View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1399_high_13 (Length: 449)

Name: NF1399_high_13
Description: NF1399
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1399_high_13
NF1399_high_13
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (13-251)||(37260164-37260418)
chr8 (261-417)||(32984096-32984252)
chr8 (262-413)||(24079924-24080075)
chr8 (261-417)||(2714556-2714712)
chr8 (261-421)||(5946054-5946214)
chr8 (261-413)||(6365993-6366145)
chr8 (261-421)||(25185906-25186066)
chr8 (261-417)||(32114256-32114412)
chr8 (261-421)||(37419947-37420107)
chr8 (261-417)||(40435172-40435328)
chr8 (261-417)||(41862227-41862383)
chr8 (261-417)||(43328714-43328870)
chr8 (262-421)||(33981678-33981837)
chr8 (261-410)||(37956428-37956577)
chr8 (261-417)||(9734262-9734416)
chr8 (261-417)||(10646130-10646286)
chr8 (261-417)||(31830974-31831130)
chr8 (261-417)||(33730660-33730816)
chr8 (261-417)||(44088462-44088618)
chr8 (262-417)||(9303593-9303748)
chr8 (263-422)||(13760662-13760821)
chr8 (261-417)||(9013691-9013846)
chr8 (261-417)||(17718741-17718897)
chr8 (262-414)||(35628785-35628937)
chr8 (261-417)||(41231953-41232109)
chr8 (261-413)||(45236588-45236740)
chr8 (262-417)||(45258518-45258673)
chr8 (261-413)||(29048426-29048578)
chr8 (261-413)||(37301348-37301500)
chr8 (261-413)||(41653902-41654054)
chr8 (262-417)||(13356139-13356294)
chr8 (262-419)||(41639922-41640079)
chr8 (261-417)||(2275920-2276075)
chr8 (262-417)||(45066611-45066766)
chr8 (261-414)||(22878398-22878551)
chr8 (261-417)||(42701308-42701465)
chr8 (261-417)||(25248046-25248196)
chr8 (310-417)||(12032986-12033093)
chr8 (303-417)||(3904126-3904239)
chr8 (320-417)||(41981534-41981631)
chr8 (265-361)||(39915887-39915983)
chr8 (265-417)||(4447314-4447455)
chr8 (265-413)||(31940326-31940462)
chr8 (265-417)||(10378320-10378461)
chr8 (265-417)||(32373746-32373886)
chr8 (265-413)||(40458795-40458932)
chr8 (265-413)||(41843264-41843401)
chr8 (275-353)||(41981454-41981532)
chr8 (265-346)||(117408-117489)
chr8 (265-413)||(2379151-2379288)
chr8 (265-417)||(3211217-3211357)
chr8 (265-346)||(4975486-4975567)
chr8 (265-346)||(27243218-27243299)
chr8 (265-346)||(27254793-27254874)
chr8 (265-410)||(33622492-33622625)
chr8 (323-417)||(31336163-31336257)
chr8 (265-413)||(9713700-9713834)
chr8 (261-353)||(33896915-33897006)
chr8 (265-338)||(3490486-3490559)
chr8 (265-346)||(9509479-9509560)
chr8 (265-414)||(38631663-38631801)
chr8 (261-363)||(31148953-31149054)
chr8 (262-353)||(26196389-26196479)
chr8 (266-413)||(40649854-40649990)
chr8 (261-333)||(164729-164800)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (261-421)||(15398497-15398657)
chr5 (261-417)||(24253389-24253545)
chr5 (261-414)||(739726-739879)
chr5 (261-417)||(43326398-43326554)
chr5 (261-414)||(18479690-18479843)
chr5 (265-417)||(35626049-35626201)
chr5 (262-417)||(39932587-39932742)
chr5 (261-418)||(15683798-15683955)
chr5 (261-413)||(3466704-3466856)
chr5 (261-417)||(5184979-5185135)
chr5 (261-417)||(6901806-6901962)
chr5 (261-417)||(7722056-7722212)
chr5 (261-417)||(27938904-27939060)
chr5 (265-417)||(31938908-31939060)
chr5 (261-417)||(40886047-40886202)
chr5 (261-421)||(27278488-27278652)
chr5 (261-417)||(12648804-12648960)
chr5 (261-413)||(25831528-25831679)
chr5 (261-417)||(13504761-13504917)
chr5 (265-417)||(40278877-40279029)
chr5 (265-417)||(43262202-43262354)
chr5 (262-417)||(27501074-27501229)
chr5 (261-417)||(2484311-2484467)
chr5 (262-415)||(38756509-38756662)
chr5 (261-417)||(5137722-5137878)
chr5 (291-417)||(29789314-29789440)
chr5 (261-417)||(28424814-28424968)
chr5 (261-417)||(890913-891068)
chr5 (265-417)||(40110245-40110396)
chr5 (265-418)||(4149705-4149848)
chr5 (296-417)||(34451292-34451413)
chr5 (261-413)||(763730-763882)
chr5 (261-352)||(40632506-40632597)
chr5 (265-417)||(33617596-33617737)
chr5 (265-413)||(6973074-6973211)
chr5 (265-413)||(9424615-9424752)
chr5 (265-413)||(38015537-38015674)
chr5 (265-413)||(42658685-42658822)
chr5 (261-361)||(2585469-2585569)
chr5 (261-365)||(12558090-12558193)
chr5 (265-413)||(5497284-5497421)
chr5 (265-413)||(13957681-13957818)
chr5 (265-413)||(14971989-14972126)
chr5 (265-413)||(19295741-19295878)
chr5 (265-413)||(27503390-27503527)
chr5 (261-413)||(31294012-31294164)
chr5 (265-413)||(23195271-23195408)
chr5 (265-413)||(36365468-36365605)
chr5 (265-362)||(5120036-5120132)
chr5 (261-361)||(36472347-36472448)
chr5 (265-338)||(42247869-42247942)
chr5 (265-413)||(9374525-9374662)
chr5 (261-353)||(18327245-18327337)
chr5 (261-353)||(38637982-38638074)
chr5 (265-418)||(6206895-6207037)
chr5 (262-321)||(9527124-9527183)
chr5 (262-353)||(27390605-27390696)
chr5 (288-413)||(38492647-38492761)
chr5 (265-338)||(9171112-9171185)
chr5 (261-353)||(1402577-1402669)
chr5 (261-353)||(24167856-24167948)
chr5 (261-361)||(40686906-40687006)
chr5 (281-413)||(3656591-3656712)
chr5 (287-413)||(36948513-36948626)
chr5 (265-336)||(15300962-15301033)
chr5 (278-338)||(3940418-3940478)
chr5 (265-321)||(33624043-33624099)
chr5 (287-361)||(20207080-20207154)
chr5 (261-314)||(28756085-28756138)
chr5 (361-410)||(33623965-33624014)
chr5 (377-421)||(40687010-40687054)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (261-417)||(2324908-2325064)
chr2 (261-417)||(746472-746628)
chr2 (261-417)||(11184978-11185134)
chr2 (261-413)||(13815241-13815393)
chr2 (261-417)||(23901785-23901941)
chr2 (261-417)||(38997107-38997263)
chr2 (262-421)||(10244597-10244756)
chr2 (261-417)||(4034598-4034754)
chr2 (261-417)||(6430479-6430635)
chr2 (261-417)||(6594477-6594633)
chr2 (261-417)||(14660452-14660608)
chr2 (261-417)||(17600842-17600998)
chr2 (261-417)||(45370996-45371152)
chr2 (262-417)||(34518374-34518529)
chr2 (261-417)||(5726135-5726291)
chr2 (261-417)||(10424601-10424757)
chr2 (261-413)||(26710351-26710503)
chr2 (261-417)||(27651053-27651209)
chr2 (265-413)||(40635228-40635376)
chr2 (262-417)||(2914157-2914312)
chr2 (261-413)||(27400409-27400561)
chr2 (261-421)||(32327367-32327527)
chr2 (261-419)||(7892705-7892863)
chr2 (261-410)||(32608386-32608535)
chr2 (261-414)||(32948452-32948604)
chr2 (261-417)||(27024421-27024577)
chr2 (262-417)||(37620886-37621044)
chr2 (262-417)||(1091970-1092125)
chr2 (262-417)||(4609633-4609788)
chr2 (261-413)||(33427670-33427822)
chr2 (264-409)||(12842112-12842257)
chr2 (261-414)||(37255359-37255507)
chr2 (262-414)||(14697559-14697711)
chr2 (269-421)||(32856451-32856603)
chr2 (261-417)||(40735470-40735626)
chr2 (261-410)||(40037149-40037298)
chr2 (261-410)||(9444689-9444845)
chr2 (264-414)||(11159631-11159780)
chr2 (261-419)||(15925086-15925244)
chr2 (261-410)||(8432942-8433091)
chr2 (261-379)||(42899921-42900039)
chr2 (306-417)||(25294886-25294997)
chr2 (265-402)||(41172468-41172605)
chr2 (303-417)||(1229675-1229789)
chr2 (265-413)||(35158073-35158210)
chr2 (265-413)||(145292-145429)
chr2 (265-417)||(39103057-39103198)
chr2 (261-334)||(12814620-12814693)
chr2 (265-411)||(4258500-4258634)
chr2 (331-417)||(447652-447738)
chr2 (265-413)||(12333519-12333655)
chr2 (265-417)||(21734919-21735060)
chr2 (265-413)||(39301220-39301357)
chr2 (265-346)||(28641371-28641452)
chr2 (261-419)||(35126786-35126933)
chr2 (261-353)||(44481834-44481926)
chr2 (265-413)||(12730071-12730208)
chr2 (269-413)||(19428449-19428582)
chr2 (265-413)||(29687051-29687188)
chr2 (265-413)||(34249275-34249412)
chr2 (265-346)||(8056636-8056717)
chr2 (265-413)||(13543647-13543784)
chr2 (265-413)||(27331308-27331449)
chr2 (265-401)||(27764897-27765022)
chr2 (265-413)||(43898994-43899130)
chr2 (265-346)||(3266306-3266387)
chr2 (265-346)||(40544155-40544236)
chr2 (334-422)||(12827142-12827229)
chr2 (265-413)||(28566721-28566858)
chr2 (265-321)||(2000441-2000497)
chr2 (326-398)||(28014856-28014928)
chr2 (265-346)||(43356109-43356187)
chr2 (262-362)||(30545828-30545928)
chr2 (262-353)||(38985350-38985439)
chr2 (265-413)||(2688752-2688889)
chr2 (285-413)||(3711663-3711780)
chr2 (261-298)||(28019959-28019996)
chr2 (261-321)||(10176565-10176625)
chr2 (381-417)||(42900781-42900817)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (261-417)||(5882513-5882669)
chr6 (261-417)||(7393605-7393761)
chr6 (261-417)||(14891398-14891554)
chr6 (262-417)||(34527881-34528036)
chr6 (261-414)||(2892195-2892348)
chr6 (261-421)||(2593867-2594027)
chr6 (261-417)||(7345131-7345287)
chr6 (261-417)||(18101514-18101670)
chr6 (261-417)||(22551080-22551236)
chr6 (261-417)||(24168098-24168254)
chr6 (265-417)||(26377223-26377375)
chr6 (261-413)||(599899-600051)
chr6 (261-417)||(1970718-1970874)
chr6 (261-417)||(8615247-8615403)
chr6 (267-417)||(11988993-11989143)
chr6 (261-417)||(16703373-16703529)
chr6 (267-417)||(22341807-22341959)
chr6 (261-413)||(959927-960079)
chr6 (261-421)||(19281070-19281230)
chr6 (261-417)||(19415552-19415708)
chr6 (261-417)||(28947094-28947250)
chr6 (261-413)||(30743471-30743623)
chr6 (266-413)||(24224093-24224240)
chr6 (261-414)||(10507930-10508083)
chr6 (261-417)||(5294820-5294976)
chr6 (261-417)||(5299372-5299528)
chr6 (261-417)||(33452591-33452747)
chr6 (261-383)||(30467656-30467778)
chr6 (286-421)||(23261944-23262079)
chr6 (265-413)||(13329392-13329529)
chr6 (265-413)||(28948868-28949005)
chr6 (261-336)||(929666-929741)
chr6 (261-353)||(7167589-7167681)
chr6 (265-413)||(15965444-15965581)
chr6 (273-413)||(4487546-4487675)
chr6 (265-345)||(3291019-3291099)
chr6 (265-421)||(1398564-1398709)
chr6 (265-350)||(1939579-1939664)
chr6 (265-413)||(3786760-3786897)
chr6 (265-345)||(13844847-13844927)
chr6 (361-413)||(18661830-18661882)
chr6 (261-310)||(11743070-11743119)
chr6 (361-413)||(24913119-24913171)
[»] chr4 (120 HSPs)
chr4 (261-417)||(51363014-51363170)
chr4 (261-417)||(21366628-21366784)
chr4 (265-417)||(34276558-34276710)
chr4 (265-417)||(44984772-44984924)
chr4 (261-417)||(53854448-53854604)
chr4 (262-417)||(397410-397565)
chr4 (262-417)||(9798473-9798628)
chr4 (261-417)||(237484-237640)
chr4 (261-417)||(2826700-2826856)
chr4 (261-417)||(6019935-6020091)
chr4 (261-417)||(23437599-23437755)
chr4 (261-417)||(27373083-27373239)
chr4 (261-417)||(42085214-42085370)
chr4 (261-413)||(55056282-55056434)
chr4 (262-421)||(45797487-45797646)
chr4 (261-417)||(49881078-49881238)
chr4 (261-414)||(146451-146604)
chr4 (265-417)||(6285318-6285470)
chr4 (261-421)||(29478367-29478527)
chr4 (261-417)||(32366679-32366835)
chr4 (261-417)||(41702478-41702634)
chr4 (262-418)||(55776053-55776208)
chr4 (262-418)||(55840231-55840386)
chr4 (261-421)||(41949389-41949551)
chr4 (261-414)||(18462035-18462188)
chr4 (261-417)||(3170633-3170789)
chr4 (261-417)||(22618533-22618687)
chr4 (261-417)||(31070093-31070248)
chr4 (261-417)||(31532154-31532310)
chr4 (261-417)||(39077552-39077708)
chr4 (261-417)||(42765861-42766016)
chr4 (261-417)||(43471714-43471870)
chr4 (265-413)||(53461839-53461987)
chr4 (261-417)||(54574959-54575115)
chr4 (262-417)||(42033183-42033338)
chr4 (261-413)||(407761-407911)
chr4 (261-417)||(19387707-19387863)
chr4 (265-417)||(26091277-26091429)
chr4 (261-417)||(29777276-29777432)
chr4 (261-413)||(31972359-31972511)
chr4 (265-417)||(41560339-41560491)
chr4 (261-417)||(47344663-47344819)
chr4 (261-417)||(54424989-54425145)
chr4 (261-417)||(54607969-54608125)
chr4 (262-421)||(33897510-33897669)
chr4 (262-417)||(50534639-50534794)
chr4 (261-417)||(39587798-39587954)
chr4 (261-413)||(42222298-42222450)
chr4 (262-417)||(31914206-31914360)
chr4 (261-417)||(38591675-38591827)
chr4 (261-414)||(50234007-50234160)
chr4 (261-417)||(22468789-22468945)
chr4 (261-417)||(23609094-23609250)
chr4 (262-417)||(48657832-48657981)
chr4 (261-417)||(50457829-50457985)
chr4 (262-414)||(50536646-50536798)
chr4 (261-417)||(53834073-53834229)
chr4 (261-417)||(55519834-55519990)
chr4 (261-414)||(2243465-2243618)
chr4 (261-414)||(47662124-47662277)
chr4 (261-410)||(56023024-56023173)
chr4 (261-417)||(3692229-3692385)
chr4 (261-417)||(35446513-35446668)
chr4 (261-417)||(48259530-48259685)
chr4 (261-417)||(54086417-54086571)
chr4 (261-410)||(1932770-1932919)
chr4 (261-413)||(41632030-41632181)
chr4 (261-417)||(48313564-48313718)
chr4 (261-417)||(51951689-51951844)
chr4 (294-417)||(52728325-52728448)
chr4 (262-417)||(48654822-48654983)
chr4 (261-417)||(14017395-14017549)
chr4 (261-417)||(54805633-54805793)
chr4 (310-417)||(36532849-36532956)
chr4 (265-417)||(43890939-43891080)
chr4 (265-413)||(5117461-5117598)
chr4 (265-413)||(45633802-45633939)
chr4 (265-417)||(54216755-54216896)
chr4 (309-417)||(42509351-42509459)
chr4 (265-417)||(9997950-9998091)
chr4 (265-413)||(15060312-15060449)
chr4 (265-413)||(20351865-20352002)
chr4 (265-413)||(46708764-46708901)
chr4 (340-421)||(35595773-35595854)
chr4 (265-414)||(47811917-47812055)
chr4 (265-413)||(37239113-37239250)
chr4 (265-417)||(54715046-54715187)
chr4 (261-338)||(42557589-42557666)
chr4 (265-419)||(4486598-4486741)
chr4 (261-353)||(14335173-14335265)
chr4 (261-353)||(27580126-27580218)
chr4 (261-361)||(34835184-34835284)
chr4 (261-364)||(27398664-27398767)
chr4 (262-353)||(38547673-38547764)
chr4 (265-413)||(22620604-22620741)
chr4 (265-413)||(34552330-34552467)
chr4 (265-346)||(31881393-31881474)
chr4 (261-353)||(1662331-1662423)
chr4 (261-360)||(49057933-49058032)
chr4 (302-392)||(52396774-52396865)
chr4 (265-413)||(27873571-27873708)
chr4 (268-346)||(49014112-49014190)
chr4 (277-413)||(52461386-52461511)
chr4 (265-346)||(3293102-3293183)
chr4 (265-346)||(11972208-11972289)
chr4 (261-354)||(43231510-43231602)
chr4 (265-346)||(54216324-54216405)
chr4 (261-353)||(46720032-46720124)
chr4 (334-421)||(35344868-35344954)
chr4 (265-413)||(33289714-33289851)
chr4 (265-413)||(52688360-52688497)
chr4 (261-338)||(6371336-6371413)
chr4 (261-353)||(573810-573902)
chr4 (363-417)||(33048990-33049044)
chr4 (265-346)||(33558021-33558102)
chr4 (261-305)||(17555617-17555661)
chr4 (359-417)||(48259722-48259780)
chr4 (287-353)||(27872612-27872678)
chr4 (265-338)||(18206609-18206682)
chr4 (361-413)||(51981502-51981554)
[»] chr1 (106 HSPs)
chr1 (261-421)||(21139427-21139587)
chr1 (261-417)||(31308008-31308164)
chr1 (261-417)||(43251718-43251874)
chr1 (261-417)||(45538160-45538316)
chr1 (265-417)||(3611147-3611299)
chr1 (261-417)||(4068702-4068858)
chr1 (261-417)||(17994970-17995126)
chr1 (261-417)||(24245044-24245200)
chr1 (261-417)||(44661977-44662133)
chr1 (262-417)||(25678278-25678433)
chr1 (261-417)||(6327567-6327722)
chr1 (261-417)||(26085417-26085572)
chr1 (261-417)||(26277184-26277340)
chr1 (261-417)||(38790216-38790372)
chr1 (261-417)||(5981177-5981333)
chr1 (261-417)||(25058695-25058851)
chr1 (261-413)||(33112840-33112992)
chr1 (261-417)||(33884095-33884251)
chr1 (261-417)||(33960001-33960157)
chr1 (261-417)||(39646575-39646731)
chr1 (265-417)||(50774228-50774380)
chr1 (262-417)||(37620211-37620366)
chr1 (265-414)||(36003141-36003290)
chr1 (261-421)||(5980075-5980235)
chr1 (261-417)||(23984762-23984918)
chr1 (261-417)||(31040716-31040872)
chr1 (261-417)||(38331878-38332034)
chr1 (261-417)||(41999822-41999978)
chr1 (261-417)||(46784430-46784586)
chr1 (265-413)||(47383755-47383903)
chr1 (261-417)||(49253994-49254150)
chr1 (264-417)||(23932528-23932681)
chr1 (261-393)||(23220972-23221104)
chr1 (261-417)||(24885508-24885664)
chr1 (265-417)||(26794315-26794467)
chr1 (261-417)||(42863872-42864028)
chr1 (261-413)||(46967064-46967216)
chr1 (261-417)||(47671593-47671749)
chr1 (261-408)||(31844383-31844530)
chr1 (261-417)||(35692682-35692839)
chr1 (261-417)||(26524908-26525064)
chr1 (261-417)||(28888588-28888744)
chr1 (261-417)||(36566337-36566493)
chr1 (261-417)||(46616556-46616712)
chr1 (265-414)||(47317326-47317475)
chr1 (261-417)||(3285409-3285564)
chr1 (261-413)||(47187112-47187264)
chr1 (261-417)||(49399007-49399163)
chr1 (261-392)||(25518821-25518952)
chr1 (265-417)||(35273607-35273759)
chr1 (265-417)||(51057082-51057234)
chr1 (261-417)||(48373511-48373658)
chr1 (261-417)||(42313380-42313540)
chr1 (261-417)||(51403036-51403182)
chr1 (261-417)||(27983622-27983762)
chr1 (289-417)||(2450529-2450657)
chr1 (261-373)||(31979998-31980110)
chr1 (261-413)||(45475866-45476009)
chr1 (295-414)||(51045618-51045737)
chr1 (308-417)||(4808699-4808808)
chr1 (265-413)||(2657314-2657451)
chr1 (265-417)||(10928078-10928219)
chr1 (265-413)||(41467655-41467792)
chr1 (261-373)||(2556909-2557021)
chr1 (265-417)||(33073222-33073363)
chr1 (265-413)||(6626047-6626184)
chr1 (265-413)||(26472202-26472339)
chr1 (265-417)||(30289929-30290070)
chr1 (265-417)||(51155608-51155749)
chr1 (267-350)||(13313249-13313332)
chr1 (265-410)||(29770681-29770815)
chr1 (265-413)||(4953063-4953200)
chr1 (265-346)||(32448659-32448740)
chr1 (265-346)||(42234851-42234932)
chr1 (304-417)||(47772191-47772304)
chr1 (261-361)||(2954862-2954962)
chr1 (261-353)||(26685863-26685955)
chr1 (265-346)||(44544125-44544206)
chr1 (261-345)||(24649802-24649886)
chr1 (261-353)||(27924730-27924822)
chr1 (261-365)||(39475843-39475946)
chr1 (266-353)||(48683402-48683489)
chr1 (265-405)||(4243521-4243650)
chr1 (265-413)||(34752337-34752474)
chr1 (265-346)||(13281641-13281722)
chr1 (261-362)||(33187347-33187448)
chr1 (265-346)||(46428332-46428413)
chr1 (261-353)||(1388480-1388572)
chr1 (261-313)||(4156188-4156240)
chr1 (261-353)||(10920207-10920299)
chr1 (261-353)||(38716319-38716411)
chr1 (261-353)||(39637907-39637996)
chr1 (262-338)||(52323946-52324022)
chr1 (343-414)||(13312553-13312624)
chr1 (265-335)||(7561632-7561702)
chr1 (305-417)||(4156438-4156557)
chr1 (265-346)||(35991678-35991759)
chr1 (265-346)||(44293534-44293615)
chr1 (264-353)||(52367893-52367982)
chr1 (261-353)||(5961339-5961431)
chr1 (265-413)||(41895187-41895324)
chr1 (375-417)||(7561547-7561589)
chr1 (367-413)||(24215865-24215911)
chr1 (261-306)||(10919313-10919358)
chr1 (375-419)||(39359502-39359546)
chr1 (377-417)||(48683349-48683389)
[»] chr7 (93 HSPs)
chr7 (262-417)||(2341681-2341836)
chr7 (264-418)||(33411271-33411425)
chr7 (265-417)||(25893936-25894088)
chr7 (261-417)||(33423294-33423450)
chr7 (261-417)||(33839734-33839890)
chr7 (261-417)||(15877558-15877714)
chr7 (261-417)||(33695840-33695996)
chr7 (261-417)||(35355896-35356052)
chr7 (261-417)||(49171381-49171537)
chr7 (261-418)||(31586856-31587013)
chr7 (261-417)||(17855436-17855592)
chr7 (261-413)||(22979670-22979822)
chr7 (261-417)||(23393070-23393226)
chr7 (261-417)||(27018124-27018280)
chr7 (261-417)||(45482666-45482822)
chr7 (265-417)||(45690116-45690268)
chr7 (261-413)||(47067000-47067152)
chr7 (261-417)||(47740350-47740506)
chr7 (261-417)||(46913117-46913275)
chr7 (261-417)||(10028496-10028652)
chr7 (261-417)||(20165833-20165989)
chr7 (265-413)||(35328092-35328240)
chr7 (261-417)||(37846035-37846191)
chr7 (261-417)||(40670571-40670727)
chr7 (274-417)||(36389377-36389520)
chr7 (262-417)||(41990877-41991032)
chr7 (270-417)||(5183844-5183991)
chr7 (261-412)||(33870253-33870404)
chr7 (262-417)||(43499494-43499649)
chr7 (261-413)||(45063380-45063530)
chr7 (261-417)||(31625712-31625867)
chr7 (261-417)||(48609696-48609852)
chr7 (261-417)||(19563455-19563611)
chr7 (265-417)||(26579736-26579888)
chr7 (261-413)||(33332797-33332948)
chr7 (261-402)||(33720070-33720211)
chr7 (278-417)||(29446863-29447001)
chr7 (265-410)||(5712180-5712325)
chr7 (261-417)||(35757039-35757195)
chr7 (261-417)||(10618306-10618455)
chr7 (261-413)||(31429498-31429650)
chr7 (261-417)||(35767489-35767638)
chr7 (271-412)||(44564356-44564497)
chr7 (299-413)||(28233959-28234073)
chr7 (305-417)||(30076546-30076658)
chr7 (265-413)||(35752057-35752194)
chr7 (320-418)||(41904272-41904370)
chr7 (265-413)||(46817444-46817581)
chr7 (265-413)||(43489230-43489367)
chr7 (261-353)||(16482855-16482947)
chr7 (265-413)||(26941555-26941692)
chr7 (265-413)||(36816868-36817005)
chr7 (265-413)||(37127949-37128086)
chr7 (261-417)||(45502835-45502980)
chr7 (265-413)||(48085870-48086007)
chr7 (262-353)||(29863024-29863115)
chr7 (265-402)||(32556640-32556766)
chr7 (265-413)||(498211-498348)
chr7 (265-413)||(7876351-7876488)
chr7 (265-405)||(24923055-24923184)
chr7 (265-417)||(41855071-41855212)
chr7 (265-417)||(46898035-46898176)
chr7 (265-346)||(24228553-24228634)
chr7 (265-346)||(25037587-25037668)
chr7 (265-345)||(29098763-29098843)
chr7 (265-353)||(44003442-44003530)
chr7 (317-417)||(44405412-44405512)
chr7 (265-417)||(2332031-2332172)
chr7 (265-413)||(26371061-26371198)
chr7 (265-346)||(29610647-29610728)
chr7 (265-346)||(39323628-39323709)
chr7 (265-338)||(39453562-39453635)
chr7 (265-346)||(39866677-39866758)
chr7 (265-346)||(47906838-47906919)
chr7 (261-353)||(33393336-33393428)
chr7 (265-405)||(21718129-21718258)
chr7 (265-346)||(44659856-44659936)
chr7 (261-353)||(7257389-7257481)
chr7 (261-353)||(15644018-15644110)
chr7 (262-321)||(35557739-35557798)
chr7 (262-353)||(47460844-47460935)
chr7 (261-318)||(30077043-30077100)
chr7 (265-346)||(33455108-33455189)
chr7 (265-346)||(35484648-35484730)
chr7 (265-413)||(45237556-45237693)
chr7 (265-346)||(46103133-46103213)
chr7 (265-365)||(38448508-38448608)
chr7 (265-316)||(35823302-35823353)
chr7 (264-353)||(7720575-7720664)
chr7 (361-413)||(39453505-39453557)
chr7 (293-353)||(37443674-37443734)
chr7 (301-351)||(26456157-26456207)
chr7 (262-353)||(21649450-21649542)
[»] chr3 (108 HSPs)
chr3 (261-421)||(40130974-40131134)
chr3 (261-417)||(41464359-41464515)
chr3 (261-417)||(47257800-47257956)
chr3 (261-417)||(7855133-7855289)
chr3 (262-417)||(51170052-51170207)
chr3 (261-414)||(29625849-29626002)
chr3 (261-417)||(27066997-27067153)
chr3 (261-417)||(38416743-38416899)
chr3 (261-421)||(42291849-42292009)
chr3 (261-413)||(43125838-43125990)
chr3 (261-417)||(43612066-43612222)
chr3 (261-417)||(49330044-49330200)
chr3 (261-417)||(52628961-52629117)
chr3 (265-417)||(47809615-47809768)
chr3 (261-414)||(52215083-52215236)
chr3 (261-417)||(18946910-18947066)
chr3 (265-417)||(20754412-20754564)
chr3 (261-417)||(22399104-22399259)
chr3 (261-417)||(24100290-24100445)
chr3 (265-417)||(28048411-28048563)
chr3 (265-417)||(40643811-40643963)
chr3 (261-421)||(43183919-43184079)
chr3 (261-421)||(55453259-55453419)
chr3 (262-417)||(35748330-35748485)
chr3 (261-413)||(2666007-2666159)
chr3 (261-417)||(32234417-32234572)
chr3 (261-417)||(37313406-37313562)
chr3 (261-413)||(40419842-40419994)
chr3 (277-417)||(46126010-46126150)
chr3 (261-417)||(48739252-48739408)
chr3 (261-417)||(51452769-51452925)
chr3 (263-417)||(48609732-48609886)
chr3 (261-415)||(51102399-51102553)
chr3 (261-410)||(39053401-39053550)
chr3 (265-417)||(37324552-37324704)
chr3 (261-417)||(39634591-39634746)
chr3 (262-421)||(43021722-43021882)
chr3 (261-413)||(44806691-44806843)
chr3 (261-413)||(46134363-46134515)
chr3 (261-417)||(53832503-53832659)
chr3 (261-417)||(53943606-53943762)
chr3 (262-417)||(35594129-35594284)
chr3 (261-411)||(24376580-24376730)
chr3 (261-417)||(7755326-7755481)
chr3 (261-417)||(40804529-40804685)
chr3 (265-417)||(44222840-44222992)
chr3 (261-422)||(36368946-36369106)
chr3 (261-414)||(41293341-41293493)
chr3 (261-421)||(41216462-41216622)
chr3 (261-417)||(41732535-41732691)
chr3 (261-417)||(5560044-5560207)
chr3 (261-417)||(46949382-46949536)
chr3 (262-417)||(47894839-47894994)
chr3 (261-403)||(53637848-53637990)
chr3 (261-410)||(52638849-52638998)
chr3 (261-373)||(54159051-54159163)
chr3 (261-413)||(51146238-51146390)
chr3 (261-400)||(37758936-37759075)
chr3 (261-373)||(48546894-48547004)
chr3 (265-413)||(25641657-25641794)
chr3 (265-413)||(34279744-34279881)
chr3 (265-413)||(42589841-42589978)
chr3 (265-413)||(54401198-54401335)
chr3 (265-413)||(54707243-54707380)
chr3 (265-413)||(39141147-39141286)
chr3 (261-361)||(41882055-41882155)
chr3 (261-361)||(53115454-53115554)
chr3 (265-414)||(49130589-49130727)
chr3 (314-417)||(52864550-52864652)
chr3 (265-413)||(37028734-37028871)
chr3 (265-413)||(38156655-38156792)
chr3 (265-413)||(51415980-51416117)
chr3 (261-353)||(21597220-21597312)
chr3 (321-417)||(33550486-33550582)
chr3 (265-361)||(48726062-48726158)
chr3 (261-353)||(55379992-55380084)
chr3 (265-413)||(31286816-31286953)
chr3 (265-413)||(41635823-41635960)
chr3 (262-360)||(50731979-50732077)
chr3 (262-360)||(50780779-50780877)
chr3 (265-413)||(55000201-55000338)
chr3 (265-346)||(17665603-17665684)
chr3 (265-346)||(45058894-45058975)
chr3 (303-384)||(47182049-47182130)
chr3 (265-346)||(47511019-47511100)
chr3 (261-353)||(25353561-25353653)
chr3 (261-361)||(28576176-28576276)
chr3 (262-353)||(51143825-51143916)
chr3 (263-365)||(47402810-47402911)
chr3 (265-413)||(51224061-51224197)
chr3 (261-353)||(30251573-30251665)
chr3 (261-353)||(42998861-42998952)
chr3 (265-413)||(24688125-24688262)
chr3 (265-413)||(40022085-40022222)
chr3 (265-338)||(44946016-44946089)
chr3 (261-365)||(2227995-2228099)
chr3 (261-353)||(43176810-43176902)
chr3 (262-329)||(48752093-48752160)
chr3 (261-329)||(52434146-52434215)
chr3 (349-421)||(30429242-30429314)
chr3 (286-353)||(40165683-40165750)
chr3 (286-365)||(41609099-41609178)
chr3 (265-365)||(8847718-8847818)
chr3 (262-306)||(37741443-37741487)
chr3 (262-351)||(177169-177258)
chr3 (289-346)||(52756150-52756207)
chr3 (361-413)||(48534030-48534082)
chr3 (261-298)||(51942543-51942580)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (261-417)||(39575-39731)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (261-417)||(13781-13937)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (261-417)||(1876-2032)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (261-417)||(11152-11307)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (261-417)||(75263-75419)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (262-417)||(278014-278171)
scaffold0007 (266-414)||(176666-176814)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (261-417)||(18873-19029)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (261-417)||(2451-2607)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (261-408)||(32568-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (296-417)||(4615-4736)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (261-414)||(3095-3239)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (261-353)||(109-201)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (265-413)||(7101-7239)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (261-361)||(4618-4719)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (261-361)||(3399-3500)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (261-353)||(14751-14843)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (261-353)||(20549-20641)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (265-335)||(17917-17987)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (265-338)||(19228-19301)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Original strand, 37260164 - 37260418
Alignment:
Q  13 aatattagctagaaattattctgttaannnnnnnn-gtccatcttggtgttaaccttttatgttcgttccattatcatattattattggcatgttattga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37260164 aatattagctagaaattattctgttaatttttttttgtccatcttggtgttaaccttttatgttcgttccattatcatattattattggcatgttattga 37260263  T
Q  112 gatcacaaggatctaaaat---------------gttgtaagtttaatcatataaaattcgaaagtatttcttcataaagctaggttaaaagtgtatata 196  Q
    |||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37260264 gatcacaaggatctaaaatgtcgtgaatttaaatgttgtaagtttaatcatataaaattcgaaagtatttcttcataaagctaggttaaaagtgtatata 37260363  T
Q  197 aatattttatactttcaagtatactctcatttctacacacttacgtatacaaaaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37260364 aatattttatactttcaagtatactctcatttctacacacttatgtataaaaaaa 37260418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32984252 - 32984096
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32984252 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 32984153  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32984152 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 32984096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 262 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24080075 - 24079924
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24080075 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 24079976  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24079975 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 24079924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 2714556 - 2714712
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2714556 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2714655  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2714656 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 2714712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 5946054 - 5946214
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5946054 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5946153  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5946154 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggt 5946214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 6365993 - 6366145
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6365993 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaa 6366092  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6366093 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 6366145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 25185906 - 25186066
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25185906 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaa 25186005  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25186006 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 25186066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 32114256 - 32114412
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  32114256 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 32114355  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32114356 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 32114412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 37419947 - 37420107
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  37419947 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 37420046  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37420047 atgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggt 37420107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40435328 - 40435172
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40435328 ctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40435229  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40435228 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 40435172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 41862227 - 41862383
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  41862227 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 41862326  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41862327 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 41862383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 43328714 - 43328870
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43328714 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43328813  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  43328814 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat 43328870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 262 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 33981837 - 33981678
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33981837 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 33981738  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33981737 tgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 33981678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 261 - 410
