View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14015_high_7 (Length: 448)

Name: NF14015_high_7
Description: NF14015
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14015_high_7
NF14015_high_7
[»] chr3 (182 HSPs)
chr3 (13-432)||(6490132-6490551)
chr3 (13-432)||(6500786-6501205)
chr3 (13-432)||(9993677-9994094)
chr3 (23-432)||(12237409-12237815)
chr3 (23-432)||(12249235-12249641)
chr3 (13-432)||(9981669-9982086)
chr3 (13-432)||(23635743-23636161)
chr3 (13-432)||(19887138-19887555)
chr3 (13-432)||(24706338-24706756)
chr3 (29-422)||(7804318-7804709)
chr3 (13-421)||(7794391-7794797)
chr3 (9-422)||(48337285-48337696)
chr3 (29-432)||(9535642-9536043)
chr3 (13-432)||(17909786-17910203)
chr3 (13-432)||(29460997-29461414)
chr3 (13-432)||(29471849-29472266)
chr3 (13-432)||(933661-934078)
chr3 (13-432)||(11216505-11216922)
chr3 (13-432)||(9390986-9391403)
chr3 (13-432)||(9380440-9380857)
chr3 (13-396)||(16391398-16391780)
chr3 (13-423)||(4404316-4404723)
chr3 (13-423)||(4456959-4457366)
chr3 (13-432)||(6220485-6220904)
chr3 (13-432)||(13383047-13383466)
chr3 (13-432)||(13372453-13372872)
chr3 (13-432)||(13393641-13394060)
chr3 (13-432)||(20683564-20683983)
chr3 (13-432)||(37759703-37760122)
chr3 (16-432)||(23767927-23768343)
chr3 (13-432)||(6180311-6180730)
chr3 (13-432)||(19778418-19778837)
chr3 (13-432)||(19789055-19789474)
chr3 (13-432)||(20672979-20673398)
chr3 (13-432)||(23647781-23648200)
chr3 (13-432)||(23757331-23757750)
chr3 (13-432)||(41683711-41684130)
chr3 (13-432)||(41694280-41694699)
chr3 (13-432)||(4174539-4174959)
chr3 (13-432)||(503951-504370)
chr3 (13-432)||(12286762-12287181)
chr3 (13-432)||(24659933-24660352)
chr3 (13-432)||(39672666-39673085)
chr3 (13-432)||(5510729-5511147)
chr3 (13-432)||(5579417-5579836)
chr3 (13-432)||(5627801-5628220)
chr3 (13-432)||(12296584-12297003)
chr3 (13-432)||(13121695-13122114)
chr3 (13-432)||(13131938-13132357)
chr3 (13-432)||(13557607-13558026)
chr3 (13-432)||(14465624-14466043)
chr3 (13-432)||(18484077-18484497)
chr3 (13-432)||(20721146-20721565)
chr3 (13-432)||(24670513-24670932)
chr3 (13-432)||(37866478-37866897)
chr3 (13-432)||(4743771-4744189)
chr3 (13-432)||(5520907-5521325)
chr3 (13-432)||(5536805-5537223)
chr3 (66-423)||(11163872-11164228)
chr3 (13-432)||(24383302-24383721)
chr3 (13-432)||(28314015-28314434)
chr3 (13-432)||(35187410-35187829)
chr3 (30-432)||(526334-526736)
chr3 (29-432)||(28169116-28169516)
chr3 (13-429)||(14476259-14476675)
chr3 (13-432)||(5547389-5547807)
chr3 (13-432)||(8774690-8775110)
chr3 (13-432)||(8785275-8785695)
chr3 (13-432)||(28324631-28325050)
chr3 (29-432)||(37885611-37886014)
chr3 (13-432)||(1783854-1784272)
chr3 (13-432)||(1794266-1794684)
chr3 (13-432)||(10626724-10627143)
chr3 (13-432)||(18851475-18851892)
chr3 (30-432)||(38194757-38195160)
chr3 (30-432)||(38205293-38205696)
chr3 (13-432)||(5865479-5865896)
chr3 (13-432)||(5876078-5876495)
chr3 (13-428)||(4754361-4754774)
chr3 (30-432)||(39382723-39383126)
chr3 (32-432)||(38314733-38315131)
chr3 (30-432)||(11272183-11272586)
chr3 (30-432)||(39372086-39372489)
chr3 (61-432)||(10655095-10655465)
chr3 (14-423)||(27883427-27883831)
chr3 (14-423)||(1064182-1064586)
chr3 (13-423)||(16076973-16077378)
chr3 (9-423)||(1053753-1054162)
chr3 (98-397)||(13261541-13261839)
chr3 (12-423)||(8995741-8996147)
chr3 (13-432)||(10099101-10099521)
chr3 (14-423)||(14581181-14581585)
chr3 (49-399)||(16665947-16666295)
chr3 (13-398)||(8739913-8740294)
chr3 (12-423)||(9006293-9006699)
chr3 (13-399)||(16476344-16476730)
chr3 (14-423)||(17281219-17281624)
chr3 (53-423)||(16670986-16671353)
chr3 (13-269)||(16348418-16348674)
chr3 (15-304)||(14321467-14321757)
chr3 (13-423)||(13199028-13199435)
chr3 (49-337)||(15216160-15216446)
chr3 (13-423)||(2246411-2246815)
chr3 (98-337)||(12567138-12567376)
chr3 (13-423)||(29933350-29933750)
chr3 (13-423)||(29982504-29982904)
chr3 (13-258)||(16493245-16493489)
chr3 (13-423)||(29905972-29906371)
chr3 (13-423)||(29947137-29947536)
chr3 (13-423)||(29996291-29996690)
chr3 (13-423)||(21736154-21736558)
chr3 (314-432)||(16386107-16386225)
chr3 (215-423)||(15651055-15651261)
chr3 (215-423)||(15662690-15662896)
chr3 (13-260)||(16487098-16487342)
chr3 (215-373)||(27172924-27173082)
chr3 (215-394)||(10529222-10529401)
chr3 (215-423)||(51989128-51989335)
chr3 (215-423)||(31113971-31114177)
chr3 (215-373)||(41045640-41045797)
chr3 (264-398)||(17961419-17961551)
chr3 (264-398)||(18006364-18006496)
chr3 (215-384)||(15850894-15851065)
chr3 (215-304)||(15833367-15833459)
chr3 (215-304)||(17021990-17022082)
chr3 (215-379)||(22151136-22151301)
chr3 (231-284)||(5213562-5213615)
chr3 (218-304)||(51340974-51341063)
chr3 (215-384)||(13148151-13148321)
chr3 (14-181)||(18006570-18006734)
chr3 (231-301)||(2785031-2785102)
chr3 (13-79)||(16665895-16665959)
chr3 (13-79)||(16670930-16670994)
chr3 (231-301)||(33583196-33583267)
chr3 (231-384)||(45861693-45861846)
chr3 (13-134)||(9092151-9092270)
chr3 (218-301)||(12752727-12752813)
chr3 (13-70)||(11167868-11167924)
chr3 (231-284)||(11223548-11223601)
chr3 (231-284)||(14955412-14955465)
chr3 (13-81)||(15662492-15662558)
chr3 (14-181)||(17961625-17961789)
chr3 (9-81)||(23680182-23680251)
chr3 (9-81)||(24052419-24052488)
chr3 (250-384)||(49990146-49990280)
chr3 (231-284)||(2561172-2561226)
chr3 (231-284)||(12726351-12726405)
chr3 (231-284)||(18121743-18121797)
chr3 (231-284)||(18142873-18142927)
chr3 (231-284)||(47207690-47207744)
chr3 (231-284)||(53056848-53056902)
chr3 (231-264)||(6090737-6090770)
chr3 (231-264)||(11868274-11868307)
chr3 (231-264)||(12388993-12389026)
chr3 (13-81)||(15650857-15650923)
chr3 (231-264)||(16032530-16032563)
chr3 (231-264)||(25398376-25398409)
chr3 (231-264)||(29855414-29855447)
chr3 (234-301)||(37412571-37412640)
chr3 (231-264)||(40799879-40799912)
chr3 (231-301)||(24775655-24775727)
chr3 (49-81)||(31113807-31113839)
chr3 (231-301)||(46796488-46796560)
chr3 (231-301)||(47405542-47405614)
chr3 (231-304)||(11909145-11909220)
chr3 (231-266)||(12968309-12968344)
chr3 (13-64)||(13604662-13604713)
chr3 (231-284)||(20646138-20646192)
chr3 (231-284)||(21605775-21605829)
chr3 (231-284)||(22140748-22140802)
chr3 (231-264)||(20627552-20627585)
chr3 (231-264)||(21636791-21636824)
chr3 (231-264)||(28582111-28582144)
chr3 (234-301)||(30054341-30054410)
chr3 (231-264)||(38177764-38177797)
chr3 (231-264)||(49553610-49553643)
chr3 (231-301)||(1728136-1728208)
chr3 (231-301)||(16658739-16658811)
chr3 (226-258)||(16880026-16880058)
chr3 (226-266)||(17697610-17697650)
chr3 (231-301)||(49642883-49642955)
chr3 (231-301)||(49666526-49666598)
[»] chr4 (108 HSPs)
chr4 (23-432)||(5022788-5023196)
chr4 (13-432)||(18077695-18078113)
chr4 (13-432)||(40454138-40454555)
chr4 (13-432)||(25657188-25657606)
chr4 (29-432)||(40470393-40470794)
chr4 (13-432)||(14835893-14836309)
chr4 (13-423)||(4987335-4987743)
chr4 (13-432)||(10909460-10909879)
chr4 (14-432)||(15207204-15207618)
chr4 (13-432)||(18752278-18752697)
chr4 (13-432)||(18762888-18763307)
chr4 (13-432)||(27814734-27815153)
chr4 (13-432)||(48371183-48371602)
chr4 (13-432)||(52703840-52704259)
chr4 (16-423)||(3370777-3371181)
chr4 (13-432)||(461209-461628)
chr4 (13-432)||(14843442-14843861)
chr4 (13-432)||(17918104-17918523)
chr4 (13-432)||(24027874-24028293)
chr4 (13-423)||(3390517-3390924)
chr4 (13-432)||(450628-451047)
chr4 (13-432)||(15560868-15561287)
chr4 (13-432)||(30936861-30937280)
chr4 (13-432)||(10695693-10696110)
chr4 (13-432)||(47151868-47152285)
chr4 (13-432)||(16266514-16266933)
chr4 (13-432)||(17928752-17929171)
chr4 (13-432)||(19944116-19944535)
chr4 (13-432)||(30926283-30926702)
chr4 (13-432)||(36018388-36018807)
chr4 (13-432)||(36028941-36029360)
chr4 (13-423)||(19581303-19581711)
chr4 (13-432)||(10740383-10740802)
chr4 (13-432)||(10750957-10751376)
chr4 (13-432)||(10954152-10954571)
chr4 (13-432)||(10964726-10965145)
chr4 (13-432)||(19954751-19955170)
chr4 (13-432)||(22007063-22007482)
chr4 (13-432)||(4948387-4948806)
chr4 (13-432)||(16255921-16256340)
chr4 (13-432)||(21996465-21996884)
chr4 (13-432)||(49518187-49518606)
chr4 (13-432)||(16317383-16317800)
chr4 (13-432)||(55745041-55745460)
chr4 (13-432)||(55755652-55756071)
chr4 (14-432)||(24713485-24713898)
chr4 (13-432)||(16305159-16305575)
chr4 (30-432)||(24640299-24640702)
chr4 (13-423)||(11535908-11536313)
chr4 (15-432)||(5873423-5873837)
chr4 (30-432)||(27656652-27657055)
chr4 (30-432)||(27667225-27667628)
chr4 (13-432)||(18130031-18130447)
chr4 (13-423)||(10300597-10301002)
chr4 (14-423)||(11515098-11515501)
chr4 (9-423)||(31266585-31266994)
chr4 (13-423)||(55651387-55651791)
chr4 (16-423)||(49001774-49002175)
chr4 (215-423)||(23509180-23509386)
chr4 (13-423)||(18774469-18774873)
chr4 (215-423)||(8997268-8997474)
chr4 (215-423)||(18007071-18007277)
chr4 (215-421)||(16819364-16819568)
chr4 (13-184)||(39525952-39526119)
chr4 (215-394)||(14778454-14778632)
chr4 (215-384)||(33378291-33378461)
chr4 (215-385)||(17993805-17993974)
chr4 (13-92)||(20648423-20648501)
chr4 (215-394)||(14710790-14710968)
chr4 (215-394)||(36210119-36210299)
chr4 (13-81)||(17198211-17198278)
chr4 (274-423)||(19242089-19242235)
chr4 (13-81)||(16819165-16819230)
chr4 (231-284)||(25651182-25651235)
chr4 (231-301)||(10692812-10692884)
chr4 (231-301)||(10906578-10906650)
chr4 (231-301)||(14604985-14605057)
chr4 (231-284)||(1672368-1672422)
chr4 (231-284)||(1674843-1674897)
chr4 (13-81)||(8997071-8997136)
chr4 (215-260)||(19244002-19244047)
chr4 (234-301)||(8105599-8105667)
chr4 (231-301)||(9751618-9751690)
chr4 (231-282)||(56533140-56533191)
chr4 (231-284)||(16853482-16853536)
chr4 (231-264)||(29121370-29121403)
chr4 (231-264)||(54679930-54679963)
chr4 (231-301)||(6517446-6517518)
chr4 (231-263)||(6641685-6641717)
chr4 (226-266)||(10661240-10661280)
chr4 (226-266)||(10875385-10875425)
chr4 (231-301)||(17398752-17398824)
chr4 (49-81)||(18006907-18006939)
chr4 (49-81)||(19244181-19244213)
chr4 (231-301)||(22190807-22190879)
chr4 (49-81)||(23509519-23509551)
chr4 (231-265)||(45833393-45833427)
chr4 (231-264)||(3105497-3105530)
chr4 (13-42)||(8182665-8182694)
chr4 (13-46)||(8997054-8997087)
chr4 (231-264)||(17247244-17247277)
chr4 (231-264)||(22675598-22675631)
chr4 (231-264)||(37435613-37435646)
chr4 (231-301)||(3395551-3395623)
chr4 (231-301)||(19884663-19884735)
chr4 (231-263)||(19911959-19911991)
chr4 (231-301)||(20977418-20977490)
chr4 (231-301)||(39419812-39419884)
[»] chr5 (164 HSPs)
chr5 (13-432)||(10754397-10754814)
chr5 (13-432)||(34782760-34783177)
chr5 (13-432)||(34771815-34772232)
chr5 (13-432)||(20797599-20798017)
chr5 (13-432)||(43043610-43044028)
chr5 (13-432)||(8521745-8522162)
chr5 (13-432)||(42394884-42395300)
chr5 (13-432)||(24926079-24926496)
chr5 (13-432)||(36084365-36084782)
chr5 (13-432)||(24983360-24983777)
chr5 (14-432)||(36228644-36229060)
chr5 (13-432)||(1109085-1109502)
chr5 (13-432)||(1121843-1122260)
chr5 (13-432)||(30069845-30070262)
chr5 (13-432)||(20551719-20552136)
chr5 (13-432)||(23406350-23406767)
chr5 (13-432)||(31448456-31448875)
chr5 (13-432)||(31418565-31418984)
chr5 (16-422)||(19477908-19478312)
chr5 (16-422)||(19463878-19464282)
chr5 (13-423)||(17457261-17457668)
chr5 (13-432)||(20562244-20562646)
chr5 (13-423)||(21705924-21706333)
chr5 (13-423)||(17446645-17447052)
chr5 (13-377)||(43621854-43622227)
chr5 (13-432)||(27622705-27623124)
chr5 (13-432)||(5290514-5290933)
chr5 (29-423)||(21703077-21703470)
chr5 (13-432)||(22146424-22146843)
chr5 (13-432)||(22157007-22157426)
chr5 (13-432)||(7032064-7032485)
chr5 (13-432)||(9377400-9377819)
chr5 (13-432)||(14557955-14558374)
chr5 (13-432)||(14568592-14569011)
chr5 (13-432)||(16003829-16004248)
chr5 (13-432)||(23306748-23307167)
chr5 (13-432)||(24816824-24817243)
chr5 (13-432)||(24827412-24827831)
chr5 (13-432)||(27603356-27603775)
chr5 (13-432)||(31843862-31844281)
chr5 (13-432)||(6130692-6131111)
chr5 (13-432)||(6975711-6976130)
chr5 (13-432)||(23296180-23296599)
chr5 (13-432)||(39352391-39352810)
chr5 (13-432)||(40390260-40390679)
chr5 (13-432)||(40400922-40401341)
chr5 (13-423)||(34062524-34062931)
chr5 (13-432)||(23362013-23362433)
chr5 (13-432)||(6986201-6986620)
chr5 (13-432)||(15993267-15993686)
chr5 (13-432)||(36582496-36582915)
chr5 (13-432)||(36593051-36593470)
chr5 (13-432)||(9335859-9336277)
chr5 (13-432)||(9346446-9346864)
chr5 (13-432)||(14029947-14030366)
chr5 (13-432)||(14040500-14040919)
chr5 (13-432)||(15739870-15740290)
chr5 (13-432)||(15769030-15769450)
chr5 (49-432)||(22559376-22559759)
chr5 (13-432)||(24807816-24808234)
chr5 (29-432)||(27203712-27204115)
chr5 (13-432)||(27460064-27460483)
chr5 (13-432)||(27470463-27470882)
chr5 (13-432)||(15693970-15694388)
chr5 (13-432)||(22676019-22676438)
chr5 (13-432)||(22685910-22686329)
chr5 (13-432)||(24566993-24567411)
chr5 (13-432)||(27042150-27042569)
chr5 (13-432)||(35225992-35226412)
chr5 (13-432)||(42042688-42043106)
chr5 (13-432)||(42053263-42053681)
chr5 (13-423)||(34051863-34052270)
chr5 (13-432)||(23707346-23707764)
chr5 (13-432)||(35215408-35215828)
chr5 (13-432)||(27052774-27053194)
chr5 (13-432)||(30227436-30227854)
chr5 (13-432)||(30237963-30238381)
chr5 (30-432)||(14446937-14447340)
chr5 (30-432)||(14457549-14457952)
chr5 (30-432)||(40513927-40514330)
chr5 (13-432)||(39502078-39502495)
chr5 (29-432)||(5301085-5301493)
chr5 (13-432)||(17718821-17719241)
chr5 (13-432)||(17729473-17729893)
chr5 (30-432)||(33951738-33952141)
chr5 (49-432)||(39490888-39491271)
chr5 (13-423)||(20624670-20625075)
chr5 (13-421)||(37406559-37406957)
chr5 (14-432)||(36687602-36688018)
chr5 (14-432)||(36698168-36698584)
chr5 (13-432)||(23372414-23372836)
chr5 (13-295)||(23392620-23392901)
chr5 (13-423)||(106023-106429)
chr5 (49-432)||(17607002-17607383)
chr5 (49-432)||(17617616-17617997)
chr5 (49-432)||(31348476-31348857)
chr5 (49-432)||(31359090-31359471)
chr5 (14-373)||(21414197-21414552)
chr5 (135-426)||(37729195-37729488)
chr5 (135-426)||(37740511-37740804)
chr5 (13-309)||(39362217-39362514)
chr5 (13-423)||(20416808-20417212)
chr5 (13-264)||(31815066-31815316)
chr5 (148-423)||(32753895-32754167)
chr5 (269-432)||(31833641-31833803)
chr5 (215-423)||(13533761-13533967)
chr5 (13-423)||(20167972-20168375)
chr5 (314-432)||(39364685-39364803)
chr5 (215-423)||(13523034-13523240)
chr5 (215-423)||(36095755-36095960)
chr5 (215-423)||(36097212-36097417)
chr5 (215-423)||(35543231-35543437)
chr5 (13-150)||(21519963-21520099)
chr5 (215-423)||(1915262-1915469)
chr5 (215-423)||(40228504-40228710)
chr5 (215-394)||(13404989-13405167)
chr5 (315-429)||(23696988-23697103)
chr5 (215-385)||(20215201-20215372)
chr5 (215-384)||(23478251-23478421)
chr5 (215-423)||(40032855-40033058)
chr5 (231-373)||(11208087-11208229)
chr5 (218-304)||(25111966-25112055)
chr5 (218-304)||(25171057-25171146)
chr5 (231-301)||(15516933-15517004)
chr5 (231-301)||(25096928-25096999)
chr5 (231-301)||(25154898-25154969)
chr5 (231-284)||(30742962-30743015)
chr5 (231-284)||(42243662-42243715)
chr5 (231-384)||(32160648-32160801)
chr5 (231-301)||(26759113-26759184)
chr5 (231-301)||(26765462-26765533)
chr5 (231-301)||(4886985-4887057)
chr5 (231-301)||(33933230-33933302)
chr5 (231-284)||(20550876-20550930)
chr5 (13-81)||(35543032-35543098)
chr5 (13-81)||(36095557-36095622)
chr5 (13-81)||(36097014-36097079)
chr5 (231-301)||(7745795-7745867)
chr5 (231-301)||(10848736-10848808)
chr5 (231-301)||(11993851-11993923)
chr5 (226-266)||(16607512-16607552)
chr5 (231-301)||(28139570-28139642)
chr5 (231-284)||(9088950-9089004)
chr5 (231-284)||(14086641-14086695)
chr5 (231-284)||(29138508-29138562)
chr5 (12-81)||(32754237-32754303)
chr5 (231-284)||(33022645-33022699)
chr5 (30-132)||(37778568-37778668)
chr5 (13-46)||(13523422-13523455)
chr5 (13-46)||(13534149-13534182)
chr5 (13-42)||(22559359-22559388)
chr5 (221-258)||(26119922-26119959)
chr5 (234-301)||(30115942-30116011)
chr5 (13-46)||(35542999-35543032)
chr5 (231-264)||(35932108-35932141)
chr5 (231-301)||(89524-89596)
chr5 (234-266)||(2153017-2153049)
chr5 (49-105)||(13523349-13523405)
chr5 (49-105)||(13534076-13534132)
chr5 (231-263)||(21099806-21099838)
chr5 (231-301)||(23413076-23413148)
chr5 (231-263)||(26784357-26784389)
chr5 (231-301)||(35986334-35986406)
chr5 (13-77)||(37778640-37778703)
[»] chr7 (118 HSPs)
chr7 (13-432)||(15888193-15888610)
chr7 (13-432)||(1367648-1368065)
chr7 (13-432)||(589231-589648)
chr7 (13-422)||(21769807-21770214)
chr7 (13-432)||(14745533-14745951)
chr7 (13-432)||(9171004-9171421)
chr7 (13-432)||(20491025-20491442)
chr7 (13-432)||(44280515-44280932)
chr7 (13-432)||(31116375-31116792)
chr7 (13-432)||(3165753-3166170)
chr7 (13-432)||(9170203-9170620)
chr7 (13-432)||(9159748-9160165)
chr7 (13-432)||(20989670-20990089)
chr7 (15-395)||(19985678-19986058)
chr7 (13-432)||(467445-467864)
chr7 (13-432)||(9433281-9433700)
chr7 (13-432)||(9443877-9444296)
chr7 (13-432)||(21002872-21003291)
chr7 (13-432)||(6867089-6867508)
chr7 (13-432)||(6877721-6878140)
chr7 (13-432)||(8617403-8617822)
chr7 (13-432)||(24930467-24930886)
chr7 (13-431)||(454663-455081)
chr7 (13-432)||(2705476-2705895)
chr7 (13-432)||(4222627-4223046)
chr7 (13-432)||(8627966-8628385)
chr7 (13-432)||(11096072-11096491)
chr7 (13-432)||(22089140-22089559)
chr7 (13-432)||(22099755-22100174)
chr7 (13-432)||(37344217-37344636)
chr7 (13-432)||(48710355-48710774)
chr7 (13-430)||(17949982-17950399)
chr7 (13-432)||(2716080-2716499)
chr7 (13-432)||(4212028-4212447)
chr7 (29-432)||(5685536-5685939)
chr7 (13-432)||(26653189-26653608)
chr7 (13-432)||(26699518-26699937)
chr7 (13-432)||(17960588-17961007)
chr7 (13-432)||(166899-167318)
chr7 (29-432)||(541102-541505)
chr7 (13-432)||(9085301-9085719)
chr7 (13-432)||(9095015-9095433)
chr7 (13-432)||(11005202-11005621)
chr7 (13-432)||(177491-177910)
chr7 (13-432)||(26389960-26390379)
chr7 (13-432)||(40041973-40042391)
chr7 (13-432)||(40052522-40052940)
chr7 (14-423)||(18441224-18441629)
chr7 (13-432)||(8001928-8002348)
chr7 (13-432)||(8012573-8012993)
chr7 (13-432)||(24734770-24735189)
chr7 (13-432)||(24744717-24745136)
chr7 (13-432)||(26400602-26401021)
chr7 (30-432)||(1987557-1987959)
chr7 (30-432)||(1998178-1998580)
chr7 (13-432)||(30049538-30049955)
chr7 (13-432)||(40054618-40055034)
chr7 (14-423)||(18419143-18419548)
chr7 (30-432)||(42865844-42866246)
chr7 (30-432)||(42876470-42876872)
chr7 (13-423)||(26209415-26209819)
chr7 (13-423)||(13682350-13682754)
chr7 (13-423)||(3476207-3476611)
chr7 (185-432)||(26294064-26294312)
chr7 (13-337)||(38593599-38593921)
chr7 (13-292)||(6044077-6044354)
chr7 (13-423)||(29590022-29590426)
chr7 (13-337)||(8933634-8933954)
chr7 (13-423)||(15216346-15216750)
chr7 (13-423)||(12734033-12734437)
chr7 (13-290)||(48382304-48382580)
chr7 (13-423)||(24882287-24882691)
chr7 (272-423)||(38403331-38403479)
chr7 (13-176)||(26290215-26290377)
chr7 (215-385)||(8998998-8999167)
chr7 (13-110)||(9261627-9261723)
chr7 (217-423)||(11087110-11087314)
chr7 (13-132)||(23264455-23264573)
chr7 (29-156)||(22494043-22494169)
chr7 (13-84)||(19193265-19193334)
chr7 (231-301)||(2265642-2265713)
chr7 (215-394)||(13174668-13174848)
chr7 (231-301)||(44467027-44467099)
chr7 (344-423)||(48382219-48382297)
chr7 (235-384)||(602646-602796)
chr7 (231-301)||(30944446-30944518)
chr7 (231-301)||(30945479-30945551)
chr7 (233-284)||(13894123-13894174)
chr7 (231-284)||(4821455-4821509)
chr7 (234-284)||(15704616-15704666)
chr7 (231-301)||(23280081-23280154)
chr7 (231-284)||(27871699-27871753)
chr7 (231-264)||(14426549-14426582)
chr7 (231-264)||(21283496-21283529)
chr7 (231-264)||(22578144-22578177)
chr7 (231-264)||(24788143-24788176)
chr7 (231-264)||(28409041-28409074)
chr7 (226-266)||(7488023-7488063)
chr7 (231-301)||(16112007-16112079)
chr7 (231-263)||(19237166-19237198)
chr7 (231-301)||(33691835-33691907)
chr7 (231-301)||(48237025-48237097)
chr7 (231-301)||(12174464-12174535)
chr7 (231-284)||(8182911-8182965)
chr7 (231-284)||(9069543-9069597)
chr7 (231-284)||(48806002-48806056)
chr7 (231-264)||(1293032-1293065)
chr7 (221-258)||(13172465-13172502)
chr7 (231-264)||(14193116-14193149)
chr7 (231-264)||(14425449-14425482)
chr7 (231-260)||(19339373-19339402)
chr7 (231-283)||(21692269-21692322)
chr7 (231-264)||(24794838-24794871)
chr7 (231-264)||(35952811-35952844)
chr7 (231-301)||(331608-331680)
chr7 (231-301)||(4494540-4494612)
chr7 (231-263)||(39284687-39284719)
chr7 (231-301)||(41842396-41842468)
[»] chr6 (145 HSPs)
chr6 (13-432)||(25787685-25788102)
chr6 (49-432)||(26044197-26044579)
chr6 (13-422)||(20029699-20030106)
chr6 (13-432)||(12827676-12828094)
chr6 (13-432)||(7375553-7375970)
chr6 (13-422)||(20062450-20062857)
chr6 (13-432)||(11147044-11147462)
chr6 (13-432)||(25986065-25986482)
chr6 (13-432)||(28251358-28251776)
chr6 (13-432)||(9122926-9123345)
chr6 (13-432)||(9112289-9112708)
chr6 (49-432)||(27505925-27506309)
chr6 (13-432)||(31542692-31543111)
chr6 (37-432)||(28356529-28356923)
chr6 (13-432)||(12855004-12855423)
chr6 (13-432)||(12865530-12865949)
chr6 (13-432)||(34806954-34807373)
chr6 (13-432)||(18925556-18925974)
chr6 (49-432)||(27372815-27373199)
chr6 (49-432)||(27463165-27463549)
chr6 (13-432)||(17984504-17984923)
chr6 (13-432)||(26875395-26875814)
chr6 (13-432)||(32961723-32962142)
chr6 (13-432)||(34817586-34818005)
chr6 (13-432)||(3661366-3661784)
chr6 (13-432)||(3672030-3672448)
chr6 (13-432)||(26036016-26036435)
chr6 (13-432)||(26864771-26865190)
chr6 (13-432)||(32972342-32972761)
chr6 (13-432)||(33199311-33199729)
chr6 (13-432)||(13913034-13913449)
chr6 (13-432)||(26025442-26025861)
chr6 (13-432)||(31982420-31982839)
chr6 (13-432)||(7751029-7751448)
chr6 (13-432)||(27341677-27342096)
chr6 (13-432)||(27402417-27402836)
chr6 (13-432)||(27413076-27413495)
chr6 (13-432)||(16959605-16960023)
chr6 (13-432)||(29384735-29385153)
chr6 (13-423)||(8653654-8654063)
chr6 (29-432)||(16930434-16930836)
chr6 (30-432)||(12716645-12717048)
chr6 (30-432)||(12727294-12727697)
chr6 (13-423)||(18826035-18826440)
chr6 (13-423)||(31572408-31572813)
chr6 (13-432)||(4630856-4631271)
chr6 (13-423)||(18834431-18834836)
chr6 (14-432)||(32300842-32301256)
chr6 (14-432)||(32311531-32311945)
chr6 (53-305)||(6158316-6158569)
chr6 (31-432)||(16123350-16123748)
chr6 (13-432)||(27384416-27384835)
chr6 (13-432)||(27474829-27475248)
chr6 (13-432)||(27504328-27504747)
chr6 (13-398)||(29765553-29765934)
chr6 (13-423)||(4292720-4293125)
chr6 (13-432)||(5845069-5845501)
chr6 (136-432)||(17982417-17982714)
chr6 (49-423)||(17042614-17042987)
chr6 (13-396)||(27166240-27166619)
chr6 (13-423)||(9933468-9933873)
chr6 (14-423)||(22308784-22309189)
chr6 (49-423)||(17064187-17064560)
chr6 (14-423)||(17745562-17745984)
chr6 (49-423)||(17741534-17741904)
chr6 (14-423)||(25518684-25519086)
chr6 (13-422)||(25735353-25735758)
chr6 (13-262)||(13928341-13928588)
chr6 (49-423)||(25686579-25686950)
chr6 (16-181)||(32761730-32761894)
chr6 (13-422)||(25679233-25679638)
chr6 (13-377)||(25675200-25675562)
chr6 (13-304)||(25722753-25723044)
chr6 (13-175)||(9419-9580)
chr6 (13-423)||(19289178-19289582)
chr6 (215-423)||(12953126-12953333)
chr6 (215-423)||(31931417-31931623)
chr6 (13-167)||(17577591-17577744)
chr6 (215-423)||(11205940-11206146)
chr6 (215-384)||(17608401-17608569)
chr6 (215-423)||(18555264-18555470)
chr6 (215-423)||(18498614-18498820)
chr6 (303-432)||(26022878-26023006)
chr6 (215-385)||(7586252-7586421)
chr6 (31-184)||(16123029-16123180)
chr6 (215-423)||(11235493-11235699)
chr6 (215-373)||(17047597-17047755)
chr6 (215-373)||(21128124-21128281)
chr6 (215-384)||(20635605-20635775)
chr6 (215-302)||(22386768-22386858)
chr6 (13-81)||(18498953-18499019)
chr6 (13-81)||(18555603-18555669)
chr6 (13-89)||(10971320-10971395)
chr6 (231-289)||(14100550-14100608)
chr6 (13-115)||(17982315-17982416)
chr6 (235-384)||(14051495-14051644)
chr6 (226-266)||(19625812-19625852)
chr6 (231-301)||(29917984-29918056)
chr6 (374-432)||(12353539-12353597)
chr6 (13-81)||(12952928-12952993)
chr6 (231-301)||(16877180-16877252)
chr6 (231-301)||(32544232-32544304)
chr6 (231-301)||(10640529-10640600)
chr6 (231-264)||(9717849-9717882)
chr6 (231-264)||(15954709-15954742)
chr6 (231-264)||(21618250-21618283)
chr6 (13-81)||(31931756-31931821)
chr6 (49-105)||(11206255-11206311)
chr6 (10-46)||(12952908-12952944)
chr6 (231-301)||(13435499-13435571)
chr6 (235-301)||(15531738-15531806)
chr6 (231-301)||(22076517-22076589)
chr6 (231-301)||(22802108-22802180)
chr6 (226-266)||(25592621-25592661)
chr6 (227-266)||(7812014-7812053)
chr6 (235-304)||(14070176-14070247)
chr6 (231-266)||(19833143-19833178)
chr6 (228-266)||(12348097-12348135)
chr6 (231-284)||(12423246-12423300)
chr6 (231-284)||(16265260-16265314)
chr6 (231-284)||(20730814-20730868)
chr6 (231-284)||(21625086-21625140)
chr6 (13-47)||(25800718-25800752)
chr6 (231-284)||(26589584-26589638)
chr6 (231-284)||(26972336-26972390)
chr6 (13-80)||(11235833-11235896)
chr6 (231-264)||(12348999-12349032)
chr6 (221-258)||(18172134-18172171)
chr6 (231-264)||(19066128-19066161)
chr6 (231-302)||(19623945-19624018)
chr6 (231-264)||(20488028-20488061)
chr6 (231-260)||(21235135-21235164)
chr6 (231-264)||(26943582-26943615)
chr6 (13-42)||(27373187-27373216)
chr6 (13-42)||(27463537-27463566)
chr6 (13-42)||(27506297-27506326)
chr6 (231-301)||(15302167-15302239)
chr6 (231-301)||(16336094-16336166)
chr6 (231-301)||(17381488-17381560)
chr6 (231-301)||(18435523-18435595)
chr6 (13-41)||(18726628-18726656)
chr6 (231-301)||(19086125-19086197)
chr6 (226-258)||(19875844-19875876)
chr6 (226-266)||(23297950-23297990)
chr6 (226-266)||(25930477-25930517)
[»] chr1 (114 HSPs)
chr1 (13-432)||(4250392-4250809)
chr1 (13-432)||(39193921-39194338)
chr1 (13-432)||(7689284-7689703)
chr1 (13-432)||(154116-154533)
chr1 (13-432)||(148041-148458)
chr1 (13-429)||(5973729-5974144)
chr1 (13-432)||(20441144-20441561)
chr1 (13-432)||(35012884-35013302)
chr1 (13-432)||(23580153-23580572)
chr1 (13-432)||(4167220-4167639)
chr1 (13-432)||(5639537-5639956)
chr1 (13-432)||(5650094-5650513)
chr1 (13-432)||(12730508-12730927)
chr1 (13-432)||(12897810-12898229)
chr1 (13-432)||(21877728-21878147)
chr1 (13-432)||(12741101-12741520)
chr1 (13-432)||(12614143-12614562)
chr1 (13-432)||(12623608-12624027)
chr1 (13-432)||(21863622-21864041)
chr1 (13-432)||(21895163-21895582)
chr1 (13-432)||(33084523-33084942)
chr1 (13-432)||(7507263-7507682)
chr1 (13-432)||(7517860-7518279)
chr1 (13-432)||(39586932-39587349)
chr1 (13-432)||(2538497-2538915)
chr1 (13-432)||(3171583-3172003)
chr1 (13-432)||(3182185-3182605)
chr1 (29-432)||(4177876-4178279)
chr1 (13-421)||(18381730-18382136)
chr1 (13-432)||(51629014-51629433)
chr1 (13-432)||(51656275-51656694)
chr1 (13-432)||(47195224-47195641)
chr1 (13-432)||(19178920-19179340)
chr1 (13-432)||(5833179-5833599)
chr1 (13-432)||(5843781-5844201)
chr1 (13-432)||(10997611-10998030)
chr1 (13-432)||(47607757-47608177)
chr1 (13-432)||(47618365-47618785)
chr1 (13-432)||(38095037-38095457)
chr1 (13-432)||(38105662-38106082)
chr1 (30-432)||(35648534-35648937)
chr1 (13-432)||(36236257-36236675)
chr1 (13-432)||(36246804-36247222)
chr1 (30-432)||(35401008-35401411)
chr1 (30-432)||(35404235-35404638)
chr1 (49-432)||(19187799-19188183)
chr1 (30-432)||(35637882-35638285)
chr1 (13-423)||(11194897-11195302)
chr1 (13-432)||(9050314-9050731)
chr1 (31-423)||(17957212-17957601)
chr1 (13-423)||(14387955-14388360)
chr1 (49-423)||(675419-675789)
chr1 (13-423)||(18310801-18311206)
chr1 (14-423)||(41132446-41132849)
chr1 (161-423)||(20195667-20195927)
chr1 (15-290)||(12946818-12947091)
chr1 (13-423)||(46180708-46181113)
chr1 (13-423)||(28474075-28474477)
chr1 (215-423)||(20798912-20799118)
chr1 (215-423)||(20883910-20884116)
chr1 (215-423)||(22610002-22610208)
chr1 (215-423)||(45070681-45070887)
chr1 (13-176)||(30291903-30292065)
chr1 (215-423)||(5929552-5929757)
chr1 (215-423)||(23926906-23927112)
chr1 (215-423)||(19037854-19038061)
chr1 (215-423)||(44200859-44201066)
chr1 (215-423)||(28379843-28380049)
chr1 (215-385)||(52350712-52350881)
chr1 (215-384)||(17370927-17371097)
chr1 (215-385)||(20251659-20251828)
chr1 (216-384)||(19170360-19170529)
chr1 (215-394)||(22019211-22019391)
chr1 (215-384)||(22655362-22655532)
chr1 (215-282)||(23064935-23065003)
chr1 (215-384)||(21543914-21544084)
chr1 (215-384)||(22642780-22642950)
chr1 (13-81)||(20883711-20883777)
chr1 (215-384)||(26548282-26548452)
chr1 (231-301)||(1900311-1900383)
chr1 (231-283)||(21204965-21205017)
chr1 (231-301)||(25448608-25448680)
chr1 (231-301)||(36134156-36134228)
chr1 (231-300)||(37642215-37642286)
chr1 (231-284)||(2327482-2327536)
chr1 (231-284)||(22153841-22153895)
chr1 (231-284)||(35040150-35040204)
chr1 (231-264)||(14263493-14263526)
chr1 (231-264)||(39201034-39201067)
chr1 (231-263)||(21191907-21191939)
chr1 (231-301)||(21702780-21702852)
chr1 (231-301)||(22427399-22427471)
chr1 (231-301)||(48570273-48570345)
chr1 (231-304)||(7745132-7745207)
chr1 (14-76)||(45070484-45070543)
chr1 (231-284)||(2268515-2268569)
chr1 (231-284)||(22600224-22600278)
chr1 (231-264)||(2267094-2267127)
chr1 (231-284)||(7309804-7309857)
chr1 (231-264)||(18896639-18896672)
chr1 (13-42)||(19188171-19188200)
chr1 (221-262)||(23054373-23054414)
chr1 (231-264)||(30572202-30572235)
chr1 (231-264)||(35401814-35401847)
chr1 (231-264)||(46088994-46089027)
chr1 (13-45)||(675807-675839)
chr1 (231-263)||(12613856-12613888)
chr1 (231-301)||(16235338-16235410)
chr1 (231-267)||(17025006-17025042)
chr1 (231-301)||(19215578-19215650)
chr1 (231-301)||(21135202-21135274)
chr1 (231-301)||(22464851-22464923)
chr1 (231-301)||(33256393-33256465)
chr1 (231-301)||(33276565-33276637)
[»] chr8 (111 HSPs)
chr8 (13-432)||(19224979-19225396)
chr8 (17-432)||(30314518-30314931)
chr8 (13-432)||(19418397-19418814)
chr8 (13-432)||(20161047-20161464)
chr8 (13-432)||(20196003-20196420)
chr8 (13-432)||(19428972-19429391)
chr8 (13-423)||(23457121-23457530)
chr8 (13-423)||(31215069-31215477)
chr8 (13-432)||(23469277-23469696)
chr8 (13-432)||(16747047-16747463)
chr8 (13-423)||(18768955-18769363)
chr8 (29-432)||(6318351-6318752)
chr8 (13-432)||(3220676-3221095)
chr8 (13-432)||(18153782-18154199)
chr8 (13-432)||(19139324-19139743)
chr8 (13-432)||(18158301-18158718)
chr8 (13-432)||(36077979-36078399)
chr8 (13-432)||(36088565-36088985)
chr8 (13-432)||(36292963-36293382)
chr8 (13-432)||(36303566-36303985)
chr8 (13-432)||(9856289-9856708)
chr8 (13-432)||(6151114-6151534)
chr8 (13-432)||(26111275-26111695)
chr8 (13-432)||(26120953-26121373)
chr8 (13-432)||(209971-210389)
chr8 (13-432)||(252453-252871)
chr8 (13-432)||(723594-724012)
chr8 (13-432)||(848785-849203)
chr8 (13-432)||(15791116-15791535)
chr8 (13-432)||(6161069-6161488)
chr8 (13-432)||(9368332-9368751)
chr8 (13-432)||(18449414-18449833)
chr8 (13-377)||(1750193-1750558)
chr8 (13-432)||(241868-242286)
chr8 (13-432)||(3348444-3348863)
chr8 (13-432)||(3359041-3359460)
chr8 (13-432)||(9341188-9341607)
chr8 (13-432)||(15780527-15780946)
chr8 (13-432)||(29076775-29077193)
chr8 (13-432)||(29087026-29087444)
chr8 (13-432)||(32088087-32088505)
chr8 (13-432)||(32077514-32077932)
chr8 (13-432)||(43248370-43248780)
chr8 (30-432)||(13688401-13688804)
chr8 (96-432)||(19128792-19129129)
chr8 (171-418)||(30325227-30325473)
chr8 (13-432)||(44481135-44481549)
chr8 (13-432)||(44491751-44492165)
chr8 (31-432)||(40213006-40213404)
chr8 (49-384)||(6576373-6576708)
chr8 (13-423)||(3843578-3843982)
chr8 (13-423)||(20259438-20259842)
chr8 (13-423)||(21046068-21046472)
chr8 (9-188)||(28691189-28691366)
chr8 (12-423)||(23370609-23371008)
chr8 (254-432)||(795223-795401)
chr8 (215-423)||(7018400-7018606)
chr8 (215-423)||(22135877-22136083)
chr8 (215-423)||(22167042-22167248)
chr8 (215-423)||(22211407-22211614)
chr8 (13-134)||(30325111-30325231)
chr8 (215-423)||(23271223-23271430)
chr8 (13-163)||(16436878-16437026)
chr8 (215-394)||(28903328-28903507)
chr8 (49-304)||(19461120-19461375)
chr8 (49-304)||(19558798-19559053)
chr8 (215-423)||(8031874-8032081)
chr8 (215-384)||(40003107-40003277)
chr8 (215-394)||(17519161-17519341)
chr8 (13-83)||(795586-795656)
chr8 (218-384)||(21540830-21540997)
chr8 (231-412)||(15425273-15425453)
chr8 (231-284)||(9320546-9320599)
chr8 (13-81)||(22135679-22135745)
chr8 (231-301)||(15336208-15336280)
chr8 (231-301)||(15516577-15516649)
chr8 (215-304)||(29379534-29379626)
chr8 (30-132)||(13596380-13596481)
chr8 (13-81)||(22211208-22211274)
chr8 (13-81)||(23783708-23783773)
chr8 (231-301)||(13430748-13430820)
chr8 (13-61)||(19129145-19129193)
chr8 (226-266)||(26833032-26833072)
chr8 (231-301)||(45538559-45538631)
chr8 (231-384)||(45568021-45568174)
chr8 (231-265)||(19943232-19943266)
chr8 (231-264)||(17797420-17797453)
chr8 (231-301)||(1237596-1237668)
chr8 (231-301)||(21932842-21932914)
chr8 (231-301)||(36105154-36105226)
chr8 (231-266)||(18685517-18685552)
chr8 (231-266)||(18722766-18722801)
chr8 (231-266)||(18731111-18731146)
chr8 (231-301)||(24833177-24833248)
chr8 (231-284)||(6407703-6407757)
chr8 (49-107)||(7018236-7018294)
chr8 (231-284)||(16207283-16207337)
chr8 (231-284)||(23185346-23185400)
chr8 (231-301)||(43639741-43639814)
chr8 (234-301)||(14989574-14989643)
chr8 (13-46)||(22166828-22166861)
chr8 (13-81)||(22166845-22166910)
chr8 (13-46)||(23783757-23783790)
chr8 (231-264)||(24551272-24551305)
chr8 (231-264)||(30421549-30421582)
chr8 (231-264)||(40845507-40845540)
chr8 (226-258)||(17687986-17688018)
chr8 (226-266)||(18772616-18772656)
chr8 (234-301)||(19956464-19956532)
chr8 (231-301)||(39693494-39693566)
chr8 (231-263)||(43644895-43644927)
[»] chr2 (105 HSPs)
chr2 (13-432)||(18768709-18769125)
chr2 (13-432)||(21172269-21172686)
chr2 (13-432)||(28721119-28721536)
chr2 (13-432)||(28731707-28732122)
chr2 (15-432)||(2561498-2561913)
chr2 (13-432)||(24414825-24415241)
chr2 (13-432)||(7005609-7006028)
chr2 (13-432)||(17857239-17857658)
chr2 (9-432)||(29244229-29244652)
chr2 (9-432)||(29254808-29255231)
chr2 (13-432)||(26867081-26867498)
chr2 (13-432)||(9897376-9897795)
chr2 (13-432)||(9907964-9908383)
chr2 (13-432)||(24327536-24327955)
chr2 (13-432)||(10267001-10267420)
chr2 (13-432)||(10277578-10277997)
chr2 (13-432)||(22914666-22915085)
chr2 (13-432)||(34790019-34790438)
chr2 (13-432)||(40222340-40222759)
chr2 (13-432)||(40251201-40251620)
chr2 (13-432)||(9773108-9773527)
chr2 (13-432)||(22960134-22960553)
chr2 (13-432)||(24338206-24338625)
chr2 (13-432)||(34804162-34804581)
chr2 (13-432)||(43093263-43093683)
chr2 (13-432)||(1098997-1099416)
chr2 (13-432)||(9762572-9762991)
chr2 (13-432)||(11388611-11389030)
chr2 (13-432)||(21650334-21650752)
chr2 (13-432)||(30488625-30489045)
chr2 (29-432)||(36251662-36252065)
chr2 (13-432)||(43355030-43355448)
chr2 (14-432)||(27978187-27978601)
chr2 (14-432)||(28064716-28065130)
chr2 (13-432)||(43082654-43083074)
chr2 (13-432)||(4209898-4210317)
chr2 (13-432)||(4220490-4220909)
chr2 (13-432)||(11394974-11395393)
chr2 (13-432)||(11405290-11405709)
chr2 (13-432)||(32217881-32218300)
chr2 (13-432)||(34477936-34478354)
chr2 (13-432)||(39169897-39170316)
chr2 (13-432)||(43345415-43345833)
chr2 (13-432)||(26879670-26880087)
chr2 (30-432)||(27221388-27221791)
chr2 (13-432)||(38585890-38586306)
chr2 (30-432)||(35252989-35253392)
chr2 (30-432)||(35263598-35264001)
chr2 (30-432)||(35274223-35274626)
chr2 (30-432)||(18392456-18392858)
chr2 (13-404)||(4099819-4100210)
chr2 (13-295)||(24425354-24425635)
chr2 (50-423)||(36784644-36785008)
chr2 (14-423)||(967309-967712)
chr2 (17-291)||(28374320-28374595)
chr2 (13-423)||(24275045-24275448)
chr2 (185-432)||(16768950-16769198)
chr2 (13-423)||(22774378-22774784)
chr2 (13-423)||(19497795-19498200)
chr2 (13-423)||(22763674-22764080)
chr2 (148-423)||(17969146-17969418)
chr2 (13-367)||(22779811-22780162)
chr2 (13-397)||(19312822-19313201)
chr2 (160-397)||(19299959-19300194)
chr2 (291-423)||(24427667-24427797)
chr2 (215-423)||(20646610-20646816)
chr2 (13-176)||(16777118-16777280)
chr2 (215-423)||(19356339-19356545)
chr2 (17-164)||(28379659-28379806)
chr2 (13-120)||(20236714-20236820)
chr2 (218-384)||(1083894-1084061)
chr2 (215-384)||(24814633-24814803)
chr2 (215-423)||(22755310-22755516)
chr2 (13-89)||(20070683-20070759)
chr2 (231-301)||(31328033-31328104)
chr2 (231-301)||(31334754-31334825)
chr2 (13-81)||(19356679-19356745)
chr2 (13-144)||(6081471-6081600)
chr2 (231-301)||(30557388-30557459)
chr2 (231-284)||(22802440-22802493)
chr2 (231-301)||(1587100-1587171)
chr2 (215-260)||(21025530-21025575)
chr2 (238-284)||(6392613-6392659)
chr2 (13-59)||(20417464-20417509)
chr2 (226-264)||(20568135-20568173)
chr2 (231-264)||(6574191-6574224)
chr2 (231-264)||(28711765-28711798)
chr2 (49-81)||(20646446-20646478)
chr2 (231-301)||(28550985-28551057)
chr2 (231-301)||(31800954-31801026)
chr2 (231-301)||(33074187-33074259)
chr2 (13-65)||(38208116-38208168)
chr2 (231-301)||(39037709-39037781)
chr2 (231-266)||(26619168-26619203)
chr2 (234-299)||(41121789-41121856)
chr2 (231-284)||(28701296-28701350)
chr2 (231-284)||(31968110-31968164)
chr2 (221-258)||(24440789-24440826)
chr2 (231-264)||(44840434-44840467)
chr2 (13-45)||(17968995-17969027)
chr2 (231-301)||(22188169-22188241)
chr2 (231-301)||(22776355-22776427)
chr2 (231-301)||(22781733-22781805)
chr2 (231-301)||(24377062-24377134)
chr2 (231-301)||(24575996-24576068)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (13-422)||(2824-3232)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (13-432)||(42344-42761)
scaffold0133 (13-432)||(31146-31565)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (15-432)||(6711-7127)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (9-432)||(53943-54364)
scaffold0028 (13-432)||(14598-15017)
scaffold0028 (231-284)||(5674-5728)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (13-432)||(32727-33143)
scaffold0047 (13-432)||(40276-40695)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (13-422)||(2043-2449)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (13-423)||(7577-7986)
scaffold0068 (29-423)||(10440-10833)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (13-384)||(2-372)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (13-432)||(6665-7084)
[»] scaffold0002 (5 HSPs)
scaffold0002 (14-398)||(117148-117530)
scaffold0002 (215-394)||(475305-475485)
scaffold0002 (215-394)||(481825-482005)
scaffold0002 (215-384)||(156681-156851)
scaffold0002 (13-59)||(347470-347515)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (13-395)||(6043-6423)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (13-432)||(12370-12789)
[»] scaffold0272 (2 HSPs)
scaffold0272 (13-421)||(13430-13836)
scaffold0272 (13-84)||(13125-13195)
[»] scaffold0105 (3 HSPs)
scaffold0105 (13-432)||(7975-8395)
scaffold0105 (13-432)||(36780-37200)
scaffold0105 (13-383)||(47414-47785)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (13-432)||(19256-19688)
scaffold0099 (13-423)||(16742-17179)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (13-423)||(11941-12347)
scaffold0407 (14-337)||(15773-16092)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (13-432)||(36558-36975)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (14-421)||(51927-52336)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (16-306)||(7889-8179)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (13-423)||(5321-5726)
scaffold0042 (13-241)||(12896-13121)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (14-423)||(10114-10518)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (13-423)||(56606-57012)
scaffold0084 (231-263)||(417-449)
scaffold0084 (231-301)||(32452-32524)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (13-423)||(35563-35967)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (13-423)||(175350-175755)
scaffold0017 (13-259)||(180424-180667)
scaffold0017 (215-423)||(40369-40576)
scaffold0017 (215-423)||(58915-59122)
scaffold0017 (29-106)||(58734-58808)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (13-423)||(127672-128076)
scaffold0012 (13-423)||(140830-141235)
scaffold0012 (215-423)||(7674-7881)
scaffold0012 (231-301)||(215569-215641)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (13-264)||(34982-35232)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (14-423)||(12651-13055)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (12-301)||(7375-7662)
scaffold0201 (13-76)||(7060-7122)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (13-190)||(26995-27171)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (200-398)||(40552-40749)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (63-284)||(1533-1755)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (13-423)||(2020-2424)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (148-420)||(15758-16027)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (13-423)||(1846-2250)
scaffold0752 (215-423)||(1231-1437)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (13-143)||(53339-53468)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (13-259)||(4321-4568)
[»] scaffold0414 (2 HSPs)
scaffold0414 (13-184)||(2550-2720)
scaffold0414 (231-264)||(7228-7261)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (215-423)||(28820-29027)
scaffold0001 (13-89)||(408032-408108)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (215-398)||(29524-29707)
scaffold0163 (13-81)||(29840-29906)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (215-423)||(58327-58533)
scaffold0073 (13-105)||(58642-58732)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (13-259)||(6037-6278)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (29-423)||(672-1060)
scaffold0090 (29-423)||(5052-5440)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (17-176)||(19045-19204)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (14-181)||(2258-2424)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (215-423)||(59316-59521)
scaffold0007 (13-81)||(59117-59183)
scaffold0007 (224-257)||(143110-143143)
[»] scaffold0547 (2 HSPs)
scaffold0547 (215-421)||(746-950)
scaffold0547 (13-81)||(1084-1149)
[»] scaffold0314 (1 HSPs)
scaffold0314 (13-117)||(20597-20700)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (215-394)||(61098-61276)
scaffold0005 (231-301)||(212321-212393)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (215-423)||(17861-18069)
scaffold0280 (231-301)||(2802-2874)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (13-132)||(19616-19734)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (215-384)||(20432-20601)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (314-423)||(38120-38228)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (13-184)||(8-176)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (215-384)||(11647-11816)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (13-184)||(15129-15297)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (13-183)||(69860-70027)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (215-423)||(61580-61788)
[»] scaffold0655 (2 HSPs)
scaffold0655 (218-373)||(5014-5170)
scaffold0655 (13-59)||(8703-8749)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (215-384)||(6577-6747)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (231-384)||(38157-38309)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (314-423)||(9914-10022)
scaffold0544 (13-81)||(9728-9794)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (215-284)||(1727-1798)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (215-384)||(990-1160)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (215-384)||(1183-1353)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (215-284)||(9281-9352)
scaffold0185 (49-81)||(9483-9515)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (231-304)||(165018-165093)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (231-373)||(7181-7324)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (219-301)||(16922-17007)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (226-266)||(379-419)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (49-260)||(22050-22259)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (231-304)||(15694-15769)
[»] scaffold0774 (2 HSPs)
scaffold0774 (215-253)||(6388-6426)
scaffold0774 (13-81)||(6190-6255)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (226-264)||(31851-31889)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (269-385)||(1116-1230)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (231-301)||(7348-7420)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (231-283)||(893-945)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (231-301)||(9923-9995)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (14-81)||(163490-163554)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (231-373)||(3967-4110)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (231-284)||(9954-10008)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (231-284)||(34876-34930)
scaffold0056 (231-264)||(25737-25770)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (13-59)||(81921-81967)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (231-264)||(727-760)
scaffold1359 (231-264)||(1827-1860)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (231-264)||(27501-27534)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (231-301)||(1771-1843)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (231-301)||(3271-3343)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (231-301)||(14615-14687)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (231-301)||(17837-17909)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (231-301)||(9122-9194)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (231-301)||(21043-21115)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (226-266)||(144909-144949)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (231-263)||(244356-244388)
scaffold0004 (231-301)||(211365-211437)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (231-301)||(90127-90199)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (231-266)||(1321-1356)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (231-266)||(55-90)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (231-266)||(5631-5666)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (231-301)||(7672-7742)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (231-304)||(1869-1944)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (236-301)||(2951-3016)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (231-284)||(15811-15865)
scaffold0247 (231-284)||(25471-25525)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (235-284)||(22661-22711)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (231-284)||(36847-36901)
scaffold0120 (231-284)||(42104-42158)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (357-423)||(16536-16601)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (234-284)||(43994-44044)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (231-284)||(99277-99331)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (231-284)||(37387-37441)
scaffold0022 (231-284)||(135447-135501)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (231-264)||(9912-9945)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (231-264)||(2763-2796)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (231-264)||(9566-9599)
scaffold0217 (231-264)||(19037-19070)
scaffold0217 (231-301)||(22203-22275)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (231-264)||(1666-1699)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (231-264)||(60809-60842)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (226-258)||(948-980)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (233-284)||(5991-6043)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (226-258)||(10474-10506)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (231-263)||(10180-10212)
scaffold0161 (231-263)||(14844-14876)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (231-263)||(40644-40676)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (231-301)||(1657-1729)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (231-263)||(87672-87704)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 182)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 6490132 - 6490551
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6490132 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 6490231  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490232 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 6490331  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6490332 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 6490431  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6490432 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactc 6490530  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6490531 tttagacgtgctgattatctc 6490551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 6500786 - 6501205
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6500786 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatattttcaaactgaagatccaa 6500885  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500886 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 6500985  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6500986 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 6501085  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6501086 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactc 6501184  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6501185 tttagacgtgctgattatctc 6501205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9993677 - 9994094
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  9993677 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatttactcaaactgaagatccaa 9993776  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9993777 agtagctgtttcttatttca-ccttatctaataagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcatttgtcctacgtta 9993875  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9993876 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 9993975  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9993976 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 9994074  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9994075 ttagacgtgctgattatctc 9994094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 432
Target Start/End: Original strand, 12237409 - 12237815
Alignment:
Q  23 cagaaggtcatcagaagca-aagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgt 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12237409 cagaaggtcatcagaagcagaaggt---catcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatagtcaaactgaagatccaaagtagctgt 12237505  T
Q  122 ttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12237506 ttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttg 12237605  T
Q  222 acaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12237606 acaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaatagctatgcctgcagaatatgtgcc-ttcaagat 12237704  T
Q  322 gggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12237705 gggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 12237804  T
Q  422 ctgattatctc 432  Q
    |||||||||||    
T  12237805 ctgattatctc 12237815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 432
Target Start/End: Original strand, 12249235 - 12249641
Alignment:
Q  23 cagaaggtcatcagaagca-aagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgt 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12249235 cagaaggtcatcagaagcagaaggt---catcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatagtcaaactgaagatccaaagtagctgt 12249331  T
Q  122 ttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249332 ttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttg 12249431  T
Q  222 acaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12249432 acaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc-ttcaagat 12249530  T
Q  322 gggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12249531 gggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 12249630  T
Q  422 ctgattatctc 432  Q
    |||||||||||    
T  12249631 ctgattatctc 12249641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9981669 - 9982086
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  9981669 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatttactcaaactgaagatccaa 9981768  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  9981769 agtagctgtttcttatttca-ccttatctaataagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcatctgtcctacgtta 9981867  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9981868 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacatctatgcctgcagaatttgtgcc 9981967  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9981968 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgatcaaaggatttcaaatgactct 9982066  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9982067 ttagacgtgctgattatctc 9982086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23636161 - 23635743
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||    
T  23636161 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcagggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacattcaatccgtatattcaaactgaagatctaa 23636063  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  23636062 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagtactgagcatttgtccttcgtta 23635963  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635962 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 23635863  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23635862 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactc 23635764  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  23635763 tttagacgtgctaattatctc 23635743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 19887138 - 19887555
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19887138 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 19887236  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  19887237 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtacttcgtta 19887336  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887337 acagagttgacaaagcacaagtgtacaaccactaactccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 19887436  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19887437 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaagtagtacacccaaatcaggcaaacgattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 19887535  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  19887536 ttagacgtgctaattatctc 19887555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 24706338 - 24706756
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  24706338 tcattagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaaacgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatcaaa 24706436  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  24706437 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 24706536  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706537 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 24706636  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  24706637 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactc 24706735  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  24706736 tttagacgtgctaattctctc 24706756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 29 - 422
Target Start/End: Original strand, 7804318 - 7804709
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7804318 gtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaatatcatcaccagaagctgcatttaatccataaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 7804416  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7804417 ttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 7804516  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7804517 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaatacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc-ttcaagatgggaatg 7804615  T
Q  329 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgc 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7804616 aatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgc 7804709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 421
Target Start/End: Original strand, 7794391 - 7794797
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7794391 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcaaaagcaatatcatcaccagaagctgcatttaatccataaattcaaactgaagatccaa 7794489  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || || | || ||||||||||    
T  7794490 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttagatagcactaagtatttttccttcgtta 7794589  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7794590 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 7794689  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  7794690 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactct 7794788  T
Q  413 ttagacgtg 421  Q
    |||||||||    
T  7794789 ttagacgtg 7794797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 9 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48337696 - 48337285
Alignment:
Q  9 gacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagat 108  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  48337696 gacatcatcagaagcataagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagat 48337598  T
Q  109 ccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  48337597 ccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcatcggtcatttggacagcactgagtatttgtccttc 48337498  T
Q  209 gttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48337497 gttaacagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 48337398  T
Q  309 tgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacga 408  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||   ||||||    
T  48337397 tgcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattactggtgaatgatcaaaggattctaaacga 48337299  T
Q  409 ctctttagacgtgc 422  Q
    ||||||||||||||    
T  48337298 ctctttagacgtgc 48337285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 29 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9536043 - 9535642
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9536043 gtcatcagaagcaaggatt-tcattagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcat 9535945  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535944 ttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 9535845  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9535844 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccatgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc-ttcaagatgggaatg 9535746  T
Q  329 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatta 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  9535745 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatca 9535646  T
Q  429 tctc 432  Q
    ||||    
T  9535645 tctc 9535642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 17909786 - 17910203
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  17909786 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatctgtaaattcaaactgaagatccaa 17909884  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  17909885 agtagctgtttctcatttcaactttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 17909984  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17909985 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacatctatgcctgcagaatttatgcc 17910084  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17910085 -ttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctaaaaggacaacacccaaatcaggaaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 17910183  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  17910184 ttagacgtgctaatcatctc 17910203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 29460997 - 29461414
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29460997 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaa 29461095  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  29461096 agtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacggagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgtta 29461195  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29461196 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcc 29461295  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29461296 -ttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 29461394  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  29461395 ttagatgtgctaattatctc 29461414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 29471849 - 29472266
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29471849 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaa 29471947  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  29471948 agtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacagagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgtta 29472047  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29472048 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcc 29472147  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29472148 -ttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 29472246  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  29472247 ttagatgtgctaattatctc 29472266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 934078 - 933661
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  934078 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaagattt-tcatcagaagcgatatcaccaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 933980  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||| | |||||||||||||    
T  933979 agtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcttttgaagtgctctgagtatttgtccttcgtta 933880  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933879 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 933780  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  933779 -ttcaagatgggaatgaatttgaaactaattcttcaaaggactacatccaaatcagacaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 933681  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||| |||| || |||||    
T  933680 ttagacatgctaatcatctc 933661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 11216505 - 11216922
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  | |||||||||||||||||||    
T  11216505 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctatatttgatccgcaaattcaaactgaagatccaa 11216603  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |  |||| | |||||||||||||    
T  11216604 agtagttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaatgatcatttgaagtccattgagtatttgtccttcgtta 11216703  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11216704 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 11216803  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  11216804 ctt-caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatctc-aacgactc 11216901  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  11216902 tttagacgtgctaatcatctc 11216922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9390986 - 9391403
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9390986 tcatcagaagcagaaaatcatcagaagcaaagttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 9391084  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  || ||||| | |||||||||||||    
T  9391085 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagcgcactgagtatttgtccttcgtta 9391184  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9391185 acagagttgagaaagtacaaatgtaccaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgttc 9391284  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  9391285 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatctc-aacgactc 9391382  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  9391383 tttagacgtgctaatcatctc 9391403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9380440 - 9380857
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  9380440 tcatcagaagcagaaaatcatcagaagcaaagttt-tcatcagaaccgatatcatcaccagaagctacatttaatctgtaaattcaaactgaagatccaa 9380538  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  || ||||| | |||||||||||||    
T  9380539 agtagctatttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagtcacttgaagcgcactgagtatttgtccttcgtta 9380638  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9380639 acatagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgttc 9380738  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  9380739 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatctc-aacgactc 9380836  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||| |||| || |||||    
T  9380837 tttagacatgctaatcatctc 9380857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 396
Target Start/End: Original strand, 16391398 - 16391780
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16391398 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaa 16391496  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  16391497 agtagctgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcttttggataacactgagcatttgtccttcgtta 16391596  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16391597 acagagttgacaaagtacaagtatacaaccactatctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatgtgtac 16391696  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaag 396  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  16391697 c-ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaatgagtacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaag 16391780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4404723 - 4404316
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  4404723 tcatcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcactagaagctacatttgatccgtaaattcaaactgaagatccaa 4404625  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  4404624 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcgtta 4404525  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |    
T  4404524 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttc 4404426  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||| ||||    
T  4404425 c-ttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacaactc 4404328  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  4404327 tttagacgtgct 4404316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4457366 - 4456959
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||    
T  4457366 tcatcagaagcagaaggtcgtcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttgatctgtaaattcaaactgaagatccaa 4457268  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  4457267 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaaaaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcgtta 4457168  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |    
T  4457167 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttc 4457069  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||| ||||    
T  4457068 c-ttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacaactc 4456971  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  4456970 tttagacgtgct 4456959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 6220485 - 6220904
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  6220485 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 6220583  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  6220584 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 6220683  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  6220684 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 6220782  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6220783 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 6220882  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6220883 ctttagacgtgctgattatctc 6220904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 13383047 - 13383466
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  13383047 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 13383145  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  13383146 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctttcgtta 13383245  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  13383246 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 13383344  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  13383345 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 13383444  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13383445 ctttagacgtgctgattatctc 13383466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 13372453 - 13372872
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  13372453 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 13372551  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  13372552 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctttcgtta 13372651  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  13372652 ataaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 13372750  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  13372751 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 13372850  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13372851 ctttagacgtgctgattatctc 13372872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 13393641 - 13394060
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  13393641 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgttttatcctttaat-caaactgaagattcaa 13393739  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  13393740 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 13393839  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  13393840 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 13393938  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  13393939 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 13394038  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13394039 ctttagacgtgctgattatctc 13394060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 20683564 - 20683983
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  20683564 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 20683662  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  20683663 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 20683762  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  20683763 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 20683862  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  20683863 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 20683961  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20683962 ctttagacgtgctgattatctc 20683983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37760122 - 37759703
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  37760122 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 37760024  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  37760023 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 37759924  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  37759923 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 37759824  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  37759823 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 37759725  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37759724 ctttagacgtgctgattatctc 37759703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23768343 - 23767927
Alignment:
Q  16 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| ||||||    
T  23768343 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagt 23768245  T
Q  116 agctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaaca 215  Q
    ||||  |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||| |    
T  23768244 agctaattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaata 23768145  T
Q  216 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |      
T  23768144 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacac 23768045  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23768044 t-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 23767946  T
Q  414 tagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23767945 tagacgtgctgattatctc 23767927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 6180311 - 6180730
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  6180311 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 6180409  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  6180410 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 6180509  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||     
T  6180510 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcataatttgt- 6180608  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6180609 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcattggtggataatcaaaggatttcaaacgact 6180708  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6180709 ctttagacgtgctgattatctc 6180730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19778837 - 19778418
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  19778837 tcatcagaagcataaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 19778739  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| ||| || ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  19778738 agtagctgattcccaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 19778639  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  19778638 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 19778540  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  19778539 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgttggataatcaaaggatttcaaacgact 19778440  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19778439 ctttagacgtgctgattatctc 19778418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19789474 - 19789055
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  19789474 tcatcagaagcataaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 19789376  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  19789375 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 19789276  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  19789275 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 19789177  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  19789176 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgttggataatcaaaggatttcaaacgact 19789077  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  19789076 ctttagacgtgttgattatctc 19789055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 20672979 - 20673398
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  20672979 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 20673077  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  20673078 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 20673177  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  20673178 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 20673276  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  20673277 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 20673376  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20673377 ctttagacgtgctgattatctc 20673398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23648200 - 23647781
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  23648200 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 23648102  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  23648101 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 23648002  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  23648001 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 23647903  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  23647902 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaatgactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 23647803  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23647802 ctttagacgtgctgattatctc 23647781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23757750 - 23757331
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  23757750 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 23757652  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||  |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  23757651 agtagctaattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 23757552  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  23757551 atagatttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 23757452  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  23757451 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 23757353  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23757352 ctttagacgtgctgattatctc 23757331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 41684130 - 41683711
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  41684130 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 41684032  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  41684031 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 41683932  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  41683931 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 41683833  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  41683832 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 41683733  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41683732 ctttagacgtgctgattatctc 41683711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 41694699 - 41694280
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  41694699 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 41694601  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  41694600 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 41694501  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  41694500 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 41694402  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  41694401 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 41694302  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41694301 ctttagacgtgctgattatctc 41694280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 4174539 - 4174959
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaa-gtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| ||    
T  4174539 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattca 4174637  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  4174638 aagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtt 4174737  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4174738 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgt 4174837  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  4174838 -acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 4174936  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4174937 tctttagacgtgctgattatctc 4174959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 503951 - 504370
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  503951 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 504049  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  || |||    
T  504050 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcatta 504149  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  504150 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 504249  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  504250 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 504348  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  504349 ctttagacgtgctgattatctc 504370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 12286762 - 12287181
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  12286762 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 12286860  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| |||| |  |||||  ||||||    
T  12286861 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaactcttgtctctcgtta 12286960  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  12286961 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 12287060  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  12287061 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 12287159  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12287160 ctttagacgtgctgattatctc 12287181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24660352 - 24659933
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  24660352 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 24660254  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||  |||||  ||||||    
T  24660253 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagctctgagctcttgtctctcgtta 24660154  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  24660153 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 24660054  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24660053 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24659955  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24659954 ctttagacgtgctgattatctc 24659933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 39672666 - 39673085
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  39672666 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 39672764  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  39672765 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 39672864  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  39672865 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgt- 39672963  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
       |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  39672964 atgttcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 39673063  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39673064 ctttagacgtgctgattatctc 39673085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5511147 - 5510729
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  5511147 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 5511049  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  5511048 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 5510949  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  5510948 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 5510851  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5510850 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 5510751  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5510750 ctttagacgtgctgattatctc 5510729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 5579417 - 5579836
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  5579417 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 5579515  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  5579516 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 5579615  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  5579616 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 5579715  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5579716 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 5579814  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5579815 ctttagacgtgctgattatctc 5579836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 5627801 - 5628220
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  5627801 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 5627899  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  5627900 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 5627999  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  5628000 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 5628099  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5628100 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 5628198  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5628199 ctttagacgtgctgattatctc 5628220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 12296584 - 12297003
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  12296584 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 12296682  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| |||| |  |||||  ||||||    
T  12296683 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaactcttgtctctcgtta 12296782  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  12296783 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 12296881  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  12296882 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgcct 12296981  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12296982 ctttagacgtgctgattatctc 12297003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13122114 - 13121695
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  13122114 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaa 13122016  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  13122015 agtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 13121916  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  13121915 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 13121817  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  13121816 tcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 13121717  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  13121716 ccttagacgtgctgattatctc 13121695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13132357 - 13131938
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  13132357 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaa 13132259  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  13132258 agtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 13132159  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  13132158 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 13132060  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  13132059 tcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 13131960  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  13131959 ccttagacgtgctgattatctc 13131938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13558026 - 13557607
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  13558026 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttaatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 13557928  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| | ||||| |||||  ||||||    
T  13557927 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcacggagcacttgtctctcgtta 13557828  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||     
T  13557827 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcatgcagaatttgta 13557728  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  13557727 cgtt-caagatgggaatgagtttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 13557629  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13557628 ctttagacgtgctgattatctc 13557607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14466043 - 14465624
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  14466043 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaa 14465945  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  14465944 agtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 14465845  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  14465844 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 14465746  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  14465745 tcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 14465646  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  14465645 ccttagacgtgctgattatctc 14465624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18484497 - 18484077
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  18484497 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 18484399  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  18484398 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatta 18484299  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  18484298 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 18484199  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  18484198 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 18484099  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18484098 ctttagacgtgctgattatctc 18484077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20721565 - 20721146
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  20721565 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 20721467  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  20721466 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 20721367  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  20721366 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 20721267  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  20721266 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 20721168  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20721167 ctttagacgtgctgattatctc 20721146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24670932 - 24670513
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  24670932 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 24670834  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||  |||||  ||||||    
T  24670833 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagctctgagctcttgtctctcgtta 24670734  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||     
T  24670733 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgta 24670634  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24670633 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24670535  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24670534 ctttagacgtgctgattatctc 24670513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37866897 - 37866478
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  37866897 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 37866799  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  37866798 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 37866699  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  37866698 atagtgttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcaactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgt- 37866600  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  37866599 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcgggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 37866500  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37866499 ctttagacgtgctgattatctc 37866478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4744189 - 4743771
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  4744189 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 4744091  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  4744090 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 4743991  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  4743990 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 4743893  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  4743892 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 4743793  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4743792 ctttagacgtgctgattatctc 4743771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5521325 - 5520907
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  5521325 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagtaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 5521227  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  5521226 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 5521127  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  5521126 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 5521029  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5521028 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 5520929  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5520928 ctttagacgtgctgattatctc 5520907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 5536805 - 5537223
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  5536805 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 5536903  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  5536904 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 5537003  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  5537004 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 5537101  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5537102 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 5537201  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5537202 ctttagacgtgctgattatctc 5537223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 66 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11164228 - 11163872
Alignment:
Q  66 atcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaaggg 165  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  11164228 atcaccggaagctacatttgatccgcaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaaaaattgaaaggg 11164129  T
Q  166 aggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt-tt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| |  || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11164128 aggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttctt 11164029  T
