View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13985_high_33 (Length: 229)

Name: NF13985_high_33
Description: NF13985
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13985_high_33
NF13985_high_33
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-197)||(7880-8075)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (1-147)||(10555205-10555351)
chr8 (1-147)||(1150108-1150254)
chr8 (1-147)||(43643598-43643744)
chr8 (1-128)||(1149635-1149762)
chr8 (3-147)||(37970524-37970668)
chr8 (3-147)||(23854436-23854580)
chr8 (1-147)||(1204968-1205114)
chr8 (2-147)||(31933890-31934035)
chr8 (8-151)||(16446885-16447028)
chr8 (3-147)||(27082843-27082987)
chr8 (3-147)||(36694971-36695115)
chr8 (1-147)||(12876150-12876296)
chr8 (3-139)||(6098523-6098659)
chr8 (1-147)||(30654586-30654732)
chr8 (8-141)||(16222910-16223043)
chr8 (8-198)||(34894958-34895147)
chr8 (3-147)||(465883-466027)
chr8 (3-147)||(38644019-38644163)
chr8 (3-141)||(9864195-9864333)
chr8 (4-106)||(35459717-35459819)
chr8 (18-147)||(13307664-13307793)
chr8 (3-128)||(41362575-41362700)
chr8 (1-114)||(7890960-7891073)
chr8 (3-147)||(5299951-5300095)
chr8 (1-147)||(8803820-8803959)
chr8 (11-147)||(11727065-11727201)
chr8 (3-147)||(34952036-34952180)
chr8 (3-116)||(39099124-39099237)
chr8 (3-109)||(44869576-44869683)
chr8 (3-147)||(40862460-40862604)
chr8 (3-72)||(33906328-33906397)
chr8 (3-112)||(1953994-1954104)
chr8 (3-71)||(41910993-41911061)
chr8 (11-131)||(43025759-43025879)
chr8 (8-63)||(4132695-4132750)
chr8 (3-71)||(7998411-7998480)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (3-147)||(7334811-7334955)
chr7 (3-135)||(18797356-18797488)
chr7 (1-193)||(30055498-30055690)
chr7 (1-147)||(38258562-38258708)
chr7 (3-147)||(27283761-27283905)
chr7 (3-147)||(31579064-31579213)
chr7 (3-147)||(10481621-10481766)
chr7 (1-147)||(37109889-37110037)
chr7 (3-147)||(24211758-24211902)
chr7 (1-147)||(17842582-17842730)
chr7 (3-139)||(11071231-11071367)
chr7 (1-147)||(32821051-32821197)
chr7 (3-147)||(21991653-21991797)
chr7 (3-139)||(37347047-37347183)
chr7 (19-147)||(12390646-12390774)
chr7 (3-147)||(22687256-22687400)
chr7 (3-131)||(29173573-29173701)
chr7 (3-139)||(38053511-38053639)
chr7 (3-141)||(9355826-9355964)
chr7 (3-147)||(5657481-5657625)
chr7 (19-147)||(23111207-23111335)
chr7 (11-147)||(27421388-27421523)
chr7 (3-139)||(31520724-31520859)
chr7 (3-147)||(44413379-44413523)
chr7 (3-147)||(33688262-33688406)
chr7 (3-131)||(4582952-4583080)
chr7 (3-139)||(41765078-41765214)
chr7 (3-147)||(43686058-43686201)
chr7 (3-147)||(6546536-6546680)
chr7 (11-147)||(8861302-8861438)
chr7 (3-147)||(15612759-15612902)
chr7 (3-147)||(26980340-26980484)
chr7 (11-131)||(32432485-32432605)
chr7 (3-141)||(48928297-48928434)
chr7 (3-147)||(12165769-12165913)
chr7 (3-137)||(10359214-10359348)
chr7 (18-141)||(48928579-48928701)
chr7 (11-147)||(25691552-25691689)
chr7 (59-148)||(34362205-34362293)
chr7 (3-99)||(43925167-43925262)
chr7 (3-141)||(32593189-32593326)
chr7 (3-71)||(15672762-15672830)
chr7 (3-71)||(37704250-37704318)
chr7 (43-141)||(26524367-26524465)
chr7 (3-89)||(44598741-44598827)
chr7 (38-141)||(35353131-35353235)
chr7 (50-96)||(34362149-34362195)
chr7 (18-56)||(37703513-37703551)
chr7 (59-100)||(46481177-46481218)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (3-147)||(10922765-10922909)
chr1 (1-147)||(32267072-32267218)
chr1 (2-147)||(28564774-28564919)
chr1 (1-141)||(15382977-15383117)
chr1 (2-193)||(37618885-37619079)
chr1 (1-147)||(15752067-15752213)
chr1 (5-147)||(18422689-18422831)
chr1 (2-191)||(30254419-30254606)
chr1 (3-149)||(37451322-37451467)
chr1 (1-147)||(8222169-8222312)
chr1 (3-147)||(51128897-51129041)
chr1 (8-147)||(9903053-9903192)
chr1 (1-147)||(19899761-19899907)
chr1 (1-141)||(30326944-30327084)
chr1 (8-147)||(2959786-2959925)
chr1 (4-147)||(28769691-28769833)
chr1 (3-138)||(42721086-42721221)
chr1 (3-147)||(32216093-32216237)
chr1 (3-147)||(48620675-48620819)
chr1 (8-147)||(46931449-46931588)
chr1 (1-147)||(27763303-27763448)
chr1 (2-147)||(23999385-23999530)
chr1 (3-147)||(27563899-27564043)
chr1 (8-131)||(47279243-47279366)
chr1 (18-147)||(38823252-38823381)
chr1 (21-149)||(3309184-3309311)
chr1 (3-135)||(10182002-10182134)
chr1 (3-147)||(11742345-11742488)
chr1 (3-114)||(7079057-7079168)
chr1 (8-147)||(34012376-34012515)
chr1 (3-147)||(16415683-16415828)
chr1 (3-111)||(27227479-27227587)
chr1 (3-139)||(41926209-41926345)
chr1 (3-141)||(4330324-4330463)
chr1 (3-141)||(14758085-14758223)
chr1 (3-141)||(31621547-31621685)
chr1 (3-107)||(25160710-25160814)
chr1 (8-128)||(27267199-27267318)
chr1 (3-147)||(27532975-27533118)
chr1 (3-147)||(238507-238650)
chr1 (3-147)||(3534970-3535114)
chr1 (3-141)||(40884857-40884995)
chr1 (3-147)||(1547325-1547461)
chr1 (3-141)||(15168133-15168278)
chr1 (19-128)||(47682504-47682614)
chr1 (43-128)||(21289729-21289814)
chr1 (3-147)||(39393421-39393566)
chr1 (3-138)||(33725594-33725729)
chr1 (90-147)||(30254896-30254952)
chr1 (8-90)||(22170806-22170888)
chr1 (59-103)||(1359933-1359977)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (3-139)||(24886154-24886290)
chr5 (1-193)||(22974069-22974260)
chr5 (3-200)||(14919517-14919714)
chr5 (1-147)||(31705599-31705744)
chr5 (8-147)||(38528231-38528369)
chr5 (3-149)||(43308641-43308786)
chr5 (1-147)||(22255223-22255370)
chr5 (1-147)||(27318474-27318620)
chr5 (3-147)||(30969313-30969457)
chr5 (11-147)||(699192-699328)
chr5 (3-147)||(7693272-7693416)
chr5 (3-147)||(22980835-22980979)
chr5 (3-139)||(39572869-39573005)
chr5 (4-135)||(7208854-7208984)
chr5 (3-139)||(12910400-12910541)
chr5 (3-147)||(1429134-1429278)
chr5 (3-147)||(9200275-9200419)
chr5 (3-147)||(17158020-17158163)
chr5 (3-147)||(31786635-31786779)
chr5 (3-147)||(32563191-32563335)
chr5 (8-147)||(23116216-23116355)
chr5 (3-139)||(5112302-5112438)
chr5 (3-147)||(26268116-26268260)
chr5 (3-147)||(36866804-36866948)
chr5 (8-147)||(35511471-35511610)
chr5 (1-135)||(5829955-5830080)
chr5 (3-141)||(14409316-14409453)
chr5 (1-127)||(35504427-35504553)
chr5 (3-147)||(27330348-27330490)
chr5 (8-141)||(33908281-33908414)
chr5 (3-147)||(19119901-19120045)
chr5 (11-147)||(36860465-36860601)
chr5 (3-141)||(5837603-5837741)
chr5 (3-128)||(23954778-23954904)
chr5 (3-131)||(40133443-40133571)
chr5 (8-132)||(6824473-6824599)
chr5 (3-149)||(25500915-25501061)
chr5 (1-139)||(35826471-35826608)
chr5 (3-147)||(8741875-8742020)
chr5 (3-128)||(21088755-21088880)
chr5 (10-110)||(15992536-15992636)
chr5 (14-148)||(42342774-42342906)
chr5 (19-147)||(15724532-15724658)
chr5 (19-147)||(28416532-28416660)
chr5 (8-147)||(8466787-8466925)
chr5 (11-131)||(22019690-22019810)
chr5 (3-141)||(8437014-8437151)
chr5 (34-135)||(25668703-25668804)
chr5 (105-147)||(22255617-22255659)
chr5 (52-137)||(11898054-11898139)
chr5 (94-147)||(13956425-13956478)
chr5 (3-71)||(35934013-35934082)
chr5 (8-67)||(13956356-13956415)
chr5 (104-147)||(26317774-26317817)
chr5 (104-146)||(5748478-5748520)
chr5 (8-41)||(2888439-2888472)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (3-147)||(43648262-43648406)
chr2 (1-147)||(37905750-37905896)
chr2 (4-147)||(19289341-19289484)
chr2 (1-147)||(33551001-33551147)
chr2 (3-139)||(3176989-3177125)
chr2 (8-141)||(4763679-4763812)
chr2 (3-147)||(33660385-33660529)
chr2 (1-147)||(17071752-17071898)
chr2 (8-141)||(11366403-11366536)
chr2 (3-147)||(19424645-19424789)
chr2 (3-147)||(27349956-27350099)
chr2 (3-139)||(29242155-29242291)
chr2 (8-147)||(26357619-26357758)
chr2 (3-147)||(4478411-4478556)
chr2 (3-135)||(33902120-33902252)
chr2 (1-139)||(17054111-17054249)
chr2 (3-149)||(4264094-4264240)
chr2 (3-131)||(4166980-4167108)
chr2 (3-147)||(33709249-33709393)
chr2 (3-139)||(36642036-36642174)
chr2 (3-118)||(39167380-39167495)
chr2 (3-141)||(31570751-31570889)
chr2 (1-147)||(2325393-2325531)
chr2 (3-147)||(43770856-43771000)
chr2 (8-139)||(41463872-41464003)
chr2 (18-147)||(13711506-13711635)
chr2 (3-118)||(7006938-7007053)
chr2 (8-90)||(41960939-41961021)
chr2 (3-131)||(44913719-44913849)
chr2 (3-92)||(45327817-45327906)
chr2 (3-147)||(19313894-19314037)
chr2 (3-118)||(5881610-5881724)
chr2 (77-140)||(35958958-35959021)
chr2 (1-70)||(31861971-31862040)
chr2 (9-91)||(18494303-18494385)
chr2 (3-147)||(44285991-44286135)
chr2 (44-89)||(41051263-41051308)
chr2 (19-70)||(19501773-19501823)
chr2 (1-63)||(35959023-35959084)
chr2 (3-88)||(41465602-41465687)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (1-147)||(25184155-25184301)
chr4 (1-141)||(879571-879711)
chr4 (5-190)||(19089480-19089664)
chr4 (1-135)||(37663764-37663898)
chr4 (1-141)||(19440671-19440811)
chr4 (1-141)||(50697290-50697429)
chr4 (3-147)||(55477916-55478064)
chr4 (3-149)||(25701082-25701228)
chr4 (2-139)||(42199779-42199916)
chr4 (8-118)||(9139316-9139426)
chr4 (3-149)||(23761112-23761257)
chr4 (1-147)||(32912603-32912749)
chr4 (3-147)||(17173332-17173476)
chr4 (3-139)||(36493713-36493849)
chr4 (1-140)||(6864084-6864223)
chr4 (8-147)||(34948127-34948266)
chr4 (3-128)||(4934227-4934353)
chr4 (1-147)||(34361515-34361660)
chr4 (1-147)||(35021058-35021204)
chr4 (3-147)||(17167755-17167899)
chr4 (3-147)||(29584225-29584367)
chr4 (18-135)||(50764784-50764901)
chr4 (3-147)||(27396658-27396802)
chr4 (3-138)||(5047990-5048125)
chr4 (3-141)||(28003011-28003149)
chr4 (3-141)||(38011902-38012040)
chr4 (8-139)||(46888187-46888318)
chr4 (3-140)||(37775718-37775853)
chr4 (19-147)||(49376009-49376137)
chr4 (3-147)||(54499262-54499408)
chr4 (3-117)||(32592165-32592279)
chr4 (3-113)||(33341475-33341584)
chr4 (3-117)||(55241130-55241243)
chr4 (61-191)||(37287732-37287862)
chr4 (3-147)||(7703559-7703695)
chr4 (1-147)||(3042653-3042807)
chr4 (18-147)||(4598035-4598163)
chr4 (3-132)||(33816558-33816687)
chr4 (11-147)||(30002665-30002793)
chr4 (3-147)||(47253791-47253926)
chr4 (84-147)||(4205158-4205221)
chr4 (3-137)||(32579496-32579632)
chr4 (3-73)||(1815417-1815487)
chr4 (59-141)||(35025669-35025751)
chr4 (77-147)||(39397960-39398030)
chr4 (97-147)||(4396368-4396418)
chr4 (104-147)||(53124329-53124372)
chr4 (3-69)||(17272084-17272150)
chr4 (2-41)||(46884132-46884171)
chr4 (77-147)||(23518402-23518472)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (1-151)||(3655199-3655349)
chr3 (1-141)||(42506072-42506212)
chr3 (4-147)||(48354974-48355117)
chr3 (3-139)||(4761648-4761784)
chr3 (8-139)||(20373300-20373431)
chr3 (1-147)||(40552256-40552402)
chr3 (3-147)||(51212980-51213124)
chr3 (1-147)||(26941257-26941403)
chr3 (11-147)||(37203100-37203236)
chr3 (2-141)||(21009800-21009939)
chr3 (2-147)||(47481555-47481700)
chr3 (8-151)||(39282682-39282824)
chr3 (11-147)||(37157741-37157876)
chr3 (3-141)||(34132974-34133112)
chr3 (21-147)||(35844359-35844485)
chr3 (3-149)||(54828700-54828845)
chr3 (3-139)||(11466865-11467001)
chr3 (3-147)||(46297761-46297905)
chr3 (8-147)||(44186505-44186644)
chr3 (3-141)||(43975887-43976025)
chr3 (3-97)||(46994660-46994754)
chr3 (11-147)||(11357371-11357508)
chr3 (18-147)||(29099388-29099517)
chr3 (3-139)||(52040921-52041058)
chr3 (2-147)||(54505841-54505985)
chr3 (3-147)||(2007966-2008110)
chr3 (3-141)||(22451007-22451145)
chr3 (3-141)||(27480378-27480516)
chr3 (3-128)||(24488961-24489086)
chr3 (18-107)||(53176127-53176216)
chr3 (3-147)||(4015493-4015637)
chr3 (3-131)||(21193655-21193783)
chr3 (11-141)||(7327489-7327619)
chr3 (3-141)||(33378784-33378922)
chr3 (3-147)||(22446063-22446207)
chr3 (18-147)||(40936024-40936153)
chr3 (11-147)||(3362286-3362424)
chr3 (8-135)||(24708119-24708246)
chr3 (11-141)||(53229159-53229290)
chr3 (3-150)||(32373502-32373647)
chr3 (8-148)||(38591726-38591870)
chr3 (3-118)||(43348320-43348434)
chr3 (3-147)||(45174536-45174683)
chr3 (3-147)||(44891539-44891674)
chr3 (3-118)||(14586669-14586784)
chr3 (3-86)||(29163912-29163995)
chr3 (3-68)||(33698265-33698330)
chr3 (8-66)||(22622722-22622780)
chr3 (8-139)||(25579780-25579911)
chr3 (104-146)||(41585407-41585449)
chr3 (105-147)||(33698221-33698263)
chr3 (8-73)||(36012244-36012310)
chr3 (3-71)||(11835626-11835695)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (1-147)||(1945876-1946022)
chr6 (3-147)||(4318820-4318965)
chr6 (2-147)||(5627433-5627578)
chr6 (3-147)||(7055213-7055357)
chr6 (1-135)||(6091179-6091313)
chr6 (3-141)||(7235033-7235170)
chr6 (8-147)||(33893006-33893144)
chr6 (8-131)||(3879942-3880065)
chr6 (8-147)||(8513275-8513415)
chr6 (11-135)||(15491669-15491793)
chr6 (13-147)||(29182205-29182339)
chr6 (13-141)||(33618882-33619010)
chr6 (18-128)||(21017125-21017235)
chr6 (8-147)||(6088950-6089090)
chr6 (3-147)||(30353356-30353500)
chr6 (3-89)||(20768184-20768268)
chr6 (58-147)||(18498475-18498565)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (1-135)||(408426-408559)
scaffold0002 (18-128)||(195-305)
scaffold0002 (19-147)||(94398-94526)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (2-147)||(43999-44144)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (2-147)||(146014-146159)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (2-147)||(154643-154788)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (8-141)||(267331-267465)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (3-141)||(11955-12095)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (98-147)||(42390-42439)


Alignment Details
Target: scaffold0291 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8075 - 7880
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8075 cgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaa 7976  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcactatagaattttcctttaaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||        |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7975 acagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaag-tcattcttataacttcaccatagaatttttctttaaaa 7880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 10555205 - 10555351
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10555205 cgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaa 10555304  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10555305 acagtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 10555351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 1150108 - 1150254
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  1150108 cgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcgttgtacaa 1150207  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1150208 acagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaactt 1150254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 43643598 - 43643744
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  43643598 cgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaa 43643697  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43643698 acagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 43643744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 1149635 - 1149762
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  1149635 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaa 1149734  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacattttt 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1149735 acagtgggttgttactcattacattttt 1149762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 37970524 - 37970668
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  37970524 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaac 37970623  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37970624 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 37970668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 23854436 - 23854580
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23854436 cttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaac 23854535  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23854536 agttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 23854580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1205114 - 1204968
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1205114 cgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaa 1205015  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1205014 acagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaactt 1204968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 31933890 - 31934035
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||    
T  31933890 gcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaa 31933989  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  31933990 gagtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaactt 31934035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Original strand, 16446885 - 16447028
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | | | ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16446885 aacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtgg 16446984  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatc 151  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16446985 ggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatc 16447028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 27082843 - 27082987
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| || || ||||||    
T  27082843 cttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaac 27082942  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27082943 agtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaactt 27082987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 36694971 - 36695115
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  36694971 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 36695070  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36695071 agtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaactt 36695115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12876296 - 12876150
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12876296 cgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaa 12876197  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||    
T  12876196 acagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaactt 12876150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 6098523 - 6098659
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||    
T  6098523 cttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 6098622  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  6098623 agtggggtgttactcactatatttttgatgctatagt 6098659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 30654586 - 30654732