Target Start/End: Original strand, 37956428 - 37956577
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37956428 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 37956527  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37956528 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 37956577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 9734262 - 9734416
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  9734262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaa 9734360  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9734361 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccat 9734416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 10646130 - 10646286
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10646130 ctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 10646229  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10646230 atgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 10646286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 31831130 - 31830974
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31831130 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31831031  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||||    
T  31831030 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccat 31830974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33730816 - 33730660
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33730816 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33730717  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33730716 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 33730660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 44088618 - 44088462
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44088618 ctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 44088519  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44088518 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 44088462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 9303748 - 9303593
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9303748 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 9303649  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9303648 tgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccat 9303593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 263 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13760821 - 13760662
Alignment:
Q  263 agattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 362  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13760821 agattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaat 13760722  T
Q  363 gtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggtg 422  Q
    |||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13760721 gtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtg 13760662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 9013691 - 9013846
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9013691 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 9013790  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9013791 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttagg-taaattacccaccattcttccat 9013846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17718897 - 17718741
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17718897 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 17718798  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17718797 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 17718741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 35628785 - 35628937
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  35628785 tagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccacttaaaaa 35628884  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35628885 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttc 35628937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 41231953 - 41232109
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41231953 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41232052  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  41232053 atgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccat 41232109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 45236740 - 45236588
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45236740 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45236641  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45236640 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctt 45236588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 45258518 - 45258673
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45258518 tagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaa 45258617  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45258618 tgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 45258673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 29048578 - 29048426
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29048578 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 29048479  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29048478 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 37301500 - 37301348
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  37301500 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccacttaaaa 37301401  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  37301400 atgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 37301348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 41653902 - 41654054
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  41653902 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccacttaaaa 41654001  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41654002 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctt 41654054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 13356294 - 13356139
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13356294 tagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 13356195  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  13356194 tgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccat 13356139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 419
Target Start/End: Original strand, 41639922 - 41640079
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||||    
T  41639922 tagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgcttaaaaa 41640021  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccatag 419  Q
    | || ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41640022 tatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatag 41640079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 2275920 - 2276075
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  2275920 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 2276018  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||| |||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  2276019 atatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccat 2276075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 45066766 - 45066611
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45066766 tagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 45066667  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||   |||||||||||| |||||||||||    
T  45066666 tgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccat 45066611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Original strand, 22878398 - 22878551
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22878398 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 22878497  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  22878498 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttc 22878551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 42701465 - 42701308
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccattt---a 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||   |    
T  42701465 ctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 42701366  T
Q  358 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  42701365 aaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccat 42701308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 25248046 - 25248196
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  25248046 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactttaaa 25248139  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  25248140 atgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccat 25248196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 310 - 417
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033093
Alignment:
Q  310 aatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccat 409  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  410 tcttccat 417  Q
    ||||||||    
T  12033086 tcttccat 12033093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 303 - 417
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904239
Alignment:
Q  303 caatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  403 ccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||    
T  3904225 ccaccattcttccat 3904239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 320 - 417
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981631
Alignment:
Q  320 ttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 41981631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39915983 - 39915887
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39915983 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4447455 - 4447314
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  4447455 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 4447367  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4447366 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat 4447314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 31940326 - 31940462
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  31940326 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 31940414  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31940415 gcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctt 31940462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 10378320 - 10378461
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  10378320 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 10378408  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10378409 gcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 10378461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32373886 - 32373746
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  32373886 attacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 32373798  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32373797 gcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccat 32373746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40458932 - 40458795
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  40458932 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 40458844  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    | || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40458843 gtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctt 40458795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 41843264 - 41843401
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||           || ||||    
T  41843264 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatg-----------aatatgt 41843352  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41843353 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 41843401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 353
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981532
Alignment:
Q  275 aagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 41981532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 117489 - 117408
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  117489 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 117408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 2379151 - 2379288
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  |||| || |||||||           || ||||    
T  2379151 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg-----------aatatgt 2379239  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2379240 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 2379288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 3211217 - 3211357
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||           || ||||    
T  3211217 attacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg-----------aatatgt 3211304  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3211305 gcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccat 3211357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4975567 - 4975486
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  4975567 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 4975486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27243299 - 27243218
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||||    
T  27243299 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27254874 - 27254793
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||||    
T  27254874 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 33622625 - 33622492
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  33622625 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttatgg-gtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 33622538  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33622537 ggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcatt 33622492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 323 - 417
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336257
Alignment:
Q  323 ttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccat 31336257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 9713700 - 9713834
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  9713700 attacctttgaagaatggtgggtaatttac---ccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 9713785  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9713786 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 9713834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 33897006 - 33896915
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  33897006 ctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagatacca 33896915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3490559 - 3490486
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3490559 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagat 3490486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9509560 - 9509479
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||    
T  9509560 attacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg 9509479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 414
Target Start/End: Original strand, 38631663 - 38631801
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||           || || |    
T  38631663 attacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg-----------aatatat 38631751  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38631752 gcttatgtggttaatatgtattggttgggataaattatccaccattcttc 38631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31149054 - 31148953
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31149054 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccacttaaaa 31148956  T
Q  361 atg 363  Q
    |||    
T  31148955 atg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26196479 - 26196389
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  26196479 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatacca 26196389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649854
Alignment:
Q  266 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 365  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||  ||||||           || |||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatg-----------aatatgtg 40649902  T
Q  366 cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||    
T  40649901 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctt 40649854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 333
Target Start/End: Original strand, 164729 - 164800
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtc 333  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  164729 ctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttg-tggtggagtc 164800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15398657 - 15398497
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15398657 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15398558  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15398557 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 15398497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 24253389 - 24253545
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24253389 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24253488  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24253489 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 24253545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 739879 - 739726
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  739879 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 739780  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  739779 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttc 739726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43326554 - 43326398
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43326554 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43326455  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43326454 atgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 43326398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18479843 - 18479690
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  18479843 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 18479744  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18479743 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 18479690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 35626049 - 35626201
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35626049 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 35626148  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35626149 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 35626201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 39932587 - 39932742
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39932587 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39932686  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  39932687 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccat 39932742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 261 - 418
Target Start/End: Original strand, 15683798 - 15683955
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15683798 ctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15683897  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 418  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15683898 atgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccata 15683955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3466856 - 3466704
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3466856 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 3466757  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3466756 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 3466704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 5184979 - 5185135
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  5184979 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 5185078  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5185079 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccat 5185135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 6901806 - 6901962
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  6901806 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 6901905  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6901906 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 6901962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 7722056 - 7722212
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7722056 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 7722155  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7722156 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccat 7722212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 27938904 - 27939060
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27938904 ctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27939003  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27939004 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 27939060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939060
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 31939060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40886202 - 40886047
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  40886202 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 40886104  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40886103 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 40886047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27278652 - 27278488
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatgg----ttcatggataccattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    ||||||||||||| ||    
T  27278652 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggataccactt 27278553  T
Q  357 aaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27278552 aaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 27278488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 12648804 - 12648960
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12648804 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 12648903  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12648904 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 12648960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 25831528 - 25831679
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25831528 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaattaaaa 25831626  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25831627 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 25831679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 13504917 - 13504761
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13504917 ctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 13504818  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13504817 atgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccat 13504761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40279029 - 40278877
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  40279029 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgt 40278930  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40278929 gcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccat 40278877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43262354 - 43262202
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  43262354 attacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43262255  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43262254 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 43262202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27501229 - 27501074
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27501229 tagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 27501130  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27501129 tgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccat 27501074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2484467 - 2484311
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  2484467 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 2484368  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2484367 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 2484311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756509
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttcc 415  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcc 38756509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 5137722 - 5137878
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5137722 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5137821  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| || || |  ||||||| |||||||||||||||    
T  5137822 atgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccat 5137878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789314
Alignment:
Q  291 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  391 gggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccat 29789314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28424968 - 28424814
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  28424968 ctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 28424871  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28424870 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 28424814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 890913 - 891068
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  890913 ctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccactt-aaa 891011  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  891012 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccat 891068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 40110245 - 40110396
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  40110245 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 40110343  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||  |||||| || | ||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  40110344 gcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccat 40110396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 265 - 418
Target Start/End: Original strand, 4149705 - 4149848
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||| ||||||||||    
T  4149705 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgg---------ggtt-atggataccacttaaaaatgt 4149794  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4149795 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccata 4149848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 417
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451413
Alignment:
Q  296 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  396 aaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccat 34451413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 763730 - 763882
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  763730 ctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcacttaaaa 763829  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  763830 atgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctt 763882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 352
Target Start/End: Original strand, 40632506 - 40632597
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacc 352  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40632506 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 40632597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 33617596 - 33617737
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  33617596 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 33617684  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33617685 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 33617737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 6973074 - 6973211
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  6973074 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 6973162  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6973163 gcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6973211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9424752 - 9424615
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||           || || |    
T  9424752 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatat 9424664  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9424663 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 9424615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 38015674 - 38015537
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  38015674 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 38015586  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  38015585 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 38015537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 42658822 - 42658685
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || || |    
T  42658822 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatat 42658734  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42658733 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 42658685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 2585469 - 2585569
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  2585469 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaa 2585568  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  2585569 a 2585569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12558193 - 12558090
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  12558193 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 12558095  T
Q  361 atgtg 365  Q
    |||||    
T  12558094 atgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 5497284 - 5497421
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  5497284 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 5497372  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5497373 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 5497421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 13957681 - 13957818
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || |||     
T  13957681 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgc 13957769  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  13957770 gcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctt 13957818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 14971989 - 14972126
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| |||           || ||||    
T  14971989 attaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-----------aatatgt 14972077  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  14972078 gcttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctt 14972126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 19295741 - 19295878
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||| ||           ||||    
T  19295741 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtat-----------atgt 19295829  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19295830 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 19295878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 27503390 - 27503527
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  27503390 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 27503478  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  27503479 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctt 27503527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 31294164 - 31294012
