View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13978_low_4 (Length: 531)

Name: NF13978_low_4
Description: NF13978
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13978_low_4
NF13978_low_4
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (147-385)||(44343474-44343715)
chr7 (147-384)||(30440685-30440925)
chr7 (147-379)||(973077-973313)
chr7 (147-384)||(12893297-12893537)
chr7 (147-379)||(43581168-43581403)
chr7 (147-388)||(18914813-18915057)
chr7 (147-385)||(34008903-34009142)
chr7 (147-379)||(727406-727642)
chr7 (147-379)||(31638769-31639004)
chr7 (147-385)||(40996727-40996969)
chr7 (147-379)||(20275341-20275576)
chr7 (147-379)||(47879062-47879297)
chr7 (147-379)||(7719338-7719574)
chr7 (147-379)||(47914160-47914395)
chr7 (147-244)||(7718440-7718537)
chr7 (147-379)||(32142995-32143233)
chr7 (147-244)||(39219455-39219551)
chr7 (147-333)||(34695215-34695402)
chr7 (302-388)||(8078280-8078369)
chr7 (302-383)||(43679359-43679444)
chr7 (154-387)||(29614849-29615085)
chr7 (154-236)||(7993175-7993257)
chr7 (147-222)||(43679468-43679543)
chr7 (154-244)||(10676505-10676595)
chr7 (302-385)||(34695119-34695205)
chr7 (302-379)||(39219568-39219648)
chr7 (147-371)||(7113358-7113581)
chr7 (154-236)||(19251572-19251654)
chr7 (312-384)||(21067764-21067838)
chr7 (154-389)||(23101175-23101413)
chr7 (154-236)||(28034890-28034972)
chr7 (154-236)||(33382670-33382752)
chr7 (154-236)||(37327960-37328042)
chr7 (154-236)||(46405516-46405598)
chr7 (154-236)||(47066736-47066819)
chr7 (154-387)||(3022805-3023041)
chr7 (433-465)||(1435803-1435835)
chr7 (312-389)||(29585434-29585513)
chr7 (312-389)||(33892495-33892574)
chr7 (154-236)||(8675366-8675448)
chr7 (154-236)||(9882321-9882403)
chr7 (154-196)||(12740445-12740488)
chr7 (154-236)||(25805725-25805807)
chr7 (328-390)||(31401579-31401643)
chr7 (154-236)||(40460792-40460874)
chr7 (154-236)||(44256851-44256933)
chr7 (174-236)||(29585548-29585608)
chr7 (302-384)||(29893005-29893090)
chr7 (302-384)||(43187576-43187661)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (147-385)||(25331017-25331258)
chr4 (147-384)||(41881161-41881403)
chr4 (154-390)||(22201896-22202135)
chr4 (147-373)||(32950915-32951144)
chr4 (147-379)||(28541590-28541825)
chr4 (147-379)||(37046530-37046766)
chr4 (147-379)||(31314811-31315042)
chr4 (147-379)||(1112786-1113020)
chr4 (148-379)||(46635722-46635957)
chr4 (147-384)||(1044697-1044934)
chr4 (147-385)||(39479434-39479677)
chr4 (147-287)||(12112932-12113072)
chr4 (186-379)||(24131091-24131286)
chr4 (147-390)||(30009756-30010002)
chr4 (147-354)||(34228662-34228869)
chr4 (147-379)||(55302735-55302970)
chr4 (147-354)||(25504718-25504926)
chr4 (147-376)||(7007268-7007501)
chr4 (147-335)||(3436531-3436720)
chr4 (147-384)||(19740987-19741226)
chr4 (205-385)||(40537282-40537465)
chr4 (147-244)||(25446080-25446177)
chr4 (150-384)||(23464840-23465079)
chr4 (147-379)||(7249844-7250087)
chr4 (147-244)||(42786714-42786811)
chr4 (147-233)||(27454157-27454244)
chr4 (303-388)||(42786650-42786739)
chr4 (147-231)||(41320853-41320937)
chr4 (147-236)||(23987252-23987341)
chr4 (154-230)||(5800021-5800098)
chr4 (154-382)||(30967385-30967616)
chr4 (253-389)||(41320632-41320769)
chr4 (154-236)||(28370962-28371044)
chr4 (154-236)||(28483937-28484019)
chr4 (154-384)||(5441291-5441524)
chr4 (147-286)||(53275827-53275966)
chr4 (154-385)||(29649753-29649987)
chr4 (154-236)||(37915865-37915947)
chr4 (154-236)||(49834899-49834981)
chr4 (154-236)||(51320959-51321041)
chr4 (154-385)||(54341030-54341264)
chr4 (154-236)||(54853554-54853636)
chr4 (154-387)||(12913107-12913344)
chr4 (154-384)||(27767943-27768176)
chr4 (312-389)||(28483865-28483944)
chr4 (154-236)||(32684074-32684155)
chr4 (154-217)||(36479317-36479380)
chr4 (312-384)||(37828647-37828719)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (147-384)||(1789331-1789571)
chr2 (147-384)||(24776244-24776484)
chr2 (147-386)||(31170705-31170947)
chr2 (147-385)||(12407268-12407509)
chr2 (147-379)||(16269585-16269820)
chr2 (146-388)||(305545-305792)
chr2 (147-379)||(14198658-14198892)
chr2 (147-388)||(35316947-35317191)
chr2 (147-379)||(44765669-44765904)
chr2 (174-388)||(22551872-22552088)
chr2 (147-333)||(20605178-20605365)
chr2 (150-287)||(43847635-43847772)
chr2 (147-354)||(32125171-32125382)
chr2 (147-326)||(5093128-5093308)
chr2 (219-379)||(20605046-20605209)
chr2 (147-385)||(26601281-26601522)
chr2 (147-389)||(28844439-28844684)
chr2 (154-236)||(10125378-10125460)
chr2 (147-244)||(9120158-9120255)
chr2 (264-390)||(9120051-9120180)
chr2 (154-244)||(378969-379059)
chr2 (165-384)||(215324-215546)
chr2 (312-384)||(378868-378942)
chr2 (154-384)||(7026492-7026726)
chr2 (154-236)||(28740371-28740453)
chr2 (154-236)||(33135663-33135745)
chr2 (154-387)||(13833510-13833746)
chr2 (312-385)||(19144912-19144987)
chr2 (312-384)||(3463560-3463634)
chr2 (154-236)||(3574887-3574969)
chr2 (154-236)||(6224635-6224718)
chr2 (154-236)||(10657446-10657528)
chr2 (158-236)||(18177307-18177385)
chr2 (319-380)||(43825084-43825147)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (147-379)||(32711360-32711595)
chr8 (147-379)||(41478990-41479225)
chr8 (147-385)||(23115247-23115487)
chr8 (147-387)||(5576698-5576942)
chr8 (147-354)||(42938195-42938403)
chr8 (147-384)||(26374508-26374746)
chr8 (147-384)||(2704897-2705137)
chr8 (147-384)||(42735355-42735595)
chr8 (147-379)||(7506977-7507212)
chr8 (147-379)||(42937253-42937479)
chr8 (147-244)||(24501891-24501988)
chr8 (147-354)||(43959577-43959785)
chr8 (147-244)||(10392315-10392412)
chr8 (295-379)||(24214817-24214904)
chr8 (174-390)||(7466217-7466435)
chr8 (302-373)||(26373704-26373778)
chr8 (154-236)||(9288542-9288624)
chr8 (154-236)||(10295466-10295548)
chr8 (312-384)||(24502015-24502089)
chr8 (154-236)||(31623734-31623816)
chr8 (154-384)||(18958812-18959045)
chr8 (154-236)||(16362235-16362317)
chr8 (154-236)||(26856106-26856188)
chr8 (154-236)||(32497564-32497646)
chr8 (154-244)||(39189899-39189988)
chr8 (154-236)||(39467553-39467635)
chr8 (154-244)||(43166775-43166865)
chr8 (147-195)||(4950094-4950143)
chr8 (312-385)||(8543406-8543482)
chr8 (312-382)||(32497373-32497445)
chr8 (319-384)||(9288701-9288768)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (147-391)||(33656119-33656369)
chr5 (147-384)||(21146955-21147195)
chr5 (147-377)||(32157975-32158210)
chr5 (147-244)||(849178-849275)
chr5 (147-379)||(27459028-27459262)
chr5 (147-379)||(6460685-6460920)
chr5 (147-354)||(139193-139401)
chr5 (295-391)||(7016923-7017022)
chr5 (147-236)||(7016817-7016906)
chr5 (147-236)||(5272997-5273086)
chr5 (304-384)||(43319134-43319218)
chr5 (158-244)||(9220796-9220882)
chr5 (154-383)||(37013803-37014035)
chr5 (154-236)||(4240537-4240619)
chr5 (154-236)||(4550342-4550424)
chr5 (147-236)||(14465305-14465394)
chr5 (154-236)||(1152188-1152270)
chr5 (205-244)||(16894038-16894077)
chr5 (154-236)||(22746336-22746418)
chr5 (302-379)||(9689554-9689633)
chr5 (147-236)||(9689697-9689785)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (147-389)||(2300816-2301061)
chr6 (147-384)||(6197556-6197796)
chr6 (147-384)||(29076484-29076726)
chr6 (147-379)||(1391516-1391751)
chr6 (147-384)||(29111457-29111700)
chr6 (147-354)||(28002584-28002792)
chr6 (174-244)||(656995-657064)
chr6 (154-388)||(7051728-7051965)
chr6 (154-236)||(30385142-30385224)
chr6 (154-236)||(34759135-34759217)
chr6 (154-384)||(31895583-31895816)
chr6 (154-244)||(7497106-7497196)
chr6 (312-390)||(7496999-7497079)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (147-388)||(19253710-19253954)
chr3 (147-384)||(20498097-20498336)
chr3 (147-385)||(6589449-6589691)
chr3 (147-377)||(37820556-37820789)
chr3 (147-387)||(10139225-10139468)
chr3 (147-386)||(33807877-33808123)
chr3 (147-385)||(996165-996405)
chr3 (147-385)||(1440031-1440271)
chr3 (147-379)||(3206284-3206510)
chr3 (147-388)||(51699559-51699802)
chr3 (147-371)||(35337635-35337862)
chr3 (147-390)||(52114412-52114656)
chr3 (147-382)||(29029895-29030132)
chr3 (147-389)||(25418248-25418493)
chr3 (147-384)||(40246731-40246971)
chr3 (147-354)||(44762116-44762324)
chr3 (147-379)||(54625484-54625719)
chr3 (147-287)||(3999724-3999864)
chr3 (147-385)||(29448937-29449180)
chr3 (147-244)||(33996620-33996717)
chr3 (147-244)||(53929207-53929304)
chr3 (304-384)||(12734076-12734159)
chr3 (312-389)||(539626-539705)
chr3 (154-236)||(40897182-40897264)
chr3 (154-384)||(10660422-10660655)
chr3 (147-379)||(22057655-22057889)
chr3 (154-384)||(23753472-23753705)
chr3 (147-236)||(27899382-27899471)
chr3 (154-384)||(44906599-44906832)
chr3 (154-241)||(5825095-5825182)
chr3 (154-236)||(17946326-17946408)
chr3 (154-236)||(18749650-18749732)
chr3 (154-236)||(34484116-34484198)
chr3 (154-236)||(51737812-51737894)
chr3 (154-236)||(52618051-52618133)
chr3 (174-384)||(12103519-12103728)
chr3 (147-219)||(52079982-52080054)
chr3 (312-385)||(20832881-20832956)
chr3 (312-385)||(27240488-27240563)
chr3 (154-236)||(44276427-44276505)
chr3 (154-236)||(55235223-55235304)
chr3 (154-196)||(539490-539533)
chr3 (174-236)||(15492968-15493028)
chr3 (154-236)||(20833030-20833112)
chr3 (154-236)||(26107299-26107381)
chr3 (154-236)||(48379195-48379277)
chr3 (154-196)||(54628921-54628964)
chr3 (174-235)||(23535918-23535977)
[»] scaffold0400 (1 HSPs)
scaffold0400 (147-384)||(15112-15349)
[»] scaffold0365 (1 HSPs)
scaffold0365 (147-384)||(15755-15992)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (147-384)||(45760088-45760329)
chr1 (147-388)||(28824452-28824695)
chr1 (147-379)||(35279558-35279793)
chr1 (147-379)||(47654430-47654668)
chr1 (147-384)||(730030-730270)
chr1 (147-384)||(21222029-21222268)
chr1 (147-379)||(49198348-49198581)
chr1 (147-377)||(49417972-49418205)
chr1 (147-384)||(50192629-50192870)
chr1 (205-387)||(953697-953882)
chr1 (147-379)||(35679207-35679442)
chr1 (147-388)||(6304331-6304577)
chr1 (180-384)||(22183251-22183457)
chr1 (147-333)||(19451887-19452074)
chr1 (147-384)||(33025393-33025634)
chr1 (295-379)||(47780505-47780592)
chr1 (147-325)||(29556046-29556225)
chr1 (147-241)||(47780738-47780832)
chr1 (147-242)||(45535970-45536065)
chr1 (253-384)||(14494093-14494224)
chr1 (174-377)||(48524208-48524412)
chr1 (302-384)||(19452084-19452169)
chr1 (154-236)||(5495182-5495264)
chr1 (154-236)||(49230918-49231000)
chr1 (154-384)||(6312455-6312688)
chr1 (154-236)||(29219318-29219400)
chr1 (154-384)||(25612038-25612271)
chr1 (147-244)||(32589032-32589129)
chr1 (154-383)||(15835139-15835371)
chr1 (334-388)||(28541381-28541437)
chr1 (154-236)||(9577518-9577600)
chr1 (154-236)||(18798523-18798605)
chr1 (154-236)||(29396474-29396556)
chr1 (147-236)||(31622538-31622626)
chr1 (301-384)||(32589187-32589273)
chr1 (154-236)||(48177548-48177630)
chr1 (154-236)||(51701612-51701694)
chr1 (147-196)||(31572276-31572326)
chr1 (174-244)||(37014747-37014816)
chr1 (314-372)||(31572410-31572470)
chr1 (147-194)||(955823-955871)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (147-385)||(100098-100339)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (147-244)||(102126-102223)
[»] scaffold0651 (1 HSPs)
scaffold0651 (253-379)||(8655-8784)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (147-244)||(38684-38780)
scaffold0151 (303-379)||(38755-38834)
[»] scaffold0276 (2 HSPs)
scaffold0276 (147-334)||(618-806)
scaffold0276 (353-390)||(814-851)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (147-244)||(38974-39071)
scaffold0113 (312-391)||(39098-39179)
[»] scaffold1504 (1 HSPs)
scaffold1504 (154-236)||(902-985)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (154-236)||(13921-14003)
scaffold0306 (302-384)||(13812-13897)
[»] scaffold0152 (2 HSPs)
scaffold0152 (154-236)||(21324-21406)
scaffold0152 (302-384)||(21430-21515)
[»] scaffold0543 (1 HSPs)
scaffold0543 (154-196)||(10638-10681)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (154-196)||(39703-39746)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Original strand, 44343474 - 44343715
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  44343474 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttaaataccactaaact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaatatcacaagac 44343572  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44343573 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 44343672  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  44343673 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccct 44343715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30440925 - 30440685
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  30440925 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagat 30440827  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  30440826 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagattttttcatgataaaaa 30440727  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30440726 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 30440685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 973313 - 973077
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  973313 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactaaatt-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 973215  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgat-aaga 343  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  973214 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaaaactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 973115  T
Q  344 aaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  973114 aaatcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 973077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12893537 - 12893297
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||     
T  12893537 aaatctgatttattaaacaattcttcgaaatttgaatgattttgaataccattagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattaaataccacaagac 12893439  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  12893438 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgaaaaaaa 12893339  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    ||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12893338 aatcttttaaaataccttagaatcatgatccaatacaccccc 12893297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 43581168 - 43581403
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  43581168 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaatacaacaagac 43581266  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  43581267 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 43581366  T
Q  345 aatcttttaa---tctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  43581367 agtcttttaaaattct-ttagaatcatgatccaataca 43581403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 388
Target Start/End: Original strand, 18914813 - 18915057
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  18914813 aaatctgatttattaaacaaacctttgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 18914911  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||| | |||| ||| || ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18914912 tttttttaaaggacaaagaattttgattgaataacacaagacttttttaaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 18915011  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaa 388  Q
    | ||||||  |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18915012 agtcttttaaaatcccttagatacatgatccaatacaccccctaaa 18915057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34009142 - 34008903
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaa-actcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34009142 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactaggact-ttttttaagtgattaagagtgttgattgaataccacaaga 34009044  T
Q  245 nnnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataaga 343  Q
            ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||| |    
T  34009043 ctttttttaaatgacaaataatcttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaatacc---agactttttcatgataaaa 34008947  T
Q  344 aaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34008946 aaatcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccct 34008903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 727642 - 727406
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || | | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  727642 aaatctgatttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaatactactagatttttttttaagtgataaagagttttgattgaatatcacaagac 727543  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| ||| || ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  727542 tttttttaaatgacaaagaattttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccgcaagactttttcatgataaaaa 727443  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | || |||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  727442 agtcatttaaaatccattagaatcatgatccaataca 727406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31639004 - 31638769
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |     
T  31639004 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgatagaataccacacaag 31638906  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| ||| || ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  31638905 tttttttaaatgacaaagaattttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacatgactttttcatgataaaaa 31638806  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31638805 agtcttttaaaatctcttagaatcatgattcaataca 31638769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Original strand, 40996727 - 40996969
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  40996727 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagcgattaagagtcttgattgaataccacaagac 40996825  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgat-aaga 343  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || |    
T  40996826 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacgagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactctttcatgataaaaa 40996925  T
Q  344 aaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  40996926 aaatattttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccct 40996969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 20275341 - 20275576
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||     
T  20275341 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccataagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccataagac 20275439  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||  |||||| ||| |||||| ||||||       |||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  20275440 tttttttaaatgacaaggaatcttgattgaataacccaagactttttttaaattggaaagaatcttgattgaataccacaagacttattcatgataaaaa 20275539  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20275540 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 20275576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47879297 - 47879062
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||     
T  47879297 aaatctgatttattaaacaatccttttaaatttgaatgattttgaatatcactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacatgac 47879199  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |    
