View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1399_low_54 (Length: 279)

Name: NF1399_low_54
Description: NF1399
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1399_low_54
NF1399_low_54
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (126-266)||(12143072-12143213)
chr1 (126-266)||(7553016-7553157)
chr1 (126-266)||(23767414-23767555)
chr1 (126-266)||(19315640-19315781)
chr1 (126-266)||(38473626-38473767)
chr1 (126-266)||(41106016-41106157)
chr1 (126-266)||(46825531-46825672)
chr1 (126-266)||(7651662-7651803)
chr1 (126-266)||(28425363-28425504)
chr1 (126-262)||(49094711-49094848)
chr1 (127-266)||(19274559-19274699)
chr1 (126-266)||(36157678-36157818)
chr1 (126-264)||(25988271-25988410)
chr1 (126-264)||(49814302-49814441)
chr1 (126-262)||(45350717-45350852)
chr1 (126-266)||(33325727-33325868)
chr1 (126-266)||(50689943-50690084)
chr1 (126-266)||(16705870-16706011)
chr1 (126-266)||(26549388-26549529)
chr1 (126-266)||(33674017-33674158)
chr1 (126-266)||(46051450-46051591)
chr1 (126-266)||(48802331-48802472)
chr1 (126-264)||(36781172-36781311)
chr1 (126-275)||(9878784-9878934)
chr1 (126-266)||(23228194-23228335)
chr1 (126-262)||(26069896-26070033)
chr1 (126-266)||(52146993-52147134)
chr1 (162-266)||(12964646-12964750)
chr1 (147-262)||(48319067-48319183)
chr1 (127-266)||(50533383-50533523)
chr1 (126-262)||(45670486-45670623)
chr1 (129-266)||(24204474-24204612)
chr1 (126-266)||(7608766-7608907)
chr1 (126-262)||(9962755-9962892)
chr1 (126-266)||(18892329-18892470)
chr1 (126-266)||(43396675-43396816)
chr1 (126-262)||(48669396-48669533)
chr1 (126-266)||(52349924-52350065)
chr1 (127-266)||(18917524-18917664)
chr1 (128-262)||(41982237-41982372)
chr1 (161-262)||(9974846-9974947)
chr1 (126-266)||(17983898-17984039)
chr1 (126-262)||(37216900-37217037)
chr1 (126-266)||(46095075-46095216)
chr1 (126-261)||(5400876-5401011)
chr1 (126-266)||(6711440-6711581)
chr1 (126-262)||(8141486-8141623)
chr1 (126-262)||(21965069-21965206)
chr1 (161-266)||(33194687-33194792)
chr1 (126-262)||(34971084-34971221)
chr1 (165-266)||(52067691-52067792)
chr1 (126-262)||(25800648-25800782)
chr1 (126-261)||(33714361-33714495)
chr1 (126-262)||(18782089-18782226)
chr1 (126-266)||(40721342-40721484)
chr1 (161-262)||(16506824-16506925)
chr1 (161-266)||(30281631-30281736)
chr1 (126-261)||(21929526-21929667)
chr1 (188-266)||(50099220-50099298)
chr1 (218-266)||(44979281-44979329)
chr1 (222-266)||(32373650-32373694)
chr1 (126-226)||(44978768-44978868)
chr1 (222-264)||(17989864-17989906)
chr1 (236-266)||(49973942-49973972)
chr1 (31-60)||(36781077-36781106)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (126-266)||(35600122-35600263)
chr7 (126-266)||(47281124-47281265)
chr7 (126-266)||(47294291-47294432)
chr7 (127-266)||(44544409-44544549)
chr7 (126-266)||(1469493-1469634)
chr7 (126-266)||(27364339-27364480)
chr7 (126-266)||(47271981-47272122)
chr7 (127-266)||(47219145-47219285)
chr7 (126-266)||(30798368-30798509)
chr7 (126-266)||(31684134-31684275)
chr7 (126-266)||(38427563-38427704)
chr7 (126-266)||(48628805-48628946)
chr7 (127-262)||(33884323-33884459)
chr7 (126-266)||(8162712-8162853)
chr7 (126-266)||(11476556-11476697)
chr7 (126-266)||(23842305-23842446)
chr7 (126-266)||(30876259-30876400)
chr7 (126-262)||(37393998-37394135)
chr7 (126-266)||(40851274-40851415)
chr7 (126-266)||(41139408-41139553)
chr7 (126-266)||(45723491-45723632)
chr7 (126-266)||(43752776-43752917)
chr7 (126-253)||(2960640-2960768)
chr7 (126-266)||(30971941-30972082)
chr7 (126-266)||(41113377-41113518)
chr7 (126-266)||(42979338-42979479)
chr7 (126-266)||(43968259-43968400)
chr7 (126-262)||(44800410-44800547)
chr7 (126-266)||(47119991-47120134)
chr7 (131-262)||(4923220-4923352)
chr7 (161-266)||(3797559-3797664)
chr7 (126-262)||(11050261-11050398)
chr7 (169-266)||(47579131-47579228)
chr7 (126-261)||(7336065-7336200)
chr7 (126-243)||(221298-221416)
chr7 (161-262)||(37354299-37354400)
chr7 (173-266)||(40520918-40521011)
chr7 (127-266)||(29248342-29248482)
chr7 (161-266)||(27774108-27774213)
chr7 (126-262)||(18353148-18353285)
chr7 (206-266)||(39034062-39034122)
chr7 (223-266)||(43025112-43025155)
chr7 (217-266)||(29739781-29739829)
chr7 (215-254)||(12583313-12583352)
chr7 (126-178)||(42888937-42888990)
chr7 (32-60)||(7335876-7335904)
chr7 (222-266)||(29739670-29739713)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (126-266)||(6739955-6740096)
chr5 (126-266)||(3352002-3352143)
chr5 (126-262)||(14717609-14717746)
chr5 (126-266)||(27457197-27457338)
chr5 (126-266)||(31710282-31710423)
chr5 (126-266)||(40074950-40075091)
chr5 (126-264)||(39002025-39002164)
chr5 (126-266)||(8215900-8216041)
chr5 (126-266)||(30297749-30297890)
chr5 (126-266)||(38964114-38964254)
chr5 (126-266)||(39824556-39824697)
chr5 (127-266)||(30863253-30863393)
chr5 (126-266)||(4015874-4016015)
chr5 (126-266)||(8689572-8689713)
chr5 (126-266)||(11000728-11000869)
chr5 (126-262)||(14952328-14952465)
chr5 (126-266)||(16095960-16096100)
chr5 (126-266)||(20079258-20079399)
chr5 (126-266)||(26593280-26593421)
chr5 (126-266)||(33760470-33760611)
chr5 (126-266)||(35342180-35342321)
chr5 (126-266)||(42993518-42993659)
chr5 (127-266)||(41282342-41282482)
chr5 (126-266)||(6251972-6252113)
chr5 (126-262)||(6600136-6600273)
chr5 (126-266)||(11692147-11692288)
chr5 (126-266)||(23128913-23129054)
chr5 (126-266)||(19659501-19659642)
chr5 (126-266)||(30208402-30208543)
chr5 (126-266)||(43166269-43166410)
chr5 (164-266)||(6331377-6331479)
chr5 (126-262)||(20408537-20408674)
chr5 (161-266)||(26035382-26035487)
chr5 (147-266)||(16752116-16752236)
chr5 (126-258)||(1052541-1052674)
chr5 (126-266)||(28078405-28078546)
chr5 (126-262)||(27116099-27116236)
chr5 (126-262)||(11935450-11935586)
chr5 (126-262)||(19398193-19398330)
chr5 (161-258)||(444962-445059)
chr5 (126-266)||(8694866-8695007)
chr5 (126-266)||(27509978-27510112)
chr5 (31-60)||(28078310-28078339)
chr5 (24-60)||(8215709-8215745)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (126-266)||(33151696-33151837)
chr3 (126-262)||(35346471-35346608)
chr3 (126-266)||(21564496-21564637)
chr3 (126-266)||(21656518-21656659)
chr3 (126-266)||(1017044-1017185)
chr3 (126-262)||(1687655-1687792)
chr3 (126-266)||(20813441-20813582)
chr3 (126-266)||(38446476-38446617)
chr3 (126-261)||(42016878-42017014)
chr3 (132-266)||(22851996-22852131)
chr3 (126-266)||(20760071-20760212)
chr3 (126-266)||(26455582-26455723)
chr3 (126-266)||(31122662-31122803)
chr3 (126-266)||(51562162-51562303)
chr3 (126-261)||(21890175-21890311)
chr3 (161-266)||(19268521-19268626)
chr3 (126-266)||(20086314-20086455)
chr3 (126-266)||(36314972-36315113)
chr3 (126-266)||(41250886-41251027)
chr3 (126-266)||(47329175-47329316)
chr3 (126-262)||(50287570-50287707)
chr3 (126-262)||(10618480-10618617)
chr3 (126-266)||(37247956-37248097)
chr3 (126-266)||(42107099-42107240)
chr3 (126-266)||(53196014-53196155)
chr3 (161-266)||(53926015-53926120)
chr3 (131-266)||(19664541-19664677)
chr3 (127-266)||(29677476-29677616)
chr3 (126-275)||(40922165-40922315)
chr3 (161-266)||(1448768-1448873)
chr3 (134-266)||(12748391-12748524)
chr3 (161-262)||(32650856-32650957)
chr3 (126-266)||(44798268-44798408)
chr3 (126-266)||(52821049-52821190)
chr3 (126-264)||(3697148-3697287)
chr3 (126-264)||(20913754-20913893)
chr3 (126-264)||(20921872-20922011)
chr3 (126-266)||(27070739-27070880)
chr3 (126-266)||(35608131-35608272)
chr3 (126-266)||(48651248-48651389)
chr3 (147-266)||(50364908-50365028)
chr3 (161-264)||(50977866-50977969)
chr3 (161-264)||(51080998-51081101)
chr3 (161-262)||(51475282-51475383)
chr3 (126-266)||(55164115-55164256)
chr3 (166-266)||(28699685-28699785)
chr3 (126-266)||(33473239-33473380)
chr3 (126-266)||(39069726-39069867)
chr3 (126-266)||(45380260-45380401)
chr3 (189-266)||(44152700-44152777)
chr3 (201-266)||(47473230-47473295)
chr3 (161-264)||(34019462-34019565)
chr3 (126-251)||(38923998-38924124)
chr3 (161-235)||(42641214-42641288)
chr3 (31-60)||(28775383-28775412)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (126-264)||(2390267-2390406)
chr6 (127-266)||(6503718-6503858)
chr6 (126-266)||(3408189-3408330)
chr6 (126-266)||(1915343-1915484)
chr6 (126-266)||(2707459-2707600)
chr6 (126-266)||(9382519-9382660)
chr6 (126-266)||(10256237-10256378)
chr6 (126-266)||(12626636-12626777)
chr6 (126-262)||(17428272-17428409)
chr6 (126-266)||(26230932-26231073)
chr6 (126-266)||(8178249-8178390)
chr6 (126-262)||(26393009-26393146)
chr6 (126-266)||(29050272-29050413)
chr6 (126-262)||(30379021-30379158)
chr6 (126-262)||(17943040-17943177)
chr6 (161-262)||(16193314-16193415)
chr6 (126-266)||(3258807-3258948)
chr6 (126-255)||(2598099-2598229)
chr6 (126-266)||(11133873-11134015)
chr6 (126-262)||(1077241-1077378)
chr6 (161-266)||(26936607-26936712)
chr6 (126-262)||(26196321-26196458)
chr6 (161-251)||(35223935-35224025)
chr6 (126-266)||(6785101-6785239)
chr6 (165-262)||(10931187-10931288)
chr6 (127-262)||(25820550-25820686)
chr6 (126-212)||(31375971-31376058)
chr6 (126-183)||(12612971-12613029)
chr6 (31-60)||(2390110-2390139)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (126-266)||(2533272-2533413)
chr8 (126-266)||(3875908-3876049)
chr8 (126-262)||(37933646-37933783)
chr8 (126-261)||(15847117-15847253)
chr8 (126-264)||(35884430-35884569)
chr8 (126-266)||(513308-513448)
chr8 (126-266)||(1293486-1293627)
chr8 (126-266)||(28707446-28707587)
chr8 (126-266)||(36400070-36400211)
chr8 (126-262)||(38107103-38107240)
chr8 (126-266)||(43806533-43806674)
chr8 (126-266)||(22683988-22684129)
chr8 (126-266)||(35443311-35443452)
chr8 (126-262)||(259982-260118)
chr8 (126-262)||(655803-655939)
chr8 (126-262)||(841538-841674)
chr8 (126-266)||(9056338-9056479)
chr8 (147-266)||(7434886-7435006)
chr8 (126-262)||(440844-440981)
chr8 (126-266)||(28496355-28496495)
chr8 (126-266)||(38633710-38633851)
chr8 (126-266)||(23972295-23972437)
chr8 (126-262)||(38208756-38208894)
chr8 (126-251)||(41536527-41536653)
chr8 (161-266)||(12010549-12010654)
chr8 (126-266)||(13797089-13797229)
chr8 (161-266)||(23935233-23935338)
chr8 (126-266)||(33651841-33651982)
chr8 (126-262)||(40301893-40302030)
chr8 (131-266)||(39513344-39513480)
chr8 (126-266)||(24430571-24430712)
chr8 (147-266)||(29485287-29485406)
chr8 (161-264)||(6016207-6016310)
chr8 (126-266)||(42988227-42988367)
chr8 (126-262)||(4649154-4649291)
chr8 (126-262)||(36218781-36218917)
chr8 (188-266)||(24193356-24193433)
chr8 (127-190)||(24193131-24193195)
chr8 (202-260)||(8137180-8137238)
chr8 (32-60)||(13797295-13797323)
chr8 (28-60)||(35443518-35443550)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (126-266)||(4544985-4545126)
chr4 (126-266)||(33807780-33807921)
chr4 (126-266)||(42273802-42273943)
chr4 (126-266)||(11795154-11795295)
chr4 (126-266)||(28264643-28264784)
chr4 (126-266)||(55517185-55517326)
chr4 (126-264)||(24458631-24458770)
chr4 (126-264)||(26017425-26017564)
chr4 (126-266)||(12196469-12196610)
chr4 (126-266)||(19496102-19496243)
chr4 (126-262)||(23135006-23135143)
chr4 (126-266)||(28159953-28160094)
chr4 (126-266)||(31591076-31591216)
chr4 (126-266)||(31973591-31973732)
chr4 (126-262)||(32317957-32318094)
chr4 (126-262)||(48551764-48551901)
chr4 (126-266)||(48707733-48707874)
chr4 (127-266)||(40988633-40988773)
chr4 (126-261)||(49118616-49118752)
chr4 (126-264)||(2055280-2055419)
chr4 (127-265)||(33174021-33174160)
chr4 (126-263)||(48149502-48149640)
chr4 (126-266)||(5227390-5227531)
chr4 (126-266)||(15985010-15985151)
chr4 (126-266)||(28812287-28812427)
chr4 (126-261)||(44490324-44490460)
chr4 (126-264)||(8882013-8882152)
chr4 (126-266)||(9339123-9339267)
chr4 (126-266)||(14564796-14564937)
chr4 (126-266)||(17847096-17847236)
chr4 (126-266)||(35930040-35930180)
chr4 (126-266)||(39995167-39995308)
chr4 (126-266)||(50542354-50542495)
chr4 (127-266)||(32118714-32118854)
chr4 (128-266)||(10588580-10588719)
chr4 (126-266)||(17993017-17993158)
chr4 (161-266)||(24623148-24623253)
chr4 (126-262)||(25734223-25734360)
chr4 (126-262)||(30467003-30467140)
chr4 (126-266)||(39700045-39700186)
chr4 (127-264)||(37381848-37381986)
chr4 (161-266)||(19168831-19168936)
chr4 (126-262)||(23553069-23553205)
chr4 (126-266)||(30141108-30141249)
chr4 (126-266)||(33693333-33693474)
chr4 (126-264)||(50276138-50276274)
chr4 (126-266)||(51371047-51371188)
chr4 (126-262)||(25730244-25730381)
chr4 (126-266)||(31208748-31208885)
chr4 (147-266)||(42549643-42549762)
chr4 (126-266)||(22298517-22298659)
chr4 (185-266)||(56555200-56555281)
chr4 (126-206)||(20534225-20534306)
chr4 (24-60)||(30141373-30141409)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (126-266)||(16246193-16246334)
chr2 (126-266)||(27328584-27328725)
chr2 (126-266)||(33865267-33865408)
chr2 (126-266)||(921022-921163)
chr2 (126-262)||(25087796-25087933)
chr2 (126-266)||(28650426-28650567)
chr2 (126-266)||(40854609-40854750)
chr2 (126-266)||(41500502-41500643)
chr2 (132-266)||(771981-772116)
chr2 (126-266)||(7378963-7379104)
chr2 (126-266)||(9276574-9276715)
chr2 (126-266)||(11949426-11949567)
chr2 (126-266)||(33106969-33107110)
chr2 (126-266)||(34253142-34253283)
chr2 (126-263)||(2056929-2057067)
chr2 (126-266)||(2456010-2456151)
chr2 (126-266)||(12759750-12759890)
chr2 (126-262)||(37838301-37838438)
chr2 (127-266)||(17134229-17134369)
chr2 (126-264)||(7297234-7297373)
chr2 (126-266)||(1106559-1106700)
chr2 (126-266)||(2094410-2094551)
chr2 (161-266)||(8396587-8396692)
chr2 (126-266)||(19180422-19180562)
chr2 (126-266)||(37732193-37732334)
chr2 (131-266)||(36211046-36211182)
chr2 (127-266)||(36444229-36444369)
chr2 (127-266)||(38751048-38751188)
chr2 (126-264)||(2314975-2315114)
chr2 (133-266)||(3430631-3430765)
chr2 (126-266)||(8899682-8899822)
chr2 (161-266)||(43249448-43249553)
chr2 (126-265)||(45124120-45124260)
chr2 (126-262)||(17484550-17484687)
chr2 (126-266)||(29737748-29737889)
chr2 (165-266)||(41178059-41178160)
chr2 (126-266)||(42629962-42630103)
chr2 (161-262)||(37654112-37654213)
chr2 (161-266)||(19916023-19916128)
chr2 (126-217)||(14630663-14630755)
chr2 (126-265)||(9331757-9331897)
chr2 (126-215)||(23671811-23671901)
chr2 (210-266)||(23672958-23673014)
chr2 (32-60)||(31214113-31214141)
chr2 (32-60)||(42630169-42630197)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (126-266)||(114-255)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (126-266)||(218885-219027)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (126-262)||(5027-5164)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (126-261)||(47967-48103)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (126-266)||(252438-252579)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (126-262)||(5190-5326)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (161-266)||(2009-2114)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (161-262)||(11362-11463)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (126-262)||(13099-13236)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (126-262)||(59608-59745)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (213-266)||(289-342)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (216-266)||(19781-19831)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (126-206)||(599-680)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (126-206)||(1913-1994)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (161-206)||(3407-3452)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (126-206)||(1877-1958)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12143213 - 12143072
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12143213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12143114  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12143072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 7553016 - 7553157
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7553016 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7553115  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7553116 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtggataatgctct 7553157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 23767414 - 23767555
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23767414 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23767513  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767514 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 23767555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19315781 - 19315640
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  19315781 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 19315682  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315681 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19315640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 38473626 - 38473767
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38473626 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 38473725  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473726 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38473767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41106157 - 41106016
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  41106157 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41106058  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106057 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 41106016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 46825672 - 46825531
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  46825672 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 46825573  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825572 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 46825531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7651803 - 7651662
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7651803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttgataattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7651704  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651703 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7651662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 28425363 - 28425504
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  28425363 gaatcgtttcaaacaagtcctattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 28425462  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28425504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 49094711 - 49094848
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49094711 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49094810  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49094811 ttagtcatctttttaggcataacaaatggtggataatg 49094848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19274699 - 19274559
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19274699 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagctggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 19274600  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19274599 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 19274559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 36157678 - 36157818
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatgttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36157678 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 36157777  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157778 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36157818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 25988271 - 25988410
