View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1399_low_31 (Length: 369)

Name: NF1399_low_31
Description: NF1399
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1399_low_31
NF1399_low_31
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (39-358)||(36769473-36769793)
chr7 (44-358)||(47953066-47953381)
chr7 (40-358)||(10932461-10932780)
chr7 (44-358)||(26994129-26994444)
chr7 (43-358)||(3922607-3922923)
chr7 (43-358)||(11321789-11322105)
chr7 (51-358)||(18470567-18470873)
chr7 (46-358)||(43158590-43158903)
chr7 (42-358)||(46633571-46633883)
chr7 (39-358)||(18386396-18386715)
chr7 (46-358)||(21784749-21785062)
chr7 (40-342)||(43189162-43189466)
chr7 (45-339)||(32873692-32873987)
chr7 (55-358)||(26371713-26372017)
chr7 (51-358)||(41211104-41211413)
chr7 (45-358)||(30849150-30849464)
chr7 (45-344)||(1870011-1870312)
chr7 (42-358)||(43368076-43368392)
chr7 (42-353)||(40753044-40753341)
chr7 (100-348)||(29661255-29661504)
chr7 (45-358)||(47316602-47316901)
chr7 (51-294)||(3891994-3892238)
chr7 (42-331)||(30598939-30599229)
chr7 (51-340)||(329354-329643)
chr7 (43-350)||(23349203-23349510)
chr7 (51-344)||(34295329-34295615)
chr7 (42-358)||(9913400-9913715)
chr7 (42-358)||(9927088-9927403)
chr7 (41-358)||(48894591-48894908)
chr7 (42-358)||(38301223-38301533)
chr7 (104-358)||(11250558-11250808)
chr7 (132-355)||(44748660-44748883)
chr7 (68-342)||(1363538-1363811)
chr7 (52-355)||(11822116-11822411)
chr7 (51-344)||(20127171-20127466)
chr7 (44-233)||(47947636-47947826)
chr7 (102-358)||(43213829-43214085)
chr7 (50-358)||(48445404-48445712)
chr7 (54-344)||(22724449-22724739)
chr7 (43-296)||(46408771-46409021)
chr7 (45-358)||(21133248-21133563)
chr7 (51-358)||(37966858-37967165)
chr7 (45-358)||(26910314-26910624)
chr7 (51-344)||(22723950-22724243)
chr7 (51-266)||(26652750-26652965)
chr7 (126-358)||(17237035-17237267)
chr7 (126-352)||(46448554-46448780)
chr7 (203-358)||(16963174-16963329)
chr7 (114-297)||(34117399-34117581)
chr7 (43-165)||(12982178-12982301)
chr7 (114-296)||(15035219-15035401)
chr7 (51-269)||(41665568-41665786)
chr7 (186-355)||(34519527-34519696)
chr7 (42-208)||(16962986-16963149)
chr7 (44-282)||(22631609-22631853)
chr7 (132-256)||(46627135-46627259)
chr7 (262-358)||(26700572-26700668)
chr7 (103-269)||(48699334-48699500)
chr7 (102-333)||(29455778-29456006)
chr7 (126-277)||(29372764-29372915)
chr7 (142-358)||(21408531-21408745)
chr7 (123-249)||(35645403-35645529)
chr7 (102-323)||(2048887-2049107)
chr7 (262-326)||(3359773-3359837)
chr7 (310-358)||(3891946-3891994)
chr7 (44-92)||(34117349-34117397)
chr7 (100-170)||(47442769-47442840)
chr7 (167-245)||(42332059-42332137)
chr7 (126-231)||(30259938-30260043)
chr7 (287-344)||(41665516-41665573)
chr7 (177-214)||(8453285-8453322)
chr7 (46-79)||(17237005-17237038)
chr7 (143-216)||(29992741-29992813)
chr7 (129-185)||(8453204-8453260)
chr7 (271-339)||(16027850-16027918)
chr7 (149-213)||(41903603-41903667)
[»] chr1 (87 HSPs)
chr1 (40-358)||(844702-845021)
chr1 (40-358)||(42510402-42510721)
chr1 (33-358)||(41972782-41973107)
chr1 (43-355)||(28340284-28340597)
chr1 (42-358)||(35387289-35387606)
chr1 (45-358)||(45490853-45491167)
chr1 (43-358)||(1351413-1351728)
chr1 (42-358)||(6711024-6711342)
chr1 (43-358)||(16386734-16387050)
chr1 (45-358)||(16451009-16451323)
chr1 (45-344)||(12890120-12890420)
chr1 (45-358)||(32270240-32270549)
chr1 (45-358)||(51264377-51264691)
chr1 (42-357)||(7183797-7184113)
chr1 (38-358)||(44738020-44738340)
chr1 (44-342)||(17887828-17888128)
chr1 (45-342)||(50540226-50540524)
chr1 (94-358)||(30105658-30105923)
chr1 (45-355)||(24339619-24339929)
chr1 (94-358)||(26118193-26118458)
chr1 (38-334)||(16476157-16476453)
chr1 (51-358)||(31004021-31004328)
chr1 (51-358)||(50304540-50304847)
chr1 (46-358)||(17327627-17327940)
chr1 (44-358)||(16437259-16437558)
chr1 (44-358)||(41967827-41968142)
chr1 (40-333)||(39281772-39282065)
chr1 (51-355)||(42512751-42513052)
chr1 (42-354)||(6029283-6029595)
chr1 (44-358)||(51703142-51703455)
chr1 (81-358)||(32289322-32289600)
chr1 (43-358)||(46154780-46155103)
chr1 (51-358)||(11772610-11772917)
chr1 (44-358)||(1601049-1601367)
chr1 (44-344)||(26764787-26765082)
chr1 (61-358)||(15539868-15540165)
chr1 (51-342)||(38086990-38087281)
chr1 (107-351)||(49303339-49303583)
chr1 (51-343)||(10384256-10384548)
chr1 (102-358)||(45658761-45659017)
chr1 (45-342)||(3414847-3415146)
chr1 (132-342)||(42705231-42705442)
chr1 (46-358)||(6143964-6144276)
chr1 (46-344)||(5109614-5109910)
chr1 (42-355)||(16704605-16704919)
chr1 (42-282)||(25539735-25539975)
chr1 (51-257)||(38663021-38663227)
chr1 (45-344)||(13994067-13994366)
chr1 (91-317)||(20494927-20495137)
chr1 (131-342)||(50382394-50382608)
chr1 (42-247)||(34663821-34664012)
chr1 (178-358)||(7837149-7837329)
chr1 (57-322)||(570281-570549)
chr1 (114-331)||(25343213-25343431)
chr1 (251-358)||(8838986-8839093)
chr1 (102-333)||(504394-504625)
chr1 (51-206)||(8838827-8838987)
chr1 (133-356)||(6771338-6771562)
chr1 (283-358)||(38663228-38663303)
chr1 (163-285)||(46447665-46447787)
chr1 (262-358)||(7837474-7837570)
chr1 (275-358)||(21071727-21071810)
chr1 (54-165)||(21071621-21071727)
chr1 (132-247)||(32467910-32468025)
chr1 (186-323)||(26733579-26733716)
chr1 (114-240)||(34283912-34284040)
chr1 (121-341)||(2761551-2761770)
chr1 (203-270)||(23799603-23799670)
chr1 (181-332)||(39792826-39792977)
chr1 (114-206)||(15324109-15324201)
chr1 (159-249)||(46815816-46815906)
chr1 (42-87)||(30105915-30105960)
chr1 (179-323)||(40610739-40610883)
chr1 (43-87)||(26118450-26118494)
chr1 (51-130)||(23799670-23799749)
chr1 (107-209)||(49799322-49799424)
chr1 (104-192)||(7836542-7836630)
chr1 (155-246)||(16643272-16643361)
chr1 (302-358)||(40811349-40811405)
chr1 (107-211)||(52030330-52030434)
chr1 (251-341)||(8780601-8780690)
chr1 (195-341)||(17291612-17291757)
chr1 (262-340)||(33316499-33316577)
chr1 (114-172)||(47093006-47093064)
chr1 (222-323)||(30798605-30798705)
chr1 (127-203)||(30798824-30798900)
chr1 (261-325)||(35335799-35335863)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (42-358)||(45446325-45446642)
chr8 (39-358)||(27103826-27104146)
chr8 (45-357)||(32019920-32020233)
chr8 (42-358)||(41709647-41709964)
chr8 (43-358)||(34101379-34101695)
chr8 (42-358)||(34062998-34063315)
chr8 (42-344)||(29563158-29563461)
chr8 (42-358)||(8672973-8673290)
chr8 (42-358)||(31513501-31513818)
chr8 (43-358)||(29672241-29672557)
chr8 (43-355)||(3251577-3251890)
chr8 (40-358)||(6386444-6386763)
chr8 (94-355)||(4052404-4052664)
chr8 (68-342)||(5968798-5969073)
chr8 (42-358)||(25478118-25478430)
chr8 (46-358)||(7394732-7395045)
chr8 (45-344)||(13406867-13407167)
chr8 (43-358)||(31731935-31732237)
chr8 (94-358)||(37664201-37664466)
chr8 (51-358)||(12753243-12753550)
chr8 (42-358)||(37618310-37618626)
chr8 (94-358)||(30542940-30543205)
chr8 (82-358)||(7591365-7591641)
chr8 (102-358)||(10466995-10467251)
chr8 (42-358)||(40388911-40389227)
chr8 (42-358)||(22999128-22999445)
chr8 (51-358)||(15001346-15001653)
chr8 (45-358)||(17805563-17805878)
chr8 (43-269)||(32303592-32303819)
chr8 (102-358)||(41548549-41548805)
chr8 (51-358)||(39642763-39643070)
chr8 (45-331)||(45113929-45114215)
chr8 (38-334)||(14004986-14005268)
chr8 (40-358)||(35225531-35225849)
chr8 (42-358)||(30501016-30501332)
chr8 (102-358)||(29610973-29611229)
chr8 (51-358)||(37474599-37474887)
chr8 (178-341)||(37861866-37862029)
chr8 (43-358)||(17520468-17520781)
chr8 (109-358)||(16485727-16485976)
chr8 (56-358)||(16595068-16595369)
chr8 (124-331)||(10656631-10656838)
chr8 (163-358)||(21272676-21272854)
chr8 (129-323)||(10320232-10320424)
chr8 (60-333)||(6460152-6460417)
chr8 (84-285)||(27109532-27109735)
chr8 (117-323)||(54117-54322)
chr8 (126-324)||(10932691-10932888)
chr8 (186-342)||(22756345-22756501)
chr8 (287-356)||(32303528-32303597)
chr8 (51-135)||(21272592-21272676)
chr8 (94-155)||(37861803-37861865)
chr8 (42-155)||(37861766-37861865)
chr8 (306-358)||(38047481-38047533)
chr8 (40-111)||(955102-955173)
chr8 (176-324)||(36426201-36426347)
chr8 (128-211)||(32918842-32918925)
chr8 (150-331)||(11944854-11945035)
chr8 (102-215)||(28746254-28746367)
chr8 (43-87)||(4052368-4052412)
chr8 (160-240)||(14958948-14959027)
chr8 (116-215)||(5859533-5859632)
chr8 (114-172)||(9624180-9624239)
chr8 (150-213)||(11926893-11926956)
chr8 (121-212)||(15351686-15351776)
chr8 (45-87)||(30543197-30543239)
chr8 (46-87)||(37664458-37664499)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (54-358)||(9732833-9733138)
chr2 (43-358)||(34338681-34338997)
chr2 (41-358)||(18685705-18686023)
chr2 (43-358)||(35114656-35114972)
chr2 (40-358)||(2644990-2645308)
chr2 (46-344)||(17540588-17540888)
chr2 (42-344)||(32497785-32498088)
chr2 (40-344)||(5278751-5279056)
chr2 (43-358)||(37308527-37308842)
chr2 (43-358)||(30326235-30326550)
chr2 (43-358)||(33366481-33366797)
chr2 (45-355)||(42706231-42706543)
chr2 (43-358)||(44284508-44284816)
chr2 (45-358)||(19513592-19513906)
chr2 (40-344)||(16104142-16104447)
chr2 (46-344)||(30798405-30798703)
chr2 (68-358)||(7258792-7259084)
chr2 (45-358)||(39461187-39461501)
chr2 (42-358)||(33889128-33889430)
chr2 (43-358)||(40692176-40692484)
chr2 (46-358)||(2085946-2086249)
chr2 (132-358)||(7761476-7761702)
chr2 (51-358)||(42365456-42365764)
chr2 (43-358)||(4641387-4641701)
chr2 (42-355)||(3913366-3913679)
chr2 (56-358)||(28824460-28824762)
chr2 (42-342)||(16177802-16178100)
chr2 (42-358)||(6896040-6896355)
chr2 (43-342)||(40832388-40832692)
chr2 (108-344)||(32766421-32766658)
chr2 (42-273)||(37003856-37004089)
chr2 (141-340)||(12672395-12672594)
chr2 (42-358)||(10399773-10400084)
chr2 (42-285)||(26418793-26419037)
chr2 (45-358)||(38992974-38993284)
chr2 (51-360)||(27462703-27463010)
chr2 (51-358)||(11114752-11115057)
chr2 (46-342)||(30712732-30713031)
chr2 (55-338)||(8112189-8112468)
chr2 (51-358)||(13829318-13829613)
chr2 (44-269)||(9717113-9717322)
chr2 (39-358)||(26981612-26981912)
chr2 (45-216)||(18793306-18793478)
chr2 (89-286)||(12939275-12939474)
chr2 (200-357)||(38623208-38623365)
chr2 (65-274)||(1247049-1247250)
chr2 (182-351)||(41366020-41366189)
chr2 (252-358)||(18793196-18793300)
chr2 (114-259)||(45463112-45463256)
chr2 (278-358)||(37863269-37863349)
chr2 (55-339)||(41934465-41934749)
chr2 (45-246)||(20907468-20907664)
chr2 (101-294)||(35472967-35473160)
chr2 (287-358)||(9717317-9717388)
chr2 (116-274)||(37088218-37088376)
chr2 (187-331)||(40876554-40876697)
chr2 (294-358)||(37003794-37003858)
chr2 (40-119)||(12672596-12672674)
chr2 (195-321)||(15303180-15303306)
chr2 (115-325)||(26796173-26796382)
chr2 (116-240)||(13249421-13249545)
chr2 (260-326)||(6453249-6453315)
chr2 (305-358)||(12939221-12939274)
chr2 (277-342)||(45463042-45463107)
chr2 (142-289)||(38786503-38786647)
chr2 (195-334)||(18278926-18279064)
chr2 (176-341)||(16062014-16062178)
chr2 (148-206)||(31148786-31148844)
chr2 (260-315)||(12217650-12217706)
[»] chr4 (110 HSPs)
chr4 (40-358)||(23521751-23522070)
chr4 (40-358)||(24002209-24002529)
chr4 (42-358)||(29785433-29785750)
chr4 (42-344)||(56154494-56154797)
chr4 (51-355)||(55065231-55065536)
chr4 (43-358)||(20802427-20802743)
chr4 (43-358)||(49151996-49152311)
chr4 (43-355)||(21579900-21580213)
chr4 (42-358)||(38486153-38486465)
chr4 (43-358)||(37865627-37865943)
chr4 (43-344)||(52319200-52319499)
chr4 (44-358)||(12600761-12601076)
chr4 (43-355)||(21202614-21202926)
chr4 (42-344)||(33176942-33177245)
chr4 (42-356)||(9512238-9512553)
chr4 (46-358)||(55593759-55594075)
chr4 (42-342)||(36743600-36743901)
chr4 (51-358)||(52949604-52949910)
chr4 (40-357)||(20694247-20694560)
chr4 (51-358)||(50178388-50178696)
chr4 (45-358)||(6776460-6776768)
chr4 (94-343)||(24210243-24210494)
chr4 (94-355)||(33552741-33553003)
chr4 (40-355)||(36885817-36886119)
chr4 (81-358)||(20517918-20518196)
chr4 (59-344)||(54542881-54543165)
chr4 (94-358)||(1231236-1231501)
chr4 (106-358)||(2725029-2725281)
chr4 (51-344)||(34929797-34930091)
chr4 (39-274)||(43640969-43641205)
chr4 (55-358)||(44649060-44649361)
chr4 (42-357)||(47642388-47642703)
chr4 (42-358)||(9807030-9807345)
chr4 (51-358)||(3649519-3649826)
chr4 (94-358)||(29616095-29616356)
chr4 (114-358)||(50727809-50728054)
chr4 (114-358)||(50735823-50736068)
chr4 (46-358)||(42869859-42870161)
chr4 (102-358)||(44324238-44324494)
chr4 (107-358)||(46680406-46680658)
chr4 (132-355)||(38812484-38812707)
chr4 (42-358)||(29592774-29593085)
chr4 (100-342)||(36497148-36497391)
chr4 (51-358)||(50186411-50186718)
chr4 (94-358)||(47361310-47361570)
chr4 (102-341)||(32181197-32181436)
chr4 (40-358)||(2786836-2787154)
chr4 (109-351)||(4325731-4325974)
chr4 (103-358)||(11055977-11056232)
chr4 (54-325)||(37695470-37695741)
chr4 (127-344)||(41711806-41712023)
chr4 (39-330)||(7554881-7555172)
chr4 (45-358)||(53200539-53200858)
chr4 (51-358)||(22318280-22318587)
chr4 (103-358)||(39078596-39078851)
chr4 (55-344)||(16320408-16320695)
chr4 (175-358)||(50729438-50729621)
chr4 (65-344)||(26083235-26083515)
chr4 (187-358)||(2629847-2630018)
chr4 (46-268)||(37931798-37932020)
chr4 (43-219)||(14296471-14296648)
chr4 (43-219)||(14314719-14314896)
chr4 (51-355)||(30942671-30942976)
chr4 (158-344)||(28115243-28115427)
chr4 (102-269)||(23327850-23328020)
chr4 (222-358)||(6973809-6973945)
chr4 (51-289)||(13110211-13110448)
chr4 (212-342)||(42772832-42772962)
chr4 (62-292)||(7001748-7001976)
chr4 (246-355)||(14296645-14296754)
chr4 (246-355)||(14314893-14315002)
chr4 (102-277)||(43739395-43739570)
chr4 (186-323)||(9947947-9948084)
chr4 (201-328)||(25978538-25978664)
chr4 (102-323)||(45577619-45577842)
chr4 (134-228)||(42772724-42772818)
chr4 (251-358)||(56487183-56487285)
chr4 (94-171)||(53343560-53343638)
chr4 (114-358)||(44355751-44355995)
chr4 (287-358)||(23328015-23328086)
chr4 (132-214)||(56487292-56487374)
chr4 (186-322)||(3579142-3579279)
chr4 (102-334)||(43189683-43189914)
chr4 (101-213)||(985216-985327)
chr4 (65-249)||(52755417-52755601)
chr4 (262-344)||(44640417-44640499)
chr4 (46-98)||(32181161-32181213)
chr4 (43-103)||(38520438-38520498)
chr4 (51-139)||(50729641-50729729)
chr4 (195-291)||(52673838-52673934)
chr4 (43-89)||(2725283-2725329)
chr4 (102-164)||(10184879-10184941)
chr4 (187-249)||(38520518-38520580)
chr4 (45-87)||(46680658-46680700)
chr4 (116-213)||(20644282-20644379)
chr4 (46-87)||(33552995-33553036)
chr4 (160-213)||(40792409-40792462)
chr4 (102-155)||(52673762-52673815)
chr4 (91-135)||(32081080-32081124)
chr4 (104-228)||(41720779-41720903)
chr4 (45-85)||(50728048-50728088)
chr4 (45-85)||(50736062-50736102)
chr4 (40-79)||(23327803-23327842)
chr4 (121-172)||(32858276-32858327)
chr4 (59-106)||(39433510-39433557)
chr4 (126-245)||(43893535-43893654)
chr4 (61-139)||(47669219-47669297)
chr4 (277-323)||(51518482-51518528)
chr4 (305-333)||(13110443-13110471)
chr4 (101-185)||(36679926-36680009)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (42-358)||(2614766-2615083)
chr6 (39-358)||(15276879-15277199)
chr6 (51-358)||(17867714-17868022)
chr6 (51-358)||(17877497-17877805)
chr6 (42-358)||(3259548-3259870)
chr6 (51-344)||(24242543-24242837)
chr6 (55-358)||(32409794-32410098)
chr6 (45-358)||(24203236-24203549)
chr6 (59-358)||(15277222-15277522)
chr6 (43-358)||(10959872-10960187)
chr6 (54-358)||(10324053-10324358)
chr6 (46-358)||(11212131-11212444)
chr6 (44-358)||(3932749-3933064)
chr6 (84-338)||(32132342-32132597)
chr6 (94-358)||(166865-167130)
chr6 (51-358)||(10485038-10485344)
chr6 (44-341)||(17443135-17443432)
chr6 (94-358)||(34176752-34177017)
chr6 (42-358)||(11613733-11614035)
chr6 (43-358)||(14925398-14925713)
chr6 (51-358)||(18057399-18057706)
chr6 (133-344)||(11279090-11279301)
chr6 (148-358)||(11382041-11382249)
chr6 (56-352)||(11675322-11675619)
chr6 (51-342)||(31870055-31870349)
chr6 (51-358)||(18597100-18597407)
chr6 (51-358)||(3379591-3379897)
chr6 (51-335)||(4494079-4494348)
chr6 (39-340)||(34683953-34684247)
chr6 (42-358)||(32859922-32860238)
chr6 (52-330)||(29054239-29054515)
chr6 (42-324)||(8177858-8178141)
chr6 (102-358)||(9902600-9902857)
chr6 (134-358)||(3290635-3290846)
chr6 (45-358)||(23636097-23636410)
chr6 (43-193)||(29814736-29814887)
chr6 (43-193)||(28502330-28502482)
chr6 (46-289)||(14808012-14808254)
chr6 (42-136)||(32805348-32805442)
chr6 (121-324)||(7396102-7396302)
chr6 (102-341)||(35004087-35004326)
chr6 (195-333)||(9613998-9614136)
chr6 (102-333)||(27824620-27824849)
chr6 (43-119)||(11381964-11382040)
chr6 (197-355)||(9200332-9200491)
chr6 (45-108)||(11279012-11279075)
chr6 (308-358)||(14807960-14808010)
chr6 (102-208)||(32614030-32614136)
chr6 (42-87)||(34176715-34176760)
chr6 (39-87)||(167122-167170)
chr6 (180-236)||(27756314-27756370)
chr6 (308-344)||(33041403-33041439)
chr6 (180-239)||(28967355-28967414)
chr6 (122-237)||(29202990-29203104)
chr6 (308-342)||(13415861-13415895)
chr6 (135-213)||(16542362-16542440)
chr6 (222-284)||(24785106-24785168)
chr6 (133-215)||(29424652-29424734)
chr6 (122-213)||(15400672-15400760)
chr6 (122-213)||(15412459-15412547)
chr6 (122-213)||(15428053-15428141)
chr6 (102-206)||(7365318-7365422)
chr6 (302-358)||(14925159-14925215)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (42-358)||(51259677-51259994)
chr3 (42-358)||(28675661-28675978)
chr3 (40-358)||(1344604-1344923)
chr3 (51-358)||(12349068-12349376)
chr3 (45-355)||(29584749-29585060)
chr3 (45-358)||(2134944-2135258)
chr3 (45-346)||(47958341-47958643)
chr3 (46-355)||(21221261-21221570)
chr3 (42-358)||(24571153-24571469)
chr3 (43-358)||(31882919-31883234)
chr3 (42-340)||(53557710-53558009)
chr3 (45-358)||(25860318-25860632)
chr3 (38-344)||(4851369-4851674)
chr3 (37-358)||(39052735-39053058)
chr3 (43-358)||(20609545-20609846)
chr3 (79-358)||(40094411-40094691)
chr3 (43-358)||(34026554-34026855)
chr3 (91-358)||(44116859-44117127)
chr3 (51-344)||(3864586-3864879)
chr3 (51-358)||(25927224-25927533)
chr3 (41-358)||(51925105-51925422)
chr3 (44-358)||(38213227-38213542)
chr3 (100-358)||(42636300-42636559)
chr3 (51-358)||(50386353-50386660)
chr3 (40-358)||(33364675-33364993)
chr3 (40-358)||(5442160-5442467)
chr3 (132-358)||(20255007-20255232)
chr3 (44-324)||(26282315-26282599)
chr3 (51-358)||(29645946-29646254)
chr3 (51-358)||(3867546-3867848)
chr3 (43-342)||(21373812-21374102)
chr3 (44-358)||(22484640-22484954)
chr3 (133-344)||(51296544-51296755)
chr3 (141-358)||(49748808-49749025)
chr3 (43-357)||(45690804-45691112)
chr3 (55-358)||(3964173-3964476)
chr3 (126-358)||(54622694-54622925)
chr3 (51-358)||(50678677-50678986)
chr3 (94-358)||(3695204-3695449)
chr3 (175-358)||(19906767-19906950)
chr3 (41-358)||(10747088-10747388)
chr3 (51-234)||(53046667-53046846)
chr3 (149-358)||(24721463-24721673)
chr3 (38-186)||(43175436-43175585)
chr3 (233-358)||(41682950-41683075)
chr3 (114-358)||(6179376-6179614)
chr3 (109-320)||(34351303-34351514)
chr3 (126-341)||(44000217-44000432)
chr3 (119-358)||(44267691-44267924)
chr3 (114-231)||(41694925-41695042)
chr3 (177-320)||(39215404-39215547)
chr3 (172-332)||(52300439-52300598)
chr3 (126-274)||(25954407-25954554)
chr3 (284-358)||(43175589-43175663)
chr3 (258-321)||(53046605-53046668)
chr3 (109-281)||(42035652-42035824)
chr3 (187-278)||(14155438-14155528)
chr3 (136-358)||(8253640-8253861)
chr3 (129-219)||(32621828-32621918)
chr3 (102-358)||(8066955-8067210)
chr3 (166-331)||(32768588-32768755)
chr3 (126-209)||(25395570-25395653)
chr3 (104-358)||(17264569-17264822)
chr3 (41-87)||(20254945-20254991)
chr3 (187-245)||(23322158-23322216)
chr3 (119-212)||(41538131-41538225)
chr3 (42-152)||(54963985-54964095)
chr3 (43-87)||(3695441-3695485)
chr3 (114-173)||(28625001-28625060)
chr3 (258-301)||(53046517-53046560)
chr3 (151-201)||(8165833-8165883)
chr3 (260-358)||(30258962-30259060)
chr3 (107-155)||(42547463-42547511)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (42-358)||(35701147-35701464)
chr5 (51-358)||(11963220-11963528)
chr5 (42-358)||(32528585-32528902)
chr5 (40-358)||(7523039-7523359)
chr5 (44-358)||(2351552-2351867)
chr5 (43-335)||(21739093-21739381)
chr5 (38-358)||(39918374-39918694)
chr5 (51-358)||(34794766-34795074)
chr5 (44-322)||(4818085-4818364)
chr5 (77-355)||(31770503-31770782)
chr5 (43-344)||(6284221-6284524)
chr5 (42-358)||(41790372-41790688)
chr5 (43-358)||(22493328-22493643)
chr5 (42-358)||(24181533-24181835)
chr5 (94-344)||(29241300-29241551)
chr5 (43-358)||(8136710-8137024)
chr5 (94-358)||(41459511-41459775)
chr5 (51-358)||(7770188-7770495)
chr5 (42-358)||(31644318-31644632)
chr5 (51-358)||(3735237-3735544)
chr5 (94-358)||(31879985-31880250)
chr5 (42-358)||(4689607-4689923)
chr5 (94-358)||(23091213-23091478)
chr5 (44-342)||(24036105-24036401)
chr5 (67-355)||(40489232-40489521)
chr5 (51-358)||(18470337-18470644)
chr5 (94-355)||(39788114-39788377)
chr5 (94-358)||(7208139-7208404)
chr5 (60-326)||(28090461-28090726)
chr5 (40-355)||(7725721-7726036)
chr5 (43-263)||(40182335-40182556)
chr5 (71-355)||(700513-700798)
chr5 (65-358)||(32092891-32093183)
chr5 (46-303)||(5673018-5673271)
chr5 (104-303)||(5571608-5571806)
chr5 (133-344)||(553358-553570)
chr5 (122-326)||(8560923-8561126)
chr5 (51-358)||(37148498-37148790)
chr5 (102-333)||(22432243-22432471)
chr5 (160-358)||(27838983-27839180)
chr5 (175-344)||(5598484-5598653)
chr5 (148-358)||(17031134-17031344)
chr5 (43-175)||(20119642-20119777)
chr5 (263-358)||(4664923-4665018)
chr5 (42-119)||(548218-548295)
chr5 (46-183)||(32313713-32313850)
chr5 (152-212)||(1338601-1338661)
chr5 (43-87)||(29241264-29241308)
chr5 (43-87)||(31880242-31880286)
chr5 (105-218)||(29788507-29788618)
chr5 (42-87)||(7208396-7208441)
chr5 (315-358)||(5571566-5571609)
chr5 (260-322)||(35955088-35955150)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (42-358)||(101819-102136)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (43-358)||(23448-23762)
scaffold0054 (121-326)||(19857-20062)
[»] scaffold0208 (1 HSPs)
scaffold0208 (40-358)||(2248-2566)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (44-339)||(17982-18278)
scaffold0169 (44-276)||(12527-12760)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (44-358)||(51311-51625)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (38-358)||(15038-15359)
[»] scaffold0729 (1 HSPs)
scaffold0729 (45-358)||(4488-4796)
[»] scaffold0957 (1 HSPs)
scaffold0957 (68-357)||(2406-2695)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (100-358)||(19001-19258)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (51-358)||(5348-5656)
[»] scaffold0360 (3 HSPs)
scaffold0360 (94-358)||(15282-15551)
scaffold0360 (142-292)||(13554-13704)
scaffold0360 (43-87)||(15543-15587)
[»] scaffold0650 (1 HSPs)
scaffold0650 (40-358)||(1552-1870)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (132-358)||(372873-373099)
scaffold0004 (41-87)||(373130-373176)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (41-358)||(13596-13913)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (40-358)||(42860-43176)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (133-282)||(33530-33678)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (222-342)||(19081-19201)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (104-212)||(3683-3791)
[»] scaffold1112 (1 HSPs)
scaffold1112 (149-198)||(1078-1127)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (42-87)||(338757-338802)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 39 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 36769793 - 36769473
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-a 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  36769793 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttta 36769694  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36769693 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 36769594  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36769593 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 36769494  T
Q  338 ttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  36769493 ttgttctattctgtccttcat 36769473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 47953066 - 47953381
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 142  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47953066 ggtgtgtttgctctgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 47953165  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  47953166 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 47953265  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47953266 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 47953365  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    || || |||| |||||    
T  47953366 ctgtcctgtcgttcat 47953381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10932780 - 10932461
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||    
T  10932780 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacacggcagaacagcataggacaaattttttat 10932681  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  10932680 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagt 10932581  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10932580 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagt 10932481  T
Q  339 tgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  10932480 tgttctgtcctgtccttcat 10932461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26994444 - 26994129
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26994444 ggtgtgtttggtttgcaaaacagaaagtactggacagaacaggacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggca 26994345  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26994344 ttgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 26994245  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26994244 tgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 26994145  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    || || ||||||||||    
T  26994144 ctgtcctgtccttcat 26994129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3922923 - 3922607
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3922923 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaccagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 3922824  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3922823 attgagtatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 3922724  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3922723 gtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaataaaacactggacaactagagttgt 3922624  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  3922623 tctgtcatgtccttcat 3922607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11322105 - 11321789
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11322105 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatcggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatggc 11322006  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11322005 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 11321906  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11321905 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccgttgcctccagtttgtcctgtacctgaatcagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 11321806  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||| ||||||    
T  11321805 tctgtcatgttcttcat 11321789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 18470567 - 18470873
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18470567 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagta 18470666  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18470667 attttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagaga 18470766  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18470767 caaaaatatgagtttttgtcctgt--cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactcgacaactagagttgttctatcct 18470864  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  18470865 gtccttcat 18470873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 46 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43158903 - 43158590
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  43158903 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagatagagcagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagtacaggacaaattttttatggcatt 43158804  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||     
T  43158803 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggta 43158704  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43158703 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 43158604  T
Q  345 atcttgtccttcat 358  Q
     |||||||||||||    
T  43158603 gtcttgtccttcat 43158590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 46633571 - 46633883
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  46633571 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacataatagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatgg 46633670  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46633671 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 46633770  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46633771 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcttg-----ttcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 46633865  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  46633866 ttctgtcatgtccttcat 46633883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 39 - 358
Target Start/End: Original strand, 18386396 - 18386715
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-a 137  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  18386396 ctaagggtgagtttggtttgcaaaacagcaagtattggacaaaacggtacaaaatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatttttta 18386495  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18386496 tgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 18386595  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18386596 tttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaa 18386694  T
Q  338 ttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  18386695 ttgttctgtcctgtccttcat 18386715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 46 - 358
Target Start/End: Original strand, 21784749 - 21785062
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcatt 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  21784749 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaatcttttatggcatt 21784848  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21784849 gagtaattttatgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 21784948  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21784949 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcatgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttct 21785048  T
Q  345 atcttgtccttcat 358  Q
     || ||||||||||    
T  21785049 gtcatgtccttcat 21785062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 40 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43189466 - 43189162
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||    
T  43189466 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaatagtgcatgacaaattttttat 43189367  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43189366 ggcattgagtaatttgttgtttcatacgatttttggggggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtgg 43189267  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43189266 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttacctccagtttgtcctgtacctgaaacatttttataaatcaaacactggacaactagag 43189167  T
Q  338 ttgtt 342  Q
    |||||    
T  43189166 ttgtt 43189162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 45 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 32873987 - 32873692
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32873987 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcat 32873888  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  32873887 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtatttcagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggt 32873788  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32873787 gaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatccggtacctgaaacaattttacaaatcaaacaatggacaactagagtt 32873692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26372017 - 26371713
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattt 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26372017 tttgaaaaacagtaagtactggacataacagtacaagatagaacagtacaacataaaacagaacatcacatgacaaattttttatggcattgaataattt 26371918  T
Q  154 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26371917 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaa 26371818  T
Q  254 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcc 353  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  26371817 aatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttgcaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctatcc 26371718  T
Q  354 ttcat 358  Q
    |||||    
T  26371717 ttcat 26371713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41211413 - 41211104
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  41211413 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagta 41211314  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41211313 attttttgttttatacgattttttagggataaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 41211214  T
Q  249 ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatct 348  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||     
T  41211213 acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgggcaacttgagttgttctgtcc 41211114  T
Q  349 tgtccttcat 358  Q
    ||||||||||    
T  41211113 tgtccttcat 41211104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30849464 - 30849150
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  30849464 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacaacacaggacaatttttttatggcat 30849365  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  30849364 tgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttatacaacttgtatatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 30849265  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  30849264 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccaccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaatcattggacaactagaattgttc 30849165  T
Q  344 tatcttgtccttcat 358  Q
    | |||||||||||||    
T  30849164 tgtcttgtccttcat 30849150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 45 - 344
Target Start/End: Original strand, 1870011 - 1870312
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  1870011 gtgtgtttggtttgcaaaacagcatgtactgtacataacagtacaatatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgataaattttttatgacat 1870110  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttg-agggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  1870111 tgagtaattttttgttttatacgatttttttagggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 1870210  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1870211 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgtt 1870310  T
Q  343 ct 344  Q
    ||    
T  1870311 ct 1870312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 43368076 - 43368392
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  43368076 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacatgacaaatttttatcac 43368175  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  43368176 attgaataattttttgttttatacgattttggagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttg 43368275  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
     ||||| | |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43368276 ctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcccgtctcttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 43368375  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  43368376 tctgtcctgtccttcat 43368392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 42 - 353
Target Start/End: Original strand, 40753044 - 40753341
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  40753044 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaagcagaacaacacaggacaaattttttatgg 40753128  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  40753129 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgattt 40753228  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40753229 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaacgagagttg 40753328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 100 - 348
Target Start/End: Original strand, 29661255 - 29661504
Alignment:
Q  100 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 198  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29661255 gtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatagcattgagtaattttttgttttatacgatttttgtgggacaaaatgctattttggtatt 29661354  T
Q  199 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 298  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29661355 ttagataacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtac 29661454  T
Q  299 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatct 348  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661455 ctgaatcagttctacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatct 29661504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 47316901 - 47316602
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||          |||    || |||||||||||||    
T  47316901 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacggtacaagatagaacagtacaacacaag----------aca----aattttttatggcatt 47316816  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  47316815 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtaatttagacaacttgcatgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 47316716  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47316715 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttattct 47316616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 51 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3892238 - 3891994
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3892238 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcatatgacaaattttttatggcattgagta 3892139  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3892138 attttttgttttacacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattctagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagaga 3892039  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 294  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3892038 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcct 3891994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30599229 - 30598939
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||     
T  30599229 agggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatga 30599130  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  30599129 aattgagtaatttgttgttttatacgatttttaggggacaaaatgttattttggtattttagataatttgtacttgagacaaaaagttgtgttgtggttt 30599030  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30599029 gatgagggacaaaaatatgagcttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatgaaacagtggacaa 30598939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 340
Target Start/End: Original strand, 329354 - 329643
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| | ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  329354 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacagcacaacacaaggcataacagtacatgacaaatttttatggtattgaataa 329453  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  329454 tttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtgttttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggac 329553  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  329554 aaaaatttcagtttttgtcttgtcctttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacacgggacaactggagttg 329643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 43 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23349510 - 23349203
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23349510 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtaatggacataacagtacaagatagaacaaaacaacataaggtagaacagcacatgacaaatttttataaca 23349411  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  23349410 ttgaataattttttgttttctacgattgttgggggacgaaatgtcattttagtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 23349311  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  23349310 tgagggacaaaaatatcagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacttgaaatagttttacaattcaaacactggacaactggagtagtt 23349211  T
Q  343 ctatcttg 350  Q
    ||||||||    
T  23349210 ctatcttg 23349203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 51 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34295615 - 34295329
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  34295615 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatgacattgaataa 34295516  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  34295515 ttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 34295416  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    |||||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34295415 aaaaatatcagtttttgt-------cttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactggagttgttct 34295329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 9913400 - 9913715
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  9913400 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaatttttatgga 9913499  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  9913500 attgaataatttttagttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttg 9913599  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||| ||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9913600 gtgagcga-caaaatatcaatttttgtcctgtcccttgcctctagtttatcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgt 9913698  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  9913699 tctgtcctgtccttcat 9913715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 9927088 - 9927403
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  9927088 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaatttttatgga 9927187  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  9927188 attgaataatttttagttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttg 9927287  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||| ||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9927288 gtgagcga-caaaatatcaatttttgtcctgtcccttgcctctagtttatcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgt 9927386  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  9927387 tctgtcctgtccttcat 9927403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 358
Target Start/End: Original strand, 48894591 - 48894908
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |    
T  48894591 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatatttgacataacagtacaagaccgaacagtacaacacaaggtaaaacagcactggacaattttttattg 48894690  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||  | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  48894691 cattgaataattttttgttttataagatttttgggggacaaaatgttattttggatttttagatgatttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 48894790  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
     ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48894791 agtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatccagtttgtactgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactggagttg 48894890  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  48894891 ttctgtcctgtccttcat 48894908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 38301223 - 38301533
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||      ||||||||| |    
T  38301223 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaacacag-----atttttatgac 38301317  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  38301318 attgaataattttttgtttaatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgt-cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 38301416  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38301417 ctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattggagttgt 38301516  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  38301517 tctgtcctgtccttcat 38301533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 104 - 358
Target Start/End: Original strand, 11250558 - 11250808
Alignment:
Q  104 aacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 202  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11250558 aacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctagtttggtattttag 11250657  T
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 302  Q
    ||||||      |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250658 acaacta-----tgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgattttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 11250752  T
Q  303 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11250753 aacaattttacaaatgaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcat 11250808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 355
Target Start/End: Original strand, 44748660 - 44748883
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  44748660 tttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgta 44748759  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748760 ttgtggtttggtgagggacaaaaatttgagtttttgttctgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 44748859  T
Q  332 ctagagttgttctatcttgtcctt 355  Q
    ||||||||||| | || |||||||    
T  44748860 ctagagttgttttgtcctgtcctt 44748883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 68 - 342
Target Start/End: Original strand, 1363538 - 1363811
Alignment:
Q  68 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacga 167  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||   ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1363538 aagtactggacataacaatataagatagaacaacacatcagaaggtagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacaa 1363637  T
Q  168 tttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttg 267  Q
    |||||| || || ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  1363638 tttttg-ggtacgaaatgctatttttgtatttttgacaacctgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttgatgagggacaaaaatatcagcttttg 1363736  T
Q  268 tcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1363737 tcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacatgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtt 1363811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 52 - 355
Target Start/End: Original strand, 11822116 - 11822411
Alignment:
Q  52 tggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| |  |    
T  11822116 tggtttgcaaaacagtaagtactgaacataacagtataaaatagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggacaaatttttatggcattgaat--t 11822213  T
Q  152 tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggata 251  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||      ||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  11822214 ttttttttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttgaatttttaaacaac------gtgggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaaggaca 11822307  T
Q  252 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| || |||    
T  11822308 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgtcctgtacctcaaacagttttacgaatcaaacactggacaagtgaagttgttctgtcctgt 11822407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 51 - 344
Target Start/End: Original strand, 20127171 - 20127466
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg----a 146  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| | |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    |    
T  20127171 ttggtttgcaaaacagtaagtac--gatagaacagtacaagacaaaacaacacaacacaagatagaacagcacatgacaaatttttgtagcattgaatta 20127268  T
Q  147 gtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgag 246  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  20127269 ttatttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgtcattttggtattttacacaaattgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttgctgag 20127368  T
Q  247 ggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    | | |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20127369 gaacaaaaatatcagcttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttaaaaatcaaacactggacaactggagttgttct 20127466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 47947636 - 47947826
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 142  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47947636 ggtgtgtttgctctgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 47947735  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47947736 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgct 47947826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 102 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43214085 - 43213829
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||     
T  43214085 acaacacaaggtagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaatcattttttgttttataggatttttgaggcacgaaatgctattttggtattttt 43213986  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||       
T  43213985 gacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagcttttatcttgtcccttgccttcagtttgtcctgtactga 43213886  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||| ||||||    
T  43213885 aaacagttttacaaatcaaacactagacaactgaagttgttctgtcctgttcttcat 43213829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 358
Target Start/End: Original strand, 48445404 - 48445712
Alignment:
Q  50 attggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||   | |||   ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48445404 attggtttgcaagacagtaagtactggacaaaacagtacaatgcataacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaatttttatggtattgaata 48445503  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| | | ||  ||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  48445504 atttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgttattttcgtgttttagacaacttgtatgcgagacaaaaagttgtcctgtgatttggtgaagga 48445603  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||    
T  48445604 caaaaatttcagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgttctgtccctcaaacagttttacaaattaaacattggataactggagttgttctgtctt 48445703  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
     ||||||||    
T  48445704 ttccttcat 48445712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22724739 - 22724449
Alignment:
Q  54 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattt 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||| |||| |||||| |||| || |||||||| ||| ||||| ||||||    
T  22724739 gtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaatatcacaacataaggcagaacaacacaagataaatttttctggtattgaataattt 22724640  T
Q  154 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 253  Q
    | ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22724639 tctgtattatatgatttttgggcgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgcgctgtggtttggtgagggacaaa 22724540  T
Q  254 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    |||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  22724539 aattgcagcttttgtcatatcccttgcctccagtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacgctgaacaactggaattgttct 22724449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 296
Target Start/End: Original strand, 46408771 - 46409021
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||      |||||||||||    
T  46408771 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacat------tttttatggca 46408864  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  46408865 ttgagtaattttttattttatacgatttttgagagacaatatgctattttgatattttagacaacttgtatgtcggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 46408964  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc----cttgcctccagtttgtcctgt 296  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||    
T  46408965 tgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtccctttcttgtctccagtttgtcctgt 46409021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Original strand, 21133248 - 21133563
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||| |||| || |||| |||||   ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| ||| |||    
T  21133248 gtgtgtttggttggcaaaatagtaagtactatacataacaatacaagaaagaacatcacaacacaaggcagaacaacacagtacaaattttttatgacat 21133347  T
Q  144 tgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||      
T  21133348 tgagtaatttttttgttttatacgatttttgggagacgaaatgctattttggtattttagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttat 21133447  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||    
T  21133448 tgagggaaaataatatcagtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaattaaacattaaataactagagttgtt 21133547  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||| | ||||||||    
T  21133548 ctatcatttccttcat 21133563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 37966858 - 37967165
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||| | ||| | ||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||| ||| | |||    
T  37966858 ttggtttgcaaaatagtaagtactagacataataatataagacataacagcacaacacaaagcagaatagtacataacaaatttttatggtattaaataa 37966957  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||| | ||||  ||     
T  37966958 ttttttgttttatacgatttttttgggacgaaatgctattttggatttttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtgatgtggtctagtgaaagac 37967057  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | || ||    
T  37967058 aaaaatatgggtttttgtcttgtcccttgcatccaatttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggagaactaaagttgttttgtcatg 37967157  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  37967158 tccttcat 37967165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26910624 - 26910314
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||   | |||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||    
T  26910624 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatataggataggacatcataacacaaggtagaacagcgcaagacaaatttt-atggtatt 26910526  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    || ||||||| || |||||  |||||||| | ||| || | |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| |    
T  26910525 gaataattttctgatttat--gatttttgggtgacgaattactatttttgtatttttgacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttggcg 26910428  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26910427 agggacaaaaattgcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgccctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactgtagttgttct 26910328  T
Q  345 atcttgtccttcat 358  Q
     || ||||||||||    
T  26910327 gtcatgtccttcat 26910314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 51 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22724243 - 22723950
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||| || |||||||||||| ||   |||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||    
T  22724243 ttggtttgcaaaatagtaaataccggacaaaatagtataagataggacaacacaacataaggcagaacaacacaagataaatttttatggtattgaataa 22724144  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||     
T  22724143 ttttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttatacaacttgtacgtgggataaaaagttgcgttgtggtttggcgatggac 22724044  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||| ||   |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22724043 aaacattgcagtttttgtcctgtcccttacctcgagtttgtccggtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttct 22723950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 266
Target Start/End: Original strand, 26652750 - 26652965
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||| ||||||  |||||| | ||| |||||||||||| | ||| | |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||    
T  26652750 ttggtttgtaaaacatcaagtacagtacataacagtataagaaaaaacagcacaatacaagggagaacagcataggacaaatttttatgacattgaataa 26652849  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  26652850 ttttttgttttatacgatttttggcggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 26652949  T
Q  251 aaaaatatgagttttt 266  Q
    |||||||| |||||||    
T  26652950 aaaaatatcagttttt 26652965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 126 - 358
Target Start/End: Original strand, 17237035 - 17237267
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||   ||||||| || ||||||||| ||  ||||    
T  17237035 gacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgagacaaaaa 17237134  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17237135 gttgtgttgtggtttagtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcatgttccttgcatccagtttgtactgtacctgaaataattttacaaatcaaacact 17237234  T
Q  326 ggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  17237235 ggacaactggagttgttctgtcatgtccttcat 17237267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 126 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 46448780 - 46448554
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||   ||||||| || || ||| |||||  ||||    
T  46448780 gacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttaggggacgaaatgttattttggatttttagataatttatacatgggacaaaaa 46448681  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46448680 gttgtgctgtggtttagtgacggacaaaaatatgagtttttatcatgtcccttgcatccagtttgtaccgtacctgaaacaattttacaaatcaaacact 46448581  T
Q  326 ggacaactagagttgttctatcttgtc 352  Q
     |||||||  |||||||||||||||||    
T  46448580 agacaactgaagttgttctatcttgtc 46448554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 203 - 358
Target Start/End: Original strand, 16963174 - 16963329
Alignment:
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 302  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16963174 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtattgtggtttgataagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcctctagtttgtcatgtacctga 16963273  T
Q  303 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  16963274 aacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttctgtcctgtccttcat 16963329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 34117399 - 34117581
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34117399 agaacaacacaagacaaatttttatggcattgaataatttttcgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggcattttagacaacttgtac 34117498  T
Q  214 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgta 297  Q
     ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  34117499 atggaacaaaaaattgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcatat-ccttgccttaagtttgtcctgta 34117581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 165
Target Start/End: Original strand, 12982178 - 12982301
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgac-aaatttttatggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12982178 gggtgtgtttggtttgcaaaagagcaagtactggagagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggc 12982277  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12982278 attgagtaattttttgttttatac 12982301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15035401 - 15035219
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  15035401 agaacaacacatgacaaatttttatggtattgaataattttttgttttgtacgatttttggtgggcaaaatgttattttgatattttagacaatttgtat 15035302  T
Q  214 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgt 296  Q
    |||| |  |||||||||| |||||| |||||||| | || ||| | | |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  15035301 gtggtacaaaaagttgtgttgtggtctggtgaggaacaagaatttcaattttcgtcctgtcctttgcttccagtttgtcctgt 15035219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 51 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41665786 - 41665568
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||| || | |||||| || | | || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  41665786 ttggtttacaaaacagtaagtacggaacataacaatacaagataggacagcacaacataacgcataatagcacaagacaaatttttatggtattgaataa 41665687  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||| |||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||     
T  41665686 ttttctgttttatataatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggcgagggac 41665587  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtc 269  Q
    ||||||   ||||||||||    
T  41665586 aaaaattgcagtttttgtc 41665568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 355
Target Start/End: Original strand, 34519527 - 34519696
Alignment:
Q  186 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 285  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  34519527 ctatttttgtattttagacaacttgtacctgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctcca 34519626  T
Q  286 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcctt 355  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  34519627 gcttgtcatgtccctgaaactgttttacaattcgaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtcctt 34519696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Original strand, 16962986 - 16963149
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |   | | ||| | ||      ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16962986 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaacacaaggcagaacagcgcat-----aacagcacatgacaaattttttatgg 16963080  T
Q  141 cattgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16963081 cattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaact 16963149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 22631609 - 22631853
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaa-----ggtagaacagcacatgacaaatttttat 138  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||   |||||||||     || |||||| ||||||||||||| |||     
T  22631609 ggtgtgtttcgtttgcaaaacaataagtattggacagaacagtacaagacataacaacacaacacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattattag 22631708  T
Q  139 ggcattgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
     ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||   |  ||||||| || |||||    
T  22631709 agcattaaataatttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatatcattttggtattttagacaacttgtacgtataacaaaaagttatgttgtgg 22631808  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 282  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  22631809 tttggtgaaggacaaaaatatcagttattgtcgcgtcccttgcct 22631853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Original strand, 46627135 - 46627259
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||  ||||||||||||   ||||||| ||  |||| |||||    
T  46627135 tttttatggcattgaataattttttgttttatacaatttttgggagacgaaatactatttttgtattttagacaatccgtacgtgagacaaaaaattgtg 46627234  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaat 256  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  46627235 ctgtggtttgatgagggataaaaat 46627259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 358
Target Start/End: Original strand, 26700572 - 26700668
Alignment:
Q  262 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||    
T  26700572 tttttgtcctttctcttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttatacaaatcaaacactggacaactggaattgttatgtcatgtccttcat 26700668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 269
Target Start/End: Original strand, 48699334 - 48699500
Alignment:
Q  103 caacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 202  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | | |||| || || ||||||||||   ||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  48699334 caacataaggcagaacagcacaagacaagcttttatggtattgaatgacttttggtcttgtacgattttttgtggacataagtctattttggtattttag 48699433  T
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtc 269  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||    
T  48699434 acaacttgtacgtggaacaaatagttgtgttgtggtttagtgagggacaagaatttcagtttttgtc 48699500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29456006 - 29455778
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| || ||||| |||||| | || |||||| ||||||||| |||||||    
T  29456006 acaacataaggcaaaacaacacatgacaaacttttatggtattgaataatatttggtcttatatgattttggtgg-acaaaacgctattttggtatttta 29455908  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
     |  ||| ||| ||||||  |||||||||| ||| |||  | || ||| || ||| | | ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||  |||    
T  29455907 ta--actagtatgtgggacaaaaagttgtgttgttgttaagcgaaggacaagaatttcactttttgttatgtcccttgcctccaatttctactgtctctg 29455810  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
    ||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  29455809 aaatagtgttacaaatcaaacattgcacaact 29455778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29372915 - 29372764
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||| |   |||    
T  29372915 gacaaacttttatggtattaaataatttttggtcttatatgatttttggtggataaaaggttaatttgaaattttagacaacttgtacatggaacagaaa 29372816  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 277  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  29372815 gttgtgttgtggtttagtgacggacaaaaattttagtttttgtcgtgtccct 29372764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21408745 - 21408531
Alignment:
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||   |||| |||  |||||||  ||||||||| ||||||||| ||  || ||||||| || ||||||||     
T  21408745 attgaataattttttatcttatacgatttttagtggacgaaaa-ctatttttgtattttagataacttgtacatgaaataaaaagttatgttgtggttta 21408647  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
     ||||||| |||  | |  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||    
T  21408646 atgagggacaaatgtttt-gtctttgtcatgtcccttgcctccagtttgtgttgtcccaaaaacagctttacaaatcaaatattgtacaactagagatgt 21408548  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
      | || ||||||||||    
T  21408547 catgtcatgtccttcat 21408531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 249
Target Start/End: Original strand, 35645403 - 35645529
Alignment:
Q  123 catgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg-ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatg 221  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||| || ||||||| | |||||||||||| || | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||     
T  35645403 catgataaacttttatggtgttgggtcattttttatcttatacgattttggatgaa-aaaatgactattttattattttagacaacttgtacgtacgata 35645501  T
Q  222 aaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35645502 aaaagttgtgttgtggtttagtgaggga 35645529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 323
Target Start/End: Original strand, 2048887 - 2049107
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |  ||||| |||   ||| |||| || |||||| |||||| | ||||||||  |||||||  ||||||     
T  2048887 acaacacaaggcagaacaacacatgataaactcgtatggtattacataagttttggtcttatacaattttttatggacaaaaa-ctatttttgtattttt 2048985  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
     | ||||| |||||||||  ||| ||| || |||||||| |||| ||| |||||| |   ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||      
T  2048986 tataacttctacgtgggacaaaatgttttgttgtggtttagtgatggacaaaaatttatatttttgttatgttccttgcctctagtttgtcccgtcccaa 2049085  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaaca 323  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
T  2049086 aaacaatttttcaaatcaaaca 2049107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3359837 - 3359773
Alignment:
Q  262 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 326  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3359837 tttttgtcatgtcccttacctctagtttatcttgtgccagaaacagttttacaaatcaaagactg 3359773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3891994 - 3891946
Alignment:
Q  310 ttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3891994 ttacaaatcaaacattggacaactagagttgttctgtcctgtccttcat 3891946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 92
Target Start/End: Original strand, 34117349 - 34117397
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataaga 92  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34117349 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaaga 34117397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 170
Target Start/End: Original strand, 47442769 - 47442840
Alignment:
Q  100 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgattt 170  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47442769 gtacaacataaggcagaacactacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacaattt 47442840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Original strand, 42332059 - 42332137
Alignment:
Q  167 atttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 245  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  42332059 atttttggtggataaaatgttattttgatatttaagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggtga 42332137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30260043 - 30259938
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| | | ||||   || ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||    
T  30260043 gacaaatttttatgatattgaataatttttgatcttatacgagttttgatgaataaaaaattaatttgatattttagacaacttgtaagtaagataaaaa 30259944  T
Q  226 gttgtg 231  Q
    ||||||    
T  30259943 gttgtg 30259938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41665573 - 41665516
Alignment:
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41665573 tttgtcctgttcttgaaacagttttataattgaaacactggacaactggagttgttct 41665516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 8453285 - 8453322
Alignment:
Q  177 gacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8453285 gacaaaatgttattttgatattttagacaatttgtacg 8453322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 79
Target Start/End: Original strand, 17237005 - 17237038
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggaca 79  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17237005 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggaca 17237038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29992813 - 29992741
Alignment:
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 216  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29992813 ttgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaaattattttg-tattttagataacttgtacgtg 29992741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 185
Target Start/End: Original strand, 8453204 - 8453260
Alignment:
Q  129 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg 185  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  8453204 aaatttttatggtattgaatatttgtttgtcttatacgatttttaagagacaaaatg 8453260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16027918 - 16027850
Alignment:
Q  271 tgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16027918 tgtccattgtctccaatttgtcttgtctttgaaacaattttacaaatcaaacactatacaactagagtt 16027850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41903667 - 41903603
Alignment:
Q  149 aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  41903667 aattttttgttttatatgatgtttggtggacaaaagactattttagtattttagacaatttgtac 41903603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 87)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 845021 - 844702
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  845021 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 844922  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  844921 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 844822  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  844821 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 844722  T
Q  339 tgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  844721 tgttctgtcctgtccttcat 844702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Original strand, 42510402 - 42510721
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  42510402 taagggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 42510501  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42510502 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 42510601  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42510602 ttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacgaatcaaacactggacaactagagt 42510701  T
Q  339 tgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || || ||||||||||    
T  42510702 tgtcctgtcctgtccttcat 42510721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 33 - 358
Target Start/End: Original strand, 41972782 - 41973107
Alignment:
Q  33 ttaagtctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat 132  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41972782 ttaagtttatgggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaat 41972881  T
Q  133 tttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||     
T  41972882 tttttatggcattaagtaattttttgttttatacgatttt-gagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgta 41972980  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972981 gtgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 41973080  T
Q  332 ctagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41973081 ctagagttgttctatcctgtccttcat 41973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28340597 - 28340284
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  28340597 gggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaatttttttatggc 28340498  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  28340497 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 28340398  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340397 atgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 28340298  T
Q  342 tctatcttgtcctt 355  Q
    |||||| |||||||    
T  28340297 tctatcctgtcctt 28340284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 35387606 - 35387289
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35387606 agggtctgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataataatacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttttatgg 35387507  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  35387506 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggttt 35387407  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387406 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 35387307  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  35387306 ttctgtcatgtccttcat 35387289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45491167 - 45490853
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45491167 gtgtgtttggtatgcaaaacagcaattactggacagaacaatataagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttgtatggcat 45491068  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  45491067 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 45490968  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45490967 gagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttc 45490868  T
Q  344 tatcttgtccttcat 358  Q
    | || |||| |||||    
T  45490867 tgtcctgtctttcat 45490853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1351728 - 1351413
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1351728 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggc 1351629  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  1351628 attgagta-ttttttgttttatatgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 1351530  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351529 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 1351430  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  1351429 tctgtcctgtccttcat 1351413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6711342 - 6711024
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggttt-gcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atg 139  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6711342 agggtgtgtttggttttgcaaaacatcaagtactggacagaacagtacaaaatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaattttttatg 6711243  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  6711242 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtt 6711143  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711142 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 6711043  T
Q  340 gttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  6711042 gttctgtcctgtccttcat 6711024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 16386734 - 16387050
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16386734 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaatacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 16386833  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16386834 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 16386933  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  16386934 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagaactgt 16387033  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  16387034 tctgtcatgtccttcat 16387050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Original strand, 16451009 - 16451323
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  16451009 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaatagtacaacacatggcagaatagcacaggacaaattttttatggcat 16451108  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16451109 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 16451208  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16451209 gagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgtta 16451308  T
Q  344 tatcttgtccttcat 358  Q
    | || ||||||||||    
T  16451309 tgtcctgtccttcat 16451323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 45 - 344
Target Start/End: Original strand, 12890120 - 12890420
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12890120 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatggcat 12890219  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  12890220 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtatcttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgat 12890319  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890320 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 12890419  T
Q  344 t 344  Q
    |    
T  12890420 t 12890420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Original strand, 32270240 - 32270549
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| || |||    || |||||||||||||    
T  32270240 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaataggaca----aattttttatggcatt 32270335  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32270336 gagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtg 32270435  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32270436 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctctacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 32270535  T
Q  345 atcttgtccttcat 358  Q
     || ||||||||||    
T  32270536 gtcctgtccttcat 32270549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Original strand, 51264377 - 51264691
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  51264377 gtgtgtttggtttgcaaatcagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaatagcacaggacaaattttttatggcat 51264476  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  51264477 tgagtaattttttgttttatacgatttttaaaggacaaaatgctattttagtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 51264576  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51264577 gagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattc 51264676  T
Q  344 tatcttgtccttcat 358  Q
    | |||||||||||||    
T  51264677 tgtcttgtccttcat 51264691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 42 - 357
Target Start/End: Original strand, 7183797 - 7184113
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  7183797 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacaatacaggacaaattttttatgg 7183896  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  7183897 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatactatattggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggttt 7183996  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  7183997 ggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacatatcaaacactggacaactaaagtta 7184096  T
Q  341 ttctatcttgtccttca 357  Q
    |||| || |||| ||||    
T  7184097 ttctgtcctgtctttca 7184113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 38 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44738340 - 44738020
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt- 136  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  44738340 tctaaggatgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtagaagatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttt 44738241  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  44738240 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaataaaaa-ctattttgctattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtg 44738142  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 336  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44738141 gtttggtgagggacaaaaatatgagttttggtcctgtcccttgcctccaagttgtcatgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaattaga 44738042  T
Q  337 gttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||| ||||||| |||||    
T  44738041 gttgttctgtcttgtctttcat 44738020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 44 - 342
Target Start/End: Original strand, 17887828 - 17888128
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17887828 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacgggacagaatagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggca 17887927  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  17887928 ttgagtaatttgttgttttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 17888027  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17888028 gcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactagagttgt 17888127  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  17888128 t 17888128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 45 - 342
Target Start/End: Original strand, 50540226 - 50540524
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  50540226 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtataagatagaacagtacaacacacgtcagaacagcacagggcaaattttttatggcat 50540325  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |    
T  50540326 tgagtaatttgttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgat 50540425  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50540426 gaaggacaaaaatatgagtttatgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagctgtt 50540524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30105923 - 30105658
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30105923 agaacagtacaacacaaggcagaacaacactggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 30105824  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30105823 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 30105724  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30105723 ctttacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcctgtccttcat 30105658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 45 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24339929 - 24339619
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24339929 gtgtgtttggtctgcaaaacagcaaatactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 24339830  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt-gg 242  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  24339829 tgaataattttttgttttatacgatgtttgggggacaa--tgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgttgtggttttgg 24339732  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24339731 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttatacaaatcaaacactgaacaactagagttgtt 24339632  T
Q  343 ctatcttgtcctt 355  Q
    || || |||||||    
T  24339631 ctgtcctgtcctt 24339619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26118458 - 26118193
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26118458 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 26118359  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26118358 ggtattttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtc 26118259  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  26118258 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttatgtcatgtccttcat 26118193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 38 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16476453 - 16476157
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   || ||| |||| | |||| |||||||||||||| ||    
T  16476453 tctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatataagatagaacaacacgacataaggcataacaccacatgacaaatttgta 16476354  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16476353 tggcattgaataattttatgttttatacaatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtgg 16476254  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16476253 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 16476157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 31004021 - 31004328
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31004021 ttggtttgcaaaacagcaagtactgtacagaacagtacaagaaagaacagcgcaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatggcattgaataa 31004120  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  31004121 ttttttgttttataggatttttgggggacgaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 31004220  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||    
T  31004221 aaaaacatcagtttttgtcctgtcccgtgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctg 31004320  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  31004321 tccttcat 31004328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 50304540 - 50304847
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  50304540 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 50304639  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||     
T  50304640 ttttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttaaacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttgcagagggac 50304739  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  50304740 aaaaatatcagtttttgtcttgtttcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctg 50304839  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  50304840 tccttcat 50304847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 46 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17327940 - 17327627
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 144  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || | ||||||||||| ||||| ||    
T  17327940 tgtgtttgatttgcaaaaaagtaagtattggacagaacagtataagatagaacagtacaatacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcgtt 17327841  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  17327840 gagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatattattttggtattttagataatttgtacatgagacaaaaagttgtgctgtgatttggtg 17327741  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17327740 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgactccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgtttt 17327641  T
Q  345 atcttgtccttcat 358  Q
     |||||||||||||    
T  17327640 gtcttgtccttcat 17327627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 16437259 - 16437558
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 143  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||               | ||| ||||||||||||||||||    
T  16437259 ggtgtgtttggtttgtaaaacagcaaatactggacagaacagtataagatagaacagtaca---------------gtacaggacaaatttttatggcat 16437343  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16437344 tgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 16437443  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16437444 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctctagtttgtcctgtagctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgttc 16437543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41968142 - 41967827
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  41968142 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtgctggacagaacagtacaagacagaacaacacaacacaaggcggaacaatacatgacaaattttttatgaca 41968043  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  41968042 atgagtaattttttgttttatacaatttttgggagacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgg 41967943  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41967942 taagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagagttgtt 41967843  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    || || ||||||||||    
T  41967842 ctgtcctgtccttcat 41967827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 40 - 333
Target Start/End: Original strand, 39281772 - 39282065
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | | |||| |||||||||| ||| ||||    
T  39281772 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaatagtataagatagaacagcacaacacaatgcataacaacacatgacaactttgtatg 39281871  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  39281872 acattgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggtt 39281971  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39281972 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactgaacaact 39282065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 51 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42513052 - 42512751
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  42513052 ttggtttgcaaaaca---agtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatcacattgaataa 42512956  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||| |     
T  42512955 ttttttgttttatacgatttttgggggacaaaattctattttgatattttagacaatttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcac 42512856  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||    
T  42512855 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctg 42512756  T
Q  351 tcctt 355  Q
    |||||    
T  42512755 tcctt 42512751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6029595 - 6029283
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||     
T  6029595 agggtgcgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagcacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttttatggt 6029496  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  6029495 attgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 6029396  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6029395 gtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 6029296  T
Q  342 tctatcttgtcct 354  Q
    ||| || ||||||    
T  6029295 tctgtcctgtcct 6029283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51703455 - 51703142
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  51703455 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatataacagaacaacacaaggcaaaacaatacatgacaaattttttatggca 51703356  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  51703355 ttgagtaattttttgttttataccatttt-gagggacaaaatgttatttttgtattttagacaacatgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtt-gg 51703258  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51703257 tgaggaacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgccttcagtttatcctgtacttgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgtt 51703158  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    || |||||||||||||    
T  51703157 ctgtcttgtccttcat 51703142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 81 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32289600 - 32289322
Alignment:
Q  81 aacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggac 179  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||| |||  |||||| || | || |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  32289600 aacagtacaagatagaagagtataacataagccagaacaacataggataaatattttatgacattgaataattttatgttttatataatttttgagggac 32289501  T
Q  180 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 279  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32289500 aaaatgctattttggtattttaaacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttg 32289401  T
Q  280 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32289400 cctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcttgtccttcat 32289322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 46154780 - 46155103
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  46154780 gggtgtgtttagtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtataacacaagacataacggcacatgacaaattttttatgac 46154879  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc-------tg 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||       ||    
T  46154880 attgaataattttttgttttataagatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtgctgtagtttg 46154979  T
Q  235 tggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 334  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  46154980 tagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctcacctccagtttgtccagtacctgaaataattttacaaatcaaacactgaacaatta 46155079  T
Q  335 gagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  46155080 gagttgttctgtcatgtccttcat 46155103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11772917 - 11772610
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||   ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  |||| | |    
T  11772917 ttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaagacataacaacacaacacaaggcagaatagcacaggacaaatttttatggttttgaatta 11772818  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| | |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  11772817 ttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatactattttggtatttaaaacaatttgtaggtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 11772718  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||    
T  11772717 aaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgcctccagattgccttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtcctg 11772618  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  11772617 tccttcat 11772610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 1601049 - 1601367
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaa-----ggtagaacagcacatgacaaatttt-ta 137  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||   |||||||||     || |||||| |||| |||||||||| ||    
T  1601049 ggtgtgtttggtctgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagaaagaacaacacaacacaacacaaggcagaacaacacaagacaaatttttta 1601148  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  1601149 tggcaatgagtaattttttgttttgtacgatttttggtggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 1601248  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1601249 tttggtgagggacaaaa--atgagtttttgttctatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaccgttttacaaatcaaacactgaacaactaaag 1601346  T
Q  338 ttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||| || ||| ||||||    
T  1601347 ttgttctgtcatgttcttcat 1601367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26765082 - 26764787
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 143  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||| ||||    
T  26765082 ggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacaacacaacacaaggcagaacaatataggacaaatttttatagcat 26764983  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||   |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  26764982 tga---atttttt--tatatacgatttttgagggacgaaatattattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttcggt 26764888  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26764887 gagggacaaaaatataagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttatcttgtacctaaaacaattgtacaaatcaaacactggacaactggagttgttc 26764788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15540165 - 15539868
Alignment:
Q  61 aaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15540165 aaacagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacagcacaacacaaggcataacaacacatgacaagtttttatggtattgaataattttttgttt 15540066  T
Q  161 tatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatga 260  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||  || |||| | | |    
T  15540065 tatatgatttttgggggacaaaatgttattttggtgttttagacaacttctacgtatgacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaagacaaaagtttca 15539966  T
Q  261 gtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  15539965 ggttttgtcctgtctcttgcctccagtttgttctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctgtccttcat 15539868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 51 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38087281 - 38086990
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  38087281 ttggtttgcaaaacattaagtactggacataacagtacaagacagaacagtacaacataaggcagaacagcacaggacaaatttttatggcattgaataa 38087182  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    | ||||| ||||| | ||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||| |||     
T  38087181 tattttgctttatgcaatttttggggaacgaaatgctattttggatttttagacaacttgtacttgggacaaaaagttgtgatgtggtttagtgaaggac 38087082  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  38087081 aaaaatatgagtttttgtcatgtccattgcatccattttatcctgtacttgaaactgttttataaatcaaacacaggacaactgaagttgtt 38086990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 49303583 - 49303339
Alignment:
Q  107 acaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagaca 205  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  49303583 acaaggcagaacatcacatgacaactattttacgtcattgagtaattttttgttttatacgatttttg-gggacaaaatgttattttagtattttagaca 49303485  T
Q  206 acttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 305  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  49303484 acttgtacgtaggataaaaaattgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttctcttgtcccttgtctccagtttgtcttatacctgaaac 49303385  T
Q  306 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  49303384 agttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttttgtcttgt 49303339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 51 - 343
Target Start/End: Original strand, 10384256 - 10384548
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||| | |||||||| || | |||| |||  ||||| ||||||| ||||||| |||    
T  10384256 ttggtttgcaaaacagtaagtactgggcataacagtacaagaccgaacagcacaacacagggcaaaacaacactggacaattttttattgcattgaataa 10384355  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||     
T  10384356 ttttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttgaatttttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttagtgaaggac 10384455  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10384456 aaaaatatgagtttttgtcttgtcctttgcatccaatttgtactgtacctgaaataattttacaaatcaaacactagacaactagagttgttc 10384548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 102 - 358
Target Start/End: Original strand, 45658761 - 45659017
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  45658761 acaacacaagacagaatagcacatgacaaatttttatggctttgaataattttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaa 45658860  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
     |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  45658861 aacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagcgacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgtctccagtttgtcctgtacttg 45658960  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||    
T  45658961 aaacagttttacaaatcagacactagacaactggagttgttttgtcctgtccttcat 45659017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3415146 - 3414847
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatg-acaaatttttatggcat 143  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||  | |||| |||||| |    ||||||||||||    
T  3415146 gtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagatagaacaatataacacaagacaaaacaacacatgtaattttttttatggcat 3415047  T
Q  144 tgagtaa-ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| || || ||| ||||||    
T  3415046 tgagtaatttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttaaacaactagtacgtgggataaaaaattatgatgtagtttgg 3414947  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3414946 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctcgtctccagattgtccagtacctaaaatagttttacaaatcaaacactggataattagagttgtt 3414847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42705442 - 42705231
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42705442 tttttatggcaatgagtaattttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttgacatttcagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgtg 42705343  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagt-ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggaca 330  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42705342 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttttttcccgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaaca 42705243  T
Q  331 actagagttgtt 342  Q
    |  |||||||||    
T  42705242 atcagagttgtt 42705231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6144276 - 6143964
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||  |   |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  6144276 tgtgtttggtttgcaaaacagtaatcactgaacagaacagtacaagatagggcaacacaacataaggcagaacatcacaagacaaatttttatggtattg 6144177  T
Q  146 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 245  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||  ||    
T  6144176 aataattttctgttttatatgatttttgggtgacaaaatgttatttttgtgttttagacaacttctacgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttgccga 6144077  T
Q  246 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttcta 345  Q
    |||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||     
T  6144076 gggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtctctgaaactgttttacaaatcaaacattggacaactgcagttgttctg 6143977  T
