View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13984_low_21 (Length: 356)

Name: NF13984_low_21
Description: NF13984
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13984_low_21
NF13984_low_21
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (14-155)||(26455582-26455723)
chr3 (20-155)||(35346471-35346606)
chr3 (14-155)||(20813441-20813582)
chr3 (14-155)||(38446476-38446617)
chr3 (20-155)||(1687657-1687792)
chr3 (20-155)||(20760071-20760206)
chr3 (14-155)||(1017044-1017185)
chr3 (14-155)||(21564496-21564637)
chr3 (14-155)||(33151696-33151837)
chr3 (20-155)||(42016879-42017014)
chr3 (20-155)||(50287572-50287707)
chr3 (14-155)||(21656518-21656659)
chr3 (14-155)||(31122662-31122803)
chr3 (14-155)||(47329175-47329316)
chr3 (14-147)||(12748391-12748524)
chr3 (14-155)||(20086314-20086455)
chr3 (14-155)||(36314972-36315113)
chr3 (14-155)||(41250886-41251027)
chr3 (20-155)||(21890176-21890311)
chr3 (14-149)||(22851996-22852131)
chr3 (14-155)||(42107099-42107240)
chr3 (14-155)||(51562162-51562303)
chr3 (14-155)||(53925979-53926120)
chr3 (14-150)||(19664541-19664677)
chr3 (20-155)||(32650820-32650955)
chr3 (14-155)||(44798268-44798408)
chr3 (14-154)||(29677476-29677616)
chr3 (20-155)||(3697152-3697287)
chr3 (20-155)||(10618480-10618615)
chr3 (20-155)||(35608131-35608266)
chr3 (20-155)||(40922165-40922300)
chr3 (14-123)||(19268521-19268630)
chr3 (14-155)||(27070739-27070880)
chr3 (14-155)||(37247956-37248097)
chr3 (14-155)||(48651248-48651389)
chr3 (14-155)||(52821049-52821190)
chr3 (14-155)||(53196014-53196155)
chr3 (14-155)||(55164115-55164256)
chr3 (229-325)||(26455797-26455893)
chr3 (20-155)||(20913754-20913889)
chr3 (20-155)||(20921872-20922007)
chr3 (20-133)||(50977870-50977983)
chr3 (20-133)||(51081002-51081115)
chr3 (20-133)||(51475268-51475381)
chr3 (14-155)||(1448735-1448873)
chr3 (14-133)||(50364909-50365028)
chr3 (14-155)||(33473239-33473380)
chr3 (14-155)||(39069726-39069867)
chr3 (14-155)||(45380260-45380401)
chr3 (14-127)||(28699685-28699798)
chr3 (14-155)||(38923998-38924139)
chr3 (20-133)||(34019466-34019579)
chr3 (14-91)||(44152700-44152777)
chr3 (45-133)||(42641200-42641288)
chr3 (14-74)||(47473230-47473290)
chr3 (248-325)||(26456171-26456248)
chr3 (113-155)||(44152772-44152814)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (14-155)||(23767414-23767555)
chr1 (14-155)||(19315640-19315781)
chr1 (14-155)||(38473626-38473767)
chr1 (14-155)||(46051450-46051591)
chr1 (14-155)||(7553016-7553157)
chr1 (14-155)||(7651662-7651803)
chr1 (14-155)||(12143072-12143213)
chr1 (14-155)||(41106016-41106157)
chr1 (14-155)||(46825531-46825672)
chr1 (20-155)||(9962757-9962892)
chr1 (20-155)||(49094711-49094846)
chr1 (20-155)||(49814306-49814441)
chr1 (14-155)||(26549388-26549529)
chr1 (14-155)||(28425363-28425504)
chr1 (14-155)||(52146993-52147134)
chr1 (20-155)||(25988271-25988406)
chr1 (14-155)||(36157678-36157818)
chr1 (14-155)||(50689943-50690084)
chr1 (20-155)||(9878784-9878919)
chr1 (20-155)||(36781172-36781307)
chr1 (14-155)||(33674017-33674158)
chr1 (14-154)||(19274559-19274699)
chr1 (20-155)||(5400877-5401011)
chr1 (20-155)||(26069898-26070033)
chr1 (14-155)||(23228194-23228335)
chr1 (14-155)||(33325727-33325868)
chr1 (14-155)||(48802331-48802472)
chr1 (14-155)||(52067651-52067792)
chr1 (20-155)||(45350717-45350850)
chr1 (20-155)||(45670486-45670621)
chr1 (20-155)||(48669396-48669531)
chr1 (14-152)||(24204474-24204612)
chr1 (14-155)||(7608766-7608907)
chr1 (14-155)||(16705870-16706011)
chr1 (14-155)||(18892329-18892470)
chr1 (14-155)||(52349924-52350065)
chr1 (20-155)||(37216902-37217037)
chr1 (20-153)||(41982237-41982370)
chr1 (14-155)||(46095075-46095216)
chr1 (14-154)||(50533383-50533523)
chr1 (20-155)||(8141486-8141621)
chr1 (20-155)||(18782089-18782224)
chr1 (20-154)||(18917530-18917664)
chr1 (14-155)||(6711440-6711581)
chr1 (14-155)||(17983898-17984039)
chr1 (14-155)||(43396675-43396816)
chr1 (20-133)||(48319068-48319181)
chr1 (14-133)||(33194673-33194792)
chr1 (20-133)||(9974848-9974961)
chr1 (14-118)||(12964646-12964750)
chr1 (20-155)||(21965071-21965206)
chr1 (20-155)||(34971086-34971221)
chr1 (14-155)||(40721342-40721484)
chr1 (20-133)||(16506810-16506923)
chr1 (14-133)||(30281631-30281750)
chr1 (20-155)||(21929527-21929667)
chr1 (20-155)||(33714361-33714494)
chr1 (20-155)||(25800650-25800782)
chr1 (54-155)||(44978768-44978868)
chr1 (14-92)||(50099220-50099298)
chr1 (14-62)||(44979281-44979329)
chr1 (14-58)||(32373650-32373694)
chr1 (20-58)||(17989864-17989902)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (14-155)||(1293486-1293627)
chr8 (14-155)||(2533272-2533413)
chr8 (20-155)||(15847118-15847253)
chr8 (20-155)||(37933648-37933783)
chr8 (14-155)||(3875908-3876049)
chr8 (14-155)||(36400070-36400211)
chr8 (20-155)||(38107105-38107240)
chr8 (14-155)||(513308-513448)
chr8 (14-155)||(43806533-43806674)
chr8 (20-155)||(259984-260118)
chr8 (20-155)||(655803-655937)
chr8 (20-155)||(841538-841672)
chr8 (14-155)||(22683988-22684129)
chr8 (14-155)||(35443311-35443452)
chr8 (14-155)||(38633710-38633851)
chr8 (20-155)||(35884430-35884565)
chr8 (20-155)||(28496355-28496489)
chr8 (29-155)||(41536527-41536653)
chr8 (14-155)||(28707446-28707587)
chr8 (20-155)||(40301893-40302028)
chr8 (14-155)||(12010549-12010693)
chr8 (14-155)||(9056338-9056479)
chr8 (30-155)||(23972295-23972420)
chr8 (20-155)||(38208758-38208894)
chr8 (20-155)||(440846-440981)
chr8 (14-133)||(7434886-7435005)
chr8 (14-133)||(23935233-23935352)
chr8 (14-155)||(33651841-33651982)
chr8 (14-155)||(24430571-24430712)
chr8 (20-155)||(36218781-36218915)
chr8 (20-150)||(39513344-39513474)
chr8 (20-133)||(6016211-6016324)
chr8 (23-155)||(13797098-13797229)
chr8 (20-155)||(4649156-4649291)
chr8 (14-133)||(29485287-29485405)
chr8 (14-155)||(42988227-42988367)
chr8 (14-92)||(24193356-24193433)
chr8 (90-154)||(24193131-24193195)
chr8 (20-74)||(8137180-8137234)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (14-155)||(35600122-35600263)
chr7 (14-155)||(1469493-1469634)
chr7 (14-155)||(31684134-31684275)
chr7 (14-155)||(47281124-47281265)
chr7 (14-154)||(44544409-44544549)
chr7 (20-154)||(33884325-33884459)
chr7 (14-154)||(47219145-47219285)
chr7 (20-155)||(37393998-37394133)
chr7 (14-155)||(30876259-30876400)
chr7 (14-155)||(38427563-38427704)
chr7 (14-155)||(47271981-47272122)
chr7 (14-155)||(47294291-47294432)
chr7 (14-155)||(8162712-8162853)
chr7 (14-155)||(11476556-11476697)
chr7 (14-155)||(23842305-23842446)
chr7 (14-155)||(27364339-27364480)
chr7 (14-155)||(30798368-30798509)
chr7 (14-155)||(30971941-30972082)
chr7 (14-155)||(40851274-40851415)
chr7 (14-155)||(48628805-48628946)
chr7 (27-155)||(2960640-2960768)
chr7 (20-155)||(44800410-44800545)
chr7 (14-155)||(43968259-43968400)
chr7 (14-155)||(45723491-45723632)
chr7 (20-150)||(4923222-4923352)
chr7 (14-155)||(41113377-41113518)
chr7 (14-155)||(43752776-43752917)
chr7 (20-155)||(11050261-11050396)
chr7 (37-155)||(221298-221416)
chr7 (20-133)||(37354285-37354398)
chr7 (14-155)||(41139408-41139553)
chr7 (14-133)||(3797545-3797664)
chr7 (20-155)||(7336066-7336200)
chr7 (20-154)||(29248348-29248482)
chr7 (14-155)||(42979338-42979479)
chr7 (14-155)||(47119991-47120134)
chr7 (14-155)||(47579086-47579228)
chr7 (14-133)||(27774108-27774227)
chr7 (20-155)||(18353150-18353285)
chr7 (14-107)||(40520918-40521011)
chr7 (14-74)||(39034062-39034122)
chr7 (102-155)||(42888937-42888990)
chr7 (99-155)||(5106127-5106182)
chr7 (21-57)||(43025119-43025155)
chr7 (26-65)||(12583313-12583352)
chr7 (14-63)||(29739781-29739829)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (14-155)||(11795154-11795295)
chr4 (14-155)||(33807780-33807921)
chr4 (14-155)||(42273802-42273943)
chr4 (14-155)||(55517185-55517326)
chr4 (14-155)||(28264643-28264784)
chr4 (20-155)||(26017429-26017564)
chr4 (20-155)||(49118617-49118752)
chr4 (14-155)||(4544985-4545126)
chr4 (14-155)||(12196469-12196610)
chr4 (14-155)||(19496102-19496243)
chr4 (14-155)||(31591076-31591216)
chr4 (14-155)||(31973591-31973732)
chr4 (14-155)||(48707733-48707874)
chr4 (14-154)||(32118714-32118854)
chr4 (14-154)||(40988633-40988773)
chr4 (20-155)||(23553071-23553205)
chr4 (20-154)||(37381852-37381986)
chr4 (14-155)||(5227390-5227531)
chr4 (14-155)||(28159953-28160094)
chr4 (14-155)||(28812287-28812427)
chr4 (14-155)||(33693333-33693474)
chr4 (20-155)||(2055284-2055419)
chr4 (20-155)||(8882013-8882148)
chr4 (24-155)||(23135006-23135137)
chr4 (20-155)||(24458631-24458766)
chr4 (20-155)||(32317959-32318094)
chr4 (15-154)||(33174021-33174160)
chr4 (20-155)||(44490325-44490460)
chr4 (20-155)||(48551764-48551899)
chr4 (14-155)||(15985010-15985151)
chr4 (14-155)||(17847096-17847236)
chr4 (14-155)||(35930040-35930180)
chr4 (20-155)||(30467003-30467138)
chr4 (20-155)||(48149505-48149640)
chr4 (14-155)||(9339123-9339267)
chr4 (14-155)||(17993017-17993158)
chr4 (20-155)||(50276138-50276270)
chr4 (14-153)||(10588580-10588719)
chr4 (14-133)||(19168817-19168936)
chr4 (14-133)||(24623148-24623267)
chr4 (20-155)||(39995167-39995302)
chr4 (14-155)||(14564796-14564937)
chr4 (14-155)||(30141108-30141249)
chr4 (14-155)||(50542354-50542495)
chr4 (20-155)||(25734223-25734358)
chr4 (14-155)||(39700045-39700186)
chr4 (14-155)||(51371047-51371188)
chr4 (20-155)||(25730246-25730381)
chr4 (46-155)||(31208776-31208885)
chr4 (14-155)||(22298517-22298659)
chr4 (30-133)||(42549644-42549747)
chr4 (14-95)||(56555200-56555281)
chr4 (80-155)||(20534231-20534306)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (20-155)||(14717611-14717746)
chr5 (20-155)||(39002025-39002160)
chr5 (14-155)||(38964114-38964254)
chr5 (14-154)||(30863253-30863393)
chr5 (14-155)||(3352002-3352143)
chr5 (14-155)||(6739955-6740096)
chr5 (14-155)||(8215900-8216041)
chr5 (14-155)||(26593280-26593421)
chr5 (14-155)||(27457197-27457338)
chr5 (14-155)||(30297749-30297890)
chr5 (14-155)||(31710282-31710423)
chr5 (20-155)||(14952330-14952465)
chr5 (9-155)||(23128913-23129059)
chr5 (14-155)||(11000728-11000869)
chr5 (14-155)||(11692147-11692288)
chr5 (14-155)||(16095960-16096100)
chr5 (14-155)||(33760470-33760611)
chr5 (14-155)||(35342180-35342321)
chr5 (14-155)||(42993518-42993659)
chr5 (14-154)||(41282342-41282482)
chr5 (20-155)||(6600136-6600271)
chr5 (14-155)||(6251972-6252113)
chr5 (14-155)||(8689572-8689713)
chr5 (14-155)||(39824556-39824697)
chr5 (14-155)||(40074950-40075091)
chr5 (14-155)||(4015874-4016015)
chr5 (14-155)||(19659501-19659642)
chr5 (14-155)||(20079258-20079399)
chr5 (14-155)||(43166269-43166410)
chr5 (20-155)||(20408539-20408674)
chr5 (22-155)||(1052541-1052674)
chr5 (14-155)||(30208402-30208543)
chr5 (14-155)||(28078405-28078546)
chr5 (14-133)||(16752116-16752235)
chr5 (20-155)||(27116099-27116234)
chr5 (20-155)||(19398193-19398328)
chr5 (14-133)||(26035368-26035487)
chr5 (14-116)||(6331377-6331479)
chr5 (20-155)||(11935452-11935586)
chr5 (22-133)||(444962-445073)
chr5 (14-155)||(8694866-8695007)
chr5 (14-155)||(27509978-27510112)
chr5 (111-155)||(6332873-6332917)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (14-155)||(3408189-3408330)
chr6 (14-155)||(10256237-10256378)
chr6 (20-155)||(1077243-1077378)
chr6 (14-155)||(12626636-12626777)
chr6 (14-154)||(6503718-6503858)
chr6 (14-155)||(1915343-1915484)
chr6 (14-155)||(9382519-9382660)
chr6 (20-155)||(2390271-2390406)
chr6 (20-155)||(30379023-30379158)
chr6 (14-155)||(2707459-2707600)
chr6 (14-155)||(8178249-8178390)
chr6 (14-155)||(29050272-29050413)
chr6 (20-155)||(17943042-17943177)
chr6 (20-155)||(26393009-26393144)
chr6 (20-155)||(17428272-17428407)
chr6 (25-155)||(2598099-2598229)
chr6 (14-155)||(3258807-3258948)
chr6 (14-155)||(26230932-26231073)
chr6 (20-155)||(16193316-16193451)
chr6 (14-155)||(11133873-11134015)
chr6 (20-133)||(26936613-26936726)
chr6 (29-133)||(35223921-35224025)
chr6 (20-155)||(26196321-26196456)
chr6 (29-155)||(6785101-6785224)
chr6 (35-155)||(10931148-10931267)
chr6 (68-155)||(31375971-31376058)
chr6 (20-154)||(25820550-25820684)
chr6 (97-155)||(12612971-12613029)
chr6 (75-155)||(12612848-12612928)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (14-155)||(16246193-16246334)
chr2 (14-155)||(27328584-27328725)
chr2 (14-155)||(921022-921163)
chr2 (14-155)||(7378963-7379104)
chr2 (14-155)||(9276574-9276715)
chr2 (14-155)||(28650426-28650567)
chr2 (14-155)||(40854609-40854750)
chr2 (14-149)||(771981-772116)
chr2 (20-155)||(33865267-33865402)
chr2 (14-155)||(2456010-2456151)
chr2 (14-155)||(11949426-11949567)
chr2 (14-155)||(34253142-34253283)
chr2 (14-155)||(41500502-41500643)
chr2 (20-155)||(7297234-7297369)
chr2 (20-155)||(37838303-37838438)
chr2 (14-154)||(17134229-17134369)
chr2 (20-155)||(19180428-19180562)
chr2 (14-155)||(1106559-1106700)
chr2 (14-155)||(2094410-2094551)
chr2 (14-155)||(8899682-8899822)
chr2 (14-155)||(12759750-12759890)
chr2 (26-155)||(33106969-33107098)
chr2 (14-154)||(36444229-36444369)
chr2 (14-154)||(38751048-38751188)
chr2 (20-155)||(2056932-2057067)
chr2 (20-155)||(2314975-2315110)
chr2 (20-155)||(17484550-17484685)
chr2 (14-148)||(3430631-3430765)
chr2 (14-155)||(43249412-43249553)
chr2 (14-133)||(8396573-8396692)
chr2 (20-155)||(25087796-25087931)
chr2 (14-155)||(29737748-29737889)
chr2 (22-155)||(42629970-42630103)
chr2 (14-150)||(36211046-36211182)
chr2 (14-155)||(37732193-37732334)
chr2 (15-155)||(45124120-45124260)
chr2 (28-130)||(37654122-37654224)
chr2 (63-155)||(14630663-14630755)
chr2 (14-133)||(19916009-19916128)
chr2 (14-115)||(41178059-41178160)
chr2 (15-155)||(9331757-9331897)
chr2 (65-155)||(23671811-23671901)
chr2 (14-70)||(23672958-23673014)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (14-155)||(114-255)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (14-155)||(218885-219027)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (20-155)||(5192-5326)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (20-155)||(5027-5162)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (20-155)||(47968-48103)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (14-155)||(252438-252579)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (14-133)||(1995-2114)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (20-155)||(13101-13236)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (20-155)||(59608-59743)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (20-154)||(11364-11498)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (80-155)||(605-680)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (80-155)||(1913-1988)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (80-155)||(3371-3446)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (80-155)||(1883-1958)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (14-67)||(289-342)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (14-64)||(19781-19831)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 26455582 - 26455723
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455582 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 26455681  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455682 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 26455723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35346606 - 35346471
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346606 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 35346507  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35346506 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 35346471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20813582 - 20813441
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813582 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20813483  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20813482 accaattatgctatctacattatgacttgtttgaaacgattc 20813441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 38446476 - 38446617
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38446476 agagcattatctactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38446575  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38446576 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 38446617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 1687657 - 1687792
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687657 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 1687756  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1687757 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 1687792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20760206 - 20760071
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20760206 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 20760107  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20760106 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 20760071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 1017044 - 1017185
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017044 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1017143  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1017144 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 1017185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 21564496 - 21564637
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564496 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21564595  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21564596 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 21564637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 33151696 - 33151837
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33151696 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaatt 33151795  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33151796 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 33151837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 42016879 - 42017014
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42016879 ttatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaac 42016978  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42016979 tatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 42017014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 50287572 - 50287707
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  50287572 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagtttaatgaagcaattaccaac 50287671  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  50287672 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 50287707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 21656518 - 21656659
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21656518 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaaggtgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21656617  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21656618 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattc 21656659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 31122662 - 31122803