Q  265 gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11164028 gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctacagaatttttgcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 11163930  T
Q  365 tcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  11163929 ttaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct 11163872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 24383302 - 24383721
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  24383302 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 24383400  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  24383401 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 24383500  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  24383501 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 24383600  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24383601 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24383699  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24383700 ctttagacgtgctgattatctc 24383721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 28314015 - 28314434
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  28314015 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 28314113  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||    
T  28314114 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcatta 28314213  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  28314214 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 28314313  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  28314314 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 28314412  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28314413 ctttagacgtgctgattatctc 28314434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35187829 - 35187410
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  35187829 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 35187731  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  35187730 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 35187631  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  35187630 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 35187531  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  35187530 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 35187432  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35187431 ctttagacgtgctgattatctc 35187410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Original strand, 526334 - 526736
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  526334 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagtagctgattctcaat 526432  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  526433 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagta 526532  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  526533 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt-acactcaagatgggaat 526631  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  526632 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 526731  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  526732 atctc 526736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 29 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28169516 - 28169116
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28169516 gtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaaggtacaattaatcagtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgt 28169418  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28169417 ttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtcctgcgttaatagagttgacaaagt 28169318  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  28169317 acaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-ttgttcc-ttcaagatgggaat 28169220  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||     
T  28169219 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaatgattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatc 28169121  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  28169120 atctc 28169116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14476675 - 14476259
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  14476675 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaa 14476577  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  14476576 agtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 14476477  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  14476476 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacactacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 14476378  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  14476377 tcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 14476278  T
Q  411 ctttagacgtgctgattat 429  Q
    | |||||||||||||||||    
T  14476277 ccttagacgtgctgattat 14476259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 5547389 - 5547807
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  5547389 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 5547487  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  5547488 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 5547587  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||     
T  5547588 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctacagaa-ttgt- 5547685  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5547686 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 5547785  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5547786 ctttagacgtgctgattatctc 5547807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8775110 - 8774690
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  8775110 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 8775012  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || || | ||| ||||||| |||||  || |||    
T  8775011 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatgaaaagcactgagcacttgtctctcatta 8774912  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  8774911 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgta 8774812  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  8774811 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 8774712  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8774711 ctttagacgtgctgattatctc 8774690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8785695 - 8785275
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  8785695 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 8785597  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || || | ||| ||||||| |||||  || |||    
T  8785596 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatgaaaagcactgagcacttgtctctcatta 8785497  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  8785496 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgta 8785397  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  8785396 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 8785297  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8785296 ctttagacgtgctgattatctc 8785275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 28324631 - 28325050
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  28324631 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 28324729  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||    
T  28324730 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcatta 28324829  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  28324830 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 28324929  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  28324930 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 28325028  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  28325029 ctttaaacgtgctgattatctc 28325050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 29 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37886014 - 37885611
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  37886014 gtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagtagctgattctcaa 37885916  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  37885915 ttcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagt 37885816  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaa 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  37885815 acaagtgtacaaccactacttccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgt-acgttcaagatgggaa 37885717  T
Q  327 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgat 426  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37885716 tgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgat 37885617  T
Q  427 tatctc 432  Q
    ||||||    
T  37885616 tatctc 37885611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 1783854 - 1784272
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||| |||| |||    
T  1783854 tcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaa 1783952  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |   || || | |||||||||||||    
T  1783953 agtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgtta 1784052  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg--ttttgtccacgctacaagacaagaca-acagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  |||    
T  1784053 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtccacgctacaagacaagaaacacagccatgcctgcagaa-atgt 1784151  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  || ||||||    
T  1784152 tcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgac 1784249  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  1784250 tctttagacgtgctaatcatctc 1784272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 1794266 - 1794684
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||| |||| |||    
T  1794266 tcatcagaagcagatggtcatcagaaacaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaa 1794364  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |   || || | |||||||||||||    
T  1794365 agtagttgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacgatcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgtta 1794464  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg--ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||    
T  1794465 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaa-atgt 1794563  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  || ||||||    
T  1794564 tcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgac 1794661  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  1794662 tctttagacgtgctaatcatctc 1794684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 10626724 - 10627143
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatat--catcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |    
T  10626724 tcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaaaataccttcaccagaagctacatttgatcccttaat-caaactgaagattc 10626821  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| |||||     |    
T  10626822 aaagtagctgtctctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatatcactgagcacttgtctcctat 10626921  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||     
T  10626922 taacagagttgacatagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagattctgc 10627021  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10627022 gcctt-caagatgggaatgaatttgaagattattattcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgac 10627120  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10627121 tctttagacgtgctgattatctc 10627143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 18851475 - 18851892
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatag-attcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| |||  ||  |||||| |||||||| ||    
T  18851475 tcatcagaagcagaagctcatcagaaataagattt-tcatcaaaagcgaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaatattcaatctgaagattca 18851573  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| |  |||||||||||    
T  18851574 aagtagctatttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaaacactgagtaaatgtccttcgtt 18851673  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  18851674 aacagagttgacaaagtacaagtatacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgca-aaattgtt 18851772  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  18851773 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctttaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 18851870  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  18851871 ctttagacgtgctaatcatctc 18851892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38195160 - 38194757
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  38195160 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 38195062  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  38195061 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagta 38194962  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  38194961 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 38194862  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38194861 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 38194762  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  38194761 atctc 38194757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38205696 - 38205293
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  38205696 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 38205598  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  38205597 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagta 38205498  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  38205497 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 38205398  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38205397 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 38205298  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  38205297 atctc 38205293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 5865479 - 5865896
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagca--aagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |    
T  5865479 tcatcagaagcagaacgtcatcagaagcagaaagt----catcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattc 5865573  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||    
T  5865574 aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgt 5865673  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5865674 taatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttg 5865773  T
Q  309 tgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacga 408  Q
    | |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  5865774 tacact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacga 5865872  T
Q  409 ctctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5865873 ctctttagacgtgctgattatctc 5865896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 5876078 - 5876495
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagca--aagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |    
T  5876078 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagt----catcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattc 5876172  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||    
T  5876173 aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgt 5876272  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5876273 taatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttg 5876372  T
Q  309 tgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacga 408  Q
    | |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  5876373 tacact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacga 5876471  T
Q  409 ctctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5876472 ctctttagacgtgctgattatctc 5876495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4754774 - 4754361
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  4754774 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 4754676  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  4754675 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 4754576  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  4754575 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 4754478  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  4754477 acactcaagatgggaatgaatttgaag-ttatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 4754379  T
Q  411 ctttagacgtgctgatta 428  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4754378 ctttagacgtgctgatta 4754361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39383126 - 39382723
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  39383126 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 39383028  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  39383027 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 39382928  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  39382927 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 39382828  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39382827 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 39382728  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  39382727 atctc 39382723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38315131 - 38314733
Alignment:
Q  32 atcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttc 131  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  38315131 atcagaagcaaggttt-tcatcagaagttaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatccaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttc 38315033  T
Q  132 aaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtaca 231  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38315032 aaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacactaagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtaca 38314933  T
Q  232 agtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatga 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  38314932 agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaa-atgttcc-ttcaagatgggaatga 38314835  T
Q  330 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattat 429  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||    
T  38314834 atttgaagctgtttcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcat 38314736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Original strand, 11272183 - 11272586
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  11272183 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 11272281  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  11272282 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 11272381  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  11272382 caagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 11272481  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11272482 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 11272581  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  11272582 atctc 11272586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39372489 - 39372086
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  39372489 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 39372391  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || | |||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  39372390 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatagataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 39372291  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  39372290 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 39372191  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39372190 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 39372091  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  39372090 atctc 39372086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 61 - 432
Target Start/End: Original strand, 10655095 - 10655465
Alignment:
Q  61 atatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattga 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||    
T  10655095 atatcttcaccagaagctacatttgatcccttaat-caaactgaagattcaaagtagctgtctctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattga 10655193  T
Q  161 aagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 260  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| |||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10655194 aagggaggtatcaacggtcatatggatatcactgagcacttgtctcctattaacagagttgacatagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 10655293  T
Q  261 -ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacac 359  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10655294 cttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagattttgcgcctt-caagatgggaatgaatttgaagattattcttcaaaggactacac 10655392  T
Q  360 ccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10655393 ccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttcgacgtgctgattatctc 10655465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27883831 - 27883427
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  27883831 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 27883734  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    | |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||     
T  27883733 ggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgacagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 27883635  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  27883634 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 27883536  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  27883535 -ttcaagatgggaatgaatttgaaattgattcttcaaaggactacactcaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 27883438  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  27883437 ttagacgtgct 27883427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 1064586 - 1064182
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  1064586 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 1064489  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    | |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||  | | |||||||||||||     
T  1064488 ggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaagagcactaggtatttgtccttcgttat 1064390  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||    
T  1064389 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaaat-gttcc 1064291  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  1064290 tt-caagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 1064193  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  1064192 ttagacgtgct 1064182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16077378 - 16076973
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || |||  |||||||||| |||    
T  16077378 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaaatgatcagtaaattttaactgaagattcaa 16077281  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||||| | |||||||||||||    
T  16077280 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtccttcgtta 16077182  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |    
T  16077181 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagca-atgttc 16077083  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |  || ||||||||    
T  16077082 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagaaactc-aacgactc 16076985  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  16076984 tttagacgtgct 16076973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 1054162 - 1053753
Alignment:
Q  9 gacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagat 108  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| |||||||||||    
T  1054162 gacatcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttct-at-agaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagat 1054065  T
Q  109 ccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttc 208  Q
     ||||| |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| ||  | | |||||||||    
T  1054064 tcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggagatatcaacggtcatttgaagagcactaggtacttgtccttc 1053966  T
Q  209 gttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaattt 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |     
T  1053965 gttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgtagaaat- 1053867  T
Q  308 gtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacg 407  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||    
T  1053866 gttcctt-caagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacg 1053769  T
Q  408 actctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||||    
T  1053768 actctttagacgtgct 1053753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 98 - 397
Target Start/End: Original strand, 13261541 - 13261839
Alignment:
Q  98 aaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagc 197  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | |||||     
T  13261541 aaactgaagatttaaagtagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagt 13261640  T
Q  198 agttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 296  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13261641 acttgtcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgc 13261740  T
Q  297 ctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaag 396  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  13261741 ctgcagaa-ttgttcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaag 13261838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 423
Target Start/End: Original strand, 8995741 - 8996147
Alignment:
Q  12 atcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||  | | |  |  ||| ||||||||||| ||    
T  8995741 atcatcagaagcagaagaccatcataagcacaatttc--atcagaagctatatcatcaccataagcttcaagtgaacagttaatttaaactgaagattca 8995838  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||| |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||| | ||||||||| ||    
T  8995839 aagaagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattttaaaagcactgagtatttgtccttcatt 8995937  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||     
T  8995938 atcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgtt 8996036  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  8996037 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagtcgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 8996134  T
Q  411 ctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||    
T  8996135 ctttagacgtgct 8996147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10099521 - 10099101
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctata-tcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaaga-tcc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||| | | |   ||||||||||||||||| |||  |  || ||||||||| | | |    
T  10099521 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagatttcatcagaagcaaaagttggcaccagaagctacatttgatcttttaat-caaactgaaaaattc 10099423  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    |||||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| ||| |  || |    
T  10099422 aaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgcctctcat 10099323  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 308  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  10099322 taatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttg 10099224  T
Q  309 tgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacga 408  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  10099223 t-acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaaggatttcaaacga 10099125  T
Q  409 ctctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10099124 ctctttagacgtgctgattatctc 10099101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14581585 - 14581181
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  14581585 catcagaagcagaag-tcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 14581489  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    | |||| ||| || |||||||||  |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||| ||| | | ||||||||| ||      
T  14581488 ggagctttttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaacgaagaattgcaagggaggtatcaacggtcatttacaaagcactgggtacttgtccttcatttt 14581390  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  14581389 cagcgttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactaccctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaatttgttcc 14581290  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  14581289 tt-caagataggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggacttcatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 14581192  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  14581191 ttagacgtgct 14581181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 49 - 399
Target Start/End: Original strand, 16665947 - 16666295
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||  |||| | |||    
T  16665947 tcatcagaagctatatcatcaccaaaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaaga 16666045  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16666046 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 16666145  T
Q  249 tccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 347  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  16666146 tccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-ttgttcc-ttcaagatgtgaatgaatttgaagttgattcttc 16666243  T
Q  348 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggat 399  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  16666244 aaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggat 16666295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 8739913 - 8740294
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  8739913 tcatcagaagcagaataccatcagaagcaagatttc--atcagaagctacatcatcaccagaagctacaagtgatcattaaatttaaactgaagattcaa 8740010  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || || ||||| || |||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||||| | |||||||||||||    
T  8740011 aggagttgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaaagaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtccttcgtta 8740109  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |      
T  8740110 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaattgct-- 8740207  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaagga 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  8740208 ccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 8740294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 423
Target Start/End: Original strand, 9006293 - 9006699
Alignment:
Q  12 atcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |  |  ||| ||||||||||| ||    
T  9006293 atcatcagaagcagaagaccatcagaagcacaatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagcttcaagtgaacagttaatttaaactgaagattca 9006390  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||| |||||||| || |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | ||| ||||| | ||||||||| ||    
T  9006391 aagaagctgtttttcgtttcaatctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggagatatcaacgggcattttaaaagcactgagtatttgtccttcatt 9006489  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||     
T  9006490 atcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgtt 9006588  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||| |    
T  9006589 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagtcgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgaat 9006686  T
Q  411 ctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||    
T  9006687 ctttagacgtgct 9006699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16476730 - 16476344
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  16476730 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 16476632  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  16476631 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 16476532  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt--ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  16476531 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttcttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 16476433  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggat 399  Q
     |  |||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||||||  |||| ||| |||| |||||    
T  16476432 acactcaccatgggaatgaatttgaagcttatccttcaaaggactacaccccaaacaggcacaggatccttggtggataatcacaggat 16476344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Original strand, 17281219 - 17281624
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||| ||| ||||    
T  17281219 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgacgattcaaa 17281316  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaac-gaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    | |||||||| || |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| | | |||||||||||||    
T  17281317 ggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaactgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgtta 17281415  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |    
T  17281416 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctatacctgcagaa-atgttc 17281514  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  17281515 c-ttcaaaatgaaaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatctggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 17281612  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||| ||||    
T  17281613 tttagacatgct 17281624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 53 - 423
Target Start/End: Original strand, 16670986 - 16671353
Alignment:
Q  53 cagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacga 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||  |||| | |||| ||    
T  16670986 cagaagctatatcatcaccaaaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaatga 16671084  T
Q  153 agaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcca 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  || | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16671085 agaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcagtgggtatttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcca 16671184  T
Q  253 ctactctgtt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaag 351  Q
    ||||| |  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  16671185 ctacttttctcttgtccacactacaagacaagacaacagctctgcctgtagaatt-gttcctt-caagatgtgaatgaatttgaagttgattcttcaaag 16671282  T
Q  352 gactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  16671283 gacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct 16671353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 16348418 - 16348674
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||   || |||||||||||||||||||    
T  16348418 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaa 16348516  T
Q  113 agtagct-gtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  16348517 agtagcttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtctttcgtt 16348616  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtcca 269  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16348617 aacagagttgacaaaatacaagtgtgcaaccactacctccactactttgttttgtcca 16348674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Original strand, 14321467 - 14321757
Alignment:
Q  15 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| |||||    
T  14321467 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtgaatttaaactgaagattcaaag 14321565  T
Q  115 tagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatca-tttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | | ||||| | |||||||| ||||     
T  14321566 tagctgtttgtcgtttcaacctcatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattttgaagaacactgagtacttgtcctttgttat 14321665  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  14321666 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacaactcttcctgcagaa 14321757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 13199028 - 13199435
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc-aaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | |||  ||||||||| | ||    
T  13199028 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaatattttaaactgaagtttca 13199125  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||| |||||||| || ||| |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||    
T  13199126 aaggagctgtttttcgttttaacctcgtctaag-agaacgatgaattaaaagggaggtaccaacggtcatttgaaaagcactgggtgtttgtccttcttt 13199224  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg---ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 308  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  13199225 ga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatga 13199323  T
Q  309 tgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacga 408  Q
    |  | |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||    
T  13199324 t--ccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacga 13199420  T
Q  409 ctctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||||    
T  13199421 ctctttagacgtgct 13199435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 337
Target Start/End: Original strand, 15216160 - 15216446
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||  |||||| |||    
T  15216160 tcatcagaagctctatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgacgattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-aga 15216258  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15216259 acgaagaattgaaagtgaggtatcaacgatcatttgaagagcactgggtacctgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 15216358  T
Q  249 tccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaag 337  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15216359 tccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-atgttcc-ttcaagatgggaatgaatttgaag 15216446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 2246815 - 2246411
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||| ||| | |||    
T  2246815 tcatcagaagcataagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatatttaaactaaagtttcaa 2246718  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || || ||||| || ||| |||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||  |   ||||||||| ||     
T  2246717 aggagttgtttttcgttttaacctcgtctaag-agaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactaggtgtttgtccttcattg 2246619  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| |    
T  2246618 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaactactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcataa-atgttc 2246521  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  2246520 c-ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 2246423  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  2246422 tttagacgtgct 2246411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 98 - 337
Target Start/End: Original strand, 12567138 - 12567376
Alignment:
Q  98 aaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagc 197  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | |||||     
T  12567138 aaactgaagatttaaagtagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagt 12567237  T
Q  198 agttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 296  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567238 acttgtcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgc 12567337  T
Q  297 ctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaag 337  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12567338 ctgcagaa-ttgttcc-ttcaagatgggaatgaatttgaag 12567376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 29933350 - 29933750
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc-aaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |  |||  ||||||||| | ||    
T  29933350 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttc--atcagaagctatataatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttca 29933447  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||       |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||   ||||||||| ||    
T  29933448 aaggagttgtttctcgtttcaacctt-------gagaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttggaaagcacggagtgcttgtccttcttt 29933540  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||     
T  29933541 ga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaatagctctgcctgcagaa-atgtt 29933638  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagct-aattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
    || |||||||| |||||| |||||||  |  || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  29933639 cc-ttcaagataggaatggatttgaacttcgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 29933736  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||    
T  29933737 tctttagacgtgct 29933750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 29982504 - 29982904
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc-aaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |  |||  ||||||||| | ||    
T  29982504 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttc--atcagaagctatataatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttca 29982601  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||       |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||   ||||||||| ||    
T  29982602 aaggagttgtttctcgtttcaacctt-------gagaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttggaaagcacggagtgcttgtccttcttt 29982694  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||     
T  29982695 ga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaatagctctgcctgcagaa-atgtt 29982792  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagct-aattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
    || |||||||| |||||| |||||||  |  || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  29982793 cc-ttcaagataggaatggatttgaacttcgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 29982890  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||    
T  29982891 tctttagacgtgct 29982904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16493489 - 16493245
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  16493489 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 16493391  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  16493390 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 16493291  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16493290 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 16493245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 29905972 - 29906371
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc-aaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  |||  ||||||||| | ||    
T  29905972 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttca 29906069  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| | |||   ||||||||| ||    
T  29906070 aaggagctgtttctcgtttcaacctt-------gagaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttgtaaagcacggagtgcttgtccttcttt 29906162  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |     
T  29906163 ga-agagttgacaaagtacaagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatttt- 29906260  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  29906261 -ccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 29906358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 29947137 - 29947536
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc-aaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  |||  ||||||||| | ||    
T  29947137 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttca 29947234  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| | |||   ||||||||| ||    
T  29947235 aaggagctgtttctcgtttcaacctt-------gagaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttgaaaagcacggagtgcttgtccttcttt 29947327  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |     
T  29947328 ga-agagttgacaaagtacaagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatttt- 29947425  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  29947426 -ccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 29947523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 29996291 - 29996690
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc-aaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  |||  ||||||||| | ||    
T  29996291 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttca 29996388  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| | |||   ||||||||| ||    
T  29996389 aaggagctgtttctcgtttcaacctt-------gagaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttgaaaagcacggagtgcttgtccttcttt 29996481  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |     
T  29996482 ga-agagttgacaaagtacaagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatttt- 29996579  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  29996580 -ccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 29996677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 21736558 - 21736154
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaact-gaagatcca 111  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| || |||  || |    
T  21736558 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatctagaatctcaa 21736462  T
Q  112 aagtagctgtttctc-atttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||| ||||||||||  |  | |||||  |||||| ||| ||||| ||  ||||||| ||  ||||| ||||||| | ||| ||| |   |||||| || |    
T  21736461 aag-agctgtttctttaagttaacctcgtctaag-agagcgaaggatcaaaagggaagtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccctcat 21736364  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |    
T  21736363 tga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaattgtt 21736265  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     ||   |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  21736264 ccca--caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtagatgatcaaaggaactc-aacgac 21736168  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
     |||||||||||||    
T  21736167 actttagacgtgct 21736154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 314 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16386225 - 16386107
Alignment:
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  16386225 ttcaagatgggaatgaatttgaatctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcatacgactctt 16386126  T
Q  414 tagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16386125 tagacgtgctgattatctc 16386107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 15651055 - 15651261
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | |      
T  15651055 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagaaaagacaacagctctgcctacagaatttttcc-- 15651152  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  15651153 ttcaaaataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 15651251  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  15651252 tagacgtgct 15651261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 15662690 - 15662896
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | |      
T  15662690 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagaaaagacaacagctctgcctacagaatttttcc-- 15662787  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||| |||    
T  15662788 ttcaaaataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgaccctt 15662886  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  15662887 tagacgtgct 15662896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16487342 - 16487098
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagca--aagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |    
T  16487342 tcatcagaagcagaaagtcatcaaaagcagaaagt----catcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattc 16487248  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||  |||||  ||||    
T  16487247 aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggataccactgagctcttgtctctcgt 16487148  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 260  Q
     || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16487147 caatagagttgacacactacaagtgttcaaccagtacctccactactctg 16487098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27173082 - 27172924
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacta-ctctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |     
T  27173082 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccacgacctccacgaactctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcaga-tttgttc- 27172985  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 373  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27172984 tttcaagataggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggactacatccaaatcaggcaaa 27172924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10529401 - 10529222
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||    
T  10529401 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagaaat-gttcc 10529303  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
    || |||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  10529302 tt-caagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 10529222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 51989128 - 51989335
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  51989128 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaatctgtttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 51989226  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||| |||||| |||||||  | |||||| | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||| |  | || |||||||||    
T  51989227 -ttcaagataggaatggatttgaacgtgattctttataggacaacatccaaatcaggaaaaagatcattggtatttgatcaaggtttctc-aacgactct 51989324  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    || ||||||||    
T  51989325 tttgacgtgct 51989335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 31113971 - 31114177
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  31113971 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctgcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 31114068  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||| | ||||||  ||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||| | || |  ||||||||||| | || ||||||||||    
T  31114069 ttcaagttaggaatggttttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattaatgttgaatgatcaaaggttctc-aacgactctt 31114167  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  31114168 tagacgtgct 31114177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41045797 - 41045640
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  41045797 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 41045700  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 373  Q
    |||||| | |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  41045699 ttcaagttaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcatgcaaa 41045640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 264 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17961551 - 17961419
Alignment:
Q  264 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaa 363  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||| | ||| | ||||||||| || ||||    
T  17961551 tgtccgcgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcaga-tttgttcctt-caagatagcaatgaatttgaagttgattatgcaaaggactgcatccaa 17961454  T
Q  364 atcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaagga 398  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  17961453 atcaggcaacagatcactggtggatgatcaaagga 17961419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 264 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18006496 - 18006364
Alignment:
Q  264 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaa 363  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||| | ||| | ||||||||| || ||||    
T  18006496 tgtccgcgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcaga-tttgttcctt-caagatagcaatgaatttgaagttgattatgcaaaggactgcatccaa 18006399  T
Q  364 atcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaagga 398  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  18006398 atcaggcaacagatcactggtggatgatcaaagga 18006364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15851065 - 15850894
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaa-ccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||  |||     
T  15851065 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctccagaa-atgtt 15850967  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    || |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15850966 cc-ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 15850894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15833459 - 15833367
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  15833459 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 15833367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17022082 - 17021990
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaa 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  17022082 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa 17021990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22151301 - 22151136
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |  |      
T  22151301 agagttgacaaagtacaaagcgtacaaccactacctccacgattctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgtt-- 22151204  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatca 379  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| | ||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22151203 ctttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataagacaacatccaaatcaggcaaaagatca 22151136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5213615 - 5213562
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5213615 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctatgctacaagacaaga 5213562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 51341063 - 51340974
Alignment:
Q  218 gttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  51341063 gttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcccgcagaa 51340974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13148321 - 13148151
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||| |    
T  13148321 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactatgcgtgcgtctacgatacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaa-ttgttc 13148223  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13148222 c-ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 13148151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18006734 - 18006570
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaa-ctgaagatccaa 112  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| | ||||| ||| || ||||| |||    
T  18006734 catccgaagcagaag-tcatcagaagcaatatttcg--tcagaagctagatcatcaccagaagctacaagtgatcaacagatttaaatctaaagattcaa 18006638  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcat 181  Q
    || ||||||||||| |||||| ||  ||| || |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  18006637 aggagctgtttctcgtttcaatctcgtct-agaagaacgaagaattgcaaggaagatatcaacggtcat 18006570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2785102 - 2785031
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  2785102 aagtgtacaaccactacctccactactctgatttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 2785031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Original strand, 16665895 - 16665959
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagcta 79  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16665895 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttc--atcagaagctatatcatcatcagaagcta 16665959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Original strand, 16670930 - 16670994
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagcta 79  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16670930 tcatcaaaagcagaagaccatcagaagcaaggtttc--atcagaagctatatcatcaccagaagcta 16670994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33583267 - 33583196
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33583267 aagtgtacaaccactacctccaatactctattttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 33583196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 384
Target Start/End: Original strand, 45861693 - 45861846
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagac-aagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatg 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || | ||||||| |||||||||||  ||| || ||||  || ||||||    
T  45861693 aagtgtacgaccactacctccactactatgtttatgtctacgctacaagacaaaaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcc-ttcagaataggaatg 45861790  T
Q  329 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
     |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  45861791 gatttgaacttgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggt 45861846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 9092151 - 9092270
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  9092151 tcatcagaagcagaataccatcagaagcaagatttc--atcagaagctacatcatcaccagaagctacaagtgatcattaaatttaaactgaagattcaa 9092248  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaac 134  Q
    || || ||||| || |||||||    
T  9092249 aggagttgtttttcgtttcaac 9092270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 301
Target Start/End: Original strand, 12752727 - 12752813
Alignment:
Q  218 gttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  12752727 gttgacaaagtacaaagtgtacgaccactatctccacaactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 12752813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 11167924 - 11167868
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcac 70  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11167924 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcac 11167868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11223601 - 11223548
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  11223601 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttgtctctgctacaagacaaga 11223548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14955465 - 14955412
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  14955465 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttatctctgctacaagacaaga 14955412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 15662492 - 15662558
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15662492 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagttaca 15662558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17961789 - 17961625
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaa-ctgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| | ||||| ||| || | ||| |||    
T  17961789 catcagaagcagaag-tcatcagaagcaatatttcg--tcagaagctagatcatcaccagaagctacaagtgatcaacagatttaaatctaaggattcaa 17961693  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcat 181  Q
    || || |||||| | |||||| || |||| || |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  17961692 aggagttgtttcacgtttcaatctcatct-agaagaacgaagaattgcaaggaagatatcaacggtcat 17961625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 23680182 - 23680251
Alignment:
Q  9 gacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23680182 gacatcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccaaaagctaca 23680251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 24052419 - 24052488
Alignment:
Q  9 gacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24052419 gacatcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccaaaagctaca 24052488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 49990280 - 49990146
Alignment:
Q  250 ccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 347  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | || |||| |||||| |||||| |||||||  | || ||||    
T  49990280 ccactactctgcttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcagaaat-gttcctt-caagataggaatggatttgaacgtgatccttc 49990183  T
Q  348 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  49990182 ataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 49990146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2561226 - 2561172
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  2561226 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 2561172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 12726351 - 12726405
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  12726351 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 12726405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 18121743 - 18121797
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgt-tttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  18121743 aagtgtacaaccactacctccactactctgtgtttgtctctgctacaagacaaga 18121797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 18142873 - 18142927
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgt-tttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  18142873 aagtgtacaaccactacctccactactctgtgtttgtctctgctacaagacaaga 18142927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 47207744 - 47207690
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  47207744 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaaga 47207690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 53056848 - 53056902
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  53056848 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 53056902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6090770 - 6090737
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6090770 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 6090737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11868307 - 11868274
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11868307 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 11868274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 12388993 - 12389026
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12388993 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 12389026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 15650857 - 15650923
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15650857 tcatcagaagcagaagtccatgagaagcaagatttcg--tcagaagctatatcatcaccagaagctaca 15650923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16032563 - 16032530
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032563 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 16032530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 25398376 - 25398409
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398376 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 25398409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29855447 - 29855414
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855447 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 29855414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37412640 - 37412571
Alignment:
Q  234 tgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37412640 tgtacaaccactatctccactactctgtttctgtcttcactacaagacaagtaaaacagctatgcctgca 37412571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 40799912 - 40799879
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40799912 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 40799879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 24775655 - 24775727
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  24775655 aagtgtacaaccactacatccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagtaaaacagctctgcctgca 24775727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 81
Target Start/End: Original strand, 31113807 - 31113839
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31113807 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 31113839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 46796488 - 46796560
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46796488 aagtgtacaaccactatctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 46796560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 47405542 - 47405614
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  47405542 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 47405614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Original strand, 11909145 - 11909220
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  11909145 aagtgtacgaccactacctccactactttgtttatgtctatgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 11909220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12968344 - 12968309
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12968344 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttgt 12968309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13604713 - 13604662
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatat 64  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||    
T  13604713 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatat 13604662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20646192 - 20646138
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||    
T  20646192 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 20646138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 21605775 - 21605829
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  21605775 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 21605829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22140802 - 22140748
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  22140802 aagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22140748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 20627552 - 20627585
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20627552 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttt 20627585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 21636791 - 21636824
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21636791 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttt 21636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28582144 - 28582111
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28582144 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttt 28582111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 301
Target Start/End: Original strand, 30054341 - 30054410
Alignment:
Q  234 tgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagac-aagacaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  30054341 tgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaagataacagctctgcctgca 30054410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 38177764 - 38177797
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38177764 aagtgtacaaccactacctccactactctatttt 38177797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 49553610 - 49553643
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49553610 aagtgtacaaccactacctccactactctatttt 49553643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 1728136 - 1728208
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  1728136 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 1728208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 16658739 - 16658811
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16658739 aagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 16658811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16880058 - 16880026
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16880058 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 16880026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17697650 - 17697610
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17697650 agtacaattgtacaaccactatctctactactctgttttgt 17697610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 49642883 - 49642955
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  49642883 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 49642955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 49666526 - 49666598
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  49666526 aagtgtacaaccactatctccactactctgattctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 49666598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 108)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5023196 - 5022788
Alignment:
Q  23 cagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5023196 cagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagtagctgtt 5023097  T
Q  123 tctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttga 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5023096 tctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttga 5022997  T
Q  223 caaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatg 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5022996 caaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttt-aagatg 5022898  T
Q  323 ggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgc 422  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5022897 ggaatgaatttggagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc 5022798  T
Q  423 tgattatctc 432  Q
    ||||||||||    
T  5022797 tgattatctc 5022788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 18077695 - 18078113
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18077695 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 18077793  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18077794 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgtta 18077893  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18077894 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactcctctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 18077993  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  18077994 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactc 18078092  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  18078093 tttagacgtgctaattatctc 18078113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 40454138 - 40454555
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40454138 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagtaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 40454236  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40454237 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgtta 40454336  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40454337 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgcc 40454436  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  40454437 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 40454535  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40454536 ttagacgtgctgattatctc 40454555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 25657606 - 25657188
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25657606 tcatcagaagcagaaggttatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 25657508  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25657507 agtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagagaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgtta 25657408  T
Q  213 ac-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657407 acaagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgctttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 25657308  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  25657307 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactc 25657209  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25657208 tttagacgtgctgattatctc 25657188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 432
Target Start/End: Original strand, 40470393 - 40470794
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470393 gtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatctgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 40470491  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470492 ttcaaccttatctaagaagaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 40470591  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40470592 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgcc-ttcaagatgggaatg 40470690  T
Q  329 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatta 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470691 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 40470790  T
Q  429 tctc 432  Q
    ||||    
T  40470791 tctc 40470794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 14835893 - 14836309
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||   || |||||||||||||||||||    
T  14835893 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaa 14835991  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  14835992 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaataattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 14836091  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14836092 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 14836191  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  || |||||||||    
T  14836192 -ttcaagatgggaatgaatttaaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactct 14836289  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  14836290 ttagacgtgctaatcatctc 14836309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4987743 - 4987335
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||    
T  4987743 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tgatcaggagcgatatcatcaccagaagctacatttgatccgtaaattcaaactgaagattcaa 4987645  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||| | |||||||||||||    
T  4987644 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgtta 4987545  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4987544 agagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 4987445  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  4987444 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 4987347  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  4987346 tttagacgtgct 4987335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10909879 - 10909460
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| | |  || | |||||||||||||| ||    
T  10909879 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagataaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattca 10909781  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  10909780 aagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagccctgagtacttgtccttcgtt 10909681  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909680 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 10909581  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  10909580 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgact 10909482  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  10909481 ctttagacgtgctaattatctc 10909460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 14 - 432
Target Start/End: Original strand, 15207204 - 15207618
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||| | ||||    
T  15207204 catcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttaatcagtaaatataaactgaagtttcaaa 15207302  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  15207303 gtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgagtacttgtccttcgttaa 15207402  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  15207403 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagttatgcctgcagaa-ttgttcc- 15207500  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  15207501 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 15207599  T
Q  414 tagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||| || |||||    
T  15207600 tagacgtgctaatcatctc 15207618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 18752278 - 18752697
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagcta--tatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||| || ||||| |||  |  || ||| ||||||||      
T  18752278 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcttcagaagcaaaatatcttcaccagaaactgcatttgatctcttaat-caatctgaagattt 18752376  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    |||||||| | |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  18752377 aaagtagccgattctccattcagccttatctaagtagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaattgctctaagcatttgtccttcgt 18752476  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18752477 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaggcaacagctatgcctgcagaatttgtg 18752576  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  18752577 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaatggatttcaaacgact 18752675  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18752676 ctttagacgtgctgattatctc 18752697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 18762888 - 18763307
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagcta--tatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||| || ||||| |||  |  || ||| ||||||||      
T  18762888 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcttcagaagcaaaatatcttcaccagaaactgcatttgatctcttaat-caatctgaagattt 18762986  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    |||||||| | |||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18762987 aaagtagccgattctccattcagccttatctaagtataacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaatagctctgagcatttgtccttcgt 18763086  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18763087 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaggcaacagttatgcctgcagaatttgtg 18763186  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  18763187 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaatggatttcaaacgact 18763285  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18763286 ctttagacgtgctgattatctc 18763307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 27814734 - 27815153
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  27814734 tcatcagaaacagaaggtcatcagaagcaaagattttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 27814832  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  27814833 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtataaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 27814932  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27814933 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttatgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgta 27815032  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27815033 cctt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 27815131  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27815132 ctttagacgtgctgattatctc 27815153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48371602 - 48371183
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  48371602 tcatcagaagcagaaggtcattagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 48371504  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  48371503 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggggggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 48371404  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  48371403 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcataatttgta 48371304  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  48371303 cctt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 48371205  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48371204 ctttagacgtgctgattatctc 48371183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 52704259 - 52703840
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  52704259 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 52704161  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  52704160 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 52704061  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  52704060 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 52703962  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  52703961 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 52703862  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  52703861 ctttagacgtgctgattatctc 52703840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3371181 - 3370777
Alignment:
Q  16 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagt 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| | |  ||| ||||||||||||||||||    
T  3371181 tcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcggaatcatcaccagaagctacaattaattcgtt-atttaaactgaagatccaaagt 3371084  T
Q  116 agctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||| | ||||||||||||||||    
T  3371083 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgttaaca 3370984  T
Q  216 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3370983 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgcc-t 3370885  T
Q  315 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactcttt 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |  || |||||||||||    
T  3370884 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgggtgatcaaagaaactc-aacgactcttt 3370786  T
Q  415 agacgtgct 423  Q
    |||||||||    
T  3370785 agacgtgct 3370777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 461628 - 461209
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  461628 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 461530  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  461529 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 461430  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  461429 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 461331  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  461330 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 461231  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  461230 ctttagacgtgctgattatctc 461209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 14843442 - 14843861
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  14843442 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 14843540  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  14843541 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 14843640  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  14843641 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 14843739  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  14843740 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 14843839  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14843840 ctttagacgtgctgattatctc 14843861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17918523 - 17918104
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  17918523 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 17918425  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  17918424 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 17918325  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  17918324 atagagttgacagagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 17918225  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  17918224 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 17918126  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17918125 ctttagacgtgctgattatctc 17918104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 24027874 - 24028293
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  24027874 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 24027972  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  24027973 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 24028072  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||     
T  24028073 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgt- 24028171  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24028172 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggattatcaaaggatttcaaacgact 24028271  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24028272 ctttagacgtgctgattatctc 24028293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3390924 - 3390517
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||| | |  ||| |||||||||||||||    
T  3390924 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcggaatcatcaccagaagctataattaattcgtt-atttaaactgaagatccaa 3390827  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||| | |||||||||||||    
T  3390826 agtagctgtttcttatttcaacctcgtctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgtta 3390727  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3390726 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcatgcagaatttatgc 3390627  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |  || ||||||||    
T  3390626 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgggtgatcaaagaaactc-aacgactc 3390529  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  3390528 tttagacgtgct 3390517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 451047 - 450628
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  451047 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 450949  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| || ||  ||||||    
T  450948 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttatctctcgtta 450849  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  450848 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 450749  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  450748 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 450650  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  450649 ctttagacgtgctgattatctc 450628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 15560868 - 15561287
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  15560868 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 15560966  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  15560967 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 15561066  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  15561067 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 15561165  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15561166 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 15561265  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15561266 ctttagacgtgctgattatctc 15561287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 30936861 - 30937280
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  30936861 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 30936959  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  30936960 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 30937059  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  30937060 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 30937158  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  30937159 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 30937258  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30937259 ctttagacgtgctgattatctc 30937280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10696110 - 10695693
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| | |  || | |||||||||||||| ||    
T  10696110 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagataaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattca 10696012  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  10696011 aagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagccctgagtacttgtccttcgtt 10695912  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  10695911 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactaccctgtttttttctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-ttgtt 10695813  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  10695812 cc-ttcgagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 10695715  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  10695714 ctttagacgtgctaatcatctc 10695693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 47151868 - 47152285
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacattt-aatccatagattcaaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||    | ||||||||||||||| ||    
T  47151868 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaagattt-tcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaatagtaaaattcaaactgaagattca 47151966  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||| |||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  47151967 aagtagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagccctgagtacttgtccttcgtt 47152066  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||     
T  47152067 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttatctacgctacaagacaagacaacaaccatgcctgcagaa-ttgtt 47152165  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  47152166 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 47152263  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  47152264 ctttagacgtgctaatcatctc 47152285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16266933 - 16266514
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  16266933 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 16266835  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  16266834 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 16266735  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  16266734 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 16266635  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  16266634 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 16266536  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16266535 ctttagacgtgctgattatctc 16266514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17929171 - 17928752
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  17929171 tcatcaaaagcggaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 17929073  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  17929072 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 17928973  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  17928972 atagagttgacagagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 17928873  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  17928872 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 17928774  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17928773 ctttagacgtgctgattatctc 17928752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 19944116 - 19944535
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  19944116 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 19944214  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  19944215 agtagctgattctcaattcagtcttttccaagaagaacgaagaattgaaagggagctatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 19944314  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  19944315 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctataagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 19944414  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  19944415 cgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaatgact 19944513  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19944514 ctttagacgtgctgattatctc 19944535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 30926283 - 30926702
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  30926283 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 30926381  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  30926382 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 30926481  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  30926482 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 30926580  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  30926581 acactcaagatgggaatgaatttaaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 30926680  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30926681 ctttagacgtgctgattatctc 30926702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36018807 - 36018388
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |  || |||||||||||| |||    
T  36018807 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcttttaat-caaactgaagattcaa 36018709  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  36018708 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 36018609  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  36018608 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 36018510  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36018509 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 36018410  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36018409 ctttagacgtgctgattatctc 36018388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36029360 - 36028941
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |  || |||||||||||| |||    
T  36029360 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcttttaat-caaactgaagattcaa 36029262  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  36029261 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 36029162  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  36029161 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 36029063  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36029062 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 36028963  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36028962 ctttagacgtgctgattatctc 36028941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 19581711 - 19581303