T  47879198 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagacttttttaaaattgaaaagagtattgattgaataccacaagactttttcattataaata 47879099  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||| |||||||    
T  47879098 agtcttttaaaatcccttagaatcatgattcaataca 47879062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 7719338 - 7719574
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  7719338 aaatctgatttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccactagatt-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 7719436  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt--attgaataccacaaggctttttcatgataaga 343  Q
           ||||| |||| ||| || ||| |||||||||||||       |||||  ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  7719437 tttttttaaatgacaaataatattgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtctttgattgaataccacaagaatttttcatgataaaa 7719536  T
Q  344 aaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    || ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7719537 aagtcttttaaaatcttttacaatcatgatccaataca 7719574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47914395 - 47914160
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||     
T  47914395 aaatcttatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaatatcactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacatgac 47914297  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |    
T  47914296 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagacttttttaaaattgaaaagagtattgattgaataccacaagactttttcattataaata 47914197  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||| |||||||    
T  47914196 agtcttttaaaatcccttagaatcatgattcaataca 47914160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 7718440 - 7718537
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7718440 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaga 7718537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 32142995 - 32143233
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactctttttt-aagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||    ||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||    
T  32142995 aaatctgatttattaaacaatccttcaaaatttgaatgattttgaataccacgtgacttttttttgaagtgattaagagtcttgattcaataccataaga 32143094  T
Q  245 nnnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataaga 343  Q
            ||||| |||||||  || ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  32143095 ctttttttaaatgacaaaaaaaatttattgaataacacaagactttttttaaattagaaagagtcttgattgaatatcacaagactttttcatgataaaa 32143194  T
Q  344 aaa-tctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32143195 aaagtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 32143233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 39219455 - 39219551
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39219455 aaatctgatttattaaacaatcatcaaaatttgaatgattttgaataccaatagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataacacaaga 39219551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34695402 - 34695215
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |     
T  34695402 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatggttttgaataccactggact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaaac 34695304  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggcttttt 333  Q
           ||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34695303 tttttttaaatgacaaggaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagacttttt 34695215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8078369 - 8078280
Alignment:
Q  302 aaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaa 388  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8078369 aaagagtcttgattgaataccacaagacttttttatgataaaaaagtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccctaaa 8078280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 43679444 - 43679359
Alignment:
Q  302 aaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaa-tcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatccc 383  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43679444 aaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaaaatcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacatccc 43679359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 387
Target Start/End: Original strand, 29614849 - 29615085
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  29614849 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaatatcacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 29614947  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  29614948 aaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttt 29615047  T
Q  352 taa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccctaa 387  Q
    |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29615048 taaaatctcatagaatcataatccaatacatcccctaa 29615085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7993257 - 7993175
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7993257 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccataagact-ttttttaagtgatgaaaagttttgattgaata 7993175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43679543 - 43679468
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaaga 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  43679543 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactggact-ttttttaagtgattaaga 43679468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Original strand, 10676505 - 10676595
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  10676505 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaatacaatgagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaataccacaaga 10676595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34695205 - 34695119
Alignment:
Q  302 aaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34695205 aaagagtcttgattgaataccacaagactttttcataataaaaaagtcttttaaaatcccttagaatcatgattcaatacaccccct 34695119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 39219568 - 39219648
Alignment:
Q  302 aaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||  |||||||| |||||||||||||    
T  39219568 aaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaagtcttttaaaattccttagaattatgatccaataca 39219648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7113581 - 7113358
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttg-aatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||    |||||||| ||||| |     
T  7113581 aaatctgatttattaaacaatcctgcgaaatttgaattattttgaataccactggact-ttttttaagtgattaaaagt----attgaataccacaaaac 7113487  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           |||||  |||||||||||||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||    
T  7113486 tttttttaaatgataaaaaatcttaattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaatacca-aatactttgtcatgataaaaa 7113388  T
Q  345 aa-tctttt--aatctcttagaatcatgat 371  Q
    || ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  7113387 aagtcttttaaaatcccttagaatcatgat 7113358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19251654 - 19251572
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  19251654 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacgagact-ttttttaagtgatgaaaaattttgattgaata 19251572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21067838 - 21067764
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  21067838 attgaataccacaagactttttcataattaaaaaatcttttaaaatctcatagaatcctaatccaatacatcccc 21067764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23101413 - 23101175
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  23101413 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 23101315  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       |||||  ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  23101314 aaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaattgcaaaaattcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttt 23101215  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaat 389  Q
    |  |||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  23101214 taaaatcccatagaatcctaatccgatacatcccctaaat 23101175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 28034890 - 28034972
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  28034890 atttattaaacaatcctttgaaatttgaataattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 28034972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33382752 - 33382670
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  33382752 atttattaaacaatccttcgaaatttaaatgattttgaataccatgagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 33382670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37328042 - 37327960
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || || ||| |||||||||||    
T  37328042 atttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtaatgaaaagtcttgattgaata 37327960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 46405516 - 46405598
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  46405516 atttattaaacaatcatttgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 46405598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47066819 - 47066736
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  47066819 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagacttttttttaagtgatgaaattttttgattgaata 47066736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 3023041 - 3022805
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || | | ||||||||||| | |||||            
T  3023041 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaaatcttgattgaatacctcaagactttttta 3022943  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||       || ||| ||| |||||| ||| ||||||| ||  ||||||||| || | |||||||||    
T  3022942 aaatgacaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttttaagttttaaaaagtcttgattaaataccataaaactttttcataattaaaaaatcttt 3022843  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaa 387  Q
    |  |||| | ||||||| | || |||||||||||||||    
T  3022842 taaaatcccatagaatcctaattcaatacatcccctaa 3022805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 1435835 - 1435803
Alignment:
Q  433 aaatctctagatttcaaattaaatttttattct 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1435835 aaatctctagatttcaaattaaatttttattct 1435803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 29585513 - 29585434
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaat 389  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||||||  |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  29585513 attgaataccacaaaactttttcataattaaaaaatcttttaaaatctcgtagaatcataattcaataaatcccctaaat 29585434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 389
Target Start/End: Original strand, 33892495 - 33892574
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaat 389  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || | ||| ||||||||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33892495 attgaataccacaaaactttttcataattaaaaagtcttttaaaatctcatagaatcctaatccaatacatcccctaaat 33892574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8675448 - 8675366
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  8675448 atttattaaacaatccttcgaagtttaaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 8675366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 9882321 - 9882403
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  9882321 atttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 9882403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12740488 - 12740445
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaatacca 196  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12740488 atttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaatacca 12740445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25805807 - 25805725
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25805807 atttattaaacaatcctacgaaatttgaatgattttgaatacca-caaatttttttttaagtgatgaaaaattttgattgaata 25805725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31401643 - 31401579
Alignment:
Q  328 ctttttcatgataagaaaatcttttaa---tctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaatt 390  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31401643 ctttttcatgataaaaaagtcttttaaagttct-ttagaatcatgatccaatacaccccctaaatt 31401579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 40460792 - 40460874
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  40460792 atttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 40460874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 44256851 - 44256933
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  44256851 atttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccacgatact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 44256933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29585608 - 29585548
Alignment:
Q  174 aatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29585608 aatttgaatgattttgaataccagaagact-ttttttaagtga-taaaagttttgattgaata 29585548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29893090 - 29893005
Alignment:
Q  302 aaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||||||  |||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  29893090 aaagagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttttaaaatctcatagaatcctaatctaatacatcccc 29893005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 384
Target Start/End: Original strand, 43187576 - 43187661
Alignment:
Q  302 aaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| || | ||| ||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43187576 aaagagtcttgattgaataccacaagactctttcataattaaaaagtcttttaaaatctcttagaatttcgatccaatacatcccc 43187661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25331258 - 25331017
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  25331258 aaatctgatttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaatatcactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 25331160  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25331159 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 25331060  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25331059 agtcttttaaaatcttttagaatcatgatccaatacaccccct 25331017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Original strand, 41881161 - 41881403
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  41881161 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactaaacttttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 41881260  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  41881261 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagacttttttaaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 41881360  T
Q  345 aa-tctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    || ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41881361 aagtcttttaaaatcccttaaaatcatgatccaatacaccccc 41881403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 154 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22202135 - 22201896
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||            
T  22202135 atttattaaacaatcttttgaaattttaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagacttttttt 22202037  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  22202036 aaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaatatcacaagactttttcatgataaaaaagtcttt 22201937  T
Q  352 taa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaatt 390  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22201936 taaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccctaaatt 22201896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 373
Target Start/End: Original strand, 32950915 - 32951144
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||     
T  32950915 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacatgac 32951013  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  32951014 tttttttaaatgacaaataatcttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcattataaaaa 32951113  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatcc 373  Q
    | ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  32951114 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatcc 32951144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28541825 - 28541590
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||     
T  28541825 aaatctgatttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacgagac 28541727  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  28541726 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcataataaaaa 28541627  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
      ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28541626 tgtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 28541590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 37046530 - 37046766
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |     
T  37046530 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttaaatatcactagacttttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaaac 37046629  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  37046630 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagacttttttatgataaaaa 37046729  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
     |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  37046730 tatcttttaaaattccttagaatcatgatccaataca 37046766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 31314811 - 31315042
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||    ||| |||||||     
T  31314811 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttga----ataccacaagac 31314905  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||       ||||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  31314906 tttttttaaatgacaaagaatcttgattaaataacacaagactttttttaaattgaaaaaagtcttgattgaataccacaatactttttcatgataaaaa 31315005  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31315006 aatcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 31315042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1113020 - 1112786
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  1113020 aaatctgatttattaaacaatcatttgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 1112922  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| ||||| |||| ||       ||||   |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  1112921 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataatacaatactttttttaaatcggaaagagtcttgattgaataacacaagactttttcatgataaaaa 1112822  T
Q  345 aa-tcttttaatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1112821 aagtcttttaaaatcttagaatcatgatccaataca 1112786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 379
Target Start/End: Original strand, 46635722 - 46635957
Alignment:
Q  148 aatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagann 246  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||      