Q  346 tcttgtccttcat 358  Q
    || ||||||||||    
T  6143976 tcctgtccttcat 6143964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 344
Target Start/End: Original strand, 5109614 - 5109910
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 145  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||  |  |||||||| | | |||| || |||||||||||||| | |||||    
T  5109614 tgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggactgaagagtacaagacaaaatagcgcaacacaaagcataacaccatatgacaaatttttacgacattg 5109713  T
Q  146 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 245  Q
    | |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  5109714 atttttttttt-ttttatacaatttttgggggacaaaatgttattttgc-attttagacaacttgtactttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtga 5109811  T
Q  246 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5109812 gggacaaaaacatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttct 5109910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 355
Target Start/End: Original strand, 16704605 - 16704919
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  | |||| |||||   | |||| || | |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  16704605 agggtgagtttggttttcaaaacagaaagtactggacataacaacacaagacagaacaacaaaacataaagcagaatagtacaagacaaatttttatggc 16704704  T
Q  142 attgagtaa-ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  || ||||||| ||||||||    
T  16704705 attaaataaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaaagctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaagagttgtgatgtggttt 16704804  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||    
T  16704805 ggtaagggacaaaaatatatgtttttgtcgtgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaattgaagttg 16704904  T
Q  341 ttctatcttgtcctt 355  Q
    |||| || |||||||    
T  16704905 ttctgtcctgtcctt 16704919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 282
Target Start/End: Original strand, 25539735 - 25539975
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||  |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25539735 agggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaagacataacaatacaacacaaggcagaatagcacaggacaaatttttatggc 25539834  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  25539835 tttgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaaaacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 25539934  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 282  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  25539935 gtgagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgcct 25539975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 257
Target Start/End: Original strand, 38663021 - 38663227
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| |||||   |||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  38663021 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacaacacaatataagggagaacaacacaggacaaatttttatgacattgaataa 38663120  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  38663121 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 38663220  T
Q  251 aaaaata 257  Q
    |||||||    
T  38663221 aaaaata 38663227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13994366 - 13994067
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||  |||||| |  ||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||  ||    
T  13994366 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtacagaacaaaacaacataagacaacacaacacaatacaaggcagaacaacacaagacaaattttgtatgatat 13994267  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||    
T  13994266 tgaataattttatgttttatatgatttttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgtgttgtggtttggt 13994168  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13994167 gagggacaaaaatttcagtttttgtccagttccttgcctccaatttgtcatgtccatgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttc 13994068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20495137 - 20494927
Alignment:
Q  91 gatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 189  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20495137 gatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatactatttttgagggacaaaatgctat 20495038  T
Q  190 tttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||                   ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20495037 tttggtattttagacaacttgtacgtggga-----------------cattggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 20494955  T
Q  290 gtcctgtacctgaaacagttttacaaat 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20494954 gtcctgtacctgaaacaattttacaaat 20494927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50382608 - 50382394
Alignment:
Q  131 atttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgt 230  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50382608 atttttatggtattgaataatattttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttatttttgtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 50382509  T
Q  231 gctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg---cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgg 327  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| ||||| |||   ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  50382508 gttgtggtttggtgaaggacaaaaatttcagtttttgtcctgtccattgcctcctccagtttgttatgtccctgaaacagttttaaaaatcaaacactaa 50382409  T
Q  328 acaactagagttgtt 342  Q
    |||  ||||||||||    
T  50382408 acatgtagagttgtt 50382394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 247
Target Start/End: Original strand, 34663821 - 34664012
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34663821 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacataaggtagaagagcacatgacaaattttttatgg 34663905  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||   |||||||||| ||||||||    
T  34663906 cattaagtaattttttgttttatatgatttttgagtgacaaaatgttattttgatattttagacaatttataagtgggtcaaaaagttgtgttgtggttt 34664005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 178 - 358
Target Start/End: Original strand, 7837149 - 7837329
Alignment:
Q  178 acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||| |||| |||||| | ||| |||||  | | ||||||||||||||||    
T  7837149 acaaaatactattttgatattttagacaacttgtctgtgagacaaaaagttgtgatgtgatttggtaatggacaaaaaattcaatttttgtcatgtccct 7837248  T
Q  278 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  7837249 tgcctctagtttgtcatgttcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgttctatcatatccttcat 7837329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 322
Target Start/End: Original strand, 570281 - 570549
Alignment:
Q  57 tgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttttt 156  Q
    |||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||   |||||| || | |||||| |||| || |||||||||||| | ||| || ||||||    
T  570281 tgcaaaacagtaagtattagacaaaatagtacaagatagaacaacacaacataaagcagaacaacacaagataaatttttatggtactgaatactttttt 570380  T
Q  157 gttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc--tgtggtttggtgagggataaaa 254  Q
     | |||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  570381 atcttatacaatttttggtggaaaaaatgttattttgatattttagacaacttatacgcgagacaaaaagttgtgcattgtggtttggtgagggacaaaa 570480  T
Q  255 atatgagtttttgtcatgtccc-ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 322  Q
    || |  |||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  570481 atttctgtttttatcatgtccctttgcctccagtttatcttgtcgctgaaacaattttataaatcaaac 570549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25343431 - 25343213
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  25343431 agaacaacacaagacaaatttttatgacattgaataattttttgctttatgcgatttttgagggacgaaatactattttggatttttggacaacttgtac 25343332  T
Q  214 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc-cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 312  Q
    ||| ||  ||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||| |||||| || | |||  |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  25343331 gtgcgacaaaaagttgtactatggtttagtgaaggacaaaaatatgtgtttttatcctatccatttgcatccagtttgtcctgtatatgaaactgtttta 25343232  T
Q  313 caaatcaaacactggacaa 331  Q
     ||||||||| | ||||||    
T  25343231 taaatcaaacgcaggacaa 25343213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Original strand, 8838986 - 8839093
Alignment:
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  8838986 aaaaatatcagtttttgtcatgtccatttcctccagtttgtcttgtaccagaaacagttttacaaatcaaacattggacaattggagttgttctgtcttg 8839085  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  8839086 tccttcat 8839093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 504625 - 504394
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||| ||  | |||||||||||  | |||||| |||| |||| |||||||    
T  504625 acaacacaaagtagaataacacatgtcaaatttttatggtattggacaatttttagtcctctacgatttttggtgaacaaaaagctactttggtatttta 504526  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    |||||||| || ||||||  |||| ||||| | |||||| ||||| || |||| | | |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||     
T  504525 gacaacttctatgtgggacaaaaaattgtgttatggtttagtgagagacaaaattttcagtttttgtgttgtcccttgcctcaagtttgtcttgtcccta 504426  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||    
T  504425 aaacaattttgcaaatcaaacgctgtacaact 504394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 206
Target Start/End: Original strand, 8838827 - 8838987
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||   |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  8838827 ttggtttgcaaaacagtaaatactagacataactgtataagacagaacaacacaacacaagatagaaaaacacataacaaatttttatagcattgaataa 8838926  T
Q  151 -ttttttgtt----ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 206  Q
     |||||||||    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8838927 tttttttgttttaattatatgatttttgggggacgaaatgccattttgatattttagacaa 8838987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 356
Target Start/End: Original strand, 6771338 - 6771562
Alignment:
Q  133 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttg-agggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    |||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  6771338 ttttatggtattgaataatacttagtcttatacgatttttttatggacaaaatattattttgatattttagtcaacttgtatgtgggagaaaaagttgtg 6771437  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
     |||| ||| ||||| || || ||| | |||||||||| ||||||||| ||| | ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  6771438 ttgtgatttagtgagtgacaagaattttagtttttgtcttgtcccttgtctctaatttatcatgtccctaaaacagttttataaatcaaacaccgcacaa 6771537  T
Q  332 ctagagttgttctatcttgtccttc 356  Q
     || | ||||  | |||||||||||    
T  6771538 ataaaattgtcatgtcttgtccttc 6771562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 283 - 358
Target Start/End: Original strand, 38663228 - 38663303
Alignment:
Q  283 ccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38663228 ccagtttatcctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcttgtccttcat 38663303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 285
Target Start/End: Original strand, 46447665 - 46447787
Alignment:
Q  163 tacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||  |||   |||| |||||||| | |||    
T  46447665 tacgatttttgatggacaaaagactattttgatattttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtgatgtaatttaaggaggaataaaaattttagt 46447764  T
Q  263 ttttgtcatgtcccttgcctcca 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  46447765 ttttgtcaggtcccttgcctcca 46447787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 358
Target Start/End: Original strand, 7837474 - 7837570
Alignment:
Q  262 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| | ||||||||    
T  7837474 tttttgtcatgtcccctgcctctagtttgtcatgttcctgaaacagttttataaatcaaacactgaacaactgaagttattctatcatatccttcat 7837570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 358
Target Start/End: Original strand, 21071727 - 21071810
Alignment:
Q  275 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||||    
T  21071727 ccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattgaagttgttctgtcatgtacttcat 21071810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Original strand, 21071621 - 21071727
Alignment:
Q  54 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattt 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||     ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  21071621 gtttgtaaaacagtaagtactggactaaacagtacaagatagcac-----aacacaaggcagaacaatacatgacaaatttttattacattgaataattt 21071715  T
Q  154 tttgttttatac 165  Q
    ||||||||||||    
T  21071716 tttgttttatac 21071727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32468025 - 32467910
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||   | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  32468025 tttttatggtattgactaattttttgtcttatatgattttttgtgaacaaaaaactattttgatattgtagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtg 32467926  T
Q  232 ctgtggtttggtgagg 247  Q
    |  |||||| ||||||    
T  32467925 cgttggtttagtgagg 32467910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 323
Target Start/End: Original strand, 26733579 - 26733716
Alignment:
Q  186 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |   |||||||||| | |||||| ||| |||| || ||| | |||||||||||||||| | | ||| |    
T  26733579 ctattttggtattttagacaacttgtacatgaggcaaaaagttgtgttatggtttagtgggggacaagaatttcagtttttgtcatgtccatcgtctcta 26733678  T
Q  286 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 323  Q
    |||||||| || |   ||||||||||||||||||||||    
T  26733679 gtttgtccggtcctaaaaacagttttacaaatcaaaca 26733716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34284040 - 34283912
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattt--tagacaacttgt 211  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  || |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||  || | |||||||    
T  34284040 agaacaacacaagacaaacttttatggtattgaataagtttttgccttgtacgattttttatggacaaaagactattttgatattttatatataacttgt 34283941  T
Q  212 acgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  34283940 acgtgagataaaaagttgtgttgtggttt 34283912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2761770 - 2761551
Alignment:
Q  121 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggat 220  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||  |||||||  ||||||||| || |||||| || ||     
T  2761770 cacatgacagacttttatagtattgaataatttttggttttatatgatttttgttg-acaaaaatctatttttgtattttagataatttgtacttgagac 2761672  T
Q  221 gaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 320  Q
     |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  |  ||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||  |  ||||| |||||||||| ||    
T  2761671 aaaaaattgtgttgtggtttagtgagggatataaaattttgtttttgttttgtcccttgcctctagtttatcatgtcgcataaacaattttacaaattaa 2761572  T
Q  321 acactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||   |||||| |||||||    
T  2761571 acaccatacaacttgagttgt 2761551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23799670 - 23799603
Alignment:
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtca 270  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23799670 acaacttaaacgtgcgataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtca 23799603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 332
Target Start/End: Original strand, 39792826 - 39792977
Alignment:
Q  181 aaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgc 280  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||  |  | |||||||| ||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||| ||  |||     
T  39792826 aaatgttattttattattttagacaatttgtacgtgaaacaacaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaagaatttcaatttttgtcatatcttttgt 39792925  T
Q  281 ctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 332  Q
    ||||| ||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39792926 ctccaatttatcttgtccctaaaacagttttgcaaatcaaacactgtacaac 39792977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Original strand, 15324109 - 15324201
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 206  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15324109 agaacaacacatgaaaagcttttatggtaataaataattttttgtcttatacgatgtttgatggacaaattactattttgatattttagacaa 15324201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 46815906 - 46815816
Alignment:
Q  159 tttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  46815906 tttagacggtttttggcggacaaaatgttattttggtattttagacaactagtacgtgggaaaaaaggttgtgatatggtttagtgaggga 46815816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 30105960 - 30105915
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30105960 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 30105915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 323
Target Start/End: Original strand, 40610739 - 40610883
Alignment:
Q  179 caaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc-cct 277  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||||||| ||   |    
T  40610739 caaaatgttattttggtattttagacaacttatatatgtgataaaaagttgtgttgtggtttgatgagggagaagaat-tttgtttttgtcatatctttt 40610837  T
Q  278 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 323  Q
    ||||| || |||||||||   | | |||||||||||||||||||||    
T  40610838 tgccttcaatttgtcctgccgccggaacagttttacaaatcaaaca 40610883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 26118494 - 26118450
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26118494 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 26118450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23799749 - 23799670
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaa 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  23799749 ttggtttacaaaacagtaagtactgtatagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaacacatgacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 49799322 - 49799424
Alignment:
Q  107 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 206  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| |||| ||| || |||| | |||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  49799322 acaagctagaacaccacaagacaaacttttatgatattgaataatatttggtcttattcaattttttatggacaaaagtctattttggtattttagacaa 49799421  T
Q  207 ctt 209  Q
    |||    
T  49799422 ctt 49799424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 192
Target Start/End: Original strand, 7836542 - 7836630
Alignment:
Q  104 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    |||| ||||||||| | ||||  |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  7836542 aacataaggtagaataacacagaacaagttattatgatattgaataattttttgttttatacgagttttggggcacaaaatgctttttt 7836630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16643361 - 16643272
Alignment:
Q  155 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgag 246  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||| |||||||||    
T  16643361 ttgttttatacgattttgg--ggacgaaatggtatttttgtattttagacaacctgtatgtgggacaaaaagttgtgtcgtgatttggtgag 16643272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40811405 - 40811349
Alignment:
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  40811405 aaacagttttataaatcaaacgctggacaactaaagttgttttgtcatgtccttcat 40811349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 52030434 - 52030330
Alignment:
Q  107 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 206  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||| | |||||||||| |||| |||||||   ||||||||  |||||||  ||||||||| ||    
T  52030434 acaaggcataacagcacatggcaaacttttacggtattgaatcattttttgttatatatgattttttgtggacaaaaaactatttttgtattttagataa 52030335  T
Q  207 cttgt 211  Q
    |||||    
T  52030334 cttgt 52030330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8780690 - 8780601
Alignment:
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||| | |||||||| |||||| |||| | |||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  8780690 aaaaatttcagtttttggcatgtctcttgtccccagtttgttatgtccatgaaacagttttac-aatcaaacacagtacaactacagttgt 8780601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 17291612 - 17291757
Alignment:
Q  195 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 294  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||  ||||||| || |||||||| ||| |||| |||||| |  ||||||||| |||| |||| || ||  || ||||    
T  17291612 tattttatataacttgtacgagggacaaaaagttttgttgtggtttagtg-gggacaaaaatttatgtttttgtcctgtctcttgacttcaacttatcct 17291710  T
Q  295 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    || |   |||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||    
T  17291711 gtcctaaaaacagttttacaaatcaaataccgtacaactggagttgt 17291757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 340
Target Start/End: Original strand, 33316499 - 33316577
Alignment:
Q  262 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  33316499 tttttgttttgtctcttgcgtccagtttgttttgtccctgaaacagatttacagatcaaatactgtagaactagagttg 33316577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 47093064 - 47093006
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  47093064 agaacaacacatgacaaatttttataatattgaataattttttgccttatacgattttt 47093006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30798705 - 30798605
Alignment:
Q  222 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 321  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| || | | | |||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  30798705 aaaagttgtgatgtgggttagtgagggacaagactttcagtttt-gtcatgtcccctgcctccaatttgttatgtccctaaaacagtctttcaaatcaaa 30798607  T
Q  322 ca 323  Q
    ||    
T  30798606 ca 30798605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30798900 - 30798824
Alignment:
Q  127 acaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttaga 203  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||| |  |||||||| |||||||||    
T  30798900 acaaaattttatgatattgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaacaaactattttggtattttaga 30798824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 325
Target Start/End: Original strand, 35335799 - 35335863
Alignment:
Q  261 gtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||  |||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  35335799 gtttttgtcatgtctcttgtctccattttgttatgtctctacaacagttttacaaatcaaacact 35335863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 45446325 - 45446642
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  45446325 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 45446424  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45446425 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 45446524  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45446525 ggtgaggaacaaaaatatgagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgtcgtgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtta 45446624  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    || | |||| ||||||||    
T  45446625 ttttgtcttatccttcat 45446642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 39 - 358
Target Start/End: Original strand, 27103826 - 27104146
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-ta 137  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  27103826 ctaagggtgtgtttgatttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacattacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttta 27103925  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27103926 tggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtgg 27104025  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27104026 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattgaacaactagag 27104125  T
Q  338 ttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||| |  ||||||||||    
T  27104126 ttgttctgttctgtccttcat 27104146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 45 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32020233 - 32019920
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32020233 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcat 32020134  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  32020133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggt 32020034  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32020033 gagggataaaaatatgagtttttgtcctaccccttgcttccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttc 32019934  T
Q  344 tatcttgtccttca 357  Q
    | || |||||||||    
T  32019933 tgtcctgtccttca 32019920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 41709647 - 41709964
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  41709647 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaatttttttatgg 41709746  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  41709747 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgttggacaaaaagttgtgctgtggttt 41709846  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41709847 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcatttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 41709946  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  41709947 ttctgtcctgtccttcat 41709964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 34101379 - 34101695
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  34101379 gggtgtgtttggtttgcaaaaaagtaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacaggacaaattttttatggc 34101478  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||    
T  34101479 gttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaaaaaaaagttatgttgtggtttg 34101578  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34101579 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtgttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 34101678  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| |||||||||||||    
T  34101679 tctgtcttgtccttcat 34101695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 34062998 - 34063315
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  34062998 agggtgtgtttggtttgcaaaaccgcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagcacaacacatgacaaattttttatgg 34063097  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34063098 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 34063197  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063198 ggcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaagagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 34063297  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  34063298 ttctgtcatgtccttcat 34063315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 42 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29563461 - 29563158
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29563461 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatgg 29563362  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  29563361 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 29563262  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29563261 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcgagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttg 29563162  T
Q  341 ttct 344  Q
    ||||    
T  29563161 ttct 29563158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8673290 - 8672973
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  8673290 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaaatttttatgg 8673191  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8673190 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 8673091  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8673090 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttg 8672991  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    || | || ||||||||||    
T  8672990 ttttgtcctgtccttcat 8672973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31513818 - 31513501
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31513818 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgg 31513719  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  31513718 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacctaggacaaaaagttgtgctgtggttt 31513619  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31513618 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatctacctgaaacaattttacaaatcaaacactggataactagagttg 31513519  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  31513518 ttctgtcatgtccttcat 31513501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29672557 - 29672241
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  29672557 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagaactggacagaacaatacaagatagaacagtgcaacacaagacagaacaacacaggacaaatttttcatggc 29672458  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  29672457 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 29672358  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29672357 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacgaatcaaacactggacaactagagttgt 29672258  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| |||||||||||||    
T  29672257 tctgtcttgtccttcat 29672241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3251890 - 3251577
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  3251890 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatcggacagaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaattttttatggc 3251791  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  3251790 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggataaaaagttgtgatgtggtttg 3251691  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3251690 gtgagggacaaaaatataagtttttgttctgtcgcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactagagttgt 3251591  T
Q  342 tctatcttgtcctt 355  Q
    ||| |||| |||||    
T  3251590 tctgtcttatcctt 3251577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Original strand, 6386444 - 6386763
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||    
T  6386444 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaaaacaaattttttat 6386543  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  6386544 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggt 6386643  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6386644 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcttttacctccagtttgtcctatacctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactacagt 6386743  T
Q  339 tgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| | | |||||||||||    
T  6386744 tgttatgttttgtccttcat 6386763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 94 - 355
Target Start/End: Original strand, 4052404 - 4052664
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4052404 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttt--gttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 4052501  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4052502 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtc 4052601  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4052602 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 4052664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 68 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5969073 - 5968798
Alignment:
Q  68 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacg 166  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5969073 aagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacg 5968974  T
Q  167 atttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttttt 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5968973 atttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaatttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagttttt 5968874  T
Q  267 gtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5968873 gtcctgtcccttgcctctagtttgtcatgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 5968798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 25478118 - 25478430
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||    || ||||||||||    
T  25478118 agggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtacttgacaaaacagtataagatagaacaatacaacacaaggcagaacaggaca----aattttttatggc 25478213  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  25478214 attgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttg 25478313  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25478314 atgagggacaaaaatatgagtttttttcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgt 25478413  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    | | || ||||||||||    
T  25478414 tatgtcctgtccttcat 25478430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 46 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7395045 - 7394732
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |    
T  7395045 tgtgtttggtttgcaaaacagtaggtacttgacagaacaatataagatagaacagtacaacacaagacagaacagcataggacaagttttttatggcact 7394946  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||    
T  7394945 gagtaattttttgttttatgcgatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggtttggtg 7394846  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394845 agggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttgtaaatcaaacactggacaactagagttgttct 7394746  T
Q  345 atcttgtccttcat 358  Q
     || ||||||||||    
T  7394745 gtcatgtccttcat 7394732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 45 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13407167 - 13406867
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  13407167 gtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtacaatatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatagcat 13407068  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  13407067 tgagtaattttttgttttatacgatttttggggcacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaaattatgctgtggtttggt 13406968  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13406967 gagggacaaaaatatgagtttttgttctgttccttgcctccagtttgtcatatacctgaaacagttttacaaattaaacactagacaactagagttgttc 13406868  T
Q  344 t 344  Q
    |    
T  13406867 t 13406867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 31731935 - 31732237
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31731935 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaaaagtataagatagaacagtacaacacaagacagaatagcacatgacaaaatttttatggc 31732034  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  31732035 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtactgtggtttg 31732134  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31732135 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcaagtttgtc--------------gttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgt 31732220  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  31732221 tctgtcctgtccttcat 31732237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37664466 - 37664201
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37664466 agaacagtacaacacaatgcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagcgacaaaatgctatttt 37664367  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37664366 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtc 37664267  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  37664266 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattctgtcctgtccttcat 37664201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12753550 - 12753243
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12753550 ttggtttgcaaaacag-aagtattggacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaagacagaacaacacatgacaaaaattttatggcattgagta 12753452  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12753451 atttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaa 12753352  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  12753351 caaaaatatgagtttttgtcttgtcatttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagtcttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcct 12753252  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  12753251 gtccttcat 12753243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37618626 - 37618310
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || | | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37618626 agggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaaaacataacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatgtttatggc 37618527  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  37618526 attgaataattttttgttttatacaatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaaaacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttg 37618427  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37618426 gtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgt 37618327  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  37618326 tctgtcatgtccttcat 37618310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30543205 - 30542940
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30543205 agaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaatattttatggcattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttatttt 30543106  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30543105 ggtattttagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtc 30543006  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  30543005 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttatgtcatgtccttcat 30542940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7591641 - 7591365
Alignment:
Q  82 acagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaa 181  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7591641 acagtacaagaaagaacagtacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaa 7591542  T
Q  182 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  7591541 aatgctattttgatattttagacaacttatacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcc 7591442  T
Q  282 tccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  7591441 tccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcat 7591365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 102 - 358
Target Start/End: Original strand, 10466995 - 10467251
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10466995 acaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacatagaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatatttta 10467094  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  10467095 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtaccta 10467194  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10467195 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcat 10467251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 40388911 - 40389227
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| | ||| | ||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||||    
T  40388911 agggtgcgtttggtttgcaaaatggtaagtactggacataagagtacaagacataacagcacaacacaaggcagaacaacacaggaaaaaattttatggc 40389010  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40389011 attgaataattttttattttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggcatttaaaacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 40389110  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40389111 gtgagagataaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 40389210  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  40389211 tctgtcatgtccttcat 40389227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 22999128 - 22999445
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  22999128 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacaatacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacagaacaaatttttatgac 22999227  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |||| ||||||    
T  22999228 attgaataattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttgatattttagacaagttgtacgtgggacaaaaaagttttgctatggttt 22999327  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22999328 gctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaaccggagttg 22999427  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  22999428 ttctgtcatgtccttcat 22999445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 15001346 - 15001653
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||| ||||| ||    
T  15001346 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagacagaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggtattgaata 15001445  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15001446 attttctgttttatatgatttttgggggacaaa-tgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggga 15001544  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     |||||| | |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |    
T  15001545 caaaaatttcagtttttgttctgtctattgcctccagtttgtcctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcct 15001644  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  15001645 gtccttcat 15001653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Original strand, 17805563 - 17805878
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||     
T  17805563 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacaaaacagtacaagacagaataacacaacacaaggtagaacaacacaggacaaattttttagggcaa 17805662  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgag-ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||    
T  17805663 cgagtaattttttgttttatacgatttttgggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaagagttgtgctttggtttgg 17805762  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  17805763 tgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctctagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattagagttggt 17805862  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    || |  ||||||||||    
T  17805863 ctgttatgtccttcat 17805878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32303819 - 32303592
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32303819 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 32303720  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  32303719 attgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 32303620  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtc 269  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32303619 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtc 32303592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 102 - 358
Target Start/End: Original strand, 41548549 - 41548805
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41548549 acaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatatttta 41548648  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  41548649 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtctgctgaggtacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcatgtatctg 41548748  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  41548749 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcat 41548805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 39642763 - 39643070
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||| |||||   ||||   |||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  39642763 ttggtttgcaaaatagtaagtattgtacagaatagtacaagaaagaacaacacaatgtaagagagaacatcacaagacaaatttttatgacattgaataa 39642862  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||     
T  39642863 ttttttgttttatacaatttttgggggatgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgggacagaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 39642962  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||    
T  39642963 aaaaatatcagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttaaaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcatg 39643062  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  39643063 tccttcat 39643070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 331
Target Start/End: Original strand, 45113929 - 45114215
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  45113929 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagatagagcagcacaacacaaggcataacaacacatgataaatttgtatgacatt 45114028  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  45114029 gaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacctatgacaaaaagttgtactgtggtttggtg 45114128  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45114129 agggacaaaaatatgagtttttgtcctctcccttgcatctcgtttgttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaa 45114215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14005268 - 14004986
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt- 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||               |||||||||  |||||| || | |||||||||||     
T  14005268 tctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta---------------caacacaagacagaacaacataggacaaatttttt 14005184  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  14005183 atgacattgagtaattttttgttttatacaattttttatggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 14005084  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 334  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14005083 gtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctcaaacagttttacaaatcaaatactggacaacta 14004986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Original strand, 35225531 - 35225849
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||   ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  35225531 taaggatgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaatagtacaagacaggacaacacaacacaagacagaacaacacaagacaaatttttatg 35225630  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    | ||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||    
T  35225631 gtattgaataatttcctgttttatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttgtgacaaaaagttgtgatgtggtt 35225730  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    ||| |||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35225731 tggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaaccaaacactggacaactggagtt 35225830  T
Q  340 gttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||| || | ||||||||    
T  35225831 gttctgtcctatccttcat 35225849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 30501016 - 30501332
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||  || |||| |||| || |||| |||| |||||   |||||| |||  | |||| || | |||||||||||||| |    
T  30501016 agggtgcgtttggtttgcaaaacaacaaatacttgacataatagtacaagacagaacaacacaacataagacaaaacaccataggacaaatttttatgac 30501115  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30501116 attgaataattttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 30501215  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  30501216 gtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgggcaactgaagttgt 30501315  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    |||  | ||||||||||    
T  30501316 tctgccatgtccttcat 30501332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 102 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29611229 - 29610973
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||    
T  29611229 acaacacaaggcataacaacacaggacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgctattttggtgtttta 29611130  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29611129 gacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgttctgtccctg 29611030  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  29611029 aaacagttttacaaatcaaacattggacaactgaagttgttctgtcatgtccttcat 29610973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 37474599 - 37474887
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | | | ||||| |||| ||||| | |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37474599 ttggtttgcaaaacagcaagtacagcatatagcagtacaagaaagaacagcacaatacaagggataacagcacatgacaaatttttatgacattgaataa 37474698  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | |||| |||| |||| |||||||||||||||||||                   ||||||||| |||||||     
T  37474699 ttttttattttatacgatttttggggaaaaaaacgctagtttggtattttagacaacttgtac-------------------tgtggtttgctgagggac 37474779  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |     
T  37474780 aaaaatataagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcata 37474879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 178 - 341
Target Start/End: Original strand, 37861866 - 37862029
Alignment:
Q  178 acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  37861866 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttatgatgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcact 37861965  T
Q  278 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  37861966 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttactaatcaaacattgaacaactagagttgt 37862029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 17520468 - 17520781
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtata-----agatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     ||| ||||    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  17520468 gggtgtggttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagaacagaagaagacagaataacacaacacaagacagaacagtacaggacaaattttta 17520567  T
Q  138 tggcattgagtaatttttt--gttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 235  Q
    | || |||  | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  17520568 tagcgttggattattttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg--------gacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgt 17520659  T
Q  236 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 335  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| || || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17520660 ggtttggtgagggacaaaa-tataagtttttgccctgtcccttgcctccattttatcatgcacctaaaacacttttacaaatcaaacaccggacaactgg 17520758  T
Q  336 agttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  17520759 agttgttctgtcatgtccttcat 17520781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16485976 - 16485727
Alignment:
Q  109 aaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 208  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  16485976 aaggcagaacagcacaaaacaaatttttatggtattgaataattttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagaaaact 16485877  T
Q  209 tgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagt 308  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||  ||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||  |    
T  16485876 tatacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgttctgtcctttgccttcaatttgtcatgtccctgaaactat 16485777  T
Q  309 tttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  16485776 tttacaaatcaaacactggacaactgaaattgttctatcatgtccttcat 16485727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16595369 - 16595068
Alignment:
Q  56 ttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 155  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||| |||| || | ||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  16595369 ttgctaaacagtatgtactggacagaacagtataagacagaacaacaaaacacaaggcagaaaagtaaatggcaaacttttttggtattgaataattttt 16595270  T