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31122662 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtcttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31122761  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31122762 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattc 31122803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47329316 - 47329175
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47329316 agagcattatccaccatttgccatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47329217  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  47329216 accaactatgctatctacgatatgacttgttggaaacgattc 47329175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Original strand, 12748391 - 12748524
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12748391 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12748490  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttga 147  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12748491 accaactatgctatctacaataggacttgtttga 12748524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20086455 - 20086314
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20086455 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20086356  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  20086355 accaagtatgctatctataataggacttgtttgaaacgattc 20086314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36315113 - 36314972
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36315113 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaatt 36315014  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  36315013 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 36314972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 41250886 - 41251027
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41250886 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 41250985  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  41250986 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacaattc 41251027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 21890176 - 21890311
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21890176 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaa 21890275  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||||||||||    
T  21890276 tatgttatctataataggacttgtttgaaacgattc 21890311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Original strand, 22851996 - 22852131
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22851996 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaacagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 22852095  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  22852096 accaactatgctatctacaataggacttatttgaaa 22852131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42107240 - 42107099
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  42107240 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtgtcaaagatgagttcaaggaagtaatt 42107141  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42107140 accaactatactatctacaataggacttgtttgaaacgattc 42107099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 51562162 - 51562303
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51562162 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 51562261  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  51562262 accaactatgttatctacattagaacttgtttgaaacgattc 51562303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 53926120 - 53925979
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53926120 agagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 53926021  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  53926020 accaactatactatctacaatatgacttatttgaaatgattc 53925979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Original strand, 19664541 - 19664677
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19664541 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttatgagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 19664640  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaac 150  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19664641 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 19664677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32650955 - 32650820
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650955 ttatccaccatttgccatgcctagaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 32650856  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||| |||||    
T  32650855 tatgctatctataatagaacttgtttgaaatgattc 32650820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 44798268 - 44798408
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44798268 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaa-atgagtaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 44798366  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  44798367 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 44798408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 29677476 - 29677616
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29677476 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaaatgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29677575  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    || ||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  29677576 acaaactatgatatctacgataggacctgtttgaaacgatt 29677616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 3697152 - 3697287
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3697152 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgaattcaatgaagcaattaccaac 3697251  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  3697252 tatactatctacaataggacttgtttgaaaggattc 3697287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10618615 - 10618480
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  10618615 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaat 10618516  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10618515 tatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattc 10618480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35608266 - 35608131
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  35608266 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttaggagtccgatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattaccaat 35608167  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  35608166 tatgctatctacaataggacttatttgaaacgattc 35608131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 40922300 - 40922165
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40922300 ttatccaccattttccatgcctaaaaaaattactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattaccaac 40922201  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40922200 tatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgattc 40922165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 19268521 - 19268630
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19268521 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 19268620  T
Q  114 accaactatg 123  Q
    ||||||||||    
T  19268621 accaactatg 19268630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27070880 - 27070739
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27070880 agagcattatccaccatttataatgtctgaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 27070781  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27070780 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattc 27070739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 37247956 - 37248097
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37247956 agagcattattcatcatttgtcatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 37248055  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37248056 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 37248097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 48651248 - 48651389
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48651248 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagacgattaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaatt 48651347  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  48651348 accaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattc 48651389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52821190 - 52821049
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  52821190 agagcattatccatcatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagttttactaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 52821091  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  52821090 accaactatgttatctacaacaggacttgtttaaaacgattc 52821049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 53196014 - 53196155
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  53196014 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaataatt 53196113  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  53196114 accaactatgttatctacaataagacttctttgaaacgattc 53196155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 55164256 - 55164115
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  55164256 agagcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 55164157  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  55164156 agcaactatgctatctacaatatgacttatttgaaacaattc 55164115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 229 - 325
Target Start/End: Original strand, 26455797 - 26455893
Alignment:
Q  229 cctttagatgcatttgaccgactttgtcatcatggtgttcctagctgaagcatccaccaactttcttattagggctctcaacctttgaggggagatt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455797 cctttagatgcatttgaccgactttgtcatcatggtgttcccagctgaagcatccaccaactttcttattagggctctcaacctttgaggggagatt 26455893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20913889 - 20913754
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20913889 ttattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaac 20913790  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  20913789 tatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 20913754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20922007 - 20921872
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20922007 ttattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaac 20921908  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  20921907 tatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 20921872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Original strand, 50977870 - 50977983
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50977870 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactaccaac 50977969  T
Q  120 tatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||    
T  50977970 tatgctatctacaa 50977983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Original strand, 51081002 - 51081115
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51081002 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactaccaac 51081101  T
Q  120 tatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||    
T  51081102 tatgctatctacaa 51081115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 51475381 - 51475268
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51475381 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 51475282  T
Q  120 tatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||    
T  51475281 tatgctatctacaa 51475268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1448873 - 1448735
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1448873 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaatt 1448774  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||   |||| | ||||| |||||||||||||    
T  1448773 accaactatggta---acaataggacttctttgaaacgattc 1448735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 50365028 - 50364909
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50365028 agagcattacccaccatttgccatgcctaaaaagattactgattttaagtgagtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 50364929  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  50364928 accaactatgttatctacaa 50364909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33473380 - 33473239
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  33473380 agagcattatccaccatttatcatgactaaaaagatgactaattttaagtgcgtgttagaaaccagatttggtaccaaagataaaatcaaggaaacaatt 33473281  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  33473280 accaactatgttatctacaataaaacttgtttgaaacgattc 33473239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 39069726 - 39069867
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  39069726 agagcattatccaccatttgccatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttggtaccaaagataagttaaaggaaacaatt 39069825  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  39069826 atcaactatgctattaacaatatgacttgtttgaaacgattc 39069867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45380401 - 45380260
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  45380401 agagcattatccaccatttaccatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagtttaaagaagcaatt 45380303  T
Q  114 a-ccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  45380302 atcaaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 45380260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 28699685 - 28699798
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28699685 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtgccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28699784  T
Q  114 accaactatgctat 127  Q
    | | |||| |||||    
T  28699785 atctactaagctat 28699798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38924139 - 38923998
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38924139 agagcgttattcattatttgtcatgcttaaagagatgattaattttaagtggatgttaggagtccaatttggtaccaaagataagttcaacgaagcaatt 38924040  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  38924039 accaactattttatctacgataggacttgtttgaaacaattc 38923998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Original strand, 34019466 - 34019579
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||    
T  34019466 ttatccaccatttgacatgcctaaaaatatggctgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacagtgagttcaagtaagcaattatcaac 34019565  T
Q  120 tatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||    
T  34019566 tatgctatctacaa 34019579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 91
Target Start/End: Original strand, 44152700 - 44152777
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaa 91  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  44152700 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaa 44152777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42641288 - 42641200
Alignment:
Q  45 aagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaa 133  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  42641288 aagatgattgattttaagtgggtgttaggaggcagacttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacttggctatatacaa 42641200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 47473230 - 47473290
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 74  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47473230 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtggatgttagga 47473290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Original strand, 26456171 - 26456248
Alignment:
Q  248 gactttgtcatcatggtgttcctagctgaagcatccaccaactttcttattagggctctcaacctttgaggggagatt 325  Q
    ||||||||  |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26456171 gactttgttttcatggtgttcccaacttaagcatccaacaacattcttatttgggctctcaacctttgagtggagatt 26456248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 155
Target Start/End: Original strand, 44152772 - 44152814
Alignment:
Q  113 taccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44152772 taccaactatgttatctataatatgacttgtttgaaacgattc 44152814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23767555 - 23767414
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767555 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23767456  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23767455 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 23767414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 19315640 - 19315781
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315640 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19315739  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19315740 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 19315781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38473767 - 38473626
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473767 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38473668  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38473667 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattc 38473626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 46051450 - 46051591
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46051450 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 46051549  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46051550 accaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgattc 46051591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7553157 - 7553016
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553157 agagcattatccaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7553058  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7553057 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 7553016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 7651662 - 7651803
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7651662 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 7651761  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7651762 atcaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 7651803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 12143072 - 12143213
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143072 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12143171  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12143172 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 12143213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 41106016 - 41106157
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106016 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41106115  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41106116 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 41106157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 46825531 - 46825672
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825531 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 46825630  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46825631 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 46825672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 9962757 - 9962892
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9962757 ttatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 9962856  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9962857 tatgctatctacaacagaacttgtttgaaacgattc 9962892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 49094846 - 49094711