T  46635722 aatcttatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaatactactaaact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagact 46635820  T
Q  247 nnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggc-tttttcatgataagaa 344  Q
          ||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||||        |||||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  46635821 ttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataatacaagattttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagacttttttcatgataaaaa 46635920  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  46635921 agtcttttaaaatctcttagaatcatgatccaataca 46635957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1044934 - 1044697
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaat-ttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  1044934 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaagttgaatggttttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 1044836  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  1044835 ttttt--aaatgacaaggaatcttgattgaataacacaagactttttt-aaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 1044739  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1044738 aatcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 1044697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Original strand, 39479434 - 39479677
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactctttttt-aagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  |  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39479434 aaatctgatttattaaacaattcttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagtctttttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaga 39479533  T
Q  245 nnnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataaga 343  Q
            ||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  39479534 ctttttttaaatgacaaggaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagacttttttatgataaaa 39479633  T
Q  344 aaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    || ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39479634 aagtcttttaaaatttcttaaaatcatgatccaatacaccccct 39479677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12113072 - 12112932
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  12113072 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccattagact-ttttttaagtgattaagagttttgattgaataccacaagac 12112974  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagac 287  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  12112973 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagac 12112932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 186 - 379
Target Start/End: Original strand, 24131091 - 24131286
Alignment:
Q  186 tttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaag 285  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||        ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  24131091 tttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaag 24131189  T
Q  286 acnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    ||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24131190 actttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaagtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 24131286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 390
Target Start/End: Original strand, 30009756 - 30010002
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||     
T  30009756 aaatctgatttattaaacaatcatttaaaatttaaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaggac 30009854  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           |||||  ||| ||| || |||||||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||    
T  30009855 tttttttaaatgataaagaattttgattaaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaatacaataagactttttcataataaaaa 30009954  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaatt 390  Q
      ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30009955 tgtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccctaaatt 30010002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 354
Target Start/End: Original strand, 34228662 - 34228869
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  34228662 aaatctgatttattaaacaatcattcgaaatttcaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagaattttgattgaataccacatgac 34228760  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34228761 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacac-agactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 34228859  T
Q  345 aatcttttaa 354  Q
    | ||||||||    
T  34228860 agtcttttaa 34228869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 55302970 - 55302735
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||     
T  55302970 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacatgac 55302872  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||    
T  55302871 ttttttaaaatgacaaagaatcttgattgaaaaacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccataacactttttcattataaaaa 55302772  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | |||| |  |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  55302771 agtcttctaaaatcccttaaaatcatgattcaataca 55302735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 354
Target Start/End: Original strand, 25504718 - 25504926
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  25504718 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaatatcactggact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaatatcacaagaa 25504816  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           |||||   || |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25504817 tttttttaaatgatcaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 25504916  T
Q  345 aatcttttaa 354  Q
    | | ||||||    
T  25504917 agtattttaa 25504926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7007501 - 7007268
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||     
T  7007501 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacatgac 7007403  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagac-nnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataaga 343  Q
           ||||| || | |||||| ||| |||||||||||||        ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  7007402 tttttttaaatgacagagaatcttgattgaataacacaagacttttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaaaactttttcattataaaa 7007303  T
Q  344 aaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaat 376  Q
    || ||| ||  |||| |||| ||||||||| ||||    
T  7007302 aagtctattaaaatcccttaaaatcatgattcaat 7007268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3436720 - 3436531
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  3436720 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccattagatt-ttttttaaatgattaagagtcttgattgaatatcacaagat 3436622  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttca 335  Q
           ||| | ||||||||||| ||| |||||||||| |        ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  3436621 tttttttaaacgacaaaaaatcttgattgaataacacaatattttttttaaattgaaaagagttttgattgaataccacaagactttttca 3436531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Original strand, 19740987 - 19741226
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||     
T  19740987 aaatctaatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgatttttaataccacaagact-ttttttaagtgattaaaagtcttgactgaataccacatgac 19741085  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  19741086 tttttataaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagattttttcatgataa-aa 19741184  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | ||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  19741185 agtcttttaaaatcttttagaatcatgattgaatacatcccc 19741226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 385
Target Start/End: Original strand, 40537282 - 40537465
Alignment:
Q  205 ttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||       |||||  |||    
T  40537282 ttttttaagtgattaagagttttgattgaataccacaagactttttttaaatgacaaagagtcttgattgaataacacaagactttttttaaattagaaa 40537381  T
Q  305 gagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40537382 gagtcttaattgaataccacaagacttttttatgatacaaaagtcttttaaaatcccttacaatcatgatccaatacaccccct 40537465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25446177 - 25446080
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25446177 aaatctgatttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaga 25446080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23465079 - 23464840
Alignment:
Q  150 tctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnn 248  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |        
T  23465079 tctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatggttttgaataccactagact-tattttaagtgattaagagtcttgattgaatattacaaaacttt 23464981  T
Q  249 nnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgat--aagaaa 345  Q
        ||||| |||  |||||| ||| ||||| |||||||       | |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || |||    
T  23464980 ttttaaatgacaaggaatcttgattgaataatacaagactttttttatattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaaaa 23464881  T
Q  346 atctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23464880 atcttttaaaattccttagaatcataatccaatacatcccc 23464840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 7249844 - 7250087
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactctttttt------aagtgattaagagttttgattgaataaca 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||      |||| || |||||| ||||| ||||| ||    
T  7249844 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagacttttttttttttttaagttatcaagagtcttgatcgaatacca 7249943  T
Q  240 caagannnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnn-aaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatg 337  Q
    |||||        ||||| | || |||||| ||| |||||||||||||        ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  7249944 caagatattttttaaatgactaagaatcttgattgaataacacaagacttttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagattttttcatg 7250043  T
Q  338 ataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    |||| ||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  7250044 ataaaaaagtcttttaaaattccttagaatcatgatccaataca 7250087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 42786811 - 42786714
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42786811 aaatatgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaaatgattaagagtcttgattgaataccacaaga 42786714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 233
Target Start/End: Original strand, 27454157 - 27454244
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattga 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  27454157 aaatctgatttattaaataatctttcaaaatttgaatgattttgaataccactaaacttttttgtaagtgattaagaatcttgattga 27454244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 303 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42786739 - 42786650
Alignment:
Q  303 aagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaa-tcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaa 388  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42786739 aagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaaagtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccctaaa 42786650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41320937 - 41320853
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgatt 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41320937 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaaatgattaagagtcttgatt 41320853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23987341 - 23987252
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23987341 aaatctaatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagttttgattgaata 23987252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5800098 - 5800021
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgat 230  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  5800098 atttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaataccacaagacttttttttaagtgatgaaaagttttgat 5800021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 382
Target Start/End: Original strand, 30967385 - 30967616
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || | | ||||||||||| | ||| |            
T  30967385 atttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaaatcttgattgaatacctcaaaactttttta 30967483  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  30967484 aaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaaatcttt 30967583  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcc 382  Q
    |  |||| | || |||||| |||||||||||||    
T  30967584 taaaatcccataaaatcataatccaatacatcc 30967616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 41320769 - 41320632
Alignment:
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  ||| |||||| |||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||    
T  41320769 aaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagacattttttaaattggaaacagtcttgattgaataccacga--ctttttcataataaaaaaatcttt 41320672  T
Q  352 taa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaat 389  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41320671 taaaatcttttagaatcatgatccaatacaccccctaaat 41320632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28371044 - 28370962
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| || |||||||||||||||    
T  28371044 atttattaaacaatcctttaaaatttgaatgattttgaataccatgagact-ttatttaagtgataaaaagttttgattgaata 28370962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28484019 - 28483937
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  28484019 atttattaaataatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacgagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 28483937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5441524 - 5441291
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  5441524 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 5441426  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  5441425 aaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttt 5441326  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |  |||| | ||||||| | |||||||||||||||    
T  5441325 taaaatcccatagaatcctaatccaatacatcccc 5441291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 53275966 - 53275827
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| |||| || || ||| |||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||||     
T  53275966 aaatctgatttattacacaatccttcgaaatttgaatgattttaaatatcactagact-ttttttaagtgattaaaaatcttgattgaatactacaagac 53275868  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaaga 286  Q
           ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  53275867 tttttttaaatgacaaataatctttattgaataacacaaga 53275827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 385
Target Start/End: Original strand, 29649753 - 29649987
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  29649753 atttattaaacaatctttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 29649851  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | | |||||  |||| ||||||||       |||||  ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| || | ||| |||||    
T  29649852 aaatgacaaagagttttaatctaataccacaagactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaataccacaaaactttttcataattaaaaagtcttt 29649951  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    |  |||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  29649952 taaaatctcatagaatcctaatccaatacatcccct 29649987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37915947 - 37915865
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  37915947 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 37915865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 49834899 - 49834981
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  49834899 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 49834981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 51321041 - 51320959
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  51321041 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 51320959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 54341264 - 54341030
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  54341264 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 54341166  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| || |||||       |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  54341165 aaatgacaaagagtcttgattgaataccataagactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttt 54341066  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    |  |||| | ||||||| | ||||||||||||||||    
T  54341065 taaaatcccatagaatcctaatccaatacatcccct 54341030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 54853554 - 54853636
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  54853554 atttattaaacaatcctttgaaatttgaataattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 54853636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12913344 - 12913107
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| || |   ||||||||||| | |||||            
T  12913344 atttattaaacaatccttcaaaatttgaatgattttgaataccatgagact-ttttttaaatgatgaaaaagcttgattgaatacctcaagactttttta 12913246  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaattta-aaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctt 350  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||        || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || | ||||||||    
T  12913245 aaatgacaaagagtcttaattaaataccacaagacttttttttaaattataaagagtcttgattgaataccacaagactttttcaaaattaaaaaatctt 12913146  T
Q  351 tt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaa 387  Q
    ||  ||||||||||| || | ||| |||| |||||||||    
T  12913145 ttaaaatctcttagattcctaatcgaatatatcccctaa 12913107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27768176 - 27767943
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  27768176 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 27768078  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       |||||  ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  27768077 aaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaattgcaaaaaatcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttt 27767978  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |  |||| | ||||||| | |||||||||||||||    
T  27767977 taaaatcccatagaatcctaatccaatacatcccc 27767943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 28483944 - 28483865
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaat 389  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || | ||| ||||||||  |||| ||||||| | || |||||||||||||||||    
T  28483944 attgaatacctcaagactttttcataattaaaaagtcttttaaaatctcatagaatcctaattcaatacatcccctaaat 28483865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 32684074 - 32684155