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||  | | || |||| |||||| ||||||    
T  31294164 ctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccacttaaaa 31294065  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    || |||||| |||| | |||  || |||||||  |||||||||||||||||||    
T  31294064 atatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattctt 31294012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23195408 - 23195271
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  23195408 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 23195320  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||    
T  23195319 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctt 23195271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 36365605 - 36365468
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  36365605 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 36365517  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  36365516 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctt 36365468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120132
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 362  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaat 5120132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36472448 - 36472347
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca-tttaaa 359  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  36472448 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccactttaaa 36472349  T
Q  360 aa 361  Q
    ||    
T  36472348 aa 36472347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42247942 - 42247869
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  42247942 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 42247869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9374662 - 9374525
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  9374662 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 9374574  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    | ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9374573 gtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 9374525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18327337 - 18327245
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18327337 ctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 18327245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38638074 - 38637982
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  38638074 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 38637982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 418
Target Start/End: Original strand, 6206895 - 6207037
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||||| || |||||||           || ||||    
T  6206895 attacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 6206983  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  6206984 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcata 6207037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9527183 - 9527124
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9527183 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Original strand, 27390605 - 27390696
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27390605 tagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 27390696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 413
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492761
Alignment:
Q  288 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactg 387  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||           ||||||||||||||||||||||| ||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  388 gttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  38492736 gttggggtaaattacccatcattctt 38492761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9171185 - 9171112
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  9171185 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 9171112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1402669 - 1402577
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  1402669 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 1402577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24167948 - 24167856
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| | |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  24167948 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 24167856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 40686906 - 40687006
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  40686906 ctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaa 40687005  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  40687006 a 40687006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656591
Alignment:
Q  281 ggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatg 380  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||           || ||||||||||||| ||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatg 3656624  T
Q  381 tgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  3656623 tgtattggttggggtaaattactcatcattctt 3656591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 36948626 - 36948513
Alignment:
Q  287 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtact 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||           ||||||||||||| |||||||||| |    
T  36948626 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggat-----------atgtgcttatgtggctaatgtgtatt 36948539  T
Q  387 ggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36948538 ggtaggg-taaattacccaccattctt 36948513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300962
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaag 336  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaatttatcggtggagtcaag 15300962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940418
Alignment:
Q  278 aatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagat 3940418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33624099 - 33624043
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 321  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33624099 attacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 33624043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20207154 - 20207080
Alignment:
Q  287 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||   | ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20207154 taatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggataccatctaaaaa 20207080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 314
Target Start/End: Original strand, 28756085 - 28756138
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 314  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28756085 ctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 33624014 - 33623965
Alignment:
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  33624014 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatt 33623965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 421
Target Start/End: Original strand, 40687010 - 40687054
Alignment:
Q  377 aatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40687010 aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggt 40687054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2325064 - 2324908
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2325064 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2324965  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2324964 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 2324908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 746472 - 746628
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  746472 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 746571  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  746572 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 746628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 11184978 - 11185134
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11184978 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 11185077  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11185078 atgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 11185134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13815393 - 13815241
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13815393 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 13815294  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13815293 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctt 13815241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 23901785 - 23901941
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23901785 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23901884  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23901885 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 23901941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 38997107 - 38997263
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38997107 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 38997206  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38997207 atgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccat 38997263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 262 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 10244756 - 10244597
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10244756 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 10244657  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    |||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10244656 tgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 10244597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 4034598 - 4034754
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4034598 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 4034697  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4034698 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 4034754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 6430479 - 6430635
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6430479 ctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 6430578  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6430579 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 6430635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 6594633 - 6594477
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6594633 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 6594534  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6594533 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccat 6594477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 14660452 - 14660608
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14660452 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 14660551  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14660552 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccat 14660608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 17600842 - 17600998
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17600842 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 17600941  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17600942 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 17600998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 45370996 - 45371152
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45370996 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45371095  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45371096 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 45371152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 34518374 - 34518529
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34518374 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 34518473  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34518474 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccat 34518529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 5726135 - 5726291
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  5726135 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccacttaaaa 5726234  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| |||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5726235 atgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 5726291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 10424601 - 10424757
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10424601 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 10424700  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10424701 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 10424757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 26710351 - 26710503
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26710351 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 26710450  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26710451 atgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 26710503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27651209 - 27651053
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27651209 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27651110  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27651109 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 27651053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 40635228 - 40635376
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40635228 attacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40635327  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40635328 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 40635376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2914312 - 2914157
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2914312 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 2914213  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2914212 tgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccat 2914157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 27400409 - 27400561
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27400409 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27400508  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27400509 atgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 27400561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 32327367 - 32327527
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  32327367 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 32327466  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32327467 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggt 32327527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7892863 - 7892705
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  7892863 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccacttaaaa 7892764  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccatag 419  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7892763 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatag 7892705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 261 - 410
Target Start/End: Original strand, 32608386 - 32608535
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  32608386 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccacttaaaa 32608485  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  32608486 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 32608535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Original strand, 32948452 - 32948604
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  32948452 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccacttaaaa 32948550  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  32948551 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttc 32948604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 27024421 - 27024577
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27024421 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27024520  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  27024521 atatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccat 27024577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 37621044 - 37620886
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg---agtcaagatggttcatggataccatttaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37621044 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggataccacttaa 37620945  T
Q  359 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37620944 aaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccat 37620886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1092125 - 1091970
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1092125 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 1092026  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1092025 tgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccat 1091970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 4609633 - 4609788
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4609633 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 4609732  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  4609733 tgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccat 4609788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33427822 - 33427670
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33427822 ctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 33427723  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33427722 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctt 33427670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 264 - 409
Target Start/End: Original strand, 12842112 - 12842257
Alignment:
Q  264 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  12842112 gattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaattaaaaatg 12842211  T
Q  364 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccat 409  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  12842212 tgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat 12842257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 37255507 - 37255359
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37255507 ctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 37255413  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255412 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttc 37255359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 14697711 - 14697559
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14697711 tagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 14697612  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14697611 tgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttc 14697559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 269 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856451
Alignment:
Q  269 cctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgctt 368  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  369 atgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggt 32856451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 40735470 - 40735626
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  40735470 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 40735569  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| |||||| | |||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  40735570 atgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccat 40735626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 410
Target Start/End: Original strand, 40037149 - 40037298
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  40037149 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 40037248  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  40037249 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt 40037298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 410
Target Start/End: Original strand, 9444689 - 9444845
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttac-------ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9444689 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatggatacca 9444788  T
Q  354 tttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9444789 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 9444845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 264 - 414
Target Start/End: Original strand, 11159631 - 11159780
Alignment:
Q  264 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 363  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  11159631 gattacctttgaaaaatggtg-gtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccacttaaaaatg 11159729  T
Q  364 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    || ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11159730 tgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttc 11159780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 419
Target Start/End: Original strand, 15925086 - 15925244
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15925086 ctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15925185  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccatag 419  Q
    || |||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  15925186 atatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatag 15925244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8433091 - 8432942
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  8433091 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccactttaaa 8432992  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
    || | |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8432991 atatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 379
Target Start/End: Original strand, 42899921 - 42900039
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42899921 ctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 42900020  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaat 379  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  42900021 atgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 306 - 417
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25294997
Alignment:
Q  306 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattaccca 405  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  406 ccattcttccat 417  Q
     |||||||||||    
T  25294986 tcattcttccat 25294997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 402
Target Start/End: Original strand, 41172468 - 41172605
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  41172468 attacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaatgt 41172567  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattac 402  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41172568 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 303 - 417
Target Start/End: Original strand, 1229675 - 1229789
Alignment:
Q  303 caatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattac 402  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||    
T  1229675 caatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattac 1229774  T
Q  403 ccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||    
T  1229775 ccaccattcttccat 1229789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35158210 - 35158073
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  35158210 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 35158122  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35158121 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 35158073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 145292 - 145429
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||           ||    
T  145292 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac-----------gt 145380  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  145381 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 145429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 39103057 - 39103198
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  39103057 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 39103145  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39103146 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 39103198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 261 - 334
Target Start/End: Original strand, 12814620 - 12814693
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtca 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12814620 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 265 - 411
Target Start/End: Original strand, 4258500 - 4258634
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  4258500 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgg-gtcaagatagttcatg-----------aatatgt 4258587  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattc 411  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4258588 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattc 4258634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 331 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 447738 - 447652
Alignment:
Q  331 gtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  447738 gtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccat 447652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12333655 - 12333519
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||| ||           ||||    
T  12333655 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat-----------atgt 12333567  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12333566 gcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctt 12333519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21735060 - 21734919
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||           || ||||    
T  21735060 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 21734972  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21734971 gcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 21734919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 39301357 - 39301220
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  39301357 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 39301269  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  39301268 gcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctt 39301220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28641452 - 28641371
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  28641452 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 28641371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 419
Target Start/End: Original strand, 35126786 - 35126933
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||    
T  35126786 ctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaa 35126885  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccatag 419  Q
    | |||           ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35126886 aggtg-----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatag 35126933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 44481834 - 44481926
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  44481834 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 44481926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 12730071 - 12730208
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||           |||| ||||    
T  12730071 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgt 12730159  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||    
T  12730160 gcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctt 12730208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19428582 - 19428449
Alignment:
Q  269 cctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgctt 368  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||           || ||||||||    
T  19428582 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgctt 19428494  T
Q  369 atgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19428493 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 19428449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 29687051 - 29687188
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  29687051 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 29687139  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||    
T  29687140 gcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctt 29687188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 34249275 - 34249412
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| |||           || ||||    
T  34249275 attatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-----------aatatgt 34249363  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||    
T  34249364 gcttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctt 34249412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 8056636 - 8056717
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  8056636 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg 8056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13543784 - 13543647
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  13543784 attacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 13543696  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||    
T  13543695 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctt 13543647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 27331308 - 27331449
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | |||||||| ||||||| |       || | ||||    
T  27331308 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaa-------tatatatgt 27331400  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  27331401 gcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctt 27331449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27765022 - 27764897
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  27765022 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 27764934  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatta 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  27764933 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 27764897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 43899130 - 43898994
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  43899130 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 43899042  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  43899041 gcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctt 43898994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 3266306 - 3266387
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  3266306 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40544236 - 40544155
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  40544236 attacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 334 - 422
Target Start/End: Original strand, 12827142 - 12827229
Alignment:
Q  334 aagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggtg 422  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12827142 aagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccacaggtg 12827229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28566858 - 28566721
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  28566858 attacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 28566770  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| || |||||||    
T  28566769 gcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctt 28566721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2000497 - 2000441
