View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1399_low_13 (Length: 450)

Name: NF1399_low_13
Description: NF1399
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1399_low_13
NF1399_low_13
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (13-252)||(37260164-37260418)
chr8 (262-418)||(32984096-32984252)
chr8 (263-414)||(24079924-24080075)
chr8 (262-418)||(2714556-2714712)
chr8 (262-422)||(5946054-5946214)
chr8 (262-414)||(6365993-6366145)
chr8 (262-422)||(25185906-25186066)
chr8 (262-418)||(32114256-32114412)
chr8 (262-422)||(37419947-37420107)
chr8 (262-418)||(40435172-40435328)
chr8 (262-418)||(41862227-41862383)
chr8 (262-418)||(43328714-43328870)
chr8 (263-422)||(33981678-33981837)
chr8 (262-411)||(37956428-37956577)
chr8 (262-418)||(9734262-9734416)
chr8 (262-418)||(10646130-10646286)
chr8 (262-418)||(31830974-31831130)
chr8 (262-418)||(33730660-33730816)
chr8 (262-418)||(44088462-44088618)
chr8 (263-418)||(9303593-9303748)
chr8 (264-423)||(13760662-13760821)
chr8 (262-418)||(9013691-9013846)
chr8 (262-418)||(17718741-17718897)
chr8 (263-415)||(35628785-35628937)
chr8 (262-418)||(41231953-41232109)
chr8 (262-414)||(45236588-45236740)
chr8 (263-418)||(45258518-45258673)
chr8 (262-414)||(29048426-29048578)
chr8 (262-414)||(37301348-37301500)
chr8 (262-414)||(41653902-41654054)
chr8 (263-418)||(13356139-13356294)
chr8 (263-420)||(41639922-41640079)
chr8 (262-418)||(2275920-2276075)
chr8 (263-418)||(45066611-45066766)
chr8 (262-415)||(22878398-22878551)
chr8 (262-418)||(42701308-42701465)
chr8 (262-418)||(25248046-25248196)
chr8 (311-418)||(12032986-12033093)
chr8 (304-418)||(3904126-3904239)
chr8 (321-418)||(41981534-41981631)
chr8 (266-362)||(39915887-39915983)
chr8 (266-418)||(4447314-4447455)
chr8 (266-414)||(31940326-31940462)
chr8 (266-418)||(10378320-10378461)
chr8 (266-418)||(32373746-32373886)
chr8 (266-414)||(40458795-40458932)
chr8 (266-414)||(41843264-41843401)
chr8 (276-354)||(41981454-41981532)
chr8 (266-347)||(117408-117489)
chr8 (266-414)||(2379151-2379288)
chr8 (266-418)||(3211217-3211357)
chr8 (266-347)||(4975486-4975567)
chr8 (266-347)||(27243218-27243299)
chr8 (266-347)||(27254793-27254874)
chr8 (266-411)||(33622492-33622625)
chr8 (324-418)||(31336163-31336257)
chr8 (266-414)||(9713700-9713834)
chr8 (262-354)||(33896915-33897006)
chr8 (266-339)||(3490486-3490559)
chr8 (266-347)||(9509479-9509560)
chr8 (266-415)||(38631663-38631801)
chr8 (262-364)||(31148953-31149054)
chr8 (263-354)||(26196389-26196479)
chr8 (267-414)||(40649854-40649990)
chr8 (262-334)||(164729-164800)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (262-422)||(15398497-15398657)
chr5 (262-418)||(24253389-24253545)
chr5 (262-415)||(739726-739879)
chr5 (262-418)||(43326398-43326554)
chr5 (262-415)||(18479690-18479843)
chr5 (266-418)||(35626049-35626201)
chr5 (263-418)||(39932587-39932742)
chr5 (262-419)||(15683798-15683955)
chr5 (262-414)||(3466704-3466856)
chr5 (262-418)||(5184979-5185135)
chr5 (262-418)||(6901806-6901962)
chr5 (262-418)||(7722056-7722212)
chr5 (262-418)||(27938904-27939060)
chr5 (266-418)||(31938908-31939060)
chr5 (262-418)||(40886047-40886202)
chr5 (262-422)||(27278488-27278652)
chr5 (262-418)||(12648804-12648960)
chr5 (262-414)||(25831528-25831679)
chr5 (262-418)||(13504761-13504917)
chr5 (266-418)||(40278877-40279029)
chr5 (266-418)||(43262202-43262354)
chr5 (263-418)||(27501074-27501229)
chr5 (262-418)||(2484311-2484467)
chr5 (263-416)||(38756509-38756662)
chr5 (262-418)||(5137722-5137878)
chr5 (292-418)||(29789314-29789440)
chr5 (262-418)||(28424814-28424968)
chr5 (262-418)||(890913-891068)
chr5 (266-418)||(40110245-40110396)
chr5 (266-419)||(4149705-4149848)
chr5 (297-418)||(34451292-34451413)
chr5 (262-414)||(763730-763882)
chr5 (262-353)||(40632506-40632597)
chr5 (266-418)||(33617596-33617737)
chr5 (266-414)||(6973074-6973211)
chr5 (266-414)||(9424615-9424752)
chr5 (266-414)||(38015537-38015674)
chr5 (266-414)||(42658685-42658822)
chr5 (262-362)||(2585469-2585569)
chr5 (262-366)||(12558090-12558193)
chr5 (266-414)||(5497284-5497421)
chr5 (266-414)||(13957681-13957818)
chr5 (266-414)||(14971989-14972126)
chr5 (266-414)||(19295741-19295878)
chr5 (266-414)||(27503390-27503527)
chr5 (262-414)||(31294012-31294164)
chr5 (266-414)||(23195271-23195408)
chr5 (266-414)||(36365468-36365605)
chr5 (266-363)||(5120036-5120132)
chr5 (262-362)||(36472347-36472448)
chr5 (266-339)||(42247869-42247942)
chr5 (266-414)||(9374525-9374662)
chr5 (262-354)||(18327245-18327337)
chr5 (262-354)||(38637982-38638074)
chr5 (266-419)||(6206895-6207037)
chr5 (263-322)||(9527124-9527183)
chr5 (263-354)||(27390605-27390696)
chr5 (289-414)||(38492647-38492761)
chr5 (266-339)||(9171112-9171185)
chr5 (262-354)||(1402577-1402669)
chr5 (262-354)||(24167856-24167948)
chr5 (262-362)||(40686906-40687006)
chr5 (282-414)||(3656591-3656712)
chr5 (288-414)||(36948513-36948626)
chr5 (266-337)||(15300962-15301033)
chr5 (279-339)||(3940418-3940478)
chr5 (266-322)||(33624043-33624099)
chr5 (288-362)||(20207080-20207154)
chr5 (262-315)||(28756085-28756138)
chr5 (362-411)||(33623965-33624014)
chr5 (378-422)||(40687010-40687054)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (262-418)||(2324908-2325064)
chr2 (262-418)||(746472-746628)
chr2 (262-418)||(11184978-11185134)
chr2 (262-414)||(13815241-13815393)
chr2 (262-418)||(23901785-23901941)
chr2 (262-418)||(38997107-38997263)
chr2 (263-422)||(10244597-10244756)
chr2 (262-418)||(4034598-4034754)
chr2 (262-418)||(6430479-6430635)
chr2 (262-418)||(6594477-6594633)
chr2 (262-418)||(14660452-14660608)
chr2 (262-418)||(17600842-17600998)
chr2 (262-418)||(45370996-45371152)
chr2 (263-418)||(34518374-34518529)
chr2 (262-418)||(5726135-5726291)
chr2 (262-418)||(10424601-10424757)
chr2 (262-414)||(26710351-26710503)
chr2 (262-418)||(27651053-27651209)
chr2 (266-414)||(40635228-40635376)
chr2 (263-418)||(2914157-2914312)
chr2 (262-414)||(27400409-27400561)
chr2 (262-422)||(32327367-32327527)
chr2 (262-420)||(7892705-7892863)
chr2 (262-411)||(32608386-32608535)
chr2 (262-415)||(32948452-32948604)
chr2 (262-418)||(27024421-27024577)
chr2 (263-418)||(37620886-37621044)
chr2 (263-418)||(1091970-1092125)
chr2 (263-418)||(4609633-4609788)
chr2 (262-414)||(33427670-33427822)
chr2 (265-410)||(12842112-12842257)
chr2 (262-415)||(37255359-37255507)
chr2 (263-415)||(14697559-14697711)
chr2 (270-422)||(32856451-32856603)
chr2 (262-418)||(40735470-40735626)
chr2 (262-411)||(40037149-40037298)
chr2 (262-411)||(9444689-9444845)
chr2 (265-415)||(11159631-11159780)
chr2 (262-420)||(15925086-15925244)
chr2 (262-411)||(8432942-8433091)
chr2 (262-380)||(42899921-42900039)
chr2 (307-418)||(25294886-25294997)
chr2 (266-403)||(41172468-41172605)
chr2 (304-418)||(1229675-1229789)
chr2 (266-414)||(35158073-35158210)
chr2 (266-414)||(145292-145429)
chr2 (266-418)||(39103057-39103198)
chr2 (262-335)||(12814620-12814693)
chr2 (266-412)||(4258500-4258634)
chr2 (332-418)||(447652-447738)
chr2 (266-414)||(12333519-12333655)
chr2 (266-418)||(21734919-21735060)
chr2 (266-414)||(39301220-39301357)
chr2 (266-347)||(28641371-28641452)
chr2 (262-420)||(35126786-35126933)
chr2 (262-354)||(44481834-44481926)
chr2 (266-414)||(12730071-12730208)
chr2 (270-414)||(19428449-19428582)
chr2 (266-414)||(29687051-29687188)
chr2 (266-414)||(34249275-34249412)
chr2 (266-347)||(8056636-8056717)
chr2 (266-414)||(13543647-13543784)
chr2 (266-414)||(27331308-27331449)
chr2 (266-402)||(27764897-27765022)
chr2 (266-414)||(43898994-43899130)
chr2 (266-347)||(3266306-3266387)
chr2 (266-347)||(40544155-40544236)
chr2 (335-423)||(12827142-12827229)
chr2 (266-414)||(28566721-28566858)
chr2 (266-322)||(2000441-2000497)
chr2 (327-399)||(28014856-28014928)
chr2 (266-347)||(43356109-43356187)
chr2 (263-363)||(30545828-30545928)
chr2 (263-354)||(38985350-38985439)
chr2 (266-414)||(2688752-2688889)
chr2 (286-414)||(3711663-3711780)
chr2 (262-299)||(28019959-28019996)
chr2 (262-322)||(10176565-10176625)
chr2 (382-418)||(42900781-42900817)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (262-418)||(5882513-5882669)
chr6 (262-418)||(7393605-7393761)
chr6 (262-418)||(14891398-14891554)
chr6 (263-418)||(34527881-34528036)
chr6 (262-415)||(2892195-2892348)
chr6 (262-422)||(2593867-2594027)
chr6 (262-418)||(7345131-7345287)
chr6 (262-418)||(18101514-18101670)
chr6 (262-418)||(22551080-22551236)
chr6 (262-418)||(24168098-24168254)
chr6 (266-418)||(26377223-26377375)
chr6 (262-414)||(599899-600051)
chr6 (262-418)||(1970718-1970874)
chr6 (262-418)||(8615247-8615403)
chr6 (268-418)||(11988993-11989143)
chr6 (262-418)||(16703373-16703529)
chr6 (268-418)||(22341807-22341959)
chr6 (262-414)||(959927-960079)
chr6 (262-422)||(19281070-19281230)
chr6 (262-418)||(19415552-19415708)
chr6 (262-418)||(28947094-28947250)
chr6 (262-414)||(30743471-30743623)
chr6 (267-414)||(24224093-24224240)
chr6 (262-415)||(10507930-10508083)
chr6 (262-418)||(5294820-5294976)
chr6 (262-418)||(5299372-5299528)
chr6 (262-418)||(33452591-33452747)
chr6 (262-384)||(30467656-30467778)
chr6 (287-422)||(23261944-23262079)
chr6 (266-414)||(13329392-13329529)
chr6 (266-414)||(28948868-28949005)
chr6 (262-337)||(929666-929741)
chr6 (262-354)||(7167589-7167681)
chr6 (266-414)||(15965444-15965581)
chr6 (274-414)||(4487546-4487675)
chr6 (266-346)||(3291019-3291099)
chr6 (266-422)||(1398564-1398709)
chr6 (266-351)||(1939579-1939664)
chr6 (266-414)||(3786760-3786897)
chr6 (266-346)||(13844847-13844927)
chr6 (362-414)||(18661830-18661882)
chr6 (262-311)||(11743070-11743119)
chr6 (362-414)||(24913119-24913171)
[»] chr4 (120 HSPs)
chr4 (262-418)||(51363014-51363170)
chr4 (262-418)||(21366628-21366784)
chr4 (266-418)||(34276558-34276710)
chr4 (266-418)||(44984772-44984924)
chr4 (262-418)||(53854448-53854604)
chr4 (263-418)||(397410-397565)
chr4 (263-418)||(9798473-9798628)
chr4 (262-418)||(237484-237640)
chr4 (262-418)||(2826700-2826856)
chr4 (262-418)||(6019935-6020091)
chr4 (262-418)||(23437599-23437755)
chr4 (262-418)||(27373083-27373239)
chr4 (262-418)||(42085214-42085370)
chr4 (262-414)||(55056282-55056434)
chr4 (263-422)||(45797487-45797646)
chr4 (262-418)||(49881078-49881238)
chr4 (262-415)||(146451-146604)
chr4 (266-418)||(6285318-6285470)
chr4 (262-422)||(29478367-29478527)
chr4 (262-418)||(32366679-32366835)
chr4 (262-418)||(41702478-41702634)
chr4 (263-419)||(55776053-55776208)
chr4 (263-419)||(55840231-55840386)
chr4 (262-422)||(41949389-41949551)
chr4 (262-415)||(18462035-18462188)
chr4 (262-418)||(3170633-3170789)
chr4 (262-418)||(22618533-22618687)
chr4 (262-418)||(31070093-31070248)
chr4 (262-418)||(31532154-31532310)
chr4 (262-418)||(39077552-39077708)
chr4 (262-418)||(42765861-42766016)
chr4 (262-418)||(43471714-43471870)
chr4 (266-414)||(53461839-53461987)
chr4 (262-418)||(54574959-54575115)
chr4 (263-418)||(42033183-42033338)
chr4 (262-414)||(407761-407911)
chr4 (262-418)||(19387707-19387863)
chr4 (266-418)||(26091277-26091429)
chr4 (262-418)||(29777276-29777432)
chr4 (262-414)||(31972359-31972511)
chr4 (266-418)||(41560339-41560491)
chr4 (262-418)||(47344663-47344819)
chr4 (262-418)||(54424989-54425145)
chr4 (262-418)||(54607969-54608125)
chr4 (263-422)||(33897510-33897669)
chr4 (263-418)||(50534639-50534794)
chr4 (262-418)||(39587798-39587954)
chr4 (262-414)||(42222298-42222450)
chr4 (263-418)||(31914206-31914360)
chr4 (262-418)||(38591675-38591827)
chr4 (262-415)||(50234007-50234160)
chr4 (262-418)||(22468789-22468945)
chr4 (262-418)||(23609094-23609250)
chr4 (263-418)||(48657832-48657981)
chr4 (262-418)||(50457829-50457985)
chr4 (263-415)||(50536646-50536798)
chr4 (262-418)||(53834073-53834229)
chr4 (262-418)||(55519834-55519990)
chr4 (262-415)||(2243465-2243618)
chr4 (262-415)||(47662124-47662277)
chr4 (262-411)||(56023024-56023173)
chr4 (262-418)||(3692229-3692385)
chr4 (262-418)||(35446513-35446668)
chr4 (262-418)||(48259530-48259685)
chr4 (262-418)||(54086417-54086571)
chr4 (262-411)||(1932770-1932919)
chr4 (262-414)||(41632030-41632181)
chr4 (262-418)||(48313564-48313718)
chr4 (262-418)||(51951689-51951844)
chr4 (295-418)||(52728325-52728448)
chr4 (263-418)||(48654822-48654983)
chr4 (262-418)||(14017395-14017549)
chr4 (262-418)||(54805633-54805793)
chr4 (311-418)||(36532849-36532956)
chr4 (266-418)||(43890939-43891080)
chr4 (266-414)||(5117461-5117598)
chr4 (266-414)||(45633802-45633939)
chr4 (266-418)||(54216755-54216896)
chr4 (310-418)||(42509351-42509459)
chr4 (266-418)||(9997950-9998091)
chr4 (266-414)||(15060312-15060449)
chr4 (266-414)||(20351865-20352002)
chr4 (266-414)||(46708764-46708901)
chr4 (341-422)||(35595773-35595854)
chr4 (266-415)||(47811917-47812055)
chr4 (266-414)||(37239113-37239250)
chr4 (266-418)||(54715046-54715187)
chr4 (262-339)||(42557589-42557666)
chr4 (266-420)||(4486598-4486741)
chr4 (262-354)||(14335173-14335265)
chr4 (262-354)||(27580126-27580218)
chr4 (262-362)||(34835184-34835284)
chr4 (262-365)||(27398664-27398767)
chr4 (263-354)||(38547673-38547764)
chr4 (266-414)||(22620604-22620741)
chr4 (266-414)||(34552330-34552467)
chr4 (266-347)||(31881393-31881474)
chr4 (262-354)||(1662331-1662423)
chr4 (262-361)||(49057933-49058032)
chr4 (303-393)||(52396774-52396865)
chr4 (266-414)||(27873571-27873708)
chr4 (269-347)||(49014112-49014190)
chr4 (278-414)||(52461386-52461511)
chr4 (266-347)||(3293102-3293183)
chr4 (266-347)||(11972208-11972289)
chr4 (262-355)||(43231510-43231602)
chr4 (266-347)||(54216324-54216405)
chr4 (262-354)||(46720032-46720124)
chr4 (335-422)||(35344868-35344954)
chr4 (266-414)||(33289714-33289851)
chr4 (266-414)||(52688360-52688497)
chr4 (262-339)||(6371336-6371413)
chr4 (262-354)||(573810-573902)
chr4 (364-418)||(33048990-33049044)
chr4 (266-347)||(33558021-33558102)
chr4 (262-306)||(17555617-17555661)
chr4 (360-418)||(48259722-48259780)
chr4 (288-354)||(27872612-27872678)
chr4 (266-339)||(18206609-18206682)
chr4 (362-414)||(51981502-51981554)
[»] chr1 (106 HSPs)
chr1 (262-422)||(21139427-21139587)
chr1 (262-418)||(31308008-31308164)
chr1 (262-418)||(43251718-43251874)
chr1 (262-418)||(45538160-45538316)
chr1 (266-418)||(3611147-3611299)
chr1 (262-418)||(4068702-4068858)
chr1 (262-418)||(17994970-17995126)
chr1 (262-418)||(24245044-24245200)
chr1 (262-418)||(44661977-44662133)
chr1 (263-418)||(25678278-25678433)
chr1 (262-418)||(6327567-6327722)
chr1 (262-418)||(26085417-26085572)
chr1 (262-418)||(26277184-26277340)
chr1 (262-418)||(38790216-38790372)
chr1 (262-418)||(5981177-5981333)
chr1 (262-418)||(25058695-25058851)
chr1 (262-414)||(33112840-33112992)
chr1 (262-418)||(33884095-33884251)
chr1 (262-418)||(33960001-33960157)
chr1 (262-418)||(39646575-39646731)
chr1 (266-418)||(50774228-50774380)
chr1 (263-418)||(37620211-37620366)
chr1 (266-415)||(36003141-36003290)
chr1 (262-422)||(5980075-5980235)
chr1 (262-418)||(23984762-23984918)
chr1 (262-418)||(31040716-31040872)
chr1 (262-418)||(38331878-38332034)
chr1 (262-418)||(41999822-41999978)
chr1 (262-418)||(46784430-46784586)
chr1 (266-414)||(47383755-47383903)
chr1 (262-418)||(49253994-49254150)
chr1 (265-418)||(23932528-23932681)
chr1 (262-394)||(23220972-23221104)
chr1 (262-418)||(24885508-24885664)
chr1 (266-418)||(26794315-26794467)
chr1 (262-418)||(42863872-42864028)
chr1 (262-414)||(46967064-46967216)
chr1 (262-418)||(47671593-47671749)
chr1 (262-409)||(31844383-31844530)
chr1 (262-418)||(35692682-35692839)
chr1 (262-418)||(26524908-26525064)
chr1 (262-418)||(28888588-28888744)
chr1 (262-418)||(36566337-36566493)
chr1 (262-418)||(46616556-46616712)
chr1 (266-415)||(47317326-47317475)
chr1 (262-418)||(3285409-3285564)
chr1 (262-414)||(47187112-47187264)
chr1 (262-418)||(49399007-49399163)
chr1 (262-393)||(25518821-25518952)
chr1 (266-418)||(35273607-35273759)
chr1 (266-418)||(51057082-51057234)
chr1 (262-418)||(48373511-48373658)
chr1 (262-418)||(42313380-42313540)
chr1 (262-418)||(51403036-51403182)
chr1 (262-418)||(27983622-27983762)
chr1 (290-418)||(2450529-2450657)
chr1 (262-374)||(31979998-31980110)
chr1 (262-414)||(45475866-45476009)
chr1 (296-415)||(51045618-51045737)
chr1 (309-418)||(4808699-4808808)
chr1 (266-414)||(2657314-2657451)
chr1 (266-418)||(10928078-10928219)
chr1 (266-414)||(41467655-41467792)
chr1 (262-374)||(2556909-2557021)
chr1 (266-418)||(33073222-33073363)
chr1 (266-414)||(6626047-6626184)
chr1 (266-414)||(26472202-26472339)
chr1 (266-418)||(30289929-30290070)
chr1 (266-418)||(51155608-51155749)
chr1 (268-351)||(13313249-13313332)
chr1 (266-411)||(29770681-29770815)
chr1 (266-414)||(4953063-4953200)
chr1 (266-347)||(32448659-32448740)
chr1 (266-347)||(42234851-42234932)
chr1 (305-418)||(47772191-47772304)
chr1 (262-362)||(2954862-2954962)
chr1 (262-354)||(26685863-26685955)
chr1 (266-347)||(44544125-44544206)
chr1 (262-346)||(24649802-24649886)
chr1 (262-354)||(27924730-27924822)
chr1 (262-366)||(39475843-39475946)
chr1 (267-354)||(48683402-48683489)
chr1 (266-406)||(4243521-4243650)
chr1 (266-414)||(34752337-34752474)
chr1 (266-347)||(13281641-13281722)
chr1 (262-363)||(33187347-33187448)
chr1 (266-347)||(46428332-46428413)
chr1 (262-354)||(1388480-1388572)
chr1 (262-314)||(4156188-4156240)
chr1 (262-354)||(10920207-10920299)
chr1 (262-354)||(38716319-38716411)
chr1 (262-354)||(39637907-39637996)
chr1 (263-339)||(52323946-52324022)
chr1 (344-415)||(13312553-13312624)
chr1 (266-336)||(7561632-7561702)
chr1 (306-418)||(4156438-4156557)
chr1 (266-347)||(35991678-35991759)
chr1 (266-347)||(44293534-44293615)
chr1 (265-354)||(52367893-52367982)
chr1 (262-354)||(5961339-5961431)
chr1 (266-414)||(41895187-41895324)
chr1 (376-418)||(7561547-7561589)
chr1 (368-414)||(24215865-24215911)
chr1 (262-307)||(10919313-10919358)
chr1 (376-420)||(39359502-39359546)
chr1 (378-418)||(48683349-48683389)
[»] chr7 (93 HSPs)
chr7 (263-418)||(2341681-2341836)
chr7 (265-419)||(33411271-33411425)
chr7 (266-418)||(25893936-25894088)
chr7 (262-418)||(33423294-33423450)
chr7 (262-418)||(33839734-33839890)
chr7 (262-418)||(15877558-15877714)
chr7 (262-418)||(33695840-33695996)
chr7 (262-418)||(35355896-35356052)
chr7 (262-418)||(49171381-49171537)
chr7 (262-419)||(31586856-31587013)
chr7 (262-418)||(17855436-17855592)
chr7 (262-414)||(22979670-22979822)
chr7 (262-418)||(23393070-23393226)
chr7 (262-418)||(27018124-27018280)
chr7 (262-418)||(45482666-45482822)
chr7 (266-418)||(45690116-45690268)
chr7 (262-414)||(47067000-47067152)
chr7 (262-418)||(47740350-47740506)
chr7 (262-418)||(46913117-46913275)
chr7 (262-418)||(10028496-10028652)
chr7 (262-418)||(20165833-20165989)
chr7 (266-414)||(35328092-35328240)
chr7 (262-418)||(37846035-37846191)
chr7 (262-418)||(40670571-40670727)
chr7 (275-418)||(36389377-36389520)
chr7 (263-418)||(41990877-41991032)
chr7 (271-418)||(5183844-5183991)
chr7 (262-413)||(33870253-33870404)
chr7 (263-418)||(43499494-43499649)
chr7 (262-414)||(45063380-45063530)
chr7 (262-418)||(31625712-31625867)
chr7 (262-418)||(48609696-48609852)
chr7 (262-418)||(19563455-19563611)
chr7 (266-418)||(26579736-26579888)
chr7 (262-414)||(33332797-33332948)
chr7 (262-403)||(33720070-33720211)
chr7 (279-418)||(29446863-29447001)
chr7 (266-411)||(5712180-5712325)
chr7 (262-418)||(35757039-35757195)
chr7 (262-418)||(10618306-10618455)
chr7 (262-414)||(31429498-31429650)
chr7 (262-418)||(35767489-35767638)
chr7 (272-413)||(44564356-44564497)
chr7 (300-414)||(28233959-28234073)
chr7 (306-418)||(30076546-30076658)
chr7 (266-414)||(35752057-35752194)
chr7 (321-419)||(41904272-41904370)
chr7 (266-414)||(46817444-46817581)
chr7 (266-414)||(43489230-43489367)
chr7 (262-354)||(16482855-16482947)
chr7 (266-414)||(26941555-26941692)
chr7 (266-414)||(36816868-36817005)
chr7 (266-414)||(37127949-37128086)
chr7 (262-418)||(45502835-45502980)
chr7 (266-414)||(48085870-48086007)
chr7 (263-354)||(29863024-29863115)
chr7 (266-403)||(32556640-32556766)
chr7 (266-414)||(498211-498348)
chr7 (266-414)||(7876351-7876488)
chr7 (266-406)||(24923055-24923184)
chr7 (266-418)||(41855071-41855212)
chr7 (266-418)||(46898035-46898176)
chr7 (266-347)||(24228553-24228634)
chr7 (266-347)||(25037587-25037668)
chr7 (266-346)||(29098763-29098843)
chr7 (266-354)||(44003442-44003530)
chr7 (318-418)||(44405412-44405512)
chr7 (266-418)||(2332031-2332172)
chr7 (266-414)||(26371061-26371198)
chr7 (266-347)||(29610647-29610728)
chr7 (266-347)||(39323628-39323709)
chr7 (266-339)||(39453562-39453635)
chr7 (266-347)||(39866677-39866758)
chr7 (266-347)||(47906838-47906919)
chr7 (262-354)||(33393336-33393428)
chr7 (266-406)||(21718129-21718258)
chr7 (266-347)||(44659856-44659936)
chr7 (262-354)||(7257389-7257481)
chr7 (262-354)||(15644018-15644110)
chr7 (263-322)||(35557739-35557798)
chr7 (263-354)||(47460844-47460935)
chr7 (262-319)||(30077043-30077100)
chr7 (266-347)||(33455108-33455189)
chr7 (266-347)||(35484648-35484730)
chr7 (266-414)||(45237556-45237693)
chr7 (266-347)||(46103133-46103213)
chr7 (266-366)||(38448508-38448608)
chr7 (266-317)||(35823302-35823353)
chr7 (265-354)||(7720575-7720664)
chr7 (362-414)||(39453505-39453557)
chr7 (294-354)||(37443674-37443734)
chr7 (302-352)||(26456157-26456207)
chr7 (263-354)||(21649450-21649542)
[»] chr3 (108 HSPs)
chr3 (262-422)||(40130974-40131134)
chr3 (262-418)||(41464359-41464515)
chr3 (262-418)||(47257800-47257956)
chr3 (262-418)||(7855133-7855289)
chr3 (263-418)||(51170052-51170207)
chr3 (262-415)||(29625849-29626002)
chr3 (262-418)||(27066997-27067153)
chr3 (262-418)||(38416743-38416899)
chr3 (262-422)||(42291849-42292009)
chr3 (262-414)||(43125838-43125990)
chr3 (262-418)||(43612066-43612222)
chr3 (262-418)||(49330044-49330200)
chr3 (262-418)||(52628961-52629117)
chr3 (266-418)||(47809615-47809768)
chr3 (262-415)||(52215083-52215236)
chr3 (262-418)||(18946910-18947066)
chr3 (266-418)||(20754412-20754564)
chr3 (262-418)||(22399104-22399259)
chr3 (262-418)||(24100290-24100445)
chr3 (266-418)||(28048411-28048563)
chr3 (266-418)||(40643811-40643963)
chr3 (262-422)||(43183919-43184079)
chr3 (262-422)||(55453259-55453419)
chr3 (263-418)||(35748330-35748485)
chr3 (262-414)||(2666007-2666159)
chr3 (262-418)||(32234417-32234572)
chr3 (262-418)||(37313406-37313562)
chr3 (262-414)||(40419842-40419994)
chr3 (278-418)||(46126010-46126150)
chr3 (262-418)||(48739252-48739408)
chr3 (262-418)||(51452769-51452925)
chr3 (264-418)||(48609732-48609886)
chr3 (262-416)||(51102399-51102553)
chr3 (262-411)||(39053401-39053550)
chr3 (266-418)||(37324552-37324704)
chr3 (262-418)||(39634591-39634746)
chr3 (263-422)||(43021722-43021882)
chr3 (262-414)||(44806691-44806843)
chr3 (262-414)||(46134363-46134515)
chr3 (262-418)||(53832503-53832659)
chr3 (262-418)||(53943606-53943762)
chr3 (263-418)||(35594129-35594284)
chr3 (262-412)||(24376580-24376730)
chr3 (262-418)||(7755326-7755481)
chr3 (262-418)||(40804529-40804685)
chr3 (266-418)||(44222840-44222992)
chr3 (262-423)||(36368946-36369106)
chr3 (262-415)||(41293341-41293493)
chr3 (262-422)||(41216462-41216622)
chr3 (262-418)||(41732535-41732691)
chr3 (262-418)||(5560044-5560207)
chr3 (262-418)||(46949382-46949536)
chr3 (263-418)||(47894839-47894994)
chr3 (262-404)||(53637848-53637990)
chr3 (262-411)||(52638849-52638998)
chr3 (262-374)||(54159051-54159163)
chr3 (262-414)||(51146238-51146390)
chr3 (262-401)||(37758936-37759075)
chr3 (262-374)||(48546894-48547004)
chr3 (266-414)||(25641657-25641794)
chr3 (266-414)||(34279744-34279881)
chr3 (266-414)||(42589841-42589978)
chr3 (266-414)||(54401198-54401335)
chr3 (266-414)||(54707243-54707380)
chr3 (266-414)||(39141147-39141286)
chr3 (262-362)||(41882055-41882155)
chr3 (262-362)||(53115454-53115554)
chr3 (266-415)||(49130589-49130727)
chr3 (315-418)||(52864550-52864652)
chr3 (266-414)||(37028734-37028871)
chr3 (266-414)||(38156655-38156792)
chr3 (266-414)||(51415980-51416117)
chr3 (262-354)||(21597220-21597312)
chr3 (322-418)||(33550486-33550582)
chr3 (266-362)||(48726062-48726158)
chr3 (262-354)||(55379992-55380084)
chr3 (266-414)||(31286816-31286953)
chr3 (266-414)||(41635823-41635960)
chr3 (263-361)||(50731979-50732077)
chr3 (263-361)||(50780779-50780877)
chr3 (266-414)||(55000201-55000338)
chr3 (266-347)||(17665603-17665684)
chr3 (266-347)||(45058894-45058975)
chr3 (304-385)||(47182049-47182130)
chr3 (266-347)||(47511019-47511100)
chr3 (262-354)||(25353561-25353653)
chr3 (262-362)||(28576176-28576276)
chr3 (263-354)||(51143825-51143916)
chr3 (264-366)||(47402810-47402911)
chr3 (266-414)||(51224061-51224197)
chr3 (262-354)||(30251573-30251665)
chr3 (262-354)||(42998861-42998952)
chr3 (266-414)||(24688125-24688262)
chr3 (266-414)||(40022085-40022222)
chr3 (266-339)||(44946016-44946089)
chr3 (262-366)||(2227995-2228099)
chr3 (262-354)||(43176810-43176902)
chr3 (263-330)||(48752093-48752160)
chr3 (262-330)||(52434146-52434215)
chr3 (350-422)||(30429242-30429314)
chr3 (287-354)||(40165683-40165750)
chr3 (287-366)||(41609099-41609178)
chr3 (266-366)||(8847718-8847818)
chr3 (263-307)||(37741443-37741487)
chr3 (263-352)||(177169-177258)
chr3 (290-347)||(52756150-52756207)
chr3 (362-414)||(48534030-48534082)
chr3 (262-299)||(51942543-51942580)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (262-418)||(39575-39731)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (262-418)||(13781-13937)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (262-418)||(1876-2032)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (262-418)||(11152-11307)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (262-418)||(75263-75419)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (263-418)||(278014-278171)
scaffold0007 (267-415)||(176666-176814)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (262-418)||(18873-19029)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (262-418)||(2451-2607)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (262-409)||(32568-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (297-418)||(4615-4736)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (262-415)||(3095-3239)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (262-354)||(109-201)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (266-414)||(7101-7239)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (262-362)||(4618-4719)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (262-362)||(3399-3500)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (262-354)||(14751-14843)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (262-354)||(20549-20641)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (266-336)||(17917-17987)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (266-339)||(19228-19301)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Original strand, 37260164 - 37260418
Alignment:
Q  13 aatattagctagaaattattctgttaannnnnnnnngtccatcttggtgttaaccttttatgttcgttccattatcatattattattggcatgttattga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37260164 aatattagctagaaattattctgttaatttttttttgtccatcttggtgttaaccttttatgttcgttccattatcatattattattggcatgttattga 37260263  T
Q  113 gatcacaaggatctaaaat---------------gttgtaagtttaatcatataaaattcgaaagtatttcttcataaagctaggttaaaagtgtatata 197  Q
    |||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37260264 gatcacaaggatctaaaatgtcgtgaatttaaatgttgtaagtttaatcatataaaattcgaaagtatttcttcataaagctaggttaaaagtgtatata 37260363  T
Q  198 aatattttatactttcaagtatactctcatttctacacacttacgtatacaaaaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37260364 aatattttatactttcaagtatactctcatttctacacacttatgtataaaaaaa 37260418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32984252 - 32984096
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32984252 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 32984153  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32984152 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 32984096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 263 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 24080075 - 24079924
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24080075 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 24079976  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24079975 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 24079924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 2714556 - 2714712
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2714556 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2714655  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2714656 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 2714712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 5946054 - 5946214
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5946054 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5946153  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5946154 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggt 5946214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 6365993 - 6366145
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6365993 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaa 6366092  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6366093 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 6366145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 25185906 - 25186066
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25185906 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaa 25186005  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25186006 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 25186066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 32114256 - 32114412
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  32114256 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 32114355  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32114356 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 32114412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 37419947 - 37420107
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  37419947 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 37420046  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37420047 atgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggt 37420107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 40435328 - 40435172
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40435328 ctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40435229  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40435228 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 40435172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 41862227 - 41862383
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  41862227 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 41862326  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41862327 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 41862383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 43328714 - 43328870
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43328714 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43328813  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  43328814 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat 43328870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 263 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33981837 - 33981678
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33981837 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 33981738  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33981737 tgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 33981678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 262 - 411
Target Start/End: Original strand, 37956428 - 37956577
