View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14019_high_3 (Length: 441)

Name: NF14019_high_3
Description: NF14019
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14019_high_3
NF14019_high_3
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (24-431)||(27623522-27623927)
chr6 (23-431)||(8899514-8899918)
chr6 (23-431)||(27355926-27356330)
chr6 (23-431)||(34458323-34458725)
chr6 (23-431)||(33370246-33370650)
chr6 (23-431)||(27284177-27284581)
chr6 (40-431)||(13518009-13518396)
chr6 (39-431)||(27491128-27491516)
chr6 (23-431)||(4539573-4539978)
chr6 (23-431)||(26110226-26110629)
chr6 (41-431)||(4763760-4764146)
chr6 (23-431)||(28213433-28213838)
chr6 (23-431)||(26772444-26772847)
chr6 (41-431)||(16755817-16756204)
chr6 (41-431)||(27063479-27063864)
chr6 (23-431)||(29555537-29555941)
chr6 (23-431)||(22928696-22929102)
chr6 (23-409)||(27200165-27200548)
chr6 (23-409)||(27248685-27249068)
chr6 (41-431)||(28166491-28166878)
chr6 (41-431)||(29507413-29507801)
chr6 (41-431)||(26791813-26792199)
chr6 (34-431)||(30551815-30552208)
chr6 (40-431)||(16680135-16680523)
chr6 (47-431)||(29579018-29579397)
chr6 (23-431)||(4531267-4531671)
chr6 (41-431)||(4778877-4779264)
chr6 (24-431)||(16937840-16938243)
chr6 (47-431)||(13292766-13293140)
chr6 (41-428)||(14139218-14139595)
chr6 (41-428)||(27013730-27014106)
chr6 (41-354)||(26926765-26927073)
chr6 (41-431)||(27031020-27031403)
chr6 (125-431)||(26666473-26666774)
chr6 (41-431)||(27208901-27209283)
chr6 (41-431)||(27239945-27240327)
chr6 (41-431)||(24869707-24870087)
chr6 (41-431)||(27025142-27025524)
chr6 (41-431)||(24299575-24299956)
chr6 (41-431)||(15406348-15406730)
chr6 (41-431)||(15418135-15418517)
chr6 (84-422)||(20174589-20174933)
chr6 (84-422)||(22161058-22161402)
chr6 (23-120)||(23851450-23851547)
chr6 (373-431)||(26927077-26927135)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (23-431)||(39856630-39857032)
chr4 (23-431)||(18794485-18794889)
chr4 (41-431)||(20332290-20332677)
chr4 (41-431)||(40099504-40099891)
chr4 (41-431)||(27157180-27157568)
chr4 (41-431)||(24586229-24586616)
chr4 (40-431)||(14104553-14104939)
chr4 (40-431)||(30759774-30760159)
chr4 (40-431)||(33667671-33668056)
chr4 (41-431)||(54839402-54839787)
chr4 (41-431)||(14753362-14753747)
chr4 (41-431)||(5700551-5700937)
chr4 (34-428)||(21975708-21976098)
chr4 (41-431)||(34182832-34183216)
chr4 (23-431)||(5011870-5012275)
chr4 (23-431)||(1906245-1906654)
chr4 (34-431)||(31120378-31120772)
chr4 (23-431)||(15233809-15234217)
chr4 (41-427)||(24118674-24119055)
chr4 (23-431)||(15276497-15276904)
chr4 (41-431)||(36338394-36338772)
chr4 (23-431)||(15380106-15380510)
chr4 (47-431)||(6575879-6576251)
chr4 (47-431)||(1673877-1674258)
chr4 (41-431)||(17019063-17019445)
chr4 (41-431)||(14671027-14671410)
chr4 (120-431)||(36324185-36324484)
chr4 (34-93)||(18311379-18311439)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (23-431)||(5141088-5141493)
chr7 (29-431)||(26441238-26441637)
chr7 (42-431)||(4138999-4139386)
chr7 (41-431)||(26678858-26679245)
chr7 (41-431)||(26663666-26664053)
chr7 (23-431)||(16745274-16745679)
chr7 (23-431)||(26268839-26269247)
chr7 (23-431)||(11446867-11447271)
chr7 (41-431)||(39206893-39207279)
chr7 (34-431)||(24586289-24586682)
chr7 (23-431)||(3451297-3451702)
chr7 (41-431)||(16443757-16444144)
chr7 (41-431)||(5154081-5154466)
chr7 (47-431)||(5164387-5164767)
chr7 (23-431)||(4205368-4205772)
chr7 (41-431)||(26518790-26519174)
chr7 (41-431)||(31558148-31558534)
chr7 (37-431)||(45393212-45393602)
chr7 (23-431)||(26313603-26314006)
chr7 (41-409)||(26509471-26509837)
chr7 (47-431)||(11418533-11418913)
chr7 (41-431)||(45737298-45737686)
chr7 (23-431)||(16047294-16047695)
chr7 (41-431)||(2160567-2160955)
chr7 (23-431)||(31084376-31084781)
chr7 (126-431)||(26595750-26596053)
chr7 (41-428)||(2779249-2779626)
chr7 (41-431)||(31129902-31130282)
chr7 (23-431)||(10847562-10847968)
chr7 (41-431)||(16512194-16512574)
chr7 (41-431)||(10910680-10911060)
chr7 (41-125)||(26531926-26532010)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (23-431)||(29658879-29659283)
chr3 (23-431)||(32296574-32296979)
chr3 (23-431)||(4629730-4630133)
chr3 (23-431)||(21680646-21681049)
chr3 (41-431)||(5727941-5728328)
chr3 (41-431)||(47029416-47029803)
chr3 (23-431)||(29142665-29143072)
chr3 (41-431)||(5717031-5717418)
chr3 (41-431)||(5764040-5764427)
chr3 (34-431)||(4340587-4340980)
chr3 (23-431)||(18248683-18249087)
chr3 (23-431)||(20570757-20571161)
chr3 (41-431)||(10649034-10649420)
chr3 (23-431)||(28027236-28027638)
chr3 (42-431)||(31958366-31958753)
chr3 (23-431)||(28109862-28110271)
chr3 (42-431)||(5603224-5603611)
chr3 (42-431)||(24334137-24334524)
chr3 (41-431)||(5472951-5473336)
chr3 (41-431)||(8217595-8217983)
chr3 (34-428)||(5590275-5590665)
chr3 (41-431)||(51787985-51788371)
chr3 (41-431)||(4422881-4423267)
chr3 (23-431)||(16422128-16422532)
chr3 (23-431)||(16618400-16618808)
chr3 (41-431)||(4790544-4790931)
chr3 (34-431)||(17978861-17979255)
chr3 (41-431)||(22381492-22381877)
chr3 (41-431)||(17970777-17971161)
chr3 (42-431)||(28345135-28345519)
chr3 (41-431)||(10402112-10402497)
chr3 (47-431)||(18286266-18286645)
chr3 (47-431)||(18301567-18301946)
chr3 (41-431)||(20071996-20072384)
chr3 (41-431)||(5019676-5020061)
chr3 (41-431)||(18231156-18231542)
chr3 (41-431)||(22864759-22865143)
chr3 (41-431)||(22879818-22880202)
chr3 (41-431)||(6536654-6537040)
chr3 (49-431)||(11104272-11104651)
chr3 (41-431)||(7079185-7079576)
chr3 (41-431)||(48471890-48472280)
chr3 (41-431)||(18057223-18057612)
chr3 (41-431)||(31030156-31030535)
chr3 (47-431)||(6207869-6208245)
chr3 (39-428)||(18336589-18336968)
chr3 (46-431)||(19700454-19700847)
chr3 (47-431)||(4727602-4727976)
chr3 (46-431)||(32445122-32445494)
chr3 (41-431)||(15735011-15735392)
chr3 (47-431)||(35886733-35887109)
chr3 (41-431)||(4689614-4689994)
chr3 (41-431)||(8283369-8283766)
chr3 (41-431)||(5658097-5658480)
chr3 (221-431)||(15886652-15886857)
chr3 (41-149)||(15886894-15887004)
chr3 (41-125)||(8002523-8002607)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (23-431)||(40239489-40239892)
chr2 (41-431)||(27809699-27810087)
chr2 (23-431)||(27782212-27782616)
chr2 (41-431)||(254510-254896)
chr2 (41-431)||(37945723-37946110)
chr2 (23-431)||(12710459-12710863)
chr2 (41-431)||(16167476-16167862)
chr2 (41-431)||(12592808-12593198)
chr2 (42-431)||(22922001-22922388)
chr2 (47-431)||(12661543-12661922)
chr2 (41-431)||(13930402-13930790)
chr2 (41-431)||(3788492-3788877)
chr2 (41-431)||(37931370-37931763)
chr2 (42-431)||(19410342-19410729)
chr2 (23-431)||(39896048-39896452)
chr2 (41-431)||(27122523-27122907)
chr2 (40-431)||(34867680-34868066)
chr2 (41-431)||(37383675-37384061)
chr2 (41-431)||(9343845-9344231)
chr2 (23-431)||(11629043-11629446)
chr2 (41-431)||(39045680-39046066)
chr2 (23-431)||(37679749-37680155)
chr2 (23-431)||(37695014-37695420)
chr2 (34-431)||(21697031-21697427)
chr2 (41-431)||(34160842-34161230)
chr2 (34-431)||(16823195-16823588)
chr2 (34-431)||(16897892-16898285)
chr2 (23-431)||(21671028-21671435)
chr2 (41-431)||(31882285-31882670)
chr2 (41-431)||(32055800-32056185)
chr2 (91-431)||(31868644-31868979)
chr2 (23-431)||(27396303-27396717)
chr2 (41-431)||(34297154-34297533)
chr2 (23-431)||(19450276-19450689)
chr2 (41-431)||(28888277-28888658)
chr2 (41-431)||(34268784-34269165)
chr2 (41-427)||(27428315-27428690)
chr2 (41-431)||(23122436-23122817)
chr2 (41-431)||(20843910-20844296)
chr2 (244-431)||(23116993-23117180)
chr2 (41-96)||(31887682-31887737)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (41-431)||(12036-12421)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (34-431)||(28355780-28356176)
chr8 (41-431)||(9360622-9361007)
chr8 (41-431)||(31360528-31360914)
chr8 (23-431)||(12086553-12086958)
chr8 (42-431)||(31483700-31484087)
chr8 (41-431)||(33248366-33248751)
chr8 (23-431)||(19680430-19680833)
chr8 (35-431)||(29835317-29835708)
chr8 (41-431)||(18796706-18797093)
chr8 (41-431)||(15773574-15773960)
chr8 (47-431)||(21342000-21342381)
chr8 (41-431)||(44566980-44567369)
chr8 (47-431)||(19910992-19911374)
chr8 (41-431)||(18715480-18715868)
chr8 (23-431)||(19202205-19202598)
chr8 (23-431)||(27602744-27603141)
chr8 (41-394)||(33264731-33265079)
chr8 (23-431)||(22074759-22075164)
chr8 (23-303)||(16260205-16260480)
chr8 (41-428)||(19655180-19655560)
chr8 (41-431)||(2131098-2131478)
chr8 (41-431)||(19694095-19694477)
chr8 (41-431)||(22138906-22139286)
chr8 (79-431)||(14569194-14569540)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (41-431)||(30174472-30174859)
chr5 (23-431)||(33298522-33298930)
chr5 (35-431)||(3795539-3795932)
chr5 (40-431)||(33881132-33881519)
chr5 (40-431)||(18369300-18369687)
chr5 (23-431)||(28953548-28953952)
chr5 (47-427)||(11555367-11555742)
chr5 (23-431)||(32590044-32590447)
chr5 (23-431)||(22894405-22894808)
chr5 (37-431)||(30158037-30158427)
chr5 (23-431)||(31820178-31820580)
chr5 (23-431)||(37352412-37352816)
chr5 (41-431)||(37760989-37761376)
chr5 (41-431)||(41680711-41681098)
chr5 (23-431)||(2517054-2517459)
chr5 (34-431)||(6880303-6880697)
chr5 (23-431)||(9323466-9323869)
chr5 (37-431)||(8659240-8659629)
chr5 (41-431)||(13318596-13318981)
chr5 (46-431)||(43084270-43084651)
chr5 (23-431)||(12138165-12138568)
chr5 (46-431)||(18494536-18494916)
chr5 (41-431)||(37746090-37746482)
chr5 (41-428)||(9544478-9544862)
chr5 (41-431)||(28655249-28655636)
chr5 (41-431)||(40467321-40467707)
chr5 (40-431)||(11329643-11330032)
chr5 (40-431)||(24729976-24730363)
chr5 (41-431)||(15752626-15753006)
chr5 (47-431)||(23631982-23632364)
chr5 (23-431)||(26486385-26486778)
chr5 (34-431)||(33522382-33522776)
chr5 (41-431)||(13180561-13180943)
chr5 (41-431)||(30035433-30035818)
chr5 (41-431)||(5643807-5644191)
chr5 (41-431)||(13436442-13436834)
chr5 (41-431)||(18122184-18122570)
chr5 (41-431)||(34622525-34622912)
chr5 (41-431)||(37665254-37665640)
chr5 (41-428)||(31437471-31437847)
chr5 (41-431)||(15652528-15652912)
chr5 (46-407)||(25206289-25206653)
chr5 (46-407)||(25270445-25270809)
chr5 (41-431)||(22992892-22993270)
chr5 (46-431)||(23897886-23898261)
chr5 (41-431)||(33783494-33783875)
chr5 (46-431)||(24975861-24976236)
chr5 (41-431)||(24608252-24608634)
chr5 (41-431)||(30940643-30941023)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (23-431)||(3047-3453)
scaffold0159 (217-431)||(17980-18194)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (41-431)||(3647148-3647534)
chr1 (41-431)||(10968667-10969054)
chr1 (23-431)||(51644204-51644610)
chr1 (48-431)||(10951100-10951480)
chr1 (40-431)||(28591084-28591470)
chr1 (23-431)||(20334283-20334689)
chr1 (41-431)||(28155728-28156116)
chr1 (41-431)||(41787177-41787565)
chr1 (23-431)||(20466761-20467173)
chr1 (23-431)||(16201895-16202307)
chr1 (23-431)||(21891630-21892020)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (23-431)||(15551-15962)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (41-431)||(9510-9895)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (23-431)||(13931-14336)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (41-431)||(8797-9182)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (41-431)||(4471-4860)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (41-431)||(9914-10299)
scaffold0143 (41-431)||(33297-33680)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (23-431)||(1639-2043)
scaffold0322 (23-431)||(12028-12443)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (41-431)||(18585-18973)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (23-431)||(25097-25509)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (41-431)||(6066-6449)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (47-431)||(24774-25150)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (23-201)||(359-537)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (259-431)||(1-173)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (23-185)||(26243-26405)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (47-179)||(40759-40898)
scaffold0099 (324-431)||(40497-40606)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27623927 - 27623522
Alignment:
Q  24 catcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623927 catcagaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 27623828  T
Q  124 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctac 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||    
T  27623827 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctac 27623731  T
Q  224 tttcaaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623730 tttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 27623631  T
Q  323 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27623630 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 27623531  T
Q  423 tagtctgtg 431  Q
    |||||||||    
T  27623530 tagtctgtg 27623522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8899918 - 8899514
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899918 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 8899819  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  8899818 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 8899724  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899723 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 8899624  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| |    
T  8899623 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccagg 8899524  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  8899523 atagtctgtg 8899514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27356330 - 27355926
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356330 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27356231  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||    
T  27356230 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttcta 27356136  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27356135 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaa 27356036  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  27356035 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 27355936  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  27355935 atagtctgtg 27355926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34458725 - 34458323
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458725 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 34458626  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  34458625 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 34458531  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 322  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34458530 ttttctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaa 34458432  T
Q  323 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  34458431 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagga 34458332  T
Q  423 tagtctgtg 431  Q
    |||||||||    
T  34458331 tagtctgtg 34458323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33370650 - 33370246
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370650 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33370551  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  33370550 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 33370456  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33370455 ctttcaaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaa 33370356  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |    
T  33370355 agcgaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctctcctccagg 33370256  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  33370255 atagtctgtg 33370246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27284581 - 27284177
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284581 tcatctgaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27284482  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||    
T  27284481 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttt---cttcta 27284386  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284385 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 27284286  T
Q  323 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27284285 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttccccagga 27284186  T
Q  423 tagtctgtg 431  Q
    |||||||||    
T  27284185 tagtctgtg 27284177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13518396 - 13518009
Alignment:
Q  40 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518396 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13518297  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||||||    
T  13518296 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt----ttccactttcaaagctatatac 13518201  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518200 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 13518101  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||    
T  13518100 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 13518009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 39 - 431
Target Start/End: Original strand, 27491128 - 27491516
Alignment:
Q  39 tacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491128 tacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 27491227  T
Q  139 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||| ||||    
T  27491228 agtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctgtata 27491322  T
Q  239 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491323 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 27491422  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||    
T  27491423 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtg 27491516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4539978 - 4539573
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 121  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4539978 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4539879  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||        | || |    
T  4539878 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt---cttttt 4539783  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4539782 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaa 4539683  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  4539682 agcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 4539583  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||| ||||||    
T  4539582 ataatctgtg 4539573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26110629 - 26110226
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110629 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26110530  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||    
T  26110529 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttcttttta 26110435  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26110434 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaa 26110335  T
Q  323 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  26110334 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttccatatatgttacaagcaggttctcctccaaga 26110235  T
Q  423 tagtctgtg 431  Q
    || ||||||    
T  26110234 taatctgtg 26110226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 4763760 - 4764146
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4763760 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 4763859  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  4763860 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 4763954  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763955 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 4764054  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||||||    
T  4764055 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 4764146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 28213433 - 28213838
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 121  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28213433 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 28213532  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||         |||||    
T  28213533 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt----cttct 28213627  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28213628 actttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaa 28213727  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||    
T  28213728 aagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaa 28213827  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||| ||||||    
T  28213828 gataatctgtg 28213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26772847 - 26772444
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772847 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26772748  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||    
T  26772747 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttcta 26772654  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26772653 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaa 26772554  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |    
T  26772553 aacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccagg 26772454  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  26772453 atagtctgtg 26772444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 16755817 - 16756204
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755817 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 16755916  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  16755917 tcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 16756011  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat--tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756012 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 16756111  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  16756112 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16756204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 27063479 - 27063864
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27063479 cttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27063578  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27063579 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 27063672  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063673 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 27063772  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  27063773 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27063864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 29555537 - 29555941
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555537 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29555636  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||         | || ||    
T  29555637 ctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa-ctct----gttttcttttta 29555731  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29555732 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaa 29555831  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | ||| |    
T  29555832 agcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcccctccagg 29555931  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  29555932 atagtctgtg 29555941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22929102 - 22928696
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929102 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22929003  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  22929002 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 22928908  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttga 319  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||      
T  22928907 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttg 22928808  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 419  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928807 aaagcaaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 22928708  T
Q  420 agatagtctgtg 431  Q
     |||||||||||    
T  22928707 ggatagtctgtg 22928696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 409
Target Start/End: Original strand, 27200165 - 27200548
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 121  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27200165 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27200264  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||         |||||    
T  27200265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttct 27200358  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 319  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200359 actttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 27200458  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  27200459 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcagg 27200548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27249068 - 27248685
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 121  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27249068 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27248969  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||         |||||    
T  27248968 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttct 27248875  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 319  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248874 actttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 27248775  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  27248774 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcagg 27248685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 28166491 - 28166878
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166491 cttgcgaatccaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28166590  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  28166591 tcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 28166685  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166686 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 28166785  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  28166786 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28166878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 29507413 - 29507801
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29507413 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 29507512  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||           || ||||||||||||||||||||    
T  29507513 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttcttt--ttttactttcaaagctatataca 29507609  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507610 aaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 29507709  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  29507710 ggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 29507801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 26791813 - 26792199
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26791813 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggaa 26791912  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26791913 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 26792007  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792008 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 26792107  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  || |||||||||||    
T  26792108 ggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 26792199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30552208 - 30551815
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552208 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 30552109  T
Q  134 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  30552108 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 30552014  T