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2000497 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 2000441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  326 gtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaa 398  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 43356109 - 43356187
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  43356109 attacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 43356187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 30545828 - 30545928
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  30545828 tagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatacaatctaaaaa 30545927  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  30545928 t 30545928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38985439 - 38985350
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||| ||||||||||||||    
T  38985439 tagattacatttga-gaacggtgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgat-atgtcaagatagttcatggatacca 38985350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2688889 - 2688752
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| || || | |||||||| |||||||           || ||||    
T  2688889 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 2688801  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  2688800 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctt 2688752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 413
Target Start/End: Original strand, 3711663 - 3711780
Alignment:
Q  285 agtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||||||||| | ||||||||||    
T  3711663 agtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgcggctaatgtgta 3711751  T
Q  385 ctggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3711752 ttggttggggtaaattacccatcattctt 3711780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28019996 - 28019959
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28019996 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 321
Target Start/End: Original strand, 10176565 - 10176625
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  10176565 ctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 42900781 - 42900817
Alignment:
Q  381 tgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42900781 tgtattggttgagataaattacccaccattcttccat 42900817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 5882513 - 5882669
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5882513 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5882612  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5882613 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 5882669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 7393761 - 7393605
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7393761 ctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 7393662  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7393661 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 7393605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 14891554 - 14891398
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14891554 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 14891455  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14891454 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 14891398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34528036 - 34527881
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  34528036 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaa 34527937  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34527936 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 34527881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Original strand, 2892195 - 2892348
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2892195 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2892294  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2892295 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttc 2892348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 2594027 - 2593867
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2594027 ctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2593928  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2593927 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggt 2593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 7345287 - 7345131
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  7345287 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 7345188  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7345187 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 7345131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18101670 - 18101514
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  18101670 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 18101571  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18101570 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 18101514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22551236 - 22551080
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  22551236 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacctaaaa 22551137  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22551136 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 22551080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 24168098 - 24168254
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24168098 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24168197  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24168198 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 24168254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26377375 - 26377223
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26377375 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 26377276  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26377275 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 26377223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 599899 - 600051
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  599899 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 599998  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  599999 atgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctt 600051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 1970718 - 1970874
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  1970718 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 1970817  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1970818 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 1970874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 8615247 - 8615403
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8615247 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 8615346  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  8615347 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccat 8615403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 267 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988993
Alignment:
Q  267 tacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgc 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  367 ttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 11988993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 16703373 - 16703529
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  16703373 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 16703472  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  16703473 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccat 16703529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 267 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341807
Alignment:
Q  267 tacctttgaagaatggtgagtaatttacccacca--accaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 22341807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 960079 - 959927
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  960079 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccacttaaaa 959980  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  959979 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 959927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19281230 - 19281070
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  19281230 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 19281131  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19281130 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggt 19281070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19415708 - 19415552
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19415708 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccacttaaaa 19415609  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  19415608 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccat 19415552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 28947094 - 28947250
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  28947094 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaa 28947193  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28947194 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 28947250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 30743623 - 30743471
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  30743623 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccacttaaaa 30743524  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30743523 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctt 30743471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24224240 - 24224093
Alignment:
Q  266 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24224240 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 24224141  T
Q  366 cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||||    
T  24224140 cttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctt 24224093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 10508083 - 10507930
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10508083 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 10507984  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10507983 atgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttc 10507930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5294976 - 5294820
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5294976 ctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 5294877  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  5294876 atgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccat 5294820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5299528 - 5299372
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5299528 ctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 5299429  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  5299428 atgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccat 5299372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33452747 - 33452591
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33452747 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33452648  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33452647 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 33452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 30467778 - 30467656
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||     
T  30467778 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaac 30467679  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgt 383  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  30467678 atgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 286 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261944
Alignment:
Q  286 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtac 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||| ||||     
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  386 tggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggt 23261944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 13329392 - 13329529
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| || ||||| |||||           |||| ||||    
T  13329392 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca-----------taaatatgt 13329480  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13329481 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 13329529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28949005 - 28948868
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||           || || |    
T  28949005 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-----------aatatat 28948917  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28948916 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 28948868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 336
Target Start/End: Original strand, 929666 - 929741
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaag 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  929666 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 7167589 - 7167681
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  7167589 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggatacca 7167681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 15965444 - 15965581
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||  ||||||           || ||||    
T  15965444 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatg-----------aatatgt 15965532  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15965533 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 15965581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 273 - 413
Target Start/End: Original strand, 4487546 - 4487675
Alignment:
Q  273 tgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgt 372  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || |||| || ||||    
T  4487546 tgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtactcatgt 4487634  T
Q  373 gactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4487635 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 4487675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 345
Target Start/End: Original strand, 3291019 - 3291099
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 345  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| || ||||| ||||||    
T  3291019 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcat 3291099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 421
Target Start/End: Original strand, 1398564 - 1398709
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||| ||| |||           || ||||    
T  1398564 attatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatg-----------aatatgt 1398652  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  1398653 gcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggt 1398709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1939664 - 1939579
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata 350  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||    
T  1939664 attatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 3786760 - 3786897
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  3786760 attacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatg-----------aatatgt 3786848  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  3786849 gcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctt 3786897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 345
Target Start/End: Original strand, 13844847 - 13844927
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 345  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  13844847 attacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcat 13844927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 413
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661882
Alignment:
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctt 18661882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11743119 - 11743070
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaa 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11743119 ctagattacccttgaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaa 11743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 361 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913119
Alignment:
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctt 24913119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 120)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 51363014 - 51363170
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51363014 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 51363113  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51363114 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 51363170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21366784 - 21366628
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21366784 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 21366685  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21366684 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 21366628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 34276558 - 34276710
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34276558 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 34276657  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34276658 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 34276710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 44984772 - 44984924
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44984772 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 44984871  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984872 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 44984924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 53854604 - 53854448
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53854604 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 53854505  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  53854504 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 53854448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 397410 - 397565
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  397410 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 397509  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  397510 tgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 397565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 9798473 - 9798628
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9798473 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 9798572  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9798573 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 9798628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 237484 - 237640
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  237484 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaa 237583  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  237584 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 237640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2826856 - 2826700
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2826856 ctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2826757  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2826756 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 2826700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 6019935 - 6020091
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6019935 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 6020034  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6020035 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat 6020091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 23437599 - 23437755
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23437599 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23437698  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23437699 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 23437755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 27373083 - 27373239
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  27373083 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 27373182  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27373183 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 27373239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 42085214 - 42085370
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42085214 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 42085313  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42085314 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 42085370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 55056434 - 55056282
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  55056434 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaa 55056335  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  55056334 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 55056282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 262 - 421
Target Start/End: Original strand, 45797487 - 45797646
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45797487 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 45797586  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45797587 tgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggt 45797646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49881238 - 49881078
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49881238 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 49881139  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt----gggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  49881138 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccat 49881078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 146604 - 146451
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  146604 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 146505  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  146504 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttc 146451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 6285318 - 6285470
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  6285318 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 6285417  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6285418 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 6285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 29478367 - 29478527
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29478367 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 29478466  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29478467 atgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggt 29478527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32366835 - 32366679
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32366835 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 32366736  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32366735 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccat 32366679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 41702634 - 41702478
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41702634 ctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 41702535  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41702534 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 41702478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 55776053 - 55776208
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55776053 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 55776151  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 418  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  55776152 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcata 55776208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 55840231 - 55840386
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55840231 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 55840329  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 418  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  55840330 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcata 55840386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 41949389 - 41949551
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41949389 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41949488  T
Q  361 atgtgct--tatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41949489 atgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggt 41949551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18462188 - 18462035
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  18462188 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 18462089  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  18462088 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttc 18462035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 3170633 - 3170789
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  3170633 ctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 3170732  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3170733 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 3170789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22618687 - 22618533
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22618687 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaa 22618589  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22618588 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttagg-taaattacccaccattcttccat 22618533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 31070248 - 31070093
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31070248 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 31070150  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31070149 atgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 31070093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 31532310 - 31532154
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31532310 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31532211  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  31532210 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat 31532154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 39077552 - 39077708
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39077552 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 39077651  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39077652 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccat 39077708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 42766016 - 42765861
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  42766016 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 42765918  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42765917 atgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 42765861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43471870 - 43471714
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43471870 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43471771  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43471770 atgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 43471714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 53461987 - 53461839
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53461987 attacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 53461888  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  53461887 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 53461839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 54575115 - 54574959
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  54575115 ctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 54575016  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54575015 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 54574959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 42033183 - 42033338
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  42033183 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 42033282  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| ||||||  ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42033283 tgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccat 42033338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 407761 - 407911
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  407761 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaa 407859  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  407860 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctt 407911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19387863 - 19387707
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19387863 ctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaa 19387764  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19387763 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 19387707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26091429 - 26091277
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26091429 attatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 26091330  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26091329 gtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 26091277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 29777432 - 29777276
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||||    
T  29777432 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccacttaaaa 29777333  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29777332 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat 29777276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 31972511 - 31972359
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  31972511 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 31972412  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  31972411 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctt 31972359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 41560339 - 41560491
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41560339 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41560438  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41560439 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 41560491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 47344663 - 47344819
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47344663 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47344762  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  47344763 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccat 47344819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 54424989 - 54425145
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54424989 ctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 54425088  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  54425089 atgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat 54425145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 54607969 - 54608125
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  54607969 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaa 54608068  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  54608069 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccat 54608125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 33897669 - 33897510
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33897669 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 33897570  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    | || |||| || |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33897569 tatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggt 33897510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 50534639 - 50534794