Q  156 tgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaa 255  Q
     || ||||||||||||||  | |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| || | |||||| ||||     
T  16595269 ggtcttatacgatttttggtgaacaaaaagctatttttgtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattagcgagggacaaaac 16595170  T
Q  256 tatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcctt 355  Q
    |    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||| |  |||||| | ||||| || || |||||||    
T  16595169 ttcatgtttttgtcctgtcccttgcctacagtttgttctgtcccagaaaca-atttacaaatcaaacaatatacaactggtgttgtcctgtcatgtcctt 16595071  T
Q  356 cat 358  Q
    |||    
T  16595070 cat 16595068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10656838 - 10656631
Alignment:
Q  124 atgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaa 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  10656838 atgacaaatttttatgttattgaataattttttcttttatacgattttttgtggacaaattgttattttgatattttagacaatttgtacgtgagacaaa 10656739  T
Q  224 aagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 323  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| |||||  | |||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||  || ||| || ||||||||||||| |    
T  10656738 aagttgtgttgtggttttgtgaaggacaaaaaattcagtttttgtcctgtcttttgcctctagtttgtcatgtctctaaaaaagatttacaaatcaaata 10656639  T
Q  324 ctggacaa 331  Q
    ||||||||    
T  10656638 ctggacaa 10656631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 358
Target Start/End: Original strand, 21272676 - 21272854
Alignment:
Q  163 tacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagt 262  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21272676 tacgatttttaaaggacaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagt 21272775  T
Q  263 ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||| ||||                  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||    
T  21272776 ttttgtcctgtc-----------------gctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctctcgtgtcattcat 21272854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 129 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10320424 - 10320232
Alignment:
Q  129 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagtt 228  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  10320424 aaatttttatggtattgaataatttttggttttatacgattgttgttagacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgtggtaaaaagtt 10320325  T
Q  229 gtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 323  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||| |   |||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  10320324 gtgttgtggtttggtgagggataagaatttctgttttt-tttcgtcccttg-ctcaagtttgtcatgtccctaaaacggttttacaaatcaaaca 10320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 333
Target Start/End: Original strand, 6460152 - 6460417
Alignment:
Q  60 aaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgtt 159  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| | || | ||| | ||| |||| || |||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||     
T  6460152 aaaacagtaagtacttgacaaaacagtacaggacaaaacagcacagcacagggcagagtagcacaggacaaatttttatggtattgaataatttt--gtc 6460249  T
Q  160 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatat 258  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||| || |||         
T  6460250 ttatacgattttttatggacaaaatgttattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagagacaaa----- 6460344  T
Q  259 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttac-aaatcaaacactggacaact 333  Q
       |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  6460345 ---tttttgtcttgtcccttgcctccagattgtcatgtctctaaaacagctttacaaaatcaaacaatgtacaact 6460417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27109735 - 27109532
Alignment:
Q  84 agtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttttt--gttttatacgatttttgagggacaa 181  Q
    |||| ||||||||||   |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |    
T  27109735 agtacaagatagaacaacacaatacaatgcagaacggtacaggacaaattttaatagcattgaataattttttttgttttatatgatttttgggggacga 27109636  T
Q  182 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 281  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  27109635 aatgttattttggtattttaaacaatttgtacgcgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaaggaacaaaaatatctgattttatcatgtcccttgcc 27109536  T
Q  282 tcca 285  Q
    ||||    
T  27109535 tcca 27109532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 323
Target Start/End: Original strand, 54117 - 54322
Alignment:
Q  117 acagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 216  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||| |||||  ||||||| |||||| || |||||||| |||    
T  54117 acagcacaagataaacttttatggtattgaataattttttgtcttaaacgattttttgtggataaaatattattttg-tattttcgataacttgtatgtg 54215  T
Q  217 ggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaa 316  Q
    |||  |||||||||| |||||||| |  | ||| |||||| |  |||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  54216 ggacaaaaagttgtgatgtggtttagcaaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtcccttgtgtccggattgtcatgtctcagaaacagttttacaaa 54315  T
Q  317 tcaaaca 323  Q
    |||||||    
T  54316 tcaaaca 54322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 324
Target Start/End: Original strand, 10932691 - 10932888
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||  |  ||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||    
T  10932691 gacaaatttgtatggtattgaataatttttggtcttataaaaaattttatggacaaaagactattttggtattttagacaaattgtacgtggaactaaaa 10932790  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 324  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  10932791 gttgtgatgtggtttagtgaggga-caaaattttagtttttatcatgtctcttgcctctactttgtcttgtcccataaacaattttataaatcaaacac 10932888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22756501 - 22756345
Alignment:
Q  186 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 285  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||| |||||| |  |||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||| |    
T  22756501 ctatttttgtattttagataacttgtacgtgatacaaaaagttgtgttgtggtataatgagggataaaaatttatgtttttgtcttgtctcttgcctcaa 22756402  T
Q  286 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||    
T  22756401 atttgtcctatcccagaaacagttttacaaatcaaacattgtataactggagttgtt 22756345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32303597 - 32303528
Alignment:
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  32303597 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgttctatcatttccttc 32303528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 135
Target Start/End: Original strand, 21272592 - 21272676
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt 135  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  21272592 ttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacaatacaagatagatcagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaatttt 21272676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 37861803 - 37861865
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagtaattttt 155  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37861803 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttt 37861865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 37861766 - 37861865
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatgg 140  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  37861766 agggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaaca---------------gtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 37861850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 358
Target Start/End: Original strand, 38047481 - 38047533
Alignment:
Q  306 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  38047481 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcat 38047533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 955173 - 955102
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaag 111  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  955173 taagagtgtgtttggtttacaaaacagcaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaag 955102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36426347 - 36426201
Alignment:
Q  176 ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc 275  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||| || |  || |||| | | |||||||||| | |||    
T  36426347 ggacaaaagactattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagatgtgttgtggtttagtaaatgacaaaatttttagtttttgtcttatcc 36426248  T
Q  276 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 324  Q
    |||||||| || ||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  36426247 cttgcctcaagattgtcgtgt--ctgaaccaattttacaaatcaaacac 36426201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 211
Target Start/End: Original strand, 32918842 - 32918925
Alignment:
Q  128 caaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgt 211  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  32918842 caaatttttatgacattaaataattttttgttttatacaattttggggggacgaaatgctattttggtattaaaaacaacttgt 32918925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 331
Target Start/End: Original strand, 11944854 - 11945035
Alignment:
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||| |||||| || ||  |||||||||  |||||||| ||| || |    
T  11944854 atttttagtcttatacaatttttgaggcaaaaaagactattttggtattttagacaaattgtacatgagacaaaaagttgtagtgtggtttagtggggaa 11944953  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
      | | | |||||||||   ||||| |||||||| |||||||| | | | | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  11944954 ctagagtttgagtttttactatgtctcttgcctctagtttgtcatctccataaaacaattttacatatcaaacactgtacaa 11945035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Original strand, 28746254 - 28746367
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  | || |||||||||||  | |||||||  ||||||| |||||||    
T  28746254 acaacataagataaaacagcacatgataaatttttatgacattgaataatttttgatcttgtacgatttttggtgaacaaaattttattttggtatttta 28746353  T
Q  202 gacaacttgtacgt 215  Q
     | | |||||||||    
T  28746354 aatagcttgtacgt 28746367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Original strand, 4052368 - 4052412
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4052368 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 4052412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 240
Target Start/End: Original strand, 14958948 - 14959027
Alignment:
Q  160 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  14958948 ttatacgattttttgtgggcaaaaagttattttgatattttagaca-cttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 14959027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5859632 - 5859533
Alignment:
Q  116 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 215  Q
    |||| ||||| | ||| |||||| | ||||| ||||| || || ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  5859632 aacatcacataagaaacttttattgtattgattaattattggtcttataagattttttatggacaaaatactattttagtattttagataacttgtacgt 5859533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 172
Target Start/End: Original strand, 9624180 - 9624239
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa-ttttttgttttatacgattttt 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  9624180 agaacaacacatgacaaatttttatggtattgaataatttttttgtcttatacaattttt 9624239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11926956 - 11926893
Alignment:
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11926956 atttttagtcttatacaatttttgaggcacaaaagactattttggtattttagacaaattgtac 11926893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 212
Target Start/End: Original strand, 15351686 - 15351776
Alignment:
Q  121 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||   ||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15351686 cacatgataaatttttatgatattgaataattttga-ttttatacgatttttggttgataaaatgttattttggtattttagacaatttgta 15351776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 30543239 - 30543197
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30543239 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtattggacagaacagta 30543197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 37664499 - 37664458
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37664499 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagcactggacagaacagta 37664458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 54 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9733138 - 9732833
Alignment:
Q  54 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaatt 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9733138 gtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggcattgaataatt 9733039  T
Q  153 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9733038 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 9732939  T
Q  253 aaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtc 352  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  9732938 aaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtc 9732839  T
Q  353 cttcat 358  Q
    ||||||    
T  9732838 cttcat 9732833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 34338681 - 34338997
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34338681 gggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatggc 34338780  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34338781 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 34338880  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34338881 gtgagggtcaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 34338980  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  34338981 tctgtcctgtccttcat 34338997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 41 - 358
Target Start/End: Original strand, 18685705 - 18686023
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatg 139  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18685705 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatg 18685804  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18685805 gcattgagtaattttttgttttataggatttttgagggacaaaatgttattttaatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtt 18685904  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18685905 tggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 18686004  T
Q  340 gttctatcttgtccttcat 358  Q
     |||| || ||||||||||    
T  18686005 attctgtcatgtccttcat 18686023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 35114656 - 35114972
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  35114656 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggc 35114755  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  35114756 aatgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttg 35114855  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35114856 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactagagttgt 35114955  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
     || |||||||||||||    
T  35114956 cctgtcttgtccttcat 35114972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2645308 - 2644990
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  2645308 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtacttgatagaacagtataagatagaacagtacaacataaggcagaacagcactggacaaattttttat 2645209  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  2645208 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 2645109  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645108 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctct-ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 2645010  T
Q  339 tgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  2645009 tgttctatcctgtccttcat 2644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 46 - 344
Target Start/End: Original strand, 17540588 - 17540888
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17540588 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacatattttttatggcatt 17540687  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt-gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17540688 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactatttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 17540787  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17540788 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattgttc 17540887  T
Q  344 t 344  Q
    |    
T  17540888 t 17540888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 42 - 344
Target Start/End: Original strand, 32497785 - 32498088
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32497785 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 32497884  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  32497885 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 32497984  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32497985 ggtgaggtacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 32498084  T
Q  341 ttct 344  Q
    ||||    
T  32498085 ttct 32498088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 40 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5279056 - 5278751
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5279056 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 5278957  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  5278956 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgctgtggt 5278857  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||    
T  5278856 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacacctaacaattagagt 5278757  T
Q  339 tgttct 344  Q
    ||||||    
T  5278756 tgttct 5278751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 37308527 - 37308842
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37308527 gggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggc 37308626  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  37308627 attgagtaatttttttgttt-tacgattttttagggacaaaatactattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 37308725  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37308726 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 37308825  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  37308826 tctgtcctgtccttcat 37308842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30326550 - 30326235
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||     
T  30326550 gggtgtgtttggtttgcaaaagagcaagtactggacagaacagtacaagatagaaccgtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatgga 30326451  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  30326450 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 30326351  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    | ||| ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30326350 gcgagaga-caaaatatgagtttttgtcctgtcccctgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgc 30326252  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  30326251 tctgtcctgtccttcat 30326235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 33366481 - 33366797
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33366481 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggc 33366580  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  33366581 attgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttg 33366680  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33366681 gtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagaattgt 33366780  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || | ||||||||    
T  33366781 tctgtcatatccttcat 33366797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 45 - 355
Target Start/End: Original strand, 42706231 - 42706543
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42706231 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagcacttgacataacagtacaagatagaacaatacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatggcat 42706330  T
Q  144 tgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  42706331 tgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 42706430  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42706431 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgtt 42706530  T
Q  343 ctatcttgtcctt 355  Q
    || || |||||||    
T  42706531 ctgtcctgtcctt 42706543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 44284508 - 44284816
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44284508 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaac--------acaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggc 44284599  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||     
T  44284600 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgttattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggttta 44284699  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  44284700 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactctagttgt 44284799  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  44284800 tctgtcatgtccttcat 44284816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19513906 - 19513592
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| | |||  ||||||||||  ||||||||||| |||| ||    
T  19513906 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggataaaacagtacaagatagaacagtacaatagaagacagaacagcacgggacaaattttttatggtat 19513807  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19513806 tgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 19513707  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19513706 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctcccgtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggaaaactagagttgttc 19513607  T
Q  344 tatcttgtccttcat 358  Q
    | || ||||||||||    
T  19513606 tgtcctgtccttcat 19513592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 40 - 344
Target Start/End: Original strand, 16104142 - 16104447
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 138  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||    
T  16104142 taagggtgtatttggtttgcaaaacaacaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagggcaaattttttat 16104241  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  16104242 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggt 16104341  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16104342 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcgtgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagt 16104441  T
Q  339 tgttct 344  Q
    ||||||    
T  16104442 tgttct 16104447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 46 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30798703 - 30798405
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30798703 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagta--acataagacagaacagcacatgacaaattttgtatggtatt 30798606  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30798605 tagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtg 30798506  T
Q  245 agggataaaaatatgagt-ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798505 agggacaaaaatatgagttttttttcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 30798406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 68 - 358
Target Start/End: Original strand, 7258792 - 7259084
Alignment:
Q  68 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacg 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7258792 aagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaatagtacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttataca 7258891  T
Q  167 atttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttt 265  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7258892 atttttgagggacaaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 7258991  T
Q  266 tgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  7258992 tgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacagctagagttgttctgtcatgtccttcat 7259084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Original strand, 39461187 - 39461501
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39461187 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcat 39461286  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttg---tgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||   || |||| |||    
T  39461287 tgagtaattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacagcttgtacgtgagataaaaagttgtgttgttgtgattt 39461386  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| |||||    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39461387 ggtgagggacaaaaa---caatttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 39461483  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  39461484 ttctatcctgtccttcat 39461501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 33889128 - 33889430
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33889128 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacataacaaattttttatgg 33889212  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33889213 tattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 33889312  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33889313 ggtgagggaaaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactagagttg 33889412  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  33889413 ttctgtcctgtccttcat 33889430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 40692176 - 40692484
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40692176 gggtgtgtttgatttgcaaaacagtaaatactagacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggc 40692275  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  40692276 attgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatt--------ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgttctgtggtttg 40692367  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40692368 gtgagggacaaaaatacgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcttgtacctaaaacagtttcacaaattaaacactggacaactagagttgt 40692467  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| |||||||||||||    
T  40692468 tctgtcttgtccttcat 40692484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 46 - 358
Target Start/End: Original strand, 2085946 - 2086249
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  2085946 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgccatt 2086045  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||      
T  2086046 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtatttcagacaacttgtacgtgaaacaaaaagttgtactgtggtttgggt 2086145  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2086146 agggacaaaaatatgagtttttg---------ttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg-tct 2086235  T
Q  345 atcttgtccttcat 358  Q
     |||||||||||||    
T  2086236 gtcttgtccttcat 2086249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 132 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7761702 - 7761476
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  7761702 tttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtg 7761603  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761602 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 7761503  T
Q  332 ctagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    
T  7761502 ctagagttgttctgtcctgtccttcat 7761476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 42365456 - 42365764
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  42365456 ttggtttgcaaaacagtaagtattggaaaaaacaacataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggcattgagta 42365555  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  42365556 attttttgttttatatgatttttaggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtccgtgatataaaaagttgtgttgtggtttgatgaagga 42365655  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |    
T  42365656 caaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactagacaactagagttgttatgtcat 42365755  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  42365756 gtccttcat 42365764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 4641387 - 4641701
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||  |    
T  4641387 gggtgtgtttgctttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtaaaatatagaacagtacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttatacc 4641486  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  4641487 attgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattttaaacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 4641586  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||   |||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4641587 gtgagagacaaaaatatgaatttttgttccgtccc--acctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgt 4641684  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  4641685 tctgtcttttccttcat 4641701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3913679 - 3913366
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||| || | || |||||||||||||    
T  3913679 agggtgtgtttgatttgcaaaacagtaaatacttgatagaacagtataagacagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggataaatttttatggc 3913580  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  3913579 attgaataatattttgttttatacgatttttggggagcaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgtggtttg 3913480  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3913479 gtgagggacaaacatgtgagtttttgtcctgtttcttgcctccagtttgtcatatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgt 3913380  T
Q  342 tctatcttgtcctt 355  Q
    | | || |||||||    
T  3913379 tttgtcatgtcctt 3913366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 56 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28824762 - 28824460
Alignment:
Q  56 ttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | |||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||    
T  28824762 ttgcaaaacagtaagtactggactgaacagtacaagacagaacagcacaacataagacagaacaatacatgacaaatttttatgacatggaataaatttt 28824663  T
Q  156 tgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaa 255  Q
    |||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28824662 tgttttatacaatttttggggtgcgaaatgctattttagtattttagacaacttgcacgtgagataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaa 28824563  T
Q  256 tatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcctt 355  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  28824562 tatgagtttttgtcctgacccttgactccagtatgtgctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcatgtcctt 28824463  T
Q  356 cat 358  Q
    |||    
T  28824462 cat 28824460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16178100 - 16177802
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  16178100 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtgcaagacatatcaacacaacacaagatagaacaacacacgacaaatttttatagc 16178001  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  16178000 attgaataatttt--gttttatacgatttttgggggacgaaattccattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttg 16177903  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    || || || |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16177902 gtaagcgacaaaaatatcagtttatgtcctgtccattgcctccagtttatcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattggagttgt 16177803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 6896040 - 6896355
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||   ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||     
T  6896040 agggtgcgtttggtttgcaaaacagtaagtacta-acagaacagtataatgcagaacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaatttttatggt 6896138  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  6896139 attgaataatttcttgttttatatgccttttgggggacgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgttgtttg 6896238  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6896239 gtgagggacaaaaatttcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgttttgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 6896338  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || |||| |||||    
T  6896339 tctgtcctgtctttcat 6896355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 43 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40832692 - 40832388
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagta---agtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40832692 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtagtaagtattagacagaatagtacaagatagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttata 40832593  T
Q  140 gcattgagtaat--tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
      ||||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  40832592 ttattgaattattatttttgttttatacgatttttgggggacgaaatactattttggtattttagactacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtgg 40832493  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40832492 tttggtgagggacaaaaatatccgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaatagctttacaaatcaaacactggacaacttaag 40832393  T
Q  338 ttgtt 342  Q
    |||||    
T  40832392 ttgtt 40832388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 108 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32766658 - 32766421
Alignment:
Q  108 caaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaac 207  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32766658 caagggagaacaacacaggacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttggaggacgaaatgttattttggtattttagacaac 32766559  T
Q  208 ttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaca 306  Q
     ||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32766558 ctgtacgtaggacaaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaaca 32766459  T
Q  307 gttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32766458 gttttacaaatcaaacactggacaattatagttgttct 32766421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37004089 - 37003856
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatg-acaaattttt-atg 139  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||    
T  37004089 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtataagatagaacagtacaatacaaggtaaaacagcacaaggacaaattttttatg 37003990  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  37003989 gcattgaataattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 37003890  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgt 273  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37003889 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgttatgt 37003856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12672594 - 12672395
Alignment:
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||    
T  12672594 cattgagtaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacttgggataaaaacttgtgttgtggttt 12672495  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12672494 ggtgagggacaaaaatatgagattttgtcccgtcccttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacacaggacaactagagttg 12672395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10400084 - 10399773
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||| | |||   |||||| ||||     |||||||||| |||||||||||||    
T  10400084 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtgagtactgaacacaatagtacaagacaaaacatcacaacataagg-----cagcacatgataaatttttatggc 10399990  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| || ||  |||||||||| ||||||||     
T  10399989 attgaataattttttgttttatacgacttttgggggacaaaatgctattttggatttttagacaacttatacatgagacaaaaagttgtgttgtggttta 10399890  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  10399889 gtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtatcttgcatctagtttgtcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgt 10399790  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||| ||||||||||    
T  10399789 tctatcatgtccttcat 10399773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 285
Target Start/End: Original strand, 26418793 - 26419037
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| ||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26418793 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatttgacagaacagtgcaagacagaacagcacaacgcaaggcagaacaacacatgacaaaaattttatgg 26418892  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26418893 caatgagtaattttttgttttatacaatttttgggggataaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 26418992  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 285  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26418993 ggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcatgtccctcgcctcca 26419037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38993284 - 38992974
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||   |||| |||    
T  38993284 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacaatataagataggacagcacaacataaggcagaacaacacaagacaaatt---atggtatt 38993188  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    || ||||||| ||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |    
T  38993187 gaataattttctgtattatattatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgacg 38993088  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||| | ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38993087 aggaacaaaaattgtagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctcttcctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactggagttattct 38992988  T
Q  345 atcttgtccttcat 358  Q
     || ||||||||||    
T  38992987 gtcatgtccttcat 38992974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 51 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27463010 - 27462703
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||  || | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  27463010 ttggtttgcaaaacagcaagtattggataaaacagtgcaaaacagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttatatgacattgaataa 27462911  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || ||||||||||||| |||||| |||||  |||| | | ||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  27462910 ttttttgtttt-tacgatttttagggcacgaaatgctattttggtatttttgacaatatgtatg-gtgataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 27462813  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||  || ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||    
T  27462812 aaaaataacagcttttgtcttgtcccttgtctacagtttgtcatgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaaattgttatatcctg 27462713  T
Q  351 tccttcatct 360  Q
    || |||||||    
T  27462712 tctttcatct 27462703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 11114752 - 11115057
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| |||| |||||   ||||||||||  ||||||  | | || |||||||||||||||||| |||    
T  11114752 ttggtttgcaaaacagtaagtactaaacataattgtacaagacagaacaacacaacacaagacagaacaatataagaaaaatttttatggcattgaataa 11114851  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |     
T  11114852 tttttcgttttatacgattgttagcggacgaaatactattttggaattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggaac 11114951  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | || ||    
T  11114952 aaaaatatgattttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaactg-aacag-tttacaaatcaaacattggacaattggagttgttttgtcctg 11115049  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  11115050 tccttcat 11115057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 342
Target Start/End: Original strand, 30712732 - 30713031
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 145  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||   ||||||||  | | ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  30712732 tgtgtttggtttgtaaaaaagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacaacacaacacagcgcataacagcaaaggacaaatttttatggtattg 30712831  T
Q  146 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt----tg 241  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    ||    
T  30712832 aataattttttgttttatatgatttttg-gggatgaaatgatattttggtgttttagacaacttctacgtgggataaaaagttgtgttgtggttaatttg 30712930  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30712931 gtgagggacaaaaatttcagtttgtgtcctgtcccttgcctccaggttgttctgtccctgaaacagtattacaaatcaaacactggataactggagttgt 30713030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 338
Target Start/End: Original strand, 8112189 - 8112468
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattt 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||        | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8112189 tttgcaaaacagtaagtactcgacggaacaatataagatagaacaatacaacacaa--------atcacatgacaaattttgtatgacattgagtaattt 8112280  T
Q  154 tttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatatttt-agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggata 251  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||| |||| | |||||  ||| |  |||||||||| |||||||||||||| || |    
T  8112281 tttgttttatacgatttttaagggaaaaaaatgttattttggtatttttagactatttgtatctggaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagaca 8112380  T
Q  252 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca-ctggacaactagagt 338  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8112381 aaaatatgagtttttgtattgtctcttgcctccagtttgttctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacaccttgacaactagagt 8112468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 13829318 - 13829613
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||   ||||| | ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||  ||||| |||    
T  13829318 ttggtttgcaaaacagtaattattggacaaaacagtacaaagcagaacagcacaacacaaggcagaacatcacagaacaaatttttatgatattgaataa 13829417  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||| | |||| |||     
T  13829418 ttttttgttttatatgatttttgagggacgaaatgatattttggtgttttagataacttgtacctgggacaaaaagttgtgatgtggtctagtgatggac 13829517  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13829518 aaaaatttcagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcct------------gtttcacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctg 13829605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 269
Target Start/End: Original strand, 9717113 - 9717322
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||              |||||||||||||||    
T  9717113 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacga--ta--------------aaatttttatggcat 9717196  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9717197 tgggtaattttttgtttgatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 9717296  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtc 269  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    
T  9717297 gagggacaaaaacatgagtttttgtc 9717322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26981912 - 26981612
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-- 136  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||      
T  26981912 ctaagggggtgtttggtttgcaag-caataagtactggacagaacagtacaagacaaaacagcacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttt 26981814  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||| | |  ||||||| || ||||    
T  26981813 atgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttgg--------------------tattttagacaacttgtacgtagaacaaaaagttttgttgtg 26981734  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 336  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26981733 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcatttgcctcccgtttgtcttgtatctggaacagttttacaaatcaaacactggacaactgga 26981634  T
Q  337 gttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||| |  ||||||||||    
T  26981633 gttgttctgttctgtccttcat 26981612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18793478 - 18793306
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||    
T  18793478 gtgtgtttggtttgcaaaataataagtactggacaaaacagtataaaatagaacagtacaacataaggtagaacatcacaagacaaattttttatgggat 18793379  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18793378 tgagtaattttttgttttatacaatttttggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtg 18793306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12939474 - 12939275
Alignment:
Q  89 aagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat--tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 186  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||  |||||| || |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  12939474 aagacagaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttaataacattgaatattgttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgt 12939375  T
Q  187 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccag 286  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12939374 tattttggtatcttagacaacttgtacgtgagataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcccttgcctccag 12939275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38623365 - 38623208
Alignment:
Q  200 tagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacc 299  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  38623365 tagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttttccattgcctcaagtttgtcctgtccc 38623266  T
Q  300 tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttca 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| | || |||||||||    
T  38623265 tgaaacagttttacaaatcaaacattggataactgaagttgttatgtcatgtccttca 38623208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Original strand, 1247049 - 1247250
Alignment:
Q  65 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 164  Q
    |||||||| | |||| ||||||| |||| |||||   ||||||||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1247049 agtaagtagttgacataacagtacaagacagaacaacacaacacaaagcagtacagtacaagacaaatttttatggcattgaataattttttattttata 1247148  T
Q  165 cgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttt 264  Q
    ||||||||| || || ||||||        |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1247149 cgatttttggggaacgaaatgc--------tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttggtgagggacaaaaatatgagatt 1247240  T
Q  265 ttgtcatgtc 274  Q
    ||||| ||||    
T  1247241 ttgtcctgtc 1247250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41366189 - 41366020
Alignment:
Q  182 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 281  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | || ||||||    
T  41366189 aatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctatctcttgcc 41366090  T
Q  282 tccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgt 351  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||    
T  41366089 tccagtttgtcatgtccctgaaactgtttcacaaatcaaacattgcacaattggagttgttctatcttgt 41366020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18793300 - 18793196
Alignment:
Q  252 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||    
T  18793300 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc--tttgtactgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgagcaactagagttgttctgtcatgt 18793203  T
Q  352 ccttcat 358  Q
    |||||||    
T  18793202 ccttcat 18793196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45463256 - 45463112
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  45463256 agaacaacacatgacaaatttttattgcattaaataattttttgttttatacgatttctg-gggacgaaatgttattttgatattttagacaatctgtac 45463158  T
Q  214 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatg 259  Q
    ||  ||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  45463157 gtatgacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagtgacaaaaatatg 45463112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37863349 - 37863269
Alignment:
Q  278 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37863349 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcat 37863269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 339
Target Start/End: Original strand, 41934465 - 41934749
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttt 154  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  |||||| ||||||||||   |||||||||| || || | | ||| ||||||||||| || ||||| | |||||    
T  41934465 tttgcaaaacagtaagtaccgtataacacagtacaagatagaacaacacaacacaagataaaataacgcataacaaatttttacggtattgaatgatttt 41934564  T
Q  155 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 254  Q
     ||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||| |||| | | || |    
T  41934565 atgtcttatatgatttttggtggacaaaatgttattttggtattttagacaacttatacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaagtacaaga 41934664  T
Q  255 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    || | |||||||||| ||||  |||| |||||||| ||   | ||| || ||||||||||||||| |||||  |||||| |||||    
T  41934665 atttcagtttttgtcttgtcttttgcatccagtttatctcatcccttaatcagttttacaaatcacacactatacaacttgagtt 41934749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 246
Target Start/End: Original strand, 20907468 - 20907664
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||| | | ||||||||| |||| |||||     ||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  20907468 gtgtgtttggtttgcaaaatagcaggtaccgtatagaacagtacaagaaagaac-----aacacaagggagaacaacatatgacaaatttttatgtcatt 20907562  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||| |||| |||||| | |||  |||| |||| |||||||||||||    
T  20907563 gaataattttttgttttgtacgatttttgggggataaaatgttattttagtattttatacaatttgtacataggacaaaaaattgttctgtggtttggtg 20907662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35473160 - 35472967
Alignment:
Q  101 tacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||| | |||||||| || |||||| | |||| | |||||||| | |||| || ||||||    
T  35473160 tacaatacaagttagaacaacatatgacaaattttgatggtattaaataatttttggtcttatacaaatttttatggacaaaaggatattatggtatttt 35473061  T
Q  201 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 294  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||    ||||||| |||||| |||| ||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  35473060 agacaacttgtacgtgggacaaaaaattgcagagtggtttagtgaggaataagaatttcagtttttgacttgtcccttgcctccaatttgtcct 35472967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 287 - 358
Target Start/End: Original strand, 9717317 - 9717388
Alignment:
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9717317 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcat 9717388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 274
Target Start/End: Original strand, 37088218 - 37088376
Alignment:
Q  116 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 215  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  |    
T  37088218 aacagcacaagacaaatttgtatggtattgaacaattttgtgtcttatccgatgtttgatggacaaaatgctattttggtattttaaacatcatgtattt 37088317  T
Q  216 gggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
     |||||||||| |||| ||||| || |||||||| || ||| | |||||||||| ||||    
T  37088318 aggatgaaaagatgtgttgtggcttagtgagggacaagaatttcagtttttgtcttgtc 37088376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40876697 - 40876554