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||||  ||||    
T  30654586 cgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaa 30654685  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30654686 acagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 30654732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16223043 - 16222910
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16223043 aacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtgg 16222944  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||   |||||| || |||||| ||||||||||||    
T  16222943 ggaactactcactatattttttatgttatagtgt 16222910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34895147 - 34894958
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  34895147 aacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtgg 34895048  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcactatagaattttcctttaaaaa 198  Q
     |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |||        ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34895047 agtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaag-tcattttcatgacttcaccatagaattttcctttaaaaa 34894958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 466027 - 465883
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | | |||| |||||||| || |||||||||    
T  466027 cttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaac 465928  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  465927 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaactt 465883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38644163 - 38644019
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||| || |  ||||||    
T  38644163 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaac 38644064  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38644063 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 38644019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9864333 - 9864195
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9864333 cttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 9864234  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  9864233 agtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgt 9864195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 35459717 - 35459819
Alignment:
Q  4 ttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaaca 103  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  35459717 ttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaatca 35459816  T
Q  104 gtg 106  Q
    |||    
T  35459817 gtg 35459819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13307793 - 13307664
Alignment:
Q  18 gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 117  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  13307793 gataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactc 13307694  T
Q  118 attacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13307693 acaacacttttgatgttatagtgttaactt 13307664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41362700 - 41362575
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||     
T  41362700 cttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcactatacaaat 41362601  T
Q  103 agtggggtgttactcattacattttt 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  41362600 agtggggtgttactcactacattttt 41362575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 7890960 - 7891073
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  7890960 cgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaa 7891059  T
Q  101 acagtggggtgtta 114  Q
    || |||| ||||||    
T  7891060 acggtggagtgtta 7891073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 5299951 - 5300095
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| || |||||||||    
T  5299951 cttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaac 5300050  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| | ||| |||| |  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  5300051 agtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaactt 5300095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 8803820 - 8803959
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||   |||       ||||||||||||||| |||||    
T  8803820 cgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgataggctga-------acttttgatgtcattctacaa 8803912  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8803913 atagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 8803959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11727201 - 11727065
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  11727201 aaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggt 11727102  T
Q  111 gttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11727101 gttacttacaacacttttgatgttatagtgttaactt 11727065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 34952036 - 34952180
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||   | | |||||||||||||||| |||||||||    
T  34952036 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 34952135  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  34952136 agtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaactt 34952180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Original strand, 39099124 - 39099237
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||     
T  39099124 cttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaag 39099223  T
Q  103 agtggggtgttact 116  Q
    ||||||||||||||    
T  39099224 agtggggtgttact 39099237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 44869683 - 44869576
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44869683 cttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaa 44869584  T
Q  102 cagtgggg 109  Q
    ||||||||    
T  44869583 cagtgggg 44869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40862604 - 40862460
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| | |||  | |||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  40862604 cttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatgagact-gaacttttgatgccattgtacaaac 40862506  T
Q  103 agtggggtgttactcattaca-tttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  40862505 agtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaactt 40862460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 33906397 - 33906328
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatga 72  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33906397 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 33906328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Original strand, 1953994 - 1954104
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgat-gatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||| || ||| ||||    
T  1953994 cttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatgccactgtccaaa 1954093  T
Q  102 cagtggggtgt 112  Q
     ||| ||||||    
T  1954094 tagtagggtgt 1954104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 41910993 - 41911061
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg 71  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910993 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 41911061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 43025879 - 43025759
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||    
T  43025879 aaggtaggataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggt 43025780  T
Q  111 gttactcattacatttttgat 131  Q
     ||| |||  ||| |||||||    
T  43025779 attaatcacaacacttttgat 43025759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Original strand, 4132695 - 4132750
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatg 63  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  4132695 aacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 7998480 - 7998411
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg 71  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  7998480 cttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatg 7998411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7334955 - 7334811
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7334955 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaac 7334856  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  7334855 agtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaactt 7334811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18797488 - 18797356
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797488 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaac 18797389  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgtta 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18797388 agtggggtgttactcattacattttttatgtta 18797356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30055690 - 30055498
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30055690 cgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaa 30055591  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcactatagaattttccttt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||        |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30055590 acagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttccttt 30055498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38258708 - 38258562
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38258708 cgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaa 38258609  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38258608 acggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 38258562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27283905 - 27283761
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  27283905 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaac 27283806  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27283805 ggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 27283761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 31579064 - 31579213
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgta----- 97  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||         
T  31579064 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaat 31579163  T
Q  98 caaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31579164 taaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 31579213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10481766 - 10481621
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  10481766 cttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaac 10481667  T
Q  103 agt-ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  10481666 agtgggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaactt 10481621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37110037 - 37109889
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaa--gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtac 98  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  37110037 cgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtac 37109938  T
Q  99 aaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37109937 aaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 37109889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24211902 - 24211758
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| || ||||    
T  24211902 cttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaac 24211803  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24211802 agtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 24211758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 17842582 - 17842730
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaa--gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtac 98  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |  | ||| ||||||||||||||||||    
T  17842582 cgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtac 17842681  T
Q  99 aaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17842682 aaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 17842730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11071367 - 11071231
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11071367 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaac 11071268  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  11071267 agtggagtgttactcgctatatttttgatgatatagt 11071231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 32821051 - 32821197
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  32821051 cgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaa 32821150  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32821151 acagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaactt 32821197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21991797 - 21991653
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| || |||||||||    
T  21991797 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaac 21991698  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21991697 agtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaactt 21991653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37347183 - 37347047
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  37347183 cttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 37347084  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37347083 aatggggtgttactcattatatttttgatggtatagt 37347047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 12390646 - 12390774
Alignment:
Q  19 ataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | |   |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  12390646 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactca 12390745  T
Q  119 ttacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12390746 ttacacttttgatgttatagtgttaactt 12390774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22687400 - 22687256
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||  || || ||||||    
T  22687400 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaac 22687301  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22687300 agtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaactt 22687256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 29173701 - 29173573
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29173701 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 29173602  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgat 131  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  29173601 agtggagtgttactcacaacacttttgat 29173573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38053639 - 38053511
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38053639 cttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaac 38053548  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38053547 agtagggttttactcattacattttttatgttatagt 38053511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 9355826 - 9355964
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  9355826 cttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaac 9355925  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  9355926 agtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgt 9355964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 5657481 - 5657625
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| || |||||||||    
T  5657481 cttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaac 5657580  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5657581 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 5657625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23111335 - 23111207
Alignment:
Q  19 ataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23111335 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactca 23111236  T
Q  119 ttacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
      | ||||||||||||||||||| |||||    
T  23111235 caatatttttgatgttatagtgttaactt 23111207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Original strand, 27421388 - 27421523
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27421388 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagt 27421486  T
Q  111 gttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27421487 gttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 27421523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 31520724 - 31520859
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||    
T  31520724 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 31520822  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    | ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  31520823 aatggagtgttactcactatatttttgatggtatagt 31520859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 44413379 - 44413523
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||||    
T  44413379 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagaccgaacttttgatttcagtgtacaaac 44413478  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  44413479 attggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaactt 44413523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 33688262 - 33688406
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactat-gagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || || |||||    
T  33688262 cttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagag-actgaacttttgatgccactggacaaa 33688360  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33688361 cagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt 33688406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4583080 - 4582952
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||     
T  4583080 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaat 4582981  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgat 131  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4582980 agtggggtgttactcacaacatttttgat 4582952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 41765078 - 41765214
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| ||  ||||||||    
T  41765078 cttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaac 41765177  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  41765178 agtggggtgctactcactacacttttgatgctatagt 41765214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43686201 - 43686058
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||  | | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  43686201 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagggactgaacttttgatgccattgtacaaac 43686102  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43686101 agt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaactt 43686058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6546680 - 6546536
