  22756 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 22787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27042
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  27011 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 27042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1598
Alignment:
Q  127 aaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
Q  227 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  1629 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 1598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 323 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 154373 - 154282
Alignment:
Q  323 tgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  154373 tgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 154282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 273 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
Q  273 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa-ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13342 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17115
Alignment:
Q  316 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc- 413  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagattattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 17142  T
Q  414 ttcccttcaaccctcttgttcttctct 440  Q
    |||| |||||| ||| ||| |||||||    
T  17141 ttcctttcaacactcctgtgcttctct 17115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 56262 - 56115
Alignment:
Q  111 aacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaa--catgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  | ||  |||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  56262 aacaacaacttagca-aaattcaccatttgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaatt 56165  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    | |||||| ||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  56164 atcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt 56115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||| || |||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  8174 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Original strand, 14198 - 14283
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || ||| || || ||||| |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14198 tatgaacatgcaatttcaccagcaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt 14283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Original strand, 108171 - 108256
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  108171 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt 108256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 84 - 4
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  84 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaagagcacgaattt 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University