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  50534639 tagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 50534738  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50534739 tgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 50534794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39587954 - 39587798
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39587954 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39587855  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39587854 atgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccat 39587798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 42222298 - 42222450
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  42222298 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccacttaaaa 42222397  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  42222398 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattctt 42222450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 31914206 - 31914360
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31914206 tagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 31914305  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31914306 tgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 31914360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 38591675 - 38591827
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    |    
T  38591675 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt----a 38591770  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38591771 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 38591827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Original strand, 50234007 - 50234160
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  50234007 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccacttaaaa 50234106  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50234107 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 50234160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22468945 - 22468789
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  22468945 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccacttaaaa 22468846  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  22468845 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccat 22468789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 23609094 - 23609250
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23609094 ctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccacttaaaa 23609193  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  23609194 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccat 23609250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 48657832 - 48657981
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  48657832 tagattacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 48657925  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48657926 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 48657981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 50457985 - 50457829
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50457985 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 50457886  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  50457885 atgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccat 50457829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 50536798 - 50536646
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  50536798 tagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaa 50536699  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    | || |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50536698 tatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttc 50536646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 53834229 - 53834073
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53834229 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 53834130  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||   |||||||||||||||||||||||    
T  53834129 atgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccat 53834073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 55519834 - 55519990
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  55519834 ctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 55519933  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  55519934 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccat 55519990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Original strand, 2243465 - 2243618
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2243465 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2243564  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||  ||||||| || ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  2243565 atgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttc 2243618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 47662277 - 47662124
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  47662277 ctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccacttaaaa 47662178  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47662177 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 47662124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 56023173 - 56023024
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  56023173 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 56023074  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  56023073 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcatt 56023024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 3692385 - 3692229
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  3692385 ctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccacttaaaa 3692286  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3692285 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 3692229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 35446513 - 35446668
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  35446513 ctagattaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 35446611  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35446612 atgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 35446668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 48259685 - 48259530
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||    
T  48259685 ctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccactt-aaa 48259587  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  48259586 atgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat 48259530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 54086417 - 54086571
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  54086417 ctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccgcttaaaa 54086514  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54086515 atgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccat 54086571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 410
Target Start/End: Original strand, 1932770 - 1932919
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  1932770 ctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 1932869  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||    
T  1932870 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcatt 1932919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41632181 - 41632030
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  41632181 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggatatcgcttaaaa 41632083  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41632082 atgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctt 41632030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 48313564 - 48313718
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  48313564 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccactt-aaa 48313661  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||  ||||| | || ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  48313662 atatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccat 48313718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 51951689 - 51951844
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  51951689 ctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagttaaaa 51951788  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51951789 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttgtg-taaattacccaccattcttccat 51951844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728325
Alignment:
Q  294 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  394 ataaattacccaccattcttccat 417  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccat 52728325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 48654822 - 48654983
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  48654822 tagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccacttaaaaa 48654921  T
Q  362 tgtgcttatgtgacta------atgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||| |||||||| |||      ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48654922 tgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccat 48654983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 14017549 - 14017395
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||    
T  14017549 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt--aa 14017452  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
     |||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  14017451 gtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccat 14017395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 54805793 - 54805633
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54805793 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccacttaaaa 54805694  T
Q  361 atgtg----cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  54805693 atgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccat 54805633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 310 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532849
Alignment:
Q  310 aatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccat 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccat 36532857  T
Q  410 tcttccat 417  Q
    ||||||||    
T  36532856 tcttccat 36532849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 43890939 - 43891080
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||           || ||||    
T  43890939 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatg-----------aatatgt 43891027  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43891028 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 43891080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 5117598 - 5117461
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  5117598 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 5117510  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5117509 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 5117461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 45633939 - 45633802
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  45633939 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 45633851  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45633850 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 45633802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 54216896 - 54216755
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  54216896 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 54216808  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54216807 gcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccat 54216755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 309 - 417
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509459
Alignment:
Q  309 aaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccacca 408  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  409 ttcttccat 417  Q
    |||||||||    
T  42509451 ttcttccat 42509459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 9998091 - 9997950
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  9998091 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 9998003  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9998002 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 9997950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 15060449 - 15060312
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  15060449 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 15060361  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15060360 gcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 15060312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 20352002 - 20351865
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  20352002 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 20351914  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20351913 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 20351865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 46708901 - 46708764
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  46708901 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 46708813  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  46708812 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctt 46708764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 340 - 421
Target Start/End: Original strand, 35595773 - 35595854
Alignment:
Q  340 gttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35595773 gttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 35595854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 265 - 414
Target Start/End: Original strand, 47811917 - 47812055
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||           || ||||    
T  47811917 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatg-----------aatatgt 47812005  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47812006 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 47812055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 37239250 - 37239113
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  37239250 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 37239162  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  37239161 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 37239113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 54715046 - 54715187
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  54715046 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatg-----------aatatgt 54715134  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  54715135 gcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccat 54715187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 42557589 - 42557666
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42557589 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4486741 - 4486598
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||           || ||||    
T  4486741 attatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-----------aatatgt 4486653  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccatag 419  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  4486652 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatag 4486598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14335265 - 14335173
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  14335265 ctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagatacca 14335173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 27580126 - 27580218
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27580126 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 27580218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 34835184 - 34835284
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  34835184 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaa 34835283  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  34835284 a 34835284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27398767 - 27398664
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  27398767 ctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 27398668  T
Q  361 atgt 364  Q
    ||||    
T  27398667 atgt 27398664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38547764 - 38547673
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  38547764 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 38547673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 22620604 - 22620741
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  22620604 attatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 22620692  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22620693 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattctt 22620741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 34552330 - 34552467
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  34552330 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatg-----------aatatgt 34552418  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  34552419 gcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctt 34552467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31881474 - 31881393
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  31881474 attacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 31881393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1662423 - 1662331
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  1662423 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 1662331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49058032 - 49057933
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||  || || || |||||| ||||||||||||||    
T  49058032 ctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccatttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 302 - 392
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  302 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaa-gatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27873708 - 27873571
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| || ||||| |||||||           || ||||    
T  27873708 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatg-----------aatatgt 27873620  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27873619 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 27873571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 346
Target Start/End: Original strand, 49014112 - 49014190
Alignment:
Q  268 acctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  49014112 acctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 49014190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 413
Target Start/End: Original strand, 52461386 - 52461511
Alignment:
Q  277 gaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgact 376  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||||||||||| ||    
T  52461386 gaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 52461474  T
Q  377 aatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  52461475 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 52461511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3293183 - 3293102
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  3293183 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11972289 - 11972208
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  11972289 attacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 354
Target Start/End: Original strand, 43231510 - 43231602
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccat 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  43231510 ctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccat 43231602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 54216324 - 54216405
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  54216324 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 54216405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 46720032 - 46720124
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  46720032 ctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggatacca 46720124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 421
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344954
Alignment:
Q  334 aagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgg-taaattatccaccattcttccataggt 35344954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 33289714 - 33289851
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |  ||||||| ||||||| ||||           ||    
T  33289714 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac-----------gt 33289802  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33289803 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 33289851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 52688360 - 52688497
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| || |||||||           || || |    
T  52688360 attaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg-----------aatatat 52688448  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  52688449 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 52688497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6371413 - 6371336
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6371413 ctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagat 6371336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 573810 - 573902
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  573810 ctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 573902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 417
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049044
Alignment:
Q  363 gtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 33049044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33558102 - 33558021
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||| |||||||    
T  33558102 attatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg 33558021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17555661 - 17555617
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17555661 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259722
Alignment:
Q  359 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 48259722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 27872612 - 27872678
Alignment:
Q  287 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  27872612 taatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggatacca 27872678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206609
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagat 18206609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 51981554 - 51981502
Alignment:
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  51981554 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctt 51981502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 106)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21139587 - 21139427
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21139587 ctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 21139488  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21139487 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 21139427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 31308008 - 31308164
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31308008 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31308107  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31308108 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 31308164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 43251718 - 43251874
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43251718 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43251817  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43251818 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 43251874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 45538160 - 45538316
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45538160 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45538259  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45538260 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 45538316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 3611147 - 3611299
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3611147 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 3611246  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3611247 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 3611299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4068858 - 4068702
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4068858 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 4068759  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4068758 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 4068702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17995126 - 17994970
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  17995126 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaa 17995027  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17995026 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 17994970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24245200 - 24245044
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24245200 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24245101  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24245100 atgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccat 24245044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 44661977 - 44662133
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  44661977 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 44662076  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44662077 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 44662133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 25678433 - 25678278
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25678433 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 25678334  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25678333 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 25678278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 6327722 - 6327567
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6327722 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 6327623  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6327622 atgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccat 6327567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26085572 - 26085417
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  26085572 ctagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 26085474  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085473 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 26085417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 26277184 - 26277340
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26277184 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 26277283  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26277284 atttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 26277340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 38790372 - 38790216
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  38790372 ctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 38790273  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38790272 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 38790216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 5981177 - 5981333
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5981177 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5981276  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  5981277 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccat 5981333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 25058695 - 25058851
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25058695 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccacttaaaa 25058794  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25058795 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 25058851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33112992 - 33112840
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33112992 ctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33112893  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  33112892 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 33112840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 33884095 - 33884251
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33884095 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaa 33884194  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33884195 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccat 33884251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33960157 - 33960001
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33960157 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaa 33960058  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33960057 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccat 33960001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 39646575 - 39646731
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  39646575 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccacttaaaa 39646674  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39646675 atgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 39646731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 50774228 - 50774380
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  50774228 attacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 50774327  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50774328 gcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccat 50774380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 37620366 - 37620211
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37620366 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 37620267  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37620266 tgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 37620211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 265 - 414
Target Start/End: Original strand, 36003141 - 36003290
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36003141 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 36003240  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36003241 gcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttc 36003290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 5980075 - 5980235
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  5980075 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaa 5980174  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5980175 attagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggt 5980235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 23984762 - 23984918
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23984762 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23984861  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23984862 atgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 23984918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 31040716 - 31040872