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094846 ttatccaccatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 49094747  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  49094746 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 49094711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 49814306 - 49814441
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814306 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 49814405  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  49814406 tatgctatctagaatatgacttatttgaaacgattc 49814441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 26549388 - 26549529
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26549388 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 26549487  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  26549488 accaactatgctatctacaataggacttgtttaaaacgattc 26549529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28425504 - 28425363
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425504 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28425405  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  28425404 accaactatgctatctgcaataggacttgtttgaaacgattc 28425363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 52146993 - 52147134
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  52146993 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 52147092  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52147093 acaaactatgctatatacaacatgacttgtttgaaacgattc 52147134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25988406 - 25988271
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25988406 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattaccaac 25988307  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25988306 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 25988271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36157818 - 36157678
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157818 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36157719  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
     |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36157718 -ccaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 36157678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 50689943 - 50690084
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50689943 agagcattatccatcatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50690042  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50690043 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 50690084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9878919 - 9878784
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9878919 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaacccgatatggtactaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 9878820  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9878819 tattttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 9878784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36781307 - 36781172
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36781307 ttatccaccatttgccatgcccaaaaagacgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 36781208  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36781207 tatgatatctacaataagacttgtttgaaacgattc 36781172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 33674017 - 33674158
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33674017 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaagatgagttcaaggaagcaatt 33674116  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  33674117 accagctatgctatctacaataggacttgtttgacacgattc 33674158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 19274559 - 19274699
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19274559 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 19274658  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19274659 accagctatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 19274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 5400877 - 5401011
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5400877 ttatccaccatttg-catgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagaaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 5400975  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  5400976 tatgctatctacaataggacttgtttgaaaagattc 5401011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 26069898 - 26070033
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26069898 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccggatttgataccaaaaatgagttcaaggaaacaattaccaac 26069997  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26069998 tatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 26070033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23228335 - 23228194
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23228335 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23228236  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  23228235 accaactatgctatctacaatagtacttgtttgaaacgattc 23228194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 33325727 - 33325868
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33325727 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtcttagaagccagatttgataccaaagatgagtttaaggaagcaatt 33325826  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33325827 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 33325868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 48802472 - 48802331
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48802472 agagcattatccaccatttatcatgcctacaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 48802373  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  48802372 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattc 48802331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52067792 - 52067651
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52067792 agagcattatccaccatttgtcatccctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacgatgagttcaaggaagcaatt 52067693  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52067692 acaaattatgccatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 52067651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45350850 - 45350717
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45350850 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagatcaaggaagcaattaccaac 45350751  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  45350750 tatgttatctacaatagg--ttgtttgaaacgattc 45350717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45670621 - 45670486
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc-aa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45670621 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaa 45670523  T
Q  119 ctatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45670522 ctatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 45670486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 48669531 - 48669396
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48669531 ttatccattatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatcaccaac 48669432  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  48669431 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 48669396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24204612 - 24204474
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24204612 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactcattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaatt 24204513  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacga 152  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24204512 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 24204474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7608907 - 7608766
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7608907 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacaaaagatgagttcaaagaagcaatt 7608808  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  7608807 atcaactatgctatctataataggacttgtttgaaacgattc 7608766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 16705870 - 16706011
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16705870 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggcgccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16705969  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||    
T  16705970 accaactatgttatctaaaataagacttgtttgaaacgattc 16706011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 18892329 - 18892470
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18892329 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaggatgactaattttcagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 18892428  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18892429 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 18892470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52350065 - 52349924
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  52350065 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaatt 52349966  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  52349965 accaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattc 52349924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 37216902 - 37217037
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37216902 ttatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagctagagttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaac 37217001  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37217002 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 37217037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41982370 - 41982237
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  41982370 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaatatgactaattttaaatgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaattatcaac 41982271  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgat 153  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41982270 tatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgat 41982237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 46095216 - 46095075
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  46095216 agagcattatccaccatttgtcatgtttaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagacagatttgatatcaaagatgagttcaaggaaacaatt 46095117  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46095116 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 46095075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 50533383 - 50533523
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50533383 agagcattatccaaaatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50533482  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  50533483 accaactatgttatctataataggacttgtttgaaacgatt 50533523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8141621 - 8141486
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  8141621 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacaagtcagatttggtactaaagatgagttcaaagaagcaattacaaat 8141522  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8141521 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 8141486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18782224 - 18782089
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  18782224 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctatgaaccagattttgtaccaaagatgagttcaaataagcaattatcaac 18782125  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  18782124 tatgctatctagaatatgacttgtttgaaatgattc 18782089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 18917530 - 18917664
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||     
T  18917530 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattattaaa 18917629  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18917630 tatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgatt 18917664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 6711440 - 6711581
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711440 agagcattatccaccatttaccatgtgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6711539  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6711540 accaactataatgtctacaatatgacttgtttgaaacgattc 6711581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17984039 - 17983898
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17984039 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 17983940  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    || ||||||| ||| ||||  | |||||| ||||||||||||    
T  17983939 acaaactatgttatttacattaggacttggttgaaacgattc 17983898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 43396675 - 43396816
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43396675 agagcattatccatcatttgctatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43396774  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | ||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  43396775 atcaactctgctatctacagtaggatttgtttgaaacgattc 43396816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 48319181 - 48319068
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48319181 ttatccaccatttgtaatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 48319082  T
Q  120 tatgctatctacaa 133  Q
    |||||||| |||||    
T  48319081 tatgctatatacaa 48319068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33194792 - 33194673
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33194792 agagcattaaccaccattcgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaact 33194693  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33194692 accaactatgctatctacaa 33194673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Original strand, 9974848 - 9974961
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9974848 ttatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccatatttagtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaac 9974947  T
Q  120 tatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||    
T  9974948 tatgctatctacaa 9974961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 12964646 - 12964750
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12964646 agagcattatacaacatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12964745  T
Q  114 accaa 118  Q
    |||||    
T  12964746 accaa 12964750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 21965071 - 21965206
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  21965071 ttatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtaaggagtcagatttggtaccaaagatgagtttaatgaagcaattaccaat 21965170  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21965171 tatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattc 21965206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 34971086 - 34971221
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  34971086 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagtcagatttgataccaaatatgagttcaaagaaacaattaccaac 34971185  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  34971186 tatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattc 34971221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 40721342 - 40721484
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-gggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40721342 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataattaattttaggttgggtattaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaagaaagcaat 40721441  T
Q  113 taccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  40721442 tatcaactatgctatctacaataggacttgttggaaacgattc 40721484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16506923 - 16506810
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16506923 ttatccaccatttgccatgcttaaaaagatggctgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattaccaac 16506824  T
Q  120 tatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||    
T  16506823 tatgctatctacaa 16506810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 30281631 - 30281750
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30281631 agagcattatccaccattttacatgcctaaaaagataactggtattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30281730  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30281731 accaactatgctatctacaa 30281750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 21929527 - 21929667
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaag-------atgagttcaaggaagcaat 112  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  21929527 ttatccaccatttgccat--ctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgaaagatgagttcaaggaagcaat 21929624  T
Q  113 taccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  21929625 taccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 21929667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33714494 - 33714361
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33714494 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatgt-aagtgg-tgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaaacaattatcaac 33714397  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  33714396 tatgttatctacaataggatttgtttgaaacgattc 33714361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 25800650 - 25800782
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtacca----aagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      | |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  25800650 ttatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta------agatttggtaccaaattaagatgagttcaaggaagcaattac 25800743  T
Q  116 caactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25800744 caac-atgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 25800782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44978868 - 44978768
Alignment:
Q  54 aattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgat 153  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  44978868 aattttaagtgg-tattaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattatcaattatgctatctacattctgacttgtttgaaacgat 44978770  T
Q  154 tc 155  Q
    ||    
T  44978769 tc 44978768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Original strand, 50099220 - 50099298
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaa 92  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  || |||||||||||||    
T  50099220 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaaaagtcatatttggtaccaaa 50099298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 44979329 - 44979281
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 62  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44979329 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 44979281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 32373694 - 32373650