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||  ||||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  32684074 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaatacca--caagacttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaata 32684155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 36479317 - 36479380
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgat 217  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  36479317 atttattaaataatccttcgaaatttgaataattttgaataccacgagact-ttttttaagtgat 36479380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 384
Target Start/End: Original strand, 37828647 - 37828719
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||||||||  ||| |||||  | |||||||||||||||    
T  37828647 attgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttttaaaatctcagaattctaatccaatacatcccc 37828719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1789571 - 1789331
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  1789571 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagttttgattgaatatcataagac 1789473  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  1789472 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagttttgattgaataccacaagacttttttatgataaaaa 1789373  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1789372 aatcttttaaaatctcttagaatcatgatccaatacaccccc 1789331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24776484 - 24776244
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  24776484 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 24776386  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24776385 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattagaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 24776286  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24776285 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 24776244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 386
Target Start/End: Original strand, 31170705 - 31170947
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  31170705 aaatctgatttattaaacaatccttggaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 31170803  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  31170804 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaatatcacaagactttttcatgataaaaa 31170903  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatccccta 386  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31170904 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacacccccta 31170947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12407509 - 12407268
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  12407509 aaatctgatttattaaacaatccttcaaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtctcgattgaataccacaagac 12407411  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12407410 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagacttttttaaaattgaaaagaatcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 12407311  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12407310 agtcttttaaaatctcttagaatcatgatccaatacaccccct 12407268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16269820 - 16269585
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  16269820 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 16269722  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  16269721 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcataataaaaa 16269622  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16269621 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 16269585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 388
Target Start/End: Original strand, 305545 - 305792
Alignment:
Q  146 gaaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  305545 gaaatctgatttattaaacaatcattcaaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaga 305643  T
Q  245 nnnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagac-nnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataag 342  Q
            ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||        |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  305644 cttttttcaaatgacaaataatcttgattgaataacacaagacttttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaa 305743  T
Q  343 aaaa-tctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaa 388  Q
    |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  305744 aaaagtcttttaaaatcgcttagaatcatgatccaatacaccccctaaa 305792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 14198658 - 14198892
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  14198658 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactggact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 14198756  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| ||| || ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14198757 tttttttaaatgacaaagaattttgattgaataacacaagac-ttttttaaattagaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 14198855  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14198856 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 14198892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 35317191 - 35316947
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  35317191 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaatattacaagac 35317093  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  35317092 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaaaactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 35316993  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaa 388  Q
    | | ||||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  35316992 agttttttaaaatcccttagaatcatgattcaatacaccccttaaa 35316947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44765904 - 44765669
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  44765904 aaatcttatttattaaacaatctttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtctcgattgaataccacaagac 44765806  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44765805 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagttttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 44765706  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44765705 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 44765669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 388
Target Start/End: Original strand, 22551872 - 22552088
Alignment:
Q  174 aatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaatt 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||        ||||| |||| |||||| |||    
T  22551872 aatttgaataattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaaaagtcttgattgaataccacaagactttttttaaatgacaaagaatcttgatt 22551970  T
Q  274 aaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatga 370  Q
     |||||||||||||       |||||  ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  22551971 gaataacacaagactttttttaaattggaaaaaatcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaagtcttttaaaatcccttagaatcatga 22552070  T
Q  371 tccaatacatcccctaaa 388  Q
    ||||||||| || |||||    
T  22552071 tccaatacacccactaaa 22552088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20605365 - 20605178
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  20605365 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaattttaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 20605267  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggcttttt 333  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20605266 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagacttttt 20605178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43847772 - 43847635
Alignment:
Q  150 tctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnn 248  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||        
T  43847772 tctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaatacaactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagacttt 43847674  T
Q  249 nnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagac 287  Q
        ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  43847673 ttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagac 43847635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32125382 - 32125171
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtg---attaagagttttgattgaataacacaa 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| ||||     
T  32125382 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacttgact-ttttttaaatgatcattaagagtcttgattgaataccacat 32125284  T
Q  243 gannnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataa 341  Q
    ||        ||||| |||| ||| || ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32125283 gactttttttaaatgacaaagaattttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcattataa 32125184  T
Q  342 gaaaatcttttaa 354  Q
     ||| ||||||||    
T  32125183 aaaagtcttttaa 32125171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 326
Target Start/End: Original strand, 5093128 - 5093308
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||     
T  5093128 aaatctgatttattaaacaatccttcaaaatttgaatgattttgaatactactagact-ttttttaagtgattaagcgtcttgattgaataccacaagac 5093226  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaag 326  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  5093227 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaag 5093308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20605209 - 20605046
Alignment:
Q  219 aagagttttgattgaataacacaagannnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaa 317  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||        ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||    
T  20605209 aagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaa 20605110  T
Q  318 taccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20605109 taccacaagactttttcatgattaaaaagtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 20605046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Original strand, 26601281 - 26601522
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||| |||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  26601281 aaatctgatttattaaacaaacattcgaaatttgaatgattttgaataccacgtgact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaatactacaagac 26601379  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
            |||| |||| | |||| |||||||||||||| ||       |||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||| ||    
T  26601380 ttttttttaatgacaaagagtcttgattaaataacacaaaactttttttaaattagaaagagttttgattgaataccacaagactttttaataataaaaa 26601479  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    | ||||||  ||||  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  26601480 agtcttttaaaatcctttagaaacatgatccaatacaccccct 26601522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 28844684 - 28844439
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||     
T  28844684 aaatctaatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagac 28844586  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       || ||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||    
T  28844585 ttttttaaaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaagttgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaa 28844486  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaat 389  Q
    | ||||||  |||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28844485 agtcttttaaaatcccatagaatcctaatccaatacatcccctaaat 28844439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 10125378 - 10125460
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10125378 atttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaatatcatgagact-ttttttaagtgatgaaaagttttgattgaata 10125460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9120255 - 9120158
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaatt-tgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9120255 aaatctaatttattaaacaatcctttaaaatctgaatgattttgaatatcactagatt-ttttttaagtgattaagaatcttgattgaataacacaaga 9120158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9120180 - 9120051
Alignment:
Q  264 aatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaa--tctctt 360  Q
    |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||  || |||    
T  9120180 aatcttgattgaataacacaagacttttttaaaattggaaagagtcttgattgaataccacatgattttttcatgataaaaaagtcttttaaaatccctt 9120081  T
Q  361 agaatcatgatccaatacatcccctaaatt 390  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9120080 agaatcatgatccaatacacccccttaatt 9120051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 379059 - 378969
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  379059 atttattaaacaatccttcaaaatttgaatgattttgaataccatgaaact-ttttttaaatgagaaaaagttttgattgaataccacaaga 378969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 384
Target Start/End: Original strand, 215324 - 215546
Alignment:
Q  165 aatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnnaaatggcaaaa 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||        || || ||||     
T  215324 aatcctttgaagtttgaatgattttgaataccacgagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttaaaattgacaaag 215422  T
Q  264 aatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctctt 360  Q
    | |||| ||| |||| ||||||||       || ||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||||||  |||||| |    
T  215423 agtcttgattgaataccacaagactttttttaagttgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttttaaaatctcat 215522  T
Q  361 agaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  215523 agaatcctaatccaatacatcccc 215546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 378942 - 378868
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  378942 attgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttttaaaatcccttataatcatgatccaatacatcccc 378868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7026726 - 7026492
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  7026726 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 7026628  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggc-tttttcatgataagaaaatctt 350  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| || | ||| ||||    
T  7026627 aaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaataccacaagacttttttcataattaaaaagtctt 7026528  T
Q  351 tt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    ||  |||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  7026527 ttaaaatctcatagaatcctaatccaatacatcccc 7026492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 28740371 - 28740453
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  28740371 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 28740453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33135745 - 33135663
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  33135745 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacgagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 33135663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 387
Target Start/End: Original strand, 13833510 - 13833746
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||   |||||            
T  13833510 atttattaaacaatccttcaaaatttgaatgattttgaataccagaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaatatatcaagactttttta 13833608  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    |||||  ||||| |||| ||| |||| ||||||||       || ||  ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| || | || ||||||    
T  13833609 aaatgataaaaagtcttgattgaataccacaagactttttttaagttgcaaaaagtcttgattgaataccacaatactttttcataattaaaatatcttt 13833708  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaa 387  Q
    |  |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13833709 taaaatctcatagaatcctaatccaatacatcccctaa 13833746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19144987 - 19144912
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||  |||| |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  19144987 attgaataccacaagacttttttatgataaaaaaatattttaaaatcccttagaatcatattccaatacaccccct 19144912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3463634 - 3463560
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||||||||||||  |||||||| || | ||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3463634 attgaataccacaagattttttcataattaaaaagtcttttaaaatctcatagaatcataatccaatacatcccc 3463560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3574969 - 3574887
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  3574969 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaatatcacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 3574887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 6224635 - 6224718
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  | ||| ||||| ||||||| || | | |||||||||||    
T  6224635 atttattaaataatccttcgaaatttgaataattttgaataccacaagactttttttaaagtgatgaaaaatcttgattgaata 6224718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10657528 - 10657446
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  10657528 atttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 10657446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18177385 - 18177307
Alignment:
Q  158 attaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  18177385 attaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaaaact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaata 18177307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 319 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43825147 - 43825084
Alignment:
Q  319 accacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacat 380  Q
    |||||||| ||||||||| || | ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  43825147 accacaagactttttcataattaaaaaatcttttaaaatctcatagaatcataatccaatacat 43825084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 32711360 - 32711595
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  32711360 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttaaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 32711458  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  32711459 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaaaactttttcatgataaaaa 32711558  T
Q  345 aatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32711559 agtcttttaaagtctcttagaatcatgatccaataca 32711595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41479225 - 41478990
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  41479225 aaatctgatttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccattagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 41479127  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  41479126 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaaaactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 41479027  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41479026 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 41478990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Original strand, 23115247 - 23115487