Alignment:
Q  187 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccag 286  Q
    ||||||| ||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  40876697 tattttggtatattaaacaatttgtacttgg-atgaaaagttgtgttgtggtttaatgaaagataaaaatttgagcttttgtcatgtcccttacctccgg 40876599  T
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
    | |||| ||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40876598 tgtgtcatgtccttaaaatagttttacaaatcaaacattggacaa 40876554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37003858 - 37003794
Alignment:
Q  294 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||    
T  37003858 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaacttgagttgttatgtcctgtccttcat 37003794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12672674 - 12672596
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaaca 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12672674 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactagacataa-aatataagatagaacagtacaacacaaggcagaaca 12672596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15303306 - 15303180
Alignment:
Q  195 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 294  Q
    |||||||||||||||  | |||| |  |||||||||| ||| ||||| | | ||| |||||| |  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15303306 tattttagacaacttacatgtggaacaaaaagttgtgatgtagtttgataaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtgtcttgcctctagtttgtcct 15303207  T
Q  295 gtacctgaaacagttttacaaatcaaa 321  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  15303206 gtctctgaagcagttttacaaatcaaa 15303180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 325
Target Start/End: Original strand, 26796173 - 26796382
Alignment:
Q  115 gaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg 214  Q
    ||||| |||| |||||| | || ||| |||||||| ||||   | ||||| ||||||||  ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26796173 gaacaacacaagacaaactattctggtattgagtatttttggctcttatatgatttttggtggacaaaagactatttgg-tattttagacaacttgtacg 26796271  T
Q  215 tgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttaca 314  Q
    || ||  |||||||| | |||| ||| |||||||| | |||| | | ||||| || | ||| ||||||  |||||||  ||| | || ||||||||||||    
T  26796272 tgtgacaaaaagttgcgttgtgctttagtgagggacacaaattttaatttttatcctatccattgcctgaagtttgttttgtccttgtaacagttttaca 26796371  T
Q  315 aatcaaacact 325  Q
    |||||||||||    
T  26796372 aatcaaacact 26796382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13249545 - 13249421
Alignment:
Q  116 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 215  Q
    |||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13249545 aacaacacaagacacatttttaagacattgaataattttttattatattctatatttgatggacaaaagtctattttgatattttaaacaacttgtactt 13249446  T
Q  216 gggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
     |||  |||| ||||| ||||||||    
T  13249445 tggacaaaaaattgtgttgtggttt 13249421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6453315 - 6453249
Alignment:
Q  260 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 326  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6453315 agtttttgtcttgtcccttacctccggtttatcctgtccctgaaacaattttaaaaatcaaacactg 6453249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12939274 - 12939221
Alignment:
Q  305 cagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  12939274 cagttttataaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcttatccttcat 12939221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45463107 - 45463042
Alignment:
Q  277 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   || |||||| ||||||||    
T  45463107 ttgcctcctgtttgtcttgtacctgaagcagttttacaaatcaaatgttgaacaactggagttgtt 45463042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 38786647 - 38786503
Alignment:
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||  | ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||  ||| |||||| | ||||||     
T  38786647 attgaataatttttggtgttctacgattttgtacggacaaaagtctattttcatattt-agacaacttatacgtgagacaaaatgttgtgttttggttta 38786549  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 289  Q
    ||||| ||  ||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  38786548 gtgagaga--aaaatttcagtttttatcttgtccattgcctccagttt 38786503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 334
Target Start/End: Original strand, 18278926 - 18279064
Alignment:
Q  195 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 294  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| ||  ||||||||||  ||| ||| |||||| | |||||| | |||||||||   |||| ||| |||||||||||| |    
T  18278926 tattttatacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgacgtgatttagtgaggaacaaaaattttagtttttgtgccgtcctttgtctccagtttgtctt 18279025  T
Q  295 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 334  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||||    
T  18279026 gtccctaaaaca-ttttataaatcaaacattgcacaacta 18279064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16062178 - 16062014
Alignment:
Q  176 ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||   || ||||| ||||||| || ||| |  ||||||||||| ||    
T  16062178 ggacaaaatgttattttgtcattttagacaa-ttgtatgtgggacaaaaaagttgtatcgtagtttgatgagggacaagaatttatgtttttgtcatatc 16062080  T
Q  275 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||| || ||| ||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  16062079 ccttaccaccaatttattttgtgtctg-aacagttttacaaatcaaaaactgtacaacttgagttgt 16062014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 31148786 - 31148844
Alignment:
Q  148 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 206  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  31148786 taattttttgttttatacaatttgtgttggataaaaaactattttgatattttagacaa 31148844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12217706 - 12217650
Alignment:
Q  260 agtttttgtcatgtcccttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaa 315  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  12217706 agtttttgtcatgtctcttgtcccccagtttgccctgtccctgtaacagttttacaa 12217650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 110)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Original strand, 23521751 - 23522070
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  23521751 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagataaaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttat 23521850  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23521851 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 23521950  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23521951 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcttccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 23522050  T
Q  339 tgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| | || ||||||||||    
T  23522051 tgttttgtcctgtccttcat 23522070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Original strand, 24002209 - 24002529
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttat- 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |     
T  24002209 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttttt 24002308  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24002309 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 24002408  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24002409 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactagag 24002508  T
Q  338 ttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||| |  ||||||||||    
T  24002509 ttgttctgtactgtccttcat 24002529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29785750 - 29785433
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29785750 agggtgtgtttgatttgcaaaacaataagtactgaacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 29785651  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  29785650 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagctgtgttgtggttt 29785551  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29785550 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 29785451  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  29785450 ttctgtcatgtccttcat 29785433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 42 - 344
Target Start/End: Original strand, 56154494 - 56154797
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  56154494 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatgg 56154593  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  56154594 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 56154693  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56154694 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctccagtttttcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttg 56154793  T
Q  341 ttct 344  Q
    ||||    
T  56154794 ttct 56154797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 51 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 55065536 - 55065231
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55065536 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtataagataaaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttatggcattgagtaa 55065437  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  55065436 ttttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 55065337  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |    
T  55065336 aaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaataactagagttgttctgtcat 55065237  T
Q  350 gtcctt 355  Q
    ||||||    
T  55065236 gtcctt 55065231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20802743 - 20802427
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  20802743 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggc 20802644  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  20802643 attgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 20802544  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20802543 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactaaagttgt 20802444  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || | ||||||||    
T  20802443 tctgtcctatccttcat 20802427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 49152311 - 49151996
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  49152311 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 49152212  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49152211 attgagtaattttttgttttatacgatttttgatggacaaaatgttattttggt-ttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtggtttg 49152113  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  49152112 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcgtgtcccttgcatccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggataactaaagttgt 49152013  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| |  ||||||||||    
T  49152012 tctgttctgtccttcat 49151996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Original strand, 21579900 - 21580213
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||     
T  21579900 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggt 21579999  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  21580000 attgagtaatttttagttttatacgatttttgagggacaacatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttg 21580099  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  21580100 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaattagaattgt 21580199  T
Q  342 tctatcttgtcctt 355  Q
    ||| || |||||||    
T  21580200 tctgtcctgtcctt 21580213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38486465 - 38486153
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |     ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38486465 agggtgtgtttcgtttgcaaaacagtaagtactagacagaacagtgcaagatagaacag-----cacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 38486371  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  38486370 cgttgagtaattttttgttttatactatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgttagacaaaaagttgtgctgtggttt 38486271  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38486270 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttatcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 38486171  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  38486170 ttctgtcatgtccttcat 38486153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 37865627 - 37865943
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  37865627 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacgggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaatttttttatggc 37865726  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||    
T  37865727 attgaataattttttgttttatacgatttctgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtgatttg 37865826  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37865827 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtctcttgcctccagattgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 37865926  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    | | || ||||||||||    
T  37865927 tatgtcgtgtccttcat 37865943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 43 - 344
Target Start/End: Original strand, 52319200 - 52319499
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  52319200 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggc 52319299  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52319300 attgagtaattt---gttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttgacattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 52319396  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52319397 gtgagggacaaaaatatgagttttcgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 52319496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 12600761 - 12601076
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12600761 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacttgacaaattttttatggca 12600860  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||     
T  12600861 ttgagtagttttttgttttaaacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttga 12600960  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12600961 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttatctccagtttgtcctgtacctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 12601060  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    || || ||||||||||    
T  12601061 ctgtcatgtccttcat 12601076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Original strand, 21202614 - 21202926
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21202614 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacaaaacagtacaagacagaacagcacaacacaaaacagaacagcacatgacaaattttttatggc 21202713  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  21202714 aatgagtaattttttgttttatacgatttttg-gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 21202812  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21202813 gtgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 21202912  T
Q  342 tctatcttgtcctt 355  Q
    ||| || |||||||    
T  21202913 tctgtcctgtcctt 21202926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 42 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33177245 - 33176942
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || | ||||||| ||||||||    
T  33177245 agggtgtgcttggtttgcaaaacggtaagtacttgacagaacagtataagatagaacagtacaacacaagacagaacaacaaaggacaaatattttatgg 33177146  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33177145 cattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 33177046  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33177045 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 33176946  T
Q  341 ttct 344  Q
    ||||    
T  33176945 ttct 33176942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 42 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9512553 - 9512238
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||  || ||||| |||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9512553 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtacgtgacagaacagtacaagatagaatagtgcaacaaaagacagaatagcacatgacaaattttttatgg 9512454  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9512453 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 9512354  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9512353 ggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgttacttgcctccagtttatcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttg 9512254  T
Q  341 ttctatcttgtccttc 356  Q
    ||||||| ||||||||    
T  9512253 ttctatcatgtccttc 9512238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 46 - 358
Target Start/End: Original strand, 55593759 - 55594075
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggac---agaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||  ||||||||| ||||||    
T  55593759 tgtgtttggtttgtaaatcagtaagtactggacgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaatgcaaaacaaattttttatggc 55593858  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55593859 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttg 55593958  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55593959 gtgagggactaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagagttgt 55594058  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||| ||||||    
T  55594059 tctgtcctgttcttcat 55594075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 42 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36743901 - 36743600
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||   ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36743901 agggtgtgtttggtttgaaaaatagtaagtactagatagaacggtacaagatagaataatacaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatgg 36743802  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  36743801 cattgagtaatttgttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagttt 36743702  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36743701 ggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaattcaaacactgaacaactagagttg 36743602  T
Q  341 tt 342  Q
    ||    
T  36743601 tt 36743600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 52949604 - 52949910
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  52949604 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaatagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 52949703  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||     
T  52949704 tttt-tgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggac 52949802  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  52949803 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatgaaacactggacaactagagttgttttgtcgtg 52949902  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  52949903 tccttcat 52949910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 40 - 357
Target Start/End: Original strand, 20694247 - 20694560
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||     ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  20694247 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtaatggatagaacagtacaagatagaac-----aacacaaggcagaatagcacatgacaaattttgtat 20694341  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||    
T  20694342 ggcaatgagtaattttttgttttatataatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgttggacaaaaagttgcgttgtggt 20694441  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20694442 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgccttcagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagt 20694541  T
Q  339 tgttctatcttgtccttca 357  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  20694542 tgttctgtgttgtccttca 20694560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 50178696 - 50178388
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  50178696 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacatcacaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatgacattgaataa 50178597  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  50178596 ttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggtttgctgaggca 50178497  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |    
T  50178496 caaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcct 50178397  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  50178396 gtccttcat 50178388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Original strand, 6776460 - 6776768
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6776460 gtgtgtttggtttgcaaaacag------ctggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 6776553  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  6776554 tgagtaattttttgttttatacgattttttagagacaaaatgatattttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 6776653  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6776654 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctatacctaaatcaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 6776753  T
Q  344 tatcttgtccttcat 358  Q
    | || ||||||||||    
T  6776754 tgtcctgtccttcat 6776768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 94 - 343
Target Start/End: Original strand, 24210243 - 24210494
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattt 191  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24210243 agaacgatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctattt 24210342  T
Q  192 tgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgt 291  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24210343 tggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaataatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgt 24210442  T
Q  292 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24210443 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaattagagttgttc 24210494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 94 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33553003 - 33552741
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33553003 agaacagtacaacacaaggcaaaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 33552904  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  33552903 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcatccaatttgtc 33552804  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  33552803 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttttgtcctgtcctt 33552741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 40 - 355
Target Start/End: Original strand, 36885817 - 36886119
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |          |||    || ||||||||    
T  36885817 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcgagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacagg----------aca----aattttttatg 36885902  T
Q  140 gcattgagt-aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36885903 gcattgagttaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttaggtattttagacaatttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggt 36886002  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36886003 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 36886102  T
Q  339 tgttctatcttgtcctt 355  Q
    |||| | ||||||||||    
T  36886103 tgttttgtcttgtcctt 36886119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 81 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20518196 - 20517918
Alignment:
Q  81 aacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggac 179  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20518196 aacagtacaagatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatagaatttttgagggac 20518097  T
Q  180 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 279  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  20518096 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaagaagttatgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgactttttgtcctgtctcttg 20517997  T
Q  280 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20517996 cctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcat 20517918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 59 - 344
Target Start/End: Original strand, 54542881 - 54543165
Alignment:
Q  59 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttg 157  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  54542881 caaaacagtaagtacta-acagaatagtacaggatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaagacaaattttttatgtcattgagtaattttttg 54542979  T
Q  158 ttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  54542980 ttttatacgatttttgagggacaaaatgatattttggtattttagacaacttgtacgtgggac-aaaagttgtgctatggtttggtgagggacaaaaata 54543078  T
Q  258 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54543079 tgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacttgaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttct 54543165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Original strand, 1231236 - 1231501
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1231236 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaagataaattttttatggcattatgtaatattttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 1231335  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  1231336 gatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttttgtgagggacaaaaatatgagtttttgtccagtctcttgcctccagtttatc 1231435  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  1231436 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctatccttcat 1231501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 106 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2725281 - 2725029
Alignment:
Q  106 cacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagac 204  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2725281 cacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagac 2725182  T
Q  205 aacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaa 304  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2725181 aacttgtacgtgg-acaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctaaaa 2725083  T
Q  305 cagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2725082 gagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcat 2725029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 51 - 344
Target Start/End: Original strand, 34929797 - 34930091
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| || ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34929797 ttggtttgcaaaacagtaaaaactagacaaaacagtacaaaataaaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggcattcagta 34929896  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34929897 aatttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtatatggggcaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggaa 34929996  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34929997 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttattctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttattct 34930091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 39 - 274
Target Start/End: Original strand, 43640969 - 43641205
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-ttttta 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  43640969 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaattttta 43641068  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43641069 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 43641168  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43641169 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 43641205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44649361 - 44649060
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttt 154  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  44649361 tttgcaaaacggcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagtacaatacaagggagaacaacacatgacaaattttgatgacattgaataatttt 44649262  T
Q  155 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 254  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  44649261 --gttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaa 44649164  T
Q  255 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcct 354  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || ||||||    
T  44649163 atatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaaactggataactggagttgttctgtcctgtcct 44649064  T
Q  355 tcat 358  Q
    ||||    
T  44649063 tcat 44649060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47642703 - 47642388
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |||||  | ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  47642703 agggtgcgtttggtttgcaaaacaacaagtatagtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaggataaatttttatgac 47642604  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  47642603 attgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 47642504  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  47642503 ctgagggacaaaaatatcagtttttatcttgtctcttacctccagtttgtcctgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgt 47642404  T
Q  342 tctatcttgtccttca 357  Q
    ||| || |||||||||    
T  47642403 tctgtcctgtccttca 47642388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 9807030 - 9807345
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9807030 agggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggc 9807129  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  9807130 attgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggtttg 9807229  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||| ||| |||||  |||||||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9807230 gtga-ggacaaaaagttgagtttttgtcctgtccattgcatctagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 9807328  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
     || || | ||||||||    
T  9807329 cctgtcctatccttcat 9807345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 3649519 - 3649826
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  3649519 ttggtttgcaaaatagtaagtactggacaacacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacatcacaaatttttatggtattgaataa 3649618  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3649619 tttcttgttttatatgttttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 3649718  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  3649719 aaaaattttagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactggagttgttctgtcttg 3649818  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  3649819 tccttcat 3649826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Original strand, 29616095 - 29616356
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29616095 agaacagtacaacacaagacagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttaagggacaaaatgttatttt 29616194  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29616195 ggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtc-----agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 29616289  T
Q  293 ctgtacct-gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29616290 ctgtaccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcatgtccttcat 29616356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 114 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 50728054 - 50727809
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50728054 agaacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta 50727955  T
Q  213 cgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 312  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50727954 cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagtttta 50727855  T
Q  313 caaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  50727854 caaatcaaacacttgacaactagagttgttctgtcatgtccttcat 50727809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 114 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 50736068 - 50735823
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50736068 agaacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta 50735969  T
Q  213 cgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 312  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50735968 cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagtttta 50735869  T
Q  313 caaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  50735868 caaatcaaacacttgacaactagagttgttctgtcatgtccttcat 50735823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 46 - 358
Target Start/End: Original strand, 42869859 - 42870161
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaagg-tagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||         || |||||||||||||    
T  42869859 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactcgacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggatagaaca---------aattttttatggcatt 42869949  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  42869950 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggac---aagttgtgctgtggtttggt 42870046  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  42870047 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcccccagtttgtcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactagagttgtta 42870146  T
Q  344 tatcttgtccttcat 358  Q
    | || ||||||||||    
T  42870147 tgtcatgtccttcat 42870161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 102 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44324494 - 44324238
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  44324494 acaacataaggcagaacagcacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaa 44324395  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  44324394 aacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcccgtcttttgcctctagtttgtcctgtacctg 44324295  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  44324294 aaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttctgtcatgtccttcat 44324238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 107 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 46680658 - 46680406
Alignment:
Q  107 acaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagaca 205  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46680658 acaagatagaacagtacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgattttttagggacaaaatgctattatggtattttagaca 46680559  T
Q  206 acttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 305  Q
    | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46680558 atttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 46680459  T
Q  306 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  46680458 agttttacaaatcaaacactgaacaactagaattgttctgtcctgtccttcat 46680406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 132 - 355
Target Start/End: Original strand, 38812484 - 38812707
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38812484 tttttatgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttgcggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 38812583  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38812584 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 38812683  T
Q  332 ctagagttgttctatcttgtcctt 355  Q
    ||||||||||| | || |||||||    
T  38812684 ctagagttgttatgtcctgtcctt 38812707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 29592774 - 29593085
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||     ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  29592774 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactggacatatcagtacaagacagaac-----aacacaaggcagaacagaacaagacaaatttttttggc 29592868  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||   ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||     
T  29592869 attgaataattttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgccattttggatttttagacaacttttatgtgggacaaaaagttgtgctgtggttta 29592968  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  29592969 gtgaagtacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaaggtgt 29593068  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  29593069 tctgtcctgtccttcat 29593085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 342
Target Start/End: Original strand, 36497148 - 36497391
Alignment:
Q  100 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatt-tttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 198  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36497148 gtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaaaaatttatagcattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacagaatgctattttgatatt 36497247  T
Q  199 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 298  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36497248 ttagacaacttgtatgttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgtctccagtttgtcctgtac 36497347  T
Q  299 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36497348 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 36497391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 50186411 - 50186718
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||  | |||||| |||  | |||| || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  50186411 ttggtttgcaaaacagtaagtacttgactgaacagtataagacaaaatagcacaacataagacataacaacataggacaaatttttatgacattgaataa 50186510  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  50186511 ttttttattttatacgatttttggggtgcgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 50186610  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50186611 aaaaatatgagtttttatcccgtcccttgcctctagtttgtcctgcacctaaaacaattttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctttcttg 50186710  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  50186711 tccttcat 50186718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 47361570 - 47361310
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47361570 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgatattgagtaattttttgttttatacgaatttttagggacaaaatgctatttt 47361471  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||     |||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  47361470 ggtattttagacaacttgtt----ggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaatttt-gtcttgtcccttgcctccggtttgtc 47361376  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  47361375 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgtcctgtccttcat 47361310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 102 - 341
Target Start/End: Original strand, 32181197 - 32181436
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32181197 acaatacaagatagaacagcacaggacaaatttgtatgacattgaataattttatgttttatactatttttgggggacgaaatgctattttggtatttta 32181296  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  32181297 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacttg 32181396  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32181397 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgt 32181436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Original strand, 2786836 - 2787154
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||   |||||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||     
T  2786836 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagaccgaacaacacaacataaggcaaaacagcactagacaattttttatt 2786935  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||   ||||||| || ||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  2786936 gcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgggacaaaaatttgtgatgtggtt 2787035  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2787036 tagtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatccagtttgtactgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactagagtt 2787135  T
Q  340 gttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| | || ||||||||||    
T  2787136 gttatgtcatgtccttcat 2787154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 109 - 351
Target Start/End: Original strand, 4325731 - 4325974
Alignment:
Q  109 aaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaac 207  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4325731 aaggcagaacaacacacgacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatgcgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaac 4325830  T
Q  208 ttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacag 307  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4325831 ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgcggttttgtgagagacaaaaatatgagtttttctcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacag 4325930  T
Q  308 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgt 351  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  4325931 ttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttttgtcttgt 4325974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 103 - 358
Target Start/End: Original strand, 11055977 - 11056232
Alignment:
Q  103 caacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 202  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| |    
T  11055977 caacacaaggtagaacagtacgggacaaatctttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgaggcacgaaatgttattttggtatttttg 11056076  T
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 302  Q
    ||||  ||||| |||||   ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11056077 acaatctgtacatgggacataaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 11056176  T
Q  303 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || |||||||    
T  11056177 aacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttatcctgaccttcat 11056232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37695741 - 37695470
Alignment:
Q  54 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattt 153  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37695741 gtttgcaaaacaacaagtactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatggcattgaataattt 37695642  T
Q  154 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  37695641 tttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttgatattttagacaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaa 37695542  T
Q  254 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37695541 aatatcagtttttgtcttgtctcttacctccaatttatcatgtacctgaaacagttttccaaataaaacact 37695470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 127 - 344
Target Start/End: Original strand, 41711806 - 41712023
Alignment:
Q  127 acaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaag 226  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||    
T  41711806 acaaatttttatgctattgaataattttttgttttatacgatatttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgagacaaaaag 41711905  T
Q  227 ttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 326  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41711906 ttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtctttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagctttacaaatcaaacactg 41712005  T
Q  327 gacaactagagttgttct 344  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41712006 gacaactagagttgttct 41712023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7555172 - 7554881
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttat 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| | |||   ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  7555172 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtattggacttaacagtacaagacaaaacaacacaacacaagacagaacatcacacgacaaatttttat 7555073  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||    
T  7555072 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttggaggccgaaatgctattttggatttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggt 7554973  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggaca 330  Q
    || |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554972 ttagtgaaggacaaaaatacgagtttttatcatgtctcttgcattcagtttgttttgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactggaca 7554881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 53200858 - 53200539
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaaca-----gtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     ||| || | |||||   |||||| |||| | |||| ||||  |||||||||||||    
T  53200858 gtgtgtttggtttgcaaaagagtaagtactggatagaacatatcagtacaaaacagaacatcacaacataaggcataacaacacagaacaaatttttatg 53200759  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggt 238  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  53200758 gtattgaataattttttgttttgtatgatttttgagggacgaaatactattttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggt 53200659  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||  |||    
T  53200658 ttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcatgttccttgcctccagtttatcctgtctctgaaacagttttgcaaatcaaacactaaacagctgaagt 53200559  T
Q  339 tgttctatcttgtccttcat 358  Q
    | || | |||||||||||||    
T  53200558 tattatgtcttgtccttcat 53200539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22318587 - 22318280
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||| | ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  22318587 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaagagtacaatgcagaacagcacaacacaagacataacaacacatgacaaatttttatgatattgaataa 22318488  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| |||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  22318487 tttcttgttttatatgatttttggatgacaaaatgttattttggtgttttagacaacttctacgtaagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 22318388  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||| | |  ||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||| || ||    
T  22318387 aaaaatttcaaattttgtcctgtctcttgccttcagtttgttctgtccctaaaacagttttacaaatcaaacactagacagctggggttgttctgtcatg 22318288  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  22318287 tccttcat 22318280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 103 - 358
Target Start/End: Original strand, 39078596 - 39078851
Alignment:
Q  103 caacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 202  Q
    |||||||||| | |||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  39078596 caacacaaggcataacaacacaggataaatttttatggtattgaataatttcttattttatatgatttttgggggacaaaatgttattttggtgttttag 39078695  T
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 302  Q
    |||||| |||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||||    
T  39078696 acaactcgtacgtaggacaaaaatttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcaggttttgtcctatctcttgcctccagtttgttctgtccctga 39078795  T
Q  303 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  39078796 aacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcat 39078851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 344
Target Start/End: Original strand, 16320408 - 16320695
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttt 154  Q
    |||||||||||| |||||||| | | | || || |||| |||||   |||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16320408 tttgcaaaacagcaagtactgtataaagcaatacaagaaagaacaacacaatagaagggagaacaacacaagacaaatttttatggcattgaataatttt 16320507  T
Q  155 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 254  Q
      ||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16320508 --gttttatacgagttttgggggatgaaattctatttttgtattttaggcaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaa 16320605  T
Q  255 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16320606 atatcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttttcctatacctgagacagttttacaaatcaaatactggacaactggagttgttct 16320695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 50729621 - 50729438
Alignment:
Q  175 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||    
T  50729621 gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatagacaaaaatttcagtttttgtcatgtc 50729522  T
Q  275 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  50729521 ccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcttgtccttcat 50729438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Original strand, 26083235 - 26083515
Alignment:
Q  65 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 164  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||   |||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  26083235 agtaagtattggactgaacaatataatgcagaacaacacaacacaaggcataacagtacacgacaaatttttatggtattgaataatttcatgttttata 26083334  T
Q  165 cgatttttgagggacaaaatgctattttga-tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtt 263  Q
     | |||||| ||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  26083335 tgctttttgggggacgaaatgttattttgggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtt 26083434  T
Q  264 tttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  26083435 tttgtcatgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactaaacaactgaagttgttct 26083515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 187 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2630018 - 2629847
Alignment:
Q  187 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccag 286  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2630018 tattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatttggtctggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcctttgcctctag 2629919  T
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  2629918 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacacgggacaactagagttgttatgtcatgtccttcat 2629847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 268
Target Start/End: Original strand, 37931798 - 37932020
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||    | || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37931798 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagacataataacataatacaaggcagaacagcacaagacaactttttatggcattg 37931897  T
Q  146 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 245  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  37931898 aataatttttcgttttatacaatttttgggggacgaaatgctattttgacattttaaacaacttgtatgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 37931997  T
Q  246 gggataaaaatatgagtttttgt 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  37931998 gggacaaaaatatgagtttttgt 37932020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 14296471 - 14296648
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14296471 gggtgtgtttgatttgcaaaacaataagtactggacagaacagaacaatatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggc 14296570  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14296571 attgagtaattttttgttttatacgatttttgggagacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtggga 14296648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 14314719 - 14314896
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14314719 gggtgtgtttgatttgctaaacaataagtactggacagaacagaacaatatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggc 14314818  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14314819 attgagtaattttttgttttatacgatttttgggagacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtggga 14314896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 51 - 355
Target Start/End: Original strand, 30942671 - 30942976