Q  234 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30552013 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 30551914  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  30551913 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30551815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Original strand, 16680135 - 16680523
Alignment:
Q  40 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16680135 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtgga 16680234  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||| |||||||    
T  16680235 gtcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttt---cttctactttcaaagttatatac 16680330  T
Q  240 aaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16680331 aaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgaca 16680430  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||    
T  16680431 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 16680523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Original strand, 29579018 - 29579397
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579018 aattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 29579117  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  29579118 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-----cttctattttcaaagctatatacaaatcat 29579211  T
Q  247 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 345  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579212 tttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 29579311  T
Q  346 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  || |||||||||||    
T  29579312 atcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 29579397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 4531267 - 4531671
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531267 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4531366  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||    
T  4531367 ctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttcta 4531461  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531462 ctttcaaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 4531561  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctat-ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||    
T  4531562 agcaaacccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctatcttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaa 4531660  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||| ||||||    
T  4531661 gataatctgtg 4531671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 4778877 - 4779264
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778877 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 4778976  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaa-gctatata 238  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||| ||| ||||    
T  4778977 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaaagctgtata 4779071  T
Q  239 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4779072 cgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 4779171  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  4779172 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 4779264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 24 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16938243 - 16937840
Alignment:
Q  24 catcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938243 catctgaagcttttgtacttgcgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16938144  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||    
T  16938143 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttcta 16938050  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
     |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16938049 ttttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaa 16937950  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||    
T  16937949 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaag 16937850  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||| ||||||    
T  16937849 ataatctgtg 16937840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13293140 - 13292766
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13293140 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 13293041  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293040 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 13292946  T
Q  247 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 346  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292945 tttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 13292851  T
Q  347 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  13292850 tcaaatgaaacatgcatgagtgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 13292766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 41 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14139595 - 14139218
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14139595 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 14139496  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  14139495 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 14139401  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14139400 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatg 14139306  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 428  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  14139305 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 14139218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 41 - 428
Target Start/End: Original strand, 27013730 - 27014106
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27013730 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27013829  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  27013830 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 27013924  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  27013925 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27014018  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 428  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  27014019 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattttaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 27014106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 354
Target Start/End: Original strand, 26926765 - 26927073
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26926765 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 26926864  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26926865 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 26926958  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926959 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 26927058  T
Q  340 ggtacattcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||    
T  26927059 ggtacattcaaatga 26927073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 27031020 - 27031403
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27031020 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27031119  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  27031120 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagttatgtaca 27031214  T
Q  240 -aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||    | ||||||||||||||||||||||||    
T  27031215 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaac 27031310  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  27031311 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27031403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 125 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666473
Alignment:
Q  125 ttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctact 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctact 26666681  T
Q  225 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  26666680 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaa 26666581  T
Q  324 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagat 423  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||    
T  26666580 caaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggat 26666481  T
Q  424 agtctgtg 431  Q
    ||||||||    
T  26666480 agtctgtg 26666473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 27208901 - 27209283
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27208901 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27209000  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  27209001 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 27209095  T
Q  240 aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 335  Q
    ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| ||||||    
T  27209096 aaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagca 27209188  T
Q  336 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27209189 acagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 27209283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27240327 - 27239945
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27240327 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27240228  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  27240227 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 27240133  T
Q  240 aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 335  Q
    ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| ||||||    
T  27240132 aaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagca 27240040  T
Q  336 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27240039 acagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 27239945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 24869707 - 24870087
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24869707 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24869806  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  24869807 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgtaca 24869901  T
Q  240 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  24869902 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 24869994  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||    
T  24869995 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtg 24870087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 27025142 - 27025524
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27025142 cttgcgaattcaaagtctctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27025241  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  27025242 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtaca 27025336  T
Q  240 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  27025337 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 27025429  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  27025430 cagggtacattcaaacgagacatgcatgagctagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27025524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24299956 - 24299575
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24299956 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24299857  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || |||| |||||| ||| |||     
T  24299856 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactctcaaagttatgtaca 24299762  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    ||||| ||| | |||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||| ||||    
T  24299761 aaaacgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaaca 24299667  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  24299666 gggtacattcaaatg-aacatgcataagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24299575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15406730 - 15406348
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15406730 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 15406631  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  15406630 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagatatgtac 15406536  T
Q  240 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||    
T  15406535 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 15406442  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  15406441 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15406348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15418517 - 15418135
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15418517 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 15418418  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  15418417 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagatatgtac 15418323  T
Q  240 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||    
T  15418322 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 15418229  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  15418228 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15418135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 84 - 422
Target Start/End: Original strand, 20174589 - 20174933
Alignment:
Q  84 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20174589 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 20174688  T
Q  184 ctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaac 281  Q
    || |||||||||||| ||||||||        |  | ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20174689 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctc--tttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaac 20174785  T
Q  282 aaacattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtata 374  Q
    ||||||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||       
T  20174786 aaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcg 20174885  T
Q  375 tgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 422  Q
      |  |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20174886 catcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttccccaaga 20174933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 84 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22161402 - 22161058
Alignment:
Q  84 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22161402 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 22161303  T
Q  184 ctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaac 281  Q
    || |||||||||||| ||||||||        |  | ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22161302 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctc--tttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaac 22161206  T
Q  282 aaacattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtata 374  Q
    ||||||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||       
T  22161205 aaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcg 22161106  T
Q  375 tgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 422  Q
      |  |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22161105 catcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttccccaaga 22161058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23851547 - 23851450
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 120  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851547 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Original strand, 26927077 - 26927135
Alignment:
Q  373 tatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||||    
T  26927077 tatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtg 26927135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 39856630 - 39857032
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856630 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 39856729  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          ||||||    
T  39856730 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactctttttt-----cttcta 39856823  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856824 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 39856923  T
Q  323 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  39856924 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagga 39857023  T
Q  423 tagtctgtg 431  Q
    |||||||||    
T  39857024 tagtctgtg 39857032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18794889 - 18794485
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794889 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 18794790  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  18794789 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 18794695  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18794694 ctttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaa 18794595  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  18794594 agcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 18794495  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  18794494 atagtctgtg 18794485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20332677 - 20332290
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332677 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 20332578  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  20332577 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 20332481  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332480 aaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 20332381  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  20332380 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 20332290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 40099891 - 40099504
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099891 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 40099792  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  40099791 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 40099695  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099694 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 40099595  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  40099594 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 40099504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27157568 - 27157180
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157568 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27157469  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27157468 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 27157372  T
Q  241 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157371 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 27157272  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  27157271 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27157180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24586616 - 24586229
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586616 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 24586517  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  24586516 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatatac 24586421  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24586420 aaaacattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatag 24586321  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  24586320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24586229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Original strand, 14104553 - 14104939
Alignment:
Q  40 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104553 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 14104652  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||         | ||||||||||||||||||||||    
T  14104653 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactct----gttttctttctactttcaaagctatatac 14104747  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104748 aaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 14104847  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  14104848 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 14104939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Original strand, 30759774 - 30760159
Alignment:
Q  40 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759774 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30759873  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||    
T  30759874 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatac 30759967  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759968 aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 30760067  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  30760068 ggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30760159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33668056 - 33667671
Alignment:
Q  40 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668056 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33667957  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||    
T  33667956 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatac 33667863  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667862 aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 33667763  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  33667762 ggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33667671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 54839402 - 54839787
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54839402 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 54839501  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  54839502 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 54839595  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54839596 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacag 54839695  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  54839696 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 54839787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14753747 - 14753362
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14753747 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 14753648  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  14753647 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 14753554  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14753553 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaaca 14753454  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  14753453 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 14753362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 5700551 - 5700937
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700551 cttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5700650  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||    
T  5700651 gtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 5700744  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5700745 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaaca 5700844  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  5700845 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5700937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 34 - 428
Target Start/End: Original strand, 21975708 - 21976098
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975708 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 21975807  T
Q  134 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  21975808 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 21975902  T
Q  234 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21975903 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 21976002  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  21976003 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 21976098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34183216 - 34182832
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34183216 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 34183117  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  34183116 tcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 34183022  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183021 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 34182923  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  34182922 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtg 34182832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 5011870 - 5012275
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 121  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5011870 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 5011969  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  5011970 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctactttt----cttct 5012064  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5012065 actttcaaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaa 5012164  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||     
T  5012165 aagcaaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 5012264  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||    
T  5012265 gatagtctgtg 5012275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 1906245 - 1906654
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906245 tcatcagaagctcatgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 1906344  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  1906345 ctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaa-ctctactat----ctttcta 1906439  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctatt 315  Q
    |||||||||| || |||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  1906440 ctttcaaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctatt 1906539  T
Q  316 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1906540 ttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttc 1906638  T
Q  416 cccaagatagtctgtg 431  Q
    |||| |||||||||||    
T  1906639 cccaggatagtctgtg 1906654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 34 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31120772 - 31120378
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 133  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31120772 ttctgtacttgtggattcgaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatc 31120673  T
Q  134 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  31120672 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 31120578  T
Q  234 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  31120577 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccg 31120478  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  31120477 agcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31120378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 15233809 - 15234217
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233809 tcatcataagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15233908  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        | |||||    
T  15233909 ctttgtaaatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttcta 15234003  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa------ctttttgtctattt 316  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||       |||||||||||||    
T  15234004 ctttcaaagctatgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattt 15234103  T
Q  317 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 416  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15234104 tg-aaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttcc 15234202  T
Q  417 ccaagatagtctgtg 431  Q
    ||| |||||||||||    
T  15234203 ccaggatagtctgtg 15234217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 41 - 427
Target Start/End: Original strand, 24118674 - 24119055
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24118674 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24118773  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  24118774 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagctatataca 24118868  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24118869 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacag 24118968  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtc 427  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  24118969 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 24119055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15276904 - 15276497