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31040716 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31040815  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  31040816 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccat 31040872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 38332034 - 38331878
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  38332034 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 38331935  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38331934 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 38331878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 41999822 - 41999978
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41999822 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaa 41999921  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41999922 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 41999978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 46784430 - 46784586
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46784430 ctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccacttaaaa 46784529  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  46784530 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccat 46784586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 47383903 - 47383755
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  47383903 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47383804  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47383803 gcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctt 47383755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49254150 - 49253994
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  49254150 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 49254051  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49254050 atgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 49253994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 264 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 23932681 - 23932528
Alignment:
Q  264 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  23932681 gattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccacttaaaaatg 23932582  T
Q  364 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||| |||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||    
T  23932581 tgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccat 23932528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23221104 - 23220972
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23221104 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23221005  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23221004 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 23220972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 24885508 - 24885664
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24885508 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24885607  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || || |||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24885608 atatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 24885664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 26794315 - 26794467
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  26794315 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 26794414  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26794415 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 26794467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 42863872 - 42864028
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  42863872 ctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 42863971  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42863972 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 42864028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 46967216 - 46967064
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46967216 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 46967117  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  46967116 atgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctt 46967064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 47671593 - 47671749
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47671593 ctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47671692  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47671693 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 47671749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 408
Target Start/End: Original strand, 31844383 - 31844530
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31844383 ctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31844482  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccacca 408  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31844483 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 35692839 - 35692682
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaattta-cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaa 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||    
T  35692839 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgcttaaa 35692740  T
Q  360 aatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  35692739 aatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccat 35692682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26525064 - 26524908
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  26525064 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccacttaaaa 26524965  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26524964 atatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccat 26524908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 28888588 - 28888744
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28888588 ctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 28888687  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28888688 atgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccat 28888744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 36566337 - 36566493
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36566337 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 36566436  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36566437 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccat 36566493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 46616556 - 46616712
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  46616556 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 46616655  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  46616656 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 46616712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 265 - 414
Target Start/End: Original strand, 47317326 - 47317475
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  47317326 attacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 47317425  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  47317426 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttc 47317475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 3285409 - 3285564
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  3285409 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 3285507  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  3285508 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat 3285564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 47187112 - 47187264
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  47187112 ctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 47187211  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||    
T  47187212 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctt 47187264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49399163 - 49399007
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  49399163 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccacttaaaa 49399064  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  49399063 atgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccat 49399007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 25518821 - 25518952
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25518821 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 25518920  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25518921 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 35273607 - 35273759
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35273607 attatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 35273706  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  35273707 gcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccat 35273759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 51057082 - 51057234
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  51057082 attacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccacttaaaaatgt 51057181  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||  ||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  51057182 gcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccat 51057234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 48373511 - 48373658
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48373511 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 48373610  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||         ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48373611 atgtgctt---------atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 48373658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 42313540 - 42313380
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagta----atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||    
T  42313540 ctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaataccactt 42313441  T
Q  357 aaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42313440 aaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 42313380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 51403182 - 51403036
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  51403182 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 51403084  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||         || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51403083 atgtgctt---------atatgtattggttgggataaattactcaccattcttccat 51403036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27983762 - 27983622
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||    
T  27983762 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg----------------ggataccatttaaaa 27983679  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27983678 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 27983622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 289 - 417
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450657
Alignment:
Q  289 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactgg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  389 ttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccat 2450657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31980110 - 31979998
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31980110 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31980011  T
Q  361 atgtgcttatgtg 373  Q
    |||| ||||||||    
T  31980010 atgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 45476009 - 45475866
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  45476009 ctagattacctttgaagaatggt--------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaa 45475918  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  45475917 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccattctt 45475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045618
Alignment:
Q  295 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggga 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||     
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattaggg 51045638  T
Q  395 taaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  51045637 taaattacccaccattcttc 51045618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808808
Alignment:
Q  308 aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccacc 407  Q
    ||||||| |||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  408 attcttccat 417  Q
    ||||||||||    
T  4808799 attcttccat 4808808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 2657314 - 2657451
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  2657314 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 2657402  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2657403 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 2657451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 10928078 - 10928219
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  10928078 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 10928166  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10928167 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 10928219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41467792 - 41467655
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  41467792 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 41467704  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41467703 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 41467655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2557021 - 2556909
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  2557021 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 2556922  T
Q  361 atgtgcttatgtg 373  Q
    ||||| |||||||    
T  2556921 atgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 33073222 - 33073363
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  33073222 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 33073310  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33073311 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat 33073363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6626184 - 6626047
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  6626184 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 6626096  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  6626095 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 6626047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26472339 - 26472202
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  26472339 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 26472251  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||    
T  26472250 gcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctt 26472202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30290070 - 30289929
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||           || ||||    
T  30290070 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatg-----------aatatgt 30289982  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  30289981 gcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccat 30289929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 51155749 - 51155608
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||           || ||||    
T  51155749 attacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg-----------aatatgt 51155661  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    | |||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  51155660 gtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat 51155608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13313332 - 13313249
Alignment:
Q  267 tacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata 350  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  13313332 tacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 410
Target Start/End: Original strand, 29770681 - 29770815
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  29770681 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 29770769  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  29770770 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 29770815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 4953063 - 4953200
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  4953063 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 4953151  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4953152 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 4953200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 32448659 - 32448740
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  32448659 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 42234851 - 42234932
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  42234851 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 42234932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 304 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772191
Alignment:
Q  304 aatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacc 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||| || ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  404 caccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||    
T  47772204 caccattcttccat 47772191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 2954862 - 2954962
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  2954862 ctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaa 2954961  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  2954962 a 2954962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 26685863 - 26685955
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  26685863 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 26685955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44544206 - 44544125
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  44544206 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24649886 - 24649802
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  24649886 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27924822 - 27924730
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  27924822 ctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 27924730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39475946 - 39475843
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||    
T  39475946 ctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgg-gtcaagatagtttatggataccacctaaaa 39475848  T
Q  361 atgtg 365  Q
    |||||    
T  39475847 atgtg 39475843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683402
Alignment:
Q  266 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 48683402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4243650 - 4243521
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||| |||           || ||||    
T  4243650 attacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-----------aatatgt 4243562  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattaccca 405  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  4243561 gcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattaccca 4243521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34752474 - 34752337
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||  | ||||| |||||||           || ||||    
T  34752474 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatg-----------aatatgt 34752386  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  34752385 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctt 34752337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13281722 - 13281641
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  13281722 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 13281641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 362
Target Start/End: Original strand, 33187347 - 33187448
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  33187347 ctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccacttaaaa 33187446  T
Q  361 at 362  Q
    ||    
T  33187447 at 33187448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 46428413 - 46428332
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  46428413 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 1388480 - 1388572
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  1388480 ctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 1388572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4156240 - 4156188
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156240 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 10920207 - 10920299
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  10920207 ctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 10920299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38716411 - 38716319
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  38716411 ctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 38716319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 39637907 - 39637996
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttc-atggatacca 353  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  39637907 ctagattacctatgaagaatggtgggtaatttaccc----accaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 338
Target Start/End: Original strand, 52323946 - 52324022
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  52323946 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagat 52324022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 343 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312553
Alignment:
Q  343 catggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttc 13312553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7561702 - 7561632
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaa 335  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  7561702 attacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaa 7561632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 417
Target Start/End: Original strand, 4156438 - 4156557
Alignment:
Q  305 atgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaaga-------tggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataa 397  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||       | ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  4156438 atgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 4156537  T
Q  398 attacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  4156538 attacccatcatttttccat 4156557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35991759 - 35991678
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  35991759 attacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 35991678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44293615 - 44293534
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  44293615 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44293534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 353
Target Start/End: Original strand, 52367893 - 52367982
Alignment:
Q  264 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  52367893 gattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 52367982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5961431 - 5961339
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  5961431 ctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 5961339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41895324 - 41895187
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||  |||||||| |||||||           || ||||    
T  41895324 attacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 41895236  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  41895235 gcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctt 41895187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 7561589 - 7561547
Alignment:
Q  375 ctaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7561589 ctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccat 7561547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 413
Target Start/End: Original strand, 24215865 - 24215911
Alignment:
Q  367 ttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24215865 ttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 24215911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10919358 - 10919313
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaat 306  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10919358 ctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 419
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359546
Alignment:
Q  375 ctaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccatag 419  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattattccatag 39359546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 48683389 - 48683349
Alignment:
Q  377 aatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48683389 aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccat 48683349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 93)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2341836 - 2341681
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  2341836 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaa 2341737  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2341736 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 2341681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 264 - 418
Target Start/End: Original strand, 33411271 - 33411425
Alignment:
Q  264 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33411271 gattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatg 33411370  T
Q  364 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 418  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411371 tgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccata 33411425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 25894088 - 25893936
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25894088 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 25893989  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25893988 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 25893936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33423450 - 33423294
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33423450 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33423351  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33423350 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 33423294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33839890 - 33839734
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33839890 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33839791  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33839790 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 33839734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 15877558 - 15877714
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15877558 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15877657  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877658 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 15877714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33695996 - 33695840
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33695996 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33695897  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33695896 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 33695840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 35355896 - 35356052
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  35355896 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 35355995  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35355996 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 35356052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49171537 - 49171381
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49171537 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 49171438  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  49171437 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 49171381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 261 - 418
Target Start/End: Original strand, 31586856 - 31587013
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31586856 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31586955  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31586956 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccata 31587013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 17855436 - 17855592
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  17855436 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 17855535  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17855536 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 17855592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22979822 - 22979670
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22979822 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 22979723  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    || |||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22979722 atatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 22979670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 23393226 - 23393070
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23393226 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23393127  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23393126 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 23393070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 27018124 - 27018280
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27018124 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27018223  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27018224 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 27018280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 45482666 - 45482822
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  45482666 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 45482765  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45482766 atatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 45482822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 45690268 - 45690116
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  45690268 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45690169  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45690168 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 45690116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 47067152 - 47067000
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47067152 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47067053  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  47067052 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 47067000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 47740506 - 47740350
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  47740506 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 47740407  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47740406 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 47740350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 46913117 - 46913275
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46913117 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 46913216  T
Q  361 a--tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |  |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46913217 atgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 46913275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 10028496 - 10028652