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||  || | |||||||||||||| ||    
T  19581711 tcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattca 19581613  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||| |||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||| |||    
T  19581612 aagtagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacgatcatttggaaaacactgagtacttgtcctttgtt 19581513  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||     
T  19581512 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaacagccatgcctgcagaa-atgtt 19581414  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  19581413 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 19581316  T
Q  411 ctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||    
T  19581315 ctttagacgtgct 19581303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 10740383 - 10740802
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  10740383 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 10740481  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  10740482 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 10740581  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  10740582 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 10740681  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  10740682 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 10740780  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10740781 ctttagacgtgctgattatctc 10740802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 10750957 - 10751376
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  10750957 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 10751055  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  10751056 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 10751155  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  10751156 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 10751255  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  10751256 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 10751354  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10751355 ctttagacgtgctgattatctc 10751376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 10954152 - 10954571
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  10954152 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 10954250  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  10954251 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 10954350  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  10954351 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 10954450  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  10954451 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 10954549  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10954550 ctttagacgtgctgattatctc 10954571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 10964726 - 10965145
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  10964726 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 10964824  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  10964825 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 10964924  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  10964925 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 10965024  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  10965025 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 10965123  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10965124 ctttagacgtgctgattatctc 10965145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 19954751 - 19955170
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  19954751 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 19954849  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  19954850 agtagctgattctcaattcagtcttttccaagaagaacgaagaattgaaagggagctatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 19954949  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  19954950 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactcttttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 19955049  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  19955050 cgtt-caagatgagaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaaccaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 19955148  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19955149 ctttagacgtgctgattatctc 19955170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22007482 - 22007063
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  22007482 tcatcagatgcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 22007384  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| ||| || ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  22007383 agtagctgattcgcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 22007284  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  22007283 atagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 22007184  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  22007183 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 22007085  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22007084 ctttagacgtgctgattatctc 22007063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4948806 - 4948387
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  4948806 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcaaaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 4948708  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  4948707 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 4948608  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||     
T  4948607 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatatgt- 4948509  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  4948508 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaatgaccacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 4948409  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4948408 ctttagacgtgctgattatctc 4948387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16256340 - 16255921
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  16256340 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 16256242  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  16256241 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 16256142  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  16256141 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaacttgta 16256042  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  16256041 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 16255943  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  16255942 ctttaaacgtgctgattatctc 16255921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21996884 - 21996465
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  21996884 tcatcagatgcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 21996786  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| ||| || ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  21996785 agtagctgattcgcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 21996686  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  21996685 atagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctctactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 21996586  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  21996585 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 21996487  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21996486 ctttagacgtgctgattatctc 21996465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 49518606 - 49518187
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  49518606 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatccttt-agtcaaactgaagattcaa 49518508  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  49518507 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 49518408  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  49518407 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 49518308  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  49518307 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 49518209  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49518208 ctttagacgtgctgattatctc 49518187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16317800 - 16317383
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | |   ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  16317800 tcatcagaagtagaagctcatcagaagcaga-tgggtcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccataaatttaaactgaagattcaa 16317702  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | | || || | |||||||||||||    
T  16317701 agtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacactaagtatttgtccttcgtta 16317602  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||     
T  16317601 acagagttgacgaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaa-atgtt 16317503  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  16317502 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggaaatc-aacgact 16317405  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  16317404 ctttagacgtgctaatcatctc 16317383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 55745041 - 55745460
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  55745041 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 55745139  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  55745140 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatta 55745239  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  55745240 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 55745339  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  55745340 cact-caagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgact 55745438  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55745439 ctttagacgtgctgattatctc 55745460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 55755652 - 55756071
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  55755652 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 55755750  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  55755751 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatta 55755850  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  55755851 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 55755950  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  55755951 cact-caagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgact 55756049  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55756050 ctttagacgtgctgattatctc 55756071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24713898 - 24713485
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  24713898 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagcgatatcatcactagaagctacaattgttcagtaaatttaaactgaagattcaaa 24713801  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||     
T  24713800 gtagttgtttcttgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtattaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 24713701  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  24713700 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 24713603  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  24713602 ttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtagatgatcaaaggaactc-aacgactctt 24713504  T
Q  414 tagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||| || |||||    
T  24713503 tagacgtgctaatcatctc 24713485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16305575 - 16305159
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |  |  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  16305575 tcatcagaagtagaagctcatcagaagcaga--tggtcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccataaatttaaactgaagattcaa 16305478  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | | || || | |||||||||||||    
T  16305477 agtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacactaagtatttgtccttcgtta 16305378  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||  |||     
T  16305377 acagagttgacaaagtataagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacaaccatgcctgcagaa-atgtt 16305279  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  16305278 cc-ttcaagatgagaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggaaatc-aacgact 16305181  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  16305180 ctttagacgtgctaatcatctc 16305159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24640702 - 24640299
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  24640702 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 24640604  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  24640603 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 24640504  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  24640503 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 24640404  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24640403 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 24640304  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  24640303 atctc 24640299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11536313 - 11535908
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  11536313 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 11536216  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| | | |||||||||||||    
T  11536215 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgtta 11536117  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  11536116 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 11536018  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  11536017 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 11535920  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  11535919 tttagacgtgct 11535908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5873837 - 5873423
Alignment:
Q  15 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaag 114  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| || |||||||| |||||    
T  5873837 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt-tcatcaaaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaagctgaagattcaaag 5873739  T
Q  115 tagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaac 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  5873738 tagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcattaac 5873639  T
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  5873638 atagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 5873541  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  || ||||||||||    
T  5873540 ttcaagatgggaatgaaattgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatccaaggaactc-aacgactctt 5873442  T
Q  414 tagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||| || |||||    
T  5873441 tagacgtgctaatcatctc 5873423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27657055 - 27656652
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  27657055 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 27656957  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  27656956 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 27656857  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  27656856 caagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 27656757  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27656756 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 27656657  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  27656656 atctc 27656652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27667628 - 27667225
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  27667628 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 27667530  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  27667529 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 27667430  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  27667429 caagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 27667330  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27667329 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 27667230  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  27667229 atctc 27667225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 18130031 - 18130447
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagca--aagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |    
T  18130031 tcatcagaagcagaaagtcatcaaaagcagaaagt----catcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattc 18130125  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||  |||||  ||||    
T  18130126 aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaaggat-atatggatagcactgagctcttgtctctcgt 18130224  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18130225 taatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttg 18130324  T
Q  309 tgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacga 408  Q
    | |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  18130325 tacact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacga 18130423  T
Q  409 ctctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18130424 ctctttagacgtgctgattatctc 18130447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 10301002 - 10300597
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  10301002 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcacgatt--tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 10300905  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||| | |||||||||||||    
T  10300904 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtct-agaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattgagtatttgtccttcgtta 10300806  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  10300805 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttatctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 10300707  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  10300706 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 10300609  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  10300608 tttagacgtgct 10300597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11515501 - 11515098
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  11515501 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagta-atttaaactgaagattcaaa 11515405  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    | |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||     
T  11515404 ggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgagtacttgtccttcgttat 11515306  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  11515305 cagagttaacaaagtaaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 11515207  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  11515206 -ttcaagatgagaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 11515109  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  11515108 ttagacgtgct 11515098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 423
Target Start/End: Original strand, 31266585 - 31266994
Alignment:
Q  9 gacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagat 108  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||  | |||  || ||| |||||||| ||    
T  31266585 gacatcatcagaagtagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccaaaagttacaagtgatcagtaaatttaaactgaatat 31266682  T
Q  109 ccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttc 208  Q
     ||||| |||||||| || |||||||||  |||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  31266683 tcaaagaagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaa-agaacgaagaattgtaaaggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttc 31266781  T
Q  209 gttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaattt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  31266782 gttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-at 31266880  T
Q  308 gtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacg 407  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |  || ||||    
T  31266881 gttcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagttgatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagaaactc-aacg 31266978  T
Q  408 actctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||||    
T  31266979 actctttagacgtgct 31266994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 55651791 - 55651387
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  || ||| ||||||||| | |||    
T  55651791 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagttacaattgatcagtaaatttaaactgaagtttcaa 55651694  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || ||| || ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  55651693 aggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 55651595  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  55651594 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 55651497  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  55651496 c-ttcaagataggaatgaatttgaatttgatccttcataggactacacccaaatcagtcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 55651399  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  55651398 tttagacgtgct 55651387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 423
Target Start/End: Original strand, 49001774 - 49002175
Alignment:
Q  16 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagt 115  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||   | ||| ||||||||| | |||||     
T  49001774 tcagaagcagaagtccatcagaagtaagatttc--atcagaagctatttcatcaccagaagctacagttgatcagaaaatttaaactgaagtttcaaagg 49001871  T
Q  116 agctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaaca 215  Q
    |||||||| || ||| || ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||  || |   ||||||||| || | |    
T  49001872 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacagtcatttgaaaagcattgggtgcttgtccttcattga-a 49001969  T
Q  216 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||    
T  49001970 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttcctt 49002068  T
Q  315 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactcttt 414  Q
     |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  49002069 -caagataggaatgaatttgaagttaatccttcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 49002166  T
Q  415 agacgtgct 423  Q
    |||||||||    
T  49002167 agacgtgct 49002175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23509386 - 23509180
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  23509386 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttcct 23509288  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  23509287 t-caagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 23509190  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    | ||||||||    
T  23509189 tggacgtgct 23509180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 18774469 - 18774873
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatc-ca 111  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||| ||    
T  18774469 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaaaatttc--atcagaagctatatgatcaccagaagctacagttgatctgaagattcaatctgaa-atctca 18774564  T
Q  112 aagtagctgtttctc-atttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||  |||||| |||  |  | |||||  |||||| ||| | ||| ||  ||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| |    
T  18774565 aaagagctgtctctttaagttaacctcgtctaag-agagcaaaggatcaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgtttgtccttcat 18774663  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||   | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  18774664 tga-agagttgacaaaatacaattgtacaaccactatctccacgaccctaagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcataatt-gt 18774761  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  18774762 tcctt-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 18774859  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||    
T  18774860 tctttagacgtgct 18774873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 8997268 - 8997474
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||    
T  8997268 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtatgtcctcgctacaagacaagataacagttctgcctgcagaagt-gttcct 8997366  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||  ||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  8997367 t-caagacaggaatgaatttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 8997464  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    | ||||||||    
T  8997465 tggacgtgct 8997474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 18007071 - 18007277
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||| ||     
T  18007071 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgca-aaaatgttcc- 18007168  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  18007169 ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaataaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggttctc-aacgactctt 18007267  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  18007268 tagacgtgct 18007277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 421
Target Start/End: Original strand, 16819364 - 16819568
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||     
T  16819364 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtccttgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccc- 16819462  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
      |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  16819463 -acaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 16819560  T
Q  414 tagacgtg 421  Q
    | ||||||    
T  16819561 tggacgtg 16819568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Original strand, 39525952 - 39526119
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  39525952 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 39526049  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttg 184  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39526050 aggagctgtttttc-tttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 39526119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Original strand, 14778454 - 14778632
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  14778454 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 14778551  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
    |||||||  |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  14778552 ttcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 14778632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33378461 - 33378291
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||  ||| |    
T  33378461 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctacctgcagaa-atgttc 33378363  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33378362 c-ttcaagataggaatggatttgaacgtgattcttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 33378291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Original strand, 17993805 - 17993974
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||  ||| ||     
T  17993805 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataatagctctgcctgcagaa-atgt-ccc 17993902  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggta 385  Q
    |||||| | |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  17993903 ttcaagttaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggta 17993974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 20648423 - 20648501
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccata 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20648423 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccata 20648501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Original strand, 14710790 - 14710968
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||  ||| ||     
T  14710790 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctatagaa-atgttcc- 14710887  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
    |||||||  |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  14710888 ttcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 14710968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Original strand, 36210119 - 36210299
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  ||| |    
T  36210119 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcataa-atgttc 36210217  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  36210218 c-ttcaagataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 36210299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 17198211 - 17198278
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17198211 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 17198278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 19242235 - 19242089
Alignment:
Q  274 acaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 373  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |||| |||||| |||||| |||||||  | ||  |||| ||||| ||| |||||||||| |||    
T  19242235 acaagacaagataacagctctgcctgcagaaat-gttcctt-caagataggaatggatttgaacttgatcattcataggacaacatccaaatcaggaaaa 19242138  T
Q  374 ggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  19242137 agatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtgct 19242089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 16819165 - 16819230
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819165 tcatcagaagcagaag-tcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 16819230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 25651182 - 25651235
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  25651182 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgctacaagacaaga 25651235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10692884 - 10692812
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10692884 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 10692812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10906650 - 10906578
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10906650 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 10906578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 14604985 - 14605057
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14604985 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 14605057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1672422 - 1672368
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  1672422 aagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtctacgctacaaaacaaga 1672368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1674897 - 1674843
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  1674897 aagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtctacgctacaaaacaaga 1674843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 8997071 - 8997136
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8997071 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 8997136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19244047 - 19244002
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19244047 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctg 19244002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8105667 - 8105599
Alignment:
Q  234 tgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  8105667 tgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgctacaagataagaaaaacagctctgcctgca 8105599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 9751618 - 9751690
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9751618 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 9751690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 282
Target Start/End: Original strand, 56533140 - 56533191
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaa 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  56533140 aagtgtacaaccactacttccactactctgttttgtctctgctacaagacaa 56533191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16853536 - 16853482
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  16853536 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 16853482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29121403 - 29121370
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29121403 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 29121370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 54679963 - 54679930
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679963 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 54679930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6517518 - 6517446
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  6517518 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 6517446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6641717 - 6641685
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6641717 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 6641685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 10661240 - 10661280
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10661240 agtacaattgtacaaccactatctccactactctgttttgt 10661280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 10875385 - 10875425
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10875385 agtacaattgtacaaccactatctccactactctgttttgt 10875425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 17398752 - 17398824
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  17398752 aagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 17398824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 81
Target Start/End: Original strand, 18006907 - 18006939
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18006907 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 18006939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19244213 - 19244181
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19244213 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 19244181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22190879 - 22190807
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagac-aagacaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  22190879 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaagataacagctctgcctgca 22190807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23509551 - 23509519
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509551 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 23509519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45833427 - 45833393
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttg 265  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45833427 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttg 45833393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 3105497 - 3105530
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3105497 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 3105530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 42
Target Start/End: Original strand, 8182665 - 8182694
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8182665 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 8182694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 46
Target Start/End: Original strand, 8997054 - 8997087
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtt 46  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8997054 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtt 8997087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17247277 - 17247244
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17247277 aagtgtacaaccactgcctccactactctgtttt 17247244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 22675598 - 22675631
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22675598 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttt 22675631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 37435613 - 37435646
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37435613 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttt 37435646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3395623 - 3395551
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  3395623 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 3395551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19884735 - 19884663
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  19884735 aagtgtacaaccactatctccactaatctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 19884663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 19911959 - 19911991
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19911959 aagtgtacaaccactacctccactactcagttt 19911991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20977490 - 20977418
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20977490 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 20977418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 39419812 - 39419884
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  39419812 aagtgtacaaccactacttccattactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 39419884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 164)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 10754397 - 10754814
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10754397 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 10754496  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10754497 agtagctgtttcttatttcaaccttatcta-gaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcatttgtcctacgtta 10754595  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10754596 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 10754695  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  10754696 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaatgatttcaaacgactct 10754794  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10754795 ttagacgtgctgattatctc 10754814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 34782760 - 34783177
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34782760 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 34782858  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34782859 agtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgtta 34782958  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34782959 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcc 34783058  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34783059 -ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 34783157  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34783158 ttagacgtgctgattatctc 34783177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 34771815 - 34772232
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34771815 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 34771913  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34771914 agtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgtta 34772013  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34772014 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcc 34772113  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34772114 -ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 34772212  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  34772213 ttagacgtgatgattatctc 34772232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 20797599 - 20798017
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20797599 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaagattt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 20797697  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20797698 agtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgtta 20797797  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20797798 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctgcaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 20797897  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  20797898 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactc 20797996  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  20797997 tttagacgtgctaattatctc 20798017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43044028 - 43043610
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  43044028 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaattcgtatattcaaactgaagatccaa 43043930  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43043929 agtagttgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgtta 43043830  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043829 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 43043730  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  43043729 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactc 43043631  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  43043630 tttagacgtgctaattatctc 43043610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 8521745 - 8522162
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8521745 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaagttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 8521843  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  8521844 agtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggatagcgctgatcatttgtccttcgtta 8521943  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8521944 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 8522043  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8522044 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtgaatgatcaaatgatttcaaacgactct 8522142  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  8522143 ttagacgtgctaattatctc 8522162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 42394884 - 42395300
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42394884 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 42394982  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42394983 agtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcgctgagcatttgtccttcgtta 42395082  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42395083 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacta-tctgttttgtccacactacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 42395181  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42395182 -ttcaagatggaaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 42395280  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  42395281 ttagacgtgctaattatctc 42395300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24926496 - 24926079
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24926496 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 24926398  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  24926397 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaaaggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 24926298  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24926297 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacacctatgcctgcagaatttgtgcc 24926198  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24926197 -ttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 24926099  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  24926098 ttagacgtgctaatcatctc 24926079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 36084365 - 36084782
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  36084365 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaatatccaa 36084463  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  36084464 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 36084563  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084564 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacatgacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 36084663  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36084664 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 36084762  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  36084763 ttagacgtgctaatcatctc 36084782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24983777 - 24983360
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24983777 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 24983679  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||    
T  24983678 agtagctgtttctcatttcaaccttatttaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcatta 24983579  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24983578 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgcc 24983479  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24983478 -ttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 24983380  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  24983379 ttagacgtgctaatcatctc 24983360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 14 - 432
Target Start/End: Original strand, 36228644 - 36229060
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36228644 catcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaa 36228742  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  36228743 gtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgtaagggaggtatcaacggtcatttggataacactgagtatttgtccttcgttaa 36228842  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36228843 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgccacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc- 36228941  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36228942 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctt 36229041  T
Q  414 tagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||| || |||||    
T  36229042 tagacgtgctaatcatctc 36229060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1109502 - 1109085
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1109502 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 1109404  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  1109403 agtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgtta 1109304  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1109303 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcc 1109204  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1109203 -ttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 1109105  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  1109104 ttagacgtgctaattatctc 1109085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1122260 - 1121843
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1122260 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 1122162  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  1122161 agtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaatgtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgtta 1122062  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1122061 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcc 1121962  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1121961 -ttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 1121863  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  1121862 ttagacgtgctaattatctc 1121843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30070262 - 30069845
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  30070262 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcttcaccagaagctacatttgatccattaat-caaactgaagatccaa 30070165  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  30070164 agtagctggttctcaattcagtcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccttcgttg 30070065  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30070064 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 30069965  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30069964 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcataggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactc 30069866  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30069865 tttagacgtgctgattatctc 30069845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 20551719 - 20552136
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||    
T  20551719 tcatcagaagcagaagctcatcagaagagaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactaaagatccaa 20551817  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  20551818 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 20551917  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20551918 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctattttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgcc 20552017  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  20552018 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaatgatttcaaacaactct 20552116  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||| |||| || |||||    
T  20552117 ttagacttgctaatcatctc 20552136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 23406350 - 23406767
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||| || || || | || |||||||||||||||||||    
T  23406350 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgtaatcatcaccagaagcttcaattgattcgtaaattcaaactgaagatccaa 23406448  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  23406449 agtagctatttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 23406548  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406549 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaatacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 23406648  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23406649 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 23406747  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  23406748 ttagacgtgctaatcatctc 23406767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 31448456 - 31448875
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31448456 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaa 31448554  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  31448555 agtagctatttatcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccttggtta 31448654  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg--ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31448655 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtg 31448754  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31448755 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 31448853  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  31448854 ctttagacgtgctaattatctc 31448875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 31418565 - 31418984
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  31418565 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatctgtatattcaaactaaagatccaa 31418663  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  31418664 agtagctgtttctcaattcaatattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcattgagcatttgtccttcgtta 31418763  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg--ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31418764 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttatg 31418863  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31418864 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 31418962  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  31418963 ctttagacgtgctaattatctc 31418984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Original strand, 19477908 - 19478312
Alignment:
Q  16 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||||||||    
T  19477908 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcaacaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagt 19478006  T
Q  116 agctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  19478007 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 19478106  T
Q  216 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19478107 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacgtccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc-t 19478205  T
Q  315 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactcttt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  || |||||||||||    
T  19478206 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 19478304  T
Q  415 agacgtgc 422  Q
    ||||||||    
T  19478305 agacgtgc 19478312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Original strand, 19463878 - 19464282
Alignment:
Q  16 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagt 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||||||||    
T  19463878 tcagaagcagaaggtcatcaaaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcaacaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagt 19463976  T
Q  116 agctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  19463977 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 19464076  T
Q  216 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19464077 aagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacgtccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc-t 19464175  T
Q  315 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactcttt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  || |||||||||||    
T  19464176 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 19464274  T
Q  415 agacgtgc 422  Q
    ||||||||    
T  19464275 agacgtgc 19464282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17457668 - 17457261
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  17457668 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttgatccgtaaattcaaactgaagatccaa 17457570  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  17457569 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcgtta 17457470  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |    
T  17457469 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtatacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttc 17457371  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  17457370 c-ttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 17457273  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  17457272 tttagacgtgct 17457261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 20562244 - 20562646
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  20562244 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaa 20562342  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  20562343 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttttccttcgtta 20562442  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||                   
T  20562443 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccatgctacaagacaagacaacagctatgcc--------------- 20562527  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  20562528 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaatgatttcaaacaactct 20562626  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||| |||| || |||||    
T  20562627 ttagacttgctaatcatctc 20562646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 21706333 - 21705924
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||  || | |||||||||||||| ||    
T  21706333 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattca 21706235  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | | ||||| | ||||||||||||    
T  21706234 aagtagttgtttctcattccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacactgagtatttgtccttcgtt 21706135  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21706134 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 21706035  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  21706034 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 21705937  T
Q  411 ctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||    
T  21705936 ctttagacgtgct 21705924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17447052 - 17446645
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  17447052 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacatttgatccgtaaattcaaactgaagatccaa 17446954  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  17446953 agtagctgtttctcatttcaacctcgtataagaaaaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcgtta 17446854  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |    
T  17446853 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttc 17446755  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  17446754 c-ttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 17446657  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  17446656 tttagacgtgct 17446645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43622227 - 43621854
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtt---------tctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactg 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  43622227 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactg 43622128  T
Q  104 aagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcattt-ggatagctctgagcagttg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||    
T  43622127 aagatccaaagtagctgtttctcatttcagcactatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattttggatagcactgagtatttg 43622028  T
Q  203 tccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622027 tccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcag 43621928  T
Q  303 aatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 377  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621927 aatttgtgcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 43621854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27623124 - 27622705
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  27623124 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 27623026  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  27623025 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 27622926  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  27622925 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgt- 27622827  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27622826 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 27622727  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27622726 ctttagacgtgctgattatctc 27622705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5290933 - 5290514
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  5290933 tcattagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 5290835  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  5290834 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 5290735  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  5290734 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgt- 5290636  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5290635 acgttcaagatggtaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 5290536  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5290535 ctttagacgtgctgattatctc 5290514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 29 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 21703470 - 21703077
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatccaaagtagctgtttctca 127  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21703470 gtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttctca 21703372  T
Q  128 tttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaag 227  Q
    || ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | | || || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703371 ttccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacactaagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaag 21703272  T
Q  228 tacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21703271 tacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt-caagatgggaa 21703173  T
Q  327 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  21703172 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct 21703077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 22146424 - 22146843
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  22146424 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 22146522  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  22146523 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 22146622  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  22146623 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 22146722  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  22146723 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 22146821  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22146822 ctttagacgtgctgattatctc 22146843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 22157007 - 22157426
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  22157007 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 22157105  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  22157106 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 22157205  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  22157206 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 22157305  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  22157306 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 22157404  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22157405 ctttagacgtgctgattatctc 22157426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7032485 - 7032064
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||| ||||||| |||    
T  7032485 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaattgaagattcaa 7032387  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  7032386 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgagagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 7032287  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt----gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7032286 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttg 7032187  T
Q  309 tgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacga 408  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  7032186 tacgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacga 7032088  T
Q  409 ctctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7032087 ctctttagacgtgctgattatctc 7032064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9377819 - 9377400
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9377819 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9377721  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  9377720 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 9377621  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  9377620 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 9377522  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9377521 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9377422  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9377421 ctttagacgtgctgattatctc 9377400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14558374 - 14557955
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  14558374 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 14558276  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  14558275 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 14558176  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  14558175 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 14558077  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  14558076 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 14557977  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14557976 ctttagacgtgctgattatctc 14557955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14569011 - 14568592
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  14569011 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 14568913  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  14568912 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 14568813  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  14568812 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 14568714  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  14568713 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 14568614  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14568613 ctttagacgtgctgattatctc 14568592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16004248 - 16003829
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  16004248 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 16004150  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||| |||||  ||||||    
T  16004149 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagcacttgtctctcgtta 16004050  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  16004049 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 16003950  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  16003949 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 16003851  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16003850 ctttagacgtgctgattatctc 16003829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 23306748 - 23307167
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  23306748 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 23306846  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  23306847 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 23306946  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  23306947 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 23307045  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  23307046 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 23307145  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23307146 ctttagacgtgctgattatctc 23307167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24817243 - 24816824
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  24817243 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 24817145  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  24817144 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 24817045  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  24817044 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 24816946  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24816945 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24816846  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24816845 ctttagacgtgctgattatctc 24816824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24827831 - 24827412
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  24827831 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 24827733  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  24827732 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 24827633  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  24827632 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 24827534  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24827533 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24827434  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24827433 ctttagacgtgctgattatctc 24827412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27603775 - 27603356
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  27603775 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccataagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 27603677  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  27603676 agtagctgattctcaattcagtcttattcaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 27603577  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  27603576 atagagttgacaaagtacaagtatacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgta 27603477  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27603476 cgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 27603378  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27603377 ctttagacgtgctgattatctc 27603356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 31843862 - 31844281
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  31843862 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagaaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 31843960  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  31843961 agtagctgattctcaattcagtcctatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 31844060  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  31844061 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 31844160  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  31844161 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 31844259  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31844260 ctttagacgtgctgattatctc 31844281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 6130692 - 6131111
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||| ||||| |||    
T  6130692 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactaaagattcaa 6130790  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  6130791 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 6130890  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  6130891 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 6130989  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6130990 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 6131089  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6131090 ctttagacgtgctgattatctc 6131111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 6975711 - 6976130
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  6975711 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 6975809  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  6975810 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 6975909  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  6975910 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 6976009  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6976010 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 6976108  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6976109 ctttagacgtgctgattatctc 6976130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 23296180 - 23296599
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  23296180 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 23296278  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  23296279 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 23296378  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  23296379 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 23296477  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  23296478 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaatgactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 23296577  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23296578 ctttagacgtgctgattatctc 23296599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 39352391 - 39352810
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  39352391 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaa 39352489  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  39352490 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 39352589  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  39352590 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 39352688  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||    
T  39352689 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaagaatttcaaacgact 39352788  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39352789 ctttagacgtgctgattatctc 39352810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 40390260 - 40390679
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  40390260 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcgtcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 40390358  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| || |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||| |||||  |||| |    
T  40390359 agtagctgattctcaatttagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagcaattgtctctcgtaa 40390458  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  40390459 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 40390558  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  40390559 cgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 40390657  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40390658 ctttagacgtgctgattatctc 40390679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 40400922 - 40401341
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  40400922 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcgtcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaa 40401020  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  |||| |    
T  40401021 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtaa 40401120  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||     
T  40401121 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgt- 40401219  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  40401220 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 40401319  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40401320 ctttagacgtgctgattatctc 40401341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 34062524 - 34062931
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| || | |||||||||||||| ||    
T  34062524 tcatcagaagcagaaggtcat-agaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaaattcaaactgaagattca 34062621  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||| |||||  |||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| | ||||||||||||    
T  34062622 aagtagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagtacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcgtt 34062721  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||     
T  34062722 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgtt 34062820  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  34062821 cc-ttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 34062918  T
Q  411 ctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||    
T  34062919 ctttagacgtgct 34062931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 23362013 - 23362433
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  23362013 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 23362111  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  23362112 agtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaataaatggatagcactgagcacttgtctctcatta 23362211  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  23362212 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 23362310  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc-aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  23362311 tcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 23362410  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23362411 tctttagacgtgctgattatctc 23362433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 6986201 - 6986620
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||||||  ||    
T  6986201 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagatttaa 6986299  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  6986300 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 6986399  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  6986400 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 6986499  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6986500 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 6986598  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6986599 ctttagacgtgctgattatctc 6986620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15993686 - 15993267
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  15993686 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 15993588  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||| ||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  15993587 agtaactgattttcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 15993488  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  15993487 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactaatctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 15993388  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15993387 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 15993289  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15993288 ctttagacgtgctgattatctc 15993267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36582915 - 36582496
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  36582915 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 36582817  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||||| |||| || |||||  || |||    
T  36582816 agtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgaccacttgtctctcatta 36582717  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  36582716 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtt 36582617  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36582616 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 36582518  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36582517 ctttagacgtgctgattatctc 36582496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36593470 - 36593051
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  36593470 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 36593372  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||||| |||| || |||||  || |||    
T  36593371 agtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgaccacttgtctctcatta 36593272  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  36593271 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtt 36593172  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36593171 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 36593073  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36593072 ctttagacgtgctgattatctc 36593051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9335859 - 9336277
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9335859 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9335957  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  9335958 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 9336057  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  9336058 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 9336155  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9336156 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9336255  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9336256 ctttagacgtgctgattatctc 9336277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9346446 - 9346864
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9346446 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9346544  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  9346545 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 9346644  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg--ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  9346645 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 9346742  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9346743 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9346842  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9346843 ctttagacgtgctgattatctc 9346864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 14029947 - 14030366
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  14029947 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 14030045  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  14030046 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 14030145  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  14030146 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 14030245  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  14030246 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 14030344  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14030345 ctttagacgtgctgattatctc 14030366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 14040500 - 14040919
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  14040500 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 14040598  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  14040599 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 14040698  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  14040699 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 14040798  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  14040799 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 14040897  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14040898 ctttagacgtgctgattatctc 14040919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 15739870 - 15740290
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  15739870 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 15739968  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  15739969 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 15740068  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  15740069 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 15740168  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15740169 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 15740268  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15740269 ctttagacgtgctgattatctc 15740290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 15769030 - 15769450
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  15769030 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 15769128  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  15769129 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 15769228  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  15769229 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 15769328  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15769329 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 15769428  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15769429 ctttagacgtgctgattatctc 15769450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Original strand, 22559376 - 22559759
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||    
T  22559376 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagatttaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaaga 22559474  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || ||| |||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22559475 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggttagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 22559574  T
Q  249 tccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 346  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22559575 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacctt-caagatgggaatgaatttgaagcttattctt 22559673  T
Q  347 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22559674 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 22559759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 24807816 - 24808234
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||| ||||| |||    
T  24807816 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactcaagattcaa 24807914  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  24807915 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 24808014  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  24808015 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 24808112  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24808113 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24808212  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24808213 ctttagacgtgctgattatctc 24808234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 432
Target Start/End: Original strand, 27203712 - 27204115
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  27203712 gtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagtagctgattctcaa 27203810  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27203811 ttcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagt 27203910  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  27203911 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt-acactcaagatgggaa 27204009  T
Q  327 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgat 426  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27204010 tgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgat 27204109  T
Q  427 tatctc 432  Q
    ||||||    
T  27204110 tatctc 27204115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 27460064 - 27460483
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  27460064 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 27460162  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  27460163 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagagaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 27460262  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  27460263 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 27460362  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  27460363 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 27460461  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27460462 ctttagacgtgctgattatctc 27460483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 27470463 - 27470882
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  27470463 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 27470561  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  27470562 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagagaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 27470661  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  27470662 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 27470761  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  27470762 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 27470860  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27470861 ctttagacgtgctgattatctc 27470882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15694388 - 15693970
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  15694388 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 15694290  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  15694289 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 15694190  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  15694189 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 15694092  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15694091 acactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 15693992  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15693991 ctttagacgtgctgattatctc 15693970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 22676019 - 22676438
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  22676019 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 22676117  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| |||| |  |||||  ||||||    
T  22676118 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaactcttgtctctcgtta 22676217  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  22676218 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 22676317  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  22676318 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 22676416  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22676417 ctttagacgtgctgattatctc 22676438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 22685910 - 22686329
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  22685910 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 22686008  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| |||| |  |||||  ||||||    
T  22686009 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaactcttgtctctcgtta 22686108  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  22686109 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 22686208  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  22686209 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 22686307  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22686308 ctttagacgtgctgattatctc 22686329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 24566993 - 24567411
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  24566993 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 24567091  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  24567092 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 24567191  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  24567192 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 24567289  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24567290 acactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24567389  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24567390 ctttagacgtgctgattatctc 24567411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27042569 - 27042150
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  27042569 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatccttt-agtcaaactgaagattcaa 27042471  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  27042470 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 27042371  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  27042370 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccaccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 27042271  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  27042270 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 27042172  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27042171 ctttagacgtgctgattatctc 27042150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 35225992 - 35226412
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  35225992 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 35226090  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  35226091 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatta 35226190  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  35226191 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 35226290  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  35226291 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 35226390  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35226391 ctttagacgtgctgattatctc 35226412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 42042688 - 42043106
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  42042688 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 42042786  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||  |||||  ||||||    
T  42042787 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgtta 42042886  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  42042887 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 42042984  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  42042985 acactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 42043084  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42043085 ctttagacgtgctgattatctc 42043106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 42053263 - 42053681
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  42053263 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 42053361  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||  |||||  ||||||    
T  42053362 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgtta 42053461  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  42053462 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 42053559  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  42053560 acactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 42053659  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42053660 ctttagacgtgctgattatctc 42053681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 34051863 - 34052270
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| || | |||||||||||||| ||    
T  34051863 tcatcagaagcagaaggtcat-agaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaaattcaaactgaagattca 34051960  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| | ||||||||| ||    
T  34051961 aagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagtacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcatt 34052060  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||     
T  34052061 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactagtctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgtt 34052159  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  34052160 cc-ttcaagttggaaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 34052257  T
Q  411 ctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||    
T  34052258 ctttagacgtgct 34052270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 23707346 - 23707764
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  23707346 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaatcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 23707444  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  23707445 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 23707544  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  23707545 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 23707642  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  23707643 acactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 23707742  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23707743 ctttagacgtgctgattatctc 23707764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 35215408 - 35215828
