View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13999_low_13 (Length: 470)

Name: NF13999_low_13
Description: NF13999
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13999_low_13
NF13999_low_13
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (23-448)||(3886356-3886781)
chr5 (119-442)||(3886908-3887231)
chr5 (119-429)||(189053-189363)
chr5 (126-441)||(2474378-2474693)
chr5 (119-448)||(22556935-22557265)
chr5 (143-448)||(22556502-22556808)
chr5 (119-416)||(8641886-8642182)
chr5 (119-415)||(34371611-34371907)
chr5 (124-441)||(2473932-2474239)
chr5 (143-415)||(17445330-17445602)
chr5 (160-448)||(1821872-1822160)
chr5 (116-415)||(42788494-42788793)
chr5 (119-415)||(34372067-34372363)
chr5 (188-415)||(21886066-21886293)
chr5 (119-415)||(34867789-34868073)
chr5 (119-415)||(2193815-2194099)
chr5 (151-420)||(8391205-8391473)
chr5 (143-415)||(10927278-10927550)
chr5 (160-415)||(27646727-27646982)
chr5 (125-415)||(15512869-15513160)
chr5 (160-420)||(20039367-20039626)
chr5 (151-400)||(18750079-18750328)
chr5 (192-415)||(10926870-10927093)
chr5 (143-414)||(18304431-18304702)
chr5 (151-404)||(29679990-29680236)
chr5 (157-441)||(30684445-30684729)
chr5 (119-360)||(20858393-20858633)
chr5 (160-419)||(39146934-39147186)
chr5 (157-441)||(30719694-30719978)
chr5 (136-414)||(24182114-24182391)
chr5 (119-430)||(2058508-2058819)
chr5 (132-334)||(11757145-11757347)
chr5 (242-415)||(42429145-42429317)
chr5 (338-442)||(22975080-22975184)
chr5 (118-284)||(30720110-30720276)
chr5 (160-286)||(8366594-8366719)
chr5 (160-414)||(1880081-1880330)
chr5 (124-420)||(4657852-4658144)
chr5 (134-412)||(16370578-16370852)
chr5 (124-193)||(21883941-21884010)
chr5 (118-270)||(30684861-30685013)
chr5 (242-378)||(32574632-32574767)
chr5 (162-243)||(187729-187810)
chr5 (164-244)||(38063725-38063804)
chr5 (161-415)||(5066781-5067038)
chr5 (300-409)||(11160713-11160822)
chr5 (263-365)||(4673466-4673568)
chr5 (216-285)||(4102925-4102994)
chr5 (299-412)||(43356651-43356762)
chr5 (153-269)||(5785990-5786106)
chr5 (242-290)||(39801025-39801073)
chr5 (304-336)||(39801498-39801530)
chr5 (119-206)||(11160605-11160692)
chr5 (146-201)||(21041405-21041460)
chr5 (162-269)||(26341169-26341276)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (124-448)||(30966200-30966524)
chr2 (119-448)||(30966656-30966985)
chr2 (119-448)||(24818292-24818620)
chr2 (152-448)||(29259504-29259800)
chr2 (119-448)||(5399668-5399997)
chr2 (119-419)||(25337848-25338148)
chr2 (117-378)||(33771037-33771298)
chr2 (119-415)||(33174957-33175251)
chr2 (160-415)||(16379392-16379647)
chr2 (144-413)||(16378938-16379207)
chr2 (182-419)||(41754284-41754521)
chr2 (164-378)||(8256562-8256776)
chr2 (160-419)||(1912520-1912778)
chr2 (151-415)||(25433939-25434203)
chr2 (215-415)||(11388188-11388386)
chr2 (163-415)||(15619897-15620149)
chr2 (226-415)||(29804681-29804870)
chr2 (119-412)||(30963114-30963407)
chr2 (144-415)||(33174504-33174772)
chr2 (166-415)||(1707041-1707289)
chr2 (130-442)||(30961745-30962064)
chr2 (119-282)||(32377758-32377921)
chr2 (215-378)||(11394571-11394732)
chr2 (160-415)||(27882818-27883073)
chr2 (119-448)||(82986-83312)
chr2 (118-367)||(15639781-15640030)
chr2 (127-308)||(32377575-32377756)
chr2 (165-424)||(1953145-1953403)
chr2 (136-370)||(13191018-13191252)
chr2 (151-405)||(30963603-30963857)
chr2 (226-414)||(38898870-38899058)
chr2 (264-415)||(18098874-18099025)
chr2 (136-404)||(8073902-8074170)
chr2 (260-387)||(20502050-20502176)
chr2 (135-365)||(16542034-16542263)
chr2 (304-415)||(18447954-18448065)
chr2 (161-242)||(8181254-8181335)
chr2 (119-190)||(29804871-29804942)
chr2 (157-266)||(18875874-18875983)
chr2 (160-222)||(36924373-36924435)
chr2 (151-206)||(20502172-20502227)
chr2 (271-404)||(9909102-9909235)
chr2 (143-220)||(11389677-11389754)
chr2 (143-220)||(11406338-11406415)
chr2 (311-403)||(8181394-8181486)
chr2 (299-363)||(36924453-36924519)
chr2 (236-357)||(26864785-26864905)
chr2 (135-376)||(37552606-37552844)
chr2 (132-284)||(3804249-3804401)
chr2 (157-204)||(26865142-26865189)
chr2 (160-199)||(38898817-38898856)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (117-443)||(2941606-2941932)
chr7 (127-448)||(13124994-13125316)
chr7 (127-448)||(9124925-9125246)
chr7 (127-440)||(18833260-18833573)
chr7 (118-415)||(28495853-28496150)
chr7 (119-415)||(2193255-2193551)
chr7 (119-415)||(36422251-36422546)
chr7 (124-415)||(2189143-2189434)
chr7 (137-415)||(42515543-42515821)
chr7 (151-448)||(42515058-42515355)
chr7 (143-415)||(34405466-34405738)
chr7 (118-415)||(6718925-6719221)
chr7 (113-415)||(28495464-28495755)
chr7 (119-378)||(2465960-2466218)
chr7 (118-318)||(7646328-7646528)
chr7 (144-415)||(22529111-22529382)
chr7 (160-419)||(679812-680071)
chr7 (276-448)||(11517397-11517568)
chr7 (127-330)||(13122363-13122567)
chr7 (160-415)||(35474013-35474268)
chr7 (144-419)||(2611535-2611803)
chr7 (159-431)||(5406478-5406751)
chr7 (119-448)||(25182328-25182656)
chr7 (194-374)||(2465773-2465953)
chr7 (151-420)||(29038903-29039172)
chr7 (119-417)||(6747457-6747747)
chr7 (119-315)||(7646514-7646710)
chr7 (160-419)||(29357348-29357606)
chr7 (207-415)||(46425740-46425947)
chr7 (157-296)||(43776179-43776318)
chr7 (217-415)||(35527070-35527268)
chr7 (160-415)||(31406481-31406731)
chr7 (151-296)||(3305231-3305376)
chr7 (324-448)||(13124757-13124881)
chr7 (162-420)||(9623202-9623459)
chr7 (151-390)||(26421643-26421882)
chr7 (213-411)||(1628719-1628914)
chr7 (230-410)||(20966055-20966235)
chr7 (119-234)||(43233137-43233252)
chr7 (261-414)||(36015404-36015557)
chr7 (278-426)||(31743834-31743982)
chr7 (293-415)||(43233412-43233534)
chr7 (314-415)||(26957603-26957704)
chr7 (160-364)||(11372501-11372697)
chr7 (250-378)||(26421287-26421415)
chr7 (151-211)||(6747959-6748019)
chr7 (119-223)||(36422573-36422677)
chr7 (157-379)||(37672195-37672417)
chr7 (137-201)||(26419104-26419168)
chr7 (161-292)||(37671654-37671785)
chr7 (276-378)||(16192355-16192457)
chr7 (144-205)||(7461258-7461319)
chr7 (330-415)||(3305374-3305459)
chr7 (55-102)||(4162602-4162649)
chr7 (236-384)||(6585638-6585787)
chr7 (119-178)||(43776321-43776380)
chr7 (160-206)||(31743781-31743827)
chr7 (317-376)||(2490077-2490136)
chr7 (310-420)||(33316721-33316832)
chr7 (160-206)||(36015361-36015407)
chr7 (261-342)||(7461344-7461424)
chr7 (235-284)||(30572413-30572462)
chr7 (322-378)||(16811900-16811956)
[»] chr4 (87 HSPs)
chr4 (134-448)||(35871594-35871907)
chr4 (118-448)||(23350127-23350457)
chr4 (144-448)||(44471195-44471499)
chr4 (127-442)||(49998608-49998923)
chr4 (113-448)||(44470714-44471048)
chr4 (182-415)||(12691907-12692140)
chr4 (119-415)||(50398383-50398679)
chr4 (119-378)||(7678467-7678726)
chr4 (119-415)||(24629281-24629574)
chr4 (144-415)||(1645619-1645890)
chr4 (119-415)||(4127739-4128030)
chr4 (160-415)||(23942675-23942930)
chr4 (119-415)||(50398839-50399134)
chr4 (164-415)||(9423748-9423999)
chr4 (119-365)||(23943087-23943333)
chr4 (119-415)||(31817699-31817993)
chr4 (127-448)||(14572007-14572324)
chr4 (119-415)||(3169205-3169501)
chr4 (119-415)||(51331128-51331422)
chr4 (132-415)||(4127276-4127578)
chr4 (151-415)||(21067281-21067545)
chr4 (134-448)||(27578317-27578627)
chr4 (124-415)||(1464146-1464436)
chr4 (119-430)||(13266070-13266381)
chr4 (226-415)||(24628929-24629121)
chr4 (179-348)||(50814730-50814899)
chr4 (160-420)||(14351789-14352049)
chr4 (149-443)||(8467688-8467966)
chr4 (157-379)||(27026538-27026759)
chr4 (160-393)||(21067755-21067985)
chr4 (160-431)||(27578795-27579066)
chr4 (214-415)||(21220272-21220472)
chr4 (235-448)||(15306052-15306270)
chr4 (137-365)||(17628560-17628788)
chr4 (174-421)||(17029323-17029570)
chr4 (157-431)||(41869901-41870175)
chr4 (255-448)||(14571702-14571895)
chr4 (162-431)||(17028858-17029126)
chr4 (151-415)||(29628531-29628808)
chr4 (162-420)||(13613786-13614043)
chr4 (249-415)||(53996090-53996256)
chr4 (160-284)||(27578172-27578296)
chr4 (159-370)||(33764904-33765115)
chr4 (175-354)||(20306063-20306241)
chr4 (131-285)||(14571545-14571699)
chr4 (257-360)||(27029331-27029434)
chr4 (130-239)||(15268029-15268138)
chr4 (252-415)||(31817376-31817539)
chr4 (151-378)||(23976095-23976323)
chr4 (144-420)||(52048547-52048813)
chr4 (119-211)||(35477863-35477955)
chr4 (173-412)||(4185717-4185956)
chr4 (151-274)||(40607071-40607194)
chr4 (117-243)||(31816981-31817107)
chr4 (168-412)||(24271445-24271690)
chr4 (237-403)||(43928927-43929092)
chr4 (151-243)||(7381438-7381530)
chr4 (242-431)||(17628951-17629139)
chr4 (231-341)||(23091468-23091578)
chr4 (151-219)||(4414264-4414332)
chr4 (185-296)||(11828396-11828507)
chr4 (299-408)||(45682209-45682318)
chr4 (160-285)||(53854733-53854858)
chr4 (186-431)||(26200205-26200444)
chr4 (265-365)||(44831046-44831146)
chr4 (266-357)||(4186224-4186315)
chr4 (253-376)||(42838661-42838787)
chr4 (242-360)||(34554483-34554601)
chr4 (325-415)||(53854858-53854948)
chr4 (119-184)||(50399334-50399399)
chr4 (144-197)||(53996000-53996053)
chr4 (157-209)||(5810039-5810091)
chr4 (119-191)||(13265859-13265931)
chr4 (367-431)||(33987164-33987227)
chr4 (344-415)||(10165953-10166024)
chr4 (160-318)||(33294778-33294936)
chr4 (298-336)||(39902477-39902515)
chr4 (293-411)||(53391890-53392008)
chr4 (202-267)||(50399270-50399335)
chr4 (233-309)||(52299826-52299902)
chr4 (315-410)||(17506389-17506484)
chr4 (350-448)||(20309594-20309689)
chr4 (144-199)||(33987019-33987074)
chr4 (130-201)||(34801230-34801301)
chr4 (160-198)||(2499388-2499426)
chr4 (362-416)||(35477801-35477855)
chr4 (351-423)||(2682707-2682779)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (119-448)||(10266-10594)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (116-440)||(107311-107635)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (119-441)||(31284127-31284449)
chr3 (119-448)||(8067246-8067575)
chr3 (117-419)||(28561741-28562042)
chr3 (119-419)||(39653159-39653459)
chr3 (124-406)||(11179890-11180172)
chr3 (127-448)||(27187188-27187510)
chr3 (119-415)||(16811380-16811674)
chr3 (124-415)||(13149955-13150246)
chr3 (119-415)||(32227072-32227368)
chr3 (119-370)||(13150405-13150656)
chr3 (117-415)||(50347745-50348043)
chr3 (129-379)||(32386595-32386845)
chr3 (119-415)||(16810924-16811220)
chr3 (119-415)||(32227500-32227795)
chr3 (161-419)||(30529682-30529939)
chr3 (119-415)||(14813948-14814244)
chr3 (119-448)||(25248077-25248407)
chr3 (119-415)||(14820153-14820449)
chr3 (151-414)||(20885000-20885263)
chr3 (214-448)||(41472267-41472500)
chr3 (144-414)||(25230124-25230394)
chr3 (144-414)||(25237711-25237981)
chr3 (151-414)||(25230588-25230851)
chr3 (151-414)||(25238175-25238438)
chr3 (144-431)||(7493864-7494151)
chr3 (114-415)||(37045034-37045332)
chr3 (144-429)||(7477176-7477461)
chr3 (151-362)||(4067243-4067454)
chr3 (160-370)||(25238576-25238786)
chr3 (162-448)||(41473963-41474249)
chr3 (144-415)||(2911094-2911354)
chr3 (226-415)||(39640936-39641125)
chr3 (218-375)||(29224363-29224520)
chr3 (151-378)||(25802431-25802658)
chr3 (174-415)||(25802910-25803151)
chr3 (261-415)||(25239070-25239224)
chr3 (151-325)||(53150695-53150869)
chr3 (343-448)||(12820610-12820715)
chr3 (151-342)||(3899872-3900063)
chr3 (119-212)||(41473743-41473836)
chr3 (160-354)||(15392570-15392764)
chr3 (160-354)||(15405606-15405800)
chr3 (276-415)||(32796943-32797082)
chr3 (160-354)||(15388203-15388397)
chr3 (160-354)||(15417431-15417625)
chr3 (160-354)||(15411015-15411209)
chr3 (381-448)||(32388844-32388911)
chr3 (160-387)||(31103850-31104079)
chr3 (119-367)||(26309840-26310088)
chr3 (144-211)||(25239003-25239070)
chr3 (162-354)||(15377344-15377536)
chr3 (160-354)||(15376056-15376250)
chr3 (160-201)||(25230989-25231030)
chr3 (242-381)||(47518296-47518432)
chr3 (160-209)||(18318860-18318909)
chr3 (173-272)||(32745994-32746093)
chr3 (166-284)||(26436022-26436140)
chr3 (262-324)||(43736715-43736777)
chr3 (157-221)||(26436241-26436305)
chr3 (297-342)||(3890050-3890095)
chr3 (326-411)||(45047071-45047156)
chr3 (217-285)||(15410630-15410698)
chr3 (158-198)||(36763837-36763877)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (119-448)||(105686-106015)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (119-422)||(18958-19261)
scaffold0322 (350-448)||(18203-18301)
[»] chr6 (61 HSPs)
chr6 (119-422)||(17027382-17027685)
chr6 (124-448)||(7912276-7912600)
chr6 (119-441)||(7911851-7912173)
chr6 (116-448)||(13492755-13493088)
chr6 (127-415)||(20850320-20850608)
chr6 (127-443)||(13191372-13191688)
chr6 (119-419)||(23776436-23776735)
chr6 (117-415)||(20896536-20896835)
chr6 (126-448)||(9352029-9352350)
chr6 (117-448)||(17730958-17731293)
chr6 (119-415)||(23986168-23986464)
chr6 (119-415)||(2681071-2681363)
chr6 (130-353)||(13492393-13492617)
chr6 (144-415)||(2890715-2890985)
chr6 (144-431)||(9440185-9440472)
chr6 (214-448)||(16519935-16520168)
chr6 (160-417)||(20126074-20126331)
chr6 (118-419)||(21311966-21312267)
chr6 (160-415)||(17850917-17851172)
chr6 (119-448)||(9440708-9441034)
chr6 (161-406)||(2720456-2720702)
chr6 (119-415)||(21311514-21311810)
chr6 (118-315)||(28780209-28780406)
chr6 (166-415)||(6330811-6331059)
chr6 (160-415)||(14771611-14771866)
chr6 (160-415)||(17851373-17851628)
chr6 (177-415)||(11062285-11062522)
chr6 (276-419)||(27334156-27334299)
chr6 (276-419)||(27394896-27395039)
chr6 (132-378)||(20735731-20735977)
chr6 (228-376)||(15929620-15929768)
chr6 (151-379)||(1991588-1991816)
chr6 (184-415)||(33774918-33775151)
chr6 (266-415)||(3652485-3652634)
chr6 (242-442)||(32292858-32293055)
chr6 (157-380)||(20732612-20732834)
chr6 (280-420)||(31821704-31821844)
chr6 (144-271)||(3652666-3652793)
chr6 (325-431)||(9440485-9440591)
chr6 (162-420)||(12194324-12194580)
chr6 (129-421)||(28582957-28583249)
chr6 (151-315)||(2891177-2891340)
chr6 (160-375)||(3884984-3885194)
chr6 (177-412)||(28065745-28065982)
chr6 (160-268)||(3653048-3653152)
chr6 (162-387)||(30729735-30729958)
chr6 (155-369)||(17205384-17205597)
chr6 (356-448)||(13490087-13490179)
chr6 (143-202)||(27334305-27334364)
chr6 (143-202)||(27395045-27395104)
chr6 (344-412)||(3652981-3653049)
chr6 (160-211)||(11062032-11062083)
chr6 (151-206)||(31415972-31416026)
chr6 (119-209)||(15929344-15929434)
chr6 (228-336)||(34660468-34660576)
chr6 (119-194)||(6331219-6331294)
chr6 (118-200)||(21312453-21312534)
chr6 (253-370)||(33470882-33470998)
chr6 (51-106)||(21246925-21246980)
chr6 (160-222)||(1663999-1664061)
chr6 (144-206)||(26380920-26380982)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (118-448)||(35759458-35759788)
chr1 (119-415)||(20054387-20054683)
chr1 (119-415)||(20054843-20055139)
chr1 (119-415)||(20055299-20055595)
chr1 (119-415)||(20055755-20056051)
chr1 (119-415)||(20056211-20056507)
chr1 (119-415)||(20057114-20057410)
chr1 (119-415)||(20053931-20054227)
chr1 (119-419)||(20057570-20057870)
chr1 (119-415)||(38340905-38341201)
chr1 (119-415)||(50002926-50003222)
chr1 (117-415)||(20845510-20845808)
chr1 (118-434)||(46693585-46693903)
chr1 (119-415)||(50002558-50002854)
chr1 (119-378)||(20056667-20056926)
chr1 (114-415)||(52250205-52250506)
chr1 (119-415)||(16451784-16452080)
chr1 (119-415)||(16460937-16461233)
chr1 (199-448)||(35760845-35761094)
chr1 (127-359)||(20060199-20060431)
chr1 (126-404)||(51372732-51373010)
chr1 (160-415)||(43057415-43057670)
chr1 (114-316)||(52250641-52250843)
chr1 (114-316)||(52250978-52251180)
chr1 (151-415)||(43056948-43057211)
chr1 (265-448)||(20061188-20061371)
chr1 (266-448)||(2328281-2328463)
chr1 (229-415)||(50002246-50002432)
chr1 (160-415)||(12883523-12883776)
chr1 (229-430)||(2634909-2635109)
chr1 (118-379)||(16907269-16907531)
chr1 (185-414)||(31822577-31822809)
chr1 (160-431)||(23180713-23180984)
chr1 (215-415)||(30872897-30873097)
chr1 (214-420)||(7548085-7548291)
chr1 (160-431)||(2634449-2634720)
chr1 (249-378)||(12728027-12728157)
chr1 (156-376)||(16410611-16410831)
chr1 (119-240)||(31822970-31823091)
chr1 (119-207)||(35759915-35760003)
chr1 (159-376)||(16440470-16440687)
chr1 (250-415)||(10820591-10820758)
chr1 (119-332)||(7229794-7230007)
chr1 (144-260)||(7547791-7547907)
chr1 (119-201)||(49996531-49996613)
chr1 (125-193)||(28181350-28181418)
chr1 (242-391)||(2739545-2739694)
chr1 (281-342)||(31823097-31823158)
chr1 (151-202)||(39582553-39582604)
chr1 (216-282)||(7067867-7067933)
chr1 (228-290)||(8278081-8278143)
chr1 (160-342)||(46411030-46411208)
chr1 (226-290)||(35009954-35010018)
chr1 (242-403)||(842907-843068)
chr1 (144-201)||(35168718-35168775)
chr1 (70-105)||(918330-918365)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (144-441)||(12100665-12100960)
chr8 (130-448)||(25147502-25147819)
chr8 (119-448)||(34308330-34308659)
chr8 (119-448)||(34308786-34309119)
chr8 (119-414)||(22548400-22548695)
chr8 (119-444)||(25147937-25148261)
chr8 (119-415)||(22548846-22549142)
chr8 (119-409)||(17103086-17103377)
chr8 (119-415)||(22026378-22026675)
chr8 (119-415)||(27022190-27022485)
chr8 (151-415)||(41658988-41659252)
chr8 (119-415)||(12827105-12827401)
chr8 (119-415)||(27925898-27926193)
chr8 (119-411)||(10844466-10844758)
chr8 (119-448)||(21315961-21316289)
chr8 (160-419)||(8080234-8080493)
chr8 (229-448)||(25144738-25144957)
chr8 (151-415)||(2044057-2044321)
chr8 (160-415)||(32292396-32292651)
chr8 (124-418)||(28453334-28453628)
chr8 (119-339)||(31283503-31283722)
chr8 (160-419)||(33852150-33852409)
chr8 (125-431)||(27819105-27819409)
chr8 (144-379)||(41913005-41913240)
chr8 (254-415)||(10844882-10845043)
chr8 (230-415)||(6464872-6465057)
chr8 (119-263)||(32292092-32292236)
chr8 (256-403)||(28375042-28375189)
chr8 (144-419)||(30527358-30527630)
chr8 (157-365)||(15818905-15819112)
chr8 (157-389)||(3744663-3744895)
chr8 (151-414)||(6466711-6466969)
chr8 (160-411)||(3745104-3745355)
chr8 (226-419)||(22840488-22840680)
chr8 (144-415)||(30334786-30335055)
chr8 (179-379)||(1297042-1297242)
chr8 (124-416)||(6466255-6466546)
chr8 (165-405)||(22705181-22705424)
chr8 (293-404)||(27021904-27022015)
chr8 (228-420)||(15567516-15567708)
chr8 (167-315)||(10729722-10729870)
chr8 (151-325)||(25307855-25308027)
chr8 (157-402)||(15567898-15568139)
chr8 (303-414)||(17429501-17429611)
chr8 (162-211)||(6463438-6463487)
chr8 (117-201)||(9251098-9251182)
chr8 (185-318)||(10729603-10729736)
chr8 (153-262)||(28374008-28374116)
chr8 (164-291)||(29971323-29971448)
chr8 (317-419)||(29971450-29971552)
chr8 (144-206)||(34688044-34688106)
chr8 (219-308)||(44041986-44042075)
chr8 (358-426)||(9250990-9251057)
chr8 (160-206)||(29117444-29117490)
chr8 (160-196)||(22840441-22840477)
chr8 (157-204)||(12119226-12119273)
chr8 (350-420)||(25307759-25307829)
chr8 (307-369)||(36968434-36968496)
chr8 (320-357)||(3508790-3508827)
chr8 (244-324)||(34687920-34688000)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (118-415)||(1219-1516)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (124-448)||(162533-162858)
scaffold0022 (116-318)||(163167-163369)
scaffold0022 (119-315)||(162985-163181)
scaffold0022 (119-379)||(69666-69926)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (119-435)||(2061-2377)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (143-415)||(1926-2198)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (119-415)||(2741-3037)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (124-415)||(154756-155047)
scaffold0002 (119-211)||(154505-154597)
[»] scaffold0333 (3 HSPs)
scaffold0333 (144-415)||(4560-4830)
scaffold0333 (119-415)||(5015-5315)
scaffold0333 (160-211)||(5325-5377)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (117-328)||(13382-13593)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (163-415)||(17493-17745)
scaffold0047 (160-419)||(18027-18285)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (127-448)||(245052-245369)
scaffold0005 (255-448)||(245481-245674)
scaffold0005 (131-285)||(245677-245831)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (118-315)||(14552-14749)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (299-448)||(142305-142454)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (116-271)||(1549-1704)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (116-365)||(2154-2394)
scaffold0557 (367-415)||(749-797)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (118-303)||(421-606)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (157-415)||(14740-14998)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (279-416)||(3993-4130)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (302-415)||(23672-23785)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (153-410)||(26074-26329)
scaffold0036 (151-296)||(16163-16307)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (160-354)||(44613-44807)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (303-414)||(45387-45497)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (144-285)||(7071-7211)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (160-218)||(37205-37263)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (129-191)||(62968-63030)
scaffold0065 (119-191)||(67214-67286)
[»] scaffold0442 (1 HSPs)
scaffold0442 (124-188)||(1-65)
[»] scaffold1138 (2 HSPs)
scaffold1138 (305-414)||(734-843)
scaffold1138 (293-331)||(271-309)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (214-298)||(246711-246795)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 448
Target Start/End: Original strand, 3886356 - 3886781
Alignment:
Q  23 ggccaagggttgagtgtcttaggacgacattcttgggttgagaaatactttacaaacatcttgggtagtgatatctcattagaacgaggatcaaagtgta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3886356 ggccaagggttgagtgtcttaggacgacattcttgggttgagaaatactttacaaacatcttgggtagtgatatctcattagagcgaggatcaaagtgta 3886455  T
Q  123 gcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttc 222  Q
     ||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3886456 acatcccagaatgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttc 3886555  T
Q  223 ccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgata 322  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3886556 ccggtaggtcacccatccaaaaattgctccacgtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgata 3886655  T
Q  323 taggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttg 422  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  3886656 taggtagtaccaaacaattcatataagcattccttctaccatgcagtcccatacttgtacgacctcaggatccctctcattccgatgtgattcaattttt 3886755  T
Q  423 cctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3886756 cctagaagcatgctaggagccggacc 3886781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 119 - 442
Target Start/End: Original strand, 3886908 - 3887231
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3886908 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttgtcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaa 3887007  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3887008 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagttaccgaaaagaagatgcatcttgtt 3887107  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3887108 gatataggtagtaccaaataattcatataagtcttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacggcctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 3887207  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagc 442  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  3887208 tttgcctaaaagcatgccaggagc 3887231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 119 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 189363 - 189053
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  189363 tgtaacatcccagactactttcaggattgcggactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaa 189264  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  189263 ctttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatacatcttgtt 189164  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  189163 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacatgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagt 189064  T
Q  419 tttgcctagaa 429  Q
    |||||||||||    
T  189063 tttgcctagaa 189053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 126 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2474693 - 2474378
Alignment:
Q  126 tcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttccca 225  Q
    |||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||| ||     
T  2474693 tcccagactgcttttaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttttcctcactcgcatgcttaccgggaaactttccg 2474594  T
Q  226 gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2474593 gtaggtcacccatctcaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 2474494  T
Q  326 gtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcct 425  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2474493 gtagtaccaaacaattcttttaagtcttccttcaaccatgcagtcccatatctgtacgaccttaggatctctctcattccgatgtgattcagtttttcct 2474394  T
Q  426 agaagcatgccaggag 441  Q
    ||||||||||||||||    
T  2474393 agaagcatgccaggag 2474378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22557265 - 22556935
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtctttt-cagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    |||| ||||||||||  | |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22557265 tgtaacatcccagacgacattcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttacagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaa 22557166  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22557165 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaggcacgcttaactgtgaagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 22557066  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcag 417  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  22557065 tgatattggtagtaccaaacaattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcatgaactctctcattccgatgtgattcag 22556966  T
Q  418 ttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22556965 ttttgccaagaagcatgccaggagccggacc 22556935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 143 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22556808 - 22556502
Alignment:
Q  143 gattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtctttt-cagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatcca 241  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||     
T  22556808 gattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttacagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcctggtaggtcacccatccc 22556709  T
Q  242 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataatt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22556708 aaaattgctccaagtcagccacgcttaactgtgaagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatt 22556609  T
Q  342 catataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggag 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22556608 catataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggag 22556509  T
Q  442 ccagacc 448  Q
    || ||||    
T  22556508 ccggacc 22556502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 119 - 416
Target Start/End: Original strand, 8641886 - 8642182
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  8641886 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaa 8641985  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8641986 cttccc-gtaggtcacccatcttaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 8642084  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8642085 gatataggtagtaccaaataattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggccttaggatccctctcattctgatgtgattca 8642182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 34371907 - 34371611
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  34371907 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 34371808  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34371807 cttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggtgttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 34371708  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  34371707 gatataggtagtaccaaacaattcttttaagcattccttcaaccatgcagtcccacacctgtacggccttgggaaccctctcattccggtgtgattc 34371611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 124 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2474239 - 2473932
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcc 223  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||           
T  2474239 catcccatactgcttttaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga------- 2474147  T
Q  224 cagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 323  Q
       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2474146 ---taggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatat 2474050  T
Q  324 aggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgc 423  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2474049 aggcagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtctcatgcctgtacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcagtttttc 2473950  T
Q  424 ctagaagcatgccaggag 441  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  2473949 ctaaaagcatgccaggag 2473932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 143 - 415
Target Start/End: Original strand, 17445330 - 17445602
Alignment:
Q  143 gattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaa 242  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  17445330 gattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatccca 17445429  T
Q  243 aaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattc 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17445430 aaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggatttcttatggaatgagctaccgataagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 17445529  T
Q  343 atataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17445530 ttataagccttccttcaaccatgtagtcccatgcctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattc 17445602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 160 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1822160 - 1821872
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  1822160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcattcacacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 1822061  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1822060 gcacgcttaaatgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 1821961  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1821960 accatgcagtctcatacctgcacgaccttaagatctctctcattccgatgtaattcaactttgcctagaagcatgccatgagccggacc 1821872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 116 - 415
Target Start/End: Original strand, 42788494 - 42788793
Alignment:
Q  116 aagtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactagg 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |    
T  42788494 aagtgtaacatcccagactgctttcaggattgtcgactgactccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcaagcttaccgag 42788593  T
Q  216 aaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatctt 315  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42788594 aaacttcccggtaggtcacctatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttgtggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 42788693  T
Q  316 gttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||  |||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42788694 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttctttcaaccatgtagtcccaatcctacacggcctcaggatccctctcattccgttgtgattc 42788793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 34372363 - 34372067
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||    
T  34372363 tgtaacattccagactgctttcaggattgccgactgacgccataaaccaacacgagtattttcagcgtgttttttcctcactcgcacgcttatcggaaaa 34372264  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34372263 cttcccggtaggtcaccaatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 34372164  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||| | ||||||||| | ||||||||    
T  34372163 gatataggtagtaccaaacaattcttttaagcattccttcaaccatgtagtcccatacttgtacggccttgggaaccctctcattctggtgtgattc 34372067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 188 - 415
Target Start/End: Original strand, 21886066 - 21886293
Alignment:
Q  188 ttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaa 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |    
T  21886066 ttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacacttaactttggagttcttatgga 21886165  T
Q  288 atgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacct 387  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21886166 atgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacaacct 21886265  T
Q  388 caggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  21886266 caggaaccctctcattccggtgtgattc 21886293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 34868073 - 34867789
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||           
T  34868073 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgacggatcccacaaatcaacacgagtctttttagcgtgttttgtccttacttgcacgcttac------- 34867981  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
         | ||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34867980 -----cggtaagtcacctatcccaaaattgctcaaagttaagcacgcttaactatggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 34867886  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  34867885 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 34867789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2194099 - 2193815
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           
T  2194099 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttac------- 2194007  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
         | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2194006 -----cggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 2193912  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | ||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  2193911 gatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcatgatccctctcattccggcgtgattc 2193815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 151 - 420
Target Start/End: Original strand, 8391205 - 8391473
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8391205 actgaccccacaaatcaacacgagtcttctcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttatcgagaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgct 8391304  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||     
T  8391305 ccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatacagg-agtaccaaacaattcttataagt 8391403  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttt 420  Q
    |||||||||| |||| |||| ||| |||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8391404 cttccttcaatcatgtagtctcatgcctacacggcctcagaatccctctcattccgatgtgattcggttt 8391473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 143 - 415
Target Start/End: Original strand, 10927278 - 10927550
Alignment:
Q  143 gattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaa 242  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  10927278 gattgtcgaccgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcattcacacgcttaccgaaaaacttcccggtcggtcacccatccaa 10927377  T
Q  243 aaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattc 342  Q
    | | | |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10927378 agactactccaagtcaagcacgtttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 10927477  T
Q  343 atataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10927478 ttataagccttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattc 10927550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Original strand, 27646727 - 27646982
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||| |||    
T  27646727 acaaaccaacatgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgtttattgggaaacttcccggtaggtcacccatgcaaagactactccaagacaa 27646826  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27646827 gcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgttataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 27646926  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||| || |||||||||  ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27646927 accatgtagccccatacctacacggccctaggatccctctcattccgatgtgattc 27646982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 125 - 415
Target Start/End: Original strand, 15512869 - 15513160
Alignment:
Q  125 atcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttccc 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15512869 atcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtattttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttccc 15512968  T
Q  225 agtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatata 324  Q
     |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||     
T  15512969 ggtaggtcatccatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgtttaattgtggagttcttatggaatgagataccaaaaagaagatgcatcttgttgatatt 15513068  T
Q  325 ggtagtaccaaataattcatataagc--cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  15513069 ggtagtacc-aacaattcttataagcatattccttcaaccatgtagtcccatacctacacagcctaatgatccctctcattccgatgtgattc 15513160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 160 - 420
Target Start/End: Original strand, 20039367 - 20039626
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| | | ||| |||||||    
T  20039367 acaaaccaacatgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccaataggtcaccaatccaaagactactctaagtcaa 20039466  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||| ||||||| |  |||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20039467 gcacacttaactgtagagttcttatggaatgggctac-caaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 20039565  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttt 420  Q
    || ||| ||||| ||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20039566 actatgtagtcctatacctacacggcctcatgatccctctcattccgatgtgattcggttt 20039626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 151 - 400
Target Start/End: Original strand, 18750079 - 18750328
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  18750079 actgaccccacaaaccaactcgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacactttctaaaaaacttcctagaaggtcacccatcctaaaattgct 18750178  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  18750179 ccaagtcaagtacgattaattatggagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatctttttggtataggtagtaccaaacaattgttataatc 18750278  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctc 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  18750279 cttccttcaaccatgcagttccaaacctgcacgacttcaggatctctctc 18750328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 192 - 415
Target Start/End: Original strand, 10926870 - 10927093
Alignment:
Q  192 gtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatga 291  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||     
T  10926870 gtcctcactcacacgcttaccaggaaacttcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgtttaactgtggagttcttatggaatgg 10926969  T
Q  292 gctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcagg 391  Q
     ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  10926970 actaccaaaaggaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacgacctcagg 10927069  T
Q  392 atcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||    
T  10927070 atccctctcattctgatgtgattc 10927093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 143 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18304702 - 18304431
Alignment:
Q  143 gattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaa 242  Q
    ||||| || |||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||  |||||||| ||  ||||||||||||  |    
T  18304702 gattgccatctgaccccagaaatcaacacgagtttgttcagcgtgttttgtcctcactcgcacaatttctgtgaaacttctcaaaaggtcacccatcaca 18304603  T
Q  243 aaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattc 342  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || | |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18304602 aaattgctccaagtcaaacatgcttaactgtggaattcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattt 18304503  T
Q  343 atataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  18304502 atataagcttttcatcatccatgtagtcccatacctacacgacctcaggatccttctcattccgttgtgatt 18304431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 151 - 404
Target Start/End: Original strand, 29679990 - 29680236
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   ||||||||| | | |||||||||||||||| | | ||    
T  29679990 actgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcatttgcacgcttatcgggaaacttctcggaaggtcacccatccaaagactact 29680089  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||    
T  29680090 ccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatgtaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtattacca-------cttataagc 29680182  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattc 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||    
T  29680183 cttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaagatctctctcattc 29680236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 157 - 441
Target Start/End: Original strand, 30684445 - 30684729
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagt 256  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||     |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30684445 cccacaaatcaatatgagtctttttagtatattttgtccttactcgcacgcttttcgagaaacttttcagaaggtcacccatcccaaaattgctccaagt 30684544  T
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcct 356  Q
      ||||||||||||| || ||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  30684545 tgagcacgcttaactgtggagttcttatggtttgacctaccgaaaagaagatgcatcttgtttttatagatagtaccaaacaattcatataagcctccct 30684644  T
Q  357 tcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggag 441  Q
    ||||| |||  || |||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  30684645 tcaacaatgatgttccatacttgcacaacctcaggatccccctcattccgatgtgatttggttttgcctataagcatgccaggag 30684729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 119 - 360
Target Start/End: Original strand, 20858393 - 20858633
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   || |||    
T  20858393 tgtaacatcccaaacttctttcaggattgtcgactgacctaacaaatcaacacgagtattttcagcgtgttttgtcctcactagcatgcttttcagaaaa 20858492  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20858493 cttcccagaaggtcacc-atcccaaagttgctccaagtcaagcaaccttaactatggagttcttatggaatgagctacagaaaagaagaagcatcttgtt 20858591  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaa 360  Q
    |||||||  | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  20858592 gatatagaaaataccaaacaattcttataagcctttcttcaa 20858633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 160 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 39147186 - 39146934
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||  |  | | |||||||||||    
T  39147186 acaaaccaacatgagtctttctagcgttttttgtcctctctcgcacgcttact-------ttcccagtaggtcacccatcatacgactactccaagtcaa 39147094  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||| || ||||||    
T  39147093 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttaatataagtagtatcaaacaattcttataagtctaccttca 39146994  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39146993 accatgtagtcccatacctacacggcctcatgatccctctcatttcgatgtgattcagtt 39146934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 157 - 441
Target Start/End: Original strand, 30719694 - 30719978
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagt 256  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||   | |||||||   || | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30719694 cccacaaattaatacgagtctttttagtatgttttgttctctctcgcacgcttttcaagaaactttttagaatgtcacccgtcccaaaattgctccaagt 30719793  T
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcct 356  Q
      ||||||||||| | || ||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30719794 tgagcacgcttaattgtggagttcttatggtttgacctaccgaaaagaagatgcatcttgtttttataggtagtaccaaacaattcatataagccttcct 30719893  T
Q  357 tcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggag 441  Q
    ||||| |||  ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| || ||||||    
T  30719894 tcaacaatgatgtcccatacttgcacaacctcaggatccctctcattctgatgtgattcggttttgccaataagcgtgtcaggag 30719978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 414
Target Start/End: Original strand, 24182114 - 24182391
Alignment:
Q  136 ctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacc 235  Q
    |||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||   || ||||||||    
T  24182114 ctttcaggattgtcgactaaccccacaaaccaacacgaatcttttcaacgtgttttatcctcactcgcacactttccgagaaactttttagaaggtcacc 24182213  T
Q  236 catccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||   || | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24182214 catcccaaaattgctccaagtcaaccacgcttaactgttaagttattatggtttggggtaccg-aaagaagatgcatcttgttggtatagatagtaccaa 24182312  T
Q  336 ataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||||| || |||  |||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  24182313 ataattcttataagccttccttcaaccatttcgtctcatacttgcacgttctcaagatccctctcattctaatgtgatt 24182391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 430
Target Start/End: Original strand, 2058508 - 2058819