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||   | | |||||||||||| | ||||||||     
T  6546680 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaat 6546581  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  6546580 agtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaactt 6546536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8861438 - 8861302
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| | |||||||||||||| | | | ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8861438 aaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 8861339  T
Q  111 gttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8861338 gttattcataacacttttgatgctatagtgttaactt 8861302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 15612759 - 15612902
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||  | | ||||||||||||| || | |||||||    
T  15612759 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaac 15612858  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||    
T  15612859 actggggtgttactcataaca-ctttgatgttatagtgttaactt 15612902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26980484 - 26980340
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||| || |||||||||    
T  26980484 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 26980385  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     |||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  26980384 cgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaactt 26980340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32432605 - 32432485
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32432605 aaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggt 32432506  T
Q  111 gttactcattacatttttgat 131  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  32432505 gttactcacaacatttttgat 32432485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 48928297 - 48928434
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||| ||  |||||||     
T  48928297 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaat 48928395  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48928396 agtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgt 48928434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12165913 - 12165769
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatac-tatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || | || || ||||||||||| || ||||||||    
T  12165913 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggactt-aacttttgatgccactgtacaaa 12165815  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  12165814 cagtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgttaactt 12165769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Original strand, 10359214 - 10359348
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagatt-aagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||    
T  10359214 cttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatcag-actgaacttttgatgtcactgtataaa 10359312  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttata 137  Q
     ||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  10359313 tagtaggatgttactcactacacttttgatgctata 10359348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Original strand, 48928579 - 48928701
Alignment:
Q  18 gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  48928579 gataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatgggact-gaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactc 48928677  T
Q  118 attacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    | |||| |||||||||||||||||    
T  48928678 actacacttttgatgttatagtgt 48928701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Original strand, 25691552 - 25691689
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||| || ||||||||||||| |||    
T  25691552 aaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaacagtgaggt 25691651  T
Q  111 -gttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
      |||||||  | | ||||||||||||||||| |||||    
T  25691652 aattactcacaatacttttgatgttatagtgttaactt 25691689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 148
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362293
Alignment:
Q  59 tgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttt 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttt 34362293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43925262 - 43925167
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtaca 99  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  43925262 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgtaca 43925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 32593189 - 32593326
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||  || ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||   || ||||    
T  32593189 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtgag-actgaacttttgataccaccatataaac 32593287  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  32593288 agtggggtgctactcactacacttttaatgctatagtgt 32593326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 15672762 - 15672830
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg 71  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15672762 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 37704318 - 37704250
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg 71  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37704318 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatg 37704250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 141
Target Start/End: Original strand, 26524367 - 26524465
Alignment:
Q  43 tgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| | || |||||||||| || || ||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  26524367 tgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagtgt 26524465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44598827 - 44598741
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatg 89  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  44598827 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatg 44598741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35353235 - 35353131
Alignment:
Q  38 agtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattg-aacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttat 136  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |  | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||    
T  35353235 agtcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgctat 35353136  T
Q  137 agtgt 141  Q
    |||||    
T  35353135 agtgt 35353131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 96
Target Start/End: Original strand, 34362149 - 34362195
Alignment:
Q  50 ctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgt 96  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  34362149 ctgatgaattgatgatactataagaactgaacttttgatgccattgt 34362195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 56
Target Start/End: Original strand, 37703513 - 37703551
Alignment:
Q  18 gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatga 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37703513 gataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 46481177 - 46481218
Alignment:
Q  59 tgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  46481177 tgatgatactatggggattgaatttttgatgtcattgtacaa 46481218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10922909 - 10922765
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10922909 cttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaac 10922810  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10922809 agtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 10922765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32267218 - 32267072
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  32267218 cgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaa 32267119  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32267118 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaactt 32267072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 28564774 - 28564919
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28564774 gcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaa 28564873  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28564874 cagtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 28564919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15383117 - 15382977
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||    
T  15383117 cgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaa 15383018  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383017 acggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgt 15382977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 37618885 - 37619079
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatg--atactatgagaattgaacttttgatgtcattgtaca 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37618885 gcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttaca 37618984  T
Q  100 aacagtggggtg--ttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcactatagaattttccttt 193  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |        |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37618985 aacagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttca-ccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttccttt 37619079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15752213 - 15752067
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  15752213 cgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaa 15752114  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||    
T  15752113 acagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaactt 15752067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18422831 - 18422689
Alignment:
Q  5 tataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacag 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18422831 tataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacgg 18422732  T
Q  105 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18422731 tggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaactt 18422689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30254606 - 30254419
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30254606 gcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaa 30254507  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcactatagaattttcct 191  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |        |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30254506 cagt-gtgtattactcattacatttttgatgttatattgttaacttcaacaaaaaag-tcattcttataacttcaccatagaattttcct 30254419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 37451467 - 37451322
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37451467 cttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 37451369  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 149  Q
     || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37451368 ggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaacttta 37451322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8222312 - 8222169
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |    
T  8222312 cgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgt---a 8222216  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8222215 acggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 8222169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 51129041 - 51128897
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  51129041 cttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaac 51128942  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  51128941 ggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 51128897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Original strand, 9903053 - 9903192
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9903053 aacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcgg 9903152  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9903153 ggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaactt 9903192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 19899761 - 19899907
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  19899761 cgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaa 19899860  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19899861 acagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaactt 19899907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 30326944 - 30327084
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||    
T  30326944 cgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaa 30327043  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30327044 acggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtgt 30327084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2959925 - 2959786
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2959925 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgg 2959826  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    | ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2959825 gatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaactt 2959786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28769833 - 28769691
Alignment:
Q  4 ttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaaca 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||     
T  28769833 ttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacg 28769734  T
Q  104 gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28769733 gt-gggtgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaactt 28769691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 42721221 - 42721086
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||    
T  42721221 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaac 42721122  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatag 138  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  42721121 agtggggtgttactcactatattttttatgatatag 42721086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32216237 - 32216093
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  32216237 cttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaac 32216138  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32216137 agtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaactt 32216093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 48620819 - 48620675
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||| |||||||||    
T  48620819 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 48620720  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  48620719 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaactt 48620675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 46931588 - 46931449
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||   |||| |||||||| | || ||||||||||||    
T  46931588 aacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtgg 46931489  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46931488 ggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 46931449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 27763303 - 27763448
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||    
T  27763303 cgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaa 27763402  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27763403 actat-gggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 27763448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23999530 - 23999385
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  23999530 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 23999431  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  23999430 tagtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaactt 23999385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 27563899 - 27564043
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  27563899 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaac 27563998  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| | |||||||||| |||||    
T  27563999 agtggagtgttactcactatatttttaaagttatagtgttaactt 27564043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47279366 - 47279243
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  47279366 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtgg 47279267  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgat 131  Q
    |||||||||||  ||| |||||||    
T  47279266 ggtgttactcacaacacttttgat 47279243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38823381 - 38823252
Alignment:
Q  18 gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 117  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  38823381 gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactc 38823282  T
Q  118 attacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
       ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  38823281 gcaacaattttgatgctatagtgttaactt 38823252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3309311 - 3309184
Alignment:
Q  21 aaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcatt 120  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||      
T  3309311 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagt-gggtgttactcaca 3309213  T
Q  121 acatttttgatgttatagtgtgaacttta 149  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3309212 acacttttgatgttatagtgttaacttta 3309184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Original strand, 10182002 - 10182134
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||    
T  10182002 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaac 10182101  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgtta 135  Q
    ||||| ||||||| || || |||||| ||||||    
T  10182102 agtggcgtgttacgcactatattttttatgtta 10182134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 11742345 - 11742488
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||||    
T  11742345 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 11742443  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||| |||||    
T  11742444 agtggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaactt 11742488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 114
Target Start/End: Original strand, 7079057 - 7079168
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7079057 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaac 7079156  T