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15276904 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15276805  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||        |  ||||    
T  15276804 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctctcta 15276710  T
Q  223 ctttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctatttt 317  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||| ||||    
T  15276709 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgtttt 15276610  T
Q  318 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 417  Q
    | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15276609 g-aaagtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttccc 15276511  T
Q  418 caagatagtctgtg 431  Q
    || |||||||||||    
T  15276510 caggatagtctgtg 15276497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 36338772 - 36338394
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338772 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 36338673  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  36338672 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatataca 36338578  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  36338577 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 36338484  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||| |||||||||||    
T  36338483 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 36338394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15380510 - 15380106
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15380510 tcatccgaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15380411  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  15380410 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 15380316  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 320  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| |||||||    
T  15380315 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttgaa 15380216  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15380215 a-gcaagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctttttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccag 15380117  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||    
T  15380116 gatagtctgtg 15380106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Original strand, 6575879 - 6576251
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6575879 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 6575978  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6575979 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatatacaaaacat 6576073  T
Q  247 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 346  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576074 tttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 6576167  T
Q  347 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  6576168 tcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 6576251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Original strand, 1673877 - 1674258
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |    
T  1673877 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactc 1673976  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        | ||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  1673977 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctactat----ctttctactttcaaagccatgtacaaaaaat 1674071  T
Q  247 --tttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1674072 attttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacttgagcaacaggg 1674170  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  1674171 tacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggttcttccctaggatagtctgtg 1674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 17019063 - 17019445
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17019063 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 17019162  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc-aaagctatata 238  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||| |||||||| ||    
T  17019163 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaaagctatgta 17019257  T
Q  239 c-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||    
T  17019258 caaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 17019351  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  17019352 cagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 17019445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 14671027 - 14671410
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14671027 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 14671126  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  14671127 gttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtac 14671221  T
Q  240 aa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    || ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||    
T  14671222 aagaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 14671315  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||||    
T  14671316 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtg 14671410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 120 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324185
Alignment:
Q  120 aagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnncctt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----ctt 36324390  T
Q  220 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      ||||||    
T  36324389 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttga 36324296  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||    
T  36324295 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctcca 36324197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18311439 - 18311379
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtg-gttactg-tgttcaatgtacc 93  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  18311439 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaa-tgtagtgtattactgttgttcaatgtacc 18311379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5141493 - 5141088
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141493 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 5141394  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  5141393 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 5141299  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aa 320  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5141298 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 5141199  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||     
T  5141198 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 5141099  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||    
T  5141098 gatagtctgtg 5141088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 29 - 431
Target Start/End: Original strand, 26441238 - 26441637
Alignment:
Q  29 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441238 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 26441337  T
Q  129 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |         ||| ||||||||    
T  26441338 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccatttttt---cttttactttca 26441434  T
Q  229 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441435 aagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 26441534  T
Q  329 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  26441535 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 26441634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4139386 - 4138999
Alignment:
Q  42 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 141  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139386 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 4139287  T
Q  142 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 241  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  4139286 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 4139189  T
Q  242 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139188 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 4139089  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  4139088 tacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 4138999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26679245 - 26678858
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679245 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26679146  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26679145 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 26679049  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26679048 aaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggg 26678949  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  26678948 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26678858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26664053 - 26663666
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664053 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26663954  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26663953 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 26663857  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26663856 aaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggg 26663757  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  26663756 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtg 26663666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16745679 - 16745274
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745679 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16745580  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  16745579 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 16745485  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745484 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 16745385  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  ||     
T  16745384 aagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaagttctccttcag 16745285  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||    
T  16745284 gatagtctgtg 16745274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26269247 - 26268839
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269247 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26269148  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         | || ||    
T  26269147 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttcttttta 26269053  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctatttt 317  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26269052 ctttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 26268953  T
Q  318 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |    
T  26268952 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 26268853  T
Q  418 caagatagtctgtg 431  Q
    || |||||||||||    
T  26268852 caggatagtctgtg 26268839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 11446867 - 11447271
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446867 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11446966  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||         ||||||    
T  11446967 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattctatttt-----cttcta 11447060  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447061 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 11447160  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||     
T  11447161 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcag 11447260  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||    
T  11447261 gatagtctgtg 11447271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 39207279 - 39206893
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207279 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 39207180  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  39207179 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 39207085  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207084 aaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 39206985  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  39206984 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 39206893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 34 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24586682 - 24586289
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586682 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 24586583  T
Q  133 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 232  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||         ||||||||||||||||    
T  24586582 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgttt-aagactctattttt----cttctactttcaaagc 24586488  T
Q  233 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586487 tatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 24586388  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  24586387 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24586289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 3451297 - 3451702
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451297 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3451396  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||         ||||||    
T  3451397 ttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttcta 3451490  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451491 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 3451590  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  3451591 aaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattccaatatatgttacaagcaggttctcctcca 3451690  T
Q  420 agatagtctgtg 431  Q
     |||||| ||||    
T  3451691 ggatagtatgtg 3451702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16444144 - 16443757
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16444144 cttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 16444045  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||| ||||    
T  16444044 tcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactctacttt----ctttctactttcaaagctatgtaca 16443950  T
Q  241 aaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16443949 aaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaac 16443851  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16443850 agggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 16443757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 5154081 - 5154466
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5154081 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5154180  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  5154181 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 5154275  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154276 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5154375  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  5154376 gtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5154466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Original strand, 5164387 - 5164767
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5164387 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 5164486  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc-tatatacaaaaca 245  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5164487 tttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagcctatatacaaaaca 5164581  T
Q  246 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 345  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164582 ttttctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 5164681  T
Q  346 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  5164682 tccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5164767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 4205368 - 4205772
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 121  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205368 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 4205467  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  4205468 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 4205561  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaa 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4205562 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaa 4205661  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  4205662 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaa 4205761  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||| ||||||    
T  4205762 gataatctgtg 4205772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 26518790 - 26519174
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518790 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26518889  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| |||||||||||||||||    
T  26518890 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatataca 26518983  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518984 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 26519083  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  26519084 gtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26519174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31558534 - 31558148
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31558534 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31558435  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31558434 tcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 31558340  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558339 aatcattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 31558240  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || |||||||||||    
T  31558239 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 31558148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 37 - 431
Target Start/End: Original strand, 45393212 - 45393602
Alignment:
Q  37 tgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393212 tgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 45393311  T
Q  137 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctata 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  45393312 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctactttt----cttctactttcaaagctata 45393406  T
Q  237 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 335  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393407 cacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 45393506  T
Q  336 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |  || |||||||||||    
T  45393507 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccatttcagtatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 45393602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26314006 - 26313603
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314006 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26313907  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  26313906 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 26313813  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26313812 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 26313713  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  26313712 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 26313613  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||| ||||||    
T  26313612 ataatctgtg 26313603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26509837 - 26509471
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26509837 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 26509738  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  26509737 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatatac 26509642  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509641 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 26509542  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  26509541 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatacatgtcacaagcagg 26509471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11418913 - 11418533
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11418913 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 11418814  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 246  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||        | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11418813 cttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttttactttcaaagctatatacaaaacat 11418719  T
Q  247 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 345  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418718 tttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 11418619  T
Q  346 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||| |||||||||||    
T  11418618 ttcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggtcctcctccaggatagtctgtg 11418533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 45737298 - 45737686
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45737298 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 45737397  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  45737398 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 45737491  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737492 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 45737591  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  45737592 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatatctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 45737686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 16047294 - 16047695
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047294 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16047393  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  16047394 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 16047488  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 322  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16047489 ctgtcaaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtttttgtctattttgaaa- 16047586  T
Q  323 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 422  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  16047587 gcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccggga 16047686  T
Q  423 tagtctgtg 431  Q
    |||||||||    
T  16047687 tagtctgtg 16047695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 2160567 - 2160955
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2160567 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2160666  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||||||| ||||    
T  2160667 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttc----ctttttactttcaaagctatgtaca 2160761  T
Q  241 aaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  2160762 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaac 2160861  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2160862 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 2160955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31084781 - 31084376
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 121  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31084781 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 31084682  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||    
T  31084681 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctattttt----cttct 31084587  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31084586 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaa 31084487  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||    
T  31084486 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaa 31084387  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||| ||||||    
T  31084386 gataatctgtg 31084376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 126 - 431
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26596053
Alignment:
Q  126 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactt 26595846  T
Q  226 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595847 tcaaagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 26595946  T
Q  325 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagata 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||    
T  26595947 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggata 26596046  T
Q  425 gtctgtg 431  Q
    |||||||    
T  26596047 gtctgtg 26596053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 41 - 428
Target Start/End: Original strand, 2779249 - 2779626
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2779249 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2779348  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  2779349 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 2779443  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  2779444 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 2779538  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 428  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  2779539 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 2779626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 31129902 - 31130282
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31129902 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31130001  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  31130002 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 31130096  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  31130097 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 31130191  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  31130192 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtg 31130282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 10847562 - 10847968
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10847562 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 10847661  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||        |  ||||    
T  10847662 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctg-aaactcta----ttttctctcta 10847756  T
Q  223 ctttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattt 316  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||    
T  10847757 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttt 10847856  T
Q  317 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 416  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10847857 tg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggctcttcc 10847953  T
Q  417 ccaagatagtctgtg 431  Q
    ||| |||||||||||    
T  10847954 ccaggatagtctgtg 10847968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16512574 - 16512194
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16512574 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 16512475  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  16512474 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtaca 16512380  T
Q  240 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||    
T  16512379 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 16512288  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  16512287 agggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16512194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10911060 - 10910680
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10911060 cttgcgaatacaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 10910961  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  10910960 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 10910866  T
Q  240 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  10910865 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 10910773  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  10910772 atggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10910680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26532010 - 26531926