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatccc-acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    |||| |||| || |||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||  || |||||| ||||||| |||| ||    |||     
T  2058508 tgtaacatctcaaactgctttcaggattgtctattgacccccacaaactaacacgagttttttcaatgtattttgtactcactcacacgtttttcgggag 2058607  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaa-gttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttg 316  Q
    |||||  || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |   | | | || ||||||||| |||| |||| | || ||||  |||||||||    
T  2058608 acttcttagaaggtcactcatcccaaaattgctccaagtcaagcatcc---agtctcaaagttcttatggaatgtgctatttaacagaatttgcatcttg 2058704  T
Q  317 ttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattca 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  2058705 ttgatataggtagtaccaaacaattcatataagtcttccttcaatcatccagtctcatagctgcatgacttcaggatctctctcaatccgatgtgattcg 2058804  T
Q  417 g-ttttgcctagaag 430  Q
    | |||||||||||||    
T  2058805 gtttttgcctagaag 2058819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 334
Target Start/End: Original strand, 11757145 - 11757347
Alignment:
Q  132 actgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggt 231  Q
    |||||||| | ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||    ||| ||||| ||||||    
T  11757145 actgcttttaggattgccgactgaccccgcaaaccaacaagagtcttttaagcggatttcgtcctcactcacacgcttaccgaaaaatttcccggtaggt 11757244  T
Q  232 cacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagta 331  Q
    ||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11757245 cacccatctcgaaattgctgtaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggattgaactaccgaaaagaagatgcattttgttgatataagtagta 11757344  T
Q  332 cca 334  Q
    |||    
T  11757345 cca 11757347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 42429317 - 42429145
Alignment:
Q  242 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataatt 341  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  42429317 aaaattgctttaagtcaagcacccttaactatgaagttcttatgtaacgggctacggaaaagaatatgcatattgttgataaaggtagtaccaaacaatt 42429218  T
Q  342 catataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    | |||||| | |||||||||||||   || |||||||  |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42429217 cttataagtcctccttcaaccatgtgttcacatacctacacggtctcaggatc-ctcttattccgatgtgattc 42429145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 338 - 442
Target Start/End: Original strand, 22975080 - 22975184
Alignment:
Q  338 aattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgcca 437  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22975080 aattcttataagcttttcttcaaccatgcagtcacatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgcca 22975179  T
Q  438 ggagc 442  Q
     ||||    
T  22975180 agagc 22975184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 284
Target Start/End: Original strand, 30720110 - 30720276
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||    
T  30720110 gtgtaacatcccagactgctttcaagattgtcgattgactccacaaaccaacaggagtcttttcagcgtgttttgtcctcgctcgcacgctt-ttcggaa 30720208  T
Q  218 a-cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttat 284  Q
    | ||| | || | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  30720209 agctttcaagaaagtcatccatcccaaaattgttccaagtcaagcacgattaactgtagagttcttat 30720276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8366719 - 8366594
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  8366719 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcgtcactcac-cgcttattggaaaacttcccagtaggtcacccatccaaatactacttcaaatcaa 8366621  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatga 286  Q
     |||||||||||||  |||||||||||    
T  8366620 acacgcttaactatagagttcttatga 8366594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 1880330 - 1880081
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||| |||| | ||||||| ||| | |||| |||     
T  1880330 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgctcgcttaccataaaacttcctagtaagtcatctatccaaatattacaccaactcat 1880231  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || |||   ||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||   | ||||| ||     |||||||||    
T  1880230 gcacgcttaactgtagagttcttgtggaatagactaccaaaaagaatatgcat-ttgttaatataggaagtactggacaattctta----acttccttca 1880136  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||  |||  |||| ||||||||| | |||||||    
T  1880135 accatgcagtcacataactgcacggtctcgagatccctctcattctggtgtgatt 1880081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 420
Target Start/End: Original strand, 4657852 - 4658144
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcc 223  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||   || |||||| |    
T  4657852 catcccaaacttctttcacgattgttgaccgatcccacaaatcaaca--agtcttttcagcgtattttgtccttacttgcatgtttttcagaaaactttc 4657949  T
Q  224 cagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 323  Q
    |   | ||||||||| | |||||   || |||||||||| | | |||| ||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||| |||||| |||    
T  4657950 ccaaatgtcacccattccaaaatatatctaagtcaagcatgat-aactgtgaagttcttatggaatggactaccaaaaagaagatgcatgttgttgttat 4658048  T
Q  324 aggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttt 420  Q
    |||||||| |||| || || |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||| |||   ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  4658049 aggtagtatcaaacaagtcttataa-tcttcgttcaaccatgaagtctcatacctgcacggtttcaagatccctcttatttcgatgtgattcagttt 4658144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 412
Target Start/End: Original strand, 16370578 - 16370852
Alignment:
Q  134 tgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtca 233  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| | ||||   | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||  |  |||||||  ||| | ||||    
T  16370578 tgcttttaggattgtcaactga-cccacatatcaacgtaaatcttttcagtgtgttttttcctcattcgcacgctttatgagaaacttttcagaatgtca 16370676  T
Q  234 cccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacc 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||  |  ||||| ||  |    |||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  16370677 cccatcccaaaattgctccaagtcaaacatgcttaactgcggggttctgatttag---gctaccaaaaagaagatacgtcttgttgatataagtagtacc 16370773  T
Q  334 aaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtga 412  Q
    ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||  | | | |||||| | |||||||| ||||||||    
T  16370774 aaacaattcttataagttttccttcaaccatgcagtcttatacctacatggcatcaggaaccctctcatttcgatgtga 16370852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Original strand, 21883941 - 21884010
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgt 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21883941 catcccagactgctttcaagattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgt 21884010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 270
Target Start/End: Original strand, 30684861 - 30685013
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| |||| || |||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    | ||    
T  30684861 gtgtaacatctcaaactgctttcaagattgccgattgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcgcttgcacgcttttcggaaa 30684960  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaac 270  Q
    |||| | || | |||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30684961 actttcaagaaagtcatccatctcaaaattgttccaagtcaagcacacttaac 30685013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 378
Target Start/End: Original strand, 32574632 - 32574767
Alignment:
Q  242 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataatt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    || |||||  |||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  32574632 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttattatagtttgggctaccaaaagaaagatgcattttgtttgtataggtagtaccaaacaatt 32574731  T
Q  342 catataagccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
    | |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  32574732 cctataagcctt-ctttaaccgtgcagtctcatacct 32574767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 187810 - 187729
Alignment:
Q  162 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  187810 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttctcagtatgtcacacattcaaa 187729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Original strand, 38063725 - 38063804
Alignment:
Q  164 accaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaa 244  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38063725 accaacacgagt-ttttcagcgtattttgtcctcattcgcacgcttaccggaaaacttcccagtaggtcacccatccaaaa 38063804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 415
Target Start/End: Original strand, 5066781 - 5067038
Alignment:
Q  161 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatcca----aaaattgctccaagt 256  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |  |||||| | | ||| |||  ||||||    || | | |||||||     
T  5066781 caaaccaacatgaatcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacgtttatcaaaaaactttcaa-tagatcattcatccattcaaagactactccaagg 5066879  T
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcct 356  Q
    ||| |||| |||| | || |||| |||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  5066880 caaacacgtttaattgtggagtttttatgaaatagactaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatatagataataccaaacaattcttataagttttcct 5066979  T
Q  357 tcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    | || ||| ||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  5066980 ttaatcatacagtctcatacatgcacggcctcgggatctctctcattctggtgtgattc 5067038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 409
Target Start/End: Original strand, 11160713 - 11160822
Alignment:
Q  300 aaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactct 399  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| ||| |||| ||||    
T  11160713 aaagaatatgcatcttgttgacatagatagtaccaaacaattattataagccttccttcaactatgtagtgtcatacctacacgacttcatgatccctct 11160812  T
Q  400 cattccgatg 409  Q
    ||||||||||    
T  11160813 cattccgatg 11160822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 263 - 365
Target Start/End: Original strand, 4673466 - 4673568
Alignment:
Q  263 cgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaacc 362  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||  |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  4673466 cgcttaactgtggagttcttatggaatgaaataccaaaaagaatatgcatcttgttgatacaggtgctaccaaataattcttataagacttccttcaatc 4673565  T
Q  363 atg 365  Q
    |||    
T  4673566 atg 4673568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4102994 - 4102925
Alignment:
Q  216 aaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatg 285  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4102994 aaacttctcagaaggtcactcatctcaaaattgctccaagtcaagcacgtttaactgtgaagttcttatg 4102925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 412
Target Start/End: Original strand, 43356651 - 43356762
Alignment:
Q  299 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactc 398  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||| | || ||||||| | |||    
T  43356651 aaaagaagatgcatattgttggtttaggttgtaccaaacaattcttataagtcatcc-tcaatcatgcagtctcatacctgcatgatctcagga-ccctc 43356748  T
Q  399 tcattccgatgtga 412  Q
    ||||||||||||||    
T  43356749 tcattccgatgtga 43356762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5786106 - 5785990
Alignment:
Q  153 tgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctcc 252  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||| |   ||  |   |||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  5786106 tgatcctacaaaccaatacgagtcttttcaatgtgttttgtcctcattcgtataattttttaaaaactttccagaagatcactcatcctaaaattgctcc 5786007  T
Q  253 aagtcaagcacgcttaa 269  Q
    ||||||| |||||||||    
T  5786006 aagtcaaacacgcttaa 5785990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 290
Target Start/End: Original strand, 39801025 - 39801073
Alignment:
Q  242 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatg 290  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39801025 aaaatttctccaagttaagtacgtttaactatgaagttcttatgaaatg 39801073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 336
Target Start/End: Original strand, 39801498 - 39801530
Alignment:
Q  304 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39801498 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 39801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 206
Target Start/End: Original strand, 11160605 - 11160692
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 206  Q
    |||| |||| || |||||||| | ||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  11160605 tgtaacatctcaaactgcttttatgattgtcgactaattccataaattaacacgagtcttttcaacgtgttttgttctcacttgcacg 11160692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 201
Target Start/End: Original strand, 21041405 - 21041460
Alignment:
Q  146 tgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 201  Q
    |||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21041405 tgtcaactgaccacacacaccaactcgagtcttttcagcatgttttgtcctaactc 21041460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 269
Target Start/End: Original strand, 26341169 - 26341276
Alignment:
Q  162 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagc 261  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| || | || || ||||| ||  ||  |||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  26341169 aaaccaacaccagtcttttagacgtgttttgtcctcactcacatgttttctgggaaatttttcaaaaggtcacccatccaaagactactccaaatcaagc 26341268  T
Q  262 acgcttaa 269  Q
    || |||||    
T  26341269 acacttaa 26341276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 124 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30966524 - 30966200
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcc 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  30966524 catcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaaacttcc 30966425  T
Q  224 cagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 323  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30966424 cggtaggtcacccatcccaaaattggtccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaatgagataccgaaaagaagatgcatcttgttgatat 30966325  T
Q  324 aggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgc 423  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30966324 aggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgcgattcagttttgc 30966225  T
Q  424 ctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  30966224 ctagaagcatgccaggagccggacc 30966200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30966985 - 30966656
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  30966985 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgactccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaa 30966886  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30966885 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagttaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 30966786  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30966785 gatataggtagtaccaaacaattcttataatccttccttcaaccatgcagtcccatacatgtacggcctcaggatccctctcattccgatgcgattcagt 30966686  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30966685 tttgcctagaagcatgccaggagccggacc 30966656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24818620 - 24818292
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||| |||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24818620 tgtaacatccccgactactttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaggaaa 24818521  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24818520 cttcccggtaggtcacccatccaaaa-ttgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgtt 24818422  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24818421 gatataggtagtactaaacaattcttataagccttccttgaaccatgcagtcccatacatgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagt 24818322  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24818321 tttacctagaagcatgccaggagccggacc 24818292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 152 - 448
Target Start/End: Original strand, 29259504 - 29259800
Alignment:
Q  152 ctgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29259504 ctgatcccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctc 29259603  T
Q  252 caagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagcc 351  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||    
T  29259604 aaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattttaataagcc 29259703  T
Q  352 ttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29259704 ttccttcaaccatgcagtcccatacttgtacggtctcaggatccctctcattccgatgtgattcagtcttacctagaagcatgccaggagccggacc 29259800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Original strand, 5399668 - 5399997
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||    
T  5399668 tgtaacatcccagactgcttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacaagtctttccagcgtgttttgttctcactcgcacgcttaccggaaaa 5399767  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5399768 cttcctggtaggtcacccatcccaaaatttctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 5399867  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5399868 gatataggtagtaccaaacaattcttataagcctcccttaaaccatacactcccatacttgcacgacctcaagatccctctcattccgatgtgattcaat 5399967  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5399968 tttgcctagaagcatgccaggagccggacc 5399997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 119 - 419
Target Start/End: Original strand, 25337848 - 25338148
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  25337848 tgtaacatctcagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaa 25337947  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25337948 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgtt 25338047  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  25338048 gatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacgacctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagt 25338147  T
Q  419 t 419  Q
    |    
T  25338148 t 25338148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 117 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33771298 - 33771037
Alignment:
Q  117 agtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactagga 216  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  |||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  33771298 agtgtaacatcccagattgctttcagaattgccggctgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccggga 33771199  T
Q  217 aacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttg 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33771198 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 33771099  T
Q  317 ttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33771098 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctttcttcaaccctgcagtcccatacct 33771037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 33175251 - 33174957
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  33175251 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccctacaaactaacacgagtctttccagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaat 33175152  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
     ||||| ||||||||||||||  || | | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33175151 -ttcccggtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaa-cacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 33175054  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33175053 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 33174957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16379647 - 16379392
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16379647 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacagtgaaacttcccggtaggtcacccatccaaagattactccaagtcaa 16379548  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
     ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  16379547 acacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcgtataagtcttccttca 16379448  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  16379447 accatgcagtcccatacctgcacggcctcgggatccctctcattccaatttgattc 16379392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 144 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16379207 - 16378938
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16379207 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacccggaaacttcccgataggtcacccatccaaa 16379108  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  16379107 gactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcg 16379008  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgat 413  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | ||| ||||||||||| ||||||    
T  16379007 tataagacttccttcaaccatgcagtctcatacttgcacggcctcggaatccctctcattccggtgtgat 16378938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 182 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41754521 - 41754284
Alignment:
Q  182 agcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41754521 agcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaactttccggtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttct 41754422  T
Q  282 tatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgta 381  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41754421 tatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgca 41754322  T
Q  382 cgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    || ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41754321 cggcctcaagaaccctctcattccggtgtgattcagtt 41754284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 164 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8256776 - 8256562
Alignment:
Q  164 accaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcac 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8256776 accaacatgagtcttttcagcgtattttgtcctcactcgcacgcttatcggaaaacttcccagcaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcac 8256677  T
Q  264 gcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaacca 363  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8256676 gcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaacca 8256577  T
Q  364 tgcagtcccatacct 378  Q
    || ||||||||||||    
T  8256576 tgtagtcccatacct 8256562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 160 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1912778 - 1912520
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||||    
T  1912778 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 1912679  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
     ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || | ||||    
T  1912678 tcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctac-caaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaatctactttca 1912580  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    |||||| |||| |||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1912579 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 1912520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 151 - 415
Target Start/End: Original strand, 25433939 - 25434203
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||| |   ||    
T  25433939 actgaccctacaaaccaacacgaatcttttcagcgtgttttgtccttactcacacgcttaccagaaaacttccctgttggtcacccatccaaagaccact 25434038  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||   |||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  25434039 ccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccagaaaggagatgcatcttgttgataaaggttgtatcaaacaattcttataagc 25434138  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25434139 cttccttcaaccatgaagtcccataccagcacggcctcaggatccctctcattccggtgtgattc 25434203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 215 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 11388386 - 11388188
Alignment:
Q  215 gaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatct 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11388386 gaaacttcctagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatct 11388287  T
Q  315 tgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||| |||| |||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11388286 tgttgatataggtagtaccaaacaatt-ttttaagcattccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcatcaggatc-ctctcattccgatgtgatt 11388189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 163 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15620149 - 15619897
Alignment:
Q  163 aaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  15620149 aaccaacacgagtcttttcagcgagttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcccagtaggtcacccatccaaagactactcaaagtcaagca 15620050  T
Q  263 cgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaacc 362  Q
    ||||||| | || |||||||||| | || | | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||     
T  15620049 cgcttaattgtggagttcttatggattgggtttccaaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcttgccttcaact 15619950  T
Q  363 atgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||| ||||| || ||| | || ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  15619949 atgcagtctcatacttgcacggcatcgggatccctctcattctgatgtaattc 15619897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 226 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 29804870 - 29804681
Alignment:
Q  226 gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29804870 gtaggtcaaacatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 29804771  T
Q  326 gtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29804770 gtagtacccaacaattcttataagcctgccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 29804681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 412
Target Start/End: Original strand, 30963114 - 30963407
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||| | |||||||||| ||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  30963114 tgtaacatccaaaactgctttcatgattgccgattgacctcacaaaccaacacgagtcttttcaacgtattttatcctcactcgcacgctttccgagaaa 30963213  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||  || |||||  |||| |||||||||||||||    
T  30963214 cttccaagaaggtcactcatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgttgaattcttatgatttgggctaccaaaaataagatgcatcttgtt 30963313  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtga 412  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||| || | ||| |||| ||||||||| |||||||    
T  30963314 gatataggtagtacctaacaattcttataagccttccttcaatcatgcattcatatacatgtgcggcttcatgatccctctcattctgatgtga 30963407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 33174772 - 33174504
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||  ||||| ||| ||||||||||  ||    
T  33174772 attgtcgactgaccctacaaacaaacacgggtctttctagcatgttttttcctaactcgcacgcttaccgggaat-ttcccggtatgtcacccatcataa 33174674  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  33174673 gactactccaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 33174574  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33174573 tataagccttccttcaac--tgtagtcccatacctacacggcatcaggatccctctcattccgatgtgattc 33174504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 166 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1707289 - 1707041
Alignment:
Q  166 caacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgc 265  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| | | || |||||||| ||| |    
T  1707289 caacgcgaatctttttagcgtgttttgtattcactcgcacgcttaccgggaaacttcctggtaggtcacccatccaaagactacttcaagtcaaacactc 1707190  T
Q  266 ttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatg 365  Q
    |||||| || ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  1707189 ttaactgtggagttcttatgagatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaatcatg 1707090  T
Q  366 cagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     |||| |||||||  ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1707089 tagtctcatacctacacagtctcaggatc-ctctcattccgatgtgattc 1707041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 130 - 442
Target Start/End: Original strand, 30961745 - 30962064
Alignment:
Q  130 agactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtag 229  Q
    ||||| |||||| ||||| | | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||| ||    
T  30961745 agactcctttcatgattgccgattgaccccacaaactaacacaagtcttttcactgtgttttgtcctcactcgcacgctttctgagaaactacccagaag 30961844  T
Q  230 gtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 329  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||   |  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30961845 gtcacccatcccaaaattgctctaagtcaagcacgtttaactgtggagttcttatggtttcggctaccgaaaaaaatatgcatcttgttgatataggtag 30961944  T
Q  330 taccaaataattcatataagcct--------tccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtttt 421  Q
    ||||||  || || |||||| ||        ||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||    
T  30961945 taccaatcaaatcttataagacttccttaaatccttcaaccatgcaatcccatacctacacggcttcaggatctctctcattctgatgtgattcgatttt 30962044  T
Q  422 gcctagaagcatgccaggagc 442  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  30962045 tcctagaagc-tgccaggagc 30962064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 119 - 282
Target Start/End: Original strand, 32377758 - 32377921
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  32377758 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaa 32377857  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttctt 282  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  32377858 cttcccagtagatcacccatcccaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttctt 32377921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 215 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11394732 - 11394571
Alignment:
Q  215 gaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatct 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11394732 gaaacttcctagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaat-agctaccgaaaagaagatgcatct 11394634  T
Q  315 tgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  11394633 tgttgatataggtagtaccaaacaatt-ttttaagcattccttcaaccatgtagtctcatacct 11394571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Original strand, 27882818 - 27883073
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    ||||||| |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||    
T  27882818 acaaaccaacaagattcttttcagcgtgttttgtcctgacttgcacacttaccgaaaaacttctcagtaggtcacctatccaaagactactccaagtcaa 27882917  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
     ||||||||| | || |||||||||| || |  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27882918 acacgcttaattgtggagttcttatggaacggcctacaaaaaagaagatgcatcttattgatatagataataccaaacaattcttataagcattccttca 27883017  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    || |||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27883018 acaatgcagtctcatacatgcacggcctcaggatccctctcatttcggtgtgattc 27883073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 83312 - 82986
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||| |||||| |||||| ||||| | | | | ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||   |||    
T  83312 tgtaacatctcagactactttcatgattgccgaataaccccacaaaccaacataagtcttatcaacgtgttttgtcctcactcgcacactttctgaaaaa 83213  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
     | |||   |||||||  |||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  83212 ttaccctaaaggtcacatatcacaaaattgttccaaatcaaacacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaaaaagattcatcttgtt 83113  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    | ||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  83112 ggtataggtagtaccaaacgattcttataagcataccttcaaccatgtagtctcatacctgcacaatctcaggatccctctcatttcgacgtgattcag- 83014  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  83013 -ttgcctagaagc-tgccaggagccagacc 82986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15640030 - 15639781
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| ||||||||||  |||| |  |||| | ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  15640030 gtgtaacatcccagacgactttaagcattgccgactgaccctaccaaccaacacgagtcttttctgcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgagaa 15639931  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | || ||||||| || | || | | |  ||||||||||| || ||||    
T  15639930 acttcccagtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaattgtggagttcttgtggattgggtttccaaaaagaagatgtatgttgt 15639831  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgca 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  15639830 tgatataggtagtaccaaacaattcctataagcgtgccttcaactatgca 15639781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 127 - 308
Target Start/End: Original strand, 32377575 - 32377756
Alignment:
Q  127 cccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccag 226  Q
    ||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| || |    
T  32377575 cccagactgcttttaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaactttccgg 32377674  T
Q  227 taggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagat 308  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  32377675 taggtcacctatcccaaaattgctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttttggaatgagctaccgaaaacaagat 32377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 165 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1953403 - 1953145
Alignment:
Q  165 ccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacg 264  Q
    |||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||  ||| ||  || |||||| |  |||| |||||||| ||||| || | |||| ||||| |    
T  1953403 ccaacatgagttttttca-cgtattttgtcctcactcgcatactttctgagatacttcctaaaaggtaacccatcccaaaatagcgcaaagttaagcatg 1953305  T
Q  265 cttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccat 364  Q
    |||||| |||||||  |||||   ||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  1953304 cttaaccatgaagtaattatggtttggactaccaaaaagaagatgcatctagttgatataggtagtaccaaacaattcttataggtcttccttcaaccat 1953205  T
Q  365 gcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcc 424  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1953204 gcagtctcatacctgcacgacttcaggatccctctcattccgatgtgattcggttttgcc 1953145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13191252 - 13191018
Alignment:
Q  136 ctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacc 235  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||  |  ||||||| |||| ||||||||    
T  13191252 ctttcaagattgtcgactgactccataaaccaacactagtctttttagcgtgttttgtccgcattcacacgctttttgagaaactttccagaaggtcacc 13191153  T
Q  236 catccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 335  Q
     |||  |||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13191152 tatctcaaaatttcttcaagtcaagcacacataactatggagttcttataaaatggactaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaa 13191053  T
Q  336 ataattcatataagccttccttcaaccatgcagtc 370  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13191052 acaattcttataagtcttccttgaaccatgcagtc 13191018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 405
Target Start/End: Original strand, 30963603 - 30963857
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |    |||||||| || |||||||| |||| |||| | |     
T  30963603 actgatcccacaaaccaaaacgagtcttttcactgtgttttgtcctcactcgcacggtttccgacaaacttcctagaaggtcacctatcccaaaactccg 30963702  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||   || |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||     
T  30963703 ccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatggtttgggctaccagaaagaagatgcatcttgttgatataggtagaaccatacaattcttataagt 30963802  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattcc 405  Q
     |||||||||||||||| || | |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||    
T  30963803 tttccttcaaccatgcattctcttacctgcacggcttcatgatccctctcattcc 30963857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 226 - 414
Target Start/End: Original strand, 38898870 - 38899058
Alignment:
Q  226 gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
    |||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38898870 gtaggtcacctatccaaagactactctaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgtgttaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatatag 38898969  T
Q  326 gtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38898970 gtagtaccaaacaattcttataagctctccttcaaccatgtagtctgatacctacacggcctcaagatcactctccttccgatgtgatt 38899058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 264 - 415
Target Start/End: Original strand, 18098874 - 18099025
Alignment:
Q  264 gcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaacca 363  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  18098874 gcttaactatggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcccttcaacca 18098973  T
Q  364 tgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    || |||| |||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18098974 tgtagtctcatacctacacggcctcaggattcctctcattccgatgtgattc 18099025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8074170 - 8073902
Alignment:
Q  136 ctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacc 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| |||| || ||| |||     ||||||| |  | |||||||     
T  8074170 ctttcaagattgtcgactgatcccacaaacaaacacaagttttttcatcgtgttttgttctcaatcacacacttttcgagaaactttctggaaggtcact 8074071  T
Q  236 catccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 335  Q
    ||||| ||||||   |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8074070 catcccaaaatttaaccaagtcaagaaggcttatctatggagttcttatgaaatgggctacaagaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaa 8073971  T
Q  336 ataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattc 404  Q
    | ||||| |||||| || ||||||||| |  || |||||||||| || | |||| |||| |||||||||    
T  8073970 acaattcttataagtctcccttcaaccttatagacccatacctgcacaatctcatgatccctctcattc 8073902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 20502176 - 20502050
Alignment:
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20502176 gcacgtttaattgtgaagttcttatgaaatgggctaccaaaaa-aagaagcatcttgttgatatagaaagtaccaaacaattcttataagccttccttca 20502078  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacct 387  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||    
T  20502077 accatgcagtcccatacttgcacgacct 20502050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16542263 - 16542034
Alignment:
Q  135 gctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcac 234  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||| ||  ||||||  ||| ||| ||| |||| | | ||||||||| |||||  |||    
T  16542263 gctttcaagattgtcgactcatcctacaaaccaacacgaatcattttagaatgtttt--ccttacttgcaagctttccaagaaacttcctagtagagcac 16542166  T
Q  235 ccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagcta-ctgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacc 333  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |  |||| ||||| |||||||||    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16542165 tcatcctaaaattgctccaagtcaaacacatttaactgtagagtttttatggaatgagctataaaaaaaaaagatacatcttgttgatataggtagtaca 16542066  T
Q  334 aaataattcatataagccttccttcaaccatg 365  Q
    ||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16542065 aaacaattattataagtcttccttcaaccatg 16542034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 304 - 415
Target Start/End: Original strand, 18447954 - 18448065
Alignment:
Q  304 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcatt 403  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||| || |||||    
T  18447954 aagatgcatcttgttgatacaagtagtaccaaacaattcttataagtcttacttcaaccatgtagtcacatacctacacggcctcaggatccctatcatt 18448053  T
Q  404 ccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||    
T  18448054 ccgatgtgattc 18448065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 242
Target Start/End: Original strand, 8181254 - 8181335
Alignment:
Q  161 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8181254 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcacgtttatcggaaaacttcccagtaggtcacccatccaa 8181335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29804942 - 29804871
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29804942 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttt 29804871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 266
Target Start/End: Original strand, 18875874 - 18875983
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagt 256  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||   | |||||||  ||| || |||||||||| |||||||||| || |    
T  18875874 cccacaaaccaacacgtgtctttacagtgtgttttgtcctcactcgcacgattttcaagaaacttttcagaagatcacccatcccaaaattgctcaaaat 18875973  T
Q  257 caagcacgct 266  Q
    ||||||||||    
T  18875974 caagcacgct 18875983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 222
Target Start/End: Original strand, 36924373 - 36924435
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttc 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  36924373 acaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgtcctcactcgcacgctaaccagaaaacttc 36924435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20502227 - 20502172
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 206  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20502227 actgaccctacaaactaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 20502172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9909235 - 9909102
Alignment:
Q  271 tatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtc 370  Q
    |||||||||||||||   || |||||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||| || ||||||||||||  ||||    
T  9909235 tatgaagttcttatgtgttgggctaccaaaaagaagttgaatcttgttggtataggtagtaccaattaatcattataaaccctccttcaaccatatagtc 9909136  T
Q  371 ccatacctgtacgacctcaggatcactctcattc 404  Q
     ||||| | |||||  |||||||| |||||||||    
T  9909135 tcatacttatacgatttcaggatccctctcattc 9909102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11389754 - 11389677
Alignment:
Q  143 gattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaact 220  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||||    
T  11389754 gattgtcgactgaccccacaaaccaacatgagttttttcagcatgttttattctcactcgcatgcttaccaggaaact 11389677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11406415 - 11406338
Alignment:
Q  143 gattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaact 220  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||||    
T  11406415 gattgtcgactgaccccacaaaccaacatgagttttttcagcatgttttattctcactcgcatgcttaccaggaaact 11406338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 403
Target Start/End: Original strand, 8181394 - 8181486
Alignment:
Q  311 atcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcatt 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||   |||||||||||| || |  ||| ||||| ||||||||    
T  8181394 atcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttaaaagtcttccttcaaccacaaagtcccatacctataaggtctcgggatccctctcatt 8181486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 363
Target Start/End: Original strand, 36924453 - 36924519
Alignment:
Q  299 aaaagaagatgcatcttgttgatatag--gtagtaccaaataattcatataagccttccttcaacca 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36924453 aaaagaagatgcatcttgttgatatataagtaataccaaacaattcttataagccttccttcaacca 36924519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 357
Target Start/End: Original strand, 26864785 - 26864905
Alignment:
Q  236 catccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 335  Q
    |||| |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |  ||| ||||  ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26864785 catctaaaaattgttctaagtcaatcacgcttaacgatgaagttcttaacat-tgacctaccaaatggaagatgcatcttgtcgatgtaggtagtaccaa 26864883  T
Q  336 ataattcatataagccttcctt 357  Q
    | | ||| || |||||||||||    
T  26864884 agagttcttacaagccttcctt 26864905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37552844 - 37552606
Alignment:
Q  135 gctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcac 234  Q
    ||||||| || |||| ||||| || ||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||| | ||    ||||||||  ||| ||||  |    
T  37552844 gctttcaagactgtcgactgaccctacaaaccaacacgggtattttaagcgtgttttttcctcaatcgcatgattttcgggaaacttttcagaaggtttc 37552745  T
Q  235 ccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 334  Q
    || ||| | ||||| |  |||||||||| |||||||| || | |||||| | |||| ||| |  ||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||    
T  37552744 ccgtcccagaattgattaaagtcaagcatgcttaactgtggaattcttacggaatgcgctgccaaaaagaaga-gcatcattttg-tatatgtagtacca 37552647  T
Q  335 aataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatac 376  Q
    || ||||| |||||| | || ||  |||||||||||||||||    
T  37552646 aacaattcttataagtc-tcgtttgaccatgcagtcccatac 37552606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 284
Target Start/End: Original strand, 3804249 - 3804401
Alignment:
Q  132 actgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggt 231  Q
    ||||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||  || |||  ||| |||||| || | || |    
T  3804249 actgctttcataattgtcgattgaccccacaaaccaacaagagtcatttcagtgtgctttgtccttactcaaacactttatagaaaactttccggaagct 3804348  T