Q  103 agtggggtgtta 114  Q
    |||| |||||||    
T  7079157 agtgaggtgtta 7079168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Original strand, 34012376 - 34012515
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  34012376 aacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtgg 34012475  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||    
T  34012476 agtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaactt 34012515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16415828 - 16415683
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||||||    
T  16415828 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaac 16415729  T
Q  103 a-gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |  | |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  16415728 atttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaactt 16415683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Original strand, 27227479 - 27227587
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||    
T  27227479 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaac 27227578  T
Q  103 agtggggtg 111  Q
    |||| ||||    
T  27227579 agtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 41926345 - 41926209
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||| ||||| || |||||||||    
T  41926345 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaac 41926246  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    |||||| | ||||||| || |||||||||||||||||    
T  41926245 agtgggatattactcactatatttttgatgttatagt 41926209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4330463 - 4330324
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||||  || |||||||||    
T  4330463 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaac 4330364  T
Q  103 agt-ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    | | ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  4330363 attgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgt 4330324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14758223 - 14758085
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14758223 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 14758124  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14758123 agttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgt 14758085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 31621547 - 31621685
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||| ||  |||||||     
T  31621547 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaaat 31621646  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    || |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  31621647 agcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgt 31621685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25160814 - 25160710
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25160814 cttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaac 25160715  T
Q  103 agtgg 107  Q
     ||||    
T  25160714 ggtgg 25160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 27267199 - 27267318
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  27267199 aacaaggta-gattaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtgg 27267297  T
Q  108 ggtgttactcattacattttt 128  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  27267298 ggtgtcactcactacattttt 27267318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 27532975 - 27533118
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||     
T  27532975 cttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaag 27533073  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||| |||||| ||  | | |||||||| |||||||| |||||    
T  27533074 agtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaactt 27533118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 238507 - 238650
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  238507 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 238606  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| || |||||||||  |||||||| ||  |||||||| |||||    
T  238607 agt-ggatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaactt 238650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3535114 - 3534970
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| || | | | |||||||||||||||| || ||||||    
T  3535114 cttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaac 3535015  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3535014 agtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 3534970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40884995 - 40884857
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||| || ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||  | | ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  40884995 cttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 40884896  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  40884895 agtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgt 40884857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1547461 - 1547325
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||    
T  1547461 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga--------tactatgagaactgaacttttgatgccactgcacaaac 1547370  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  1547369 agtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaactt 1547325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15168278 - 15168133
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatg-------tcattg 95  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||        ||  |    
T  15168278 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaacg 15168179  T
Q  96 tacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  15168178 tacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgt 15168133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 47682504 - 47682614
Alignment:
Q  19 ataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggg-gtgttactc 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  47682504 ataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactc 47682603  T
Q  118 attacattttt 128  Q
    |  ||||||||    
T  47682604 acaacattttt 47682614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21289814 - 21289729
Alignment:
Q  43 tgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21289814 tgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttt 21289729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39393566 - 39393421
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  39393566 cttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaa 39393467  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    || ||  || |||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  39393466 caatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 39393421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Original strand, 33725594 - 33725729
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    | |||     
T  33725594 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccaaagaaat 33725693  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatag 138  Q
    |||||| || |||||| |||| |||||||| |||||    
T  33725694 agtgggctgctactcaatacacttttgatgatatag 33725729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30254952 - 30254896
Alignment:
Q  90 tcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30254952 tcattgtacaaacagtggg-tgttatccattacatttttgatgttatagtgttaactt 30254896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22170888 - 22170806
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgt 90  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  22170888 aacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatgt 22170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 103
Target Start/End: Original strand, 1359933 - 1359977
Alignment:
Q  59 tgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaaca 103  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1359933 tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcattatacaaaca 1359977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24886290 - 24886154
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24886290 cttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 24886191  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24886190 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 24886154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 22974069 - 22974260
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22974069 cgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaa 22974168  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcactatagaattttccttt 193  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |        ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22974169 acagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttca-ccaaaaaaatcattctcataacttcaccatagaattttccttt 22974260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Original strand, 14919517 - 14919714
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||    
T  14919517 cttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaac 14919616  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcactatagaattttcctttaaaaata 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||        | ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14919617 agtgaggtgttactcattacatttttgatgttataatgttaacttcatcaaaaaaaataattctcatgacttcaccatataattttcctttaaaaata 14919714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 31705599 - 31705744
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  31705599 cgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaa 31705697  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31705698 acggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaactt 31705744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Original strand, 38528231 - 38528369
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  38528231 aacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag-actgaacttttgatgtcactgtataaacaatgg 38528329  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38528330 ggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaactt 38528369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Original strand, 43308641 - 43308786
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||    
T  43308641 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaac 43308740  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 149  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43308741 agt-gggtgttattcattacatttttgatgttataatgttaacttta 43308786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22255370 - 22255223
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22255370 cgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaa 22255271  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacat-ttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  22255270 acggtggggtgttactcattacattttttgatgttataatgttaactt 22255223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 27318474 - 27318620
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27318474 cgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaa 27318573  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  27318574 acagtggtgtgttactcactacattttttatgttttagtgttaactt 27318620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 30969313 - 30969457
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||     
T  30969313 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaat 30969412  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  30969413 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 30969457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 699328 - 699192
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  699328 aaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 699229  T
Q  111 gttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||| || |||||| ||| |||||||| |||||    
T  699228 gttactcactagattttttatgctatagtgttaactt 699192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7693416 - 7693272
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  7693416 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaac 7693317  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7693316 agtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 7693272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22980979 - 22980835
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||  |||||    
T  22980979 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaac 22980880  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||  |||||||| |||||    
T  22980879 agtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaactt 22980835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 39573005 - 39572869
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  39573005 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaac 39572906  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||    
T  39572905 agtggagtgttactcacaacattttttatattatagt 39572869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 7208854 - 7208984
Alignment:
Q  4 ttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaaca 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||     
T  7208854 ttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacg 7208952  T
Q  104 gtggggtgttactcattacatttttgatgtta 135  Q
    || ||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  7208953 gtagggtgttactcgttgcattttttatgtta 7208984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12910541 - 12910400
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtc-----attgta 97  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||     | ||||    
T  12910541 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgta 12910442  T
Q  98 caaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12910441 caaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagt 12910400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 1429134 - 1429278
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||   | |||| |||||||| || |||||||||    
T  1429134 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaac 1429233  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  1429234 agtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaactt 1429278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9200419 - 9200275
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||    
T  9200419 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaac 9200320  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9200319 tgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 9200275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 17158020 - 17158163
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  17158020 cttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaac 17158118  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17158119 ggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 17158163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 31786635 - 31786779
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  31786635 cttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaac 31786734  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||   | |||| ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  31786735 agtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaactt 31786779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32563335 - 32563191
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | | | |||||||||||||||| |||||| ||    
T  32563335 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagac 32563236  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32563235 agtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 32563191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Original strand, 23116216 - 23116355
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  23116216 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtgg 23116315  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  23116316 ggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaactt 23116355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 5112302 - 5112438
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| || |||||||||    
T  5112302 cttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 5112401  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  5112402 agtggggtgttactcactatattttttatgttatagt 5112438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26268260 - 26268116
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||||  ||||||||    
T  26268260 cttaaaacaaggtatgataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaac 26268161  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  26268160 agtggggtgttactcaaaacacttttgatgctatagtgttaactt 26268116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 36866948 - 36866804
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||  | | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36866948 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaac 36866849  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||    
T  36866848 agtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaactt 36866804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Original strand, 35511471 - 35511610
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35511471 aacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtgg 35511570  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     |||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  35511571 agtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaactt 35511610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5830080 - 5829955
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||         ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  5830080 cgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaat---------tgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaa 5829990  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 135  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5829989 acggtagggtgttactcattacattttttatgtta 5829955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 14409316 - 14409453
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  |||  ||     