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 125  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532010 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 29659283 - 29658879
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659283 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29659184  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||    
T  29659183 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttcta 29659089  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29659088 ctttcaaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaa 29658989  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  29658988 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 29658889  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  29658888 atagtctgtg 29658879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 32296574 - 32296979
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296574 tcatcagaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32296673  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  32296674 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttt---cttcta 32296770  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296771 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 32296870  T
Q  323 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  32296871 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagga 32296970  T
Q  423 tagtctgtg 431  Q
    |||||||||    
T  32296971 tagtctgtg 32296979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 4629730 - 4630133
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629730 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4629829  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  4629830 ctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 4629924  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629925 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 4630024  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  4630025 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 4630123  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  4630124 atagtctgtg 4630133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 21680646 - 21681049
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680646 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21680745  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  21680746 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 21680840  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680841 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 21680940  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  21680941 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 21681039  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  21681040 atagtctgtg 21681049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 5727941 - 5728328
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727941 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5728040  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5728041 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 5728137  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728138 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5728237  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  5728238 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5728328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 47029416 - 47029803
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029416 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 47029515  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  47029516 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 47029612  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029613 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 47029712  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  47029713 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 47029803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 29143072 - 29142665
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143072 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29142973  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||    
T  29142972 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttt----ttcta 29142877  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--ga 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  29142876 ctttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaa 29142777  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 419  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  29142776 aaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 29142677  T
Q  420 agatagtctgtg 431  Q
     |||||||||||    
T  29142676 ggatagtctgtg 29142665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 5717031 - 5717418
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717031 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5717130  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5717131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 5717227  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717228 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5717327  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  5717328 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5717418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5764427 - 5764040
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764427 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5764328  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5764327 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 5764231  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764230 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5764131  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  5764130 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5764040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 34 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4340980 - 4340587
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340980 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4340881  T
Q  134 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  4340880 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 4340786  T
Q  234 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 332  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4340785 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 4340686  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  4340685 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 4340587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 18248683 - 18249087
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18248683 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgag 18248782  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||         ||||||    
T  18248783 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttggaa-ctctattttt----cttcta 18248877  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18248878 ctttcaaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaa 18248977  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  18248978 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 18249077  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  18249078 atagtctgtg 18249087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20571161 - 20570757
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571161 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20571062  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  20571061 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 20570967  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20570966 ttttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaa 20570867  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| |    
T  20570866 agcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccagg 20570767  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  20570766 atagtctgtg 20570757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 10649034 - 10649420
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649034 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 10649133  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||    
T  10649134 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 10649228  T
Q  241 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649229 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 10649328  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  10649329 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10649420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 28027236 - 28027638
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027236 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28027335  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||         ||||||    
T  28027336 ctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaattctatttt-----cttcta 28027429  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027430 ctttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 28027529  T
Q  323 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  28027530 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagga 28027629  T
Q  423 tagtctgtg 431  Q
    |||||||||    
T  28027630 tagtctgtg 28027638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 42 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31958753 - 31958366
Alignment:
Q  42 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 141  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958753 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 31958654  T
Q  142 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 241  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  31958653 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 31958556  T
Q  242 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958555 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 31958456  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  31958455 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31958366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28110271 - 28109862
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 121  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110271 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 28110172  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||    
T  28110171 gctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttct 28110076  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac----attttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110075 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 28109976  T
Q  318 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  28109975 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctc 28109876  T
Q  418 caagatagtctgtg 431  Q
    ||||||| ||||||    
T  28109875 caagataatctgtg 28109862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5603611 - 5603224
Alignment:
Q  42 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 141  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603611 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 5603512  T
Q  142 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 241  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  5603511 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 5603414  T
Q  242 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603413 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 5603314  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  5603313 taccttcaaataaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5603224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 431
Target Start/End: Original strand, 24334137 - 24334524
Alignment:
Q  42 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 141  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334137 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 24334236  T
Q  142 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 241  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||| ||||    
T  24334237 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatacacaa 24334334  T
Q  242 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334335 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 24334434  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  24334435 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24334524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 5472951 - 5473336
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472951 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5473050  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5473051 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 5473145  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473146 aaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 5473244  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  5473245 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5473336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 8217595 - 8217983
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8217595 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtggag 8217694  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||    
T  8217695 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 8217789  T
Q  241 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217790 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 8217889  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  8217890 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8217983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 34 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5590665 - 5590275
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5590665 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 5590566  T
Q  134 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  5590565 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 5590471  T
Q  234 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 332  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590470 atgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 5590371  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  5590370 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaataggtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 5590275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 51787985 - 51788371
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787985 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 51788084  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  51788085 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 51788179  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788180 aaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 51788279  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  51788280 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 51788371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 4422881 - 4423267
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4422881 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 4422980  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  4422981 tcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 4423075  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423076 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 4423175  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || |||||||||||    
T  4423176 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 4423267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 16422128 - 16422532
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||   ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422128 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccg-gaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16422226  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  16422227 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 16422321  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttga 319  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16422322 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttga 16422421  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 419  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422422 aa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 16422520  T
Q  420 agatagtctgtg 431  Q
     |||||||||||    
T  16422521 ggatagtctgtg 16422532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16618808 - 16618400
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618808 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16618709  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | |||||    
T  16618708 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttcta 16618614  T
Q  223 ctttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctattt 316  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| ||||    
T  16618613 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattt 16618514  T
Q  317 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 416  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16618513 tg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaggaggctcttcc 16618415  T
Q  417 ccaagatagtctgtg 431  Q
    ||| |||||||||||    
T  16618414 ccaggatagtctgtg 16618400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4790931 - 4790544
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4790931 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4790832  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  4790831 ttcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatac 4790737  T
Q  240 aaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790736 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 4790637  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  4790636 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 4790544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 34 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17979255 - 17978861
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979255 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 17979156  T
Q  134 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  17979155 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 17979061  T
Q  234 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17979060 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctg 17978961  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  17978960 agcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 17978861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22381877 - 22381492
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381877 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 22381778  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  22381777 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 22381683  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22381682 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacag 22381583  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  22381582 tgtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22381492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17971161 - 17970777
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971161 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 17971062  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| |||||||||||||||||    
T  17971061 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatataca 17970968  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970967 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 17970868  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  17970867 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgcgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 17970777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 42 - 431
Target Start/End: Original strand, 28345135 - 28345519
Alignment:
Q  42 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 141  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345135 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 28345234  T
Q  142 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 241  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||||    
T  28345235 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatacaa 28345328  T
Q  242 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345329 atcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 28345428  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  28345429 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 28345519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 10402112 - 10402497
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10402112 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 10402211  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||          |||||||||||||||||||||||    
T  10402212 tcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaattctattttt-----ttctactttcaaagctatataca 10402305  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402306 aaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 10402405  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  10402406 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10402497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18286645 - 18286266
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18286645 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18286546  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286545 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 18286452  T
Q  247 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18286451 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtac 18286352  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  18286351 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18286266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18301946 - 18301567
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18301946 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18301847  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301846 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 18301753  T
Q  247 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18301752 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtac 18301653  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  18301652 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18301567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 20071996 - 20072384
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20071996 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 20072095  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  20072096 tcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 20072189  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072190 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 20072289  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  20072290 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 20072384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 5019676 - 5020061
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5019676 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5019775  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5019776 tcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctacttt-----cttctactttcaaagctatataca 5019869  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019870 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 5019969  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||    
T  5019970 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 5020061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 18231156 - 18231542
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18231156 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtggag 18231255  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         | |||||||||||||||||||||||    
T  18231256 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactct----gttttctttctactttcaaagctatataca 18231350  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18231351 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacag 18231450  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  18231451 ggtacagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18231542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22865143 - 22864759
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22865143 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22865044  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  22865043 tcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctatgcttt---cttctactttcaaagctgtataca 22864950  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22864949 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 22864850  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||| | |||||||||    
T  22864849 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtg 22864759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22880202 - 22879818
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22880202 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22880103  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  22880102 tcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctatgcttt---cttctactttcaaagctgtataca 22880009  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22880008 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 22879909  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||| | |||||||||    
T  22879908 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtg 22879818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6537040 - 6536654
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6537040 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 6536941  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  6536940 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 6536846  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6536845 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacag 6536746  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  6536745 ggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtg 6536654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 49 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11104651 - 11104272
Alignment:
Q  49 ttcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcct 148  Q
    ||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11104651 ttcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgcct 11104552  T
Q  149 ttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta--tatacaaaacat 246  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        | || ||||||||||||||  |||||||   ||    
T  11104551 tcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt----ctttttactttcaaagctaaatatacaatttat 11104457  T
Q  247 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 346  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104456 tttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 11104357  T
Q  347 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  11104356 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 11104272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 7079185 - 7079576
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7079185 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 7079284  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata-- 238  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||         | || ||||||||||||||||||      
T  7079285 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagctatatata 7079379  T