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || || ||||||||| |||    
T  35215408 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-catactgaagattcaa 35215506  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  35215507 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatta 35215606  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  35215607 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 35215706  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  35215707 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 35215806  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35215807 ctttagacgtgctgattatctc 35215828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27053194 - 27052774
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  27053194 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatccttt-agtcaaactgaagattcaa 27053096  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  27053095 agttgctgattctcaattcattcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 27052996  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgt-acaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27052995 atagagttgacaaagtacaagtgttacaaccactaccaccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 27052896  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  27052895 acact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 27052797  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27052796 tctttagacgtgctgattatctc 27052774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30227854 - 30227436
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  30227854 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaatcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 30227756  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||  |||||  ||||||    
T  30227755 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgtta 30227656  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  30227655 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 30227558  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  30227557 acactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 30227458  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30227457 ctttagacgtgctgattatctc 30227436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30238381 - 30237963
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  30238381 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaatcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 30238283  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||  |||||  ||||||    
T  30238282 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgtta 30238183  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  30238182 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 30238085  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  30238084 acactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 30237985  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30237984 ctttagacgtgctgattatctc 30237963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14447340 - 14446937
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  14447340 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tgtaatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 14447242  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  14447241 tcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggacatatggaaagcactgagcacttgtctctctttaatagagttgacaaagta 14447142  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  14447141 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 14447042  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14447041 gaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 14446942  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  14446941 atctc 14446937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14457952 - 14457549
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  14457952 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tgtaatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 14457854  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  14457853 tcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggacatatggaaagcactgagcacttgtctctctttaatagagttgacaaagta 14457754  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  14457753 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 14457654  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14457653 gaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 14457554  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  14457553 atctc 14457549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40514330 - 40513927
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  40514330 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 40514232  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  40514231 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 40514132  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  40514131 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 40514032  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40514031 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 40513932  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  40513931 atctc 40513927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39502495 - 39502078
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagca--aagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |    
T  39502495 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagt----catcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattc 39502401  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||    
T  39502400 aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgt 39502301  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39502300 taatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttg 39502201  T
Q  309 tgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacga 408  Q
    | |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  39502200 tacact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacga 39502102  T
Q  409 ctctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39502101 ctctttagacgtgctgattatctc 39502078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5301493 - 5301085
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  5301493 gtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagtagctgattctcaa 5301395  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| ||||   ||||||| |||| |||||||||    
T  5301394 ttcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtttctcgttaatagagctgacaaagt 5301295  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgct-----acaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||     |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  | ||||||||    
T  5301294 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaagacaacagccatgccagcagaagttgt-acgttcaagat 5301196  T
Q  322 gggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtg 421  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5301195 gggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 5301096  T
Q  422 ctgattatctc 432  Q
    |||||||||||    
T  5301095 ctgattatctc 5301085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 17718821 - 17719241
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  17718821 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatccttt-agtcaaactgaagattcaa 17718919  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || |||    
T  17718920 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcatta 17719019  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  17719020 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 17719119  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  17719120 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 17719219  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17719220 ctttagacgtgctgattatctc 17719241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 17729473 - 17729893
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  17729473 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatccttt-agtcaaactgaagattcaa 17729571  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || |||    
T  17729572 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcatta 17729671  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  17729672 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 17729771  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  17729772 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 17729871  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17729872 ctttagacgtgctgattatctc 17729893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33952141 - 33951738
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  33952141 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 33952043  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  33952042 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 33951943  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |   |||||||||||||    
T  33951942 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcccgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 33951843  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33951842 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 33951743  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  33951742 atctc 33951738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39491271 - 39490888
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||    
T  39491271 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 39491173  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    || |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39491172 acaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 39491073  T
Q  249 tccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 346  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39491072 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacact-caagatgggaatgaatttgaagtttattctt 39490974  T
Q  347 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39490973 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 39490888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 20624670 - 20625075
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  || ||| ||||||| ||| |||    
T  20624670 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcacaatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtaatcagtaaatttaaactgacgattcaa 20624767  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || ||| |||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||| | | |||||||||||||    
T  20624768 aggagcagtttttcgtttcaacctcatctaag-agaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaggcactgggtacttgtccttcgtta 20624866  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |    
T  20624867 tcagagttgataaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaacagctatgcctgcagaaat-gttc 20624965  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  20624966 ctt-caagatgagaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 20625063  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  20625064 tttagacgtgct 20625075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 421
Target Start/End: Original strand, 37406559 - 37406957
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  37406559 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaacatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 37406657  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| |||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||       | | ||||| | |||||||||||||    
T  37406658 agtagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca-------aacactgagtacttgtccttcgtta 37406750  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  37406751 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagttatgcctgcagaatt-gttc 37406849  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  || ||||||||    
T  37406850 ctt-caagatgagaattaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactc 37406947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 432
Target Start/End: Original strand, 36687602 - 36688018
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | || |||| |  || |||||||||||   |||    
T  36687602 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaacttgatcctttaat-caaactgaagag--aaa 36687698  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    || |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || ||||    
T  36687699 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaa 36687798  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  36687799 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 36687898  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
      | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  36687899 act-caagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactc 36687997  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36687998 tttagacgtgctgattatctc 36688018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 432
Target Start/End: Original strand, 36698168 - 36698584
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | || |||| |  || |||||||||||   |||    
T  36698168 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaacttgatcctttaat-caaactgaagag--aaa 36698264  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    || |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || ||||    
T  36698265 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaa 36698364  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  36698365 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 36698464  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
      | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  36698465 act-caagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactc 36698563  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36698564 tttagacgtgctgattatctc 36698584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 23372414 - 23372836
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  23372414 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 23372512  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  23372513 agtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaataaatggatagcactgagcacttgtctctcatta 23372612  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaa-ccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||  | |||||      
T  23372613 atagagttgacaaagtacaagtgtacaacccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagaaaaaacaacagccatgcctcaaaaattttg 23372712  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc-aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacga 408  Q
      |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  23372713 ttcactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaaggactacccccaaatcaggcaaaggaacactggtggataatcaaaggatttcaaacga 23372812  T
Q  409 ctctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  23372813 ctctttagacgggctgattatctc 23372836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 295
Target Start/End: Original strand, 23392620 - 23392901
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||| | || || || | || |||||||||||||||||||    
T  23392620 tcatcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgtaatcatcaccagaagtttcaattgattcgtaaattcaaactgaagatccaa 23392718  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  23392719 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaaaggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 23392818  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23392819 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 23392901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 106023 - 106429
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc-aaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || |||  ||||||||||| ||    
T  106023 tcatcagaagcagaagagcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaattttaaactgaagattca 106120  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||  |||||||| || |||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||    
T  106121 aatgagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgtt 106219  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||     
T  106220 atcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgtagaa-atgtt 106318  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  106319 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 106416  T
Q  411 ctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||    
T  106417 ctttagacgtgct 106429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Original strand, 17607002 - 17607383
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||| |  || |||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||    
T  17607002 tcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctttaat-caaactgaagag--aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 17607098  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607099 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 17607198  T
Q  249 tccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 346  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | || |||    
T  17607199 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacact-caagatgggaatgaatttgaagtttatcctt 17607297  T
Q  347 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607298 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 17607383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Original strand, 17617616 - 17617997
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||| |  || |||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||    
T  17617616 tcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctttaat-caaactgaagag--aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 17617712  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17617713 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 17617812  T
Q  249 tccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 346  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | || |||    
T  17617813 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacact-caagatgggaatgaatttgaagtttatcctt 17617911  T
Q  347 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17617912 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 17617997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Original strand, 31348476 - 31348857
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||| |  || |||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||    
T  31348476 tcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctttaat-caaactgaagag--aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 31348572  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31348573 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 31348672  T
Q  249 tccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 346  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | || |||    
T  31348673 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacact-caagatgggaatgaatttgaagtttatcctt 31348771  T
Q  347 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31348772 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 31348857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Original strand, 31359090 - 31359471
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||| |  || |||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||    
T  31359090 tcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctttaat-caaactgaagag--aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 31359186  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359187 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 31359286  T
Q  249 tccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 346  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | || |||    
T  31359287 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacact-caagatgggaatgaatttgaagtttatcctt 31359385  T
Q  347 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359386 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 31359471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21414552 - 21414197
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  21414552 catcagaagtagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaacctatatcatcaccagaagctacaattgttcagtaaatttaaactgaagattcaaa 21414455  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    | |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||| | | |||||||||||||     
T  21414454 ggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaaaagcactgggtaattgtccttcgttat 21414356  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  21414355 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 21414257  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 373  Q
     |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21414256 -ttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 21414197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 135 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 37729488 - 37729195
Alignment:
Q  135 cttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagt 234  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||    
T  37729488 cttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactttgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagt 37729389  T
Q  235 gtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||    
T  37729388 gtacaaccactacctccactattctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatt 37729289  T
Q  333 tgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgat 426  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37729288 tgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgat 37729195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 135 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 37740804 - 37740511
Alignment:
Q  135 cttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagt 234  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||    
T  37740804 cttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactttgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagt 37740705  T
Q  235 gtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||    
T  37740704 gtacaaccactacctccactattctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatt 37740605  T
Q  333 tgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgat 426  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37740604 tgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgat 37740511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Original strand, 39362217 - 39362514
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  39362217 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcccttaat-caaactgaagattcaa 39362315  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  39362316 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 39362415  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39362416 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 39362514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 20416808 - 20417212
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| | |||    
T  20416808 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaa 20416905  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || ||  ||  |  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  20416906 aggagctgtttttcgttctaatatcgtctaagaa-aacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 20417004  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  20417005 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 20417102  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  20417103 c-ttcaagagaggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatctaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 20417200  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  20417201 tttagacgtgct 20417212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 31815066 - 31815316
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  31815066 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagaaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 31815164  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| || |||||| ||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  31815165 agtagttgattctcaattcagtcctatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 31815264  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31815265 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 31815316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 32754167 - 32753895
Alignment:
Q  148 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  ||     | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32754167 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatgctcgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 32754069  T
Q  248 ctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 346  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  32754068 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctctgcctgcagaaat-gttcctt-caagataggaatgaatttgaagttaatcctt 32753971  T
Q  347 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  32753970 cataggactacacccaaatcaggaaaaagattaatggtagatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct 32753895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 31833641 - 31833803
Alignment:
Q  269 acgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag 368  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31833641 acgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcag 31833739  T
Q  369 gcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31833740 gcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 31833803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13533967 - 13533761
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  13533967 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttcct 13533869  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  13533868 t-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 13533771  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  13533770 tagacgtgct 13533761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 20167972 - 20168375
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatc-ca 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||   |||||||| ||||| ||| ||    
T  20167972 tcatcagaagcagaag-tcatcagaagcaaagtt---catcagaagctatatcatcaccagaagttatagttgttcagaagattcaatctgaa-atctca 20168066  T
Q  112 aagtagctgtttctc-atttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||  |||||| |||  |  | |||||  |||||| ||| ||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| |    
T  20168067 aaagagctgtctcttgaagttaacctcgtctaag-agagcgaaggatcaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcat 20168165  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |    
T  20168166 tga-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgtt 20168264  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     |||  |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  20168265 ccct--caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 20168361  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||    
T  20168362 tctttagacgtgct 20168375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 314 - 432
Target Start/End: Original strand, 39364685 - 39364803
Alignment:
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39364685 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 39364784  T
Q  414 tagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39364785 tagacgtgctgattatctc 39364803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13523240 - 13523034
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  13523240 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttcct 13523142  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  13523141 t-caagataggaatgaatttgaagttgatctttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 13523044  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  13523043 tagacgtgct 13523034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 36095755 - 36095960
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |||    
T  36095755 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaaaatt-gttcct 36095853  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | || ||||| ||||    
T  36095854 t-caagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg-tctc-aacgaatctt 36095950  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  36095951 tagacgtgct 36095960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 36097212 - 36097417
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |||    
T  36097212 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaaaatt-gttcct 36097310  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | || ||||| ||||    
T  36097311 t-caagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg-tctc-aacgaatctt 36097407  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  36097408 tagacgtgct 36097417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 35543231 - 35543437
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  | ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  35543231 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcgacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaatt-gttcct 35543329  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | ||||||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||  || ||||||||||    
T  35543330 t-caagatatgaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattacttgtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 35543427  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  35543428 tagacgtgct 35543437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 150
Target Start/End: Original strand, 21519963 - 21520099
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||| |||| |||    
T  21519963 tcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaa 21520061  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaac 150  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  21520062 agtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaac 21520099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 1915469 - 1915262
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | || ||    
T  1915469 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacaactctgcctgcagaaat-gttcc 1915371  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
    || |||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |  | || |||||||||    
T  1915370 tt-caagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaaggtttctc-aacgactct 1915273  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    || ||||||||    
T  1915272 tttgacgtgct 1915262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 40228710 - 40228504
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  40228710 agagctgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccatgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 40228613  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| || || |||||  ||||||| |  | || ||||||||||    
T  40228612 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagaccattggtatttgatcaaggtttctc-aacgactctt 40228514  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    | ||||||||    
T  40228513 ttgacgtgct 40228504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13405167 - 13404989
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  13405167 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 13405070  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
    |||||||  |||||| |||||||  | || |||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  13405069 ttcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcattggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 13404989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 315 - 429
Target Start/End: Original strand, 23696988 - 23697103
Alignment:
Q  315 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaa-ggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||    
T  23696988 tcaagatgggaaggaatttgaaggtttttctttaaaaggactccacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattcaaaacgactctt 23697087  T
Q  414 tagacgtgctgattat 429  Q
    ||||||||||||||||    
T  23697088 tagacgtgctgattat 23697103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Original strand, 20215201 - 20215372
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | || |    
T  20215201 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaat-gttc 20215299  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggta 385  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  20215300 ctt-caagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggta 20215372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23478421 - 23478251
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||  ||| |    
T  23478421 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgtagaa-atgttc 23478323  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23478322 c-ttcaagataggaatggatttgaatgtgatccttcttaggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggt 23478251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 40032855 - 40033058
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | || |||    
T  40032855 agagttgacaaagta---gtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcttgcagaaat-gttcct 40032950  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |  | || ||||||||||    
T  40032951 t-caagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaaggtttctc-aacgactctt 40033048  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    | ||||||||    
T  40033049 ttgacgtgct 40033058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 373
Target Start/End: Original strand, 11208087 - 11208229
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatg 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| || ||||| ||  |||||    
T  11208087 aagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcc-ttcaaaataagaatg 11208184  T
Q  329 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 373  Q
     |||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  11208185 gatttgaacttaattcttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 11208229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 304
Target Start/End: Original strand, 25111966 - 25112055
Alignment:
Q  218 gttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  25111966 gttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 25112055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 304
Target Start/End: Original strand, 25171057 - 25171146
Alignment:
Q  218 gttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  25171057 gttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 25171146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15517004 - 15516933
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  15517004 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 15516933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 25096928 - 25096999
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25096928 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgcaacaagacaagaataacagctatgcctgca 25096999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 25154898 - 25154969
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25154898 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgcaacaagacaagaataacagctatgcctgca 25154969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30743015 - 30742962
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  30743015 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgctacaagacaaga 30742962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 42243715 - 42243662
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  42243715 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgctacaagacaaga 42243662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32160801 - 32160648
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatg 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |  | ||||  |  || ||||||    
T  32160801 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttatgtctacgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccctt--agaataggaatg 32160704  T
Q  329 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
     |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  32160703 gatttgaacttgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggt 32160648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26759184 - 26759113
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  26759184 aagtgtacaaccactacctccactactctattttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 26759113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26765533 - 26765462
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  26765533 aagtgtacaaccactgcctccactactctgttttgtctcagctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 26765462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4887057 - 4886985
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  4887057 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 4886985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33933302 - 33933230
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  33933302 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 33933230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20550930 - 20550876
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  20550930 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 20550876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 35543032 - 35543098
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35543032 tcatcagaagcaagatttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 35543098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 36095557 - 36095622
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36095557 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccggaagctaca 36095622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 36097014 - 36097079
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36097014 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccggaagctaca 36097079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 7745795 - 7745867
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7745795 aagtgtacaaccactacctccactactcggtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 7745867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10848808 - 10848736
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  10848808 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 10848736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11993923 - 11993851
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  11993923 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaaaacaagaaaaacagctatgcctgca 11993851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16607552 - 16607512
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16607552 agtacaagtgtacaaccactatctccactactctgctttgt 16607512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28139642 - 28139570
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  28139642 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 28139570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9089004 - 9088950
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  9089004 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 9088950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 14086641 - 14086695
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  14086641 aagtgtacaaccgctacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 14086695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 29138508 - 29138562
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  29138508 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttgtgtctctgctacaagacaaga 29138562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 32754303 - 32754237
Alignment:
Q  12 atcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32754303 atcatcagaagca-aagtccatcagaagcaacatttc--atcagaagctgtatcatcaccagaagctaca 32754237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33022699 - 33022645
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||    
T  33022699 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgctacaagacaaga 33022645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 37778668 - 37778568
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  37778668 tcatcagaagcaatattt-tcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 37778571  T
Q  130 tca 132  Q
    |||    
T  37778570 tca 37778568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 13523455 - 13523422
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtt 46  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13523455 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtt 13523422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 13534182 - 13534149
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtt 46  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13534182 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtt 13534149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 42
Target Start/End: Original strand, 22559359 - 22559388
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22559359 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 22559388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 258
Target Start/End: Original strand, 26119922 - 26119959
Alignment:
Q  221 gacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 258  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26119922 gacatagtacaattgtacaaccactacctccactactc 26119959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 301
Target Start/End: Original strand, 30115942 - 30116011
Alignment:
Q  234 tgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30115942 tgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 30116011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 46
Target Start/End: Original strand, 35542999 - 35543032
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtt 46  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35542999 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtt 35543032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 35932108 - 35932141
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35932108 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttt 35932141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 89524 - 89596
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  89524 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 89596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 266
Target Start/End: Original strand, 2153017 - 2153049
Alignment:
Q  234 tgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2153017 tgtacaaccactatctccactactctgttttgt 2153049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13523405 - 13523349
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||||||| |||||    
T  13523405 tcatcagaagctatatcatcaccagaagatacagttgatcagaagattcaatctgaa 13523349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13534132 - 13534076
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaa 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||    
T  13534132 tcatcataagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatctgaa 13534076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 21099806 - 21099838
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21099806 aagtgtacaaccactacctccactactcagttt 21099838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 23413076 - 23413148
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagac-aagacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  23413076 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaaaataacagctatgcctgca 23413148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26784389 - 26784357
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26784389 aagtgtacaaccactacctccactactcagttt 26784357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 35986334 - 35986406
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  35986334 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 35986406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 37778703 - 37778640
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagc 77  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  37778703 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattt-tcatcagaagcaatattttcatcagaagc 37778640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 118)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 15888193 - 15888610
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15888193 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaa 15888291  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15888292 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgtta 15888391  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15888392 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaatttgtgcc 15888491  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15888492 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 15888590  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  15888591 ttagacgtgctaattatctc 15888610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1368065 - 1367648
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  1368065 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaa 1367967  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  1367966 agtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 1367867  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367866 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 1367767  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1367766 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 1367668  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  1367667 ttagacgtgctaattatctc 1367648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 589648 - 589231
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  589648 tcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 589550  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  589549 agtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 589450  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  589449 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctaggcctgcagaatttgtgcc 589350  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  589349 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggatcactggtgattgatcaaaggatttcaaacgactct 589251  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  589250 ttagacgtgctaattatctc 589231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 21769807 - 21770214
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||| ||||||||    
T  21769807 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatacgtaaattcaaactggagatccaa 21769905  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  21769906 agtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 21770005  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21770006 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgcc 21770105  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  21770106 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactct 21770204  T
Q  413 ttagacgtgc 422  Q
    ||||||||||    
T  21770205 ttagacgtgc 21770214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 14745533 - 14745951
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  14745533 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagctatatcatcaccagatgctacatttaattcatttattcaaactgaagatccaa 14745631  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14745632 agtagatgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccttcgtta 14745731  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745732 acagagttgacaaaatacaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 14745831  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14745832 c-ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggagtacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactc 14745930  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14745931 tttagacgtgctgattatctc 14745951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9171421 - 9171004
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||    
T  9171421 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaaaattcaa 9171323  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  9171322 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 9171223  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9171222 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttctgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 9171123  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9171122 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 9171024  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||| |||| || |||||    
T  9171023 ttagacatgctaatcatctc 9171004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20491442 - 20491025
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20491442 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 20491344  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||    
T  20491343 agtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacaacgctgagcatttgtccttcgtta 20491244  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20491243 acagagttgacaaagtacaagtgtacaatcactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgcc 20491144  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20491143 -ttcaagatgagaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 20491045  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  20491044 ttagacgtgctaattatctc 20491025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44280932 - 44280515
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  44280932 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaa 44280834  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  44280833 agtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgtta 44280734  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44280733 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcc 44280634  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44280633 -ttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 44280535  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  44280534 ttagacgtgctaattatctc 44280515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 31116375 - 31116792
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  31116375 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactaaagatccaa 31116473  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  31116474 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactaagtatttgtccttcgtta 31116573  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116574 gcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 31116673  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  31116674 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttc-aacgactc 31116771  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  31116772 tttagacgtgctaatcatctc 31116792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3166170 - 3165753
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3166170 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaa 3166072  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  3166071 agtagttgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgtta 3165972  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3165971 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacaggtatgtctgcagaatttgtgcc 3165872  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3165871 -ttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 3165773  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  3165772 ttagacgtgctaattatctc 3165753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9170620 - 9170203
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||    
T  9170620 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaaaattcaa 9170522  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  9170521 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcantgagtatttgtccttcgtta 9170422  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9170421 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttctgtctacgctacaagacaanacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 9170322  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9170321 -ttcaagatgggaatgaatttnaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaangattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 9170223  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||| |||| || |||||    
T  9170222 ttagacntgctaatcatctc 9170203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9160165 - 9159748
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||    
T  9160165 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaaaattcaa 9160067  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  9160066 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcattgagtatttgtccttcgtta 9159967  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9159966 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttctgtctacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 9159867  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9159866 -ttcaagatgggaatgaatttaaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 9159768  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  9159767 ttagacgtgctaatcatctc 9159748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20990089 - 20989670
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  20990089 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 20989991  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||  ||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  20989990 agtagctgactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcatttgtctctcgtta 20989891  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20989890 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgta 20989791  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20989790 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactgcacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 20989692  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20989691 ctttagacgtgctgattatctc 20989670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 395
Target Start/End: Original strand, 19985678 - 19986058
Alignment:
Q  15 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaa-ctgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |   ||||||| || ||||||||||    
T  19985678 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaatatcttcacccgaagctacatttaatcaagttattcaaaacttaagatccaaa 19985776  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  19985777 gtagttgtttcttaattcaatcttatctaagaggaacgaagaaatgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgaacatttgtccttcgttaa 19985876  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19985877 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgcc 19985976  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaa 395  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19985977 -ttcaagatgggaatgaatttgaagataattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 19986058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 467445 - 467864
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  467445 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 467543  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  467544 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 467643  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  467644 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 467742  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  467743 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 467842  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  467843 ctttagacgtgctgattatctc 467864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9433700 - 9433281
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9433700 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaaacaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9433602  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  9433601 agtagctgattttcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 9433502  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  9433501 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgta 9433402  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9433401 cgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 9433303  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9433302 ctttagacgtgctgattatctc 9433281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9444296 - 9443877
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9444296 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9444198  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  9444197 agtagctgattttcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 9444098  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  9444097 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtgttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgta 9443998  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9443997 cgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 9443899  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9443898 ctttagacgtgctgattatctc 9443877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 21002872 - 21003291
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  21002872 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 21002970  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||  ||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  21002971 agtagctgactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 21003070  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  21003071 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttcta 21003170  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |    
T  21003171 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaatggatttcaaacgaat 21003269  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21003270 ctttagacgtgctgattatctc 21003291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 6867089 - 6867508
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  6867089 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 6867187  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  6867188 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 6867287  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  6867288 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 6867386  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  6867387 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagaatttcaaacgact 6867486  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6867487 ctttagacgtgctgattatctc 6867508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 6877721 - 6878140
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  6877721 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 6877819  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  6877820 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 6877919  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  6877920 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 6878018  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  6878019 acattcaagttgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagaatttcaaacgact 6878118  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6878119 ctttagacgtgctgattatctc 6878140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8617822 - 8617403
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  8617822 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 8617724  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  8617723 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 8617624  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  8617623 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 8617524  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  8617523 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 8617425  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8617424 ctttagacgtgctgattatctc 8617403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 24930467 - 24930886
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  24930467 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 24930565  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  24930566 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 24930665  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||     
T  24930666 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgt- 24930764  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24930765 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24930864  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24930865 ctttagacgtgctgattatctc 24930886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 454663 - 455081
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  454663 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 454761  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  454762 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 454861  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  454862 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 454960  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  454961 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 455060  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatct 431  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  455061 ctttagacgtgctgattatct 455081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 2705476 - 2705895
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  2705476 tcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 2705574  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  2705575 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 2705674  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||     
T  2705675 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgt- 2705773  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  2705774 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 2705873  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2705874 ctttagacgtgctgattatctc 2705895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4223046 - 4222627
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  4223046 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcttcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 4222948  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  4222947 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 4222848  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  4222847 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 4222748  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  4222747 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 4222649  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4222648 ctttagacgtgctgattatctc 4222627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8628385 - 8627966
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  8628385 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 8628287  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  8628286 agtagctgattctcaattcagtcctatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 8628187  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  8628186 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 8628087  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  8628086 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 8627988  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8627987 ctttagacgtgctgattatctc 8627966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11096491 - 11096072
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||   |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  11096491 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaataatttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 11096393  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  11096392 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 11096293  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  11096292 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 11096194  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  11096193 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 11096094  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11096093 ctttagacgtgctgattatctc 11096072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22089559 - 22089140
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  22089559 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 22089461  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  22089460 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 22089361  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||     
T  22089360 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacgacagtcatgcctgcagaatttgt- 22089262  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  22089261 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 22089162  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22089161 ctttagacgtgctgattatctc 22089140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22100174 - 22099755
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  22100174 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 22100076  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  22100075 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 22099976  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||     
T  22099975 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacgacaaccatgcctgcagaatttgt- 22099877  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  22099876 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 22099777  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22099776 ctttagacgtgctgattatctc 22099755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37344636 - 37344217
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  37344636 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 37344538  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| ||| |  ||||||    
T  37344537 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgcctctcgtta 37344438  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  37344437 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 37344339  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  37344338 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaagactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 37344239  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37344238 ctttagacgtgctgattatctc 37344217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 48710355 - 48710774
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  48710355 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 48710453  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  48710454 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 48710553  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  48710554 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 48710652  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  48710653 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 48710752  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48710753 ctttagacgtgctgattatctc 48710774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 430
Target Start/End: Original strand, 17949982 - 17950399
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  17949982 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaa 17950080  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  17950081 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 17950180  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  17950181 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 17950279  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  17950280 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 17950379  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatc 430  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17950380 ctttagacgtgctgattatc 17950399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 2716080 - 2716499
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  2716080 tcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 2716178  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  2716179 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 2716278  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  2716279 atagagttgaaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 2716377  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  2716378 acactcaagatgagaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 2716477  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2716478 ctttagacgtgctgattatctc 2716499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4212447 - 4212028
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  4212447 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcttcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 4212349  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  4212348 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 4212249  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  4212248 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 4212150  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  4212149 acactcaagatggaaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 4212050  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4212049 ctttagacgtgctgattatctc 4212028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 29 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5685939 - 5685536
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  |  |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  5685939 gtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaaa-caaactgaagattcaaagtagctgattctcaa 5685841  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  5685840 ttcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagt 5685741  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  5685740 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgt-acgttcaagatgggaa 5685642  T
Q  327 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgat 426  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5685641 tgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgat 5685542  T
Q  427 tatctc 432  Q
    ||||||    
T  5685541 tatctc 5685536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 26653189 - 26653608
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || ||||| |||||| |||    
T  26653189 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaacggaagattcaa 26653287  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  26653288 agtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 26653387  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  26653388 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtt 26653487  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  26653488 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 26653586  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26653587 ctttagacgtgctgattatctc 26653608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 26699518 - 26699937
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || ||||| |||||| |||    
T  26699518 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaacggaagattcaa 26699616  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  26699617 agtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 26699716  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  26699717 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtt 26699816  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  26699817 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 26699915  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26699916 ctttagacgtgctgattatctc 26699937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 17960588 - 17961007
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  17960588 tcatcagaagcagaaggtcatccgaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaa 17960686  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  17960687 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 17960786  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  17960787 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctatgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 17960885  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  17960886 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 17960985  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17960986 ctttagacgtgctgattatctc 17961007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 167318 - 166899
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||| ||||| |||    
T  167318 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactaaagattcaa 167220  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  167219 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 167120  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  167119 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 167021  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  167020 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 166921  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  166920 ctttagacgtgctgattatctc 166899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 541505 - 541102
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  541505 gtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagtagctgattctcaa 541407  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  541406 ttcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagt 541307  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  541306 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgt-acgttcaagatgggaa 541208  T
Q  327 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgat 426  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  541207 tgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgat 541108  T
Q  427 tatctc 432  Q
    ||||||    
T  541107 tatctc 541102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9085719 - 9085301
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9085719 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9085621  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  9085620 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 9085521  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  9085520 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 9085423  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9085422 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9085323  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9085322 ctttagacgtgctgattatctc 9085301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9095433 - 9095015
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9095433 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9095335  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  9095334 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 9095235  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  9095234 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 9095137  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9095136 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9095037  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9095036 ctttagacgtgctgattatctc 9095015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11005621 - 11005202
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  11005621 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 11005523  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||    
T  11005522 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcatta 11005423  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  11005422 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 11005323  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  11005322 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 11005224  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11005223 ctttagacgtgctgattatctc 11005202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 177910 - 177491
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||| ||||| |||    
T  177910 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcattatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactaaagattcaa 177812  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  177811 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 177712  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  177711 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 177613  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  177612 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 177513  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  177512 ctttagacgtgctgattatctc 177491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 26389960 - 26390379
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  26389960 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 26390058  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  26390059 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 26390158  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  26390159 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 26390258  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  26390259 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaattcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 26390357  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26390358 ctttagacgtgctgattatctc 26390379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 40041973 - 40042391
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  40041973 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 40042071  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  40042072 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 40042171  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  40042172 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 40042269  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  40042270 acactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 40042369  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40042370 ctttagacgtgctgattatctc 40042391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 40052522 - 40052940
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  40052522 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 40052620  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  40052621 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 40052720  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  40052721 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 40052818  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  40052819 acactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 40052918  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40052919 ctttagacgtgctgattatctc 40052940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18441629 - 18441224
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  18441629 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 18441532  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    | || ||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||     
T  18441531 ggagttgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgggtacttgtccttcgttat 18441433  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  18441432 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 18441334  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  18441333 -ttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactct 18441235  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  18441234 ttagacgtgct 18441224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 8001928 - 8002348
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || ||| |||||||| |||    
T  8001928 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatccaa-ctgaagattcaa 8002026  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  8002027 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatta 8002126  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  8002127 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 8002226  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  8002227 caactcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgact 8002326  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8002327 ctttagacgtgctgattatctc 8002348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 8012573 - 8012993
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || ||| |||||||| |||    
T  8012573 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatccaa-ctgaagattcaa 8012671  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  8012672 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatta 8012771  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  8012772 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 8012871  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  8012872 caactcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgact 8012971  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8012972 ctttagacgtgctgattatctc 8012993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24735189 - 24734770
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  24735189 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 24735091  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  24735090 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 24734991  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  24734990 ttagagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 24734891  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24734890 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24734792  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24734791 ctttagacgtgctgattatctc 24734770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24745136 - 24744717
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  24745136 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 24745038  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  24745037 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 24744938  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  24744937 ttagagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 24744838  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24744837 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24744739  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24744738 ctttagacgtgctgattatctc 24744717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 26400602 - 26401021
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  26400602 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 26400700  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  26400701 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 26400800  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  26400801 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 26400900  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  26400901 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaattcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 26400999  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26401000 ctttagacgtgctgattatctc 26401021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1987959 - 1987557
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  1987959 tcatcagaagcaatattt-tcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagtagctgattctcaat 1987862  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  1987861 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagta 1987762  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  1987761 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 1987662  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1987661 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 1987562  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  1987561 atctc 1987557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1998580 - 1998178
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  1998580 tcatcagaagcaatattt-tcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagtagctgattctcaat 1998483  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  1998482 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagta 1998383  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  1998382 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 1998283  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1998282 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 1998183  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  1998182 atctc 1998178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30049955 - 30049538
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||| |||| |||    
T  30049955 tcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttt-tcatcataagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaa 30049857  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    | |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| |   || || | |||||||||||||    
T  30049856 attagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacagtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgtta 30049757  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |  |     
T  30049756 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaaatgtt- 30049658  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  || |||||||    
T  30049657 -cattcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgact 30049560  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  30049559 ctttagacgtgctaatcatctc 30049538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 40054618 - 40055034
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||| |||| |||    
T  40054618 tcatcataagcagaagcccatcagaagcaaggtttc--atcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactggagattcaa 40054715  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||||| |||    
T  40054716 agtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcttta 40054815  T
Q  213 acagagttgac-aaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  |||     
T  40054816 acagagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacaaccatgcctgcataa-atgtt 40054914  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  40054915 cc-ttcaagataggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 40055012  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  40055013 ctttagacgtgctaatcatctc 40055034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18419548 - 18419143
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  18419548 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 18419451  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    | || ||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||     
T  18419450 ggagttgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgggtacttgtccttcgttat 18419352  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||| ||    
T  18419351 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctcttcctgcagaa-atgttcc 18419253  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  18419252 -ttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactct 18419154  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  18419153 ttagacgtgct 18419143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42866246 - 42865844
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || | |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  42866246 tcatcagaagcaatattt-tcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgattctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 42866149  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  42866148 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 42866049  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |   |||||||||||||    
T  42866048 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaat 42865949  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42865948 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 42865849  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  42865848 atctc 42865844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42876872 - 42876470
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || | |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  42876872 tcatcagaagcaatattt-tcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgattctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 42876775  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  42876774 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 42876675  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |   |||||||||||||    
T  42876674 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaat 42876575  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42876574 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 42876475  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  42876474 atctc 42876470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 26209415 - 26209819
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| | |||    
T  26209415 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaa 26209512  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || ||| || ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  26209513 aggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 26209611  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |    
T  26209612 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttc 26209709  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  26209710 ctt-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 26209807  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  26209808 tttagacgtgct 26209819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13682754 - 13682350
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| | |||    
T  13682754 tcattagaagcagaagttcatcagaagcaaaatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaa 13682657  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || ||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | | | ||| |   |||||||||  |     
T  13682656 aggagctgtttttcgttttaacctcgtctaag-agaacgaagaattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaatcactgggtgcttgtccttctctg 13682558  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |    
T  13682557 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctattcctgcagaa-atgttc 13682460  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  13682459 c-ttcaaaatgggaatgaatttgaagttaatccttcacaagactacacccaaatcaggcaaaatattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 13682362  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  13682361 tttagacgtgct 13682350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 3476207 - 3476611
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| | |||    
T  3476207 tcatcagaaccagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaa 3476304  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| |||||  |  ||  |||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| |   |||||||||  |     
T  3476305 aggagctgtttttcattatattctcgtctaaa-agaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctctg 3476403  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |    
T  3476404 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttc 3476501  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  3476502 ctt-caagataggaatgaatttgaagttaatccttcacaggactacacccaaatcaggcaaaggattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 3476599  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  3476600 tttagacgtgct 3476611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 185 - 432