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 58  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32373694 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 32373650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 17989902 - 17989864
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 58  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17989902 ttattcactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 17989864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 1293486 - 1293627
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293486 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1293585  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293586 accaactatgttatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 1293627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 2533272 - 2533413
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533272 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2533371  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2533372 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 2533413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 15847118 - 15847253
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847118 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 15847217  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15847218 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 15847253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 37933648 - 37933783
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933648 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 37933747  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  37933748 tatgctatctacgataagacttgtttgaaacgattc 37933783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 3875908 - 3876049
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875908 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3876007  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3876008 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 3876049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36400211 - 36400070
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400211 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36400112  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36400111 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 36400070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 38107105 - 38107240
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38107105 ttatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 38107204  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38107205 tatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattc 38107240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 513308 - 513448
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  513308 agagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 513406  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  513407 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 513448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43806674 - 43806533
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43806674 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43806575  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43806574 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 43806533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 259984 - 260118
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  259984 ttatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 260082  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  260083 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 260118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 655937 - 655803
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  655937 ttatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 655839  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  655838 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 655803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 841672 - 841538
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  841672 ttatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 841574  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  841573 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 841538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22684129 - 22683988
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22684129 agagcattattcaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 22684030  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22684029 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaatgattc 22683988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 35443311 - 35443452
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35443311 agagcattatccactatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35443410  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  35443411 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 35443452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38633851 - 38633710
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38633851 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38633752  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  38633751 accaactatgctatctacattagaacttgtttgaaacgattc 38633710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35884565 - 35884430
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884565 ttatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 35884466  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35884465 tatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 35884430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28496489 - 28496355
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496489 ttatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattag-aactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 28496391  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28496390 tatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 28496355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41536653 - 41536527
Alignment:
Q  29 atttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41536653 atttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattaccaactatgctatc 41536554  T
Q  129 tacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  41536553 tacaataggacttgtttgaaacgattc 41536527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28707587 - 28707446
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28707587 agagcattatccaccatttgtcatgccttaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 28707488  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  28707487 accaattatgatatctacaataggatttgtttgaaacgattc 28707446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 40302028 - 40301893
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  40302028 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgagtgttaggagctagatttggtaccaaagataaattcaatgaagcaattaccaac 40301929  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40301928 tatgctatctacaatatgacttttttgaaacgattc 40301893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 12010549 - 12010693
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12010549 agagcattatccaccatttgccatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggcaacaatt 12010648  T
Q  114 accaactatgctat---ctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||| ||||    
T  12010649 accaactatgctatctactacaataggacttgtttgaaacaattc 12010693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9056479 - 9056338
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9056479 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 9056380  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  9056379 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacaattc 9056338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23972420 - 23972295
Alignment:
Q  30 tttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatct 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23972420 tttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgataggagtcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatct 23972321  T
Q  130 acaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  23972320 acaatatgacttgtttgaaacgattc 23972295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 38208758 - 38208894
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaag-atgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 118  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38208758 ttatccaccatttgccatgtctaaaatggatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtagcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaa 38208857  T
Q  119 ctatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38208858 ctatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 38208894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 440846 - 440981
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  440846 ttatccaccgtttgccatgtctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaac 440945  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  440946 tatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattc 440981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 7434886 - 7435005
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7434886 agagcattatccaccatttgtcaagcctataaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7434985  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  7434986 accaactatgttatctacaa 7435005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 23935233 - 23935352
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23935233 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 23935332  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  23935333 atcaactatgctatctacaa 23935352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 33651841 - 33651982
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  33651841 agagcattatccaccgtttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatgaaagatgagttcaaggaaacaatt 33651940  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    || ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  33651941 acaaactatgctatctacgataggacttgtttgaaacgattc 33651982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24430712 - 24430571
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  24430712 agagcattatccaccttttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagtagtgagatttggtaccaaagatgagttcaataaaacaatt 24430613  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24430612 atcaactatactatctacaataggacttgtttgaaacgattc 24430571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36218915 - 36218781
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36218915 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgctagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaa-gaagcaattatcaac 36218817  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36218816 tatattatctacatcatgacttgtttgaaacgattc 36218781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39513474 - 39513344
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39513474 ttatccaccatatgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaac 39513375  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaac 150  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||||||    
T  39513374 tatgttatctacattaggacttatttgaaac 39513344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Original strand, 6016211 - 6016324
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6016211 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccaaattgagtatcaaagatgagtttaaagaagcaattaccaac 6016310  T
Q  120 tatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||    
T  6016311 tatgctatctacaa 6016324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Original strand, 13797098 - 13797229
Alignment:
Q  23 tccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactat 122  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13797098 tccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttatgtggatgttaggagccagatttgataccaaa-atgagttcaaagaagcaattaccaactat 13797196  T
Q  123 gctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||||||||    
T  13797197 gctatatacaataggatttgtttgaaacgattc 13797229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 4649156 - 4649291
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  4649156 ttatccaccatttgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtggatgttggaagtcagatttggtaccaaagacgagttcaaggaaacaattaccaat 4649255  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  4649256 tatgctatctacaattggacttgtttgaaacgattc 4649291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 29485287 - 29485405
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29485287 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaa-atgactgattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29485385  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  29485386 accaactatgttatctacaa 29485405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42988367 - 42988227
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  42988367 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaatataagttaaatgaagcaatt 42988268  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | |||||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  42988267 atcaactatattatctacaataggactt-tttgaaacgattc 42988227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24193433 - 24193356
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaa 92  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24193433 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtaccaaa 24193356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24193195 - 24193131
Alignment:
Q  90 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24193195 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 24193131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 74
Target Start/End: Original strand, 8137180 - 8137234
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 74  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8137180 ttatccaccatttgctatgcctaaaaaaatgactaattttaagtaggtgttagga 8137234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35600263 - 35600122
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600263 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35600164  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35600163 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 35600122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1469634 - 1469493
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1469634 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaacaaagatgagttcaaggaagcaatt 1469535  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1469534 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 1469493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31684275 - 31684134
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31684275 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31684176  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31684175 accaactattctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 31684134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47281265 - 47281124
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281265 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47281166  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47281165 accaactatggtatctacaataggacttgtttgaaacgattc 47281124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 44544409 - 44544549
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44544409 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 44544508  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  44544509 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 44544549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 33884325 - 33884459
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884325 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 33884424  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33884425 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 33884459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 47219145 - 47219285
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219145 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47219244  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47219245 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 47219285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37394133 - 37393998
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37394133 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactaccaac 37394034  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37394033 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 37393998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 30876259 - 30876400
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30876259 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcccaatttggtaccaaaaatgagttcaatgaagcaatt 30876358  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  30876359 accaactatgctatctacaatagcacttgtttgaaacgattc 30876400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38427704 - 38427563
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38427704 agagcattatccgccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38427605  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  38427604 accaactatgctatctataataggacttgtttgaaacgattc 38427563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 47271981 - 47272122
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47271981 agagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47272080  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47272081 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 47272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47294432 - 47294291
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294432 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47294333  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47294332 accaacgatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 47294291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8162853 - 8162712
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8162853 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataacaaagatgagttcaaggaagcaatt 8162754  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  8162753 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 8162712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11476697 - 11476556
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476697 agagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 11476598  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11476597 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11476556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 23842305 - 23842446