Q  232 cacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttat 284  Q
     | ||||||||| ||| ||| ||||||  ||| |||||||||| || ||||||    
T  3804349 tatccatccaaatattactctaagtcagacacacttaactatggaggtcttat 3804401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 204
Target Start/End: Original strand, 26865142 - 26865189
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgca 204  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26865142 cccacaaaccaacacggatcttttcagcatgctttgtcctcactcgca 26865189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 199
Target Start/End: Original strand, 38898817 - 38898856
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcac 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898817 acaaaccaacttgagtcttttcagcgtgttttgtcctcac 38898856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 117 - 443
Target Start/End: Original strand, 2941606 - 2941932
Alignment:
Q  117 agtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactagga 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  2941606 agtgtaacatcccagactgctttcgtgattgccgactgaccgcacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttctcctcactcgcacgcttaccggga 2941705  T
Q  217 aacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttg 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2941706 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 2941805  T
Q  317 ttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattca 416  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2941806 ttgatataggtagtaccaaacaattcttatcagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattctgatgtgattca 2941905  T
Q  417 gttttgcctagaagcatgccaggagcc 443  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  2941906 gttttgcctagaagcatggcgggagcc 2941932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 127 - 448
Target Start/End: Original strand, 13124994 - 13125316
Alignment:
Q  127 cccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcttactaggaaacttccca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13124994 cccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcctttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccg 13125093  T
Q  226 gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13125094 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatatag 13125193  T
Q  326 gtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcct 425  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13125194 gtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcagggcctcaagatccctctcattccgatatgattcagttttgcct 13125293  T
Q  426 agaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13125294 agaagcatgccaggagccagacc 13125316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 127 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9125246 - 9124925
Alignment:
Q  127 cccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccag 226  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |    
T  9125246 cccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccgg 9125147  T
Q  227 taggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9125146 taggtcacccatcccaaaattgctccgagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 9125047  T
Q  327 tagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgccta 426  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9125046 tagtaccaaacaattcttataagctttcctttaaccatacagtctcatacctgcacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattcagttttgccta 9124947  T
Q  427 gaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  9124946 gaagcatgccaggagccggacc 9124925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 127 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18833573 - 18833260
Alignment:
Q  127 cccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccag 226  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |    
T  18833573 cccagactgctttcaggattgccgacttatcccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaacttcccgg 18833474  T
Q  227 taggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18833473 taggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatgtaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 18833374  T
Q  327 tagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgccta 426  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18833373 tagtactaaacaattcatataagctttccctcaaccatgcagttccatacctgtacggcctcaggaaccctctcattccgatgtgattcagttttgccta 18833274  T
Q  427 gaagcatgccagga 440  Q
    ||||||||||||||    
T  18833273 gaagcatgccagga 18833260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 118 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 28496150 - 28495853
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28496150 gtgtaacattccaaactgttttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaa 28496051  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28496050 acttcccaataggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 28495951  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28495950 tgatataggtagtacccaacagttcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattc 28495853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2193551 - 2193255
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  2193551 tgtaacatctcagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaa 2193452  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2193451 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaaatcaagcacgcttaactgtggagttcctatgaaatgagctaccgaatagaagatgcatcttgtt 2193352  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  2193351 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggtctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 2193255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 36422546 - 36422251
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  36422546 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaa 36422447  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36422446 cttcccggtaggtcacccatcccaaa-ttgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 36422348  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | ||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  36422347 gatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggcgtgattc 36422251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 124 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2189434 - 2189143
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcc 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  2189434 catcccagactgctttcaggattgccgactgtccccacaaatcaacacgagtcttctcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaacttcc 2189335  T
Q  224 cagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 323  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2189334 cggtaggtcactcatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatat 2189235  T
Q  324 aggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  2189234 aggtagtgccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgcagtcccacacctgcacagcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 2189143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 137 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 42515821 - 42515543
Alignment:
Q  137 tttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcaccc 236  Q
    ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||  |||||||||||    
T  42515821 tttcaagattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaatttccatgtaggtcaccc 42515722  T
Q  237 atccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 336  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42515721 atcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 42515622  T
Q  337 taattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42515621 cacttcttataagccttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccctctcattctgatgtgattc 42515543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 151 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42515355 - 42515058
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||| ||||  ||| |||||||||||||| | | ||    
T  42515355 actgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacccgcacgcttaccgaaaaagttcctggtatgtcacccatccaaagactact 42515256  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  42515255 ccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagt 42515156  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42515155 cttccttcaatcatgcagtctcatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcaattttgcctagaagcatgccaggagccggacc 42515058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 143 - 415
Target Start/End: Original strand, 34405466 - 34405738
Alignment:
Q  143 gattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaa 242  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34405466 gattgtcgactgaccccacaaatcaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatccca 34405565  T
Q  243 aaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattc 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  34405566 aaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcctgttgatataggtagtacccaacaattc 34405665  T
Q  343 atataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | ||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34405666 ttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggtgtgattc 34405738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 118 - 415
Target Start/End: Original strand, 6718925 - 6719221
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| ||||||||||  |||| | |||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6718925 gtgtaacatcccagacgacttttaggattgctgactgaccccacaaaccaacacgattcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaa 6719024  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    | |||||  || ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6719025 agttcccgatatgtcacccatcccaaa-ttactccaagtcaagcacgcttaactctggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 6719123  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6719124 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagcattccttcaaccatgtagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccaatgtgattc 6719221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 113 - 415
Target Start/End: Original strand, 28495464 - 28495755
Alignment:
Q  113 tcaaagtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttact 212  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  28495464 tcaaactgtaacatcgcagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgggttttgtcctcactcgcacgctt--- 28495560  T
Q  213 aggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcat 312  Q
            |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  28495561 --------tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctacctaaaagaagatgcat 28495652  T
Q  313 cttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtga 412  Q
    ||||||||||||||||  ||  || ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28495653 cttgttgatataggtaaaactcaacaattcttataagtcttccttcaaccatgtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctcattccgatggga 28495752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 119 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2466218 - 2465960
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||  |||| |  |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||    
T  2466218 tgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgactga-cctacaaactaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcatgcttaccgggaaa 2466120  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
     ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2466119 tttcccggtaggtcacccatcccgaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcaacttgtt 2466020  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2466019 gatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacct 2465960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Original strand, 7646328 - 7646528
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||    
T  7646328 gtgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgagaa 7646427  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7646428 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 7646527  T
Q  318 t 318  Q
    |    
T  7646528 t 7646528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 144 - 415
Target Start/End: Original strand, 22529111 - 22529382
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22529111 attgtcgactgaccctacaaaccaacatgagtcttttcagcgtattttgtcctcactcacacgcttaccgagaaacttctcagtaggtcacccatccaaa 22529210  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     | | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||     
T  22529211 gactactccaagtcaaacacgcttaactgtgaagttcttttgtaatgagttactgaaaagaagatgcatcttgtttatatagatagtaccaaacatttct 22529310  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |  | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  22529311 tataagccttccttcaaccatgtaggcccatacttacatgacctcaggatccctctcattcggatatgattc 22529382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 680071 - 679812
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtca 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  680071 acaaaccaacatgagtcttttcagcgtgtttttgttctcactcgcatgtttaccgcgaaacttcccggcaggtcacccatccaaagactactccaagtca 679972  T
Q  259 agcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttc 358  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  679971 agcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagtacc-aacaattcttataagccttccttc 679873  T
Q  359 aaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    | ||||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  679872 agccatgtactcccatacctacacgacctcaggatccctctcattctgatgtgattcagtt 679812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 276 - 448
Target Start/End: Original strand, 11517397 - 11517568
Alignment:
Q  276 agttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccata 375  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11517397 agttcttatggaatgagctaccgaaaagtagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca-ccatgcagtcccata 11517495  T
Q  376 cctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11517496 cctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccggacc 11517568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 330
Target Start/End: Original strand, 13122363 - 13122567
Alignment:
Q  127 cccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcttactaggaaacttccca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  13122363 cccagactgctttcaggattgccgattgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccg 13122462  T
Q  226 gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  13122463 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaaatcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatatat 13122562  T
Q  326 gtagt 330  Q
    |||||    
T  13122563 gtagt 13122567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Original strand, 35474013 - 35474268
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||    
T  35474013 acaaaccaacacaagtcatttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgagaaaattcccggtacgtcacccatccaaagactactccaagtcaa 35474112  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
     ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||    
T  35474113 acacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtactaaacaattcttataagtctttcttca 35474212  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35474213 accatgtagtctcatacctacacgacctaaggatccctctcattccggtgtgattc 35474268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 419
Target Start/End: Original strand, 2611535 - 2611803
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |       | ||| ||||||||||||||||||    
T  2611535 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagagtgttttgtcctcactcgcacgcttagt-------tacccggtaggtcacccatccaaa 2611627  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||     
T  2611628 gactactccaagtaaagcacgcttaactatggagttcttatagaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgttatagatagtaccaaacaattct 2611727  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2611728 tataagccttccttccaccatatagtctcatacctacatgacctcaggacccctctcattccgatgtgattcagtt 2611803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 159 - 431
Target Start/End: Original strand, 5406478 - 5406751
Alignment:
Q  159 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa-cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtc 257  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| |||| | |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  5406478 cacagaccaacacgagtgttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgttttttcggaaaactttccagaaagtcatccatcccaaaattgctcaaagtc 5406577  T
Q  258 aagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcctt 357  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||   || || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  5406578 aagcacgcttaactgtggagttcttatggtttgggcaaccaaaaataagatgcatcttgttgatataggtaataccaaacaattcttataaatcttcctt 5406677  T
Q  358 caaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagc 431  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5406678 caaccatgcagtcccataccggcacgactttaggatccctatcattccgatgtgattcagttttgcttagaagc 5406751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25182656 - 25182328
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||| || |||||| | |||| || | ||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||    
T  25182656 tgtaacatccctgagtgcttttaggattttcgattgaccccacaacccaatacgagtttttttagcgtgttttgccctcactcgaacgctttttgagaaa 25182557  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||||| |||||  ||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  25182556 cttcccagaaggtcctccatccaaagactactccaagtcaaacacacttaactgtgaagttcttatggaatgagttaccgaaaataagatgtatcttgtt 25182457  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||       
T  25182456 gatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcagtctcatacttgcacagtctcaggatctctctcattccgatgtgactcgtc 25182357  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  25182356 tttgcctagaagc-tgctaggagcctgacc 25182328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2465953 - 2465773
Alignment:
Q  194 cctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagc 293  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  2465953 cctcactcgcatgcttaccgggaaatttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagc 2465854  T
Q  294 tactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccat 374  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2465853 taccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttcaaccatgtagtcccat 2465773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 420
Target Start/End: Original strand, 29038903 - 29039172
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||| | | ||    
T  29038903 actgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcagtcacacgcttaccgggaaacttaccggtaggtcatccatccaaagactact 29039002  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||   ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  29039003 ccaagtcaagcacgcttaaatgtagagttcttatggaatggattatcaaaaagaagatgcatgttgttgatataggtagtaccaaacaattcttgtaagc 29039102  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttt 420  Q
    || | |||||||||| |||| |||| ||  ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  29039103 ctccattcaaccatgtagtcacatatctacacggcctcaggatgcctctcattccgatgtgattcggttt 29039172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 417
Target Start/End: Original strand, 6747457 - 6747747
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||        |||    
T  6747457 tgtaacatcccagactgctttaagcattgccgactgaccctacaaaccaacacaagtcttttcaacttgttttgtcctcactcgcaagc--------aaa 6747548  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| | | |   ||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  6747549 cttcccgataggtcacccatccaaagactacgataagtcaagcacgcttaactgtggagtttttatggaataggctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 6747648  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcag 417  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||  ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6747649 gatataggtagtaccaaacaattcttataatccttccttcaaccatgtagtatcatacctacacggcctcaggatccctctcattccaatgtgattcag 6747747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7646710 - 7646514
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||    
T  7646710 tgtaacatcccagacgacttttaggattgtcgactaaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcggaaaa 7646611  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatctt 315  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  7646610 ctttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagttaccgaaaacaagatgcatctt 7646514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 419
Target Start/End: Original strand, 29357348 - 29357606
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgctta-ctaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  | ||||| ||| || | |||||| |||||  || | | ||| ||||||    
T  29357348 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgctttgttctcactcgcacgcttttcgaggaa-cttaccggaaggtcatccatcttaagactactctaagtca 29357446  T
Q  259 agcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttc 358  Q
    | |||| |||||| || ||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  29357447 aacacggttaactgtgtagttcttatgaaacgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatatagttagtaccaaacaattcttataaacattccttc 29357546  T
Q  359 aaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  29357547 aaccatgcagtcccatacctgcacgacctcgggatacctctcatt-cggtgtgattcagtt 29357606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 207 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 46425947 - 46425740
Alignment:
Q  207 cttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaag 306  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  46425947 cttacgaggaaacttctc-gtaggtcacccatcataagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaataagataccgaaaagaag 46425849  T
Q  307 atgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  | |  ||||||||| |||||||||||    
T  46425848 atgcatcttgttgatataggtaataccaaacaattcttataagccttatttcaaccatgtagtcccatacctacatggtctcaggatccctctcattccg 46425749  T
Q  407 atgtgattc 415  Q
    |||||||||    
T  46425748 atgtgattc 46425740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 296
Target Start/End: Original strand, 43776179 - 43776318
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  43776179 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcattcgcacgcttactggaaaacttccccgcaggtcacccattccaaaattgctccaagt 43776278  T
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctac 296  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  43776279 caagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctac 43776318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 217 - 415
Target Start/End: Original strand, 35527070 - 35527268
Alignment:
Q  217 aacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttg 316  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  35527070 aacttctcagtaggtcacccatgcaaagactactccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcctatggaatggactactgaaaagaatatgcatcttg 35527169  T
Q  317 ttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  35527170 ttgatataggtagcaccaaacaattcttataagccttctttcaaccaaccagtcccatatttgcacgacctcgggatccctctcatttcggtgtgattc 35527268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Original strand, 31406481 - 31406731
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||  || ||| |||||||||||| | | ||||||    |    
T  31406481 acaaaccaacacatgtcttttcagcatgttttgtcctcactcacacgctttctaagaaacgtct-agaaggccacccatccaaagactactccaa----a 31406575  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||| | || ||||    
T  31406576 gcacgcttaactgtggagttcttatgaaacgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaacaccaaacaattctaataagtcatctttca 31406675  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  31406676 accattcagtcccagatctgcacggcttcaggatccctctcattttgatgtgattc 31406731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Original strand, 3305231 - 3305376
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||    
T  3305231 actgatcctacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgttctcactcgcactcttaccaggaaactttccggtaggtcacccatccaaagactact 3305330  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctac 296  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  3305331 ccaaatcaagcacgcttaactgtgaagtttttatgtaatgagctac 3305376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 324 - 448
Target Start/End: Original strand, 13124757 - 13124881
Alignment:
Q  324 aggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgc 423  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  13124757 aggtagtaccacacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaagatccctctcattccaatatgattcagttttgc 13124856  T
Q  424 ctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13124857 ctagaagcatgccaggagccagacc 13124881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 162 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 9623459 - 9623202
Alignment:
Q  162 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagc 261  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||   || ||||||| ||| | |||||||||||||| | |  |||||||||| |    
T  9623459 aaaccaacatgagtctttacagcgtgctttgtcctcactcgaaggcttttcagaaaacttctcagaacgtcacccatccaaagactagtccaagtcaaac 9623360  T
Q  262 acgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaac 361  Q
    |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||   |||||| ||    
T  9623359 acgcttaactgtggagttcttatagaatgaactaccg-aaagaagatgcatcttgttgatataggtggtatcaaacaattcttataagtactccttctac 9623261  T
Q  362 catgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttt 420  Q
    |||| |||| ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  9623260 catggagtctcatgcatgcacaacctctggatccctctcattccattgtgattcggttt 9623202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 390
Target Start/End: Original strand, 26421643 - 26421882
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || ||| |||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||| || | || | | |||||||||||  |||||||| ||||||| | | ||    
T  26421643 actgaccctacataccaacacgagtattttcggcattctttgtcctcactcacatgttttccaagaaacttcccataaggtcaccaatccaaagactact 26421742  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    | ||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||| |||    
T  26421743 cgaagccaaacacgcttaactgtgtagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagattcatcttgttggtatagggagtacctaacaattcttatgagc 26421842  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcag 390  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  26421843 cttacttcaaccatgcagtctcatacatgcacggcctcag 26421882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1628914 - 1628719
Alignment:
Q  213 aggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcat 312  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||  ||| ||| |  ||||||||||||||    
T  1628914 aggaaacttcgcaggaggtcacccatcccaaaattgctccaagccaaatacacttaactatggagttcttatggtatgggcttcaaaaaagaagatgcat 1628815  T
Q  313 cttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtg 411  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||  ||| |||||||||| |||||    
T  1628814 cttgttgatatcgatagtaccaaacaat---tataagcctttcttcaaccatgcaatcccatatctgcacggcttcaacatccctctcattccaatgtg 1628719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 230 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20966235 - 20966055
Alignment:
Q  230 gtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 329  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||     
T  20966235 gtcacccatcccaaaattgatacaagtcatgcatgtttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaataatatacatcttgttggtataggtat 20966136  T
Q  330 taccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgt 410  Q
    ||| ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| |||||||  | | ||||| || |||||||||||||||||    
T  20966135 tacaaaataattcttataagtcatccttcaatcatgcagtctcatacctagatggcctcaagaccactctcattccgatgt 20966055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43233252 - 43233137
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  43233252 tgtagcatcccaatctgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaa 43233153  T
Q  219 cttcccagtaggtcac 234  Q
    |||| | |||||||||    
T  43233152 cttctcggtaggtcac 43233137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Original strand, 36015404 - 36015557
Alignment:
Q  261 cacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaa 360  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  36015404 cacgtttaactgtgaagttcttatggaatgggctatttaaaagaagaggcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttttaagctttccttcaa 36015503  T
Q  361 ccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    ||||| |||| ||||| || ||  |||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  36015504 ccatggagtctcatacttgcactgccttgggatccctctcattccggtgtgatt 36015557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 278 - 426
Target Start/End: Original strand, 31743834 - 31743982
Alignment:
Q  278 ttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacc 377  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |     
T  31743834 ttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagcaccaaaccattcttataagcattccttcaaccatgcagtctcatgct 31743933  T
Q  378 tgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgccta 426  Q
    || ||||  ||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  31743934 tgcacgatttcaagatccatctcatttcgatatgattcagtttttccta 31743982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 293 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 43233534 - 43233412
Alignment:
Q  293 ctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcagga 392  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| ||||| ||    
T  43233534 ctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagtcttcctttaaccatacagtcacatacctacacggcctcatga 43233435  T
Q  393 tcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    || |||||||| || ||||||||    
T  43233434 tccctctcatttcggtgtgattc 43233412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 314 - 415
Target Start/End: Original strand, 26957603 - 26957704
Alignment:
Q  314 ttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26957603 ttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgtagttccatacctacacagcctcaagatccctctcattccgatgtgat 26957702  T
Q  414 tc 415  Q
    ||    
T  26957703 tc 26957704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11372697 - 11372501
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     | || |  | ||||||| | |   ||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  11372697 acaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcact-----gatttccggaaaacttctcgg---gtcactcatcccaaaattgctataagtcaa 11372606  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
     |  |||||||| || ||||||||||   ||||||||  |||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11372605 acgtgcttaactttggagttcttatggtttgagctaccaaaaataacatgcatcatgttggtacaggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 11372506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 26421287 - 26421415
Alignment:
Q  250 tccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataag 349  Q
    ||||| |||| |||| |||||| || |||||||||| ||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||    
T  26421287 tccaattcaaacacgtttaactgtggagttcttatggaatggactaccgaaaaaaatatgcatcttgttgatataggtagtatcaagcaattcttataag 26421386  T
Q  350 ccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
     |||||||||||||| | | |||||||||    
T  26421387 tcttccttcaaccatactgacccatacct 26421415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Original strand, 6747959 - 6748019
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttac 211  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6747959 actgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttac 6748019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36422677 - 36422573
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||| | |||| |  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |  |||||    
T  36422677 tgtaacatcccagattacttttagcattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacacttgccgggaaa 36422578  T
Q  219 cttcc 223  Q
    |||||    
T  36422577 cttcc 36422573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37672417 - 37672195
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagt 256  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||| ||   || |   |||| ||||||| ||||| |||||   ||||||| || ||||    
T  37672417 cccataaaccaacacgggtattttcaacgtattttatcctcactcacatattttccgagaaatttcccagaaggtcgcccattataaaattgttcaaagt 37672318  T
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcct 356  Q
    ||| ||||||||||| || | |||||||||||| | |||   |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||  ||||| ||||  |    
T  37672317 caaacacgcttaactgtgtatttcttatgaaatcaactaacaaaaagaagttgcatcttgttggtacaagtagtaccaaacaattattataaaccttttt 37672218  T
Q  357 tcaaccatgcagtcccatacctg 379  Q
     |||||||||||||  |||||||    
T  37672217 gcaaccatgcagtcttatacctg 37672195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 201
Target Start/End: Original strand, 26419104 - 26419168
Alignment:
Q  137 tttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 201  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26419104 tttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacatgttttgtcctcactc 26419168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Original strand, 37671654 - 37671785
Alignment:
Q  161 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaag 260  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||  |  |||||||  ||  |||| |||||||  ||||||||||||| |||||    
T  37671654 caaaccaacacgagactttttagtgtgtttggtcctcactcacacgctttatgagaaacttttcaaaaggtgacccatcacaaaattgctccaattcaag 37671753  T
Q  261 cacgcttaactatgaagttcttatgaaatgag 292  Q
    ||||||||| | || | ||| |||||||||||    
T  37671754 cacgcttaaatgtggatttcatatgaaatgag 37671785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16192457 - 16192355
Alignment:
Q  276 agttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccata 375  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| | ||| |||    
T  16192457 agttcttatggaatgggctaccaaaacgaagatgcatcttgttgatgtaggtaataccaaacaattcttataatccttcattcaatcatgaattcctata 16192358  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  16192357 cct 16192355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 205
Target Start/End: Original strand, 7461258 - 7461319
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 205  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7461258 attgtcgattgatcccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttatcttcactcgcac 7461319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 415
Target Start/End: Original strand, 3305374 - 3305459
Alignment:
Q  330 taccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  3305374 taccaaacaattctcataagccttcattcaaccatgtagtcccatacttacacggcctcaggatccccctcatttcgatgtgattc 3305459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 102
Target Start/End: Original strand, 4162602 - 4162649
Alignment:
Q  55 ttgggttgagaaatactttacaaacatcttgggtagtgatatctcatt 102  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4162602 ttgggttgataaatacttcacaaatatcttgggtagtgatatctcatt 4162649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6585787 - 6585638
Alignment:
Q  236 catccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatctt--gttgatataggtagtacc 333  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||   ||  ||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  6585787 catcctaaatttgcttcaagtcaagcacacttaactataaagtttttatgttttgc-ctaccaaaaggaagatgtatcttttgttgatataggtagtacc 6585689  T
Q  334 aaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacga 384  Q
    ||| ||||  |||||| |||| ||||| |||||| || |||| ||| ||||    
T  6585688 aaacaatttttataagtcttctttcaatcatgcaatctcatatctgcacga 6585638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43776380 - 43776321
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtctt 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43776380 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactaaccccacaaaccaacacgagtctt 43776321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Original strand, 31743781 - 31743827
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  31743781 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgcgttgacctcactcgcacg 31743827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2490136 - 2490077
Alignment:
Q  317 ttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatac 376  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  2490136 ttgatataggtagtaacaaacacttcttataagcattccttcaatcatgcagtcacatac 2490077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 33316832 - 33316721
Alignment:
Q  310 catcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatg 409  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |||| ||||| |||||   |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||  ||   |||||||||||||    
T  33316832 catcttgttgatataagtattgtcaaacaattcttataatttttccttcaaccatgtagtctcatacctgcacgacatcaaaatttatctcattccgatg 33316733  T
Q  410 t-gattcagttt 420  Q
    | ||||||||||    
T  33316732 tggattcagttt 33316721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Original strand, 36015361 - 36015407
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 206  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  36015361 acaaactaacacgagtctttttagcgtattttgtcctcactcacacg 36015407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 342
Target Start/End: Original strand, 7461344 - 7461424
Alignment:
Q  261 cacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattc 342  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||| |||||    
T  7461344 cacgcttaactgtagagttcttatgaa-tgaactaccaaaaagaagatgtatcttgtttatatagttagtatcaaacaattc 7461424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 284
Target Start/End: Original strand, 30572413 - 30572462
Alignment:
Q  235 ccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttat 284  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  30572413 ccatccaaaaattgttcaaagttaagcacgcttaagtatgaaattcttat 30572462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 378
Target Start/End: Original strand, 16811900 - 16811956
Alignment:
Q  322 ataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  16811900 atagatagtacaaaacaattcttataagcattccttcaaccatgtagtctcatacct 16811956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 87)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 134 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 35871907 - 35871594
Alignment:
Q  134 tgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtca 233  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  |||||||    
T  35871907 tgctttcaggattgccgactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaactttccgataggtca 35871808  T
Q  234 cccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacc 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35871807 cccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaa-atgcatcttgttgatataggtggtacc 35871709  T
Q  334 aaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcat 433  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35871708 aaacaattcatataagccttccttcaaccatgaagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcat 35871609  T
Q  434 gccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||| ||||    
T  35871608 gccaggagccggacc 35871594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 118 - 448
Target Start/End: Original strand, 23350127 - 23350457
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| || |||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  23350127 gtgtaacaccccagactgctttcagaattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcacacgcttacagagaa 23350226  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23350227 acttctcggtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatggaaggagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 23350326  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcag 417  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23350327 tgatataggaagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccctacctgtacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattcag 23350426  T
Q  418 ttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23350427 ttttgcctagaagcatgccaggagccggacc 23350457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 144 - 448
Target Start/End: Original strand, 44471195 - 44471499
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  44471195 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcatgttttgtcctcactcgcccgcttaccgggaaatttcccggtaggtcacccatcccaa 44471294  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  44471295 aattgctccaaatcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 44471394  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagcc 443  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  44471395 tataagtcttccttcaaccatgtagtctcatacctgtacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattcagtttttcctagaagcatgctaggagcc 44471494  T
Q  444 agacc 448  Q
     ||||    
T  44471495 ggacc 44471499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 127 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 49998923 - 49998608
Alignment:
Q  127 cccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccag 226  Q
    |||| ||||||||||  |||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  49998923 cccaaactgctttcagaattgccgactgtccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccgg 49998824  T
Q  227 taggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49998823 taggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 49998724  T
Q  327 tagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgccta 426  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  49998723 tagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcagtcccatgcctacacagccttaggatccctctcattccgatgtgatttagttttgtcta 49998624  T
Q  427 gaagcatgccaggagc 442  Q
    ||||||||||| ||||    
T  49998623 gaagcatgccaagagc 49998608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 113 - 448
Target Start/End: Original strand, 44470714 - 44471048
Alignment:
Q  113 tcaaagtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttact 212  Q
    |||||||||| || |||||||  |||| |  |||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44470714 tcaaagtgtaacaccccagacgactttaagaattgttgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacc 44470813  T
Q  213 aggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcat 312  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  44470814 gggaaacttcccggtaggtcaaccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagttac-gaacagaagatgcat 44470912  T
Q  313 cttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtga 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||| |||| |||||||||||||||||    
T  44470913 cttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccatacagtcacatacttgtacagcgtcatgatctctctcattccgatgtga 44471012  T
Q  413 ttcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44471013 ttcagttttgcctagaagcatgctaggagccggacc 44471048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 182 - 415
Target Start/End: Original strand, 12691907 - 12692140
Alignment:
Q  182 agcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12691907 agcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttct 12692006  T
Q  282 tatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgta 381  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12692007 tatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgca 12692106  T
Q  382 cgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    || |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  12692107 cggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 12692140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 50398383 - 50398679
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  50398383 tgtaacatctcagactgctttcaggattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagtgtattttgtcctcactcgcacgcttaccggtaaa 50398482  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||  || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50398483 cttcccggtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 50398582  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50398583 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcctatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 50398679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 119 - 378
Target Start/End: Original strand, 7678467 - 7678726