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37956428 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 37956527  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37956528 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 37956577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 9734262 - 9734416
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  9734262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaa 9734360  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9734361 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccat 9734416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 10646130 - 10646286
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10646130 ctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 10646229  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10646230 atgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 10646286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 31831130 - 31830974
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31831130 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31831031  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||||    
T  31831030 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccat 31830974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33730816 - 33730660
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33730816 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33730717  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33730716 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 33730660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 44088618 - 44088462
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44088618 ctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 44088519  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44088518 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 44088462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9303748 - 9303593
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9303748 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 9303649  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9303648 tgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccat 9303593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 264 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13760821 - 13760662
Alignment:
Q  264 agattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13760821 agattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaat 13760722  T
Q  364 gtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggtg 423  Q
    |||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13760721 gtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtg 13760662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 9013691 - 9013846
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9013691 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 9013790  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9013791 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttagg-taaattacccaccattcttccat 9013846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 17718897 - 17718741
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17718897 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 17718798  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17718797 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 17718741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 263 - 415
Target Start/End: Original strand, 35628785 - 35628937
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  35628785 tagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccacttaaaaa 35628884  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35628885 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttc 35628937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 41231953 - 41232109
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41231953 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41232052  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  41232053 atgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccat 41232109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 45236740 - 45236588
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45236740 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45236641  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45236640 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctt 45236588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 45258518 - 45258673
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45258518 tagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaa 45258617  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45258618 tgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 45258673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29048578 - 29048426
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29048578 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 29048479  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29048478 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 37301500 - 37301348
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  37301500 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccacttaaaa 37301401  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  37301400 atgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 37301348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 41653902 - 41654054
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  41653902 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccacttaaaa 41654001  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41654002 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctt 41654054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 13356294 - 13356139
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13356294 tagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 13356195  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  13356194 tgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccat 13356139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 263 - 420
Target Start/End: Original strand, 41639922 - 41640079
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||||    
T  41639922 tagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgcttaaaaa 41640021  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccatag 420  Q
    | || ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41640022 tatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatag 41640079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 2275920 - 2276075
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  2275920 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 2276018  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||| |||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  2276019 atatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccat 2276075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 45066766 - 45066611
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45066766 tagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 45066667  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||   |||||||||||| |||||||||||    
T  45066666 tgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccat 45066611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Original strand, 22878398 - 22878551
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22878398 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 22878497  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  22878498 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttc 22878551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 42701465 - 42701308
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccattt---a 358  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||   |    
T  42701465 ctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 42701366  T
Q  359 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  42701365 aaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccat 42701308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 25248046 - 25248196
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  25248046 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactttaaa 25248139  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  25248140 atgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccat 25248196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 311 - 418
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033093
Alignment:
Q  311 aatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccat 410  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  411 tcttccat 418  Q
    ||||||||    
T  12033086 tcttccat 12033093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 304 - 418
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904239
Alignment:
Q  304 caatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  404 ccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||    
T  3904225 ccaccattcttccat 3904239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 321 - 418
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981631
Alignment:
Q  321 ttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 41981631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39915983 - 39915887
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39915983 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 4447455 - 4447314
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  4447455 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 4447367  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4447366 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat 4447314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 31940326 - 31940462
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  31940326 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 31940414  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31940415 gcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctt 31940462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 10378320 - 10378461
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  10378320 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 10378408  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10378409 gcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 10378461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32373886 - 32373746
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  32373886 attacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 32373798  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32373797 gcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccat 32373746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 40458932 - 40458795
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  40458932 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 40458844  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    | || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40458843 gtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctt 40458795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 41843264 - 41843401
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||           || ||||    
T  41843264 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatg-----------aatatgt 41843352  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41843353 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 41843401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 276 - 354
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981532
Alignment:
Q  276 aagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 41981532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 117489 - 117408
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  117489 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 117408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 2379151 - 2379288
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  |||| || |||||||           || ||||    
T  2379151 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg-----------aatatgt 2379239  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2379240 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 2379288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 3211217 - 3211357
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||           || ||||    
T  3211217 attacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg-----------aatatgt 3211304  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3211305 gcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccat 3211357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4975567 - 4975486
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  4975567 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 4975486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27243299 - 27243218
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||||    
T  27243299 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27254874 - 27254793
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||||    
T  27254874 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33622625 - 33622492
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  33622625 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttatgg-gtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 33622538  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33622537 ggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcatt 33622492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 324 - 418
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336257
Alignment:
Q  324 ttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccat 31336257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 9713700 - 9713834
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  9713700 attacctttgaagaatggtgggtaatttac---ccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 9713785  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9713786 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 9713834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33897006 - 33896915
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  33897006 ctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagatacca 33896915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3490559 - 3490486
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3490559 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagat 3490486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9509560 - 9509479
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||    
T  9509560 attacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg 9509479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 415
Target Start/End: Original strand, 38631663 - 38631801
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||           || || |    
T  38631663 attacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg-----------aatatat 38631751  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38631752 gcttatgtggttaatatgtattggttgggataaattatccaccattcttc 38631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31149054 - 31148953
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31149054 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccacttaaaa 31148956  T
Q  362 atg 364  Q
    |||    
T  31148955 atg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26196479 - 26196389
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  26196479 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatacca 26196389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649854
Alignment:
Q  267 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 366  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||  ||||||           || |||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatg-----------aatatgtg 40649902  T
Q  367 cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||    
T  40649901 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctt 40649854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Original strand, 164729 - 164800
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtc 334  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  164729 ctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttg-tggtggagtc 164800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15398657 - 15398497
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15398657 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15398558  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15398557 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 15398497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 24253389 - 24253545
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24253389 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24253488  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24253489 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 24253545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 739879 - 739726
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  739879 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 739780  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  739779 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttc 739726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 43326554 - 43326398
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43326554 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43326455  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43326454 atgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 43326398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18479843 - 18479690
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  18479843 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 18479744  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18479743 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 18479690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 35626049 - 35626201
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35626049 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 35626148  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35626149 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 35626201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 39932587 - 39932742
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39932587 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39932686  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  39932687 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccat 39932742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 262 - 419
Target Start/End: Original strand, 15683798 - 15683955
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15683798 ctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15683897  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 419  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15683898 atgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccata 15683955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3466856 - 3466704
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3466856 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 3466757  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3466756 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 3466704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 5184979 - 5185135
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  5184979 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 5185078  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5185079 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccat 5185135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 6901806 - 6901962
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  6901806 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 6901905  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6901906 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 6901962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 7722056 - 7722212
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7722056 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 7722155  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7722156 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccat 7722212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 27938904 - 27939060
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27938904 ctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27939003  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27939004 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 27939060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939060
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 31939060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 40886202 - 40886047
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  40886202 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 40886104  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40886103 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 40886047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27278652 - 27278488
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatgg----ttcatggataccattt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    ||||||||||||| ||    
T  27278652 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggataccactt 27278553  T
Q  358 aaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27278552 aaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 27278488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 12648804 - 12648960
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12648804 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 12648903  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12648904 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 12648960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 25831528 - 25831679
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25831528 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaattaaaa 25831626  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25831627 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 25831679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 13504917 - 13504761
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13504917 ctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 13504818  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13504817 atgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccat 13504761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 40279029 - 40278877
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  40279029 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgt 40278930  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40278929 gcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccat 40278877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 43262354 - 43262202
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  43262354 attacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43262255  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43262254 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 43262202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27501229 - 27501074
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27501229 tagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 27501130  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27501129 tgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccat 27501074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2484467 - 2484311
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  2484467 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 2484368  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2484367 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 2484311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 263 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756509
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttcc 416  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcc 38756509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 5137722 - 5137878
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5137722 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5137821  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| || || |  ||||||| |||||||||||||||    
T  5137822 atgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccat 5137878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 292 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789314
Alignment:
Q  292 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  392 gggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccat 29789314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28424968 - 28424814
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  28424968 ctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 28424871  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28424870 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 28424814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 890913 - 891068
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  890913 ctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccactt-aaa 891011  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  891012 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccat 891068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 40110245 - 40110396
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  40110245 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 40110343  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||  |||||| || | ||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  40110344 gcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccat 40110396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 419
Target Start/End: Original strand, 4149705 - 4149848
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||| ||||||||||    
T  4149705 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgg---------ggtt-atggataccacttaaaaatgt 4149794  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 419  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4149795 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccata 4149848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 297 - 418
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451413
Alignment:
Q  297 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  397 aaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccat 34451413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 763730 - 763882
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  763730 ctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcacttaaaa 763829  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  763830 atgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctt 763882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Original strand, 40632506 - 40632597
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacc 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40632506 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 40632597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 33617596 - 33617737
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  33617596 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 33617684  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33617685 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 33617737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 6973074 - 6973211
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  6973074 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 6973162  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6973163 gcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6973211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 9424752 - 9424615
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||           || || |    
T  9424752 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatat 9424664  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9424663 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 9424615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 38015674 - 38015537
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  38015674 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 38015586  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  38015585 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 38015537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 42658822 - 42658685
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || || |    
T  42658822 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatat 42658734  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42658733 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 42658685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 2585469 - 2585569
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  2585469 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaa 2585568  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  2585569 a 2585569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12558193 - 12558090
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  12558193 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 12558095  T
Q  362 atgtg 366  Q
    |||||    
T  12558094 atgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 5497284 - 5497421
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  5497284 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 5497372  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5497373 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 5497421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 13957681 - 13957818
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || |||     
T  13957681 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgc 13957769  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  13957770 gcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctt 13957818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 14971989 - 14972126
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| |||           || ||||    
T  14971989 attaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-----------aatatgt 14972077  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  14972078 gcttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctt 14972126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 19295741 - 19295878
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||| ||           ||||    
T  19295741 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtat-----------atgt 19295829  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19295830 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 19295878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 27503390 - 27503527
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  27503390 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 27503478  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  27503479 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctt 27503527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31294164 - 31294012
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||  | | || |||| |||||| ||||||    
T  31294164 ctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccacttaaaa 31294065  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    || |||||| |||| | |||  || |||||||  |||||||||||||||||||    