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23842305 agagcattatccaccatctgccatgcctaaaaagatgactaatttgaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 23842404  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23842405 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 23842446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27364480 - 27364339
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27364480 agagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaatt 27364381  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  27364380 accaactatgttatctacaataggatctgtttgaaacgattc 27364339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30798509 - 30798368
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798509 agagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30798410  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  30798409 accaactatgctatctacaataggatttgtttgaaacgattc 30798368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30972082 - 30971941
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  30972082 agagcattatccacaatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgggtttaaggaagtaatt 30971983  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30971982 accaactatgccatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 30971941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 40851274 - 40851415
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40851274 agagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaatt 40851373  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  40851374 accaactattctacctacaataggacttgtttgaaacgattc 40851415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 48628805 - 48628946
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  48628805 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtgcaaaaaatgagttcaaggaagcaatt 48628904  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  48628905 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 48628946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2960768 - 2960640
Alignment:
Q  27 ccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgcta 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2960768 ccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgcta 2960669  T
Q  127 tctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2960668 tctacaataggacttgtttgaaacgattc 2960640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44800545 - 44800410
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44800545 ttatccaccatatatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccatatttggtaccaaagatgagttcaatgaaacaattaccaac 44800446  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44800445 tatgttatctacaacaggacttgtttgaaacaattc 44800410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43968400 - 43968259
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  43968400 agagcattatccaccatttgtcatgcctataaagatgactaattttaagtgggtattatgagccaaatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 43968301  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43968300 accaactacgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 43968259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45723632 - 45723491
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  45723632 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatt 45723533  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    || || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45723532 actaattatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgattc 45723491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 150
Target Start/End: Original strand, 4923222 - 4923352
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4923222 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattaccaac 4923321  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaac 150  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  4923322 tatgctatccacaataggacttgtttgaaac 4923352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 41113377 - 41113518
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41113377 agagcattattcatcatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 41113476  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  41113477 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgattc 41113518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43752917 - 43752776
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43752917 agagcattatccaccatttgtcctgcctcaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43752818  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43752817 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 43752776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11050396 - 11050261
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  11050396 ttatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggaggcagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaattaccaaa 11050297  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11050296 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11050261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 221298 - 221416
Alignment:
Q  37 tgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacat 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  221298 tgcctaaaaagaagactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaatag 221397  T
Q  137 gacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||    
T  221398 gacttgtttgaaacgattc 221416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 37354398 - 37354285
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37354398 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccaaatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaac 37354299  T
Q  120 tatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||    
T  37354298 tatgctatctacaa 37354285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41139553 - 41139408
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41139553 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41139454  T
Q  114 accaac----tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  41139453 accaactatatatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattc 41139408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3797664 - 3797545
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3797664 agagcattatccaccatttaacatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3797565  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  3797564 atcaactatgctatctacaa 3797545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 7336066 - 7336200
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7336066 ttattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaatgatgagttcaaggaagcaattatcaac 7336165  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  7336166 tatgctatctacaata-gaactgtttgaaacgattc 7336200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 29248348 - 29248482
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29248348 ttatccacaatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttgatgccaaagatgagttcaaggaatcaattaccaac 29248447  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  29248448 tatgctatctacaataagacttgtttgaaatgatt 29248482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42979479 - 42979338
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  42979479 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttgatatcaaagatgagttcaacgaagcaatt 42979380  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  42979379 accaactatgttatctacagtaggacttgtttgaaacgattc 42979338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 47119991 - 47120134
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47119991 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaatatgagttcaagaaagcaatt 47120090  T
Q  114 accaac--tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47120091 accaactatatgctctctacaataggacttgtttgaaacgattc 47120134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47579228 - 47579086
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagc-aat 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47579228 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatggttaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaaat 47579129  T
Q  113 taccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||| ||||||||||| || | ||||||| |||||| ||||    
T  47579128 taccaattatgctatctataataggacttgtctgaaacaattc 47579086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 27774108 - 27774227
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27774108 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctgattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaatt 27774207  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27774208 accaactatgctatctacaa 27774227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 18353150 - 18353285
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18353150 ttatccaccatttatcatgtctaaaaagatgactaattttaattaggtgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaagaaaacaattaccaac 18353249  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  18353250 tatgctatctaccttaggacttgtttgaaacgattc 18353285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 107
Target Start/End: Original strand, 40520918 - 40521011
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaa 107  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40520918 agagcattatccaccatttgccatggctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaa 40521011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 39034062 - 39034122
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 74  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39034062 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggcgttagga 39034122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Original strand, 42888937 - 42888990
Alignment:
Q  102 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42888937 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 42888990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 155
Target Start/End: Original strand, 5106127 - 5106182
Alignment:
Q  99 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  5106127 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataaga-atgtttgaaacgattc 5106182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Original strand, 43025119 - 43025155
Alignment:
Q  21 tatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatt 57  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43025119 tatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaatt 43025155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Original strand, 12583313 - 12583352
Alignment:
Q  26 accatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg 65  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12583313 accatttttcatgcgtaaaaagatgactaattttaagtgg 12583352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 29739781 - 29739829
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt 63  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29739781 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaa-gatgactaattttaagt 29739829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11795295 - 11795154
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11795295 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 11795196  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11795195 accaactatgctatctagaatatgacttgtttgaaacgattc 11795154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33807921 - 33807780
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33807921 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 33807822  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33807821 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 33807780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 42273802 - 42273943
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273802 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 42273901  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42273902 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 42273943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 55517326 - 55517185
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  55517326 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 55517227  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55517226 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 55517185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 28264643 - 28264784
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264643 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28264742  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28264743 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 28264784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 26017429 - 26017564
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26017429 ttatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 26017528  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26017529 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 26017564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 49118617 - 49118752
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49118617 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaac 49118716  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  49118717 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 49118752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4545126 - 4544985
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4545126 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaatt 4545027  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4545026 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 4544985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 12196469 - 12196610
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12196469 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 12196568  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  12196569 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgattc 12196610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19496243 - 19496102
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19496243 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggcgccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19496144  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  19496143 accaactatggtatctacaataggacttgtttgaaacaattc 19496102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 31591076 - 31591216
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591076 agagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31591174  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31591175 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 31591216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 31973591 - 31973732
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31973591 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31973690  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  31973691 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 31973732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 48707874 - 48707733
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48707874 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 48707775  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  48707774 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaaagattc 48707733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 32118714 - 32118854
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32118714 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagggggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 32118813  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  32118814 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 32118854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 40988633 - 40988773
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40988633 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40988732  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40988733 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 40988773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 23553071 - 23553205
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23553071 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaat 23553169  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553170 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 23553205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 37381852 - 37381986
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37381852 ttatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatggtaccaaaaatgagtttaaggaagcaattaccaac 37381951  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37381952 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaatgatt 37381986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 5227390 - 5227531
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5227390 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatactaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 5227489  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5227490 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 5227531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28160094 - 28159953
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28160094 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 28159995  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  28159994 accaactatggtatctacaataagacttgtttgaaatgattc 28159953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28812427 - 28812287
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28812427 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtaccaaagatgacttcaaggaagcaatt 28812329  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28812328 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 28812287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33693474 - 33693333
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33693474 agagcattatctatcatttgccatgtctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33693375  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33693374 accaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgattc 33693333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 2055284 - 2055419
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2055284 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaactttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattatcaac 2055383  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2055384 tatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 2055419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8882148 - 8882013