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  25988271 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25988370  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25988371 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 25988410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 49814441 - 49814302
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||| || || |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49814441 gaatcgtttcaaataagtcatattctagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49814342  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814341 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 49814302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 45350717 - 45350852
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  45350717 gaatcgtttcaaacaa--cctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgatctcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 45350814  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45350815 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45350852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33325868 - 33325727
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  33325868 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttggtatcaaatctggcttctaagacccacttaaaa 33325769  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33325768 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33325727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50690084 - 50689943
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  50690084 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50689985  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  50689984 ttagtcatctttttaggcatagcaaatgatggataatgctct 50689943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16706011 - 16705870
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  16706011 gaatcgtttcaaacaagtcttattttagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcgcctaaaacccacttaaaa 16705912  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16705911 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctct 16705870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26549529 - 26549388
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26549529 gaatcgttttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 26549430  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26549429 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 26549388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33674158 - 33674017
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33674158 gaatcgtgtcaaacaagtcctattgtagatagcatagctggtaattgcttccttgaactcatctttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33674059  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33674058 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 33674017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 46051591 - 46051450
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  46051591 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 46051492  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46051491 ctagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 46051450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 48802331 - 48802472
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48802331 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacctacttaaaa 48802430  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48802431 ttagtcatctttgtaggcatgataaatggtggataatgctct 48802472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 36781172 - 36781311
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36781172 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 36781271  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36781272 ttagtcgtctttttgggcatggcaaatggtggataatgct 36781311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 275
Target Start/End: Original strand, 9878784 - 9878934
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  || |||||||||||||||||||    
T  9878784 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccatatcgggttcctaacacccacttaaaa 9878883  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctgtggtgctg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  9878884 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgctg 9878934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 23228194 - 23228335
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||    
T  23228194 gaatcgtttcaaacaagtactattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccatttaaaa 23228293  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23228294 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 23228335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26070033 - 26069896
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26070033 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatttttggtatcaaatccggctcctaacacccacttaaaa 26069934  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26069933 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26069896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 52147134 - 52146993
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  52147134 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtatatagcatagtttgtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 52147035  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52147034 ttattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 52146993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 162 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12964750 - 12964646
Alignment:
Q  162 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12964750 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatgttgtataat 12964651  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  12964650 gctct 12964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 48319067 - 48319183
Alignment:
Q  147 attgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 245  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  48319067 attgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatt 48319166  T
Q  246 acaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||||    
T  48319167 acaaatggtggataatg 48319183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50533523 - 50533383
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50533523 aatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 50533424  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  50533423 tagtcatctttttaggcatgtcaaattttggataatgctct 50533383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 45670486 - 45670623
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg--ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaa 223  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||    
T  45670486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacc-acttaaa 45670584  T
Q  224 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670585 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45670623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 129 - 266
Target Start/End: Original strand, 24204474 - 24204612
Alignment:
Q  129 tcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaatta 227  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  24204474 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaatga 24204573  T
Q  228 gtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24204574 gtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctct 24204612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 7608766 - 7608907
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  7608766 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatcttttgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 7608865  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608866 ttagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7608907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9962892 - 9962755
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||    
T  9962892 gaatcgtttcaaacaagttctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagttcctaacacccacttaaaa 9962793  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9962792 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 9962755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18892470 - 18892329
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18892470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccactgaaaa 18892371  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18892370 ttagtcatccttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 18892329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43396816 - 43396675
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43396816 gaatcgtttcaaacaaatcctactgtagatagcagagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 43396717  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  43396716 ttagtcatctttttaagcatagcaaatgatggataatgctct 43396675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 48669396 - 48669533
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  48669396 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtgattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48669495  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  48669496 ttagtcatctttttaggcatgacaaataatggataatg 48669533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 52349924 - 52350065
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  52349924 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 52350023  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52350024 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 52350065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18917664 - 18917524
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatgttgg-taattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18917664 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcatatttaataattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 18917565  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18917564 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataattctct 18917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 262
Target Start/End: Original strand, 41982237 - 41982372
Alignment:
Q  128 atcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaatt 226  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  41982237 atcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccatttaaaatt 41982336  T
Q  227 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41982337 agtcatatttttaggcatgacaaatggtggataatg 41982372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9974947 - 9974846
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9974947 gttggtaattgcttccttgaactcatttttggtactaaatatggctcgtaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataa 9974848  T
Q  261 tg 262  Q
    ||    
T  9974847 tg 9974846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 17983898 - 17984039
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||| ||| || || |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||    
T  17983898 gaatcgtttcaaccaagtcctaatgtaaataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgattcataacacccacttaaaa 17983997  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17983998 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 17984039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37217037 - 37216900
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||||||||||||||    
T  37217037 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaactctagctcataacacccacttaaaa 37216938  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37216937 ttagtcatctttttagacatggcaaatggtggataatg 37216900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 46095075 - 46095216
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  46095075 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttgatatcaaatctgtctcctaacatccacttaaaa 46095174  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  46095175 ttagtcatctttttaaacatgacaaatggtggataatgctct 46095216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5401011 - 5400876
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  5401011 gaatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggtttctaacatccacttaaaa 5400912  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5400911 ttagtcatctttttaggcatg-caaatggtggataat 5400876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6711581 - 6711440
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6711581 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagacattatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6711482  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  6711481 ttagccatctttttacacatggtaaatggtggataatgctct 6711440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 8141486 - 8141623
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||  ||||||||||||||||    
T  8141486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataatttgtaattgcttctttgaactcatctttagtaccaaatctgacttgtaacacccacttaaaa 8141585  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8141586 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 8141623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21965206 - 21965069
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  21965206 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattaaactcatctttggtaccaaatctgactccttacacccacttaaaa 21965107  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21965106 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtgtataatg 21965069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 33194687 - 33194792
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  33194687 gttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcgaatggtggttaa 33194786  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  33194787 tgctct 33194792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34971221 - 34971084
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||| || |||||||||| |||||||||    
T  34971221 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgtttctttgaactcatatttggtatcaaatctgactcctaacactcacttaaaa 34971122  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34971121 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 34971084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 266
Target Start/End: Original strand, 52067691 - 52067792
Alignment:
Q  165 gtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52067691 gtaattgcttccttgaactcatcgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattattcatctttttagggatgacaaatggtggataatgct 52067790  T
Q  265 ct 266  Q
    ||    
T  52067791 ct 52067792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25800782 - 25800648
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatgttggtaattgcttccttgaactcatc----tttggtacaaaatatggctcctaacacccactta 221  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||      || |||||||||||||    
T  25800782 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatgttggtaattgcttccttgaactcatcttaatttggtaccaaa------tcttaacacccactta 25800689  T
Q  222 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25800688 aaattagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 25800648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Original strand, 33714361 - 33714495
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |     
T  33714361 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagataacatagttgataattgtttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacacc-acttaca- 33714458  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33714459 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 33714495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 18782089 - 18782226
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| |||||||||| || |||| || ||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||    
T  18782089 gaatcatttcaaacaagtcatattctagatagcatagttgataattgcttatttgaactcatctttggtacaaaatctggttcatagcacccacttaaaa 18782188  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18782189 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 18782226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40721484 - 40721342
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacaccca-cttaaa 223  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| | ||||    
T  40721484 gaatcgtttccaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgctttcttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaatacccaacctaaa 40721385  T
Q  224 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40721384 attaattatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40721342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 262
Target Start/End: Original strand, 16506824 - 16506925
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16506824 gttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagccatctttttaagcatggcaaatggtggataa 16506923  T
Q  261 tg 262  Q
    ||    
T  16506924 tg 16506925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30281736 - 30281631
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30281736 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaataccagttatctttttaggcatgtaaaatggtggataa 30281637  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  30281636 tgctct 30281631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21929667 - 21929526
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatcttt-------ggtacaaaatatggctcctaacaccca 217  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||| |||||||||| |||||    
T  21929667 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttcatctttggtaccaaatctggctcctaaaaccca 21929568  T
Q  218 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21929567 cttaaaattagtcatctttttag--atggcaaatggtggataat 21929526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50099298 - 50099220
Alignment:
Q  188 tttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50099298 tttggtaccaaatatgacttttaacatccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 50099220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 266
Target Start/End: Original strand, 44979281 - 44979329
Alignment:
Q  218 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44979281 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 44979329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 266
Target Start/End: Original strand, 32373650 - 32373694
Alignment:
Q  222 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32373650 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 32373694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Original strand, 44978768 - 44978868
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  44978768 gaatcgtttcaaacaagtcagaatgtagatagcataattgataattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaata-ccacttaaaa 44978866  T
Q  225 tt 226  Q
    ||    
T  44978867 tt 44978868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 264
Target Start/End: Original strand, 17989864 - 17989906
Alignment:
Q  222 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17989864 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtgaataatgct 17989906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49973972 - 49973942
Alignment:
Q  236 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49973972 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 49973942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 60
Target Start/End: Original strand, 36781077 - 36781106
Alignment:
Q  31 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36781077 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 36781106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 35600122 - 35600263
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600122 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 35600221  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600222 ttagttatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 35600263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 47281124 - 47281265
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47281124 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47281223  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281224 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47281265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 47294291 - 47294432
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  47294291 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatcgttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttataa 47294390  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294391 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47294432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44544549 - 44544409
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44544549 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 44544450  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44544449 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 44544409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 1469493 - 1469634
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1469493 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1469592  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469593 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1469634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 27364339 - 27364480
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27364339 gaatcgtttcaaacagatcctattgtagataacatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 27364438  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27364439 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 27364480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47272122 - 47271981
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47272122 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 47272023  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47272022 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctct 47271981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47219285 - 47219145
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  47219285 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaat 47219186  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219185 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47219145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 30798368 - 30798509
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30798368 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 30798467  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  30798468 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctct 30798509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 31684134 - 31684275
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31684134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 31684233  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31684234 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31684275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 38427563 - 38427704
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38427563 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38427662  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38427663 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggcggataatgctct 38427704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 48628946 - 48628805
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  48628946 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcattttttgcaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 48628847  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48628846 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 48628805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33884459 - 33884323
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  33884459 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 33884360  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884359 tagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 33884323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 8162712 - 8162853
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8162712 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8162811  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8162812 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 8162853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 11476556 - 11476697
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11476556 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11476655  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  11476656 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctct 11476697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23842446 - 23842305
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23842446 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttcaaa 23842347  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23842346 ttagtcatctttttaggcatggcagatggtggataatgctct 23842305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30876400 - 30876259
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30876400 gaatcgtttcaaacaagtgctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttggtaccaaattgggctcctaacacccacttaaaa 30876301  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30876300 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30876259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 37393998 - 37394135
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  37393998 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacacccagttaaaa 37394097  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394098 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 37394135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40851415 - 40851274
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40851415 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaggtagaatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40851316  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40851315 ttagtcatctttttaggcacgacaaatggtggataatgctct 40851274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 41139408 - 41139553
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-----gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccactt 220  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  41139408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatatatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccgctt 41139507  T
Q  221 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41139508 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 41139553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 45723491 - 45723632
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  45723491 gaatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcataattagtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 45723590  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45723591 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 45723632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 43752776 - 43752917
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  43752776 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctgactcctaacatccacttaaaa 43752875  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43752876 ttagtcatcttttgaggcaggacaaatggtggataatgctct 43752917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 253
Target Start/End: Original strand, 2960640 - 2960768
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2960640 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2960739  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgg 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2960740 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgg 2960768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 30971941 - 30972082
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30971941 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatggcatagttggtaattacttccttaaacccatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 30972040  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30972041 ttagtcatctttttaagcatgacaaattgtggataatgctct 30972082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41113518 - 41113377
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41113518 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 41113419  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  41113418 ttagtcatctttttagacatggcaaatgatgaataatgctct 41113377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 42979338 - 42979479
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  42979338 gaatcgtttcaaacaagtcctactgtagataacatagttggtaattgcttcgttgaactcatctttgatatcaaatctgactcctaacatccacttaaaa 42979437  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42979438 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 42979479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 43968259 - 43968400
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  43968259 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcgtagttggtaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatttggctcataatacccacttaaaa 43968358  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43968359 ttagtcatctttataggcatgacaaatggtggataatgctct 43968400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 44800410 - 44800547
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44800410 gaattgtttcaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgtttcattgaactcatctttggtaccaaatatggttcctaacacccacttaaaa 44800509  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44800510 ttagtcatctttttaggcatgatatatggtggataatg 44800547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47120134 - 47119991
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat---gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaa 222  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| | | |||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  47120134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagagagcatatagttggtaattgctttcttgaactcatatttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaa 47120035  T
Q  223 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47120034 aattagttatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 47119991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4923352 - 4923220
Alignment:
Q  131 gtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagt 229  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4923352 gtttcaaacaagtcctattgtggatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaattagt 4923253  T
Q  230 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4923252 catctttttaggcatggcaaatggtggataatg 4923220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 3797559 - 3797664
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3797559 gttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgttaaatggtggataa 3797658  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  3797659 tgctct 3797664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 11050261 - 11050398
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatgtt-ggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||    
T  11050261 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatatttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctgcctcctaatacccacttaaaa 11050360  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11050361 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 11050398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 266
Target Start/End: Original strand, 47579131 - 47579228
Alignment:
Q  169 ttgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47579131 ttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaattaaccatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 47579228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7336200 - 7336065
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7336200 gaatcgtttcaaacagttc-tattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatcattgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7336102  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7336101 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataat 7336065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 221416 - 221298
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  221416 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221317  T
Q  225 ttagtcatctttttaggca 243  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  221316 ttagtcttctttttaggca 221298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 262
Target Start/End: Original strand, 37354299 - 37354400
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37354299 gttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatttggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 37354398  T
Q  261 tg 262  Q
    ||    
T  37354399 tg 37354400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40521011 - 40520918
Alignment:
Q  173 ttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40521011 ttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttagccatggcaaatggtggataatgctct 40520918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29248482 - 29248342
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  29248482 aatcatttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcatcaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 29248383  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  29248382 tagtcatctttttaggcatggcaaattgtggataattctct 29248342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27774213 - 27774108
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27774213 gttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaatcagccatctttttaggcatggcaaatggtggataa 27774114  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  27774113 tgctct 27774108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18353285 - 18353148
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| | ||||||    
T  18353285 gaatcgtttcaaacaagtcctaaggtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacacctaattaaaa 18353186  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18353185 ttagtcatctttttagacatgataaatggtggataatg 18353148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39034122 - 39034062
Alignment:
Q  206 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39034122 tcctaacgcccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 39034062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43025155 - 43025112
Alignment:
Q  223 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43025155 aattagtcatctttttaggcatgacaaatgatggatattgctct 43025112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29739829 - 29739781
Alignment:
Q  217 acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29739829 acttaaaattagtcatctttt-aggcatggtaaatggtggataatgctct 29739781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12583352 - 12583313
Alignment:
Q  215 ccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12583352 ccacttaaaattagtcatctttttacgcatgaaaaatggt 12583313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42888990 - 42888937
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttcctt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42888990 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcctt 42888937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 7335876 - 7335904
Alignment:
Q  32 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7335876 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 7335904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29739713 - 29739670
Alignment:
Q  222 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29739713 aaattagtcatctttt-aggcatggtaaatggtggataatgctct 29739670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 6739955 - 6740096
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  6739955 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 6740054  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740055 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 6740096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 3352002 - 3352143
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3352002 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 3352101  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3352102 ttagtcatctttttaggcatgacaaagggtggataatgctct 3352143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14717746 - 14717609
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14717746 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14717647  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717646 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 14717609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 27457197 - 27457338
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27457197 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccactttaaa 27457296  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27457297 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 27457338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31710423 - 31710282
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31710423 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 31710324  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710323 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 31710282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40075091 - 40074950
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40075091 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40074992  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40074991 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 39002025 - 39002164
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39002025 gaattgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 39002124  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002125 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 39002164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8216041 - 8215900
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8216041 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8215942  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8215941 ttagtcatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 8215900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 30297749 - 30297890