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  23115247 aaatctgatttattaaacaatccttccaaatttgaatgattt-gaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 23115344  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  23115345 attttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 23115444  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23115445 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccct 23115487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 387
Target Start/End: Original strand, 5576698 - 5576942
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  5576698 aaatctggtttattaaacaattcttcgaaatttgaatgattttgaataccacttgacttttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 5576797  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||    
T  5576798 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactatttcatgacaaaaa 5576897  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaa 387  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5576898 aatcttttaaaatcccttagaatcataatccaatacaccccctaa 5576942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 354
Target Start/End: Original strand, 42938195 - 42938403
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  42938195 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 42938293  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  42938294 tttttttaaatgacaaataatcttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatggtaaaaa 42938393  T
Q  345 aatcttttaa 354  Q
    | ||||||||    
T  42938394 agtcttttaa 42938403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Original strand, 26374508 - 26374746
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  26374508 aaatcttatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 26374606  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||  ||       |||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  26374607 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacaca--actttttttaaattggaaagagtcttgattgaatatcacaagactttttcatgataaaaa 26374704  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26374705 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacatcccc 26374746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Original strand, 2704897 - 2705137
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||| |||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  2704897 aaatttgatttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 2704995  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       || ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  2704996 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaatttggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 2705095  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    ||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2705096 aatcttttaaaatcctttacaatcatgatccaatacaccccc 2705137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Original strand, 42735355 - 42735595
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||      
T  42735355 aaatctgatttattaaacaatacttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttaattgaataccacaagtc 42735453  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           |||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  42735454 tttttttaaatgataaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 42735553  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42735554 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 42735595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 7506977 - 7507212
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  7506977 aaatctgatttattaaacaatccttcaaaatttgaatggttttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 7507075  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||  |||||  ||| ||||||||||          |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7507076 ttttcttaaatgacaaggaatctcgattgaataacacaaacttttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 7507175  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7507176 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 7507212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42937479 - 42937253
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||     
T  42937479 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagag--tcgattgaataccacaagac 42937383  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtcttattgaataccacaaggctttttcatgataagaaa 345  Q
           ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||       ||||||      |  | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  42937382 tttttttaaatgacaaaaaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattt------ggttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaa 42937289  T
Q  346 atctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
     ||||||  |||| |||| |||||||||||||||||    
T  42937288 gtcttttaaaatcccttaaaatcatgatccaataca 42937253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 24501891 - 24501988
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24501891 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaga 24501988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43959785 - 43959577
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||     
T  43959785 aaatctgatttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccactagtct-tttttgaagtgattaagaatcttgattgaat-acacaagac 43959688  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  43959687 ttttttaaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 43959588  T
Q  345 aa-tcttttaa 354  Q
    || ||||||||    
T  43959587 aagtcttttaa 43959577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 10392315 - 10392412
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  10392315 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattctgaataccactagact-tttcttaagtgattaaaagtcttgattgaatatcacaaga 10392412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Original strand, 24214817 - 24214904
Alignment:
Q  295 aaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  24214817 aaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagacttttttatgataaaaaagtcttttaaaatcctttagaatcatgatccaataca 24214904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7466435 - 7466217
Alignment:
Q  174 aatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaatt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||| | |||||        ||||| |||| | |||| |||    
T  7466435 aatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagcgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagacttttttaaaatgacaaagagtcttgatt 7466337  T
Q  274 aaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatga 370  Q
     |||| ||||||||       || ||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||  |||||| ||||||| | |    
T  7466336 gaataccacaagactttttttaagttgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaaatcttttaaaatctcatagaatcctaa 7466237  T
Q  371 tccaatacatcccctaaatt 390  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  7466236 tccaatacatccccttaatt 7466217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26373778 - 26373704
Alignment:
Q  302 aaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatcc 373  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  26373778 aaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaagtcttttaaaatcccttagaatcatgatcc 26373704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 9288542 - 9288624
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  9288542 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaatttttgattgaata 9288624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 10295466 - 10295548
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  10295466 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 10295548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 384
Target Start/End: Original strand, 24502015 - 24502089
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24502015 attgaataacacaagactttttcatgataaaaaagtcttttaaaatcctttagaatcatgatccaatacaccccc 24502089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31623816 - 31623734
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  31623816 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 31623734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Original strand, 18958812 - 18959045
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  18958812 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 18958910  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    |||||  ||| | |||| ||| |||| ||||||||       |||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  18958911 aaatgataaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaatactacaagactttttcataattaaaaagtcttt 18959010  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |  |||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  18959011 taaaatctcatagaatcctaatccaatacatcccc 18959045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16362317 - 16362235
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || || ||| |||||||||||    
T  16362317 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacgagact-ttttttaagtaatgaaaagtcttgattgaata 16362235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26856188 - 26856106
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  26856188 atttattaaacaatacttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 26856106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32497646 - 32497564
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  32497646 atttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 32497564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Original strand, 39189899 - 39189988
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  39189899 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgatgttgaata-catgagact-ttttttaaatgataaagagtttttattgaataccacaaga 39189988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 39467553 - 39467635
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  39467553 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaata 39467635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Original strand, 43166775 - 43166865
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  43166775 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-tttttaaaatgacaaagagtcttgattgaataccacaaga 43166865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Original strand, 4950094 - 4950143
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttg-aatttgaatgattttgaatacc 195  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  4950094 aaatctaatttattaaataatcttttgaaacttgaatgattttgaatacc 4950143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8543482 - 8543406
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaa-tcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8543482 attgaataccacaaaacttttttatgataaaaaaaatcttttaaaatcccttagaatcatgatctaatacaccccct 8543406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 32497445 - 32497373
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcc 382  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||  |||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  32497445 attgaataccacaagactttttcatgattaaaaagtcttttaaaatcccatagaatcctaatccaatacatcc 32497373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 319 - 384
Target Start/End: Original strand, 9288701 - 9288768
Alignment:
Q  319 accacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||||| ||||||||| || | ||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9288701 accacaagactttttcataattaaaaagtcttttaaaatctcatagaatcataatccaatacatcccc 9288768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 147 - 391
Target Start/End: Original strand, 33656119 - 33656369
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  33656119 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccattagatt-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 33656217  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaa--aatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataag 342  Q
           ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33656218 tttttttaaatgacaaaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaa 33656317  T
Q  343 aaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcc-cctaaattg 391  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33656318 aaaatcttttaaaatcccttaaaatcatgatccaatacaccctcctaaattg 33656369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21147195 - 21146955
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  21147195 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 21147097  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  21147096 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacacgactttttcatgataaaaa 21146997  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21146996 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 21146955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 377
Target Start/End: Original strand, 32157975 - 32158210
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||     
T  32157975 aaatctaatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagacttttttttaagtgattaggggtcttgattgaataccacaagac 32158074  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagac-nnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataaga 343  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||        ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32158075 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagacttttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaa 32158174  T
Q  344 aaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaata 377  Q
    || ||||||  |||  |||||||||||||| |||||    
T  32158175 aagtcttttaaaattccttagaatcatgattcaata 32158210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 849275 - 849178
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  849275 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccattagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaga 849178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 27459028 - 27459262
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaatt-tgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  27459028 aaatctaatttattaaacaatccttcaaaatctgaatgattttgaataccactagact--tttttaagtgattaagagtcttgattgaatactacaagac 27459125  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  27459126 tttttttaaatgacaaagaatcttaattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaatactacgagactttttcatgataaaaa 27459225  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | | ||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  27459226 agttttttaaaatccgttagaatcatgatccaataca 27459262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6460920 - 6460685
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  6460920 aaatctgatttattaaacaaaccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagatt-ttttttaaatgattaagagtcttgattgaatacgacatgac 6460822  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||||       || ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  6460821 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacataagactttttttaagttggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcattataaaaa 6460722  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||    
T  6460721 aatcttttaaaatcccttagaatcatgattcaataca 6460685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 139401 - 139193
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||     
T  139401 aaatctggtttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaaaagtcttgattgaataccacatgac 139303  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||       ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||    
T  139302 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaaaactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaatactaaaagactttttcattataaaaa 139203  T
Q  345 aatcttttaa 354  Q
    | ||||||||    
T  139202 agtcttttaa 139193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 391
Target Start/End: Original strand, 7016923 - 7017022
Alignment:
Q  295 aaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaattg 391  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7016923 aaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaagtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccctaaattg 7017022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Original strand, 7016817 - 7016906
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7016817 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaata 7016906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Original strand, 5272997 - 5273086
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5272997 aaatctgatttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaaatgattaagagtcttgattgaata 5273086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43319218 - 43319134
Alignment:
Q  304 agagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaa-tctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  43319218 agagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaaagtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 43319134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 244
Target Start/End: Original strand, 9220796 - 9220882
Alignment:
Q  158 attaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  9220796 attaaacaatccttagaaatttgaatgattttgaatatcataagact-ttttttaagtgataaagagtcttgattgaatatcacaaga 9220882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 37014035 - 37013803
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  37014035 atttattaaacaacccttcgaaatttgaatgattttgaataccgcaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttaa 37013937  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       || ||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  37013936 aaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaagttgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttt 37013837  T
Q  352 taa--tctcttagaatcatgatccaatacatccc 383  Q
    |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  37013836 taaaatctcatagaatcataatccaatacatccc 37013803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 4240537 - 4240619
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  4240537 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 4240619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 4550342 - 4550424
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  4550342 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 4550424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Original strand, 14465305 - 14465394
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    ||||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  14465305 aaatccgatttattaaacaatctttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagcgatgaagagtcttgattgaata 14465394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 1152188 - 1152270
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  1152188 atttattaaacaatccctcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgataaaaagtcttgattgaata 1152270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 244