T  14409316 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag-actgaacttttgatgccaccgtattaag 14409414  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14409415 agtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgt 14409453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 35504553 - 35504427
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||    
T  35504553 cgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatcatacaa 35504454  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttt 127  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||    
T  35504453 acggtgaggtgttactcattacatttt 35504427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27330490 - 27330348
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27330490 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaac 27330391  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27330390 agtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaactt 27330348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33908414 - 33908281
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  33908414 aacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 33908315  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
     ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  33908314 agtgctactcactacacttttgatgatatagtgt 33908281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19120045 - 19119901
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||||||    
T  19120045 cttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 19119946  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19119945 agtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaactt 19119901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 36860601 - 36860465
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36860601 aaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 36860502  T
Q  111 gttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||  |||||||| ||  |||||||| |||||    
T  36860501 gttactcacaacattttttatactatagtgttaactt 36860465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5837741 - 5837603
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||   | |||| ||||||||||| |||||||||    
T  5837741 cttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaac 5837642  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  5837641 agtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgt 5837603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 23954778 - 23954904
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtca-ttgtacaaa 101  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| || | ||| |||    
T  23954778 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaa 23954877  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacattttt 128  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||    
T  23954878 cagtggggtgttactcactatattttt 23954904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40133571 - 40133443
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||| | | ||||||||||||| |||||||||||     
T  40133571 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaat 40133472  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgat 131  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40133471 agtggggtgttactcacaacatttttgat 40133443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Original strand, 6824473 - 6824599
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattga--acttttgatgtcattgtacaaacagt 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||  | |||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6824473 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagt 6824572  T
Q  106 ggggtgttactcattacatttttgatg 132  Q
    || ||||||||||  ||| ||||||||    
T  6824573 ggagtgttactcacaacacttttgatg 6824599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Original strand, 25500915 - 25501061
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||  | | | ||||||||||| || |||||||||    
T  25500915 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaac 25501014  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 149  Q
    |||| ||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  25501015 agtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaacttta 25501061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 35826471 - 35826608
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  35826471 cgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaa 35826569  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35826570 acaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagt 35826608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 8741875 - 8742020
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8741875 cttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaac 8741974  T
Q  103 agt-ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    | | |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8741975 aatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 8742020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 21088755 - 21088880
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||| | |||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21088755 cttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 21088854  T
Q  103 agtggggtgttactcattacattttt 128  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||    
T  21088855 agtggggtgtcactcacaacattttt 21088880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Original strand, 15992536 - 15992636
Alignment:
Q  10 caaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggg 109  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15992536 caaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggg 15992635  T
Q  110 t 110  Q
    |    
T  15992636 t 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 42342906 - 42342774
Alignment:
Q  14 gtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgag--aattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||    ||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  42342906 gtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggaaatt----ttttgatgtcactgtataaacagtggggta 42342811  T
Q  112 ttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttt 148  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42342810 ttactcacaacatttttgatgttatagtattaacttt 42342774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15724658 - 15724532
Alignment:
Q  19 ataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 118  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15724658 ataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgggact-gaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactca 15724561  T
Q  119 ttacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
      | | ||||||||||||||||| |||||    
T  15724560 caaaacttttgatgttatagtgttaactt 15724532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 28416532 - 28416660
Alignment:
Q  19 ataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 118  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |   ||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  28416532 ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactca 28416631  T
Q  119 ttacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
      | | ||||||| ||||||||| |||||    
T  28416632 caatacttttgatattatagtgttaactt 28416660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8466925 - 8466787
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||  || |||||||| || ||    
T  8466925 aacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgtacaaagag-gg 8466827  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  8466826 ggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaactt 8466787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22019810 - 22019690
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||| | | | | |||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  22019810 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggt 22019711  T
Q  111 gttactcattacatttttgat 131  Q
    ||||||||  ||| |||||||    
T  22019710 gttactcacaacacttttgat 22019690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 8437151 - 8437014
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  8437151 cttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatg-gttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 8437053  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||| || | ||||||||    
T  8437052 aatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgt 8437014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25668804 - 25668703
Alignment:
Q  34 gtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgt 133  Q
    ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  25668804 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt 25668705  T
Q  134 ta 135  Q
    ||    
T  25668704 ta 25668703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22255659 - 22255617
Alignment:
Q  105 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22255659 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 22255617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898054
Alignment:
Q  52 gatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttata 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| | || |||||||| ||||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctata 11898054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 147
Target Start/End: Original strand, 13956425 - 13956478
Alignment:
Q  94 tgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13956425 tgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaactt 13956478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 35934082 - 35934013
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaat-tagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg 71  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35934082 cttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 35934013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 13956356 - 13956415
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatac 67  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  13956356 aacaagataaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 147
Target Start/End: Original strand, 26317774 - 26317817
Alignment:
Q  104 gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26317774 gtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaactt 26317817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5748520 - 5748478
Alignment:
Q  104 gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaact 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  5748520 gtggggtgttactcattatatttttgacgttatagtgttaact 5748478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 41
Target Start/End: Original strand, 2888439 - 2888472
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtc 41  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2888439 aacaaggtaaaataaaattagattaagtgtagtc 2888472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 43648262 - 43648406
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  43648262 cttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaac 43648361  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43648362 agtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 43648406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37905896 - 37905750
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37905896 cgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaa 37905797  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37905796 acggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaactt 37905750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 19289341 - 19289484
Alignment:
Q  4 ttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaaca 103  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19289341 ttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaaca 19289440  T
Q  104 gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19289441 atggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaactt 19289484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 33551001 - 33551147
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  33551001 cgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaa 33551100  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33551101 acagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaactt 33551147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 3177125 - 3176989
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3177125 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 3177026  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  3177025 agttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagt 3176989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4763812 - 4763679
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4763812 aacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgg 4763713  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  4763712 ggtgttactcactacagttttgttgatatagtgt 4763679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 33660385 - 33660529
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| || |||||||||    
T  33660385 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaac 33660484  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33660485 agttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 33660529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 17071752 - 17071898
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  17071752 cgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcattgtacaa 17071851  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    | | || | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17071852 ataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaactt 17071898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Original strand, 11366403 - 11366536
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  11366403 aacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtga 11366502  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366503 gatgttactcattacatttttgatgttatagtgt 11366536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 19424645 - 19424789
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| || | || ||||    
T  19424645 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaac 19424744  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19424745 aatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 19424789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 27349956 - 27350099
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  27349956 cttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggact-gaacttttgatgtcactgtacaaac 27350054  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  27350055 agtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtgttaactt 27350099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 29242155 - 29242291
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||  || |||||||||    
T  29242155 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaac 29242254  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||    
T  29242255 agtggggtgttacgcactatattttttatgttatagt 29242291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26357758 - 26357619
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||| |  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26357758 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgg 26357659  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26357658 gatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaactt 26357619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4478556 - 4478411
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||    
T  4478556 cttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaa 4478457  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    || ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4478456 caatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 4478411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33902252 - 33902120
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  33902252 cttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaac 33902153  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgtta 135  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  33902152 agtggggtattactcactacattttttatgtta 33902120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 17054111 - 17054249
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  |  | |||||||||||||||||||||    
T  17054111 cgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcattgtacaa 17054210  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    ||| || | ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17054211 acaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagt 17054249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Original strand, 4264094 - 4264240
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||| ||||||||   | |||||||||||||||| |||||||||    
T  4264094 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaac 4264193  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 149  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  4264194 agtgggatgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttta 4264240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4167108 - 4166980
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4167108 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaac 4167009  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgat 131  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  4167008 agtggggtgttactcacaatatttttgat 4166980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 33709249 - 33709393
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  | |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||| |||    
T  33709249 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaac 33709348  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33709349 agtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaactt 33709393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 36642174 - 36642036
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaa--ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  36642174 cttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaa 36642075  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    |||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||||||    