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30297749 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttcaactcatctttggtaccaaatctggctcctagcacccacttaaaa 30297848  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30297849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30297890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 38964114 - 38964254
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38964114 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38964213  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964214 ttagtcat-tttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38964254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39824697 - 39824556
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  39824697 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 39824598  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39824597 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 39824556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30863393 - 30863253
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30863393 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 30863294  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30863293 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30863253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 4015874 - 4016015
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4015874 gaatcgtttcaagcaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 4015973  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4015974 ttagtcatatttttaggcatgataaatggtggataatgctct 4016015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8689713 - 8689572
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8689713 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgattccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8689614  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8689613 ttagtcatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctct 8689572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 11000728 - 11000869
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11000728 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11000827  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  11000828 ttagtcatctttttaggcctggcaagtggtggataatgctct 11000869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14952465 - 14952328
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14952465 gaatcgtttcaaacaagtcttgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14952366  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14952365 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 14952328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 16095960 - 16096100
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16095960 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctt-ggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16096058  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16096059 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 16096100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 20079258 - 20079399
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  20079258 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 20079357  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20079358 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 20079399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 26593280 - 26593421
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26593280 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26593379  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593380 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 26593421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 33760470 - 33760611
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33760470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33760569  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33760570 ttagtcatctttttagtcatgacaaatggtggataatgctct 33760611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35342321 - 35342180
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35342321 gaatcgtttcaaacaagtctcattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35342222  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342221 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 35342180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42993659 - 42993518
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42993659 gaattgtttcaaacaattcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 42993560  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42993559 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 42993518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41282482 - 41282342
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41282482 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 41282383  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41282382 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 41282342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6252113 - 6251972
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||||||||    
T  6252113 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaaa 6252014  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6252013 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 6251972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 6600136 - 6600273
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6600136 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6600235  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6600236 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 6600273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 11692147 - 11692288
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  11692147 gaatcgtttcaaacaagtcatattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 11692246  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11692247 ttagtcatctttttaggcatcacaaatggtggataatgctct 11692288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 23128913 - 23129054
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23128913 gaatcgtttcaaacaagtcatatcgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacaaccacttaaaa 23129012  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23129013 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 23129054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 19659501 - 19659642
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19659501 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttttttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaa 19659600  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19659601 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 19659642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 30208402 - 30208543
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30208402 gaatcatttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacctacttaaaa 30208501  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30208502 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 30208543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 43166269 - 43166410
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  43166269 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcataacacccacttaaaa 43166368  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43166369 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctct 43166410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6331479 - 6331377
Alignment:
Q  164 ggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6331479 ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgc 6331380  T
Q  264 tct 266  Q
    |||    
T  6331379 tct 6331377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20408674 - 20408537
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||    
T  20408674 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatatttggtaccaaatctagctcctaacacccgcttaaaa 20408575  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20408574 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 20408537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 26035382 - 26035487
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26035382 gttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaatacccacttaaaatcagtcatctttttaggcacgacaaatggtggataa 26035481  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  26035482 tgctct 26035487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16752236 - 16752116
Alignment:
Q  147 attgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 245  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16752236 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggatcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 16752137  T
Q  246 acaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  16752136 acaaatggtgaataatgctct 16752116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1052674 - 1052541
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1052674 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1052575  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat 258  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1052574 ttactcatctttttaagcatggcaaatggtggat 1052541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 28078405 - 28078546
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28078405 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28078504  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28078505 ttagtaaactaattaggcatgacaaatggtagataatgctct 28078546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 27116099 - 27116236
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| ||| |||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||    
T  27116099 gaatcattttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacatccacttcaaa 27116198  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27116199 ttagtcatctttttaggcattacaaatcgtggataatg 27116236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11935586 - 11935450
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11935586 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgtttccttgatctcatctttga-accaaatgtggctcctaacactcacttaaaa 11935488  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11935487 ttagccatctttttaggcataacaaatagtggataatg 11935450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 19398193 - 19398330
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||    
T  19398193 gaatcatttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgtttctttgaactcatctttggtaccaaatctagcctctaacacccacttaaaa 19398292  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19398293 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 19398330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 445059 - 444962
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  445059 gttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatatgactcctaaaacccacttaaaatcagtcgtctttttaggcgtggcaaatggtggat 444962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8695007 - 8694866
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||  ||| |||||  ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || |||||||||    
T  8695007 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgataattatttcattgaactcatctttagtaccaaatctggctcataatactcacttaaaa 8694908  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8694907 ttagtcatgttcttaggcatgataaatggtggataatgctct 8694866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27510112 - 27509978
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataa-cat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaa 223  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |      |||| |   |||||||    
T  27510112 gaatcgtttcaaacaagtcctattgta-ataagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaaaa------ctaaaagg-acttaaa 27510021  T
Q  224 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27510020 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 27509978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 60
Target Start/End: Original strand, 28078310 - 28078339
Alignment:
Q  31 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078310 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 28078339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 60
Target Start/End: Original strand, 8215709 - 8215745
Alignment:
Q  24 ttaagaataggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8215709 ttaaaaataggtcaaatgcatctaaaggtcctttaag 8215745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33151837 - 33151696
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33151837 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33151738  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151737 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33151696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 35346471 - 35346608
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35346471 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35346570  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346571 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 35346608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21564637 - 21564496
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564637 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacccacttaaaa 21564538  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21564537 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 21564496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21656659 - 21656518
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21656659 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 21656560  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21656559 ttagtcacctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 21656518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1017185 - 1017044
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  1017185 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 1017086  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1017044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1687792 - 1687655
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  1687792 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1687693  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687692 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1687655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 20813441 - 20813582
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20813441 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20813540  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813541 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 20813582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38446617 - 38446476
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38446617 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38446518  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38446517 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtagataatgctct 38446476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 42017014 - 42016878
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42017014 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42016915  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42016914 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataat 42016878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 132 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22852131 - 22851996
Alignment:
Q  132 tttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 230  Q
    ||||||| || || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22852131 tttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 22852032  T
Q  231 atctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22852031 atctgtttaggcatgacaaatggtggataatgctct 22851996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 20760071 - 20760212
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  20760071 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 20760170  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20760171 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 20760212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26455723 - 26455582
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26455723 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 26455624  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26455623 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctct 26455582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31122803 - 31122662
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  31122803 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaagacccgcttaaaa 31122704  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31122703 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31122662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 51562303 - 51562162
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  51562303 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagataacatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 51562204  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51562203 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 51562162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21890311 - 21890175
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatgtt-ggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  21890311 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatatttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 21890212  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890211 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 21890175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19268626 - 19268521
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268626 gttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 19268527  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  19268526 tgctct 19268521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 20086314 - 20086455
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20086314 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatacttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20086413  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20086414 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctct 20086455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 36314972 - 36315113
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36314972 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 36315071  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315072 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36315113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41251027 - 41250886
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41251027 gaattgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 41250928  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41250927 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 41250886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 47329175 - 47329316