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  7678467 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaacctacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaa 7678566  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7678567 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 7678666  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7678667 gatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagccccatacct 7678726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 24629281 - 24629574
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||       
T  24629281 tgtaacatcacagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaactaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggt-- 24629378  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24629379 -ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggaattcttatggaacgaggtaccgaaaagaagatgcatcttgtt 24629477  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  24629478 gatataggtagtaccaaacaattcttataagcattcctttaaccatgcagtcccatacctacacgacctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 24629574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 415
Target Start/End: Original strand, 1645619 - 1645890
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1645619 attgccaactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttacaaagaaacttcctggtaggtcacccatccaaa 1645718  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  1645719 gactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaataccaaacaattct 1645818  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  1645819 tataagtcttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaagattcctctcattccgatgtgattc 1645890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 4127739 - 4128030
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||    
T  4127739 tgtaacatcccagactgctttcaagattgccgac-----ccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccggaaaa 4127833  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||  | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4127834 cttttcggtaggtcacccatcccaaaattgctctaagccaagcacgcttaactctgaagttcttatggaattggctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 4127933  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4127934 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatatagtctcatgcctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 4128030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Original strand, 23942675 - 23942930
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||| | | |||||||||||    
T  23942675 acaaaccaacacgggtcctttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttatttggaaactttccggtaggtcatccatccaaagactactccaagtcaa 23942774  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  23942775 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctacaaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttca 23942874  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23942875 accatgtagttccatacctacacggccccaggatccctctcattccgatgtgattc 23942930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 50398839 - 50399134
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||     
T  50398839 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccaacgtgttttgtcctcacttgcacgtttaccgggaat 50398938  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
     | ||| ||||||||||||||  || | | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  50398939 -tccccggtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcgtgtt 50399037  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50399038 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtaatctcatacctacacggtctcaggatccctctcattccgatgtgattc 50399134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 164 - 415
Target Start/End: Original strand, 9423748 - 9423999
Alignment:
Q  164 accaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcac 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||| ||||||||||||||| || | | |||||| ||||||||    
T  9423748 accaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaacgggaaatttcccggtaggtcacccatcctaagactactccaattcaagcac 9423847  T
Q  264 gcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaacca 363  Q
     ||||| | |||| |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  9423848 acttaattgtgaaattcttatggaatgggctactagaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattattataagccttctttcaacca 9423947  T
Q  364 tgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9423948 tgcagtcccatacatgcacgacctcaggatccctctcattccggtgtgattc 9423999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 119 - 365
Target Start/End: Original strand, 23943087 - 23943333
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||  |||| |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23943087 tgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 23943186  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  23943187 cttcccggttggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 23943286  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatg 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  23943287 gatataggtagtaccaaatattttttataagtcttccttcaaccatg 23943333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 31817699 - 31817993
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  31817699 tgtagcatcc-agactgctttcaggattgctgactgatccctcaaaccaacacgagtcatt-caacatgatttgtcctcactcgcacgctttccgcgaaa 31817796  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||| | | ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  31817797 cttcaccgaaggtcgcccatcctaaaactactacaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatggactaccgaaaagaagatgcatcttgtt 31817896  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  ||| |||| |||||||||||||||    
T  31817897 ggtataggtagtaccgaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacatgcatgacctcataatccctcttattccgatgtgattc 31817993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 127 - 448
Target Start/End: Original strand, 14572007 - 14572324
Alignment:
Q  127 cccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccag 226  Q
    |||| |||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||    
T  14572007 cccatactgctttcaggattgccgactgaccccgcaaaccaacacgagtcttttcaccgtgttttgtcctcactcacacgctttccgagaaacttcccag 14572106  T
Q  227 taggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 326  Q
     ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   | || ||||||||||   |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14572107 aaggtcacccatctcaaaattgctctaagtcaagcacgctt---tgtggagttcttatggtttaggctaccgaaa-gaagatgcatcttgttgatatagg 14572202  T
Q  327 tagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgccta 426  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||    
T  14572203 tagtaccaaacaattcttataagcctcccttcaaccatgtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcatatttttcta 14572302  T
Q  427 gaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    || |||||||| ||||| ||||    
T  14572303 gatgcatgccaagagccggacc 14572324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3169501 - 3169205
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||||||||| ||||  |||| |  |||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  3169501 tgtagcatcctagacgactttaagtattgccaactgaccctacaaaccaacacgagtattttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaagaaa 3169402  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| | || | |||  ||||||||||||||||||||    
T  3169401 ctttctggtaggtcactcatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaagtgtggagttcttatggattgggttaccaaaaagaagatgcatcttgtt 3169302  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  3169301 gatataggtagtaccaaacaatttttataagtcttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcatgattcctctcattccgatgtgattc 3169205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 51331128 - 51331422
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||| ||||| |||| | ||||| | ||||| || |||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | | |||    
T  51331128 tgtaacatcctagactacttttaggattgccgactgaccctacaaactaatacgagtcttt-cagtgtgttttgtcctcattcgcacgctta-tcgaaaa 51331225  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
     ||||| ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  51331226 tttcccggtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgtatcttgtt 51331325  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  51331326 gatatagatagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcatgattcctctcattccgatgtgattc 51331422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 132 - 415
Target Start/End: Original strand, 4127276 - 4127578
Alignment:
Q  132 actgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggt 231  Q
    |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||| |    
T  4127276 actgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaacttcccgatagct 4127375  T
Q  232 cacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaa-------------------tgagctactgaaaagaagatgcat 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||                   |||||||| |||||||||||||||    
T  4127376 cacccatcccaaaattgctccaagccaatcatgcttaactgtggagttcttatggaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcat 4127475  T
Q  313 cttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtga 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4127476 cttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaactatgtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtga 4127575  T
Q  413 ttc 415  Q
    |||    
T  4127576 ttc 4127578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 151 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21067545 - 21067281
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||| |||||| | | ||    
T  21067545 actgacccaacaaactaacacgagtcttttcagtgtgttttgtccccactcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtcacccctccaaagactact 21067446  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||| ||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||     
T  21067445 ccaagtcaagcacgcttaattgtggagtacttttagaatgagctaccggaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaataattattattagt 21067346  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21067345 cttccttcaaccatgcagtctcatacatgcacgacctcgggatccctctcattccggtgtgattc 21067281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 134 - 448
Target Start/End: Original strand, 27578317 - 27578627
Alignment:
Q  134 tgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtca 233  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||| |||||     
T  27578317 tgctttcaggattgttgactgatcccacaaaccatcacgagtcttttctgcgtgttttgtcctcactcgcacgcttgtcggaaaacttcccagaaggtcg 27578416  T
Q  234 cccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacc 333  Q
    | ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||   || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27578417 ctcatcccaaaattgttcgaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggtttgggataccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagcacc 27578516  T
Q  334 aaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcat 433  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| || ||||  ||||| ||||   |  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  27578517 aaataattcttataaaccatcattcaaccacacagtctcacacctccacgacttcag---ccatctcattctgatatgattcggttttgcctagaagc-t 27578612  T
Q  434 gccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||| ||||    
T  27578613 gccaggagccggacc 27578627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1464436 - 1464146
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcc 223  Q
    |||||||||||||||| | |||| || || || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  | | |||||||     
T  1464436 catcccagactgcttttaggattatcgaccgaccccacaaatcaacacgagt-ttttcagcgtgttgtgtcctaactcgcacgttttttggaaaacttct 1464338  T
Q  224 cagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 323  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1464337 cagaaggtcacccatcccaaaattgctccaagttaagcacgctaaattgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatat 1464238  T
Q  324 aggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||| ||| | || |||||||  |||  | || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  1464237 aggtagtaccaaacaattcttataagttttctttcaactatgtattctcatacctacacggtcgcatgatccctctcattctgatgtgattc 1464146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 119 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13266381 - 13266070
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||    | |||    
T  13266381 tgtaacatcccatactgctttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacaagtcttttcaacatgttttctcctcactcgcacacttttcggaaaa 13266282  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||  || ||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  13266281 cttcccaaaaggtcacccatcctaaaatttctcaaagtcaagcacgcttaactgtggggttcttgtgatttgggctaccgaaaataagatgcatcttatt 13266182  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | | |||| |||||||||  |||||||||| |    
T  13266181 gatatagggagtactaaaaaattattataagccttccttcaaccatgcattcccatacctgcacggctttaagatccctctcattctaatgtgattcaat 13266082  T
Q  419 tttgcctagaag 430  Q
    |||||| |||||    
T  13266081 tttgcccagaag 13266070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 415
Target Start/End: Original strand, 24628929 - 24629121
Alignment:
Q  226 gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628929 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaacgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 24629028  T
Q  326 gtagtaccaaataattcatataagcc---ttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  24629029 gtagtaccaaacaattcttataagcctaattcctttaaccatgcagtcccatacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 24629121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 348
Target Start/End: Original strand, 50814730 - 50814899
Alignment:
Q  179 ttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  50814730 ttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaacttcccggtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagt 50814829  T
Q  279 tcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataa 348  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  50814830 tcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataa 50814899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 160 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 14352049 - 14351789
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||| | | ||| |||||||    
T  14352049 acaaaccaacatgagtcttttcagcatattttgtcttcacttgcacgcttactggaaaactttgcagtaggtcatccatccaaagactactcgaagtcaa 14351950  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
     ||||||||||| || |||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||    
T  14351949 acacgcttaactgtggagttcttatggaataggataccaaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaaaaactcttacaagccttccttca 14351850  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttt 420  Q
    ||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||    
T  14351849 accatgcagactcatacatgcacgacctcaggatccctctcattctggtgtgattcggttt 14351789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 149 - 443
Target Start/End: Original strand, 8467688 - 8467966
Alignment:
Q  149 caactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattg 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||  |||||||||     |||||||    
T  8467688 caactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcatgctttccgagaaacttcccataaggtcaccc-----aaaattg 8467782  T
Q  249 ctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataa 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||        || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8467783 ctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttc--------tgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataa 8467874  T
Q  349 gccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagcc 443  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||   ||||||||| || |||||| |||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  8467875 gtcttccttcaaccatgtagtctcatacctgcacagtctcaggatccctttcattctgatgtggttcgg--ttgcctagaagc-tgccaggagcc 8467966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 157 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27026759 - 27026538
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagt 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  | | |||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  27026759 cccacaaacaaacacgagtcttttcagcgtgttttttcctcagtcacacgctttttggtaaacttcctagaaggtcacccttcccaaaattgcttcaagt 27026660  T
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcct 356  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  27026659 caagcacgcttaactacgtagttcttatggaatgggctac-caaaaaaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagccttcct 27026561  T
Q  357 tcaaccatgcagtcccatacctg 379  Q
    |||| | || |||||||||||||    
T  27026560 tcaatcgtgtagtcccatacctg 27026538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 160 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21067985 - 21067755
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| | | || ||||||||    
T  21067985 acaaaccaacacgaattttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccggtaaacttcccggtaggtcacccatccaaagactacttcaagtcaa 21067886  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||    || || ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  21067885 gcacgcttaactgtgaagttcttatggaatggactac---caaaaaaatgtatcttgttgatataggtagcaccaaacaattcttataagtcttccttca 21067789  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggat 393  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  21067788 accatgcagtcccatacctgcacggcctcgggat 21067755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 160 - 431
Target Start/End: Original strand, 27578795 - 27579066
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||    
T  27578795 acaaatcaacacaagtcttttcagcatgatttgtcctcactcgcacgctttctgggaaacttcccagaaggtcacgcatcccaaaatcgctccaagttaa 27578894  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |  | ||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||    
T  27578895 gcacgcttaactgtgtagttcttatggatagggctactgaaaagaagatgtgtctaattgatatatgtagtaccaaacaattcttataagtcttcagtca 27578994  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagc 431  Q
    |||| | |||  |||||||  ||||| | | |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27578995 accaagtagtgtcatacctacacgactttaagatccctcttattccgatgtgattcggttttacctagaagc 27579066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 214 - 415
Target Start/End: Original strand, 21220272 - 21220472
Alignment:
Q  214 ggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatc 313  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||    
T  21220272 ggaaacttcc-agtaggtcacccgtcccaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactgtgtagttcttatagaatgagttaccaaaaagaagatgcatc 21220370  T
Q  314 ttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||  |||||||  | | ||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  21220371 ttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcattccttcaaccatatagtttcatacctacatggcctcatgatccctctcattctgatgtgat 21220470  T
Q  414 tc 415  Q
    ||    
T  21220471 tc 21220472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 235 - 448
Target Start/End: Original strand, 15306052 - 15306270
Alignment:
Q  235 ccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 334  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15306052 ccatcccaagattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttatataggtagtacca 15306151  T
Q  335 aa------taattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctaga 428  Q
    ||       || || |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  15306152 aaattgctcaaatcttataagtcttctttcgaccatgtagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattctgatgtggttctgttttgcctaga 15306251  T
Q  429 agcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  15306252 agc-tgccaggagccagacc 15306270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17628788 - 17628560
Alignment:
Q  137 tttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcaccc 236  Q
    ||||| ||||| | |||||  ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||| || |||||||||    
T  17628788 tttcaggattgccgactgactccacataccaacacaagtctttccagtgtgttttgtcctcactcacacgctttatgggaatcttcctagaaggtcaccc 17628689  T
Q  237 atccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 336  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||||   || ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17628688 atctcaaaattgctccaagtcaggcacgctcaactgtggaattcttatgggttgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaa 17628589  T
Q  337 taattcatataagccttccttcaaccatg 365  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17628588 caattcttataagcctaccttcaaccatg 17628560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17029570 - 17029323
Alignment:
Q  174 gtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactat 273  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||| |    
T  17029570 gtctttttagcatgttttgtcgtcatttgcccgctttctgggaaacttcccagaaggtcacccaacccaaaaatgctccaagttaagcactcttaactgt 17029471  T
Q  274 gaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtccca 373  Q
    | |||||||||| ||| || |||  |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  17029470 ggagttcttatggaataaggtaccaaaagtaatatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattattacaagtcttcattcaactatgcagtccca 17029371  T
Q  374 tacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtttt 421  Q
    ||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17029370 tacttgcacgacctctagatccctctcattccgatgtaattcagtttt 17029323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41870175 - 41869901
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagt 256  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| || ||  |||||||      ||||||  ||| |||||  |||||| |||||||||| | ||    
T  41870175 cccacaaataaacacgagtcttttcagcgtgttctgtcatcccttacacgcttttcgaaaaacttttcagaaggtcttccatcccaaaattgctctatgt 41870076  T
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcct 356  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||    
T  41870075 caaacatgcataattgtgaagttcttatgatttgggttactgaaaagaagatgcgtcttgttgatataggtagtatcatacaattcttataagtcttcct 41869976  T
Q  357 tcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagc 431  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||   ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41869975 tcaatcatgcagtcccatatatgtacagtctcaggatccctctcactccgatgtgatttagttttgcctagaagc 41869901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 255 - 448
Target Start/End: Original strand, 14571702 - 14571895
Alignment:
Q  255 gtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttc 354  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |    
T  14571702 gtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggtttaggctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcc 14571801  T
Q  355 cttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||  |||| |||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||    
T  14571802 cttcaaccatgaagtcccatacctacacggactcaagatccctttcattatgatgtgattcagtttttcctagaaccaagccaggagccggacc 14571895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 162 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17029126 - 17028858
Alignment:
Q  162 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagc 261  Q
    |||||||||  |||||||||| | |||||| |||||| | |||| |||     |||||||||||  || | ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17029126 aaaccaacagaagtcttttcaacatgttttctcctcattagcacacttttcgagaaacttcccataagtttacccatcccgaaattgctccaagtcaagc 17029027  T
Q  262 acgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaac 361  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||  | |||||||||    
T  17029026 actcttaactatgaagttcttatggaataagctaggtaaaataagacgcatcttgttgatataggtagcacctaacaattcttacaaatcctccttcaac 17028927  T
Q  362 catgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagc 431  Q
     |||||||||||||| || | | | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17028926 tatgcagtcccatacatgcaaggcttcaggatccctctcattccgatgtgattcag-tttgcctagaagc 17028858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 415
Target Start/End: Original strand, 29628531 - 29628808
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaac--------------ttcccagtaggtcaccc 236  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||||||              ||||| ||| |||||||    
T  29628531 actgatcctacaaatcaacacgagttttttcagcgtattttatcctcactcgtacacttactgggaaacaaactttctggagtttcccggtaagtcaccc 29628630  T
Q  237 atccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 336  Q
    ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||  || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29628631 atccaaagactactccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaca-aagacacatcttgttgatataggtagtaccaaa 29628729  T
Q  337 taattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29628730 caattcttataagtcttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattc 29628808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 162 - 420
Target Start/End: Original strand, 13613786 - 13614043
Alignment:
Q  162 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagc 261  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||   || ||||||| ||| | |||||||||||||| | |  |||||||||| |    
T  13613786 aaaccaacatgagtctttacagcgtgctttgtcctcactcgaaggcttttcagaaaacttctcagaacgtcacccatccaaagactagtccaagtcaaac 13613885  T
Q  262 acgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaac 361  Q
    |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||   |||||| ||    
T  13613886 acgcttaactgtggagttcttatagaatgaactaccg-aaagaagatgcatcttgttgatataggtggtatcaaacaattcttataagtactccttctac 13613984  T
Q  362 catgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttt 420  Q
    |||| |||| ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  13613985 catggagtctcatgcatgcacaacctctggatccctctcattccattgtgattcggttt 13614043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 249 - 415
Target Start/End: Original strand, 53996090 - 53996256
Alignment:
Q  249 ctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataa 348  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  53996090 ctccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgagataccaaaaagaagatgaatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataa 53996189  T
Q  349 gccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||  |   ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  53996190 gcattccttcaaccatgtagtcccatatctacatagcctcaggatccttctcattccgatgtgattc 53996256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 284
Target Start/End: Original strand, 27578172 - 27578296
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  27578172 acaacccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgttttcagggaaacttcccataaggtcactcatcccaaaactgctccaagtcaa 27578271  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttat 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  27578272 gcacgcttaactgtgaagttcttat 27578296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33765115 - 33764904
Alignment:
Q  159 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtca 258  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| || ||||  |   |||  ||| || | ||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  33765115 cacaaaccaacacgagtctttttagtgtgttttgacctcgctcacatgctttttgaaaaaactcctagaaagtcacccatcccaaaattgatccaaatca 33765016  T
Q  259 agcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttc 358  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||| |||| | |    
T  33765015 agcacgcttaagtgtgaagttcttataaaatgagctacaaaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagcaccaaacaattcttaaaagtcttcatcc 33764916  T
Q  359 aaccatgcagtc 370  Q
    ||||||| ||||    
T  33764915 aaccatgtagtc 33764904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 175 - 354
Target Start/End: Original strand, 20306063 - 20306241
Alignment:
Q  175 tcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttccca--gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaacta 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    |||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20306063 tcttttcagagtgttttgtcctcacttgcacgtttttcgggaaacttcctatagtagggcacccatctaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaaccg 20306162  T
Q  273 tgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttc 354  Q
    || ||||||||||||||| | |||    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20306163 tgtagttcttatgaaatgggatac---caaaaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagccttc 20306241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 285
Target Start/End: Original strand, 14571545 - 14571699
Alignment:
Q  131 gactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtagg 230  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||||||||  ||     
T  14571545 gactgctttcaggattcccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcacacactttccgagaaacttcccaaaaga 14571644  T
Q  231 tcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatg 285  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14571645 tcacccatctcgaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatg 14571699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27029434 - 27029331
Alignment:
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcct 356  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27029434 caagcacacttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaataattcttataagtcttcct 27029335  T
Q  357 tcaa 360  Q
    ||||    
T  27029334 tcaa 27029331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Original strand, 15268029 - 15268138
Alignment:
Q  130 agactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtag 229  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||| ||||    
T  15268029 agactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgagaaatttcccggtag 15268128  T
Q  230 gtcacccatc 239  Q
     |||||||||    
T  15268129 ctcacccatc 15268138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 415
Target Start/End: Original strand, 31817376 - 31817539
Alignment:
Q  252 caagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagcc 351  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |     
T  31817376 caagtcaaacacgcttaattgtagagttcttaaggaatgggctgcggaaaagaagatgcattttgttggtataggtagtaccaaacaattattataaacg 31817475  T
Q  352 ttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||    
T  31817476 ttccttcaaccatgaagtctcatacatgcacgacctcatgatccctcttatttcgatgtgattc 31817539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 378
Target Start/End: Original strand, 23976095 - 23976323
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||| | ||  | |||||| || ||  || |||| ||||| ||||||  |    
T  23976095 actgaccccataaaccaacattagtcttttcagcgtgttttttcctcagccgcatgttttttgggaaacatcacataagctcactcatcccaaaattatt 23976194  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaa--gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataa 348  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  |  |||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23976195 ccaagtcaagcacgtttaactgtggagtttttatgattttggcta-tgaaaaaagaagatgcatcttgttagtataggtagtaccaaacaattcttataa 23976293  T
Q  349 gccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
      |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23976294 ctcttccttcaatcatgcagacccatacct 23976323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 420
Target Start/End: Original strand, 52048547 - 52048813
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||     ||||||||| || |||||| |||| | ||    
T  52048547 attgtcgactgatctcacaaaccaacatgaatcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcactcttttcgagaaacttcctagaaggtcatccat-ctaa 52048645  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
    |||||||||||||         |||||| || |||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||     
T  52048646 aattgctccaagt---------ttaactgtggagttcttatggaatgacttac-aaaatgaagatgcatcttgttagtatacgtagtatcaaacaattct 52048735  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtg-attcagttt 420  Q
    |||||   |||||||| | |||||||  |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||| |||||||||    
T  52048736 tataaattttccttcagctatgcagtttcatacctgtacggccttaggaaccctctcattccgacgtgaattcagttt 52048813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35477955 - 35477863
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttac 211  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  35477955 tgtaacatcccatactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctctctcgcacgtttac 35477863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4185956 - 4185717
Alignment:
Q  173 agtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaacta 272  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |||||||     |||| ||| ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||     
T  4185956 agtctttttagtgtgttttgtcctcattcacacgcttttcgagaaatttcgcataaggtcacctatcccaaaattgctccaagtcaagcatacttaactg 4185857  T
Q  273 tgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtccc 372  Q
    |  ||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||||| |||| |  |||||| |||||||| ||| |    
T  4185856 tagagttcttgtagaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgtggtatcaaacaattcttatatgtattcctttaaccatgccgtctc 4185757  T
Q  373 atacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtga 412  Q
    ||||||| | | ||||| || | ||||||||  |||||||    
T  4185756 atacctgcatggcctcatgaaccctctcattttgatgtga 4185717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40607194 - 40607071
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  40607194 actgattccacaaatcaacacgagttttttcagcgtattttgtcctcactcgaacgcttaccgataaactttccggtaggtcacccatcccaaatttgct 40607095  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatg 274  Q
    |||| |||| |||| |||||||||    
T  40607094 ccaaatcaaacacgtttaactatg 40607071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 243
Target Start/End: Original strand, 31816981 - 31817107
Alignment:
Q  117 agtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactagga 216  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||| ||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  31816981 agtgtaacatcccatactactatcaggattgtcgattggccccacaaaccagcacgagtcttttcaacatgttttgtcctcactcgtacgctttctggga 31817080  T
Q  217 aacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||    
T  31817081 aacttcccagaatgtcacccatccaaa 31817107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 412
Target Start/End: Original strand, 24271445 - 24271690
Alignment:
Q  168 acacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgctt 267  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| || |||||| ||||||| |||  ||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||| || || ||||||| | ||    
T  24271445 acacgggtctttttaacgtgttttttcttcactcacacgctttctacaaaacttttcagaaggtcacgcatcccaaaattgttctaactcaagcatgttt 24271544  T
Q  268 aactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgca 367  Q
    |  |    |||||||||| |||| |||||  |||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| | ||| ||| ||||||| |    
T  24271545 atttgcagagttcttatggaatgggctacccaaaa-aatatgcatcttgttcgtataggtagtatcaaataattcttatatgtcttactttaaccatgta 24271643  T
Q  368 gtcccatacctg--tacgacctcaggatcactctcattccgatgtga 412  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24271644 gtctcatacctgcacacgacctcaggaaccctctcattccgatgtga 24271690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Original strand, 43928927 - 43929092
Alignment:
Q  237 atccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 336  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||| | || | |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43928927 atcccaaaattgctcaaagtcaagcacgtttaattgtggatttcttatgaaataa-ctaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaaa 43929025  T
Q  337 taattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcatt 403  Q
     ||||| | ||||| ||||||| ||||   |||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||    
T  43929026 caattcttgtaagctttccttcgaccaaatagtctcatacctgcacggcttcaggaaccctctcatt 43929092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7381530 - 7381438
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| | ||||||||    
T  7381530 actgaccctacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttctcggtaggtcgctcatccaaa 7381438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17629139 - 17628951
Alignment:
Q  242 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataatt 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||| || | || ||| || ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  17629139 aaaattgctccaagtcaagcatgcttaa-tgtggaattcttttggattgggcttctaaaaagaagaggcatcttattagtataggtagtaccaaacaatt 17629041  T
Q  342 catataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgt-gattcagttttgcctagaagc 431  Q
    | ||||||  ||  ||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  17629040 cttataagtttttattcaaccatacattcacatacctgcacgaccttaggatcccactcattctgatgtggattc-gatttgcctagaagc 17628951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 341
Target Start/End: Original strand, 23091468 - 23091578
Alignment:
Q  231 tcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagt 330  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||||  ||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23091468 tcacccatcccaaaattgctacaagtcaagcatgcttaactgtggagtttttatagaataagctaccagaaagaagatgcatcttgttaatatatgtagt 23091567  T
Q  331 accaaataatt 341  Q
    |||||| ||||    
T  23091568 accaaacaatt 23091578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 219
Target Start/End: Original strand, 4414264 - 4414332
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaac 219  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4414264 actgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctgactcgcacgcttaccaggaaac 4414332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 296
Target Start/End: Original strand, 11828396 - 11828507
Alignment:
Q  185 gtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttat 284  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||  | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  11828396 gtgttttgccctcactcgcacattttttgggaaattttccagaaggtcacccatcccaaaaatgctccaagtaaagcacgcttaactgtggagttcttat 11828495  T
Q  285 gaaatgagctac 296  Q
    | || |||||||    
T  11828496 ggaaggagctac 11828507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 299 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 45682318 - 45682209
Alignment:
Q  299 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactc 398  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||  || | | ||||| |||| |||    
T  45682318 aaaagaaaatgcatcttgttggtatagataataccaaataattcttataaaccttcattcaatcatgtagtcccatatatgcatggcctcaagatctctc 45682219  T
Q  399 tcattccgat 408  Q
    ||||||||||    
T  45682218 tcattccgat 45682209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 285
Target Start/End: Original strand, 53854733 - 53854858
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||    ||||||||| |||||||||| | || |||||| |    
T  53854733 acaaatcaacacgagtcttttcaacgtattttgtcatcactcgcacgtttaccggtaaactttttggtaggtcacacatccaaaaactacttcaagtcta 53854832  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatg 285  Q
     || ||||||||||| ||||||||||    
T  53854833 acatgcttaactatggagttcttatg 53854858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 431
Target Start/End: Original strand, 26200205 - 26200444
Alignment:
Q  186 tgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatg 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||     |||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |        |||||||||||    
T  26200205 tgttttgtcctcactcacacgcttttcgtgaaacttcgctgaaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcatgtt--------aagttcttatg 26200296  T
Q  286 aaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc--cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacg 383  Q
       |  |||||   |||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||  |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||  ||     
T  26200297 gtttcggctaccacaaagaatatgcatcttgtttgtatagttagtatcaaacaattgttataagcctcttccttcaaccatgatgtcccatacctacaca 26200396  T
Q  384 acctcaggatcactctcattccgatgtg-attcagttttgcctagaagc 431  Q
    |  |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  26200397 atatcaggatccctctcattctgatgtgaattcag-tttgcctagaagc 26200444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44831146 - 44831046
Alignment:
Q  265 cttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccat 364  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||  | |||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||    
T  44831146 cttaactgtgaagttcatatgaaatgggctaccgaaaagaatatacatcttgttagtttaggtagtaccaaacaatttttataagcttcccttcaaccat 44831047  T
Q  365 g 365  Q
    |    
T  44831046 g 44831046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4186315 - 4186224
Alignment:
Q  266 ttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcctt 357  Q
    |||||| || |||||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  4186315 ttaactgtgtagttcttatgcaatgggctaccaaaaagaagatgaatcttgttcatgtaggtagtaccaaatcattcttataagcattcctt 4186224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42838787 - 42838661
Alignment:
Q  253 aagtcaagcacgcttaactatgaa-gttcttatgaaatgagctactgaaaag--aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataag 349  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||  |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |    
T  42838787 aagtcaaacacgcttaactgtgaaagttcttatggaatgaactatcgaaaaagaaagatgcattttgttgatataggtagtaccaaacaatttttatacg 42838688  T
Q  350 ccttccttcaaccatgcagtcccatac 376  Q
     ||||||| ||| ||| |||| |||||    
T  42838687 tcttccttgaactatgtagtctcatac 42838661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34554601 - 34554483
Alignment:
Q  242 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataatt 341  Q
    |||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||| || |||||||||| || ||||||||||  |||| ||||    
T  34554601 aaaatttctctaagtcaaacatgtttaactatgaagttcttatggaatggtctaccaaaaataaaatgcatcttgctggtataggtagtgtcaaacaatt 34554502  T
Q  342 catataagccttccttcaa 360  Q
    | ||||||| ||| |||||    
T  34554501 cttataagcattctttcaa 34554483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 415
Target Start/End: Original strand, 53854858 - 53854948
Alignment:
Q  325 ggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||  ||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  53854858 ggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatatagtctcatacctacactgcttcatgatccctctcattccgatgtgattc 53854948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 50399399 - 50399334
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagc 184  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  50399399 tgtaacatcgcagactgctttcaggattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagc 50399334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 53996000 - 53996053
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctc 197  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53996000 attgtccactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctc 53996053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5810091 - 5810039
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgctt 209  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5810091 cccacaaatcaacatgagtcttttcagcgtgttttatcctcactcacacgctt 5810039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13265931 - 13265859
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt 191  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||  | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13265931 tgtaacatctcagactgctttcaggattaccgactgaccgcacaaactaacacgagtcttttcagcgtgtttt 13265859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 431
Target Start/End: Original strand, 33987164 - 33987227
Alignment:
Q  367 agtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagc 431  Q
    |||| |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33987164 agtcacatacctgcacgatctcatgatccctctcattccgatgtgattcag-tttgcctagaagc 33987227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 10166024 - 10165953
Alignment:
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |   ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  10166024 tataagccttcattcaacaatgcagtcccatacctgcaatgcctcatgatctttctcattccgatgtgattc 10165953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 318
Target Start/End: Original strand, 33294778 - 33294936
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctcc-aagtca 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  |  |||| || |||  | | || |||| | ||||||| ||| |||||     
T  33294778 acaacccaacacgagtcttttcagcgtgttttgttctcacttgcacactt-ttgagaaattttccataatggcatccattccaaaattgttccaaagtcg 33294876  T
Q  259 agcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  33294877 agcacgctttactgtggagttcttatggagtgaactacaaaaaagaagatgcattttgtt 33294936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 336