Target Start/End: Original strand, 16894038 - 16894077
Alignment:
Q  205 ttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16894038 ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaga 16894077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22746418 - 22746336
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22746418 atttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaatatcacaagact-ttttttaagtgatgaaaagttttgattgaata 22746336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9689633 - 9689554
Alignment:
Q  302 aaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9689633 aaagagtcttgattgaataccacaagactttttcataataa-aaagtctattaaaatcccttagaatcataatccaataca 9689554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9689785 - 9689697
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||| |||||| ||| |||| || ||| || ||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9689785 aaatctaatttatcaaacaatcattcgaaatttaatgattttaaataccacaagact-ttttttaagtgatgaagagtcttgattgaata 9689697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 389
Target Start/End: Original strand, 2300816 - 2301061
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||     
T  2300816 aaatcttatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttcaataccagtagact-ttttttaagtgatcaagagtcttgattgaataccacaagac 2300914  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  2300915 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 2301014  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaat 389  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2301015 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccctaaat 2301061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Original strand, 6197556 - 6197796
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  6197556 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 6197654  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  6197655 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacacgactttttcatgataaaaa 6197754  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | | ||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6197755 agttttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 6197796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29076726 - 29076484
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||     
T  29076726 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaatactactagacttttttttaagtgattaagaatctagattgaataccacaagac 29076627  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  29076626 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttatttaaattggaaagagtcttgattgaatatcacaagactttttcatgataaaaa 29076527  T
Q  345 aa-tctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29076526 aagtcttttaaaatctcttagaatcatgatccaatacaccccc 29076484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1391751 - 1391516
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  1391751 aaatctgatttattaaacaatccttccaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 1391653  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  1391652 tttatttaaatgacaatgaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 1391553  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | || |||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  1391552 agtcatttaaaatcctttagaatcatgatccaataca 1391516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29111700 - 29111457
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactctttttt-aagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||| | | ||||||||| |||||||    
T  29111700 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaatactactagactttttttttaagtgattaagaatctagattgaataccacaaga 29111601  T
Q  245 nnnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataaga 343  Q
            ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  29111600 ctttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttatttaaattggaaagagtcttgattgaatatcacaagactttttcatgataaaa 29111501  T
Q  344 aaa-tcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29111500 aaagtcttttaaaatctcttagaatcatgatccaatacaccccc 29111457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28002792 - 28002584
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||     
T  28002792 aaatctgatttattaaacaatccttccaaatttgaatgattttgaatatcactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccagaagac 28002694  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||       |||||  |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||| ||    
T  28002693 tttttttaaatgacaaaaaatcttgattgaataagacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaatacgacaagattttttcattataaaaa 28002594  T
Q  345 aatcttttaa 354  Q
    | ||||||||    
T  28002593 agtcttttaa 28002584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 657064 - 656995
Alignment:
Q  174 aatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  657064 aatttgaatgatttagaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaga 656995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 7051965 - 7051728
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||            
T  7051965 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaatatcacacgact-ttttttaagtgatgaagagtcttgattgtataccacaagacttttttt 7051867  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| |||||| ||   ||| ||||||||       || ||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  7051866 aaatgacaaagaatcttgatcgtataccacaagactttttttaagttgcaaagagtcttgattgaatatcacaagactttttcatgataaaaaagtcttt 7051767  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaa 388  Q
    |  |||||||||||||| | ||| || ||| ||||||||    
T  7051766 taaaatctcttagaatcctaatcaaacacaccccctaaa 7051728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 30385142 - 30385224
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  30385142 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaatttttgattgaata 30385224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 34759135 - 34759217
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  34759135 atttattaaacaatccttggaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 34759217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31895816 - 31895583
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||   |||||            
T  31895816 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaatacttcaagactttttta 31895718  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  31895717 aaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttt 31895618  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |  |||| | ||||||| | |||||||||||||||    
T  31895617 taaaatcccatagaatcctaatccaatacatcccc 31895583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7497196 - 7497106
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||    
T  7497196 atttattaaacactccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaaatcttgattgaataccacaaga 7497106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7497079 - 7496999
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaatt 390  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||| || | ||||||||||||  |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  7497079 attgaataccagaatactttttcataattaaaaaatcttttaaaatctcatagaattctaatccaatacatcccctaaatt 7496999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19253954 - 19253710
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  19253954 aaatcttatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 19253856  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19253855 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 19253756  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaa 388  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19253755 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataaaccccctaaa 19253710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20498336 - 20498097
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  20498336 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 20498238  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20498237 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaaaactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataa-aa 20498139  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20498138 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 20498097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6589691 - 6589449
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  6589691 aaatctgatttattaaataattcttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaaatgattaagagtcttgattgaataccacaagac 6589593  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||  ||| || ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6589592 tttttttaaatgacaaggaatattgattgaataacacaagactttttttaaattagaaagagtcttaattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 6589493  T
Q  345 aa-tcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6589492 aagtcttttaaagtcccttagaatcatgatccaatacatcccct 6589449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 377
Target Start/End: Original strand, 37820556 - 37820789
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||     
T  37820556 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagaatcttgattgaataccacaagaa 37820654  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  37820655 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 37820754  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaata 377  Q
    | ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  37820755 agtcttttaaaatcccttagaatcattatccaata 37820789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 387
Target Start/End: Original strand, 10139225 - 10139468
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  10139225 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 10139323  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           |||||  ||  |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10139324 tttttttaaatgataaggaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 10139423  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaa 387  Q
    | | ||||  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10139424 agtattttaaaatcccttagaatcatgattcaatacaccccctaa 10139468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 386
Target Start/End: Original strand, 33807877 - 33808123
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  33807877 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagacttttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 33807976  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaat---accacaaggctttttcatgataa 341  Q
           ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||       ||||| |||||| | || |||||||   |||||||| |||||| |||||||    
T  33807977 tttttttaaatgacaaagaatcttaattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagaattttgattgaataccaccacaagacttttttatgataa 33808076  T
Q  342 gaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatccccta 386  Q
     ||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33808077 aaaagtcttttaaaatcccttagaatcatgattcaatacacccccta 33808123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Original strand, 996165 - 996405
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||     
T  996165 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagaatcttgattgaataccacaagac 996263  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           |||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||        ||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  996264 ttttttgaaatgataaagaatcttgattgaataacacaagacttttttt-aattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 996362  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  996363 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccct 996405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Original strand, 1440031 - 1440271
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga- 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |     
T  1440031 aaatctgatttattaaacaatccttggaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaaac 1440129  T
Q  245 nnnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataaga 343  Q
            ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1440130 ttttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagac-ttttttaaattgaaaatagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataa-a 1440227  T
Q  344 aaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1440228 aagtattttaaaatctcttagaatcatgacccaatacatcccct 1440271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 3206284 - 3206510
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  3206284 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 3206382  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
              |   ||| |||||| ||| |||| ||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3206383 t---------ttttaaagaatcttgattgaataccacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 3206473  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3206474 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 3206510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 388
Target Start/End: Original strand, 51699559 - 51699802
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  51699559 aaatcttatttattaaccaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagatt--tttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagat 51699656  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||| ||    
T  51699657 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataatacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaaaattttttcttgataaaaa 51699756  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaa 388  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  51699757 aatcttttaaaatcttttataatcatgatccaatacaccccctaaa 51699802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35337862 - 35337635
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  35337862 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatttttttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 35337764  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  35337763 ttttttaaaatgacaaggaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcataataaaaa 35337664  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgat 371  Q
    | ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  35337663 agtcttttaaaatcccttagaatcatgat 35337635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 52114656 - 52114412
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||     
T  52114656 aaatctgatttattaaacaatcctgcgaaatttgaattattttgaataccactagacttttttttaagtgattaaaagtcttgattgaataccacaagac 52114557  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtcttattgaataccacaaggctttttcatgataagaaa 345  Q
           ||||| |||| ||||||  || ||||||||||||        ||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  52114556 tttttttaaatgacaaagaatcttggttgaataacacaagattttttttaaattgaaaatagt-tgattgaataccacaagactttatcatgataaaaaa 52114458  T
Q  346 atctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaatt 390  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52114457 atcttttaaaattccttagaatcatgatccagtaca-cccctaaatt 52114412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29030132 - 29029895
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  29030132 aaatctgatttattaaacaatccttcaaaatttgaatgattttgaatacca--caagacttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 29030035  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||        ||||  || ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||  ||    
T  29030034 tttttttaaatgacaaagagtcttaattgaataacacaagactttttcttaattagaatgagtcttgattgaataccacaatattttttcatgatataaa 29029935  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcc 382  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29029934 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacatcc 29029895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 25418493 - 25418248
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  || | | |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||     
T  25418493 aaatctgatttattaaacaatcctttcaaatttgaatgattttgaataccgctagatt-ttttgtaagtgattaaaagtcttgattgaataccacaagac 25418395  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||| |  ||||||| || ||||||||||||||    |||||||||||| ||    
T  25418394 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaaatggaaagagttttgattgaataccacaaaaaattttcatgataaaaa 25418295  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaat 389  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25418294 aattttttaaaatctcttagaatcatgatccaataaaccccctaaat 25418248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40246971 - 40246731
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |     
T  40246971 aaatctgatttattaaacaatccttccaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaactgattaatagtcttgattgaataccacaaaac 40246873  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||        |||    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40246872 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagattttttttaaaccagaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcacgataaaaa 40246773  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40246772 agttttttaaaatctcttagaatcatgatccaatacaccccc 40246731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 354
Target Start/End: Original strand, 44762116 - 44762324
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaat-ttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  44762116 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaacttgaataattttaaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaatactacatgac 44762214  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  44762215 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcattataaaaa 44762314  T
Q  345 aatcttttaa 354  Q
    | ||||||||    
T  44762315 agtcttttaa 44762324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 54625719 - 54625484
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  54625719 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaataattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaatacaacaagat 54625621  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||  ||| || ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||| ||||     ||||||||||| ||    
T  54625620 tttttttaaatgacaacgaatattgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaatactacaaaaaaatttcatgataaaaa 54625521  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  54625520 aatcttctaaaatctcttagaatcatgatccaataca 54625484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 287
Target Start/End: Original strand, 3999724 - 3999864
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  3999724 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagatt-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 3999822  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagac 287  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  3999823 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagac 3999864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Original strand, 29448937 - 29449180