T  31294064 atatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattctt 31294012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23195408 - 23195271
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  23195408 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 23195320  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||    
T  23195319 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctt 23195271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 36365605 - 36365468
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  36365605 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 36365517  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  36365516 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctt 36365468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 363
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120132
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 363  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaat 5120132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36472448 - 36472347
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca-tttaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  36472448 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccactttaaa 36472349  T
Q  361 aa 362  Q
    ||    
T  36472348 aa 36472347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 42247942 - 42247869
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  42247942 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 42247869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 9374662 - 9374525
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  9374662 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 9374574  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    | ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9374573 gtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 9374525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18327337 - 18327245
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18327337 ctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 18327245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38638074 - 38637982
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  38638074 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 38637982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 419
Target Start/End: Original strand, 6206895 - 6207037
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||||| || |||||||           || ||||    
T  6206895 attacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 6206983  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 419  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  6206984 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcata 6207037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9527183 - 9527124
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9527183 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Original strand, 27390605 - 27390696
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27390605 tagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 27390696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 414
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492761
Alignment:
Q  289 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactg 388  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||           ||||||||||||||||||||||| ||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  389 gttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  38492736 gttggggtaaattacccatcattctt 38492761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9171185 - 9171112
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  9171185 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 9171112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1402669 - 1402577
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  1402669 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 1402577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24167948 - 24167856
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| | |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  24167948 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 24167856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 40686906 - 40687006
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  40686906 ctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaa 40687005  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  40687006 a 40687006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656591
Alignment:
Q  282 ggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatg 381  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||           || ||||||||||||| ||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatg 3656624  T
Q  382 tgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  3656623 tgtattggttggggtaaattactcatcattctt 3656591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 36948626 - 36948513
Alignment:
Q  288 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtact 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||           ||||||||||||| |||||||||| |    
T  36948626 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggat-----------atgtgcttatgtggctaatgtgtatt 36948539  T
Q  388 ggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36948538 ggtaggg-taaattacccaccattctt 36948513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300962
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaag 337  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaatttatcggtggagtcaag 15300962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940418
Alignment:
Q  279 aatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagat 3940418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33624099 - 33624043
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 322  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33624099 attacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 33624043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20207154 - 20207080
Alignment:
Q  288 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||   | ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20207154 taatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggataccatctaaaaa 20207080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 315
Target Start/End: Original strand, 28756085 - 28756138
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 315  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28756085 ctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33624014 - 33623965
Alignment:
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  33624014 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatt 33623965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 422
Target Start/End: Original strand, 40687010 - 40687054
Alignment:
Q  378 aatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40687010 aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggt 40687054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2325064 - 2324908
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2325064 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2324965  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2324964 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 2324908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 746472 - 746628
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  746472 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 746571  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  746572 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 746628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 11184978 - 11185134
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11184978 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 11185077  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11185078 atgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 11185134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13815393 - 13815241
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13815393 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 13815294  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13815293 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctt 13815241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 23901785 - 23901941
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23901785 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23901884  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23901885 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 23901941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 38997107 - 38997263
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38997107 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 38997206  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38997207 atgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccat 38997263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 263 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10244756 - 10244597
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10244756 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 10244657  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    |||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10244656 tgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 10244597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 4034598 - 4034754
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4034598 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 4034697  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4034698 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 4034754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 6430479 - 6430635
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6430479 ctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 6430578  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6430579 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 6430635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 6594633 - 6594477
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6594633 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 6594534  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6594533 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccat 6594477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 14660452 - 14660608
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14660452 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 14660551  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14660552 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccat 14660608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 17600842 - 17600998
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17600842 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 17600941  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17600942 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 17600998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 45370996 - 45371152
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45370996 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45371095  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45371096 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 45371152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 34518374 - 34518529
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34518374 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 34518473  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34518474 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccat 34518529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 5726135 - 5726291
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  5726135 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccacttaaaa 5726234  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| |||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5726235 atgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 5726291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 10424601 - 10424757
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10424601 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 10424700  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10424701 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 10424757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 26710351 - 26710503
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26710351 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 26710450  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26710451 atgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 26710503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27651209 - 27651053
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27651209 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27651110  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27651109 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 27651053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 40635228 - 40635376
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40635228 attacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40635327  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40635328 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 40635376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2914312 - 2914157
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2914312 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 2914213  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2914212 tgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccat 2914157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 27400409 - 27400561
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27400409 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27400508  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27400509 atgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 27400561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 32327367 - 32327527
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  32327367 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 32327466  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32327467 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggt 32327527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7892863 - 7892705
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  7892863 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccacttaaaa 7892764  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccatag 420  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7892763 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatag 7892705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 262 - 411
Target Start/End: Original strand, 32608386 - 32608535
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  32608386 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccacttaaaa 32608485  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  32608486 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 32608535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Original strand, 32948452 - 32948604
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  32948452 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccacttaaaa 32948550  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  32948551 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttc 32948604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 27024421 - 27024577
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27024421 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27024520  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  27024521 atatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccat 27024577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 37621044 - 37620886
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg---agtcaagatggttcatggataccatttaa 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37621044 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggataccacttaa 37620945  T
Q  360 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37620944 aaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccat 37620886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 1092125 - 1091970
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1092125 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 1092026  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1092025 tgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccat 1091970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 4609633 - 4609788
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4609633 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 4609732  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  4609733 tgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccat 4609788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 33427822 - 33427670
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33427822 ctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 33427723  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33427722 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctt 33427670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 265 - 410
Target Start/End: Original strand, 12842112 - 12842257
Alignment:
Q  265 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  12842112 gattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaattaaaaatg 12842211  T
Q  365 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccat 410  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  12842212 tgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat 12842257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 37255507 - 37255359
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37255507 ctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 37255413  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255412 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttc 37255359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 263 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 14697711 - 14697559
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14697711 tagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 14697612  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14697611 tgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttc 14697559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 270 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856451
Alignment:
Q  270 cctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgctt 369  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  370 atgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggt 32856451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 40735470 - 40735626
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  40735470 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 40735569  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| |||||| | |||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  40735570 atgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccat 40735626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 411
Target Start/End: Original strand, 40037149 - 40037298
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  40037149 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 40037248  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  40037249 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt 40037298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 411
Target Start/End: Original strand, 9444689 - 9444845
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttac-------ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9444689 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatggatacca 9444788  T
Q  355 tttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9444789 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 9444845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 265 - 415
Target Start/End: Original strand, 11159631 - 11159780
Alignment:
Q  265 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 364  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  11159631 gattacctttgaaaaatggtg-gtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccacttaaaaatg 11159729  T
Q  365 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    || ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11159730 tgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttc 11159780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 420
Target Start/End: Original strand, 15925086 - 15925244
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15925086 ctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15925185  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccatag 420  Q
    || |||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  15925186 atatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatag 15925244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 262 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8433091 - 8432942
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  8433091 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccactttaaa 8432992  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
    || | |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8432991 atatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 380
Target Start/End: Original strand, 42899921 - 42900039
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42899921 ctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 42900020  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaat 380  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  42900021 atgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 307 - 418
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25294997
Alignment:
Q  307 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattaccca 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  407 ccattcttccat 418  Q
     |||||||||||    
T  25294986 tcattcttccat 25294997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 266 - 403
Target Start/End: Original strand, 41172468 - 41172605
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  41172468 attacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaatgt 41172567  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattac 403  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41172568 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 304 - 418
Target Start/End: Original strand, 1229675 - 1229789
Alignment:
Q  304 caatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattac 403  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||    
T  1229675 caatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattac 1229774  T
Q  404 ccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||    
T  1229775 ccaccattcttccat 1229789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 35158210 - 35158073
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  35158210 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 35158122  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35158121 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 35158073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 145292 - 145429
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||           ||    
T  145292 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac-----------gt 145380  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  145381 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 145429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 39103057 - 39103198
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  39103057 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 39103145  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39103146 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 39103198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 335
Target Start/End: Original strand, 12814620 - 12814693
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12814620 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 412
Target Start/End: Original strand, 4258500 - 4258634
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  4258500 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgg-gtcaagatagttcatg-----------aatatgt 4258587  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattc 412  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4258588 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattc 4258634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 447738 - 447652
Alignment:
Q  332 gtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  447738 gtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccat 447652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 12333655 - 12333519
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||| ||           ||||    
T  12333655 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat-----------atgt 12333567  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12333566 gcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctt 12333519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 21735060 - 21734919
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||           || ||||    
T  21735060 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 21734972  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21734971 gcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 21734919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 39301357 - 39301220
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  39301357 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 39301269  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  39301268 gcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctt 39301220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28641452 - 28641371
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  28641452 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 28641371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 420
Target Start/End: Original strand, 35126786 - 35126933
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||    
T  35126786 ctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaa 35126885  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccatag 420  Q
    | |||           ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35126886 aggtg-----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatag 35126933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 44481834 - 44481926
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  44481834 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 44481926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 12730071 - 12730208
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||           |||| ||||    
T  12730071 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgt 12730159  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||    
T  12730160 gcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctt 12730208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 19428582 - 19428449
Alignment:
Q  270 cctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgctt 369  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||           || ||||||||    
T  19428582 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgctt 19428494  T
Q  370 atgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19428493 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 19428449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 29687051 - 29687188
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  29687051 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 29687139  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||    
T  29687140 gcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctt 29687188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 34249275 - 34249412
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| |||           || ||||    
T  34249275 attatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-----------aatatgt 34249363  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||    
T  34249364 gcttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctt 34249412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 8056636 - 8056717
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  8056636 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg 8056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13543784 - 13543647
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  13543784 attacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 13543696  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||    
T  13543695 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctt 13543647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 27331308 - 27331449
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | |||||||| ||||||| |       || | ||||    
T  27331308 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaa-------tatatatgt 27331400  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  27331401 gcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctt 27331449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 27765022 - 27764897
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  27765022 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 27764934  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatta 402  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  27764933 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 27764897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 43899130 - 43898994
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  43899130 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 43899042  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  43899041 gcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctt 43898994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 3266306 - 3266387
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  3266306 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40544236 - 40544155
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  40544236 attacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Original strand, 12827142 - 12827229
Alignment:
Q  335 aagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggtg 423  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12827142 aagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccacaggtg 12827229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 28566858 - 28566721
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  28566858 attacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 28566770  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| || |||||||    
T  28566769 gcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctt 28566721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2000497 - 2000441
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2000497 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 2000441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  327 gtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaa 399  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 43356109 - 43356187