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||| ||||| || ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47329175 gaatcgtttccaacaagtcatatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47329274  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  47329275 ttagtcatctttttaggtatggcaaatggtggataatgctct 47329316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 50287707 - 50287570
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  50287707 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattaaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50287608  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287607 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 50287570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 10618480 - 10618617
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  10618480 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 10618579  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618580 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 10618617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37248097 - 37247956
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  37248097 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37247998  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||    
T  37247997 ttagtcatcttttcatgcatgacaaatgatgaataatgctct 37247956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 42107099 - 42107240
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42107099 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattacttccttgaactcatctttgacaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42107198  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42107199 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 42107240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 53196155 - 53196014
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  53196155 gaatcgtttcaaagaagtcttattgtagataacatagttggtaattatttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 53196056  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53196055 ttagttatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 53196014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 53926015 - 53926120
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53926015 gttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataa 53926114  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  53926115 tgctct 53926120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 131 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19664677 - 19664541
Alignment:
Q  131 gtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagt 229  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19664677 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcataacatccacttaaaattagt 19664578  T
Q  230 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19664577 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19664541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29677616 - 29677476
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29677616 aatcgtttcaaacaggtcctatcgtagatatcatagtttgtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccatttaaaat 29677517  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29677516 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 29677476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 126 - 275
Target Start/End: Original strand, 40922165 - 40922315
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40922165 gaatcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40922264  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctgtggtgctg 275  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||    
T  40922265 ttagtaatttttttaggcatggaaaatggtggataatgttctttgttgctg 40922315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 1448768 - 1448873
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1448768 gttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 1448867  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  1448868 tgctct 1448873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12748524 - 12748391
Alignment:
Q  134 tcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcat 232  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  12748524 tcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgttttctaacacccacttaaaattagtcat 12748425  T
Q  233 ctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12748424 ctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 12748391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 262
Target Start/End: Original strand, 32650856 - 32650957
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32650856 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttctaggcatggcaaatggtggataa 32650955  T
Q  261 tg 262  Q
    ||    
T  32650956 tg 32650957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44798408 - 44798268
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44798408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 44798309  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44798308 ttactcat-tttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 44798268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 52821049 - 52821190
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  52821049 gaatcgttttaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtagtaaaactggctcctaacacccacttaaaa 52821148  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  52821149 ttagtcatctttttaggcataacaaatgatggataatgctct 52821190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3697287 - 3697148
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  3697287 gaatcctttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaattcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 3697188  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3697187 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgct 3697148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 20913754 - 20913893
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913754 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20913853  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20913854 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgct 20913893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 20921872 - 20922011
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20921872 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20921971  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20921972 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgct 20922011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 27070739 - 27070880
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||    
T  27070739 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacactcacttaaaa 27070838  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  27070839 ttagtcatcttttcagacattataaatggtggataatgctct 27070880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 35608131 - 35608272
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||     
T  35608131 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatcggactcctaacacccacttaaac 35608230  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35608231 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 35608272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 48651389 - 48651248
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  48651389 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 48651290  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48651289 ttaatcgtctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 48651248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Original strand, 50364908 - 50365028
Alignment:
Q  147 attgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 245  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50364908 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacactcacttaaaatcagtaatctttttaggcatg 50365007  T
Q  246 acaaatggtggataatgctct 266  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  50365008 gcaaatggtgggtaatgctct 50365028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 50977969 - 50977866
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50977969 gttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataa 50977870  T
Q  261 tgct 264  Q
    ||||    
T  50977869 tgct 50977866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 51081101 - 51080998
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51081101 gttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataa 51081002  T
Q  261 tgct 264  Q
    ||||    
T  51081001 tgct 51080998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 262
Target Start/End: Original strand, 51475282 - 51475383
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51475282 gttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 51475381  T
Q  261 tg 262  Q
    ||    
T  51475382 tg 51475383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 55164115 - 55164256
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| |||||||| || || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  55164115 gaattgtttcaaataagtcatattgtagatagcatagttgctaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacctacttaaaa 55164214  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  55164215 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgctct 55164256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28699785 - 28699685
Alignment:
Q  166 taattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28699785 taattgcttccttgaactcatctttggcaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctc 28699686  T
Q  266 t 266  Q
    |    
T  28699685 t 28699685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 33473239 - 33473380
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  33473239 gaatcgtttcaaacaagttttattgtagataacatagttggtaattgtttccttgattttatctttggtaccaaatctggtttctaacacgcacttaaaa 33473338  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33473339 ttagtcatctttttagtcatgataaatggtggataatgctct 33473380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39069867 - 39069726
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||| ||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39069867 gaatcgtttcaaacaagtcatattgttaatagcatagttgataattgtttcctttaacttatctttggtaccaaatctggctcttaacacccacttaaaa 39069768  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39069767 ttagtcatcttttcatgcatggcaaatggtggataatgctct 39069726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 45380260 - 45380401
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg--ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaa 223  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||   ||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  45380260 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagtttgataattgcttctttaaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacc-acttaaa 45380358  T
Q  224 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  45380359 attagtcatctttttatgcatggtaaatggtggataatgctct 45380401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44152777 - 44152700
Alignment:
Q  189 ttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44152777 ttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 44152700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47473295 - 47473230
Alignment:
Q  201 atggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47473295 atggctcctaacatccacttaaaattagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47473230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34019565 - 34019462
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||   ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34019565 gttgataattgcttacttgaactcactgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagccatatttttaggcatgtcaaatggtggataa 34019466  T
Q  261 tgct 264  Q
    ||||    
T  34019465 tgct 34019462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 251
Target Start/End: Original strand, 38923998 - 38924124
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  38923998 gaattgtttcaaacaagtcctatcgtagataaaatagttggtaattgcttcgttgaacttatctttggtaccaaattggactcctaacatccacttaaaa 38924097  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 251  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  38924098 ttaatcatctctttaagcatgacaaat 38924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 235
Target Start/End: Original strand, 42641214 - 42641288
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42641214 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaagtctgcctcctaacacccacttaaaatcaatcatctt 42641288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 60
Target Start/End: Original strand, 28775383 - 28775412
Alignment:
Q  31 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775383 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 28775412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2390406 - 2390267
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2390406 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatagctcctaacacccacttataa 2390307  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390306 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 2390267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6503858 - 6503718
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6503858 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaacccatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 6503759  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6503758 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 6503718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3408330 - 3408189
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3408330 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 3408231  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408230 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 3408189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 1915343 - 1915484
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1915343 gaatagtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1915442  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1915443 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1915484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2707600 - 2707459
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2707600 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2707501  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2707500 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 2707459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9382660 - 9382519
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  9382660 gaatcgtttcaaacaagtcctgatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 9382561  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9382560 ttagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctct 9382519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10256378 - 10256237
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10256378 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 10256279  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10256278 ttagtcatctttttaggcattgcaaatggtggataatgctct 10256237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12626777 - 12626636
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12626777 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 12626678  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12626677 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 12626636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 17428272 - 17428409
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17428272 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaa 17428371  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17428372 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtgaataatg 17428409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 26230932 - 26231073
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26230932 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtaaataacatagttggtagtttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 26231031  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26231032 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 26231073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 8178249 - 8178390
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8178249 gaatcgtttcaaacatgtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8178348  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8178349 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 8178390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 26393009 - 26393146
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26393009 gaatcgtttcaaaaaacttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 26393108  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26393109 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26393146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29050413 - 29050272
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29050413 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 29050314  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  29050313 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctct 29050272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30379158 - 30379021
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30379158 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 30379059  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30379058 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 30379021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17943177 - 17943040
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17943177 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcataattggtaattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17943078  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17943077 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 17943040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16193415 - 16193314
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16193415 gttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 16193316  T
Q  261 tg 262  Q
    ||    
T  16193315 tg 16193314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 3258807 - 3258948
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg--ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaa 223  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  3258807 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataccatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaa 3258905  T
Q  224 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3258906 attagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataacgctct 3258948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 255
Target Start/End: Original strand, 2598099 - 2598229
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2598099 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgctttattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2598198  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtg 255  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2598199 ttactcatctttttaggcatggcaaatggtg 2598229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11134015 - 11133873
