View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13983_low_21 (Length: 379)

Name: NF13983_low_21
Description: NF13983
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13983_low_21
NF13983_low_21
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (17-358)||(45570234-45570573)
chr2 (17-358)||(45573901-45574240)
chr2 (17-358)||(45577568-45577907)
chr2 (17-358)||(45581235-45581574)
chr2 (17-358)||(45584902-45585241)
chr2 (17-358)||(45588569-45588908)
chr2 (17-358)||(45592236-45592575)
chr2 (17-358)||(45595903-45596242)
chr2 (17-358)||(45599570-45599909)
chr2 (17-358)||(45603237-45603576)
chr2 (17-358)||(45606904-45607243)
chr2 (17-358)||(45610571-45610910)
chr2 (17-358)||(45614238-45614577)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45570234 - 45570573
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45570234 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45570331  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45570332 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45570431  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45570432 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45570531  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45570532 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45570573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45573901 - 45574240
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45573901 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45573998  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45573999 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45574098  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45574099 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45574198  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574199 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45574240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45577568 - 45577907
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45577568 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45577665  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577666 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45577765  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45577766 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45577865  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577866 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45577907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45581235 - 45581574
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45581235 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45581332  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581333 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45581432  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45581433 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45581532  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581533 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45581574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45584902 - 45585241
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45584902 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45584999  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45585000 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45585099  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45585100 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45585199  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45585200 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45585241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45588569 - 45588908
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45588569 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45588666  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45588667 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45588766  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45588767 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45588866  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45588867 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45588908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45592236 - 45592575
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45592236 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45592333  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45592334 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45592433  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45592434 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45592533  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45592534 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45592575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45595903 - 45596242
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45595903 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45596000  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45596001 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45596100  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45596101 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45596200  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45596201 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45596242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45599570 - 45599909
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45599570 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45599667  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45599668 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45599767  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45599768 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45599867  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45599868 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45599909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45603237 - 45603576
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45603237 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45603334  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45603335 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45603434  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45603435 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45603534  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45603535 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45603576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45606904 - 45607243
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45606904 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45607001  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607002 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45607101  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45607102 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45607201  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607202 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45607243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45610571 - 45610910
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45610571 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45610668  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45610669 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45610768  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45610769 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45610868  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45610869 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45610910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 45614238 - 45614577
Alignment:
Q  17 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggacttgagagagagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggcggcgaggttatccaggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45614238 agcctcaaggtcgttgaaagaggaagcgtcggactcgaga--gagtggatctccatcacagagagatcttggacaaaataggtggcgaggttatccaggt 45614335  T
Q  117 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45614336 cggcgaaggagcgacggagacgagatcgtcatcctgacgtcgtcgttaccttcgtgaatcgcgacatattcgcggtgagtaccaaatctggacggtggtg 45614435  T
Q  217 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctaaactgatatggttgtattgcagagnnnnnnnggttgtgtcagagatggaaaagaagat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  45614436 gcgaggaagaaaagaagaagaggaggttgtgttgcaaatctgaactgttatggttgtattgcagagaaaaaaaggttgtgtcagagatggaaaagaagat 45614535  T
Q  317 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45614536 gacatatggtggagcagaggcgcgacaatggtgacaatcgtg 45614577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University