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||  ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30942671 ttggtttgtaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaattaagaacattacaatacaaggtataatagcatatgacaaatttttatagcattgaataa 30942770  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||| |   ||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  30942771 tttcttgttttatatgatttttgggggatgaaatgatattttggtgttttagacaacttatatgtgaggcaaaatgttgtgttgtggtttggtgagagac 30942870  T
Q  251 aaaaatatgag-tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
    | |||| | || ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||    
T  30942871 agaaatttcagttttttgtcccgtctcttgcctccaatttgttctgtccctgaaacagttttataaatcaaacactgaataactggagttgttctgtctt 30942970  T
Q  350 gtcctt 355  Q
     |||||    
T  30942971 atcctt 30942976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 158 - 344
Target Start/End: Original strand, 28115243 - 28115427
Alignment:
Q  158 ttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 257  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28115243 ttttataagattcttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 28115341  T
Q  258 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28115342 tcaatttttctcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacc-aaaacagttttacaaatcaaacactagacaacttgagttgttct 28115427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 269
Target Start/End: Original strand, 23327850 - 23328020
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt-gagggacaaaatgctattttgatattt 199  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||||    
T  23327850 acaacacaaagtagaacattacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttggggggataaaatgttattttggtattt 23327949  T
Q  200 tagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtc 269  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23327950 tagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatatgagtttttgtc 23328020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 222 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6973945 - 6973809
Alignment:
Q  222 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 321  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6973945 aaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtcaattgcctcccgtttgtccagtacctgaaacagttttacaaatcaaa 6973846  T
Q  322 cactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  6973845 cactggacaacaaaagttgttctatcctgtccttcat 6973809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 289
Target Start/End: Original strand, 13110211 - 13110448
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||   | | |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||  |||    
T  13110211 ttggtttgcaaaacagtaagtagtggataaaacaatacaagatagaacaacatagcacaaggtagaacaacgcagaacaaatttttatggcattgcataa 13110310  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg-tttggtgaggga 249  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||| || |||||||||  || ||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  13110311 ttttt-gttttgtatgatttttgggggacgaaatgctattttggatttttagacaaattttacgtgggacaaacagttgtgttgtggttttagtgaagga 13110409  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 289  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13110410 caaaaatatgag-ttttgtcatgtcctttgcatccagttt 13110448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 342
Target Start/End: Original strand, 42772832 - 42772962
Alignment:
Q  212 acgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttt 311  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  42772832 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctcaagtttgtcatgtacctgaaacaatttt 42772931  T
Q  312 acaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  42772932 acaaatcaaacacttgaaaactaaagttgtt 42772962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 292
Target Start/End: Original strand, 7001748 - 7001976
Alignment:
Q  62 aacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgtttt 161  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||   ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  7001748 aacagtaaatactggacaaaatagtacaagacagaacatcacaacacaagacagaacaatacaggacaaatttttatggcattgaataatttttggtctt 7001847  T
Q  162 atacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgag 261  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| ||||||| || |||||||||||| ||| | | |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  7001848 atacgatttttggtggac-aaatgttattttggta-tttagacaacttatacatagaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttttg 7001945  T
Q  262 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  7001946 tttttgttctgtctcttgcctcgagtttgtc 7001976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 246 - 355
Target Start/End: Original strand, 14296645 - 14296754
Alignment:
Q  246 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttcta 345  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  14296645 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttatg 14296744  T
Q  346 tcttgtcctt 355  Q
    || |||||||    
T  14296745 tcctgtcctt 14296754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 246 - 355
Target Start/End: Original strand, 14314893 - 14315002
Alignment:
Q  246 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttcta 345  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  14314893 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttatg 14314992  T
Q  346 tcttgtcctt 355  Q
    || |||||||    
T  14314993 tcctgtcctt 14315002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 277
Target Start/End: Original strand, 43739395 - 43739570
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||| | |||||||| || |||||| ||||||   ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  43739395 acaacataaggcagaacaacacatgataaatttttttggtattaaataatttttggtcttatacaattttttgtggataaaatgttattttaatatttta 43739494  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 277  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||    
T  43739495 gacaacttgtatgtgggacaaaatgttgtgttgtggtttggtgagggacaataatttcagtttttgtcatgtccct 43739570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 323
Target Start/End: Original strand, 9947947 - 9948084
Alignment:
Q  186 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 285  Q
    |||||||| ||||||  | |||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |    
T  9947947 ctattttggtattttgaataacttgtacgtgagacaaaaagttgtaatgtggtttagtgagggataagaattttagtttttgtcatgtctcttgcctcaa 9948046  T
Q  286 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 323  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9948047 gtttgtcatgttccttaaacagttttacaaatcaaaca 9948084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25978664 - 25978538
Alignment:
Q  201 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 300  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||| |||    
T  25978664 agacaacttgtaagtgagacaaaaagttgtgatatggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgttcattgcctccaatttgtcatgt-cct 25978566  T
Q  301 gaaacagttttacaaatcaaacactgga 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25978565 gaaacagttttacaaatcaaacactgga 25978538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 45577842 - 45577619
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |||  | ||||||   ||||||||||  |||||| |||||||    
T  45577842 acaacataaggttgaacaacacatgacaaagttttatggtattgaataatttt--gtcttaatcaattttttgtggacaaaatgtcattttggtatttta 45577745  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaat---atgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 298  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| | |||| | || |||   ||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  45577744 gacaacttgcacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttagcgaggaacaagaatttcatttttttttgtcatgtctcttgcctccagtttgtcatgtcc 45577645  T
Q  299 ctgaaacag-ttttacaaatcaaaca 323  Q
     | |||||| ||||||||||||||||    
T  45577644 ataaaacagcttttacaaatcaaaca 45577619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 228
Target Start/End: Original strand, 42772724 - 42772818
Alignment:
Q  134 tttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  42772724 tttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttggaggaaaaaatgttattttggtattttagataacttatacgtgggacaaaaagtt 42772818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 56487285 - 56487183
Alignment:
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| || ||    
T  56487285 aaaaatataaatttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatatctgaaacagttttacaaatcaaac-----acaactagagttgttctgtcatg 56487191  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    || |||||    
T  56487190 tctttcat 56487183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 53343638 - 53343560
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttt 171  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53343638 agaacagtacaacacaatgcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttt 53343560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44355995 - 44355751
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| |||| | |||| |||||||  ||||| ||| |||| || || |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  44355995 agaacaacacaggccaaacttttatgctattgaataacttttggtcttgtacgatttttgatggacaaaagactattttggtatatcatacaacttgtac 44355896  T
Q  214 gtgggatgaaaag-ttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 312  Q
    ||  ||  ||||  ||||| ||||||||  ||||||| |||||| | | |||||||| | || ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  44355895 gtaagacaaaaaaattgtgttgtggtttaatgagggacaaaaatttcaatttttgtcctctctcttacctccagtttgtcctatccctaaaacag-ttta 44355797  T
Q  313 caaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||  |||| | ||||||||    
T  44355796 caaatcaaacaccacacaactagatttgtcatatcatatccttcat 44355751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 287 - 358
Target Start/End: Original strand, 23328015 - 23328086
Alignment:
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  23328015 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaagtcaaacacatgacaactagagttgttctgtcatatccttcat 23328086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 56487374 - 56487292
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg 214  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  56487374 tttttatgtcattgattgattttttgttttatatgatttttggaggacaaaatgttattttggtattttaaacaacttgtacg 56487292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 322
Target Start/End: Original strand, 3579142 - 3579279
Alignment:
Q  186 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataa-aaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || |||  |||||||||| | |||||| |||| ||| || |||| |   ||||||||||||||||||||||     
T  3579142 ctattttggtattttagacaacttgaatgttggacaaaaagttgtgatatggtttagtgatggaaaataaatttacttttttgtcatgtcccttgcctca 3579241  T
Q  285 agtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 322  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  3579242 agtttgtcctgcccctaaaacagatttacgaatcaaac 3579279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43189914 - 43189683
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||   |||||| | | ||||||  ||||| |    
T  43189914 acaatacaaggaagagcaacacatgataaacttttatggtattgaataattttttgtcttatacgatatttagtggacaataagttatttttgtattt-a 43189816  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    || |||||| |  |||||  |||| |||||  ||||||| |||||  | |||||  |  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |  |      
T  43189815 gataacttgcatttgggacaaaaacttgtgtcgtggtttagtgagacacaaaaaattatgtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgtcatatttcaa 43189716  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43189715 aaacaattttacaaatcaaacactgtacaacta 43189683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Original strand, 985216 - 985327
Alignment:
Q  101 tacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 200  Q
    |||||||||||  | |||| || | |||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  985216 tacaacacaagacaaaacatcataagacaaatttttatggt-ttgaataatttttggtcttatatgatttttgctggacaaaagactattttgatatttt 985314  T
Q  201 agacaacttgtac 213  Q
    | |||||||||||    
T  985315 aaacaacttgtac 985327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Original strand, 52755417 - 52755601
Alignment:
Q  65 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 164  Q
    |||||||||| || ||||| ||| ||||||| |  || ||| ||||||| ||||| | |  |||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  52755417 agtaagtacttgatagaaccgtaaaagataggatagtgcaaaacaaggttgaacaacgctggacaaattgttatggtgttgaacaattttttgttttata 52755516  T
Q  165 cgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    | || ||||| ||| |||||| ||||||| || |||| ||| ||||| | ||| |  |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  52755517 caatgtttgatggaaaaaatgttattttgctaatttacacagcttgtgcttggaacaaaaagttgttttgtgctttggtgaggga 52755601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 344
Target Start/End: Original strand, 44640417 - 44640499
Alignment:
Q  262 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  44640417 tttttgtcttgtctcttgcctctagtttgtcattttccataaacagttttacaaatcaaacactgtacaactgaagttgttct 44640499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 98
Target Start/End: Original strand, 32181161 - 32181213
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaac 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  32181161 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacaatacaagatagaac 32181213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 103
Target Start/End: Original strand, 38520438 - 38520498
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtac 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38520438 gggtgtgtttggtttgcaaaacaactagtattggacagaacagtataagatagaacagtac 38520498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 50729729 - 50729641
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||   ||||| | ||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||    
T  50729729 ttggtttgcaaaatagtaaatactggacggcacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacagaacaaatttttatg 50729641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 291
Target Start/End: Original strand, 52673838 - 52673934
Alignment:
Q  195 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgt 291  Q
    ||||||||| ||||  |||||| ||  |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52673838 tattttagataactcatacgtgagacaaaaaattgtgttgaggtttagtgagggacaaaaatttctgtttttgtcatgtcccttgactccagtttgt 52673934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 2725329 - 2725283
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtata 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2725329 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatata 2725283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10184941 - 10184879
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 164  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  10184941 acaatacaaggtggaacagcacatgacaaacttttatggtattgaacaattttttgtcttata 10184879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 249
Target Start/End: Original strand, 38520518 - 38520580
Alignment:
Q  187 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  38520518 tattttggtattttatacaacttgtgcgtgggacaaaaaattatgctgtggtttggtgaggga 38520580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 46680700 - 46680658
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46680700 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagta 46680658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20644379 - 20644282
Alignment:
Q  116 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  20644379 aacaacacatgacacacttttatcgcattgaataatttttgattttatacgatttttggtgtacaaaaatctatttttgtatcttagataacttgtac 20644282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 33553036 - 33552995
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33553036 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 33552995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Original strand, 40792409 - 40792462
Alignment:
Q  160 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  40792409 ttatacgatttttgatggacaaaaagctatttttgtattttagataacttgtac 40792462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Original strand, 52673762 - 52673815
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 155  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  52673762 acaacacaaggcagaactgcacatgacaaacttttatggtattgaataattttt 52673815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 135
Target Start/End: Original strand, 32081080 - 32081124
Alignment:
Q  91 gatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt 135  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32081080 gatagaacagtacaacataaggtagaacagcacaagacaaatttt 32081124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 41720779 - 41720903
Alignment:
Q  104 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttaga 203  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||  |||||||| || |||||| ||||||   ||||||||   ||||||  |||||||||    
T  41720779 aacacaaagtagaacaacacatgacaaactttaatgatattgtataatttttagtcttatactattttttgtggacaaaaaattatttttgtattttaga 41720878  T
Q  204 caacttgtacgtgggatgaaaagtt 228  Q
     || ||||||||||||  |||||||    
T  41720879 taatttgtacgtgggacaaaaagtt 41720903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 50728088 - 50728048
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacag 85  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50728088 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacag 50728048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 50736102 - 50736062
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacag 85  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50736102 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacag 50736062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 79
Target Start/End: Original strand, 23327803 - 23327842
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggaca 79  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23327803 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtaccggaca 23327842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 172
Target Start/End: Original strand, 32858276 - 32858327
Alignment:
Q  121 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt 172  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32858276 cacatgccaaatttttatagtattgaataattttttgttttatacaattttt 32858327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 39433557 - 39433510
Alignment:
Q  59 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaac 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  39433557 caaaatagtaagtactggacagaacagtgtaagataggacagtacaac 39433510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 245
Target Start/End: Original strand, 43893535 - 43893654
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||  |||||||  ||||||||  |||||||  ||||||||| ||| || ||||| ||  ||||    
T  43893535 gacaactttttatggtattgattttttttttgttttatataatttttggtggacaaaaaactatttttgtattttagataacctgcacgtgagacaaaaa 43893634  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtga 245  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  43893635 attgtgttgtggtttagtga 43893654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 47669297 - 47669219
Alignment:
Q  61 aaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||| |||| | |||||| || |||||| |||||||    
T  47669297 aaacagtaagtattggacagaacaatacaagatggaacaatacaacataaggcaaaacagcgcacgacaaacttttatg 47669219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 323
Target Start/End: Original strand, 51518482 - 51518528
Alignment:
Q  277 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 323  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51518482 ttgcttccagcttgtcctgtatcagaaacagttttacaaatcaaaca 51518528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 333
Target Start/End: Original strand, 13110443 - 13110471
Alignment:
Q  305 cagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110443 cagttttacaaatcaaacactggacaact 13110471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 185
Target Start/End: Original strand, 36679926 - 36680009
Alignment:
Q  101 tacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg 185  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  36679926 tacaacataaggtagaacaatacatga-atttttttatggtattgatcaatgttttgttttataagatgtttgatggacaaaatg 36680009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 2614766 - 2615083
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2614766 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgg 2614865  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2614866 cattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 2614965  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2614966 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacagtggacaactagagttg 2615065  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| |||||||||||||    
T  2615066 ttctgtcttgtccttcat 2615083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 39 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15277199 - 15276879
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-tttta 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||    
T  15277199 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgacaaaaatttta 15277100  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  15277099 tggcattgagtaattttttgttttataagatttttgagggacaaaatgctattttgttcttttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtgg 15277000  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15276999 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattagacaactagag 15276900  T
Q  338 ttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  15276899 ttgttctgtcatgtccttcat 15276879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 17867714 - 17868022
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17867714 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaacatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagta 17867813  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17867814 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgaggga 17867913  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  17867914 caaaaatatgagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctagagttgttctgtcct 17868013  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  17868014 gtccttcat 17868022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 17877497 - 17877805
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17877497 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaacatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagta 17877596  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17877597 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgaggga 17877696  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  17877697 caaaaatatgagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctagagttgttctgtcct 17877796  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  17877797 gtccttcat 17877805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 3259548 - 3259870
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgac------aaatttt 135  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||      || ||||    
T  3259548 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaggattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacatgacaaattttt 3259647  T
Q  136 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3259648 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgt 3259747  T
Q  236 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259748 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 3259847  T
Q  336 agttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||| | || ||||||||||    
T  3259848 agttgttttgtcatgtccttcat 3259870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 51 - 344
Target Start/End: Original strand, 24242543 - 24242837
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  24242543 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagataaaagagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagta 24242642  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24242643 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggga 24242742  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24242743 caaaaatatgagtttttgttgtgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 24242837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32410098 - 32409794
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattt 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  32410098 tttgcaaaacagtaaatactagacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgaataattt 32409999  T
Q  154 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32409998 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtgagtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaa 32409899  T
Q  254 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcc 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  32409898 aatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttattctgtcatgtcc 32409799  T
Q  354 ttcat 358  Q
    |||||    
T  32409798 ttcat 32409794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Original strand, 24203236 - 24203549
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24203236 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacatgatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggcat 24203335  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24203336 tgagtaattttttgttttatacaatttt-gagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 24203434  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24203435 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttgttc 24203534  T
Q  344 tatcttgtccttcat 358  Q
    | || ||||||||||    
T  24203535 tgtcatgtccttcat 24203549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 59 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15277522 - 15277222
Alignment:
Q  59 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  15277522 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggtaaaacaacacagaacaaattttttatagcattgagtaatttgttg 15277423  T
Q  158 ttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 257  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15277422 ttttatacgatttttggaagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 15277323  T
Q  258 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttca 357  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  15277322 tgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaccttaaacaattttacaaatcaaacactggacaaatagagttgttttgtcttgtctttca 15277223  T
Q  358 t 358  Q
    |    
T  15277222 t 15277222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 10959872 - 10960187
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||   ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10959872 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacagtacaagacagaacatcacagcacaaggcagaacaacacatgacaaatttttatggca 10959971  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||     
T  10959972 ttgaatgatattttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgt 10960071  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10960072 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgtt 10960171  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    || || | ||||||||    
T  10960172 ctgtcctatccttcat 10960187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10324358 - 10324053
Alignment:
Q  54 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaatt 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  10324358 gtttgcaaaacagtaagtaccggacagaacagtacaagatagaacattacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatgggattgagtaatt 10324259  T
Q  153 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataa 252  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10324258 ttttgttttatacgattttttggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 10324159  T
Q  253 aaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtc 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||    
T  10324158 aaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactgaacaactagagttgttctgttctgtc 10324059  T
Q  353 cttcat 358  Q
    ||||||    
T  10324058 cttcat 10324053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 46 - 358
Target Start/End: Original strand, 11212131 - 11212444
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  11212131 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatgttttatggcctt 11212230  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||| || ||||||||||||    
T  11212231 gagtaattttttgttttattcgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgcacgtgagacaaaaggttatgttgtggtttggtg 11212330  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212331 agggacaaaagtatgagtttttgtcatgtcccttatctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 11212430  T
Q  345 atcttgtccttcat 358  Q
     ||  |||||||||    
T  11212431 gtcccgtccttcat 11212444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3933064 - 3932749
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| ||||||||||||| |  ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3933064 ggtgtgtttggtttgcaaaataacaagtattggataaaacagtataagatagaacagtacaacacaagacaaaacagcacaggacaaattttttatggca 3932965  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  3932964 ttgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttgg 3932865  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3932864 tgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgccccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagaattgtt 3932765  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    || || ||||||||||    
T  3932764 ctgtcctgtccttcat 3932749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 84 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32132597 - 32132342
Alignment:
Q  84 agtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaa 182  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32132597 agtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaa 32132498  T
Q  183 atgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32132497 atgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcct 32132398  T
Q  283 ccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32132397 ccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 32132342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 167130 - 166865
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  167130 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatatgatttttaagggacgaaatgctatttt 167031  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  167030 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttatgtcccttgcctctagtttgtc 166931  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||    
T  166930 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaagtagagttgttctgtcatatccttcat 166865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 10485038 - 10485344
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| | |||| |||| ||||||| |||||| |||||| |||    
T  10485038 ttggtttgtaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaaggga-aacaacacaggacaaatatttatgacattgaataa 10485136  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  10485137 ttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 10485236  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  10485237 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaataattttacaaatcaaacactggacaactggagttgttttgtcttg 10485336  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  10485337 tccttcat 10485344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 341
Target Start/End: Original strand, 17443135 - 17443432
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  17443135 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatattggacagaacagtacaagatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatgacat 17443234  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  17443235 tgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggt 17443334  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17443335 gagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacctgaaatggttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgt 17443432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Original strand, 34176752 - 34177017
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34176752 agaacagtacaacataagacagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 34176851  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34176852 ggtattttagactacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcatgtcacttgcctccagtttgtc 34176951  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34176952 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaagtgacaactagagttgttctgtcttgtccttcat 34177017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11614035 - 11613733
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |          |||    || ||||||||||    
T  11614035 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacacgatagaacagtacaacacagg----------aca----aattttttatggc 11613950  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11613949 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttatacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 11613850  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11613849 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgtctccattttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgt 11613750  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  11613749 tctgtcctgtccttcat 11613733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14925713 - 14925398
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  14925713 gggtgtgtttggtttgcaaagaagtaagtacgggacataacagtaaaagatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatgaca 14925614  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  14925613 ttgaataattttatgttttatacgatttttaggggacggaatgctattttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggtttgg 14925514  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  14925513 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtc 14925414  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
     | || ||||||||||    
T  14925413 atgtcctgtccttcat 14925398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 18057399 - 18057706
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||| |||||| |||    
T  18057399 ttggtttgcaaaacagtaagtattggatagaacagtaaaagatagaacagcacaacacaaggcataatagcacaggacaaatttgtatgacattgaataa 18057498  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18057499 ttttatgttttatacgatttttagaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggac 18057598  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||| ||    
T  18057599 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttacatctagtttgtcatgtatctcaaacagttttacaaatcaaacattggacaattgaagttgtcctatcctg 18057698  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  18057699 tccttcat 18057706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 133 - 344
Target Start/End: Original strand, 11279090 - 11279301
Alignment:
Q  133 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||     
T  11279090 ttttatggccttgagtaattttttgttttattcgatttttgagggataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgt 11279189  T
Q  233 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279190 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccatgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 11279289  T
Q  333 tagagttgttct 344  Q
    | ||||||||||    
T  11279290 tggagttgttct 11279301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 148 - 358
Target Start/End: Original strand, 11382041 - 11382249
Alignment:
Q  148 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  11382041 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgag- 11382139  T
Q  248 gataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatc 347  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11382140 -acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgttctgtc 11382238  T
Q  348 ttgtccttcat 358  Q
     ||||||||||    
T  11382239 atgtccttcat 11382249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11675619 - 11675322
Alignment:
Q  56 ttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| |||||   |||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  11675619 ttgcaaaacagtaagtattggacataacaatacaagacagaacaacacaacaaaaggtaaaatagcacatgacaaatttctatagcattgaataattttt 11675520  T
Q  156 t-gttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 254  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  11675519 ttgttttatacgatttttgggggacgagatgccatttaggtattttacaaagcttgtacgtgggataaaaagttgtgttatggtttggtgagagacaaaa 11675420  T
Q  255 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtc 352  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||    
T  11675419 atatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggaattgttttgtcttgtc 11675322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 51 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31870349 - 31870055
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| |||| |||||   |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31870349 ttggtttgcaaaacatcaagtattgtacataacagtacaagaaagaacaacacaatataagggagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaataa 31870250  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  31870249 ttttttgttttatacgagttttgggggacgaaatgctatttttgtattttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 31870150  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcc---tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31870149 aaaaatatcagtttttgttttgtcccttgcctctagtttgttctgttgttcctgagacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgtt 31870055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18597407 - 18597100
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||   ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  18597407 ttggtttgtaaaacagtaagtattggacagaacagtacaaagcagaacaacacaacactaggtagaacaacacataataaatttttatggtattgaataa 18597308  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  18597307 ttttttgttttatatgatttttgagggacgaagtactattttagcgttttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 18597208  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||  |    
T  18597207 aaaaatttcagattttgtcatgtcccttgcctccggtttgtcatatccctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaaattgttcaatcccg 18597108  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  18597107 tccttcat 18597100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 3379591 - 3379897
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||| | |||||  |||||||||| || |||| ||||    ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  ||    
T  3379591 ttggtttgcaaaaccgcaagtatcggacagaacaatacaagacagaataacacaacacaatgcagaacagtacatgtcaaattttaa--gcattgaacaa 3379688  T
Q  151 tttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3379689 tttttttgttttatatgatttttggaggacgaaatgctattttggtatttaagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctatggtttggtgagcga 3379788  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3379789 caaaaatatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactaaagttgttctatcat 3379888  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  3379889 gtccttcat 3379897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4494348 - 4494079
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  4494348 ttggtttgcaaaacagtaagtactagacagaacagtacaggatagaacagcacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcaatgagta 4494249  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||||                 ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4494248 attttttg-----------------gggacaaaatgttatttcggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgaggga 4494166  T
Q  250 taaaaatatgagt-ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 335  Q
     |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4494165 caaaaatatgagttttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaagagtcttacaaatcaaacactggacaactag 4494079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34684247 - 34683953
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatt--ttt 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||   |||||| |||| | |||| |||| || |||    |||    
T  34684247 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaagacaggacaacacaacataaggcataacaacacaggataaaaaagttt 34684148  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgata-ttttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 235  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  34684147 atgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtatttttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgt 34684048  T
Q  236 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 335  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34684047 ggtttggtgagggacaaaa--atgagtttttgtcgtgtcccttgcctccagtttgtcatgtacc--------ttttacaaatcaaaaactggacaactag 34683958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 32859922 - 32860238
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||   |||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||     
T  32859922 agggtgtgtttgatttgtagaacagtaagtattggacataacagtacaagataggacaacacaatataaggcagaacagcacaatacaaatttttatggt 32860021  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||  |||||||| | ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  32860022 attgaataattttctgtattatttgatttttgggtgacgaaatgttatttttgtattttagaaaacttgtacgtgagacaaaaggttgtgctgtggtttg 32860121  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    | || ||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32860122 gcgatggacaaaaattgcagcttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcatgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaattggagttgt 32860221  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    | | || ||||||||||    
T  32860222 tttgtcatgtccttcat 32860238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 330
Target Start/End: Original strand, 29054239 - 29054515
Alignment:
Q  52 tggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat 151  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||   |||||| |||  ||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||    
T  29054239 tggtttgcaaaataataagtactggacataacagtacaagataggacaacacaacataagacagaacagcacaagataaatttt-atggtattgaataat 29054337  T
Q  152 tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggata 251  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  29054338 tttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgttattttg-tattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggaca 29054436  T
Q  252 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggaca 330  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29054437 aaaattgtagtttttgtcatgtcccttgcttccaatttgtcctgttcctgaaactgttttacaaatcaaacattggaca 29054515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8178141 - 8177858
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||| || |||||||||  | ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||    
T  8178141 agggtgtgtttggtttgcaaaacatgaagcactggatagaacaatacaagatagaatagcacaacacaagacagaacagtacatgacaagttttaatagc 8178042  T
Q  142 attga--gtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    |||||   |  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||    
T  8178041 attgaacatttttttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgaacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 8177942  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 324  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8177941 tggtaagggacaaaaatatca-tttttatcctgtcccttgcctccagtttgttttgtacctgaaacagttttataaatcaaacac 8177858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9902857 - 9902600
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat-tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 200  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||  |||||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9902857 acaacacaaggcagatcagtacataacaattttttataacattgaataaaatttttggtttatatgatttttgggggacgaaatgttattttggtatttt 9902758  T
Q  201 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  9902757 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttaatgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcccttacctctagtttgtcctatacct 9902658  T
Q  301 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  9902657 gaaacagttcaacaaattaaacactgaacaactgaagttgttctatcctatccttcat 9902600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 358
Target Start/End: Original strand, 3290635 - 3290846
Alignment:
Q  134 tttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgct 233  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |    
T  3290635 tttatgacattgaataattgtttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtggga--aaaagttgtgtt 3290732  T
Q  234 gtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3290733 gtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt-----------tgacacagttatacaaatcaaacactgaacaact 3290821  T
Q  334 agagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  3290822 agagttgttctgtcatgtccttcat 3290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Original strand, 23636097 - 23636410
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||   |||||| |||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  23636097 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactggatataacagtacaagacagaacaacacaacagaaggcagaactgtacatgacagttttttatggcatt 23636196  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||   ||||| | |||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||  ||    
T  23636197 gaataattttttgttttatacaattttggggggacgaaatgctattttggatttttaaataacttgtacgtgagacaaaaatttgtgttgtggtttaatg 23636296  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    |   | |||||||||||||||| || | | |||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  23636297 aataacaaaaatatgagtttttatcctattccttgcatccagtttatcatgtacctaaaacaattttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgttct 23636396  T
Q  345 atcttgtccttcat 358  Q
     || | ||||||||    
T  23636397 gtcatatccttcat 23636410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 193
Target Start/End: Original strand, 29814736 - 29814887
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaa-atttttatggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  29814736 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttatggc 29814835  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29814836 attgagtaatgttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttg 29814887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 193
Target Start/End: Original strand, 28502330 - 28502482
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt--atgg 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||   |||    
T  28502330 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttattgg 28502429  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28502430 cattgagtaatgttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttg 28502482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14808254 - 14808012
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 145  Q
    |||| |||||||||||||||  || || || ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14808254 tgtgtttggtttgcaaaacaacaaatattgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaatagcacaggacaaatttttatggaattg 14808155  T
Q  146 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 245  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  14808154 aataatttttagttttatacgatttttgggggatgaaatgttattttggta-cttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 14808056  T
Q  246 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 289  Q
    |||| |||||||| | ||||| || | ||||||||||| |||||    
T  14808055 gggacaaaaatatcaatttttatcctatcccttgcctctagttt 14808012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 136
Target Start/End: Original strand, 32805348 - 32805442
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32805348 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttt 32805442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7396302 - 7396102
Alignment:
Q  121 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggat 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | |||| |||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||     
T  7396302 cacatgacaaatttttatggtattgaataatttt--gtctcataccatttttgatggacaaaacactatttttgtattttagataacttgtacgtgagac 7396205  T
Q  221 gaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 320  Q
     ||||||||||  ||||||| ||||||||  || || |  ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  7396204 aaaaagttgtgtagtggtttagtgaggga-caagatttctgtttttgtcctgtccattgcttccagcttgtcatgtcccagaaacagctttacaaatcaa 7396106  T
Q  321 acac 324  Q
    ||||    
T  7396105 acac 7396102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35004326 - 35004087
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| || ||||| || |||||| |||||| |  |||||||  ||||||||||||||||    
T  35004326 acaatacaaggcagaacaacacataacaaacttttatgatattgaatagtttttggtattatacaattttttattgacaaaaatctattttgatatttta 35004227  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    || |||||||||||||||  || ||||||| |||||||   |||| || |||||  | |||||||||| |||| |||| |||| |||| || ||| |       
T  35004226 gaaaacttgtacgtgggacaaagagttgtgttgtggttatatgagagacaaaaaatttagtttttgtcttgtctcttgtctccggtttatcttgtcctat 35004127  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  35004126 aaaccgttttacaaatcaaacaccgcacaactggagttgt 35004087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 333
Target Start/End: Original strand, 9613998 - 9614136
Alignment:
Q  195 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||| || ||||| |||||  | |||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9613998 tattttagacaacttatacgtggaacaaaaaattgtgttgcggtttagtgagtaacaaaaacttcaaattttgtcatgtcccttgcctccagtttatcct 9614097  T
Q  295 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9614098 gtccttgaaacagttttacaaatcaaacattgtacaact 9614136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27824849 - 27824620