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  10028496 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 10028595  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  10028596 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccat 10028652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 20165989 - 20165833
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20165989 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 20165890  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  20165889 atgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccat 20165833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35328240 - 35328092
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35328240 attacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 35328141  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35328140 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 35328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 37846191 - 37846035
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || |||||||||| ||||||    
T  37846191 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccacttaaaa 37846092  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37846091 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 37846035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 40670571 - 40670727
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40670571 ctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40670670  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40670671 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 40670727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 274 - 417
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389520
Alignment:
Q  274 gaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtg 373  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  374 actaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 36389520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 41991032 - 41990877
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  41991032 tagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaa 41990933  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41990932 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccat 41990877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 270 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183844
Alignment:
Q  270 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgctta 369  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  370 tgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 5183844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 412
Target Start/End: Original strand, 33870253 - 33870404
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33870253 ctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccatttaaaa 33870352  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattct 412  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33870353 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct 33870404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 43499494 - 43499649
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43499494 tagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 43499593  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    | | |||||||| | ||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43499594 tatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccat 43499649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 45063530 - 45063380
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45063530 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45063431  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||| | ||||||| |||||||||||    
T  45063430 atgtgcttatgtggctaatgtgta--tgttgaggtaaattatccaccattctt 45063380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 31625712 - 31625867
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31625712 ctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 31625811  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  31625812 atgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccat 31625867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 48609852 - 48609696
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  48609852 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaa 48609753  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  48609752 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccat 48609696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 19563455 - 19563611
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  19563455 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 19563554  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  19563555 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccat 19563611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26579888 - 26579736
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  26579888 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 26579789  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    | ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26579788 gtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 26579736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 33332797 - 33332948
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33332797 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 33332895  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    || |||||||| | |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  33332896 atatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctt 33332948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 33720211 - 33720070
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33720211 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33720112  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattac 402  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  33720111 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 278 - 417
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447001
Alignment:
Q  278 aatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgacta 377  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  378 atgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  29446963 atgtgtattggtt-ggagtaattacccaccattcttccat 29447001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 265 - 410
Target Start/End: Original strand, 5712180 - 5712325
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5712180 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 5712279  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  5712280 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 5712325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 35757195 - 35757039
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  35757195 ctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 35757097  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt-gggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35757096 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccat 35757039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 10618306 - 10618455
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  10618306 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-------gatagttcatgaataccacttaaaa 10618398  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618399 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 10618455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 31429650 - 31429498
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  31429650 ctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccacttaaaa 31429551  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||||| || |||||||    
T  31429550 atgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctt 31429498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 35767489 - 35767638
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||       | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35767489 ctagattacctttgaagaatggtgggta-------ccccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 35767581  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| |||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35767582 atgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 35767638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 271 - 412
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564497
Alignment:
Q  271 tttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttat 370  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  371 gtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattct 412  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 299 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233959
Alignment:
Q  299 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaa 398  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  399 ttacccaccattctt 413  Q
     |||||||| |||||    
T  28233973 ctacccacctttctt 28233959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 305 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076546
Alignment:
Q  305 atgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattaccc 404  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||  ||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  405 accattcttccat 417  Q
    | |||||||||||    
T  30076558 atcattcttccat 30076546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35752194 - 35752057
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  35752194 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 35752106  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35752105 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 35752057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 320 - 418
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904370
Alignment:
Q  320 ttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 418  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccata 41904370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 46817581 - 46817444
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  46817581 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 46817493  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  46817492 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 46817444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 43489230 - 43489367
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  43489230 attacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 43489318  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  43489319 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 43489367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16482947 - 16482855
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16482947 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggatacca 16482855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26941692 - 26941555
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  26941692 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 26941604  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  26941603 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctt 26941555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 36817005 - 36816868
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  36817005 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 36816917  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  36816916 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctt 36816868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 37127949 - 37128086
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||           |||| ||||    
T  37127949 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgt 37128037  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  37128038 gcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 37128086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 45502980 - 45502835
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||           ||||||||||||||    
T  45502980 ctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaa-----------gataccatttaaaa 45502892  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||  ||||||| || |||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  45502891 atatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccat 45502835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 48085870 - 48086007
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  48085870 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 48085958  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  48085959 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 48086007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Original strand, 29863024 - 29863115
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  29863024 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggatacca 29863115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 32556766 - 32556640
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||| |||||||           || ||||    
T  32556766 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg-----------aatatgt 32556678  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattac 402  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32556677 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 498348 - 498211
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  498348 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 498260  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  498259 gcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctt 498211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7876488 - 7876351
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  7876488 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 7876400  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7876399 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 7876351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24923184 - 24923055
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||           || ||||    
T  24923184 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-----------aatatgt 24923096  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattaccca 405  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  24923095 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 24923055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 41855071 - 41855212
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||           |||| || |    
T  41855071 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca-----------taaatatat 41855159  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41855160 gcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccat 41855212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 46898176 - 46898035
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||||| |||           |||    
T  46898176 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgt 46898088  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46898087 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 46898035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 24228553 - 24228634
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  24228553 attacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 24228634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 25037668 - 25037587
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  25037668 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg 25037587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 345
Target Start/End: Original strand, 29098763 - 29098843
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 345  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  29098763 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 29098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 44003530 - 44003442
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44003530 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 44003442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 417
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405512
Alignment:
Q  317 aatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttcca 416  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  417 t 417  Q
    |    
T  44405512 t 44405512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 2332031 - 2332172
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  2332031 attatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 2332119  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||  || |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  2332120 gcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccat 2332172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 26371061 - 26371198
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  26371061 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 26371149  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  26371150 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctt 26371198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 29610647 - 29610728
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||    
T  29610647 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg 29610728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 39323628 - 39323709
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  39323628 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39323709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39453635 - 39453562
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  39453635 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 39453562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 39866677 - 39866758
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  39866677 attacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 47906919 - 47906838
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  47906919 attacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 47906838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 33393336 - 33393428
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  33393336 ctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 33393428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 405
Target Start/End: Original strand, 21718129 - 21718258
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  21718129 attacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 21718217  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattaccca 405  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  21718218 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 21718258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 44659856 - 44659936
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  44659856 attacctttgaagaatggtg-gtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 44659936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 7257389 - 7257481
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  7257389 ctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 7257481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15644110 - 15644018
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  15644110 ctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatacca 15644018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Original strand, 35557739 - 35557798
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 321  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557739 tagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47460935 - 47460844
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  47460935 tagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 47460844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30077100 - 30077043
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaa 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30077100 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 33455108 - 33455189
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  33455108 attacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 33455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 35484648 - 35484730
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  35484648 attatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 35484730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 45237693 - 45237556
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||  ||||||           || ||||    
T  45237693 attacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatg-----------aatatgt 45237605  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  45237604 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctt 45237556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 46103133 - 46103213
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  46103133 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 46103213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448508
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||  |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  365 g 365  Q
    |    
T  38448508 g 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 35823302 - 35823353
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagc 316  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35823302 attaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7720664 - 7720575
Alignment:
Q  264 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| | | | | || ||||| ||||||||||||||    
T  7720664 gattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggatacca 7720575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 39453557 - 39453505
Alignment:
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39453557 atgtgtttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctt 39453505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443674
Alignment:
Q  293 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagatacca 37443674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 351
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456207
Alignment:
Q  301 accaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatac 351  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatac 26456207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21649542 - 21649450
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaa-tggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||  |  |||||||||||||||||||||| || || || | ||||| ||| ||||||||||    
T  21649542 tagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttattagtagatttaagatagtttatggatacca 21649450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 108)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 40131134 - 40130974
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40131134 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40131035  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40131034 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 40130974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 41464359 - 41464515
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41464359 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41464458  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  41464459 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccat 41464515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 47257800 - 47257956
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  47257800 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 47257899  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47257900 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 47257956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 7855289 - 7855133
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  7855289 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccacttaaaa 7855190  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7855189 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 7855133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 51170207 - 51170052
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  51170207 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 51170108  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51170107 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 51170052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29626002 - 29625849
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29626002 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 29625903  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    || ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29625902 atatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 29625849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27067153 - 27066997
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  27067153 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 27067054  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27067053 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccat 27066997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 38416899 - 38416743
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38416899 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 38416800  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38416799 atgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 38416743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 42291849 - 42292009
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||    
T  42291849 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttgaaa 42291948  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42291949 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 42292009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 43125838 - 43125990
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43125838 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43125937  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43125938 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 43125990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43612222 - 43612066
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43612222 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43612123  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43612122 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 43612066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 49330044 - 49330200
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49330044 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 49330143  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  49330144 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccat 49330200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 52628961 - 52629117
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52628961 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 52629060  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  52629061 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 52629117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 47809768 - 47809615
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  47809768 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47809669  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggtt-gggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47809668 gtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccat 47809615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Original strand, 52215083 - 52215236
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52215083 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 52215182  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  52215183 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttc 52215236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 18946910 - 18947066
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18946910 ctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagttaaaa 18947009  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18947010 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccat 18947066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 20754564 - 20754412
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  20754564 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatat 20754465  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20754464 gtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccat 20754412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 22399104 - 22399259
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||    
T  22399104 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccactt-aaa 22399202  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22399203 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 22399259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 24100290 - 24100445
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  24100290 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 24100388  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24100389 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 24100445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28048563 - 28048411
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28048563 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 28048464  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||    
T  28048463 gcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccat 28048411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 40643811 - 40643963
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  40643811 attatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcatttaaaaatgt 40643910  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40643911 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 40643963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 43183919 - 43184079
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43183919 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaaaa 43184018  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43184019 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggt 43184079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 55453419 - 55453259
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  55453419 ctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 55453320  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  55453319 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggt 55453259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 35748485 - 35748330
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35748485 tagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 35748386  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35748385 tatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccat 35748330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 2666007 - 2666159
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2666007 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2666106  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||    
T  2666107 ctgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctt 2666159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32234572 - 32234417
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  32234572 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 32234474  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  32234473 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccat 32234417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 37313406 - 37313562