T  36642074 acagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagt 36642036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 39167380 - 39167495
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  39167380 cttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 39167479  T
Q  103 agtggggtgttactca 118  Q
    |||| |||||||||||    
T  39167480 agtgaggtgttactca 39167495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 31570751 - 31570889
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||||| | || |||     
T  31570751 cttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaat 31570850  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    |||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||    
T  31570851 agtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgt 31570889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 2325393 - 2325531
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||    
T  2325393 cgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaa 2325484  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  2325485 acaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaactt 2325531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 43770856 - 43771000
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||| | |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || | | | ||||||||||||| || |||| ||||    
T  43770856 cttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataaac 43770955  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43770956 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 43771000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Original strand, 41463872 - 41464003
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||  ||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  41463872 aacaaagtatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtga 41463971  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  41463972 ggtgttactcacaacacttttgattttatagt 41464003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13711635 - 13711506
Alignment:
Q  18 gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 117  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| | | | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13711635 gataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactc 13711536  T
Q  118 attacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |  ||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  13711535 acaacacttttgatgctataatgttaactt 13711506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 7006938 - 7007053
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||| ||| | |||||||||||  | |||||||||    
T  7006938 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaac 7007037  T
Q  103 agtggggtgttactca 118  Q
    |||||| |||||||||    
T  7007038 agtgggatgttactca 7007053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 41961021 - 41960939
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgt 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  41961021 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgt 41960939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44913849 - 44913719
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactat-gagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44913849 cttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaa 44913750  T
Q  102 c-agtggggtgttactcattacatttttgat 131  Q
    | |||| |||||||||||  |||||||||||    
T  44913749 caagtgaggtgttactcacaacatttttgat 44913719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 45327906 - 45327817
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtca 92  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  45327906 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtca 45327817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19314037 - 19313894
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||     
T  19314037 cttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaat 19313939  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||  |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  19313938 agtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaactt 19313894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 5881724 - 5881610
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||||||||| | | | | |||||||||||||| |||||||||    
T  5881724 cttaaaacaaggtatgataaa-ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgtacaaac 5881626  T
Q  103 agtggggtgttactca 118  Q
    ||||||||||||||||    
T  5881625 agtggggtgttactca 5881610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35959021 - 35958958
Alignment:
Q  77 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtg 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35959021 tgaacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtg 35958958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 31862040 - 31861971
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactat 70  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31862040 cgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 31861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 91
Target Start/End: Original strand, 18494303 - 18494385
Alignment:
Q  9 acaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtc 91  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18494303 acaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 18494385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 44286135 - 44285991
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| | | | ||||||||||| || | |||||||    
T  44286135 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaac 44286036  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| | | || |||   ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  44286035 agtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaactt 44285991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 89
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051308
Alignment:
Q  44 gttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatg 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 41051308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 19501773 - 19501823
Alignment:
Q  19 ataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactat 70  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19501773 ataaaattagattaaatgtagtt-tgttaatctgatgaattgatgatactat 19501823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 35959084 - 35959023
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatg 63  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  35959084 cgcttataacaaggtaggat-aaattatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg 35959023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 41465687 - 41465602
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgat 88  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||  | | ||||||||||||    
T  41465687 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttgat 41465602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25184301 - 25184155
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  25184301 cgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaa 25184202  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25184201 acagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 25184155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 879571 - 879711
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  879571 cgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaa 879670  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879671 acaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 879711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 190
Target Start/End: Original strand, 19089480 - 19089664
Alignment:
Q  5 tataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacag 104  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19089480 tatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacag 19089579  T
Q  105 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnnttcattcttataacttcactatagaattttcc 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||       || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19089580 tggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaagtt-attcttatgacttcaccatagaattttcc 19089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 37663764 - 37663898
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37663764 cgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaa 37663863  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37663864 acagtggggtgttactcattacagttttaatgtta 37663898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 19440671 - 19440811
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  19440671 cgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaa 19440770  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19440771 acggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgt 19440811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 50697429 - 50697290
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50697429 cgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 50697331  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  50697330 acggtagggtgttactcgttatattttttatgttatagtgt 50697290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 55477916 - 55478064
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgt----ac 98  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    ||    
T  55477916 cttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 55478015  T
Q  99 aaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55478016 aaacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaactt 55478064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Original strand, 25701082 - 25701228
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  25701082 cttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 25701181  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 149  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  25701182 agtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaacttta 25701228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 42199916 - 42199779
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||    
T  42199916 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaa 42199817  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42199816 taatggggtattactcattacatttttgatgttatagt 42199779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9139426 - 9139316
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  9139426 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtgg 9139327  T
Q  108 ggtgttactca 118  Q
    |||||||||||    
T  9139326 ggtgttactca 9139316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23761257 - 23761112
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||    
T  23761257 cttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaac 23761159  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 149  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23761158 agtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttta 23761112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 32912603 - 32912749
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||| |||||    
T  32912603 cgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaa 32912702  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32912703 atactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 32912749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17173476 - 17173332
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17173476 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaac 17173377  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  17173376 agtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaactt 17173332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 36493713 - 36493849
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||    
T  36493713 cttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 36493812  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  36493813 aatggggtgttactcactatatttttgatggtatagt 36493849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6864223 - 6864084
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||||  |||||||||    
T  6864223 cgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaa 6864124  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtg 140  Q
    | ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6864123 aaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtg 6864084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Original strand, 34948127 - 34948266
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  34948127 aacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtgg 34948226  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34948227 ggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 34948266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 4934227 - 4934353
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  4934227 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaac 4934326  T
Q  103 agt-ggggtgttactcattacattttt 128  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||    
T  4934327 aatgggggtgttactcactacattttt 4934353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 34361515 - 34361660
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||| ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| |||||    
T  34361515 cgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgaggct-gaacttttaatgtcattctacaa 34361613  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  34361614 acagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 34361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 35021058 - 35021204
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |   ||||||||| | || |||||||    
T  35021058 cgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaa 35021157  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35021158 acagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaactt 35021204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17167899 - 17167755
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg-agaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17167899 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaat-gaacttttgatgtcattgtacaaa 17167801  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  17167800 cagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaactt 17167755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 29584225 - 29584367
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29584225 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaac 29584324  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29584325 agtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaactt 29584367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 50764901 - 50764784
Alignment:
Q  18 gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 117  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  50764901 gataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactc 50764802  T
Q  118 attacatttttgatgtta 135  Q
    |  ||| |||||||||||    
T  50764801 acaacacttttgatgtta 50764784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27396802 - 27396658
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  27396802 cttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaac 27396703  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| |||||    
T  27396702 agtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaactt 27396658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Original strand, 5047990 - 5048125
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  5047990 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaac 5048089  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatag 138  Q
    |||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  5048090 agtgtggtcctactcactacacttttgatgttatag 5048125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 28003011 - 28003149
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  28003011 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaac 28003110  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||| ||  |||| | |||| |||||||| ||||||||    
T  28003111 agtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgt 28003149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 38012040 - 38011902
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| | | ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  38012040 cttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggggactgaacttttgatggcaccgtacaaac 38011941  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  38011940 agtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgt 38011902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Original strand, 46888187 - 46888318
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||| |||| | | ||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  46888187 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtgg 46888286  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  46888287 ggtattactcactacaattttgatgttatagt 46888318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 37775853 - 37775718
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||    |||||||||||| || |||||||||    
T  37775853 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccactgtacaaac 37775756  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtg 140  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||    
T  37775755 agtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtg 37775718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 49376137 - 49376009
Alignment:
Q  19 ataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 118  Q
    |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  49376137 ataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactca 49376038  T
Q  119 ttacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
      ||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  49376037 cgacacttttgatgctataatgttaactt 49376009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 54499262 - 54499408
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactat-gagaattgaacttttgatgtcatt-gtaca 99  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  54499262 cttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagag-actgaacttttgatgtcattagtaca 54499360  T