Target Start/End: Original strand, 26294064 - 26294312
Alignment:
Q  185 gatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaa 282  Q
    |||||| ||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  26294064 gatagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaa 26294163  T
Q  283 gacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactg 382  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294164 aacaacagccatgcctgcagaatttgtacact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactg 26294262  T
Q  383 gtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294263 gtgtataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 26294312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Original strand, 38593599 - 38593921
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| | | || |||| |||    
T  38593599 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttatattggagattcaa 38593697  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| ||||  |||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||||| |||    
T  38593698 agtagctggttcttgtttcaacctcgtctaataagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcttta 38593797  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||| |    
T  38593798 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagataacagtcatgcctgcagaa-atgttc 38593896  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaag 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  38593897 c-ttcaagatgggaatgaatttgaag 38593921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 6044077 - 6044354
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  6044077 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcacaatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 6044174  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||| | | |||||||||||||    
T  6044175 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaggcactgggtacttgtccttcgtta 6044273  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagct 292  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6044274 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagct 6044354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 29590426 - 29590022
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||| ||||||||| | |||    
T  29590426 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcaggacatttaaactgaagtttcaa 29590329  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || || ||||| || ||| || ||  |||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  29590328 aggagttgtttttcgttttaatctcgtctaaa-agaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 29590230  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |    
T  29590229 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttc 29590132  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  29590131 ctt-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcatatgactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 29590034  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  29590033 tttagacgtgct 29590022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8933954 - 8933634
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| |  ||    
T  8933954 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagttttaa 8933857  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
     | |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| |||    
T  8933856 tggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcttta 8933758  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  8933757 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-ttgttc 8933659  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaag 337  Q
    | |||||||| |||||||||||||||    
T  8933658 c-ttcaagataggaatgaatttgaag 8933634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15216750 - 15216346
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| | |||    
T  15216750 tcattagaagcagaagtccatcagaagcgaaatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaa 15216653  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||| ||| || ||| || ||  | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  15216652 aggagctatttttcgttttaatctcgtttaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggccatttgagaagcactgggtgcttgtccttctttg 15216554  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  15216553 a-agagttgacaaagtaaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 15216456  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| | ||   ||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||  || ||||||||    
T  15216455 c-ttcaagataggaatgaatttgaagttgatctgtcataggactacacccaaatcaggcaatagattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactc 15216358  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  15216357 tttagacgtgct 15216346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 12734033 - 12734437
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagca-aagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||  || ||| ||||||||| | ||    
T  12734033 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcagaagtc---catcagaagctatatcatcaccataagctatagttgatcagtaaatttaaactgaagtttca 12734129  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||| |||||||| || ||| || ||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   |||||||||  |    
T  12734130 aaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaatttaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctct 12734228  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||  |||     
T  12734229 ga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtctacgctataagacaagacaacaactctgcctgcagaa-atgtt 12734326  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  12734327 cc-ttcaagataggaataaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaagagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 12734424  T
Q  411 ctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||    
T  12734425 ctttagacgtgct 12734437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 48382580 - 48382304
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  || ||| ||||||||| | |||    
T  48382580 tcatcagaagcagaagtccgtcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgctcagtaaatttaaactgaagtttcaa 48382483  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| |||    
T  48382482 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattaaaagggatgtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcttta 48382384  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg--ttttgtccacgctacaagacaagacaacag 290  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48382383 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccgctacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaagacaacag 48382304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 24882287 - 24882691
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatc-ca 111  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||| ||    
T  24882287 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatctgaa-atctca 24882382  T
Q  112 aagtagctgtttc-tcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||  ||||||||| | |  | |||||  |||||| ||| ||||  ||  ||||||| ||  ||||| ||||||| | |||  || |   |||||| || |    
T  24882383 aaagagctgtttcattaagttaacctcgtctaag-agagcgaacgatcaaaagggaagtgccaacgttcatttgaaaagcaatgggtgcttgtccctcat 24882481  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  | ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||    
T  24882482 taa-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcaacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaatt-gt 24882579  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  24882580 tcctt-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 24882677  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||    
T  24882678 tctttagacgtgct 24882691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 272 - 423
Target Start/End: Original strand, 38403331 - 38403479
Alignment:
Q  272 ctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggca 371  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38403331 ctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttcctt-caagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggca 38403428  T
Q  372 aaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  38403429 aaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct 38403479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 26290215 - 26290377
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||| ||||| |||    
T  26290215 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactaaagattcaa 26290313  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacg 176  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26290314 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacg 26290377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Original strand, 8998998 - 8999167
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  8998998 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 8999095  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggta 385  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  8999096 ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggta 8999167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Original strand, 9261627 - 9261723
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9261627 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatcc 9261723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 423
Target Start/End: Original strand, 11087110 - 11087314
Alignment:
Q  217 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||| |||||    
T  11087110 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccatgactctgcttgtgtctacactacaagacaagataacagctctgcctgcataa-atgttccttt 11087208  T
Q  316 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactcttta 415  Q
     ||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |  | || |||||||||||     
T  11087209 -aagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaaggtttctc-aacgactctttt 11087306  T
Q  416 gacgtgct 423  Q
    ||||||||    
T  11087307 gacgtgct 11087314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 23264455 - 23264573
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  23264455 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaa 23264553  T
Q  113 agtagctgtttctcatttca 132  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  23264554 agtagctgattctcaattca 23264573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 156
Target Start/End: Original strand, 22494043 - 22494169
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||     
T  22494043 gtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatt-aaactaaagattcaaagtagctgattctcaa 22494141  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaa 156  Q
    ||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  22494142 ttcagtcttatccaagaagaacgaagaa 22494169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 19193334 - 19193265
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacattt 84  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19193334 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaatttc--atcagaagcgatatcatcaccagaagctacattt 19193265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 2265642 - 2265713
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2265642 aagtgtacaaccactacctccactgctctgttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 2265713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Original strand, 13174668 - 13174848
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | || || |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| |  | |    
T  13174668 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtctctacactacaagacaagaaaaacagctttgcatgcagaaatgttac 13174767  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
      |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  13174768 --ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 13174848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44467099 - 44467027
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44467099 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 44467027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 48382297 - 48382219
Alignment:
Q  344 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  48382297 cttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacatgct 48382219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 602796 - 602646
Alignment:
Q  235 gtacaaccactacctccactactctgt--tttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |  | ||  ||||  |  ||||| ||    
T  602796 gtacaaccacttcctccactactctgttctttgtctacgctacaggacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccc--tcaaattcagaatggat 602699  T
Q  332 ttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    |||||   ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  602698 ttgaaatcaattcttcataggactatatccaaatcaggcaaaggatcattggt 602646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 30944446 - 30944518
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30944446 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 30944518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 30945479 - 30945551
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30945479 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctcagctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 30945551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 284
Target Start/End: Original strand, 13894123 - 13894174
Alignment:
Q  233 gtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  13894123 gtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgcaacaagacaaga 13894174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4821509 - 4821455
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  4821509 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 4821455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 284
Target Start/End: Original strand, 15704616 - 15704666
Alignment:
Q  234 tgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  15704616 tgtacaaccactacttccactactctgttttgtctctgctacaagacaaga 15704666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 23280081 - 23280154
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg--ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23280081 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 23280154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27871753 - 27871699
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  27871753 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 27871699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14426582 - 14426549
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426582 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 14426549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 21283496 - 21283529
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21283496 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 21283529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 22578144 - 22578177
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22578144 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 22578177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24788176 - 24788143
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24788176 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 24788143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28409074 - 28409041
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28409074 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 28409041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 7488023 - 7488063
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7488023 agtacaactgtacaaccactatctccactactctgttttgt 7488063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 16112007 - 16112079
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16112007 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggaaaacagctctgcctgca 16112079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 19237166 - 19237198
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19237166 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 19237198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 33691835 - 33691907
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  33691835 aagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 33691907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 48237025 - 48237097
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  48237025 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 48237097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 12174464 - 12174535
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  12174464 aagtgtacaaccactacctttagtactctgttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 12174535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8182965 - 8182911
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  8182965 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 8182911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9069597 - 9069543
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||    
T  9069597 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttttgtctctgctacaagacaaga 9069543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 48806002 - 48806056
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  48806002 aagtgtacaaccactacttccactactctgattttgtctctgctacaagacaaga 48806056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1293065 - 1293032
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1293065 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 1293032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 258
Target Start/End: Original strand, 13172465 - 13172502
Alignment:
Q  221 gacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 258  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13172465 gacatagtacaattgtacaaccactacctccactactc 13172502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14193149 - 14193116
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14193149 aagtgtacaaccactacctctactactctgtttt 14193116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14425482 - 14425449
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14425482 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 14425449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 260
Target Start/End: Original strand, 19339373 - 19339402
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19339373 aagtgtacaaccactacctccactactctg 19339402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21692322 - 21692269
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  21692322 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 21692269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 24794838 - 24794871
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24794838 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttt 24794871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 35952811 - 35952844
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35952811 aagtgtacaaccactacctccattactctgtttt 35952844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 331680 - 331608
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  331680 aagtgtacaaccactacctccactacacagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 331608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4494612 - 4494540
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  4494612 aagtgtacaaccgctacctccactactctctttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 4494540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 39284687 - 39284719
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39284687 aagtgtacaaccactacctccactactcagttt 39284719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 41842396 - 41842468
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  41842396 aagtgtacaaccactacctgcactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 41842468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 145)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 25788102 - 25787685
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25788102 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaa 25788004  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  25788003 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 25787904  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787903 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 25787804  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25787803 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 25787705  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  25787704 ttagacgtgctaattatctc 25787685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26044579 - 26044197
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26044579 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccctatattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 26044480  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26044479 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 26044380  T
Q  249 tccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26044379 tccactactctgctttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaatccttca 26044281  T
Q  349 aaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26044280 aaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 26044197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 20029699 - 20030106
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  20029699 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaa 20029797  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  20029798 agtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 20029897  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20029898 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 20029997  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  20029998 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactct 20030096  T
Q  413 ttagacgtgc 422  Q
    ||||||||||    
T  20030097 ttagacgtgc 20030106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12828094 - 12827676
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12828094 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcataagcgtaatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 12827996  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  12827995 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 12827896  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12827895 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgcgc 12827796  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  12827795 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactc 12827697  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  12827696 tttagacgtgctaatcatctc 12827676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 7375553 - 7375970
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  7375553 tcatcagaagcagaagctcattagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaa 7375651  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  7375652 agtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 7375751  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7375752 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgccagcagaatttgtgcc 7375851  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  7375852 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactct 7375950  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  7375951 ttagacgtgctaatcatctc 7375970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 20062450 - 20062857
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||    
T  20062450 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaaatcaaactgaagatccaa 20062548  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  20062549 agtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 20062648  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062649 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 20062748  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  20062749 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactct 20062847  T
Q  413 ttagacgtgc 422  Q
    ||||||||||    
T  20062848 ttagacgtgc 20062857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 11147044 - 11147462
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  11147044 tcatcagatgcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcaacaccagaagctacatataatccgtaaattcaaactgaagatccaa 11147142  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  11147143 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 11147242  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11147243 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 11147342  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  11147343 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaatgactc 11147441  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  11147442 tttagacgtgctaattatctc 11147462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 25986482 - 25986065
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |  || ||||||||||||||||    
T  25986482 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaatatcttcacaagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagatccaa 25986385  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25986384 agtagctggttctcaattcggtcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtaccaacggtcatatgaatagcactgagcatttgtccttcgtta 25986285  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25986284 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 25986185  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  25986184 c-ttcaagatgggaataaatttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactc 25986086  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  25986085 tttagacgtgctaattatctc 25986065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 28251358 - 28251776
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagcta--tatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| |||| |  || ||||||||||||      
T  28251358 tcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatcctttaat-caaactgaagattt 28251456  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  28251457 aaagtagctggttctccattcagccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggagagctctgaacatttgtccttcgt 28251556  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28251557 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 28251656  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||  ||||||||||    
T  28251657 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt-gatgatttaaggaattcaaacgact 28251754  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  28251755 ctttagacatgctgattatctc 28251776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9122926 - 9123345
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||  ||    
T  9122926 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagatttaa 9123024  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  9123025 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 9123124  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  9123125 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgta 9123224  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9123225 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaaagact 9123323  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9123324 ctttagacgtgctgattatctc 9123345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9112289 - 9112708
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||  ||    
T  9112289 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagatttaa 9112387  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  9112388 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 9112487  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  9112488 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcaaaatttgta 9112587  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9112588 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaaagact 9112686  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9112687 ctttagacgtgctgattatctc 9112708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27506309 - 27505925
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||    
T  27506309 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatatttgatcctttaat-caaactgaagatccaaagtagctgattctcaattcaatcttatctaagaaga 27506211  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27506210 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttagtagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 27506111  T
Q  249 tccactactctg---ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattct 345  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27506110 tccactactctgtttttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattct 27506012  T
Q  346 tcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27506011 tcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 27505925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 31542692 - 31543111
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa-agtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| ||    
T  31542692 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaacagttt-tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattca 31542789  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  31542790 aagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtt 31542889  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31542890 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 31542989  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  31542990 -acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 31543088  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31543089 tctttagacgtgctgattatctc 31543111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 37 - 432
Target Start/End: Original strand, 28356529 - 28356923
Alignment:
Q  37 aagcaaagtttctcatcagaagcta--tatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaac 134  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| |||| |  || ||||||||||||  |||||||||| |||||  |||| |    
T  28356529 aagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatcctttaat-caaactgaagatttaaagtagctggttctccattcagc 28356627  T
Q  135 cttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagt 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356628 cttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggagagctctgaacatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagt 28356727  T
Q  235 gtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28356728 gtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc-ttcaagatgggaatgaatttg 28356826  T
Q  335 aagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28356827 aagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt-gatgatttaaggaattcaaacgactctttagacatgctgattatctc 28356923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12855423 - 12855004
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||| ||||| |||    
T  12855423 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactaaagattcaa 12855325  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  12855324 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 12855225  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  12855224 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 12855125  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  12855124 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 12855026  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12855025 ctttagacgtgctgattatctc 12855004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12865949 - 12865530
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||| ||||| |||    
T  12865949 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactaaagattcaa 12865851  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  12865850 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 12865751  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  12865750 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 12865651  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  12865650 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 12865552  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12865551 ctttagacgtgctgattatctc 12865530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 34806954 - 34807373
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  34806954 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 34807052  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  34807053 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 34807152  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt--ccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  34807153 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctatctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 34807252  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  34807253 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 34807351  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34807352 ctttagacgtgctgattatctc 34807373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 18925556 - 18925974
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||| |||| |||    
T  18925556 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaa 18925655  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | | || || | |||||||||||||    
T  18925656 agtagttgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacacttagtacttgtccttcgtta 18925755  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||  |||     
T  18925756 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaa-atgtt 18925854  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  18925855 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 18925952  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  18925953 ctttagacgtgctaatcatctc 18925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27373199 - 27372815
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||    
T  27373199 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatatttgatcctttaat-caaactgaagatccaaagtagctgattctcaattcaatcttatctaagaaga 27373101  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaac-gatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373100 acgaagaattgaaagggaggtatcaacagat-atatggatagcactgagcacttgtctctcgttagtagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 27373002  T
Q  248 ctccactactctgtttt---gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 344  Q
    |||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27373001 ctccactactctgtttttttgtctacactacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgcctt-caagatgggaatgaatttgaagcttattc 27372903  T
Q  345 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372902 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 27372815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27463549 - 27463165
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||    
T  27463549 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatatttgatcctttaat-caaactgaagatccaaagtagctgattctcaattcaatcttatctaagaaga 27463451  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaac-gatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27463450 acgaagaattgaaagggaggtatcaacagat-atatggatagcactgagcacttgtctctcgttagtagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 27463352  T
Q  248 ctccactactctgtttt---gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 344  Q
    |||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27463351 ctccactactctgtttttttgtctacactacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgcctt-caagatgggaatgaatttgaagcttattc 27463253  T
Q  345 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27463252 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 27463165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 17984504 - 17984923
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  17984504 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 17984602  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  17984603 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 17984702  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  17984703 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 17984802  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  17984803 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 17984901  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17984902 ctttagacgtgctgattatctc 17984923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26875814 - 26875395
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  26875814 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 26875716  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  26875715 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 26875616  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  26875615 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagattttgt- 26875517  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  26875516 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaaggatttcaaacgact 26875417  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26875416 ctttagacgtgctgattatctc 26875395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 32961723 - 32962142
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  32961723 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 32961821  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  32961822 agtagctgattctcaattcagtcttatgaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 32961921  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtcc--acgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  32961922 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctctctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 32962021  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  32962022 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 32962120  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32962121 ctttagacgtgctgattatctc 32962142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 34817586 - 34818005
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  34817586 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 34817684  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  34817685 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 34817784  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt--ccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  34817785 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctatctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 34817884  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  34817885 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 34817983  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34817984 ctttagacgtgctgattatctc 34818005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3661784 - 3661366
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  3661784 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 3661686  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  3661685 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 3661586  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  3661585 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 3661488  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  3661487 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 3661388  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3661387 ctttagacgtgctgattatctc 3661366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3672448 - 3672030
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  3672448 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 3672350  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  3672349 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 3672250  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  3672249 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 3672152  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  3672151 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 3672052  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3672051 ctttagacgtgctgattatctc 3672030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26036435 - 26036016
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  26036435 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 26036337  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  26036336 agttgctgattctcaattcaatcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 26036237  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  26036236 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 26036137  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  26036136 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 26036038  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26036037 ctttagacgtgctgattatctc 26036016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26865190 - 26864771
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  26865190 tcatcagaagtagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 26865092  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  26865091 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 26864992  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  26864991 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagattttgt- 26864893  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  26864892 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaaggatttcaaacgact 26864793  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26864792 ctttagacgtgctgattatctc 26864771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 32972342 - 32972761
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  32972342 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccaaaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 32972440  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  32972441 agtagctgattctcaattcagtcttatgaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 32972540  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtcc--acgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  32972541 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctctctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 32972640  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  32972641 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 32972739  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32972740 ctttagacgtgctgattatctc 32972761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33199729 - 33199311
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  33199729 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 33199631  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
     ||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  ||||||    
T  33199630 -gtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcgtta 33199532  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  33199531 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 33199432  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  33199431 catt-caagataggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 33199333  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33199332 ctttagacgtgctgattatctc 33199311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13913449 - 13913034
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  || ||| |||||| |||| |||    
T  13913449 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttc--atcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactggagattcaa 13913352  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | |||||||||| ||    
T  13913351 agtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgata 13913252  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |    
T  13913251 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacaactctgcctgcagaa-atgttc 13913153  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||| ||||    
T  13913152 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagataattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacaactc 13913055  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  13913054 tttagacgtgctaatcatctc 13913034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26025861 - 26025442
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  26025861 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 26025763  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  26025762 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 26025663  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  26025662 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 26025563  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  26025562 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 26025464  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26025463 ctttagacgtgctgattatctc 26025442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 31982420 - 31982839
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  31982420 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatccttt-agtcaaactgaagattcaa 31982518  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  31982519 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 31982618  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  31982619 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 31982718  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  31982719 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 31982817  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31982818 ctttagacgtgctgattatctc 31982839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 7751029 - 7751448
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagcta--tatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||  |  |||| |||||||||||| ||||| |||| |  || |||||||||||| |    
T  7751029 tcatcagaagcagaggatcatcagaagcaaggttt-tcatcagaaggaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaat-caaactgaagattc 7751126  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |    
T  7751127 aaagtagctgtttctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctctt 7751226  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  7751227 tactagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatgtgc 7751326  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  7751327 gcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaactcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggaattcaaacgac 7751425  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7751426 tctttagacgtgctgattatctc 7751448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27342096 - 27341677
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  27342096 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatccttt-agtcaaactgaagattcaa 27341998  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  27341997 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 27341898  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  27341897 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 27341798  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  27341797 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 27341699  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27341698 ctttagacgtgctgattatctc 27341677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27402836 - 27402417
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  27402836 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatccttt-agtcaaactgaagattcaa 27402738  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  27402737 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 27402638  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  27402637 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 27402538  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  27402537 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 27402439  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27402438 ctttagacgtgctgattatctc 27402417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27413495 - 27413076
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  27413495 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatccttt-agtcaaactgaagattcaa 27413397  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  27413396 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 27413297  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  27413296 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 27413197  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  27413196 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 27413098  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27413097 ctttagacgtgctgattatctc 27413076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16960023 - 16959605
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  16960023 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 16959925  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  16959924 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 16959825  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  16959824 atagagttgacaaagtacaagtgtgcaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 16959727  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  16959726 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 16959627  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16959626 ctttagacgtgctgattatctc 16959605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29385153 - 29384735
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || | |  || |||||||||||| |||    
T  29385153 tcatcagaagcagaaagtcatcagaaacaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgattctttaat-caaactgaagattcaa 29385055  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  29385054 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 29384955  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  29384954 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 29384857  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  29384856 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggatttcaaacgact 29384757  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29384756 ctttagacgtgctgattatctc 29384735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 8654063 - 8653654
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctata-tcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| |||  || | |||||||||||||| |    
T  8654063 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattc 8653965  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||  | |||||||||||    
T  8653964 aaagtagctgtttctcatttcaacctcgactaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgaatacttgtccttcgt 8653865  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  8653864 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaaagctatgcctgtagaa-atgt 8653766  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||  || ||||||    
T  8653765 tcc-ttcaaaacgggaatgaatttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 8653668  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||    
T  8653667 tctttagacgtgct 8653654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16930836 - 16930434
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| ||||||     
T  16930836 gtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaa 16930738  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16930737 ttcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagt 16930638  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |  ||||||||||||    
T  16930637 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt-acactcaagatgggaa 16930540  T
Q  327 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgat 426  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16930539 tgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgat 16930440  T
Q  427 tatctc 432  Q
    ||||||    
T  16930439 tatctc 16930434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Original strand, 12716645 - 12717048
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  12716645 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatttttaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 12716743  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  12716744 tcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctctttaatagagttgacaaagta 12716843  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  12716844 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 12716943  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12716944 gaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 12717043  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  12717044 atctc 12717048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Original strand, 12727294 - 12727697
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  12727294 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatttttaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 12727392  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  12727393 tcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctctttaatagagttgacaaagta 12727492  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  12727493 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 12727592  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12727593 gaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 12727692  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  12727693 atctc 12727697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 18826035 - 18826440
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  18826035 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 18826132  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||| | | || ||||||||||    
T  18826133 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgggtacttatccttcgtta 18826231  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  18826232 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-ttgttc 18826330  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  18826331 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactttacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 18826428  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  18826429 tttagacgtgct 18826440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31572813 - 31572408
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||| | ||| |||    
T  31572813 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaatttc--atcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttgatcagtaaatttaaactaacgattcaa 31572716  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||| | |||||||||||||    
T  31572715 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcttttgaaaagcactgagtatttgtccttcgtta 31572617  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |  |      
T  31572616 tcagagttgacaaactacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacgaccatgcctgcagaaatgtt-- 31572519  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  31572518 ctatcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 31572420  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  31572419 tttagacgtgct 31572408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4631271 - 4630856
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||| |||| |  || |||||||||||   ||    
T  4631271 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta--tttgatcctttaat-caaactgaagag--aa 4631177  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || |||    
T  4631176 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcatta 4631077  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  4631076 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 4630977  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  4630976 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 4630878  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4630877 ctttagacgtgctgattatctc 4630856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 18834431 - 18834836
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  18834431 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 18834528  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | | ||| | | |||||||||||||    
T  18834529 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgggtacttgtccttcgtta 18834627  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  18834628 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-ttgttc 18834726  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  18834727 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggacttttcccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 18834824  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  18834825 tttagacgtgct 18834836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 432
Target Start/End: Original strand, 32300842 - 32301256
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||| |||| |  || |||||||||||   |||    
T  32300842 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta--tttgatcctttaat-caaactgaagag--aaa 32300936  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    || |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || ||||    
T  32300937 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaa 32301036  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  32301037 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 32301136  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
      | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  32301137 act-caagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactc 32301235  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32301236 tttagacgtgctgattatctc 32301256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 432
Target Start/End: Original strand, 32311531 - 32311945
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||| |||| |  || |||||||||||   |||    
T  32311531 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta--tttgatcctttaat-caaactgaagag--aaa 32311625  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    || |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || ||||    
T  32311626 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaa 32311725  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  32311726 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 32311825  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
      | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  32311826 act-caagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactc 32311924  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32311925 tttagacgtgctgattatctc 32311945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6158569 - 6158316
Alignment:
Q  53 cagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacga 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  6158569 cagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccatatatttaaactgaagatccaaagtagttgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacga 6158470  T
Q  153 agaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcca 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6158469 agaattgaaagggaggtaacaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccctcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcca 6158370  T
Q  253 ctactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6158369 ctactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat 6158316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 16123350 - 16123748
Alignment:
Q  31 catcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcattt 130  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  16123350 catcagaagcaaagtttc--atcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagttaatttaaactggagattcaaagtagctgtttctctttt 16123447  T
Q  131 caaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgac-aaagta 229  Q
     |||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16123448 taacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttctttaacagagttgacaaaagta 16123547  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||  ||| || |||||||| | ||||    
T  16123548 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacatccatgccttcataa-atgttcc-ttcaagattgtaatg 16123645  T
Q  329 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatta 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |    
T  16123646 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagtcaaagtattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatca 16123744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27384835 - 27384416
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagcta--tatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||  |  |||| |||||||||||| ||||| |||| |  || |||||||||||| |    
T  27384835 tcatcagaagcagaggatcatcagaagcaaggttt-tcatcagaaggaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaat-caaactgaagattc 27384738  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||||||||||  ||||| ||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |    
T  27384737 aaagtagctggctctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctctt 27384638  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||     
T  27384637 tactagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgc 27384538  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  27384537 gcctt-caagatgggaatgattttgaagctaactcttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggatttcaaacgac 27384439  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  27384438 tctttagacgtgctgataatctc 27384416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27475248 - 27474829
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagcta--tatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||  |  |||| |||||||||||| ||||| |||| |  || |||||||||||| |    
T  27475248 tcatcagaagcagaggatcatcagaagcaaggttt-tcatcagaaggaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaat-caaactgaagattc 27475151  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||||||||||  ||||| ||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |    
T  27475150 aaagtagctggctctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctctt 27475051  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||     
T  27475050 tactagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgc 27474951  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  27474950 gcctt-caagatgggaatgattttgaagctaactcttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggatttcaaacgac 27474852  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  27474851 tctttagacgtgctgataatctc 27474829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27504747 - 27504328
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagcta--tatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||  |||||||||||| ||||| |||| |  || |||||||||||| |    
T  27504747 tcatcagaagcagaggatcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaaaatattttcaccagaagctgcatttgatccctcaat-caaactgaagattc 27504650  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||||||||||  ||||| ||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |    
T  27504649 aaagtagctggctctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctctt 27504550  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||     
T  27504549 tactagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgc 27504450  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  27504449 gcctt-caagatgggaatgattttgaagctaactcttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggatttcaaacgac 27504351  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  27504350 tctttagacgtgctgataatctc 27504328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29765934 - 29765553
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||   || ||| ||||||||||| |||    
T  29765934 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttc--atcagaagctataccatcaccagaagctacaagtgattagtaaatttaaactgaagattcaa 29765837  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |  |||||||| || ||||||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||| | | |||||||||||||    
T  29765836 aagagctgtttttcgtttcaacatcgtcta-gaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgggtacttgtccttcgtta 29765738  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  29765737 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctatcagacaagacaacagctctgcctgcagaatt-gttc 29765639  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaagga 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  29765638 ctt-caagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 29765553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4293125 - 4292720
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || || |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  4293125 tcatcagaagcagaagagcatcagaagcacattttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 4293028  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  ||   | ||||||||| | |    
T  4293027 aggagctatttttcgtttcaacctcatctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatacttgtccttcttca 4292929  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || |    
T  4292928 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaggacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttc 4292830  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||| |   ||||||||    
T  4292829 ctt-caagatgggaatgaatttgaagctgatccttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaagga-acttaacgactc 4292732  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  4292731 tttagacgtgct 4292720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5845501 - 5845069
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  5845501 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttc--atcagaagcgatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 5845404  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatca-----------------acgatcatttggatagctctga 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||                 ||| ||||||| | ||| ||||    
T  5845403 agtagctgtttctcgtttcaacctcgtctgagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcacggtcatttgaagagcactga 5845304  T
Q  196 gcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctat 294  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5845303 gtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctct 5845204  T
Q  295 gcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
    |||||||| | |  |  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5845203 gcctgcaggaatgtt--cattcaagatgggaatgaatttgaagccgattcttcaaaggactgcacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 5845106  T
Q  395 aggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  5845105 aggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctc 5845069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 136 - 432
Target Start/End: Original strand, 17982417 - 17982714
Alignment:
Q  136 ttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtg 235  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17982417 ttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtg 17982516  T
Q  236 tacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaattt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  17982517 tacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacact-caagatgggaatgaattt 17982615  T
Q  334 gaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982616 gaagtttattcttcagaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 17982714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 49 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17042987 - 17042614
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||  | | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||  |||  |||  |||| | |||    
T  17042987 tcatcagaagctatatcatcaccagaagcttcaagtgatcagttgtttcaaactaaagatttaaaggagctgtttttcggttcgtcctcgtcta-gaaga 17042889  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||| ||| | | ||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042888 acgaagaattgcaagggaggtatcaacggtcttttgcaaagcactgggtacttgtctttcgttttcagcgttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 17042789  T
Q  249 tccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 347  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17042788 tccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaatttgttcctt-caagatgggaatgaatttgaagttaatacttc 17042690  T
Q  348 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17042689 aaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgct 17042614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 396
Target Start/End: Original strand, 27166240 - 27166619
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  27166240 tcatcagaagcagaagactatcagaagcaaggtttc--atcagaagttatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 27166337  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || || ||||| || ||||||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| | | ||||||||| |||    
T  27166338 aggagttgtttttcgtttcaacatcgtcta-gaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgtgtacttgtccttcatta 27166436  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |    
T  27166437 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactacactgttcttgtccacgctacaagacaagacaacggctctgcctgcagaa-ttgttc 27166535  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaag 396  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  27166536 c-ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaag 27166619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 9933468 - 9933873
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| | |||    
T  9933468 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagtttcaa 9933565  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| |||    
T  9933566 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcttta 9933664  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |    
T  9933665 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactatgtttctgtctatgctacaagacaagacaacaactctgcctgcagaa-atgttc 9933763  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| |||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  9933764 c-ttcaagataggaaggaatttgaagttgatccttcataggactacaccaaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 9933861  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  9933862 tttagacgtgct 9933873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22309189 - 22308784
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatc-accagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||  || ||| ||||||| ||| |||    
T  22309189 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagttatatcatccaccagaagctacaagtaatcagtaaatttaaactgacgattcaa 22309092  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| | ||| ||| | | |||| ||||||||    
T  22309091 aggagctgtttttcgtttcaaccttgtctaag-agaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggtcgtttgaaaagcactgggtaattgttcttcgtta 22308993  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |  |      
T  22308992 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctacactacaagacaagacaacagctctacctgtagaaatatt-- 22308895  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  22308894 ccttcaagatgggaatgaatttgaaattgattcctcaaaggactacacccaaatcatgcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 22308796  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  22308795 tttagacgtgct 22308784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 49 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17064560 - 17064187
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||  | | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||  |||  |||  |||| | |||    
T  17064560 tcatcagaaactatatcatcaccagaagcttcaagtgatcagttgtttcaaactaaagatttaaaggagctgtttttcggttcgtcctcgtcta-gaaga 17064462  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||| ||| | | ||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17064461 acgaagaattgcaagggaggtatcaacggtcttttgcaaagcactgggtacttgtctttcattttcagcgttgacaaagtacaagtgtacaacaactacc 17064362  T
Q  249 tccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 347  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17064361 tccactactatgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaatttgttcctt-caagatgggaatgaatttgaagttaatacttc 17064263  T
Q  348 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17064262 aaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgct 17064187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Original strand, 17745562 - 17745984
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||  |  ||| ||||||||||| ||||    
T  17745562 catcagaagcagaagaccatcagaagcaatatttc--atcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattgttcagttaatttaaactgaagattcaaa 17745659  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctc-----------------tgag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |                 ||||    
T  17745660 gtagctgtttctcatttcaacctcgtccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcacggtcatttgaagagcactgag 17745759  T
Q  197 cagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 295  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17745760 tacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtagaagtgtacaaccattacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 17745859  T
Q  296 cctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaa 395  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||  || ||||||    
T  17745860 cctgcagaa-atgttcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaatcattactggtgaataatcaaa 17745957  T
Q  396 ggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||    
T  17745958 ggaactc-aacgactctttagacgtgct 17745984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 423
Target Start/End: Original strand, 17741534 - 17741904
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||| || ||  |||||| |||    
T  17741534 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaag-aga 17741632  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |   |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17741633 atgaagaattgaaagggaggtatcaacaatcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctctaa-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 17741731  T
Q  249 tccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  17741732 tccactactctgtttttgtctacgctacaagacaatacaacatctctgcctgcagaa-atgttcc-ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttc 17741829  T
Q  348 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    | |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  17741830 ataggactacacccaaatcaagcataagattactggtgtatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct 17741904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 25519086 - 25518684
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  25519086 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 25518989  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    | ||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||| || | ||| ||| |   ||||||||| || |    
T  25518988 ggagctgtttctcgttttaacctcgtctaag-agaacgaagaattaaaaaggag-tatcaacggtcatctgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga 25518891  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||    
T  25518890 -agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgttacaagacaagacaacagctctgcctccagaa-atgttcc 25518793  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||  ||||||||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  25518792 -ttcaagacaggaatgaatttgaagttgatccttcatagcacaacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 25518695  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  25518694 ttagacgtgct 25518684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 25735353 - 25735758
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc--aaactgaagatcc 110  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||  ||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||  |  |||   ||||||||| | |    
T  25735353 tcatcagaagcagaagtctatcagaagcaacatttc--atcagaagttgtatcatcagcagaagctacatttgatcagtttatttttaaactgaagtttc 25735450  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggata-gctctgagcagttgtccttcg 209  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||| |   |||||||||     
T  25735451 aaagaagctgtttctcgtgtcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtgcttgtccttca 25735549  T
Q  210 ttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 308  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  25735550 ttga-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atg 25735647  T
Q  309 tgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacga 408  Q
    | || |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || |||||    
T  25735648 ttcc-ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaggattactggtagatgatc-aaggaactc-aacga 25735744  T
Q  409 ctctttagacgtgc 422  Q
    ||||||||||||||    
T  25735745 ctctttagacgtgc 25735758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13928588 - 13928341
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||  || ||| |||||| |||| |||    
T  13928588 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttc--atcagaagcgatatcatcactagaagctacaattgatcagtaaatttaaactggagattcaa 13928491  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | |||||||||| ||    
T  13928490 agtagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgata 13928391  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13928390 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgtt 13928341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 423
Target Start/End: Original strand, 25686579 - 25686950
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc-aaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||  ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||  ||    
T  25686579 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaactgaagtttcaatgaagctgtttctcgtttcaacctcgtctaaa-ag 25686677  T
Q  148 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggata-gctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||| |   ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25686678 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 25686776  T
Q  247 cctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattct 345  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| || |||||||| |||||| |||||||  | || ||    
T  25686777 cctctactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc-ttcaagataggaatggatttgaacttgatcct 25686874  T
Q  346 tcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    ||| ||||| ||| |||||||| | ||| ||| |||||| ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  25686875 tcataggacaacatccaaatcaagaaaaagattactggtggatgatc-aaggaactc-aacgactctttagacgtgct 25686950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 181
Target Start/End: Original strand, 32761730 - 32761894
Alignment:
Q  16 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32761730 tcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 32761828  T
Q  116 agctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcat 181  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32761829 agttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 32761894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25679638 - 25679233
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc--aaactgaagatcc 110  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||  ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||   ||||||||| | |    
T  25679638 tcatcagaagcagaagtctatcagaagcaacatttc--atcagaagatctatcatcaccagaagctacatttgatcagttcatttttaaactgaagtttc 25679541  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggata-gctctgagcagttgtccttcg 209  Q
    |||| || |||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||| |   |||||||||     
T  25679540 aaagaagttgtttctcgtgtcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaaggtaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtgcttgtccttca 25679442  T
Q  210 ttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 308  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||    
T  25679441 ttga-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacatcagctcttcctgcagaa-atg 25679344  T
Q  309 tgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacga 408  Q
    | || |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  || |||||    
T  25679343 ttcc-ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaggattactagtagatgatc-aaggaactc-aacga 25679247  T
Q  409 ctctttagacgtgc 422  Q
    ||||||||||||||    
T  25679246 ctctttagacgtgc 25679233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25675562 - 25675200
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc--aaactgaagatcc 110  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||  ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||   ||||||||| | |    
T  25675562 tcatcagaagcagaagtctatcagaagcaacatttc--atcagaagatctatcatcaccagaagctacatttgatcagttcatttttaaactgaagtttc 25675465  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggata-gctctgagcagttgtccttcg 209  Q
    |||| || |||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||| |   |||||||||     
T  25675464 aaagaagttgtttctcgtgtcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtgcttgtccttca 25675366  T
Q  210 ttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 308  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  25675365 ttga-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atg 25675268  T
Q  309 tgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 377  Q
    | || |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25675267 ttcc-ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaggat 25675200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 304
Target Start/End: Original strand, 25722753 - 25723044
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc--aaactgaagatcc 110  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||   ||||||||| | |    
T  25722753 tcatcagaagcagaagtctatcagaagcaacatttc--atcagaagctgtatcatcaccagaagctacatttgatcagtttatttttaaactgaagttgc 25722850  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggata-gctctgagcagttgtccttcg 209  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||| | | |||||||||     
T  25722851 aaagaagctgtttctcctgtcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtacttgtccttca 25722949  T
Q  210 ttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25722950 ttga-agagttgacaaagtacaaatgtacaactactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa 25723044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 9419 - 9580
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9419 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 9517  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaac 175  Q
    ||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9518 agtagttgtttctcgtttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaac 9580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 19289178 - 19289582
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatc-ca 111  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||| ||    
T  19289178 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaaaatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatctgaa-atctca 19289273  T
Q  112 aagtagctgtttctc-atttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||  |||||| |||  |  | |||||   ||||| ||| ||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| |    
T  19289274 aaagagctgtctcttgaagttaacctcgcctaag-agagcgaaggatcaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcat 19289372  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  19289373 tga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gt 19289470  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||   || ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  19289471 tcctt-caagataggaatgaatttgaagtcgatccttcataggactacatccaaatcagacaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 19289568  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||    
T  19289569 tctttagacgtgct 19289582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 12953126 - 12953333
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| || |||    
T  12953126 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaatacaagataacagctctgcctgtagaatt-gttcct 12953224  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  12953225 t-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 12953322  T
Q  414 t-agacgtgct 423  Q
    | |||||||||    
T  12953323 taagacgtgct 12953333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31931623 - 31931417
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| || |||    
T  31931623 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagttaacaactctgcctgcagaatt-gttcct 31931525  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||| | ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  31931524 t-caagttaggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaatattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 31931427  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  31931426 tagacgtgct 31931417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 17577591 - 17577744
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||| |||| |||    
T  17577591 tcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaa 17577689  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggag 167  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17577690 agtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggag 17577744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11206146 - 11205940
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  11206146 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctatgctacaacacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 11206049  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | ||| |||| || || | | |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  11206048 ttcaagataggaatggatttgaacttgatttttcatagtacaatatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggttctc-aacgactctt 11205950  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  11205949 tagacgtgct 11205940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Original strand, 17608401 - 17608569
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  17608401 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 17608498  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17608499 ttcaagataggaatgaatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggt 17608569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18555470 - 18555264
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||     
T  18555470 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccc- 18555372  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
     ||||||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||||||| | | ||| || ||||||| |||||  || ||||||||||    
T  18555371 -tcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcgtaggactacacccaaatcaggcaaaagtttactcgtggatgatctaaggaactc-aacgactctt 18555274  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    |||| |||||    
T  18555273 tagatgtgct 18555264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18498820 - 18498614
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  18498820 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaaataacagctctgcctgcagaatt-gttcct 18498722  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | ||||||  |||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  || || |||||||    
T  18498721 t-caagataagaatgaatttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcagacaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aatgactctt 18498624  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    | ||||||||    
T  18498623 tggacgtgct 18498614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 303 - 432
Target Start/End: Original strand, 26022878 - 26023006
Alignment:
Q  303 aatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatc 402  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||    
T  26022878 aatttgtgcctt-caaaatgggaatgaatttaaacctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgaataatcaaaggatttc 26022976  T
Q  403 aaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26022977 aaacgactctttaaacttgctgattatctc 26023006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Original strand, 7586252 - 7586421
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  7586252 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 7586349  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggta 385  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||| |||||    
T  7586350 ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaacagatcattggta 7586421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 184
Target Start/End: Original strand, 16123029 - 16123180
Alignment:
Q  31 catcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcattt 130  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  16123029 catcagaagcaaagtttc--atcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactggagattcaaagtagctgtttctcgttt 16123126  T
Q  131 caaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttg 184  Q
     |||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16123127 taacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttg 16123180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11235699 - 11235493
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  11235699 agagttgacaaattacaagtgtacaaccactacctccactattctacttttgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 11235602  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | ||| |||| ||||| | | |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| || | || ||||||||||    
T  11235601 ttcaagataggaatggatttgaacttgatttttcataggacaatatccaaatcaggcaaaagattacaggtggatgatcaatggttctc-aacgactctt 11235503  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    |||| |||||    
T  11235502 tagatgtgct 11235493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17047755 - 17047597
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacta-ctctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  17047755 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccacgacctccacgaactctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcaga-tttgttcc 17047657  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 373  Q
    || |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17047656 tt-caagataggaatgaattttaagttaattctttaaaggactacatccaaatcaggcaaa 17047597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21128281 - 21128124
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||| ||     
T  21128281 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacttccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacatctctgcctgcagaa-atgttcc- 21128184  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 373  Q
    |||||||| |||||| |||||||    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  21128183 ttcaagataggaatggatttgaatgcgattcttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 21128124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20635775 - 20635605
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |  ||| |    
T  20635775 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagca-atgttc 20635677  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  20635676 c-ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 20635605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22386858 - 22386768
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcag 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  22386858 agagttgacaaagtaccaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcag 22386768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18499019 - 18498953
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18499019 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaaatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 18498953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18555669 - 18555603