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  37313406 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 37313505  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37313506 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 37313562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 40419842 - 40419994
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40419842 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40419941  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  40419942 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctt 40419994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 277 - 417
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126150
Alignment:
Q  277 gaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgact 376  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  377 aatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 46126150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 48739408 - 48739252
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48739408 ctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaa 48739309  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48739308 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 48739252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 51452925 - 51452769
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  51452925 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 51452826  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  51452825 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat 51452769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 263 - 417
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609886
Alignment:
Q  263 agattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 362  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  363 gtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 48609886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 51102553 - 51102399
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  51102553 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 51102454  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttcc 415  Q
    ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51102453 atgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttcc 51102399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 261 - 410
Target Start/End: Original strand, 39053401 - 39053550
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39053401 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39053500  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  39053501 atgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatt 39053550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 37324552 - 37324704
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  37324552 attacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatat 37324651  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37324652 atttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 37324704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39634746 - 39634591
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  39634746 ctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccacttaaaa 39634648  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39634647 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccat 39634591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 421
Target Start/End: Original strand, 43021722 - 43021882
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-ggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  43021722 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 43021821  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43021822 atgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggt 43021882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 44806691 - 44806843
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44806691 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaa 44806790  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   ||||||| |||| ||||||    
T  44806791 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctt 44806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 46134363 - 46134515
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46134363 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 46134462  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||    
T  46134463 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctt 46134515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 53832659 - 53832503
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  53832659 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaattaaaa 53832560  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    | | ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  53832559 aggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 53832503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 53943762 - 53943606
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53943762 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 53943663  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || | |||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53943662 atatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 53943606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 35594129 - 35594284
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  35594129 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 35594228  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    | |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35594229 tatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccat 35594284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 411
Target Start/End: Original strand, 24376580 - 24376730
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24376580 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 24376679  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattc 411  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  24376680 atgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 7755481 - 7755326
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||    
T  7755481 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccactt-aaa 7755383  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7755382 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccat 7755326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40804685 - 40804529
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40804685 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 40804586  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  40804585 atgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccat 40804529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 44222840 - 44222992
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  44222840 attacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccacttaaaaatgt 44222939  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44222940 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 44222992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 422
Target Start/End: Original strand, 36368946 - 36369106
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36368946 ctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 36369045  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggtg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36369046 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgggtg 36369106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41293493 - 41293341
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||| || |||    
T  41293493 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccactt-aaa 41293395  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41293394 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttc 41293341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 41216462 - 41216622
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  41216462 ctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccacttaaaa 41216561  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41216562 atgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggt 41216622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 41732535 - 41732691
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41732535 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41732634  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41732635 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccat 41732691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5560207 - 5560044
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaat-----gagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  5560207 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccact 5560108  T
Q  356 taaaaatgtgcttatgtgac--taatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5560107 taaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccat 5560044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 46949382 - 46949536
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46949382 ctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 46949480  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46949481 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccat 46949536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 47894994 - 47894839
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47894994 tagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 47894895  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| | ||||| | |||||||||||||||    
T  47894894 tgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccat 47894839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 403
Target Start/End: Original strand, 53637848 - 53637990
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  53637848 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccacttaaaa 53637947  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacc 403  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||    
T  53637948 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 410
Target Start/End: Original strand, 52638849 - 52638998
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  52638849 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccacttaaaa 52638948  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 410  Q
    |||||||| |||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  52638949 atgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccatt 52638998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54159163 - 54159051
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54159163 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccacttaaaa 54159064  T
Q  361 atgtgcttatgtg 373  Q
    |||||||||||||    
T  54159063 atgtgcttatgtg 54159051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 51146390 - 51146238
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51146390 ctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 51146291  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    || |||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  51146290 atttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctt 51146238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 37758936 - 37759075
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  37758936 ctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccacttaaaa 37759035  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  37759036 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48547004 - 48546894
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  48547004 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaa-atagttcatggataccacttaaaa 48546907  T
Q  361 atgtgcttatgtg 373  Q
    |||||||||||||    
T  48546906 atgtgcttatgtg 48546894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 25641657 - 25641794
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||           |||| ||||    
T  25641657 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgt 25641745  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25641746 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 25641794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34279881 - 34279744
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  34279881 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 34279793  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34279792 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 34279744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 42589841 - 42589978
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  42589841 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 42589929  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42589930 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 42589978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 54401198 - 54401335
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  54401198 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 54401286  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  54401287 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 54401335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 54707380 - 54707243
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  54707380 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 54707292  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  54707291 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 54707243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 39141286 - 39141147
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||         | ||||    
T  39141286 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat---------atatgt 39141196  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  39141195 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctt 39141147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41882155 - 41882055
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  41882155 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaa 41882056  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  41882055 a 41882055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 53115454 - 53115554
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  53115454 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 53115553  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  53115554 a 53115554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 265 - 414
Target Start/End: Original strand, 49130589 - 49130727
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||           || ||||    
T  49130589 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 49130677  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49130678 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 49130727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 314 - 417
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864652
Alignment:
Q  314 agcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgag-taaattacccaccattctt 52864648  T
Q  414 ccat 417  Q
    ||||    
T  52864649 ccat 52864652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 37028734 - 37028871
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||           || ||||    
T  37028734 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatg-----------aatatgt 37028822  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37028823 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 37028871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 38156792 - 38156655
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  38156792 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 38156704  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  38156703 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 38156655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 51415980 - 51416117
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||           ||||    
T  51415980 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat-----------atgt 51416068  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  51416069 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctt 51416117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21597312 - 21597220
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  21597312 ctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 21597220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 321 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550486
Alignment:
Q  321 tgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 33550486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48726158 - 48726062
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  48726158 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggataccatctaaaaa 48726062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 55379992 - 55380084
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  55379992 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 55380084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 31286953 - 31286816
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  31286953 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 31286865  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| || |||||||    
T  31286864 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctt 31286816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41635960 - 41635823
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  41635960 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 41635872  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||    
T  41635871 gcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctt 41635823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 50732077 - 50731979
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  50732077 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaa 50731979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 360
Target Start/End: Original strand, 50780779 - 50780877
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  50780779 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaa 50780877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 55000338 - 55000201
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||||| |||||||           || ||||    
T  55000338 attaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 55000250  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  55000249 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 55000201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17665684 - 17665603
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  17665684 attacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 17665603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 45058894 - 45058975
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  45058894 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 45058975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 303 - 384
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182130
Alignment:
Q  303 caatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgta 47182130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 47511100 - 47511019
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  47511100 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 47511019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 25353561 - 25353653
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  25353561 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 25353653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28576276 - 28576176
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  28576276 ctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaa 28576177  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  28576176 a 28576176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Original strand, 51143825 - 51143916
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  51143825 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggatacca 51143916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402810
Alignment:
Q  263 agattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 362  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T
Q  363 gtg 365  Q
    |||    
T  47402812 gtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 51224197 - 51224061
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  51224197 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 51224110  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51224109 gcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattctt 51224061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30251665 - 30251573
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  30251665 ctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 30251573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42998952 - 42998861
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  42998952 ctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 42998861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 24688125 - 24688262
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  24688125 attacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 24688213  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  24688214 gtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctt 24688262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 40022085 - 40022222
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  40022085 attacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 40022173  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  40022174 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctt 40022222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44946089 - 44946016
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  44946089 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 44946016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2228099 - 2227995
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||| || || |||    
T  2228099 ctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcacttcaaa 2228000  T
Q  361 atgtg 365  Q
    |||||    
T  2227999 atgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 43176902 - 43176810
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  43176902 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggatacca 43176810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 329
Target Start/End: Original strand, 48752093 - 48752160
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  48752093 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtgg 48752160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 329
Target Start/End: Original strand, 52434146 - 52434215
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg 329  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  52434146 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgg 52434215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429242
Alignment:
Q  349 taccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 421  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggt 30429242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Original strand, 40165683 - 40165750
Alignment:
Q  286 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40165683 gtaatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 40165750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 365
Target Start/End: Original strand, 41609099 - 41609178
Alignment:
Q  286 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 365  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||| |  ||||||||||    
T  41609099 gtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg 41609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8847818 - 8847718
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||  |||| || ||||| | |||||| ||||||||||    
T  8847818 attacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccacttaaaaatgt 8847719  T
Q  365 g 365  Q
    |    
T  8847718 g 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 306
Target Start/End: Original strand, 37741443 - 37741487
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaat 306  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37741443 tagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 351
Target Start/End: Original strand, 177169 - 177258
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatac 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||| |||||||  |||||||  || ||||||||    
T  177169 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatac 177258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 52756207 - 52756150
Alignment:
Q  289 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  52756207 atttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 52756150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 48534082 - 48534030
Alignment:
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  48534082 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctt 48534030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 51942580 - 51942543
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51942580 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccac 51942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39731 - 39575
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39731 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39632  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39631 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 39575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 13937 - 13781
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13937 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 13838  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13837 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 13781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Original strand, 1876 - 2032
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1876 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 1975  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1976 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 2032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11307 - 11152
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11307 ctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 11209  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11208 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 11152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 75419 - 75263
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  75419 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccacttaaaa 75320  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  75319 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccat 75263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 278014 - 278171
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata--ccatttaaa 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||    
T  278014 tagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccccacttaaa 278113  T
Q  360 aatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278114 aatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 278171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176814
Alignment:
Q  266 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  366 cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 176814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19029 - 18873
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  19029 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaa 18930  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  18929 atgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccat 18873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2451
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2607 ctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2508  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  2507 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccat 2451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 408
Target Start/End: Original strand, 32568 - 32715
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32568 ctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccatttaaaa 32667  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccacca 408  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32668 atgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 296 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4736 - 4615
Alignment:
Q  296 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggat 395  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  4736 caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggat 4637  T
Q  396 aaattacccaccattcttccat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4636 aaattacccaccattcttccat 4615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Original strand, 3095 - 3239
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3095 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcacttaaaa 3185  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3186 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttc 3239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 109 - 201
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  109 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaatacca 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 7101 - 7239
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 363  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || |||    
T  7101 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatg 7189  T
Q  364 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 413  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7190 tgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 7239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4719 - 4618
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaa 359  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4719 ctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaa 4620  T
Q  360 aa 361  Q
    ||    
T  4619 aa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 3399 - 3500
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaa 359  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3399 ctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaa 3498  T
Q  360 aa 361  Q
    ||    
T  3499 aa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 14751 - 14843
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  14751 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 14843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20641 - 20549
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  20641 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 20549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 335
Target Start/End: Original strand, 17917 - 17987
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaa 335  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||    
T  17917 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaa 17987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19301
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagat 19301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University