Target Start/End: Original strand, 39902477 - 39902515
Alignment:
Q  298 gaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39902477 gaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaa 39902515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 53392008 - 53391890
Alignment:
Q  293 ctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcagga 392  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||   ||| || ||| ||    
T  53392008 ctaccgaaaaaaatatgtatcttgttgatatagatggtatcaaacaatttttataagcatttcttcaaccatgcagtctcatactcttacaacttcaaga 53391909  T
Q  393 tcactctcattccgatgtg 411  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  53391908 tctctctcattctgatgtg 53391890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 50399335 - 50399270
Alignment:
Q  202 gcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgctt 267  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||| ||||||||    
T  50399335 gcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaggcacgctt 50399270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 309
Target Start/End: Original strand, 52299826 - 52299902
Alignment:
Q  233 acccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatg 309  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||  |||  |||||  |||||||||||    
T  52299826 acccatcctaaaattgctcaaaatcaagcatgtttaactatgaagttcttattgaataggctacaaaaaagaagatg 52299902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 17506484 - 17506389
Alignment:
Q  315 tgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgt 410  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||| || || |||||| || ||||| || | ||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  17506484 tgttgatataggtagtactatacaattcttataagtcttcttttaatcatgcactctcatacatgcatgacctcatgatccctctcattctgatgt 17506389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 448
Target Start/End: Original strand, 20309594 - 20309689
Alignment:
Q  350 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || || ||||||||||    
T  20309594 ccttccttcaaccatgtagtcacatacctgcaaagtctcatgatccctctcattccgatgtgattcggttt--cctagaagc-tgtcatgagccagacc 20309689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 199
Target Start/End: Original strand, 33987019 - 33987074
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcac 199  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  33987019 attgtcgactgattccacaaaccaacacaagttctttcagcgtgttttgtcatcac 33987074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 201
Target Start/End: Original strand, 34801230 - 34801301
Alignment:
Q  130 agactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 201  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||    
T  34801230 agactcctttcacgattgtcggctgatttcacaaaccaacatgagttttttcagccagttttgtcttcactc 34801301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 198
Target Start/End: Original strand, 2499388 - 2499426
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctca 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2499388 acaaaccaacacgcgtcttttcaacgtgttttgtcctca 2499426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 35477855 - 35477801
Alignment:
Q  362 catgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattca 416  Q
    ||||||||| | ||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35477855 catgcagtctcgtacttgcacggcctcaggatctctctcattccgatgtgattca 35477801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 423
Target Start/End: Original strand, 2682707 - 2682779
Alignment:
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgc 423  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2682707 cttccttcaatcatgcaatcacatacatgcacggtttcaggatccctctcatttcgatgtgattcaattttgc 2682779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10594 - 10266
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||| |||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10594 tgtaacatccccgactactttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaggaaa 10495  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10494 cttcccggtaggtcacccatccaaaa-ttgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgtt 10396  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10395 gatataggtagtactaaacaattcttataagccttccttgaaccatgcagtcccatacatgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagt 10296  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10295 tttacctagaagcatgccaggagccggacc 10266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 116 - 440
Target Start/End: Original strand, 107311 - 107635
Alignment:
Q  116 aagtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactagg 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  107311 aagtgtaacatcccagactgctttcagaatagccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccggg 107410  T
Q  216 aaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatctt 315  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  107411 aaacttcccggtacgtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 107510  T
Q  316 gttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  107511 gttgatattggtagtatcaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacggcctcagaatccctctcattccgatgtgattc 107610  T
Q  416 agttttgcctagaagcatgccagga 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  107611 agtttttcctagaagcatgccagga 107635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 119 - 441
Target Start/End: Original strand, 31284127 - 31284449
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    | |||    
T  31284127 tgtaacatcccagattgctttcatgattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcggcgtgttttgtccccactcgcacgcttgtcggaaaa 31284226  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31284227 cttcccggcaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 31284326  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31284327 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacgacctcaagatccctctcattccgatgtgattcagt 31284426  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggag 441  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31284427 tttgcctagaagcatgccaggag 31284449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8067575 - 8067246
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  8067575 tgtaacatcccagactgcttttaggattgccgattgacctcacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaa 8067476  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8067475 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgtt 8067376  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  8067375 gatataggtagtactaaacaattcttataagccggccttcaaccatgcaatcccatacctgcacggcctcagggtccctctcattccgatgtgattcaat 8067276  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8067275 tttgcttagaagcatgccaggagccggacc 8067246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 117 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28562042 - 28561741
Alignment:
Q  117 agtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactagga 216  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28562042 agtgtaacatctcatactgctttcaagattaccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 28561943  T
Q  217 aacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttg 316  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28561942 aacttccccgtaggtcacc-atcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 28561844  T
Q  317 ttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattca 416  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  28561843 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattca 28561744  T
Q  417 gtt 419  Q
    |||    
T  28561743 gtt 28561741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 119 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 39653459 - 39653159
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  39653459 tgtaacatcccagactgcttttagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaa 39653360  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39653359 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacacttaactgtggagttctcatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 39653260  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    ||||||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  39653259 gatataggtagtatccaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagt 39653160  T
Q  419 t 419  Q
    |    
T  39653159 t 39653159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 124 - 406
Target Start/End: Original strand, 11179890 - 11180172
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcc 223  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| |||    
T  11179890 catcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacacttaccgggaaacatcc 11179989  T
Q  224 cagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 323  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11179990 cggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatat 11180089  T
Q  324 aggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccg 406  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||    
T  11180090 aggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccg 11180172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 127 - 448
Target Start/End: Original strand, 27187188 - 27187510
Alignment:
Q  127 cccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcttactaggaaacttccca 225  Q
    ||||||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||     
T  27187188 cccagactgttttcagaattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttcccg 27187287  T
Q  226 gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27187288 gtaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttagtgatatag 27187387  T
Q  326 gtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcct 425  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  27187388 gtagtaccaaacaattcttataagccttcatttaaccatgcagtcccatacatgcacagcctcaggatccctctcattccaatgtgattcaatttttcct 27187487  T
Q  426 agaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||    
T  27187488 agaagcttgctaggagccggacc 27187510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16811674 - 16811380
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||   |||||    
T  16811674 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgt--tttgtcctcactcgcatgcttatcgggaaa 16811577  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16811576 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggaattcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 16811477  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    || |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16811476 gaaataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatggagtcccaaacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 16811380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 124 - 415
Target Start/End: Original strand, 13149955 - 13150246
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcc 223  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||    
T  13149955 catcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcacacttaccgagaaacttcc 13150054  T
Q  224 cagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 323  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13150055 cggtaggtcacccattccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatac 13150154  T
Q  324 aggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||| | |||||||||||  |||||||    
T  13150155 aggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggagccctctcattccggcgtgattc 13150246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 32227072 - 32227368
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||    
T  32227072 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaatgtgttttttcctcactcgcacacttaccgggaaa 32227171  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32227172 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 32227271  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | ||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  32227272 aatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggcgtgattc 32227368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 119 - 370
Target Start/End: Original strand, 13150405 - 13150656
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  13150405 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaa 13150504  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13150505 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 13150604  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtc 370  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13150605 gatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtc 13150656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 117 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 50348043 - 50347745
Alignment:
Q  117 agtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactagga 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  50348043 agtgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttatcggga 50347944  T
Q  217 aacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttg 316  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50347943 aacttctcggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttg 50347844  T
Q  317 ttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| |  | | |||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  50347843 ttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccaagtagtctcatacatacaaggcctcaggatccctctcattccggcgtgattc 50347745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 129 - 379
Target Start/End: Original strand, 32386595 - 32386845
Alignment:
Q  129 cagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagta 228  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| || ||     
T  32386595 cagactgctttcaagattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcggacgcttaccaagaaactttccggtg 32386694  T
Q  229 ggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 328  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32386695 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaattagctactgaaaagaagatgcatcttgttaatataggta 32386794  T
Q  329 gtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctg 379  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32386795 gtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatacagtcccatacctg 32386845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16811220 - 16810924
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16811220 tgtaacatcccagattgctttcaggattgccgaccgaccccacaaaccaacacgaatcttttcagcgtattttgtcctcactcgcacgcttacggggaaa 16811121  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  16811120 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctacaagtcaagcacacttaaatgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgta 16811021  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16811020 gatatagttagtacgcaacaattcttataagccttccatcaaccatgcagtcccatatctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattc 16810924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 32227795 - 32227500
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||   |||||    
T  32227795 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaatgtgttttttcctcactcgcacacttatcgggaaa 32227696  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32227695 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 32227596  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | ||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  32227595 aatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctca-gatccctctcattccggcgtgattc 32227500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 161 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 30529939 - 30529682
Alignment:
Q  161 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaag 260  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  30529939 caaaccaacacaagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttactgggaaacttcc-agtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaag 30529841  T
Q  261 cacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30529840 cacgcttaactatgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaaaattcttataagccttacttcaa 30529741  T
Q  361 ccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    ||||| |||| |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30529740 ccatgtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 30529682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 14814244 - 14813948
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  14814244 tgtaacatcccagactgctttcagtattgccgactaaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacgcttaccgggaaa 14814145  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    | |  | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  14814144 cctttcggtaggtcacccatcacaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaacgagctaccgaaaagaagatgcatcttatt 14814045  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  14814044 gatataggtagtaccaaacaattattataagccttcctttaaccatgcagtctcatacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 14813948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25248407 - 25248077
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtctttt-cagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  25248407 tgtaacatcccagactgcttttaggattgtcgactaacctcacaaatcaacacgagtctttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgtgaa 25248308  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    ||||||| |||||||| |||||  || | | |||||||||||||||||| |||  || |||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  25248307 acttcccggtaggtcatccatcataagactactccaagtcaagcacgctgaaccgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgt 25248208  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcag 417  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248207 tgatataggtagtaccaaacaattcttataaacattcctttaaccatgcagtcccatacctgcacggccttagaatccctctcattccgatgtgattcag 25248108  T
Q  418 ttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25248107 ttttgcctataagcatgccaggagcctgacc 25248077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 14820449 - 14820153
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||    
T  14820449 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcatgcttaccgggaaa 14820350  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14820349 ctttccgataggtcacccatcccaaaattgttccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaacgagctaccgaaaataagatgcatcttgtt 14820250  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||  |||  ||||||| | |||||||| || ||||||||    
T  14820249 gatataagtagtaccaaacaattcttataagccttcctttagccgtgcagccccatacctacacgggctcaggaaccctctcattgcggtgtgattc 14820153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 151 - 414
Target Start/End: Original strand, 20885000 - 20885263
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||| | | ||    
T  20885000 actgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctaacttgcacgcttaacgggaaatttcccggtaggtcacccatccaaatactact 20885099  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||     
T  20885100 ccaagtcaagcacgcttaattgtggagttcttatggaatgtgctactaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagt 20885199  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  20885200 cttccttcaaccatgtagtcacatacctacacgacctcaagatccctctcattgcgatgtgatt 20885263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 214 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 41472500 - 41472267
Alignment:
Q  214 ggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatc 313  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||  || |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41472500 ggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgtttcaagtcaagcacgtttaaccgtggagttcttatggaatgatctaccgaaaagaagatgcatc 41472401  T
Q  314 ttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgat 413  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41472400 ttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttataagc-ttccttcaaccatgcagtctcatacctgtacgacctcaggatccctctcattccgatgtgat 41472302  T
Q  414 tcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41472301 tcagtcttgcctagatgcatgccaggagccggacc 41472267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 144 - 414
Target Start/End: Original strand, 25230124 - 25230394
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||   |||||||||||||  ||    
T  25230124 attgtcgactgaccctacaaaccaacactagtctttccaacgtgttttgtcctcactcgctcgcttaccggaaaacttcctgataggtcacccatcataa 25230223  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     | | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25230224 gactactccaagtcaagcacgcataactgtggagttcttattgaatgggctaccaaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaataattct 25230323  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25230324 tataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctccttccgatgtgatt 25230394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 144 - 414
Target Start/End: Original strand, 25237711 - 25237981
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||   |||||||||||||  ||    
T  25237711 attgtcgactgaccctacaaaccaacactagtctttccaacgtgttttgtcctcactcgctcgcttaccggaaaacttcctgataggtcacccatcataa 25237810  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     | | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25237811 gactactccaagtcaagcacgcataactgtggagttcttattgaatgggctaccaaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaataattct 25237910  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25237911 tataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctccttccgatgtgatt 25237981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 151 - 414
Target Start/End: Original strand, 25230588 - 25230851
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  || | | ||    
T  25230588 actgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgatctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtagggcacccatcataagactact 25230687  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  25230688 ccaagtcaagcacgcttaattgttgagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaac 25230787  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  | | |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25230788 cttccttcaaccatgtagtctcatacctacatggcctcaggatccctctcattccaatgtgatt 25230851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 151 - 414
Target Start/End: Original strand, 25238175 - 25238438
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  || | | ||    
T  25238175 actgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgatctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtagggcacccatcataagactact 25238274  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  25238275 ccaagtcaagcacgcttaattgttgagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaac 25238374  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  | | |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25238375 cttccttcaaccatgtagtctcatacctacatggcctcaggatccctctcattccaatgtgatt 25238438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 144 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7494151 - 7493864
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    ||||| |||| || |||||| |||| | ||    
T  7494151 attgtcgactgaccccacataccaacatgagtcttttcaacgtgctttgttctcactcgcacgctttacgggaaatttcctagaaggtcagccatgctaa 7494052  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     |   |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  7494051 gacaactccaagtcaagcatgcttaaatgtggagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaaaaattct 7493952  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7493951 tataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacgactttaggatctctctcattccgatgtgattatgttttgcctagaagc 7493864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 37045332 - 37045034
Alignment:
Q  114 caaagtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacta 213  Q
    |||| |||| ||||||||||  |||| |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       
T  37045332 caaactgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttatcg 37045233  T
Q  214 ggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatc 313  Q
    ||||   |||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||  | |||  ||||||||||||| |    
T  37045232 ggaa---tcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatagggtaccaaaaagaagatgcacc 37045136  T
Q  314 ttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgat 413  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37045135 ttgttgatataggtattaccaaacaattcttataagcattccttcattcatgtagtcccacacctacacggcctcaggatccctctcattcagatgtgat 37045036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 144 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7477461 - 7477176
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |   |||| ||||||  |||||| |||||| ||    
T  7477461 attgtcgactgaccccacataccaacatgagtcttttcaacgtgctttgttctcactcgcacgctttccgagaaatttcccataaggtcagccatcctaa 7477362  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     | | ||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||   || ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  7477361 gactactctaagtcaagcatgcttaaatgtggagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgtatcttgttgatataagtagtaccaaaaaattct 7477262  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaa 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7477261 tataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacgactttaggatccctctcattccgatgtgattatgttttgcctagaa 7477176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 151 - 362
Target Start/End: Original strand, 4067243 - 4067454
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| || |||||||| ||||||||| | | ||    
T  4067243 actgaccctacaaaccaacactggtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcacgcttaccagaaaactttccggtaggtcatccatccaaagactact 4067342  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||     
T  4067343 ccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgtaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataagt 4067442  T
Q  351 cttccttcaacc 362  Q
    ||||||||||||    
T  4067443 cttccttcaacc 4067454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 160 - 370
Target Start/End: Original strand, 25238576 - 25238786
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||||| | | |||||||||||    
T  25238576 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccaaaaaacttcccgataggtcaccaatccaaagactactccaagtcaa 25238675  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  25238676 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgataaagatagtaccaaacaattcttataagtcttccttca 25238775  T
Q  360 accatgcagtc 370  Q
    |||||| ||||    
T  25238776 accatgtagtc 25238786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 162 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 41474249 - 41473963
Alignment:
Q  162 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagc 261  Q
    |||| |||| ||||||||||| | ||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41474249 aaactaacatgagtcttttcaacatgttttgtattcacccgcacgattactgggaaactttctggtatgtcacccatcccaaaattgttccaagtcaagc 41474150  T
Q  262 acgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaac 361  Q
    |||||| ||| || |||| ||||  ||||| | ||  ||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  41474149 acgcttgactgtggagtttttatagaatgatccaccaaaaagaatatcaatcttgttgatataggaagtatcaaacaattcttataagtcttcctttaac 41474050  T
Q  362 catgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  41474049 catccagtcacatacctgaacgacctcaagatccctctcatttcgatgtgattcagtcttgccgagaagcatgctaggagccggacc 41473963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 144 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2911354 - 2911094
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           | || ||||||| ||||||||    
T  2911354 attgtcgattgatcctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttac-----------cgagaaggtcactcatccaaa 2911266  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||      
T  2911265 gactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaatatgcatcttgttgatataggtaatatcaaacaatttt 2911166  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  2911165 tataaccattctttcaaccatgtggtcccatacctgcacggcctcgggatccctctcattcaggtgtgattc 2911094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 226 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 39641125 - 39640936
Alignment:
Q  226 gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39641125 gtaggtcaccaatccaaagactgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttattgatatag 39641026  T
Q  326 gtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39641025 gtagtaccaaacaactcttataagtcttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatctctctcattctgatgtgattc 39640936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 218 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29224520 - 29224363
Alignment:
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29224520 acttctcagaaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaattgtgaagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgcatcttgt 29224421  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccata 375  Q
    |  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29224420 tagtataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcagtctcata 29224363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 378
Target Start/End: Original strand, 25802431 - 25802658
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||     ||||||||| || ||||||||| ||| || | | ||    
T  25802431 actgaccctacaaaccaacacacgtcttttcagcgtgttttgaccttactcgcactcttttcgagaaacttcctagaaggtcacccgtcctaagactact 25802530  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||    
T  25802531 ccaagtcaaacacgcttaactgtggatttcttatggaatgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaccattcttatcagc 25802630  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  25802631 cttccgttaaccatgcagtctcatacct 25802658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 174 - 415
Target Start/End: Original strand, 25802910 - 25803151
Alignment:
Q  174 gtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactat 273  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| || ||||||| | || |||| || ||  ||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||     
T  25802910 gtcttttcagcatgatttttcctcattcacacgctttccagaaaacatctcataaggtcacccatcctaagactagtccaagtcaagcacgcttaactac 25803009  T
Q  274 gaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtccca 373  Q
    | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25803010 ggagttcttatgaaatgggataccgaaaagaagatacatcttgtttttataggtagtaccaaacaattcttacaagtcttacttcaaccatgcagtccca 25803109  T
Q  374 tacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||  ||||| | |||| | |||| |||||||| ||||||    
T  25803110 tacctacacgacattaggaaccctcttattccgatatgattc 25803151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 25239070 - 25239224
Alignment:
Q  261 cacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaa 360  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  25239070 cacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaaaattcttataagcgttccttcaa 25239169  T
Q  361 ccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  25239170 ccatatagtcccatacctacacgacctcagaatccctctcataccggtgtgattc 25239224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 325
Target Start/End: Original strand, 53150695 - 53150869
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  53150695 actgaccccacaaactaacatgagtcttttcaacatgttttgtcctcactcgcccgctttttgggaaacttctcataaggtcacccatcccaaaattgct 53150794  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  53150795 ccaagttaagcacggttaactgtgaagttcttatgaaattggctaccgaaaaaaatatgcatcttgttaatatag 53150869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 343 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12820715 - 12820610
Alignment:
Q  343 atataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagc 442  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12820715 atattagcctttcttcaaccatgcagtcccatacctgtacggccttagaatccctctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgcaaggagc 12820616  T
Q  443 cagacc 448  Q
    | ||||    
T  12820615 cggacc 12820610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3900063 - 3899872
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||  | |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||    
T  3900063 actgaccccacagatcaacacgagtcttttcaccttgttttgtccatactcacacgctttttgggaaactttccagaaggtcacccataccaaaattgct 3899964  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattc 342  Q
    |||||||||||| |||| | | || |||||||||||  || | |   ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  3899963 ccaagtcaagcatgctttattgtggagttcttatgatttgtgttgtcgaaaaaaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaaacaattc 3899872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41473836 - 41473743
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttact 212  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41473836 tgtaacatctcatactgctttcacgattggcgactgaccccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttact 41473743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15392764 - 15392570
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa-cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtca 258  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15392764 acaaaccaacacgagttctttcagcgtgctatgtcctcacttgcacacttt-taggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtca 15392666  T
Q  259 agcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttc 354  Q
    |||||  |||||| || |||||| |||      |||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  15392665 agcacatttaactttggagttctgatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagccttc 15392570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15405800 - 15405606
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa-cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtca 258  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15405800 acaaaccaacacgggttctttcagcgtgctttgtcctcacttgcacacttt-taggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtca 15405702  T
Q  259 agcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttc 354  Q
    |||||  |||||| || |||||| |||      |||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  15405701 agcacatttaactttggagttctaatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagccttc 15405606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 276 - 415
Target Start/End: Original strand, 32796943 - 32797082
Alignment:
Q  276 agttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccata 375  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||  ||||    
T  32796943 agttcttatggaatgtgctacaaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtttcata 32797042  T
Q  376 cctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||  | |  ||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  32797043 cctacatggtctcaggatccctcttatttcgatgtgattc 32797082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15388397 - 15388203
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa-cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtca 258  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15388397 acaaaccaacacgagttctttcagcgtgctatgtcctcacttgcacacttt-taggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtca 15388299  T
Q  259 agcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttc 354  Q
    |||||  |||||| || |||||| |||      |||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  15388298 agcacatttaactttggagttctgatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtactggtaatacgaaacaattcttataagccttc 15388203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15417625 - 15417431
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa-cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtca 258  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15417625 acaaaccaatacgggttctttcagcgtgctttgtcctcacttgcacacttt-taggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtca 15417527  T
Q  259 agcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttc 354  Q
    |||||  |||||| || |||||| |||      |||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  15417526 agcacatttaactttggagttctaatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagccttc 15417431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15411209 - 15411015
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa-cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtca 258  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15411209 acaaaccaacacgggttctttcaccgtgctttgtcctcacttgcacacttt-taggaaaacttcccaaaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtca 15411111  T
Q  259 agcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttc 354  Q
    |||||  |||||| || |||||| |||      |||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  15411110 agcacatttaactttggagttctaatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagccttc 15411015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 448
Target Start/End: Original strand, 32388844 - 32388911
Alignment:
Q  381 acgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32388844 acgacctcaggatccctctcattccgatgtgattcaattttgcctagaagcatgccaggagccggacc 32388911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 387
Target Start/End: Original strand, 31103850 - 31104079
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||  | ||||||||| ||  | ||||  || |   ||||| ||| |||||||    
T  31103850 acaaatcaacacgagtcgtttcagcatgttttgttctcactcgcgcgttttttgggaaacttctcataaagtcattcaactccaaattactcaaagtcaa 31103949  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgag--ctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcctt 357  Q
      || ||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||||    
T  31103950 agacacttaaatgtgaagttcttatggaatgagagctaccaaaaagaaaatgcatctagttggtatagatagtatcaaacaattcttataagtcttcctt 31104049  T
Q  358 caaccatgcagtcccatacctgtacgacct 387  Q
     ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  31104050 gaaccatgcaatctcatacctgtacaacct 31104079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 367
Target Start/End: Original strand, 26309840 - 26310088
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||  |||| |  ||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||| |||||||  | ||||||    
T  26309840 tgtaacatcccagacgactttaattattgttaactaaccccacaaaccaacatgagtcttttgagtgtattttgtcttcacttgcacgctatccaggaaa 26309939  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    | |||    || |||||||||| ||||||| |  |||||||  ||  |||||| |  |||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||    
T  26309940 catcctgaaagatcacccatcccaaaattgttttaagtcaaatacatttaactgtcgagttctaatggaatgagctaccataaagaagatgcatcttttt 26310039  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgca 367  Q
    | |||| |||||| |||| ||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  26310040 ggtatatgtagtaacaaaaaattcttataaatcgtccttcaaccatgca 26310088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Original strand, 25239003 - 25239070
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttac 211  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25239003 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttac 25239070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15377536 - 15377344
Alignment:
Q  162 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa-cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaag 260  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15377536 aaaccaacacgggttctttcaacgtgctttgtcctcacttgcacacttt-taggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtcaag 15377438  T
Q  261 cacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttc 354  Q
    |||  |||||| || |||||| |||      | |||||||||||||  ||||||||||| ||   ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  15377437 cacatttaactgtggagttctaatggtcctgggtactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccagtaataccaaacaattcttataagccttc 15377344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15376250 - 15376056
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa-cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtca 258  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||| |||| |||  ||||||| |||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15376250 acaaaccaacacgggttctttcagcgtgctttgtcatcacttgcacacttt-taggaaaacttcccaaaagttcacccatcccaaaattgatccaagtca 15376152  T
Q  259 agcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttc 354  Q
    |||||  |||||| || |||||| |||      | |||||||||||||  ||||||||||| ||   ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  15376151 agcacatttaactttggagttctaatggtcctgggtactgaaaagaagtggcatcttgttggtacctgtaataccaaacaattcttataagccttc 15376056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Original strand, 25230989 - 25231030
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25230989 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 25231030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 381
Target Start/End: Original strand, 47518296 - 47518432
Alignment:
Q  242 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataatt 341  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| | | ||||| ||||| ||||||||||| |||| |   |||||||||||| || || ||||  |||| ||||    
T  47518296 aaaattgctccaaatcaagctcacttaattgtaaagttattatggaatgagctactaaaaaaa---tgcatcttgttggtagagatagtttcaaacaatt 47518392  T
Q  342 catataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgta 381  Q
    | ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  47518393 cttataagttttccttcaaccatgcaattccatacctgta 47518432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18318909 - 18318860
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgctt 209  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18318909 acaaaccaacccgaatcttttcagcgtgttttgttctcactcgcacgctt 18318860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32746093 - 32745994
Alignment:
Q  173 agtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaacta 272  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| || |  | || |||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32746093 agtcttttcagcatgttttattctcattcacgtgttttctaggagacttcccaaaaggtcacttatccaaaaattgatccaagtcaagaacgcttaacta 32745994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 284
Target Start/End: Original strand, 26436022 - 26436140
Alignment:
Q  166 caacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgc 265  Q
    ||||| ||||||||||| |||  ||||||   ||||| || |||  ||||||||||||  | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| || |    
T  26436022 caacaagagtcttttcaacgtactttgtcactactcgtacactttttaggaaacttcctggaaggtcacccatccaaatactactctaattcaagaacac 26436121  T
Q  266 ttaactatgaagttcttat 284  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26436122 ttaactatgaagttcttat 26436140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 324
Target Start/End: Original strand, 43736715 - 43736777
Alignment:
Q  262 acgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatata 324  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  43736715 acgcttaacagtgaaattcttatgaaatgagctaccaacaagaagatgcatattgttgatata 43736777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26436305 - 26436241
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaactt 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||| || |||| ||||||    
T  26436305 cccaaaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgttctcaatcacacgttttctagaaaactt 26436241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3890095 - 3890050
Alignment:
Q  297 tgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattc 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  3890095 tgaaaaaaagatgcatcttgttgatatatgtagtagcaaacaattc 3890050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 411
Target Start/End: Original strand, 45047071 - 45047156
Alignment:
Q  326 gtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtg 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||| ||||| |||||  | |||| || ||||||||| ||||| |||||||    
T  45047071 gtagtaccaaataattcttataagtttttcttcaatcatacagtctcatactcgcacgatctgaggatcactatcatttcgatgtg 45047156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15410698 - 15410630
Alignment:
Q  217 aacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatg 285  Q
    |||||||||| ||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  15410698 aacttcccagaaggtttcccatctcaaaattgatccaagtcaagcacacttaaatgtggagttcttatg 15410630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 198
Target Start/End: Original strand, 36763837 - 36763877
Alignment:
Q  158 ccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctca 198  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36763837 ccacaaaccaacatgagtcttatcagcgtgttttttcctca 36763877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 106015 - 105686