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||     
T  29448937 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattgagagtcttgattgaatatcacaagac 29449035  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagac-nnnnnnnaaattt-aaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataag 342  Q
           ||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||        ||||||  ||||||| || |||||||||||||||  |||||||| ||||     
T  29449036 tttttgtaaatgacaaggaatcttgattgaataacacaagacttttttttaaatttggaaagagtattgattgaataccacaagattttttcataataaa 29449135  T
Q  343 aaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    ||| ||||||  |||| |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  29449136 aaagtcttttaaaatcccttataatcatgatctaatacaccccct 29449180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 33996620 - 33996717
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33996620 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactgga-ttttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaga 33996717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 53929207 - 53929304
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttga-atttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||| |||||||||| |||| || || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  53929207 aaatcttatttattaaacaatcgttcgatatttaaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaga 53929304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 384
Target Start/End: Original strand, 12734076 - 12734159
Alignment:
Q  304 agagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12734076 agagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaagtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 12734159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 389
Target Start/End: Original strand, 539626 - 539705
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||| | | |||||||||||||| |||||    
T  539626 attgaataccacaaggctttttcataattaaaaaatcttttaaaatctcttagaaccctaatccaatacatcccttaaat 539705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40897264 - 40897182
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  40897264 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccataagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 40897182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10660655 - 10660422
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  10660655 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaatact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 10660557  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  10660556 aaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttt 10660457  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |  |||| | ||||||| | |||||||||||||||    
T  10660456 taaaatcccatagaatcttaatccaatacatcccc 10660422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22057889 - 22057655
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaag-a 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||      
T  22057889 aaatctgatttattaaacaatccatcgaaatttgaatgattttaaataccactagatt-ttttttaagtgatcaagagtcttgatggaataccacaagtt 22057791  T
Q  245 nnnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtcttattgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
            ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||     ||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  22057790 ttttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaaga--acgattgaataccacaatactttttcatgataaaaa 22057693  T
Q  345 aa-tctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    || ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22057692 aagtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 22057655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Original strand, 23753472 - 23753705
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  23753472 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 23753570  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||       |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  23753571 aaatgacaaagaatcttgattgaataccacaagactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttt 23753670  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |  ||||   ||||||| | |||||||||||||||    
T  23753671 taaaatcctatagaatcctaatccaatacatcccc 23753705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27899471 - 27899382
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  27899471 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccaccagact-ttttttaaatgacaaagagtcttgattgaata 27899382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Original strand, 44906599 - 44906832
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  44906599 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 44906697  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       || ||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  44906698 aaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaagttgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttt 44906797  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |  |||||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  44906798 taaaatctcatagaatcctaatccaatatatcccc 44906832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5825182 - 5825095
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacaca 241  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||    
T  5825182 atttattaaacaatccttcaaaatttgaatgattttgaataccatgaaact-ttttttaaatgagaaaaagttttgattgaataccaca 5825095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17946408 - 17946326
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  17946408 atttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaatatcacgagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 17946326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18749732 - 18749650
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  18749732 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtttttattgaata 18749650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 34484116 - 34484198
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  34484116 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaaaact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaata 34484198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 51737812 - 51737894
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  51737812 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 51737894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 52618051 - 52618133
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  52618051 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 52618133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12103728 - 12103519
Alignment:
Q  174 aatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaatt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || | | ||||||||||| | |||||        ||||| |||| ||||||||||    
T  12103728 aatttgaatgattttgaataccatgagact-ttttttaagtgatgaaaaatcttgattgaatacctcaagacttttttaaaatgacaaagaatcttaatt 12103630  T
Q  274 aaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaatctcttagaatcatgatc 372  Q
     |||| ||| ||||       |||||  ||||||| || ||||||||| ||||| || |||||| || | ||| ||||||||  |||||||||  | |||    
T  12103629 gaataccacgagac-ttttttaaattacaaagagtattgattgaatacaacaagactatttcataattaaaaagtcttttaaaatcttagaattctaatc 12103531  T
Q  373 caatacatcccc 384  Q
    ||||||||||||    
T  12103530 caatacatcccc 12103519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52080054 - 52079982
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgatta 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||    
T  52080054 aaatctgatttattaaacaatccttcaaaatttgaatgattttgaataccactaga-ttttttttaagtgatta 52079982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20832956 - 20832881
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  20832956 attgaataccacaaaactttttcataattaaaaaatcttttaaaatctcatagaatcctaatccaatacatcccct 20832881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Original strand, 27240488 - 27240563
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||||||  |||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  27240488 attgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttttaaaatctcatagaatcctaatccaatacatcccct 27240563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44276505 - 44276427
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  44276505 atttattaaacaatcct---aatttgaatgattttgaataccatgagact-ttttttaagtgatgaaaaatcttgattgaata 44276427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 55235304 - 55235223
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  55235304 atttattaaacaatctttcgaaatttgaatgattttgaatatcatgagact--tttttaattgatgaagagttttgattgaata 55235223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 196
Target Start/End: Original strand, 539490 - 539533
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaatacca 196  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  539490 atttattaaataatccttcgaaatttgaatgattttgaatacca 539533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 236
Target Start/End: Original strand, 15492968 - 15493028
Alignment:
Q  174 aatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15492968 aatttgaatgattttgaataccatgaga--catttttaagtgatgaaaagttttgattgaata 15493028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20833112 - 20833030
Alignment:
Q  154 atttattaaataatccttt-gaatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  20833112 atttattaaacaatccttccgaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaattcttgattgaata 20833030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26107381 - 26107299
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  26107381 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaattgatgaaaagtcttgattgaata 26107299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48379277 - 48379195
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||    
T  48379277 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtctagattgaata 48379195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 54628964 - 54628921
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaatacca 196  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54628964 atttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaatacca 54628921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 235
Target Start/End: Original strand, 23535918 - 23535977
Alignment:
Q  174 aatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23535918 aatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaagag-tttgattgaat 23535977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Original strand, 15112 - 15349
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  15112 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaatactacaagac 15210  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  15211 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagattttttcatgataaaaa 15310  T
Q  345 aatcttttaatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15311 agtcttttaa-cccttagaatcatgatccaatacaccccc 15349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Original strand, 15755 - 15992
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  15755 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaatactacaagac 15853  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  15854 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagattttttcatgataaaaa 15953  T
Q  345 aatcttttaatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15954 agtcttttaa-cccttagaatcatgatccaatacaccccc 15992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Original strand, 45760088 - 45760329
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||     
T  45760088 aaatctgatttattaaacaatccttcgaagtttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacatgac 45760186  T
Q  246 nnnnnnnaaa-tggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataaga 343  Q
           ||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  45760187 tttttttaaattgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagttttgattgaataccacaagactttttcatgataaaa 45760286  T
Q  344 aaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  45760287 aaatcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 45760329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 388
Target Start/End: Original strand, 28824452 - 28824695
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagann 246  Q
    ||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||      
T  28824452 aaatctgatttattaaacaatcttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagactgttttt-aagtgattaagagtcttgattgaataccacaagact 28824550  T
Q  247 nnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaa 345  Q
          ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28824551 ttttttaaatgacaaataatcttgattgaataacacaagactttttttaaattagaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaa 28824650  T
Q  346 atctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaa 388  Q
     ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28824651 gtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccctaaa 28824695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35279793 - 35279558
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||     
T  35279793 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttaaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaatagtcttgattgaataccacaagac 35279695  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  35279694 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagtctttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 35279595  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35279594 agtcttttaaaatctcttagaatcatgatccaataca 35279558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 47654430 - 47654668
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  47654430 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaataattttgaataccactagacttttttttaagtgattaagagttttgattgaataccacaagac 47654529  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacac-aagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataaga 343  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||       |||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  47654530 ttcttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaaagactttttttaaattggaaagagtcttgatcgaataccacaagactttttcatgataaaa 47654629  T
Q  344 aaa-tctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  47654630 aaagtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 47654668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 730270 - 730030
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  730270 aaatctgatttattaaacaattcgtcgaaatttgaatgattttgaataccactagacttttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 730171  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  730170 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatga-aaaaa 730072  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  730071 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 730030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21222268 - 21222029
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  21222268 aaatcttatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaatacctctagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 21222170  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21222169 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaa-actttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 21222071  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |  |||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21222070 agccttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 21222029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 49198348 - 49198581
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |     
T  49198348 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactgaact-ttttttaagtgattaagagtctt-attgaataccacaaaac 49198445  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  49198446 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagac-ttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaa 49198544  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  49198545 agtcttttaaaattccttagaatcatgatccaataca 49198581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 49418205 - 49417972
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |     
T  49418205 aaatctgatttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttaattgaataccacataat 49418107  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||    
T  49418106 tttttttaaatgacaatgaatcttgattgaataacacaagactttttctaaattggaaagagtcttgattgaatatcacatgactttttcatgataaaaa 49418007  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaata 377  Q
    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49418006 agtcttttaaaatctcttagaatcatgatccaata 49417972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Original strand, 50192629 - 50192870
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  50192629 aaatctgatttattaaacaatccttcaaaatttgaatgattttgaataccactagacttttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagac 50192728  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||  |||||| ||| ||||||||||||        |||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  50192729 ttttttaaaatgacaaggaatcttgattgaataacacaagattttttttaaattggaaagaatcttgattgaataccacaagactttttcataataaaaa 50192828  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    | ||||||  |||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  50192829 agtcttttaaaattccttagaatcatgattcaatacaccccc 50192870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 953882 - 953697
Alignment:
Q  205 ttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaa 304  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||        ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||    
T  953882 ttttttaagtgattaagagtcttgatcgaataccacaagactttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaa 953783  T
Q  305 gagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaa 387  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  953782 gagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaagtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccctaa 953697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 35679207 - 35679442
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  35679207 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacatgact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaatactacaagat 35679305  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||       ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  35679306 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataccacaagactttttttaaattgaaaagagccttgattgaataccacaagactttttcattataaaaa 35679405  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    | ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  35679406 agtcttttaaaatcccttaaaatcatgattcaataca 35679442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 388