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8882148 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaac 8882049  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  8882048 tatgctatctagaataggacttgtttgaaacgattc 8882013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23135137 - 23135006
Alignment:
Q  24 ccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatg 123  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135137 ccaccatttggcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatg 23135038  T
Q  124 ctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23135037 ttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 23135006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24458766 - 24458631
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24458766 ttatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 24458667  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24458666 tatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 24458631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 32317959 - 32318094
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32317959 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagacagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaac 32318058  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  32318059 tatgttatctacaataggacttgtttgaaatgattc 32318094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33174160 - 33174021
Alignment:
Q  15 gagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33174160 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatta 33174061  T
Q  115 ccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33174060 ccaactatgaaatctacaataagacttgtttgaaacgatt 33174021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 44490325 - 44490460
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44490325 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaactttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaac 44490424  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  44490425 tatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattc 44490460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 48551899 - 48551764
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48551899 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagattttgtaccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaac 48551800  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48551799 catgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 48551764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 15985010 - 15985151
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15985010 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagattactgattttaagtaggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 15985109  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15985110 accaactatgttatctagaatatgacttgtttgaaacgattc 15985151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17847236 - 17847096
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17847236 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaa-gatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 17847138  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17847137 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 17847096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 35930040 - 35930180
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35930040 agagcattatccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcatggaagcaatt 35930138  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  35930139 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 35930180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30467138 - 30467003
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30467138 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaaatgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaattaccaac 30467039  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  30467038 tatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 30467003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 48149505 - 48149640
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149505 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgtcaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 48149604  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  48149605 tatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattc 48149640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9339267 - 9339123
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaa---gatgagttcaaggaagca 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  9339267 agagcattattcaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgatgagttcaaggaagca 9339168  T
Q  111 attaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9339167 attaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaatgattc 9339123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17993158 - 17993017
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  17993158 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaatt 17993059  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  17993058 accaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattc 17993017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 50276270 - 50276138
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50276270 ttatccaccgtttgccatgcctaaaaaga---ctaattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 50276174  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  50276173 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 50276138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Original strand, 10588580 - 10588719
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10588580 agagcattatctgccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 10588679  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgat 153  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10588680 accaactatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgat 10588719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19168936 - 19168817
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19168936 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgagtcaaatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19168837  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19168836 accaactatgctatctacaa 19168817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 24623148 - 24623267
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24623148 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaataactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 24623247  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24623248 accaactatgctatctacaa 24623267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39995302 - 39995167
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39995302 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaac 39995203  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  39995202 tatgttatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 39995167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 14564796 - 14564937
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  14564796 agagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaatt 14564895  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  14564896 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattc 14564937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30141249 - 30141108
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30141249 agagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 30141150  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  30141149 accaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgattc 30141108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 50542495 - 50542354
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50542495 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50542396  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||    
T  50542395 accaactatgctatctacaataagatttgtttaaaacgattc 50542354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25734358 - 25734223
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25734358 ttatccaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacgaaagatgagttcaattaagcaattaccaac 25734259  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  25734258 tatgttatctacaataggacttgtttgaaatgattc 25734223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 39700045 - 39700186
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39700045 agagcattattcacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaagagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 39700144  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||    
T  39700145 accaattatgttatctataataagacttgtttgaaacgattc 39700186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 51371188 - 51371047
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51371188 agagcattattcaccatttgccatgtctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaatt 51371089  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  51371088 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 51371047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 25730246 - 25730381
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25730246 ttatccactatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcggatttagtgccaaagatgagttcaaggaatcaattaccaac 25730345  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25730346 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 25730381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Original strand, 31208776 - 31208885
Alignment:
Q  46 agatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31208776 agatgactaattttaagtgggtgttgggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgttt 31208875  T
Q  146 gaaacgattc 155  Q
    ||||||||||    
T  31208876 gaaacgattc 31208885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 22298517 - 22298659
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaa-agatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 112  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||||    
T  22298517 agagcattatccaccatttgctatgcctaaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagtttaaggaaacaat 22298616  T
Q  113 taccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22298617 taccaattatgctatctacaatagggcttgtttgaaacgattc 22298659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42549747 - 42549644
Alignment:
Q  30 tttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatct 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  42549747 tttgtcatgcctaaaaagatgattgattttaagtgggtgttaggagccaaatttagtaccaaagataagttcaatgaagcaattaccaactatgttatct 42549648  T
Q  130 acaa 133  Q
    ||||    
T  42549647 acaa 42549644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 56555281 - 56555200
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagat 95  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  56555281 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtcaggagccagatttggtaccaaagat 56555200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Original strand, 20534231 - 20534306
Alignment:
Q  80 atttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  20534231 atttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgattc 20534306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 14717611 - 14717746
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717611 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 14717710  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14717711 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 14717746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39002160 - 39002025
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002160 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 39002061  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39002060 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacaattc 39002025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38964254 - 38964114
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964254 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38964156  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38964155 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 38964114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 30863253 - 30863393
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30863253 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 30863352  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30863353 accaactatgctatctacattatgacttgtttgaaacgatt 30863393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3352143 - 3352002
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3352143 agagcattatccaccctttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 3352044  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3352043 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 3352002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6740096 - 6739955
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740096 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6739997  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6739996 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 6739955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 8215900 - 8216041
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8215900 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 8215999  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8216000 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 8216041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26593421 - 26593280
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26593421 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaagaagcaatt 26593322  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26593321 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 26593280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27457338 - 27457197
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27457338 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaatttaaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 27457239  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27457238 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 27457197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30297890 - 30297749
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30297890 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctaggagccagatttggtaccaaagatgagttgaaggaagcaatt 30297791  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30297790 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 30297749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 31710282 - 31710423
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710282 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31710381  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31710382 accaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgattc 31710423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 14952330 - 14952465
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952330 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 14952429  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14952430 tatgttatctacaacaagacttgtttgaaacgattc 14952465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23129059 - 23128913
Alignment:
Q  9 agcagagagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaag 108  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23129059 agcaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaag 23128960  T
Q  109 caattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23128959 caattaccaattatgctatctacgatatgacttgtttgaaacgattc 23128913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11000869 - 11000728
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000869 agagcattatccaccacttgccaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 11000770  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11000769 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11000728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11692288 - 11692147
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11692288 agagcattatccaccatttgtgatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 11692189  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11692188 accaactatgctatctgcaatatgacttgtttgaaacgattc 11692147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16096100 - 16095960
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16096100 agagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacc-aagatgagttcaaggaagcaatt 16096002  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16096001 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 16095960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33760611 - 33760470
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33760611 agagcattatccaccatttgtcatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaatt 33760512  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33760511 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 33760470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 35342180 - 35342321
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342180 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35342279  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  35342280 atcaactatgctatctacaatgagacttgtttgaaacgattc 35342321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 42993518 - 42993659
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993518 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 42993617  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  42993618 accaactatgctatctacaataggaattgtttgaaacaattc 42993659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 41282342 - 41282482
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41282342 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41282441  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  41282442 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgatt 41282482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6600271 - 6600136
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600271 ttatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 6600172  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6600171 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 6600136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 6251972 - 6252113
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6251972 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 6252071  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6252072 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 6252113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 8689572 - 8689713