Q  239 --caaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 334  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079380 tacaaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 7079479  T
Q  335 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  7079480 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 7079576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 48471890 - 48472280
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48471890 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggag 48471989  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  48471990 tcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 48472084  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472085 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaagcaaacctgagca 48472184  T
Q  336 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  48472185 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 48472280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 18057223 - 18057612
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18057223 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 18057322  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  18057323 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagttatgtac 18057417  T
Q  240 aaaa-cattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18057418 aaaaacattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaa 18057517  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18057518 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 18057612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31030535 - 31030156
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31030535 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31030436  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31030435 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatataca 31030341  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  31030340 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 31030246  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  31030245 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaagatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31030156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Original strand, 6207869 - 6208245
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 145  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6207869 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 6207968  T
Q  146 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207969 ccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaaca 6208064  T
Q  246 ttttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6208065 ttttccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 6208158  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6208159 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtg 6208245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Original strand, 18336589 - 18336968
Alignment:
Q  39 tacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 137  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18336589 tacttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 18336688  T
Q  138 gagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatat 237  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  18336689 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatat 18336783  T
Q  238 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  18336784 acaaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaac 18336878  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  18336879 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 18336968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 46 - 431
Target Start/End: Original strand, 19700454 - 19700847
Alignment:
Q  46 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 145  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19700454 gaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 19700553  T
Q  146 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaa-- 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||        | || ||||||||||||||| |||||||      
T  19700554 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt----ctttttactttcaaagctatgtacaaaaaa 19700648  T
Q  244 ---------cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctg 331  Q
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19700649 aaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctg 19700747  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  19700748 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcagattcttccccaggatagtctgtg 19700847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Original strand, 4727602 - 4727976
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4727602 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 4727701  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4727702 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatatacaaaacat 4727796  T
Q  247 tttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727797 tttctttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 4727890  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4727891 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtg 4727976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 46 - 431
Target Start/End: Original strand, 32445122 - 32445494
Alignment:
Q  46 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 145  Q
    |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32445122 gaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 32445221  T
Q  146 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  32445222 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatatacaaaaca 32445316  T
Q  246 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 345  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445317 ttttctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 32445409  T
Q  346 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  32445410 ttcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 32445494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15735392 - 15735011
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735392 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 15735293  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||          ||| ||||||||||| ||| |||     
T  15735292 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct-----gctttcttttactttcaaagttatgtaca 15735199  T
Q  240 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  15735198 aaaacatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaac 15735104  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  15735103 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15735011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Original strand, 35886733 - 35887109
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 145  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  35886733 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 35886832  T
Q  146 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  35886833 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaac 35886927  T
Q  245 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35886928 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggt 35887021  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  35887022 acattcaaacg-aacatacatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 35887109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 4689614 - 4689994
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4689614 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgga 4689713  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||          ||| ||||||| ||| ||| |||    
T  4689714 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct-----gctttcttttactttctaagttatgtac 4689807  T
Q  240 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  4689808 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 4689900  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||    
T  4689901 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcagattctcctccaggatagtctgtg 4689994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8283766 - 8283369
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283766 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 8283667  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||          | || ||||||||||| ||| |||     
T  8283666 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttg-aaactc----cgctttctttttactttcaaagttatgtaca 8283572  T
Q  240 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---------ctttttgtctattttgaaaagcaaac 328  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||          ||||| | | ||||| |||||||||    
T  8283571 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaac 8283472  T
Q  329 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  8283471 ctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 8283372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 5658097 - 5658480
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5658097 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5658196  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 238  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||        |||| ||||||||| | ||| ||    
T  5658197 tcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttccttttactttcaacgttatgta 5658291  T
Q  239 c-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 335  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||      ||||||||||||||||| ||||    
T  5658292 caaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagca 5658385  T
Q  336 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| ||| | | | |||||||||||    
T  5658386 acagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgcatgttacaagcaggttctcctcaaggatagtctgtg 5658480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15886857 - 15886652
Alignment:
Q  221 tactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 317  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||       ||    
T  15886857 tactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaagcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------tt 15886765  T
Q  318 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |    
T  15886764 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 15886666  T
Q  418 caagatagtctgtg 431  Q
    |  |||||||||||    
T  15886665 ccggatagtctgtg 15886652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15887004 - 15886894
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgt-gaatccgtgg 138  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15887004 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgtgg 15886905  T
Q  139 agtcatgcctt 149  Q
    ||||| |||||    
T  15886904 agtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Original strand, 8002523 - 8002607
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 125  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002523 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 40239489 - 40239892
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239489 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 40239588  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  40239589 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 40239683  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239684 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 40239783  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  40239784 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 40239882  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  40239883 atagtctgtg 40239892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 27809699 - 27810087
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809699 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27809798  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27809799 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttt--cttctactttcaaagctatataca 27809896  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809897 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27809996  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  27809997 ttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27810087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 27782212 - 27782616
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782212 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27782311  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  27782312 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 27782406  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27782407 ttttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaa 27782506  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| |    
T  27782507 agcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccagg 27782606  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  27782607 atagtctgtg 27782616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 254896 - 254510
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254896 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 254797  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  254796 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 254700  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254699 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 254601  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  254600 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 254510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37946110 - 37945723
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946110 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 37946011  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  37946010 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 37945914  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945913 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37945814  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  37945813 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37945723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12710863 - 12710459
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710863 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12710764  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||         ||||||    
T  12710763 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattctatttt-----cttcta 12710670  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710669 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 12710570  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||     
T  12710569 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcag 12710470  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||    
T  12710469 gatagtctgtg 12710459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 16167476 - 16167862
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167476 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 16167575  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||    
T  16167576 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 16167670  T
Q  241 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167671 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 16167770  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  16167771 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16167862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 12592808 - 12593198
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592808 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 12592907  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  12592908 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 12593003  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12593004 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaa 12593103  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  12593104 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 12593198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 42 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22922388 - 22922001
Alignment:
Q  42 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 141  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922388 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 22922289  T
Q  142 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 241  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  22922288 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 22922191  T
Q  242 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922190 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 22922091  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  22922090 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22922001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Original strand, 12661543 - 12661922
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12661543 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 12661642  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661643 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 12661737  T
Q  247 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 346  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661738 tttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 12661837  T
Q  347 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  12661838 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 12661922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13930790 - 13930402
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930790 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 13930691  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  13930690 tcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 13930595  T
Q  241 aaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930594 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 13930495  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  13930494 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagatagtctgtg 13930402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 3788492 - 3788877
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  3788492 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcggag 3788591  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  3788592 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 3788686  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788687 aaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 3788786  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  3788787 gtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3788877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 37931370 - 37931763
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931370 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 37931469  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnc--cttctactttcaaagctatata 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||    
T  37931470 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatata 37931569  T
Q  239 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37931570 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaac 37931669  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||    
T  37931670 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 37931763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19410729 - 19410342
Alignment:
Q  42 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 141  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410729 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 19410630  T
Q  142 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 241  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||| ||||    
T  19410629 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatacacaa 19410532  T
Q  242 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19410531 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagga 19410432  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  19410431 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 19410342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 39896048 - 39896452
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 121  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39896048 tcatctgaagcttctgtacttgagaattcaaagtttttggggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccga 39896147  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||    
T  39896148 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttct 39896242  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39896243 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 39896342  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  39896343 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 39896442  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  39896443 atagtctgtg 39896452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 27122523 - 27122907
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27122523 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27122622  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27122623 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctttgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 27122716  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27122717 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagg 27122816  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  27122817 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27122907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Original strand, 34867680 - 34868066
Alignment:
Q  40 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34867680 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtaga 34867779  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||    
T  34867780 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatac 34867873  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867874 aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 34867973  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  34867974 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 34868066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 37383675 - 37384061
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383675 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37383774  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  37383775 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatac 37383869  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383870 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 37383969  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  37383970 ggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37384061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9344231 - 9343845
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9344231 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9344132  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  9344131 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt----ctttctactttcaaagctatataca 9344037  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9344036 aaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacag 9343937  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  9343936 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 9343845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11629446 - 11629043
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629446 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11629347  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         ||| ||    
T  11629346 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----ctttta 11629253  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 320  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11629252 ttttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaa 11629153  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||     
T  11629152 aaacaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 11629054  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||    
T  11629053 gatagtctgtg 11629043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 39046066 - 39045680
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| |  || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39046066 cttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 39045967  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  39045966 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt----ctttctactttcaaagctatataca 39045872  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045871 aaacattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 39045772  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  39045771 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 39045680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37680155 - 37679749
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 121  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37680155 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37680056  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  37680055 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 37679962  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttg 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  37679961 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttg 37679862  T
Q  319 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||    
T  37679861 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctcc 37679762  T
Q  419 aagatagtctgtg 431  Q
    | |||||||||||    
T  37679761 aggatagtctgtg 37679749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37695420 - 37695014
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 121  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37695420 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37695321  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  37695320 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 37695227  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttg 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  37695226 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttg 37695127  T
Q  319 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||    
T  37695126 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctcc 37695027  T
Q  419 aagatagtctgtg 431  Q
    | |||||||||||    
T  37695026 aggatagtctgtg 37695014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21697427 - 21697031
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 133  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21697427 ttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 21697328  T
Q  134 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        | | ||||||||||||||    
T  21697327 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctactat----cttcctactttcaaagct 21697233  T
Q  234 atatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaac 328  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  21697232 atgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaac 21697134  T
Q  329 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 428  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21697133 ctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtct 21697034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 34160842 - 34161230
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34160842 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 34160941  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  34160942 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 34161036  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161037 aaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 34161136  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  34161137 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtcacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 34161230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16823588 - 16823195