Q  100 aacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  54499361 aacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 54499408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32592279 - 32592165
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||||||    
T  32592279 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactatacaaac 32592180  T
Q  103 agtggggtgttactc 117  Q
    ||||| |||||||||    
T  32592179 agtggagtgttactc 32592165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33341584 - 33341475
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| || |||||||||    
T  33341584 cttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccactgtacaaac 33341486  T
Q  103 agtggggtgtt 113  Q
    |||||||||||    
T  33341485 agtggggtgtt 33341475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 55241130 - 55241243
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| | |||||||||||||| | | ||||||||||||| || |||||||||    
T  55241130 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctta-tctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 55241228  T
Q  103 agtggggtgttactc 117  Q
    |||||||||||||||    
T  55241229 agtggggtgttactc 55241243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37287862 - 37287732
Alignment:
Q  61 atgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatcnnnnnnntt 160  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |        |    
T  37287862 atgatattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagt 37287763  T
Q  161 cattcttataacttcactatagaattttcct 191  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  37287762 cattctcattacttcaccatagaattttcct 37287732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7703695 - 7703559
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||        ||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  7703695 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaac 7703604  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7703603 agtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaactt 7703559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3042807 - 3042653
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaat--------tgaacttttgatgtca 92  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||  ||| | |        |||| |||||||||||    
T  3042807 cgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatacattgatactctaatgactgaatttttgatgtca 3042708  T
Q  93 ttgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  3042707 ttgtataaacggtggggtattactcattacattttgtatgttatagtgttaactt 3042653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4598163 - 4598035
Alignment:
Q  18 gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 117  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||||  ||| | | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  4598163 gataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 4598064  T
Q  118 attacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |  |||  |||||||||||||||| |||||    
T  4598063 acaaca-ctttgatgttatagtgttaactt 4598035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 33816558 - 33816687
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||||||||||   | ||||||||||||| ||  ||| |||     
T  33816558 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccaccgtataaat 33816657  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatg 132  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||||||    
T  33816658 agtgaggtgctactcactacacttttgatg 33816687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Original strand, 30002665 - 30002793
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||        ||||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  30002665 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat--------gatactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggt 30002756  T
Q  111 gttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||  ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  30002757 gttactcacaacacttttgatgctacagtgttaactt 30002793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 47253926 - 47253791
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||        ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||    
T  47253926 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaac 47253835  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    | | ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  47253834 aat-gggtgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaactt 47253791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4205221 - 4205158
Alignment:
Q  84 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4205221 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaactt 4205158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 32579632 - 32579496
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgt---aca 99  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| | | ||||||||||| ||  ||   |||    
T  32579632 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatgag-actaaacttttgatggcaccgtacaaca 32579534  T
Q  100 aacagtggggtgttactcattacatttttgatgttata 137  Q
    |||| ||||||| |||||| | || |||||||||||||    
T  32579533 aacactggggtgctactcactgcacttttgatgttata 32579496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 1815487 - 1815417
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgag 73  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1815487 cttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgag 1815417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 35025669 - 35025751
Alignment:
Q  59 tgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  35025669 tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgt 35025751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39398030 - 39397960
Alignment:
Q  77 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  39398030 tgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaactt 39397960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4396418 - 4396368
Alignment:
Q  97 acaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4396418 acaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 4396368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 53124372 - 53124329
Alignment:
Q  104 gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  53124372 gtggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaactt 53124329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17272150 - 17272084
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatacta 69  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  17272150 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta 17272084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 41
Target Start/End: Original strand, 46884132 - 46884171
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtc 41  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  46884132 gcttataacaagatatgataaaattagattaagtgtagtc 46884171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Original strand, 23518402 - 23518472
Alignment:
Q  77 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||||    
T  23518402 tgaatttttgatgccactgtattaacagtggggtgttagtcactacagttttaatgttatagtgttaactt 23518472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 3655199 - 3655349
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3655199 cgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaa 3655298  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatc 151  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3655299 acggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactttatc 3655349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 42506072 - 42506212
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  42506072 cgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaa 42506171  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42506172 acagtggggtattactcattacaattttgatgttatagtgt 42506212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 48355117 - 48354974
Alignment:
Q  4 ttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaaca 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  48355117 ttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaaca 48355018  T
Q  104 gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  48355017 atggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaactt 48354974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 4761648 - 4761784
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4761648 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 4761747  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4761748 agtgaagtgttactcattacatttttgatattatagt 4761784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373431
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagt 20373431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 40552256 - 40552402
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40552256 cgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaa 40552355  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40552356 acggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 40552402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 51212980 - 51213124
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  51212980 cttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactcaacttttgatgccattgtacaaac 51213079  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  51213080 agtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaactt 51213124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 26941257 - 26941403
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  26941257 cgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaa 26941356  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||    
T  26941357 acagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaactt 26941403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37203236 - 37203100
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37203236 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 37203137  T
Q  111 gttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37203136 gttactcactacaattttgatgttatagtgttaactt 37203100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 21009800 - 21009939
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  21009800 gcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 21009899  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21009900 tagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 21009939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 47481700 - 47481555
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    ||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||    
T  47481700 gcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaa 47481601  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47481600 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 47481555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 39282824 - 39282682
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  39282824 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtgg 39282725  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttatc 151  Q
    ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  39282724 ggtattactca-cacagttttgatgttatagtgttaattttatc 39282682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37157876 - 37157741
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||  | ||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  37157876 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgtac-aacagtggggt 37157778  T
Q  111 gttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37157777 gttactcactacaattttgatgttatagtgttaactt 37157741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 34133112 - 34132974
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34133112 cttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 34133013  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  34133012 agtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgt 34132974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35844485 - 35844359
Alignment:
Q  21 aaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcatt 120  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||      
T  35844485 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcaca 35844386  T
Q  121 acatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35844385 acatttttgttgttatagtgttaactt 35844359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Original strand, 54828700 - 54828845
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||  | |||| |||||||||| ||||  ||||    
T  54828700 cttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaac 54828799  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttta 149  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  54828800 ggtggggtgttactcattacattttt-atgttatagtgttaacttta 54828845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11467001 - 11466865
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||| || |||||||||    
T  11467001 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaac 11466902  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  11466901 agtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagt 11466865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 46297761 - 46297905
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  46297761 cttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaac 46297860  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  46297861 agtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaactt 46297905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Original strand, 44186505 - 44186644
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  44186505 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaacagcgg 44186604  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  44186605 ggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 44186644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 43975887 - 43976025
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  43975887 cttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaat 43975986  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  43975987 agtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgt 43976025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 46994660 - 46994754
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgta 97  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  46994660 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgta 46994754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Original strand, 11357371 - 11357508
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-gggg 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  11357371 aaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtggggg 11357470  T
Q  110 tgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||||| |||||    
T  11357471 tgttactcactatacttttgatgctatagtgttaactt 11357508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29099517 - 29099388
Alignment:
Q  18 gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 117  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||| | | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29099517 gataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactc 29099418  T
Q  118 attacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  29099417 acgacattttttatgttatagtgttaactt 29099388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 52040921 - 52041058
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| || | |||||||    
T  52040921 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaac 52041020  T
Q  103 a-gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
    |  ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  52041021 atttggggagttactcactacacttttgatgttatagt 52041058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 54505985 - 54505841
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||  || |||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || |||    
T  54505985 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgaggct-gaatttttgatgtcattctataaa 54505887  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54505886 taatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 54505841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2008110 - 2007966
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  2008110 cttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaac 2008011  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| | | |||||||| |||||    
T  2008010 agtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgttaactt 2007966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22451145 - 22451007
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||   |||||||    
T  22451145 cttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccatacaaac 22451046  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  22451045 agtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgt 22451007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 27480378 - 27480516
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  27480378 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaac 27480477  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    | | || || ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27480478 aattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgt 27480516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 24488961 - 24489086
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||    
T  24488961 cttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaac 24489060  T
Q  103 agtggggtgttactcattacattttt 128  Q
    |||||  |||||||||  ||||||||    
T  24489061 agtggaatgttactcacaacattttt 24489086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 53176216 - 53176127
Alignment:
Q  18 gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53176216 gataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagtgg 53176127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4015637 - 4015493
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||| ||| | || || ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||    