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8689572 agagcattatccactatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaatcaatt 8689671  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8689672 accaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgattc 8689713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 39824556 - 39824697
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39824556 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaatt 39824655  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39824656 accaactatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattc 39824697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 40074950 - 40075091
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40074950 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 40075049  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  40075050 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacaattc 40075091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4016015 - 4015874
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016015 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaatatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 4015916  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  4015915 accaactatgttatctacaataggacttgcttgaaacgattc 4015874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19659642 - 19659501
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19659642 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaaaagcaatt 19659543  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19659542 accaactatgctatctacaataggacttatttgaaacgattc 19659501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20079399 - 20079258
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20079399 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 20079300  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  20079299 accaactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattc 20079258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43166410 - 43166269
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43166410 agagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 43166311  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  43166310 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 43166269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 20408539 - 20408674
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20408539 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagctagatttggtaccaaatatgagttcaatgaagcaattaccaac 20408638  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20408639 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 20408674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 155
Target Start/End: Original strand, 1052541 - 1052674
Alignment:
Q  22 atccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacta 121  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1052541 atccaccatttgccatgcttaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggatgagttcaaggaagcaattaccaacta 1052640  T
Q  122 tgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  1052641 tgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 1052674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30208543 - 30208402
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30208543 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtaggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 30208444  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||    
T  30208443 accaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaatgattc 30208402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28078546 - 28078405
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28078546 agagcattatctaccatttgtcatgcctaattagtttactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 28078447  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  28078446 accaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattc 28078405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 16752116 - 16752235
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752116 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggatccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16752215  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  16752216 accaactatgttatctacaa 16752235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27116234 - 27116099
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27116234 ttatccacgatttgtaatgcctaaaaagatgactaatttgaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaac 27116135  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  27116134 tatgctatctacaataggacttgtttaaaatgattc 27116099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19398328 - 19398193
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19398328 ttatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaggctagatttggtaccaaagatgagttcaaagaaacaattaccaac 19398229  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||    
T  19398228 tatgctatctacaatagaacttgtttgaaatgattc 19398193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26035487 - 26035368
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26035487 agagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtattaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 26035388  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  26035387 accaactatggtatctacaa 26035368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 116
Target Start/End: Original strand, 6331377 - 6331479
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6331377 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6331476  T
Q  114 acc 116  Q
    |||    
T  6331477 acc 6331479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 11935452 - 11935586
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11935452 ttatccactatttgttatgcctaaaaagatggctaattttaagtgagtgttaggagccacatttggttc-aaagatgagatcaaggaaacaattaccaac 11935550  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11935551 tatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11935586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 133
Target Start/End: Original strand, 444962 - 445073
Alignment:
Q  22 atccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacta 121  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  444962 atccaccatttgccacgcctaaaaagacgactgattttaagtgggttttaggagtcatatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaacta 445061  T
Q  122 tgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||    
T  445062 tgctatctacaa 445073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 8694866 - 8695007
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  8694866 agagcattatccaccatttatcatgcctaagaacatgactaattttaagtgagtattatgagccagatttggtactaaagatgagttcaatgaaataatt 8694965  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | ||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  8694966 atcaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 8695007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 27509978 - 27510112
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27509978 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtcctt-ttagtt------tttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 27510070  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27510071 accaactatgcttattacaataggacttgtttgaaacgattc 27510112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 155
Target Start/End: Original strand, 6332873 - 6332917
Alignment:
Q  111 attaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  6332873 attaccaactattctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 6332917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 3408189 - 3408330
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3408189 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 3408288  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3408289 accaactatactatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 3408330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 10256237 - 10256378
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10256237 agagcattatccaccatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 10256336  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10256337 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 10256378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 1077243 - 1077378
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1077243 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 1077342  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1077343 tatgctatctacaacatgacttatttgaaacgattc 1077378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 12626636 - 12626777
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12626636 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaatt 12626735  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12626736 accaactattctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 12626777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 6503718 - 6503858
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6503718 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgggttcaaggaagcaatt 6503817  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6503818 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgatt 6503858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1915484 - 1915343
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1915484 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 1915385  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  1915384 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaactattc 1915343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 9382519 - 9382660
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9382519 agagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 9382618  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9382619 accaactatgttatctacatcaggacttgtttgaaacgattc 9382660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 2390271 - 2390406
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390271 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagctatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 2390370  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2390371 tatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 2390406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 30379023 - 30379158
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30379023 ttatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 30379122  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30379123 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 30379158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 2707459 - 2707600
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2707459 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaatt 2707558  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2707559 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattc 2707600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8178390 - 8178249
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8178390 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 8178291  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  8178290 accaactatgctatctacaataggacatgtttgaaacgattc 8178249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 29050272 - 29050413
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050272 agagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29050371  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29050372 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 29050413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 17943042 - 17943177
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  17943042 ttatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattaccaat 17943141  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  17943142 tatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattc 17943177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26393144 - 26393009
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26393144 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 26393045  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |  | || |||||||||||||    
T  26393044 tatgctatctacaatagaagttttttgaaacgattc 26393009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17428407 - 17428272
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17428407 ttattcaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 17428308  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17428307 tatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 17428272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2598229 - 2598099
Alignment:
Q  25 caccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgc 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  2598229 caccatttgccatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaataaagcaattaccaactatga 2598130  T
Q  125 tatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2598129 tatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 2598099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3258948 - 3258807
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3258948 agagcgttatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3258850  T
Q  114 acc-aactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  3258849 accaaactatggtatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 3258807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26231073 - 26230932
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26231073 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaact 26230974  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||    
T  26230973 accaactatgttatttacattaggacttgtttgaaacgattc 26230932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 16193316 - 16193451
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193316 ttatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 16193415  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||  ||||| ||  |  ||||||||||||||||||    
T  16193416 tattttatctgcattagaacttgtttgaaacgattc 16193451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 11133873 - 11134015
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttc-aaggaagcaat 112  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11133873 agagcattatccatcatttgttatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaggaagcaat 11133972  T
Q  113 taccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  11133973 taccatctatgctatctacgataggacttgtttgaaacgattc 11134015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Original strand, 26936613 - 26936726
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26936613 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccggatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattatcaac 26936712  T
Q  120 tatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||    
T  26936713 tatgctatctacaa 26936726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 35224025 - 35223921
Alignment:
Q  29 atttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatc 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35224025 atttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatc 35223926  T
Q  129 tacaa 133  Q
    |||||    
T  35223925 tacaa 35223921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26196456 - 26196321
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc-aa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26196456 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagt-gttgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcacggaagcaattaccaaa 26196358  T
Q  119 ctatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  26196357 ctatgttatctacaataggacttggttgaaccgattc 26196321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6785224 - 6785101
Alignment:
Q  29 atttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatc 128  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||| ||||    
T  6785224 atttgacatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagca---accaattatgttatc 6785128  T
Q  129 tacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||    
T  6785127 tacattaggacttgtttgaaacgattc 6785101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10931267 - 10931148
Alignment:
Q  35 catgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||      
T  10931267 catgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatta-caactatgctatccacatt 10931169  T
Q  135 atgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  10931168 aggacttgtttgatacgattc 10931148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 155
Target Start/End: Original strand, 31375971 - 31376058
Alignment:
Q  68 gttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31375971 gttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaacaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 31376058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25820684 - 25820550
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||   | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25820684 ttatccataatttgacatgactaaaattatgactaattttaaatgggtgttatgagttagatttggtaccaaacatgagttcaatgaagcaattaccaac 25820585  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||| | | || |||||||||||||||    
T  25820584 tatgctatctacgataggaattgtttgaaacgatt 25820550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12613029 - 12612971
Alignment:
Q  97 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12613029 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 12612971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12612928 - 12612848
Alignment:
Q  75 accaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  12612928 accagatttggtagcaaagatgagttcaatgaagcaagtactaactttgctatctacaataggacttgtttgaaatgattc 12612848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16246334 - 16246193
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16246334 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16246235  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16246234 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 16246193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 27328584 - 27328725
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328584 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 27328683  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27328684 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 27328725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 921022 - 921163
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  921022 agagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 921121  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  921122 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 921163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 7378963 - 7379104