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823588 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16823489  T
Q  134 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  16823488 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 16823394  T
Q  234 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16823393 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 16823294  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  16823293 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16823195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 431
Target Start/End: Original strand, 16897892 - 16898285
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897892 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16897991  T
Q  134 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  16897992 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 16898086  T
Q  234 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16898087 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 16898186  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  16898187 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16898285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21671435 - 21671028
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 121  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21671435 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 21671336  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  21671335 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 21671242  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaacttttt-gtctatttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||    
T  21671241 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattttttttgtctatttt 21671142  T
Q  318 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |    
T  21671141 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctc 21671042  T
Q  418 caagatagtctgtg 431  Q
    || |||||||||||    
T  21671041 caggatagtctgtg 21671028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 31882285 - 31882670
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31882285 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31882384  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31882385 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 31882478  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31882479 aaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacgg 31882578  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  31882579 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31882670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 32055800 - 32056185
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32055800 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 32055899  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  32055900 tcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaattctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 32055993  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055994 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 32056093  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  32056094 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtg 32056185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 91 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868644
Alignment:
Q  91 accaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgct 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  191 tttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 290  Q
    ||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868879 tttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 31868786  T
Q  291 -gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctattt 389  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  31868785 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctattt 31868686  T
Q  390 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  31868685 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31868644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 27396303 - 27396717
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27396303 tcatcagaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 27396402  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | |||||    
T  27396403 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttcta 27396497  T
Q  223 ctttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----------ctttttgt 310  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           |||||||    
T  27396498 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgt 27396597  T
Q  311 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggc 410  Q
    |  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396598 cctttttg-aaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggc 27396696  T
Q  411 tcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  27396697 tcttccccaggatagtctgtg 27396717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 34297154 - 34297533
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34297154 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 34297253  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  34297254 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 34297348  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  34297349 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 34297442  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||| |||||||||||    
T  34297443 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 34297533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19450689 - 19450276
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19450689 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 19450590  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||        |  ||||    
T  19450589 ctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctctcta 19450495  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg------aaaactttttgtc 311  Q
    ||||||||| ||| |||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||| ||||||||    
T  19450494 ctttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtc 19450395  T
Q  312 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggct 411  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19450394 tgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttataagcaggct 19450296  T
Q  412 cttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  19450295 cttccccaggatagtctgtg 19450276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 28888277 - 28888658
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28888277 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 28888376  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  28888377 tcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtaca 28888471  T
Q  240 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||    
T  28888472 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 28888565  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  28888566 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28888658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34269165 - 34268784
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34269165 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtggag 34269066  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  34269065 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgttt-aaaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 34268971  T
Q  240 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  34268970 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 34268878  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | | |||||||||||    
T  34268877 agggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagattcttctctaggatagtctgtg 34268784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27428690 - 27428315
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27428690 cttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27428591  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||| ||| | |     
T  27428590 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtgca 27428496  T
Q  240 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||    
T  27428495 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 27428404  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtc 427  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  27428403 agggtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcccccaggatagtc 27428315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23122817 - 23122436
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23122817 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtgga 23122718  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  23122717 gtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagttatgtac 23122623  T
Q  240 -aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||    
T  23122622 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 23122529  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  23122528 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 23122436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 20843910 - 20844296
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20843910 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 20844009  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc-aaagctatat- 237  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||| ||| |||| ||| |     
T  20844010 gtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttaccttcaaaagttatgtt 20844104  T
Q  238 -acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 334  Q
     | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||    
T  20844105 caaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagc 20844199  T
Q  335 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  20844200 aacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 20844296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 244 - 431
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117180
Alignment:
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 23117180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 31887737 - 31887682
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccacc 96  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  31887737 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 12036 - 12421
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12036 cttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 12135  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |    
T  12136 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatata 12230  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 12330  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  12331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 12421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 34 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28356176 - 28355780
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356176 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 28356077  T
Q  133 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||    
T  28356076 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttt--cttctactttcaaagc 28355979  T
Q  233 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355978 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 28355879  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  28355878 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28355780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 9360622 - 9361007
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360622 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 9360721  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9360722 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 9360816  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360817 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 9360916  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  9360917 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 9361007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 31360528 - 31360914
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360528 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 31360627  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||    
T  31360628 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 31360722  T
Q  241 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360723 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 31360822  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  31360823 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12086958 - 12086553
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 121  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12086958 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 12086859  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||         |||||    
T  12086858 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt----cttct 12086764  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12086763 actttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaa 12086664  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||    
T  12086663 aagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaa 12086564  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||| ||||||    
T  12086563 gataatctgtg 12086553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31484087 - 31483700
Alignment:
Q  42 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 141  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484087 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 31483988  T
Q  142 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 241  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  31483987 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 31483890  T
Q  242 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31483889 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaagg 31483790  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  31483789 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacgagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31483700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 33248366 - 33248751
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248366 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33248465  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  33248466 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt----cttctactttcaaagctatataca 33248560  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248561 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 33248660  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  33248661 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33248751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 19680430 - 19680833
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 121  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680430 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19680529  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  19680530 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 19680623  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19680624 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 19680723  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  19680724 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 19680823  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  19680824 atagtctgtg 19680833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 35 - 431
Target Start/End: Original strand, 29835317 - 29835708
Alignment:
Q  35 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29835317 tctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 29835416  T
Q  135 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta 234  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||    
T  29835417 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttt-----cttctactttcaaagcta 29835511  T
Q  235 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 334  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835512 tatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 29835611  T
Q  335 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  29835612 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagataatctgtg 29835708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 18796706 - 18797093
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18796706 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtgga 18796805  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  18796806 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatac 18796900  T
Q  240 aaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796901 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 18797000  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  18797001 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18797093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 15773574 - 15773960
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15773574 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 15773673  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||| |||||||||||    
T  15773674 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcagagctatataca 15773768  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773769 aaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 15773868  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  15773869 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15773960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21342381 - 21342000
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 145  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21342381 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 21342282  T
Q  146 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||         | || |||||||||||||||||||||||||    
T  21342281 ccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatatacaaaaca 21342187  T
Q  246 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342186 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 21342087  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||    
T  21342086 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagaatagtctgtg 21342000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 44566980 - 44567369
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| ||||||||||||||  || || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44566980 cttgcgaattcaaagtttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 44567079  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  44567080 gtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 44567173  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567174 aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 44567273  T
Q  336 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  44567274 acagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 44567369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19911374 - 19910992
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19911374 aattcaaagtttctaggagatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 19911275  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaa--c 244  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||||||| |||||||  |    
T  19911274 cttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttc----ctttttactttcaaagctatgtacaaaaaac 19911180  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19911179 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggta 19911080  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  19911079 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagatagtctgtg 19910992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 18715480 - 18715868
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18715480 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 18715579  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  18715580 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 18715673  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715674 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 18715773  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| | ||| |||||||||||    
T  18715774 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgactatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 18715868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19202598 - 19202205
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagt-ttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202598 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19202499  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||                  
T  19202498 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctat------------- 19202413  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19202412 --tttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 19202315  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  19202314 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 19202215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27603141 - 27602744
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603141 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27603042  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||    
T  27603041 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttcttttta 27602947  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 319  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||        ||||||    
T  27602946 ctttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtt--------ttttga 27602855  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 419  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  27602854 aaagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 27602756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 394
Target Start/End: Original strand, 33264731 - 33265079
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33264731 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgccatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 33264830  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||     
T  33264831 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatatacg 33264924  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264925 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 33265024  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaata 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  33265025 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcaatgtctatttcaata 33265079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22075164 - 22074759
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22075164 tcatcagaagcttttgtgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 22075065  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||        | |||||    
T  22075064 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 22074970  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 319  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  22074969 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaagtttttgtctgttttga 22074870  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 419  Q
    || |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22074869 aa-gcaagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccta 22074771  T
Q  420 agatagtctgtg 431  Q
     |||||||||||    
T  22074770 ggatagtctgtg 22074759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 16260205 - 16260480
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260205 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16260304  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  16260305 ctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 16260399  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260400 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 41 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19655560 - 19655180
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa--ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 138  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19655560 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 19655461  T
Q  139 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 238  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| ||    
T  19655460 agtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgta 19655366  T
Q  239 c-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 335  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      ||||| ||||||||||||||||    
T  19655365 caaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtttt------ttttg-aaagcaaacctgagca 19655273  T
Q  336 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 428  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19655272 acagggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagactcttccccaggatagtct 19655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 2131478 - 2131098
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2131478 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2131379  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  2131378 tcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgtaca 2131284  T
Q  240 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||        |||||||||||||||||||||||    
T  2131283 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaac 2131191  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  2131190 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 2131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 19694095 - 19694477
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19694095 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 19694194  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||          | || ||||||||||| ||| |||    
T  19694195 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactc----cgctttctttttactttcaaagttatgtac 19694289  T
Q  240 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||    
T  19694290 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 19694383  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||    
T  19694384 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtg 19694477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 22138906 - 22139286
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22138906 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 22139005  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||    
T  22139006 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtac 22139100  T
Q  240 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |        ||||| ||||||||| |||||||    
T  22139101 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaaagt--------ttttg-aaagcaaacttgagcaa 22139191  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  22139192 cagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22139286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 79 - 431
Target Start/End: Original strand, 14569194 - 14569540
Alignment:
Q  79 tgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569194 tgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 14569293  T
Q  179 tgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctat-----atacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aa 271  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| |||     | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  14569294 tgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaa 14569388  T