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18555669 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaaatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 18555603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 10971320 - 10971395
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatcc 89  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10971320 tcattagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc 10971395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 289
Target Start/End: Original strand, 14100550 - 14100608
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaaca 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  14100550 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgctacaagacaagaaaaca 14100608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 17982315 - 17982416
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  17982315 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacttttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaa 17982413  T
Q  113 agt 115  Q
    |||    
T  17982414 agt 17982416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 384
Target Start/End: Original strand, 14051495 - 14051644
Alignment:
Q  235 gtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatt 332  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |  | |  |||||  |  ||||| |||    
T  14051495 gtacagccacttcctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgtttc--ttcaaattcagaatggatt 14051592  T
Q  333 tgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    ||||  |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14051593 tgaaattaattcttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 14051644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19625852 - 19625812
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19625852 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 19625812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29918056 - 29917984
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  29918056 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 29917984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12353597 - 12353539
Alignment:
Q  374 ggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12353597 ggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctc 12353539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 12952928 - 12952993
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12952928 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 12952993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16877252 - 16877180
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccac-gctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16877252 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgcctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 16877180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 32544304 - 32544232
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32544304 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 32544232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 10640529 - 10640600
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  10640529 aagtgtacaaccactacctccactactatgttttgtctctactacatgacaagaataacagctatgcctgca 10640600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9717882 - 9717849
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717882 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 9717849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15954742 - 15954709
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15954742 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 15954709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21618283 - 21618250
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618283 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 21618250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 31931821 - 31931756
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31931821 tcatcagaagcaaaat-tcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 31931756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11206311 - 11206255
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaa 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| |||||    
T  11206311 tcatcagaaactatatcatcaccagaagctacagttgatcaaaagattcaatctgaa 11206255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 46
Target Start/End: Original strand, 12952908 - 12952944
Alignment:
Q  10 acatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtt 46  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12952908 acatcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtt 12952944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13435571 - 13435499
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgt-tttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13435571 aagtgtacaaccactacctccactactctatatttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 13435499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 301
Target Start/End: Original strand, 15531738 - 15531806
Alignment:
Q  235 gtacaaccactacctccactactctgt-tttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  15531738 gtacaaccactacctccactactctgtctttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 15531806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 22076517 - 22076589
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22076517 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 22076589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22802180 - 22802108
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22802180 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 22802108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25592661 - 25592621
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25592661 agtacaattgtacaaccactatctccactactctgttttgt 25592621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7812053 - 7812014
Alignment:
Q  227 gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7812053 gtacaattgtacaaccactatctccactactctgttttgt 7812014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 304
Target Start/End: Original strand, 14070176 - 14070247
Alignment:
Q  235 gtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  14070176 gtacagccacttcctccactactctgtttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 14070247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 266
Target Start/End: Original strand, 19833143 - 19833178
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19833143 aagtgtacaagcactacctccactactctgttttgt 19833178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12348135 - 12348097
Alignment:
Q  228 tacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12348135 tacaattgtacaaccactatctccactactctgttttgt 12348097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12423300 - 12423246
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  12423300 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctccgctataagacaaga 12423246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 16265260 - 16265314
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  16265260 aagtgtgcaaccactacctccactactctgtttgtgtctctgctacaagacaaga 16265314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 20730814 - 20730868
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  20730814 aagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctcagctacaagacaaga 20730868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21625140 - 21625086
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  21625140 aagtgtacaaccactatctccactactttgtttttgtccgtgctacaagacaaga 21625086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 25800752 - 25800718
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagttt 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25800752 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt 25800718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26589638 - 26589584
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  26589638 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttctgtctctgctacaagacaaga 26589584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 26972336 - 26972390
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgt-tttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||    
T  26972336 aagtgtacaaccactacctccactactcagtatttgtctctgctacaagacaaga 26972390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 11235896 - 11235833
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctac 80  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11235896 tcatcataagca-aagttcatcagaagcaaattt---catcaaaagctatatcatcaccagaagctac 11235833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12349032 - 12348999
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12349032 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 12348999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 258
Target Start/End: Original strand, 18172134 - 18172171
Alignment:
Q  221 gacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 258  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18172134 gacatagtacaattgtacaaccactacctccactactc 18172171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 19066128 - 19066161
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19066128 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttt 19066161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19624018 - 19623945
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcag 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  19624018 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctttgctacaagacaagaataacagctctgcctgcag 19623945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 20488028 - 20488061
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20488028 aagtttacaaccactacctccactactctgtttt 20488061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21235164 - 21235135
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21235164 aagtgtacaaccactacctccactactctg 21235135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26943615 - 26943582
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26943615 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttt 26943582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 27373216 - 27373187
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373216 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 27373187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 27463566 - 27463537
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27463566 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 27463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 27506326 - 27506297
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27506326 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 27506297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15302239 - 15302167
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15302239 aagtgtacaaccactatctccactactcagttagtgtctctgctacaagacaaggataacagctatgcctgca 15302167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16336166 - 16336094
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16336166 aagtgtacaaccactatctacactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 16336094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17381560 - 17381488
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17381560 aagtgtacaatcactacctccactattctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 17381488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18435595 - 18435523
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  18435595 aagtgtacaaccactacctccagtacactgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 18435523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 18726656 - 18726628
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagca 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18726656 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagca 18726628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19086197 - 19086125
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  19086197 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 19086125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19875876 - 19875844
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19875876 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 19875844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23297990 - 23297950
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23297990 agtacaattgtacaactactatctccactactctgttttgt 23297950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25930517 - 25930477
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25930517 agtacaattgtacaaccactatctccactactctcttttgt 25930477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 114)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 4250392 - 4250809
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4250392 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 4250490  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4250491 agtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggatagcgctgagcatttgtccttcgtta 4250590  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4250591 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 4250690  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4250691 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 4250789  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  4250790 ttagacgtgctaattatctc 4250809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 39193921 - 39194338
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39193921 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 39194019  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  39194020 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggttatttggatagcactgagtatctgtccttcgtta 39194119  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194120 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 39194219  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  39194220 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactct 39194318  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  39194319 ttagacgtgctaatcatctc 39194338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 7689284 - 7689703
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7689284 tcatcagaagcagaaggtcaacagaagctaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 7689383  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgag-cagttgtccttcgtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  7689384 agtagctgtttctcatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagttatttgtccttcgtt 7689483  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7689484 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 7689583  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||    
T  7689584 c-ttcaagatgtgaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacggctc 7689682  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  7689683 tttagacgtgctaattatctc 7689703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 154116 - 154533
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  154116 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 154214  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  154215 agtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgtta 154314  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  154315 acagagttgacaaagtacaagtgtataaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcc 154414  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  154415 -ttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 154513  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  154514 ttagacgtgctaattatctc 154533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 148041 - 148458
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  148041 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 148139  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  148140 agtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaagtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgtta 148239  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  148240 acagagttgacaaagtacaagtgtacaatcactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcc 148339  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  148340 -ttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 148438  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  148439 ttagacgtgctaattatctc 148458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5974144 - 5973729
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5974144 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 5974046  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcattt-ggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  5974045 agtagttgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcattttggacaacgctgagcatttgtccttcgtt 5973946  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973945 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactgcctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 5973846  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  5973845 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactc 5973747  T
Q  412 tttagacgtgctgattat 429  Q
    |||||||||||| |||||    
T  5973746 tttagacgtgctaattat 5973729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 20441144 - 20441561
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || | ||||| |||    
T  20441144 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattctaattaaagattcaa 20441242  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  20441243 agtagctgtttctcatttcaacatcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttttccttcgtta 20441342  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20441343 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctacagaatttgtgc 20441442  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  20441443 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga-attcaacgactc 20441540  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  20441541 tttagacgtgcttatcatctc 20441561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35013302 - 35012884
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  35013302 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 35013204  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  35013203 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 35013104  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  35013103 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtac 35013004  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35013003 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactc 35012905  T
Q  412 tttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35012904 tttagacgtgctgattatctc 35012884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 23580153 - 23580572
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  23580153 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 23580251  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  23580252 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 23580351  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23580352 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgta 23580451  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23580452 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 23580550  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23580551 ctttagacgtgctgattatctc 23580572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4167639 - 4167220
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  4167639 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 4167541  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  4167540 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 4167441  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||     
T  4167440 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgt- 4167342  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  4167341 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 4167242  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4167241 ctttagacgtgctgattatctc 4167220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 5639537 - 5639956
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  5639537 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 5639635  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  5639636 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 5639735  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||     
T  5639736 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgt- 5639834  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5639835 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcgtattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 5639934  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5639935 ctttagacgtgctgattatctc 5639956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 5650094 - 5650513
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  5650094 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 5650192  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  5650193 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 5650292  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||     
T  5650293 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgt- 5650391  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5650392 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcgtattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 5650491  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5650492 ctttagacgtgctgattatctc 5650513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12730927 - 12730508
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  12730927 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 12730829  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  12730828 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 12730729  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  12730728 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 12730630  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  12730629 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 12730530  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12730529 ctttagacgtgctgattatctc 12730508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 12897810 - 12898229
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  12897810 tcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 12897908  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  12897909 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 12898008  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  12898009 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 12898107  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  12898108 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 12898207  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12898208 ctttagacgtgctgattatctc 12898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21878147 - 21877728
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  21878147 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 21878049  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  21878048 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatagatagcactgagcacttgtctctcgtta 21877949  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  21877948 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 21877849  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  21877848 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 21877750  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21877749 ctttagacgtgctgattatctc 21877728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12741520 - 12741101
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||| ||||||| |||    
T  12741520 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaattgaagattcaa 12741422  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  12741421 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 12741322  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  12741321 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 12741222  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  12741221 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 12741123  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12741122 ctttagacgtgctgattatctc 12741101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 12614143 - 12614562
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  12614143 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 12614241  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  12614242 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 12614341  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  12614342 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 12614441  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  12614442 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 12614540  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12614541 ctttagacgtgctgattatctc 12614562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 12623608 - 12624027
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  12623608 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 12623706  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||    
T  12623707 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatatcactgagcacttgtctctcatta 12623806  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  12623807 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 12623906  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  12623907 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 12624005  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12624006 ctttagacgtgctgattatctc 12624027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21864041 - 21863622
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  21864041 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 21863943  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  21863942 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 21863843  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  21863842 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtttacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 21863744  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  21863743 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 21863644  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21863643 ctttagacgtgctgattatctc 21863622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21895582 - 21895163
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  21895582 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 21895484  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  21895483 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 21895384  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  21895383 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 21895284  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  21895283 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 21895185  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21895184 ctttagacgtgctgattatctc 21895163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33084942 - 33084523
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||   |  || |||||||||||| |||    
T  33084942 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgattttttaat-caaactgaagattcaa 33084844  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  33084843 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 33084744  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  33084743 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctattttctgtctatgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 33084644  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  33084643 cgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 33084545  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33084544 ctttagacgtgctgattatctc 33084523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7507682 - 7507263
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||| |||    
T  7507682 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatccattaat-caaactgaagattcaa 7507584  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  7507583 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 7507484  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  7507483 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 7507384  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  7507383 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 7507285  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7507284 ctttagacgtgctgattatctc 7507263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7518279 - 7517860
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||| |||    
T  7518279 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatccattaat-caaactgaagattcaa 7518181  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  7518180 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 7518081  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  7518080 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 7517981  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  7517980 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 7517882  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7517881 ctttagacgtgctgattatctc 7517860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39587349 - 39586932
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||| || |||||||  || ||||||||||| |||    
T  39587349 tcatcggaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaattatcaccagaagctacaattgatccataagtttaaactgaagattcaa 39587251  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | | || || | |||||||||||||    
T  39587250 agtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacactaagtacttgtccttcgtta 39587151  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||     
T  39587150 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaa-atgtt 39587052  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  39587051 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacactcaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 39586954  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  39586953 ctttagacgtgctaatcatctc 39586932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2538915 - 2538497
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  2538915 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 2538817  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  2538816 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 2538717  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||     
T  2538716 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcag-ttttgt- 2538619  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  2538618 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 2538519  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2538518 ctttagacgtgctgattatctc 2538497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3172003 - 3171583
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  3172003 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 3171905  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  3171904 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatta 3171805  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  3171804 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgta 3171705  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  3171704 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 3171605  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3171604 ctttagacgtgctgattatctc 3171583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3182605 - 3182185
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  3182605 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 3182507  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  3182506 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatta 3182407  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  3182406 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgta 3182307  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  3182306 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 3182207  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3182206 ctttagacgtgctgattatctc 3182185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4178279 - 4177876
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  4178279 gtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagtagctgattctcaa 4178181  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  4178180 ttcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagt 4178081  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  4178080 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcaaaatttgt-acgttcaagatgggaa 4177982  T
Q  327 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgat 426  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4177981 tgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgat 4177882  T
Q  427 tatctc 432  Q
    ||||||    
T  4177881 tatctc 4177876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 421
Target Start/End: Original strand, 18381730 - 18382136
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| | |  || | |||||||||||||| ||    
T  18381730 tcatcagaagcagaagctaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattca 18381828  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  18381829 aagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagtcatttggagagccctgagtacttgtccttcgtt 18381928  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||     
T  18381929 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgtt 18382027  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  || |||||||    
T  18382028 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaaggaactc-aacgact 18382125  T
Q  411 ctttagacgtg 421  Q
    |||||||||||    
T  18382126 ctttagacgtg 18382136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 51629014 - 51629433
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  51629014 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 51629112  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  51629113 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 51629212  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  51629213 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 51629312  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  51629313 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 51629411  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  51629412 ctttagacgtgctgattatctc 51629433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 51656275 - 51656694
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  51656275 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 51656373  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  51656374 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 51656473  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  51656474 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 51656573  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  51656574 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 51656672  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  51656673 ctttagacgtgctgattatctc 51656694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 47195641 - 47195224
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| |||| |||    
T  47195641 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccataaatttaaactggagattcaa 47195543  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |   || || | |||||||||||||    
T  47195542 agtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgtta 47195443  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||  |||     
T  47195442 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaa-atgtt 47195344  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  47195343 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcgaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 47195246  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  47195245 ctttagacgtgctaatcatctc 47195224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19179340 - 19178920
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  19179340 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 19179242  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcat-ttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||| || |||| |||||  |||||    
T  19179241 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggagttatcaacggatatattggatagcactaagcacttgtctctcgtt 19179142  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19179141 aatatagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgt 19179042  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  19179041 acgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttactcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgattactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 19178943  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19178942 tctttagacgtgctgattatctc 19178920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5833599 - 5833179
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  5833599 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 5833501  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  5833500 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatta 5833401  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  5833400 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 5833301  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5833300 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 5833201  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5833200 ctttagacgtgctgattatctc 5833179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5844201 - 5843781
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  5844201 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 5844103  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  5844102 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatta 5844003  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  5844002 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 5843903  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5843902 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 5843803  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5843802 ctttagacgtgctgattatctc 5843781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 10997611 - 10998030
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||| ||||| |||    
T  10997611 tcattagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactaaagattcaa 10997709  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  10997710 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 10997809  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  10997810 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 10997908  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  10997909 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 10998008  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  10998009 ctttagaagtgctgattatctc 10998030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 47607757 - 47608177
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  47607757 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 47607855  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| || | |||||| ||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  47607856 agttgcggattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcttta 47607955  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  47607956 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 47608055  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  47608056 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 47608155  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47608156 ctttagacgtgctgattatctc 47608177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 47618365 - 47618785
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  47618365 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 47618463  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| || | |||||| ||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||    
T  47618464 agttgcggattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcttta 47618563  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  47618564 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 47618663  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  47618664 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 47618763  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47618764 ctttagacgtgctgattatctc 47618785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38095457 - 38095037
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || ||| |||||||| |||    
T  38095457 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatccaa-ctgaagattcaa 38095359  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| |||||||  ||||  || |||    
T  38095358 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacctgtctctcatta 38095259  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  38095258 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 38095159  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  38095158 caactcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 38095059  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38095058 ctttagacgtgctgattatctc 38095037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38106082 - 38105662
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || ||| |||||||| |||    
T  38106082 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatccaa-ctgaagattcaa 38105984  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| |||||||  ||||  || |||    
T  38105983 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacctgtctctcatta 38105884  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  38105883 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 38105784  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  38105783 caactcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 38105684  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38105683 ctttagacgtgctgattatctc 38105662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Original strand, 35648534 - 35648937
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  35648534 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 35648632  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  35648633 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 35648732  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  35648733 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 35648832  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35648833 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 35648932  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  35648933 atctc 35648937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 36236257 - 36236675
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||| |||    
T  36236257 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttaatcctttaat-caaactgaagattcaa 36236355  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||  |||||  ||||||    
T  36236356 agttgctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgtta 36236455  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  36236456 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 36236553  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36236554 acactcaagatgggaaggaatttgaaatttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 36236653  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36236654 ctttagacgtgctgattatctc 36236675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 36246804 - 36247222
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||| |||    
T  36246804 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttaatcctttaat-caaactgaagattcaa 36246902  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||  |||||  ||||||    
T  36246903 agttgctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgtta 36247002  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  36247003 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 36247100  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36247101 acactcaagatgggaaggaatttgaaatttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 36247200  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36247201 ctttagacgtgctgattatctc 36247222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Original strand, 35401008 - 35401411
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  35401008 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 35401106  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  35401107 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 35401206  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  35401207 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 35401306  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35401307 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtactgatt 35401406  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  35401407 atctc 35401411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Original strand, 35404235 - 35404638
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  35404235 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 35404333  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  35404334 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 35404433  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  35404434 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 35404533  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35404534 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtactgatt 35404633  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  35404634 atctc 35404638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19188183 - 19187799
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||  |||||| ||| |||    
T  19188183 tcatcagaagcaatatcttcactagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagtagttgattctcaattcagtcttatccaagaaga 19188085  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcat-ttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19188084 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatattggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 19187985  T
Q  248 ctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattct 345  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19187984 ctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttactct 19187886  T
Q  346 tcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187885 tcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 19187799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Original strand, 35637882 - 35638285
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||| || |||||| |||| |||||| |    
T  35637882 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaaaattcaaagttgctgattctcaat 35637980  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaac-gatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||| | ||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||    
T  35637981 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacagat-atatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagt 35638079  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  35638080 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaa 35638179  T
Q  327 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgat 426  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  35638180 tgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacctgctgat 35638279  T
Q  427 tatctc 432  Q
    ||||||    
T  35638280 tatctc 35638285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 11194897 - 11195302
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || || |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  11194897 tcatcagaagcagaataccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcac-agaagctgcaattgatcagtatatttaaactgaagattcaa 11194993  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | | ||||| |||||||    
T  11194994 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgggtacttgtctttcgtta 11195092  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  11195093 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccattacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaa-atgttc 11195191  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  11195192 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacactcaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactc 11195290  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  11195291 tttagacgtgct 11195302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9050314 - 9050731
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||  || |||| |||    
T  9050314 tcatcagaagcagaaaaccatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaatttggagattcaa 9050412  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||| | ||||| ||| |||    
T  9050413 agtagctggttctcatttcaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtattaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtcattcttta 9050512  T
Q  213 acagagttgacaaa-gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  9050513 acaaagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaat-gtt 9050611  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||  |||||||    
T  9050612 cctt-caagatggtaatgaatttgaagctattttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaagga-attcaacgact 9050709  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  9050710 ctttagacgtgctaatcatctc 9050731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17957601 - 17957212
Alignment:
Q  31 catcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcattt 130  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17957601 catcagaagcaaagtttc--atcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtgaatttaaactggagattcaaagtagctgtttctcattt 17957504  T
Q  131 caaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgac-aaagta 229  Q
    ||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||||    
T  17957503 caacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtatttgtccttctttatcagagtttacaaaagta 17957404  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  17957403 caagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtctacactacaagacaagaaaacaaccatgcctgcagaa-atgttcc-ttcaagatgggaatg 17957306  T
Q  329 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  17957305 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccatatcaggcaaagaattactggtggaagatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct 17957212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 14387955 - 14388360
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| | |||    
T  14387955 tcatcaaaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaa 14388052  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || ||  |||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| |||    
T  14388053 aggagctgtttttcgttctaacctcgtctaaa-agaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcttta 14388151  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  14388152 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 14388250  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  14388251 c-ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 14388348  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  14388349 tttagacgtgct 14388360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 675789 - 675419
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |   | ||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||| || ||  |||||| ||     
T  675789 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgaacagaatatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaag-agg 675691  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||  |   ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  675690 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactcggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 675592  T
Q  249 tccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 347  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||| |||||||||||||||||| | || ||||    
T  675591 tccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttcctt-caaaatgggaatgaatttgaagttgatccttc 675494  T
Q  348 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  675493 ataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct 675419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 18310801 - 18311206
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||  ||||| | |||    
T  18310801 tcatcagaaacagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaatttgaagtttcaa 18310898  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| |||    
T  18310899 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaa-agaacgaaggattgaaaggaagatatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcttta 18310997  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| |    
T  18310998 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaa-atgttc 18311096  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| |  || ||||||||    
T  18311097 c-ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaagcaaaagattactggtgaatgatcaaagaaactc-aacgactc 18311194  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  18311195 tttagacgtgct 18311206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Original strand, 41132446 - 41132849
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| | ||||    
T  41132446 catcagaagtagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaa 41132543  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
      |||||||| || ||| || ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  || |   ||||||||| || |    
T  41132544 tgagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattgggtgtttgtccttctttga 41132642  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||    
T  41132643 -agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaact-gttcc 41132740  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
    || ||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || || ||||||    
T  41132741 tt-caaaatgggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aatgactct 41132838  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||| ||||    
T  41132839 ttagacatgct 41132849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 161 - 423
Target Start/End: Original strand, 20195667 - 20195927
Alignment:
Q  161 aagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20195667 aagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactaggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 20195766  T
Q  261 tt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacac 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||    
T  20195767 ttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-ttgttcc-atcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggacttcac 20195864  T
Q  360 ccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  20195865 ccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct 20195927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12947091 - 12946818
Alignment:
Q  15 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaag 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |  |  ||| ||||||||||| |||||    
T  12947091 atcagaagcagaagatcatcagaagcacgatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagcttcaagtgaacagttaatttaaactgaagattcaaag 12946994  T
Q  115 tagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaac 214  Q
     |||||||| || |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | || |||||||||| |    
T  12946993 gagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgagtatttatccttcgttatc 12946895  T
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacag 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12946894 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacag 12946818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 46180708 - 46181113
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatc-ca 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| ||| | ||| ||    
T  46180708 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatctgga-atctca 46180804  T
Q  112 aagtagctgtttctc-atttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||  || |||||||  |  | |||||  |||||| ||| ||||| ||  ||||||| ||  ||||| ||||||| | ||| ||| |   |||||| || |    
T  46180805 aaagagttgtttctttaagttaacctcgtctaag-agagcgaaggatcaaaagggaagtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccctcat 46180903  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||    
T  46180904 tga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcttcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaatt-gt 46181001  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  46181002 tcctt-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 46181099  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||    
T  46181100 tctttagacgtgct 46181113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28474477 - 28474075
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||| | |||    
T  28474477 tcatcagaagcagaac-tcatcagaagcaaagtt---catcagaagctatatgatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatctgaagtttcaa 28474382  T
Q  113 agtagctgtttctc--atttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    | | ||||||| |   |||| |||||  |||||| ||| ||||  | | ||||| ||||  ||||| ||||||| | ||| ||| |   |||||||| ||    
T  28474381 a-tggctgtttattggattt-aacctcgtctaag-agagcgaaagactcaaaggaaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtcctttgt 28474285  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||    
T  28474284 tga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctgcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgt 28474187  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     ||||| ||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  28474186 tccttt-aagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgac 28474089  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||    
T  28474088 tctttagacgtgct 28474075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20799118 - 20798912
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  20799118 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaaaataacagctctgcctgcagaatt-gttcct 20799020  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  20799019 t-caagataggaatgaatttgaagttgatcctctataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 20798922  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  20798921 tagacgtgct 20798912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 20883910 - 20884116
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  | |      
T  20883910 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccattagctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgccagcagaattcttcc-- 20884007  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  20884008 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaacagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 20884106  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    | ||||||||    
T  20884107 tggacgtgct 20884116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 22610002 - 22610208
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  22610002 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaatt-gttcct 22610100  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||  | || ||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||  || ||||||||||    
T  22610101 t-caagataggaatgaatttgaatttgatcctttataggactacactcaaatcaggcaaaagattactgatggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 22610198  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  22610199 tagacgtgct 22610208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 45070681 - 45070887
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  45070681 agagttgacaaattacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttcct 45070779  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  || ||||| ||||    
T  45070780 t-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattagtggtgaatgatcaaaggaactc-aacgattctt 45070877  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  45070878 tagacgtgct 45070887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 30291903 - 30292065
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||| ||||| |||    
T  30291903 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactaaagattcaa 30292001  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacg 176  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30292002 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacg 30292065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 5929757 - 5929552
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||     
T  5929757 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagacaccagctctgcctgcagaa-atgttcc- 5929660  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |  | || ||||||||||    
T  5929659 ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggta-ttgatcaaggtttctc-aacgactctt 5929562  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  5929561 tagacgtgct 5929552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23927112 - 23926906
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| ||     
T  23927112 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtatgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctacagaa-atgttcc- 23927015  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||  || ||||||||||    
T  23927014 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 23926916  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    | ||||||||    
T  23926915 tggacgtgct 23926906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 19038061 - 19037854
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  19038061 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctgcgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 19037963  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||| |||||| |||||||  | |||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |  | || |||||||||    
T  19037962 -ttcaagataggaatggatttgaacgtgattctttataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaaggtttctc-aacgactct 19037865  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    || ||||||||    
T  19037864 tttgacgtgct 19037854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 44201066 - 44200859
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||| ||    
T  44201066 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacaactttgcctgcagaa-atgttcc 44200968  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||| |||||| |||||||  | ||  |||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| |    |||||||||    
T  44200967 -ttcaagataggaatggatttgaacttgatctttcataggacaacatccaaatcaggaaaaagatcattggta-ttgatcaaaggtttctcaacgactct 44200870  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  44200869 ttagacgtgct 44200859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28380049 - 28379843
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  28380049 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccagtacctccacgactctaattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 28379952  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| |||||  |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |  | || ||||||||||    
T  28379951 ttcaagataggaattgatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaaggtttctc-aacgactctt 28379853  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    | ||||||||    
T  28379852 ttgacgtgct 28379843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Original strand, 52350712 - 52350881
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||  ||| ||     
T  52350712 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataatagctctgcctgcagaa-atgt-ccc 52350809  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggta 385  Q
    |||||| | |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  52350810 ttcaagttaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggta 52350881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17371097 - 17370927
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || |||| |||||||||||  ||| |    
T  17371097 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcagaa-atgttc 17370999  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | |||| ||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17370998 c-ttcatgataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggt 17370927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20251828 - 20251659
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  20251828 agagttgacaaagtgcaagggtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctatgctacaaaacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 20251731  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggta 385  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  20251730 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggta 20251659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 384
Target Start/End: Original strand, 19170360 - 19170529
Alignment:
Q  216 gagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |  |  |    
T  19170360 gagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgtt--c 19170457  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
     |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  19170458 gttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaagcaaaagatcattggt 19170529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22019391 - 22019211
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||  ||| |    
T  22019391 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctcttcctgcagaa-atgttc 22019293  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  22019292 c-ttcaagataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 22019211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22655532 - 22655362
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||  ||| |    
T  22655532 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaa-atgttc 22655434  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22655433 c-ttcaagataggaatggatttgaatgtgatccttcttaggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 22655362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23065003 - 23064935
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23065003 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaa 23064935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21544084 - 21543914
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| | || |    
T  21544084 agagttgacaaagtaagaaatgtacgaccactacctccactactttgcttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgtagaaat-gttc 21543986  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    ||| |||| | |||||| |||||||  | |||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  21543985 ctt-caagttaggaatggatttgaacatgattctttataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 21543914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22642950 - 22642780
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||  ||| |    
T  22642950 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacggtacaagacaagataaacagttctgcctgcagaa-atgttc 22642852  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||  ||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22642851 c-ttcaagataggaatggatttgaacatgatccttcttaggacaacatccaaataaggcaaaagatcattggt 22642780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 20883711 - 20883777
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20883711 tcatcagaaccagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 20883777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Original strand, 26548282 - 26548452
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | |||| ||||||||||||| ||  ||||||| || ||||| || |  |      
T  26548282 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgacactgcctctgtctacgctacaagacaggataaacagctctgtctgcataaatgtt-- 26548379  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| |||||  || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26548380 ctttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacagcatccaaatcaggcaaaagatcattggt 26548452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1900383 - 1900311
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  1900383 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 1900311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 21204965 - 21205017
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21204965 aagtgtacaaccactacttccactactctgttttgtctgtgctacaagacaag 21205017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 25448608 - 25448680
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  25448608 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 25448680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 36134228 - 36134156
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  36134228 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 36134156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37642286 - 37642215
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgc 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37642286 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgc 37642215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 2327482 - 2327536
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  2327482 aagtgtacaaccactacctccactactctggttttgtctctgctacaagacaaga 2327536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22153895 - 22153841
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  22153895 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22153841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35040204 - 35040150
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  35040204 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 35040150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 14263493 - 14263526
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14263493 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 14263526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 39201034 - 39201067
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39201034 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 39201067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 21191907 - 21191939
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21191907 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 21191939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21702852 - 21702780
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  21702852 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 21702780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 22427399 - 22427471
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22427399 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 22427471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 48570273 - 48570345
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  48570273 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaggacaagaaaaacagctatgcctgca 48570345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Original strand, 7745132 - 7745207
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||    
T  7745132 aagtgtacaaccactacctccactactctgctattgccttcgctacatgacaagaaaaacagctttgcctgcagaa 7745207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 45070484 - 45070543
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaag 76  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45070484 catcagaagca-aagttcataagaagcaaaatttc--atcagaagctatatcatcaccagaag 45070543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2268569 - 2268515
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  2268569 aagtgtacaaccactacctcgactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 2268515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 22600224 - 22600278
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  22600224 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22600278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2267127 - 2267094
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2267127 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttt 2267094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7309857 - 7309804
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    ||||||||||||||    
T  7309857 aagtgtacaaccactacctccaatactctgttgtgtatctgctacaagacaaga 7309804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 18896639 - 18896672
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18896639 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttt 18896672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 19188200 - 19188171
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19188200 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 19188171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23054414 - 23054373
Alignment:
Q  221 gacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 262  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23054414 gacatagtacaattgtacaaccactaccttcactactctgtt 23054373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30572235 - 30572202
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30572235 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 30572202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35401847 - 35401814
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35401847 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttt 35401814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46089027 - 46088994
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46089027 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 46088994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 675839 - 675807
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagt 45  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  675839 tcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaagt 675807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 12613856 - 12613888
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12613856 aagtgtacaaccactaccttcactactctgttt 12613888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 16235338 - 16235410
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactact-ctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16235338 aagtgtacaacaactacctccactactccttttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 16235410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 267
Target Start/End: Original strand, 17025006 - 17025042
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17025006 aagtgtacaaccactacctccacttctttgttttgtc 17025042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19215650 - 19215578
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  19215650 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 19215578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 21135202 - 21135274
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21135202 aagtgtacaaccactaaatccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 21135274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 22464851 - 22464923
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22464851 aagtgtacatccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 22464923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 33256393 - 33256465
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  33256393 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 33256465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 33276565 - 33276637
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  33276565 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 33276637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 111)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19225396 - 19224979
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19225396 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 19225298  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19225297 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcgctgagcatttgtccttcgtta 19225198  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225197 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 19225098  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19225097 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggacaacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaatgactct 19224999  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  19224998 ttagacgtgctaatcatctc 19224979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Original strand, 30314518 - 30314931
Alignment:
Q  17 cagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagta 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30314518 cagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagattcaaagta 30314616  T
Q  117 gctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacag 216  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  30314617 gttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtaccaacggtcatttggatagcgcttagcatttgtccttcgttaacag 30314716  T
Q  217 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30314717 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtcctcgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc-ttc 30314815  T
Q  317 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30314816 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttag 30314915  T
Q  417 acgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||| ||||||||    
T  30314916 acgtgctaattatctc 30314931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19418814 - 19418397
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  19418814 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaa 19418716  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | || ||||||||||    
T  19418715 agtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcattgagtatttttccttcgtta 19418616  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19418615 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgcc 19418516  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  19418515 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactct 19418417  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  19418416 ttagacgtgctaatcatctc 19418397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 20161047 - 20161464
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20161047 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaa 20161145  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  20161146 agtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgtta 20161245  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20161246 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcc 20161345  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20161346 -ttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 20161444  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  20161445 ttagacgtgctaattatctc 20161464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20196420 - 20196003
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20196420 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaa 20196322  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  20196321 agtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgtta 20196222  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20196221 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcc 20196122  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20196121 -ttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 20196023  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  20196022 ttagacgtgctaattatctc 20196003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19429391 - 19428972
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  19429391 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaa 19429293  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | || ||||||||||    
T  19429292 agtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcattgagtatttttccttcgtta 19429193  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19429192 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtg 19429093  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  19429092 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgact 19428994  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  19428993 ctttagacgtgctaatcatctc 19428972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 23457121 - 23457530
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  23457121 tcatcagaagtagaaaatcatcagaagcaaagttg-tcatcataagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaaattcaaactgaagatcca 23457219  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  23457220 aagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaaccaagaattgaaagggaggtatcaatggtcatttggatagcactgagtatttttccttcgtt 23457319  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23457320 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 23457419  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23457420 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggagtactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactc 23457518  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  23457519 tttagacgtgct 23457530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31215477 - 31215069
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31215477 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccataaattcaaactgaagatccaa 31215379  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  31215378 agtagctgtttctcttttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaactgtcattt-gatagcactgagcatttgtccttcatta 31215280  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31215279 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctataagacaagacaacagctatgcctgcataatttatgc 31215180  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||| |||||| ||||    
T  31215179 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtggatgatcaaaagatttcaaacaactc 31215081  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  31215080 tttagacgtgct 31215069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 23469277 - 23469696
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  23469277 tcatcagaagtagaaaatcatcagaagcaaagttg-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaaattcaaactgaagatcca 23469375  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  23469376 aagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaaccaagaattgaaagggaggtatcaatggtcatttggatagcactgagtatttttccttcgtt 23469475  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23469476 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactcctctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 23469575  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  23469576 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggagtactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgact 23469674  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  23469675 ctttagacgtgctaatcatctc 23469696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16747463 - 16747047
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||   || |||||||||||||||||||    
T  16747463 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagtgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaa 16747365  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  16747364 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 16747265  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16747264 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgcc 16747165  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  || |||||||||    
T  16747164 -ttcaagatggaaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactct 16747067  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  16747066 ttagacgtgctaatcatctc 16747047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 18768955 - 18769363
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||||||| |||    
T  18768955 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactgaagattcaa 18769053  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| |||||  |||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | | ||||| | |||||||||||||    
T  18769054 agtagttgtttaacatttcaacctcgtcttagaagaacgaagaattgacagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtatttgtccttcgtta 18769153  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769154 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagataagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 18769253  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  18769254 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 18769351  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  18769352 tttagacgtgct 18769363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 29 - 432
Target Start/End: Original strand, 6318351 - 6318752
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  || ||| |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  6318351 gtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagctatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caatctgaagattcaaagtagctggttctcaa 6318448  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6318449 ttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggatgtaccaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccctcgttaacagagttgacaaagt 6318548  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  6318549 acaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcataatttgtgtc-ctcaagatgggaat 6318647  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6318648 gaatttgaagcttattcttcaaaggagtacactcaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgttctgatt 6318747  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  6318748 atctc 6318752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3221095 - 3220676
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  3221095 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 3220997  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  3220996 agtagctgattctcaattcagtcttattcaagaagaacgaagaattgaaagggaagtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 3220897  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  3220896 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgta 3220797  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3220796 cctt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 3220698  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3220697 ctttagacgtgctgattatctc 3220676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18154199 - 18153782
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||  || | |||||||||||||| ||    
T  18154199 tcatcataagcagaaggtcatcagaagcaaggttttttatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattca 18154100  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  18154099 aagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagcactgagtacttgtccttcgtt 18154000  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||     
T  18153999 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgc--aaattgtt 18153902  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||| |||    
T  18153901 cc-ttcaagataggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacaact 18153804  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  18153803 ctttagacgtgctaatcatctc 18153782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19139743 - 19139324
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  19139743 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 19139645  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  19139644 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 19139545  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  19139544 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgt- 19139446  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  19139445 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 19139346  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  19139345 ctttagacgtgttgattatctc 19139324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18158718 - 18158301
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||  || | |||||||||||||| ||    
T  18158718 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagaaaggttttt-atcagaagcgaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattca 18158620  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||| |||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||    
T  18158619 aagtagatgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagaactgagtacttgtccttcgtt 18158520  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18158519 aacggagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccactctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-ttgtt 18158421  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  18158420 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 18158323  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  18158322 ctttagacgtgctaatcatctc 18158301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36078399 - 36077979
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  36078399 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 36078301  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  36078300 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 36078201  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  36078200 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 36078101  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36078100 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 36078001  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36078000 ctttagacgtgctgattatctc 36077979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36088985 - 36088565
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  36088985 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 36088887  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  36088886 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 36088787  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  36088786 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 36088687  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36088686 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 36088587  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36088586 ctttagacgtgctgattatctc 36088565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36293382 - 36292963
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  36293382 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 36293284  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  36293283 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 36293184  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  36293183 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 36293085  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36293084 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 36292985  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36292984 ctttagacgtgctgattatctc 36292963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36303985 - 36303566
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  36303985 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 36303887  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  36303886 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 36303787  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  36303786 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 36303688  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36303687 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 36303588  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36303587 ctttagacgtgctgattatctc 36303566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9856289 - 9856708
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||| ||||| |||    