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  43356109 attacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 43356187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 363
Target Start/End: Original strand, 30545828 - 30545928
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  30545828 tagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatacaatctaaaaa 30545927  T
Q  363 t 363  Q
    |    
T  30545928 t 30545928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38985439 - 38985350
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||| ||||||||||||||    
T  38985439 tagattacatttga-gaacggtgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgat-atgtcaagatagttcatggatacca 38985350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2688889 - 2688752
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| || || | |||||||| |||||||           || ||||    
T  2688889 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 2688801  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  2688800 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctt 2688752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 414
Target Start/End: Original strand, 3711663 - 3711780
Alignment:
Q  286 agtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||||||||| | ||||||||||    
T  3711663 agtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgcggctaatgtgta 3711751  T
Q  386 ctggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3711752 ttggttggggtaaattacccatcattctt 3711780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28019996 - 28019959
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28019996 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 322
Target Start/End: Original strand, 10176565 - 10176625
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 322  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  10176565 ctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 418
Target Start/End: Original strand, 42900781 - 42900817
Alignment:
Q  382 tgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42900781 tgtattggttgagataaattacccaccattcttccat 42900817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 5882513 - 5882669
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5882513 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5882612  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5882613 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 5882669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7393761 - 7393605
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7393761 ctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 7393662  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7393661 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 7393605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 14891554 - 14891398
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14891554 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 14891455  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14891454 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 14891398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 34528036 - 34527881
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  34528036 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaa 34527937  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34527936 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 34527881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Original strand, 2892195 - 2892348
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2892195 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2892294  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2892295 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttc 2892348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2594027 - 2593867
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2594027 ctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2593928  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2593927 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggt 2593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7345287 - 7345131
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  7345287 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 7345188  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7345187 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 7345131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18101670 - 18101514
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  18101670 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 18101571  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18101570 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 18101514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 22551236 - 22551080
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  22551236 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacctaaaa 22551137  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22551136 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 22551080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 24168098 - 24168254
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24168098 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24168197  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24168198 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 24168254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26377375 - 26377223
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26377375 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 26377276  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26377275 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 26377223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 599899 - 600051
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  599899 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 599998  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  599999 atgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctt 600051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 1970718 - 1970874
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  1970718 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 1970817  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1970818 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 1970874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 8615247 - 8615403
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8615247 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 8615346  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  8615347 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccat 8615403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 268 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988993
Alignment:
Q  268 tacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgc 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  368 ttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 11988993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 16703373 - 16703529
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  16703373 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 16703472  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  16703473 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccat 16703529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 268 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341807
Alignment:
Q  268 tacctttgaagaatggtgagtaatttacccacca--accaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 22341807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 960079 - 959927
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  960079 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccacttaaaa 959980  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  959979 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 959927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19281230 - 19281070
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  19281230 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 19281131  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19281130 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggt 19281070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 19415708 - 19415552
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19415708 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccacttaaaa 19415609  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  19415608 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccat 19415552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 28947094 - 28947250
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  28947094 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaa 28947193  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28947194 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 28947250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 30743623 - 30743471
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  30743623 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccacttaaaa 30743524  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30743523 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctt 30743471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 267 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 24224240 - 24224093
Alignment:
Q  267 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24224240 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 24224141  T
Q  367 cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||||    
T  24224140 cttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctt 24224093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 10508083 - 10507930
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10508083 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 10507984  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10507983 atgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttc 10507930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5294976 - 5294820
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5294976 ctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 5294877  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  5294876 atgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccat 5294820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5299528 - 5299372
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5299528 ctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 5299429  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  5299428 atgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccat 5299372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33452747 - 33452591
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33452747 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33452648  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33452647 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 33452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30467778 - 30467656
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||     
T  30467778 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaac 30467679  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgt 384  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  30467678 atgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261944
Alignment:
Q  287 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtac 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||| ||||     
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  387 tggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggt 23261944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 13329392 - 13329529
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| || ||||| |||||           |||| ||||    
T  13329392 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca-----------taaatatgt 13329480  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13329481 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 13329529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 28949005 - 28948868
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||           || || |    
T  28949005 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-----------aatatat 28948917  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28948916 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 28948868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 337
Target Start/End: Original strand, 929666 - 929741
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaag 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  929666 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 7167589 - 7167681
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  7167589 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggatacca 7167681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 15965444 - 15965581
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||  ||||||           || ||||    
T  15965444 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatg-----------aatatgt 15965532  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15965533 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 15965581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 414
Target Start/End: Original strand, 4487546 - 4487675
Alignment:
Q  274 tgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgt 373  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || |||| || ||||    
T  4487546 tgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtactcatgt 4487634  T
Q  374 gactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4487635 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 4487675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 346
Target Start/End: Original strand, 3291019 - 3291099
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| || ||||| ||||||    
T  3291019 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcat 3291099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 422
Target Start/End: Original strand, 1398564 - 1398709
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||| ||| |||           || ||||    
T  1398564 attatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatg-----------aatatgt 1398652  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  1398653 gcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggt 1398709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1939664 - 1939579
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata 351  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||    
T  1939664 attatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 3786760 - 3786897
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  3786760 attacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatg-----------aatatgt 3786848  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  3786849 gcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctt 3786897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 346
Target Start/End: Original strand, 13844847 - 13844927
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 346  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  13844847 attacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcat 13844927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 414
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661882
Alignment:
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctt 18661882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11743119 - 11743070
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaa 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11743119 ctagattacccttgaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaa 11743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913119
Alignment:
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctt 24913119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 120)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 51363014 - 51363170
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51363014 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 51363113  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51363114 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 51363170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 21366784 - 21366628
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21366784 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 21366685  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21366684 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 21366628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 34276558 - 34276710
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34276558 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 34276657  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34276658 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 34276710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 44984772 - 44984924
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44984772 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 44984871  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984872 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 44984924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 53854604 - 53854448
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53854604 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 53854505  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  53854504 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 53854448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 397410 - 397565
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  397410 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 397509  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  397510 tgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 397565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 9798473 - 9798628
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9798473 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 9798572  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9798573 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 9798628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 237484 - 237640
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  237484 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaa 237583  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  237584 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 237640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2826856 - 2826700
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2826856 ctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2826757  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2826756 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 2826700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 6019935 - 6020091
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6019935 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 6020034  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6020035 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat 6020091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 23437599 - 23437755
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23437599 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23437698  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23437699 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 23437755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 27373083 - 27373239
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  27373083 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 27373182  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27373183 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 27373239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 42085214 - 42085370
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42085214 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 42085313  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42085314 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 42085370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 55056434 - 55056282
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  55056434 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaa 55056335  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  55056334 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 55056282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 263 - 422
Target Start/End: Original strand, 45797487 - 45797646
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45797487 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 45797586  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45797587 tgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggt 45797646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 49881238 - 49881078
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49881238 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 49881139  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt----gggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  49881138 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccat 49881078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 146604 - 146451
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  146604 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 146505  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  146504 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttc 146451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 6285318 - 6285470
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  6285318 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 6285417  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6285418 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 6285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 29478367 - 29478527
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29478367 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 29478466  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29478467 atgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggt 29478527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32366835 - 32366679
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32366835 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 32366736  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32366735 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccat 32366679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 41702634 - 41702478
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41702634 ctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 41702535  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41702534 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 41702478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 263 - 419
Target Start/End: Original strand, 55776053 - 55776208
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55776053 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 55776151  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 419  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  55776152 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcata 55776208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 263 - 419
Target Start/End: Original strand, 55840231 - 55840386
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55840231 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 55840329  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 419  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  55840330 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcata 55840386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 41949389 - 41949551
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41949389 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41949488  T
Q  362 atgtgct--tatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41949489 atgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggt 41949551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18462188 - 18462035
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  18462188 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 18462089  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  18462088 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttc 18462035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 3170633 - 3170789
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  3170633 ctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 3170732  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3170733 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 3170789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 22618687 - 22618533
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22618687 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaa 22618589  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22618588 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttagg-taaattacccaccattcttccat 22618533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 31070248 - 31070093
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31070248 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 31070150  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31070149 atgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 31070093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 31532310 - 31532154
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31532310 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31532211  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  31532210 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat 31532154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 39077552 - 39077708
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39077552 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 39077651  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39077652 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccat 39077708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 42766016 - 42765861
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  42766016 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 42765918  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42765917 atgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 42765861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 43471870 - 43471714
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43471870 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43471771  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43471770 atgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 43471714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 53461987 - 53461839
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53461987 attacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 53461888  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  53461887 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 53461839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 54575115 - 54574959
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  54575115 ctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 54575016  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54575015 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 54574959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 42033183 - 42033338
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  42033183 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 42033282  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| ||||||  ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42033283 tgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccat 42033338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 407761 - 407911
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  407761 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaa 407859  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  407860 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctt 407911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 19387863 - 19387707
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19387863 ctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaa 19387764  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19387763 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 19387707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26091429 - 26091277
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26091429 attatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 26091330  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26091329 gtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 26091277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 29777432 - 29777276
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||||    
T  29777432 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccacttaaaa 29777333  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29777332 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat 29777276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31972511 - 31972359
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  31972511 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 31972412  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  31972411 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctt 31972359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 41560339 - 41560491
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41560339 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41560438  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41560439 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 41560491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 47344663 - 47344819
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47344663 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47344762  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  47344763 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccat 47344819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 54424989 - 54425145
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54424989 ctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 54425088  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  54425089 atgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat 54425145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 54607969 - 54608125
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  54607969 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaa 54608068  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  54608069 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccat 54608125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33897669 - 33897510
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33897669 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 33897570  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    | || |||| || |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33897569 tatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggt 33897510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 50534639 - 50534794
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  50534639 tagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 50534738  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50534739 tgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 50534794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 39587954 - 39587798