Q  272 tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 371  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14569389 tgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 14569480  T
Q  372 atatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
     | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  14569481 gtgtgttggtgtctatttcaatacatgttacaagcaggttctcctccaggatattctgtg 14569540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 30174472 - 30174859
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174472 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 30174571  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  30174572 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 30174668  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174669 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 30174768  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  30174769 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30174859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 33298522 - 33298930
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298522 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33298621  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||    
T  33298622 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttt---ttcta 33298718  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--ga 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  33298719 ctttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaa 33298818  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 419  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  33298819 aaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 33298918  T
Q  420 agatagtctgtg 431  Q
     |||||||||||    
T  33298919 ggatagtctgtg 33298930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 35 - 431
Target Start/End: Original strand, 3795539 - 3795932
Alignment:
Q  35 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 134  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795539 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 3795638  T
Q  135 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||    
T  3795639 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttt---cttctactttcaaagcta 3795735  T
Q  235 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795736 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 3795835  T
Q  335 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  3795836 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3795932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Original strand, 33881132 - 33881519
Alignment:
Q  40 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881132 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33881231  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||||||    
T  33881232 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt----ttccactttcaaagctatatac 33881327  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881328 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 33881427  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||    
T  33881428 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 33881519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18369687 - 18369300
Alignment:
Q  40 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369687 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 18369588  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  18369587 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctattttt----cttctactttcaaagctatatac 18369492  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369491 aaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18369392  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  18369391 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18369300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28953952 - 28953548
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953952 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28953853  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  28953852 ctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 28953758  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28953757 ctttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaa 28953658  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||     
T  28953657 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccag 28953559  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||    
T  28953558 gatagtctgtg 28953548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 47 - 427
Target Start/End: Original strand, 11555367 - 11555742
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11555367 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 11555466  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555467 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 11555561  T
Q  247 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555562 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 11555661  T
Q  347 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtc 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  11555662 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 11555742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32590447 - 32590044
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590447 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32590348  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||    
T  32590347 ctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctacttt-----cttcta 32590254  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590253 ctttcaaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 32590154  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  32590153 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 32590054  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  32590053 atagtctgtg 32590044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 22894405 - 22894808
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894405 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22894504  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  22894505 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 22894599  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaa 321  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22894600 ctttcaaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggtttttgtctattttgaaa 22894699  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22894700 -gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtctatttcgatatgtgttacaagcagactcttccccagg 22894798  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||||||||    
T  22894799 atagtctgtg 22894808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 37 - 431
Target Start/End: Original strand, 30158037 - 30158427
Alignment:
Q  37 tgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 136  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158037 tgtactcgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 30158136  T
Q  137 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctata 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  30158137 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctaccttt----cttctactttcaaagctata 30158231  T
Q  237 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158232 tacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 30158331  T
Q  336 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  30158332 acggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30158427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31820580 - 31820178
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820580 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 31820481  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||    
T  31820480 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttcta 31820387  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 322  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31820386 ttttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaa 31820287  T
Q  323 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 422  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  || ||    
T  31820286 gcaaacctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcagga 31820187  T
Q  423 tagtctgtg 431  Q
    |||||||||    
T  31820186 tagtctgtg 31820178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37352816 - 37352412
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352816 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 37352717  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  37352716 ctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 37352622  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37352621 ctttcaaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaa 37352522  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  37352521 agcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 37352422  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||| ||||||    
T  37352421 ataatctgtg 37352412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 37760989 - 37761376
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37760989 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggag 37761088  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  37761089 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 37761183  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctatttt-gaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37761184 aaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaaca 37761283  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||    
T  37761284 gggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagactgtg 37761376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 41680711 - 41681098
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680711 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 41680810  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  41680811 tcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 41680906  T
Q  241 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41680907 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaaca 41681006  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  41681007 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 41681098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 2517054 - 2517459
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517054 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 2517153  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||         ||||||    
T  2517154 ctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgagat-tctatttt-----cttcta 2517247  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517248 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 2517347  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | |||    
T  2517348 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaacgtgtgttacaagcaggttctcctcca 2517447  T
Q  420 agatagtctgtg 431  Q
     |||||||||||    
T  2517448 ggatagtctgtg 2517459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 34 - 431
Target Start/End: Original strand, 6880303 - 6880697
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880303 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 6880402  T
Q  133 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 232  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||         ||||||||||||||||    
T  6880403 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aagactctattttt----cttctactttcaaagc 6880497  T
Q  233 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880498 tatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 6880597  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  6880598 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatgtgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 6880697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 9323466 - 9323869
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323466 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 9323565  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  9323566 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 9323659  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9323660 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 9323759  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  9323760 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 9323859  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||| ||||||    
T  9323860 ataatctgtg 9323869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 37 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8659629 - 8659240
Alignment:
Q  37 tgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8659629 tgtacttgtgaattcaaagtttcgg-gaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgt 8659531  T
Q  137 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctata 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  8659530 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctata 8659436  T
Q  237 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8659435 tacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagca 8659336  T
Q  336 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  8659335 acagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8659240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13318981 - 13318596
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13318981 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 13318882  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  13318881 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 13318787  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13318786 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 13318687  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  13318686 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 13318596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 46 - 431
Target Start/End: Original strand, 43084270 - 43084651
Alignment:
Q  46 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 145  Q
    |||||||||||||    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084270 gaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 43084369  T
Q  146 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaac- 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| |||||||| |||||||||||      
T  43084370 cctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctattttcaaagttatatacaaaaat 43084464  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084465 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 43084564  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  43084565 attcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 43084651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 12138165 - 12138568
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138165 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 12138264  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  12138265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 12138358  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12138359 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 12138458  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  12138459 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 12138558  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||| ||||||    
T  12138559 ataatctgtg 12138568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 46 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18494916 - 18494536
Alignment:
Q  46 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 145  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18494916 gaattcgaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 18494817  T
Q  146 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 245  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||   |    
T  18494816 ccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttt-----cttctactttcaaagctatatacaattta 18494722  T
Q  246 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 345  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494721 ctttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 18494622  T
Q  346 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||    
T  18494621 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 18494536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37746482 - 37746090
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37746482 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 37746383  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | || ||||||||||||||||||||    
T  37746382 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt----ctttttactttcaaagctatataca 37746287  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37746286 aaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37746187  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagc--gagtat----atgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  37746186 gtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37746090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9544862 - 9544478
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9544862 cttgcgaattcaaagtttc-aggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9544764  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9544763 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 9544670  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9544669 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaa 9544570  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  9544569 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 9544478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 28655249 - 28655636
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655249 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28655348  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  28655349 tcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 28655442  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655443 aaacattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 28655542  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  28655543 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28655636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 40467707 - 40467321
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40467707 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtggag 40467608  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  40467607 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt----ctttctactttcaaagctatataca 40467513  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467512 aaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 40467413  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  40467412 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 40467321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Original strand, 11329643 - 11330032
Alignment:
Q  40 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329643 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 11329742  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta--tat 237  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||  |||    
T  11329743 gtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctaaatat 11329837  T
Q  238 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    ||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329838 acaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 11329937  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  11329938 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 11330032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Original strand, 24729976 - 24730363
Alignment:
Q  40 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729976 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 24730075  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||    
T  24730076 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 24730169  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730170 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 24730269  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  || |||||||||||    
T  24730270 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 24730363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15753006 - 15752626
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753006 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 15752907  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  15752906 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 15752813  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752812 aaacattttctttct----tgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 15752717  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  15752716 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtg 15752626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Original strand, 23631982 - 23632364
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 146  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23631982 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgc 23632081  T
Q  147 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632082 cttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 23632176  T
Q  247 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatttt-gaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23632177 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggta 23632276  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||| |||||||||||    
T  23632277 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttataagccggttctcctccaggatagtctgtg 23632364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 26486385 - 26486778
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486385 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26486484  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||                  
T  26486485 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctat------------- 26486570  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 321  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26486571 --tttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 26486668  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  26486669 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 26486768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 34 - 431
Target Start/End: Original strand, 33522382 - 33522776
Alignment:
Q  34 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522382 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 33522481  T
Q  134 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||           || |||||||||||||    
T  33522482 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttctt---ttttactttcaaagct 33522577  T
Q  234 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33522578 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 33522677  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  33522678 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33522776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13180943 - 13180561
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13180943 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 13180844  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  13180843 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatatac 13180748  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  13180747 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 13180653  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  13180652 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtg 13180561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 30035433 - 30035818
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30035433 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 30035532  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  30035533 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaattctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 30035626  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035627 aaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 30035726  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||| | |||||||| ||||||    
T  30035727 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcagattctcctccaagataatctgtg 30035818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 5643807 - 5644191
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5643807 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggag 5643906  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||    
T  5643907 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-----cttttactttcaaagctatataca 5644000  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5644001 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 5644100  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  5644101 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttaaaagcaggttctcctccaagataatctgtg 5644191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13436834 - 13436442
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436834 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13436735  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  13436734 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttt---cttctactttcaaagctatatac 13436639  T
Q  240 aaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436638 aaaacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 13436539  T
Q  335 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  13436538 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatattacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 13436442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18122570 - 18122184
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18122570 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 18122471  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||          |||||||||||||||||||||||    
T  18122470 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttttt---ttctactttcaaagctatataca 18122375  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122374 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18122275  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||    
T  18122274 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtg 18122184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 34622525 - 34622912
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34622525 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgga 34622624  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||||||||    
T  34622625 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatatac 34622719  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34622720 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaaca 34622819  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  34622820 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtg 34622912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37665640 - 37665254
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37665640 cttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 37665541  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  37665540 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctgtataca 37665446  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37665445 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaaca 37665346  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||    