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||| |||||||||||||  |||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  106015 tgtaacatctcagactgctttcagaattgccgactgaccctataaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaggaaa 105916  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  105915 cttctcggtaggtcacacatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcattttgtt 105816  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  105815 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccctgcagttccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgatttagt 105716  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  105715 tttgcctagaagcatgccaggaaccagacc 105686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 119 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19261 - 18958
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  19261 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaa 19162  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19161 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgaatcttgtt 19062  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19061 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgatttagt 18962  T
Q  419 tttg 422  Q
    ||||    
T  18961 tttg 18958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 350 - 448
Target Start/End: Original strand, 18203 - 18301
Alignment:
Q  350 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18203 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgattcagtgttgcctagaagcatgccaggagccggacc 18301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 119 - 422
Target Start/End: Original strand, 17027382 - 17027685
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  17027382 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaa 17027481  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17027482 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgaatcttgtt 17027581  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17027582 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgatttagt 17027681  T
Q  419 tttg 422  Q
    ||||    
T  17027682 tttg 17027685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 124 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7912600 - 7912276
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcc 223  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  7912600 catcccagattgctttcaggattgccgactaaccccacaaaccaacatgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgtacgcttaacgggaaacttcc 7912501  T
Q  224 cagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 323  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7912500 cagcaggtcacccattccaaaattgctccaagtcaagcacgtttaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaaaatgcatcttgttgatat 7912401  T
Q  324 aggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgc 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7912400 aggtagtaccaaacaattcatataagttttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcgagatccctctcattccgatgtgattcagtttttc 7912301  T
Q  424 ctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  7912300 ctagaagcatgccaggagccggacc 7912276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 119 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7912173 - 7911851
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||     
T  7912173 tgtaacatcccagactgctttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacaagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaat 7912074  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7912073 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcaagcataactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 7911974  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7911973 gatataggtagtaccaaacaattcttataagttttccttcaaccatgcagtcctatacctgcacggcctcgagatccctctcattccgatgtgattcagt 7911874  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggag 441  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  7911873 ttttcctagaaacatgccaggag 7911851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 116 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13493088 - 13492755
Alignment:
Q  116 aagtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcttactag 214  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||   ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  13493088 aagtgtaacaccccagactgctttcaggattgctgactgaccctacaaatcaacacgagtcttttcagcatgtttttgtcctcactcgcacgcttaccgg 13492989  T
Q  215 gaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatct 314  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13492988 gtaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctctaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatct 13492889  T
Q  315 tgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  13492888 tgttgatataggtagtaccaaacaattattataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacagcctcaggatccttctcattccgatatgatt 13492789  T
Q  415 cagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13492788 cagttttgcctagaagcatgccaggagccggacc 13492755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 127 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20850608 - 20850320
Alignment:
Q  127 cccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccag 226  Q
    |||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  20850608 cccatactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccgg 20850509  T
Q  227 taggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850508 taggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 20850409  T
Q  327 tagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  20850408 tagtacaaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcatgaaccctctcattccggtgtgattc 20850320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 127 - 443
Target Start/End: Original strand, 13191372 - 13191688
Alignment:
Q  127 cccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccag 226  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |    
T  13191372 cccagactgctttcaagattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtattttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttcccgg 13191471  T
Q  227 taggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 326  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13191472 ttggtcacccatctcaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaacgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 13191571  T
Q  327 tagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgccta 426  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    || |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  13191572 tagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctacatagtcttaggatccctctcattccgatgtgatttagtttttcctc 13191671  T
Q  427 gaagcatgccaggagcc 443  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  13191672 gaagcataccaagagcc 13191688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 119 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23776735 - 23776436
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23776735 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgactccacaaaccaacacgaatcttttcagcgtgttttgtcgtcactcgcacgtttactaggaaa 23776636  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23776635 cttcccagtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaagtacgcttaa-tgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 23776537  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  23776536 gatataggtagtaccagacgattcttataagtcttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggatacctctcattccggcgtgattcagt 23776437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 117 - 415
Target Start/End: Original strand, 20896536 - 20896835
Alignment:
Q  117 agtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttg-tcctcactcgcacgcttactagg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||  ||    
T  20896536 agtgtaacatcccagactgctttcaagattgccggctgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgtttttctcctcactcgcacacttaccggg 20896635  T
Q  216 aaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatctt 315  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20896636 aaatttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagccaagcacgcttaaccgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatctt 20896735  T
Q  316 gttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20896736 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctaaggatccctctcattccgatgtgattc 20896835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 126 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9352350 - 9352029
Alignment:
Q  126 tcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttccca 225  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||      
T  9352350 tcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttccag 9352251  T
Q  226 gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9352250 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttatatag 9352151  T
Q  326 gtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcct 425  Q
    ||||||||||| || |  |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||  ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  9352150 gtagtaccaaacaaatattataagtctcccttcgaccatgtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcatttcgatgtgattatgttttgcct 9352051  T
Q  426 agaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    
T  9352050 agaagc-tgccaggagccggacc 9352029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 117 - 448
Target Start/End: Original strand, 17730958 - 17731293
Alignment:
Q  117 agtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactagga 216  Q
    |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    |    
T  17730958 agtgtaacatcctagacgactctcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcacttgcacgcttaccgata 17731057  T
Q  217 aacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatct-- 314  Q
    ||||| || |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||      
T  17731058 aactttccggtaggtcacctatctcaaaattgctccaagtcaagcacgcttaaatgtggagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatctat 17731157  T
Q  315 --tgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtga 412  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17731158 cttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttcctttaaccatgcagtcccatacctgaacggcctcaggatccctctcattccgatgtga 17731257  T
Q  413 ttcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17731258 ttcaattttgcctagaagcatgctaggagccggacc 17731293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 23986168 - 23986464
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |   ||||    
T  23986168 tgtaacatcccatactgctttcagaattgccgactgaccccacaaaccaacacaagtcttttcagcgtgtcttctcctcactcgcacgctttccgtgaaa 23986267  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23986268 cttcccagaaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacacttaactgtgaagttcttatggtttgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 23986367  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23986368 catataggtagtaccaaacaattcttataagcctaccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctccggatccctctcattccgatgtgattc 23986464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 2681071 - 2681363
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2681071 tgtaacatcccagacagctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttctcaacgtgttttgtcctcacttgcacgcttactaggaaa 2681170  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||||||||||    |||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2681171 cttcccagta----acccatcccaaaattgttccaaattaagcacgcttaattgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 2681266  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  2681267 gatatgggtagtaccaaacaattcttataagtcttcattcaaccatgcagtcccaaacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 2681363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 130 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13492617 - 13492393
Alignment:
Q  130 agactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgt-cctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagta 228  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  13492617 agactgctttcaagattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttttcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccggta 13492518  T
Q  229 ggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 328  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13492517 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 13492418  T
Q  329 gtaccaaataattcatataagcctt 353  Q
     || |||| ||||| ||||||||||    
T  13492417 atatcaaacaattcttataagcctt 13492393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 144 - 415
Target Start/End: Original strand, 2890715 - 2890985
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  2890715 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttctcagtaggtcacccatcctag 2890814  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     | |  | |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||     
T  2890815 tactatttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctactgaaaagaagaagcatctttttgatataggtagtccctaacaattct 2890914  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  2890915 tataaaccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcgggatc-ctctcattctaatgtgattc 2890985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 144 - 431
Target Start/End: Original strand, 9440185 - 9440472
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||  | ||||||| ||| || |||| ||  |  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9440185 attgtcgactgatcccacaaatcaacacgagtttttttagtatattttgtcatcattcacacgtttttttagaaacttcccataaggtcacccatccaaa 9440284  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||     
T  9440285 aattgctccaaatcaagcacacttaactgtgaagttcttatggagtgagctaccgaaaagaaaatgcatcttgttgatataagtagtaccgaacaattct 9440384  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagc 431  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  9440385 tataagctttcattcaaccatgcagttccatacctgcacgacttcaggatccctctcattccgatgtgattcggtcttccctagaagc 9440472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 214 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16520168 - 16519935
Alignment:
Q  214 ggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatc 313  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16520168 ggaaacttcccggcaggtcacccatctcaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatc 16520069  T
Q  314 ttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16520068 ttgttgatataggtagtaccaaacaaatctcataagccttccttcgaccatgtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgat 16519969  T
Q  414 tcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16519968 tctgttttgcctagaagc-tgccaggagccggacc 16519935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 160 - 417
Target Start/End: Original strand, 20126074 - 20126331
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||| |||| | | |||||||||||    
T  20126074 acaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttctaggtaggtcgcccattcaaagactactccaagtcaa 20126173  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||| | || | |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  20126174 gcacgcttaattgtggaattcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaaccattcttataagccttccttca 20126273  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcag 417  Q
    |||||| |||| |||||||  ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20126274 accatgtagtctcatacctacacagccttaggatccctctcattccgatgtgattcag 20126331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 118 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21312267 - 21311966
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| ||||||||||  |||| |  |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||  ||| |||||  ||||    
T  21312267 gtgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacaccagtcttttcaatgtgttttgtcttcacttacacacttaccgggaa 21312168  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  21312167 acttcccggtaggtcactcatcataagactgctccaagtcaagcacgtttaactatggatttcttatgaaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgt 21312068  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcag 417  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| || | ||||||||| | ||||||||||    
T  21312067 tgatataggtagtacctaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacagcctcatgaaccctctcattctggtgtgattcag 21311968  T
Q  418 tt 419  Q
    ||    
T  21311967 tt 21311966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17851172 - 17850917
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || | | |||||||||||    
T  17851172 acaaaccaacacgagtcttttcgacttgttttgtcctaactcgcacgcgtactaggaaacttcccagtaggtctcccatccgaagactactccaagtcaa 17851073  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||||| || |||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||| ||| ||| || |    
T  17851072 gcacgcttaactgtggagttcttatagaatgggctaccagaaagaagatgcatcttgttgataaaggtagtaccaaacatatcttatcagcattctttta 17850973  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17850972 accatgcagtcccatacttgcacgacctcaggatccctctcattccggtgtgattc 17850917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Original strand, 9440708 - 9441034
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||    |||||    
T  9440708 tgtaacatcccagactgctttcaagattgccgactgaccccacaaaccagcacgagttttttcagcgtattttgtcatcacttgcacatttttcgggaaa 9440807  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9440808 cttccaagaaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaaacacacttaactgtgaagttcttatggtttgggctactgaaaagaaaatgcatcttgtt 9440907  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||  | |||||| ||   |||  |||||||||||||    
T  9440908 gataaaagtagtaccaaagaattcttataagcattccttcaaccatgtagttccatgcctgcacga--ttaggatcccttctattttgatgtgattcagt 9441005  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9441006 tttgcctagaagc-tgccaggagccggacc 9441034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 161 - 406
Target Start/End: Original strand, 2720456 - 2720702
Alignment:
Q  161 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaag 260  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  2720456 caaaccgacacgagtcttctcagcgtgttttgttctcactcgcacgcttatcgggaaacttcccaatatgtcacccatccaaagactactccaagtcaag 2720555  T
Q  261 cacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagcta-ctgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  2720556 cacacttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaaaaaagatgtgtcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttca 2720655  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccg 406  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  2720656 accatgcagtctcatacctgcacgaccttgggatccctctcattccg 2720702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21311810 - 21311514
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||  |||| |  |||||| | ||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||    
T  21311810 tgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgattgaccctacaaaccaacacgagtccttacagcgtgttttgtcttcactcgcacacttaccggaaaa 21311711  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    | |||| ||||||||||||||  || | | ||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  21311710 catcccggtaggtcacccatcataagactactcaaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgagcttccaaaaagaagatggatcttgtt 21311611  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     || |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  21311610 tatctaggtaataccaaacaattcttataaggcttccttcaaccatgcagtcccatacttgtacggcctcatgaaccctctcattccgatgtgattc 21311514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 118 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28780406 - 28780209
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  28780406 gtgtaacatcccagactgctttcagcattgtcggctgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaaaatgttttatcctcactcgcacacttaccagaaa 28780307  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatctt 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28780306 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 28780209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 166 - 415
Target Start/End: Original strand, 6330811 - 6331059
Alignment:
Q  166 caacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgc 265  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||  |||  || |  |||||||||| |||  || | | ||| |||||||||||||    
T  6330811 caacacgagtctttctcgcgtgttttgtcatcacttgcacgcttactgagaatttttcg-gtaggtcaccaatcataagaatactcaaagtcaagcacgc 6330909  T
Q  266 ttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatg 365  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  6330910 ttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatattgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatg 6331009  T
Q  366 cagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     |||| |||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6331010 tagtctcatacctacacggcctcaggatccatctcattccgatgtgattc 6331059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Original strand, 14771611 - 14771866
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||| |    
T  14771611 acaaaccaacatgagtcttatcagcgtgttttgtcctcgctcgtacgtttactggtaaacttccgagtaggtcactcatccaaagactactccacgtcta 14771710  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||| ||||||| || |||||||||| |||    |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  14771711 gcacacttaactgtggagttcttatggaatagattaccaaaaagaatatggatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttca 14771810  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| | || ||||| |||||||||||  |||||||    
T  14771811 accatgcagtctcatacctacacggcttcgggatccctctcattccggcgtgattc 14771866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17851628 - 17851373
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||  | |||| ||||| ||| |||||||||| || | | |||||||||||    
T  17851628 acaaaccaatacgattctttttaccgtgttttgccctcgctcgcacgctaacgggaaaacctcccaatagatcacccatccgaagactactccaagtcaa 17851529  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||| | || |||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||| || |    
T  17851528 gcacgcttaattgtggagttcttatagaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgataaaggtagtaccaaacatatcttataagccttctttta 17851429  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17851428 accatgcagtcccatacttgcacggcctcgggatccctctcattccggtgtgattc 17851373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 177 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 11062522 - 11062285
Alignment:
Q  177 ttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | |||   |||||||| ||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || |    
T  11062522 ttttcagcgtgttttgtcctcactcacgggtttatcgggaaactttccgataggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtgga 11062423  T
Q  277 gttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatac 376  Q
    ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  11062422 gttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacaaaacacttcttataagccttccttcaaccatgtagtttcatac 11062323  T
Q  377 ctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||  ||  |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  11062322 ctacacagcctcaggatc-ctctcatgtcgatgtgattc 11062285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 276 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27334299 - 27334156
Alignment:
Q  276 agttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccata 375  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27334299 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagattcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagttccata 27334200  T
Q  376 cctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  27334199 cctgcacgacctcaggaaccctctcgttccggtgtgattcagtt 27334156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 276 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27395039 - 27394896
Alignment:
Q  276 agttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccata 375  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27395039 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagattcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagttccata 27394940  T
Q  376 cctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  27394939 cctgcacgacctcaggaaccctctcgttccggtgtgattcagtt 27394896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20735977 - 20735731
Alignment:
Q  132 actgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggt 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| |  ||||||||||  | ||||    
T  20735977 actgctttcaggattgtcaactgaccccacaaaccgacgcaagtctttttagcgtgttttgtcctcaattgcatgctttcctggaaacttccttgaaggt 20735878  T
Q  232 cacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagta 331  Q
     |||||||||||   | ||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20735877 tacccatccaaaggctactccaagccaaccacacttaactatggagtttttatagaatggactaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagta 20735778  T
Q  332 ccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
     |||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  20735777 tcaaacaattcttataagccttcctacaatcatgtagtcacatacct 20735731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15929768 - 15929620
Alignment:
Q  228 aggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15929768 aggtcacccatcccaaaattgcttcatgttaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcattttgttgatataggt 15929669  T
Q  328 agtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatac 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  15929668 agtaccaaataattcttataagccttcattcaaccatgtagtccaatac 15929620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1991816 - 1991588
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| || ||||    | ||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||    
T  1991816 actgatcccacaaatcaacacgagttttttcagcgtactttgtcttcactcacatgcttttcggaaaacttttcagaaggtcacccatccaaaaactact 1991717  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    |||| ||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||| | |||||    
T  1991716 ccaaatcaataatgtttaactgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttagatatgtaataccaaacaattcttgtaagc 1991617  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctg 379  Q
    |||| | |||||||| |||| ||||||||    
T  1991616 cttcttccaaccatgtagtctcatacctg 1991588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 415
Target Start/End: Original strand, 33774918 - 33775151
Alignment:
Q  184 cgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttctta 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||| | | || |||||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  33774918 cgtgttttttcctcactcgcacgcttaccgaaaaacttctcagtaggtcacccatccaaagactactgcaagtcaaacacacttaactgtggagttctta 33775017  T
Q  284 tgaaatgagctactgaaaagaagatgcatct--tgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgta 381  Q
    || ||||  |||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || |    
T  33775018 tggaatggactatcaaaaagaagatgcatctcttgttgatataggtagcaccagacaattcttataatccttccttcaaccatgcggtcacatacttgca 33775117  T
Q  382 cgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    || ||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  33775118 cggcctcgcgatcactctcattccagtgtgattc 33775151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3652634 - 3652485
Alignment:
Q  266 ttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatg 365  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3652634 ttaactgtggagttcttatggaatgaactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcagacaattcttataagccttccttcaaccatg 3652535  T
Q  366 cagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     ||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3652534 tagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 3652485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 32293055 - 32292858
Alignment:
Q  242 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataatt 341  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||| | |||| |||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32293055 aaaattgctcaaagtcaagttcgcttaactatggagttcttat--aatgtgttactaaaaacaagatgtattttgttggtataggtagtaccaaacaatt 32292958  T
Q  342 catataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggag 441  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||  |||||||||| |||||| |  | |||||||||||| ||||||||||    
T  32292957 cttataagccttcattcaaccatgcagtctcatacctgcacgatctaaggatttctctcattccaatgtgaatttggtttgcctagaag-atgccaggag 32292859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20732834 - 20732612
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagt 256  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||  | ||||||||   ||| | | ||||||||    
T  20732834 cccacaaaccaacacaaa-cttttcagtgtgttttttcctcactcgcaagctttctaggaaacttctcacaatgtcacccaataaaagactactccaagt 20732736  T
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcct 356  Q
    ||||||| ||||||  |  |||| ||||  |||| ||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20732735 caagcactcttaaccgtagagtttttattgaatgggctaccgaaaagaatatgcatattattaatataggtagtaccaaataattcttataagccttcct 20732636  T
Q  357 tcaaccatgcagtcccatacctgt 380  Q
     |||||||| |||| |||||||||    
T  20732635 acaaccatgtagtcacatacctgt 20732612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 280 - 420
Target Start/End: Original strand, 31821704 - 31821844
Alignment:
Q  280 cttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctg 379  Q
    |||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  31821704 cttatggaatgagctaccaaaaaaaagatgcatcttgttgatatagttagtaccaaataattcttataagcattccttcaaccatgtagtctcataccta 31821803  T
Q  380 tacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttt 420  Q
     | | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31821804 catggcctcatgatccctctcattccgatgtgattcggttt 31821844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3652793 - 3652666
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3652793 attgtcaactgaccctacaaaccaacaagagtcttttcagctttttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaagcttcccggtaggtcacccatccaaa 3652694  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaact 271  Q
     | | |||||||||||||| ||||||||    
T  3652693 gactactccaagtcaagcaagcttaact 3652666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 325 - 431
Target Start/End: Original strand, 9440485 - 9440591
Alignment:
Q  325 ggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcc 424  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9440485 ggtagtaccaaacaattcttataagccttcattcaaccatgaagtcccatacctgcacgacttcaggatccctctcattccgatgtgattcagttttccc 9440584  T
Q  425 tagaagc 431  Q
    |||||||    
T  9440585 tagaagc 9440591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 12194580 - 12194324
Alignment:
Q  162 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagc 261  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| |||| || || | |||||| | |  |||||| |||||| |||||||||||| ||||| |    
T  12194580 aaaccaacatgagtcttttcagtgtgttttgtccaaactcacacgttttctggaaaactttctaaaaggtcatccatcctaaaattgctccatgtcaaac 12194481  T
Q  262 acgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaac 361  Q
    | |||||||| || |||||||||| |||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |  |||||| ||| ||||||     
T  12194480 atgcttaactgtggagttcttatggaatgaattataaaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtgccaaaaaaat-ttataagtctttcttcaat 12194382  T
Q  362 catgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttt 420  Q
    ||||||||  |||| ||| |||  ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  12194381 catgcagt-tcatatctgcacggtctcaggattcctctcattccaatgtgattcggttt 12194324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28583249 - 28582957
Alignment:
Q  129 cagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagta 228  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| |||| |    
T  28583249 cagactgctttcgagattgccgactgaccccacaaactaacatgagtcttttcagtatgttttgtccccactcacacgctttctgggaaactttccagaa 28583150  T
Q  229 ggtcacccatccaaaaattgct-ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 327  Q
     || || ||| |||| | |  | ||| |||||| || |||| || || | |||||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28583149 agtaactcatacaaagactaattccatgtcaaggacacttagctgtggatttcttatggaatgaactaccggaaagatgatgcatcttgttgatatagat 28583050  T
Q  328 agtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtttt 421  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | | ||||||| ||||| |   |||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  28583049 cgtatcaaataattcttataagccttcattcaaccatacaat-ctatacctgcacgacttttagatcacttctattccgatgtgattcggtttt 28582957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 315
Target Start/End: Original strand, 2891177 - 2891340
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||| | | ||    
T  2891177 actgaccctacaaaccaacacgaatcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttac-cggaaacatcgtagtaggtcacccatccaaagactact 2891275  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatctt 315  Q
    |||| ||||||||  |||||| || |||| ||||| |||| |||||  |||  ||||||||||||    
T  2891276 ccaaatcaagcacatttaactgtggagtttttatggaatgggctaccaaaacaaagatgcatctt 2891340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 375
Target Start/End: Original strand, 3884984 - 3885194
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || |||| || || ||||| | |  | |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  3884984 acaaaccaacacaagtctttacatcgtgttttgtcctcactcacatgctt-cttgggaactttcgaa-atgtcacctatctcaaaattgctccaagtcaa 3885081  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||||||    || |||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  3885082 gcacgttcaactttgaagttcttatggaataagctac---caaaaagatgtattttgttagtatatgtagtaccaaacaattcttttaagcattccttca 3885178  T
Q  360 accatgcagtcccata 375  Q
    || |||||||| ||||    
T  3885179 actatgcagtctcata 3885194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 412
Target Start/End: Original strand, 28065745 - 28065982
Alignment:
Q  177 ttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaa 276  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |||||||  | ||||||||| |   |||| |||||||  |||| ||||| ||||||| || |||||| | || |    
T  28065745 tttttagcgtgttttgtcatcattcacacgctt-ttcggaaacttctcgaaaggttacccatcacaaaactgctcaaagtcaaacatgcttaattgtgga 28065843  T
Q  277 gttcttatgaaatgagctac---tgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtccca 373  Q
    ||||||||| ||| ||||||     |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||    
T  28065844 gttcttatggaataagctaccaaaaaaaaaaagatgcatcttgttgatagagatagtaccaaacaattcttataagctttcattcaatcatacagtctca 28065943  T
Q  374 tacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtga 412  Q
    |  ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28065944 tttctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 28065982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3653152 - 3653048
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||   ||||||||| |  ||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  3653152 acaaaccaatacgagtcttttcagcgtgttttgtcctc----gcacgcttatcgggaaacttctcgataggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 3653057  T
Q  260 gcacgctta 268  Q
    |||||||||    
T  3653056 gcacgctta 3653048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 387
Target Start/End: Original strand, 30729735 - 30729958
Alignment:
Q  162 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagc 261  Q
    |||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||| |   | || |||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||| || |||||     
T  30729735 aaaccaacacaagtctttttatcttgttttatccgcacttgtctgttttctaggaaacttcccaaaaggtcac--atcccaaaattgctcaaattcaaga 30729832  T
Q  262 acgcttaactatgaagttcttat-gaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaa 360  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||| || | ||||||||    
T  30729833 acgcttaactataaagttcttatagaattga-ctacccaaaagaagatcaatcatgtttatatacgtagtaccaaacaatttttatgagtcctccttcaa 30729931  T
Q  361 ccatgcagtcccatacctgtacgacct 387  Q
    |||||| ||| ||||| || |||||||    
T  30729932 ccatgctgtctcatacttgcacgacct 30729958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17205597 - 17205384
Alignment:
Q  155 atcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaa 254  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | || |    |||||| |    ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  17205597 atcccgcaaatcaacgcgagtcttttcggtgtgttttgttctcactcgcatgttttccgaaaaactttcataaaggtctcccatcccaaaattactccaa 17205498  T
Q  255 gtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttc 354  Q
     ||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||| |||||  |||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||  ||||    
T  17205497 atcaagcatgtttaacaatggagttcttatggaatgggctacc-aaaacaagatgaatcttgttggtaaaggtagtaccaaacaattcttataattcttc 17205399  T
Q  355 cttcaaccatgcagt 369  Q
     ||||| ||||||||    
T  17205398 attcaatcatgcagt 17205384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13490179 - 13490087
Alignment:
Q  356 ttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  13490179 ttcaaccatgcagtcctatacctgcacagcctcatgatctctctcatttcgatgtgattaagtttttcctagaagcatgtcaggagccggacc 13490087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27334364 - 27334305
Alignment:
Q  143 gattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 202  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27334364 gattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 27334305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27395104 - 27395045
Alignment:
Q  143 gattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 202  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395104 gattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 27395045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3653049 - 3652981
Alignment:
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtga 412  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3653049 tataagccttcgttcaaccatgcagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtga 3652981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11062083 - 11062032
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttac 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11062083 acaaaccaacacgagtttttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttac 11062032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 206
Target Start/End: Original strand, 31415972 - 31416026
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31415972 actgatcccacaaaccaacacga-tcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacg 31416026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15929434 - 15929344
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgctt 209  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||| | | ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15929434 tgtaacatcccagactgctttaaggattgccgagtgaccccacaaatcaacacaagtctttttagcgtattttgtcctcactcacacgctt 15929344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Original strand, 34660468 - 34660576
Alignment:
Q  228 aggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 327  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   || |||||||||| |||| ||||||| |    
T  34660468 aggtcacccatctaaaacttgcttcaagtcaagtatgcttaactatggagttcgtatgatttgagctaccagaaggaagatgcatattgtcgatatagat 34660567  T
Q  328 agtaccaaa 336  Q
    | |||||||    
T  34660568 aataccaaa 34660576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 194
Target Start/End: Original strand, 6331219 - 6331294
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtc 194  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6331219 tgtaacatctcagactgctttcaagattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcatgttttgtc 6331294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21312534 - 21312453
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcact 200  Q
    ||||| ||||||||||  |||| || |||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21312534 gtgtaacatcccagacgactttaaccattgtcgactgaccctacaaaccaacaccagtcttttcagc-tgttttgtcttcact 21312453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33470998 - 33470882
Alignment:
Q  253 aagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagcct 352  Q
    ||||||| ||||| ||||| || | |||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||  ||||| ||    
T  33470998 aagtcaaacacgcataactgtggaattcttatgtaatgaactacaaaaaagaatatgcatcttgttagtataggtaataccaagtaa-tctaataagtct 33470900  T
Q  353 tccttcaaccatgcagtc 370  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  33470899 tcctttaaccatgaagtc 33470882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 106
Target Start/End: Original strand, 21246925 - 21246980
Alignment:
Q  51 attcttgggttgagaaatactttacaaacatcttgggtagtgatatctcattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  21246925 attcttgggttgagaaacacttcacaaacactttgaatagtgatatctcattagaa 21246980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1664061 - 1663999
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttc 222  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1664061 acaaaccaacatgaatctttttagcatattttgttctcactcgcacgctttctaagaaacttc 1663999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26380982 - 26380920
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 206  Q
    |||||||||||| | || |||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  26380982 attgtcaactgaccacataaaccaactcgagtctttttagtgtgttttgtcctaactcacacg 26380920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 118 - 448
Target Start/End: Original strand, 35759458 - 35759788
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| || |||||||| |||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  35759458 gtgtaacaccccagactactttcatgattgccgactgaccccaaaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgaaaa 35759557  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35759558 acttcccggtaggtcaccaatcccaaaatagctccaagtcaagcacgtttaactatgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 35759657  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcag 417  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  35759658 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcaa 35759757  T
Q  418 ttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35759758 tttttcctagaagcatgctaggagccagacc 35759788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 20054387 - 20054683
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20054387 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 20054486  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20054487 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 20054586  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  20054587 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20054683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 20054843 - 20055139
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20054843 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 20054942  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20054943 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 20055042  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  20055043 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20055139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 20055299 - 20055595
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20055299 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 20055398  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20055399 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 20055498  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  20055499 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20055595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 20055755 - 20056051
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20055755 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 20055854  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20055855 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 20055954  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  20055955 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20056051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 20056211 - 20056507
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20056211 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 20056310  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20056311 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 20056410  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  20056411 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20056507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 20057114 - 20057410