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttcctt-gaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaa 223  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11134015 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagatggtaattgcttcctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaa 11133916  T
Q  224 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  11133915 attagtcatctttttagacataacaaatgatggataatgctct 11133873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1077378 - 1077241
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1077378 gaatcgtttcaaataagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 1077279  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1077278 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 1077241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26936712 - 26936607
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26936712 gttgataattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatccggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 26936613  T
Q  261 tgctct 266  Q
    | ||||    
T  26936612 tactct 26936607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 26196321 - 26196458
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg--ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaa 223  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||    
T  26196321 gaatcggttcaaccaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccgtgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacaac-acttaaa 26196419  T
Q  224 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26196420 attaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26196458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 35223935 - 35224025
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35223935 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctagctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgtcaaat 35224025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 6785101 - 6785239
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |||||||  |||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6785101 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacataattggt---tgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 6785197  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||    
T  6785198 ttagtcatctttttagtcatgtcaaattttgtataatgctct 6785239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 262
Target Start/End: Original strand, 10931187 - 10931288
Alignment:
Q  165 gtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg----acaaatggtggataa 260  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||    
T  10931187 gtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctaacacccgcttaaaattagtcatctttttaggcatgcatgagaaatggtggataa 10931286  T
Q  261 tg 262  Q
    ||    
T  10931287 tg 10931288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 262
Target Start/End: Original strand, 25820550 - 25820686
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |  ||| ||||||||| |||||||    
T  25820550 aatcgtttcaaacaattcctatcgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatgtttggtaccaaatctaactcataacacccatttaaaat 25820649  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||  |||||||||    
T  25820650 tagtcataattttagtcatgtcaaattatggataatg 25820686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31376058 - 31375971
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaac 212  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31376058 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgttaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaac 31375971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 183
Target Start/End: Original strand, 12612971 - 12613029
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaact 183  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12612971 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaact 12613029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 60
Target Start/End: Original strand, 2390110 - 2390139
Alignment:
Q  31 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390110 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 2390139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2533413 - 2533272
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2533413 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctccaaacacccacttaaaa 2533314  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533313 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 2533272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3876049 - 3875908
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||    
T  3876049 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactatatctggttcctaacacccacttaaaa 3875950  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875949 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 3875908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37933783 - 37933646
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37933783 gaatcgtttcaaacaagtcttatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37933684  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933683 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 37933646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15847253 - 15847117
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15847253 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 15847154  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15847153 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataat 15847117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 35884430 - 35884569
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35884430 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 35884529  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35884530 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgct 35884569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 513448 - 513308
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  513448 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 513349  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  513348 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctct 513308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1293627 - 1293486
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  1293627 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggtttctaacacccacttaaaa 1293528  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293527 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1293486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 28707446 - 28707587
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28707446 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatatcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaa 28707545  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28707546 ttagtcatcttttaaggcatgacaaatggtggataatgctct 28707587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 36400070 - 36400211
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||     
T  36400070 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaac 36400169  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400170 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36400211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38107240 - 38107103
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38107240 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38107141  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38107140 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 38107103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 43806533 - 43806674
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43806533 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacactcacttaaaa 43806632  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43806633 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctct 43806674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 22683988 - 22684129
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22683988 gaatcatttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22684087  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22684088 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtgaataatgctct 22684129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35443452 - 35443311
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35443452 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35443353  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35443352 ttagttatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctct 35443311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 260118 - 259982
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  260118 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 260019  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  260018 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 259982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 655803 - 655939
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  655803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 655902  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  655903 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 655939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 841538 - 841674
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  841538 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 841637  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  841638 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 841674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 9056338 - 9056479
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  9056338 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 9056437  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9056438 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 9056479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7435006 - 7434886
Alignment:
Q  147 attgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 245  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7435006 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttataggcttg 7434907  T
Q  246 acaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7434906 acaaatggtggataatgctct 7434886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 440981 - 440844
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  440981 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 440882  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  440881 ttactcatctttttagacatggcaaacggtggataatg 440844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 28496355 - 28496495
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || ||| ||||||||||||    
T  28496355 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagttc-taatacccacttaaaa 28496453  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28496454 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatactct 28496495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 38633710 - 38633851
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  38633710 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgatttctaacacccacttaaaa 38633809  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38633810 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 38633851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 23972295 - 23972437
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||    
T  23972295 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgactcctatcacccacttaaaa 23972394  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgac-aaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  23972395 ttagtcatctttttagacatgacaaaatgttggataatactct 23972437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38208894 - 38208756
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38208894 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgctaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38208795  T
Q  225 ttagtcat-ctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38208794 ttagtcatccattttagacatggcaaatggtggataatg 38208756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 251
Target Start/End: Original strand, 41536527 - 41536653
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  41536527 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41536626  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41536627 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 41536653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12010654 - 12010549
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12010654 gttggtaattgttgccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttatgcatggcaaatggtggataa 12010555  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  12010554 tgctct 12010549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13797229 - 13797089
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  13797229 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtatatagcatagttggtaattgcttctttgaactcat-tttggtatcaaatctggctcctaacatccacataaaa 13797131  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  13797130 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggacgatgctct 13797089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23935338 - 23935233
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23935338 gttgataattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 23935239  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  23935238 tgctct 23935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33651982 - 33651841
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  33651982 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagtttgtaattgtttccttgaactcatctttcataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 33651883  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33651882 ttagtcatctttttagacatgacaaacggtggataatgctct 33651841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 40301893 - 40302030
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40301893 gaatcgtttcaaaaaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaatttatctttggtaccaaatctagctcctaacactcacttaaaa 40301992  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40301993 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 40302030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 266
Target Start/End: Original strand, 39513344 - 39513480
Alignment:
Q  131 gtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagt 229  Q
    |||||||| || || || |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  39513344 gtttcaaataagtcctaatgtagataacatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaattagt 39513443  T
Q  230 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  39513444 catctttttaggcatggcatatggtggataatactct 39513480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 24430571 - 24430712
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||    
T  24430571 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttgataattgttttattgaactcatctttggtaccaaatctcactactaacacccacttaaaa 24430670  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24430671 ttagtcatctttttaggcatgacaaaaggtggataatgctct 24430712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29485406 - 29485287
Alignment:
Q  147 attgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 245  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29485406 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaatcagtcat-tttttaggcatg 29485308  T
Q  246 acaaatggtggataatgctct 266  Q
     |||||| |||||||||||||    
T  29485307 gcaaatgatggataatgctct 29485287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6016310 - 6016207
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6016310 gttggtaattgcttctttaaactcatctttgatactcaatttggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 6016211  T
Q  261 tgct 264  Q
    ||||    
T  6016210 tgct 6016207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 42988227 - 42988367
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| |||| || |||| |||||||||| || |||| || |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  42988227 gaatcgtttcaaa-aagtcctattgtagataatatagttgataattgcttcatttaacttatatttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 42988325  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42988326 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 42988367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4649291 - 4649154
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| || || | |||| ||||||||||    
T  4649291 gaatcgtttcaaacaagtccaattgtagatagcataattggtaattgtttccttgaactcgtctttggtaccaaatctgacttccaacatccacttaaaa 4649192  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4649191 ttagtcatttttttaggcatggcaaatggtggataatg 4649154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 36218781 - 36218917
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |  |||| |||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||||||||    
T  36218781 gaatcgtttcaaacaagtcatgatgtagataatatagttgataattgcttc-ttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctagcacccacttaaaa 36218879  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36218880 ttagccatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 36218917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 266
Target Start/End: Original strand, 24193356 - 24193433
Alignment:
Q  188 tttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24193356 tttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 24193433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 190
Target Start/End: Original strand, 24193131 - 24193195
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatcttt 190  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24193131 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcttt 24193195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8137238 - 8137180
Alignment:
Q  202 tggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  8137238 tggctcctaacacctacttaaaattagtcatttttttaggcatagcaaatggtggataa 8137180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13797323 - 13797295
Alignment:
Q  32 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13797323 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 13797295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 35443550 - 35443518
Alignment:
Q  28 gaataggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35443550 gaataggtcaaatgcatctaaaggtcctttaag 35443518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 4544985 - 4545126
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4544985 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 4545084  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 4545126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 33807780 - 33807921
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33807780 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 33807879  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33807880 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33807921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42273943 - 42273802