T  37665345 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtg 37665254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 41 - 428
Target Start/End: Original strand, 31437471 - 31437847
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31437471 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31437570  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  31437571 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 31437665  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  31437666 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 31437759  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 428  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  31437760 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 31437847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15652912 - 15652528
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15652912 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 15652813  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  15652812 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 15652718  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |    ||||||||||||||||||||||    
T  15652717 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagg 15652618  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  15652617 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15652528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 46 - 407
Target Start/End: Original strand, 25206289 - 25206653
Alignment:
Q  46 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcat 144  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25206289 gaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcac 25206388  T
Q  145 gcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac--aaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||||||| |||  |||    
T  25206389 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 25206483  T
Q  243 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25206484 acattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaa 25206582  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206583 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 25206653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 46 - 407
Target Start/End: Original strand, 25270445 - 25270809
Alignment:
Q  46 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcat 144  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25270445 gaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcac 25270544  T
Q  145 gcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac--aaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||||||| |||  |||    
T  25270545 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 25270639  T
Q  243 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25270640 acattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaa 25270738  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270739 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 25270809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22993270 - 22992892
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22993270 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22993171  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  22993170 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 22993076  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  22993075 aaacattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 22992982  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  22992981 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22992892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 46 - 431
Target Start/End: Original strand, 23897886 - 23898261
Alignment:
Q  46 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 145  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |    
T  23897886 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacg 23897985  T
Q  146 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac----aa 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||||||| |||    ||    
T  23897986 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaa 23898080  T
Q  242 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||          |||||||||||||||||||||    
T  23898081 aacattttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttg----------aaagcaaacctgagcaacagg 23898170  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  23898171 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttgcaagcagattcttctccaggatagtctgtg 23898261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 33783494 - 33783875
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33783494 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 33783593  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 239  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  33783594 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 33783688  T
Q  240 aaaacattttctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||| ||||||    
T  33783689 aaaacattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaa 33783781  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  33783782 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33783875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 46 - 431
Target Start/End: Original strand, 24975861 - 24976236
Alignment:
Q  46 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 145  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24975861 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 24975960  T
Q  146 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  24975961 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaac 24976055  T
Q  245 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24976056 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 24976147  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||    
T  24976148 acattcaaacgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtatgtg 24976236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 24608252 - 24608634
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24608252 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 24608351  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||          | || ||||||||||| ||| |||    
T  24608352 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttg-aaactc----cgctttctttttactttcaaagttatgtac 24608446  T
Q  240 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  24608447 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 24608539  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  24608540 cagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24608634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 30940643 - 30941023
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30940643 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgga 30940742  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  30940743 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttg-aaattct----gctttctttttactttcaaagttatgtac 30940837  T
Q  240 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |        |||||||||||||||||||||||    
T  30940838 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 30940929  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  30940930 cagggtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30941023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3047
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3453 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3354  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  3353 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttcta 3256  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3255 ctttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaa 3156  T
Q  323 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 422  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  3155 gcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 3056  T
Q  423 tagtctgtg 431  Q
    |||||||||    
T  3055 tagtctgtg 3047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 217 - 431
Target Start/End: Original strand, 17980 - 18194
Alignment:
Q  217 cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17980 cttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattt 18079  T
Q  317 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |     
T  18080 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 18179  T
Q  417 ccaagatagtctgtg 431  Q
    ||| |||||||||||    
T  18180 ccaggatagtctgtg 18194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 3647148 - 3647534
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3647148 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 3647247  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  3647248 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 3647343  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647344 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 3647443  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  3647444 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3647534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 10968667 - 10969054
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968667 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcctgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 10968766  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  10968767 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 10968863  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968864 aaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 10968963  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| ||| |||||||    
T  10968964 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatggtctgtg 10969054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 51644204 - 51644610
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644204 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 51644303  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  51644304 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttcta 51644400  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51644401 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaa 51644500  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||    
T  51644501 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcacctccaag 51644600  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||| ||||||    
T  51644601 ataatctgtg 51644610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 48 - 431
Target Start/End: Original strand, 10951100 - 10951480
Alignment:
Q  48 attcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcc 147  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10951100 attcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcc 10951199  T
Q  148 tttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacatt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951200 tttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatatacaaaacatt 10951296  T
Q  248 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10951297 ttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacatt 10951396  T
Q  348 caaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  10951397 caaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 10951480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Original strand, 28591084 - 28591470
Alignment:
Q  40 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591084 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 28591183  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||||||||    
T  28591184 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatatac 28591278  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591279 aaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 28591378  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  28591379 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28591470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20334689 - 20334283
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334689 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20334590  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    | |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  20334589 ccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 20334495  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttg 318  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20334494 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg 20334395  T
Q  319 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 418  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334394 aaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 20334296  T
Q  419 aagatagtctgtg 431  Q
    | |||||||||||    
T  20334295 aggatagtctgtg 20334283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 28155728 - 28156116
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28155728 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 28155827  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  28155828 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 28155921  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155922 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 28156021  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  28156022 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28156116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41787565 - 41787177
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41787565 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggg 41787466  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  41787465 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 41787372  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787371 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 41787272  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  41787271 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 41787177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 20466761 - 20467173
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| |||| | ||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466761 tcatcagaagcttctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20466860  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | ||| |    
T  20466861 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttcca 20466955  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt--------gaaaactttttgtct 312  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||         |||| ||  |||||    
T  20466956 ctttcaaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtct 20467055  T
Q  313 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 412  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20467056 attttg-aaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 20467154  T
Q  413 ttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  20467155 ttccccatgatagtctgtg 20467173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16202307 - 16201895
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| | ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202307 tcatcagaagctcctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16202208  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||    
T  16202207 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttcttttta 16202113  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-----aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtct 312  Q
    |||||||||| || |||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||    
T  16202112 ctttcaaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtct 16202013  T
Q  313 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16202012 attttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttc 16201914  T
Q  413 ttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  16201913 ttctccaggatagtctgtg 16201895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21892020 - 21891630
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892020 tcatcagaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21891921  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | ||||     
T  21891920 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta--------ctttctt 21891830  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 319  Q
     ||       ||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||      || | ||||||    
T  21891829 ttt-------tatgttcaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa----aagttttttttga 21891741  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  21891740 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 21891642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 15551 - 15962
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15650  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  15651 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 15745  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------ttttgaaaattgaaaactttttgtctatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15746 ctttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaactttttgtctatt 15845  T
Q  316 ttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctctt 414  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  15846 ttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctc 15945  T
Q  415 ccccaagatagtctgtg 431  Q
    | ||| |||||||||||    
T  15946 ctccaggatagtctgtg 15962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9895 - 9510
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9895 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9796  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9795 tcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 9701  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9700 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 9601  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  9600 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 9510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 13931 - 14336
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 121  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13931 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 14030  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||         |||||    
T  14031 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt----cttct 14125  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14126 actttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaa 14225  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||    
T  14226 aagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaa 14325  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||| ||||||    
T  14326 gataatctgtg 14336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9182 - 8797
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9182 cttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 9083  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9082 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 8989  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8988 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacag 8889  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  8888 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4860 - 4471
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 138  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4860 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 4761  T
Q  139 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||    
T  4760 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatata 4666  T
Q  239 caaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4665 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaa 4566  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4565 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 4471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 9914 - 10299
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  9914 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgaag 10013  T
Q  141 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| |||||||||||||||||    
T  10014 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatataca 10107  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10108 aaacattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 10207  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  10208 ggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 33297 - 33680
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33297 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 33396  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  33397 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagttatgtac 33491  T
Q  240 -aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaa 336  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||    
T  33492 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgtaaaagcaaacctgagcaa 33586  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  33587 cagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 1639 - 2043
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1639 tcatcagaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 1738  T
Q  122 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         |||||    
T  1739 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-----cttct 1832  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1833 actttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaa 1932  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||      
T  1933 aagcaaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgg 2032  T
Q  421 gatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||    
T  2033 gatagtctgtg 2043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 12028 - 12443
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12028 tcatcagaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12127  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaattt-gagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 221  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||        | ||||    
T  12128 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctactat----ctttct 12222  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaa-----------cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttg 309  Q
    |||||||||||||| || ||||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  12223 actttcaaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttg 12322  T
Q  310 tctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 409  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12323 tctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 12421  T
Q  410 ctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  12422 ctcttctccaggatagtctgtg 12443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 18585 - 18973
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18585 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggg 18684  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 239  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  18685 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 18778  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18779 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 18878  T
Q  337 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  18879 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 25097 - 25509
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25097 tcatcagaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 25196  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 222  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||        | |||||    
T  25197 ctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttcta 25291  T
Q  223 ctttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-------ctttttgtct 312  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||    
T  25292 ctttcaaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtct 25391  T
Q  313 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 412  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25392 gttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 25490  T
Q  413 ttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  25491 ttccccaggatagtctgtg 25509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 6066 - 6449
Alignment:
Q  41 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 139  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6066 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 6165  T
Q  140 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatat-- 237  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |      
T  6166 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgttc 6260  T
Q  238 acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 335  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||    
T  6261 aaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagca 6353  T
Q  336 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  6354 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 6449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 47 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25150 - 24774
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 145  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  25150 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 25051  T
Q  146 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  25050 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaac 24956  T
Q  245 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24955 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaattttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggt 24862  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  24861 acattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Original strand, 359 - 537
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  359 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 458  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  459 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 259 - 431
Target Start/End: Original strand, 1 - 173
Alignment:
Q  259 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  358 atgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 431  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccctaggatagtctgtg 173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26405 - 26243
Alignment:
Q  23 tcatcagaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 122  Q
    |||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  26405 tcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttttcaag 26306  T
Q  123 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcct 185  Q
    |||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26305 ctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcct 26243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40898 - 40759
Alignment:
Q  47 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgtt-caat-gtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatccgt-ggag 140  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  40898 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgtttcaattgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggag 40799  T
Q  141 tcatgcctttggct-gaccaccactcttatacatcaattt 179  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40798 tcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40497
Alignment:
Q  324 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatat-gtgttacaagcaggctcttccccaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcaggttctcctccagg 40507  T
Q  422 atagtctgtg 431  Q
    ||||| ||||    
T  40506 atagtatgtg 40497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University