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39587954 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39587855  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39587854 atgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccat 39587798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 42222298 - 42222450
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  42222298 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccacttaaaa 42222397  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  42222398 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattctt 42222450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 31914206 - 31914360
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31914206 tagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 31914305  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31914306 tgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 31914360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 38591675 - 38591827
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    |    
T  38591675 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt----a 38591770  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38591771 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 38591827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Original strand, 50234007 - 50234160
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  50234007 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccacttaaaa 50234106  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50234107 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 50234160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 22468945 - 22468789
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  22468945 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccacttaaaa 22468846  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  22468845 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccat 22468789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 23609094 - 23609250
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23609094 ctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccacttaaaa 23609193  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  23609194 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccat 23609250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 48657832 - 48657981
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  48657832 tagattacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 48657925  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48657926 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 48657981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 50457985 - 50457829
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50457985 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 50457886  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  50457885 atgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccat 50457829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 263 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 50536798 - 50536646
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  50536798 tagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaa 50536699  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    | || |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50536698 tatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttc 50536646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 53834229 - 53834073
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53834229 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 53834130  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||   |||||||||||||||||||||||    
T  53834129 atgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccat 53834073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 55519834 - 55519990
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  55519834 ctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 55519933  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  55519934 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccat 55519990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Original strand, 2243465 - 2243618
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2243465 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2243564  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||  ||||||| || ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  2243565 atgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttc 2243618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 47662277 - 47662124
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  47662277 ctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccacttaaaa 47662178  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47662177 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 47662124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 56023173 - 56023024
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  56023173 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 56023074  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  56023073 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcatt 56023024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 3692385 - 3692229
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  3692385 ctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccacttaaaa 3692286  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3692285 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 3692229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 35446513 - 35446668
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  35446513 ctagattaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 35446611  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35446612 atgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 35446668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 48259685 - 48259530
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||    
T  48259685 ctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccactt-aaa 48259587  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  48259586 atgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat 48259530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 54086417 - 54086571
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  54086417 ctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccgcttaaaa 54086514  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54086515 atgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccat 54086571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 411
Target Start/End: Original strand, 1932770 - 1932919
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  1932770 ctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 1932869  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||    
T  1932870 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcatt 1932919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41632181 - 41632030
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  41632181 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggatatcgcttaaaa 41632083  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41632082 atgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctt 41632030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 48313564 - 48313718
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  48313564 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccactt-aaa 48313661  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||  ||||| | || ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  48313662 atatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccat 48313718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 51951689 - 51951844
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  51951689 ctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagttaaaa 51951788  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51951789 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttgtg-taaattacccaccattcttccat 51951844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728325
Alignment:
Q  295 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  395 ataaattacccaccattcttccat 418  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccat 52728325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 48654822 - 48654983
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  48654822 tagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccacttaaaaa 48654921  T
Q  363 tgtgcttatgtgacta------atgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||| |||||||| |||      ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48654922 tgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccat 48654983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 14017549 - 14017395
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||    
T  14017549 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt--aa 14017452  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
     |||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  14017451 gtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccat 14017395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 54805793 - 54805633
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54805793 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccacttaaaa 54805694  T
Q  362 atgtg----cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  54805693 atgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccat 54805633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 311 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532849
Alignment:
Q  311 aatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccat 410  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccat 36532857  T
Q  411 tcttccat 418  Q
    ||||||||    
T  36532856 tcttccat 36532849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 43890939 - 43891080
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||           || ||||    
T  43890939 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatg-----------aatatgt 43891027  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43891028 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 43891080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 5117598 - 5117461
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  5117598 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 5117510  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5117509 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 5117461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 45633939 - 45633802
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  45633939 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 45633851  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45633850 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 45633802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 54216896 - 54216755
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  54216896 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 54216808  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54216807 gcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccat 54216755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 310 - 418
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509459
Alignment:
Q  310 aaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccacca 409  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  410 ttcttccat 418  Q
    |||||||||    
T  42509451 ttcttccat 42509459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9998091 - 9997950
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  9998091 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 9998003  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9998002 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 9997950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15060449 - 15060312
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  15060449 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 15060361  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15060360 gcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 15060312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 20352002 - 20351865
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  20352002 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 20351914  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20351913 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 20351865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 46708901 - 46708764
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  46708901 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 46708813  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  46708812 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctt 46708764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 341 - 422
Target Start/End: Original strand, 35595773 - 35595854
Alignment:
Q  341 gttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35595773 gttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 35595854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 415
Target Start/End: Original strand, 47811917 - 47812055
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||           || ||||    
T  47811917 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatg-----------aatatgt 47812005  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47812006 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 47812055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 37239250 - 37239113
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  37239250 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 37239162  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  37239161 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 37239113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 54715046 - 54715187
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  54715046 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatg-----------aatatgt 54715134  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  54715135 gcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccat 54715187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 339
Target Start/End: Original strand, 42557589 - 42557666
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42557589 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4486741 - 4486598
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||           || ||||    
T  4486741 attatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-----------aatatgt 4486653  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccatag 420  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  4486652 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatag 4486598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14335265 - 14335173
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  14335265 ctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagatacca 14335173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 27580126 - 27580218
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27580126 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 27580218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 34835184 - 34835284
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  34835184 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaa 34835283  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  34835284 a 34835284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27398767 - 27398664
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  27398767 ctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 27398668  T
Q  362 atgt 365  Q
    ||||    
T  27398667 atgt 27398664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38547764 - 38547673
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  38547764 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 38547673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 22620604 - 22620741
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  22620604 attatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 22620692  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22620693 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattctt 22620741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 34552330 - 34552467
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  34552330 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatg-----------aatatgt 34552418  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  34552419 gcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctt 34552467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31881474 - 31881393
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  31881474 attacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 31881393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1662423 - 1662331
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  1662423 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 1662331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 49058032 - 49057933
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||  || || || |||||| ||||||||||||||    
T  49058032 ctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccatttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 393
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  303 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaa-gatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27873708 - 27873571
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| || ||||| |||||||           || ||||    
T  27873708 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatg-----------aatatgt 27873620  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27873619 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 27873571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Original strand, 49014112 - 49014190
Alignment:
Q  269 acctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  49014112 acctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 49014190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 414
Target Start/End: Original strand, 52461386 - 52461511
Alignment:
Q  278 gaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgact 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||||||||||| ||    
T  52461386 gaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 52461474  T
Q  378 aatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  52461475 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 52461511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3293183 - 3293102
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  3293183 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11972289 - 11972208
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  11972289 attacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 355
Target Start/End: Original strand, 43231510 - 43231602
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  43231510 ctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccat 43231602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 54216324 - 54216405
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  54216324 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 54216405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 46720032 - 46720124
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  46720032 ctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggatacca 46720124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 422
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344954
Alignment:
Q  335 aagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgg-taaattatccaccattcttccataggt 35344954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 33289714 - 33289851
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |  ||||||| ||||||| ||||           ||    
T  33289714 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac-----------gt 33289802  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33289803 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 33289851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 52688360 - 52688497
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| || |||||||           || || |    
T  52688360 attaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg-----------aatatat 52688448  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  52688449 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 52688497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6371413 - 6371336
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6371413 ctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagat 6371336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 573810 - 573902
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  573810 ctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 573902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 418
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049044
Alignment:
Q  364 gtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 33049044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33558102 - 33558021
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||| |||||||    
T  33558102 attatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg 33558021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17555661 - 17555617
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17555661 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259722
Alignment:
Q  360 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 48259722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 354
Target Start/End: Original strand, 27872612 - 27872678
Alignment:
Q  288 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  27872612 taatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggatacca 27872678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206609
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagat 18206609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 51981554 - 51981502
Alignment:
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  51981554 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctt 51981502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 106)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21139587 - 21139427
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21139587 ctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 21139488  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21139487 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 21139427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 31308008 - 31308164
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31308008 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31308107  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31308108 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 31308164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 43251718 - 43251874
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43251718 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43251817  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43251818 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 43251874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 45538160 - 45538316
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45538160 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45538259  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45538260 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 45538316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 3611147 - 3611299
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3611147 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 3611246  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3611247 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 3611299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 4068858 - 4068702
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4068858 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 4068759  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4068758 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 4068702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 17995126 - 17994970
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  17995126 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaa 17995027  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17995026 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 17994970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 24245200 - 24245044
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24245200 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24245101  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24245100 atgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccat 24245044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 44661977 - 44662133
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  44661977 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 44662076  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44662077 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 44662133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 25678433 - 25678278
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25678433 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 25678334  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25678333 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 25678278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 6327722 - 6327567
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6327722 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 6327623  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6327622 atgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccat 6327567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26085572 - 26085417
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  26085572 ctagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 26085474  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085473 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 26085417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 26277184 - 26277340
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26277184 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 26277283  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26277284 atttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 26277340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 38790372 - 38790216
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  38790372 ctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 38790273  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38790272 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 38790216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 5981177 - 5981333
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5981177 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5981276  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  5981277 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccat 5981333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 25058695 - 25058851
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25058695 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccacttaaaa 25058794  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25058795 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 25058851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 33112992 - 33112840
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33112992 ctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33112893  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  33112892 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 33112840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 33884095 - 33884251
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33884095 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaa 33884194  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33884195 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccat 33884251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33960157 - 33960001
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33960157 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaa 33960058  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33960057 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccat 33960001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 39646575 - 39646731
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  39646575 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccacttaaaa 39646674  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39646675 atgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 39646731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 50774228 - 50774380
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  50774228 attacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 50774327  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50774328 gcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccat 50774380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 37620366 - 37620211
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37620366 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 37620267  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37620266 tgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 37620211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 415
Target Start/End: Original strand, 36003141 - 36003290
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36003141 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 36003240  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36003241 gcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttc 36003290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 5980075 - 5980235
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  5980075 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaa 5980174  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5980175 attagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggt 5980235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 23984762 - 23984918
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23984762 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23984861  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23984862 atgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 23984918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 31040716 - 31040872
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31040716 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31040815  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  31040816 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccat 31040872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 38332034 - 38331878
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  38332034 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 38331935  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38331934 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 38331878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 41999822 - 41999978