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20057114 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 20057213  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20057214 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 20057313  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  20057314 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20057410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 20053931 - 20054227
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20053931 tgtaacatcccagactgctttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccagaaaa 20054030  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20054031 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcctagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 20054130  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  20054131 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20054227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 119 - 419
Target Start/End: Original strand, 20057570 - 20057870
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20057570 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 20057669  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20057670 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 20057769  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| || |||||||||||    
T  20057770 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcatttcggtgtgattcagt 20057869  T
Q  419 t 419  Q
    |    
T  20057870 t 20057870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 38341201 - 38340905
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  38341201 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccataaaccaacacgagtcttttccgcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 38341102  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38341101 cttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaatgaagatgcatcttgtt 38341002  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  38341001 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccatctcattccggtgtgattc 38340905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 50002926 - 50003222
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  50002926 tgtaacatcccagactgctttcaggattgctgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 50003025  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50003026 cttcccggtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttttggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 50003125  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50003126 gatataggtagtacccaacaattattataagtctccctttaaccatgcagtcctatacctgcatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 50003222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 117 - 415
Target Start/End: Original strand, 20845510 - 20845808
Alignment:
Q  117 agtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactagga 216  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20845510 agtgtaacatctcagactgctttcaagattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 20845609  T
Q  217 aacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttg 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20845610 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaatttctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 20845709  T
Q  317 ttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  20845710 ttgatataggtagtaacaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacggcctcaggaaccgtctcattccggtgtgattc 20845808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 118 - 434
Target Start/End: Original strand, 46693585 - 46693903
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  46693585 gtgtaacatcccaaactgctttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcataccgggaa 46693684  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  46693685 actttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatgaaatgagataccgaaaagaagatgcatcttgt 46693784  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc- 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  46693785 tgatataggtagtaccaaacaatttttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacatgcacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 46693884  T
Q  416 agttttgcctagaagcatg 434  Q
    | |||||||||||||||||    
T  46693885 acttttgcctagaagcatg 46693903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 50002558 - 50002854
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||| ||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  50002558 tgtaacatcctagacgactttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggggaa 50002657  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50002658 cttcccggtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactatggagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 50002757  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50002758 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatgcctacacggcctcaggatctctctcattccgatgtgattc 50002854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 119 - 378
Target Start/End: Original strand, 20056667 - 20056926
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20056667 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 20056766  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20056767 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 20056866  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20056867 gatataggtagtaccaaacaattctcataagccttccttcaaccctgcagtcccatacct 20056926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 114 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 52250506 - 52250205
Alignment:
Q  114 caaagtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacta 213  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  52250506 caaaatgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccg 52250407  T
Q  214 ggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatc 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  52250406 ggaaacttcccggtaggtcacccattccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatc 52250307  T
Q  314 ttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgat 413  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | | ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  52250306 ttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcgaccatgtagtcccatacctacaaggcctcatgatccctctcattccggtgtgat 52250207  T
Q  414 tc 415  Q
    ||    
T  52250206 tc 52250205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 16451784 - 16452080
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | | |||    
T  16451784 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcatcacgcgcacgcttattggaaaa 16451883  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16451884 ctttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgaactaccgaaaagaagatgcatcttgtt 16451983  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16451984 gatataggtagtacccaacaattcttataagctttccttcaaccatgtagtcccctacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 16452080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 16460937 - 16461233
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | | |||    
T  16460937 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcatcacgcgcacgcttattggaaaa 16461036  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16461037 ctttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgaactaccgaaaagaagatgcatcttgtt 16461136  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16461137 gatataggtagtacccaacaattcttataagctttccttcaaccatgtagtcccctacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 16461233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 199 - 448
Target Start/End: Original strand, 35760845 - 35761094
Alignment:
Q  199 ctcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactg 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||      
T  35760845 ctcgcacgcttaccgggaaacttcccgataggttacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactacggagttctcatggaatgagctacca 35760944  T
Q  299 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||    
T  35760945 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacggcctcaggatccctc 35761044  T
Q  399 tcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35761045 tcattccgatgtgattcaatttttcctagaagcatgccaggagccagacc 35761094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 127 - 359
Target Start/End: Original strand, 20060199 - 20060431
Alignment:
Q  127 cccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccag 226  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |    
T  20060199 cccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtctttccatcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccgg 20060298  T
Q  227 taggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 326  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060299 taggtcacccatcccaaaattgatccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 20060398  T
Q  327 tagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  20060399 tagtaccaaacaattcttataagctttccttca 20060431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 126 - 404
Target Start/End: Original strand, 51372732 - 51373010
Alignment:
Q  126 tcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttccca 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||      
T  51372732 tcccatactgctttcaagattgccgattgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcggattttgtcctcactcgcacgcttaccgaaaaacttcctg 51372831  T
Q  226 gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  51372832 ataggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaataagatgcatcttgtcgatatag 51372931  T
Q  326 gtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattc 404  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||    
T  51372932 gtagtactaaacaattcttataagccttccttcaaccatacagtcacatacctgtatggcctcgggatccctctcattc 51373010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Original strand, 43057415 - 43057670
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||    
T  43057415 acaaaccaacacaagtctttttagcgtgttttgttctcactcacatgcttaccgggaaacttcccagtaggtcaccgatccaaagaccactccaagtcaa 43057514  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
     ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43057515 tcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 43057614  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||| |||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43057615 accatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 43057670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 114 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52250843 - 52250641
Alignment:
Q  114 caaagtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacta 213  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||      
T  52250843 caaaatgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacacttaccg 52250744  T
Q  214 ggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatc 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  52250743 ggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatc 52250644  T
Q  314 ttg 316  Q
    |||    
T  52250643 ttg 52250641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 114 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52251180 - 52250978
Alignment:
Q  114 caaagtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacta 213  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||      
T  52251180 caaaatgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacacttaccg 52251081  T
Q  214 ggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatc 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  52251080 ggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatc 52250981  T
Q  314 ttg 316  Q
    |||    
T  52250980 ttg 52250978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 151 - 415
Target Start/End: Original strand, 43056948 - 43057211
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  43056948 actgaccctacaaaccaacacaagttttttcagtgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatccaaagaccact 43057047  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    | ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||    
T  43057048 ctaagtcaatcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttctaagc 43057147  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  43057148 cttccttcaaccatgtagtcacatacctacacggccttaggatc-ccctcattctgatgtgattc 43057211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 265 - 448
Target Start/End: Original strand, 20061188 - 20061371
Alignment:
Q  265 cttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccat 364  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20061188 cttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccat 20061287  T
Q  365 gcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  20061288 gcagtcccatacctgcacgacctcaggatccctctcattctgatgtgattcagtttagcctagaagattgccaagagccggacc 20061371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2328463 - 2328281
Alignment:
Q  266 ttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatg 365  Q
    |||||| || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2328463 ttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatg 2328364  T
Q  366 cagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2328363 cagtcccatacctgtacggcctcataatttctctcattccaatgtgattcagttttgcctaaaagcatgccaggagccagacc 2328281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 229 - 415
Target Start/End: Original strand, 50002246 - 50002432
Alignment:
Q  229 ggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 328  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50002246 ggtcaccaatcccaaaattgctccaagtcaagcacactcaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgataaaggta 50002345  T
Q  329 gtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50002346 gtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatgcctacacggcctcatgatccctctcattccgatgtgattc 50002432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12883776 - 12883523
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||    || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||    
T  12883776 acaaatcaacacgagt-ttttcagcatgttttgtccacaaaa-catgcttactgggaaacttcccagtaggtcatccatccaaaaactacttcaagtcaa 12883679  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
     ||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  12883678 acacacttaactgtggagtttttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtattccttca 12883579  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  12883578 atcatgcagtcccatacctgcacagcctcgggatccatctcattccggtgtgattc 12883523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 229 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 2635109 - 2634909
Alignment:
Q  229 ggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 328  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2635109 ggtcactcatccaaagattactccaagccaaacacgcttaactgtggagttcttattgaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggta 2635010  T
Q  329 gtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctaga 428  Q
    |||||||| ||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2635009 gtaccaaacaattcttatgagttatccttcaaccatgcagtcccatacctgcacaacctcatgatccctctcattccgatgtgattc-gatttgcctaga 2634911  T
Q  429 ag 430  Q
    ||    
T  2634910 ag 2634909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 118 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16907531 - 16907269
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctc-actcgcacgcttactagga 216  Q
    ||||| |||||||  ||||||| | ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||| ||| ||||   | ||    
T  16907531 gtgtaacatcccatgctgctttaaggattgttggctgaccccacaaaccaacacgagtctttccagtgtattttgtcctttacttgcatgcttttcaaga 16907432  T
Q  217 aacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttg 316  Q
    |||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  16907431 aacttctcaaaaggtcacccatctcaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactatggagttcttgtagaatggaccactgaaaagaagatgtatcttg 16907332  T
Q  317 ttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctg 379  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  16907331 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgcagtttcatacctg 16907269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 185 - 414
Target Start/End: Original strand, 31822577 - 31822809
Alignment:
Q  185 gtgttttgtcctcactcgcacgcttactagga---aacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  |||   ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  31822577 gtgttttgtcctcactcgcacgtctacagggaaataacttccgagtaggtcgtccatcccaaaattgttccaagtcaaaaacgcttaactgtggagttct 31822676  T
Q  282 tatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgta 381  Q
    | || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||  |    
T  31822677 tttggattgagctaccgaaaagaagatgcatattgttgatatatgtagtaccaaataattcttataaatcttccttcaaccatgtagtctcatacctaca 31822776  T
Q  382 cgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    || ||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  31822777 cggcctcatgatccctctcattctgatgtgatt 31822809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 160 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23180984 - 23180713
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  |   |||||| |||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  23180984 acaaaccaacattagtcttttcagcatgttttgtcgtcactcgcacattttttgaaaaactttccagaaggtaacccatcccaaaatttctccaagtcaa 23180885  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||| | || | |||||||| |||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||    
T  23180884 gcacgcttaattgtggaattcttatggaatgggctagcgaatagaagatacatcttgttgatataggtagtaccaagcaattcttataatcattccttca 23180785  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagc 431  Q
    |||| | |||||||| |||  ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  23180784 accacgtagtcccattcctacacggcttcaagatccctctcattccaatgtgattcaatttttcctataagc 23180713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 215 - 415
Target Start/End: Original strand, 30872897 - 30873097
Alignment:
Q  215 gaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatct 314  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| |||||| | || |||||||||  ||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  30872897 gaaacttttcagtaggtcacccatccaaagactactgcaagtcaagcatgcttaattgtggagttcttatagaatggactaccaaaaagaagatgcatct 30872996  T
Q  315 tgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  30872997 tgttgatataggtagtatcaaacaattcttaaaagtcttccttcaaccatacagtctcatacctgcacggcctcagaatccctctcattccggtgtgatt 30873096  T
Q  415 c 415  Q
    |    
T  30873097 c 30873097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 214 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7548291 - 7548085
Alignment:
Q  214 ggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatc 313  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  7548291 ggaaacttctcggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagtacgcttaattgtggagttcttatcaaatgggctaccaaaaagaatatgcatc 7548192  T
Q  314 ttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgat 413  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||  |||||| ||||||| || |||| |||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  7548191 ttgttgatatagttaataccaaacaatttttataagtcttcctttaatcatgtagtctcatacctacacggcctcatgatccctctcattgcaatgtgat 7548092  T
Q  414 tcagttt 420  Q
    |||||||    
T  7548091 tcagttt 7548085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 2634720 - 2634449
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||  | | ||||||||||| | |||| ||||||||| | | |||||||||||    
T  2634720 acaaacaaacaagagtcttttcagcgtgcttcatcctcattcgcatgctttttggaaaacttcccagaatgtcatccatccaaagactactccaagtcaa 2634621  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||  |||   |||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||| |    
T  2634620 gcacgtttaacagtgaagttcttattgaatagactatcgaaaagaagatgcatcttgtttgtatagctagtaccaaacaattcttgcaagccttccttta 2634521  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggat-cactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagc 431  Q
    | |||||| || ||||| |  || |||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2634520 atcatgcaatctcatacatacacaacctcaggatcccctctcatttcgatgtgattcggtttt-cctagaagc 2634449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 249 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12728157 - 12728027
Alignment:
Q  249 ctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagt-accaaataattcatata 347  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||    
T  12728157 ctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggcagtaaccaaacaattcttata 12728058  T
Q  348 agccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  12728057 agtcttccttcaaccatgttgtcccatacct 12728027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 376
Target Start/End: Original strand, 16410611 - 16410831
Alignment:
Q  156 tcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaag 255  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||| || ||||||| |||||| || ||||||||| ||| | || |  ||||| ||| ||||||||||    
T  16410611 tcccacaaactaacacaagttttttcaacatgttttatcatcactcgtacgctttcttggaaacttctcagaatgttaaacatcccaaacttgctccaag 16410710  T
Q  256 tcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcc 355  Q
    |||| || | |||||| |||||||||| |  |||  |||||  |||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  16410711 tcaaacatgtttaactttgaagttcttctagaataggctaccaaaaacaagatgcatcttgttggtattggtagtagtaaataattcttataagctttcc 16410810  T
Q  356 ttcaaccatgcagtcccatac 376  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  16410811 ttcaacaatgcattcccatac 16410831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Original strand, 31822970 - 31823091
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||    
T  31822970 tgtaacatcccagaatgctttctggattgctgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaaa 31823069  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatcc 240  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31823070 cttcccagtaggtcacccatcc 31823091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 207
Target Start/End: Original strand, 35759915 - 35760003
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35759915 tgtaacatcccagactgctttcatgattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcgctcgcacgc 35760003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 376
Target Start/End: Original strand, 16440470 - 16440687
Alignment:
Q  159 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtca 258  Q
    |||||||||||||  || |||| |||||||||  |||||||||| |||||| |||||||  |||  || |  | || ||||| ||||||||| | |||||    
T  16440470 cacaaaccaacacatgtttttttagcgtgtttaatcctcactcgtacgctttctaggaagtttcttagaaccttactcatcccaaaattgcttcgagtca 16440569  T
Q  259 agcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttc 358  Q
    | ||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| | ||| |||||| ||| ||||    
T  16440570 atcacacttaactttgaagttattatagaatgagctaccaaaaagaatatgcatcttgttgttatcggtagtagcaaacagttcttataagtctttcttc 16440669  T
Q  359 aaccatgcagtcccatac 376  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  16440670 aaccatgtattcccatac 16440687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 10820758 - 10820591
Alignment:
Q  250 tccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaa--gatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatata 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |  ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10820758 tccaagtcaagcacgcttaactgtgaatttcttatgaaatgagtcatcgaaaaaaaaagatgtatcttattgatataggtagtaccaaacaattcttata 10820659  T
Q  348 agccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |  ||||||||||||||| ||||| |||| |  ||  |||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  10820658 aatcttccttcaaccatgtagtccaatacatacaccgcctcataatccctctcactccgatgtgattc 10820591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 332
Target Start/End: Original strand, 7229794 - 7230007
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||| |||||| ||||  ||||| | ||| | |||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||||      |||    
T  7229794 tgtaacatcctagactgttttcttgattgacgactcaccccacaaagcaacacgagttttttcagcatgttttatcctcactttcacgcttttcgaaaaa 7229893  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||   |  |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| || ||||    
T  7229894 ctttatataaggtcaccaatcctaaaattgctccaagtcaaacatgcttatctatggagttcttatgtaatgaactaccgaaatgaagatgcttcgtgtt 7229993  T
Q  319 gatataggtagtac 332  Q
    ||||||| ||||||    
T  7229994 gatatagttagtac 7230007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7547907 - 7547791
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||     |||||| || ||||||||||||||||||    
T  7547907 attgtcgactgaccctacaaatcaacacgagacttttcagtgtgttttgtccttactcgcacgcttatcgaaaaactttccggtaggtcacccatccaaa 7547808  T
Q  244 aattgctccaagtcaag 260  Q
     | | ||||||||||||    
T  7547807 cactactccaagtcaag 7547791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Original strand, 49996531 - 49996613
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 201  Q
    |||| |||| ||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49996531 tgtaacatctcagactgcttttaggattgccgactgaccccacaaactaacaagagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 49996613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 193
Target Start/End: Original strand, 28181350 - 28181418
Alignment:
Q  125 atcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgt 193  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28181350 atcccatactgctttcaggattgtcaactgcctccacaaaccaacacgagtcttttcagagtgttttgt 28181418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2739694 - 2739545
Alignment:
Q  242 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataatt 341  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||   |||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  2739694 aaaattgctcaaagtcaaacacacttaaccatgaagttcttatggaatagactataaaaaagaagatacatattgttgatatatgtagtgctaaacaatt 2739595  T
Q  342 catataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcagg 391  Q
    | |||||| ||| | | |||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  2739594 cttataagtctttccttaaccatacagtctcatacctatacaaccccagg 2739545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 342
Target Start/End: Original strand, 31823097 - 31823158
Alignment:
Q  281 ttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattc 342  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31823097 ttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcattttattgatataggtagtaccaaataattc 31823158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39582604 - 39582553
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 202  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39582604 actgatcctacaaaccaaaacgagtcttctcagcgtgttttgtcctcactcg 39582553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Original strand, 7067867 - 7067933
Alignment:
Q  216 aaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttctt 282  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7067867 aaacttctcagaaggtcacccatccaaatactactccaagtaaaacacgcttaactatgaagttctt 7067933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8278143 - 8278081
Alignment:
Q  228 aggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatg 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  8278143 aggtcacccatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagtctttatgaaatg 8278081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 46411030 - 46411208
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    ||| ||  |   |||||| | || ||||||| ||||| ||||    ||||| ||||    
T  46411030 acaaaccaacacgagtcttttcaatttgttttgtcctcac----acgttttttgaaaaactttctagaaggtcactcatcccaaaacatatccaaatcaa 46411125  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaaga-tgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattc 342  Q
     || ||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46411126 tcatgcttaactatgaagttcttatgaatgga-ctacaaaaaaaaataatgcatcttattgatataggtagtaccaaataattc 46411208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 290
Target Start/End: Original strand, 35009954 - 35010018
Alignment:
Q  226 gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatg 290  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||    
T  35009954 gtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaaccgtggagttcttatggaatg 35010018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 403
Target Start/End: Original strand, 842907 - 843068
Alignment:
Q  242 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataatt 341  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||| |  ||||||||||  | || |||   ||||||| |||||||||||||  || | |||||||||| ||||    
T  842907 aaaattgttcaaagtcaagcacgttcaactgttgagttcttatgtgacgatctatcaaaaagaacatgcatcttgttggaatggatagtaccaaacaatt 843006  T
Q  342 catataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcatt 403  Q
    | || | | |||||||||| ||||||| | |||||||  |||| |||| |||| ||||||||    
T  843007 cttacacgacttccttcaatcatgcagacacatacctacacgatctcatgatccctctcatt 843068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35168775 - 35168718
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 201  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  35168775 attgtcaactgaccccacaaatcaatacgagtctttcccgcgtattttgtcctcactc 35168718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 105
Target Start/End: Original strand, 918330 - 918365
Alignment:
Q  70 ctttacaaacatcttgggtagtgatatctcattaga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  918330 ctttacaaacatcttgggtagtgagatctcattaga 918365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 144 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12100960 - 12100665
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12100960 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacgaggaaacttcccggtaggtcacccatccaaa 12100861  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  12100860 a-ttgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggtagtaccaaacaaatct 12100762  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggag 441  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12100761 tataagcttgccttcaaccatgcagtctcatacctgtacggcctcaggatc-ttctcatttcgatgtgattcagtttttcctagaagcatgccaggag 12100665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 130 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25147819 - 25147502
Alignment:
Q  130 agactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtag 229  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  25147819 agactgctttcaggattgccgactga-cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtactcactcgcacgcttatcaggaaacttcccggtag 25147721  T
Q  230 gtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 329  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25147720 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgattaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 25147621  T
Q  330 taccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaa 429  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||   || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25147620 caccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctacacagtcttaggatctctctcattccgatgtgatttagttttgcctagaa 25147521  T
Q  430 gcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  25147520 gcatgccaagagccggacc 25147502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Original strand, 34308330 - 34308659
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||    
T  34308330 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccagcacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacatgcttaccgggaaa 34308429  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34308430 cttcccggtaggtcacccatctcaaaattgctccaagccaagcacgcttaagtgtggagttcttatggaataggctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 34308529  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  34308530 gatataggtagtaccaaacagttcttataagccttccttcaaccatacagtctcatacttgtacggcctcaggatccctttcattccgatgtgattcagt 34308629  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34308630 tttgcctagaagcacgccaggagccggacc 34308659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Original strand, 34308786 - 34309119
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||    
T  34308786 tgtaacatcccagactgctttcaggattgctgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacatgcttaccgggaaa 34308885  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34308886 cttcccggtaggtcacccatctcaaaattgctccaagccaagcacgcttaactgtggagttcttatggaataggctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 34308985  T
Q  319 g----atataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    |    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34308986 gatatatataggtagtaccaaacagttcttataagccttccttcaaccatacagtctcatacttgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgatt 34309085  T
Q  415 cagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34309086 cagttttgcctagaagcatgccaggagccggacc 34309119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 119 - 414
Target Start/End: Original strand, 22548400 - 22548695
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22548400 tgtaacatcccatactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaa 22548499  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22548500 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 22548599  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  22548600 gatataggtagtaccaaacaattcttataaaacttccttcaaccatgcagtcacatacctgcacagcctcaggaaccctctcattccggtgtgatt 22548695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 119 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25148261 - 25147937
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||| || |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  25148261 tgtaacatctcatactgcttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgacctcactcgcacgttta-tcggaaa 25148163  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25148162 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgtt 25148063  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  25148062 gatataggtaagaccaaacaattcttataagccttccttcaacgacacagtcccatacctacacgacctcgggatccctctcattcttatgtgattcagt 25147963  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagcca 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25147962 tttgcctagaagcatgccaggagcca 25147937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 22548846 - 22549142
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22548846 tgtaacatcccatactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtctgttcagcgtgttttatcctcactcgcacgcttactgggaaa 22548945  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22548946 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagtttttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 22549045  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  22549046 gatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcagtcacatacctgcacagcctcaggaagcctctcattccggtgtgattc 22549142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 119 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 17103377 - 17103086
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17103377 tgtaacatcccagacgacttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 17103278  T
Q  219 cttcccagtaggtca-cccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17103277 cttcccggtaggtcaacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaaccgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcagcttgt 17103178  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatg 409  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17103177 tgatataggcagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcagtctcatacctgtacggcctcaggatctctctcattccgatg 17103086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22026675 - 22026378
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  22026675 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgtttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaa 22026576  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    |||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22026575 acttcccgataggttacccatcccaatattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 22026476  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  22026475 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttcattcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcacgaaccctctcattccggtgtgattc 22026378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 27022190 - 27022485
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  27022190 tgtaacatcccagactgcttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaa-aaa 27022288  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||    
T  27022289 ctttccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctgccgaaaataagatgcatgttgtt 27022388  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27022389 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgtagtcccatacctacatggcctcaagatccctctcattccgatgtgattc 27022485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 151 - 415
Target Start/End: Original strand, 41658988 - 41659252
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  41658988 actgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttacagggaaacttcccggtaggtcacctatcccaaaattgct 41659087  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  41659088 ccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatgtaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagt 41659187  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  41659188 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacgacatcaggaaccctctcattccggtgtgattc 41659252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 12827105 - 12827401
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||    
T  12827105 tgtaacatcccagactgctttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttaaaagtgttttaacctcactcgcacacttaccgggaaa 12827204  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12827205 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 12827304  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  12827305 gatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccaagtagtcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccggcgtgattc 12827401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27926193 - 27925898
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||  |||| |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  27926193 tgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaa 27926094  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27926093 cttcccggtacctcacccatcccaaa-ttgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 27925995  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  27925994 gatataggtagtaccaaacaattcttataatccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 27925898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 119 - 411
Target Start/End: Original strand, 10844466 - 10844758
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||    
T  10844466 tgtaacatcccagacgacttttaggattgtcgactgaccctacaaacaaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaaa 10844565  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10844566 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 10844665  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtg 411  Q
     ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  10844666 aatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcaaggcctcaggaaccctctcattccggtgtg 10844758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Original strand, 21315961 - 21316289
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  21315961 tgtaacatcccagactgcttttaggattgtcgattgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacc-ggaaa 21316059  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||| | ||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21316060 cttcgcggtaggtcacccttaccaaaattactccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatgaaatgagctactgaaaagacgatgcatcttgtt 21316159  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||  || || |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||| |    
T  21316160 gatataggtagtaccaaacaattcttttaagcgctcatttaaccatacagtctcatacctgcacggccttaggatccctctcatcgcgatgtgattcaat 21316259  T
Q  419 tttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||| |||||| || |||||| |||| ||||    
T  21316260 ttttcctagatgcttgccagaagccggacc 21316289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 160 - 419
Target Start/End: Original strand, 8080234 - 8080493
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| | | |||||||||||    
T  8080234 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcctagtaggttacccatccaaagactactccaagtcaa 8080333  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||    
T  8080334 gcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttatcagctttccttca 8080433  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8080434 accatgtagtcccatacctacacggcttcaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 8080493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 229 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25144957 - 25144738
Alignment:
Q  229 ggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 328  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25144957 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgctgatataggta 25144858  T
Q  329 gtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctaga 428  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25144857 gtaccaaacaattcttataagcctgccttcaatcatgcaatcccatacctgcacgacctcgagatctctctcattctgatgtgattcagttttgcctaga 25144758  T
Q  429 agcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25144757 agcatgccaggagccagacc 25144738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 151 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2044321 - 2044057
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| | | ||    
T  2044321 actgaccctacaaaccaatacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccattaggtcacccatccaaagactact 2044222  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  2044221 ccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagc 2044122  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2044121 cttccttcaaccatgtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 2044057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 32292651 - 32292396
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||||||    
T  32292651 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccggaaaacttcccggtagatcacccatccaaagactactccaagtcaa 32292552  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  32292551 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctagcaaaaagaagatgcaacttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagcattccttca 32292452  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  32292451 accatgcagtcccatacttgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 32292396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28453628 - 28453334
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcc 223  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  28453628 catcccagactgcttttaggattgtcgactgatcttacaaacaaacacgactcttttcagcatgttttgtcctcactcgcagtcttattaggaaacttcc 28453529  T
Q  224 cagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 323  Q
     ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  28453528 gagtaggtcatccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtagagttcttatggaatgggctaccataaagaagatgcatcttgttaatat 28453429  T
Q  324 aggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    ||||||||  ||| ||||| ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28453428 aggtagtataaaacaattcttataagttttctttcaaccatgaagtctcatacctgcacgacctcgggatccctctcattccggtgtgattcagt 28453334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 119 - 339
Target Start/End: Original strand, 31283503 - 31283722
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  31283503 tgtaacatcccagacgactttcaacattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgcgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 31283602  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31283603 cttcccggtaggtcacccatcc-aaaattgctcaaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 31283701  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataa 339  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  31283702 aatataggtagtaccaaataa 31283722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 419
Target Start/End: Original strand, 33852150 - 33852409
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  33852150 acaaatcaacatgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcatgaaactttccgataggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 33852249  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  33852250 gcacgcttaattgtgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatacatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagttttccttca 33852349  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||  ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  33852350 accatacagtctcatacctgcacggtctcgggatccctctcattctggtgtgattcagtt 33852409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 125 - 431