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7378963 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagaggactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7379062  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7379063 accaactattctatctacattatgacttgtttgaaacgattc 7379104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 9276574 - 9276715
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9276574 agagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 9276673  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9276674 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 9276715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28650567 - 28650426
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28650567 agagcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaatt 28650468  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28650467 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 28650426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 40854609 - 40854750
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40854609 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40854708  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40854709 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 40854750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 772116 - 771981
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  772116 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 772017  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  772016 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 771981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33865402 - 33865267
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33865402 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 33865303  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33865302 tatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 33865267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 2456010 - 2456151
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2456010 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2456109  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  2456110 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 2456151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11949567 - 11949426
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11949567 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 11949468  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11949467 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11949426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 34253142 - 34253283
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34253142 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 34253241  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34253242 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 34253283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41500643 - 41500502
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41500643 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41500544  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  41500543 accaactatgctatgtacaataggacttgtttgaaacgattc 41500502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7297369 - 7297234
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  7297369 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaagaagacaattaccaac 7297270  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7297269 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 7297234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 37838303 - 37838438
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37838303 ttatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaac 37838402  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37838403 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 37838438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 17134229 - 17134369
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17134229 agagcattatccatcatttgccattcctaaaaagatgactacttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 17134328  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17134329 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 17134369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 19180428 - 19180562
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19180428 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag-agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattactaac 19180526  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19180527 tatactatctacaataagacttgtttgaaacgattc 19180562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1106700 - 1106559
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1106700 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1106601  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||    
T  1106600 accaattatgctatctacaataggacttatttgaaatgattc 1106559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2094551 - 2094410
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2094551 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccaaatttagtatcaaagattagttcaaggaagcaatt 2094452  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2094451 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 2094410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 8899682 - 8899822
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8899682 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcatggaagcaatt 8899781  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8899782 accaactatgctatctacaatatgacttg-ttgaaacgattc 8899822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12759890 - 12759750
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12759890 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag-aggcaaatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaatt 12759792  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12759791 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 12759750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33107098 - 33106969
Alignment:
Q  26 accatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgct 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33107098 accatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgat 33106999  T
Q  126 atctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  33106998 atctacaataggactcgtttgaaacgattc 33106969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36444369 - 36444229
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36444369 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtaggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36444270  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  36444269 accaactatgctatctactataggacttgtttgaaacgatt 36444229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 38751048 - 38751188
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38751048 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtggatgttaggagccacatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38751147  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    ||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  38751148 accaactatactatctacattaggacttgtttgaaacgatt 38751188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 2056932 - 2057067
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2056932 ttatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctggatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 2057031  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2057032 tatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 2057067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2315110 - 2314975
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2315110 ttatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaac 2315011  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  2315010 tatgctatctacaataagacttgtttgaaacaattc 2314975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17484685 - 17484550
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17484685 ttatccaccattttccatgcttaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaac 17484586  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17484585 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 17484550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3430765 - 3430631
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3430765 agagcattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 3430666  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaa 148  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3430665 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaa 3430631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43249553 - 43249412
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  43249553 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgtattcaaggaaacaatt 43249454  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||||| ||||||||||    
T  43249453 accaactatgctatcatcaataggacttgttcgaaacgattc 43249412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8396692 - 8396573
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8396692 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggttttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 8396593  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  8396592 atcaactatgctatctacaa 8396573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25087931 - 25087796
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25087931 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccagagatgagttcaaggaagcaattatcaac 25087832  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  25087831 tatgttatatacaataagacttgtttgaaacaattc 25087796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 29737748 - 29737889
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29737748 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatcttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29737847  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||    
T  29737848 atcaactatgctatcgacaataggacttgtttgaaacaattc 29737889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 155
Target Start/End: Original strand, 42629970 - 42630103
Alignment:
Q  22 atccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacta 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  42629970 atccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattatcaatta 42630069  T
Q  122 tgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  42630070 tgctatctatgataggacttgtttgaaacgattc 42630103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Original strand, 36211046 - 36211182
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36211046 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 36211145  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaac 150  Q
    || ||||||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  36211146 acaaactatgttatctagaataggacttgtttgaaac 36211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37732334 - 37732193
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37732334 agagcattatccaccatttgtcatacataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaaaatgagttcaagaaagcaatt 37732235  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  37732234 accaactatgttatttacaataagacttgtttgaaacgattc 37732193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 155
Target Start/End: Original strand, 45124120 - 45124260
Alignment:
Q  15 gagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  45124120 gagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaagagtctgatttgataccaaagatgagtttaaggaaacaatta 45124219  T
Q  115 ccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  45124220 ccaactatgctatctacaataagatttgtttgaaacgattc 45124260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 130
Target Start/End: Original strand, 37654122 - 37654224
Alignment:
Q  28 catttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37654122 catttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttat 37654221  T
Q  128 cta 130  Q
    |||    
T  37654222 cta 37654224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 155
Target Start/End: Original strand, 14630663 - 14630755
Alignment:
Q  63 tgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14630663 tgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 14630755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19916128 - 19916009
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19916128 agagcattatccacaatttgtcaagcctaaaaagatgattgatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaatt 19916029  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19916028 accaactatgctatctacaa 19916009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 41178160 - 41178059
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41178160 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41178061  T
Q  114 ac 115  Q
    ||    
T  41178060 ac 41178059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 155
Target Start/End: Original strand, 9331757 - 9331897
Alignment:
Q  15 gagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||  |||||||||||    
T  9331757 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaatcttaggtgggtgttaggagccaaatttggtacctaagataatatctgggaagcaatta 9331856  T
Q  115 ccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9331857 ccaacaatactatctacaataggacttgtttgaaacgattc 9331897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23671901 - 23671811
Alignment:
Q  65 ggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||||||||||    
T  23671901 ggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaccatgttatctataataagacttgtttgaaacgattc 23671811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 23673014 - 23672958
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 70  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673014 agagcattttccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 23672958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 114 - 255
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 213  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  214 accgactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattc 255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 218885 - 219027
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggg-tgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  218885 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 218984  T
Q  113 taccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  218985 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 219027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 5192 - 5326
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5192 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaat 5290  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5291 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 5326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5162 - 5027
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5162 ttatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagagggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaattaccaac 5063  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5062 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 5027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 47968 - 48103
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47968 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaaggtgagttcaaggaagcaattaccaac 48067  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||  || |||||   ||||||||| |||||||||    
T  48068 tatgtgatatacaatcggacttgtttaaaacgattc 48103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 252579 - 252438
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  252579 agagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaatt 252480  T
Q  114 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  252479 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattc 252438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2114 - 1995
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2114 agagcattatccaccatttgtcatgcctaataagatgactgattttaagtaggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2015  T
Q  114 accaactatgctatctacaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2014 accaactatgctatctacaa 1995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 13101 - 13236
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  13101 ttatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatcaat 13200  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13201 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 13236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 59743 - 59608
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  59743 ttatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatcaat 59644  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  59643 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 59608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 11364 - 11498
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 119  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11364 ttatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccatagataagtttaaggaagcaattaccaac 11463  T
Q  120 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 154  Q
    ||||||| |||||| | | ||| ||| ||||||||    
T  11464 tatgctacctacaataggtcttatttaaaacgatt 11498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Original strand, 605 - 680
Alignment:
Q  80 atttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||    
T  605 atttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgattc 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1988 - 1913
Alignment:
Q  80 atttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||    
T  1988 atttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgattc 1913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3446 - 3371
Alignment:
Q  80 atttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||||||||    
T  3446 atttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcaacattaggacttatttgaaacgattc 3371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Original strand, 1883 - 1958
Alignment:
Q  80 atttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  1883 atttggtaccaaagatgaggtcaaggaagcaattatcaactatgctatcaacattaggacttgtttgaaacgattc 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 342 - 289
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggt 67  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  342 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggt 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Original strand, 19781 - 19831
Alignment:
Q  14 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 64  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19781 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 19831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University