T  4015637 cttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaac 4015538  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  4015537 agttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 4015493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21193783 - 21193655
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || ||||||| ||| | | |||||||||||||||| | |||||||    
T  21193783 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaac 21193684  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgat 131  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  21193683 agtggggtgttactcacaacacttttgat 21193655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Original strand, 7327489 - 7327619
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  7327489 aaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagt 7327588  T
Q  111 gttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  7327589 gttactcacaacacttttgatgttatagtgt 7327619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 33378784 - 33378922
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||     
T  33378784 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaat 33378883  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    | ||||||  |||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  33378884 attggggtactactcactacacttttgatactatagtgt 33378922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 22446063 - 22446207
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatga-gaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||    
T  22446063 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtacaaa 22446162  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| |||||    
T  22446163 -agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaactt 22446207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40936153 - 40936024
Alignment:
Q  18 gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 117  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||    
T  40936153 gataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttactc 40936054  T
Q  118 attacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
       ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  40936053 gcaacacttttgatgctatagtgttaactt 40936024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3362424 - 3362286
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaa--gtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggg 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  3362424 aaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtggg 3362325  T
Q  109 gtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     ||||||||| || |||| ||||| |||||||| |||||    
T  3362324 atgttactcactatatttctgatgctatagtgttaactt 3362286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 24708119 - 24708246
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaa--gtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  24708119 aacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtac--acagt 24708216  T
Q  106 ggggtgttactcattacatttttgatgtta 135  Q
    | ||||||||||| | || |||||||||||    
T  24708217 gaggtgttactcactgcagttttgatgtta 24708246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Original strand, 53229159 - 53229290
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtg-ggg 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||  | |||||||||| || |||    
T  53229159 aaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgaggg 53229258  T
Q  110 tgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    |||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  53229259 tgttgctcactacacttttgatgctatagtgt 53229290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 32373647 - 32373502
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||| ||  |  | |||||||||||| || |||||||||    
T  32373647 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactgtacaaac 32373548  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactttat 150  Q
    |||  || ||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  32373547 agt--ggagttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttat 32373502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 38591870 - 38591726
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa----aca 103  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | | | ||||||||||| ||||||||||    |||    
T  38591870 aacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgtacaacaataca 38591771  T
Q  104 gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaacttt 148  Q
     || | ||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||    
T  38591770 atgagatgttactccctataattttgatgttatagtgttaacttt 38591726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 43348434 - 43348320
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||||| || |  ||||||    
T  43348434 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaaag-actgaacttttgatgccactaaacaaac 43348336  T
Q  103 agtggggtgttactca 118  Q
    ||||||||||| ||||    
T  43348335 agtggggtgttgctca 43348320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 45174683 - 45174536
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||  | ||||||||    
T  45174683 cttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaa 45174584  T
Q  102 cagtggggtgttact--cattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45174583 cagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaactt 45174536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 44891674 - 44891539
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| | | | ||||||||||| |         ||    
T  44891674 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc---------ac 44891584  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44891583 agtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 44891539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 14586669 - 14586784
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | |   |||||||||| ||| |||| |||     
T  14586669 cttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcactgtataaat 14586768  T
Q  103 agtggggtgttactca 118  Q
    |||| |||||||||||    
T  14586769 agtgaggtgttactca 14586784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 29163995 - 29163912
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttg 86  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  29163995 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 33698330 - 33698265
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatact 68  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  33698330 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 22622722 - 22622780
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgata 66  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22622722 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 25579911 - 25579780
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |  |||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  25579911 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtag 25579812  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagt 139  Q
      ||||| |||  ||| |||||||| ||||||    
T  25579811 aatgttattcacaacacttttgatgctatagt 25579780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 146
Target Start/End: Original strand, 41585407 - 41585449
Alignment:
Q  104 gtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaact 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41585407 gtggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaact 41585449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33698263 - 33698221
Alignment:
Q  105 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33698263 tggggtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaactt 33698221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 36012310 - 36012244
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgag 73  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36012310 aacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatgag 36012244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 11835626 - 11835695
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaa-attagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatg 71  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  11835626 cttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgatactatg 11835695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1946022 - 1945876
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  1946022 cgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaa 1945923  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1945922 acagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 1945876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 4318820 - 4318965
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4318820 cttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaa 4318919  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4318920 cagtggggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt 4318965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5627578 - 5627433
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  5627578 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 5627479  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  5627478 tagtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaactt 5627433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 7055213 - 7055357
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||     
T  7055213 cttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaat 7055312  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  7055313 agtgaggtgttactaattatattttttatgttatagtgttaactt 7055357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 6091179 - 6091313
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6091179 cgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaa 6091278  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 135  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6091279 acaatggtgtgttactcactacattttttatgtta 6091313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 7235033 - 7235170
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  7235033 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatgag-actgaacttttgatggcaccgtacaaac 7235131  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7235132 agtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgt 7235170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Original strand, 33893006 - 33893144
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  33893006 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcattgtacaaatagtgg 33893104  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33893105 ggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 33893144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 3879942 - 3880065
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 107  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3879942 aacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtag 3880041  T
Q  108 ggtgttactcattacatttttgat 131  Q
    |||||||||||  ||| |||||||    
T  3880042 ggtgttactcacaacacttttgat 3880065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8513415 - 8513275
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtg 106  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8513415 aacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtg 8513316  T
Q  107 gggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  8513315 gggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaactt 8513275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15491793 - 15491669
Alignment:
Q  11 aaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  15491793 aaggtaggataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggt 15491694  T
Q  111 gttactcattacatttttgatgtta 135  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||    
T  15491693 gttactcacaacacttttgatgtta 15491669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29182339 - 29182205
Alignment:
Q  13 ggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgt 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||   | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  29182339 ggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgt 29182240  T
Q  113 tactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29182239 tactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 29182205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33619010 - 33618882
Alignment:
Q  13 ggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgt 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| | |||| ||     
T  33619010 ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgc 33618911  T
Q  113 tactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    |||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  33618910 tactcactacacttttgatgcgatagtgt 33618882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 21017125 - 21017235
Alignment:
Q  18 gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 117  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  21017125 gataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaataatggggtgttactc 21017224  T
Q  118 attacattttt 128  Q
    |  ||||||||    
T  21017225 acaacattttt 21017235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6089090 - 6088950
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtg 106  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||| || | |||||||||||    
T  6089090 aacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtg 6088991  T
Q  107 gggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||| ||||||||  ||| |||||||  |||||||| |||||    
T  6088990 gggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaactt 6088950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 30353356 - 30353500
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 102  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||   | |||||| | |||| || |||||||||    
T  30353356 cttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaac 30353455  T
Q  103 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| | | ||||||   ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  30353456 agtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaactt 30353500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 20768268 - 20768184
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatg 89  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20768268 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagt--aatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatg 20768184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498475
Alignment:
Q  58 ttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaactt 18498475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 408426 - 408559
Alignment:
Q  1 cgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||||    
T  408426 cgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatttcattttacaa 408524  T
Q  101 acagtggggtgttactcattacatttttgatgtta 135  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  408525 acggtaaggtgttactcattacatttttgatgtta 408559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 305 - 195
Alignment:
Q  18 gataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 117  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  305 gataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactc 206  T
Q  118 attacattttt 128  Q
    |  ||||||||    
T  205 acaacattttt 195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 94398 - 94526
Alignment:
Q  19 ataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| | |   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  94398 ataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactca 94497  T
Q  119 ttacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     |||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  94498 ctacaattttgatgttataatgttaactt 94526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 44144 - 43999
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  44144 gcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaa 44045  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  44044 caacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaactt 43999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 146014 - 146159
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||    
T  146014 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaa 146113  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
     | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  146114 taatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaactt 146159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 154643 - 154788
Alignment:
Q  2 gcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattgtacaaa 101  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  154643 gcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaa 154742  T
Q  102 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  154743 caacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaactt 154788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 267465 - 267331
Alignment:
Q  8 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactat-gagaattgaacttttgatgtcattgtac-aaacagt 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  267465 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatagag-actgaacttttgatgacactgtacaaaacagt 267367  T
Q  106 ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
     || ||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  267366 tggatgttactcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12095 - 11955
Alignment:
Q  3 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcgtgttaatctgatgagttgatgatactatgagaattgaacttttgatgtcattg-tacaaa 101  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||  || || ||||||    
T  12095 cttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccactgatacaaa 11996  T
Q  102 cagt-ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 141  Q
    || | |||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||    
T  11995 caatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgt 11955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 42439 - 42390
Alignment:
Q  98 caaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtgaactt 147  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42439 caaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 42390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University