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41999822 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaa 41999921  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41999922 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 41999978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 46784430 - 46784586
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46784430 ctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccacttaaaa 46784529  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  46784530 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccat 46784586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 47383903 - 47383755
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  47383903 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47383804  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47383803 gcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctt 47383755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 49254150 - 49253994
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  49254150 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 49254051  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49254050 atgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 49253994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 265 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 23932681 - 23932528
Alignment:
Q  265 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  23932681 gattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccacttaaaaatg 23932582  T
Q  365 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||| |||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||    
T  23932581 tgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccat 23932528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23221104 - 23220972
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23221104 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23221005  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 394  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23221004 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 23220972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 24885508 - 24885664
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24885508 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24885607  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || || |||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24885608 atatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 24885664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 26794315 - 26794467
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  26794315 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 26794414  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26794415 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 26794467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 42863872 - 42864028
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  42863872 ctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 42863971  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42863972 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 42864028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 46967216 - 46967064
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46967216 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 46967117  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  46967116 atgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctt 46967064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 47671593 - 47671749
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47671593 ctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47671692  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47671693 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 47671749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 409
Target Start/End: Original strand, 31844383 - 31844530
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31844383 ctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31844482  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccacca 409  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31844483 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 35692839 - 35692682
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaattta-cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||    
T  35692839 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgcttaaa 35692740  T
Q  361 aatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  35692739 aatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccat 35692682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26525064 - 26524908
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  26525064 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccacttaaaa 26524965  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26524964 atatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccat 26524908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 28888588 - 28888744
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28888588 ctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 28888687  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28888688 atgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccat 28888744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 36566337 - 36566493
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36566337 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 36566436  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36566437 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccat 36566493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 46616556 - 46616712
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  46616556 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 46616655  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  46616656 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 46616712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 415
Target Start/End: Original strand, 47317326 - 47317475
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  47317326 attacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 47317425  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  47317426 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttc 47317475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 3285409 - 3285564
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  3285409 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 3285507  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  3285508 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat 3285564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 47187112 - 47187264
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  47187112 ctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 47187211  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||    
T  47187212 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctt 47187264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 49399163 - 49399007
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  49399163 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccacttaaaa 49399064  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  49399063 atgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccat 49399007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 393
Target Start/End: Original strand, 25518821 - 25518952
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25518821 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 25518920  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 393  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25518921 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 35273607 - 35273759
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35273607 attatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 35273706  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  35273707 gcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccat 35273759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 51057082 - 51057234
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  51057082 attacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccacttaaaaatgt 51057181  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||  ||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  51057182 gcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccat 51057234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 48373511 - 48373658
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48373511 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 48373610  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||         ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48373611 atgtgctt---------atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 48373658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 42313540 - 42313380
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagta----atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccattt 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||    
T  42313540 ctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaataccactt 42313441  T
Q  358 aaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42313440 aaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 42313380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 51403182 - 51403036
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  51403182 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 51403084  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||         || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51403083 atgtgctt---------atatgtattggttgggataaattactcaccattcttccat 51403036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27983762 - 27983622
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||    
T  27983762 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg----------------ggataccatttaaaa 27983679  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27983678 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 27983622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 290 - 418
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450657
Alignment:
Q  290 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactgg 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  390 ttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccat 2450657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31980110 - 31979998
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31980110 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31980011  T
Q  362 atgtgcttatgtg 374  Q
    |||| ||||||||    
T  31980010 atgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 45476009 - 45475866
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  45476009 ctagattacctttgaagaatggt--------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaa 45475918  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  45475917 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccattctt 45475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 296 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045618
Alignment:
Q  296 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggga 395  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||     
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattaggg 51045638  T
Q  396 taaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  51045637 taaattacccaccattcttc 51045618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 309 - 418
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808808
Alignment:
Q  309 aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccacc 408  Q
    ||||||| |||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  409 attcttccat 418  Q
    ||||||||||    
T  4808799 attcttccat 4808808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 2657314 - 2657451
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  2657314 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 2657402  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2657403 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 2657451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 10928078 - 10928219
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  10928078 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 10928166  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10928167 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 10928219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41467792 - 41467655
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  41467792 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 41467704  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41467703 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 41467655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2557021 - 2556909
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  2557021 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 2556922  T
Q  362 atgtgcttatgtg 374  Q
    ||||| |||||||    
T  2556921 atgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 33073222 - 33073363
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  33073222 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 33073310  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33073311 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat 33073363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6626184 - 6626047
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  6626184 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 6626096  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  6626095 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 6626047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 26472339 - 26472202
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  26472339 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 26472251  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||    
T  26472250 gcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctt 26472202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 30290070 - 30289929
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||           || ||||    
T  30290070 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatg-----------aatatgt 30289982  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  30289981 gcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccat 30289929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 51155749 - 51155608
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||           || ||||    
T  51155749 attacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg-----------aatatgt 51155661  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    | |||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  51155660 gtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat 51155608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 268 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13313332 - 13313249
Alignment:
Q  268 tacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata 351  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  13313332 tacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 411
Target Start/End: Original strand, 29770681 - 29770815
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  29770681 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 29770769  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  29770770 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 29770815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 4953063 - 4953200
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  4953063 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 4953151  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4953152 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 4953200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 32448659 - 32448740
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  32448659 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 42234851 - 42234932
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  42234851 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 42234932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 305 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772191
Alignment:
Q  305 aatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacc 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||| || ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  405 caccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||    
T  47772204 caccattcttccat 47772191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 2954862 - 2954962
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  2954862 ctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaa 2954961  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  2954962 a 2954962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 26685863 - 26685955
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  26685863 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 26685955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44544206 - 44544125
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  44544206 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24649886 - 24649802
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 346  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  24649886 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27924822 - 27924730
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  27924822 ctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 27924730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39475946 - 39475843
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||    
T  39475946 ctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgg-gtcaagatagtttatggataccacctaaaa 39475848  T
Q  362 atgtg 366  Q
    |||||    
T  39475847 atgtg 39475843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683402
Alignment:
Q  267 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 48683402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4243650 - 4243521
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||| |||           || ||||    
T  4243650 attacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-----------aatatgt 4243562  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattaccca 406  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  4243561 gcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattaccca 4243521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 34752474 - 34752337
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||  | ||||| |||||||           || ||||    
T  34752474 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatg-----------aatatgt 34752386  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  34752385 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctt 34752337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13281722 - 13281641
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  13281722 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 13281641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 363
Target Start/End: Original strand, 33187347 - 33187448
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  33187347 ctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccacttaaaa 33187446  T
Q  362 at 363  Q
    ||    
T  33187447 at 33187448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 46428413 - 46428332
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  46428413 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 1388480 - 1388572
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  1388480 ctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 1388572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4156240 - 4156188
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156240 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 10920207 - 10920299
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  10920207 ctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 10920299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38716411 - 38716319
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  38716411 ctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 38716319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 39637907 - 39637996
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttc-atggatacca 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  39637907 ctagattacctatgaagaatggtgggtaatttaccc----accaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 339
Target Start/End: Original strand, 52323946 - 52324022
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  52323946 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagat 52324022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312553
Alignment:
Q  344 catggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttc 13312553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7561702 - 7561632
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaa 336  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  7561702 attacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaa 7561632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 418
Target Start/End: Original strand, 4156438 - 4156557
Alignment:
Q  306 atgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaaga-------tggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataa 398  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||       | ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  4156438 atgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 4156537  T
Q  399 attacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  4156538 attacccatcatttttccat 4156557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35991759 - 35991678
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  35991759 attacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 35991678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44293615 - 44293534
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  44293615 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44293534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 354
Target Start/End: Original strand, 52367893 - 52367982
Alignment:
Q  265 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  52367893 gattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 52367982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5961431 - 5961339
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  5961431 ctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 5961339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41895324 - 41895187
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||  |||||||| |||||||           || ||||    
T  41895324 attacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 41895236  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  41895235 gcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctt 41895187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7561589 - 7561547
Alignment:
Q  376 ctaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7561589 ctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccat 7561547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 414
Target Start/End: Original strand, 24215865 - 24215911
Alignment:
Q  368 ttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24215865 ttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 24215911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10919358 - 10919313
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaat 307  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10919358 ctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 420
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359546
Alignment:
Q  376 ctaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccatag 420  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattattccatag 39359546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 48683389 - 48683349
Alignment:
Q  378 aatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48683389 aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccat 48683349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 93)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2341836 - 2341681
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  2341836 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaa 2341737  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2341736 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 2341681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 265 - 419
Target Start/End: Original strand, 33411271 - 33411425
Alignment:
Q  265 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33411271 gattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatg 33411370  T
Q  365 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 419  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411371 tgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccata 33411425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 25894088 - 25893936
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25894088 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 25893989  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25893988 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 25893936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33423450 - 33423294
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33423450 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33423351  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33423350 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 33423294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33839890 - 33839734
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33839890 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33839791  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33839790 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 33839734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 15877558 - 15877714
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15877558 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15877657  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877658 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 15877714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33695996 - 33695840
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33695996 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33695897  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33695896 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 33695840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 35355896 - 35356052
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  35355896 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 35355995  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35355996 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 35356052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 49171537 - 49171381
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49171537 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 49171438  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  49171437 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 49171381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 262 - 419
Target Start/End: Original strand, 31586856 - 31587013
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31586856 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31586955  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 419  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31586956 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccata 31587013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 17855436 - 17855592
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  17855436 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 17855535  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17855536 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 17855592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22979822 - 22979670
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22979822 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 22979723  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    || |||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22979722 atatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 22979670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 23393226 - 23393070
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23393226 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23393127  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23393126 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 23393070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 27018124 - 27018280
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27018124 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27018223  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27018224 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 27018280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 45482666 - 45482822
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  45482666 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 45482765  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45482766 atatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 45482822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 45690268 - 45690116
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  45690268 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45690169  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45690168 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 45690116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 47067152 - 47067000
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47067152 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47067053  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  47067052 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 47067000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 47740506 - 47740350
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  47740506 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 47740407  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47740406 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 47740350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 46913117 - 46913275
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46913117 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 46913216  T
Q  362 a--tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |  |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46913217 atgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 46913275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 10028496 - 10028652
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  10028496 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 10028595  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  10028596 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccat 10028652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 20165989 - 20165833