T  9856289 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactaaagattcaa 9856387  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  9856388 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggagatatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 9856487  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  9856488 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctctactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 9856587  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9856588 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9856686  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9856687 ctttagacgtgctgattatctc 9856708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6151534 - 6151114
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  6151534 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 6151436  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || ||    
T  6151435 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatt 6151336  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6151335 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 6151236  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  6151235 acact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 6151137  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6151136 tctttagacgtgctgattatctc 6151114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26111695 - 26111275
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  26111695 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 26111597  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  26111596 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagagaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 26111497  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||     
T  26111496 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacaacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgt- 26111398  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  26111397 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 26111298  T
Q  411 cttt-agacgtgctgattatctc 432  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  26111297 ctttaagacgtgctaattatctc 26111275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26121373 - 26120953
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  26121373 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 26121275  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| || |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  26121274 agtagttgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 26121175  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  26121174 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 26121076  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  26121075 acgttcaagatgggaataaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 26120976  T
Q  411 cttt-agacgtgctgattatctc 432  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  26120975 ctttaagacgtgctaattatctc 26120953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 209971 - 210389
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  209971 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 210069  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  210070 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 210169  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  210170 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 210267  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  210268 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 210367  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  210368 ctttagacgtgctgattatctc 210389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 252871 - 252453
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  252871 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 252773  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  252772 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 252673  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  252672 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 252575  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  252574 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 252475  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  252474 ctttagacgtgctgattatctc 252453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 723594 - 724012
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  723594 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 723692  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  723693 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 723792  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  723793 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 723890  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  723891 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 723990  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  723991 ctttagacgtgctgattatctc 724012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 848785 - 849203
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  848785 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 848883  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  848884 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 848983  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  848984 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 849081  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  849082 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 849181  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  849182 ctttagacgtgctgattatctc 849203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 15791116 - 15791535
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  15791116 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 15791214  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||   ||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  15791215 agtagctaactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 15791314  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  15791315 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 15791414  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15791415 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 15791513  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  15791514 ctttagacgtgctgagtatctc 15791535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6161488 - 6161069
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  6161488 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 6161390  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  6161389 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 6161290  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||     
T  6161289 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaaaacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgta 6161190  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6161189 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 6161091  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6161090 ctttagacgtgctgattatctc 6161069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9368751 - 9368332
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9368751 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9368653  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  9368652 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 9368553  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  9368552 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 9368453  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9368452 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9368354  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9368353 ctttagacgtgctgattatctc 9368332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18449833 - 18449414
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  18449833 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 18449735  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  18449734 agtagctgattctcaattcagtcctattcaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 18449635  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  18449634 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 18449536  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  18449535 acactcaaaatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 18449436  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  18449435 ctttagacgtgctgactatctc 18449414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1750558 - 1750193
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagcta--tatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| ||   |  || | ||||||||||      
T  1750558 tcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatatcttaat-ctaactgaagattt 1750460  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1750459 aaagtagctggttctcaactcagccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcatttgtccttcgt 1750360  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  1750359 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatatgt 1750260  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 377  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1750259 gcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 1750193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 242286 - 241868
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  242286 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 242188  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaac-gatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
     ||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||  |||||  |||||    
T  242187 tgtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagat-atatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 242089  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  242088 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt 241990  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
      |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  241989 -acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 241891  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  241890 tctttagacgtgctgattatctc 241868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 3348444 - 3348863
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || ||| |||||||| |||    
T  3348444 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caatctgaagattcaa 3348542  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  3348543 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 3348642  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  3348643 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 3348742  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  3348743 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 3348841  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3348842 ctttagacgtgctgattatctc 3348863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 3359041 - 3359460
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || ||| |||||||| |||    
T  3359041 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caatctgaagattcaa 3359139  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  3359140 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 3359239  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  3359240 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 3359339  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  3359340 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 3359438  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3359439 ctttagacgtgctgattatctc 3359460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9341607 - 9341188
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9341607 tcatcagaagcagaaaatcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9341509  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  9341508 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 9341409  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  9341408 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 9341309  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9341308 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9341210  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9341209 ctttagacgtgctgattatctc 9341188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 15780527 - 15780946
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || || ||||||||| |||    
T  15780527 tcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-catactgaagattcaa 15780625  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||   ||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||||| ||||| | |||||  ||||||    
T  15780626 agtagctaactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgagtacttgtctctcgtta 15780725  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  15780726 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 15780825  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15780826 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 15780924  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  15780925 ctttagacgtgctgagtatctc 15780946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29077193 - 29076775
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  29077193 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 29077095  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  29077094 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 29076995  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  29076994 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 29076897  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  29076896 acactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 29076797  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29076796 ctttagacgtgctgattatctc 29076775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29087444 - 29087026
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  29087444 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 29087346  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  29087345 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 29087246  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  29087245 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 29087148  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  29087147 acactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 29087048  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29087047 ctttagacgtgctgattatctc 29087026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 32088087 - 32088505
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  32088087 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 32088185  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  32088186 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 32088285  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  32088286 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 32088383  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  32088384 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 32088483  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32088484 ctttagacgtgctgattatctc 32088505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 32077514 - 32077932
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  32077514 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 32077612  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  32077613 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 32077712  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  32077713 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 32077810  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  32077811 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgatggataatcaaaggatttcaaacgact 32077910  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32077911 ctttagacgtgctgattatctc 32077932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43248780 - 43248370
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  43248780 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 43248682  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  43248681 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 43248582  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  43248581 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac---------tctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 43248491  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  43248490 cgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 43248392  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43248391 ctttagacgtgctgattatctc 43248370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Original strand, 13688401 - 13688804
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  13688401 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 13688499  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  13688500 tcagtcttatcaaagaaggacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 13688599  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  13688600 caagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 13688699  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13688700 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 13688799  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  13688800 atctc 13688804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 96 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19129129 - 19128792
Alignment:
Q  96 tcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctga 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||    
T  19129129 tcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattctgtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 19129030  T
Q  196 gcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 293  Q
    ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  19129029 gcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagcca 19128930  T
Q  294 tgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatca 393  Q
    ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  19128929 tgcctgcagaagttgt-acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggattactggtggataatca 19128831  T
Q  394 aaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19128830 aaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctc 19128792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 171 - 418
Target Start/End: Original strand, 30325227 - 30325473
Alignment:
Q  171 tcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccac 270  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30325227 tcaacggtcatttggatagcgcttagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtcctc 30325326  T
Q  271 gctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30325327 gctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggc 30325425  T
Q  371 aaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagac 418  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30325426 aaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagac 30325473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44481549 - 44481135
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||| |  | ||||||||||||   ||    
T  44481549 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcc-tttaatcaaactgaaga--gaa 44481453  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || |||    
T  44481452 agttgctgattctcaattcagtcttatcaa---agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcatta 44481356  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  44481355 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 44481257  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  44481256 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 44481157  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  44481156 ctttagacgtgctgtttatctc 44481135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44492165 - 44491751
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||| |  | ||||||||||||   ||    
T  44492165 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcc-tttaatcaaactgaaga--gaa 44492069  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || |||    
T  44492068 agttgctgattctcaattcagtcttatcaa---agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcatta 44491972  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  44491971 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 44491873  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  44491872 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 44491773  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  44491772 ctttagacgtgctgtttatctc 44491751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 40213006 - 40213404
Alignment:
Q  31 catcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcattt 130  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  40213006 catcagaagcaaggtttc--atcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtgaatttaaactggagattcaaagtagctgtttctcgttt 40213103  T
Q  131 caaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaa-gta 229  Q
    ||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| | ||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  40213104 caacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggccgtttgaagagcactgcgtacttgtccttctttaacagagttgacaaaagta 40213203  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatg 328  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||| |||||||||||||    
T  40213204 caagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacactacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaaat-gttcctt-caagatgggaatg 40213301  T
Q  329 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatta 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||| || |    
T  40213302 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacctgctaatca 40213400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 384
Target Start/End: Original strand, 6576373 - 6576708
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggaga 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||  |||||| ||| |||    
T  6576373 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagtagctaactctcaattcagtcttatccaagaaga 6576471  T
Q  149 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576472 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcatttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 6576571  T
Q  249 tccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 346  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6576572 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt-acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattctt 6576670  T
Q  347 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576671 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 6576708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3843982 - 3843578
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| | |||    
T  3843982 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaa 3843885  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || ||| || ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  3843884 aggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 3843786  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |    
T  3843785 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttc 3843688  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  3843687 ctt-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 3843590  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  3843589 tttagacgtgct 3843578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 20259438 - 20259842
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||   || ||| ||||||||| | |||    
T  20259438 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagttatatcatcaccagaagctacagttgattagtaaatttaaactgaagtttcaa 20259535  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || ||| || ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  20259536 aggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 20259634  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  20259635 a-agagttgaaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 20259732  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||| ||| |||||||     
T  20259733 c-ttcaagataggaatgaattcaaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtgaatgatcaaaggaaatc-aacgactt 20259830  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  20259831 tttagacgtgct 20259842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 21046068 - 21046472
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||   || ||| ||||||||| | |||    
T  21046068 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagttatatcatcaccagaagctacagttgattagtaaatttaaactgaagtttcaa 21046165  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || ||| || ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  21046166 aggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 21046264  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  21046265 a-agagttgaaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 21046362  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||| ||| |||||||     
T  21046363 c-ttcaagataggaatgaattcaaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtgaatgatcaaaggaaatc-aacgactt 21046460  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  21046461 tttagacgtgct 21046472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28691366 - 28691189
Alignment:
Q  9 gacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagat 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28691366 gacatcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaaaggtc--atcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagat 28691269  T
Q  109 ccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggata 188  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28691268 ctaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata 28691189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23371008 - 23370609
Alignment:
Q  12 atcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||  | ||    
T  23371008 atcatcagaagca-aagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaaatttca 23370912  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||| |||||||| || ||| | ||| |||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||    
T  23370911 aaggagctgtttttcgttttatcctcatctgagaa-aacgaagaattaaaagggaggtaccaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcttt 23370813  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||     
T  23370812 ga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt-----ctacaagacaagacaacacctctgcctacagaa-atgtt 23370720  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||| | || ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  23370719 ccttt-aagataggaatgaattcaaagttgatccttcgtaggactacacccaaatcaggaaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 23370622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 254 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 795401 - 795223
Alignment:
Q  254 tactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaag 351  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  795401 tactctgttttcggtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaag 795304  T
Q  352 gactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  795303 gactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 795223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 7018400 - 7018606
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  7018400 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaa-atgttcc- 7018497  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  7018498 ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 7018596  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  7018597 tagacgtgct 7018606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 22135877 - 22136083
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  22135877 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttcct 22135975  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  22135976 t-caagatgggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 22136073  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  22136074 tagacgtgct 22136083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 22167042 - 22167248
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  22167042 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagataagataacagctttgcctgcagaatt-gttcct 22167140  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  22167141 t-caagatgggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 22167238  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  22167239 tagacgtgct 22167248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 22211407 - 22211614
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||    
T  22211407 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagccctgcctgcagaatt-gttcct 22211505  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  22211506 t-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 22211603  T
Q  414 t-agacgtgct 423  Q
    | |||||||||    
T  22211604 taagacgtgct 22211614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 30325111 - 30325231
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30325111 tcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaa 30325209  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30325210 agtagctgtttctcatttcaac 30325231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 23271223 - 23271430
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  23271223 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacttccactactctgcctgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 23271321  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  23271322 -ttcaagataggaatggatttgaatttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactct 23271419  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  23271420 ttagacgtgct 23271430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 16436878 - 16437026
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  16436878 tcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatccctcaat-caaactgaagattcaa 16436975  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaag 163  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16436976 agtagctgtctctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaag 16437026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28903507 - 28903328
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  28903507 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactagctccactactctgttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 28903409  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
     |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  28903408 -ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtaattgatcaa 28903328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19461375 - 19461120
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgt-ttctcatttcaaccttatctaaggag 147  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||| | ||||  |||||| || | | || |||||  |||||| ||    
T  19461375 tcattagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaacctgaagtttcaaaagagctgtcttttgaatttaacctcgtctaag-ag 19461277  T
Q  148 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 247  Q
    | ||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19461276 agcgaaggattaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagagtacaaccactac 19461178  T
Q  248 ctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    |||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19461177 ctccacgactctgcttgtgtctacgctataagacaagataacagctctgcctgcagaa 19461120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19559053 - 19558798
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgt-ttctcatttcaaccttatctaaggag 147  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||| | ||||  |||||| || | | || |||||  |||||| ||    
T  19559053 tcattagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaacctgaagtttcaaaagagctgtcttttgaatttaacctcgtctaag-ag 19558955  T
Q  148 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 247  Q
    | ||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19558954 agcgaaggattaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagagtacaaccactac 19558856  T
Q  248 ctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    |||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19558855 ctccacgactctgcttgtgtctacgctataagacaagataacagctctgcctgcagaa 19558798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 8032081 - 8031874
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||  ||| ||    
T  8032081 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcttgcagaa-atgttcc 8031983  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |  | || |||||||||    
T  8031982 -ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaaggtttctc-aacgactct 8031885  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    || ||||||||    
T  8031884 tttgacgtgct 8031874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40003277 - 40003107
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| |    
T  40003277 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgactgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttc 40003179  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  |||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  40003178 c-ttcaagataggaatggatttgaacgtaattcttcttaggacaacatccaaatcagacaaaagatcattggt 40003107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Original strand, 17519161 - 17519341
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||  ||| |    
T  17519161 agagttaacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctcttcctgcagaa-atgttc 17519259  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  17519260 c-ttcaagataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 17519341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 795656 - 795586
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatt 83  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  795656 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatt 795586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21540997 - 21540830
Alignment:
Q  218 gttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 314  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||  ||| || |    
T  21540997 gttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataa-atgttcc-t 21540900  T
Q  315 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    |||  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  21540899 tcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggt 21540830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 412
Target Start/End: Original strand, 15425273 - 15425453
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |   ||| || ||||  |||||||||    
T  15425273 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttcc-ttcacaatgggaatg 15425370  T
Q  329 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| | | ||||||||||||    
T  15425371 catttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaaggatcattggtgaatgatcaaaagct-tcaaacgactct 15425453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9320599 - 9320546
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  9320599 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgctacaagacaaga 9320546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 22135679 - 22135745
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22135679 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagttaca 22135745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 15336208 - 15336280
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15336208 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 15336280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 15516577 - 15516649
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15516577 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 15516649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29379626 - 29379534
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||    
T  29379626 agagttgacaaagtagaaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagaaaaacatctctgcctgcagaa 29379534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 132
Target Start/End: Original strand, 13596380 - 13596481
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  13596380 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 13596478  T
Q  130 tca 132  Q
    |||    
T  13596479 tca 13596481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 22211208 - 22211274
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22211208 tcatcagaagtagaagttcatcagaagcaagaat--tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 22211274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23783773 - 23783708
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783773 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 23783708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 13430748 - 13430820
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13430748 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtccctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 13430820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19129193 - 19129145
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagcta 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  19129193 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcta 19129145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26833072 - 26833032
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26833072 agtataagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 26833032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 45538559 - 45538631
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  45538559 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 45538631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 384
Target Start/End: Original strand, 45568021 - 45568174
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatg 328  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| |  | ||  |||  || ||||||    
T  45568021 aagtgtacgaccactaccttcactactctgtttatgtctacgctataagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccc--tcagaataggaatg 45568118  T
Q  329 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
     |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  45568119 gatttgaatgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggt 45568174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19943266 - 19943232
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19943266 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttg 19943232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17797453 - 17797420
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17797453 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 17797420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1237668 - 1237596
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  1237668 aagtgtacaaccactacctccactactctgttgttgtctctgctacaagagaagaaaaacagctctgcctgca 1237596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21932914 - 21932842
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgt-tttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  21932914 aagtgtacaaccactacctccactactcagtgtttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 21932842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 36105226 - 36105154
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  36105226 aagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 36105154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 266
Target Start/End: Original strand, 18685517 - 18685552
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18685517 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttgt 18685552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 266
Target Start/End: Original strand, 18722766 - 18722801
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18722766 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttgt 18722801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 266
Target Start/End: Original strand, 18731111 - 18731146
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18731111 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttgt 18731146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 24833177 - 24833248
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | ||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  24833177 aagtgtacaaccactacctccattactctattttgtctctgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 24833248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6407757 - 6407703
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  6407757 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 6407703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 107
Target Start/End: Original strand, 7018236 - 7018294
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaaga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||| |||||||    
T  7018236 tcatcagaagctatatcatcaccagaatctacagttgatcagaagattcaacctgaaga 7018294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16207337 - 16207283
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  16207337 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 16207283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 23185346 - 23185400
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  23185346 aagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaaga 23185400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43639814 - 43639741
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg--ttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  43639814 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 43639741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 301
Target Start/End: Original strand, 14989574 - 14989643
Alignment:
Q  234 tgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14989574 tgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 14989643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 46
Target Start/End: Original strand, 22166828 - 22166861
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtt 46  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22166828 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtt 22166861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 22166845 - 22166910
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22166845 tcatcagaagca-aagttcataagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagttaca 22166910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 23783790 - 23783757
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtt 46  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23783790 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtt 23783757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24551305 - 24551272
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24551305 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttt 24551272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 30421549 - 30421582
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30421549 aagtttacaaccactacctccactactctgtttt 30421582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 40845507 - 40845540
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40845507 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 40845540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17688018 - 17687986
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17688018 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 17687986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18772656 - 18772616
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18772656 agtacaaatgtacaaccattacctccactactcttttttgt 18772616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 301
Target Start/End: Original strand, 19956464 - 19956532
Alignment:
Q  234 tgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   || |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  19956464 tgtacaaccactacctccaataccctgttttgtctctgcaacaagacaagaataacagttatgcctgca 19956532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 39693566 - 39693494
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39693566 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgca 39693494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43644927 - 43644895
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43644927 aagtgtacaaccactacctccactactcggttt 43644895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 105)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 18768709 - 18769125
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18768709 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 18768807  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  18768808 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 18768907  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18768908 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 18769007  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  18769008 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 18769105  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  18769106 ttagacgtgctaatcatctc 18769125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 21172269 - 21172686
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21172269 tcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 21172367  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  21172368 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 21172467  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21172468 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcttgcagaatttgtgcc 21172567  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21172568 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 21172666  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  21172667 ttagacgtgctaatcatctc 21172686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 28721119 - 28721536
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  28721119 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactcaagatccaa 28721217  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  28721218 agtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatctgtccttcgtta 28721317  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28721318 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 28721417  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28721418 -ttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 28721516  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  28721517 ttagacgtgctaatcatctc 28721536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 28731707 - 28732122
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28731707 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 28731805  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  28731806 agtagctgtttctcatttcaacatcatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 28731905  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28731906 acagagttgacaaagtacaagtgt--aaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 28732003  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28732004 -ttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 28732102  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  28732103 ttagacgtgctaatcatctc 28732122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 15 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2561913 - 2561498
Alignment:
Q  15 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaag 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2561913 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaag 2561815  T
Q  115 tagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2561814 tagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcacttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaac 2561715  T
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  2561714 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcc-t 2561616  T
Q  315 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactcttt 414  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2561615 tcaaagtgggaatgaatttgaagataattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactcttt 2561516  T
Q  415 agacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  2561515 agacgtgctaattatctc 2561498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 24414825 - 24415241
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||   || |||||||||||||||||||    
T  24414825 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaa 24414923  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  24414924 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 24415023  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24415024 acaaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 24415123  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||  || |||||||||    
T  24415124 -ttcaagatgagaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactct 24415221  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  24415222 ttagacgtgctaatcatctc 24415241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 7005609 - 7006028
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  7005609 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 7005707  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  7005708 agtagctgattctcaattcaatcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 7005807  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  7005808 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgt- 7005906  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  7005907 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 7006006  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7006007 ctttagacgtgctgattatctc 7006028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 17857239 - 17857658
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||| ||||| |||    
T  17857239 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactaaagattcaa 17857337  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  17857338 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 17857437  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  17857438 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 17857537  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  17857538 cgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 17857636  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17857637 ctttagacgtgctgattatctc 17857658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29244652 - 29244229
Alignment:
Q  9 gacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagat 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||    
T  29244652 gacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagat 29244554  T
Q  109 ccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttc 208  Q
     ||||||| ||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||    
T  29244553 tcaaagtaactgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctc 29244454  T
Q  209 gttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatt 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  29244453 gttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagt 29244354  T
Q  307 tgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaac 406  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  29244353 tgt-acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaac 29244255  T
Q  407 gactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29244254 gactctttagacgtgctgattatctc 29244229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29255231 - 29254808
Alignment:
Q  9 gacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagat 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||    
T  29255231 gacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagat 29255133  T
Q  109 ccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttc 208  Q
     ||||||| ||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||    
T  29255132 tcaaagtaactgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctc 29255033  T
Q  209 gttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatt 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  29255032 gttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagt 29254933  T
Q  307 tgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaac 406  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  29254932 tgt-acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaac 29254834  T
Q  407 gactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29254833 gactctttagacgtgctgattatctc 29254808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26867498 - 26867081
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||  || | |||||||||||||| ||    
T  26867498 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattca 26867400  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||    
T  26867399 aagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagcattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 26867300  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  26867299 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-ttgtt 26867201  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||  || |||||||    
T  26867200 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattgttggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 26867103  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  26867102 ctttagacgtgctaatcatctc 26867081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9897376 - 9897795
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9897376 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9897474  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  9897475 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 9897574  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  9897575 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 9897673  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9897674 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9897773  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9897774 ctttagacgtgctgattatctc 9897795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9907964 - 9908383
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9907964 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9908062  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  9908063 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 9908162  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  9908163 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 9908261  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9908262 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9908361  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9908362 ctttagacgtgctgattatctc 9908383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 24327536 - 24327955
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  24327536 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 24327634  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  24327635 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 24327734  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||     
T  24327735 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgt- 24327833  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24327834 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24327933  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  24327934 ctttagacatgctgattatctc 24327955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10267420 - 10267001
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  10267420 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 10267322  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  10267321 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 10267222  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  10267221 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 10267123  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  10267122 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 10267023  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10267022 ctttagacgtgctgattatctc 10267001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10277997 - 10277578
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  10277997 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 10277899  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  10277898 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 10277799  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  10277798 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 10277700  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  10277699 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 10277600  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10277599 ctttagacgtgctgattatctc 10277578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 22914666 - 22915085
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  22914666 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 22914764  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  22914765 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 22914864  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||     
T  22914865 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgta 22914964  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  22914965 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 22915063  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22915064 ctttagacgtgctgattatctc 22915085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 34790019 - 34790438
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  34790019 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 34790117  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||| |||||  ||||||    
T  34790118 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagcacttgtctctcgtta 34790217  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  34790218 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 34790317  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  34790318 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 34790416  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34790417 ctttagacgtgctgattatctc 34790438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40222759 - 40222340
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||| ||||| |||    
T  40222759 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactaaagattcaa 40222661  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  40222660 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 40222561  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  40222560 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 40222461  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  40222460 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 40222362  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40222361 ctttagacgtgctgattatctc 40222340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40251620 - 40251201
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||| ||||| |||    
T  40251620 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactaaagattcaa 40251522  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  40251521 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 40251422  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  40251421 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 40251322  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  40251321 cact-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 40251223  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40251222 ctttagacgtgctgattatctc 40251201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9773108 - 9773527
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9773108 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9773206  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  9773207 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 9773306  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  9773307 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 9773405  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9773406 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9773505  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9773506 ctttagacgtgctgattatctc 9773527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 22960134 - 22960553
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  22960134 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 22960232  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  22960233 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 22960332  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||     
T  22960333 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgt- 22960431  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  22960432 acactcaagatgagaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 22960531  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22960532 ctttagacgtgctgattatctc 22960553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 24338206 - 24338625
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||| ||| |||    
T  24338206 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgatgattcaa 24338304  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||  |||||| |||||  ||||||    
T  24338305 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcattgagcacttgtctctcgtta 24338404  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  24338405 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 24338503  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24338504 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgatggataatcaaaggatttcaaacgact 24338603  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  24338604 ctttagacatgctgattatctc 24338625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 34804162 - 34804581
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  34804162 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 34804260  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||| |||||  ||||||    
T  34804261 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagcacttgtctctcgtta 34804360  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  34804361 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 34804459  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  34804460 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 34804559  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  34804560 ctttagacgtggtgattatctc 34804581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43093683 - 43093263
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |  || |||||||||||| |||    
T  43093683 tcatcagaagcagaaggtcgtcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgcttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 43093585  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcat-ttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  43093584 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatattggatagcactgagcacttgtctctcgtt 43093485  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  43093484 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactagtctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaagttgt 43093385  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43093384 acgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgac 43093286  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43093285 tctttagacgtgctgattatctc 43093263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 1098997 - 1099416
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||| ||||| |||    
T  1098997 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactaaagattcaa 1099095  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  1099096 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 1099195  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  1099196 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 1099294  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  1099295 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 1099394  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1099395 ctttagacgtgctgattatctc 1099416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 9762572 - 9762991
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  9762572 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 9762670  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  9762671 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcttta 9762770  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  9762771 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 9762869  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9762870 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9762969  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9762970 ctttagacgtgctgattatctc 9762991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 11388611 - 11389030
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  11388611 tcatcagaagcaaaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 11388709  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  11388710 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 11388809  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  11388810 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 11388908  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  11388909 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 11389008  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11389009 ctttagacgtgctgattatctc 11389030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 21650334 - 21650752
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  21650334 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 21650432  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  21650433 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 21650532  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  21650533 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 21650630  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  21650631 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 21650730  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21650731 ctttagacgtgctgattatctc 21650752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 30488625 - 30489045
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||| ||||| |||    
T  30488625 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactaaagattcaa 30488723  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  30488724 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 30488823  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  30488824 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 30488923  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  30488924 caactcaagatgggaacgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 30489023  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30489024 ctttagacgtgctgattatctc 30489045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 432
Target Start/End: Original strand, 36251662 - 36252065
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 128  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  36251662 gtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagtagctgattctcaa 36251760  T
Q  129 ttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 228  Q
    ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  36251761 ttcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagt 36251860  T
Q  229 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  36251861 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt-acactcaagatgggaa 36251959  T
Q  327 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgat 426  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36251960 tgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgat 36252059  T
Q  427 tatctc 432  Q
    ||||||    
T  36252060 tatctc 36252065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43355448 - 43355030
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  43355448 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 43355350  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  43355349 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 43355250  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  43355249 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 43355152  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  43355151 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 43355052  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43355051 ctttagacgtgctgattatctc 43355030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 432
Target Start/End: Original strand, 27978187 - 27978601
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  || ||  ||| ||||||||||| ||||    
T  27978187 catcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttc--atcagaagcgatatcatcaccagaagctacaagtgttcaattaatttaaactgaagattcaaa 27978284  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||     
T  27978285 gtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 27978384  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  27978385 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 27978483  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  27978484 -ttcaagatgagaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 27978581  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  27978582 ttagacgtgctaatcatctc 27978601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 432
Target Start/End: Original strand, 28064716 - 28065130
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  || ||  ||| ||||||||||| ||||    
T  28064716 catcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttc--atcagaagcgatatcatcaccagaagctacaagtgttcaattaatttaaactgaagattcaaa 28064813  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||     
T  28064814 gtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 28064913  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  28064914 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 28065012  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  28065013 -ttcaagatgagaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 28065110  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  28065111 ttagacgtgctaatcatctc 28065130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43083074 - 43082654
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |  || |||||||||||| |||    
T  43083074 tcatcagaagcagaaggtcgtcagaagcaaaagttttcatcggaagcaatatcttcaccagaagctacgcttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 43082976  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcat-ttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| || ||  |||||    
T  43082975 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatattggatagcactgagcacttatctctcgtt 43082876  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43082875 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactagtctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgt 43082776  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43082775 acgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgac 43082677  T
Q  410 tctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43082676 tctttagacgtgctgattatctc 43082654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4210317 - 4209898
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | || |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  4210317 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttattagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 4210219  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  4210218 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 4210119  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  4210118 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 4210020  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  4210019 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 4209920  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4209919 ctttagacgtgctgattatctc 4209898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4220909 - 4220490
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  4220909 tcatcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagttacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 4220811  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  4220810 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 4220711  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  4220710 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 4220612  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  4220611 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 4220512  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4220511 ctttagacgtgctgattatctc 4220490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 11394974 - 11395393
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  11394974 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 11395072  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  11395073 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 11395172  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  11395173 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 11395272  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  11395273 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 11395371  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11395372 ctttagacgtgctgattatctc 11395393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 11405290 - 11405709
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  11405290 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 11405388  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  11405389 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 11405488  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  11405489 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 11405588  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  11405589 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 11405687  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11405688 ctttagacgtgctgattatctc 11405709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32218300 - 32217881
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||| ||| ||  | ||||||| ||||| |||    
T  32218300 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagtaatatcttcaccagaagctatgtttgatc-atttaatcaaactaaagattcaa 32218202  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  32218201 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 32218102  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  32218101 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 32218002  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  32218001 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 32217903  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32217902 ctttagacgtgctgattatctc 32217881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34478354 - 34477936
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  34478354 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 34478256  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  34478255 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 34478156  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  34478155 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 34478058  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  34478057 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 34477958  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34477957 ctttagacgtgctgattatctc 34477936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 39169897 - 39170316
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  39169897 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagcaacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 39169995  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  39169996 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 39170095  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  39170096 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 39170195  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  39170196 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 39170294  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39170295 ctttagacgtgctgattatctc 39170316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43345833 - 43345415
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  43345833 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 43345735  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  43345734 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaatggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 43345635  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  43345634 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa-ttgt- 43345537  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  43345536 acactcaagatggaaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 43345437  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43345436 ctttagacgtgctgattatctc 43345415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26880087 - 26879670
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||  || | ||||| |||||||| ||    
T  26880087 tcatcagaagcagaagatcatcataagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaacctgaagattca 26879989  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    || |||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | || |||||| ||    
T  26879988 aattagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttatccttcatt 26879889  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  26879888 aacaaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-ttgtt 26879790  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||  || |||||||    
T  26879789 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattgctggtgaatgatcaaaggaactc-aacgact 26879692  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  26879691 ctttagacgtgctaatcatctc 26879670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27221791 - 27221388
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  27221791 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 27221693  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  27221692 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagta 27221593  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  27221592 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 27221493  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27221492 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 27221393  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  27221392 atctc 27221388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 38585890 - 38586306
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||| |||| |||    
T  38585890 tcatcagaagaagaagcccatcagaagcaaggtttt--atcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgtagattcaa 38585987  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||||| |||    
T  38585988 agtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcttta 38586087  T
Q  213 acagagttgac-aaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||     
T  38586088 acatagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctaaaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgtt 38586186  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  38586187 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 38586284  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  38586285 ctttagacgtgctaatcatctc 38586306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35253392 - 35252989
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  35253392 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 35253294  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  35253293 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 35253194  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  35253193 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 35253094  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35253093 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 35252994  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  35252993 atctc 35252989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35264001 - 35263598
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  35264001 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 35263903  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  35263902 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 35263803  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  35263802 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 35263703  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35263702 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 35263603  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  35263602 atctc 35263598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35274626 - 35274223
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  35274626 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 35274528  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  35274527 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 35274428  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  35274427 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 35274328  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35274327 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 35274228  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  35274227 atctc 35274223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Original strand, 18392456 - 18392858
Alignment:
Q  30 tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatt 129  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  18392456 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 18392554  T
Q  130 tcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagta 229  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  18392555 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 18392654  T
Q  230 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  18392655 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacact-caagatgggaat 18392753  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgatt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  18392754 gaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctgact 18392853  T
Q  428 atctc 432  Q
    |||||    
T  18392854 atctc 18392858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 4100210 - 4099819
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  | ||||||| ||||| |||    
T  4100210 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaatcaaactaaagattcaa 4100112  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  4100111 agtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatta 4100012  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  4100011 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 4099913  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaa 404  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  4099912 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaa 4099819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 295
Target Start/End: Original strand, 24425354 - 24425635
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||   || |||||||||||||||||||    
T  24425354 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaa 24425452  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  24425453 agtagttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 24425552  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24425553 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatg 24425635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 423
Target Start/End: Original strand, 36784644 - 36785008
Alignment:
Q  50 catcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||    
T  36784644 catcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcatctaag-agaa 36784742  T
Q  150 cgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacct 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||   | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36784743 cgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcattggatacttgtccttcgctatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacct 36784842  T
Q  250 ccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 348  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| | || | |||    
T  36784843 ccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-------gcctgcagaa-ttgttcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccctca 36784933  T
Q  349 aaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36784934 aatgactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgct 36785008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Original strand, 967309 - 967712
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| | ||||    
T  967309 catcagaagcagaaatccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaa 967406  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    | |||||||| || ||| || ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| || |    
T  967407 ggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga 967505  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  967506 -agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-atgttcc 967603  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||| ||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  967604 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccgtcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 967701  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  967702 ttagacgtgct 967712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 28374320 - 28374595
Alignment:
Q  17 cagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatccaaagt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| | |  || | |||||||||||||| ||||||    
T  28374320 cagaagcagaaggtcatcagaaacaaagttt-tcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaagt 28374418  T
Q  116 agctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaaca 215  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  28374419 agctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcagttggagagcactgagtacttgtccttcgttaaca 28374518  T
Q  216 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28374519 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagc 28374595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24275448 - 24275045
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| | |||    
T  24275448 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagta-atttaaactgaagtttcaa 24275352  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || ||| || ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  24275351 aggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 24275253  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  24275252 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 24275155  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  | || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  24275154 c-ttcaagataggaatgaatttgaatttgatccgtcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 24275057  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  24275056 tttagacgtgct 24275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 185 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16769198 - 16768950
Alignment:
Q  185 gatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaa 282  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  16769198 gatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaa 16769099  T
Q  283 gacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactg 382  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  16769098 gacaacagtcatgcctgcagaagttgtacgtt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggaccacacccaaatcaggcaaagtattactg 16769000  T
Q  383 gtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768999 gtgaataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 16768950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22774784 - 22774378
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc-aaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||  ||| ||||| | ||    
T  22774784 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatattttg--tcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaattgaagtttca 22774687  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggata-gctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||| |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | || ||| |   ||||||||| |    
T  22774686 aaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcat 22774588  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  22774587 tga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgt 22774490  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     || |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  22774489 tcc-ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 22774392  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||    
T  22774391 tctttagacgtgct 22774378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 19497795 - 19498200
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  || ||| ||||||||| | |||    
T  19497795 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctatagttgatcagtatatttaaactgaagtttcaa 19497892  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaa-gggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    || |||||||| || ||| || |   |||||| | ||||||| | | ||| |||||||  ||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||    
T  19497893 aggagctgtttttcgttttaatcccgtctaagaa-aacgaaggactaaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcatt 19497991  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||     
T  19497992 ga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctactctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgtt 19498089  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  19498090 ccttt-aagataggaatgaatttgaacttgatccttcataggactacacccaaatcatgcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 19498187  T
Q  411 ctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||    
T  19498188 ctttagacgtgct 19498200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22764080 - 22763674
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc-aaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||  ||||||||| | ||    
T  22764080 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatattttt--tcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaactgaagtttca 22763983  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggata-gctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||| |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | || ||| |   ||||||||| |    
T  22763982 aaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcat 22763884  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||    
T  22763883 tga-agagttgataaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaccagctctacctgcagaa-atgt 22763786  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     || |||||||| |||||| |||||||  | || | ||| ||||  ||| |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||  || ||||||    
T  22763785 tcc-ttcaagataggaatggatttgaacttgatccgtcataggagaacatccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 22763688  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||    
T  22763687 tctttagacgtgct 22763674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 423
Target Start/End: Original strand, 17969146 - 17969418
Alignment:
Q  148 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17969146 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgctcgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 17969244  T