Target Start/End: Original strand, 27819105 - 27819409
Alignment:
Q  125 atcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttccc 224  Q
    |||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| | |||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| || | ||||||  |    
T  27819105 atcctagactgcttttaggattgtcgactgaccccacaatc-aacacgggtcttttcagtgtgctt-gtcctcactcacacgctttctggaaaacttatc 27819202  T
Q  225 agtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatata 324  Q
    || |||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27819203 agaaggtcacccatccaaatactactcaaagtcaaacacacttaactgtggagtttttatggaatgagctattgaaaagaagatgcattttgttgatata 27819302  T
Q  325 ggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcc 424  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27819303 ggtagtaccaaacaattcttattagccttccttcaaccatgaagtctcatacttgcatgacttcatgatccctctcattctgatgtgattcggttttgcc 27819402  T
Q  425 tagaagc 431  Q
    || ||||    
T  27819403 taaaagc 27819409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41913240 - 41913005
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| || | |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  41913240 attgtcgactgaccctataaactaacacgagttttttcaacgtgttttgtcctcacttgcacgcttaccaagaaactttctagtaggtcactcatccaaa 41913141  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     | | || ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  41913140 gactacttcaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagacgcatcttgttgatataggtagcaccaaacaattct 41913041  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctg 379  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41913040 tataagccttctttcaaacatgcagtcccatacctg 41913005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 254 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 10845043 - 10844882
Alignment:
Q  254 agtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagcctt 353  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  10845043 agtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcttt 10844944  T
Q  354 ccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  10844943 ccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 10844882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 230 - 415
Target Start/End: Original strand, 6464872 - 6465057
Alignment:
Q  230 gtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 329  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6464872 gtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttgttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtag 6464971  T
Q  330 taccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||    
T  6464972 taccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagttccatacctacacggcctcatgattcctctcattccaatgtgattc 6465057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32292236 - 32292092
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  32292236 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 32292137  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcac 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  32292136 cttcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcac 32292092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 403
Target Start/End: Original strand, 28375042 - 28375189
Alignment:
Q  256 tcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcc 355  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28375042 tcaagcacgcttaactatgaagctgttatggaaagagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatgtaggtagtaccaaacaattcttataagccttcc 28375141  T
Q  356 ttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcatt 403  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  28375142 ttcaatcatgcagtctcatacctgcacggcctcaggatccctctcatt 28375189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 144 - 419
Target Start/End: Original strand, 30527358 - 30527630
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  || |  |||| |||||||||||||    
T  30527358 attgtcgactgatcctacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttatcctcactcgcacgcttaccgggaagttttcaggtagatcacccatccaaa 30527457  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     ||| ||| ||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||     
T  30527458 gattactcaaagtcaaacaatcttaactgtggagttcttatgaaatgggctacccaaaagaagatgtatcttattgatgtaagtggtaccaaacaattct 30527557  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    |||||| | |  ||||| ||||||||| |||||  ||||| |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  30527558 tataagtc-tggttcaaacatgcagtctcatac--gtacggcctcggaatccctctcattccagtgtgattcagtt 30527630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 365
Target Start/End: Original strand, 15818905 - 15819112
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagt 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    ||||||||||||| ||||| ||||||||||   | ||||||||    
T  15818905 cccacaaaccaacacaagtcttttcagtgtgctttgtcctcactcgcacacttttcgggaaacttcccagaaggtcgcccatccaaagcctactccaagt 15819004  T
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcct 356  Q
    ||||||   |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  15819005 caagcaaatttaactgtga-gttcttatggaatgtgctaccgaaaagaagatgcatcatgttgatatatgtagtaccaaacaatttttctaagcattcct 15819103  T
Q  357 tcaaccatg 365  Q
    |||||||||    
T  15819104 tcaaccatg 15819112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 3744895 - 3744663
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||| ||| ||  |||||||| ||    |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  3744895 cccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgttctcattaacacactttctgagaaacttctcaaatagtcaccaatcccaaaattgctcaaagt 3744796  T
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcct 356  Q
     ||  | |||||| | |  ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  3744795 taataaagcttaattgtagagttcttatgaaatgtgctaccaaaaagaaggtgcatattgttggtataggtagtgtcaaacaattcttataagtcttcct 3744696  T
Q  357 tcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctca 389  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3744695 tcaaccatgcagtcccatacctacacgacctca 3744663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6466969 - 6466711
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||| |||||  ||||||| | |||| |||| |||||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  6466969 actgaccccacaaaccaacatgagtttttttagtgtgctttgttttcactcgtatgctttctagaaaacttccaagaaggtcacccataccaaaattgct 6466870  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||     
T  6466869 ccaagtcaagtacacttaaatttgtagttcttatgaaatg-gcta-tgaaa--aagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaatttttataagt 6466774  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgatt 414  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||| | ||   ||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  6466773 c-tcctttaaccatgcagttccatacccgcacagtctcagaatccctctcattctgatatgatt 6466711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3745355 - 3745104
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |  ||| || |||||||  |  |||||||| |||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  3745355 acaaatcaacatgagtcttttcagcatgttttattatcattcacacgctttttgagaaacttctcagatggtcagccatcccaaaattgctctaagtcaa 3745256  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||| ||| || |||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||||  ||||||||    
T  3745255 gcacgcttgactgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatattgttggtataggtagtactaaacagttcttataagttttccttca 3745156  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtg 411  Q
    |||||| |||||    |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  3745155 accatgtagtccttagcctgcacgaccttaggatccctctcatttcgatgtg 3745104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 226 - 419
Target Start/End: Original strand, 22840488 - 22840680
Alignment:
Q  226 gtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
    |||||||||||||||||| | |  || |||||||||| | ||| || || |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  22840488 gtaggtcacccatccaaagactaatctaagtcaagcatgatta-ctgtggagttcttatggaatgagctaacaaaaagaagatgcatcttgttgatatag 22840586  T
Q  326 gtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
     |||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22840587 atagtaccaaacaattcttataagtcttcattcgaccatgtagtctcatacctacaaagcctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 22840680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 415
Target Start/End: Original strand, 30334786 - 30335055
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||  ||| ||  | ||||||||| ||  | |||||| |||||||    
T  30334786 attgtcgattgatcccacaaatcaacatgagtctttttaacgtgttttgttttcactc--acgttttatgggaaacttctcataatgtcacctatccaaa 30334883  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
     | |  | |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||      
T  30334884 taatatttcaagtcaaacacatttaactatgaagttattatgaattgagctatcgaaaagaagatgtatcttgttggtataggtagtatcaaacaatttt 30334983  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||   |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  30334984 tataagtcttctttcaaccttgcagtcgcatacctgcacagtctcaggatccatctaattccgatgtgattc 30335055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1297242 - 1297042
Alignment:
Q  179 ttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagt 278  Q
    |||| |||| |||||||||| | |||| ||| || | ||||||  ||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||||| |||    
T  1297242 ttcaacgtgctttgtcctcatttgcacactttcttgaaaacttttcagaaggtcactcatccaaagattacttcaagtcaaacacacttaactatggagt 1297143  T
Q  279 tcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
    ||||||  |||| | ||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||| |||||||    
T  1297142 tcttatataatgggataccgaaaagaatataaatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagttttacttcaaccatgcagtctcatacct 1297043  T
Q  379 g 379  Q
    |    
T  1297042 g 1297042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6466546 - 6466255
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcc 223  Q
    ||||||||||  ||||||  |||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||  |  |||||||||    
T  6466546 catcccagacgactttcagtattgccgactggccccacaaaccaacacaagtctttttagcgtgctttgtcctcactcgtatgctttttgagaaacttcc 6466447  T
Q  224 cagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 323  Q
    ||  ||| |||  |||  ||||||||| |||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||| |||    
T  6466446 caaaaggccacttatctcaaaattgcttcaagtcaagcacacctaacaatggatttcttatgaaatga-ctaccaaaaggaagatgcaacttgttggtat 6466348  T
Q  324 aggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattca 416  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||  | | || || |||| |||||||||| || ||   ||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  6466347 aagtagtaccaaacaattcatattagtatacttttaaacatgtagtcccatacatgcactctctcagaattcctctcattctgatgtgattca 6466255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22705424 - 22705181
Alignment:
Q  165 ccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatcca--------------aaaattgct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||              || | | ||    
T  22705424 ccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactggcacgcttactggaaaacttcccggtaggtcacccgtccaaagctactcattcaaagactact 22705325  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |        |||| |||| | |||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  22705324 ccaagtcaagcacgcttaactgt--------tatggaatgggttaccaaaaaga---tgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataacc 22705236  T
Q  351 cttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattcc 405  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  ||| | |||||||| ||||||||||    
T  22705235 cttccttcaatcatccagtcccatacctacacggcttcaggatccctctcattcc 22705181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 293 - 404
Target Start/End: Original strand, 27021904 - 27022015
Alignment:
Q  293 ctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcagga 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | | ||||||||    
T  27021904 ctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcttatacctacatggcctcagga 27022003  T
Q  393 tcactctcattc 404  Q
    || |||||||||    
T  27022004 tccctctcattc 27022015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 420
Target Start/End: Original strand, 15567516 - 15567708
Alignment:
Q  228 aggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 327  Q
    |||||| |||| | |||| | ||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  15567516 aggtcatccattccaaaactactccaagtcaaacacgattaactgcggagttcttatgaaatgaactaccaaaaagaagatgtatcttgttggtatatgt 15567615  T
Q  328 agtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttt 420  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||  |||| ||  |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15567616 agtgtcaaacaattcttataagccttccttccaccatgatgtctaatacttgcgcgatgtcaagatctctctcattccgatgtgattcagttt 15567708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10729870 - 10729722
Alignment:
Q  167 aacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||| ||| | | ||||||||| | ||||||    
T  10729870 aacacgagtcttttcagcgtgctttgtccacactcgcacgctttctaggatatttcccataaggtcacccatcaaaagactactccaagtctatcacgct 10729771  T
Q  267 taactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatctt 315  Q
    ||| | || |||||||||| |||| |  || ||||| ||||||||||||    
T  10729770 taattgtggagttcttatggaatgggtaacagaaaacaagatgcatctt 10729722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25308027 - 25307855
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    |||||| | |||| |||||||||||||| | | |     
T  25308027 actgatcccataaatcaacacgagtcttttcagcgtactttgtcctcactcgcacgcttgccgaaaaactttcaagtacgtcacccatccaaagactaca 25307928  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 325  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||   |||| |||||   ||| |||||| |||||||||||||||    
T  25307927 ccaagtcaagcaagcttaactgtggagttcttacagaatgggctac--caaaaaagatgtatcttgttgatatag 25307855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 402
Target Start/End: Original strand, 15567898 - 15568139
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagt 256  Q
    |||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||  || |   ||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||  |||    
T  15567898 cccacatactaacacgggtctttttaacgtgttttgtcctcactctcacattttccgagaaacttcctagaaattcacccatcccaaaattgctctgagt 15567997  T
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcct 356  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||| |||  |   |    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  15567998 caagtacgcttaattgtggagttcttattaaaaaaaaaa----aaaaaagatgcatcttgttgatataggtcataccaaacaattgttataagtcttcct 15568093  T
Q  357 tcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcat 402  Q
    ||||||| | |||| ||||  ||||||  ||||||||| |||||||    
T  15568094 tcaaccaagaagtcacatatttgtacggtctcaggatctctctcat 15568139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 17429611 - 17429501
Alignment:
Q  303 gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcat 402  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || |||  |||| |||| |||||||    
T  17429611 gaagatacatcttgttgatataggtagtaccaaataatactcataagtcttccttcaacaatgcagtcacatatatgcacggtctcaagatc-ctctcat 17429513  T
Q  403 tccgatgtgatt 414  Q
    ||||||||||||    
T  17429512 tccgatgtgatt 17429501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Original strand, 6463438 - 6463487
Alignment:
Q  162 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6463438 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttac 6463487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9251182 - 9251098
Alignment:
Q  117 agtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 201  Q
    |||||| ||||  |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9251182 agtgtaacatcatagactgctttcaggattgtcgattgaccccacaaaccaacacaagttttttcagcgtgttttgtcctcactc 9251098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 318
Target Start/End: Original strand, 10729603 - 10729736
Alignment:
Q  185 gtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttat 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||| |||  ||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| | || ||| |||||    
T  10729603 gtgttttgtcttcactcgcacgcttttcatgaaactttccataaggtcagtcatcccaaaattgcttcaagccaagcacccttaattgtggagtccttat 10729702  T
Q  285 gaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    | |||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  10729703 ggaataggctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 10729736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 28374008 - 28374116
Alignment:
Q  153 tgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctcc 252  Q
    ||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||||| | ||| ||||| | ||||| |||||||||||    
T  28374008 tgatctcacaaatcaatacaagttttttcagcgtgttttatcctcactcacacactttctagaaaactactcagaaggtcgctcatcc-aaaattgctcc 28374106  T
Q  253 aagtcaagca 262  Q
    ||||||||||    
T  28374107 aagtcaagca 28374116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 291
Target Start/End: Original strand, 29971323 - 29971448
Alignment:
Q  164 accaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcac 263  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |  |||| ||  ||||||||||||||| |||| | |  |||||||||| |||    
T  29971323 accaacacgagttttttcagcatgttttgtcctcacttgcatgtttattgagaaattt--cagtaggtcacccatacaaagactattccaagtcaaacac 29971420  T
Q  264 gcttaactatgaagttcttatgaaatga 291  Q
    | |||||| ||||||| ||||| |||||    
T  29971421 gtttaactgtgaagtttttatggaatga 29971448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 419
Target Start/End: Original strand, 29971450 - 29971552
Alignment:
Q  317 ttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattca 416  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||  ||  |||| |||||||||||    
T  29971450 ttgatatagatagtatcaaacaattcttataaatcttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccttccaattctgatgtgattca 29971549  T
Q  417 gtt 419  Q
    |||    
T  29971550 gtt 29971552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34688106 - 34688044
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 206  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34688106 attgtccactggtcctacaaaccaacatgagtcttttcaacgtgttttgtcctcattcgcacg 34688044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44042075 - 44041986
Alignment:
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagat 308  Q
    |||||||  ||||||| ||| |||| | | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  44042075 cttcccaaaaggtcactcattcaaagactacttcaagtcaagcacgcttaacaatgaagttcttgtggaatgtgttactgaaaagaagat 44041986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9251057 - 9250990
Alignment:
Q  358 caaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgccta 426  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9251057 caaccatgcagtcccatacctcta-ggcttcaggatccctctcattctgatgtgattcggttttgccta 9250990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29117490 - 29117444
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  29117490 acaaaccaacacgagtcttttcaggatgatttgtcctcactcgcacg 29117444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 196
Target Start/End: Original strand, 22840441 - 22840477
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcct 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22840441 acaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcct 22840477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 204
Target Start/End: Original strand, 12119226 - 12119273
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgca 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  12119226 cccacaaaccaacacgagtattttcaatgtgctttgtcctcactcgca 12119273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25307829 - 25307759
Alignment:
Q  350 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttt 420  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||  | ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  25307829 ccttccttcaaccatacagtctcatacctgcacggccttggaatcgctctcattccagtgtgattcagttt 25307759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 369
Target Start/End: Original strand, 36968434 - 36968496
Alignment:
Q  307 atgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagt 369  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||| | |||||||||||| ||||    
T  36968434 atgcatcttgttgatataagtagcaccaatcaattcttataagtcatccttcaaccatacagt 36968496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3508827 - 3508790
Alignment:
Q  320 atataggtagtaccaaataattcatataagccttcctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3508827 atataggtagtaccaaataattcttataaaccttcctt 3508790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34688000 - 34687920
Alignment:
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatata 324  Q
    |||||||||||||||  |||  ||||||||| | |||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34688000 aattgctccaagtcagacacatttaactatggaattcttatggaataacctaccaaaaagaagatgcatctttttggtata 34687920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 118 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1516 - 1219
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1516 gtgtaacatcccagactgctttcaggattgtcgactgacgccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaa 1417  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1416 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 1317  T
Q  318 tgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  1316 ttatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcatggcctcaggaaccgtctcattccggtgtgattc 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 124 - 448
Target Start/End: Original strand, 162533 - 162858
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtctttt-cagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttc 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  162533 catcccatactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtctttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgcgaaacttc 162632  T
Q  223 ccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgata 322  Q
    |  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  162633 caggtaggtcactcatcccaaagttgctccaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaata 162732  T
Q  323 taggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttg 422  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  162733 taggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcagtcacatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtaattcagttttg 162832  T
Q  423 cctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  162833 cctagaagcatgtcaggagccagacc 162858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 163369 - 163167
Alignment:
Q  116 aagtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactagg 215  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  163369 aagtgtaacatcccagacgactttcaggattgtcgacagaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactggg 163270  T
Q  216 aaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatctt 315  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  163269 aaacttctcggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggaattcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 163170  T
Q  316 gtt 318  Q
    |||    
T  163169 gtt 163167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 315
Target Start/End: Original strand, 162985 - 163181
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||    
T  162985 tgtaacatcccagactgttttcaggattgccgactggccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgaacgcttaccgagaaa 163084  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatctt 315  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  163085 cttcccgataggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 163181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 379
Target Start/End: Original strand, 69666 - 69926
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||| |    |||    
T  69666 tgtaacatcccaaactgctttcaggattgccgactgaaccaacaaaccaacacgagtctttttagcgtggtttgtcatcactcacacgctttcccataaa 69765  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  69766 cttccctgaaggtcacccatccaaagactactcctagtcaagcccgcataactgtggagttcttatggaatgagctaatgaaaaaaagatgcatcatgtt 69865  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctg 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  69866 gatataggtagtaccaaacaattattataagcattccttcaacgatgcagtctcatacctg 69926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 119 - 435
Target Start/End: Original strand, 2061 - 2377
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  2061 tgtaacatcccagacaacttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaatgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaa 2160  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2161 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactattgagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 2260  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2261 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctgcacggccttaggatccttctcattccgatgtgattcagt 2360  T
Q  419 tttgcctagaagcatgc 435  Q
    ||| |||||||||||||    
T  2361 ttttcctagaagcatgc 2377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 143 - 415
Target Start/End: Original strand, 1926 - 2198
Alignment:
Q  143 gattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaa 242  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1926 gattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtattttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatccca 2025  T
Q  243 aaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattc 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2026 aaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 2125  T
Q  343 atataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| | || |||||| | ||||||||    
T  2126 ttataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacggcctcaggaaccctttcattctggtgtgattc 2198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3037 - 2741
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  |||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  3037 tgtaacatccgagactgctttcagcattgccgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaa 2938  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2937 cttcccggtaggtctcccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgtt 2838  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2837 gatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattc 2741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 124 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 155047 - 154756
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcc 223  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||    
T  155047 catcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactagcacacttaccgagaaacttcc 154948  T
Q  224 cagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 323  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  154947 cggtaggtcacccattccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatac 154848  T
Q  324 aggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||| | |||||||||||  |||||||    
T  154847 aggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggagccctctcattccggcgtgattc 154756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 154597 - 154505
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttac 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  154597 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttac 154505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 4830 - 4560
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4830 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 4731  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 343  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4730 a-ttgctccaagttaagcacacttaactgtggagttcttataaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 4632  T
Q  344 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  4631 tctaaaccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcatggcctcaggaaccctctccttccgatgtgattc 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 5315 - 5015
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||| ||||||||||  |||| |  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  5315 tgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaa 5216  T
Q  219 cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgtt 318  Q
     ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5215 tttccaggtaggtcacccatcccaaa-ttgctccaagttaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 5117  T
Q  319 gatataggtagtaccaaataat-----tcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgat 413  Q
     ||||||||||||||||| |||     || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  5116 aatataggtagtaccaaacaattcttctcttttaaaccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcatggcctcaggaaccctctcattccggtgtgat 5017  T
Q  414 tc 415  Q
    ||    
T  5016 tc 5015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5377 - 5325
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtg-ttttgtcctcactcgcacgcttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5377 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacacttac 5325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 117 - 328
Target Start/End: Original strand, 13382 - 13593
Alignment:
Q  117 agtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactagga 216  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13382 agtgtaacatcccggactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacaaaga 13481  T
Q  217 aacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttg 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13482 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 13581  T
Q  317 ttgatataggta 328  Q
    ||||||||||||    
T  13582 ttgatataggta 13593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 415
Target Start/End: Original strand, 17493 - 17745
Alignment:
Q  163 aaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  17493 aaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgaaaaactttcgagtaggtcacccatccaaagagtactccaagtcaagca 17592  T
Q  263 cgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaacc 362  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  17593 cgcttaactgtggagttcttatgaattgagctaccaaaaagaagatacatcctgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaacc 17692  T
Q  363 atgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  17693 atgtagtcccatacctacacggcctcaggatccctctcattctgatgtcattc 17745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 160 - 419
Target Start/End: Original strand, 18027 - 18285
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaa 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  18027 acaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttgtgtcctcactcgcacgtttaccgaaaaactttccaataggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 18126  T
Q  260 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttca 359  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||    
T  18127 gcacgcttaactgtggagttcttatggaattagctaccaaaaa-aagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagtcttccttca 18225  T
Q  360 accatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 419  Q
    || ||| |||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18226 actatgtagtcacatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 18285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 127 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 245369 - 245052
Alignment:
Q  127 cccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccag 226  Q
    |||| |||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||    
T  245369 cccatactgctttcaggattgccgactgaccccgcaaaccaacacgagtcttttcaccgtgttttgtcctcactcacacgctttccgagaaacttcccag 245270  T
Q  227 taggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 326  Q
     ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   | || ||||||||||   |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  245269 aaggtcacccatctcaaaattgctctaagtcaagcacgctt---tgtggagttcttatggtttaggctaccgaaa-gaagatgcatcttgttgatatagg 245174  T
Q  327 tagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgccta 426  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||    
T  245173 tagtaccaaacaattcttataagcctcccttcaaccatgtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcatatttttcta 245074  T
Q  427 gaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    || |||||||| ||||| ||||    
T  245073 gatgcatgccaagagccggacc 245052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 255 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 245674 - 245481
Alignment:
Q  255 gtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttc 354  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |    
T  245674 gtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggtttaggctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcc 245575  T
Q  355 cttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||  |||| |||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||    
T  245574 cttcaaccatgaagtcccatacctacacggactcaagatccctttcattatgatgtgattcagtttttcctagaaccaagccaggagccggacc 245481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 245831 - 245677
Alignment:
Q  131 gactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtagg 230  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||||||||  ||     
T  245831 gactgctttcaggattcccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcacacactttccgagaaacttcccaaaaga 245732  T
Q  231 tcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatg 285  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  245731 tcacccatctcgaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatg 245677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 118 - 315
Target Start/End: Original strand, 14552 - 14749
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  14552 gtgtaacatcccagactgctttcagcattgtcggctgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaa 14651  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatctt 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14652 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 14749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 299 - 448
Target Start/End: Original strand, 142305 - 142454
Alignment:
Q  299 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  142305 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaacattccttcaaccatgaagtcccatacctgcacggcctcaggatccctc 142404  T
Q  399 tcattccgatgtgattcagttttgcctagaagcatgccaggagccagacc 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  142405 tcattccgatgtgattcagtttttcctagaagcatgccaggagccggacc 142454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 116 - 271
Target Start/End: Original strand, 1549 - 1704
Alignment:
Q  116 aagtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactagg 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  ||    
T  1549 aagtgtaacatcccagactgctttcaggattatcgactgaccccacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcacatgcttaccggg 1648  T
Q  216 aaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaact 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1649 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaact 1704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 116 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2394 - 2154
Alignment:
Q  116 aagtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttact-ag 214  Q
    |||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  2394 aagtgtaaaatcccagactgcttttaggattgtcgactgatcctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttctcctcactcgcacgcttaccgag 2295  T
Q  215 gaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatct 314  Q
    |          ||||||||||||||  || | | ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  2294 g----------gtaggtcacccatcataagactactccatgtcaagcatgcttaactgtggagttcttaaggaatgggctaccaaaaagaagatgcatct 2205  T
Q  315 tgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatg 365  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2204 tgtttatatagggagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatg 2154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 749
Alignment:
Q  367 agtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    ||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  797 agtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 606 - 421
Alignment:
Q  118 gtgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaa 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||    
T  606 gtgtaacatccgagactacttttaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacatgcttatcgggaa 507  T
Q  218 acttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaag 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||    
T  506 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccatgtcaagcacgcttaactatggagattttatggaatgagctaccgaaaag 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 157 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 14998 - 14740
Alignment:
Q  157 cccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagt 256  Q
    |||||||||  || || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    | ||||||||||   ||||||||||||||| |   ||||||||    
T  14998 cccacaaacatactcgtgtctttttagcgtgttttgtcatcactcgcacgtttttcggaaaacttcccatatggtcacccatccaaagaccactccaagt 14899  T
Q  257 caagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttcct 356  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  14898 caaacatgcttaactgtgaagttcttattcaatgaattaccgaaaagacgatgcatcttattgatataggtattaccaaacaattcttataagcattcct 14799  T
Q  357 tcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattc 415  Q
    |||||  |||||||| |||| || ||||  | |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  14798 tcaacactgcagtcctatacatgcacgatattaggatccctcttgttccgatgtgattc 14740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Original strand, 3993 - 4130
Alignment:
Q  279 tcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacct 378  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3993 tcttataaaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatacaggtagtaccaaacaattcttataagcattccttcaacaatgcagtcccatacct 4092  T
Q  379 gtacgacctcaggatcactctcattccgatgtgattca 416  Q
    | ||| |||| ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  4093 gcacggcctcgggatccctctcattctggtgtgattca 4130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 302 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 23785 - 23672
Alignment:
Q  302 agaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctca 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||    
T  23785 agaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaagaaccctctca 23686  T
Q  402 ttccgatgtgattc 415  Q
    || || ||||||||    
T  23685 tttcggtgtgattc 23672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26329 - 26074
Alignment:
Q  153 tgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctcc 252  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||     ||||||| | |  || |||| ||||| |||| | ||||    
T  26329 tgatcctacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttatgttctccctcgcaagcttttcgagaaactttctataagctcactcatcctaaaaatactcc 26230  T
Q  253 aagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagcct 352  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||     
T  26229 aagtcaagcacacttaact--ggagttcttataaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcatgttgatatatgtagtaccaaaaaatttgtataagcca 26132  T
Q  353 tccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattccgatgt 410  Q
    |  | |||||||| |||| || ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  26131 ttatgcaaccatgaagtctcacacctgcacggccttaggatccctctctttctgatgt 26074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16307 - 16163
Alignment:
Q  151 actgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgct 250  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||| |  | ||||||   |  ||||||| ||||| |||| || |    
T  16307 actgaccctacaaaccaacacgagccttt-cagcatgttttgtcatcacttgcaagctttccggaaaactttatataaggtcactcatcctaaaactgtt 16209  T
Q  251 ccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctac 296  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  16208 tcaagtcaagcacgtttaactatgaagtttttataaaatgggctac 16163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 354
Target Start/End: Original strand, 44613 - 44807
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa-cttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtca 258  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44613 acaaaccaatacgggttctttcagcgtgctttgtcctcacttgcacacttt-taggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtca 44711  T
Q  259 agcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttc 354  Q
    |||||  |||||| || |||||| |||      |||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  44712 agcacatttaactttggagttctaatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagccttc 44807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 45497 - 45387
Alignment:
Q  303 gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcat 402  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||  || |||  |||| |||| |||||||    
T  45497 gaagatacatcttgttgatataggtagtaccaaataattctcataagtcttccttcaacaatgtagtcacatatatgcacggtctcaagatc-ctctcat 45399  T
Q  403 tccgatgtgatt 414  Q
    ||||||||||||    
T  45398 tccgatgtgatt 45387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7211 - 7071
Alignment:
Q  144 attgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 243  Q
    |||||| | ||| ||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| || ||||    |||||||| |||  ||||||||||| | ||    
T  7211 attgtcgattgaccccacaggccaacacgagtcttttcaccttgttt-gtccccactcacatgcttttcgggaaactttccaaaaggtcacccataccaa 7113  T
Q  244 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatg 285  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  7112 aattgctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttatg 7071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 218
Target Start/End: Original strand, 37205 - 37263
Alignment:
Q  160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactaggaaa 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  37205 acaaaccaacacgaatcttttcagcgtgtttttccctcactcgcacgtttactaggaaa 37263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 191
Target Start/End: Original strand, 62968 - 63030
Alignment:
Q  129 cagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt 191  Q
    |||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  62968 cagactactttcaggattgccgactgaccccacaaaccaatacgagtcttttcagcgtgtttt 63030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 191
Target Start/End: Original strand, 67214 - 67286
Alignment:
Q  119 tgtagcatcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt 191  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  67214 tgtaacatcacagactgctttcaggattgccgattgaccccacaaaccaacacaagtgtttttagcgtctttt 67286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 65 - 1
Alignment:
Q  124 catcccagactgctttcacgattgtcaactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgt 188  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  65 catcccaaactgcttttaggattgcctactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1138 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold1138
Description:

Target: scaffold1138; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 414
Target Start/End: Original strand, 734 - 843
Alignment:
Q  305 agatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacgacctcaggatcactctcattc 404  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||  | || ||||||| ||||| || | |  | |||||||||    
T  734 agatgcatcttgttgatgtatgtagtaccgattaatccatataagtcctccttcaaccatataatctcatacctatacgatcttatgcaccctctcattc 833  T
Q  405 cgatgtgatt 414  Q
     |||||||||    
T  834 tgatgtgatt 843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1138; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 293 - 331
Target Start/End: Original strand, 271 - 309
Alignment:
Q  293 ctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagta 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  271 ctactgaaaagaagaagcatcttgttgatatatgtagta 309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Original strand, 246711 - 246795
Alignment:
Q  214 ggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctactg 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||||| |||| |||  |||||||||| | || |||||||    
T  246711 ggaaacttaccagtaggtcacccatccaaagactactccaaattaagcacgattaattatagagttcttatggattgggctactg 246795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University