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20165989 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 20165890  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  20165889 atgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccat 20165833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 35328240 - 35328092
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35328240 attacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 35328141  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35328140 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 35328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 37846191 - 37846035
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || |||||||||| ||||||    
T  37846191 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccacttaaaa 37846092  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37846091 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 37846035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 40670571 - 40670727
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40670571 ctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40670670  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40670671 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 40670727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389520
Alignment:
Q  275 gaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtg 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  375 actaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 36389520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 41991032 - 41990877
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  41991032 tagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaa 41990933  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41990932 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccat 41990877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 271 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183844
Alignment:
Q  271 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgctta 370  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  371 tgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 5183844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 413
Target Start/End: Original strand, 33870253 - 33870404
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33870253 ctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccatttaaaa 33870352  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattct 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33870353 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct 33870404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 43499494 - 43499649
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43499494 tagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 43499593  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    | | |||||||| | ||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43499594 tatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccat 43499649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 45063530 - 45063380
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45063530 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45063431  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||| | ||||||| |||||||||||    
T  45063430 atgtgcttatgtggctaatgtgta--tgttgaggtaaattatccaccattctt 45063380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 31625712 - 31625867
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31625712 ctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 31625811  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  31625812 atgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccat 31625867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 48609852 - 48609696
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  48609852 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaa 48609753  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  48609752 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccat 48609696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 19563455 - 19563611
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  19563455 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 19563554  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  19563555 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccat 19563611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26579888 - 26579736
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  26579888 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 26579789  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    | ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26579788 gtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 26579736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 33332797 - 33332948
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33332797 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 33332895  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    || |||||||| | |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  33332896 atatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctt 33332948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 33720211 - 33720070
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33720211 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33720112  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattac 403  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  33720111 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 279 - 418
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447001
Alignment:
Q  279 aatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgacta 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  379 atgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  29446963 atgtgtattggtt-ggagtaattacccaccattcttccat 29447001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 266 - 411
Target Start/End: Original strand, 5712180 - 5712325
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5712180 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 5712279  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  5712280 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 5712325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 35757195 - 35757039
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  35757195 ctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 35757097  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt-gggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35757096 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccat 35757039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 10618306 - 10618455
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  10618306 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-------gatagttcatgaataccacttaaaa 10618398  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618399 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 10618455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31429650 - 31429498
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  31429650 ctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccacttaaaa 31429551  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||||| || |||||||    
T  31429550 atgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctt 31429498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 35767489 - 35767638
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||       | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35767489 ctagattacctttgaagaatggtgggta-------ccccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 35767581  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| |||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35767582 atgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 35767638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 272 - 413
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564497
Alignment:
Q  272 tttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttat 371  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  372 gtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattct 413  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 300 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233959
Alignment:
Q  300 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaa 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  400 ttacccaccattctt 414  Q
     |||||||| |||||    
T  28233973 ctacccacctttctt 28233959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 306 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076546
Alignment:
Q  306 atgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattaccc 405  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||  ||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  406 accattcttccat 418  Q
    | |||||||||||    
T  30076558 atcattcttccat 30076546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 35752194 - 35752057
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  35752194 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 35752106  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35752105 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 35752057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 321 - 419
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904370
Alignment:
Q  321 ttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccata 419  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccata 41904370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 46817581 - 46817444
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  46817581 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 46817493  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  46817492 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 46817444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 43489230 - 43489367
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  43489230 attacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 43489318  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  43489319 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 43489367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16482947 - 16482855
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16482947 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggatacca 16482855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 26941692 - 26941555
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  26941692 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 26941604  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  26941603 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctt 26941555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 36817005 - 36816868
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  36817005 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 36816917  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  36816916 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctt 36816868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 37127949 - 37128086
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||           |||| ||||    
T  37127949 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgt 37128037  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  37128038 gcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 37128086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 45502980 - 45502835
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||           ||||||||||||||    
T  45502980 ctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaa-----------gataccatttaaaa 45502892  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||  ||||||| || |||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  45502891 atatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccat 45502835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 48085870 - 48086007
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  48085870 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 48085958  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  48085959 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 48086007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Original strand, 29863024 - 29863115
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  29863024 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggatacca 29863115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 32556766 - 32556640
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||| |||||||           || ||||    
T  32556766 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg-----------aatatgt 32556678  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattac 403  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32556677 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 498348 - 498211
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  498348 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 498260  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  498259 gcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctt 498211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 7876488 - 7876351
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  7876488 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 7876400  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7876399 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 7876351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24923184 - 24923055
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||           || ||||    
T  24923184 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-----------aatatgt 24923096  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattaccca 406  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  24923095 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 24923055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 41855071 - 41855212
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||           |||| || |    
T  41855071 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca-----------taaatatat 41855159  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41855160 gcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccat 41855212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 46898176 - 46898035
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||||| |||           |||    
T  46898176 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgt 46898088  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46898087 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 46898035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 24228553 - 24228634
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  24228553 attacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 24228634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25037668 - 25037587
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  25037668 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg 25037587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 346
Target Start/End: Original strand, 29098763 - 29098843
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 346  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  29098763 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 29098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 44003530 - 44003442
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44003530 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 44003442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 418
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405512
Alignment:
Q  318 aatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttcca 417  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  418 t 418  Q
    |    
T  44405512 t 44405512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 2332031 - 2332172
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  2332031 attatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 2332119  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||  || |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  2332120 gcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccat 2332172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 26371061 - 26371198
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  26371061 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 26371149  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  26371150 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctt 26371198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 29610647 - 29610728
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||    
T  29610647 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg 29610728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 39323628 - 39323709
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  39323628 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39323709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39453635 - 39453562
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  39453635 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 39453562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 39866677 - 39866758
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  39866677 attacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47906919 - 47906838
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  47906919 attacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 47906838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 33393336 - 33393428
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  33393336 ctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 33393428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 406
Target Start/End: Original strand, 21718129 - 21718258
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  21718129 attacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 21718217  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattaccca 406  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  21718218 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 21718258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 44659856 - 44659936
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  44659856 attacctttgaagaatggtg-gtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 44659936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 7257389 - 7257481
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  7257389 ctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 7257481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15644110 - 15644018
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  15644110 ctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatacca 15644018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 322
Target Start/End: Original strand, 35557739 - 35557798
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 322  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557739 tagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47460935 - 47460844
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  47460935 tagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 47460844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30077100 - 30077043
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaa 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30077100 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 33455108 - 33455189
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  33455108 attacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 33455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 35484648 - 35484730
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  35484648 attatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 35484730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 45237693 - 45237556
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||  ||||||           || ||||    
T  45237693 attacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatg-----------aatatgt 45237605  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  45237604 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctt 45237556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 46103133 - 46103213
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  46103133 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 46103213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448508
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||  |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  366 g 366  Q
    |    
T  38448508 g 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 35823302 - 35823353
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagc 317  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35823302 attaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7720664 - 7720575
Alignment:
Q  265 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| | | | | || ||||| ||||||||||||||    
T  7720664 gattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggatacca 7720575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 39453557 - 39453505
Alignment:
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39453557 atgtgtttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctt 39453505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443674
Alignment:
Q  294 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagatacca 37443674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 352
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456207
Alignment:
Q  302 accaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatac 352  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatac 26456207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21649542 - 21649450
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaa-tggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||  |  |||||||||||||||||||||| || || || | ||||| ||| ||||||||||    
T  21649542 tagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttattagtagatttaagatagtttatggatacca 21649450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 108)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 40131134 - 40130974
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40131134 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40131035  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40131034 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 40130974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 41464359 - 41464515
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41464359 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41464458  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  41464459 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccat 41464515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 47257800 - 47257956
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  47257800 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 47257899  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47257900 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 47257956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7855289 - 7855133
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  7855289 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccacttaaaa 7855190  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7855189 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 7855133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 51170207 - 51170052
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  51170207 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 51170108  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51170107 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 51170052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 29626002 - 29625849
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29626002 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 29625903  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    || ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29625902 atatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 29625849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27067153 - 27066997
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  27067153 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 27067054  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27067053 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccat 27066997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 38416899 - 38416743
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38416899 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 38416800  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38416799 atgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 38416743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 42291849 - 42292009
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||    
T  42291849 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttgaaa 42291948  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42291949 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggt 42292009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 43125838 - 43125990
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43125838 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43125937  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43125938 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 43125990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 43612222 - 43612066
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43612222 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43612123  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43612122 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 43612066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 49330044 - 49330200
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49330044 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 49330143  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  49330144 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccat 49330200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 52628961 - 52629117
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52628961 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 52629060  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  52629061 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 52629117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 47809768 - 47809615
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  47809768 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47809669  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggtt-gggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47809668 gtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccat 47809615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Original strand, 52215083 - 52215236
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52215083 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 52215182  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  52215183 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttc 52215236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 18946910 - 18947066
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18946910 ctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagttaaaa 18947009  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18947010 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccat 18947066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 20754564 - 20754412
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  20754564 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatat 20754465  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20754464 gtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccat 20754412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 22399104 - 22399259
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||    
T  22399104 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccactt-aaa 22399202  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22399203 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 22399259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 24100290 - 24100445
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  24100290 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 24100388  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24100389 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 24100445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28048563 - 28048411
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28048563 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 28048464  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||    
T  28048463 gcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccat 28048411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 40643811 - 40643963
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  40643811 attatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcatttaaaaatgt 40643910  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40643911 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 40643963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 43183919 - 43184079
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43183919 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaaaa 43184018  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43184019 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggt 43184079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 55453419 - 55453259
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  55453419 ctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 55453320  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  55453319 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggt 55453259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 35748485 - 35748330
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35748485 tagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 35748386  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35748385 tatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccat 35748330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 2666007 - 2666159
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2666007 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2666106  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||    
T  2666107 ctgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctt 2666159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32234572 - 32234417
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  32234572 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 32234474  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  32234473 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccat 32234417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 37313406 - 37313562
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  37313406 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 37313505  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37313506 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 37313562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 40419842 - 40419994