Q  248 ctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 346  Q
     ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  17969245 atccactactctatttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctctgcctgcagaaat-gttcctt-caagataggaatgaatttgaagttaatcctt 17969342  T
Q  347 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  17969343 cataggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct 17969418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22780162 - 22779811
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattc-aaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||  ||| ||||| | ||    
T  22780162 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatattttg--tcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaattgaagtttca 22780065  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggata-gctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||| |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | || ||| |   ||||||||| |    
T  22780064 aaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcat 22779966  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  22779965 tga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgt 22779868  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatca 367  Q
     || |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  22779867 tcc-ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatca 22779811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 397
Target Start/End: Original strand, 19312822 - 19313201
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||| |  | |||    
T  19312822 tcatcataagca-aagttcatcagaagcaaaatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttaatcagaagattcaatctggaatttcaa 19312918  T
Q  113 agtagctgtttctc-atttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |  |||||| |||  | || |||||  |||||| ||| ||||| ||  ||||||| || |||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||    
T  19312919 aagagctgtctcttgaatttaacctcgtctaag-agagcgaaggatcaaaagggatgtttcaacgttcatttgaaaagcactgtgtgcttgtccttcatt 19313017  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||     
T  19313018 ga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccacaactctgagtgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gtt 19313115  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaagg 397  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  19313116 cctt-caagatagaaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg 19313201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 397
Target Start/End: Original strand, 19299959 - 19300194
Alignment:
Q  160 aaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 259  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19299959 aaagggaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgggtgtttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacaactct 19300057  T
Q  260 gttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactaca 358  Q
    |  | |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  19300058 gagtgtgtctacgctaccagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttcctt-caagataggaatgaatttgaagtttatccttcataggactaca 19300155  T
Q  359 cccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaagg 397  Q
     |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  19300156 tccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg 19300194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 291 - 423
Target Start/End: Original strand, 24427667 - 24427797
Alignment:
Q  291 ctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatga 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||    
T  24427667 ctatgcctgcagaatttgtgcctt-caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagtcaaaggattactggtgaatga 24427765  T
Q  391 tcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  24427766 tcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct 24427797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 20646610 - 20646816
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||| ||     
T  20646610 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgca-aaaatgttcc- 20646707  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  20646708 ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaataaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggttctc-aacgactctt 20646806  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  20646807 tagacgtgct 20646816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16777280 - 16777118
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  16777280 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 16777182  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacg 176  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16777181 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacg 16777118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 19356545 - 19356339
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | | ||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  19356545 agagttggcaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtctcctcgttacaagacaagttaacagctctgcctgcagaatt-gttcct 19356447  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||  || ||||||||||    
T  19356446 t-caagataggaatgaatttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaaagattactgatggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 19356349  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  19356348 tagacgtgct 19356339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 28379659 - 28379806
Alignment:
Q  17 cagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatccaaagt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| | |  || | |||||||||||||| ||||||    
T  28379659 cagaagcagaaggtcatcagaaacaaagttt-tcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaagt 28379757  T
Q  116 agctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagg 164  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  28379758 agctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagg 28379806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20236820 - 20236714
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  20236820 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaa 20236722  T
Q  113 agtagctg 120  Q
    ||||||||    
T  20236721 agtagctg 20236714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1084061 - 1083894
Alignment:
Q  218 gttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 314  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| || |    
T  1084061 gttgacaaagtacaaagtgtacgaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcc-t 1083964  T
Q  315 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    |||  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  1083963 tcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggt 1083894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Original strand, 24814633 - 24814803
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| |    
T  24814633 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactccgcttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttc 24814731  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | ||||  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24814732 c-ttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 24814803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22755516 - 22755310
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaag-tgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| || ||||||||  ||| ||    
T  22755516 agagttgacaaagtacaaggtgtacgaccactacttccactactctgttttgtctgcgctacaagacaagtataacagctctgtctgcagaa-atgttcc 22755418  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| | ||| | | ||||||||| |||| ||||| ||||   ||||| |||| | || |||||||||    
T  22755417 -ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcatatgacaatatccaaatcagacaaaagatcattggtgactgatc-aaggttctc-aacgactct 22755321  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  22755320 ttagacgtgct 22755310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 20070683 - 20070759
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatcc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  20070683 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc 20070759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 31328033 - 31328104
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31328033 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 31328104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 31334754 - 31334825
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31334754 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 31334825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19356745 - 19356679
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19356745 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 19356679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6081600 - 6081471
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||  || ||| ||||||| ||| |||    
T  6081600 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcac--cagaagctatatcatcaccagaagctataagtgatcggtaaatttaaactgacgatacaa 6081503  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaag 144  Q
    || |||||||| || |||||||||| ||||||    
T  6081502 aggagctgtttttcgtttcaaccttgtctaag 6081471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 30557388 - 30557459
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30557388 aagtgtacaaccactacctccactactctattttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 30557459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22802493 - 22802440
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22802493 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtctctgctacaagacaaga 22802440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 1587100 - 1587171
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  1587100 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 1587171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 260
Target Start/End: Original strand, 21025530 - 21025575
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21025530 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacttcctccacgactctg 21025575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6392659 - 6392613
Alignment:
Q  238 caaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  6392659 caaccactacctccactactctgttttgtctctgctacaagacaaga 6392613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Original strand, 20417464 - 20417509
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagc 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20417464 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagc 20417509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20568173 - 20568135
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20568173 agtacaattgtacaaccactacctccactactctgtttt 20568135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 6574191 - 6574224
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6574191 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 6574224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 28711765 - 28711798
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28711765 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 28711798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 81
Target Start/End: Original strand, 20646446 - 20646478
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20646446 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 20646478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 28550985 - 28551057
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  28550985 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 28551057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 31800954 - 31801026
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  31800954 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 31801026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33074259 - 33074187
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  33074259 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 33074187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 38208168 - 38208116
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatc 65  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  38208168 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatc 38208116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 39037709 - 39037781
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  39037709 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacatgacaaggataacagctatgcctgca 39037781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 266
Target Start/End: Original strand, 26619168 - 26619203
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26619168 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttgt 26619203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Original strand, 41121789 - 41121856
Alignment:
Q  234 tgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  41121789 tgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctctgctacaggacaagaataacagctatgcctg 41121856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 28701296 - 28701350
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  28701296 aagtgtacaaccattacctccactactttgtttttgtccctgctacaagacaaga 28701350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 31968110 - 31968164
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  31968110 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 31968164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 258
Target Start/End: Original strand, 24440789 - 24440826
Alignment:
Q  221 gacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 258  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24440789 gacatagtacaattgtacaaccactacctccactactc 24440826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44840467 - 44840434
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44840467 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 44840434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 45
Target Start/End: Original strand, 17968995 - 17969027
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagt 45  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17968995 tcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaagt 17969027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 22188169 - 22188241
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  22188169 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 22188241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 22776355 - 22776427
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  22776355 aagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 22776427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 22781733 - 22781805
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  22781733 aagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 22781805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24377134 - 24377062
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  24377134 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 24377062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24576068 - 24575996
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  24576068 aagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 24575996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3232 - 2824
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3232 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaggtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattaatccatatattcaaactgaaggtccaa 3133  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3132 agtagctgtttctcatttcaacctaatctaagaagaacgaagaagtgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctcttagcatttgtccttcgtta 3033  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3032 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccaatacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 2933  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2932 -ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggagtacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 2834  T
Q  413 ttagacgtgc 422  Q
    ||||||||||    
T  2833 ttagacgtgc 2824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 42344 - 42761
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  42344 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 42442  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  42443 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 42542  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42543 acagagttgacaacgtacaagtgtacaacgactacctccactactctgttttgtcctcgctacaagacaagacatcagctatgcctgcagaatttgtgcc 42642  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42643 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 42741  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  42742 ttagacgtgctaatcatctc 42761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31565 - 31146
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  31565 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 31467  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  31466 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtta 31367  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  31366 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 31267  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  31266 cact-caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 31168  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31167 ctttagacgtgctgattatctc 31146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 15 - 432
Target Start/End: Original strand, 6711 - 7127
Alignment:
Q  15 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  6711 atcagaagcagaaggtcatcaaaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaaac 6809  T
Q  115 tagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaac 214  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  6810 tagctgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactaagcatttgtccttcgttaac 6909  T
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6910 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc- 7008  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  7009 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctttaaaggactacacccaaaccaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggttttcaaacgactctt 7108  T
Q  414 tagacgtgctgattatctc 432  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7109 tagacgtgctgattatctc 7127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 432
Target Start/End: Original strand, 53943 - 54364
Alignment:
Q  9 gacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagat 108  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  53943 gacatcatcagaagcagaaggaaatcagaagcaagattt-tcatcaaaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatactcaaactgaagat 54041  T
Q  109 ccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||| |    
T  54042 ccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtcctgc 54141  T
Q  209 gttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54142 gttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccatgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttg 54241  T
Q  309 tgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacga 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  54242 tgcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacga 54340  T
Q  409 ctctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  54341 ctctttagacgtgctaattatctc 54364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15017 - 14598
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |  |  ||||| |||||| |||    
T  15017 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaaa-caaacggaagattcaa 14919  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  14918 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 14819  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  14818 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgctttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgta 14719  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14718 cctt-caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 14620  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14619 ctttagacgtgctgattatctc 14598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 5674 - 5728
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||    
T  5674 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgctacaagacaaga 5728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 32727 - 33143
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||   || |||||||||||||||||||    
T  32727 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaa 32825  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  32826 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaataattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 32925  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32926 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 33025  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  || |||||||||    
T  33026 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactct 33123  T
Q  413 ttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  33124 ttagacgtgctaatcatctc 33143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 40276 - 40695
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  40276 tcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 40374  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  40375 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 40474  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  40475 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 40573  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  40574 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 40673  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40674 ctttagacgtgctgattatctc 40695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 2043 - 2449
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagca-aagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |    
T  2043 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaag---ctcatcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagataaa 2139  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  2140 aagtagatgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtt 2239  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2240 aacagagttgacaaaatacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcttgcagattttgtgc 2339  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  2340 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacaccaaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattacaaacgactc 2438  T
Q  412 tttagacgtgc 422  Q
    |||||||||||    
T  2439 tttagacgtgc 2449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 7577 - 7986
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||  || | |||||||||||||| ||    
T  7577 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattca 7675  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | | ||||| | ||||||||||||    
T  7676 aagtagttgtttctcattccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacactgagtatttgtccttcgtt 7775  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7776 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 7875  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  7876 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 7973  T
Q  411 ctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||    
T  7974 ctttagacgtgct 7986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 29 - 423
Target Start/End: Original strand, 10440 - 10833
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatccaaagtagctgtttctca 127  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10440 gtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttctca 10538  T
Q  128 tttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaag 227  Q
    || ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | | || || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10539 ttccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacactaagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaag 10638  T
Q  228 tacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10639 tacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt-caagatgggaa 10737  T
Q  327 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  10738 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct 10833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 372 - 2
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||| || || | || ||||||||||||||| |||    
T  372 tcatcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttt-atcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgattcgtatattcaaactgaagattcaa 274  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  273 agtagctgtttctcatttcaacctagtctaagaaaaatgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 174  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 74  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  73 c-ttcaagatgggaataaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 6665 - 7084
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  6665 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 6763  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  6764 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 6863  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||     
T  6864 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgt- 6962  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6963 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 7062  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7063 ctttagacgtgctgattatctc 7084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 5)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 117530 - 117148
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  117530 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 117432  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    ||||||| ||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  117431 gtagctggttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttaa 117332  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  117331 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccgctactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgca-aaattgttcc 117233  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaagga 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  117232 -ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 117148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Original strand, 475305 - 475485
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | || |    
T  475305 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaat-gttc 475403  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  475404 ctt-caagataggaatgaatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 475485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Original strand, 481825 - 482005
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | || |    
T  481825 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaat-gttc 481923  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  481924 ctt-caagataggaatgaatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 482005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Original strand, 156681 - 156851
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||| |    
T  156681 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactatgcgtgcgtctacgatacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaa-ttgttc 156779  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  156780 c-ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 156851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Original strand, 347470 - 347515
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagc 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  347470 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagc 347515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 395
Target Start/End: Original strand, 6043 - 6423
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||   || |||||| ||||||||||||    
T  6043 tcataagaagcagaaggtcttcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgtaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaa-ctgaagatccaa 6140  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||| | |||||||||||||    
T  6141 agtagctgtttctcatttcaacataatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatgaaaagcactgagtatttgtccttcgtta 6240  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6241 acagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgc 6340  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaa 395  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  6341 c-ttaaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12789 - 12370
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  12789 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 12691  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  12690 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 12591  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  12590 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctactctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt- 12492  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  12491 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 12392  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12391 ctttagacgtgctgattatctc 12370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 421
Target Start/End: Original strand, 13430 - 13836
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatcca 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||   || | |||||||||||||| ||    
T  13430 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaagttt-tcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgattagtaaaattcaaactgaagattca 13528  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    ||| ||||| | ||||||||||||    
T  13529 aagtagttgtttctcatttcaacctcatctaaggaaaacgaagaatcgaaagggaggtatcaacggtcatttcagaagcactgagtatttgtccttcgtt 13628  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |     
T  13629 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcataattatt- 13727  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  13728 -ccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 13825  T
Q  411 ctttagacgtg 421  Q
    |||||||||||    
T  13826 ctttagacgtg 13836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Original strand, 13125 - 13195
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacattt 84  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  13125 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaagttt-tcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacattt 13195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8395 - 7975
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  8395 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 8297  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| ||| |  || |||    
T  8296 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgcctctcatta 8197  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  8196 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 8097  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  8096 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 7997  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  7996 ctttagacgtgctgactatctc 7975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 36780 - 37200
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  36780 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 36878  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| ||| |  || |||    
T  36879 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgcctctcatta 36978  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  36979 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 37078  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  37079 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 37178  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  37179 ctttagacgtgctgactatctc 37200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 383
Target Start/End: Original strand, 47414 - 47785
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  47414 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaat-caaactgaagattcaa 47512  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||| ||| |  || |||    
T  47513 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgcctctcatta 47612  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt--tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  47613 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 47712  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgg 383  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47713 caactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgg 47785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19688 - 19256
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaagg-tcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactg-aagatc 109  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  19688 tcatcagaagcagaagtctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaaattcaaactgtaagatc 19590  T
Q  110 caaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaa-cgaagaatt-gaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtcctt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  19589 caaagtagctgtttctcatttcaaccttatttaagaagaaacgaagaattagaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtcctt 19490  T
Q  208 cgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgt--ccacgctacaagacaagacaacagc-tatgcct----g 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||         
T  19489 cattaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgttccaacgctacaagacaagacaacaccttatgcctcgaca 19390  T
Q  300 cagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagct-aattcttc-aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaagg 397  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  19389 ccgaatttgtgcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagttaaattcctcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 19291  T
Q  398 atatcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19290 atttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctc 19256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 16742 - 17179
Alignment:
Q  13 tcatcagaag-cagaaggtc-atcagaagcaaagtttctcatcagaag-ctatatcatcacc-agaag-ctacatttaatccataga-ttcaaactgaag 106  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  16742 tcatcagaagacagaagctctatcagaagcaaggttt-tcatcagaagtcgatatcatcacccagaagtctacatttaatccgtaaaattcaaactgaag 16840  T
Q  107 atccaaagtagc-tgtttctcatttcaacc-ttatctaaggagaacgaagaattg-aaagggaggt-atc-aacgatcatttgg-atagctctgagcagt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| | |    
T  16841 atccaaagtagcttgtttctcatttcaacctttatctaagaagaacgaagaattgaaaaaggaggtaatcaaacggtcatttggaatagcactgagtatt 16940  T
Q  201 tgtccttcg--ttaacagagttgacaaagtacaagt-gtacaa-ccactacctccactactctg-ttttgtcc-acgctacaagacaagacaacagctat 294  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16941 tgtccttcgttttaacagagttgacaaagtacaagtagtacaacccactacctccactactctgtttttgtccaacgctacaagacaagacaacacctat 17040  T
Q  295 gcct-gca---gaatttgtgcctttcaagatgggaatgaa--tttgaagctaattcttcaaagga-ctacacccaaatcaggcaaagga-tcactggtag 386  Q
    |||| | |   |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  17041 gcctcgtacacgaatttgtgccttcaaagatgggaatgaaattttgaagttaattcctcaaaggacctacacccaaatcaggcaaaggattaactggtga 17140  T
Q  387 atgatcaaagg-atatcaaacgact-ctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  17141 atgatcaaaggaatttcaaacgactactttagacgtgct 17179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 11941 - 12347
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  11941 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 12038  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| | | |||||||||||||    
T  12039 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgtta 12137  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |    
T  12138 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctccgcctgcagaa-ttgttc 12236  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  12237 c-ttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactc 12335  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  12336 tttagacgtgct 12347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 337
Target Start/End: Original strand, 15773 - 16092
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || || |||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  15773 catcagaagcagaagaccatctgaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 15870  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    | ||||| || || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  ||   | ||||| |||  ||     
T  15871 ggagctgattttcgtttcaacctcatctaagg-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcaatggatacttgtcattcaatat 15969  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||    
T  15970 aaaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctacactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctccgcctgcagaa-ttgttcc 16068  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaag 337  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  16069 -ttcaagatgggaatgaatttgaag 16092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 36558 - 36975
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||| |||| |||    
T  36558 tcatcaaaagcatatggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaa 36656  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |   || || | |||||||||||||    
T  36657 agtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgtta 36756  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||     
T  36757 acagagttaacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaa-atgtt 36855  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  || |||||||    
T  36856 cc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgact 36953  T
Q  411 ctttagacgtgctgattatctc 432  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  36954 ctttagacgtgctaatcatctc 36975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 421
Target Start/End: Original strand, 51927 - 52336
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  51927 catcagaagcagaagtccatcagaagcaaggtttc--atcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaactaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 52024  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  52025 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaataagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttctttaa 52124  T
Q  214 cagagttgac-aaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgt----ccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaattt 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||  |    
T  52125 cagagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacctacgctgcaagacaagataacagctctgcctgcataa-at 52223  T
Q  308 gtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacg 407  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  52224 gttcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactgatgaatgatcaaaggatttcaaacg 52322  T
Q  408 actctttagacgtg 421  Q
    ||||||||||||||    
T  52323 actctttagacgtg 52336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 7889 - 8179
Alignment:
Q  16 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagt 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||   || ||||||||||||||||||||||    
T  7889 tcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagatacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagt 7987  T
Q  116 agctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7988 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggttagctctgagtatttgtccttcgttaaca 8087  T
Q  216 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8088 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatt 8179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 5726 - 5321
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || | | ||||||||||| |||    
T  5726 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaaattaaactgaagattcaa 5629  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| | ||| ||| | | |||||||||||||    
T  5628 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggagatatcaacggtcggttgaaaagcactgggtaattgtccttcgtta 5530  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |    
T  5529 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaactactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttc 5431  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  5430 ctt-caagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 5333  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  5332 tttagacgtgct 5321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13121 - 12896
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || | | ||||||||||| |||    
T  13121 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaaattaaactgaagattcaa 13024  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| | ||| ||| | | |||||||||||||    
T  13023 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggagatatcaacggtcggttgaaaagcactgggtaattgtccttcgtta 12925  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaac 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12924 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaac 12896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Original strand, 10114 - 10518
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  10114 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaaactatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 10211  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaa 213  Q
    | |||||||| |  | |||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||| | | |||||||||||||     
T  10212 ggagctgttttttgtctcaacctcgtataag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaaaagcactgggtacttgtccttcgttat 10310  T
Q  214 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  10311 cagagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 10409  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  10410 ttt-aagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 10507  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    ||||| |||||    
T  10508 ttagatgtgct 10518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 56606 - 57012
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||  || ||| | ||||| ||| |||    
T  56606 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccataagctacaagtgatcagtaaatttacactgacgattcaa 56703  T
Q  113 agtagctg-tttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    || ||||| ||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| | | | | || |||||||||    
T  56704 aggagctggtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaaaagcacggggaaattttccttcgtt 56802  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 310  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||     
T  56803 atcagatttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gtt 56901  T
Q  311 cctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  56902 cctt-caagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 56999  T
Q  411 ctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||    
T  57000 ctttagacgtgct 57012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 417 - 449
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  417 aagtgtacgaccactacctccactactctgttt 449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 32524 - 32452
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  32524 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgca 32452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 35967 - 35563
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||  | |||    
T  35967 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaaatttcaa 35870  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| |||||  | |||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  35869 aggagctgtttttcattatatcctcgtctaag-agaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttg 35771  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |    
T  35770 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttc 35673  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  35672 ctt-caagataggaatgaatttgaagttaatccttcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 35575  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  35574 tttagacgtgct 35563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 175755 - 175350
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | | |||   |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  175755 tcatcagaagcagaagagcatcagaaggacattttt--atcagaagctgtatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 175658  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||| ||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  ||   | ||||||||| | |    
T  175657 aggagctatttttcgtttcaacctagtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatacttgtccttcttca 175559  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| | || |    
T  175558 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaggacaagacaacagctttgtttgcagaaat-gttc 175460  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  175459 ctt-caagatgggaatgaatttgaagctgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 175362  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  175361 tttagacgtgct 175350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 180667 - 180424
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||| || || |||  || ||| ||||||||||| |||    
T  180667 tcatcagaagcagaagagcatcagaagcacattttt--atcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 180570  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||| ||| || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  ||   | ||||||||| | |    
T  180569 aggagctatttttcgtttcaacctagtctaa-gagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatacttgtccttcttca 180471  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180470 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 180424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 40369 - 40576
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  40369 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtcttcgctacaagacaagtataacagctttgcctgcagaa-atgttcc 40467  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  40468 -ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactct 40565  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  40566 ttagacgtgct 40576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 58915 - 59122
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| || |||   | |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| | || ||    
T  58915 agagttgacaaagtacaattgtacaatcactacctccacgaatctgcttgtgtttgcactacgagacaagtataacagctctgcctgcagaaat-gttcc 59013  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
    || |||||| |||||| |||||||  | || ||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  59014 tt-caagataggaatggatttgaacttgatccttcataagacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactct 59111  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  59112 ttagacgtgct 59122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 106
Target Start/End: Original strand, 58734 - 58808
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaag 106  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||    
T  58734 gtcattagaagcaaagtt---catcagaagctatatcgtcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatctgaag 58808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 128076 - 127672
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||  ||||||||| | |||    
T  128076 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaatatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatctaaactgaagtttcaa 127979  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || || ||| | || |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  127978 aggaggtgtctttcgtttcaaccttgtctaag-agaacgaataattaaaagggaggtatcaacggtcatttaaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 127880  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  127879 a-agatttgactaagtacaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 127782  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  127781 c-ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaacgattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 127684  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  127683 tttagacgtgct 127672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 141235 - 140830
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||  || ||  ||||||||| | |||    
T  141235 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttc--atcagaagctatatcatcactagaaactacaattgatcagtaaatctaaactgaagtttcaa 141138  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || || ||| | || |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  141137 aggagttgtctttcctttccatcttgtctaag-agaacgaagaattaaaagggaggtatcaacagtcatttaaaaagcactgggtgtttgtccttcattg 141039  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  141038 aaa-agtttacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 140941  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc-aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgact 410  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  140940 c-ttcaagatgggaatgagtttgaagttgatccttcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 140843  T
Q  411 ctttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||||    
T  140842 ctttagacgtgct 140830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 7674 - 7881
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |  |  |    
T  7674 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgagtgtgtctgcgctacaagacaagtataacagctctgcctgcagaaatgtt--c 7771  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
     ||||||||  |||||||||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  7772 attcaagatatgaatgaatttgaacttgatgcttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactct 7870  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    || ||||||||    
T  7871 tttgacgtgct 7881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 215569 - 215641
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  215569 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttcgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 215641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 34982 - 35232
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||| |||| |||    
T  34982 tcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaa 35080  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |   || || | |||||||||||||    
T  35081 agtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgtta 35180  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35181 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 35232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Original strand, 12651 - 13055
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattca-aactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||   |||||||| | |||    
T  12651 catcagaagcagaaatccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattttgaactgaagtttcaa 12748  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || ||| || ||  |||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| |   |||||| || ||     
T  12749 aggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccctctttg 12847  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||| |    
T  12848 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcatg-aaaaaatgttc 12945  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  12946 c-ttcaagataggaatgaatttgaagttgatacttcaaaggactacaaccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 13043  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  13044 tttagacgtgct 13055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7662 - 7375
Alignment:
Q  12 atcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcca 111  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||  ||||||||| | ||    
T  7662 atcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatctaaactgaagtttca 7565  T
Q  112 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtt 211  Q
    ||| |||||| | || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||    
T  7564 aaggagctgtctttcgtttcaaccttgtctaag-agaacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcttt 7466  T
Q  212 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgca 301  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7465 atcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgca 7375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 7122 - 7060
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaag 76  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7122 tcatcagaagcagaaaaccatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaag 7060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27171 - 26995
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27171 tcatcagaagcagaaggtcatcaaaagcaaggttt-tcatcagaagtgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaa 27073  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagc 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27072 agtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 26995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 200 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40749 - 40552
Alignment:
Q  200 ttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcct 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40749 ttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcct 40650  T
Q  299 gcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaagga 398  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||    
T  40649 gcagaa-atgttcc-ttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaagga 40552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 284
Target Start/End: Original strand, 1533 - 1755
Alignment:
Q  63 atcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaa 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  1533 atcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctatttctcgtttcaacctcatctaagaagaacgaagaattaaaa 1632  T
Q  163 gggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-t 261  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | | ||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1633 gggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtccttcattattagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 1732  T
Q  262 tttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  1733 tttgtctacgctacaagacaaga 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2020
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  || | || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| | |||    
T  2424 tcatcagaagcagaagtccatcagaagca--gtatttcctcataagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaa 2327  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    || |||||||| || ||| |||||  ||| || | |||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| |    | |||||| ||     
T  2326 aggagctgtttttcgttttaacctcgtctgagaa-aacgtaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcctttccttctttg 2228  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  2227 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 2130  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  || ||||||||    
T  2129 c-ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccgtcacaggactacacccaaattaggcaaaagattaatggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactc 2032  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||    
T  2031 tttagacgtgct 2020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 148 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 16027 - 15758
Alignment:
Q  148 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16027 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaggtacaagtgtacaaccactac 15929  T
Q  248 ctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 346  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| || |||||||  |||||||||| |||| | || |||    
T  15928 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacatctctgcctgcagaa-atgttcc-ttcaagaaaggaatgaattagaagttgatcctt 15831  T
Q  347 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgt 420  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  15830 cataggactacacccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgt 15758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 2250 - 1846
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatc-ca 111  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | |||||| ||||| ||| ||    
T  2250 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaaaatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaatattcaatctgaa-atctca 2155  T
Q  112 aagtagctgtttc-tcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||  || ||| || | |  | || ||  |||||| ||||||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||| |    |||||||| |    
T  2154 aaagagttgtctcctgaagttaatctcgtctaag-agaacgaaggatcaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcctgtccttcat 2056  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgt 309  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  2055 tga-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gt 1958  T
Q  310 gcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgac 409  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  1957 tcctt-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactatatccaaatcaggcaaaagattactggtagatgatcaaaggaactc-aacgac 1860  T
Q  410 tctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||||||||    
T  1859 tctttagacgtgct 1846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 1437 - 1231
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  1437 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttcct 1339  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  1338 t-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactatatccaaatcaggcaaaagattactggtagatgatcaaaggaactc-aacgactctt 1241  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  1240 tagacgtgct 1231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 53468 - 53339
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  53468 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatttactcaaactgaagatccaa 53369  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  53368 agtagctgtttcttatttc-accttatctaa 53339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 4321 - 4568
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagcta--tatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatcc 110  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| |||| |  || |||||||||||| |    
T  4321 tcatcagaagcagaagatcattagaagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaat-caaactgaagattc 4419  T
Q  111 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgt 210  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||   || |||||||| ||||||| |||||  ||||    
T  4420 aaagtagatgaatctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaatcgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgt 4519  T
Q  211 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 259  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4520 taatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2720 - 2550
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||   || |||||||||||||||||||    
T  2720 tcatcagaagcagaagctcatcaggtgcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttttaaattcaaactgaagatccaa 2622  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttg 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2621 agtagttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 2550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 7228 - 7261
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7228 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 7261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 28820 - 29027
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta-cctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||    
T  28820 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatcctctacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttcc 28918  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactct 412  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  28919 ttt-aagattggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 29016  T
Q  413 ttagacgtgct 423  Q
    |||||||||||    
T  29017 ttagacgtgct 29027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 408032 - 408108
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatcc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  408032 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc 408108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 215 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29707 - 29524
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||     
T  29707 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc- 29610  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaa-aggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaagga 398  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  29609 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcaataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 29524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 29906 - 29840
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29906 tcatcagaagcaaaagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 29840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 58533 - 58327
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  58533 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctaagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttcct 58435  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  58434 t-caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 58337  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||| ||||||    
T  58336 tagtcgtgct 58327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 58732 - 58642
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaa 105  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||    
T  58732 tcatcagaagcagaagttcatcaaaagcaagatttc--atcagatgctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatctgaa 58642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 6037 - 6278
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||| |||| |  || |||||||||||   ||    
T  6037 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta--tttgatcctttaat-caaactgaagag--aa 6131  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgtta 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||  ||| |||||  || |||    
T  6132 agttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcatta 6231  T
Q  213 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 259  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6232 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 6278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 1060 - 672
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctc-a 127  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   | |||||| ||| | || ||||  |||||| |||  |    
T  1060 gtcatcagaagcaaagtt---catcagaagctatatcatcaccagaaactacagttgatcagaacattcaatctggaaattcaaaagagctgtctcttga 964  T
Q  128 tttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaag 227  Q
     || |||||  |||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| || | |||||||||||||    
T  963 atttaacctcgtctaag-agagcgaaggatcaaaagggaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgtgtgcttgtccttcattga-agagttgacaaag 866  T
Q  228 tacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| || ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| || |||| |||||| ||||    
T  865 tacaagtgtacaaccactacctccacaactctgagcgtgtctacactacaagacaagatagcagctctgcctgtagaatt-gttcctt-caagataggaa 768  T
Q  327 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    ||| ||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||    
T  767 tgattttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaagg-tactcaacgactctttaaacgtgct 672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 5440 - 5052
Alignment:
Q  29 gtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctc-a 127  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   | |||||| ||| | || ||||  |||||| |||  |    
T  5440 gtcatcagaagcaaagtt---catcagaagctatatcatcaccagaaactacagttgatcagaacattcaatctggaaattcaaaagagctgtctcttga 5344  T
Q  128 tttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaag 227  Q
     || |||||  |||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| || | |||||||||||||    
T  5343 atttaacctcgtctaag-agagcgaaggatcaaaagggaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgtgtgcttgtccttcattga-agagttgacaaag 5246  T
Q  228 tacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| || ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| || |||| |||||| ||||    
T  5245 tacaagtgtacaaccactacctccacaactctgagcgtgtctacactacaagacaagatagcagctctgcctgtagaatt-gttcctt-caagataggaa 5148  T
Q  327 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    ||| ||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||    
T  5147 tgattttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaagg-tactcaacgactctttaaacgtgct 5052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 19045 - 19204
Alignment:
Q  17 cagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccataga-ttcaaactgaagatccaaagt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| | |  || | |||||||||||||| ||||||    
T  19045 cagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaagt 19143  T
Q  116 agctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacg 176  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19144 agctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacg 19204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 2258 - 2424
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaa 113  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||  || ||| ||||||||| | ||||    
T  2258 catcagaagtagaagcccatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcaaaatcatcactagaagttacatttaatcagtaaatttaaactgaagtttcaaa 2356  T
Q  114 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcat 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2357 gtagccgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 2424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 59316 - 59521
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||   | |     
T  59316 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccattatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcagaatt---gtcc 59412  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  59413 ttcaagataggaatgaatttgaagttcatccttcataggactacacctaaattaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 59511  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  59512 tagacgtgct 59521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 59117 - 59183
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  59117 tcatcagaagcagaagttcatcaggagcaacatttc--atcagaagctataccatcaccagaagctaca 59183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 143143 - 143110
Alignment:
Q  224 aaagtacaagtgtacaaccactacctccactact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143143 aaagtacaagtgtacaaccactacctccactact 143110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 950 - 746
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||     
T  950 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtccttgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccc- 852  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
      |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  851 -acaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 754  T
Q  414 tagacgtg 421  Q
    | ||||||    
T  753 tggacgtg 746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1149 - 1084
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149 tcatcagaagcagaag-tcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 1084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0314
Description:

Target: scaffold0314; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Original strand, 20597 - 20700
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20597 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatgtattcaaactgaagatccaa 20695  T
Q  113 agtag 117  Q
    |||||    
T  20696 agtag 20700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 61276 - 61098
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  61276 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcc- 61179  T
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaa 394  Q
    |||||||  |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  61178 ttcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 61098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 212393 - 212321
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  212393 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 212321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Original strand, 17861 - 18069
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | || |    
T  17861 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaat-gttc 17959  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | || |||||||     
T  17960 ctt-caagataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcaatggtgaatgatcaaaggttctc-aacgactt 18057  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    | ||||||||||    
T  18058 tatagacgtgct 18069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 2802 - 2874
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  2802 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 2874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 19616 - 19734
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |  | ||||||||||||| |||    
T  19616 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaa 19714  T
Q  113 agtagctgtttctcatttca 132  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  19715 agtagctgattctcaattca 19734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Original strand, 20432 - 20601
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||    ||     
T  20432 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgtagaa---atgt 20528  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  20529 ccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 20601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 314 - 423
Target Start/End: Original strand, 38120 - 38228
Alignment:
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  38120 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 38218  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  38219 tagacgtgct 38228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 176 - 8
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| | |||    
T  176 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaa 79  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttg 184  Q
    || |||||||| || ||  | |||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  78 aggagctgtttttcgttatatcctcgtctaa-gagaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttg 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11816 - 11647
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||  |  |    
T  11816 agagttgacaaagtacaaagtgtaaaaccactacctccactactctgttttgtctacgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcagaattgat--c 11719  T
Q  313 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
     |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  11718 cttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaactaccaaatcaggtaaaagatcattggt 11647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15297 - 15129
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||| | |||    
T  15297 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctgtatcatcaccagaagctacagttgatcagtatatttaaactgaagtttcaa 15200  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttg 184  Q
    || |||||||| |||||| |||||  | ||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  15199 aggagctgtttttcattttaacctcgtttaa-gagaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttg 15129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 70027 - 69860
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| | |||    
T  70027 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaa 69930  T
Q  113 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaaggagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcattt 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||  ||| | |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  69929 aggagctgtttttcgttataacctcgtctga-gagaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcattt 69860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 61788 - 61580
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||  ||| |    
T  61788 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctaca-aaaatgttc 61690  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactc 411  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |  | || ||||||||    
T  61689 c-ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaaggtttctc-aacgactc 61592  T
Q  412 tttagacgtgct 423  Q
    ||| ||||||||    
T  61591 ttttgacgtgct 61580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5170 - 5014
Alignment:
Q  218 gttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatttgtgcctt 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | || ||||    
T  5170 gttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcgtgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaat-gttcctt 5072  T
Q  315 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 373  Q
     |||||| |||||| |||||||  | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  5071 -caagataggaatggatttgaacatgattcttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 5014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Original strand, 8703 - 8749
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagc 59  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  8703 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagc 8749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Original strand, 6577 - 6747
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| |    
T  6577 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactccgcttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttc 6675  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | ||||  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  6676 c-ttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 6747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 384
Target Start/End: Original strand, 38157 - 38309
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatga 329  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||  |||| || ||||||     
T  38157 aagtgtacgaccactacctccactactctgttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcc-atcaaaataggaatgg 38254  T
Q  330 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  38255 atttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggt 38309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 423
Target Start/End: Original strand, 9914 - 10022
Alignment:
Q  314 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctt 413  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||| || | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  9914 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactgcatctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 10012  T
Q  414 tagacgtgct 423  Q
    ||||||||||    
T  10013 tagacgtgct 10022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 9728 - 9794
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9728 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaaatttc--atccgaagctatatcatcaccagaagctaca 9794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 284
Target Start/End: Original strand, 1727 - 1798
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1727 agagttgacaaagtacgaagtttacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaaga 1798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Original strand, 990 - 1160
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || |||||||||||| | ||||| | |||||||||||  ||| |    
T  990 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactatgcttatgtctactctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaa-atgttc 1088  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | ||||  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  1089 c-ttcataataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 1160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Original strand, 1183 - 1353
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgc 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || |||||||||||| | ||||| | |||||||||||  ||| |    
T  1183 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactatgcttatgtctactctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaa-atgttc 1281  T
Q  312 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggt 384  Q
    | ||||  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  1282 c-ttcataataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt 1353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9352 - 9281
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  9352 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaaga 9281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 9515 - 9483
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9515 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 9483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Original strand, 165018 - 165093
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  165018 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 165093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7324 - 7181
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg--ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||   || || |||||||| |||||    
T  7324 aagtgtacgaccactacctccacttctctgttttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-aagttcc-ttcaagataggaat 7227  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 373  Q
    | |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  7226 ggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 7181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17007 - 16922
Alignment:
Q  219 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17007 ttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 16922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 379 - 419
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  379 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22259 - 22050
Alignment:
Q  49 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatagattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctca-tttcaaccttatctaaggag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||  ||||| | |||| | ||||||| |   ||| |||||  |||||| ||    
T  22259 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatttgaagtttcaaa-tggctgtttattggttttaacctcgtctaag-ag 22162  T
Q  148 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 247  Q
    | ||||  | | ||||| |||| |||||| ||||||| | ||| ||| |   |||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22161 agcgaaagactcaaaggaaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtcctttgttga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactac 22063  T
Q  248 ctccactactctg 260  Q
    |||||| ||||||    
T  22062 ctccacaactctg 22050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Original strand, 15694 - 15769
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  15694 aagtgtacgaccactatctccactactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 15769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0774
Description:

Target: scaffold0774; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 215 - 253
Target Start/End: Original strand, 6388 - 6426
Alignment:
Q  215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6388 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 6426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 6190 - 6255
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6190 tcatcagaagca-aagttaatcagaagcaagatttc--atcataagctatatcatcaccagaagctaca 6255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 264
Target Start/End: Original strand, 31851 - 31889
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31851 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 31889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 385
Target Start/End: Original strand, 1116 - 1230
Alignment:
Q  269 acgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag 368  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | || |||| |||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  1116 acgctacaagacaagataacagctctgtctgcagaaat-gttcctt-caagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcag 1213  T
Q  369 gcaaaggatcactggta 385  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  1214 gcaaaagatcattggta 1230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7420 - 7348
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7420 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtccctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 7348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 893 - 945
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  893 aagtgtacaaccactacttccactactctgttttgtctctgctacaagacaag 945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9995 - 9923
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9995 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtcgctgctacaagacaaggataacagctatgcctgca 9923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 163554 - 163490
Alignment:
Q  14 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 81  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163554 catcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttc--atcagaagctatatcatcaccagaagctaca 163490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 373
Target Start/End: Original strand, 3967 - 4110
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt--gtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatttgtgcctttcaagatgggaat 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||   || || |||||||| |||||    
T  3967 aagtgtacgaccactacctccacttctctgtttttcgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaa-aagttcc-ttcaagataggaat 4064  T
Q  328 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 373  Q
    | |||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  4065 ggatttgaacgtgatccttcataagacaacatccaaatcaggcaaa 4110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10008 - 9954
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  10008 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 9954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 34876 - 34930
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  34876 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 34930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 25737 - 25770
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25737 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 25770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Original strand, 81921 - 81967
Alignment:
Q  13 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcatcagaagc 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  81921 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagc 81967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 727 - 760
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 1827 - 1860
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1827 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 1860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 27501 - 27534
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 27534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 1771 - 1843
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1771 aagtgtacaaccactaccttcactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 1843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3343 - 3271
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  3343 aagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14687 - 14615
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14687 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 14615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 17837 - 17909
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17837 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 17909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9194 - 9122
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  9194 aagtgtacaaccactatctccactactgtgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 9122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 21043 - 21115
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  21043 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 21115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 144949 - 144909
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  144949 agtacaattgtacatccactacctccactactctgttttgt 144909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 244356 - 244388
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244356 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 244388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 211437 - 211365
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  211437 aagtatacaactactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 211365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 90127 - 90199
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  90127 aagtgtacaacccctacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 90199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1356 - 1321
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1356 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttgt 1321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 266
Target Start/End: Original strand, 55 - 90
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttgt 90  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5666 - 5631
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5666 aagtgtacaaccactacctccactactcagttttgt 5631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7742 - 7672
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7742 aagtgtacaaccactacctccactactcag-tttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 7672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Original strand, 1869 - 1944
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  1869 aagtgtacgaccactacctccactactttgtttatgtctatgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3016 - 2951
Alignment:
Q  236 tacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  3016 tacaaccactacctccactactctatttttgtccctgctacaagacaa-aaaacagctctgcctgca 2951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 15811 - 15865
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  15811 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 15865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 25471 - 25525
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  25471 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 25525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22711 - 22661
Alignment:
Q  235 gtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  22711 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 36847 - 36901
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  36847 aagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 36901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 42158 - 42104
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  42158 aagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 42104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16601 - 16536
Alignment:
Q  357 cacccaaatcaggcaaaggatcactggtagatgatcaaaggatatcaaacgactctttagacgtgct 423  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  16601 cacccaaattaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttttgacgtgct 16536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 284
Target Start/End: Original strand, 43994 - 44044
Alignment:
Q  234 tgtacaaccactacctccactactctgttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  43994 tgtacaaccactatctccactactctgttttgtctctgcaacaagacaaga 44044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 99277 - 99331
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  99277 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 99331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37441 - 37387
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||    
T  37441 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaaga 37387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 135501 - 135447
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactct-gttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||    
T  135501 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaaga 135447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9945 - 9912
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9945 aagtgtacaaccactacctgcactactctgtttt 9912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 2763 - 2796
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2763 aagtgtacaaccactaactccactactctgtttt 2796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9599 - 9566
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9599 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 9566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19070 - 19037
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19070 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttt 19037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Original strand, 22203 - 22275
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22203 aagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 22275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1699 - 1666
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1699 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttt 1666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 60842 - 60809
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  60842 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 60809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 258
Target Start/End: Original strand, 948 - 980
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  948 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6043 - 5991
Alignment:
Q  233 gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 284  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  6043 gtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 5991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 258
Target Start/End: Original strand, 10474 - 10506
Alignment:
Q  226 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10474 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 10506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 10180 - 10212
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10180 aagtgtacgaccactacctccactactctgttt 10212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 14844 - 14876
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14844 aagtgtacgaccactacctccactactctgttt 14876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40676 - 40644
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40676 aagtgtacaaccactaccttcactactctgttt 40644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1657
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  1729 aagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 87672 - 87704
Alignment:
Q  231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  87672 aagtgtacaaccactacttccactactctgttt 87704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University