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtag-aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 200  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||    
T  27824849 acaacacaaggttggaacaatacatgacaaacttttatggtattgaataatttttgatcttatatgatttttgttggacaaaaagctatttttgtatttt 27824750  T
Q  201 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 300  Q
     || |||| ||||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||| ||   | |   || || || | ||||||||||| |||||||||| | ||     
T  27824749 ggataactcgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtataatgagggacaatttttt---ttcttctcttatcccttgcctctagtttgtcctttccca 27824653  T
Q  301 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27824652 aaaacagttttacaaatcaaacactgtacaact 27824620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 119
Target Start/End: Original strand, 11381964 - 11382040
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaaca 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11381964 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaaca 11382040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9200491 - 9200332
Alignment:
Q  197 ttttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccctt-gcctccagtttgtcctg 295  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||  | ||||||||||||||| || ||| |  ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  9200491 ttttaaacaatttgtatgtgggacaaaaagttgttatatggtttggtgagggagaagaatttttgtttttgtcttgtctcttagcctctagtttgtcatg 9200392  T
Q  296 tacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcctt 355  Q
    |   | |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  | ||||||||||    
T  9200391 tctttaaaacagttttacaaatcaaacattgtacaacttgagttgtcatgtcttgtcctt 9200332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 11279012 - 11279075
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacac 108  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11279012 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacac 11279075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14808010 - 14807960
Alignment:
Q  308 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  14808010 ttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcat 14807960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32614136 - 32614030
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||| | |||| || |||||||| |||||||| |||   |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||    
T  32614136 acaacacaaggcataacaacatatgacaaacttttatggtattatataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaagttatttttatatttta 32614037  T
Q  202 gacaact 208  Q
    || ||||    
T  32614036 gataact 32614030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Original strand, 34176715 - 34176760
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34176715 agggtgggtttggtttgcaaaacggtaagtactggacagaacagta 34176760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 167170 - 167122
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  167170 ctaagggtgtgtttgatgtgcaaaacagtaaatactggacagaacagta 167122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Original strand, 27756314 - 27756370
Alignment:
Q  180 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||    
T  27756314 aaaatgttattttgatattttagacaacttatacgggggacaaaaagttgtgttgtg 27756370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 344
Target Start/End: Original strand, 33041403 - 33041439
Alignment:
Q  308 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33041403 ttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttct 33041439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28967414 - 28967355
Alignment:
Q  180 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |||||||| | |||||||    
T  28967414 aaaatgctattttgataatttagacaacttgtacttgaaataaaaagttgggttgtggtt 28967355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29203104 - 29202990
Alignment:
Q  122 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatg 221  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| || ||||   ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| || ||      
T  29203104 acatgacaaatttttatgatattgaacaattatttgtcttatatgaatttttgtggacaaaatgct-ctttggtattttaaacaacttgtacttgagaga 29203006  T
Q  222 aaaagttgtgctgtgg 237  Q
    |||||||||| |||||    
T  29203005 aaaagttgtgttgtgg 29202990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 342
Target Start/End: Original strand, 13415861 - 13415895
Alignment:
Q  308 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13415861 ttttacaaatcaaacactgtacaactagagttgtt 13415895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16542440 - 16542362
Alignment:
Q  135 ttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||||  | | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16542440 ttatggtattgaataattttttatcttatacaatttttgttgcataaaaggttattttggtattttagacaacttgtac 16542362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 284
Target Start/End: Original strand, 24785106 - 24785168
Alignment:
Q  222 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc 284  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24785106 aaaaattgtgttgtggtttagtgagcgacaagaatttcagtttttgtcatgtcccttgcctcc 24785168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29424734 - 29424652
Alignment:
Q  133 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 215  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||  ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  29424734 ttttatggtattgaataatttttggtcttgtacgttttttggtggacaaaaaactatttttgtattttagataacttgtacgt 29424652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15400760 - 15400672
Alignment:
Q  122 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15400760 acatgacaaacttttatggtattga---attttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtac 15400672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15412547 - 15412459
Alignment:
Q  122 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15412547 acatgacaaacttttatggtattga---attttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtac 15412459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15428141 - 15428053
Alignment:
Q  122 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15428141 acatgacaaacttttatggtattga---attttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtac 15428053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 206
Target Start/End: Original strand, 7365318 - 7365422
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||||||| || || | ||||| | | |||||||||| ||| | |||||||| || |||||| ||||||   |||||||   ||||||||||||||||    
T  7365318 acaacacaagttaaaataacacataatatatttttatggtattaaataatttttagtcttataccattttttgcggacaaatgactattttgatatttta 7365417  T
Q  202 gacaa 206  Q
    |||||    
T  7365418 gacaa 7365422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14925215 - 14925159
Alignment:
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || ||||||||||    
T  14925215 aaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcatgtcctgtccttcat 14925159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51259994 - 51259677
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatgg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  51259994 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaaatttttatgg 51259895  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  51259894 cattgagtaattttttgttttatatgatttttaagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtggttt 51259795  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51259794 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 51259695  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  51259694 ttctgtcatgtccttcat 51259677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 28675661 - 28675978
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  28675661 agggtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatgg 28675760  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  28675761 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 28675860  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28675861 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattg 28675960  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||| ||||||    
T  28675961 ttctgtcctgttcttcat 28675978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1344923 - 1344604
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||    
T  1344923 taagggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacatcacatgacaatttttttat 1344824  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  1344823 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggt 1344724  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1344723 ttggtgagggacaaaaatatgagtttctgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 1344624  T
Q  339 tgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  1344623 tgttctgtcctgtccttcat 1344604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12349376 - 12349068
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12349376 ttggtttgcaaaagagcaagtattggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagta 12349277  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12349276 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgtgctgtggtttggtgagaga 12349177  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |    
T  12349176 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtcct 12349077  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  12349076 gtccttcat 12349068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 45 - 355
Target Start/End: Original strand, 29584749 - 29585060
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||| || ||||    
T  29584749 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagtacagaacaaattttttattgcat 29584848  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  29584849 tgagtaattttttattttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 29584948  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584949 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 29585048  T
Q  344 tatcttgtcctt 355  Q
    | || |||||||    
T  29585049 tgtcctgtcctt 29585060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Original strand, 2134944 - 2135258
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  2134944 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacgttacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcat 2135043  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2135044 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaagtgctattttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 2135143  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2135144 gagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 2135243  T
Q  344 tatcttgtccttcat 358  Q
    | || ||||||||||    
T  2135244 tgtcctgtccttcat 2135258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 45 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 47958643 - 47958341
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||| ||| |||    
T  47958643 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagatagaacactacaatacaaggcagaacagcatagaacaaattttttatgtcat 47958544  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  47958543 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagtttggt 47958444  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47958443 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttttcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 47958344  T
Q  344 tat 346  Q
    |||    
T  47958343 tat 47958341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 46 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21221570 - 21221261
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 144  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21221570 tgtgtttggtttgcaatacagcaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatggcatt 21221471  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21221470 gagtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 21221371  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21221370 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccag-ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatattggacaactagagttgttct 21221272  T
Q  345 atcttgtcctt 355  Q
     || |||||||    
T  21221271 gtcctgtcctt 21221261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 24571153 - 24571469
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24571153 agggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacaga-cactataagatagaacaatacaacataaggcagaacagtacatgacaaattttttatgg 24571251  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24571252 cattgagtaatttgttgttttattcgatttttgggggacaaaatcctatttttgtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggttt 24571351  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24571352 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 24571451  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    || | || ||||||||||    
T  24571452 ttttgtcctgtccttcat 24571469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31883234 - 31882919
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  31883234 gggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacaacacaggacaaatttttatgaca 31883135  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  31883134 ttgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgc 31883035  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31883034 tgaggcacaaaaatatcagtttttgtcgtgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgtt 31882935  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    || || ||||||||||    
T  31882934 ctgtcatgtccttcat 31882919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 42 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 53558009 - 53557710
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53558009 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacaatacaaggtataacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 53557910  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  53557909 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgcagtggttt 53557810  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53557809 ggtgagggacaaaactatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacattgaacaactagagttg 53557710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25860632 - 25860318
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||     
T  25860632 gtgtgtttggtttgcaaaacggtaagcactggacagaacagtacaagatagaacagcacaacaaaaggcataacaacacaggacaaattttttatggcaa 25860533  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  25860532 tgagtaattttttgttttatacgatttttggagaacaaaatgctatttcggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggt 25860433  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25860432 gagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 25860333  T
Q  344 tatcttgtccttcat 358  Q
    | ||  |||||||||    
T  25860332 tgtcaagtccttcat 25860318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 38 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4851674 - 4851369
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt- 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||     
T  4851674 tctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtaccggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaagacaggacaaatttttt 4851575  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4851574 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 4851475  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 336  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4851474 ggttggtgagggacaaaa--atgagtttttgtcctgtcccttgcctccaaattgtcttgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 4851377  T
Q  337 gttgttct 344  Q
    ||||||||    
T  4851376 gttgttct 4851369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 39053058 - 39052735
Alignment:
Q  37 gtctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt 136  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39053058 gtcttagggtgtgtttggtttgcaaaatagtaaatgctgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagatagaacaacacatgacaaattttt 39052959  T
Q  137 --atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctg 234  Q
      || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  39052958 ttatagcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttg 39052859  T
Q  235 tggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 334  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39052858 tggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtcctgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaacta 39052759  T
Q  335 gagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||| | ||||||| |||||    
T  39052758 gagttgttttgtcttgtctttcat 39052735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20609846 - 20609545
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  20609846 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgac 20609762  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20609761 attgagtaattttttgttatatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 20609662  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20609661 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccaccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 20609562  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  20609561 tctgtcctgtccttcat 20609545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 40094411 - 40094691
Alignment:
Q  79 agaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg 177  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40094411 agaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatgcgatttttgaggg 40094510  T
Q  178 acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 277  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  40094511 acaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgaaacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccct 40094610  T
Q  278 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40094611 tgcctccagtttgttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcat 40094691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 34026554 - 34026855
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  34026554 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggt 34026638  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  34026639 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttg 34026738  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34026739 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaaatagagttgt 34026838  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  34026839 tctgtcctgtccttcat 34026855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 91 - 358
Target Start/End: Original strand, 44116859 - 44117127
Alignment:
Q  91 gatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 189  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116859 gatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 44116958  T
Q  190 tttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 289  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44116959 ttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 44117058  T
Q  290 gtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  44117059 gtcctgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtccagtccttcat 44117127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 51 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3864879 - 3864586
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| || | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3864879 ttggtttgcaaaacagtaagtactgcacagaacagtacaagatagaacattacaacataacgcataacagcacaggacaaattttttatggcattgagta 3864780  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3864779 attttttgttttatatgatttttg-gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgaggga 3864681  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3864680 caaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactaaagttgttct 3864586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25927533 - 25927224
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaa-cagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagt 148  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25927533 ttggtttgcaaaaacaacaagtaccggacaaaacagtataagatagaacagtacaatacaaggtagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagt 25927434  T
Q  149 aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  25927433 gattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgttttggtaaggg 25927334  T
Q  249 ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatct 348  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||     
T  25927333 acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtatttgaaacagttttacaaatcaaacattagacaactagagttgttctgtcc 25927234  T
Q  349 tgtccttcat 358  Q
    ||||| ||||    
T  25927233 tgtccatcat 25927224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51925422 - 51925105
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 140  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51925422 aagggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggatataacagtacaagacataacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttatgg 51925323  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  51925322 cattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattaaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 51925223  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51925222 ggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactggagttg 51925123  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || | ||||||||    
T  51925122 ttctgtcctatccttcat 51925105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 38213227 - 38213542
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||   | ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38213227 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattgtacagaacagtacaagacaaaacaacataacattaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 38213326  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |    
T  38213327 atgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatggtattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttcg 38213426  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38213427 tgagtgacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagattgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 38213526  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||| |||| |||||    
T  38213527 ctatcctgtctttcat 38213542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 100 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42636559 - 42636300
Alignment:
Q  100 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42636559 gtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttaaacgatttttgagggacaaaatgttattttggtatt 42636460  T
Q  199 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 298  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  42636459 ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgtcctatac 42636360  T
Q  299 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  42636359 ctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttctgtcctgtccttcat 42636300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 50386660 - 50386353
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || | ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  50386660 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaaaaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatcacattgaataa 50386561  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |     
T  50386560 ttttttgttttatacaatttttggggaacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttgttgaggcac 50386461  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||    
T  50386460 aaaaatatcaatttttgtcatgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactggagttgttctgtcctg 50386361  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  50386360 tccttcat 50386353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33364993 - 33364675
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| ||||  | |||| |||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  33364993 taagggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaatagcacaatacaagagagaacaacccaggacaaatttttatg 33364894  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  33364893 acattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtt 33364794  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    || ||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  33364793 tgctgaggggcaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaataaaacactggacaactgaagtt 33364694  T
Q  340 gttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  33364693 gttctgtcttgtccttcat 33364675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Original strand, 5442160 - 5442467
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  5442160 taagggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtactggacagaacagtacaatttagaacagtacaatacaaggtataacaacacatgacaaattttttat 5442259  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  5442260 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggataaaatgctattttgatattttagacagcttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgat 5442359  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| |||||            || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5442360 ttggtgagggacaaaaa-----------ctc-tgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagctttacaaatcaaacactggacaactagagt 5442447  T
Q  339 tgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  5442448 tgttctgtcatgtccttcat 5442467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 132 - 358
Target Start/End: Original strand, 20255007 - 20255232
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||    
T  20255007 tttttatggcattgagtaattttttgttttataagatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta-gtgggacaagaagttgtg 20255105  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20255106 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 20255205  T
Q  332 ctagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    
T  20255206 ctagagttgttctgtcatgtccttcat 20255232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26282599 - 26282315
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26282599 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagcacatgacaaattttttatggca 26282500  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  26282499 ttgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttga 26282400  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga---aacagttttacaaatcaaacac 324  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |   || |||||||||||||||||||    
T  26282399 tgagagacaaaaatataagtttttgtcccgtctcttacctccagtttgtcttgtaccttaaataatagttttacaaatcaaacac 26282315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 29645946 - 29646254
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| || |||| | |||   |||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  29645946 ttggtttgcaaaataacaagtattggacagaacaatacaagacaaaacaacacaacataaggtataacatcacaagacaaatttttatggcattaaataa 29646045  T
Q  151 tttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29646046 tttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggga 29646145  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||    
T  29646146 caaaaatatatgtttttgtcctatcccttgcctccagtttatcgtgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggaattgttttgtctt 29646245  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  29646246 gtccttcat 29646254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3867848 - 3867546
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||   |||||||     ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  3867848 ttggtttgcaaaacagtaagtactgaacataacagtacaatgcagaacgg-----cacaaggcataacaacacatgacaagtttttatggtattgaataa 3867754  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3867753 tttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtgttttagaaaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 3867654  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||| | || |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  3867653 aaaaatttcaggttttgtcatgtctcttgtctccagtatgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgttctgtcttg 3867554  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  3867553 tccttcat 3867546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 43 - 342
Target Start/End: Original strand, 21373812 - 21374102
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||         |||| |||||||||||||||||    
T  21373812 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacaatacaagacagaacagcacaacacaaga--------cacaggacaaatttttatggca 21373903  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||   ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  21373904 ttgaataattttta-ttttatacgatttttggccgaagaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 21374002  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  21374003 tgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactgaagttgtt 21374102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22484954 - 22484640
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22484954 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtataagataggacaacacaacataaggtagaacagcacaagacaaatttttatggtat 22484855  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||| ||||||| ||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||     
T  22484854 tgaataattttctgtattatataatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggc 22484755  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
     ||| | ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22484754 aaggaacaaaaattgtagcttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcatgtccctgaaactgttttacaaatcaatcactggacaattggagttgttc 22484655  T
Q  344 tatcttgtccttcat 358  Q
    | || ||||||||||    
T  22484654 tgtcctgtccttcat 22484640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 133 - 344
Target Start/End: Original strand, 51296544 - 51296755
Alignment:
Q  133 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  |||| |||||     
T  51296544 ttttatggtattgagtaattttttgttttatacgattttttggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttaggacaaaaaattgtgt 51296643  T
Q  233 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  51296644 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaat 51296743  T
Q  333 tagagttgttct 344  Q
    ||||||||||||    
T  51296744 tagagttgttct 51296755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 141 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 49749025 - 49748808
Alignment:
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  49749025 cattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtatttaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 49748926  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  49748925 ggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactaaacaacttgagttg 49748826  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  49748825 ttctatcctatccttcat 49748808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 45691112 - 45690804
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||   |||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  45691112 gggtgtgtttgatttacaaaacactaagtactggatagaacagtacaagacagaacaacacaatataagatagaataacacatgacaaatttttatagca 45691013  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||        
T  45691012 ttgaataattttt-gttttatacgatttttggaggacgaaatgcgattttggtattttagacaacttatgcgtgagacaaaaagttgtgctgtggt---- 45690918  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
     |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45690917 -gagggagaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccaatttatcctgtacctgaaacagttttgcaaatcaaacactggacaactgaagttgtt 45690819  T
Q  343 ctatcttgtccttca 357  Q
    ||||| |||||||||    
T  45690818 ctatcctgtccttca 45690804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Original strand, 3964173 - 3964476
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattt 153  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| |  ||   |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  3964173 tttgcaaaacagtaagtacttgatagaacagcacaagacaacacaacacaatacaaggcagaacagcacaagacaaattttgtatgatattgaataattt 3964272  T
Q  154 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 253  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3964273 tatgttttatatgatttttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaa 3964371  T
Q  254 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcc 353  Q
    ||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | |||    
T  3964372 aatttcagtttttgtccagttccttgcctccaatttgtcatgtccatgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctatcc 3964471  T
Q  354 ttcat 358  Q
    |||||    
T  3964472 ttcat 3964476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 126 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 54622925 - 54622694
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54622925 gacaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaa 54622826  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  54622825 gttgtgttgtggtttcgtgagcgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatttagtttgt-cagtacctgaaacagttttacaaatcaaatacc 54622727  T
Q  326 ggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||  ||||||| | || ||||||||||    
T  54622726 ggacaactgaagttgttttgtcatgtccttcat 54622694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 50678677 - 50678986
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||  | |||||| |||||| || | | || |||||||||||||   ||||| | |    
T  50678677 ttggtttacgaaaccgtaagtactagacataacaatataagatagaatagcacaacataaggtataatatcgcaagacaaatttttatattattgaatta 50678776  T
Q  151 --ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 248  Q
      |||||||||||||| ||||| || || |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |    
T  50678777 ttttttttgttttataggatttatgtggaatgaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagag 50678876  T
Q  249 ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatct 348  Q
    | |||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||    
T  50678877 acaaaaatatcagtttttgtcctgttctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttttcaaatcaaacactggacaacttgaattgttatgtct 50678976  T
Q  349 tgtccttcat 358  Q
    ||| ||||||    
T  50678977 tgtacttcat 50678986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3695449 - 3695204
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg 193  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  3695449 agaacagtacaacacaaggcagaacaggaca----aattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacaatttttgggggataaaatactattttg 3695354  T
Q  194 atattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcc 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||               |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  3695353 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaggttgtgatgtggtttgg---------------tgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtca 3695269  T
Q  294 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  3695268 tgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctgtccttcat 3695204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 175 - 358
Target Start/End: Original strand, 19906767 - 19906950
Alignment:
Q  175 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  19906767 gggacgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtc 19906866  T
Q  275 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  19906867 ccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttatcctgtccttcat 19906950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 358
Target Start/End: Original strand, 10747088 - 10747388
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 140  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||| | | | ||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  10747088 aagggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtataaaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatga 10747187  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgattttt-gagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||    
T  10747188 cattgaataattttttgttttatacgatttttggggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg------------------tgtggtt 10747269  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    || ||| | | |||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  10747270 tgctgacgaacaaaaatatcagtttttgtcctatctcttgtctccagtttgtcctgtacctaaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactgaaatt 10747369  T
Q  340 gttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| | || ||||||||||    
T  10747370 gttttgtcctgtccttcat 10747388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 53046846 - 53046667
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  53046846 ttggtttgcaaaacaacaagtactgaacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaattttttatggcattgagta 53046747  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||  |||||||||||||    
T  53046746 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgctg 53046667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 149 - 358
Target Start/End: Original strand, 24721463 - 24721673
Alignment:
Q  149 aattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 247  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| ||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  24721463 aatttcttgttttatatgctttttggggggatgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttgttgagg 24721562  T
Q  248 gataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatc 347  Q
     |  ||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24721563 taccaaaattttagtttttgtcctgtcctttacctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtc 24721662  T
Q  348 ttgtccttcat 358  Q
     ||||||||||    
T  24721663 atgtccttcat 24721673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 186
Target Start/End: Original strand, 43175436 - 43175585
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-ttttt 136  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||  ||||||||||| || ||| |||||    
T  43175436 tctatgggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtataatacaagacagaacagcacacgataaatttttt 43175535  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43175536 atggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 43175585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41683075 - 41682950
Alignment:
Q  233 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 332  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683075 tgtggtttgctgagggacaaaagtatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 41682976  T
Q  333 tagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |  ||||||| | || ||||||||||    
T  41682975 tgaagttgttttgtcctgtccttcat 41682950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 358
Target Start/End: Original strand, 6179376 - 6179614
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||| |||||||  | ||| ||||| ||||||  |||||||||||       |    
T  6179376 agaacaacacaagacgaatttttatggtattgaataattttctttattatatgattttttggtgacgaaatgttatttttgtattttagaca-------c 6179468  T
Q  214 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg-ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 312  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  6179469 gtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttggcgaggggacaaaaattacagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgacctgtttctgaaactgtttta 6179568  T
Q  313 caaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  6179569 caaatcaaacactggacaactggagttgttttatcctgtccttcat 6179614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34351514 - 34351303
Alignment:
Q  109 aaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 208  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||| | || || ||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34351514 aaggcagaacaacatatgacgaatttttatagtattgaataatttatggtcttgtacgattttttgtggataaaatgttattttgatattttagacaact 34351415  T
Q  209 tgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagt 308  Q
    |||| ||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||||| ||||  || |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  34351414 tgtatgtgcgacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaataatttttgtttttgtcgtgtctatttcctctagtttgtcatgtccctgaaacagt 34351315  T
Q  309 tttacaaatcaa 320  Q
    ||||||||||||    
T  34351314 tttacaaatcaa 34351303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 341
Target Start/End: Original strand, 44000217 - 44000432
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||  ||||    
T  44000217 gacaaacttttatggtattgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaaactatttttgtatttcagataacttgtacgtgggacaaaaa 44000316  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
     ||||| |||||||| |||||||| |||||  |  ||||||||||||||| ||||||  ||||| || | | ||  |||||||||||||||| ||||||     
T  44000317 attgtgatgtggtttagtgagggaaaaaaaattctgtttttgtcatgtcctttgccttgagtttatcatttcccaaaaacagttttacaaatgaaacacg 44000416  T
Q  326 ggacaactagagttgt 341  Q
    | ||||||||||||||    
T  44000417 gtacaactagagttgt 44000432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Original strand, 44267691 - 44267924
Alignment:
Q  119 agcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggg 218  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  44267691 agcacaagacaaatttttatcgtattcaataattttttgttttatatgatttttggatgacgaaatgctatttttgtattttagacaatttgtatgtggg 44267790  T
Q  219 atgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatc 318  Q
    || ||||||| || |||||||||| |||||| |     || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||| ||||||||||||    
T  44267791 ataaaaagttatgttgtggtttggcgagggaca-----attattttttgtcatgtcccttacctacagtttgtcatat-cctaaaactgttttacaaatc 44267884  T
Q  319 aaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||  | ||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  44267885 aaacatcgaacaactgaagttgttcgatcatgtccttcat 44267924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41695042 - 41694925
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  41695042 agaacagcacagaacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctatttcagtattttagacaacttgtat 41694943  T
Q  214 gtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  41694942 gtgggacaaaaagttgtg 41694925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 39215547 - 39215404
Alignment:
Q  177 gacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccc 276  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || || | ||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  39215547 gacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattatgatttggttcggtaaggggtaaaaatttcagtttttgtcttgtccc 39215448  T
Q  277 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 320  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39215447 ttacctccggtttgtcctgttcttgaaacagttttacaaatcaa 39215404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 332
Target Start/End: Original strand, 52300439 - 52300598
Alignment:
Q  172 tgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcat 271  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| |    
T  52300439 tgagggacgaaatgatattttggtgttttagacaacttgtac-tgggacaaaaaattgcgttgtggtttggtgatggacaaaaatttcagtttttgtcct 52300537  T
Q  272 gtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 332  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  52300538 gtcccttacctgcagtttgtcccgtctctgaaacagttttatgaatcaaacattggacaac 52300598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 274
Target Start/End: Original strand, 25954407 - 25954554
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||| ||||||| || ||| ||  ||||    
T  25954407 gacaaatttttatgatattgaataattttttattttatacgctttttg-gggacgaaatgttatattagtattttaaacaacttatatgtgagacaaaaa 25954505  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
    ||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  25954506 gttgtgctgtaatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcgtgtc 25954554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 284 - 358
Target Start/End: Original strand, 43175589 - 43175663
Alignment:
Q  284 cagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  43175589 cagtttgtcctatacctgaaatagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgttctgtccttcat 43175663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 53046668 - 53046605
Alignment:
Q  258 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 321  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53046668 tgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaa 53046605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 42035824 - 42035652
Alignment:
Q  109 aaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 208  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||||| || |||   |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  42035824 aaggtagaacaacacttgacaaacttttatggtattgaacaattttttctcttatactatgttttgtggacaaaatgctgttttgctattttacacaact 42035725  T
Q  209 tgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 281  Q
    ||||| |||| ||  ||||||   |||||||| ||||  || || ||| | |||||||||  |||||||||||    
T  42035724 tgtacttgggttgccaagttgcattgtggtttagtgaaagacaagaatttcagtttttgttgtgtcccttgcc 42035652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14155528 - 14155438
Alignment:
Q  187 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccctt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| | || ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  14155528 tattttgatattttagacaacttgtacttgagacaaaaagttgtgttatgatttagtgagggat-aaaatttcagtttttgtcatgtccctt 14155438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 358
Target Start/End: Original strand, 8253640 - 8253861
Alignment:
Q  136 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||   || |||||||  ||    
T  8253640 tatggtattgattaatttttaatcttatacaatttttgatgaataaaatgttattttggtattttagacaacttttaattggggcaaagagttgtgtcgt 8253739  T
Q  236 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 335  Q
    ||||| || || || || ||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||| |||| |  ||||||||    
T  8253740 ggtttagt-agagacaagaacttcagtttttatcatgttccttgactccagtttgtcttgtccttgaaacaactttacaaatcgaacattatacaactag 8253838  T
Q  336 agttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||  | |||| ||||||||    
T  8253839 agttgtcttgtcttatccttcat 8253861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 219
Target Start/End: Original strand, 32621828 - 32621918
Alignment:
Q  129 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga 219  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32621828 aaattgttatgctattgaataattttttgttgtatacaatttttgatggacaacatattattttggtattttagacaacttgtacatggga 32621918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8067210 - 8066955
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||  ||| || ||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||  | ||||| ||||| |   |||||||| |||||||||||||||||    
T  8067210 acaacacaagacagaccaacacatgacatacttttatggtattgaatgatttttgatcttatatgatttctagtggacaaaaagctattttgatatttta 8067111  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
     | |||||||||||| ||  ||||||||| || || ||| |||| ||| | |||| | |  ||||||| |||| | |||||| |  ||||  ||| ||||    
T  8067110 tataacttgtacgtgtgacaaaaagttgtactatgattttgtgaaggacacaaatttta-attttgtcttgtcacctgcctcaatcttgttttgtccctg 8067012  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||| ||||||||||||||  | | | |||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  8067011 aaacaattttacaaatcaaatgcggtataactagtgttgttatgtcttgtccctcat 8066955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 331
Target Start/End: Original strand, 32768588 - 32768755
Alignment:
Q  166 gatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttt 265  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||||  |||||||||||| | |||  ||| | | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | | ||||    
T  32768588 gatttttgggtgacaaaaggttattttagtattttagacaaatagtaattggaacggaaagttgtgatgtggtttagtgagggacaataatttcaatttt 32768687  T
Q  266 tgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctg--tacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
    ||||||||| ||||| |   ||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32768688 tgtcatgtctcttgctttttgtttgtcatgtctccctgaaacaattttacaaatcaaacactgtacaa 32768755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 209
Target Start/End: Original strand, 25395570 - 25395653
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaactt 209  Q
    |||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25395570 gacaaacttttatgacattgcattattttttgttttatacgatttttagtgaacaaaatgttattttggtattttagacaactt 25395653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17264822 - 17264569
Alignment:
Q  104 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagg--gacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| ||  || |||||| ||||||| ||  |||||||  |||||||  |||||||    
T  17264822 aacataaggtagatcagcacaagacaaaattttatggtactgaataatgtt--gtcttatacaatttttgtggtcgacaaaaa-ctatttttgtatttta 17264726  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
     |||||||||||||||||  |||  || |  |||||||| |||| |||||| ||| | || |||||||||||  ||||| ||| ||||||  |||   ||    
T  17264725 cacaacttgtacgtgggacaaaatttttttatgtggtttagtgaaggataataatttcagcttttgtcatgtatcttgcttcctgtttgttatgtttttg 17264626  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
     ||||||||||||||||||| | || |||| || |||||   ||| |||||||||||    
T  17264625 taacagttttacaaatcaaatattgtacaattaaagttgccatattttgtccttcat 17264569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 87
Target Start/End: Original strand, 20254945 - 20254991
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20254945 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagta 20254991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 245
Target Start/End: Original strand, 23322158 - 23322216
Alignment:
Q  187 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23322158 tattttgatatattagacaacttgtacgagagataaaaagttgtgttgtggtttagtga 23322216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41538225 - 41538131
Alignment:
Q  119 agcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta-ttttgatattttagacaacttgta 212  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||| | ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  41538225 agcacatgataaacttttatgatattgaatgatttttgattttatacgattttttatggacaaaatactatttttgacattttaaacaacttgta 41538131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 54964095 - 54963985
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| || | ||| || ||||  ||||||||||||||     
T  54964095 agggtatgtttggtttgcaaaatagtacgtactggacataacagtataagataggacaccataacataaagcagagcaacacaaaacaaatttttatggt 54963996  T
Q  142 attgagtaatt 152  Q
    ||||| |||||    
T  54963995 attgaataatt 54963985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 3695485 - 3695441
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3695485 gggtgtgtttggtttgcaaaaatgtaagtactggacagaacagta 3695441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28625060 - 28625001
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttg 173  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28625060 agaacaacacaagacaaacttttatggtattgaataattttttgtcttataagatttttg 28625001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 53046560 - 53046517
Alignment:
Q  258 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53046560 tgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctatacctg 53046517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8165883 - 8165833
Alignment:
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  8165883 ttttttgttttatactatgtttgatggacaaaatgttagtttgatatttta 8165833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 358
Target Start/End: Original strand, 30258962 - 30259060
Alignment:
Q  260 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||    |||||||||||||    
T  30258962 agtttttgtcttgcccattgcctcgagtttatcctgtctttgaaacaattttacaaatcaaacattgtataactagggttgtcgcgtcttgtccttcat 30259060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42547511 - 42547463
Alignment:
Q  107 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  42547511 acaaggtagaacaacacatgacaaacttttatgatattgaataattttt 42547463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 35701147 - 35701464
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||    
T  35701147 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaataacacaggacaaattttttatgg 35701246  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||    
T  35701247 caatgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttatgttgtggttt 35701346  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701347 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 35701446  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35701447 ttctatcttgtccttcat 35701464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 11963220 - 11963528
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11963220 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaagcagaataacacatgacaaattttttatggcattgagta 11963319  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11963320 attttgtattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgcacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 11963419  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  11963420 caaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcct 11963519  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  11963520 gtccttcat 11963528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 32528585 - 32528902
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32528585 agggtgtgtttgatttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 32528684  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  32528685 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 32528784  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32528785 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttg 32528884  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    | || || ||||||||||    
T  32528885 tcctgtcatgtccttcat 32528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Original strand, 7523039 - 7523359
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7523039 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaggaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 7523138  T
Q  139 ggcattgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  7523139 gacattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtgg 7523238  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7523239 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaa 7523338  T
Q  338 ttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||| || | ||||||||    
T  7523339 ttgttctgtcctatccttcat 7523359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 2351552 - 2351867
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  2351552 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggataaattttttatggca 2351651  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2351652 ttgagtaattttttgttttgtacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 2351751  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2351752 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctataccttaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgtc 2351851  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    || || ||||||||||    
T  2351852 ctgtcctgtccttcat 2351867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 43 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21739381 - 21739093
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||    || |||||||||||    
T  21739381 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacaatataagatagaacagtacaacacaagacagaacaggaca----aattttttatggca 21739286  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21739285 ttgtgtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 21739186  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739185 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 21739093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 38 - 358
Target Start/End: Original strand, 39918374 - 39918694
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-tttt 136  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  39918374 tctatgggtgtgtttggtttgcaat-cagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacaggacaaatatttt 39918472  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  39918473 atagtattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtg 39918572  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 336  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39918573 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 39918672  T
Q  337 gttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||  | || ||||||||||    
T  39918673 gttgtcttgtcctgtccttcat 39918694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 34794766 - 34795074
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta-tggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  34794766 ttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgataaattttttgtggcattgaata 34794865  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  34794866 attttttgttttatacgaattttggggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggga 34794965  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |    
T  34794966 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatattggacaactagagttgttctgtcat 34795065  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  34795066 gtccttcat 34795074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 44 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4818364 - 4818085
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  4818364 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtgcaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggca 4818265  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4818264 ttgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 4818165  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4818164 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgttccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 4818085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 77 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31770782 - 31770503
Alignment:
Q  77 acagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgag 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31770782 acagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgag 31770683  T
Q  176 ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31770682 ggacaaaatgctattttggtatttcagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcc 31770583  T
Q  276 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcctt 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  31770582 cttgcctccagtttgtcttgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttatgtcatgtcctt 31770503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 43 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6284524 - 6284221
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  6284524 gggtgtgtttgatttacaaaacagcaagtactggacagaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagtacagcacaagacaaattttttatggc 6284425  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt-gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  6284424 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttttggtattttggacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 6284325  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6284324 ggtgagggacaaaaaaataagtttttgtcctgtcccatgcctccagtttgtcctgtacctgaagcagttttacaaatcaaacactggacaactaaagtta 6284225  T
Q  341 ttct 344  Q
    ||||    
T  6284224 ttct 6284221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41790688 - 41790372
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatgg 140  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41790688 agggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtataaaatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatgg 41790589  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  41790588 cattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttagtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggttt 41790489  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  41790488 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtttattgcctccagtttgtcctgta-ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 41790390  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || |||| |||||    
T  41790389 ttctgtcctgtctttcat 41790372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22493643 - 22493328
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||| ||||    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  22493643 gggtgtgtttggttcgcaaaacaacaagtattggacagaacagtgcaagacagaataacacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatggc 22493544  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  22493543 aatgagtaattttttgttttatacgatttttgcgg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttg 22493445  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22493444 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttggctccagtttatcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgt 22493345  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  22493344 tctgtcctgtccttcat 22493328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24181835 - 24181533
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24181835 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 24181751  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24181750 cattgagtaatttgttgttttatacgatctttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttatgctgtggttt 24181651  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181650 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttggctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 24181551  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    || | || ||||||||||    
T  24181550 ttttgtcatgtccttcat 24181533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 94 - 344
Target Start/End: Original strand, 29241300 - 29241551
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29241300 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 29241399  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  29241400 gatattttagccaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaatatgagcttttggcctgtcccttgcctccaatttgtc 29241499  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29241500 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 29241551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 8136710 - 8137024
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  8136710 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacagaatagtacaagatagaacagtacaacacaaggcataacaacacaggacaatttttttatggc 8136809  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||    
T  8136810 attgagtaatgttttgttttatactattttttggggacaa--tgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttg 8136907  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8136908 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaaacaaacactggacaactagagttgt 8137007  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || | ||||||||    
T  8137008 tctgtcctatccttcat 8137024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Original strand, 41459511 - 41459775
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta-tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41459511 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaggacaaaaatttaatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 41459610  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41459611 gatattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctctggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt-tcttgtcccttgcctccagtttgtc 41459709  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41459710 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactaaacaactagagttgttctgtcatgtccttcat 41459775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7770495 - 7770188
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||   ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  7770495 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacataatcgtacaagacagaacaacacaacacaagacagaatagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 7770396  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  7770395 ttttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggac 7770296  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7770295 aaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcatg 7770196  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  7770195 tccttcat 7770188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 31644318 - 31644632
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | |||| |  |||||||||| |||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  31644318 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcatgtacagtgcagaacagtacaaga-agaatagcacaatacaaggtagaacaacacaagacaaatttttatgac 31644416  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31644417 attgaataattttatgttttatatgatttttaggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 31644516  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31644517 gtgagggacaaaaatatgagtatttgtcttg-ctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 31644615  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| ||  |||||||||    
T  31644616 tctgtcccgtccttcat 31644632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Original strand, 3735237 - 3735544
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||  | |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||    
T  3735237 ttggtttgcaaaacagcaggtactgtacagaacagtacaagaaagaatagcacaatacaagggagaacagcataggacaaatttttatgacattgaataa 3735336  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  3735337 ttttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatggac 3735436  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  3735437 aaaaatatcagtttttgtcctgtccattgcctccattttgtcatgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatg 3735536  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    | ||||||    
T  3735537 ttcttcat 3735544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31880250 - 31879985
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31880250 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatgacattgaataattttttgtattatacgattgttgggggacaaaatgctatttt 31880151  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31880150 ggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtc 31880051  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31880050 ctgtacctgaaacagttttactaatcaaacactgaacaactagagttgttatatcttgtccttcat 31879985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4689923 - 4689607
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||   |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4689923 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtaatggacataacagtacaagacagaacaacacaacataaggcagaacaacacatgacaaatttttatgac 4689824  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  4689823 attgaataattttttgttttatacgacttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 4689724  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4689723 gtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 4689624  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || ||||||||||    
T  4689623 tctgtcatgtccttcat 4689607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23091478 - 23091213
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattt-ttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23091478 agaacagtacaacacaagatagaacaacacaagacaaatttcttatggcattgagtaatgttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 23091379  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  23091378 gatattttagacaatttatacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgatgacggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttatc 23091279  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||    
T  23091278 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacttgagtagttatatcttgtcattcat 23091213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 342
Target Start/End: Original strand, 24036105 - 24036401
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||| | |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  24036105 ggtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactgtactgaacagtacaagacagaacagcacaacataagacagaacaacacatgacaaattttt--gacat 24036202  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24036203 tgaataattttttgttttatacgatttttggggtgcaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggt 24036302  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24036303 gagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctgtacctgaaacagttttccaaatcaaacactggacaacttgaattgtt 24036401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 67 - 355
Target Start/End: Original strand, 40489232 - 40489521
Alignment:
Q  67 taagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatac 165  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| || | ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40489232 taagtattggacagaatagtacaagattgaacagtacaacataaagcagaacaatgcatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatac 40489331  T
Q  166 gatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttt 265  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40489332 aatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttt 40489431  T
Q  266 tgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcctt 355  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||||||    
T  40489432 tgtcccgtcccttgcctccagtttgtcttctacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattagagttattctgtcctgtcctt 40489521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18470644 - 18470337
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||| | |||| |||||  | |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  18470644 ttggtttgcaaaatagtaagtactggacagcacagtataatgcagaacagcacaatacaagacataacagcacagaacaaatttttatggtattgaataa 18470545  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  18470544 tttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtaagggac 18470445  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  18470444 aaaaatttcagtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtcttg 18470345  T
Q  351 tccttcat 358  Q
    ||||||||    
T  18470344 tccttcat 18470337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 94 - 355
Target Start/End: Original strand, 39788114 - 39788377
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattt 191  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  39788114 agaacagtacaacataatgcagaacagcacatgacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaaatgttattt 39788213  T
Q  192 tgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgt 291  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  39788214 tagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctacagtttgt 39788313  T
Q  292 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  39788314 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagaattgttctgtcctgtcctt 39788377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7208404 - 7208139
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| |||||| |||||   |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7208404 agaacagtacaatacaagacggaacagcacgggacaaatattttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctatttt 7208305  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  7208304 ggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttggttctgtctcttgcatccagtttgtc 7208205  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||    
T  7208204 ccgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgttctgtccttcat 7208139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28090726 - 28090461
Alignment:
Q  60 aaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgt 158  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  28090726 aaaacattaagtattggacagaaca--ataagatagaacagtacaactcacggcagaacagtacaggacaaattttttatattattgagtaattttttgt 28090629  T
Q  159 tttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28090628 tttatacgatttttgagggacaaaatgttatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggtgagggacaaaaatat 28090529  T
Q  259 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28090528 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgccttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 28090461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7726036 - 7725721
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||   |||||||||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  7726036 taagggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactagacataacagtacaagacagtacatcacaacacaaggtagaatagtataggacaaatttttatg 7725937  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg-atattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  7725936 gaattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggatattt-agacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 7725838  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  7725837 ttaatgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgttctgcacctgaaacaattttactaatcaaacactggacaactgaagt 7725738  T
Q  339 tgttctatcttgtcctt 355  Q
    |||| | || |||||||    
T  7725737 tgttttgtcctgtcctt 7725721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 263
Target Start/End: Original strand, 40182335 - 40182556
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  40182335 gggtgtgtttggtttccaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagaaagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacatgacaaattttttatggc 40182434  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  40182435 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 40182534  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtt 263  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  40182535 gtgagggacaaaaatataagtt 40182556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 700798 - 700513
Alignment:
Q  71 tactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatt 169  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  700798 tactggacataacagtacaagacaaaataatacaacacaaggtagaacagcacatgacaaaatttttatggcaatgagtaattttttgttttatatgatt 700699  T
Q  170 tttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtc 269  Q
    || | ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||     
T  700698 ttcgggggacaaaataatattttggtattttagataacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaacaaaaatatgaatttttgtt 700599  T
Q  270 atgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtcctt 355  Q
     ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||||    
T  700598 ttgtcccttgtctcttgtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaatcattgaacaactagagttgttttgtcatgtcctt 700513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32093183 - 32092891
Alignment:
Q  65 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 164  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||   | ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||  | |||| |||||||||    
T  32093183 agtaagtactggacagaacagtaagagacagaacaacataacacaaggcagaacagcacaacacaaatttttatggtattgaaaatttttatgttttata 32093084  T
Q  165 cgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttt 264  Q
      ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||    
T  32093083 taatttttgggggacgaaatgctattttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtga-ggacaaaaatttcagttt 32092985  T
Q  265 ttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32092984 ttgtcctatcctttgcctccaatttgtcctgttcctgaaacaattttacaaatcaaacactgcacaactggagttgttctgtcttgtccttcat 32092891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 303
Target Start/End: Original strand, 5673018 - 5673271
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcatt 144  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||| || | ||||||| |||||||||| |    
T  5673018 tgtgtttggtttacaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatataacagcacaacacaaggcataacatcaaaggacaaatattttatggcaat 5673117  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  5673118 gagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 5673212  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaa 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5673213 agggacaaaaatatgagtttttgacttgtcccttgcctccagtttatcgtgtacctgaa 5673271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 104 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5571806 - 5571608
Alignment:
Q  104 aacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 202  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  5571806 aacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaa--tgctattttggtattttag 5571709  T
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 302  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5571708 acaacttgtacgttggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 5571609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 133 - 344
Target Start/End: Original strand, 553358 - 553570
Alignment:
Q  133 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  553358 ttttatggcattgaataattttatgttttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 553457  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  553458 ttgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttataaatcaaacactagacaa 553557  T
Q  332 ctagagttgttct 344  Q
     || |||||||||    
T  553558 ttaaagttgttct 553570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 122 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8561126 - 8560923
Alignment:
Q  122 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |      
T  8561126 acatgacaaatttttatggcattgattaattttttgttttatacgatttttg-gggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacctggaaca 8561028  T
Q  222 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8561027 aaaagttgtgatgtggtttggtgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgctttcagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaa 8560928  T
Q  322 cactg 326  Q
    |||||    
T  8560927 cactg 8560923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37148790 - 37148498
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  37148790 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtataatacagaacagcacaacacaaggtataacagcacaggacaaatttttatggtattgaataa 37148691  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| || |||||||   |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||               |||||||| |||||||||||||| |     
T  37148690 tttcttattttatattctttttgggggacgaaatgctattttggtgttttagacaactt---------------agttgtgccgtggtttggtgaggaac 37148606  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttg 350  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| || |     
T  37148605 aaaaatttcagtttttgtcccgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacaattgacaactggagttgttctgtcata 37148506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22432471 - 22432243
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |   ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22432471 acaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttatatgattgatt---ttttttttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttta 22432375  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    |||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22432374 gacaacttgtacttgagacaaaaaattgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttatcctgaacctg 22432275  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22432274 aaacagttttacaaatcaaacataggacaact 22432243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27839180 - 27838983
Alignment:
Q  160 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatg 259  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |     
T  27839180 ttatacgatttttggaggacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgttttatggtttggtgagggacaaaaattta 27839081  T
Q  260 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
     |||||  || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  27839080 tgtttta-tcctgtccattgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcat 27838983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 175 - 344
Target Start/End: Original strand, 5598484 - 5598653
Alignment:
Q  175 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||| | ||    
T  5598484 gggacgaaatgttattttgatattttagacaagttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgttgtttgatgaaggacaaaaatatctgtttttgtcctctc 5598583  T
Q  275 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5598584 ccttgcctccagtttgtctcgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaacttgagttgttct 5598653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 358
Target Start/End: Original strand, 17031134 - 17031344
Alignment:
Q  148 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 247  Q
    |||||||| || ||||| |||||||   |||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||    
T  17031134 taatttttggtcttatatgattttttgtggacaaaaagctatttttgtattttaaataacttgtacgtgggacgaaaagttgtgctgtgatttaatgagg 17031233  T
Q  248 gataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatc 347  Q
    |  |||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||  | ||    
T  17031234 ggcaaaaatttatgtttttgtcctgtcctttgcctccaatttgtactgtccctgaaacagttttacaaatcaaacattatacaagtggagttgtgttgtc 17031333  T
Q  348 ttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||    
T  17031334 ttgtccttcat 17031344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 175
Target Start/End: Original strand, 20119642 - 20119777
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||    
T  20119642 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagcacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttaatagca 20119741  T
Q  143 ttgagtaa---ttttttgttttatacgatttttgag 175  Q
    |||| |||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  20119742 ttgaataatatttgtttgttttatatgatttttgag 20119777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 263 - 358
Target Start/End: Original strand, 4664923 - 4665018
Alignment:
Q  263 ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  4664923 ttttgtcatgtcccttgcctcctgtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtcatgtccttcat 4665018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 119
Target Start/End: Original strand, 548218 - 548295
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  548218 agggtgtgtttggtttgcaaaacattaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaaca 548295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Original strand, 32313713 - 32313850
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 145  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||| |||||   | ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  32313713 tgtgtttgatttgctaaacaataagtacttgacataaaagtataagacagaacaacataacacaagacagaacaacacatgacaaatttgtatagtattg 32313812  T
Q  146 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa 183  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||    
T  32313813 attaatttttgatcttatacgatttttgctggacaaaa 32313850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 212
Target Start/End: Original strand, 1338601 - 1338661
Alignment:
Q  152 tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1338601 tttttgttatatacgatatttgatggacaaaaaattattttgatattttagacaacttgta 1338661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Original strand, 29241264 - 29241308
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29241264 gggtgtgcttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 29241308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 31880286 - 31880242
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31880286 gggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 31880242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29788618 - 29788507
Alignment:
Q  105 acacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagac 204  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||  || |||||| |||||||   ||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  29788618 acacaagatagaacaacacatgataaacttttatggtattgaatagtttt--gtcttatacaatttttggttgatcaaatgttattttaatattttagac 29788521  T
Q  205 aacttgtacgtggg 218  Q
    |||||| |||||||    
T  29788520 aacttgaacgtggg 29788507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7208441 - 7208396
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7208441 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagta 7208396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5571609 - 5571566
Alignment:
Q  315 aatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  5571609 aatcaaacactggacaactagagttgttttgttttgtccttcat 5571566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 322
Target Start/End: Original strand, 35955088 - 35955150
Alignment:
Q  260 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 322  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||    
T  35955088 agtttttgtcttgtctcatgcctccagtttgtcatgtctttgaaacaattttacaaatcaaac 35955150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Original strand, 101819 - 102136
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  101819 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtaccggacagaacagtataagatagaacagtacaatataaggtagaacagcacaggacaaattttttatgg 101918  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  101919 cattgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 102018  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  102019 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtccgttgcctccaagttgtcctgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttg 102118  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  102119 ttctgtcatgtccttcat 102136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 23448 - 23762
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  23448 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactggacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcactggacaaattttttatggc 23547  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23548 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaa--tgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 23645  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23646 gtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcaagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 23745  T
Q  342 tctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| || || |||||||    
T  23746 tctgtcctgcccttcat 23762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 326
Target Start/End: Original strand, 19857 - 20062
Alignment:
Q  121 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggat 220  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |  |||| |||||||||| | ||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||  |     
T  19857 cacatgacaaacttttatggtattgaataatatttggcgttatgcgatttttgatgaacaaaagactattttggtatttcaaacaacttgtacgtgaaac 19956  T
Q  221 gaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 320  Q
     ||||||||| | ||||||| ||||| || || ||| | |||||||||||| ||||||  || || |||||| | |  || ||||||||||||| |||||    
T  19957 aaaaagttgtacagtggtttagtgagtgacaagaatttcagtttttgtcatatcccttttctacaatttgtcttatctctaaaacagttttacatatcaa 20056  T
Q  321 acactg 326  Q
    ||||||    
T  20057 acactg 20062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2566 - 2248
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2566 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttat 2467  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2466 gacattgagtaattttttgttttataggatttttatgggacaaaaaactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 2367  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  2366 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact-gaaaactaaagt 2268  T
Q  339 tgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  2267 tgttctatcctgtccttcat 2248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 44 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18278 - 17982
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  18278 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagca 18179  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  18178 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 18079  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 17982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 44 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12760 - 12527
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  12760 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagca 12661  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12660 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 12561  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccc 276  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12560 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccc 12527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 51311 - 51625
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  51311 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaatatagaacagtataatacaagacagaacagcacaagacaaattttttatgaca 51410  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  51411 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt-g 51509  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  51510 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcatccagtttgttctgcacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattaaagttgtt 51609  T
Q  343 ctatcttgtccttcat 358  Q
    || | |||||||||||    
T  51610 ctgttttgtccttcat 51625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 38 - 358
Target Start/End: Original strand, 15038 - 15359
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatt-ttt 136  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||   |||    
T  15038 tctatgggggtgtttggtttgcaaaacagtaagtaccggacagaacagtacaaaatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgaaaaaaaattt 15137  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  15138 atggcattgagtaatttgttgttttataagatttttgggggacaaaatactattttagtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtg 15237  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 336  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15238 gtttggtgggggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattaga 15337  T
Q  337 gttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  15338 gttgttttgtcttgtccttcat 15359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0729 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0729
Description:

Target: scaffold0729; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4796 - 4488
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4796 gtgtgtttggtttgcaaaacag------ctggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 4703  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  4702 tgagtaattttttgttttatacgattttttagagacaaaatgatattttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 4603  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4602 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctatacctaaatcaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 4503  T
Q  344 tatcttgtccttcat 358  Q
    | || ||||||||||    
T  4502 tgtcctgtccttcat 4488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0957 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0957
Description:

Target: scaffold0957; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 68 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2695 - 2406
Alignment:
Q  68 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacg 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  2695 aagtactggacataacagtataagatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatgagattgggtaattttttgttttatacg 2596  T
Q  167 atttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttttt 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  2595 atttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagac-aatagttgtgttgtggtttggttagggacaaagatatgagttttt 2497  T
Q  267 gtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttca 357  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2496 gtcctgtccctttcctccaatttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttatgtcttgtccttca 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 100 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19258 - 19001
Alignment:
Q  100 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  19258 gtacaacacaaggtagaacagcacatggcaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgttattttggtatt 19159  T
Q  199 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 298  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19158 ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtac 19060  T
Q  299 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||    
T  19059 ctg-aacagttttacaaatcaaacactggacaaatataattgttctgtcctgtccttcat 19001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5656 - 5348
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  5656 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagacagaacaacacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 5557  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  5556 ttttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggac 5457  T
Q  251 aaaaatatgag-tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatctt 349  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |    
T  5456 aaaaatatgtgttttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgttct 5357  T
Q  350 gtccttcat 358  Q
    |||||||||    
T  5356 gtccttcat 5348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 94 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15551 - 15282
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  15551 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagg----aaatgctatttt 15456  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtca--------tgtcccttgcctcc 284  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  15455 ggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtgatcttgtcccttgcctcc 15356  T
Q  285 agtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15355 agtttatcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctatcatgttcttcat 15282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13554
Alignment:
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||  ||  |||     
T  13704 attgattaattattggtcttatacgatttttgatggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacatgtgacaaaaagttgtgtcgtatttta 13605  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    ||||| || | |||| | | |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  13604 gtgagagacacaaatttcaatttttgtcatgtctattgcctccaatttgtc 13554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15587 - 15543
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacagaacagta 15543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0650 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0650
Description:

Target: scaffold0650; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1870 - 1552
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||   | ||| | ||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||    
T  1870 taagggtgcgtttgatttgcaaaacaataagtatttgacagaactgtacaaagcaaaacagcacaacacaagagagaacaacacagaacaaatttttatg 1771  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  1770 gtattgaataattttttgttttatatgacttttgagggacgaaatgctattttggttttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 1671  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  1670 tggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctatccttgaaacagttttacaaatcaaacactggagaactgaagtt 1571  T
Q  340 gttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  1570 gttctgttttgtccttcat 1552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 132 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 373099 - 372873
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  373099 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgatattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 373000  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  372999 ttatggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatatcccttgtctccagttttttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacatttgacaa 372900  T
Q  332 ctagagttgttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||| | ||||||| || | ||||||||    
T  372899 ctaaaattgttctgtcatatccttcat 372873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 373176 - 373130
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  373176 aaggatgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactgaacagaacagta 373130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13913 - 13596
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 140  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   | || |||||| | ||  ||||| |||||||||||||||    
T  13913 aagggtgcgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataatgcagaacaacaaaatacaaggcataattgcacaggacaaatttttatgg 13814  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
     ||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  13813 tattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacggaatgctattttggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggttt 13714  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13713 ggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctatcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactggagttg 13614  T
Q  341 ttctatcttgtccttcat 358  Q
    |||| || ||||||||||    
T  13613 ttctgtcctgtccttcat 13596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43176 - 42860
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||| | |||| |||||| | || |  |||   ||||||||| ||    
T  43176 taagggtgcgtttggtttgcaaaacagtaagtactagacagagcagtacaatgcagaacagcacaatacaaggcataataatacagatcaaatttttgtg 43077  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  43076 gtattgaataatttcttgttttatatgattgtttggggacaacatgctattttggtgttttagacaa-ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 42978  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    |||||||||| | |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  42977 tggtgagggacacaaatttcagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacta-tggagtt 42879  T
Q  340 gttctatcttgtccttcat 358  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  42878 gttctgtcttatccttcat 42860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33678 - 33530
Alignment:
Q  133 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc 232  Q
    |||||||  ||||| |||||||| || |||||| | |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||     
T  33678 ttttatgatattgaataatttttggtcttatacaagttttgatggacaaaagcctattttggtattttatacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgt 33579  T
Q  233 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 282  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||||    
T  33578 tgtggtttgatgagggacaagaatttca-tttttgtcatgtcccttgcct 33530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19201 - 19081
Alignment:
Q  222 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 321  Q
    |||||||||| || | |||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19201 aaaagttgtgttgagctttgatgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtccattgcctcctgtttattctgtccctgaaacagttttacaaatcaaa 19102  T
Q  322 cactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| |||| || |||||    
T  19101 cactggataactggaattgtt 19081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3791 - 3683
Alignment:
Q  104 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttaga 203  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||||  |||||||  |||||||||    
T  3791 aacacaaggtagaatagtacatgacaaacttttatgatattgaataattttttatcttatatgatttttggtggataaaaaactatttttgtattttaga 3692  T
Q  204 caacttgta 212  Q
     ||||||||    
T  3691 taacttgta 3683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1112 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1112
Description:

Target: scaffold1112; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 198
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1127
Alignment:
Q  149 aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1078 aatttttggttttatacgatttttgagggacaagatgatattttgatatt 1127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Original strand, 338757 - 338802
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  338757 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagta 338802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University