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40419842 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40419941  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  40419942 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctt 40419994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 278 - 418
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126150
Alignment:
Q  278 gaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgact 377  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  378 aatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 46126150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 48739408 - 48739252
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48739408 ctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaa 48739309  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48739308 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 48739252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 51452925 - 51452769
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  51452925 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 51452826  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  51452825 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat 51452769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 264 - 418
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609886
Alignment:
Q  264 agattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 363  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  364 gtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccat 48609886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 51102553 - 51102399
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  51102553 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 51102454  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttcc 416  Q
    ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51102453 atgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttcc 51102399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 411
Target Start/End: Original strand, 39053401 - 39053550
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39053401 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39053500  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  39053501 atgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatt 39053550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 37324552 - 37324704
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  37324552 attacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatat 37324651  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37324652 atttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 37324704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 39634746 - 39634591
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  39634746 ctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccacttaaaa 39634648  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39634647 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccat 39634591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 263 - 422
Target Start/End: Original strand, 43021722 - 43021882
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-ggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  43021722 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 43021821  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43021822 atgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggt 43021882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 44806691 - 44806843
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44806691 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaa 44806790  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   ||||||| |||| ||||||    
T  44806791 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctt 44806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Original strand, 46134363 - 46134515
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46134363 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 46134462  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||    
T  46134463 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctt 46134515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 53832659 - 53832503
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  53832659 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaattaaaa 53832560  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    | | ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  53832559 aggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 53832503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 53943762 - 53943606
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53943762 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 53943663  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || | |||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53943662 atatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 53943606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 35594129 - 35594284
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  35594129 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 35594228  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    | |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35594229 tatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccat 35594284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 412
Target Start/End: Original strand, 24376580 - 24376730
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24376580 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 24376679  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattc 412  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  24376680 atgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7755481 - 7755326
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||    
T  7755481 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccactt-aaa 7755383  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7755382 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccat 7755326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 40804685 - 40804529
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40804685 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 40804586  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  40804585 atgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccat 40804529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Original strand, 44222840 - 44222992
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  44222840 attacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccacttaaaaatgt 44222939  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44222940 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 44222992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 423
Target Start/End: Original strand, 36368946 - 36369106
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36368946 ctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 36369045  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggtg 423  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36369046 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgggtg 36369106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 41293493 - 41293341
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||| || |||    
T  41293493 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccactt-aaa 41293395  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41293394 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttc 41293341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 41216462 - 41216622
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  41216462 ctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccacttaaaa 41216561  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41216562 atgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggt 41216622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 41732535 - 41732691
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41732535 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41732634  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41732635 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccat 41732691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5560207 - 5560044
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaat-----gagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  5560207 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccact 5560108  T
Q  357 taaaaatgtgcttatgtgac--taatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5560107 taaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccat 5560044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 46949382 - 46949536
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46949382 ctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 46949480  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46949481 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccat 46949536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 47894994 - 47894839
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47894994 tagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 47894895  T
Q  363 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| | ||||| | |||||||||||||||    
T  47894894 tgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccat 47894839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 404
Target Start/End: Original strand, 53637848 - 53637990
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  53637848 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccacttaaaa 53637947  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacc 404  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||    
T  53637948 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 262 - 411
Target Start/End: Original strand, 52638849 - 52638998
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  52638849 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccacttaaaa 52638948  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccatt 411  Q
    |||||||| |||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  52638949 atgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccatt 52638998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54159163 - 54159051
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54159163 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccacttaaaa 54159064  T
Q  362 atgtgcttatgtg 374  Q
    |||||||||||||    
T  54159063 atgtgcttatgtg 54159051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 51146390 - 51146238
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51146390 ctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 51146291  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    || |||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  51146290 atttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctt 51146238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 401
Target Start/End: Original strand, 37758936 - 37759075
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  37758936 ctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccacttaaaa 37759035  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 401  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  37759036 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48547004 - 48546894
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  48547004 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaa-atagttcatggataccacttaaaa 48546907  T
Q  362 atgtgcttatgtg 374  Q
    |||||||||||||    
T  48546906 atgtgcttatgtg 48546894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 25641657 - 25641794
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||           |||| ||||    
T  25641657 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgt 25641745  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25641746 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 25641794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 34279881 - 34279744
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  34279881 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 34279793  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34279792 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 34279744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 42589841 - 42589978
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  42589841 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 42589929  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42589930 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 42589978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 54401198 - 54401335
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  54401198 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 54401286  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  54401287 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 54401335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 54707380 - 54707243
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  54707380 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 54707292  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  54707291 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 54707243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 39141286 - 39141147
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||         | ||||    
T  39141286 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat---------atatgt 39141196  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  39141195 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctt 39141147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41882155 - 41882055
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  41882155 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaa 41882056  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  41882055 a 41882055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 53115454 - 53115554
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  53115454 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 53115553  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  53115554 a 53115554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 415
Target Start/End: Original strand, 49130589 - 49130727
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||           || ||||    
T  49130589 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 49130677  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49130678 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 49130727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 315 - 418
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864652
Alignment:
Q  315 agcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgag-taaattacccaccattctt 52864648  T
Q  415 ccat 418  Q
    ||||    
T  52864649 ccat 52864652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 37028734 - 37028871
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||           || ||||    
T  37028734 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatg-----------aatatgt 37028822  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37028823 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 37028871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 38156792 - 38156655
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  38156792 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 38156704  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  38156703 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 38156655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 51415980 - 51416117
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||           ||||    
T  51415980 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat-----------atgt 51416068  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  51416069 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctt 51416117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21597312 - 21597220
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  21597312 ctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 21597220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 322 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550486
Alignment:
Q  322 tgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 33550486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 48726158 - 48726062
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 362  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  48726158 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggataccatctaaaaa 48726062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 55379992 - 55380084
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  55379992 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 55380084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31286953 - 31286816
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  31286953 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 31286865  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| || |||||||    
T  31286864 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctt 31286816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41635960 - 41635823
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  41635960 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 41635872  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||    
T  41635871 gcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctt 41635823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50732077 - 50731979
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  50732077 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaa 50731979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 361
Target Start/End: Original strand, 50780779 - 50780877
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  50780779 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaa 50780877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 55000338 - 55000201
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||||| |||||||           || ||||    
T  55000338 attaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 55000250  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  55000249 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 55000201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17665684 - 17665603
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  17665684 attacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 17665603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 45058894 - 45058975
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  45058894 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 45058975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 304 - 385
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182130
Alignment:
Q  304 caatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgta 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgta 47182130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47511100 - 47511019
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  47511100 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 47511019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 25353561 - 25353653
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  25353561 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 25353653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28576276 - 28576176
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  28576276 ctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaa 28576177  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  28576176 a 28576176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Original strand, 51143825 - 51143916
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  51143825 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggatacca 51143916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 264 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402810
Alignment:
Q  264 agattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 363  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T
Q  364 gtg 366  Q
    |||    
T  47402812 gtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 51224197 - 51224061
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  51224197 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 51224110  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51224109 gcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattctt 51224061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 30251665 - 30251573
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  30251665 ctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 30251573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42998952 - 42998861
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  42998952 ctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 42998861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 24688125 - 24688262
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  24688125 attacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 24688213  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  24688214 gtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctt 24688262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 40022085 - 40022222
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  40022085 attacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 40022173  T
Q  366 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  40022174 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctt 40022222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 44946089 - 44946016
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  44946089 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 44946016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2228099 - 2227995
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||| || || |||    
T  2228099 ctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcacttcaaa 2228000  T
Q  362 atgtg 366  Q
    |||||    
T  2227999 atgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43176902 - 43176810
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  43176902 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggatacca 43176810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 330
Target Start/End: Original strand, 48752093 - 48752160
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  48752093 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtgg 48752160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 330
Target Start/End: Original strand, 52434146 - 52434215
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg 330  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  52434146 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgg 52434215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429242
Alignment:
Q  350 taccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccataggt 422  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggt 30429242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 354
Target Start/End: Original strand, 40165683 - 40165750
Alignment:
Q  287 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40165683 gtaatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 40165750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 366
Target Start/End: Original strand, 41609099 - 41609178
Alignment:
Q  287 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 366  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||| |  ||||||||||    
T  41609099 gtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg 41609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8847818 - 8847718
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 365  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||  |||| || ||||| | |||||| ||||||||||    
T  8847818 attacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccacttaaaaatgt 8847719  T
Q  366 g 366  Q
    |    
T  8847718 g 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 307
Target Start/End: Original strand, 37741443 - 37741487
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaat 307  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37741443 tagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 352
Target Start/End: Original strand, 177169 - 177258
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatac 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||| |||||||  |||||||  || ||||||||    
T  177169 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatac 177258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52756207 - 52756150
Alignment:
Q  290 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  52756207 atttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 52756150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 48534082 - 48534030
Alignment:
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  48534082 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctt 48534030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 51942580 - 51942543
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51942580 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccac 51942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 39731 - 39575
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39731 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39632  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39631 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 39575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 13937 - 13781
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13937 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 13838  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13837 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat 13781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Original strand, 1876 - 2032
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1876 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 1975  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1976 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat 2032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11307 - 11152
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11307 ctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 11209  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11208 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 11152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 75419 - 75263
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  75419 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccacttaaaa 75320  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  75319 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccat 75263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 278014 - 278171
Alignment:
Q  263 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata--ccatttaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||    
T  278014 tagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccccacttaaa 278113  T
Q  361 aatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278114 aatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 278171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 267 - 415
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176814
Alignment:
Q  267 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  367 cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 176814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 19029 - 18873
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  19029 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaa 18930  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  18929 atgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccat 18873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2451
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2607 ctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2508  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  2507 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccat 2451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 409
Target Start/End: Original strand, 32568 - 32715
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32568 ctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccatttaaaa 32667  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccacca 409  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32668 atgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 297 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 4736 - 4615
Alignment:
Q  297 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggat 396  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  4736 caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggat 4637  T
Q  397 aaattacccaccattcttccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4636 aaattacccaccattcttccat 4615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Original strand, 3095 - 3239
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3095 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcacttaaaa 3185  T
Q  362 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattcttc 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3186 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttc 3239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 109 - 201
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  109 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaatacca 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 414
Target Start/End: Original strand, 7101 - 7239
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || |||    
T  7101 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatg 7189  T
Q  365 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattacccaccattctt 414  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7190 tgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctt 7239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4719 - 4618
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaa 360  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4719 ctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaa 4620  T
Q  361 aa 362  Q
    ||    
T  4619 aa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 3399 - 3500
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaa 360  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3399 ctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaa 3498  T
Q  361 aa 362  Q
    ||    
T  3499 aa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 14751 - 14843
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  14751 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 14843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20641 - 20549
Alignment:
Q  262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  20641 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 20549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 336
Target Start/End: Original strand, 17917 - 17987
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaa 336  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||    
T  17917 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaa 17987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19301
Alignment:
Q  266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 339  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagat 19301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University