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  42273943 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 42273844  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273843 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 42273802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 11795154 - 11795295
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11795154 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 11795253  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11795254 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 11795295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28264784 - 28264643
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  28264784 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 28264685  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264684 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28264643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 55517185 - 55517326
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  55517185 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 55517284  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55517285 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 55517326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 24458631 - 24458770
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24458631 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 24458730  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24458731 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgct 24458770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26017564 - 26017425
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26017564 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26017465  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26017464 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgct 26017425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12196610 - 12196469
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12196610 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12196511  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12196510 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12196469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 19496102 - 19496243
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19496102 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggcgcctaacacccacttaaaa 19496201  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19496202 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 19496243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 23135006 - 23135143
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23135006 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23135105  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23135106 ttagtcatttttttaggcatgccaaatggtggctaatg 23135143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 28159953 - 28160094
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28159953 gaatcatttcaaacaagtcttattgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28160052  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28160053 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28160094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31591216 - 31591076
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31591216 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 31591117  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31591116 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctct 31591076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31973732 - 31973591
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  31973732 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 31973633  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31973632 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31973591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32318094 - 32317957
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  32318094 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgtctcctaacacccacttaaaa 32317995  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32317994 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 32317957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 48551764 - 48551901
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  48551764 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatggttggtaattgctttcttgaactcatctttggtacaaaatctgactcctaacacccacttaaaa 48551863  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48551864 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 48551901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 48707733 - 48707874
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  48707733 gaatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48707832  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48707833 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 48707874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40988773 - 40988633
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40988773 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40988674  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40988673 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 40988633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 49118752 - 49118616
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  49118752 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 49118653  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49118652 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 49118616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2055419 - 2055280
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  2055419 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaag 2055320  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2055319 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 2055280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 265
Target Start/End: Original strand, 33174021 - 33174160
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33174021 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatttcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33174120  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33174121 tagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 33174160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48149640 - 48149502
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  48149640 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctgacacccacttaaaa 48149541  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149540 ttactcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 48149502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5227531 - 5227390
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||    
T  5227531 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctagtatccacttaaaa 5227432  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227431 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 5227390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15985151 - 15985010
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15985151 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 15985052  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15985051 tcagtaatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 15985010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 28812287 - 28812427
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28812287 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaagtcatctttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaaa 28812385  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28812386 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 28812427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44490460 - 44490324
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||     
T  44490460 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaag 44490361  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490360 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 44490324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 8882013 - 8882152
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8882013 gaatcgtttcaaacaagtcctattctagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8882112  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8882113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 8882152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 9339123 - 9339267
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatc---tttggtacaaaatatggctcctaacacccactta 221  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9339123 gaatcatttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccactta 9339222  T
Q  222 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9339223 aaattagtcatctttttatgcatgacaaatggtgaataatgctct 9339267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14564937 - 14564796
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14564937 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 14564838  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14564837 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctct 14564796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 17847096 - 17847236
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17847096 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17847195  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17847196 ttagtcatc-ttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 17847236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35930180 - 35930040
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35930180 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35930081  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35930080 ttagtcatctttttaggcatgacaaa-ggtggataatgctct 35930040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 39995167 - 39995308
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39995167 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaa 39995266  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39995267 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatcctct 39995308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 50542354 - 50542495
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  50542354 gaatcgttttaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 50542453  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50542454 ttaatcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 50542495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32118854 - 32118714
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32118854 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccccttaaaat 32118755  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32118754 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctct 32118714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10588719 - 10588580
Alignment:
Q  128 atcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaatt 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10588719 atcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaact 10588620  T
Q  227 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  10588619 agtcatctttttaggcatggtaaatggcagataatgctct 10588580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 17993017 - 17993158
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17993017 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 17993116  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17993117 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 17993158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24623253 - 24623148
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24623253 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagttatttttttaggcatgacaaatggtggataa 24623154  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  24623153 tgctct 24623148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 25734223 - 25734360
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  25734223 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttaattgaactcatctttcgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25734322  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25734323 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtggataatg 25734360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 30467003 - 30467140
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||    
T  30467003 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccatttaaaa 30467102  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30467103 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 30467140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39700186 - 39700045
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  39700186 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacataattggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcttaacactcacttaaaa 39700087  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39700086 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtgaataatgctct 39700045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37381986 - 37381848
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||    
T  37381986 aatcatttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatttttggtaccatatctggttcctaacacccacttaaaat 37381887  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37381886 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgct 37381848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 19168831 - 19168936
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19168831 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatttgactcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 19168930  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  19168931 tgctct 19168936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23553205 - 23553069
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23553205 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacc-acttaaaa 23553107  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553106 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 23553069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 30141108 - 30141249
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30141108 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 30141207  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  30141208 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctct 30141249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 33693333 - 33693474
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  33693333 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 33693432  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  33693433 ttattcatctttttagacatggcaaatgatagataatgctct 33693474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 50276138 - 50276274
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  50276138 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 50276237  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50276238 ttag---tctttttaggcatggcaaacggtggataatgct 50276274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 51371047 - 51371188
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  51371047 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 51371146  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  51371147 ttagtcatttttttagacatggcaaatggtgaataatgctct 51371188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25730381 - 25730244
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  25730381 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcactaaatccgactcctaacatccacttaaaa 25730282  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  25730281 ttagtcatctttttaggcatagcaaatagtggataatg 25730244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31208885 - 31208748
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31208885 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcccaacacccacttaaaa 31208786  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||    ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  31208785 ttagtcatc----taaacatgataaatggtggataatgctct 31208748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Original strand, 42549643 - 42549762
Alignment:
Q  147 attgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 245  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42549643 attgtagataacatagttggtaattgcttcattgaacttatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatcaatcatctttttaggcatg 42549742  T
Q  246 acaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  42549743 acaaa-ggtggaaaatgctct 42549762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22298659 - 22298517
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22298659 gaatcgtttcaaacaagccctattgtagatagcataattggtaattgtttccttaaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22298560  T
Q  225 ttagtcatct-ttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22298559 ttagtcatcttttttaggcatagcaaatggtggataatgctct 22298517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 266
Target Start/End: Original strand, 56555200 - 56555281
Alignment:
Q  185 atctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56555200 atctttggtaccaaatctggctcctgacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 56555281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20534306 - 20534225
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggct 206  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20534306 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggct 20534225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 30141409 - 30141373
Alignment:
Q  24 ttaagaataggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30141409 ttaaaaataggtcaaatgcatctaaaggtcctttaag 30141373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 16246193 - 16246334
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16246193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16246292  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16246293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 16246334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27328725 - 27328584
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  27328725 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 27328626  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328625 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 27328584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 33865267 - 33865408
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33865267 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33865366  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33865367 ttagtcatttttttaggcatgacaaatggtggataatactct 33865408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 921163 - 921022
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  921163 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 921064  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  921063 ttagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctct 921022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 25087796 - 25087933