Target Start/End: Original strand, 6304331 - 6304577
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagag-ttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  6304331 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtttttggttgaataccacaaga 6304429  T
Q  245 nnnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagac-nnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataag 342  Q
            ||||| |||| |||||| ||| |||||||||  ||        |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  6304430 ctttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacagtacttttttttaaattggaaatagtcttgattgaataccacaagactttttcatgaaaaa 6304529  T
Q  343 aaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaa 388  Q
    ||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6304530 aaagtcttttaaaatcctttagaatcatgatccaatacaccccctaaa 6304577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22183457 - 22183251
Alignment:
Q  180 aatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataa 279  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||        ||||| |||| |||||| ||| |||||    
T  22183457 aatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagaatcttgattgaataccacaagactttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataa 22183359  T
Q  280 cacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaat 376  Q
    ||||| ||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  22183358 cacaaaactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaagtcttttaaaatcctttagaatcatgatccaat 22183259  T
Q  377 acatcccc 384  Q
    ||| ||||    
T  22183258 acaccccc 22183251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 333
Target Start/End: Original strand, 19451887 - 19452074
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||     
T  19451887 aaatctgatttattaaacgatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattaaataccacaagac 19451985  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggcttttt 333  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19451986 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagacttttt 19452074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33025634 - 33025393
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagtttt-gattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33025634 aaatctgatgtattaaacaatccttcaaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgattaagagtttttgattgaataccacaaga 33025536  T
Q  245 nnnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataaga 343  Q
            ||||| |||| |||||| ||| ||||| |||| ||       |||||  |||   | || |||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  33025535 atttttaaaaatgtcaaagaatcttgattgaataagacaaaactttttttaaattggaaaattttttgattgaataccacaagattttttcatgataaaa 33025436  T
Q  344 aaatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33025435 aagtcttttaaattctcttagaatcatgatccaatacaccccc 33025393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47780592 - 47780505
Alignment:
Q  295 aaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47780592 aaattgaaaagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaaatcttttaaaatttcttagaatcatgatccaataca 47780505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29556225 - 29556046
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||||| |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  29556225 aaatctaatttattaaacaatctttcgaaatttgaatgattttgaataacactagatt-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataacacaagac 29556127  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaa 325  Q
           ||||  |||  |||||||||| |||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29556126 tttttttaaataacaatgaatcttaattgaataacacaagactttttttaaattgaaaagagtcttgattgaataccacaa 29556046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47780832 - 47780738
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaattt-gaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacaca 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  47780832 aaatctgatttattaaacaatccttttaattttgaatgattttgaatatcactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccaca 47780738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45536065 - 45535970
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaa 242  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  45536065 aaatctgatttattaaacaatctttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagcgattaagagtcttgattgaataccacaa 45535970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14494224 - 14494093
Alignment:
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  14494224 aaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaataccacaagattttttcatgataaaaaagtcttt 14494125  T
Q  352 taatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14494124 taa-cccttagaatcatgatccaatacaccccc 14494093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48524412 - 48524208
Alignment:
Q  174 aatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaatt 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||        ||||| ||||||||||| |||    
T  48524412 aatttgaatgattttgaatatcacaagact-ttttttaagtgattaagagttttgattaaataccacatgaatttttttaaatgacaaaaaatcttgatt 48524314  T
Q  274 aaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatga 370  Q
     |||||||||||||       |||||  |||||||||| |||||||||  |||  |||||| ||||||| ||| ||||||  |||  |||||||||||||    
T  48524313 gaataacacaagactttttttaaattggaaagagtcttgattgaatactgcaaaacttttttatgataa-aaagtcttttaaaattccttagaatcatga 48524215  T
Q  371 tccaata 377  Q
    |||||||    
T  48524214 tccaata 48524208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 384
Target Start/End: Original strand, 19452084 - 19452169
Alignment:
Q  302 aaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19452084 aaagagtcttgattgaataccacaagactttttcaagataaaaaagtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccc 19452169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 5495182 - 5495264
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttg-aatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  5495182 atttattaaataatcctttgaaatttaaatgattttgaataccacgagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 5495264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 49231000 - 49230918
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  49231000 atttattaaataatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 49230918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6312688 - 6312455
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||            
T  6312688 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 6312590  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||       |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  6312589 aaatgacaaagagtcttaattgaataccacaaaactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttt 6312490  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |  |||| | ||||||| | |||||||||||||||    
T  6312489 taaaatcccatagaatcctaatccaatacatcccc 6312455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29219400 - 29219318
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctt-tgaatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  29219400 atttattaaacaatccttcttaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 29219318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25612271 - 25612038
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| | |||||            
T  25612271 atttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaaatcttgattgaatacctcaagactttttta 25612173  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       |||||  ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| || | ||| |||||    
T  25612172 aaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaataccacaagattttttcataattaaaaagtcttt 25612073  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |  |||| | ||||||| | |||||||||||||||    
T  25612072 taaaatcccatagaatcctaatccaatacatcccc 25612038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 32589032 - 32589129
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||    
T  32589032 aaatccgatttattaaacaatccttcaaaatttgaatgattttgaataccacaagact-tcttttaagtgatgaagagtcttgattgaatgccacaaga 32589129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 383
Target Start/End: Original strand, 15835139 - 15835371
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttg-aatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagannnnnnnn 252  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  | |||||||| |||| |  ||| ||||||||||| | |||||            
T  15835139 atttattaaacaatcctttgcaatttgaatgattttgaatacca-caagattttttttaaatgatgagaagtcttgattgaatacctcaagactttttta 15835237  T
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||       |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  15835238 aaatgacaaagagtcttgattgaataccacaagactttttttaaattgcaaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttt 15835337  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaatacatccc 383  Q
    |  |||| | ||||||| | ||||||||||||||    
T  15835338 taaaatcccatagaatcctaatccaatacatccc 15835371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 28541437 - 28541381
Alignment:
Q  334 catgataagaaaatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaa 388  Q
    |||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28541437 catgataaaaaaatcttttaaaatcgcttagaatcatgatccaatacaccccctaaa 28541381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 9577518 - 9577600
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctt-tgaatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  9577518 atttattaaacaatccttctaaatttgaatgattttgaatatcacaagact-ttttttaagtgataaaaagttttgatttaata 9577600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18798605 - 18798523
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  18798605 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaata 18798523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 29396474 - 29396556
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  29396474 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaata 29396556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Original strand, 31622538 - 31622626
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |   ||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  31622538 aaatccgatttattaaacaatcttttgaaatttgaatgattttgaatacaa--caatacttttttaagtgatgaagagtcttgatttaata 31622626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 384
Target Start/End: Original strand, 32589187 - 32589273
Alignment:
Q  301 aaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttttaa--tctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| ||| | ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32589187 aaaagagtcttgattgaatacaacataactttttcatgataaaaaagttttttaaaatctcatagaatcataatccaatacatcccc 32589273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 48177548 - 48177630
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  48177548 atttattaaacaatcattcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaaattttgattgaata 48177630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 51701694 - 51701612
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  51701694 atttattaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaaatgatgaaaagtcttgattgaata 51701612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 196
Target Start/End: Original strand, 31572276 - 31572326
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttg-aatttgaatgattttgaatacca 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  31572276 aaatctgatttattaaacaatccttcgaaatttaaatgattttgaatacca 31572326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 244
Target Start/End: Original strand, 37014747 - 37014816
Alignment:
Q  174 aatttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  37014747 aatttgaatgattttgaatatcacaagact-ttttttaagtgatgaagaatattgattgaataccacaaga 37014816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 372
Target Start/End: Original strand, 31572410 - 31572470
Alignment:
Q  314 tgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatc 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  31572410 tgaataccacaagactttttcatgataaaaaagtctcttaaaatcccttagaatcatgatc 31572470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 955871 - 955823
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaatac 194  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  955871 aaatctgatttattaaacaacccttcgaaatttgaatgattttgaatac 955823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 100339 - 100098
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||     
T  100339 aaatttgatttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgagtaccacaagac 100241  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaa 344  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||| || || |||||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  100240 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattggaaagtgtgttgattgaatatcagaagactttttcatgataaaaa 100141  T
Q  345 aatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccct 385  Q
    | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  100140 agtcttttaaaatcccttagaatcatgatccaatacaccccct 100098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 102223 - 102126
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  102223 aaatctgatttattaaacaatctttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaga 102126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0651
Description:

Target: scaffold0651; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8784 - 8655
Alignment:
Q  253 aaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatcttt 351  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||       ||||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  8784 aaatgacaaagaatcttgattaaataacacaagactttttttaaattgaaaaaagtcttgattgaataccacaatactttttcatgataaaaaaatcttt 8685  T
Q  352 t--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8684 taaaatcccttagaatcatgatccaataca 8655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 38684 - 38780
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  38684 aaatctgatt-attaaacaatccttcgaaatttgaatgattttgaataccactagact-ttttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaaga 38780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 379
Target Start/End: Original strand, 38755 - 38834
Alignment:
Q  303 aagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaataca 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38755 aagagtcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaatatcttttaaaatcccttagaatcatgatccaataca 38834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 618 - 806
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaagan 245  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||     ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  618 aaatatgatttattaaacaatccttccaaatttgaatgattttgaataccactaaaaaaaattt-aagtgattaagagttttgattgaataccacaatac 716  T
Q  246 nnnnnnnaaatggcaaaaaatcttaattaaataacacaagacnnnnnnnaaatttaaaagagtctt-attgaataccacaaggctttttc 334  Q
           ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||       |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  717 tttttttaaatgacaaagaatcttgattgaataacacaagactttttttaaattgtaaagagtcttgattgaataccacaagactttttc 806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 390
Target Start/End: Original strand, 814 - 851
Alignment:
Q  353 aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaatt 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  814 aatctcttagattcatgatccaatacatccccaaaatt 851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 38974 - 39071
Alignment:
Q  147 aaatctgatttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaataacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  38974 aaatctgatttattaaacaatccttccaaatttgaatgattttgaatatcactagact-tcttttaagtgattaagagtctttattgaataccacaaga 39071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Original strand, 39098 - 39179
Alignment:
Q  312 attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccctaaattg 391  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39098 attgaataccacaagactttttcatgataaaaaagtcttttaaaatccattagaatcatgatccaatacacccccttaattg 39179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1504 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1504
Description:

Target: scaffold1504; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 902
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  985 atttattaaataattcttcgaaatttgaatgattttgaataccacaagacttttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14003 - 13921
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  14003 atttattaaacaatcttttgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 13921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13897 - 13812
Alignment:
Q  302 aaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  13897 aaagagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttttaaaatctcatagaatcctaatccaatacatcccc 13812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0152 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0152
Description:

Target: scaffold0152; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 21324 - 21406
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaataccattaaactcttttttaagtgattaagagttttgattgaata 236  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  21324 atttattaaacaatcttttgaaatttgaatgattttgaataccacaagact-ttttttaagtgatgaaaagtcttgattgaata 21406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0152; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 384
Target Start/End: Original strand, 21430 - 21515
Alignment:
Q  302 aaagagtctt-attgaataccacaaggctttttcatgataagaaaatctttt--aatctcttagaatcatgatccaatacatcccc 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  21430 aaagagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttttaaaatctcatagaatcctaatccaatacatcccc 21515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0543 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0543
Description:

Target: scaffold0543; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10681 - 10638
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaatacca 196  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10681 atttattaaacaatcctttgaaatttgaatgattttgaatacca 10638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 196
Target Start/End: Original strand, 39703 - 39746
Alignment:
Q  154 atttattaaataatcctttgaa-tttgaatgattttgaatacca 196  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  39703 atttattaaataatccttcgaagtttgaatgattttgaatacca 39746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University