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25087796 gaattgtttcaaacaagtcttattgtatataacatagttgataattgcttccttgaactcatctctggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaa 25087895  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25087896 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 25087933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 28650426 - 28650567
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28650426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28650525  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28650526 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgctct 28650567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40854750 - 40854609
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40854750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40854651  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40854650 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40854609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 41500502 - 41500643
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41500502 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtacatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccgcttaaaa 41500601  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41500602 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 41500643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 132 - 266
Target Start/End: Original strand, 771981 - 772116
Alignment:
Q  132 tttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 230  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  771981 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 772080  T
Q  231 atctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  772081 atctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 772116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7379104 - 7378963
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7379104 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7379005  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7379004 ttagtcctctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7378963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9276715 - 9276574
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9276715 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 9276616  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9276615 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctct 9276574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 11949426 - 11949567
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |    
T  11949426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaata 11949525  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949526 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 11949567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 33106969 - 33107110
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||| | || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33106969 gaatcgtttcaaacgagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 33107068  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  33107069 ttagtcatctttttaggcatgaaaaatggtaaataatgctct 33107110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34253283 - 34253142
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34253283 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaata 34253184  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34253183 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 34253142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2057067 - 2056929
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||    
T  2057067 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatccagctcctaacacccacttaaaa 2056968  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2056967 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgc 2056929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2456151 - 2456010
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  2456151 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttaactcctaacacccacttaaaa 2456052  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2456051 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 2456010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 12759750 - 12759890
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  12759750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatttgcctc-taacacccacttaaaa 12759848  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12759890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37838438 - 37838301
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37838438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37838339  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37838338 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 37838301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17134369 - 17134229
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  17134369 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaag 17134270  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  17134269 tagtcatctttttaggaatggcaaatgatggataatgctct 17134229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 7297234 - 7297373
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  7297234 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgtcttcttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 7297333  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7297334 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 7297373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 1106559 - 1106700
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||| ||||||| || || ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  1106559 gaatcatttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1106658  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1106659 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 1106700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 2094410 - 2094551
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2094410 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttgatactaaatttggctccaaacacccacttaaaa 2094509  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2094510 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 2094551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 8396587 - 8396692
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8396587 gttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaaaacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 8396686  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  8396687 tgctct 8396692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19180562 - 19180422
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19180562 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagtatagttagtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctc-taacacccacttaaaa 19180464  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19180463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 19180422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 37732193 - 37732334
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  37732193 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtaaataacatagttggtaattgctttcttgaactcatttttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37732292  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37732293 ttagtcatctttttatgtatgacaaatggtggataatgctct 37732334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 131 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36211182 - 36211046
Alignment:
Q  131 gtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagt 229  Q
    ||||||||||| || |||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36211182 gtttcaaacaagtcctattctagataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagt 36211083  T
Q  230 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36211082 catctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 36211046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 36444229 - 36444369
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  36444229 aatcgtttcaaacaagtcctatagtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacctacttaaaat 36444328  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36444329 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 36444369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38751188 - 38751048
Alignment:
Q  127 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 225  Q
    ||||||||||||||| || || |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38751188 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatgtggctcctaacatccacttaaaat 38751089  T
Q  226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38751088 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38751048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 2314975 - 2315114
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2314975 gaattgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2315074  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2315075 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgct 2315114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 133 - 266
Target Start/End: Original strand, 3430631 - 3430765
Alignment:
Q  133 ttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtca 231  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3430631 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaattagtca 3430730  T
Q  232 tctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3430731 tctttttaggcatggcaaatggtgtataatgctct 3430765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8899822 - 8899682
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8899822 gaatcgtttcaa-caagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8899724  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8899723 ctagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 8899682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 43249448 - 43249553
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43249448 gttggtaattgtttccttgaatacatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 43249547  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  43249548 tgctct 43249553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45124260 - 45124120
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  45124260 gaatcgtttcaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttaaactcatctttggtatcaaatcagactcttaacacccacttaaaa 45124161  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 265  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45124160 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 45124120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 17484550 - 17484687
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  17484550 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacaaccacttaaaa 17484649  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  17484650 ttagtcatctttttaagcatggaaaatggtggataatg 17484687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29737889 - 29737748
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||| ||||||    
T  29737889 gaattgtttcaaacaagtcctattgtcgatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaagatccatttaaaa 29737790  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29737789 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 29737748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 266
Target Start/End: Original strand, 41178059 - 41178160
Alignment:
Q  165 gtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41178059 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatttttttaggcatggtaaatggtggataatgct 41178158  T
Q  265 ct 266  Q
    ||    
T  41178159 ct 41178160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42630103 - 42629962
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || |||  || ||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42630103 gaatcgtttcaaacaagtcctatcatagatagcataattgataattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 42630004  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42630003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggatgatgctct 42629962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37654213 - 37654112
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  37654213 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatgatgaataa 37654114  T
Q  261 tg 262  Q
    ||    
T  37654113 tg 37654112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 19916023 - 19916128
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19916023 gttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatatcaatcatctttttaggcttgacaaattgtggataa 19916122  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  19916123 tgctct 19916128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14630755 - 14630663
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacaccca 217  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14630755 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacaccca 14630663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9331897 - 9331757
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || ||||||||||||||||  ||  | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  9331897 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtattgttggtaattgcttcccagatattatcttaggtaccaaatttggctcctaacacccacctaaga 9331798  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 265  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9331797 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 9331757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 215
Target Start/End: Original strand, 23671811 - 23671901
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacc 215  Q
    |||||||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23671811 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacatggttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacc 23671901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 210 - 266
Target Start/End: Original strand, 23672958 - 23673014
Alignment:
Q  210 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23672958 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggaaaatgctct 23673014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 31214141 - 31214113
Alignment:
Q  32 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31214141 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 31214113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 42630197 - 42630169
Alignment:
Q  32 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42630197 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 42630169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 114
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  255 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagtcggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 156  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 219027 - 218885
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacaccc-acttaaa 223  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  219027 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacaccccacttaaa 218928  T
Q  224 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  218927 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 218885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 5027 - 5164
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5027 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacaccctcttaaaa 5126  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5127 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatg 5164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 48103 - 47967
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    ||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  48103 gaatcgttttaaacaagtccgattgtatatcacatagttggtaattgcttccttgaactcacctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 48004  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 47967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 252438 - 252579
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  252438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 252537  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  252538 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctct 252579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5326 - 5190
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5326 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacc-acttaaaa 5228  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 5190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 2009 - 2114
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2009 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacctacttaaaatcagtcatcttattaggcatgacaaatggtggataa 2108  T
Q  261 tgctct 266  Q
    ||||||    
T  2109 tgctct 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11463 - 11362
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 260  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11463 gttggtaattgcttccttaaacttatctatggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataa 11364  T
Q  261 tg 262  Q
    ||    
T  11363 tg 11362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13236 - 13099
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||    
T  13236 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 13137  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13136 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 13099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 59608 - 59745
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||    
T  59608 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 59707  T
Q  225 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 262  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  59708 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 59745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 289 - 342
Alignment:
Q  213 acccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  289 acccacttaaaattattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19831 - 19781
Alignment:
Q  216 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19831 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 19781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 680 - 599
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggct 206  Q
    |||||||||||||||| || || |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  680 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 206
Target Start/End: Original strand, 1913 - 1994
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggct 206  Q
    |||||||||||||||| || || |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1913 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 3407 - 3452
Alignment:
Q  161 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3407 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 3452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1877
Alignment:
Q  126 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggct 206  Q
    |||||||||||||||| || || |||  ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  1958 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttgatagcatagttgataattgcttccttgacctcatctttggtaccaaatctggct 1877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University